3PMXA

Ligand-binding domain of glua2 (flip) ionotropic glutamate receptor in complex with an allosteric modulator
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
263
structure length
262
Chain Sequence
b'GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDLKNKWWYDKGECGA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure based evolution of a novel series of positive modulators of the AMPA receptor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
total genus 85
structure length 262
sequence length 263
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-11-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3pmxA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3pmxA02
2I3WA 4IO6A 3C4MA 1FQBA 1SYHA 2VOZA 5H8NB 3Q29A 2I3VA 4OESA 4NF6A 2DVCA 3EF7A 3F11A 1HSLA 4GVOA 5F7VA 1PB7A 1IIWA 3PD8A 4G4PA 4M1VA 5CMBA 2A5TB 2O68A 3VVFA 4OERA 4K3FA 1S9TA 4GRKA 2XXQA 2ZYMA 1SI1A 5TPAB 4DLDA 4LONB 3FJMA 4XIGQ 3TTLA 4ZS9A 1P99A 3HPIA 4U4XA 2B65A 2OCUA 3FV2A 4OXVA 4R9GA 3VVEA 1AIVA 4ONYA 4JWYA 1FCKA 2RF1A 2IA4A 1MY1A 1AMFA 1H43A 2KLFA 3TODA 2ANJA 1MXYA 1SDXA 4G68C 1LB9A 3CFXA 3FXRA 3KBRA 4ISUA 1LBBA 5CMCA 4LATA 3CI8A 1D4NA 3T96B 2NXOA 3Q28A 4BDQA 4PFUA 3PPRA 1JETA 4U22A 4X1BA 5CM6A 3MJNA 3OD7A 3CIJA 4TLMB 3IOWA 3BFTA 5I56A 3KN8A 2ONRA 3MP6A 1F9BA 3V5AA 1EU8A 3TAJA 2HAVA 4ESXA 3DM0A 2HAUA 4AB6A 1MXXA 4F2QA 1WVJA 2THIA 5KCJA 4FORA 4ZZAA 2F6PA 2HEUA 1A40A 4RPOA 3U93A 2F7BA 3K6VA 3A3CA 3EQ1A 3FVNA 4OFOA 2DP8A 3TTNA 2XX8A 3U72A 4F18A 2PVUA 2XXTA 5CBSA 1SI0A 5I2NA 4TQUQ 5I2KA 4M4GA 1IEJA 2F7CA 2XXWA 4GOTA 4JSOA 5A5XB 4OMBA 3MVYA 2DXRA 3IJOB 1QUKA 1B0LA 3R6UA 2YLNA 3VV5A 3C35A 4GXSB 1A99A 3U1OA 3N6UA 3MQ9A 3FVKA 3TELA 4QFLA 4RK2A 1XVYA 5B70A 4U1OA 4P0GA 4N07A 1B05A 4HCWA 3TTKA 