4ELOA

Ferric binding protein in apo form 1
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
308
structure length
308
Chain Sequence
TLTIYSGRGQSLVEPLVKQFEAETGIRVQVRYSTDAQILAALQEEGSRSPADLFWANTAGALGQASAKGLLRPLGETLLEKPIAFVPASRTWVPVTVRLRVLAYNPDRIKAEELPESLLDLPRFAREKGLVGRVGWTPTYSSFQDMVAGMIALYGEEKTREWLLAMKALAPKAYPSNPAMLDAIRAGEVDLGSTNHYYVVRFRRAGYRLGMHHFRDGDAGNLALVTGAGLLKTSKNLAAATRFLTYLLSPQAQQYFVGNIGEYPLVKGVALDPNLLPLEEALAKSPKLDLEKLPLDRALRLLRETGVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein
publication title Crystal structure of the ferric binding protein A
rcsb
source organism Thermus thermophilus
molecule tags Metal transport
total genus 110
structure length 308
sequence length 308
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4eloA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4eloA02
4F19A 4EQBA 5BWJA 2F6PA 1QW0A 3IR1A 1AIVA 4TLLB 1LAGE 2DWAA 5AA4A 1IQ7A 3K6XA 1II5A 1I6BA 1PB7A 3USDA 3KG2A 3DM0A 1H44A 3MW0A 1LSTA 1GTKA 4FATA 4I62A 4R74A 5CMCA 3C32A 2RC8A 1LB8A 4WXJA 1LB9A 3N6TA 3O97A 3H6VA 3KSXA 1GR2A 4LQ2A 3HHGA 2AIXA 5L9OA 2QRYA 4ZZEA 3VLVA 3ZKLA 3MP6A 1LAXA 1SBPA 2B65A 4YZZA 3TCGA 1JW4A 1IIWA 5AA4B 3HN0A 3KOTA 3OENA 1Y4TA 3FZVA 1QUJA 3EPEA 2CMOA 4NWDA 2GRVA 3PPRA 3CSBA 4YB5A 1KWHA 3TTNA 4BDOA 4MLVA 3FXRA 2KLFA 4BDQA 1UTBA 5KDTA 3RN8A 3VV5A 2QS3A 2XXPA 4NEDA 3K0VA 5HBCA 1M5EA 1HSJA 5DVJA 1LBCA 3PD8A 1B3LA 3MAMA 1ANFA 4O3BA 2V25A 2XXYA 4POXA 1PB8A 5CBSA 2FNCA 1HSEA 3B6WA 3CSGA 2YJPA 2DP8A 2HAUA 2Z23A 3I5OA 2R9JA 4RYAA 1NNTA 1RYOA 3MVZA 2V3UA 1XVYA 3MZ9A 4OEVA 3VXCA 1EU8A 3GXAA 2DWHA 4YKIA 1ZLQA 1IXHA 5F1QA 1UQWA 4ZECA 3LR1A 5DVIA 3SETA 1AH5A 1BTJA 2UVJA 2H98A 3RT8A 4BDLA 3LSWA 3OO7A 3RT6B 1R9LA 1UTBB 5KDTB 2D3IA 3KGCA 5CI5A 1M5CA 1GGGA 3H06B 2DOJA 4RK9A 1OIBA 4H1XA 3O2AA 1MXYA 1N7WA 1B5IA 1DPPA 3OO9A 3M3FA 2R71A 2VD2A 2F97A 4EXKA 3G3KA 5HPQA 3RGYA 1A8EA 1AL3A 1N0TA 5ITPA 4XKRA 3MPKA 5I56B 2Q9TA 3ONMA 1FTJA 1B1HA 1JEVA 2Z8EA 1XT8A 3IJOB 5I59B 1YCJA 4R6YA 1MG1A 4ELRA 4R72A 3CI8A 1B7ZA 