3PMXA

Ligand-binding domain of glua2 (flip) ionotropic glutamate receptor in complex with an allosteric modulator
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
263
structure length
262
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDLKNKWWYDKGECGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Structure based evolution of a novel series of positive modulators of the AMPA receptor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 85
structure length 262
sequence length 263
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-11-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3pmxA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3pmxA02
4C0RA 4OWDA 4NF6A 3MP1A 4UA8A 5AE4A 1GV8A 1MQHA 3RY3A 1LCFA 3E4RA 1SW2A 2O84X 1FTJA 3VLVA 4EXLA 4OEVA 4F39A 2ZMBA 3FATA 3GLBA 3G3KA 3C36A 1MM6A 3KN7A 3C35A 4AQ4A 4PP0A 4LA9A 5CMBA 1NMUA 1NNKA 1B4ZA 3USDA 2VHAA 4IY5A 5DEXB 4RJZA 3DLNA 3BFUA 3D4CA 1N7XA 2Y84A 1D4NA 3C4MA 1Y3PA 5H8SA 1P99A 3N26A 1O63A 2UVJA 4QFPA 1N04A 1WODA 2ANJA 5CBSA 4YKIA 3TFLA 4F18A 3IB2A 1AMFA 3VDFA 3S9EA 4G77A 3SEUA 1B58A 4U1ZA 1M5BA 2XXRA 1GGGA 4GF8A 5HBCA 4TLLB 3FD3A 3IJXB 3RNNA 3CSGA 3DP4A 4GOTA 4ECFA 5AA2A 3AXFA 3VE1B 1MY0A 1A40A 3V89B 2XXPA 3T9VA 3IB0A 3BBRA 2F6GA 4F2OA 3Q28A 2KLFA 2Y7RA 2XXHA 1XC1A 5CMCA 2VGQA 4KR5A 1A8EA 4GXSB 1O7TA 1XS5A 4NF4A 3Q25A 1US4A 2I4CA 4RYAA 1N3XA 2H9BA 1VFDA 2O1LA 3PV0E 3UK4A 1MXUA 3DP8A 4OFJA 3R26A 3UP9A 3G3FA 3SESA 5AA2D 4ZE8A 4OTEA 3VLUA 3VVEA 5IAIA 1ZLQA 3G3GA 3QAXA 5CM6A 3KGCA 5ICQA 3F11A 1Z7NE 1P1OA 2Q2AA 2A5SA 4IO3A 4DXUA 1H3DA 3DM0A 1O64A 1SQYA 3U93A 2M8CA 2V3UA 3ECRA 2BJJX 3OEKA 4X1BA 3OENA 5DVIA 2UVHA 3OO7A 3PUZE 3PPPA 4YAHX 2Q8JA 3E3KA 1FQBA 2V25A 3PMVA 4THIA 1IITA 1OVBA 2REGA 3SETA 3FZVA 