3GZGA

Crystal structure of the xanthomonas axonopodis pv. citri molybdate-binding protein (moda) mutant (k127s)
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
sequence length
232
structure length
232
Chain Sequence
TAPVTVFAAASLKESMDEAATAYEKATGTPVRVSYAASSALARQIEQGAPADVFLSADLEWMDYLQQHGLVLPAQRHNLLGNTLVLVAPASSKLRVDPRAPGAIAKALGENGRLAVGQTASVPAGSYAAAALRKLGQWDSVSNRLAESESVRAALMLVSRGEAPLGIVYGSDARADAKVRVVATFPDDSHDAIVYPVAALKNSNNPATAAFVSWLGSKPAKAIFARRGFSLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Metal binding protein
source organism Xanthomonas axonopodis pv. citri
publication title Crystal structure of the Xanthomonas axonopodis pv. citri molybdate-binding protein (ModA) mutant (K127S)
rcsb
molecule keywords Molybdate-binding periplasmic protein; permease
total genus 72
structure length 232
sequence length 232
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-04-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3gzgA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3gzgA02
1FW0A 1BTJA 1NFTA 2XXIA 3VDFA 3PMWA 3IOVA 2Z8EA 1IXCA 2PMSA 1HSEA 2Q2AA 3FV1A 3TTKA 2Y7WA 3KN3A 3UK4A 3RT6B 2XXYA 4RK2A 5H8FA 3VE1B 1VFEA 4FE8A 2Q9TA 1LBCA 3H3GA 4RNSA 4H8JA 4IY6A 3SEYA 3LC8A 1ZMGA 2VP1A 3W15C 3KGCA 3GXAA 1D9VA 4XKPA 3VVFA 3FXQA 3LSFB 1B6HA 2W7YA 3LR1A 3GBBA 1TFAA 3EHTA 3IX1A 2ZYMA 5HPQA 1MXYA 1TT1A 4YMAA 2DYXA 4NF4B 2A5TB 1UIUA 3JV9A 4OMBA 3TUSA 4XTCQ 4HW8A 2I0BA 4FAJA 3FUZA 2X7PA 2ALUA 4OQOA 1R9QA 3RY3A 1B1HA 3K1MA 3OMBA 2DOJA 4KYEA 5LOMA 4EF2A 5L9MA 4GLIA 1QJMA 1H45A 4BDOA 1MRPA 4POWA 1URGA 3VFJA 3FD3A 1IEJA 3A09A 2V93A 1B52A 1WODA 2NUVA 3H6WA 2H25A 5JTYB 3DLNA 3Q28A 1B4HA 4YAHX 3MZBA 4AQ4A 1S50A 1R9LA 4PFYA 1MXZA 5A5XA 2ZYNA 1JVXA 2PVUA 3G3GA 3LSWA 4DDDA 3MAMA 4WKMA 4KYDA 5I57B 1O64A 3T9UA 2OBGA 1MY2A 3M3FA 5CM6A 1JW5A 1SQYA 