3PMXA

Ligand-binding domain of glua2 (flip) ionotropic glutamate receptor in complex with an allosteric modulator
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
263
structure length
262
Chain Sequence
b'GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDLKNKWWYDKGECGA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Structure based evolution of a novel series of positive modulators of the AMPA receptor.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
total genus 85
structure length 262
sequence length 263
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-11-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3pmxA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3pmxA02
4F3PA 3T66A 1N3WA 4F19A 4QFLA 5HBCA 4EQ7A 4LA9A 1FCKA 2DE3A 4TLMB 1UTHB 1FTLA 2HZLA 2QSXA 2B3BA 3PD9A 1US5A 1B5HA 3CFXA 4RPNA 3EHTA 1IXIA 3C9HA 1B7UA 5DEXB 1Y4TA 3M3KA 4MBPA 5CC2A 4Q30B 3K4UA 2RC7A 4OFJA 3IX1A 1MM6A 4NF4A 3GLBA 1Y1MA 3QAXA 4IO7A 3K6VA 3LSLA 3MVYA 1OIBA 4KYSA 1Q35A 4Q5TA 4RY1A 2DXRA 2UYFA 4HTGA 3H6TA 5ISUA 4DDDA 1FTOA 2VD3A 4THIA 2A5TA 3O6GA 1N7WA 2A5SA 4BDLA 1PEBA 4YAHX 1R6ZA 1FQDA 1BP5A 2OWTA 4ZECA 3TQLA 3U93A 3N5LA 4G8HA 4FEDA 4H65A 1KWHA 4XKRA 1Q1KA 1B3EA 1II5A 2RKMA 4ELQA 3M3FA 4BDRA 1XT8A 3W9WA 5AA2D 2F5XA 4PFWA 3CIJA 5HM4B 4ZEIA 3VXBA 1IQ7A 4TLLB 4BDQA 2XXYA 2Z8FA 4U23A 2VD2A 3MVXA 4LP2B 4H0WA 3VXCA 1MH4A 3SESA 4ZE8A 4AB5A 4KHZE 3C31A 3S9LC 2Q89A 4RPOA 4YB5A 4YKPA 1A54A 1O63A 2XXTA 1AOVA 1NNKA 3KSXA 2DWIA 4LONB 2O68A 2Q9TA 3FIRA 1MQHA 2AIXA 2Y7KA 3ZKLA 4JWYA 3CVGA 2H98A 3FVGA 4JB7A 1B05A 1AMFA 1MY4A 3EN3A 4EQBA 3FV1A 3UGWA 2AYSA 3U8QA 1H76A 3OD7A 4H8JA 3U72A 3KGCA 4YKKA 1LCTA 4I1DA 2I58A 2X7QA 1O64A 1POY1 2I0BA 3FASA 2XD2A 2Z8EA 4GWOA 3TPAA 1B6HA 5IKBA 4DZ1A 