3PUYE 2HZLA 3O29A 4RA1A 4KPTA 4DE8A 1SI0A 4OVJA 2H4IA 1MY2A 3K01A 3OXNA 3OELA 2OWSA 5I2NA 3T9UA 1LBCA 3ILUB 3CSBA 5H8HA 3K02A 3BFTA 1XT8A 4GIZA 4OEUA 3FV1A 2DVZA 3SDFA 1EH3A 2OJTA 2O68A 1MXZA 3CG3A 2X7QA 2V3TA 3M3KA 4OENA 4RK2A 1Y3NA 4YZZA 2RCBA 3OO9A 1PB7A 4ZEIA 1MDQA 3KJ7A 5CC2A 3KJTA 3KFMA 2QS4A 5AA3A 5BUUA 1TXFA 2XXYA 3RTFB 3HHFA 4U22A 4EDPA 1HSEA 3N94A 4N07A 5KZTA 1XOCA 1SI1A 3EHSA 4YB6A 3SERA 4JXIA 1XHYA 2P2AA 1A55A 3MVZA 4LZ5A 4IO4A 1B5JA 3IB1A 1USYE 1P1UA 3KSJA 4DCXA 1MQJA 2DXYA 1OMPA 2PBWA 2OLBA 2DS9A 4RXLA 3EHTA 5H8FB 1EZ9A 4GLIA 2YPNA 4NEDA 4G68A 4IY6A 4YKPA 3JYRA 1POTA 4TLMB 4YMBA 3T66A 1P1WA 3T9XB 4PFUA 3MZ1A 4MLQA 2DVCA 4QSCA 3K1MA 3OOAA 3QUJA 1MXWA 1LFGA 1R1NA 3CVGA 4GRKA 4AB6A 1NH8A 5I59A 3C32A 5I2KA 1B2HA 4H1XA 1F9BA 3K1PA 1HSLA 2OK2A 1PBPA 1RYOA 2X7PA 3KN8A 4NF6B 2E1SA 4EUOA 2D21A 4FORA 1RYXA 1M5EA 2REJA 5F1QA 3ONMA 3HPIA 4FEDA 3LSXA 3MVXA 2UXAA 3FIRA 2FYIA 3IOVA 1QKBA 3SEWA 4U23A 4GXAA 4DIGA 1LFHA 1URDA 3UA8A 4OESA 4YMAA 4ZE9A 1QUKA 3I3VA 2P0SA 1R9LA 4BDRA 4OMBA 3B6WA 2XX7A 3HO7A 4E0WA 1UTHA 2PT1A 4TQUQ 4XTCQ 3CI8A 4EF1A 2GH9A 3K6XA 4R74A 3TCGA 4X48A 3QYTA 5L9OA 3K6WA 1MH3A 4LZ8A 3KBRA 1LSTA 3MBPA 1I69A 3PUXE 3FUZA 3FJGA 1H76A 1AIVA 4DCYA 1PB9A 4FATA 5FTHA 5AA2B 3G3JA 3MAMA 4QHQA 1BP5A 3O28A 2WKYA 4WEDA 4EQBA 1PDAA 3CRBA 3TPAA 1B1HA 3FASA 5A5XB 3MVYA 3UN6A 4EQ7A 3HHGA 1IIWA 1ZJLA 5TP9A 4POXA 1IUDA 5KDTA 4U4XA 3MWBA 1Y4CA 2ONSA 1EZOA 3K2DA 4F3BA 3H3GA 5DT6A 4R72A 1II5A 1Y1MA 1JETA 2XX9A 4K3FA 1MS7A 4L17A 2HXWA 1QVSA 5FHOA 4ISUA 4WKMA 1UQWA 1D9YA 3IR1A 2AL5A 4XIGQ 1N76A 5I56A 5TPAA 3W9WA 2QMWA 2DP8A 3VFJA 1NH7A 2Y7PA 1B7UA 5H8NA 1OLCA 1SYHA 2F34A 3RPWA 5HPQA 1IXIA 1OQHA 4QFOA 3K0VA 2H98A 1I6BA 4IO6A 4O3CA 5K2XA 1B1XA 1FQFA 4H67A 5KCJA 3H03A 2NUVA 