2UVJA 2YJPA 1FQCA 2RF1A 4DXCA 4JWXA 1MDP1 3FXUA 3KOTA 1A40A 2Y7RA 4X1BA 3CG3A 1CE2A 1IXHA 4EQ9A 3S9MC 2CMOA 2QPQA 3ZS6A 5I59B 2Z23A 3TMGA 3A3CA 4FATA 4TLLB 4GXAA 3BKIB 2XXPA 1B7UA 3O28A 1QULA 2AYSA 3B6TA 3SEVA 3MW0A 3MVWA 4DZ1A 2G29A 4JB7A 1VSOA 1QVSA 3FJ7A 3PMVA 3BFUA 2PYYA 1UQWA 3FGSA 5I2NA 4KCDA 3RQTA 3SERA 1B3EA 4G68B 1B1XA 5CMMA 2I49A 2PT1A 1R1NA 3LSXA 2ZXTA 1N7XA 2RCAA 2M8CA 4XIGQ 3DP6A 2ONRA 4Q8RA 3QSLA 3QYTA 3EHSA 3VXCA 3CFLA 4LA9A 1IUDA 3ODBA 4GL0A 3N94A 1PB7A 4OETA 2DWHA 5I56A 4GL8A 3C35A 2XX9A 1YAEA 1OVBA 1WVJA 3HHFA 5J1DA 1P1OA 1LBBA 4PFUA 1II5A 1NNPA 1H3DA 2REJA 4YZZA 1POTA 1I6QA 1D9YA 3PPOA 3K2DA 2QJEA 2DE4A 2NVUB 2V3TA 3IR1A 1AH5A 4GIZA 1QUKA 4BDLA 1MH3A 1MXWA 3CR9A 2Z8DA 1MS7A 2CZLA 4U4XA 2FNCA 1RYXA 4ESWA 1SYIA 2HCAA 4H6DA 2HXWA 3K6VA 1R6ZA 1PDAA 4G2ZA 1PBQA 3TELA 1IXIA 3MZ9A 3N6UA 4XKQA 1MM6A 3U8QA 3E13X 2DSFA 5TPAB 4IGTA 2XXRA 4Q5TA 2O7UA 3PGFA 4MH5A 4O3AA 5KCJB 3UGWA 5IAIA 3H7MA 1H43A 5F7VA 1VR5A 1P1NA 1Y4CA 2ONSA 1ZKBA 5DVIA 3QUJA 1PEBA 2KLFA 4H1XA 2V84A 2O1LA 1IZ1A 4LQ2A 5DTBA 1F9BA 3MBPA 2VGQA 1FQBA 1N84A 1N0TA 4OERA 3D4CA 4P0GA 1Y20A 2DE3A 3VLUA 1B05A 4ELQA 2P2AA 1MY1A 4GOTA 2QRYA 4LP2B 4TQUQ 4H0WA 3TTRA 1Z7NE 3QUFA 1NMUA 5EHSA 1D4NA 4YB5A 5K2YA 4HTGA 4DXBA 3TZAA 4ZS9A 1DTZA 1UTHA 4Q30B 5I2KA 3ZKLA 1LB8A 1GGGA 5CBRA 2RC8A 3N6TA 3UP9A 4H5FA 4NWDA 3QK6A 1MQGA 2QSXA 1B2HA 5ITPA 4PQJA 4WEPA 2O84X 3TTLA 4YKKA 3S4UA 3TDJA 1M5FA 4QSCA 4U1OA 4H5GA 1OQGA 3KN7A 3VXBA 4DIGA 5ICTA 3OENA 2OWSA 5EYFA 4QHQA 4EXKA 4ESXA 5DT6A 2VOZA 1FTOA 1MG1A 3I5OA 4KCCA 2B3BA 2H98A 4HCYA 3IB2A 1FQFA 5B7DA 1UTBB 1XC1A 3K1PA 3TYHA 4R6YA 2AL5A 2NWJA 2WKYA 4QFLA 3EHUA 2X7QA 3TKDA 3KOSA 1NNTA 4ONYA 4YMBA 3FJGA 1FCKA 2QS2A 4ELPA 1OLAA 3T22A 1BKAA 1SW2A 2F5XA 1I6BA 3FASA 2ZNUA 5DYHA 2LAOA 3O6HA 1JW1A 1N7WA 2THIA 2Z8FA 2A5SA 1B5IA 1LFIA 2RINA 