3O29A

Ligand-binding domain of glua2 (flip) ionotropic glutamate receptor in complex with an allosteric modulator
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
263
structure length
263
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title A novel series of positive modulators of the AMPA receptor: discovery and structure based hit-to-lead studies.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 90
structure length 263
sequence length 263
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-07-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3o29A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3o29A02
5H8SA 4DXBA 2H4IA 4LZ8A 4BDLA 3OD7A 1B51A 5DVIA 3FXQA 3TFLA 2RCAA 2D21A 5ELVA 4R72A 2ONKE 4BLAA 1SI1A 4DCYA 1OQGA 2RCBA 3K1PA 3BBRA 1MPBA 2Z8FA 4G68C 4ZEKA 3CFZA 3BFTA 4C0RA 5H8FA 1B4HA 2P0SA 1MQJA 1MS7A 1XS5A 2PT2A 3M3KA 1B58A 3CI8A 3O29A 3ODBA 4H0WA 1B05A 2HAUA 3RY3A 5H8NB 5HM4B 4JXIA 1TT1A 4DXCA 5CC2A 3T66A 1IZ1A 3DP6A 3G3KA 3H6UA 3OEMA 4LZ5A 1Y4CA 3HPIA 4NMYA 4O3CA 2DYXA 3LBSA 2VD2A 2I0CA 3U8QA 1N3WA 3C4MA 4YKJA 3KBRA 4P11A 2G93A 5TP9B 3RT6B 1Y3PA 1BLFA 2H9BA 3PU5A 3QAXA 1IIWA 2AIXA 2W7YA 1H45A 3IO6A 4IO7A 4Z0IA 3RUMA 2ZNSA 3UA8A 5I58B 3V8XB 2X7PA 1LLSA 2XXUA 3KJ7A 4KCCA 1DSNA 3SESA 4FEBA 4THIA 4QFNA 4EF2A 3TQWA 2ZNTA 3MBPA 4GQOA 2V84A 2F6PA 1XOCA 4LQ2A 1QULA 3K6XA 2ZNUA 2Q88A 1Y3QA 3CVGA 4GF8A 4H1XA 2H99A 3BKIB 3QUJA 5FHMA 4G68B 1H3DA 4H67A 2V3QA 1JQFA 1M5DA 2UYFA 2XXRA 3C33A 1FTLA 1JNFA 1ZU0A 2FA7A 1N76A 3MPKA 2V93A 4GL8A 4PFWA 2NVUB 3U93A 4C1TA 2Y7RA 3EHSA 3QK6A 3K6VA 2ABHA 4LATA 4R2BA 1GTKA 4JSOA 2HXWA 3RT8A 3T93B 4ZEFA 3Q29A 5H8HB 1IQ7A 2F5XA 3C9HA 1RYXA 1S7YA 4Q30B 2UXAA 2FYIA 3FJGA 5A5XA 2O68A 2ESNA 4I8CA 4OTEA 1Q1KA 3C36A 