3U72A

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with isoniazid at 2.2 a resolution
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Metal binding protein
molecule keywords Lactotransferrin
publication title Crystal Structure of C-lobe of Bovine lactoferrin Complexed with Isoniazid at 2.2 A Resolution
rcsb
total genus 119
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2011-10-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3u72A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3u72A02
4MLVA 2UXAA 1SVXB 3QSLA 3MPKA 2FA7A 4NF4A 2REGA 4R74A 3TTMA 1MXXA 1SYIA 3P7IA 4PP0A 1AIVA 5AA2D 1N84A 5I2NB 4NF8B 4IO4A 1B9JA 1LAGE 2Q2CA 2YLNA 4MLQA 1LAXA 4LATA 1H44A 3B7DA 1LCTA 1DPEA 5BUUA 3L6HA 4LZ8A 5DEXA 1B3GA 1FW0A 3ONMA 4GLIA 2PVUA 3FJGA 1GVCA 1LB9A 1LAFE 1A8EA 4ISUA 3DM0A 4HS7A 4YICA 3F11A 4R75A 3HO7A 1H45A 4KPTA 2V25A 2OJTA 3U92A 3PPRA 2QJEA 3LC8A 5DVFA 4TLLB 2OLBA 3QXMA 5BWJA 1QVSA 2X7QA 1MPBA 1LFGA 1BIYA 3S9NC 3IR1A 4GQOA 2RF1A 3CR9A 3LR1A 3I6VA 2XXXA 1MM7A 4EF1A 1NNPA 1JW5A 2QPQA 2GH9A 1XC1A 1MXZA 3OELA 1S7YA 2HZKA 1DTZA 5A5XA 3ZSFA 1BLFA 4YKIA 3FVKA 5I2KB 4JSDA 4GF8A 1JEUA 5F1QA 3PPOA 3THIA 3S4UA 2OBGA 3IB0A 2PMSA 4RNSA 4U4XA 1WVJA 1SW5A 5H8QA 2OCUA 5JEIA 3UK4A 3MQ9A 4F3PA 3JYRA 3N6TA 4FJPA 2XD2A 2HZLA 1I6AA 1P1OA 2G29A 4GD5A 3BBRA 2ZYOA 2ONSA 3DP8A 3R6UA 3HCQA 5HM4B 4ELOA 4GIZA 4HTGA 1URSA 1FQCA 2VOZA 3CI8A 3H7MA 3KN8A 1ZJLA 3OO8A 2ONRA 2R6GE 3GBAA 5B7DA 4E0XA 2Q2AA 4F1YA 3MUQA 3O9PA 4ZEFA 4RK9A 2V93A 1D4NA 1WDNA 2O6AA 2ONKE 4LA9A 3VVDA 1OQGA 3CG1A 4R2BA 3C31A 3H6WA 4NF5B 2RC7A 3BFTA 3PD8A 4DCYA 3K6VA 4GL8A 4C1UA 5IAIA 3MZ1A 4QF9A 3OEMA 5H8SA 2Y7RA 2LAOA 1MY4A 4NMYA 5I2NA 1Y1ZA 3U1OA 1XS5A 3G7WA 4NF8A 3RGYA 4PFYA 1HSLA 1B3FA 2A5TB 2G93A 4EDPA 3DP4A 1MH4A 5AA3A 5H8NB 1UQWA 3EN3A 1M5CA 1NKXA 3T9VA 1USYH 4GFRA 1XVXA 4BDOA 3EHUA 3IL1B 4AQ4A 1A54A 4F1VA 4BLAA 4ELPA 5DVIA 1O63A 5CRYA 1T0KA 3OO9A 2F78A 3FATA 1F9BA 3W15C 3U93A 