3U72A

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with isoniazid at 2.2 a resolution
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of C-lobe of Bovine lactoferrin Complexed with Isoniazid at 2.2 A Resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
molecule tags Metal binding protein
total genus 119
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2011-10-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3u72A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3u72A02
4H67A 5DTBA 2QSXA 2ZYNA 4NF5B 4OEUA 3RLFE 4F39A 3G3JA 2AL4A 1JVYA 3S4UA 4UA8A 5DYHA 1MQGA 2DWHA 3N5LA 4DZ1A 1OVBA 4BDMA 1QULA 1LCTA 3QYTA 1Y4CA 1O7TA 1A7LA 4TQUQ 1SVXB 1SD3A 1BLFA 3PPQA 2XXRA 1Y20A 3O29A 1I6QA 1JNFA 1JQFA 1XVXA 4XKNA 4AB6A 3I5OA 2ALUA 1N04A 1B7HA 3MP1A 3MW0A 4DXUA 3OD7A 1PBQA 3ODBA 4NF8A 1BTJA 2HXWA 4NF6A 5I2NA 4LQ2A 4U23A 3TZAA 4NF5A 1B5JA 2FYIA 4OESA 2DWJA 1LB9A 2Z23A 5H8FA 1J1NA 1S9TA 3MWBA 3E13X 2ONKE 4F1VA 2Q9TA 4QSCA 2OCUA 2QJEA 2XXTA 3QUJA 2GHAA 3IX1A 3H7MA 3VFJA 4IGRA 3OOAA 3TAJA 1Z7ME 1MXZA 1D3KA 1P1QA 2ANJA 3FGSA 3FVGA 5ISUA 4Q0CA 3PMWA 2PYYA 3RY3A 1B3HA 4YICA 1B3EA 2DVCA 1B3FA 5H8HB 2ONSA 2Y7WA 2Q2AA 3H4ZA 1S50A 4PP0A 4XKQA 1MXYA 1LCFA 2XXYA 1Y3PA 4DCYA 4ISUA 3KOSA 1FQFA 2DOJA 1GGGA 1I6BA 1LAGE 1PB9A 1URGA 2A5TA 1MY0A 4G68B 1GVCA 4RYAA 5ICTA 1TXFA 1UIUA 3FVNA 4R6HA 2DVZA 1ZU0A 2F97A 3H6UA 2PBWA 1WDNA 2AL5A 1B40A 1ELJA 4O3CA 4MFIA 3W15C 5EHMA 3FVOA 4P11A 1FCKA 5H8HA 1VE4A 1ZMGA 1ZIUA 3C4MA 4PQJA 4G68C 1MS7A 4BDRA 2I48A 2ZNUA 1POY1 2PX1A 3FXRA 5DEXB 1NH7A 4G68A 2DSFA 4H65A 3JZJA 4JXIA 3FJ7A 4KFQA 3MBPA 5M2VA 1A99A 1XC1A 3QIMA 3KOTA 3GBAA 1B4ZA 4KQPA 4E0WA 1B7UA 1NL5A 2DE2A 2VP1A 2F35A 1MQIA 3T22A 3VLUA 2O1LA 4LA9A 