1B5IA 3RLFE 1P1QA 2UVIA 4GXSB 4P0IA 4GD5A 4RPNA 3TTNA 1IITA 4N13A 3T9UA 5ICTA 3O9PA 1QUKA 5I2NB 4TQUQ 4LQ5A 4FAJA 3IJXB 3T9HB 4ESXA 2F34A 1H44A 4G8HA 3TPAA 4F2QA 2Q8JA 3SKPA 2B65A 3TTKA 2NUVA 1B4ZA 1B5JA 4LA9A 3ZSFA 3W9VA 4ELRA 3HHGA 2OK2A 5TPAA 1FQAA 4R6KA 3RTWB 3S9EA 2RC7A 3ILTB 1WDNA 2I6EA 3H6WA 3U1OA 4MH5A 3MP6A 1M5EA 4KHZE 3VFJA 2ZYNA 3KZGA 1D9YA 3OO9A 3VLWA 2Y7PA 4ZS9A 1NKXA 4F3GA 1RKMA 1EZ9A 1LBCA 1LB8A 3V89B 4ZEBA 3VV5A 5L8DA 3K02A 4FIMA 4WEDA 3GBAA 4GOTA 3K6WA 4MLQA 2UVGA 2F36A 1FTJA 2XXTA 2OBGA 4WXJA 3HO7A 3JZJA 1NL5A 3EQ1A 2V3TA 2NXOA 4TOZA 1Y3NA 2G29A 3DM0A 3EHUA 5CMMA 3CRBA 5FTHA 2Y84A 1N0TA 1Y1MA 3IL1B 2E0SA 1XVXA 4L17A 1PC3A 4U2RA 1FQEA 1FQFA 2XXVA 5CMKA 1MXXA 3FXUA 4H5GA 4LZ7A 2XXXA 1SYHA 2DQVA 2QS3A 3H7MA 3I3VA 4N6PA 1LBBA 1MH4A 3KFMA 4OENA 4H6DA 3KN3A 2XXWA 3JYRA 4KYEA 2I4BA 3DLNA 3H06B 1VSOA 3K01A 4F1YA 4U23A 3K4UA 1IEJA 3EPEA 1B1HA 4HCWA 4X48A 3B7DA 5F1QA 5K2YA 3KN7A 5J1DA 1DPEA 3TTMA 3H4ZA 3PUXE 1I69A 1PBQA 3MJNA 2PT1A 3VVFA 4XIGQ 1HSJA 4G68A 3FJ7A 5KDTA 1B40A 1US4A 3FVOA 3PMWA 2UYEA 3E4RA 3E3KA 2DWHA 4OHNA 4NF4A 4PFTA 4XXUA 4Z7EA 4U21A 2DXYA 3T96B 1LB9A 5B70A 1MXWA 1B7UA 1URGA 1N7XA 1PB8A 2B3FA 2RF1A 2XXHA 5KDTB 2UVHA 1B6HA 1B1XA 1DTGA 1Y20A 2GRVA 1R1NA 4XKRA 2P1SA 3H3GA 4RJZA 4P0GA 4PETA 5BUUA 2F8DA 2P2AA 4TLMB 2Q2CA 3FUZA 2I49A 3USDA 5JTYB 2DP8A 1OVTA 2DS9A 1LGBC 4EQ7A 3CFLA 3PPPA 2Z22A 3MUQA 3M3LA 3SEVA 2O69A 1DPPA 1FQDA 4YKPA 1B7HA 1N7WA 4OQOA 3O2AA 1UTHA 1S9TA 3MQ9A 2AL4A 2ANJA 4X9TA 5CMBA 1MY1A 5EHSA 5H8FB 1QUIA 3LR1A 3CG1A 4IB2A 2X26A 1B3EA 1DTZA 5KCJA 1MPCA 1MDQA 2Q89A 4FORA 4F1VA 3R7XA 4ZECA 1US5A 2DWIA 1DOTA 1MXUA 4DE8A 4EQ9A 5ISUA 4EXLA 1A8FA 1POY1 2HZKA 3CFXA 3TELA 1YCJA 1MH3A 3N26A 4MLVA 3EHTA 3TTLA 2ZYKA 4YMAA 4XTCQ 3RPWA 