5A5XA

Crystal structure of se-met mltf from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
420
structure length
420
Chain Sequence
RVQKEGVLRVITRNSPATYFQDRNGETGFEYELAKRFAERLGVELKIETADNLDDLYAQLSREGGPALAAAGLTPGREDDASVRYSHTYLDVTPQIIYRNGQQRPTRPEDLVGKRIMVLKGSSHAEQLAELKKQYPELKYEESDAVEVVDLLRMVDVGDIDLTLVDSNELAMNQVYFPNVRVAFDFGEARGLAWALPGGDDDSLMNEVNAFLDQAKKEGLLQRLKDRYYGHVDVLGYVGAYTFTQHLQQRLPRYESHFKQSGKQKDTDWRLLAAIGYQESLWQPGATSKTGVRGLMMLTNRTAQAMGVSNRLDPKQSIQGGSKYFVQIRSELPESIKEPDRSWFALAAYNIGGAHLEDARKMAEKEGLNPNKWLDVKKMLPRLAQKQWYAKTRYGYARGGETVHFVQNVRRYYDILTWVT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Activation by Allostery in Cell-Wall Remodeling by a Modular Membrane-Bound Lytic Transglycosylase from Pseudomonas aeruginosa.
pubmed doi rcsb
molecule keywords MEMBRANE-BOUND LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE F
molecule tags Hydrolase
total genus 138
structure length 420
sequence length 420
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 2015-06-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5a5xA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5a5xA02
1HSJA 4DXBA 1LCFA 3IAZA 5AA2D 2IA4A 2GRVA 1B3GA 3Q28A 3MZ9A 3MZBA 2RF1A 4G4PA 2E0SA 5K2YA 1DTGA 4GOTA 3T9HB 3PD8A 4ZEIA 2GFEA 4JXIA 4F2OA 2CMOA 2ZYNA 4C1TA 1A54A 2UYEA 1PEBA 4OQOA 4ZEBA 4OFOA 4NF8B 1TFAA 4MFIA 1B3LA 3TTLA 1IUDA 4U4XA 1P1QA 1FTOA 1N3WA 3IO6A 3MVXA 2RCAA 2ZNUA 3IOVA 4KHZE 3A3UA 1Q1KA 3UA8A 4ISUA 1B46A 5I2KA 2O1MA 3VFJA 3H06B 4QHQA 1FQCA 2GHBA 1IIWA 3OXNA 1FTKA 3E9XA 2DSFA 3K6UA 4NWCA 2E1SA 3FJ7A 3TCHA 3C4MA 3QXMA 3K0VA 3AXFA 2F7BA 4PE5B 1PB7A 3A09A 2DWIA 1PDAA 3FUZA 5KCJA 1B1HA 3OO7A 4G8HA 1BP5A 4YAHX 4H5FA 4OEVA 4GVOA 3S9NC 2I4BA 2DS9A 3TCGA 4BDOA 1FQAA 3TTRA 3GBAA 2XX9A 4IO7A 2XXRA 4KYSA 1MS7A 2LAOA 3O6HA 5I2KB 5BWJA 4Q30B 4YMBA 4LZ8A 3ILTB 3HHFA 3E4RA 3KSXA 4Z0IA 1FQEA 4H5GA 3HN0A 4OVJA 3CFXA 4HTGA 1ELJA 1B05A 2X26A 1A99A 3O9PA 3C9HA 3IB0A 4N07A 1B2HA 5KCJB 4ECFA 4LZ5A 4JWOA 5DEXB 4OHNA 3FVGA 3ZSFA 2RC7A 4ZEFA 4ZEDA 3FXRA 4TQUQ 5FHNA 1LSTA 4THIA 4U21A 