3JV9A

The structure of a reduced form of oxyr from n. meningitidis
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
216
structure length
216
Chain Sequence
EGAFKLGLIFTVAPYLLPKLIVSLRRTAPKMPLMLEENYTHTLTESLKRGDVDAIIVAEPFQEPGIVTEPLYDEPFFVIVPKGHSFEELDAVSPRMLGEEQVLLLTEGNCMRDQVLSSCSELAAKQRIQGLTNTLQGSSINTIRHMVASGLAISVLPATALTENDHMLFSIIPFEGTPPSRRVVLAYRRNFVRPKALSAMKAAIMQSQLHGVSFIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Transcriptional regulator, LysR family
publication title The structure of a reduced form of OxyR from Neisseria meningitidis
pubmed doi rcsb
source organism Neisseria meningitidis
molecule tags Transcription
total genus 46
structure length 216
sequence length 216
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-09-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3jv9A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3jv9A02
4R9GA 3O2AA 3KEIA 5KCJB 4H0WA 4LQ5A 1M5FA 2GHAA 3RTWB 3LUYA 1SI0A 2I48A 5FTIA 2Q9TA 4H8IA 3M8UA 1UTBA 3VFJA 3HCQA 3H7MA 4H1XA 3QK6A 4X1BA 4GXSB 4GOTA 1AL3A 3S2VA 1UTBB 2ZYOA 3E9XA 2B3BA 5KDTA 3C4MA 4M4GA 2H5YA 5KDTB 3CIJA 4YAHX 2AIXA 3PMVA 3IR1A 4O3AA 4KQPA 4QRZA 2HAUA 2IA4A 4RYAA 3I5OA 5HM4B 2QSXA 4GFRA 3L6HA 1MPCA 1B4ZA 2A5SA 1B4HA 1Z7ME 4R72A 1FW0A 4ESXA 4PFTA 1NFTA 2V25A 1EH3A 4YMBA 4EF1A 1IQ7A 1B0LA 4NF8A 1B3LA 4DXBA 3RTFB 2I3WA 4EDPA 3Q28A 4NF8B 3RY3A 3E4RA 1IIWA 4YB6A 2AL4A 3ODBA 4KD5A 3KGCA 2F97A 3ZSFA 1O7TA 2XXVA 4P0GA 5F7VA 2I4BA 3O9PA 4BDQA 1POY1 1FQAA 1B2HA 2OBGA 3VVDA 2Z8DA 4C0RA 1ANFA 2X26A 3IB1A 4GIZA 4U2RA 1PC3A 4RXLA 2F7BA 4MBPA 3O66A 3KSJA 2Z8EA 4F29A 4WXJA 1XOCA 4R6KA 5L9MA 2DOJA 4P0IA 3OO6A 1PB8A 1LFHA 2F7CA 3GBAA 3PGFA 4AQ4A 1LAHE 4Q0CA 3OEMA 3VLUA 3HV1A 4OTEA 3V83A 1H45A 3K00A 3O6GA 5BUUA 4F31B 