5EHMA 4R74A 1MY3A 5KZTA 2F8DA 2HCAA 1A55A 4OERA 3G3GA 2UVGA 3LSFB 5DT6A 3K02A 1AH5A 4U1ZA 1B1HA 1D4NA 5L8DA 3RT8A 3GZGA 1TFDA 4Q0CA 3T9HB 3V5AA 1B3LA 1GR2A 3S4UA 2F34A 3EHUA 5AA4B 5AE4A 4P11A 3PUYE 5H8NA 1JVXA 3KEIA 4XIGQ 2PBWA 3CRBA 1WDNA 4POXA 1SYHA 3G7WA 4OVJA 3KN3A 4F29A 4F39A 3KBRA 1LCFA 3MP8A 1OQGA 3GBAA 5FHOA 3SDFA 2O1LA 3N26A 3PU5A 1PBQA 3H03A 1MPBA 4YMBA 3Q26A 1MXZA 3OSQA 1OLAA 1NFTA 2HEUA 4H67A 2AL4A 3K6WA 4DXBA 1R9QA 3IOUA 3H4ZA 2DWJA 3C36A 5CBSA 1FQCA 3MP6A 1PDAA 3T22A 2ABHA 3HHFA 4FEBA 1NMUA 1FW0A 1JEVA 2HZKA 1N76A 3UA8A 1B0HA 2F36A 3K00A 5H8HB 4RA1A 3TTNA 4JBZA 2KLFA 5H8NB 1JVYA 5I59B 2PT2A 3HSTA 3FD3A 4NEDA 4IO3A 4U4SA 2DVZA 2ONKE 3FV2A 2ONRA 1B5JA 1OVBA 1L5TA 4FORA 1M5EA 4POWA 4MFIA 2R9JA 1ZU0A 2ZYNA 3U94A 3IB1A 3TCGA 1MQJA 2ZMBA 4OEVA 4HCWA 3OENA 2UVHA 4G2ZA 3VVFA 1P1QA 3TCFA 4ONYA 1LAGE 1B51A 3U1OA 3RN8A 3TTRA 2QMWA 3A3UA 3VDFA 3QUJA 4WEDA 5KCJB 2NOOA 3RPWA 1A8FA 1Y1ZA 3GXAA 4OZ9A 1EZPA 3PMWA 4GVOA 4ZS9A 4I62A 3G3KA 2H25A 4EF2A 3G3JA 2VHAA 2RCBA 3KG2A 4KCCA 3MUQA 2OCUA 3KN7A 1I6BA 5H8SA 4XKNA 1D9YA 3D4CA 1PC3A 4GXSB 1MXVA 3ZS6A 4C1TA 1FTMA 4PFTA 3N94A 3UK4A 5I58B 1EH3A 2X26A 1SYIA 1MXXA 5TP9B 4F1UA 3TODA 3IOVA 4XKPA 4X1BA 4KCDA 3E13X 5JTYA 3C35A 1SW1A 1P1UA 2GHAA 3CFZA 4R72A 3TKDA 5IAIA 3FXUA 3SEXA 2HAUA 3TZAA 1MRPA 1LBCA 2GHBA 1YTVA 3H6WA 3BFUA 4OHNA 4ISUA 2I0CA 5I57B 2I49A 3FJ7A 4X1DA 2Z23A 1QW0A 2Y7PA 2XX7A 3K0VA 4OFOA 3RQTA 1I6QA 3SEWA 1AIVA 3Q27A 2D21A 2DXYA 3AXFA 2ZNUA 2F78A 1QJMA 3G3HA 2Y7WA 2F6PA 3SETA 2H4IA 4GQOA 2Z8DA 3K1MA 3K1PA 5DEXA 2AL5A 1TXFA 1GV8A 2RINA 4DIGA 5JTYB 3O28A 3IB2A 5CRYA 3PPPA 4QSDA 1NNPA 1DSNA 2ZYOA 3F11A 2I6EA 4U2RA 3B7DA 2O69A 4F2QA 2F7AA 1ELJA 2O1MA 4R2FA 4F3SA 5FTHA 4JWXA 1H44A 4WEPA 3T9VA 1LSTA 3PGFA 3PPOA 4I8CA 1GTKA 