2QJEA 4ZEDA 3ZKKA 3TQLA 2GFEA 1FTLA 1DTGA 2G93A 4KI0E 3O97A 1B0LA 1LB9A 3LC8A 3TYHA 2Q88A 1XVXA 1I6QA 3QIMA 2PYYA 4ONYA 3TDJA 4ELRA 3TODA 3TZAA 4KHZE 1Y20A 1L5TA 2QS3A 3EF7A 3D4GA 5FHMA 3E13X 4JWXA 4IO7A 5CRYA 5I57A 2Z23A 2YLNA 1SW5A 3HSTA 2IEEA 2VD3A 1URSA 1MXVA 5I84A 1UTBB 2DWAA 1NKXA 2ZYNA 4F19A 3B7DA 5I58A 1JVXA 3O6GA 1RKMA 1Y9UA 2RC9A 2HAUA 3Q26A 2OCUA 4KCDA 4BDQA 4LQ5A 1LAHE 4NF8B 1N0TA 2ZNSA 4GVOA 4F3SA 3I5OA 2NXOA 3K00A 4NTLA 3IOUA 1BKAA 4M4GA 4ZEFA 4ZZAA 1NNFA 2F8DA 3ZS6A 5CI5A 4ND9A 3UGWA 1AOVA 1TT1A 3FGSA 4F1UA 3CG1A 3PPQA 5EHMA 1NFTA 3U92A 2A5TA 3FJ7A 4ELOA 3A09A 3O2AA 5ELVA 3G3HA 4G68B 1ZMGA 2QS1A 3VXBA 1R6ZA 2XXTA 3C33A 3IK6B 2O7UA 2DWJA 4U21A 5L9SA 2DXRA 3HN0A 4ZZEA 1BLFA 3PU5A 3Q29A 1GR2A 4BDNA 5H8QB 1MPBA 2QMXA 1R9QA 4GL8A 3MVWA 5IKBA 3IX1A 2LAOA 4I62A 3FVOA 3IOWA 2I6EA 3MW0A 3LSFB 1OIBA 1FQEA 1UIVA 5DEXA 3ZSFA 3A3UA 1B3LA 4OZ9A 3TTKA 1JNFA 5DYHA 4LQ2A 4XXUA 3V5AA 1QW0A 1P1QA 4KYSA 3TTNA 3OSQA 1MQIA 3I6VA 4EF2A 1SVXB 4G68C 5F7VA 3KZGA 3UIFA 3CFXA 5BWJA 1EU8A 2XXVA 2CZLA 4IGRA 3W15C 1JEUA 4NF5A 2H25A 3T22A 1D3KA 1B52A 1UTHB 1QKAA 1B7ZA 3OO8A 1WDNA 1GTKA 2XXXA 4QSDA 2DYXA 3ZKLA 4BLAA 5ICTA 1J1NA 3PUVE 3RLFE 2ZNUA 3T93B 1LGBC 3QSLA 3CFLA 1MY1A 4IGTA 1YAEA 1MPDA 5JEIA 3ILTB 1NNPA 1B46A 1ATGA 4BDLA 1Y1ZA 3B6TA 4BDMA 3KN3A 1FTKA 1JQFA 4PFTA 3EPEA 4RY1A 1BIYA 3VLWA 4F1VA 4OETA 3N6TA 1B05A 4GQOA 5AA4B 4POWA 3MC2A 4KYEA 1D9VA 2NOOA 3S2VA 5B70A 4DLDA 4R6YA 1XVYA 2HFBA 5M2VA 1B40A 1OLAA 2OBGA 3O9PA 3PMWA 2O7IA 4R9GA 4XKQA 4N6PA 1QUJA 3CR9A 4QFNA 1TFDA 5TU0A 1USYH 1B3HA 4ESWA 3WAFA 3G3IA 3S9NC 3G7WA 5HM4B 4MBPA 4HTGA 2I3VA 3BKIB 2AIXA 4F3PA 1LFIA 5I56B 4OXVA 1TWYA 4PQJA 4R75A 4QFKA 1UIUA 4O3BA 4R73A 2QL3A 1LCTA 5JK4A 2D5WA 4KD5A 4U1OA 3V83A 4UACA 3N5LA 2Y7KA 4Z7EA 