1B3GA 4H5GA 2HXWA 3DLNA 1B32A 3S9EA 3U8QA 1MQJA 4BDNA 1H44A 3ONMA 4U1OA 4GD5A 4RNSA 1FQCA 2O68A 3FVOA 4F39A 5I2NA 2PBWA 4BDLA 2GRVA 3TAJA 2RC8A 5I2NB 1WVJA 3KJTA 3UORA 1ZTYA 3K6VA 1QUKA 4G68A 1ZU0A 1ZIUA 3HSTA 1EU8A 3M3FA 3FXRA 3EQ1A 3VXCA 3R26A 4NWCA 2DP8A 2R6GE 1P1UA 3TCHA 4GQOA 2DXYA 3IX1A 3FATA 5AA2D 5KZTA 2VOZA 2OZZA 4TLMB 4BDMA 2XXTA 3S9NC 4F1UA 2OCUA 1B7ZA 2XXQA 3D4CA 1B3FA 4C1TA 3PMXA 3C36A 3C34A 2Q2CA 2VD3A 4DXUA 2Q8JA 4AB5A 1ZJLA 4QF9A 3TZAA 5DVFA 5CC2A 2LAOA 3RT8A 1MM6A 4EQ7A 1I6BA 3TTRA 4X1DA 1Y4TA 3KSXA 3WAFA 4K3FA 1I6AA 1VE4A 1FQDA 3QSLA 3ZKLA 2HFBA 4R73A 2QS2A 3FXUA 4OFLA 3VXBA 5CMKA 4C1UA 3Q25A 3OELA 4R75A 5ITPA 1POTA 4FIMA 3MUQA 3JZJA 4ZEFA 4ELOA 5K2XA 3IOTA 1UQWA 2E0SA 3CG3A 3TFLA 3GLBA 3KN7A 1MY0A 3C33A 2ZNUA 3IO6A 1II5A 3MVWA 2IEEA 2F35A 2QMWA 1FQFA 3Q29A 4HCWA 3TELA 4JWXA 4F3BA 3VVFA 1B46A 2YJPA 3OD7A 1QUJA 4U1ZA 3FVNA 3IL1B 1Y3NA 1AH5A 4H6DA 5IKBA 5CRYA 4OWDA 3MZBA 1YTVA 2V3QA 5ICTA 5AA2A 1AMFA 1PEBA 4GL0A 1RYOA 2E1SA 1N3XA 2RCAA 4LQ2A 3C35A 4E0XA 1VSOA 5I57B 1QUIA 1A99A 4EXKA 1Y1ZA 5H8FA 1HSLA 2ZMBA 1H3DA 3SEXA 2VGQA 3FASA 4HW8A 1FQBA 3TQWA 1N0TA 2XXPA 2ESNA 1MPBA 3O6HA 3B6TA 4Q30B 2O7UA 1HSJA 4QFOA 2QS3A 1R6ZA 3G3HA 1DOTA 2FA7A 4IB2A 5CMBA 3TUSA 3UK4A 4FJPA 2ZNTA 3LC8A 3H03A 1NH8A 4R2BA 2DYXA 2OLBA 3RUMA 3EHUA 3SEWA 1JQFA 1OQHA 3T96B 4G77A 1US5A 3E3KA 4YKKA 3IO4A 1SI1A 3O97A 5ICQA 3H3GA 5JEIA 3LSXA 5B70A 4KPTA 4DE8A 1L5TA 3KJ7A 3LSWA 1KWHA 3VLWA 1Y9UA 3KOTA 4R6HA 2I3VA 3GZGA 1DPEA 2H9BA 2G29A 4POWA 3KOSA 1Y1MA 1MH3A 5B7DA 1MXZA 2CZLA 1JETA 3PPOA 2HQ0A 1SDXA 1SW1A 3PPRA 3RNNA 1R9LA 1R9QA 3FJ7A 4X9TA 4ZS9A 1B51A 3B7DA 2RC7A 5I59B 3IJXB 2Y7PA 1ZKBA 2RKMA 2X7QA 4LONB 3G3GA 1LFGA 3K0VA 5M2VA 1PB9A 1TWYA 4DXCA 3MAMA 3G3FA 2HZLA 5KCJA 4F18A 4ZDMA 3TEPA 