1URSA

X-ray structures of the maltose-maltodextrin binding protein of the thermoacidophilic bacterium alicyclobacillus acidocaldarius
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
366
structure length
366
Chain Sequence
QTITVWSWQTGPELQDVKQIAAQWAKAHGDKVIVVDQSSNPKGFQFYATAARTGKGPDVVFGMPHDNNGVFAEEGLMAPVPSGVLNTGLYAPNTIDAIKVNGTMYSVPVSVQVAAIYYNKKLVPQPPQTWAEFVKDANAHGFMYDQANLYFDYAIIGGYGGYVFKDNNGTLDPNNIGLDTPGAVQAYTLMRDMVSKYHWMTPSTNGSIAKAEFLAGKIGMYVSGPWDTADIEKAKIDFGVTPWPTLPNGKHATPFLGVITAFVNKESKTQAADWSLVQALTSAQAQQMYFRDSQQIPALLSVQRSSAVQSSPTFKAFVEQLRYAVPMPNIPQMQAVWQAMSILQNIIAGKVSPEQGAKDFVQNIQK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Maltose-binding protein
molecule keywords MALTOSE-BINDING PROTEIN
publication title X-Ray Structures of the Maltose-Maltodextrin-Binding Protein of the Thermoacidophilic Bacterium Alicyclobacillus Acidocaldarius Provide Insight Into Acid Stability of Proteins
pubmed doi rcsb
source organism Alicyclobacillus acidocaldarius
total genus 120
structure length 366
sequence length 366
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-11-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ursA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ursA01
2VHAA 3BFUA 1TWYA 1UTHA 2F6GA 2X7QA 3TCFA 1IUDA 4I1DA 2A5TA 3TTNA 4DCYA 3HPIA 2THIA 2I4BA 1SD3A 5M2VA 3MJNA 3UGWA 2B3FA 3A3UA 4OXVA 4C1UA 4DXCA 4PFWA 3OELA 3TODA 4MLQA 1FQEA 1H45A 4EF1A 2X7PA 3VVEA 1IITA 3CIJA 4NF6B 2QMXA 2YPNA 1FQCA 3VXBA 4ZEDA 4K3FA 1N84A 3RUMA 5DT6A 3U93A 1XS5A 1P1OA 1URSA 2DE3A 3KFMA 2H9BA 4P11A 1Q1KA 1ZTYA 4AQ4A 5L9SA 2Z23A 3TQLA 3OO6A 3OO9A 2XXQA 4QFOA 3OEMA 1XHYA 4IGTA 4Z7EA 5I57B 4Q5TA 1US5A 1MY1A 3MAMA 1MPBA 3IOWA 1EU8A 3LSFB 5CMKA 4GXAA 2QSXA 