2Z8FA 4HW8A 2Y7IA 1J1NA 4JDFA 4KYEA 2DSFA 1ZMGA 3S2VA 3PPQA 1LAHE 4XKQA 3TTLA 3CFXA 4G4PA 1SDXA 4E0WA 3C31A 2H99A 3TFLA 4IGTA 2DS9A 3VFJA 3RTWB 4MH5A 1FQAA 3TPAA 3JZJA 3IB1A 2HXWA 4YB7A 4U22A 3U72A 3TZAA 5L9MA 4KYSA 3A3UA 2DQVA 2E1SA 3OO8A 1SI1A 3N5LA 3O6IA 4RXLA 2ANJA 3Q29A 3V89B 4X1BA 3PPPA 3CG1A 4OQOA 3KN3A 1CB6A 4NWCA 1O7TA 2QSXA 2V3QA 4PFTA 1I6AA 4JWYA 2G93A 2UXAA 5DVFA 2V3TA 3OEKA 3OEMA 4KCCA 1MXUA 5JTYB 3OSQA 3ZSFA 4DLDA 3SEUA 4H6DA 1B3HA 3GBAA 1B52A 4OFLA 3OOAA 3UN6A 1FQEA 3ODBA 4O3AA 5DTBA 3HO7A 1ELJA 4QF9A 4GXSB 2VOZA 4JXIA 4F1UA 1B51A 1D9YA 3KJTA 1FTMA 4OVJA 4RK2A 2Q88A 2ZMBA 3FASA 1T0KA 3S4UA 2O69A 1M5FA 1GV8A 3MZBA 3FVKA 4O3CA 5L8DA 3EN3A 5FHOA 3R26A 5TPAA 3KFMA 4F3GA 4ELPA 3H7MA 4DCYA 1UTHA 2ZYMA 1H43A 5EHMA 4Z0IA 3C34A 1P1WA 3DLNA 3PUZE 4DZ1A 1MS7A 4JWOA 1FQBA 3KBRA 1L5TA 1SYIA 1BIYA 3QSLA 2XD3A 3U94A 2CZLA 1DTGA 2H4IA 5K2XA 1Z7NE 1SW5A 4U4XA 4HTGA 3CFLA 1IITA 3UK4A 1O63A 2O7UA 1MM6A 1TT1A 3TQLA 4IO2A 2DWIA 4X9TA 2PMSA 4QFKA 1B7UA 3IK6B 2NVUB 1B5JA 3QYTA 3TYHA 3H6TA 2AL4A 3G3FA 4YKJA 1IXCA 4C0RA 1Y4CA 4X48A 4RJZA 3KN7A 5IAIA 5ELVA 5JEIA 2AL5A 4H5FA 4IO5A 5TPAB 2ZYOA 1RYXA 1OVTA 3OXNA 2H25A 1JVXA 4POWA 3KJ7A 1OMPA 4PQJA 1NL5A 2BJJX 3B7DA 3E9XA 3RUMA 1SW1A 3LSXA 3H03A 3VXBA 3K4UA 3Q27A 4LZ5A 5I84A 4H5GA 3QAXA 5KCJA 2H5YA 2QPQA 3IOWA 4MLQA 1A7LA 1D9VA 1B5HA 2QMXA 5ITOA 1USYH 1USYE 1S7YA 3TTMA 4GFRA 5FHNA 1N84A 1LGBC 3IL1B 4ZEFA 5AE4A 3SDFA 4K3FA 1MXVA 4EF2A 2H9BA 4KHZE 1OQGA 3FATA 1VR5A 3U93A 5JK4A 2AYSA 1JEUA 2XXXA 2Y7KA 2F35A 4ELQA 3CRBA 3THIA 4F31B 1D4NA 3PUWE 1B6HA 1SW2A 1URSA 4H0WA 1MY3A 2V84A 3LBSA 1JVYA 1N04A 3MQ9A 5KCJB 1WVJA 2VHAA 4QRZA 5CC2A 1UIUA 2XXVA 4E0XA 4YAHX 1DMBA 3MP8A 3MVYA 3H6WA 1FQCA 4WEDA 1R1NA 3E4RA 3TTKA 2P0SA 1SD3A 3TUSA 3FJGA 1MPCA 1LFGA 3GZGA 3TEPA 4R9FA 2O1MA 1MH4A 4KCDA 4R2BA 3FV2A 3FGSA 1LFHA 2P2AA 3CR9A 4WKMA 3G3HA 5CM6A 4FAJA 2DVZA 1NNPA 1POY1 3G3GA 1B0HA 4F3BA 3ILUB 1OLCA 2I58A 3MPLA 1TFDA 3EHSA 4GOTA 2M8CA 3FVGA 2Y7WA 3N6UA 3RLFE 4NE4A 5DT6A 3T66A 1N76A 4YICA 3DP8A 