1MXWA 4F3SA 1J1NA 4OXVA 3CFLA 3HO7A 3K6XA 2QJEA 4OQOA 3TCGA 1IUDA 2GH9A 3K2DA 3C32A 3MP6A 3F11A 3H06B 4QFLA 1TT1A 1B1XA 4ONYA 4XKPA 2DSFA 3QUFA 1A7LA 4FAJA 5I84A 2UYEA 5BWJA 3FVKA 1N7XA 1UIUA 5ISUA 1A54A 5H8QB 1LB9A 2RINA 1S7YA 2XXUA 2D5WA 4NEDA 1IXGA 2B3FA 3SETA 4XKQA 1LB8A 1B05A 1D4NA 3VE1B 1F9BA 2XXIA 4R6YA 3MWBA 4PFWA 1B6HA 3EF7A 4NF5A 5CBRA 2I4CA 3TYHA 2F6GA 3RLFE 4DZ1A 1B0HA 2HEUA 4DCXA 4NF5B 3FD3A 2DE3A 1YPNA 3EN3A 2AL5A 2AYSA 4IO4A 3PMWA 2WKYA 2DXRA 5CMCA 3P7IA 3TQLA 3MW0A 2Y7WA 4OZ9A 3MZ9A 3U1OA 4HTGA 1ATGA 1B5HA 1XT8A 3FV2A 1PB7A 3CI8A 3G3JA 3KFMA 3ILUB 3UA8A 2F36A 3U72A 5I2KB 4QFNA 1SQYA 3ECRA 5AA4A 3UIFA 3SESA 3MVXA 2H25A 2NVUB 1IXCA 1LAFE 4LVQA 1FTLA 5AA4B 1LAXA 3TTKA 1S50A 1SD3A 1URGA 2H4IA 3GBBA 5ITOA 3T66A 4OENA 4MLQA 4UACA 2PT2A 3K6UA 1O64A 3OSRA 2THIA 1BIYA 4H65A 2QRYA 4ZECA 5TU0A 1B5IA 3MP1A 3C31A 4OFOA 3IB2A 1R1NA 4MF3A 1A8EA 3N26A 4OVJA 3FVGA 2RC9A 4L17A 2YLNA 4R9FA 2H98A 4I62A 1MS7A 4RPNA 3OMBA 4YKJA 3ILTB 4TQUQ 1NMUA 1OQGA 2NWJA 4IO7A 4OERA 1M5DA 2H99A 1SW2A 1B5JA 3KN8A 4TOZA 4LATA 1MQHA 4PFYA 2ZYMA 4JDFA 1B40A 4NTLA 4ZE9A 3B6WA 2VHAA 4GL8A 1H43A 3FV1A 4H8JA 2G93A 4LP2B 1Y4CA 3DM0A 4G2ZA 4I9DA 4GF8A 2XX7A 4IO3A 2HCAA 5FHNA 4UA8A 4KCDA 1XC1A 4ESWA 3H6VA 3MVZA 3N6UA 1SVXB 4BDRA 1I69A 4N13A 4OEVA 2NOOA 4NF6B 3GXAA 3OEKA 1Q1KA 1MM7A 3E13X 1Y3PA 3DP4A 4POXA 2RF1A 3PV0E 3U93A 2FYIA 1A40A 4GLIA 2DQVA 2Q88A 1OLCA 4G8MA 3MPKA 1LCTA 4RJZA 3THIA 1LSTA 4F1YA 4R74A 4U4SA 2XXRA 1USYH 3QAXA 1USYE 4G8NA 1VR5A 3OSQA 1GGGA 3BFTA 3B6QA 1YAEA 4IGTA 1JVYA 3K4UA 2I49A 4GVOA 3H6WA 3G3IA 3TMGA 4EXLA 3IOUA 1S9TA 4ZZEA 2I6EA 2V3TA 5AA1A 2ZYKA 2GHBA 1Y20A 4ZEDA 3IAZA 1IITA 4HCYA 3VVEA 5CM6A 2QS4A 1OVTA 2DWAA 3RT6B 1SW5A 4X48A 3K1NA 5DT6A 4WEDA 1D9YA 1MY2A 3H4ZA 3TTLA 4ZEBA 