3PMXA

Ligand-binding domain of glua2 (flip) ionotropic glutamate receptor in complex with an allosteric modulator
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
263
structure length
262
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDLKNKWWYDKGECGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure based evolution of a novel series of positive modulators of the AMPA receptor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 85
structure length 262
sequence length 263
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-11-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3pmxA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3pmxA02
2HFBA 3D4CA 5DT6A 4R6HA 5EHSA 1MDP1 4TLMB 1B7HA 5CBRA 1LCFA 1MY2A 4OEVA 1BLFA 3FZVA 1Y3NA 4R74A 1BKAA 1LSTA 2X7PA 4R73A 3R7XA 3PUXE 4FIMA 4KFQA 5CMBA 1OMPA 1MQJA 2RC9A 4HS7A 4BDLA 5KDTB 2AIXA 1AL3A 2X26A 3QUFA 3VDFA 2F7AA 1JEVA 3H6WA 3QIMA 1GR2A 2OBGA 2Q88A 1SW2A 4ELQA 2Z8DA 1OQHA 4JDFA 5H8FA 3E3KA 1EU8A 3RLFE 2D3IA 2RC7A 3LSWA 3O29A 1MDQA 4KYSA 1N7WA 4DCXA 3PU5A 2I48A 3T66A 3TPAA 4YAHX 3JV9A 3TAJA 1LLSA 4NF5B 4NTLA 3EF7A 2ZYOA 3PV0E 3T22A 2I0BA 3G3GA 4G68A 5ITOA 3V83A 4IGTA 5F1QA 4OTEA 3K02A 2UVIA 4FAJA 3K4UA 3KSJA 2X7QA 3KFMA 2Y84A 2ZMBA 4OENA 3LUYA 4Q8RA 2Y7RA 4H1XA 1LB9A 3MWBA 1SI1A 2F97A 4L17A 3PUWE 4P11A 2O84X 3VVDA 4YB7A 3KBRA 1A8FA 1NKXA 5TP9B 1MS7A 1IXCA 3C34A 4EQ9A 1B05A 3T93B 1MXUA 2V3TA 5CBSA 3RN8A 3OSRA 2QS2A 2NOOA 5B70A 3CSBA 4R2FA 3S4UA 2DYXA 5TPAA 4UACA 4MBPA 5H8HA 4H5FA 1OVBA 1MXWA 3CI8A 5DVIA 2QL3A 1MXZA 3A3CA 4QSDA 1GGGA 1R9LA 1Z7ME 3M8UA 4H0WA 5L9MA 1JW5A 3D4GA 4KD5A 4JB7A 3KJ7A 2DXRA 2PT1A 4YMAA 2H25A 1QUIA 3UGWA 3MVWA 2DXYA 4ZECA 1MY4A 1CE2A 5I59B 3T9HB 5H8NA 4O3AA 3PUZE 4H67A 4GL8A 2VP1A 