3U72A

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with isoniazid at 2.2 a resolution
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of C-lobe of Bovine lactoferrin Complexed with Isoniazid at 2.2 A Resolution
rcsb
molecule tags Metal binding protein
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 119
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2011-10-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3u72A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3u72A02
1B4ZA 3CR9A 4LQ5A 1JETA 2QL3A 4LP2B 5K2YA 4F3SA 2QS1A 4XIGQ 1JVXA 3MZ9A 5DEXA 2OWSA 1PBQA 2B65A 3KOTA 4XKQA 3H4ZA 2HEUA 4G68C 4KYSA 3BBRA 1NNKA 4EF1A 3SEWA 1M5BA 1ANFA 4Q0CA 4MFIA 1B46A 4X1BA 3KGCA 3T9XB 3ZSFA 1RYOA 2ONSA 5FHMA 2REGA 3FVKA 5L9MA 1PB8A 3S9MC 3VLVA 4O3BA 3G3KA 2QS3A 3MAMA 3PD9A 2ZNTA 1SI1A 1VE4A 1EZPA 2PBWA 3LSFB 5H8NB 1LAXA 4F1YA 1MH4A 2DSFA 1HSJA 3RLFE 2XXRA 4UACA 1MQGA 2O6AA 5EHMA 1B32A 2P0SA 4QSCA 3TDJA 2KLFA 1P99A 2PT1A 3R26A 1B0HA 2F78A 4LUBA 3GXAA 4EQ9A 3KJ7A 1OVTA 1QKAA 2F8DA 4OTEA 4RJZA 1NH7A 4N07A 3M8UA 1B6HA 3CFLA 4M1VA 3RT8A 4IO2A 5TU0A 3K0VA 1FTMA 1PB9A 2IEEA 2DVCA 3FXQA 1ZIUA 5L9SA 2CMOA 1MDQA 2XXUA 3MVXA 1I6AA 1JW4A 3K1PA 1BTJA 2DVZA 2Z8EA 2UVIA 3CFXA 4OFJA 3K2DA 5AA2A 4DIGA 4OXVA 1XVYA 1GV8A 3PPQA 4GXSB 2H98A 3I5OA 2F7AA 3KOSA 5I2KB 3ILUB 2A5SA 4BDNA 4OEUA 4F19A 1R9LA 2OWTA 5JTYA 4F29A 3OD7A 2D3IA 3RTFB 3IOUA 1M5EA 4M4GA 3IOVA 1CE2A 2QPQA 2B3BA 4PETA 2I4CA 2Z22A 4QFNA 1FQBA 2I48A 1S7YA 4H8JA 2UVGA 5CRYA 1GR2A 3FVGA 5AA4B 1LB8A 1QVSA 4PP0A 2DS9A 4MLQA 3PV0E 4R9GA 1US4A 4R6HA 4F3PA 3R6UA 3G3FA 3RQTA 3PPRA 4OQOA 3GBAA 3PMWA 3OEKA 1MY4A 1B3GA 3KFMA 2V84A 4XKRA 5ICQA 1FQAA 2CZLA 3CRBA 3OSQA 1UTHB 1A8EA 4YU0A 4U1ZA 