2GH9A 3PGFA 3JYRA 2XD2A 4OEUA 3KSJA 2QS2A 4QSEA 1B2HA 5I56A 3KN8A 1B1XA 4EF1A 4OWDA 1IXIA 4DXBA 4N07A 2Q8JA 4RY1A 1H45A 3LC8A 3G3JA 5I59A 4GF8A 1YTVA 1MQJA 1Y3PA 4FEDA 4YKKA 4NF4A 4G8HA 1N7XA 3OMBA 3IJXB 4YB6A 3E3KA 4PP0A 3R7XA 1LLSA 3K1NA 2ONRA 2XX9A 4YKPA 1FW0A 4ZE9A 4HS7A 2ALUA 4XIGQ 2B3FA 1QUKA 4F1YA 2YLNA 4HCYA 2LAOA 4MF3A 4GL0A 1D3KA 3S9EA 4YMBA 4NMYA 1RKMA 1CE2A 2I0BA 3FVOA 1HSLA 4G77A 1LCFA 4BDMA 2QS1A 4QFNA 1S50A 1XS5A 1EH3A 4BDNA 5I2KA 2OWSA 2HAVA 2ZXTA 3B6QA 3GBBA 2OBGA 2XXWA 3PD9A 2R6GE 4NF4B 4G8NA 3W9VA 3T9VA 2HQ0A 3TDJA 2PT1A 1MY0A 1XOCA 1IUDA 4PETA 2HZKA 5I57A 3OSRA 3VE1B 4HCWA 4AB5A 5JTYA 2X7QA 3IX1A 3O28A 3SEVA 2ESNA 3S9LC 4C1UA 4ECFA 4G8MA 3BFUA 2O51A 3RNNA 4FECA 3DP6A 4ND9A 1URGA 3PPOA 4I1DA 3HV1A 4FIMA 3MVWA 4XTCQ 2OK2A 4GL8A 3VVFA 1GVCA 3W9WA 3T22A 4TQUQ 2DE4A 5LOMA 2F5XA 5I2KB 3FUZA 2A5SA 1MXWA 1B3GA 4OXVA 4GIZA 2O7IA 1VSOA 2Y84A 4DIGA 3PMVA 4BDRA 1PC3A 3TELA 1DSNA 4EDPA 1WDNA 5I57B 3VVEA 3C4MA 2IA4A 4EQ7A 3S9MC 1PBQA 4FORA 1Y3QA 3PMWA 3UGWA 5CMMA 2NUVA 2HCAA 3CFZA 1SYHA 1M5BA 1FQFA 1LBBA 1VFDA 4WEPA 3G7WA 2FYIA 3K6WA 3RY3A 2XXHA 1NKXA 4TLMB 1IEJA 3C35A 4H65A 1URDA 4LP2B 4OZ9A 3UP9A 2YPNA 4U2RA 4LZ8A 3PUXE 3PV0E 4Q8RA 1Q35A 3M8UA 1EZOA 4LZ7A 3CIJA 3O66A 1M5DA 2V93A 4R73A 4KD5A 2FA7A 3P7IA 4R6KA 4G68A 2DYXA 3DP4A 4GXAA 1US4A 4PFYA 1A40A 3WAFA 2Q2CA 3ILTB 1SW4A 1JW1A 3B6TA 3BBRA 3FXUA 2F6GA 2Y7PA 3TODA 3SEYA 3HPIA 5ISUA 2QMWA 2XXRA 1B32A 3V8XB 3EHTA 5TU0A 4THIA 3MVXA 4LVQA 3VVDA 1R6ZA 4OTEA 1JETA 3O9PA 1OQHA 4DE8A 3LSLA 1F9BA 4IGRA 4QFLA 3SESA 2I4CA 1NNKA 3HCQA 4N13A 1A54A 4F3SA 5TP9A 4G68B 4LONB 1MXXA 4GQOA 2HFBA 2HEUA 3MUQA 1ZTYA 2NXOA 3QIMA 1A55A 5I2NA 1MY2A 4PFUA 2VD3A 2Z8DA 3S9NC 4FEBA 1VFEA 1ZIUA 1B4HA 3QUFA 1FTOA 1SI0A 2RC9A 4Q30B 1MQDA 2UYFA 2UVHA 1NFTA 1PEBA 3GLBA 3TTRA 1B9JA 2GHBA 3FV1A 3W15C 1EZ9A 1MPBA 2F34A 5AA2A 3CVGA 4U21A 4OMBA 2REJA 2DVCA 1QJMA 2G29A 1TWYA 3K6UA 2B3BA 4DXUA 5TP9B 4XXUA 1N3WA 4OFJA 4G68C 4FJPA 3SKPA 4P0GA 4ISUA 2XX8A 5HM4B 1B4ZA 4I8CA 1US5A 1NH8A 4ZEIA 4F2QA 