3HHFA 5EYFA 1N04A 1XHYA 4PE5B 3C32A 1ELJA 4FE8A 4N6PA 1QKBA 3BKIB 5I56B 1N76A 4KR5A 4LUBA 4KCCA 1MQGA 1VE4A 1JVXA 5KDTA 4PP0A 1YTVA 1LBCA 1TFAA 2PMSA 2AL4A 3C35A 2XXUA 1P1QA 2ZNTA 3B6TA 4ISUA 4GFRA 3G3FA 1UIVA 4IY6A 3V8XB 5EHMA 2ESNA 3EQ1A 3P7IA 3ZS6A 1QKAA 3W9VA 2Z23A 4IO2A 4OFOA 3S2VA 2UYEA 4NF5A 3UK4A 3KN8A 2HAUA 2QMWA 4XKRA 1SI0A 2LAOA 1PB7A 4H8JA 1US5A 3DELB 1O7TA 4H8IA 1USYE 2I3VA 2V25A 1XVXA 3KG2A 3TFLA 1AMFA 1T0KA 2QS1A 1OLCA 1FQCA 3EHSA 1M5FA 2ZYNA 3VE1B 4QFKA 4FECA 1B0HA 1NNPA 4E0WA 5ICTA 3QXMA 3MP6A 4WEPA 1QW0A 4G8NA 5HM4B 2QS4A 1SD3A 1XVYA 3TUSA 1I6QA 1RYOA 3FXRA 5I57B 3KGCA 1JW4A 4ZEIA 3DM0A 4LZ7A 3PPPA 1YCJA 3WAEA 2DE2A 4XXUA 2ONKE 2AYSA 3G3JA 1I6AA 1S50A 5CC2A 4GQOA 1MY1A 3H4ZA 4KYEA 3RNNA 3C9HA 4NF6B 3M3KA 3EPEA 4U4XA 1B5IA 4MFIA 5I59A 4G8HA 5CI5A 1PBPA 3K2DA 3TTMA 2XX9A 2H4IA 3VLUA 3C4MA 5CMKA 1IIWA 1DPEA 5I56A 3S9MC 2REGA 5CRYA 4DIGA 5A5XA 1M5DA 3K6WA 1S7YA 1H44A 1N7XA 1ZTYA 3OELA 5AA2D 4AB6A 4DXBA 1Q35A 2ONRA 3MW0A 2DVZA 4G4PA 1ZMGA 1SYHA 2PT2A 2D21A 4JXIA 3IORA 5F7VA 3SERA 3VXBA 4U4SA 2XXPA 2VD2A 1LAHE 4PFTA 2OK2A 2Z22A 5CMCA 4BDNA 2UXAA 1VFEA 3TCFA 1MG1A 5L9OA 3PGFA 3OO8A 2Z8EA 1B0LA 3VVEA 5ELVA 2I4CA 1B3GA 4R75A 2I49A 5B7DA 4FATA 1P99A 2P0SA 2R6GE 3OEKA 4LZ5A 1J1NA 2DS9A 3HPIA 4U21A 1Y3QA 3O6IA 2KLFA 4ND9A 5DYHA 3MP8A 1GV8A 3E13X 4C1UA 2HAVA 5CM6A 2F7BA 1MPCA 3PUYE 2GHAA 4JWXA 4NWCA 3K00A 2RCBA 4I62A 1EZOA 4BDOA 5L8DA 3VVFA 3KOTA 3MZ9A 2GRVA 4GOTA 2VD3A 4IGRA 1UTHA 1OIBA 3TTKA 5I57A 2XXXA 4LA9A 2H9BA 5FHNA 1LBBA 2AL5A 3VLVA 5FTIA 1B4ZA 3KOSA 1URSA 3CFLA 2ZXTA 2XHDA 4I1DA 2E0SA 4YKKA 2B3BA 4ELOA 3RTWB 3U92A 1VFDA 3QAXA 1FQAA 3T9UA 1ZIUA 4DLDA 4NF6A 4E0XA 3H6VA 1FQEA 1IXHA 3LBSA 5KZTA 3GXAA 4JWOA 4LP2B 3HCQA 3HV1A 4Z0IA 2VOZA 3TQLA 1JVYA 3UN6A 