2DWIA 4R6KA 2I0CA 5ITOA 4ZECA 5JK4A 1OLAA 1GR2A 2H4IA 1XOCA 1P99A 3OELA 3MVYA 4BDQA 4QSEA 3M3KA 2VD2A 2H25A 4ZEDA 2UVHA 1ZLQA 4M4GA 1MM6A 2Y84A 3H6VA 3HCQA 1LBCA 2Q88A 2Z8EA 1MPCA 4GOTA 4NEDA 1GTKA 3A09A 2CMOA 4NE4A 2ZNTA 4G8HA 2RINA 3KEIA 3CIJA 3S9EA 1B2HA 3C36A 2PT2A 4R9GA 3G3FA 2DYXA 1MPDA 4XKRA 1PBPA 3O28A 3K1NA 1SQYA 4TOZA 1A8FA 5KDTA 4IY6A 5AA3A 3C31A 5H8NB 1MXWA 1QJMA 4BDOA 2D5WA 5CM6A 4H8IA 2PMSA 1JW1A 3PPPA 4TLMB 1D4NA 4FEDA 5B7DA 1XS5A 4F31B 3O6GA 4QFOA 2REJA 1FQAA 3TKDA 1SW2A 1QUKA 2O6AA 3V5AA 3PGFA 4RPOA 1ZJLA 4JSOA 4QFPA 2NUVA 4HCWA 3K4UA 1PB7A 4NTLA 4RJZA 2F6PA 4RXLA 4FECA 3MC2A 4JWXA 2M8CA 4DLDA 2X26A 1JVXA 3SEWA 4RA1A 4N13A 2WKYA 2QS1A 4OEVA 3RT6B 3O6IA 3HHGA 3IO6A 5H8NA 3HN0A 1H3DA 3IL1B 4KYSA 3LC8A 3Q26A 2AYSA 1FTOA 4EF2A 4YMBA 4RK9A 3IAZA 3Q27A 1MXUA 4EF1A 2XD2A 5CBSA 4IY5A 4F29A 3M3FA 1B5IA 1M5EA 4LP2B 2VOZA 3K6VA 3VXBA 2Z8FA 3F11A 3KFMA 1OVTA 4FE8A 4ZDMA 3U1OA 3S9MC 1QUJA 3G3HA 2UVGA 4U4XA 2OWSA 3V89B 1FQDA 4EXLA 4PFTA 2F7AA 2FA7A 4G8MA 3OO8A 1EZ9A 1LB8A 2ZXTA 2A5SA 3IB2A 4QFKA 2O69A 4ELRA 4OYVA 1SYHA 3L6GA 3UN6A 1I69A 1B51A 4QSDA 2XD3A 4P0GA 4ZZEA 4GF8A 2AIXA 4IGTA 3MQ9A 5H8SA 3THIA 1Y1ZA 3MAMA 3PUVE 2H99A 2XXIA 2XX7A 3JYRA 1FTLA 2F78A 3UIFA 4KD5A 2I49A 3ZKLA 4ZZAA 2ZMBA 5LOMA 4P0IA 1QKAA 5KCJB 3FVKA 3SEXA 3DP6A 3LR1A 4DXCA 1LGBC 1NNTA 5H8QB 3U8QA 2ZYMA 1YTVA 4LZ7A 4GLIA 1UTHA 3ZS6A 3TTMA 4QHQA 3IO4A 3EN3A 3LSXA 3FJMA 1TFDA 5FHOA 3TPAA 2P2AA 4F3GA 3PD9A 4OMBA 3H03A 5FHMA 3KBRA 3O6HA 5TPAB 1CB6A 3TTLA 3BFUA 1IUDA 4O3AA 1MM7A 4IO3A 2O84X 2P0SA 1B4HA 5DT6A 1FTMA 4KYEA 2F36A 1R9QA 1SW1A 2V25A 2R6GE 2CZLA 3PMVA 4ELOA 4OWDA 1B7ZA 2XXXA 4YB5A 4YU0A 2I4CA 4OHNA 1SI1A 3K00A 2RC9A 4F3SA 5H8QA 3LBSA 3HV1A 4HS7A 5JEIA 