3FXRA

Crystal structure of tsar in complex with sulfate
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
296
structure length
296
Chain Sequence
MLKLQTLQALICIEEVGSLRAAAQLLHLSQPALSAAIQQLEDELKAPLLVRTKRGVSLTSFGQAFMKHARLIVTESRRAQEEIGQLRGRWEGHITFAASPAIALAALPLALASFAREFPDVTVNVRDGMYPAVSPQLRDGTLDFALTAAHKHDIDTDLEAQPLYVSDVVIVGQRQHPMANATRLAELQECRWAFSSAPRGPGAIIRNAFARYGLPEPKLGLVCESFLALPGVVAHSDLLTTMPRTLYERNAFKDQLCSIPLQDALPNPTIYVLRRHDLPVTPAAAGLIRWIQHHAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural studies on the full-length LysR-type regulator TsaR from Comamonas testosteroni T-2 reveal a novel open conformation of the tetrameric LTTR fold
pubmed doi rcsb
molecule keywords LysR type regulator of tsaMBCD
molecule tags Transcription regulator
source organism Comamonas testosteroni
total genus 86
structure length 296
sequence length 296
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 3fxrA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fxrA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fxrA03
2NNYA 1V4RA 2CFXA 4GXAA 3PPOA 3LSLA 2J5PA 4GIZA 4CZZA 3FASA 3MWBA 5I2NB 2P7CB 3CR9A 4MTEA 1GV8A 4WXHA 1QZYA 3RN8A 1FTMA 3R61A 3HTSB 3H6VA 3BOQA 2VD3A 2DE2A 4M74A 1B2HA 2EA2A 1LDDA 4NWDA 3FMRA 1QKBA 1US5A 5F1RA 4R74A 2YSRA 2Y7PA 2R9JA 4CICA 1SI0A 1YIOA 4KNYA 1FY7A 4G9YA 4HA8A 1O3RA 4OHNA 1EH7A 1K6OA 5CVUA 2FBKA 1I1GA 5ILSA 4IO3A 2UVHA 2G7UA 1LFHA 3E4RA 5LHGA 1UQWA 4IJAA 2P6TA 4AVPA 3UORA 3LWFA 4YMBA 1OR7A 1MRPA 4BHPA 1YFHA 4RGRA 5K1YA 2XXIA 3J81K 3P7IA 4KFCA 4H8IA 4YB7A 4RGUA 1F4KA 3T96B 4ESXA 1B40A 3M9AA 2X0LA 2HQNA 4N07A 3MZHA 2Z8EA 1IXCA 1O7FA 3LSTA 1ON1A 3MBPA 1TQIA 2OZZA 4AB6A 4M73A 2DE4A 3DKWA 4ECFA 5ICTA 1IF1A 4ZZAA 1PEBA 3H7MA 4Q5SF 3MVWA 4DQ2A 1M5FA 2K4BA 1O7LA 4OFJA 3FD3A 3CG1A 1DPPA 4R2BA 2IA1A 1IIWA 2DT5A 3TAJA 3W9VA 4RGXA 5F1QA 4ZYEA 1ELJA 1YCJA 3IOVA 4HBLA 3KSXA 4I98B 3MC2A 4IO6A 3MEXA 5E1WA 2RCAA 1PBQA 1JGSA 4OIQF 3SZTA 3HSTA 4N0BA 5E8GA 3IK6B 4NF6A 4Q5TA 4R9FA 4LG0A 1UHMA 4QSEA 5AA2A 4KIGA 1U5TC 3HUGA 2XX8A 2OWTA 2ESHA 4YMAA 5EHSA 3IO4A 1UTHB 3SEXA 3T66A 2RC9A 1TTYA 1D8KA 