4TLLB 3S4UA 3IO4A 1TXFA 2XXVA 4XKPA 1ZU0A 4U1OA 3DM0A 1MXVA 2GHBA 1FQDA 3S9NC 1GVCA 3OXNA 3GZGA 5A5XB 3QXMA 3MP8A 1R6ZA 4ZE8A 1A55A 3TTRA 2GH9A 1N84A 1SQYA 3K6VA 1IXGA 4ZEFA 3TYHA 1A8FA 3V5AA 1POTA 1ZBMA 1LFIA 2THIA 2XX7A 5CMMA 1EZ9A 3RNNA 3G3JA 1N0TA 4TOZA 3BKIB 1YPNA 1WODA 3TQWA 3SEXA 4IO5A 4PFUA 1ELJA 3FGSA 1MM7A 1MPCA 5EYFA 4BDOA 2H25A 4YZZA 1P1NA 1YTVA 1H43A 3IK6B 1A99A 3B7DA 3E4RA 3D4CA 5ISUA 1FTJA 3KN7A 2DE4A 2VP1A 1LCFA 1UIVA 1OLCA 4OVJA 4OHNA 1SYHA 5H8HB 4GXAA 3O6HA 3FXUA 4JWOA 1HSLA 4U21A 3HSTA 1XOCA 3O9PA 4IGRA 1B3LA 5K2XA 3U8QA 1XHYA 2REJA 3KBRA 4NF5A 1SYIA 3CIJA 4NF6B 1FQFA 1JVYA 3O28A 3K1NA 1ZJLA 2DYXA 2F34A 4FEDA 4RY1A 3TTKA 3RPWA 4DXBA 1I69A 4HCWA 4I1DA 2LAOA 4YB5A 4HS7A 1TT1A 5I59B 5I58A 3U72A 1N3XA 4G68A 3H3GA 4IB2A 2DP8A 3VVEA 3M3LA 3TELA 4RXLA 3OO8A 4NF4B 2PYYA 3TODA 2R6GE 3QIMA 3TFLA 4LQ2A 5F1QA 5HM4B 4GWOA 1IQ7A 1MM6A 4EXKA 5I84A 1R1NA 3B6TA 4POXA 2RC7A 4C0RA 4KHZE 5I2NA 3T9VA 4DZ1A 4TLMB 3IJOB 2Q88A 2HZLA 5J1DA 4P0GA 4E0WA 1EH3A 4R2BA 3EN3A 2DWHA 2O1LA 4G8MA 4BDLA 3TMGA 3W9WA 4LONB 3JYRA 3FV1A 5KDTB 4KYEA 2ANJA 2ESNA 5JEIA 4X1DA 3FVOA 3DLNA 1I6BA 3VDFA 1Y4CA 4PE5B 2OJTA 2I58A 3V8XB 3VLWA 2F97A 2ZXTA 3QUFA 4H6DA 1OMPA 2QRYA 1Y9UA 4YAHX 2F6PA 1SD3A 5H8QA 3CVGA 3TTLA 5CI5A 4ZEDA 5KCJA 2GRVA 1PEBA 2VGQA 2RC9A 2XD2A 2XX8A 2AL4A 4G8NA 3GLBA 1TFAA 1B52A 3LBSA 4I62A 3CG1A 5DVIA 5DEXB 2F36A 3BFUA 3SERA 3G7WA 4Q30B 1H44A 1MQDA 3IO6A 4AB6A 4OWDA 4GFRA 3TQLA 4ZZAA 3C32A 5AA3A 3OENA 5CMKA 3OELA 1ZMGA 1PDAA 3LSLA 2RCAA 3SEUA 1MG1A 3CI8A 1NNPA 2X26A 1AMFA 3PU5A 3P7IA 1QW0A 1QKBA 4HCYA 3HN0A 3KSJA 1IEJA 3K6XA 3FATA 1B3HA 2RCBA 4QFOA 5DVFA 5L9OA 1B1XA 3SKPA 2O7UA 3KEIA 4JBZA 4XXUA 3SEYA 2AYSA 2O68A 2ZYMA 3OO9A 2UYEA 1GGGA 