5JTYB 2DP8A 3GBBA 3PPOA 4QFOA 5K2XA 1M5CA 3TZAA 4IY5A 3RY3A 4ZZEA 4FEBA 3ILUB 4MH5A 4OVJA 1B7UA 3FUZA 4M1VA 3SDFA 1R1NA 4RY1A 4OMBA 4OWDA 2Y7PA 1A55A 3QSLA 1B5JA 4G2ZA 3OSQA 2NWJA 3OENA 1N84A 5ISUA 3DP8A 2ABHA 3PUVE 4AB5A 1JETA 3TELA 1B51A 5K2YA 5KCJB 4JSOA 5I2KB 1NNKA 1TT1A 2O6AA 4MLQA 1P1UA 1URDA 3BFTA 3TYHA 1MRPA 4KCDA 3MZBA 4ZEKA 5AE4A 4RNSA 4U2RA 4QSCA 3UIFA 1R6ZA 3MVYA 1NH8A 1NNTA 1IQ7A 2Y7IA 2VGQA 3TMGA 3FVKA 2XXQA 2Q89A 1B3FA 4HCWA 2GFEA 4F2OA 3I3VA 3SETA 3GBAA 4FJPA 1DOTA 4M4GA 3SEYA 1WODA 2UYFA 2F5XA 2XXYA 1D3KA 2FNCA 3N5LA 2XD2A 1LB8A 1B6HA 3Q26A 3FATA 4WXJA 3RQTA 1OVTA 3V89B 2F7CA 2H5YA 2OLBA 3UORA 3KSXA 3Q25A 4OQOA 5HBCA 5AA2A 5BWJA 4PFWA 1IXGA 2CMOA 3I6VA 2QRYA 4P0GA 1B7ZA 3FJ7A 3CIJA 5A5XB 4GWOA 4OESA 2O7UA 4DZ1A 2XXVA 1UTBB 2XXIA 1MH4A 3KEIA 4H65A 3C33A 3S9LC 1SYIA 5I2NB 4YKPA 1WVJA 2P1SA 1P1OA 4GXSB 2O1LA 4EQBA 3FV1A 4P0IA 1Y1ZA 4R6YA 2F6PA 5DVFA 1LFGA 1DMBA 1EZPA 3Q29A 3LSFB 3IJOB 1DPPA 3BFUA 2F78A 1D4NA 1N3WA 3IOVA 2E1SA 2I3WA 3S9NC 4WKMA 4EXKA 4F3SA 4OXVA 1MXYA 4OZ9A 5JTYA 2O69A 1FTLA 2B65A 4H6DA 3MQ9A 4O3BA 1A7LA 3S9EA 3FVOA 1LGBC 4F3PA 2RF1A 4NE4A 3TTNA 3IR1A 4LQ2A 1SW5A 3G3HA 3TTLA 1F9BA 3ZSFA 2O1MA 1HSJA 3LR1A 2PVUA 1NNFA 2I58A 3FJMA 1MQIA 4GL0A 4TLLB 5I58B 4Z7EA 3IOWA 3EN3A 3O66A 3O6GA 5KCJA 1Y4CA 1ZKBA 1B9JA 3ILTB 5I2KA 4R6KA 2ALUA 1SQYA 3L6HA 2DOJA 2IEEA 2F35A 1UTHB 1SW4A 2B3FA 1QUKA 4U22A 3IOTA 1ATGA 2ZYKA 3CVGA 4F1VA 2XXHA 5H8SA 1FCKA 3IO6A 4ELPA 5H8QB 1D9VA 4I8CA 2HZKA 4BDQA 3I5OA 4N07A 1QJMA 1H3DA 1BIYA 4YZZA 3CSGA 1Y4TA 4IO6A 2Y7KA 3OOAA 3ECRA 1PB8A 4RK2A 1H45A 3FD3A 4F39A 2THIA 5TU0A 4BDMA 1TWYA 3CFZA 1Y1MA 2DE3A 1NH7A 3VXCA 3IB0A 5ICQA 3O97A 1B2HA 2UVJA 3THIA 4HTGA 3RGYA 3PMWA 3ODBA 1PB9A 3T96B 1II5A 4N13A 1FQDA 3IOUA 3IAZA 4ESWA 