3O29A

Ligand-binding domain of glua2 (flip) ionotropic glutamate receptor in complex with an allosteric modulator
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
263
structure length
263
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
publication title A novel series of positive modulators of the AMPA receptor: discovery and structure based hit-to-lead studies.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 90
structure length 263
sequence length 263
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-07-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3o29A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3o29A02
1SYHA 1XHYA 2A5TA 3ZSFA 4R74A 2XX7A 2RF1A 1H76A 1LFGA 4EQBA 4QSEA 4LZ5A 5J1DA 1D4NA 4NMYA 2XX9A 1NNKA 3H06B 1AL3A 4OVJA 2DXRA 1JEVA 3C36A 2AL4A 4P0IA 3MJNA 3E9XA 1BKAA 4KQPA 3IOTA 3E4RA 1B3LA 1Y4CA 2Q2CA 5ICTA 1S9TA 3G3KA 3IL1B 1OLAA 4AB6A 4QFNA 4R75A 2OWTA 1MDQA 2O7IA 3PMXA 4OENA 4KYDA 4FE8A 3FUZA 1FQFA 3MZBA 4OERA 4EQ7A 3H4ZA 2E0SA 5JTYB 4YAHX 2X7QA 4NTLA 2Z8FA 1TXFA 2R9JA 4Z0IA 3ZKLA 2HAUA 3MWBA 1SW1A 1B58A 2V84A 4IGRA 1JNFA 3QK6A 1URGA 3SEWA 2NXOA 2A5SA 3JV9A 3PMVA 2ZXTA 4R2BA 4MLVA 2VGQA 1NFTA 1P1OA 3IJXB 3FXUA 4OMBA 2XXRA 4NF8A 3DP8A 1Z7NE 5I56B 3UORA 4LZ7A 2V93A 1B52A 4Q0CA 1R6ZA 2F97A 1EZPA 1BLFA 4EDPA 4U4XA 5KCJA 3H6VA 4LATA 1N04A 3UN6A 3O9PA 4YMBA 3SEXA 4H0WA 2GFEA 2OBGA 4FATA 4JSOA 1SW4A 3CSBA 1H3DA 3IB0A 5H8QA 1M5BA 1Z7ME 3HHFA 4QRZA 3C31A 3EHSA 1I6AA 4ESWA 4WEPA 4QSDA 4QF9A 1MH3A 3MPLA 1MXYA 4RJZA 3C9HA 1ATGA 1BP5A 3MAMA 3EHUA 3DELB 1GV8A 3V8XB 5KDTA 5DEXB 3MPKA 3RTFB 2D5WA 1N3WA 1SYIA 3EN3A 4NF6B 1FW0A 4F3BA 4H5GA 4GL8A 2X7PA 2I6EA 1URDA 3PU5A 4JBZA 4LUBA 5AA4A 3D4GA 1EZOA 3QAXA 1D9VA 1LFIA 3T9VA 1VR5A 3VLVA 