1URSA

X-ray structures of the maltose-maltodextrin binding protein of the thermoacidophilic bacterium alicyclobacillus acidocaldarius
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
366
structure length
366
Chain Sequence
QTITVWSWQTGPELQDVKQIAAQWAKAHGDKVIVVDQSSNPKGFQFYATAARTGKGPDVVFGMPHDNNGVFAEEGLMAPVPSGVLNTGLYAPNTIDAIKVNGTMYSVPVSVQVAAIYYNKKLVPQPPQTWAEFVKDANAHGFMYDQANLYFDYAIIGGYGGYVFKDNNGTLDPNNIGLDTPGAVQAYTLMRDMVSKYHWMTPSTNGSIAKAEFLAGKIGMYVSGPWDTADIEKAKIDFGVTPWPTLPNGKHATPFLGVITAFVNKESKTQAADWSLVQALTSAQAQQMYFRDSQQIPALLSVQRSSAVQSSPTFKAFVEQLRYAVPMPNIPQMQAVWQAMSILQNIIAGKVSPEQGAKDFVQNIQK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title X-Ray Structures of the Maltose-Maltodextrin-Binding Protein of the Thermoacidophilic Bacterium Alicyclobacillus Acidocaldarius Provide Insight Into Acid Stability of Proteins
pubmed doi rcsb
molecule tags Maltose-binding protein
source organism Alicyclobacillus acidocaldarius
molecule keywords MALTOSE-BINDING PROTEIN
total genus 120
structure length 366
sequence length 366
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-11-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ursA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ursA01
4ZECA 5ICTA 4G8NA 1QVSA 2RINA 1N0TA 1AL3A 3KOTA 3FVOA 2ESNA 3GZGA 5DVFA 1RYXA 2NOOA 1JEVA 1TXFA 3D4CA 2OZZA 4OXVA 1I69A 2DXYA 2F8DA 1JVXA 1VE4A 3VLWA 3TTKA 1N84A 5EYFA 3OENA 4UA8A 5TPAA 1PB8A 4R75A 3MBPA 5I56B 1LSTA 1GV8A 4KR5A 1IXGA 5DTBA 2DSFA 4GRKA 1AMFA 2DVCA 1EZ9A 4LONB 1XC1A 3RLFE 4KYSA 4F18A 1NMUA 2QL3A 4E0WA 1PBQA 5HM4B 3CFXA 2THIA 4IGRA 3QXMA 1B0LA 4H8IA 1SVXB 4C1UA 4GFRA 4KPTA 5H8FB 3S9LC 1LAXA 3FZVA 3T93B 5F7VA 1MPBA 3WAEA 4P0GA 2I4CA 4F2QA 3IOUA 3V83A 