5HPQA 5LOMA 3IAZA 1MQGA 3U94A 1BIYA 1I6BA 1PBPA 2O7UA 2ALUA 3K1MA 4KPTA 1QUJA 4R2FA 3U92A 3TMGA 3VE1B 3VVDA 3SEYA 4JWXA 2DVZA 3GXAA 1B46A 1B3FA 3IOVA 4JWYA 5L9MA 3TYHA 3MVWA 5CI5A 4IO3A 3G3GA 3PD8A 4O3BA 4PFUA 3VLUA 3LSXA 4FATA 2NOOA 1D3KA 3MP1A 3MZ1A 5M2VA 1LFIA 2YPNA 2YJPA 2IA4A 4POXA 3O66A 3CSGA 4KYDA 5I59A 2DXRA 1MY3A 5ITPA 1O64A 5JK4A 1LSTA 3GLBA 4YICA 1TXFA 4K3FA 4Q8RA 1MDP1 1GGGA 4ELOA 4IO2A 1NMUA 1JEVA 1MM7A 1SYIA 1TFAA 3CG3A 3G3FA 2KLFA 3K1NA 3MVXA 3QXMA 1QJMA 3OXNA 3BFUA 4IY5A 4YAHX 4GWOA 3TTRA 5DT6A 5EYFA 3VDFA 1ZBMA 1Y1ZA 4RK2A 3C32A 3RTFB 1LAGE 2CMOA 5I58A 4EQBA 4QFPA 4R6HA 4H65A 5L9SA 2H25A 1GR2A 2ONSA 3FASA 4QFLA 2FNCA 3SEWA 3L6GA 5H8NA 3O6GA 5DEXA 2PVUA 4KYSA 1A8EA 1P1UA 2F97A 3IB0A 3ZS6A 3OMBA 4ESWA 2OZZA 3UK4A 1NFTA 5I57B 1HSEA 2RC9A 3IX1A 4ZE9A 4BDOA 4ISUA 5DVFA 1LAHE 5B7DA 3K0VA 4IO6A 2QS1A 4NF6A 4Q0CA 1ANFA 1FCKA 2GH9A 3PUZE 2QRYA 4DZ1A 4OVJA 3TCGA 4BDRA 1AMFA 2REJA 2VP1A 1O7TA 1POTA 2VOZA 4QRZA 1H76A 2A5SA 3N6UA 4PQJA 2O51A 3A09A 4WKMA 3R6UA 3KJTA 3RGYA 4F3BA 2HEUA 5AA3A 3N94A 1BTJA 2XXYA 1VFEA 2DE2A 3C35A 3FIRA 3H03A 1QKAA 3QSLA 2OLBA 3THIA 3PPOA 2Z8EA 1URDA 1L5TA 3M8UA 1M5CA 2DWJA 3FGSA 4RY1A 2PX1A 4OZ9A 3T9XB 3TCFA 3TQLA 2VHAA 4PFYA 1OLAA 4U1ZA 1NNKA 4LP2B 1OIBA 1CB6A 1ZTYA 3FV1A 3MPLA 4E0XA 3O28A 3G3IA 4I1DA 1RYOA 3KOTA 2XXIA 5EHMA 4RA1A 4IY6A 4QSCA 2THIA 5CBSA 2XXPA 2I0BA 3Q27A 4POWA 1T0KA 1UTBB 3DP8A 2HZLA 2ZMBA 1MM6A 3TKDA 4H5FA 1MG1A 5H8QB 3PPQA 4IGTA 3MVZA 5ITOA 2BJJX 2Z23A 3AXFA 3Q28A 4X1DA 3IORA 3E9XA 3OOAA 1P1OA 4KFQA 4JSDA 4MBPA 5I2KA 3V83A 4DCXA 1H43A 4BDNA 1EU8A 3MC2A 3QIMA 2XHDA 4OFJA 5AA2D 4NWCA 5I57A 5I2KB 3LSWA 4FEDA 5CBRA 3B6TA 2QL3A 1NNTA 2OWTA 3N5LA 4I9DA 4NF4B 4EXKA 3MW0A 1JVYA 1Z7NE 4LVQA 2O6AA 2QMXA 3RNNA 4ELQA 