2DWAA 4Z7EA 3ECRA 1VFEA 3TTRA 4JWOA 2V3QA 5ICQA 4G77A 5JK4A 5K2XA 3BBRA 3S2VA 3K1NA 3MQ9A 3CIJA 2PT1A 4F22A 4TLMB 3VFJA 1MG1A 3SESA 1SQYA 2PYYA 3QUJA 3KSJA 3G7WA 4F19A 2Y7IA 1MXZA 3H7MA 4XTCQ 2XXYA 1LAFE 3RPWA 2V3UA 4ND9A 1B32A 1OQHA 1LSTA 1MH4A 5I2NA 3RT6B 1OQGA 4ELPA 1TWYA 4RK9A 5F7VA 3H6UA 1USYH 2ABHA 3N94A 3FD3A 1MY4A 1LBCA 4OTEA 5AE4A 3K1PA 5TPAB 2I49A 2E1SA 2VHAA 3SKPA 2YPNA 4F29A 4F31B 1MQIA 5I58A 4QHQA 3TTMA 4L17A 4C1UA 3MZ1A 2ONKE 4F3GA 1S50A 3QYTA 5CM6A 3ONMA 4ZEKA 1B7HA 4BDLA 2PBWA 5DVIA 5H8NA 2GRVA 1FQDA 3OOAA 5H8HB 5DT6A 1IXHA 1B1XA 1NH7A 5A5XA 3SDFA 3U94A 3W9WA 1H43A 3CG3A 1B3HA 5I2KA 1LCFA 4KYEA 5M2VA 3IAZA 1R1NA 1XT8A 4HCWA 2ONSA 1CB6A 4DCXA 3O97A 4IO3A 2HCAA 5JEIA 4ZECA 1M5CA 1PB8A 1B05A 4BLAA 4QFOA 2QJEA 3OEKA 3LSXA 3VVFA 1MY3A 5I57B 3TEPA 2D21A 4POWA 2XD2A 3T96B 4F3SA 1DPPA 3ODBA 1UIVA 2Z8DA 3TFLA 5DVJA 5FHMA 2O51A 2F36A 1TFAA 2R71A 4ELRA 3K02A 4KCDA 3VXCA 3IK6B 3G3GA 1MPDA 2A5TB 2P0SA 1HSLA 3MP8A 4F18A 1MQGA 4GIZA 4X1DA 1ZLQA 4GVOA 1VFDA 1XS5A 1XC1A 4FJPA 2CZLA 3PMWA 4IO7A 4E0WA 3HPIA 3UK4A 4EXKA 3RLFE 3KG2A 4ZZEA 3MVZA 3HO7A 2UXAA 3U93A 4RXLA 1B3FA 1NL5A 1YPNA 3TMGA 5IAIA 3TTLA 1AIVA 3O6HA 3Q26A 1LLSA 5AA2B 4F2OA 5ITOA 5HBCA 2QRYA 4OFLA 3PUWE 4HS7A 3T9XB 2I3VA 2UYFA 3DM0A 2NVUB 1MY0A 4KI0E 4O3CA 3FZVA 3T93B 5DVFA 2DVCA 2XXQA 4OHNA 3KSXA 2QPQA 4NF5A 4G8NA 1MQDA 4MFIA 1WODA 3TELA 3PD8A 3ILUB 3L6HA 5L9OA 3B6TA 2REGA 4ONYA 4LQ2A 5L9MA 1MM7A 5TP9A 4GLIA 2NWJA 1Y1ZA 2XXXA 5AA1A 2PMSA 4YKIA 4U21A 5FTIA 2M8CA 4YICA 3HN0A 2BJJX 4U1ZA 2DS9A 3I5OA 3LUYA 5KCJB 1TFDA 2F34A 1B7UA 1QULA 3K6UA 5ITPA 3VV5A 3KN7A 4IO4A 3MBPA 4KR5A 4G68A 2XXPA 3QSLA 3CVGA 2FYIA 3UIFA 3K6VA 4JDFA 2F8DA 2ALUA 3A3UA 4TOZA 4PETA 1N7XA 4U2RA 1WDNA 1FQAA 1ANFA 2F6PA 4I62A 1D3KA 3K1MA 