3U72A

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with isoniazid at 2.2 a resolution
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal Structure of C-lobe of Bovine lactoferrin Complexed with Isoniazid at 2.2 A Resolution
rcsb
molecule tags Metal binding protein
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 119
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2011-10-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3u72A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3u72A02
5H8FB 4YU0A 3W9VA 1MG1A 4I62A 2RC9A 1POTA 4OMBA 4OFJA 2DWHA 3HHFA 1KWHA 1SW4A 2WKYA 3EPEA 3MZ9A 4R9GA 1PB9A 4RK9A 3IK6B 3EF7A 1Z7ME 2FYIA 4GL8A 5I2KA 1Z7NE 4H1XA 4NF6A 2QRYA 2Z23A 3MPKA 4GXAA 2B3BA 1MQGA 2O1LA 3I3VA 4OQOA 2HCAA 3THIA 3FXQA 3C31A 2PBWA 4NF4A 2DE4A 3M3LA 3PPQA 3TAJA 1EZOA 4F31B 1Y4TA 2B3FA 3MAMA 5ELVA 3B6TA 1OLCA 2F6GA 2ZYOA 4GRKA 1A55A 1B9JA 1CE2A 3G3IA 3VXCA 4BDMA 2UVGA 4NEDA 3TYHA 2AIXA 2ESNA 1B6HA 3K4UA 3KN8A 1IIWA 3OELA 4NE4A 5L9OA 1P1QA 2OLBA 4KYEA 4R74A 4R6HA 1VSOA 4M1VA 3CRBA 3OXNA 5DEXB 1FQFA 1H3DA 1GR2A 1USYE 1UTHB 3TELA 3RY3A 1MS7A 5L8DA 1LAXA 2ZYMA 3HHGA 2GHBA 2UYEA 2ZMBA 2DXYA 4RK2A 4FE8A 1IZ1A 4YB7A 3IL1B 2ZNTA 2DVCA 1S50A 2HZLA 2QS3A 3C34A 3G3JA 3PU5A 3VDFA 4QSCA 3ZKKA 5CI5A 4MFIA 3KG2A 3VVFA 1MXYA 2AL4A 3PMWA 3H03A 3IR1A 3QK6A 2ABHA 1RYXA 2Z8FA 3IOTA 3JV9A 4OFLA 2NVUB 3IOUA 4NTLA 3KSXA 1BKAA 5ICQA 3FJGA 5CM6A 3CIJA 2QPQA 2V3UA 3LR1A 3SKPA 4Q0CA 4G77A 3RT8A 2AYSA 4FECA 2RCAA 1PEBA 3G3FA 3PGFA 4ZE8A 4DCYA 4ZEDA 2DWJA 3MUQA 1GGGA 1MM6A 1QVSA 4F22A 1A7LA 2O1MA 4KFQA 5AE4A 1USYH 1BTJA 1QUJA 1MXXA 1M5EA 2LAOA 4YMAA 1XT8A 1B5IA 4KI0E 2RKMA 3PUXE 1I6BA 4FAJA 5B70A 3B6QA 1Y3PA 1DPPA 3GLBA 1QW0A 3N26A 1JW4A 