4OEUA 3N6TA 3G3FA 4IGTA 1IIWA 3EQ1A 3TELA 2VOZA 3PPQA 2DSFA 1Y9UA 4DXUA 1OMPA 2UVJA 3MC2A 3R26A 3L6HA 3RTFB 4EUOA 4GF8A 2UVIA 3CG3A 3K2DA 3K01A 1T0KA 5F7VA 4R73A 4KI0E 5ELVA 3FVKA 3C33A 4F31B 3HV1A 3B6QA 4OETA 1LFHA 2XX8A 3CG1A 4O3AA 3MPLA 1LFGA 1B7HA 1ZLQA 3MZ9A 4RK9A 1N84A 1ANFA 5CMKA 1DPPA 3VVEA 5BWJA 3TUSA 4YU0A 2W7YA 5KDTA 4I9DA 2D3IA 3T9UA 2DQVA 1AL3A 4ZZEA 3TEPA 4DCXA 3UN6A 3SEYA 4BDMA 4NMYA 5L9OA 1ATGA 4LQ2A 4PETA 1Y20A 4RXLA 4RNSA 1FTKA 2NXOA 4FAJA 4TQUQ 1FQEA 5I56A 1MS7A 2Q2CA 3IAZA 4OFLA 4LZ7A 2OK2A 1GGGA 3V8XB 4OTEA 3PUWE 2E1SA 3IORA 3G3IA 4M1VA 5DTBA 2QMXA 1ZIUA 5ITPA 4R6HA 3RTWB 4WKMA 3O9PA 3QUFA 2B65A 1FQFA 1EZOA 2O6AA 1Y3PA 4PFYA 4BDNA 5KDTB 1MDQA 3H06B 1J1NA 3O97A 4ESWA 4ND9A 1JW1A 1NKXA 5CI5A 3THIA 2HAVA 4GXAA 3BBRA 1SW5A 2ALUA 3KJ7A 1DMBA 2OWSA 1B3FA 2ESNA 3KSJA 1OQHA 3LC8A 4G8NA 3IK6B 1BKAA 4MF3A 3FXRA 2Y7RA 5I56B 1QKBA 3W9VA 5AA4A 1M5DA 1SI0A 3RUMA 4PE5B 3JYRA 2XXWA 3IO4A 1M5BA 1H43A 3DP8A 4MH5A 2XXRA 3QK6A 4BLAA 1VFEA 4LUBA 2ZXTA 3FXQA 3JZJA 3WAFA 4F1YA 4AQ4A 3HN0A 3H6UA 4GL0A 3S2VA 4QSCA 1QVSA 4NF8B 2QS2A 4LATA 3IB0A 1B58A 1LLSA 1WVJA 5M2VA 2NVUB 5H8HA 2PYYA 2M8CA 1DTGA 3ILTB 5I59A 1P99A 5LOMA 3O6HA 3T9XB 3LUYA 4BDOA 3HO7A 4LVQA 5L9SA 1S7YA 4E0WA 2WKYA 3FVOA 1QUIA 4QF9A 1MQDA 4EDPA 1YPNA 1HSLA 1MPCA 2OLBA 1USYE 3CI8A 4ZE9A 3KOTA 1POTA 2VP1A 1QUKA 4KYDA 1B52A 4JSOA 3TMGA 4GD5A 1HSJA 4N6PA 1M5FA 1SQYA 3R7XA 4N13A 2F7CA 3K6XA 1URSA 4LQ5A 4NF6A 1UTBB 3Q29A 1A40A 2V93A 1PB7A 1QULA 4H1XA 2THIA 5BUUA 3PUVE 5KCJA 1HSEA 2O7IA 1MPDA 4YMAA 5ITOA 2RC9A 1DOTA 4DE8A 1PB9A 5L9MA 2B3FA 4NE4A 3SEVA 4E0XA 2I3WA 1YAEA 3MVWA 1MY0A 3HPIA 3ZSFA 5B7DA 1XC1A 5DYHA 1BIYA 3E9XA 3E3KA 4XXUA 3CSBA 4G8MA 1PB8A 3BKIB 4ZZAA 3RLFE 1RKMA 4EXKA 3MZBA 3Q28A 2DWAA 2LAOA 3RT6B 2CZLA 