4N6PA 4LK1F 4PGGA 4L5IA 4YB5A 5LBQA 1BIYA 3QIMA 3KETA 4GQOA 4I9DA 4U7BA 1POTA 3QXMA 5DCMB 4GF8A 3TQLA 3FWEA 3DEUA 3QPHA 1IN7A 2W57A 5CVJA 4HW8A 3HCQA 5HS9A 2VOPA 1P4WA 3S9EA 4I0BA 5DUKA 4HCWA 4L9TA 2RF1A 1TW2A 2R7DA 4M6XA 4I8CA 1XGSA 3CVGA 3C18A 4EJOA 5LHIA 3I54A 1L5TA 2OK2A 1GXPA 4IXAA 2MBFA 1Z6TA 2OBGA 3VXBA 3QYTA 1MXYA 4Z2YA 2RINA 1DPUA 3G3FA 3KCCA 1FNNA 1B05A 4PQJA 2M5WA 2GWRA 1B3EA 1JETA 3N6TA 1U3EM 4JXIA 1BI3A 4YB6A 1EH3A 1LFGA 4Q0CA 1JVXA 2NOOA 4FORA 1ZGAA 4FX0A 2KRFA 5HDGA 3EDPA 5CC2A 1HKQA 4G6DA 3QU3A 1B9MA 3WE3A 5FLXK 3O3KA 1U5TB 1UCRA 1Y3NA 2HCAA 1WRJA 4R6HA 2QQBA 1USYE 1XDUA 2QZ8A 4PGHA 4PFTA 5FFXA 1OQGA 5D5WB 1T98A 2Z33A 4M9ZA 1BJAA 1QUJA 2PLYA 3LQQA 4G68C 5AA3A 1ZRFA 1DPEA 3HYIA 4IY6A 1D3YA 4A12A 2BEOA 3BZ6A 1UTBB 1FBQA 2E1NA 5FO5A 3WTVC 1ZTYA 3TTMA 3CSBA 2KJBA 3D4GA 3E3KA 4PZJA 3CFLA 5L3FA 4AWXB 4CDGA 5HLIA 5FD5A 4M4GA 2XKPA 4G4PA 1FQAA 3EQ1A 1YAEA 3MPKA 2BV6A 1FT9A 2Q2EA 5FHNA 5LOMA 4P96A 4Q8RA 1LBBA 3O6IA 3M8FA 2EFQA 3OOAA 3L00A 5LLQA 3OO6A 3UGWA 3J7AO 3V8KA 4NB5A 4MH5A 1R23A 2M1BA 5J8CA 4S04A 1MPBA 5I57A 4QFPA 4H6DA 5CVVA 5LEJA 5CBRA 2EJRA 1FQEA 4BDQA 2HDCA 4H8JA 1IQ7A 2Q88A 1GR2A 1HXDA 3HSFA 4F31B 5BS6A 2V3TA 3HRMA 2PI0A 4EM0B 3KN8A 2NVUB 3HRSA 1MDMB 2EFWA 1BTJA 5ICCA 5H8FA 1GVJA 5F7VA 2V1DA 1SYHA 3O97A 3PQKA 4WKMA 2O51A 2VOZA 2ACJA 2YU3A 3RUMA 2BJJX 1D9VA 2OU2A 3CUQC 3WTYC 1SBPA 1IN4A 4NMYA 1JEVA 2EV0A 3FATA 1TWYA 3I58A 2YX7A 3K02A 2HGCA 1B6HA 2FBHA 1ZJLA 2M87A 1G3TA 3EUHA 4RNSA 1EH6A 1KU2A 2ONRA 1IN5A 2DP8A 2M8CA 4EJTA 4PFWA 1FC3A 2O6AA 3BJAA 4TLLB 1B4AA 2OAZA 3F3XA 4AD9A 3ROUA 1LB2A 2PMSA 1FOKA 1AMFA 1H44A 3OO8A 2M8EA 3KFWX 4MNUA 2CGPA 4JWYA 3QPTA 1V3FA 2CYYA 2PVUA 5CM6A 2DU9A 5L3EA 5DV5A 2L02A 3D0SA 3H3ZA 3T5XA 5J6XA 1JW5A 1YW7A 3PUZE 1HW2A 1XS5A 2QL3A 1QJMA 4IPAA 4EV0A 2DXYA 3B6QA 1W5TA 2Y48A 3MUQA 2O7IA 3I59A 3RT8A 2RN7A 2DAOA 2XGXA 5D8LB 2KLFA 3O6GA 2FU4A 1MDP1 4HCYA 3SEUA 1HQCA 3HO7A 2I48A 1N84A 2QPQA 3H6WA 3DELB 4A5NA 3F8MA 4HYEA 2VC1A 3Q27A 4N9IA 4XSXF 1KYZA 3C3WA 1IRFA 1BKAA 3DP4A 3B6WA 4UACA 4JDFA 4FT8A 1I6QA 1PP7U 4OYVA 3HOTA 2W84A 3HRUA 1PUEE 3BROA 2ZXTA 