4ZEBA 4ZZEA 3SDFA 1IITA 4H65A 4JSDA 1FQAA 2V93A 3N6UA 1ZIUA 1OLAA 1B58A 3BKIB 5A5XB 1B7UA 1MRPA 4F1VA 5BUUA 3KOTA 3HO7A 3MP1A 4RNSA 2OK2A 3S4UA 1B32A 1MXVA 2OCUA 1B3EA 3IB0A 4PFTA 3RT6B 1Y4CA 3N5LA 4R6KA 1VFEA 3IJOB 4TLLB 3MP8A 5IKBA 1UTBB 3DP6A 4IY6A 3SETA 3Q29A 1JEUA 3FVNA 5ICTA 1YTVA 1MXZA 3FATA 4KYDA 3RN8A 4F19A 1OMPA 4FIMA 1M5BA 4G4PA 1PBQA 4OENA 2Y7KA 3ZSFA 5KCJB 5KDTA 2XX7A 3IO6A 3E9XA 3QUFA 2O7UA 3VXBA 1D4NA 5I56B 3KJ7A 5AA4B 3IB2A 3K02A 3KN7A 2GRVA 1SDXA 3PUYE 4UACA 1ZMGA 1MPCA 3HSTA 5K2YA 4I1DA 5TPAA 2Z22A 2H98A 3DLNA 3PUZE 1GVCA 2UVIA 5AA4A 1LBBA 1CB6A 1I69A 1NH8A 1P1UA 2ONKE 3PPNA 1DTZA 3RQTA 4HS7A 1GTKA 2P2AA 1ATGA 2XD3A 3OOAA 2ZYNA 4GQOA 1R9LA 3MJNA 3FJMA 5H8QB 2Q8JA 5I58B 2DS9A 4ZE9A 2XX8A 3PUWE 4PFWA 4AQ4A 5ITOA 1URDA 2IA4A 3B7DA 3OMBA 3C4MA 3CI8A 3K1NA 1NNFA 1FQDA 4IO4A 4LQ5A 1N04A 3KSJA 1MPBA 2PT2A 4N13A 4XKQA 5FHMA 3BFUA 3CFXA 1XOCA 3PPOA 5AA2D 4PE5B 2O7IA 4KHZE 4DIGA 3SEXA 2UYFA 4IO5A 1D9VA 1DOTA 3IO4A 2H25A 2UXAA 1Y1ZA 3H7MA 3MVZA 3MPLA 4P0GA 4QHQA 5FTHA 2HQ0A 2ZXTA 1B5HA 2XXPA 5AA3A 4NWDA 2A5TA 3ILTB 1URGA 4IO6A 4LONB 3C33A 1B52A 3UA8A 1MXWA 3ZKLA 4ZS9A 3LC8A 3RUMA 1B51A 1Y20A 2XXQA 2QS1A 3ILUB 1US4A 1XHYA 3M3KA 4ONYA 1P1NA 3EHTA 3K1PA 3MQ9A 4O3AA 5CMMA 3R7XA 5EHSA 2FA7A 4BDLA 1ZKBA 4ESXA 2X7PA 4PFUA 1J1NA 2Y7RA 3A3CA 4X9TA 4U2RA 2QMXA 2X7QA 1P99A 3GXAA 1B0LA 5FTIA 3K01A 2VOZA 3MP6A 5AA2B 5JK4A 5L9SA 4G2ZA 4OERA 1TWYA 2XXXA 4DCXA 3Q27A 1NH7A 1QKBA 3OSRA 4JWYA 4OESA 1P1WA 2Z8DA 1JNFA 4GF8A 4YAHX 4KD5A 5H8QA 1URSA 3ONMA 5TP9A 1MQDA 2DXRA 1YCJA 4XTCQ 4HCWA 3F11A 3CSGA 2E0SA 1JVXA 3UORA 2F78A 5DT6A 3VLWA 4MLQA 4OHNA 3FV1A 4OEVA 3JYRA 2B65A 2I3VA 1O63A 1B46A 1LFHA 4R75A 1SW2A 3TUSA 3H4ZA 2HAUA 3O97A 1MXUA 4RYAA 1B05A 