4XKPA 1IUDA 3IJOB 3BFUA 4NWDA 3KSXA 5A5XB 3IO6A 1WVJA 4F1UA 4PFWA 5CRYA 3H3GA 4DXCA 2FNCA 1CE2A 4Q0CA 1EH3A 2H4IA 2ABHA 2H99A 3GLBA 4RK9A 5L9OA 2DYXA 4BDOA 4OFOA 2Q8JA 1OMPA 4ZEIA 3TAJA 2V3UA 4OVJA 2O68A 1OQHA 4ZS9A 3QYTA 3UIFA 1A7LA 4RNSA 3BBRA 4GL0A 2E1SA 1QUKA 3KN3A 3TYHA 1TFDA 2GH9A 3M3LA 2O69A 4NF4B 2A5TB 2Y7PA 4DIGA 5M2VA 3UGWA 2Q2CA 1B52A 1B46A 3FXUA 2ONKE 1KWHA 2PMSA 4IB2A 3G3GA 2Y84A 4BDLA 4F2OA 4GXSB 1FCKA 2XXIA 3P7IA 4ELQA 3CR9A 1TWYA 3CFZA 3MVZA 3C32A 2Z8DA 4G4PA 2O51A 3G7WA 4EF1A 2X7PA 1XOCA 1MXWA 1P1NA 1FTOA 3C33A 4R72A 1DPPA 4C0RA 5H8QA 1MDP1 5CBRA 3IL1B 4LZ5A 3VVFA 2WKYA 2ZNUA 1LFIA 4DCXA 1SI0A 3KOSA 2O6AA 3L6GA 5EHMA 3UK4A 2NWJA 3VV5A 3DP6A 5TPAB 2AL5A 2QS4A 3OSRA 1B9JA 3PMWA 1BP5A 1Q35A 3WAFA 1POTA 2UVHA 5ICQA 3LR1A 4PFYA 2VD3A 4HS7A 2M8CA 4IO4A 2VHAA 1FW0A 3T9XB 3SETA 1JNFA 5FHNA 2HZKA 1US4A 1IITA 4QHQA 3O6GA 5JTYA 3KJ7A 5EHSA 2HAVA 1B05A 4WEPA 1NNPA 1B7HA 4ZZAA 2ONSA 1PBPA 2Y7WA 3FV2A 2YJPA 1P1UA 3CIJA 4EQ9A 2NVUB 4KYEA 2XXXA 3IR1A 3MP1A 2PYYA 2PT1A 2XX8A 3K00A 4FJPA 2DWAA 3SEUA 1UTBA 4ND9A 1FTJA 1ZLQA 4M4GA 1B32A 3FUZA 4MLQA 4BDNA 4EXLA 5I57A 3EHUA 4U2RA 5DEXA 1SYIA 3T66A 4YB5A 3U72A 1VFDA 1RKMA 3BKIB 4BLAA 3ZSFA 4QFOA 4N13A 1JQFA 4N07A 1FQEA 4R9FA 4LA9A 5CBSA 4QSEA 2DE3A 4R73A 3DP4A 2PBWA 3O66A 4JSOA 1GGGA 3C34A 3L6HA 2ONRA 1NKXA 1POY1 4Z0IA 3PD8A 3MPLA 4DE8A 3T9UA 4QSCA 3W9WA 2HFBA 3FVGA 3MUQA 3ILUB 2O7UA 1SYHA 1US5A 3B6TA 1B1XA 1II5A 5H8QB 3IB1A 3VLUA 1ZTYA 3JYRA 3K6UA 4HCYA 2XD3A 1A55A 5K2YA 4F1VA 2DQVA 4EDPA 2XX7A 4QFKA 1B5HA 3R7XA 1QULA 5TU0A 1DMBA 4OZ9A 3TODA 3R6UA 4ESXA 1N7WA 3K0VA 1DTGA 3O28A 3K1PA 3OSQA 3TCGA 1MG1A 5AA4B 4ELPA 3I3VA 1B3HA 1H76A 2Q9TA 5H8HA 1DTZA 3TDJA 5CM6A 2FYIA 3G3HA 4F3PA 2DXRA 3ONMA 1MDQA 2DVZA 