2QPQA 2ZYNA 1JW5A 3C9HA 2RKMA 1LB9A 4BDQA 5TP9A 1EZPA 1DPPA 5L8DA 2Z8DA 4OEVA 1P99A 1TFAA 2Y7IA 4U22A 4MBPA 1CE2A 3IB1A 4H8JA 3ZKKA 3T9VA 1B3GA 2Q9TA 3ONMA 3SKPA 5FTHA 3TYHA 1P1UA 4MH5A 3FXUA 3EHSA 3H4ZA 5CBRA 3VVDA 2REJA 3O9PA 3H03A 3JYRA 4NE4A 3MW0A 2UYFA 4FJPA 2GFEA 2F5XA 1ZBMA 3CFZA 4FEBA 5ELVA 3N26A 3KJTA 4EQ7A 1H44A 4R9FA 5CI5A 4IY6A 1FQAA 3Q29A 2O6AA 3U72A 1M5BA 2F34A 3TCHA 1B3FA 3TPAA 3H6VA 3EN3A 2PMSA 3LBSA 1MXWA 2UVJA 2ZNTA 3OENA 3QYTA 1LB8A 4DIGA 1B7UA 3FUZA 2Z8EA 4H0WA 4BDLA 2I48A 1L5TA 2O1LA 3SEXA 2ALUA 3WAFA 4NF8A 4RA1A 4N07A 2V25A 3S9EA 1H3DA 1AH5A 3FV2A 1MPCA 3K6WA 3Q27A 1N3WA 2DWIA 1AIVA 3G3HA 4XKPA 1LCTA 1I6BA 2DSFA 5AA2B 3T93B 2GH9A 4QFLA 4ONYA 2YJPA 3UORA 4ZDMA 1JNFA 4G68C 5H8HA 2IA4A 1Y3QA 4QRZA 3TDJA 3TZAA 2DP8A 2V84A 3EQ1A 5TPAB 4F2QA 3PPPA 4ISUA 2W7YA 1Y1MA 3PGFA 5ICTA 3C36A 1UTBB 1MY3A 1LAHE 4IGRA 3TUSA 1SDXA 1MY0A 5J1DA 4GVOA 2Z22A 5H8FB 1SQYA 1BP5A 4JDFA 3K6UA 3TMGA 3RTFB 2M8CA 1D4NA 1I69A 1USYH 4XTCQ 3TEPA 1FTLA 2DS9A 1IZ1A 4IY5A 3JZJA 5I2KB 4DDDA 3VV5A 3FJMA 1MM7A 3O2AA 1US4A 3CFXA 1GR2A 1FW0A 4YB7A 2VGQA 2HAVA 3S2VA 3UIFA 4LA9A 1JVYA 3T9HB 3K4UA 2DE4A 1NMUA 1S7YA 4MF3A 5HM4B 4DE8A 4FECA 1AOVA 3W15C 1JVXA 1MH3A 5TPAA 4BDRA 3THIA 2XXRA 4MLVA 1UTBA 5I58A 4NWCA 3RN8A 1POTA 2ZYKA 4NEDA 4DZ1A 2XXPA 1VFDA 3G3GA 2LAOA 4LVQA 2F7BA 5KCJA 1IEJA 2DVCA 2QL3A 3MZ9A 1RKMA 3E4RA 4ZZAA 3OXNA 1Y4TA 3I5OA 2F7CA 4LZ8A 3QIMA 2V3TA 3PUVE 3FVGA 3U8QA 4ZS9A 4U23A 5CC2A 4QSCA 1B5HA 4FAJA 4M1VA 4ELOA 4ND9A 5I84A 5CRYA 3VVFA 2DXYA 1DPEA 3AXFA 3IOTA 4M4GA 1ZLQA 4XKRA 2DWHA 3O28A 1HSJA 4BDNA 1LBCA 3BKIB 4F31B 1QJMA 1MM6A 3CSGA 1MH4A 4PFTA 4F39A 4R9GA 4LATA 3PD8A 3SERA 2UYEA 2DYXA 1B0HA 4KCCA 3CG3A 3KJ7A 5DEXB 4FORA 2OBGA 2F35A 1OMPA 1Y3PA 3KOTA 