4P11A 1XVXA 4FEBA 1MXVA 2REJA 1ZMGA 3LBSA 4IO5A 3N6TA 5EHSA 5I57A 1NNPA 4O3BA 4EQ9A 4GWOA 2DWHA 1EZOA 4BLAA 2PT1A 1BP5A 4NE4A 3S9MC 1MDQA 2XD2A 3VLVA 5K2YA 4ND9A 4KYEA 4XKRA 3OXNA 4F22A 5FHOA 1QKBA 1I6QA 2NXOA 4XIGQ 3PPPA 3PUVE 3A09A 2DS9A 4G68C 2UVIA 3T22A 4MLVA 5I56A 4MH5A 3MPLA 3BBRA 1QJMA 2ANJA 1OIBA 4ELRA 4NF4B 5I56B 4ISUA 3D4GA 5HPQA 4IY6A 3S4UA 1Y3QA 2QPQA 1SYHA 2ONSA 1LBBA 4DDDA 1QVSA 1MY3A 2R9JA 2F6PA 4F2QA 3RPWA 1M5BA 1LLSA 1RYXA 2UXAA 4AB6A 1CB6A 1ZBMA 1MG1A 4OMBA 1B1HA 1US4A 1VFDA 1HSEA 5L9SA 3FIRA 4QHQA 1Z7NE 3G7WA 1QW0A 2OJTA 4JWOA 3K6WA 1SBPA 4FATA 4YKPA 2GFEA 5I59A 1XHYA 2ONKE 3SEYA 5TPAA 3IOVA 3PUZE 5DEXB 2O51A 1IXIA 2NUVA 4U21A 2Z22A 2Y7IA 4F1VA 2HAVA 4OESA 5TPAB 3WAEA 1JNFA 3U92A 2A5TB 2FNCA 4Q5TA 2V93A 5DTBA 2V3UA 1MQGA 4N07A 3RGYA 4ELQA 3I6VA 3TKDA 3FJGA 2F5XA 2F8DA 3V5AA 1TFDA 3CRBA 1O63A 4ZE8A 1MDP1 3W9VA 3QXMA 3RN8A 1IEJA 4EF2A 2UYFA 2XD3A 3MZ1A 4F3GA 5H8QA 5AA3A 2F7AA 1MXXA 5DVIA 2OWSA 4EQBA 5AE4A 1DTGA 1B3EA 1FTJA 4YB7A 3SEUA 3PPNA 1BKAA 2ALUA 2Q2AA 3PUWE 2YPNA 1JVXA 3UP9A 5DYHA 3O29A 1UTHA 1OVBA 2I0CA 3KZGA 2O69A 3Q26A 3T93B 3SDFA 1LBCA 1LAGE 3N94A 5IAIA 1UTHB 3AXFA 3FZVA 1MQIA 4RK2A 4ELPA 4EUOA 2VP1A 4NMYA 1JW1A 4WEPA 3PUXE 2DVCA 5J1DA 4Z0IA 2O1MA 4N6PA 1P99A 2O6AA 1P1NA 4JXIA 2DWIA 3PD9A 3S9LC 3PU5A 3PPQA 3CFZA 1JW5A 1IXHA 3QYTA 2BJJX 4U23A 2PVUA 3OOAA 1MY1A 5CI5A 2UVHA 5I2KA 1GV8A 1EZPA 2ZNSA 2XX9A 2P2AA 4JBZA 4FE8A 4H5FA 1N76A 4XKNA 4GRKA 1ELJA 2QL3A 3DP8A 3JV9A 4YU0A 3QIMA 2XX8A 4LZ5A 4JSOA 3VDFA 1WDNA 5H8NA 2ZYNA 3K01A 3MBPA 3SERA 3OO8A 4KCCA 5H8HA 4RY1A 1D9VA 5H8NB 2M8CA 4KYDA 5LOMA 1OLAA 1URSA 5JTYA 5H8HB 3SEVA 1YCJA 1OMPA 4KYSA 3HHFA 4QSCA 2PMSA 4HS7A 1JEUA 5JTYB 4LUBA 1B58A 1BTJA 3IORA 1N3WA 3CG1A 2REGA 4JB7A 3MQ9A 1JW4A 1M5CA 4QSEA 