4KCDA 4YMAA 4U1ZA 5CBRA 2GFEA 3FASA 4FEBA 1MY1A 3EHUA 3TCFA 3SKPA 2XX8A 1UIVA 3HO7A 2HZLA 3PV0E 1DMBA 4EDPA 3WAFA 2YJPA 3K2DA 3TYHA 1DTZA 5B70A 4N6PA 2F34A 4H5GA 1ZTYA 3TCHA 1A54A 4LVQA 2E1SA 2OZZA 3IK6B 3G7WA 3FV1A 3PUYE 3SEYA 3TUSA 2HAVA 1EH3A 1RYOA 3MJNA 5I56B 1WODA 1POTA 3Q29A 1MQJA 4U22A 4U2RA 1IXHA 2ZNSA 3SDFA 4AQ4A 3IJOB 1B3GA 1FQCA 3TELA 4YB6A 4FJPA 2QS2A 3ILTB 3B6QA 4JWOA 4NF4B 1MRPA 4H1XA 4H0WA 5CRYA 3G3GA 4YKKA 5FTHA 3OEMA 4GFRA 3GBBA 4OFLA 4R73A 1DPEA 1NNFA 4NWCA 3O97A 4XTCQ 3K1PA 2O7UA 2NOOA 4JB7A 3IR1A 5I59B 4PE5B 1ZBMA 3PPOA 3HHFA 4BDNA 1RYXA 4ONYA 2V3TA 1PB8A 4ECFA 5CC2A 3O9PA 3GXAA 3LSFB 3H3GA 1TT1A 3SETA 4Q5TA 2I6EA 1IXGA 1OMPA 1YPNA 3DP4A 4G77A 4OFJA 2V84A 3I3VA 4YKPA 3DELB 1M5FA 1N76A 3OEKA 1OLCA 5F7VA 3BBRA 3K02A 2QRYA 1FQBA 3KSXA 5I84A 1NNKA 1MY4A 2QS3A 1XT8A 3TTKA 5I59A 5HBCA 2H5YA 3G3IA 3KN3A 1WVJA 4ZEKA 2W7YA 4FATA 4RNSA 3OENA 3QAXA 1UTBB 1TFAA 2UYEA 3O66A 4R74A 3TTNA 1QVSA 3PPNA 3T93B 3LUYA 3W9WA 1ATGA 2O7IA 2BJJX 1MQHA 5DEXA 3CG1A 1F9BA 5AA4B 4JDFA 4X48A 4DDDA 2R71A 3SESA 4OZ9A 1Y1MA 3U93A 2ABHA 1VR5A 3MVZA 4C1UA 1N7XA 1PEBA 1EU8A 3WAEA 4Z0IA 4MLVA 4LZ5A 5BWJA 1M5DA 1FQEA 1UTBA 1II5A 3SEVA 1L5TA 5EHSA 4X1DA 3N6UA 1UQWA 2F5XA 3AXFA 2XXQA 1N0TA 1B0LA 3K6XA 2H98A 4OERA 5BUUA 3MUQA 3CG3A 1IXCA 3H6WA 1Y4TA 3N94A 1N7WA 5AA4A 2IA4A 3FXQA 1R9LA 3QK6A 1Q1KA 4GQOA 3A3CA 1N3XA 3ZKKA 1BIYA 2OBGA 5AA1A 4EQ7A 4M1VA 4MLQA 1H45A 1EZPA 1SW5A 3R6UA 5JTYB 5AA2D 1Y9UA 3MP8A 3EQ1A 4DIGA 2RCAA 2PT1A 4MH5A 1LBBA 1FTJA 1CE2A 3FV2A 5DVJA 4EQ9A 4ZE8A 3D4GA 3Q25A 3RTWB 4U21A 4I1DA 3RNNA 1SDXA 1AH5A 2GRVA 3VDFA 2UVJA 2PVUA 1OQGA 2OJTA 3U92A 1NMUA 4K3FA 1JETA 3KJTA 2Q8JA 1MXXA 4GD5A 3KG2A 4F2OA 2UYFA 5ICQA 4H5FA 4IO6A 3EF7A 1ZKBA 1IQ7A 