1BM9A 4FIMA 3TMGA 1K78A 2YLNA 2MH2A 2XXYA 3V8XB 1FQDA 2RVCA 2QUFA 1M5BA 3GF2A 3GLBA 3CUQB 1MPCA 3CI8A 2UXAA 2GA2A 1LEAA 1UIVA 1KGSA 3KEIA 2XAQA 2Z5UA 3KEQA 1QQIA 3EYYA 2L3DA 1TNSA 3AXFA 3IL2A 4LB6B 4HLYA 4EQ9A 3F6VA 3C36A 1SMYF 2DPUA 5DUIA 4G8XA 2I58A 3GFJA 1XOCA 4O5VA 3ZMVA 2REJA 1B4HA 3TCFA 2O1LA 3VE1B 5EHMA 4BDLA 4U0YA 3GZ6A 4ZE9A 2ZMEA 3MQ9A 4LZ7A 4ENKA 2HWVA 3FUZA 4R6KA 5K5OA 4DXBA 4HV6A 3SESA 1QKAA 2A07F 4OMYA 3F21A 4O3BA 1UB9A 3O6BB 4OWDA 4O6JA 1B3FA 5HDNA 4GWOA 4HF1A 4BDNA 4BHCA 1DSNA 2R7FA 1BI2A 4UVCA 3F23A 2EA4A 4HV5A 4F29A 3WTXC 1U78A 4BLAA 1B51A 3TTLA 4HTGA 2HZLA 3V5AA 3I0TA 4KCDA 4RS8A 2XIGA 2Y84A 3EETA 4OIOF 1MY4A 2RC8A 3G3GA 1PDNC 4KMUX 4BQAA 5L3GA 1YS7A 1BI0A 2UZKA 1T39A 1ON2A 2IA0A 4EF1A 4M9XA 1R5GA 1ULYA 3MP6A 1Z91A 2AYSA 2P7VB 5ILVA 1FBUA 3F8FA 4O3AA 1O3SA 2XX9A 3Q5FA 4YKJA 3ZMUA 4C1UA 2PBIA 3OEKA 3S9MC 4I01A 1D4NA 2JPBA 1TW3A 3JW4A 3IWFA 1YO5C 3EPEA 2UVGA 5HDKA 3SERA 1B3GA 2XROA 3KP3A 2RKMA 1FP2A 4YIIA 2A3SA 2ZNZA 2OZUA 3WTWC 2V79A 1R5HA 4IO2A 4KN4X 1ZYRF 2D1VA 2UWMA 4OERA 4XKRA 5BOXA 4GRKA 5L3CA 2D45A 1JHHA 3I64A 3SHFA 2A61A 4RB2C 1SW5A 3CJNA 4L0YB 4ASNA 4KYWA 1ZIUA 2BYVE 2H27A 2K02A 2KIMA 2PFBA 2PQ8A 3LSFB 2Z9OA 2F7AA 4OXVA 5CMBA 2QS2A 1HKSA 3FMQA 1TQPA 2QS3A 2A6EF 1RZ4A 3RTRA 1FX7A 4P55A 1JEUA 5I2KB 4GOTA 1H43A 4F3SA 2GH9A 4OU0A 3CRBA 2P1SA 3IL1B 4ZEBA 3IORA 5K5QA 1FW0A 4LQ2A 3HHHA 1EU8A 1IZ1A 1R00A 2D2WA 5I56A 4RAZA 4UV9A 3ZMSA 1JW1A 3K00A 1OIBA 1CF7B 3QRFF 1MZBA 3TUSA 1W5SA 4FHTA 3MJNA 5K2YA 1R9QA 2NXOA 1Y1MA 4DIGA 3TO6A 2W7YA 1MXWA 3R0AA 4ONYA 3FXUA 1W7PD 1BIBA 2HS5A 3DXJF 3N94A 3L6GA 2F5FA 4NQWA 3FV2A 4JWOA 1BOAA 3IOTA 1MQDA 4PETA 3WU1B 3ZP5A 5F6FA 2ZYNA 5ICQA 1RIOH 3GFLA 2FMYA 2F36A 3JSOA 1MM6A 2LDUA 4YFXF 3KEOA 4HX8A 3OELA 1SDXA 3MAJA 3IHUA 1KU7A 4OIRF 2IA2A 1Y0UA 4JBAA 2FYIA 3LR1A 3IRQA 1OLCA 4QFLA 3E3VA 4LFUA 4U0WA 4H5FA 3E97A 1XDSA 2K86A 3JTHA 4G7HF 5LEKA 2EB7A 1C0WA 1WSUA 3MAMA 2W24A 1B1XA 2F5CA 2RKHA 2ZNUA 3S2VA 1MXZA 2EV5A 2XXUA 1P4XA 1PP8F 4XKNA 4HQMA 1XVXA 4QSDA 3O29A 1TFDA 2ABHA 4K3FA 1ZBMA 2X7PA 1XSXA 4L18B 5KDTA 1R1TA 1SFEA 2XAFA 4H65A 2ETHA 5L9MA 1A8EA 