1A99A 3DLNA 3JZJA 3PU5A 3FASA 3FUZA 3TCGA 2ZYKA 3MP1A 1S9TA 1D9YA 4MF3A 2F97A 3MJNA 4OFLA 4BDNA 2REJA 1B4ZA 4PE5B 3PPPA 4E0WA 5DVJA 1Z7ME 2HXWA 3T9HB 1FTJA 3FXQA 5EHMA 3VXBA 3QAXA 5ICTA 1JQFA 2OWSA 5CMMA 5JTYB 3RT6B 3PUVE 4OVJA 4EF2A 4KI0E 4QSEA 1POY1 1M5BA 1SI1A 3LSXA 4JXIA 3ZKLA 1IQ7A 5I2KA 3G3KA 1QUIA 4QFPA 3R7XA 4OESA 1DTGA 3A09A 2O1LA 3FXRA 4DLDA 1PB7A 5ICQA 1WODA 4ZZAA 4WKMA 3IJOB 2P2AA 4EQ9A 3TUSA 4OXVA 4QRZA 3VFJA 4PQJA 3E13X 3CFLA 5JK4A 1EU8A 1AMFA 3H6UA 5H8FB 5KCJB 1B5HA 4F19A 2H4IA 4GXSB 4G8HA 4N07A 4LZ7A 3C33A 4FIMA 3IOVA 2QL3A 3A3CA 3PUXE 3O66A 2WKYA 1QUKA 1OVTA 4RYAA 2I4CA 4LQ5A 4R72A 4GVOA 4U4SA 4F3BA 3V5AA 3UN6A 1IITA 4KCDA 3R26A 2Q88A 2I3WA 3PUYE 4RK2A 3G3GA 1QUJA 4OERA 2M8CA 4X48A 2DE4A 4F31B 3K0VA 1ZKBA 3GLBA 3QUJA 3C34A 4WXJA 3GZGA 3JV9A 3MW0A 5CC2A 3PPNA 1Y3PA 4Q8RA 4EQBA 4NF5A 5CMKA 1P1NA 3ZKKA 3RUMA 5TP9A 1PDAA 3MZBA 4XTCQ 3FGSA 4I8CA 3W9VA 4YKJA 2XXWA 2Z8FA 2A5TA 4RY1A 4GOTA 2NWJA 1M5DA 1GTKA 3OSQA 3S9EA 3Q29A 1LBCA 3S9MC 1QKAA 2RC8A 4G8NA 3CG3A 3OXNA 5K2XA 3O6HA 1B1XA 4OETA 4F2OA 3VLVA 1YCJA 1NNTA 1PBQA 2HFBA 1N04A 3ZS6A 3Q28A 2BJJX 2X7PA 2XXVA 4LVQA 4XKQA 1MG1A 2DOJA 1URGA 1RKMA 2DE2A 3O6IA 4EXLA 2D21A 5J1DA 1VFEA 1Q35A 3VVFA 1XOCA 4G4PA 1SW4A 1N3XA 2PT2A 3BFUA 2V3UA 2ANJA 3TTLA 5H8HA 4K3FA 4X9TA 1FTKA 4ECFA 4ZEIA 3UP9A 2ZNSA 5F7VA 2NVUB 2Z8DA 5JTYA 3TTKA 4YKPA 4I9DA 4KHZE 4DCXA 1DMBA 5ITOA 5B70A 1US5A 4O3AA 4F3SA 4PFTA 1H43A 3CIJA 4ELRA 4IO6A 5EYFA 4DXBA 4N6PA 4KCCA 4Q5TA 4RA1A 3TFLA 3C4MA 1B7HA 4ZDMA 2DXYA 1N7XA 3HV1A 1Y1MA 3O28A 1OVBA 4H6DA 1N76A 4OEUA 1QW0A 2CZLA 4H0WA 3PV0E 1QULA 4P0IA 4F18A 2R71A 1QJMA 5EHSA 3KJTA 3VLWA 5H8FA 4R6HA 5KCJA 5L8DA 1MY0A 4QFLA 2XXPA 3CFZA 4ZEBA 4F22A 3UORA 4YB5A 4AB6A 2AIXA 1OMPA 1Y3NA 2QS3A 4P0GA 3TAJA 3VLUA 2F34A 1B7ZA 1SYHA 2XXRA 4U1ZA 2ESNA 3KN7A 2H99A 3PUZE 3MC2A 2XHDA 1R9LA 3D4CA 4PFWA 1TFDA 1B3LA 3HHGA 5L9SA 3FZVA 1B2HA 3L6GA 4R6KA 2NXOA 5TPAA 4H8JA 1OLCA 5CM6A 2Y7PA 1MQHA 