1N0TA 3H3GA 3Q27A 3OMBA 4QSEA 1UTBA 3QUJA 3ZKLA 4YKJA 3HHGA 3MPKA 2V93A 5I2NA 2I0CA 3RUMA 3FVGA 1ZBMA 3MUQA 1HSLA 3IO4A 2WKYA 3R6UA 4YB5A 4ZE8A 4QFPA 3O2AA 3E4RA 3TTRA 2Q2AA 2HCAA 5IKBA 1B46A 4R2BA 1EH3A 5DEXB 4PFYA 3TODA 2F34A 1ZJLA 2DWIA 1DTZA 4ZE9A 1RKMA 4QFNA 4EDPA 3N26A 4LATA 4RPNA 1O64A 2Q2CA 2FA7A 2ONSA 2XX8A 4AQ4A 4GVOA 1KWHA 3B6QA 3N6UA 4EF2A 1UQWA 3OO6A 2F6GA 2G93A 1B3EA 3HO7A 2FYIA 4DE8A 2O7IA 3H6TA 2HQ0A 1AIVA 2PYYA 3K1PA 1B40A 4R9GA 4YKIA 3PPNA 1MXVA 4Q0CA 3GLBA 1GTKA 5I58A 3IB1A 5J1DA 4GRKA 1S9TA 4OEUA 3V5AA 3VV5A 4F18A 3K1MA 1PDAA 4NF4B 5AA2B 2DQVA 1ZU0A 2HZLA 3BBRA 1FW0A 4THIA 1JW1A 4XIGQ 4PFUA 2HEUA 2RKMA 5H8QA 1UIUA 3VFJA 1P1NA 3OO9A 1FQFA 1B3HA 2DWJA 3B6WA 3U94A 1A99A 2GH9A 4LVQA 3U72A 2A5TB 3O28A 4RA1A 2REJA 1LFHA 4R9FA 3O6HA 1NMUA 1FQBA 3RTFB 4X1DA 3FXUA 5AA4A 4IO3A 4HCYA 3OO7A 4TOZA 3MVXA 4Q30B 4ZEBA 3W9WA 3DP4A 3F11A 3QYTA 1YPNA 4GXAA 3FIRA 5FHMA 1H43A 4LQ5A 3T9XB 4ZDMA 3WAFA 2QS3A 1M5EA 3KZGA 1TXFA 2PX1A 2PBWA 3HN0A 5AA1A 4QRZA 3JYRA 1URGA 1SW1A 4EXLA 1QULA 4U1OA 2QMXA 1QVSA 2Y7WA 1EZ9A 2R9JA 2OZZA 2G29A 3T9VA 5I84A 4F22A 3Q28A 4ESXA 2QSXA 3SEXA 3HSTA 1MQHA 4MLVA 4EUOA 1OLAA 3QK6A 2V3UA 3M3LA 3FGSA 1Q1KA 3LSLA 1MM7A 4XKPA 5DEXA 4DDDA 5AA3A 3U8QA 3MC2A 4ZEFA 4JBZA 1VSOA 1FTMA 1O63A 3UA8A 2XXWA 2NUVA 1SDXA 1B1HA 4EQ7A 4X9TA 4F3BA 3DLNA 4YB6A 4PQJA 4QFLA 3PD8A 2CZLA 2QPQA 1IITA 4GF8A 2DSFA 3A3UA 3MZ1A 1LCTA 3IL1B 4NMYA 2XX7A 4GIZA 4JSDA 1Y3PA 4GD5A 1A8EA 4Q5TA 3TDJA 4C0RA 1FTJA 1D9YA 4OERA 3A09A 5M2VA 4NF4A 4OFJA 1MPBA 4U1ZA 3U93A 1FTKA 1ANFA 2ZYMA 1MM6A 3K0VA 4HW8A 5FTHA 4X48A 3SEVA 1NL5A 4O3CA 3IX1A 1YAEA 4F2QA 3K01A 1GVCA 2ZNSA 3LC8A 4NEDA 1B4HA 1MXXA 2YJPA 4QF9A 1AOVA 4G77A 3G3KA 3N6TA 5ITPA 2A5TA 1MY0A 4FEDA 2R71A 2M8CA 5DTBA 3PD9A 4ELRA 