1VSOA 4R75A 1AMFA 2NXOA 2Q2CA 2GHBA 3PU5A 1B5HA 4FAJA 5ITPA 4IO5A 1USYE 5CI5A 4G8NA 3MZ9A 4IO4A 4RPNA 1NH8A 1IEJA 2Y7PA 3MPKA 1B6HA 1A40A 5TU0A 5CMKA 3K6UA 4KYDA 4ESXA 1XVYA 2VHAA 5I2KB 3UGWA 2NVUB 1QKBA 4EQBA 1NKXA 2XXPA 2DS9A 3OO9A 4LZ8A 3VE1B 3BFTA 3C33A 1I6AA 1B46A 5HPQA 3D4CA 4AB5A 3EHSA 4KCCA 1TWYA 3GZGA 3H6TA 1DOTA 2THIA 3RTFB 2P1SA 3UORA 3TDJA 3VXCA 2ZYOA 3E3KA 4PETA 3CFLA 4ZEFA 4GL8A 4GRKA 4IO7A 1OIBA 4JWYA 4ZS9A 5L9SA 4DXBA 2FNCA 3QXMA 4N07A 4X9TA 2Z22A 3C34A 3RUMA 3V83A 1AIVA 2XXVA 3CSGA 1Y3NA 3CFXA 4NF6B 3ILUB 3QSLA 2QL3A 4WXJA 3OMBA 2V3UA 5ELVA 1B0HA 3DLNA 3K01A 2UVIA 1B9JA 3SEUA 5H8FB 4EUOA 1M5BA 3PUZE 1BP5A 1H44A 1AOVA 2DP8A 5A5XB 4C0RA 2YPNA 2DWAA 1MY2A 4F1UA 5KCJA 4F1YA 5FTIA 1MXVA 2XHDA 3VVDA 4F19A 3CFZA 2G29A 4THIA 4U4SA 1NNPA 3M8UA 4HTGA 4JBZA 3P7IA 3IOWA 3KJ7A 1LFHA 1D9VA 2QMXA 4R2FA 4ELPA 4OQOA 4Q8RA 3PMXA 4IO2A 3DP8A 5IKBA 5TPAA 2R9JA 3A3UA 1N84A 3K1MA 4PFWA 3N6TA 4H6DA 3K6WA 4RY1A 1A55A 5A5XA 2A5TB 4FORA 2QPQA 4MF3A 3B6TA 1M5CA 1P1OA 3IJXB 3KN7A 4YZZA 2GH9A 4R6YA 4I62A 3OO6A 1JEVA 3RT8A 2XXUA 4ND9A 1JW5A 3OSRA 3K0VA 3CSBA 3FZVA 5DVIA 2ZYKA 3T9VA 2NWJA 1OQHA 1B58A 4BLAA 3KN8A 2I0BA 1SW4A 1PDAA 1JEUA 5CMCA 3T9XB 2ONRA 3O2AA 4QFNA 1B1HA 3FXUA 4QF9A 1R1NA 3ECRA 3R26A 4YKJA 4POXA 3IOVA 2QMWA 4GVOA 1Q35A 3MP6A 1FTKA 4DCXA 2I58A 4ZE9A 5K2YA 1D9YA 5HM4B 1MY3A 3CRBA 3TCGA 4R9FA 3KZGA 3KGCA 5I56A 1HSEA 3C9HA 4O3BA 4XKPA 2F7CA 4LATA 1MH3A 1B1XA 4ZEIA 3FIRA 4NF4A 3TQWA 2REGA 1MDP1 1DTGA 1IITA 1LFIA 2V93A 3G3KA 3C35A 2RCBA 1NFTA 2RF1A 3B7DA 1MPBA 4QRZA 3RN8A 4F22A 2F6GA 4GWOA 5DVFA 4WEPA 2Y7IA 4R72A 1US5A 3CVGA 3T66A 2RC7A 1XHYA 2X7PA 1P1UA 3T96B 1FW0A 2HAUA 4G4PA 1YCJA 1B52A 1LSTA 1US4A 3RGYA 3UA8A 2XX9A 1IXIA 4ESWA 4MBPA 