3IK6B 4GOTA 4F3BA 1LAHE 4XKRA 5ITPA 3KEIA 4I9DA 3T22A 5TP9A 1MQJA 3KN8A 2OWSA 3MZBA 4NF5A 4M1VA 5JTYB 5DVIA 4F31B 1ZBMA 1B0HA 3RPWA 2OWTA 3MQ9A 4NWCA 4IO3A 3G3IA 1QUJA 3PD9A 1L5TA 3RN8A 3DELB 3FVNA 4MFIA 1XVXA 1AH5A 4YB6A 3TQLA 4EQ7A 4QF9A 4FORA 3C36A 1QJMA 5CMKA 2F97A 1ZU0A 5FHOA 1UTBB 1Q1KA 2ALUA 3O6IA 1B5JA 4OYVA 1FTLA 3OEKA 4PFUA 2H9BA 1SD3A 5AA2D 3FXQA 1MM7A 5I57B 2ZNSA 4ZE8A 2XXQA 5DEXB 2XXYA 2DS9A 4LQ2A 4WXJA 1OIBA 3F11A 4R2FA 1IIWA 1EZPA 2V25A 3PGFA 2OJTA 2ZYMA 4QFLA 1N04A 4FEBA 3H7MA 4X1DA 2HXWA 1MH4A 4MBPA 4NF6A 2UVGA 1ZMGA 3E9XA 3KSJA 4OFJA 4IO2A 1LCTA 4NMYA 1HSJA 3FD3A 3QAXA 4R6KA 4ELOA 2I3VA 3U93A 3IO4A 2V84A 2GRVA 5HPQA 3SDFA 4YU0A 4QRZA 2R71A 2O1LA 2VOZA 3HO7A 3A3CA 2PVUA 1D3KA 3K6WA 5J1DA 4YKIA 2XXUA 5I59B 5I2KA 4XKQA 2RC9A 4JWXA 3IOWA 2D21A 3PMVA 3V8XB 4AQ4A 1TFAA 3VDFA 3DP8A 3PUZE 3N6UA 3CSBA 1D4NA 1PDAA 1SBPA 3SEVA 5H8HB 4YMBA 3DM0A 4L17A 1FQDA 2P0SA 4U1OA 3TKDA 5TP9B 4F1YA 4WEDA 1JETA 3BFTA 2UVJA 4BDRA 1QUIA 4H6DA 4GF8A 3E3KA 3RT6B 2I4BA 2OK2A 3DLNA 2REJA 4NF5B 2XXWA 4Q5TA 2OCUA 2UXAA 4ELRA 3V5AA 1JW4A 1N76A 1H3DA 3OD7A 5DYHA 3MC2A 1WODA 1VFEA 1Y3NA 4RPNA 3LUYA 3VXCA 1AOVA 4O3AA 1P1WA 2XXTA 1UIVA 4DCYA 1GVCA 4OQOA 3CSGA 3G3KA 2OLBA 3LC8A 2XD2A 1LGBC 3MVWA 2W7YA 1Y1ZA 1D9VA 1JW5A 4RYAA 4UACA 3C31A 3C9HA 5IKBA 2Q89A 2F78A 3OO6A 4G8HA 5L9MA 3U1OA 4X1BA 4ZDMA 1B3FA 5KCJA 1Z7NE 5I2NB 4JDFA 3MVXA 3SERA 2VP1A 3N94A 3TELA 5AE4A 3LSFB 4NF6B 5L8DA 2DP8A 2I6EA 4F39A 2PX1A 2D5WA 3QK6A 4AB6A 4RY1A 3T9VA 1BKAA 1B2HA 2LAOA 1QW0A 3IOTA 1URDA 2IEEA 1Y1MA 3UA8A 3PPNA 1WDNA 5AA4A 3VVDA 4U21A 3CI8A 4EXKA 2O1MA 4YAHX 3M3KA 3G3FA 4FECA 4I8CA 4Z7EA 2B65A 3V89B 2P2AA 1M5CA 1SDXA 3TTMA 4DXUA 3TCFA 4OFLA 1I6QA 2CMOA 3IOVA 5I2KB 3C35A 4YB7A 2A5SA 4JWYA 