1UTHB 3PPRA 4LP2B 5KDTB 4EQ9A 4ZS9A 3PUXE 1B51A 4F1YA 4R6HA 2I58A 4IO6A 1KWHA 4H6DA 2PX1A 4UACA 2DVZA 4BDNA 2XXVA 4QFKA 3TDJA 4GQOA 3LR1A 3S4UA 3V83A 3BKIB 4R9GA 3OSQA 1I6QA 3HHGA 3LC8A 2UVJA 3TCHA 4U1OA 2ZYNA 4ZEIA 4DE8A 1MXUA 1TT1A 5B70A 1MPBA 1SBPA 2OLBA 1LBBA 4OETA 4THIA 1AOVA 3G3FA 2ZYOA 1QVSA 3WAFA 4JXIA 2ZYKA 4RPNA 2P2AA 1Y1MA 3DP6A 1Y3NA 5I2NB 3OXNA 2H99A 3K01A 4QFLA 4RA1A 1YTVA 3A09A 5H8FB 4R9FA 4GXAA 4IGTA 4DCYA 3TYHA 3S9MC 3IOUA 1IXCA 1QUIA 4KD5A 3G3IA 3OEMA 3IOVA 3EQ1A 5FHNA 1P1NA 3VLWA 3C32A 4NF4A 1Y3PA 4BDOA 1SW2A 2HXWA 4MBPA 3PV0E 2G93A 4HCYA 4F1VA 3O6GA 2IA4A 4H8IA 1FQBA 2HAVA 1M5FA 1OMPA 1FTJA 1IZ1A 3KGCA 4OWDA 5I59B 5F1QA 3E13X 5HM4B 5H8NB 3W9VA 2Z23A 1MXXA 2Y84A 4MF3A 1B7ZA 2Z22A 4DDDA 1LAHE 3QIMA 3E3KA 4XKRA 1PEBA 3PUVE 4EXLA 5I2KB 2ZMBA 3O29A 4NWCA 5LOMA 1N84A 4ELOA 3T66A 1GTKA 3KN8A 5EYFA 4GL0A 4M4GA 1IQ7A 4IY6A 3KOTA 4IB2A 2AYSA 3TCGA 3FVKA 3OO7A 2DWJA 4Q30B 3PPQA 5ISUA 5JTYA 3BFTA 1FTMA 3S9NC 3EPEA 1A54A 3VXBA 3SERA 2O69A 1N76A 2DXYA 1B4HA 1MY2A 1JETA 2LAOA 2F6GA 3GBAA 4OEUA 2XD3A 1B1HA 2Y7WA 1NNTA 4ECFA 2FNCA 1PBQA 1PC3A 1RKMA 1LGBC 4PFUA 2ZNTA 5H8SA 3TAJA 5I56A 5IKBA 2QMWA 1Y20A 1NH8A 3N26A 4ZEBA 3KEIA 1A7LA 2DP8A 3RGYA 2VD3A 2VP1A 4U23A 1UTBB 3MVXA 1JVYA 3K6WA 1OIBA 4TQUQ 3KOSA 3RY3A 3I6VA 1B5IA 3FIRA 3U8QA 1N0TA 1IXIA 1LAXA 1B3GA 2Q9TA 3RT8A 3IO4A 1PDAA 2KLFA 2DOJA 2QSXA 3CFZA 4ZEFA 3VDFA 4OZ9A 2ZNSA 1B46A 1DPEA 1DTGA 3Q27A 4HTGA 3L6GA 4N07A 2DE3A 3UA8A 4G8HA 5DEXA 3C35A 1P99A 3JYRA 3SEUA 4YMAA 3TTNA 5CRYA 3CI8A 4NF6A 1FCKA 2I48A 4AQ4A 4KCCA 3PPNA 2O1LA 1URSA 1EZ9A 4ZDMA 1P1WA 2QS2A 1ELJA 4K3FA 3GZGA 1SI1A 1II5A 3T9UA 4ISUA 4IO5A 3GBBA 2YJPA 2Y7RA 5CBRA 1FQEA 2F78A 2AIXA 2ONRA 4BDRA 3CFXA 1Y3QA 3M3KA 3MP6A 5TP9B 3IB2A 3SEYA 3IJOB 