3FD3A 3S9LC 5FHNA 5TP9B 4HCYA 1LLSA 2YLNA 3ZSFA 4LQ5A 2OLBA 4U1OA 3IOTA 2X7QA 1DSNA 3C32A 3Q28A 1EZOA 3T9UA 4GL0A 2DQVA 2IEEA 4R2BA 2F7BA 1IZ1A 2DXRA 5KDTB 2RKMA 1VFDA 5KZTA 2V3QA 4YAHX 4QFLA 3OXNA 1DPPA 2Q89A 1S7YA 2LAOA 1LAHE 4F3BA 5I58B 5AA2B 2E0SA 3KSJA 4L17A 1LAFE 4OETA 3TODA 1JW4A 4H8JA 1URDA 4OXVA 3DM0A 4KPTA 3TQLA 4UACA 3BKIB 3PUWE 2Z8DA 3EHTA 4EXKA 3MZBA 1B05A 3TEPA 2H9BA 4I8CA 3QUFA 4KI0E 5TP9A 4PFUA 1T0KA 3FATA 4RK2A 5L9MA 2D21A 4F18A 4FIMA 3N26A 2RC8A 4Z7EA 3L6HA 1MDQA 4TLLB 3VLWA 3UP9A 2HQ0A 3M3LA 2G93A 1IIWA 2KLFA 1HSLA 1Z7NE 3MPLA 3IORA 5I58A 5AA2A 3IB1A 4BDLA 3S9NC 2O1MA 2O68A 1H43A 2VGQA 2DE4A 1AL3A 4WKMA 1HSJA 1URSA 4HW8A 3UK4A 1MH4A 3SERA 3MVXA 5J1DA 3VVFA 1B3LA 2XXWA 3FJGA 2Y7KA 2Y7RA 3CR9A 5AE4A 3PD8A 2OWTA 3FUZA 2B3FA 1RKMA 4NMYA 4X1BA 4GXSB 5L9OA 2HZKA 3E4RA 3W9VA 5F1QA 1O64A 1MQDA 1SYIA 4LUBA 1O63A 3ONMA 4YKIA 2VD3A 1VFEA 4GXAA 1QW0A 2OK2A 3R7XA 3HPIA 4IB2A 3B6WA 2QS4A 1PC3A 5JTYA 3VV5A 4F2QA 1GV8A 1A8EA 2UXAA 3T9HB 2I4BA 2B3BA 4GIZA 3OSQA 1SI0A 1MG1A 1LFGA 2ESNA 3H06B 3USDA 4F3PA 4JSDA 2HCAA 1N3WA 1USYH 4WEDA 5EYFA 1B32A 4I9DA 3PPRA 4YB7A 3V8XB 4XXUA 5L8DA 3CI8A 3E9XA 4KR5A 2HEUA 4C1TA 4KHZE 4OTEA 4POWA 4DE8A 4E0XA 1P1WA 3U72A 3IOUA 3HSTA 3S2VA 5I57B 4OFOA 3LSWA 3MVWA 4NWDA 3OO7A 3VVEA 4Q30B 1QUIA 1UTHB 2I3VA 1R6ZA 3LSLA 1LAXA 3I6VA 3JV9A 1P1NA 5IAIA 3PUXE 1ANFA 3U94A 3MZ1A 2O51A 3TFLA 2B65A 2I3WA 4LONB 3TMGA 4ELQA 3RPWA 2DE3A 3IB0A 4ZEBA 1YAEA 3GLBA 3EPEA 4OVJA 3RQTA 1H76A 4XIGQ 5CMBA 1SBPA 5CMMA 3TTRA 2DXYA 4G2ZA 2HFBA 1Y3QA 3VLVA 1BKAA 2F8DA 2XXHA 2D3IA 4OENA 4NF8B 5I2KA 1KWHA 4PFYA 5I57A 5I2NB 5K2XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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