1A54A 2UYFA 4Q5TA 4O3CA 4OMBA 2ONRA 4PFYA 1BKAA 3C33A 3Q26A 1NL5A 4F39A 3BFTA 3IB1A 1LBBA 1Y3QA 1VFDA 1DPPA 4UA8A 1LAHE 1B58A 4IY5A 3ZS6A 4FECA 3HV1A 1S50A 1OLAA 3FASA 5CBSA 3IAZA 1WDNA 3OEMA 1B5HA 2Q2CA 1NMUA 3MQ9A 3ILTB 4ZZEA 3IJXB 2DXYA 2Q89A 3S9LC 1SVXB 3QK6A 2DWIA 3MVYA 5LOMA 1EZOA 3U92A 2YLNA 4R75A 3H6UA 5AA2B 1WVJA 1B0LA 2HAUA 3PGFA 3HPIA 3Q29A 1MRPA 4IY6A 3TKDA 5B70A 1H76A 2UXAA 1L5TA 4RK2A 2FNCA 1I6QA 1Z7ME 4F22A 2A5TA 1B5IA 4LA9A 1BIYA 1MQJA 3EF7A 3S9EA 2IA4A 4KCCA 1RKMA 4OETA 4N13A 2DWJA 3PMVA 4OFOA 3O29A 1JEVA 2GFEA 2XXPA 1R9QA 3SEVA 1B7ZA 1SDXA 1N7XA 5TP9A 1Q1KA 2VD3A 4GQOA 4EDPA 4R72A 2RINA 4ZE9A 4YB6A 1MY2A 4ZEIA 4L17A 1QULA 3A3CA 4NWCA 4ELQA 5B7DA 4DCYA 3IX1A 3U93A 4JSDA 3RN8A 2Y7RA 3K1MA 1SW4A 3MW0A 4RYAA 3H6WA 3K00A 2Z8FA 4KPTA 5DVJA 2XXXA 3TPAA 4EUOA 1O7TA 3RTWB 4IGTA 1LFHA 4ELRA 5DT6A 5I57A 3FUZA 5I56A 3S2VA 3MPLA 1O63A 3K4UA 5EHSA 5FTHA 3TUSA 3DP4A 1N7WA 3MP6A 3SESA 2V25A 1OQHA 2Y7KA 3B6QA 3UK4A 4G77A 4XKNA 2OBGA 4LZ5A 1MH3A 3E3KA 4EF2A 3MPKA 4HW8A 2XD3A 4RPOA 4E0XA 3QYTA 3CSGA 4AQ4A 4PFWA 4H5FA 2DWAA 2V3TA 4LVQA 1UIUA 4Q8RA 3PUYE 4DDDA 3C4MA 2Y7PA 1LAGE 5AE4A 3HCQA 1LBCA 2F7CA 1B05A 3KJTA 3USDA 4RNSA 5AA1A 3TAJA 5H8FA 4DXCA 2QS4A 4KCDA 1CB6A 4G8HA 4OFLA 3U94A 3EHUA 1O64A 1NH8A 3THIA 4H0WA 4U22A 4QSDA 4NF5B 3LR1A 2XXIA 1MPBA 1MQIA 2F6GA 4GRKA 4NMYA 1UTHA 2Q9TA 3C9HA 3CFZA 4JDFA 3D4GA 3MC2A 4WEPA 1YCJA 4NTLA 4GF8A 1Y1MA 3SDFA 2QMWA 3G3HA 4WXJA 3V89B 2Q2AA 5I58B 1LB9A 4ELOA 2H4IA 4G68B 1JW1A 4F1VA 2M8CA 2QS2A 4DCXA 3KZGA 1N76A 3FD3A 2XHDA 1MPDA 1MXWA 4O3AA 2UVJA 1IXIA 3UP9A 1P1UA 4PFTA 1DPEA 3EHTA 4KD5A 1LSTA 2QSXA 2F5XA 4OEVA 4R6YA 1IUDA 1B9JA 1Y1ZA 1B3EA 4PQJA 4ESWA 5I2NB 5KZTA 3QAXA 2R9JA 4ZEKA 4YB7A 2AIXA 4FAJA 