1QVSA 2Q89A 5CRYA 3RQTA 4EUOA 4U1OA 4H8IA 1Y1MA 4DDDA 3TMGA 5I2NB 3E13X 3EQ1A 4F2OA 3K2DA 4F22A 4JBZA 2ONSA 4NF8A 3JV9A 3O6GA 3TCFA 5DEXA 2THIA 2OWTA 4G2ZA 1FCKA 4IO4A 3ZS6A 4NTLA 3C9HA 1PB9A 3O6HA 3K02A 2DE2A 3IOVA 5AA2B 2HZLA 3HHFA 1B7HA 1NMUA 3RPWA 3MC2A 2VP1A 4DXCA 5I58B 1DTZA 4U23A 5H8FA 2A5TA 2X26A 3Q26A 4RPNA 1BP5A 1LCTA 5L9SA 3AXFA 1P1OA 4P0IA 4JB7A 3T96B 3VLWA 1B46A 2OLBA 2RCAA 1YAEA 2I4BA 3FJ7A 3PMXA 4M4GA 2ONKE 5AA1A 4NF8B 3PU5A 2QL3A 1TFAA 1XHYA 3OELA 5DEXB 3BFTA 5A5XA 3IAZA 2ZNTA 3C33A 2OCUA 5M2VA 3OD7A 1IZ1A 3IB0A 3IOUA 1EZPA 3CG3A 2NOOA 2PX1A 3UA8A 2PVUA 5H8HA 4YMAA 1MRPA 1P1UA 3SERA 1XVXA 2ZYNA 3FVNA 4U4SA 5CMBA 4OETA 2RINA 5H8FB 2A5TB 2XXQA 2D21A 1MM7A 5AA3A 1QULA 2RKMA 1WODA 2O6AA 3Q28A 1Q1KA 2Z22A 1IXGA 1BKAA 5H8SA 5B70A 2D5WA 3KZGA 2XXTA 5AA2D 4X1DA 4EXLA 5KZTA 2ABHA 2F78A 4LQ5A 2O84X 1B58A 3I3VA 3T93B 1XC1A 5A5XB 4IO3A 1B3EA 1A8FA 2RCBA 1MY1A 4UACA 4ZEDA 4DCXA 4U1ZA 3TKDA 1DOTA 3H3GA 4R2FA 3D4CA 5H8HB 3D4GA 4QHQA 3L6GA 2GFEA 2ZNUA 3OO6A 4OENA 1FQDA 1NNFA 1Y9UA 3M3LA 4RNSA 3U8QA 1MXZA 2UVGA 1B05A 3TAJA 2I6EA 2OJTA 5CBRA 3U92A 4L17A 4Q5TA 3MBPA 1N3XA 1ZKBA 4R75A 1ZJLA 2DE3A 4ZDMA 1JNFA 4NF6A 4R9GA 5EHSA 2NWJA 4MFIA 3KEIA 2XXIA 3FIRA 1MQHA 3K1MA 1TXFA 1QUIA 1POTA 2F7BA 5CMKA 3FJMA 2QJEA 2Q2AA 1R9QA 4F1VA 5BUUA 4XKPA 4H8JA 1PDAA 3R6UA 3K01A 3BKIB 4OFOA 4ZZAA 3FD3A 1B3FA 1H76A 4ESXA 3SEWA 1SVXB 3LUYA 4NF6B 2GHAA 4M1VA 4NF5A 3G3IA 1QKBA 5IKBA 1FTKA 3PUYE 2P1SA 1P1QA 3N94A 4KPTA 1MDQA 3A3CA 1Y1ZA 4R6HA 4ZEKA 4RA1A 2OZZA 3F11A 2F36A 4XKNA 4GRKA 4ESWA 2DWJA 1BLFA 2RC7A 3N26A 2ZYKA 4PE5B 4KYDA 1Y3NA 5H8NA 4OESA 4PFWA 3K6VA 3IO4A 4JWXA 1O64A 3K1PA 2WKYA 2X7PA 4GWOA 3MP1A 3IO6A 3H4ZA 3ECRA 4ZE8A 1S9TA 1Y20A 2UVIA 4ZEBA 4QSDA 2F7AA 4OERA 2O68A 1OVBA 4LA9A 4IO6A 1PBPA 1B40A 4F29A 5FTHA 4LATA 4GVOA 3QUJA 2DXRA 4LUBA 4NF5B 4RPOA 1OLAA 5F7VA 1MQIA 1SQYA 3L6HA 1JW5A 2QS4A 2ZNSA 2XXUA 1ATGA 5H8QA 4EQ9A 3PPNA 4QSCA 4FE8A 4AB6A 2I49A 3EHUA 4ONYA 3C36A 5H8NB 4MBPA 4P11A 2I3VA 1P1NA 4C1TA 1MY4A 5FHMA 4OYVA 4I9DA 