2P1SA 4ESXA 4NF6A 3I5OA 1B32A 4R9GA 3H03A 3CRBA 2H9BA 2F7AA 3H3GA 4NTLA 4ZEKA 1MXUA 3MVWA 3AXFA 4IGTA 2DWAA 3SERA 1P99A 4U1OA 1Y20A 3PPQA 3USDA 2O7IA 5CMBA 3PMXA 2B3FA 3E9XA 3K2DA 3KOSA 4KR5A 2H5YA 3U94A 3KSJA 1NH8A 4FECA 4RJZA 3TKDA 3C36A 3M8UA 5CMCA 5HPQA 4QFNA 3OD7A 4FORA 1NNFA 2V3TA 1HSJA 2DQVA 2ZYMA 2DWHA 4XXUA 5KZTA 3OEKA 4JB7A 5HBCA 1XVYA 4QSCA 4FE8A 3UIFA 5L9MA 2DVCA 4G2ZA 1CB6A 5CBSA 2Y7WA 4FEBA 3CSGA 4NE4A 3Q25A 4UA8A 1PEBA 4O3BA 3IB2A 3DELB 3V83A 3G3JA 3IO6A 2I0CA 4XKPA 4TQUQ 3K6UA 4G77A 2I49A 2YJPA 4M1VA 2RKMA 3EF7A 4OYVA 1TT1A 1AH5A 2F7BA 3C32A 3ILTB 2DWJA 3FD3A 3RY3A 3KJ7A 2YPNA 2F5XA 3SEUA 3H06B 5TP9B 1IXHA 1B51A 3LUYA 3BKIB 3LSLA 3KEIA 4ONYA 2DYXA 1FQBA 1DSNA 4H1XA 5CBRA 3HSTA 1SBPA 2I3VA 4R6YA 4DXUA 2D5WA 4IO2A 1OLAA 4LUBA 1IEJA 2I6EA 4QHQA 1P1WA 1NNKA 1N7WA 1Z7NE 2DSFA 4H67A 4XIGQ 3H4ZA 4NWCA 2E0SA 4YB7A 1MQIA 2F8DA 3LSFB 1YPNA 3FVNA 3RNNA 1P1UA 2H25A 3RTWB 3FIRA 3B6WA 2CMOA 2Z23A 3IO4A 3EQ1A 3KN3A 2HEUA 5H8HB 5K2YA 1B5JA 4Q0CA 5I56B 1M5FA 4H5FA 2QS1A 1I6QA 4KYEA 2RINA 2HAUA 3MZ9A 4R73A 1NL5A 1UIUA 3CSBA 2XXQA 2Y84A 1I6BA 3K4UA 5DYHA 2GHBA 5I57B 1IZ1A 4L17A 3RT8A 1N0TA 3Q27A 1RYOA 4YB6A 1ZMGA 2R9JA 1MXWA 3O29A 1GR2A 3IJXB 1KWHA 2PYYA 1B0HA 1MY3A 2O68A 5ITPA 2IA4A 1A7LA 3EPEA 4RXLA 2F7CA 1SQYA 4IO7A 4F39A 2I48A 2Q9TA 3M3KA 1ZLQA 3SEVA 1D3KA 1NMUA 1ZTYA 2I4BA 2O84X 4FAJA 3T9UA 1LBBA 5FHOA 3PGFA 1MY2A 2DS9A 2VHAA 1OIBA 2ZMBA 3MAMA 2H98A 4WEPA 3TODA 1NH7A 4Z0IA 1ATGA 3KGCA 3K02A 1BTJA 1SD3A 4F3GA 3T22A 3C9HA 4GXAA 3U72A 4GL0A 1B52A 1B40A 5TPAB 1IXIA 3EHTA 3TQWA 2Y7IA 3SESA 2AL5A 3K6XA 1UTHB 4NF6B 3N94A 3T96B 5IKBA 4IY6A 2QMXA 1MM6A 4POWA 4YU0A 3MVYA 3TCHA 3RN8A 1O64A 3OOAA 3FV2A 4THIA 3HPIA 3KOTA 1BKAA 5FTHA 5LOMA 2UVIA 3O97A 3PMVA 4LZ5A 2GHAA 4IB2A 2AL4A 3T66A 1LAHE 4ZEDA 1ELJA 1IXCA 1MQDA 1HSEA 1Y9UA 4ZE8A 4EUOA 4GWOA 5DT6A 3V8XB 4F29A 4XKNA 1JW1A 1B7UA 4G68B 3IAZA 4NWDA 2OZZA 5AE4A 1M5EA 1I69A 3S9LC 2ALUA 3EHSA 3QIMA 1USYE 