2OCUA 4IO7A 2RCAA 1NFTA 4K3FA 1PBQA 2W7YA 3K6UA 3C31A 1SBPA 4I9DA 4DCYA 3TQWA 3JZJA 1SVXB 5HPQA 5IAIA 3CRBA 4TQUQ 1LAGE 1USYH 3PMVA 5FHOA 4RK9A 1CB6A 1XOCA 1DTGA 1B5HA 2Q9TA 3K1NA 2DE4A 1H76A 4RXLA 2ZNUA 3KN3A 4ECFA 3MBPA 4NWDA 3OEMA 5L9SA 3PMXA 4NF8B 4F3GA 5LOMA 1Y20A 3K6VA 3N94A 3FASA 1RYXA 3RT8A 2O68A 4F29A 3B7DA 2OJTA 4FORA 4XKQA 2DWAA 3KJTA 1JNFA 2Q8JA 4G8MA 1MY3A 3SESA 1QUJA 1XS5A 1A40A 4MF3A 2XXRA 2I6EA 3DP6A 3LSXA 1L5TA 2VHAA 3CR9A 5TP9A 2DWHA 3TCHA 5CMMA 4KPTA 1BTJA 4BDRA 1PC3A 4C1TA 4ZZAA 1ZLQA 4H5GA 1LFIA 1XT8A 4JWYA 2UVHA 1DSNA 4UA8A 1WDNA 3RPWA 3OD7A 2YPNA 1I6BA 2OWSA 4EF1A 1VR5A 2H98A 1US4A 4LONB 3FXQA 3IK6B 3IJXB 4YU0A 3L6GA 3G3IA 3SEUA 1B1XA 4F19A 3PPRA 5AA4B 3R26A 1MPDA 2H99A 4XTCQ 2F36A 1HSEA 3CG1A 3USDA 3OXNA 1PEBA 2XXTA 1IEJA 4F1YA 3VLWA 3E9XA 1Z7NE 3TEPA 3C36A 5H8FB 2RINA 4RYAA 4ZS9A 1B32A 2P2AA 3SEWA 4XKNA 1P1WA 4POXA 2V3QA 3PPQA 4IB2A 2D5WA 3TKDA 1A54A 3RT6B 1FTOA 3ZKKA 3MP1A 1Y9UA 2UVGA 1MH3A 5DVJA 4IO4A 3GZGA 2BJJX 1IUDA 4G68B 1JEUA 2I4BA 2NXOA 5BUUA 1OQGA 4OHNA 4ONYA 3MAMA 1IXIA 4U23A 4KHZE 1POTA 2YLNA 3TCGA 2A5SA 3H7MA 3MPLA 3H03A 3MVZA 1N3XA 4KQPA 1JQFA 1MQDA 4R72A 1M5BA 3K6XA 4RJZA 1I69A 3FVNA 3UP9A 4G68C 3M3FA 3U1OA 2QJEA 1AH5A 1B58A 3FV2A 4RPOA 2XD3A 3MJNA 4OETA 3FJGA 2RC8A 3W15C 4DXCA 1R9QA 2V84A 4KI0E 1POY1 4LZ8A 2F8DA 5JK4A 2OWTA 4OFLA 4POWA 4WEDA 4PETA 4YMBA 5TPAB 5H8HB 1TFDA 3EHTA 3H6UA 3CFXA 2DVCA 1B3LA 4NF8A 4ZEDA 4OYVA 2IA4A 2ANJA 1IZ1A 3H06B 1B52A 5JEIA 2O51A 3EHUA 3SKPA 4IO5A 3G7WA 4X1BA 3ONMA 4YICA 4F31B 3IB2A 3AXFA 1BP5A 3O9PA 4BLAA 2NVUB 4DXUA 4KYDA 4GLIA 2GHBA 4F1UA 3KN7A 3CG3A 1LAXA 1XC1A 2Z8FA 5H8NB 4QHQA 1LAFE 2HXWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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