5FTIA 1ZBMA 3T9UA 3IB2A 4JSOA 1H3DA 4KR5A 4JSDA 4QFOA 1A99A 2F7CA 3I6VA 3HSTA 4KFQA 4ZS9A 2DXYA 2XHDA 2VGQA 1QKAA 3SEXA 4QFPA 5ICQA 4IB2A 3IORA 3K00A 1MH3A 3MWBA 5J1DA 1MDP1 3QXMA 1LFIA 1UIVA 3TCHA 2I48A 3EF7A 3VLUA 3MJNA 3WAEA 2E0SA 4UA8A 1DPEA 5H8QB 4OHNA 3UORA 3UIFA 5EYFA 1MQGA 5B7DA 3ZKKA 3M3KA 5K2YA 3KOSA 3T9XB 3DELB 3H6UA 2Y7RA 3RTFB 2F8DA 3U1OA 4ELOA 2IEEA 1I6QA 1P99A 4YU0A 4TOZA 2PBWA 1I69A 4IY6A 1UTHB 1JQFA 3A09A 2I3WA 4N6PA 4F39A 3MZ1A 3TQWA 1AOVA 2XX7A 5DYHA 1LAFE 4AQ4A 2PYYA 4H67A 1MPDA 2I0CA 5ICTA 4BLAA 2RF1A 4F18A 3IOTA 5I58A 1FTLA 4GD5A 1NH7A 1ZU0A 4GLIA 1VE4A 2REGA 3PUVE 4F3PA 2UYEA 4IY5A 1YPNA 1Z7ME 2O1LA 4IO7A 3T9HB 3O29A 4Z7EA 2W7YA 3V83A 3VDFA 3V5AA 4KQPA 2PT2A 3QK6A 4KI0E 1B0LA 1AMFA 3LSFB 3Q25A 4Q0CA 3FXQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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3LSWA 5DW8A 4PDHA 1LBXA 3OO7A 3RT6B 1R9LA 1UTBB 2HPGA 2D3IA 3KGCA 5KDTB 5CI5A 1NV0A 1M5CA 1GGGA 3H06B 2DOJA 4RK9A 2XWKA 1OIBA 4H1XA 3O2AA 1MXYA 1NV4A 1N7WA 1B5IA 1DPPA 3OO9A 3M3FA 2R71A 2VD2A 2F97A 4EXKA 3G3KA 5HPQA 3RGYA 1A8EA 1AL3A 1N0TA 5ITPA 4MNIA 4XKRA 3MPKA 5I56B 4AS5A 2Q9TA 3ONMA 1FTJA 1B1HA 1JEVA 3U65A 2Z8EA 1FRPA 1XT8A 3IJOB 5I59B 1YCJA 4JVDA 4R6YA 1MG1A 4ELRA 4R72A 3CI8A 1B7ZA 2Z8FA 4HW8A 2Y7IA 1QGXA 4G61A 1J1NA 4JDFA 4KYEA 2DSFA 1ZMGA 3S2VA 2CEYA 3PPQA 1LAHE 1FPBA 4XKQA 3TTLA 3CFXA 4G4PA 1SDXA 1G0IA 4E0WA 3C31A 2H99A 3TFLA 4IGTA 2DS9A 3VFJA 3RTWB 4MH5A 1FQAA 3TPAA 3JZJA 3IB1A 2HXWA 4YB7A 4U22A 4O94A 3U72A 3TZAA 5L9MA 4KYSA 3A3UA 1EYIA 2DQVA 2E1SA 3OO8A 1SI1A 3N5LA 3O6IA 5EQAA 4RXLA 2ANJA 3Q29A 3V89B 4X1BA 3PPPA 3CG1A 1KA0A 4OQOA 3KN3A 1CB6A 4NWCA 1O7TA 2QSXA 2V3QA 4PFTA 1I6AA 4JWYA 2G93A 2UXAA 5DVFA 2V3TA 3OEKA 2WYKA 3OEMA 4KCCA 2Q8MA 1IMAA 1MXUA 5JTYB 1IMCA 3OSQA 1FBEA 3ZSFA 4N6KA 4GX4A 5EYGA 4DLDA 3SEUA 4O7MA 4H6DA 1B3HA 3GBAA 1B52A 4OFLA 3OOAA 3UN6A 1FQEA 3ODBA 4O3AA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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