3S2VA 2AYSA 1L5TA 1UIVA 1LSTA 4U23A 4GRKA 1FQAA 1MY1A 2P0SA 2FNCA 3U8QA 1VE4A 2V3QA 4LP2B 4MH5A 2I0BA 4QFOA 3FJ7A 1R1NA 5I58B 5AA4B 1RYXA 1VR5A 3O6GA 1B6HA 2KLFA 1EH3A 4HCYA 5I56A 3K6WA 4KQPA 2DVZA 5L9OA 2O7UA 2A5SA 1SW2A 4OTEA 4TLMB 3KG2A 1ANFA 2B3BA 2V84A 1UTBB 1S50A 1A55A 1IXGA 3FJMA 3SKPA 3RLFE 4I62A 3O2AA 4JWYA 1MDP1 5DTBA 1US4A 4G8MA 3TEPA 2NUVA 1SW1A 4JDFA 2NOOA 2XX8A 3VE1B 3ODBA 1FTOA 5I57A 3UGWA 1D9VA 1JEVA 1MQJA 4LQ2A 5I59B 4RPNA 3RQTA 3VXCA 2OWTA 1AOVA 4KFQA 3OSRA 3I3VA 3M3FA 1B4HA 4YAHX 1SDXA 4ZS9A 1ZIUA 1H76A 3TTNA 4HCWA 1Q1KA 2PX1A 4ELQA 3H6TA 3MBPA 4OMBA 2B65A 2HAVA 4FATA 3TYHA 1JNFA 3UA8A 1MXYA 4BDLA 2ZXTA 5I84A 4ZZEA 2QS4A 1OQHA 3TMGA 3MWBA 4MBPA 4AB5A 4M4GA 3OO6A 3N6UA 3QUFA 4ND9A 5CI5A 2ZYNA 1A8FA 3VVEA 4KYSA 4QSDA 3H6VA 4G68C 4YMBA 1TWYA 1MXVA 1UTHA 2RCAA 3T9XB 2DXRA 2O1MA 1FCKA 1PC3A 5FHMA 1URDA 1LCFA 5FHNA 3TDJA 4YMAA 3MVZA 3K01A 2FYIA 2UVGA 3SEXA 2HQ0A 1MPDA 4OZ9A 2HCAA 4DXCA 3OMBA 1B58A 4C1TA 3RTFB 1NFTA 3TCFA 3KSXA 3C35A 5KDTB 2Z22A 3MVXA 2XXYA 4ZE9A 5AA2A 4G68A 1FQEA 4YKKA 1MPCA 2DE3A 1PBPA 4DZ1A 4C0RA 3OO7A 1XHYA 3CVGA 3G3FA 4IGRA 4EXKA 4MFIA 3T93B 3GXAA 4U22A 1B46A 1YAEA 1IIWA 2UYEA 3HN0A 4BDRA 1B0LA 3IOUA 2D3IA 2VD3A 3MP6A 3K1MA 4H8IA 1O7TA 5I58A 1QKBA 1A40A 1LGBC 5AA4A 2Y7KA 2XXUA 3TELA 4OWDA 4IO5A 3M3LA 1R9QA 2IEEA 1II5A 2E1SA 1XT8A 3FV1A 5M2VA 2UVJA 1UTBA 2QS2A 1DPPA 2THIA 3LBSA 5TU0A 4ESWA 3Q26A 1JVYA 1TXFA 3GBBA 4OENA 2XXIA 1VSOA 2XD3A 5I59A 4X1BA 4P11A 2UVHA 3SETA 3TQLA 3CFXA 2Q89A 2W7YA 3IK6B 4Q30B 1FQFA 3K1NA 1LB8A 1FTMA 3ILUB 2RC9A 1JETA 2XXHA 4R2FA 3OENA 4NF4B 4FEDA 1J1NA 2VP1A 3SEYA 1MS7A 1Y4TA 1P1QA 4UACA 2F6PA 4JWOA 2GRVA 1GGGA 1MQGA 2ZNUA 3PUWE 3IX1A 5ISUA 2RCBA 4JSOA 1ZBMA 2PBWA 3KFMA 4U2RA 3SDFA 2XX9A 4Z7EA 4H65A 2PT1A 1B3EA 2F35A 4BDMA 3HHFA 3ECRA 3KBRA 3QYTA 2O69A 3VDFA 2VD2A 3D4GA 5DEXB 1TFAA 4U21A 1LFIA 1JW4A 2F36A 1PB8A 3FVGA 3G3HA 4KD5A 4F1UA 2VGQA 1BP5A 4IY5A 1FQDA 4DDDA 4EQ7A 3LSWA 1ZU0A 