4F2QA 4ZS9A 4XXUA 5FHOA 3HHGA 3T9UA 3T9XB 1P1OA 1BLFA 4RPOA 2XXTA 3T96B 3KBRA 4YB7A 5I56B 2F97A 4RK2A 4P11A 1LAXA 3QYTA 3RTWB 1MY1A 2HAUA 2D21A 1II5A 3TEPA 3ODBA 3IO4A 3IB1A 3CG1A 3DM0A 2RINA 3UK4A 3S9MC 1IXCA 4EXLA 3HPIA 2A5SA 5FHMA 2PYYA 1XVYA 3MJNA 3VVFA 2CZLA 1N3XA 5EYFA 3IORA 3SESA 3DLNA 5AE4A 2O68A 3TUSA 4EUOA 1OVBA 1N0TA 3FV2A 3V89B 1IXIA 3MWBA 1ZTYA 4FATA 4DXUA 3UN6A 4MF3A 3I5OA 4RY1A 5A5XA 3H6WA 4OFJA 1A55A 2PMSA 2QS3A 5H8FA 2Q89A 5CI5A 2FNCA 4G68B 4QFOA 3LSLA 4H67A 3IK6B 3ONMA 2REJA 3Q25A 3T9VA 1B52A 1H3DA 4I8CA 1B9JA 5I58A 5CBSA 4QSEA 4U22A 1JEVA 3OELA 4KPTA 4RNSA 4GXAA 1FTMA 3OENA 4R6HA 1R9QA 3FV1A 4FAJA 4KQPA 1FTJA 3O97A 1SI1A 4BDRA 4OTEA 4BDMA 1AOVA 2H4IA 2DE4A 2XXWA 5H8FB 3B6WA 2Y7KA 4F3PA 3TTKA 3BFUA 1N04A 4G8NA 5CBRA 1MDQA 2AYSA 4JWYA 4I1DA 3IJXB 1NNPA 1MQIA 4LUBA 4BDNA 4YKPA 4GLIA 1NH8A 3B7DA 3TKDA 4KCCA 2P1SA 4U1ZA 1S50A 5CRYA 1GR2A 1B7ZA 4Q5TA 4R74A 3TQLA 3BFTA 1MM7A 4ZE9A 2DWAA 5L8DA 2DVZA 2XXPA 3MVWA 4FE8A 2O84X 3RGYA 4MH5A 3OSQA 4R73A 1T0KA 3KJTA 2QS4A 4XKPA 2O1LA 2Y7WA 3ZS6A 3FXUA 2Q9TA 2AL5A 1LFGA 3FVNA 4RPNA 2ZXTA 3K00A 2NUVA 4PFYA 4RJZA 1HSLA 2KLFA 3VXCA 1LFIA 3IL1B 1A7LA 4OENA 4EF2A 3TODA 1MQDA 1JQFA 4R9FA 4DIGA 4F1VA 1CB6A 4LATA 4QSDA 3V83A 3V5AA 4O3BA 3H4ZA 3RQTA 2DQVA 3K2DA 1B32A 2O6AA 3FD3A 4L17A 4EF1A 1SI0A 1SW5A 1M5DA 4F39A 5H8QA 1FQFA 3QAXA 3O29A 5B70A 1A8FA 2NOOA 1QW0A 1QVSA 1MH3A 3S2VA 3IOWA 2DXRA 3CFZA 3RTFB 4HS7A 5LOMA 1IQ7A 2NWJA 3G3KA 1US5A 1B3FA 4RYAA 1BTJA 3KEIA 2UXAA 2VOZA 5CM6A 3D4GA 1Z7ME 4R2FA 1B3HA 2D5WA 5DVFA 3N94A 5M2VA 1QUJA 2REGA 3OOAA 4R6YA 3S9EA 3WAFA 1A40A 3PD9A 4TLLB 5IAIA 4G8MA 4FEBA 3EHSA 3G3GA 1Y9UA 1B3EA 2V25A 1Y20A 1B5JA 3VVEA 2V3UA 4C0RA 5H8QB 1GGGA 5AA3A 1UTBA 1USYE 3OSRA 1MM6A 2PX1A 3PUXE 3ILUB 2OZZA 1ANFA 1MXXA 3EQ1A 4OERA 2I49A 2HQ0A 4U4SA 4KI0E 3MP1A 4NWDA 4DZ1A 1UIVA 4WEPA 3OD7A 1Q35A 4N6PA 3CI8A 2F6PA 5I2NA 3I6VA 2I4CA 4IB2A 3RT8A 1MXYA 1TFDA 5AA4A 1BIYA 4RK9A 4Q0CA 3PGFA 4PFWA 4F1UA 1LCTA 2OK2A 1PB9A 4HCYA 4ZE8A 3F11A 4X9TA 4X48A 4JSOA 4JSDA 1UTBB 2WKYA 3EPEA 3K1PA 2NVUB 2X7PA 4FORA 1DSNA 