3PUXE 3Q26A 2HZLA 2DOJA 1BTJA 3B6QA 3E4RA 3ILTB 4TLLB 4GL8A 2DWHA 1Z7ME 4BDQA 4JWOA 3QUJA 1CB6A 2XXVA 3JV9A 1JVYA 1H45A 3TUSA 4KCCA 1LAFE 3MVYA 1MY1A 1NNTA 1MRPA 3O6HA 3H6UA 1FQBA 1B7ZA 2IA4A 3OXNA 1O64A 3IAZA 3VLVA 3T9HB 3IB2A 1MQIA 2DE2A 1MY4A 1NL5A 1Y3QA 3GBBA 5AA1A 4DLDA 3TTLA 4EUOA 1ELJA 1B3EA 3JZJA 4WKMA 1A8EA 4LATA 1R6ZA 5CMCA 3ZKLA 1IQ7A 2AIXA 1YCJA 4HCWA 1TT1A 5KDTB 2HAUA 5I84A 1NNKA 1LB8A 3VXBA 2I48A 3FJ7A 3CRBA 4FIMA 5AA3A 3GXAA 1MXUA 3FXRA 1ZJLA 3TPAA 1B51A 1B5IA 5LOMA 1SW4A 5IAIA 1B1HA 3SEXA 3PPQA 3LSLA 2H98A 4H65A 2XXHA 1HSLA 4MH5A 1IXCA 5KCJB 1MY0A 1LCFA 4PE5B 1LLSA 3RTWB 3K1NA 4POWA 2RC8A 5I59A 4RA1A 1NH7A 2I3WA 4PETA 4C1TA 2YPNA 4IO7A 4ZEDA 3K6VA 1D9YA 2R6GE 3HV1A 3OO9A 3RNNA 3EQ1A 3PUVE 4ZEBA 4ESWA 4LVQA 2QRYA 1FQFA 4KYDA 1SI1A 2I0BA 3PV0E 3GBAA 3G3JA 4YICA 4OEUA 4P0IA 3W15C 2REGA 2H5YA 2OBGA 1JW1A 3TEPA 4N6PA 4QFNA 3QSLA 1R9QA 3RUMA 3QUFA 4YKJA 3Q28A 1USYH 3RTFB 1IXHA 1YTVA 2X26A 4GWOA 3MW0A 3FV1A 2UYFA 3LSXA 4R6HA 4U23A 1O7TA 1URGA 1SW5A 2ZYOA 4ZEKA 1MXVA 4FE8A 2UVIA 1N3WA 1SW2A 1DOTA 4X48A 1N7XA 4G77A 3H06B 4OESA 4RJZA 2F7CA 2V3TA 1QKBA 3O9PA 3S9MC 3PUWE 3OO7A 3T96B 2R9JA 1Y3PA 4LZ8A 1AIVA 4H5GA 1UQWA 1B3GA 2Z23A 2CZLA 1OLCA 2QS1A 1Y9UA 3S4UA 1LBBA 2Z8EA 4IGTA 4TLMB 2ZXTA 5I58A 5H8NB 1LB9A 3S9NC 4FATA 4JBZA 3VE1B 1I6BA 4ONYA 4NE4A 5I2NA 3CFLA 4LUBA 1XHYA 2RC7A 2GHBA 3U92A 4H67A 4X9TA 4GIZA 1S50A 2NXOA 5DT6A 1GTKA 4NF8A 2FA7A 2NUVA 5FHMA 3RGYA 3C4MA 4YMAA 2O84X 1P1OA 4EF2A 4Q8RA 2RCAA 1OQGA 4G68B 2QJEA 3FATA 4U4SA 1PC3A 3A3UA 4JB7A 4JSDA 2ANJA 4F22A 1R1NA 3VFJA 1B3LA 3M8UA 2XXPA 3KFMA 3RT8A 2RF1A 2QS3A 2O7IA 1Y4TA 4R6YA 2F7AA 4NEDA 4U4XA 2ZNTA 4G2ZA 2F35A 1YPNA 2QMXA 3TZAA 3H6WA 3O29A 1N3XA 4U22A 3KBRA 1M5FA 1BIYA 1NFTA 1FTKA 2XX9A 