2REGA 4GXOA 4LP2B 3GBBA 2K4JA 4FJPA 4JWXA 1EZPA 3DM0A 3ONMA 5ITOA 2RCBA 3FF5A 1DTGA 5IKBA 2FRHA 4IGTA 4WXJA 4X1BA 2BE5F 2DWJA 5FB2A 3EF7A 1AIVA 3TQNA 5H8HA 3VOEA 4LB5A 3Q25A 1D9YA 2L4MA 1SW1A 1FTJA 3KGCA 1QO0D 1B5HA 1RYOA 1ATGA 4PP0A 3KN3A 4ELQA 3MVXA 5DT6A 4BYYA 5TPAB 4LLLA 3TTKA 1ZGJA 5D8KB 4LMYA 4A0YA 5FHMA 1WODA 3HHGA 1MG1A 3EN3A 3QP6A 1OYIA 3U72A 3LUYA 4NF4B 3TQWA 5BPDA 4KYDA 2H6BA 3BPVA 4DCXA 5JTYB 5A5XA 2ZKZA 2E1SA 1KU9A 4ENMA 3UIFA 3V4GA 3E6CC 3ABUA 3C32A 4F3BA 2O1MA 4GLIA 1Z1DA 3KJTA 2GZWA 2P0SA 1JE8A 2X7QA 1JHFA 5ISUA 4ZEFA 4LATA 1SFUA 1MS7A 3O9PA 4LJZF 1IXHA 4O3MA 1SD3A 4Y15A 5ED4A 3PD9A 2VGQA 3KLOA 1SYIA 3W6JB 2F34A 4U23A 1MM7A 1SVXB 4XIGQ 3IB1A 5KCJA 2FQ3A 2VT2A 1J2XA 4HF0A 4AIKA 1QBJA 4WEPA 1YYVA 3QUJA 2ZYMA 4M71A 1YW8A 3H3GA 4M1VA 1VSOA 3P9IA 3FM5A 4GYGA 3F22A 5DYMA 1HW1A 3U93A 1FSHA 4HW0A 3RPUA 2D5WA 1J75A 2PX1A 4HDVA 3F8NA 4ESFA 4OOIA 1OVBA 4POWA 2VBWA 2VT3A 5E1XA 4LK0F 3ILUB 5CRYA 3BDDA 1BC7C 4ESJA 4U2RA 3K01A 4OEVA 4M6YA 1R6ZA 4RY1A 4UV8A 2XXRA 2C6YA 4U21A 4G7OF 1O64A 2P6SA 1MDMA 3FGSA 1ZLKA 3KJ7A 1G3SA 4P9FA 1B7UA 1MKMA 1FZPB 3RYPA 1X3UA 4IGRA 3O6HA 2OA4A 5JVTA 4OVJA 5L8DA 1H0MA 4ENJA 1SFXA 2O8XA 5FGMA 3IO6A 4XRFA 3REOA 1MY1A 3F8BA 5BQTA 4EUOA 1MGTA 3K1PA 3JZJA 5CMCA 1LAXA 4I2OA 4A0ZA 2HAVA 1XSVA 4KYEA 3ECRA 3IR1A 3LAJA 2HFBA 1XC1A 1E17A 4Y13A 4G2ZA 4QHQA 2DS9A 2HOEA 1B5IA 4GD5A 4F18A 1DPRA 3TO9A 3RPQA 2ALUA 5TP9B 3T22A 3CFZA 5FHOA 3S4UA 1IITA 4QFOA 1B3HA 5DD8A 4YG2F 5IT9K 1SW4A 2F7CA 5L9SA 2H4IA 3G3JA 3MVZA 2IW5A 1IXIA 4I62A 2BBYA 4G8HA 3W6KB 4EGYA 1SD7A 4GFRA 4LQ5A 3ZPLA 1B59A 1I27A 2IA4A 1BBYA 2P5LC 4P0IA 2GQQA 1PC3A 3K0VA 3SZPA 4Z0IA 2F5EA 3BY6A 1YLFA 1P99A 1BIAA 2D1HA 4NTLA 2L54A 2FSWA 4OTEA 5DTBA 3ML6A 2O03A 2ELHA 5D5UB 1FTKA 5CVIA 1LNWA 4M9SA 1USSA 1P1NA 3G3HA 1T0FA 3Q9SA 5KVRA 4F2QA 4OETA 1ZG1A 1RUOA 1LAHE 3MZBA 2CSOA 1A04A 4D0PA 4CXFA 5BPIA 3CUOA 4F1YA 5LGNA 2JTVA 1B58A 1VTNC 3GWZA 3V83A 2V9VA 2ZFWA 1XB4A 2CWEA 5B70A 5CLSA 1N76A 4NF5A 1B46A 3P7NA 3QU6A 1FSEA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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