2OJTA 1LAGE 1XT8A 4YB5A 1YPNA 1IXHA 3FATA 4OQOA 3GBBA 2QRYA 4I8CA 4P0IA 3K01A 3SEVA 2OLBA 4OYVA 1HSLA 2DWAA 5BUUA 1IQ7A 5DYHA 1B1XA 2FNCA 1N7WA 4YKKA 2UVIA 1H43A 3U92A 1SYHA 4RYAA 3BBRA 3PPOA 2XXYA 3MQ9A 4JWOA 2AL5A 3OO7A 3N6UA 4PFUA 1ANFA 1XVYA 4H5GA 3B6TA 3CI8A 4X1DA 5ISUA 3Q26A 2NVUB 4ZE8A 5A5XA 2PBWA 1FQDA 4QFNA 1VE4A 3PUYE 5DEXA 2AYSA 1SI0A 3PV0E 4Q8RA 4U4SA 5ICQA 2QS3A 1B52A 4QSEA 3M8UA 3H6TA 4LP2B 3ILTB 1A8FA 3RT8A 2YLNA 3I3VA 4F3BA 4OVJA 2E0SA 3T9UA 4LQ2A 1P1QA 3UA8A 4KYDA 1B58A 1MPDA 4PETA 1O64A 3SEWA 4AB5A 3B6QA 2XX7A 2G93A 5AA3A 3IAZA 4F1YA 4LQ5A 1QW0A 4NWDA 1MS7A 4OETA 3ZSFA 2FYIA 1B4HA 4XIGQ 3L6HA 3RLFE 3RQTA 1B5JA 3FVKA 5JTYA 5TU0A 3K1PA 5AA4B 4YU0A 1JW4A 1Y4CA 3Q25A 3FIRA 3ZS6A 1VFEA 2I4CA 3LSLA 4WEDA 3OO8A 3PMXA 2O51A 4F29A 3LUYA 3VLUA 3I6VA 3O29A 4JB7A 2QS1A 3OEKA 1DOTA 3TTMA 3RY3A 2XXIA 1LGBC 4QSDA 4NF4B 1SI1A 2I49A 4E0WA 1KWHA 3HHGA 4DCXA 1M5CA 4XXUA 3IR1A 3DP8A 2PT2A 4TLMB 3M3LA 3H6UA 4XKQA 4ZEBA 4R75A 3KSJA 4NF6A 5CMBA 1B2HA 4F18A 4XKNA 2Y84A 4Q30B 2A5SA 1N76A 3TKDA 1SW1A 2DXRA 2BJJX 3OSRA 4IO6A 1DTZA 3O6HA 2Q8JA 2I0CA 3PMWA 1B3HA 2ONRA 1LFGA 4TOZA 3R26A 1MG1A 1XC1A 1LFIA 2NWJA 2Q2CA 2VD2A 3SETA 2OZZA 1NH8A 3HHFA 1B9JA 5I57A 4GRKA 3IJOB 3E3KA 3UP9A 2F78A 5I59B 2F8DA 3M3KA 4L17A 1T0KA 3FVNA 2HAUA 4G8NA 2HZLA 1MRPA 1SW5A 3K02A 1OLCA 4WXJA 4OZ9A 1YTVA 3QUFA 2DOJA 2KLFA 3FXQA 1Z7NE 4EF2A 3VDFA 4C0RA 1MXUA 1B4ZA 2QMWA 1R1NA 1NKXA 4IO2A 2UVGA 5IAIA 2DQVA 3MZ1A 2Q2AA 2H98A 1UIUA 4R73A 1XVXA 3PUWE 4YZZA 4ECFA 2F7AA 5L9MA 4DXUA 5I56B 4F22A 4Q0CA 2GHAA 3IO6A 2E1SA 4H8IA 1S9TA 3TTKA 3IL1B 1MXXA 5ITPA 4MFIA 3LR1A 3CSBA 5K2XA 2F97A 3MC2A 1QUIA 2XHDA 3H06B 3R7XA 3S9MC 1QKBA 1NFTA 5DVIA 1R6ZA 4ELRA 4GOTA 1JW1A 4KI0E 1B40A 4FEDA 3EHTA 3C35A 