3RPWA 1B40A 3C35A 3S9LC 1NL5A 1P99A 2VP1A 1MQGA 3KOSA 4G77A 2UVHA 4KD5A 5HBCA 3SEXA 4MLVA 5I2NB 3LC8A 5ELVA 1ZU0A 4XKRA 2DE2A 1DPEA 3CG3A 3KSJA 5AA4B 1XC1A 3PMVA 3G3JA 2OCUA 5KDTA 4YKIA 1QUKA 3N6UA 4JB7A 2QS1A 3CIJA 4QFKA 3EHTA 2DWHA 2ZNSA 3KOTA 3C32A 3JV9A 4GRKA 1SD3A 1Y3PA 3QK6A 3U92A 1XVXA 2HZKA 3ECRA 3O6GA 1LAHE 4R75A 3PUYE 1EU8A 5EHMA 5J1DA 1SBPA 1GVCA 3LBSA 3P7IA 4KFQA 3G3FA 4F1YA 3T66A 3RN8A 3KN8A 2Y7PA 1XT8A 1B5HA 2G93A 1PBPA 3M3FA 4OXVA 2HXWA 1US4A 5JTYA 2V93A 3MW0A 3S4UA 4QFPA 3U94A 1MXZA 4R9GA 2GHAA 4PQJA 1AH5A 3MPKA 3VDFA 1OIBA 1RYXA 2QPQA 3TTNA 2Q2CA 4NF6A 3VLVA 2Q2AA 5KDTB 4LQ5A 4F3SA 1TXFA 3H03A 4F31B 1SW2A 3FJMA 4LZ7A 3OEMA 1YTVA 4IY5A 1MXWA 3VLUA 1LB9A 2ONSA 4R2BA 5JK4A 2BJJX 2AIXA 3SERA 4PFTA 2I0CA 1FTLA 3CSBA 4LVQA 2QJEA 3L6GA 1PB8A 2RC9A 5JTYB 4AQ4A 5ITPA 2F34A 5DT6A 4QRZA 4G2ZA 3R6UA 3HSTA 1FCKA 2P0SA 3JZJA 1MY4A 4NF6B 1JEUA 3KFMA 2R9JA 1JW5A 3GBBA 3FATA 3G3HA 3K02A 4YICA 1LBCA 5CMMA 4OWDA 3PU5A 1SVXB 1S9TA 2I3WA 3QIMA 1VE4A 1XS5A 3USDA 2ALUA 1OMPA 3C31A 3FIRA 4F19A 5HPQA 3BKIB 1SYIA 3PPRA 5KZTA 3M8UA 1MQHA 5DVJA 1QJMA 1PBQA 5ISUA 1OLCA 4EQ7A 4H0WA 3Q26A 3L6HA 1ZMGA 3LR1A 1ZJLA 1VSOA 4H1XA 4OMBA 3LUYA 3TTMA 4BDLA 2ZYKA 1Y4TA 2QL3A 2YJPA 1OQGA 3OMBA 3TMGA 1WVJA 1H44A 3C36A 2ANJA 3FZVA 3SEVA 4GD5A 2UVJA 2B3FA 3R26A 3RLFE 3GLBA 2DP8A 1JETA 3HV1A 1A8EA 3R7XA 5A5XB 2QS2A 5DTBA 2XHDA 2UVIA 1IITA 1F9BA 5H8SA 4DLDA 5K2XA 5H8HA 2O51A 1POY1 2F6GA 4U1OA 3A3CA 1H45A 1QUIA 2XX7A 1M5EA 2V3QA 3MVZA 1FQBA 4LP2B 4E0WA 4KR5A 1GV8A 1NNTA 1O7TA 3CFLA 4ELOA 1ZLQA 5I58B 2PT2A 2XD2A 1Y4CA 1ZKBA 3FVOA 1N76A 4GQOA 5L9MA 2XXHA 3MVYA 2V3TA 1IEJA 2ONRA 2F7AA 1S7YA 1FQDA 1MH4A 3G3IA 2GH9A 4DE8A 1MG1A 3CR9A 1WDNA 3O2AA 2F78A 5AA1A 1IXGA 3K01A 2DE3A 3DELB 2Z23A 4HCWA 1SYHA 2DWJA 3MZ1A 2I58A 2XXXA 2I3VA 4P0IA 3SKPA 3H7MA 3U8QA 4H8JA 3KGCA 4Z7EA 3DP6A 4FEDA 4K3FA 2F5XA 2DOJA 3O66A 2H9BA 5IKBA 1ZBMA 1NFTA 3CSGA 4PETA 2F8DA 4M1VA 3WAEA 3K6WA 2QRYA 3KJ7A 3HO7A 4NF4A 2A5TA 4NMYA 1URGA 3H6TA 3UORA 2OBGA 4JBZA 1UTHA 3KN3A 4DDDA 1Y3NA 3KZGA 5DVIA 2Q8JA 3RNNA 1UQWA 2F35A 1ATGA 