4H8IA 4F2QA 5JEIA 5KDTB 1UIVA 3E3KA 3V83A 1NMUA 4KYSA 3QAXA 4JSOA 1I6QA 2THIA 2O84X 5F1QA 4ELRA 1SYHA 3HV1A 5AA2A 2GFEA 2D21A 3B6WA 2PVUA 5H8NB 4Z7EA 1SD3A 1H43A 1S9TA 4NF6B 3FGSA 1D9YA 3H6UA 4C0RA 4F3BA 2XXYA 1VR5A 1Y3QA 4JBZA 2H9BA 2XXIA 2OWSA 2F8DA 3C35A 1AH5A 2NXOA 3OENA 3Q28A 3HCQA 2DWAA 3TQWA 3V5AA 3QYTA 3W9WA 3T96B 5IAIA 2PYYA 2PMSA 3PMXA 3M8UA 4QSDA 2O68A 2I58A 1Q35A 4OETA 3TFLA 2QMWA 1II5A 3SEYA 4Z0IA 3TMGA 1MY0A 4ECFA 3C32A 4THIA 5B7DA 2O6AA 3UK4A 3OO9A 3MWBA 2A5TB 4GLIA 3S9LC 1FQCA 4P0IA 5H8HB 3K0VA 4DXUA 1LFGA 1P1OA 3KJTA 4ZDMA 1AOVA 2ONRA 2XXVA 5L9MA 3TZAA 1WVJA 5CBRA 1L5TA 3EN3A 4U1OA 5DVJA 1A99A 1ZLQA 5A5XA 2I0BA 2Y7PA 4LP2B 2HZKA 3ODBA 4U21A 2F7AA 1T0KA 1Q1KA 3PPPA 2Y7WA 1FTOA 3TEPA 3PPRA 3CG1A 5H8NA 2DE3A 4QRZA 1FTJA 2O51A 1IEJA 2VGQA 2GHAA 1JETA 4YICA 3MVYA 4I9DA 1QULA 3MW0A 1MY4A 2QS2A 1ZJLA 3G3GA 1FQBA 1PC3A 4WEPA 3RGYA 1H76A 1NNKA 3SERA 5I58A 3MZ1A 2QL3A 1OVTA 3O6IA 3EHUA 4EUOA 2GH9A 2KLFA 1NNPA 4GL0A 4R73A 3TDJA 4BDRA 3I6VA 4KQPA 1R1NA 2REJA 2Q89A 4ZEIA 1UTHA 4BDQA 2ZNSA 1LBCA 3IJXB 1S7YA 3VE1B 2CZLA 2R9JA 2XXHA 5TPAB 3IORA 3O2AA 2I48A 4R9FA 3R26A 2DWIA 2PX1A 3PV0E 5H8SA 1XVYA 2NWJA 1AIVA 5I56A 1SVXB 4H5FA 4IO7A 3UN6A 2ALUA 4DDDA 3OO8A 5HM4B 1B3FA 3PD9A 4FEDA 3P7IA 5TP9B 3A09A 3MC2A 4YKJA 3WAFA 1JEVA 1LGBC 3DP4A 2AL5A 3SEUA 1JW5A 3KOSA 3MVXA 1A8FA 1B0HA 5K2XA 4G8HA 1M5FA 2DYXA 3O28A 2OJTA 3PMVA 3TKDA 3G3KA 4PFYA 2ONSA 4JWOA 3V89B 3IOWA 1OVBA 4FJPA 1VFDA 4WEDA 1N7WA 1ZTYA 3VV5A 5TU0A 5KZTA 4R2FA 5I2KB 1XC1A 1NFTA 1QUKA 3A3UA 4IO3A 3TCFA 4DLDA 2REGA 3LSFB 4LA9A 3FJ7A 1SI0A 1VE4A 4OWDA 4U1ZA 4U4XA 1YPNA 2H4IA 4F18A 1JW1A 3OD7A 3KBRA 5EYFA 1NKXA 3U92A 1IQ7A 4QFKA 4WXJA 5CMCA 4BDNA 4HW8A 4JDFA 1MQHA 2R6GE 5AA1A 5JTYA 