1S7YA 2PT2A 3PMXA 5ISUA 4GLIA 3HCQA 1MPCA 2Y7RA 4GXAA 3H6VA 3O97A 1UTHA 5AA2A 3N6TA 1J1NA 1IXIA 4KHZE 4POXA 5FTHA 4YKKA 5H8SA 3N26A 3SEWA 1MS7A 2I58A 4DZ1A 2F5XA 4YKPA 4MF3A 3FASA 3KG2A 4KD5A 1A54A 1MH3A 4O3CA 4R74A 2HEUA 4GVOA 4H0WA 5F1QA 3RQTA 3MPKA 3HPIA 3O2AA 1YAEA 4GQOA 4XKNA 1H44A 3EPEA 1URSA 4XIGQ 1MM6A 4IO6A 5KDTA 2E0SA 5B70A 1ANFA 1XS5A 1B4ZA 1MXYA 2Q2AA 3ZKKA 4TOZA 1S9TA 4LZ7A 3OELA 5CI5A 1H43A 2Z8FA 3A09A 2G93A 2I49A 3H4ZA 4MLVA 3D4GA 4QSDA 3EN3A 5I58B 1MQDA 4AB5A 4XXUA 3THIA 4G68C 1P99A 1EZOA 3MP8A 4G8MA 3LSWA 2YLNA 3MJNA 2GHAA 3EF7A 3TQWA 3TFLA 4KQPA 1MXZA 5K2XA 5CC2A 3OOAA 4NF8B 4RK2A 2QPQA 3TTRA 4O3BA 2AYSA 3R26A 2G29A 1R9LA 4PFTA 4EQBA 2Y7KA 4DDDA 3OMBA 1SQYA 4XTCQ 4ZZEA 4LQ5A 5JK4A 1B7UA 4F3SA 3H6TA 2VGQA 1M5EA 2F6GA 4H5FA 2F34A 1MY2A 4OEVA 1BLFA 5L9SA 3Q25A 4YZZA 2AL4A 1Y20A 4OERA 2Y7IA 1B6HA 3PPOA 3OO8A 3E13X 3USDA 3HHFA 4PQJA 1SW1A 3OEMA 4R2BA 3CG3A 2RCBA 3UP9A 1QKAA 1B40A 2QS2A 2QSXA 1A8FA 4TQUQ 4OMBA 1XVYA 1OVBA 3U94A 3VVEA 1VSOA 4RXLA 1P1QA 4F19A 1UIUA 3MP6A 1UTHB 3FJGA 5AA2B 2DE4A 3Q27A 1MQGA 3QIMA 3IORA 3UORA 4H1XA 1DSNA 3K1MA 1Y4CA 4DXBA 4IY5A 4KFQA 3KN7A 5CMBA 4K3FA 2H25A 3K4UA 3TMGA 3TCHA 1LFHA 3I5OA 3IB0A 3PPRA 2XXRA 2ZYNA 3K6XA 1LFGA 3K01A 1VR5A 3B6WA 3SKPA 5H8NA 4JXIA 2BJJX 1PB9A 1HSEA 1MQHA 4OETA 3SEYA 1MY3A 1A99A 4KCDA 3IX1A 2QMWA 1F9BA 5B7DA 4ZEFA 3K02A 4GD5A 1DPEA 1PB7A 1JEUA 2KLFA 3FVKA 4Q30B 5BWJA 1ZIUA 3SESA 3AXFA 5FTIA 1A40A 2D3IA 4OHNA 2VD2A 3MAMA 1I6AA 5ITOA 2UYEA 4G68A 3FGSA 5ELVA 3FIRA 1NNFA 1O63A 3LBSA 4ECFA 1NH8A 4OWDA 5KZTA 1FQAA 3S2VA 3I6VA 1M5DA 1OVTA 4R9GA 4OTEA 4P11A 3KZGA 2ZMBA 3TTNA 5I56A 3KJTA 3CG1A 1T0KA 3MZ9A 4I62A 1EU8A 2Z22A 1B58A 3HN0A 5DVJA 4QFPA 3W9VA 4IO5A 1XT8A 3PU5A 2V93A 3FJMA 4F29A 