3FVNA 2Y7KA 1ZJLA 3IB1A 2Q88A 3TCFA 1POY1 4DLDA 2O1MA 3O6IA 4U4SA 2H9BA 1Y9UA 3TKDA 1BIYA 5DTBA 4LZ8A 4OEVA 1F9BA 3VLUA 4R6KA 4JB7A 4LVQA 2YLNA 3IORA 1JEUA 1QJMA 4TLLB 2I4CA 2R6GE 2UVGA 3FV1A 1IXGA 4GXSB 1Q1KA 3DLNA 1B6HA 1JW1A 1AH5A 1MY1A 1ZBMA 3DP4A 2XXHA 3OO6A 1JQFA 2P1SA 4AB5A 1HSEA 2X26A 4DXCA 1NNFA 2UYEA 3KFMA 4YKKA 3LBSA 4ELQA 1QKAA 5H8HA 1OVBA 4RY1A 3V89B 3CRBA 4YKJA 3THIA 3VVEA 3FXQA 4RNSA 5CI5A 4O3AA 1I6BA 3LSWA 4H67A 3RNNA 1A8FA 2THIA 4H1XA 3PPPA 1MXWA 4NEDA 5CMCA 2CMOA 3MZ9A 4G4PA 3C34A 4X9TA 3C33A 2OK2A 2IEEA 5CMBA 3PUZE 3TQWA 3TODA 4H8JA 1ZU0A 4NF8B 3AXFA 3FGSA 1SI0A 2FA7A 1S7YA 3V5AA 1JW5A 3CR9A 2XHDA 2RCBA 1J1NA 5FHOA 3D4CA 5I57A 3PPOA 1VSOA 3MVYA 3K6XA 1YCJA 1N3XA 2OWSA 4KHZE 4P11A 3M3FA 2B3BA 5DYHA 3K2DA 2O7UA 4PFWA 5H8QB 3LSLA 1DSNA 1ZIUA 1O7TA 2ZNUA 1B0LA 1DOTA 1MQHA 1B3EA 4C1TA 2OJTA 1LFHA 4I9DA 4FAJA 1USYE 5CMMA 2H5YA 3T9HB 4OQOA 1BTJA 3TTKA 3RN8A 4ZE9A 3IOWA 1EU8A 4RYAA 3QXMA 1LAGE 2O6AA 4R73A 3PD9A 3IX1A 4PQJA 5AA4B 3HSTA 1P1UA 4DXUA 4OESA 1IITA 3FATA 2F7AA 5AA2A 4Q5TA 4PP0A 1B40A 2DE2A 4E0XA 2H4IA 3RQTA 1PBPA 3R6UA 4YB5A 4R6YA 1XVXA 2I3WA 4I1DA 2VD2A 3ILTB 3U92A 2QL3A 3O28A 5FTHA 4M1VA 3TPAA 5EHSA 3USDA 3P7IA 5AA2D 1MRPA 1O63A 4OXVA 2OZZA 4GF8A 3VE1B 1VE4A 4C0RA 2RC9A 1JVXA 3B6WA 4JSDA 5AA3A 5B7DA 2OCUA 3B6QA 2UVIA 3F11A 1NKXA 4PFTA 1CE2A 3C4MA 4EUOA 4FORA 3MUQA 4IY5A 4DZ1A 5CC2A 3O2AA 4WXJA 1LB9A 2W7YA 4F1UA 5BUUA 1MS7A 4XIGQ 5I84A 4YB7A 3I3VA 5I58B 4XKNA 3MP1A 3QUFA 4POXA 1XOCA 1OVTA 3ZKKA 1FTLA 1DTZA 2VOZA 3A3CA 1QW0A 1FTKA 2DYXA 4ZZAA 4R2FA 4YB6A 3W15C 2Q89A 2O84X 4G8MA 4PFYA 4MH5A 4EF2A 3GLBA 5CBSA 3VVDA 4ZE8A 2NUVA 3OD7A 3PGFA 4F3PA 5A5XB 1LB8A 1ZMGA 2Q8JA 4ZEDA 3RTWB 4LA9A 3SETA 3T22A 1UTHA 4XXUA 3TQLA 3H6TA 4FEDA 2ESNA 3FASA 4DIGA 