4FJPA 5CMKA 2F7AA 2I58A 4FIMA 3SEXA 3U8QA 1H44A 5EHSA 4P11A 2RF1A 4C1TA 3SKPA 4ZEKA 5KCJB 3TQWA 4U2RA 2X26A 1B4HA 3FVNA 5AA1A 4IO5A 1Y4TA 4R6KA 1PBQA 4QSEA 2V84A 5ITOA 4H8JA 1B6HA 2F78A 1URGA 2RC7A 2Q2CA 3VVFA 4ZECA 5LOMA 2O69A 3E9XA 3S4UA 1Q1KA 1PEBA 3GBBA 3VVDA 4H8IA 1KWHA 3C34A 1Y3QA 4NWCA 1OVTA 1YPNA 2DWIA 4H0WA 3OMBA 5I57B 1QJMA 4ZEBA 5DTBA 4ZDMA 1SBPA 4GD5A 3LUYA 1ZU0A 1IXGA 1A8FA 3M3FA 2PX1A 1M5FA 4GL0A 4DDDA 1M5CA 1IEJA 4LUBA 3KEIA 1LLSA 4DXBA 1DPPA 5I58B 4H5GA 3IAZA 1PC3A 3CFZA 2F7BA 3RN8A 2UVIA 3MZBA 4Z0IA 4NF4B 4G2ZA 3IO4A 1QUIA 2ABHA 3N6UA 3H06B 3O6IA 5FTIA 4NE4A 2PVUA 4C1UA 1TFAA 1SYIA 4Q30B 1ZKBA 4PETA 4XKRA 4YKKA 5JTYA 3RT6B 1A99A 2FA7A 2P1SA 3MP6A 1US5A 3ODBA 5EYFA 5L9MA 3IL1B 4BDOA 3SEVA 2NVUB 1YTVA 1MY4A 4ESXA 1MPCA 5L8DA 4YB7A 3L6HA 2A5TB 3LSWA 4Q0CA 4DXCA 1LAFE 2B3FA 1SW4A 2QSXA 1MM7A 2CMOA 3A3CA 2GHBA 2H99A 1GVCA 2RCAA 4O3AA 2HAVA 3KOTA 1JW5A 3OSRA 1FTMA 2THIA 3PPRA 3HV1A 4I1DA 2ONKE 3W9VA 2I49A 3FV2A 2I4BA 3VV5A 3MZ9A 3TAJA 2UYFA 5FHNA 3TCFA 2HQ0A 1B7HA 1LAGE 1CB6A 5DVFA 3R7XA 1LBBA 4G8NA 3DP6A 5CBRA 3PD8A 2DE2A 1MG1A 2D3IA 2AYSA 5I2NB 3H6WA 2Z8FA 1AL3A 1MXYA 4OHNA 5H8HB 3H6TA 4YICA 3JV9A 3QUFA 2H5YA 4GWOA 2B65A 4HCWA 3L6GA 4IB2A 2DQVA 2R6GE 3FVGA 1N3WA 4YKJA 1POY1 3PGFA 2VD2A 1ANFA 3K6VA 2ZXTA 4XKNA 4NF5B 1SW1A 4MLVA 1Q35A 4QFLA 2DE4A 1S50A 2F97A 1PB8A 1CE2A 1B51A 4LATA 5A5XA 1B3GA 1I6AA 3MP8A 4LONB 3MUQA 1S7YA 1YCJA 1JEVA 3K1NA 3OO6A 4RPNA 3RQTA 2UVGA 3PPOA 2F5XA 2O6AA 4JWOA 3MPKA 1QULA 4ELQA 4NWDA 2Y7WA 3VXCA 1MDP1 3GXAA 3C31A 2O51A 2QS2A 3TTRA 3RTWB 3B6QA 3KG2A 1H43A 4FAJA 4X9TA 1VSOA 1A7LA 2O1MA 4OERA 2I48A 3S9MC 4H6DA 2VP1A 2PT2A 1OQGA 3OEMA 4EXKA 4Q8RA 5I59B 5I2KB 4NMYA 3V8XB 4P0IA 3Q27A 3RGYA 4LP2B 2OZZA 3QK6A 5CMMA 1FW0A 4R9FA 1Z7ME 