1VSOA 1M5CA 3BBRA 4IGRA 1NL5A 4NF6B 4NEDA 1XVXA 4ZEFA 1JQFA 3P7IA 1GVCA 3HO7A 3PPNA 2RCBA 2AL4A 2ZXTA 5AA4B 5CBRA 5I59A 2H99A 3U94A 1LAXA 3OMBA 1P1WA 5DVIA 1S7YA 1UTHA 1O63A 3GBBA 4JWOA 5AA2B 3ECRA 4LVQA 2F35A 4O3CA 3U92A 4XKNA 1MM7A 3CFLA 3I6VA 3LUYA 3A3UA 4LQ5A 1B32A 1B51A 1MXWA 1XS5A 4H8JA 3QXMA 4UA8A 4YKPA 3M3KA 1Z7ME 5H8QA 4U1ZA 3KZGA 1N3XA 2F36A 5TP9A 3D4CA 2PX1A 4OETA 3QSLA 4MBPA 5H8SA 3G7WA 5ITPA 3TKDA 3K6UA 2DWHA 3IL1B 3GXAA 3LSXA 1YPNA 3RLFE 4ZE9A 1I6BA 3TTRA 3K6WA 4H1XA 2H98A 4FJPA 2OBGA 4BDRA 1QKBA 4IO5A 4AB5A 3VLVA 2YPNA 5I56B 5ITOA 2P1SA 5I84A 5CMKA 3RPWA 4JB7A 4ELOA 1B5IA 4G8MA 3EN3A 1GV8A 3THIA 4GLIA 2REGA 3ILUB 4I9DA 5EYFA 4YAHX 1USYH 1EH3A 4THIA 3W9WA 2DYXA 1YTVA 1LAFE 1VFEA 3VE1B 2DXYA 2ZNSA 4BLAA 1MXUA 1POY1 2UVIA 2UYFA 3ZS6A 1VR5A 4MLVA 3SDFA 5DEXB 3T22A 1FTOA 3B6QA 3HV1A 4BDOA 2I58A 4HS7A 5I2NB 4O3AA 1B9JA 5I2KB 1LBCA 2DE3A 2P2AA 3HSTA 2V3TA 4RXLA 4PP0A 1SW2A 1I69A 4DZ1A 1B4HA 3S9NC 2O84X 4Q8RA 2QS3A 1A7LA 3HHFA 2D3IA 4H5GA 3K2DA 2F6GA 3B6WA 3T9UA 2ONKE 2I6EA 3G3JA 4FEDA 3QK6A 3UN6A 4QFOA 4ZEBA 3C36A 1TT1A 2Q88A 3G3FA 4LZ8A 5L8DA 4IY6A 2R71A 2ZYKA 4NF4A 5I59B 5AA3A 1FQDA 3RY3A 1UTHB 2VD3A 1MH4A 2DWJA 5ICQA 2R9JA 4ECFA 4Z7EA 3PU5A 3MC2A 3MVXA 4YB7A 3EHSA 3G3HA 4QSEA 1QKAA 3LSFB 1IXCA 1VE4A 4ZEKA 3VDFA 3B6TA 2QSXA 2NOOA 4LQ2A 4C1TA 1URSA 3LSLA 1QJMA 1LSTA 2V84A 3V8XB 5H8QB 3EHTA 3M8UA 2I4CA 1CB6A 3IR1A 1MDP1 3SEWA 1H44A 4WEPA 1AL3A 1MQHA 3CG3A 1TFDA 2VD2A 1B7ZA 3MUQA 1OVTA 1MG1A 5M2VA 5TP9B 3KGCA 1PEBA 1XT8A 4F3GA 4DXUA 3UGWA 4EQ7A 2NVUB 1LGBC 4G2ZA 3OEMA 3PPPA 3E13X 2XXIA 4F19A 2D5WA 3K1NA 4L17A 3OOAA 3MWBA 1FQEA 2F34A 5L9MA 4IO3A 4X1DA 1JNFA 4YMBA 1UTBA 4OVJA 1D3KA 2NUVA 4BDMA 1WDNA 1IXGA 4Q30B 1NFTA 2CZLA 1A55A 3DELB 3KG2A 2ONSA 4EXKA 5B7DA 2F78A 