1URDA 5DVJA 1M5FA 2CZLA 3D4GA 3CVGA 3W9WA 1BTJA 3QK6A 4BDMA 2V3UA 1A55A 1RYXA 4ESXA 3R6UA 3KSXA 4KYSA 1TXFA 4PQJA 3MP8A 3K6XA 2XXUA 3HCQA 4GXSB 1ZU0A 4ELPA 4EDPA 3RT6B 5EHMA 1MXYA 1NH7A 4GWOA 1Y9UA 1IXIA 5AA2A 2H5YA 3DP6A 1QVSA 2PVUA 1B05A 2B3BA 1B6HA 4H65A 4KFQA 2AL4A 3OSQA 3A09A 3ECRA 3V83A 3B7DA 1IXCA 2O7UA 1R9LA 1TT1A 4U21A 5JEIA 1Y3NA 5B7DA 1POY1 5H8SA 5H8QB 4G68B 3MVZA 5CM6A 1J1NA 2XXXA 3TCGA 2R6GE 3VFJA 1VSOA 3K2DA 1WDNA 2H99A 1S50A 2HQ0A 5H8FA 4GF8A 2V3QA 5H8NB 3A3CA 1AL3A 1B7HA 1N7XA 1CB6A 3C31A 2ZNSA 3BFTA 3UN6A 4LZ5A 5KDTB 2RC8A 5K2YA 4UA8A 1QKAA 5I2KA 2UVHA 2I3VA 3ODBA 4IB2A 1A54A 1GTKA 1O7TA 5JK4A 2Q88A 3FASA 1R9QA 4GQOA 4R72A 3TTLA 2XX8A 1JEVA 3FD3A 3SESA 2QS4A 4OFJA 1OQHA 1Q35A 1H76A 2H4IA 3C33A 5DVFA 2XX9A 3PPQA 3MVWA 4NF5B 1B7ZA 1PC3A 2GRVA 3PUXE 4JWYA 3CFLA 2ESNA 4OWDA 3SEYA 4N13A 4G68A 1B3EA 3N94A 3T96B 1FTOA 3DM0A 3USDA 2XXWA 4G8MA 2HEUA 3KZGA 4BLAA 2CMOA 2I6EA 1OIBA 3RTWB 2O1MA 3QAXA 4LZ7A 3HSTA 1N3XA 2XXTA 2D21A 4G4PA 4ELQA 2Z8FA 4H6DA 2A5TB 1DSNA 1LBBA 1EH3A 1NNFA 4RPNA 1GGGA 4NF5A 4GLIA 3MWBA 3KG2A 4O3CA 1D3KA 3FVOA 1JQFA 1LLSA 4IO7A 1WODA 3T22A 4LUBA 2R9JA 2HZKA 4FIMA 4H1XA 3N5LA 1PDAA 1SYIA 3MP6A 3KN3A 4AB6A 1HSEA 3S4UA 5FTIA 2ABHA 4IO4A 4YKJA 4ZEIA 5EHSA 3WAEA 2I0BA 4PP0A 1URGA 4KYEA 4G2ZA 4KCDA 4X9TA 1DTGA 1SW2A 4X48A 4HW8A 2I58A 3PMVA 2F36A 3GLBA 1QUJA 4F1UA 1FTMA 1II5A 4RK9A 1O63A 4HTGA 1MY4A 1SBPA 3IK6B 1GVCA 2P1SA 1I6AA 1JEUA 3FJGA 2QJEA 2G29A 4OEUA 2OK2A 1BLFA 3QXMA 2OWSA 3IO4A 3E9XA 4ZEKA 4THIA 1LSTA 1PB7A 1PB8A 3QUJA 3TFLA 1JETA 2XXVA 4RNSA 3EHUA 1AMFA 1B5IA 1FCKA 5DTBA 4POWA 1PEBA 4F1VA 3IOUA 2F6PA 3GBAA 4RK2A 4U4XA 4N6PA 3K6VA 4LONB 3IX1A 3O66A 3GXAA 3MP1A 3MPLA 4NTLA 2O7IA 5FHOA 2P2AA 4YKPA 5TP9B 4UACA 3TAJA 