3CFZA 3P7IA 3FZVA 1SW5A 1PB8A 3MUQA 5CRYA 4KR5A 1QKAA 4R73A 3T96B 1ZJLA 1B7HA 3U93A 1FTLA 4U22A 3SESA 1WDNA 1MH4A 4ZEBA 4C0RA 1MY4A 3OEKA 3IL1B 1OLCA 1RYOA 4Q0CA 1EH3A 1YTVA 5TP9B 2RC7A 4FORA 2ESNA 5JTYA 5I58A 1A7LA 1N76A 5FHMA 4IO5A 3R6UA 1JVYA 4YICA 3USDA 3Q26A 2QMXA 3MP6A 2F7BA 1OVTA 4U1ZA 4GXSB 3U94A 2F8DA 4M4GA 1SYHA 4OEVA 3EF7A 4I62A 5I57A 1BLFA 4KD5A 1LLSA 3B6QA 4BDMA 5H8SA 3HPIA 4GRKA 5L9OA 1Y3QA 3PV0E 4QFKA 3TCHA 1EZOA 3M8UA 4GVOA 4R6KA 1B46A 3IJOB 5ICQA 3AXFA 1XHYA 3H6TA 5I59A 1T0KA 1B0LA 2HQ0A 4KYSA 1B3FA 2XXXA 4OWDA 1MY3A 2OCUA 2UVIA 4OHNA 3G7WA 3MWBA 1XVXA 3DELB 2H9BA 3FIRA 1AMFA 5M2VA 3TEPA 4H67A 3TAJA 4F29A 3MVZA 2OZZA 3WAEA 3R26A 4OFLA 2Z22A 3RUMA 4PFTA 3SKPA 1OQHA 2D21A 1AIVA 5H8FB 2Q88A 1HSJA 1EZPA 1HSLA 2UVHA 5AA1A 2VD3A 2DWJA 2I4CA 3PPQA 5FHNA 3HSTA 1P99A 3VV5A 4X9TA 3CG1A 4PE5B 1ZBMA 3W9WA 4C1TA 1NH7A 3JYRA 4C1UA 3VLVA 4LATA 2ABHA 1ATGA 3CVGA 3H6UA 3BFTA 2XX8A 3CFXA 1KWHA 1US5A 1FQDA 4MF3A 3IOTA 4OESA 4MLQA 3Q25A 3C34A 3Q27A 4LQ5A 4QF9A 4U4SA 4YKPA 4JDFA 5JK4A 3U92A 3BBRA 3UN6A 5AE4A 5DEXA 4ZECA 3O29A 4YKIA 4F2QA 1LFGA 1Y3NA 4I8CA 2P0SA 4IB2A 1CB6A 5HBCA 4L17A 1P1QA 1B58A 2O68A 4BDRA 4ZZAA 2O7IA 5JEIA 3RT8A 3K02A 4N13A 1BP5A 3C9HA 3MC2A 5CI5A 1PB9A 3T66A 3PUYE 4I9DA 4DLDA 3OXNA 4ZEKA 3B7DA 1GTKA 1ELJA 2F7AA 3HO7A 3V83A 2F36A 2D3IA 2R9JA 4KPTA 3M3LA 2ZNTA 3OOAA 1DOTA 1A99A 3OSQA 5H8HA 1Y4TA 1M5EA 3CRBA 3TPAA 1I69A 3WAFA 4R2FA 4KHZE 1FTMA 2GH9A 4EDPA 1MQIA 2Y7PA 2B3FA 3MP1A 4JXIA 1URSA 3S9LC 4R74A 3CI8A 3D4GA 1JEVA 1ZTYA 3KBRA 4POXA 4R72A 3KG2A 4RPNA 3K0VA 4F3BA 1OIBA 4RY1A 1B3GA 3VVEA 5AA4B 5I84A 3PUWE 4NF6A 4OFJA 4ZEDA 2F35A 1B3HA 3L6HA 3KN8A 1Y1MA 1SI0A 4RK9A 1EU8A 3TQLA 1MXVA 4NF5A 1J1NA 5B70A 3U72A 5I2NB 5AA2A 1ZLQA 4QFNA 2HAVA 1LAXA 2E0SA 3KZGA 2BJJX 3RTFB 4R75A 4RYAA 4F1YA 1IIWA 4JSOA 3O2AA 5HM4B 4DCXA 4ECFA 