5CMCA 4ZEDA 3IO6A 5I58A 3P7IA 3DP6A 4FIMA 3D4GA 2ZNSA 5TP9A 4QFKA 4FE8A 1MXYA 4NF6B 2PMSA 2PX1A 3OO8A 1ZBMA 2X7PA 3K6UA 4WXJA 1RYXA 2RF1A 3O66A 5I57A 2QS1A 2QJEA 3O2AA 1LGBC 1B46A 5I2NB 4YB7A 3WAEA 2OZZA 1B7ZA 2ONSA 1B2HA 4JDFA 5EHSA 1IITA 1XOCA 3RNNA 3S9EA 2PVUA 3U92A 4DCYA 2G29A 5JEIA 5K2XA 4X48A 4LZ5A 3SEUA 1S50A 1JQFA 3HCQA 4ZEBA 1LB9A 2IA4A 3HHGA 1NH7A 1BTJA 4R2BA 3B6TA 1B4HA 4GFRA 1MXWA 3DM0A 5ICQA 4PP0A 1P1WA 5AA3A 1IXGA 2DE2A 4N07A 3UP9A 3Q25A 2XXUA 4IO6A 4RK2A 4ELRA 1JW5A 3V83A 4G77A 4QFNA 3A09A 1VE4A 1EU8A 1NL5A 4IO5A 5K2YA 3C34A 1TT1A 5CMBA 1H45A 1IUDA 4ZDMA 1SI1A 2ZYMA 3TYHA 4MLQA 4ECFA 2NUVA 3N6UA 5FHMA 2XXHA 1S9TA 4HS7A 3RY3A 3MBPA 2P2AA 2H5YA 3A3CA 2V3TA 4F3GA 3MWBA 3DP4A 2XHDA 3K1NA 3EHSA 1B1XA 3CFLA 4OWDA 2UXAA 4IO2A 1URGA 1N3XA 2VGQA 1JETA 4H5FA 3OMBA 3PUZE 3MPKA 4HW8A 2I3VA 3TDJA 3IL1B 3VLWA 4FECA 4O3BA 3L6GA 1B0LA 5DVIA 1MH3A 3KZGA 2XXXA 4YKJA 3TTMA 1BLFA 4Z0IA 3ODBA 2F97A 1SBPA 5JK4A 2DVCA 3OEMA 1B5IA 3I3VA 4R6YA 4ESXA 2FNCA 2CMOA 1GVCA 3RGYA 3LBSA 3PPNA 4GLIA 2DOJA 2Q8JA 3LSXA 3CR9A 2GH9A 5J1DA 2XXQA 3MW0A 4H6DA 3O6IA 4PQJA 4NWCA 3OO6A 3TTKA 4QFOA 4F2OA 1MXUA 2RCAA 1OLCA 2Z22A 3OEKA 3S9NC 2QS4A 4XKQA 3MAMA 2IEEA 3OXNA 1SW4A 1USYH 1LAXA 2ANJA 2QS3A 5AA2A 1ZJLA 4ELOA 4NTLA 4IB2A 3EPEA 3VFJA 3VLUA 1LFIA 3I5OA 3T93B 5I2KA 3DLNA 1VR5A 2UYEA 2G93A 4GOTA 4P0IA 3MJNA 1LBBA 3C4MA 2HXWA 4M4GA 2OBGA 5I84A 1CB6A 1R1NA 4R6KA 1URDA 4NF4B 4KQPA 2PT1A 1NH8A 1B3GA 3IJXB 1MY2A 2Y7IA 1IXHA 2R71A 1FTJA 3IJOB 1TWYA 2XX9A 4JXIA 1WODA 2R6GE 1UIUA 4OQOA 2NWJA 1I69A 4G4PA 1ZKBA 5ICTA 4Z7EA 2DS9A 4QFPA 1A7LA 4KR5A 4U21A 4KPTA 4FJPA 4DXCA 5AA2B 2A5TB 2XXPA 2V25A 5FTIA 1SVXB 3PMXA 1B32A 4NF8A 3TQWA 4OYVA 5CMMA 3BFTA 5I2KB 3DELB 3FUZA 4R9FA 2HFBA 4G68A 3C32A 3H7MA 3IOWA 3QYTA 3GBBA 