3FVKA 5I2NB 3FUZA 2P0SA 1MM7A 2YLNA 2Y7IA 2RCBA 1H44A 3ECRA 3O6HA 3TTRA 3D4CA 3V8XB 1BP5A 1QKAA 2DOJA 2V3TA 5CMKA 5BWJA 3T9UA 1A8EA 1MQJA 2HEUA 2F5XA 4Q5TA 2XD2A 2UVJA 2BJJX 1Y1MA 4ZECA 1BLFA 3FV2A 3K6UA 2V84A 1NL5A 1HSLA 4IY5A 3FD3A 4JXIA 4XKPA 2PT1A 4RPOA 4YKIA 3DP8A 4MF3A 4O3BA 4R6YA 2XX9A 3T66A 1DPEA 3G7WA 4ZZAA 3KN3A 3U94A 5I84A 3K2DA 2Q2AA 1B5JA 1SBPA 4MH5A 4XIGQ 3H3GA 3EQ1A 4ZEFA 1RYOA 4ESWA 4XKRA 1M5CA 5FHNA 2CMOA 2DE2A 3KFMA 3L6HA 3MBPA 3TCGA 2XXUA 3QXMA 4U4SA 2I3WA 4EXKA 1DMBA 2FNCA 2HXWA 2Q88A 5CRYA 1MPDA 1TXFA 3PD8A 4OZ9A 4Q30B 3TPAA 4O3CA 1WDNA 3S9NC 4N07A 4G68B 1AMFA 1R9QA 1JQFA 1MQIA 4HTGA 1TFAA 4GFRA 4GD5A 2F97A 2A5SA 2UVHA 4KR5A 1XS5A 1Y3NA 1LAHE 2V3QA 3GBAA 3K6XA 3LUYA 4U22A 3T9XB 4RA1A 3LSXA 3ZS6A 3USDA 1IXGA 4IO2A 4DE8A 4EDPA 1FQEA 1HSJA 1MH4A 2NUVA 2O69A 3IX1A 2DSFA 4E0XA 2VD3A 2I4BA 3RPWA 2F35A 5KCJA 2D5WA 4TOZA 3RLFE 4F39A 3JZJA 4IGTA 5J1DA 1N0TA 2H5YA 3BBRA 4TQUQ 1UTBA 1N84A 4YB6A 4NF4B 1LCFA 4YKKA 3Q26A 1EH3A 2F7BA 3H6TA 1XVXA 3EHSA 4LATA 4R2BA 5I2NA 1IXIA 1FTMA 3T22A 4EQ9A 3O66A 4OEUA 3H06B 1M5DA 3FVOA 3E13X 1B4HA 3VVEA 4AB5A 3TTMA 4Q8RA 3S2VA 4YZZA 3KEIA 5LOMA 3E4RA 1MY1A 2H99A 3K6WA 2RINA 5ISUA 1FTLA 4PP0A 1D3KA 1RKMA 3S9MC 1EZPA 2XXTA 4QFOA 1MDP1 3BFTA 4AB6A 1A40A 4C1UA 2DVZA 4EF2A 4F29A 1B4ZA 1B2HA 4ISUA 4ELQA 4F3SA 4LUBA 4H5GA 2VD2A 5I59A 4G8NA 5EHMA 4X1BA 4C1TA 1WODA 3KGCA 4GWOA 3OO6A 2NOOA 1LSTA 3UIFA 4EQ7A 4H6DA 2F6PA 2Y84A 4OYVA 2D3IA 4G68A 2OZZA 1IUDA 4F3PA 1OIBA 1FW0A 1FCKA 2R71A 1UIUA 1MY2A 4HCYA 1ANFA 4LVQA 2DP8A 4POXA 4OFOA 3VFJA 5CBSA 3OSQA 4QFPA 4H0WA 4MBPA 4OVJA 3K1MA 4E0WA 5JTYB 1US5A 2XXRA 1GV8A 1EZ9A 1FTKA 3K6VA 2F36A 2Z8EA 5CMBA 1B1HA 1PB7A 5I57A 1B7ZA 4DXBA 4JB7A 3TCHA 3IB1A 3K00A 3LSWA 