2DWIA 3TFLA 3THIA 3T9VA 1MDQA 4RA1A 4QSDA 2QS3A 5H8QA 1S7YA 4I1DA 4E0WA 2DWAA 4NF8A 3N5LA 3V89B 2Q2CA 5BUUA 4X48A 5CMCA 3DM0A 2FYIA 3JZJA 5I56B 3PU5A 4G8HA 3V5AA 3K1NA 4NMYA 4EQBA 1H44A 2UXAA 4QSEA 1A8FA 2DQVA 3UA8A 3C33A 3Q29A 4EQ7A 2FA7A 4F1VA 4RJZA 1M5BA 1O7TA 3E4RA 3S2VA 4LONB 2X26A 3T9XB 4NTLA 3SEXA 2PBWA 2GHBA 1MQJA 2UYEA 4GFRA 3RLFE 1QW0A 2D5WA 2XXTA 3IJXB 3K6UA 4OTEA 5EHMA 1YPNA 3QAXA 1Q35A 2O6AA 1S9TA 1A54A 2DXYA 4LUBA 1SI1A 4NWCA 1Y1ZA 4RPOA 1TXFA 1Y9UA 2F34A 1IXGA 1L5TA 3VVDA 3K01A 1GR2A 2I4BA 1DPEA 1XS5A 1P1WA 1Y3PA 3B6WA 2I3WA 1IITA 4OXVA 1M5CA 3K6XA 2Q89A 2HAUA 2QMWA 4JSDA 3KEIA 3SETA 2ANJA 3IO4A 3G3HA 3N26A 2ZYOA 4F3PA 1DPPA 4F22A 2V3UA 1B5HA 5DVFA 4XKNA 2V3QA 1IQ7A 5FTIA 1SW1A 5BWJA 3G3IA 1UTHB 4WXJA 5I2KB 3UORA 3MVXA 3U1OA 3PPPA 1ZU0A 2HFBA 3OSRA 4NF4A 2A5TA 4F1UA 1XVYA 3FATA 3RN8A 5CC2A 4UA8A 4UACA 2R6GE 2XX7A 3FVGA 2GRVA 1MXUA 3RNNA 5AA2D 1SBPA 3VLWA 4ZE9A 4QRZA 4PETA 1MY0A 1N3XA 3DP8A 1ANFA 1OMPA 2F6PA 4XXUA 4ZZEA 5H8NB 1QUJA 1MPBA 4OZ9A 3KJ7A 4F39A 4N07A 4EUOA 3KSJA 3R7XA 3HN0A 1MPCA 1XOCA 1JQFA 2NXOA 4YKJA 2OK2A 3UIFA 3CSGA 1JW4A 5TU0A 3OO6A 1B40A 3PD9A 3EPEA 3O6IA 3TCGA 4E0XA 1MQHA 2UYFA 3LSLA 3SDFA 2XXHA 3MPKA 4THIA 1USYH 2XXQA 3A3UA 4BDNA 3C32A 4YU0A 4OEUA 3OEMA 4F3SA 3C36A 3MQ9A 3K4UA 2HEUA 3RTWB 5F1QA 3C4MA 2ZYKA 1SW4A 3K00A 2XXWA 2Y7KA 1Z7ME 3TTMA 3M3KA 1Q1KA 5KDTB 3TCFA 4IY5A 3RPWA 3SEWA 4QFOA 4YB6A 1VE4A 4KI0E 2H4IA 3ZSFA 1LCFA 2GHAA 3I6VA 1LSTA 4ZE8A 1ZIUA 1B5JA 3F11A 3C31A 3KFMA 4G8MA 1UIVA 2XHDA 3V8XB 4IGRA 2I58A 4FECA 3TODA 2Y84A 1N04A 3OO9A 1LFHA 3HHGA 2OLBA 4G68A 4IO3A 5CMBA 2XD3A 3IORA 2G93A 5L8DA 2XXVA 4ZDMA 3OELA 4ZEFA 5I58B 2O51A 3ECRA 1TWYA 4FEBA 4MLVA 2IA4A 4R6HA 5FTHA 3O97A 4GQOA 1B51A 1PBPA 2QL3A 3FV2A 1MQDA 1A55A 3LBSA 2XXUA 3MPLA 3CSBA 3IB0A 1TFDA 1NKXA 4GD5A 3S9NC 4F19A 3KSXA 4M1VA 