3B7DA 2X7QA 3MZ1A 3ECRA 3RY3A 3H03A 4IY6A 4KI0E 5BUUA 2V3QA 3U8QA 3ZS6A 5H8FA 2F7BA 2B3BA 2B3FA 1USYE 4LP2B 1RYOA 4ISUA 4THIA 1MPDA 2HCAA 3N5LA 5A5XA 3ODBA 4PP0A 2P1SA 3PUYE 1OLAA 4U1ZA 4RPOA 2DWJA 4NTLA 3MWBA 3K2DA 4I1DA 2F6PA 2F36A 5JEIA 2I0CA 1FTMA 3HSTA 2RKMA 4FAJA 2HQ0A 3EHTA 1M5BA 2XHDA 3Q29A 1LAGE 5CMMA 1ZKBA 3S9EA 1IEJA 2ZYKA 4OENA 3CVGA 4ZE9A 3PPPA 1MXXA 4NF4A 2A5TA 1B4HA 4F3GA 4E0XA 3IJXB 1PEBA 3UN6A 3M3FA 4HW8A 2DWIA 2GFEA 4HTGA 3HHGA 2Q88A 4H8JA 3EHSA 1IZ1A 4BDMA 4FEDA 1FQCA 1ATGA 5HBCA 3KGCA 1GR2A 1LBCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ZECA 5ICTA 4G8NA 1QVSA 2RINA 1N0TA 1AL3A 2HHMA 3KOTA 4NN3A 3FVOA 4OVTA 2CEXA 2ESNA 3GZGA 5DVFA 1RYXA 2NOOA 5EYGA 1JEVA 1TXFA 3D4CA 2OZZA 4OXVA 4I40A 4H45A 1I69A 2DXYA 2F8DA 2ZZVA 1JVXA 1VE4A 3VLWA 4GX3A 3TTKA 1N84A 5EYFA 3OENA 4UA8A 2WYPA 5TPAA 1PB8A 4R75A 3MBPA 5I56B 1LSTA 1GV8A 4KR5A 1IXGA 5DTBA 4GWYA 2Y5LA 2DSFA 1FSAA 2BJIA 4GRKA 1AMFA 2DVCA 1EZ9A 4LONB 1XC1A 3LUZA 3RLFE 4KYSA 4F18A 2XWVA 1NMUA 2QL3A 4E0WA 1PBQA 5HM4B 3CFXA 2THIA 4IGRA 2B4MA 3QXMA 4GWSA 4MMPA 1B0LA 4H8IA 1SVXB 4C1UA 2V4CA 4GFRA 5EQ8A 4MNCA 4KPTA 5H8FB 3S9LC 1LAXA 3FZVA 3T93B 4OVQA 5F7VA 1MPBA 5ET5A 3WAEA 4P0GA 2I4CA 4F2QA 3IOUA 3V83A 4XKPA 1IUDA 3IJOB 3BFUA 4NWDA 3KSXA 5A5XB 3IO6A 1WVJA 4F1UA 1FBPA 4PFWA 5CRYA 3H3GA 4DXCA 2FNCA 1CE2A 4Q0CA 1EH3A 2H4IA 2ABHA 2H99A 3GLBA 4MX6A 4RK9A 5L9OA 4JVIA 2DYXA 4BDOA 4OFOA 2Q8JA 1OMPA 2R8TA 4ZEIA 3TAJA 1CNQA 2V3UA 4OVJA 2O68A 1OQHA 4ZS9A 3QYTA 3UIFA 1A7LA 4PDDA 3U65A 4RNSA 3BBRA 4GL0A 2E1SA 1QUKA 3KN3A 3TYHA 1TFDA 2GH9A 2FBPA 3M3LA 2O69A 4GWWA 4NF4B 2A5TB 2Y7PA 2MKZA 4DIGA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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