3K2DA 3RN8A 2QJEA 3OSRA 1FW0A 4GIZA 2HQ0A 3KOSA 4N07A 4U22A 1MY4A 3M3FA 3TODA 5H8QA 2I3VA 1A55A 1A40A 4WEPA 5AE4A 2AL5A 3EF7A 3IB2A 4EF1A 1B9JA 4HS7A 4F29A 4NF6B 2PYYA 3K6UA 4RYAA 3DP4A 1JEUA 1O63A 3A3CA 1XC1A 3IJOB 3IOWA 3OSQA 5F7VA 4F18A 2QPQA 1OVBA 2RINA 4R75A 4YKIA 3O6IA 3RQTA 5TP9A 2O7IA 5KZTA 1LAXA 2H5YA 3FZVA 1NH7A 3O97A 5DEXB 4ZE8A 1SI0A 3SEUA 3UGWA 4DIGA 2REGA 2D5WA 3S2VA 5I56A 2OWSA 2IEEA 4AB6A 1FQCA 1FTMA 1P1NA 1SDXA 2X7QA 4M1VA 2O1LA 1IXHA 3R26A 1BKAA 4DXUA 5A5XB 2DWAA 2QSXA 1IXCA 2VGQA 3HHFA 3TDJA 4NEDA 1SQYA 3WAFA 4QSDA 5JEIA 4FE8A 1ZJLA 3GZGA 2F7AA 2HAVA 2XD2A 4ZZEA 5HBCA 1UQWA 1N84A 2F6GA 2ZYOA 4KQPA 4QSEA 3VXBA 4QFKA 5FHOA 4F22A 5KCJB 3S9MC 5CRYA 2M8CA 3PUWE 3N6TA 2A5TB 5CM6A 4KI0E 4GVOA 5H8HA 1SW5A 5AA1A 1TFDA 3C31A 4IO5A 2OCUA 2XD3A 1UTHB 4OXVA 4F31B 1EZPA 3G3HA 3OO8A 3PV0E 1P99A 2A5TA 1USYH 4NF5A 5DYHA 3GBBA 1JW1A 1P1WA 2F7BA 2OJTA 4BDMA 3PMVA 3A3UA 3MZBA 3JV9A 4OYVA 4R74A 2F35A 1M5FA 1UTBA 1FTOA 1II5A 4RPOA 1UIUA 5I84A 1JETA 1LFGA 2QS4A 4NE4A 4G77A 4ZZAA 3VVEA 2DSFA 2B3BA 2F7CA 2O1MA 4R6YA 3T22A 4U4XA 4ND9A 3O6HA 5I59B 1LCTA 5DVJA 2XX8A 1Z7ME 1MPDA 1N04A 1OMPA 1USYE 4GLIA 4OMBA 4YZZA 3UIFA 3P7IA 3HN0A 3Q25A 1PB7A 2GFEA 1D4NA 3OO7A 1UIVA 4OFLA 3TUSA 1FTKA 2Z8DA 4OESA 4R73A 1I6AA 1ZLQA 3IOTA 3SEXA 2XXQA 3VLVA 3MZ9A 3UN6A 1F9BA 3CSBA 3KEIA 4HCYA 2XX9A 3H6VA 1Q35A 1CE2A 1B7ZA 2Q2AA 2QS2A 4TLLB 5AA4B 4G8MA 3LSFB 5AA2B 2YLNA 4G8NA 1B32A 3PGFA 1MXVA 3VXCA 2I4CA 4F39A 1XT8A 1PEBA 1R9QA 2ZXTA 4NF8B 3PPNA 4QHQA 2DE3A 3PD9A 4ZEDA 2ONRA 4YMBA 3H6TA 3PMXA 1LCFA 1MQDA 3MVYA 4JDFA 3TZAA 4JB7A 3WAEA 2NWJA 4KD5A 4NF5B 1VE4A 4F19A 2QMWA 2R71A 4KCDA 4OERA 2V3UA 1QW0A 2RKMA 1EZOA 1AH5A 1B52A 4G2ZA 4NF8A 4JBZA 4E0WA 1AIVA 4JWOA 2Y7KA 1LFHA 3KGCA 4H8JA 3SERA 