4KCCA 4KCDA 4P11A 1OQHA 4N6PA 1TT1A 1I6AA 4NF5A 1SW5A 3H6VA 3TODA 2ANJA 2ZNUA 3FASA 1F9BA 1N76A 2M8CA 4OTEA 3O9PA 3RNNA 1ZBMA 2I6EA 4H8JA 2HAVA 3CVGA 1IXCA 4OXVA 4FORA 5DEXA 4PQJA 1IXHA 4ELPA 5CC2A 1OQGA 3TQLA 1B1XA 2Q9TA 3O29A 4QF9A 4M4GA 3U8QA 4NF8B 3VVDA 4DZ1A 4YKPA 2HFBA 3FVGA 1MDQA 4QFLA 3UGWA 3TTNA 3GBBA 1N7XA 4K3FA 4G8MA 3U1OA 3L6GA 2I49A 1YAEA 3H6WA 4I8CA 3LBSA 4X48A 4ZEKA 1EU8A 3SEWA 1B3HA 1JVYA 1ZU0A 2P1SA 4H67A 4POWA 3WAEA 4QFNA 3N6TA 1QJMA 3R6UA 3OEMA 3LSLA 3OO7A 4QSEA 5DYHA 3VLVA 3TTLA 4F1UA 4PETA 4X1DA 3U72A 1LCTA 3FXRA 1DTGA 2F34A 1SQYA 1H45A 1LB8A 1MH3A 3C9HA 2Q2CA 4LZ5A 4RY1A 5DVIA 1UQWA 2I0CA 4FEBA 3D4GA 1TFDA 2QS4A 2YPNA 3GZGA 4IB2A 2G29A 2RC7A 2VP1A 2XXWA 4UA8A 4EXLA 3S9EA 3HPIA 1DSNA 2V25A 2W7YA 1A54A 3Q25A 3CR9A 3QIMA 2IEEA 1NNTA 2YJPA 3DELB 5HBCA 1R6ZA 3I5OA 2G93A 3RTWB 1POY1 4LQ2A 3T9HB 3T93B 3UP9A 4MLVA 5HPQA 1LFIA 2RC8A 3G3HA 4TLMB 3W15C 5FHOA 1B7HA 4ELOA 1O7TA 3QSLA 4ND9A 4F1YA 2E1SA 1PDAA 3CG3A 1LB9A 3HN0A 4NF8A 4R72A 4BDOA 3IAZA 1SYIA 3VLUA 1B40A 3FXUA 4L17A 1N3XA 2VHAA 4NWCA 4GIZA 2XHDA 4KPTA 4F2OA 5F7VA 2OWTA 4G68C 1SW1A 4WKMA 1LLSA 3U93A 4DXCA 4GXSB 1O64A 1HSEA 2OBGA 3MVWA 3O6GA 3AXFA 1AL3A 3DM0A 4NMYA 4XXUA 1B3GA 3SESA 1SI1A 3CSBA 3M3FA 4NF5B 5M2VA 3SEVA 3FZVA 3N94A 3T9VA 1LAFE 1QUIA 2QSXA 3FIRA 5I57B 2I4CA 3C36A 3CFLA 3KZGA 4JWXA 4YMBA 4GOTA 1PB8A 4RJZA 1B3LA 3IOVA 2ZYKA 3OEKA 4EQBA 2RF1A 2X26A 1MY3A 3PUVE 4IGRA 4LZ7A 4RPNA 5DTBA 1ELJA 4GVOA 5H8FA 3QUJA 4YB5A 3TTKA 1N3WA 4LZ8A 2DQVA 4BLAA 3MZBA 2F7CA 3RTFB 4XKNA 5H8HA 4FATA 4F3GA 5DVFA 1LAGE 2QJEA 3CFZA 4U23A 4EF1A 4RXLA 5I59B 5ITPA 1PBPA 1BIYA 1Y9UA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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