1US4A 2GHAA 1FQAA 2QL3A 3TPAA 2XXUA 4BDLA 5K2XA 2O7UA 4R2FA 3B7DA 4H65A 4F29A 3L6GA 4OYVA 1URDA 3S9MC 2Z8DA 4ND9A 2QRYA 4G8HA 3O66A 3G3KA 2XXXA 4NWDA 3L6HA 3ODBA 2QS4A 4IY5A 1URGA 2F5XA 4OWDA 3HN0A 3ONMA 3T66A 4KHZE 4LUBA 1MY0A 4P11A 3S9LC 2Y84A 1B52A 4R6YA 3M3LA 3FXUA 3KSJA 1B7UA 5KDTA 4QSCA 3H6VA 4G8NA 1N04A 4DXBA 1A8EA 1BIYA 5F1QA 4F1UA 2HZKA 4QFKA 1M5FA 3FGSA 3SERA 1AOVA 1OVBA 1N84A 2VGQA 1JW5A 1JVXA 1IZ1A 3UIFA 4G77A 3O6GA 1SQYA 1O64A 4EQBA 3KFMA 1MXVA 5H8HA 1LCFA 4N6PA 3IX1A 3PV0E 4AQ4A 3W15C 4C0RA 4H67A 3BFUA 4NF4B 2REJA 1O7TA 3FIRA 3MVWA 1DPPA 1FQCA 2X26A 1Y20A 3VXCA 5I57B 3VXBA 3QUJA 3UORA 4ZE8A 3W9VA 3IOTA 3CSGA 2DOJA 1M5EA 3MZBA 3MZ9A 4GWOA 4KI0E 1T0KA 4H5FA 3EHUA 3OENA 5EHMA 4HTGA 3TDJA 1PB8A 3RUMA 3CG1A 3UA8A 1ZIUA 1TWYA 3CR9A 4H8IA 3CFZA 5FHMA 3PD9A 2YJPA 1R1NA 4NF5A 4QHQA 4OENA 3ZSFA 4E0WA 1MH3A 4IO4A 4NE4A 2GH9A 2DQVA 1ZKBA 3SESA 3FJGA 5JEIA 4YKJA 1BLFA 5L9SA 2A5SA 1US5A 4MF3A 1OQGA 3TMGA 5ISUA 3SKPA 1A54A 2H4IA 1JEVA 1HSJA 1ZJLA 3Q26A 3O28A 2QS2A 3SETA 2HFBA 4KR5A 2DWIA 1N76A 1FQFA 2CMOA 3VFJA 5AA1A 4ESWA 3WAFA 1ZU0A 3ILTB 2XD3A 2XX7A 2GHBA 1Y9UA 5HM4B 3JZJA 5L9OA 1IUDA 1FTLA 3T9VA 1B2HA 1HSEA 3USDA 3VVDA 3EPEA 4KFQA 3PUYE 1MY3A 2FNCA 5JK4A 2H25A 3N5LA 1N7WA 2RC9A 4QF9A 3IK6B 5JTYA 3KOSA 2ESNA 1B3GA 1B1XA 1MQDA 1PBQA 5KDTB 1A8FA 1NNPA 2V3QA 1YAEA 3E3KA 5HBCA 3MZ1A 4JBZA 3OO9A 3K4UA 2B3BA 3K02A 3PPOA 4GXAA 2G93A 4NF8A 3RT8A 2GRVA 3KN7A 4EDPA 3V83A 4KQPA 4OFLA 3TCHA 1FTMA 1KWHA 2WKYA 4QSDA 4XTCQ 2E1SA 4ELRA 1PDAA 4KYSA 3C34A 2PT1A 4I8CA 2Y7PA 1B58A 3AXFA 4F3SA 1IITA 4MLQA 1EZPA 1P1NA 1MPDA 1Y3QA 2Y7RA 1N7XA 4EXLA 2HCAA 1NNFA 1SYIA 5H8HB 1OLAA 1JEUA 3K6XA 4F1YA 5KCJB 1GGGA 3O6IA 5CC2A 5AA2D 2HXWA 4ZEIA 4PQJA 4YB5A 3IORA 3RGYA 3WAEA 4JDFA 1PC3A 3TCFA 2F7AA 