4RK9A 1PDAA 1M5BA 3FXRA 2PBWA 1GV8A 5IKBA 2DE4A 3HCQA 4MF3A 2GHBA 4YB7A 3SETA 3CIJA 3B6WA 3ECRA 4FECA 4XKNA 1ELJA 2DVCA 2H98A 4UA8A 3MAMA 4FJPA 4ZEIA 2AYSA 5JTYA 1DMBA 2R6GE 4ZDMA 5K2XA 1MQIA 4HTGA 1XVYA 3D4GA 4DDDA 4NTLA 1MY2A 1ZMGA 3FVGA 4HW8A 1YAEA 4IO4A 4OEVA 4QFOA 3TAJA 3FVNA 3QYTA 4EDPA 1KWHA 3UORA 4RNSA 4F1UA 5TU0A 3IO4A 3IOUA 2PMSA 1WODA 2V25A 5ICQA 4GL0A 4C1UA 1QKBA 4R9FA 2O84X 2R9JA 3LSLA 1Y4TA 3Q26A 1MXZA 4AQ4A 4AB5A 1SVXB 1ATGA 3S4UA 3T9VA 4BDQA 3D4CA 1B0HA 3LUYA 3MWBA 4EUOA 1IXIA 3OELA 4QF9A 3TCHA 4R9GA 1A7LA 1J1NA 1LAFE 2D3IA 1SD3A 1YTVA 4F3SA 3EN3A 3FATA 1B2HA 4H8IA 5IAIA 3IB1A 3HSTA 3QUFA 4F3PA 2RC8A 1URSA 4XKPA 5AA2A 3KN8A 4XKQA 4OEUA 4MFIA 3F11A 3FJMA 1HSLA 4YKKA 4PE5B 4OETA 4DLDA 3CR9A 1ZIUA 4PP0A 1GVCA 2VD3A 4IGRA 1VR5A 4O3AA 3FVKA 4YB5A 1IUDA 3E13X 4LUBA 4LONB 3KSJA 2XX7A 3ONMA 1AOVA 1IXGA 3HV1A 3ILUB 1B5HA 5AA4A 4YB6A 2ZYMA 1B3HA 4F2OA 2Y7IA 2I3WA 5CMCA 3ZKLA 1B3LA 1QVSA 3SDFA 4UACA 1ZKBA 1XHYA 2HFBA 2I58A 3IR1A 4Q5TA 4ELPA 5I56B 5L9OA 1OLCA 2GHAA 3KG2A 4U1OA 4U4SA 1MY0A 1A99A 1WVJA 3FV2A 3G7WA 4OFOA 4OWDA 1B3GA 1SW4A 1N3XA 1MQHA 1NH8A 2CZLA 2UVJA 3W9WA 1EH3A 2I48A 3G3JA 4YU0A 3L6HA 3ZKKA 1AL3A 5TPAB 3S9NC 1MRPA 1Y9UA 1SBPA 1B0LA 1MXYA 1I6QA 1FQBA 1JW5A 3PUVE 1VFDA 3PUYE 3W15C 1R6ZA 5I2NA 3MP8A 5FHNA 3U72A 2DOJA 3LC8A 1A54A 1JW4A 4I62A 3OO6A 3PPRA 1R9LA 1SW1A 3C34A 3IK6B 4GXAA 4GRKA 3UP9A 4NWDA 1BP5A 3KSXA 3I6VA 2F78A 3OENA 5DTBA 1S50A 1OQHA 4M4GA 1YPNA 1D9VA 4X1BA 5FTIA 1PB9A 2HCAA 3FD3A 4G4PA 3I5OA 4ONYA 2E1SA 4GFRA 4ECFA 3DELB 3K00A 3S9LC 3TEPA 2Y7WA 2Q9TA 1JVXA 5BWJA 4KR5A 1NNFA 1TWYA 1SW2A 1NNPA 3B6QA 3OEKA 2WKYA 4RXLA 3V5AA 2LAOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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