2FYIA 4ZZAA 3BBRA 3PUVE 2Y7RA 4ELRA 4NTLA 4ESXA 2OJTA 4XTCQ 5BUUA 3IOUA 4GIZA 4GL8A 4IO5A 4YU0A 1HSEA 3PPQA 4OZ9A 5H8NA 1LAFE 2XXYA 1DOTA 3QSLA 1SW4A 1NKXA 5CC2A 5I57A 4I62A 1JW4A 4NF4B 1LBBA 2OWSA 2A5TB 3SETA 3IR1A 1USYH 5FTHA 4F3GA 4H6DA 3W15C 1UTHB 2XX8A 3TAJA 4XKQA 4UACA 4XKNA 3PMXA 1QULA 2Y7IA 1J1NA 3CRBA 1Z7NE 3SEYA 1LB8A 3MP8A 2HFBA 5F1QA 4UA8A 4F18A 1JW1A 1QKBA 2H25A 5CMBA 1EZPA 4ZEKA 2D3IA 1D4NA 3EHUA 4IGTA 4EDPA 3T93B 3FGSA 2B3BA 5H8NB 2H99A 4X1BA 1B7HA 1R1NA 4X1DA 3PPPA 4GXSB 5I57B 4OFLA 3CVGA 3VE1B 4EQBA 2OWTA 4YZZA 3SEUA 4Q8RA 2RC8A 2H98A 3RT6B 4IO2A 1VFDA 1LGBC 1O64A 4JDFA 5TPAA 2ABHA 3PMWA 3W9VA 1XHYA 2H5YA 3TFLA 2OLBA 1AMFA 4P0GA 3N6TA 4TLMB 4KCDA 1DPPA 1I6QA 3FASA 1Y1ZA 2VHAA 2HEUA 3VVDA 4DCYA 2XXVA 2XXIA 3MPLA 2I48A 1OLAA 1NNKA 5B7DA 1YAEA 4F29A 3LSXA 3IB2A 1M5BA 5DEXA 4IO4A 1M5CA 2Z8EA 3K6XA 1B4HA 4IO6A 2DXYA 1N7XA 4ZECA 5TPAB 1EH3A 4NF5A 4XIGQ 1JVXA 3UIFA 2Q88A 4POWA 4WKMA 4QFNA 1I6BA 5I56A 4ONYA 3B6TA 4M4GA 2QMXA 2Z22A 4H65A 1MY0A 3THIA 3K6VA 1B4ZA 4F3BA 4H8IA 3TYHA 2Z8FA 3KN7A 1UIUA 1RKMA 1NH7A 1B58A 1N84A 2W7YA 3PPOA 2QMWA 1JNFA 2PBWA 1TT1A 1H76A 2UYFA 3QUJA 1M5FA 4E0XA 3E3KA 3ZKLA 1RYOA 2R71A 4YKKA 5HM4B 4GWOA 4NF5B 3OO6A 2VD3A 3PUZE 3E13X 3B6QA 4OEUA 2XD3A 1Y3QA 3MC2A 4EXKA 2F7CA 3U93A 4MBPA 2O7UA 1P1NA 3C33A 2P2AA 2Y84A 4U23A 1EZOA 5L9SA 2HCAA 1B0LA 4OETA 2ONKE 4DCXA 1CE2A 5TP9A 2F36A 3PUWE 3Q29A 1MQJA 3VXBA 3I3VA 4G68A 3D4CA 4GFRA 4HW8A 2I0BA 2ESNA 2RCBA 4LONB 4FJPA 2XXQA 3N5LA 3PPNA 4DXCA 4ELQA 3OO9A 5JEIA 3LSWA 1D9VA 1R9LA 3VLWA 4NE4A 4LQ2A 4U2RA 2ZYOA 4BLAA 1MDP1 3JYRA 4TOZA 4RA1A 4EQ9A 2B65A 1O63A 5ICQA 4PFUA 3MUQA 3MBPA 1NMUA 1B6HA 3DP4A 1MXUA 3M3LA 1MPBA 4G68C 3MAMA 2I6EA 3IJOB 1AL3A 1URDA 5ITOA 1B7UA 3H6VA 1Y1MA 2X7QA 1SW1A 1B0HA 2ZMBA 3TCFA 1MPDA 4WXJA 4YB5A 2HAVA 5TP9B 3EN3A 3FVKA 1D3KA 1MRPA 2O7IA 5CMCA 4R72A 3K1NA 5TU0A 1B5IA 3EF7A 1OVTA 4MLQA 3Q27A 4FECA 1I6AA 1PC3A 1MPCA 1SQYA 1GTKA 4FIMA 3VV5A 3TPAA 3O28A 1DTZA 4OESA 3SEWA 4I9DA 4N13A 3IOTA 4ZDMA 1WODA 1XOCA 2FA7A 1DMBA 1R6ZA 2G29A 3RUMA 4JWXA 3U1OA 3QUFA 3KG2A 