4OMBA 3FATA 1B9JA 2I48A 2V3UA 1JEUA 1LAFE 2V3QA 1OVTA 1N7XA 4H5GA 1A8EA 2QL3A 1TFAA 4EXLA 5CM6A 2GRVA 3UORA 2P0SA 3KFMA 1SD3A 3O29A 1CE2A 4GRKA 1QKAA 3MP1A 3OO9A 4GIZA 2REGA 4TOZA 2YPNA 3PD8A 4U4XA 3VVDA 2H9BA 4F1VA 1UTBA 1XVYA 3USDA 4NWDA 2ZYKA 3FJGA 4C0RA 5H8QA 4G68B 4IO4A 1B4ZA 1IXCA 3OO7A 2XD3A 2O7UA 1YCJA 3VLVA 3E4RA 4RYAA 1XHYA 4C1UA 3R6UA 4H8IA 2E0SA 3H3GA 4QSEA 4YZZA 4IGRA 1R9LA 4ZEFA 4L17A 1SDXA 3LSWA 2RC8A 4FATA 1MQIA 5HPQA 3IOTA 4P0GA 3TFLA 1B40A 1ZMGA 5DVFA 5EYFA 4HCYA 1D3KA 1VSOA 1A99A 3TTLA 3M8UA 3CSGA 1Z7ME 1ZTYA 2ZNTA 2BJJX 4KD5A 3SKPA 4EF1A 1DPEA 5H8QB 4DLDA 1FQBA 2V84A 4PFUA 4Q8RA 3B6WA 4UACA 3QSLA 3MVZA 1MG1A 2GFEA 3FGSA 2FA7A 3PMVA 5I2NA 4O3CA 1D9VA 2I4CA 4IY5A 1XVXA 4F18A 1Y3QA 1MDP1 5CBRA 3KN8A 4AB6A 2FYIA 1MY1A 4OESA 3MQ9A 4ZEKA 4IY6A 1MM7A 2HQ0A 2XXVA 4U1OA 4JWOA 2DP8A 1QUJA 1NNFA 5TPAA 1UQWA 4GL8A 4QRZA 4OENA 2DWHA 1M5CA 1RYOA 1P1OA 2XXIA 4F3BA 2Q2AA 2QPQA 3ECRA 3LR1A 3VE1B 3H6VA 4JSDA 1Y3NA 1IEJA 2F35A 3PV0E 2REJA 1N04A 1IZ1A 4NF5A 1LAHE 3FJMA 4KFQA 5AA1A 2QRYA 5DVJA 2I4BA 3OOAA 2DYXA 1Y4CA 1JNFA 4K3FA 5B70A 1EZ9A 4RJZA 5A5XA 3M3LA 4R9GA 2H99A 1N0TA 4U22A 3TCHA 5F1QA 2Y84A 1O7TA 4YKIA 1PBPA 4YB6A 5TPAB 2Q88A 5FHNA 4F22A 5H8FA 4QHQA 4XTCQ 1F9BA 1US4A 2F7BA 4KYEA 1I6AA 3V89B 1DTZA 2O51A 4NF5B 3QIMA 3MZ1A 3ZKKA 3TAJA 4G68C 3ONMA 1NNTA 3T96B 3OSRA 2F6GA 3SERA 3S9MC 1B3HA 4X9TA 3QXMA 3FVNA 3I6VA 5A5XB 1Z7NE 3PPRA 3OELA 5TU0A 4OXVA 1P1NA 2D5WA 2DE4A 4LZ8A 3UIFA 3W15C 1H3DA 2P1SA 1UTHA 1SW2A 4ELPA 1VFDA 3ILUB 4YICA 3KJTA 3JV9A 2YLNA 5H8FB 3KOSA 3VV5A 1FQAA 2OJTA 4UA8A 1MQGA 2O84X 3FZVA 4R75A 1XS5A 3PUXE 1UIVA 3EF7A 2YJPA 4EQ9A 3IR1A 4MLVA 1JW4A 1LB8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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