4THIA 3WAFA 3UGWA 2ZMBA 1FW0A 2H5YA 2Q8JA 2DE3A 1P1OA 3CG3A 4R74A 5CMCA 2B3FA 2E0SA 2D5WA 2BJJX 1ATGA 4R9FA 3MBPA 5TPAA 2P2AA 1B40A 5DTBA 4R73A 4MLVA 4G2ZA 1FTOA 3MZ1A 3DELB 4NF8A 4F1UA 4KQPA 4IO6A 3MJNA 4OZ9A 4RPNA 4ZS9A 5H8QB 1USYH 5KCJB 1NFTA 1VFEA 3RGYA 4RA1A 3GBBA 4QSEA 3IB2A 4ONYA 4GVOA 2HAVA 4ISUA 1JW5A 2VOZA 3EQ1A 3OOAA 1US5A 4FATA 3O97A 3ECRA 1H45A 4IO4A 3EHSA 1EU8A 1FQCA 4FJPA 1B4HA 2DXRA 2F35A 2P1SA 4QFPA 1M5FA 3TTMA 4RK9A 5FHOA 1MQHA 1LGBC 3T93B 3FJMA 1N3WA 3UN6A 4YICA 4KFQA 1POY1 3VVDA 3JZJA 3T9UA 2OCUA 1B5JA 1Y4TA 3K6UA 2ZYKA 1IIWA 2O1MA 1Z7NE 2ALUA 4C1TA 5BWJA 1H3DA 1AIVA 1ZKBA 3Q27A 3JV9A 1DMBA 1HSEA 1Y3NA 5ITPA 5HBCA 1DOTA 1QUJA 4JSOA 1GTKA 1D9YA 2UVHA 4HTGA 3FJGA 1AL3A 1VR5A 2QJEA 4I8CA 2X7QA 2I0CA 3PPNA 4AB5A 3RUMA 3O66A 3T96B 2X7PA 2FA7A 4R2FA 4U2RA 4H8IA 4NE4A 3C31A 4ZEBA 2ZYNA 2I4BA 4X48A 2HCAA 3HHGA 1XT8A 3O2AA 2ONKE 1MXXA 4F2QA 5FTIA 3KG2A 3IOWA 4U23A 1MXZA 3VLUA 3N94A 3M3FA 3L6HA 1UTBA 3T9HB 5ITOA 3ONMA 2I3VA 3IB0A 1II5A 4WEDA 4YKIA 2A5TB 3KN8A 1S9TA 4DLDA 3ODBA 1Y3PA 2V3UA 1J1NA 5FHNA 3TZAA 3WAEA 1D4NA 2XXWA 2I49A 5AA2D 4C1UA 5TP9B 4MBPA 2NXOA 1LLSA 4ELPA 4FE8A 1OQGA 3QSLA 3FV2A 2NUVA 4KR5A 3IORA 4DE8A 1MS7A 2XXQA 4POWA 2NWJA 4YKPA 3R7XA 2HQ0A 1A40A 3LC8A 3T66A 1Q35A 4GL8A 2D21A 5H8SA 5HPQA 5JTYB 1QUKA 1P1QA 1SI0A 4JWYA 3PUVE 2PVUA 2I0BA 3PD8A 1FTKA 1M5DA 4GOTA 3VE1B 2NVUB 3C34A 3O6GA 2ABHA 5I57B 4IO7A 5I56B 2HFBA 4XTCQ 3FJ7A 3MVZA 3UIFA 1P1WA 4FEBA 4QFKA 5H8NA 4P11A 4F31B 3H6TA 2RKMA 5CBRA 3U1OA 3C35A 2G93A 2DQVA 2I3WA 2Z23A 5BUUA 3DP8A 3G3GA 4K3FA 4R6KA 3OO6A 1B3FA 3TEPA 3TCGA 4Z7EA 1B51A 5IAIA 1F9BA 3KSXA 2RC8A 2ZYOA 3MUQA 3V83A 1SBPA 4EQ7A 3MVWA 3N6UA 4IO3A 4I9DA 4BDMA 2YJPA 5H8FB 3H6VA 2PX1A 4GD5A 4NEDA 