3W9VA 1JETA 2F7CA 4R9GA 4OVJA 2VHAA 4U23A 3FVNA 1LB9A 2AL4A 4ZEIA 4ND9A 1AL3A 1PC3A 5FHOA 3T93B 1MXXA 4X1DA 4ELRA 4N6PA 1QKBA 5AA4A 4IO2A 2QS1A 5ELVA 1FTKA 4AB5A 2YPNA 1B3LA 3L6GA 4H8IA 3IK6B 2IEEA 3ILTB 4TOZA 5TPAA 1B7ZA 4U21A 5A5XB 3S9EA 1I6AA 4F18A 5KCJA 4G4PA 3EQ1A 5K2XA 4FJPA 4Z7EA 4YB7A 4RXLA 2RKMA 3LUYA 4P0IA 4JBZA 4IO4A 3SEUA 1LGBC 1JNFA 1FQAA 3PD8A 1P1UA 1GV8A 3FVKA 2PX1A 1SDXA 3MP8A 4QFPA 1DTGA 3HV1A 1URDA 4BLAA 1NL5A 5CBSA 2ONKE 4XKRA 3GZGA 1FQEA 4GF8A 3MVYA 4H65A 2UVGA 2Y7IA 4OYVA 1BIYA 3PUXE 4LZ7A 2QS4A 3ILUB 4F2OA 1DSNA 1N3WA 5DEXB 3FXRA 5ISUA 3H03A 3O6GA 3EN3A 4IO6A 4LZ8A 2V25A 3TTNA 3E9XA 2XD2A 2O69A 1H76A 1LCTA 2I0CA 5L9SA 2PT2A 2R71A 3MJNA 4LZ5A 3ZKKA 2F97A 3OO7A 3IOUA 3IAZA 1USYE 2I6EA 4G68C 2NOOA 3I3VA 3IB1A 4DXUA 2Q8JA 1NNFA 3K6WA 1UTBA 2DE2A 3PPRA 2RC9A 4AB6A 3FJMA 2ZMBA 4MBPA 3PUVE 2F78A 4IO7A 3HCQA 4LVQA 2E1SA 2F6GA 4BDQA 3OD7A 3PPNA 1DMBA 1NH8A 4DCYA 4OFOA 4WEDA 4HCWA 1B32A 3DP4A 3G3KA 4KQPA 2ZNSA 4O3CA 1O63A 2OWTA 2O1MA 3G3JA 1SVXB 3T9HB 5H8HB 4FEDA 3H6VA 4NEDA 4F3GA 4R9FA 1RKMA 2H5YA 4MFIA 1LAHE 2RCBA 5CMKA 3GLBA 1MM7A 4JWOA 2DXRA 4PFWA 1A8EA 4ELOA 2HZKA 5AA3A 4ISUA 2VD2A 3PMXA 4EXLA 1B9JA 2I48A 2DVCA 4NF6B 1QUIA 4JWYA 1AOVA 5DVJA 1LAGE 4KFQA 1LAFE 1US4A 3OO8A 4O3BA 5IKBA 1XT8A 3GBAA 1POY1 3IO6A 4NF5B 2I3VA 3ONMA 5H8NA 3KJTA 5AA2B 5KZTA 4Z0IA 3PUZE 1YCJA 1JEUA 5TP9A 1GVCA 3E3KA 2OJTA 1B0HA 3MZ1A 3IOWA 3QIMA 4HS7A 1SD3A 4G8NA 4NE4A 5H8QB 1B4ZA 2DP8A 5ITOA 2DS9A 4NF8B 3H4ZA 2HZLA 2B65A 4DE8A 1FTJA 1NNKA 4FIMA 4TLMB 4GWOA 1D3KA 4R2BA 4P11A 4K3FA 3CIJA 1EZ9A 3H06B 2GFEA 2AIXA 2P1SA 2H99A 4OENA 3G3FA 1MPDA 2YLNA 3QXMA 4PP0A 2REGA 3O66A 3O9PA 3TQWA 4U2RA 5KDTA 1M5DA 1VFDA 4EF1A 3FVOA 4G77A 3RGYA 4F31B 2DVZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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