3FXRA 2I3WA 1MXZA 4QFPA 2V93A 4R2FA 4PFYA 3EF7A 2ZMBA 3IB0A 2PX1A 2Q89A 3PD9A 3IORA 5BWJA 1MQHA 1OQGA 3KN8A 3KN7A 3G3KA 1EZOA 4GFRA 4O3BA 4KPTA 2ZXTA 1UIVA 5FHMA 2ZNUA 3H6WA 1IIWA 4HCWA 4BDOA 1M5EA 2DWJA 4R2BA 1A8EA 4YB6A 1Y20A 2XD3A 4ZEFA 3S9NC 3DELB 1FQFA 3HN0A 3G7WA 2UXAA 5AA4A 1NNKA 4RY1A 2ZYMA 1ZIUA 3T9XB 2VD3A 4I62A 4RXLA 1VR5A 3IJXB 2Y7WA 2X26A 3S9LC 5ITOA 1MY2A 3K00A 3G3IA 4OERA 4QHQA 1OLAA 5B70A 3K1MA 1QUKA 3O6IA 1MQJA 5HBCA 4EXLA 3GZGA 4ZE9A 3JV9A 3T66A 3C4MA 3HV1A 4NF8B 1A99A 4NF4A 1P1WA 3OMBA 4OESA 2OCUA 3LSXA 3FV1A 4HCYA 4U2RA 1LFHA 1WVJA 2RCBA 1B51A 2OWTA 1Z7ME 2REGA 4R6KA 5F1QA 2B65A 5H8HB 2NOOA 4KHZE 3LSWA 1MQGA 5CMCA 2HXWA 3RNNA 4EQ9A 2H25A 3L6GA 3ZKLA 4JBZA 3B6WA 1QULA 3D4CA 4OTEA 3IOVA 4EQBA 2VOZA 1USYE 5F7VA 2O68A 1LCFA 3PUZE 3VXCA 3PPNA 3G3JA 4KQPA 1SW4A 4WKMA 2VP1A 5I59A 2RC7A 1OVTA 5AE4A 4YICA 3E13X 1RYOA 4FATA 1MQIA 4GD5A 2ONKE 1NNTA 4YAHX 1GV8A 3V5AA 3V8XB 1YCJA 5EYFA 2R71A 1IXGA 3U1OA 1UQWA 1TFDA 1PB9A 3VE1B 1PBPA 4GL8A 3O6GA 1FQBA 3PU5A 3Q28A 1PBQA 4KR5A 3MUQA 4JSOA 3M3FA 2FA7A 4YMAA 3U94A 1N04A 4EUOA 4F3PA 2DVZA 2PYYA 4QFKA 2Y7KA 4YKIA 4DXBA 2PT1A 1OVBA 3SDFA 3H3GA 3SEUA 4OFOA 4RPOA 3RGYA 4OMBA 5I58B 1NL5A 4R6YA 5CMMA 5I2NB 4F3SA 4NMYA 5I56A 4TQUQ 1EZ9A 3G3FA 3KEIA 5KCJB 3KOSA 3CR9A 1MDQA 3EPEA 1FTKA 4O3AA 1N0TA 2XD2A 1LAXA 4JWXA 2XXHA 1LAFE 4OFLA 1BKAA 2RINA 5AA1A 2GHBA 4WEPA 1ZJLA 1MQDA 4DLDA 5CBSA 1F9BA 4JXIA 3OOAA 4H67A 3DLNA 1FTJA 4C1TA 3RPWA 5LOMA 2RCAA 3PPRA 2D5WA 1Y1ZA 1SVXB 4E0XA 1B1HA 1B0LA 1XOCA 3KGCA 5I2NA 2WKYA 3VLWA 3C34A 1P1NA 3MPKA 3N6TA 4R6HA 1B32A 1M5DA 3P7IA 4G77A 1MXVA 5FHNA 2ANJA 4POXA 3TELA 4ESWA 5AA2D 2O84X 3UK4A 3F11A 4ZZEA 4JSDA 4QF9A 2RF1A 2RC9A 3LC8A 4U1OA 2HFBA 5H8QA 4FE8A 2AIXA 3KBRA 4F2OA 