4F2QA 1B3HA 1R6ZA 2DWIA 4NEDA 2ZNTA 1IUDA 3B6TA 1Y3QA 1YTVA 1FTLA 4R9FA 4XKRA 4DIGA 5ELVA 3A3UA 5FTIA 5KDTA 2UYFA 3SEWA 1AL3A 3IORA 3RPWA 1DOTA 4OFOA 4I1DA 3FVOA 3IB1A 2DP8A 2GFEA 3DP6A 4DE8A 3PD9A 1Y4CA 2I58A 1POTA 5A5XB 2Q8JA 4WEDA 3K1PA 4OHNA 3B6QA 2Z8EA 3IOWA 3FXUA 4PETA 3N5LA 1VFDA 3MPLA 4YZZA 2XXTA 4H5GA 1GV8A 3VV5A 3K00A 5H8QB 5AA1A 3TZAA 2F6GA 4JWXA 4POXA 4LONB 2XX7A 1LLSA 2O51A 4JBZA 3E4RA 3PMWA 1JVXA 2X26A 3V89B 4HW8A 1B05A 1PB9A 2QRYA 1MH3A 4PFUA 4IO3A 3KZGA 4BDQA 1CE2A 5AA2B 1H3DA 4OQOA 3E3KA 4O3CA 3N26A 5H8NA 3G3IA 3IOTA 3MP8A 4OFJA 1EZPA 2QMWA 1EZOA 1N3WA 1B5IA 3TTRA 3WAFA 3TPAA 3WAEA 2QSXA 4ZECA 1B1HA 4TOZA 2OK2A 4N13A 1LFHA 4OEVA 3QK6A 1SI0A 4X1DA 4KYDA 3W9WA 1EZ9A 1MRPA 2ABHA 4QFKA 4RPOA 1MDQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4MLVA 1FTAA 1SVXB 2UXAA 3QSLA 3MPKA 2FA7A 4NF4A 2REGA 4R74A 3TTMA 4MNPA 5FBPA 1MXXA 1SYIA 3P7IA 1IMCA 4PP0A 1AIVA 5DW8A 5AA2D 1N84A 5I2NB 4NF8B 4IO4A 1B9JA 1LAGE 2WYKA 2Q2CA 2YLNA 4MLQA 1LAXA 1FRPA 4LATA 1H44A 3B7DA 1LCTA 1DPEA 2VPNA 5BUUA 4GBWA 3L6HA 4LZ8A 5DEXA 2WBBA 1B3GA 1FW0A 3ONMA 4O7IA 4GLIA 2PVUA 3FJGA 4N17A 4NHBA 4LN5A 1GVCA 1LB9A 1LAFE 1A8EA 4ISUA 3DM0A 4HS7A 3HFUA 4YICA 3E79A 4PBQA 3F11A 4R75A 4N81A 3HO7A 1H45A 4KPTA 4N6DA 2V25A 2OJTA 3U92A 3PPRA 2QJEA 3LC8A 2PFZA 5DVFA 4TLLB 2OLBA 3QXMA 5BWJA 1QVSA 3RPLB 2X7QA 1MPBA 1LFGA 1BIYA 3S9NC 3IR1A 2BJIA 2Q8MA 4NG7A 4GQOA 2RF1A 3CR9A 3LR1A 3I6VA 2XXXA 4PCDA 2XWOA 1MM7A 4EF1A 1NNPA 1JW5A 2QPQA 2GH9A 1XC1A 1MXZA 5I5PA 3OELA 2FBPA 1S7YA 1YZ0A 2HZKA 1DTZA 1FJ6A 5A5XA 2WYPA 3ZSFA 1BLFA 4YKIA 3FVKA 5I2KB 4JSDA 4GF8A 1JEUA 5F1QA 3PPOA 3THIA 3S4UA 2OBGA 3IB0A 2PMSA 4RNSA 4U4XA 1WVJA 1SW5A 5H8QA 5ESYA 2OCUA 1G0IA 5JEIA 3UK4A 3MQ9A 4F3PA 3JYRA 3N6TA 4FJPA 2XD2A 2HZLA 1I6AA 1P1OA 2G29A 4GD5A 1FBCA 3BBRA 2ZYOA 2ONSA 2V4CA 3DP8A 3R6UA 3HCQA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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