1BTJA 4R2BA 1LAHE 4F1VA 4DXCA 1JVYA 1B46A 5BWJA 2PYYA 1R9QA 4ZZEA 2R6GE 5CMMA 3A09A 4WKMA 3OO7A 3MW0A 3O97A 1Q1KA 4R75A 4Q5TA 5FHNA 3OO6A 3FVGA 3H06B 1IQ7A 3LR1A 3R26A 4IO2A 1EZOA 2DE4A 4LZ7A 4NF5B 2QPQA 2XHDA 4WEDA 3V89B 3CRBA 4LP2B 1Y3NA 4GF8A 1D9VA 1P1UA 4F31B 1P1OA 1RYOA 2W7YA 3MPLA 2AYSA 3C9HA 1Y4TA 3S9EA 3UP9A 2Z23A 1P1QA 4OHNA 4P0IA 3MP1A 4ZDMA 1B7HA 4U2RA 4OQOA 1B1HA 3IOUA 2NWJA 3KJ7A 4JXIA 3HCQA 2GFEA 3FATA 1MRPA 3BKIB 1XC1A 3RTFB 5K2YA 2I4BA 3TQLA 1R6ZA 2ZNTA 3N94A 3OSRA 5DT6A 3TFLA 1B3EA 2Q9TA 3SEXA 3FUZA 3QUFA 4FAJA 5A5XA 1UIVA 1NMUA 4GL0A 4JSDA 5HPQA 1OIBA 2RC8A 1NNTA 5H8FA 5IAIA 3TZAA 1XHYA 2DS9A 3DP8A 3JYRA 1SD3A 1FTJA 2Q2AA 2QMWA 1M5DA 2Y7IA 4NF8B 1B5JA 4XKQA 1MY4A 2Q89A 2RC7A 1D9YA 4DDDA 4O3BA 1OMPA 3FZVA 1RYXA 2ZNUA 4H0WA 3RNNA 1NH7A 2I0CA 3MAMA 1NKXA 4HCYA 2FA7A 2G29A 4IO7A 3KSXA 4I1DA 1B40A 3GBAA 5AA4A 3G3IA 1EZ9A 4NTLA 2I0BA 5FHOA 3OELA 3O2AA 4GFRA 4RYAA 1ANFA 5AA2A 3LBSA 4OEUA 1AH5A 3OSQA 3H6UA 4E0XA 2O7IA 4C1UA 4GQOA 3KEIA 1QULA 3HHGA 3RT6B 4PFTA 3H7MA 4DIGA 3U8QA 2OWTA 3SEVA 2UVGA 3KOTA 1DTGA 3MVZA 4I62A 4PFYA 4Z0IA 3H3GA 4ZECA 4OFJA 1JW4A 4MH5A 2ABHA 1POTA 3IB0A 1MQGA 4OZ9A 4YZZA 3QAXA 3K1MA 3H4ZA 3IO4A 3TYHA 3TUSA 1OQHA 4OEVA 3SEYA 5ELVA 4ZEDA 1LFIA 2E0SA 4DE8A 3MBPA 2DE2A 2Y7KA 4G68A 2OWSA 1DSNA 4QFPA 1MM6A 1N3WA 3CSBA 1MS7A 3GLBA 1WODA 1Z7NE 3PUXE 2XXHA 4KCCA 2OZZA 1H45A 4RA1A 3Q27A 1Y3PA 2DWAA 1Y1MA 3M3FA 5KZTA 3Q25A 1CE2A 1DPEA 5FTHA 2DVZA 2RINA 5DYHA 3LC8A 4U4SA 1PB9A 4R74A 4TOZA 3R7XA 1LB8A 1LFGA 1B5HA 3OEKA 1IXHA 1B4ZA 2RCAA 1ZBMA 1Y4CA 2Z8EA 3QIMA 4YKIA 2DSFA 4BDNA 2UVJA 1YCJA 2O1MA 3T9XB 2PMSA 1LCTA 1I6QA 3G3GA 5DEXA 3FXQA 1MXZA 1XOCA 3C32A 2O1LA 3LSWA 5TU0A 2FYIA 5CRYA 4JWXA 4R6KA 4FATA 1ELJA 5AE4A 2X7PA 1QVSA 3D4GA 1QUIA 3PUVE 4DCXA 