5HPQA 4P0GA 1NNPA 3V89B 3C32A 3H7MA 3W9VA 4H5FA 2IEEA 3FZVA 2HCAA 3IB2A 5H8NA 1B3LA 4R74A 2ZYOA 3MVYA 5A5XB 4G8HA 1ATGA 4EXKA 1MDP1 5KDTA 1DMBA 4PE5B 3ILUB 3OD7A 2Y7RA 4IO5A 1BIYA 2NUVA 2QS2A 3QSLA 2NXOA 1UTHB 3CRBA 5IKBA 1ZKBA 1YAEA 2ONSA 3TQWA 1D9VA 4ZECA 2DE2A 5L9OA 3CG1A 4Z0IA 3O97A 4U1ZA 4F3GA 3MVXA 4IO3A 3HO7A 1D9YA 4KD5A 5KZTA 3DP4A 1A40A 4GIZA 4OENA 1A7LA 4YMBA 3MBPA 3FGSA 2D3IA 1B46A 4F19A 3MZBA 4X1BA 3VLVA 1I6QA 4RJZA 4GL0A 5JTYB 3FJ7A 2Y7PA 2O69A 1ELJA 4OHNA 3K0VA 4TLLB 3K1NA 1ZMGA 3TTRA 2P0SA 4HS7A 4I9DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2VHAA 3BFUA 1TWYA 1UTHA 2F6GA 2X7QA 3TCFA 1IUDA 4I1DA 2A5TA 3TTNA 4DCYA 2Y5KA 3HPIA 2THIA 2FVZA 2I4BA 1SD3A 5M2VA 3MJNA 3UGWA 2B3FA 3A3UA 4OXVA 4C1UA 4DXCA 1FPLA 4PFWA 3OELA 3TODA 4N15A 4MLQA 1FQEA 1H45A 2WBDA 4EF1A 1CNQA 2X7PA 3VVEA 1IITA 3CIJA 2ZZXA 4NF6B 2QMXA 4MHFA 2YPNA 1FQCA 3VXBA 4ZEDA 4K3FA 1N84A 3RUMA 5DT6A 3U93A 2ZZVA 1XS5A 1P1OA 1URSA 2DE3A 3KFMA 2H9BA 4P11A 1Q1KA 1FPKA 1ZTYA 4AQ4A 5L9SA 2Z23A 2L5VA 3TQLA 3OO6A 4UABA 3OO9A 4I40A 2XXQA 4QFOA 3OEMA 4P1EA 5DW8A 1XHYA 4IGTA 4Z7EA 5I57B 4Q5TA 1US5A 1MY1A 3MAMA 1MPBA 1NV3A 3IOWA 5ET5A 1EU8A 3LSFB 5CMKA 4GXAA 2QSXA 2QPQA 2ZYNA 3PTYA 1JW5A 1NUZA 3C9HA 2RKMA 1LB9A 4BDQA 4DI4B 5TP9A 1EZPA 1DPPA 5L8DA 2Z8DA 4P1LA 4OEVA 1P99A 1TFAA 2Y7IA 4U22A 4PGPA 4MBPA 1CE2A 3IB1A 4H8JA 3ZKKA 5ET8A 3T9VA 1B3GA 5EYGA 2Q9TA 3ONMA 3SKPA 5FTHA 3TYHA 1P1UA 4MH5A 3FXUA 3EHSA 3H4ZA 5CBRA 3VVDA 2REJA 3O9PA 3H03A 3JYRA 4NE4A 3MW0A 2UYFA 4FJPA 2GFEA 2F5XA 1ZBMA 3CFZA 4FEBA 5ELVA 3N26A 3KJTA 4EQ7A 1INPA 1H44A 4R9FA 5CI5A 4IY6A 5A5LA 1FQAA 3Q29A 2O6AA 3U72A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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