2VD2A 5M2VA 4F3BA 2PMSA 2AL5A 3F11A 4G4PA 1FCKA 2DE2A 2O69A 5L8DA 2OK2A 4ESXA 2Y7WA 2OZZA 4WKMA 2ZNUA 1URGA 1YAEA 3MWBA 1URSA 5I2KA 4BDRA 2O51A 1JEUA 2V3QA 3ZKLA 4QRZA 2WKYA 3H03A 3W9VA 3E13X 4YMBA 1ZTYA 2O7IA 3PMXA 3Q25A 4NWDA 4JB7A 3K6WA 4OERA 4GLIA 1B1HA 1BP5A 1VSOA 3M3KA 5F7VA 4QFLA 3SETA 4QHQA 5AA4A 3C36A 4YKJA 4MF3A 3HHFA 3I3VA 1AOVA 3RY3A 5ICTA 3K01A 1DTZA 3HO7A 3N26A 3LUYA 1MY1A 1LCTA 1NNFA 1XVXA 2Y7IA 5JK4A 1OIBA 2PT2A 3IL1B 4BDQA 3TCFA 2QMXA 3LSXA 3OO7A 4FIMA 4TQUQ 4H1XA 1SW1A 5IKBA 4GIZA 1M5CA 5A5XA 2Z8DA 3N6TA 2I6EA 3FVNA 1USYE 2W7YA 1ZLQA 3Q28A 1UQWA 1B7HA 1IXCA 4ZDMA 3VXBA 3PUWE 3PPPA 1B7UA 4P0IA 5TPAB 4EQBA 1NNTA 1KWHA 4QF9A 1IZ1A 2XXTA 4F2OA 4ZECA 1DSNA 4MH5A 2H9BA 4ECFA 1N04A 4NF8B 2NOOA 2ZNSA 4LZ8A 3VVFA 3TTNA 3UA8A 4N6PA 2XX9A 2XXYA 3OSRA 5CMBA 3W15C 1MXUA 1LAFE 4Z0IA 4LATA 5CM6A 1TFDA 3QUJA 3VXCA 1RYXA 1IXHA 5DYHA 1B2HA 3LSWA 1D3KA 5H8HA 3IOTA 3MP1A 2F7BA 1BLFA 2OLBA 1JQFA 4YKKA 4H67A 3O6IA 2G29A 4ND9A 3PPOA 1FTLA 4YMAA 1A7LA 1OVBA 2Y84A 4DXUA 2FYIA 3ZKKA 1MY0A 3DP6A 4NF6A 1T0KA 3FXRA 3VFJA 1MDP1 3I6VA 1XC1A 4EXLA 1XS5A 1AH5A 1MXYA 5ELVA 4OENA 1LFGA 3EPEA 3A09A 3B6WA 5I59A 3H06B 2H99A 3IR1A 2O84X 4OYVA 2YPNA 3UORA 1TWYA 3T22A 3RT6B 1FQEA 4NF4A 3AXFA 4JWXA 2XXHA 2R71A 5CC2A 2RF1A 4JXIA 3N5LA 2DOJA 3G3IA 3PUZE 2E1SA 3TCHA 4U4SA 4FORA 4LZ7A 1D9VA 1MY3A 1QJMA 1URDA 4U4XA 3VV5A 1QUIA 4X9TA 1PB7A 3H7MA 4H5GA 2VHAA 1PC3A 1IITA 5KDTA 2HZKA 1UTBB 4F3GA 3A3UA 3KN3A 3K02A 3MZBA 4GL0A 4OESA 3L6GA 3CSBA 3FZVA 4BLAA 4KYDA 3OMBA 4H65A 2GHAA 4KI0E 1SW5A 3PUXE 1JNFA 2HXWA 1NKXA 4F18A 1SW2A 3E9XA 1DTGA 1PBPA 1Y20A 3FIRA 2V93A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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