5I58A 3T93B 1S50A 3O29A 5H8FB 4NWCA 1ZTYA 3E4RA 4QFNA 1BP5A 1RKMA 4MFIA 4EF1A 1UTBB 4IGTA 2VP1A 1QUJA 1ATGA 1B0HA 2PBWA 1B3FA 3PGFA 4KYDA 4FEBA 4YKKA 4R6HA 5EHSA 2F8DA 4ELQA 1R9LA 3K0VA 4WXJA 3VLUA 2HZLA 1VFDA 4UACA 4FIMA 2HQ0A 2B3FA 1PBPA 1H76A 1SVXB 2IEEA 4U23A 4LZ5A 4U21A 4EQ9A 1FW0A 1GTKA 3ZKKA 3FVOA 4HW8A 2F97A 2Q8JA 3IB2A 2D21A 4ELPA 1I6AA 5IKBA 4F3PA 3TCGA 2V25A 4YU0A 4GD5A 3I5OA 2M8CA 4KYEA 3IO6A 1SBPA 4PE5B 3IB1A 4OTEA 3H6WA 2XD2A 2OLBA 3FV1A 3S4UA 2QS1A 1J1NA 1MPCA 3QYTA 5LOMA 1ZMGA 4RNSA 5H8NA 3PUZE 4R72A 4FE8A 3CVGA 3MPKA 4XKPA 3GZGA 3KJTA 4POXA 3KN3A 3OXNA 5J1DA 1LLSA 4F22A 1DMBA 4G68B 1FTKA 1II5A 3MP8A 2UYEA 4GIZA 1ZLQA 4YMAA 1OLCA 1USYE 3T9HB 2A5TA 4QRZA 1NNKA 1Y1ZA 1MQIA 1B3HA 3PMWA 2OK2A 3O9PA 3RTWB 1SW4A 4POWA 5TPAA 4DCYA 1IXIA 1H3DA 3DP6A 3IOVA 3JV9A 3RN8A 3I3VA 2RKMA 3VLWA 4R9FA 3ZKLA 1SW5A 3TTMA 2PT2A 5CI5A 4KD5A 3IAZA 3PMVA 2H9BA 2OJTA 1TFAA 1MQJA 3E9XA 3TEPA 1N0TA 3C33A 2O51A 3N6TA 2UVHA 5ICTA 4NMYA 3H6TA 2ALUA 2BJJX 1M5BA 3K1PA 2H5YA 1LAGE 4R73A 4F2OA 4EF2A 1NH8A 2AL5A 3PPQA 2Y7WA 1MPBA 1JW1A 4X9TA 2ZYNA 5I58B 2P0SA 2Z8FA 4RJZA 5DTBA 1QW0A 4KPTA 3K00A 2ZYOA 1BKAA 2LAOA 4TLLB 3PMXA 4X48A 3C31A 4H6DA 1Q35A 2I48A 2QMXA 1B6HA 2AIXA 2XXYA 2VHAA 3DLNA 4YICA 4LA9A 2X7QA 4PFWA 5DVFA 3O6HA 3PUWE 2ZMBA 1GR2A 2QJEA 1UQWA 1SW1A 2V93A 3FASA 1MDQA 2XXVA 2XXRA 4FECA 3S2VA 3UK4A 3K01A 4EUOA 3H03A 4KCDA 3DP4A 2UXAA 4XXUA 4RK9A 2XX9A 1MY2A 5DVJA 4F39A 3RQTA 5I57A 3FJ7A 3N26A 3OO8A 4F3BA 4YB6A 2O69A 1UIUA 5FTIA 4GL8A 4PETA 3SEUA 4RY1A 3FD3A 5JTYB 3TQWA 4RPNA 4N13A 1LFHA 1DOTA 2O6AA 4Q0CA 1B3LA 2Z22A 1DTZA 2XXPA 3IJXB 4IB2A 2I49A 4XKRA 1L5TA 2Q2CA 1TXFA 5BUUA 2V3UA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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