2D3IA 1RYOA 1IIWA 1B5HA 4OFJA 4NE4A 2V25A 3N6TA 2RKMA 3UP9A 1B9JA 4YKPA 4X48A 3FJGA 3IO6A 1SVXB 1HSJA 1RYXA 3M8UA 1SD3A 1ZKBA 2AL5A 1EH3A 2ANJA 1D9YA 3R7XA 4LQ5A 3Q29A 4QSCA 3MC2A 4XKPA 2Q2AA 1L5TA 1AMFA 3FXRA 2HZKA 3BFUA 1GR2A 4F39A 3KJTA 2B65A 4O3BA 2O68A 3KJ7A 1H45A 2QS1A 3MVWA 1A40A 1A99A 1B5JA 4N6PA 1N7WA 3H03A 2DQVA 5KZTA 1I69A 5H8FA 2XXWA 1UIUA 2GH9A 3KBRA 2UVHA 3OSRA 2DE4A 4I8CA 4ESXA 4N13A 3OELA 3S9EA 2XXUA 2HZLA 5L8DA 2HQ0A 1IUDA 3H6WA 1QKBA 3U72A 2F7BA 5CMKA 1PB7A 4WKMA 3KZGA 3Q28A 2QMXA 4MLQA 2DWIA 3HV1A 1NNPA 5EHMA 4FEBA 3CG1A 1MQJA 3FVOA 2PVUA 4G68C 2GHBA 4KPTA 3WAEA 2I0CA 5I59A 3TUSA 3GXAA 2H25A 1ZTYA 3OO8A 4G2ZA 1Y4TA 1NMUA 4YU0A 4LONB 3O66A 2QS4A 1T0KA 3TZAA 4JWXA 4HW8A 4NF5B 3G3JA 3JZJA 2DWHA 1FTOA 3RUMA 1QUJA 2REJA 2Y7PA 2HFBA 3M3LA 1US4A 4KFQA 4KYSA 1OLCA 2H98A 1US5A 2XXTA 2HEUA 4JWYA 4BDQA 3MW0A 1SW5A 1MDP1 4P0GA 4RK2A 2GHAA 1A8EA 1Q35A 3SEVA 3N5LA 3S9LC 4FECA 5TU0A 1B2HA 3PUYE 1M5DA 1SDXA 3Q25A 3EF7A 1R9QA 2ZYMA 4G68B 1LCTA 1A55A 2I4BA 4F2QA 3G3HA 1H44A 2RINA 2RCAA 2XX8A 2RC7A 5TPAA 1B4ZA 3K4UA 5BWJA 1MXVA 4H5FA 3K0VA 3CFLA 3FJMA 4FIMA 3FVGA 3N6UA 3H3GA 4U22A 3KN3A 4WEDA 3FV2A 5L9SA 1UTBA 4GD5A 3IR1A 4IO2A 4GFRA 3EHTA 4PE5B 4H65A 1IEJA 4NWDA 4DXBA 2F7CA 4QFPA 1JW4A 2F5XA 3LSFB 3R26A 4GWOA 4RPOA 2RC8A 3UGWA 3OO9A 3OMBA 1DMBA 4X1BA 3ZS6A 2NOOA 2WKYA 2PT2A 2Z8EA 5ELVA 3K00A 3OENA 4R72A 4OYVA 1XVYA 4YZZA 5K2YA 2B3FA 3U1OA 1B0HA 1MM6A 1M5EA 1UQWA 1P1QA 3B7DA 3CSGA 3HCQA 1WVJA 2I0BA 2XXIA 2F35A 2G29A 4EF1A 1GGGA 1PB9A 1R9LA 4XKQA 2DSFA 1POTA 1GVCA 4GOTA 4BDMA 1YAEA 5HPQA 1FQCA 4OFOA 2V3TA 4Q8RA 3FJ7A 1MPCA 4UA8A 1QUKA 2QS3A 4GRKA 4NF4B 1O64A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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