3H6VA 3H4ZA 1FTOA 1MXXA 2G29A 5ITPA 4JWYA 4OQOA 4R2BA 2DWHA 1B0HA 4YU0A 1MRPA 4JSOA 4P0GA 1B3FA 3EN3A 3EHUA 1B9JA 3C9HA 4MH5A 4HCYA 1AH5A 2GHAA 3PD9A 3TKDA 5DVJA 1FCKA 1VE4A 2ZNTA 3LBSA 1H45A 3TUSA 3P7IA 2DOJA 3FXQA 3U94A 2F36A 4IO2A 4H65A 4MF3A 1UTBA 4X1DA 1ELJA 4DZ1A 2AL4A 2DSFA 3TEPA 3QXMA 4PFWA 3SEYA 1JW1A 2V3QA 2OWTA 2I0CA 3S9LC 2PMSA 4Q5TA 4RPOA 1JW4A 2XXQA 3H6UA 1N7WA 2Z8EA 2ZYOA 5ISUA 4N13A 3IOTA 2VOZA 1FQDA 1A54A 2Z8DA 4NF8A 3PUWE 3O66A 1DTZA 1B32A 3IO6A 3UORA 3GZGA 4JB7A 2Z22A 4PE5B 1FQCA 5J1DA 2ZYKA 1B3EA 3R6UA 5TP9B 5KDTB 2GRVA 3FJMA 2E0SA 4F1YA 4OYVA 1IXHA 4KFQA 4F31B 1M5DA 1MQDA 1BTJA 2Y7IA 3M3LA 2XXUA 4FECA 4MFIA 4OFOA 2ALUA 1VR5A 2V93A 3TTMA 3U72A 3K4UA 4RK9A 2XD2A 4QF9A 2R9JA 1LAXA 3JZJA 3U1OA 2HEUA 3TCHA 5JTYB 4R2FA 2Q89A 2RKMA 3K6UA 1HSJA 4TOZA 5TPAB 1LB8A 3RUMA 1B5IA 2UYEA 2XXWA 2R71A 1ZBMA 2DE3A 3IORA 1EZPA 4H5FA 5H8NB 5H8QA 3EQ1A 2HZKA 4F22A 3O6HA 4JBZA 1ZIUA 3KSXA 3WAEA 2NWJA 1NNTA 3OD7A 3THIA 1JVYA 1SDXA 3TMGA 3CIJA 2I3WA 4FE8A 4ZS9A 4G4PA 4HW8A 1MQGA 5B7DA 3FXRA 2IA4A 4QRZA 3TELA 1IZ1A 4JSDA 2ONRA 2XHDA 4WXJA 4ELPA 4F3GA 2ZYMA 4I8CA 4FEBA 4JDFA 1WVJA 2ESNA 4EQ9A 1DSNA 1SD3A 1FQAA 2QRYA 4U4SA 4G8MA 2Q9TA 3HCQA 4F2QA 3DELB 2F35A 4KQPA 3H7MA 4WEPA 1N84A 3LSLA 2RINA 2W7YA 2XX8A 4OFLA 2I0BA 2B3BA 1P1NA 4RNSA 4LZ7A 3PMXA 2F7CA 2F6PA 1DOTA 1MH4A 1VFEA 4LVQA 4XKPA 4YB5A 1DMBA 5H8FA 4I9DA 5AA4A 3T9HB 5K2YA 3IJOB 3KOSA 4M1VA 3GBAA 4PFYA 3RT8A 2XD3A 4G8HA 1S9TA 3FXUA 4R6HA 2XXIA 1MY3A 2RC8A 4HS7A 1B5HA 4F29A 3T96B 3LR1A 1NL5A 1DPEA 2YJPA 2FNCA 4KCCA 3TTLA 4E0XA 1T0KA 3M8UA 2QPQA 3PPNA 1IXCA 3MQ9A 3MPLA 3FVKA 4AB5A 2HCAA 3MJNA 1IQ7A 4KYDA 4GFRA 1ZTYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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