3G7WA 3TQWA 2VD2A 3T22A 2HZLA 3U72A 2RKMA 4ELPA 1BKAA 3GZGA 4OYVA 1OQHA 2YLNA 1VR5A 1IZ1A 1ZIUA 4IY6A 4YMAA 1AIVA 3ZKKA 3K1MA 3W9WA 3C34A 4AB5A 3DP8A 4WEDA 4BDQA 2ZYMA 3N26A 1FW0A 3IX1A 1NNFA 5FTIA 3FJGA 3TDJA 4AB6A 1QKAA 2ZNTA 5CMKA 4O3CA 5ICTA 3FXQA 5AA2A 2YPNA 4ZZEA 2IEEA 4GF8A 2PVUA 2O69A 1P1WA 5H8HB 4RXLA 1YCJA 3H3GA 5I84A 4QSCA 3PV0E 2VGQA 1POTA 3TELA 4O3AA 1LAGE 1MY3A 2DVCA 1L5TA 4QF9A 3MP6A 2THIA 1VFEA 2R6GE 1URSA 2Z8DA 4R6KA 1MXVA 3LSFB 4ESWA 1LLSA 1B1XA 4KYEA 2UVGA 4QFLA 5I59A 3K4UA 1KWHA 3H6UA 5EHSA 1EZ9A 1TWYA 1I69A 2DYXA 4IO3A 3M3KA 4LA9A 4POXA 1IXHA 3TZAA 1H43A 4NEDA 4PP0A 5AA2B 3SDFA 1MY2A 4F22A 2PT1A 2NXOA 3O6IA 1D9YA 3OEKA 4IGRA 2V84A 3GXAA 3RY3A 1N7WA 1P1UA 2M8CA 1JVYA 2AL4A 2XXUA 3MQ9A 5DYHA 4NF8A 1SDXA 1B51A 3UGWA 4YB6A 5L9OA 5I59B 3V8XB 4GL0A 2QSXA 1LFHA 4KYDA 5F7VA 3HCQA 1YPNA 4YKJA 3OO8A 4C1UA 3UP9A 4ND9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HSJA 4DXBA 1LCFA 3IAZA 5AA2D 2IA4A 2GRVA 4GWZA 1B3GA 3Q28A 3MZ9A 3MZBA 2RF1A 4G4PA 2E0SA 3PTYA 1FPLA 2ZZVA 5K2YA 1DTGA 4GOTA 3T9HB 3PD8A 4ZEIA 2GFEA 4JXIA 4F2OA 2CMOA 2ZYNA 4MHFA 4C1TA 1A54A 2UYEA 1PEBA 4P1EA 4OQOA 4ZEBA 4OFOA 4NF8B 1TFAA 4MFIA 1B3LA 4OVQA 2CZIA 3TTLA 1IUDA 4U4XA 1P1QA 1FTOA 1N3WA 3IO6A 3MVXA 2RCAA 2ZNUA 4O7IA 1RDXA 3IOVA 4KHZE 3A3UA 1Q1KA 3UA8A 4ISUA 1B46A 5I2KA 2O1MA 3VFJA 3H06B 4QHQA 1FQCA 2GHBA 1IIWA 2CEXA 3OXNA 1FTKA 3E9XA 2DSFA 3K6UA 4NWCA 2E1SA 3FJ7A 3TCHA 3C4MA 1LBZA 3QXMA 1NV4A 3K0VA 3AXFA 1FTAA 2F7BA 4PE5B 1PB7A 3A09A 3E79A 2DWIA 1PDAA 3FUZA 5KCJA 1B1HA 3OO7A 4G8HA 2XA5A 1BP5A 4YAHX 5ET5A 4H5FA 4OEVA 4GVOA 3S9NC 2I4BA 2DS9A 3TCGA 4BDOA 1FQAA 4QXDA 3TTRA 3GBAA 2XX9A 4IO7A 2XXRA 4KYSA 1MS7A 2LAOA 3O6HA 5I2KB 4PCDA 3IFAA 5BWJA 4Q30B 4YMBA 4LZ8A 3ILTB 3HHFA 3E4RA 3KSXA 4Z0IA 1FQEA 4H5GA 3HN0A 4OVJA 2CZHA 3CFXA 4HTGA 1ELJA 1B05A 2X26A 1A99A 3O9PA 3C9HA 3IB0A 4N07A 1B2HA 5KCJB 4ECFA 4LZ5A 4NX1A 4JWOA 2FHYA 5DEXB 4OHNA 3FVGA 3ZSFA 2RC7A 4ZEFA 4ZEDA 3FXRA 4TQUQ 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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