3FXQA 3TDJA 2XHDA 4RK9A 1DTZA 3V89B 1LFIA 3ZKKA 1PDAA 3K1MA 1DSNA 4PE5B 1B3HA 1NL5A 3CSGA 3T9XB 2F34A 1Q35A 4PETA 3RQTA 4O3CA 3CSBA 1A55A 3OENA 4DCYA 1NNFA 1XS5A 4FECA 1P1WA 4G4PA 2DVZA 1SYIA 2ONRA 3IK6B 2B65A 3MVYA 1VFEA 4OFJA 3CFXA 3OO9A 1DPPA 2Y7RA 3A3CA 3FGSA 3T9VA 1P1QA 3KBRA 1AIVA 4MFIA 3IOWA 4FORA 3T9UA 3M3KA 4NF6A 4G8HA 2X7PA 4R2FA 3USDA 4FEDA 5JK4A 4G68B 4ECFA 4THIA 4PP0A 2Z23A 1MXYA 3MC2A 3K1PA 2Z8FA 2HZKA 1EZ9A 4KI0E 4U4XA 2O7IA 4NWDA 3MP8A 4U22A 4TLLB 4I1DA 2R71A 1FQEA 4F19A 2F78A 3IJOB 3KN3A 3R6UA 3C9HA 4QFKA 4IO6A 1SW4A 3A3UA 5EHMA 5EYFA 4XTCQ 5A5XA 1JEVA 4YMAA 3JYRA 3QUJA 3VV5A 2V84A 3ZS6A 2W7YA 4IY5A 5A5XB 3BKIB 3UGWA 1UIVA 3T9HB 3L6GA 1QULA 1P1OA 5DVJA 1MPDA 2QS1A 1TXFA 2CMOA 4YICA 3EPEA 4OETA 1B7HA 1A8FA 2Y7KA 4LZ8A 4PQJA 1MY4A 2PX1A 3G3KA 1FTMA 1LGBC 1MRPA 4ZZAA 5CMMA 1XVYA 1N04A 4ZEKA 3FJMA 1M5EA 2P1SA 1T0KA 4M1VA 1FTKA 3CR9A 4Q8RA 4RA1A 4WKMA 5I58A 1D3KA 3BFUA 3HPIA 5L8DA 2DE4A 1PBPA 3PD8A 1N7WA 4XXUA 1N84A 2D21A 5L9OA 4PFUA 4KHZE 5I58B 3Q27A 4E0WA 1FTOA 4JWYA 3V8XB 2DWJA 2XXYA 2Y84A 3R7XA 3EHTA 3IB0A 3TTNA 3PUYE 1PBQA 4YKIA 1GR2A 3TCFA 1IZ1A 1FCKA 4KFQA 5AA2B 4QSDA 1NH7A 1WODA 2PYYA 2ABHA 5ELVA 2XXHA 3DELB 4DIGA 1BLFA 2UVGA 3TPAA 2DE2A 4RPOA 1MXUA 5H8SA 1NNKA 5H8FB 4ZEIA 4NF4A 5F1QA 2I0BA 3I3VA 4IGRA 2KLFA 2P0SA 1AOVA 4KR5A 3OO7A 3SKPA 2UVJA 1CE2A 1MQDA 3UN6A 1B9JA 2OWTA 1NNTA 4Z7EA 3FUZA 1GVCA 3LR1A 3LSFB 3W15C 3H6UA 4QFPA 1B7UA 3HHGA 1RKMA 1GTKA 1QKAA 3LSLA 2I58A 3O28A 5HBCA 3H6TA 4YZZA 5CBSA 1B52A 2ZXTA 3KG2A 5DEXA 4OHNA 3W9WA 4I8CA 4IO2A 4YB5A 1URDA 2D3IA 2A5TA 4BDOA 4F2OA 3U94A 4F3PA 2QMXA 3O6IA 4GXAA 1H76A 1DMBA 2XXXA 4LA9A 2Q89A 4LZ7A 4JSDA 4OEUA 3TODA 2RCBA 1LCFA 3N5LA 3DP6A 3CVGA 3EHSA 1ZLQA 5TP9A 2O1LA 2OK2A 5FHMA 3HN0A 3TTMA 2VD2A 5TP9B 1TFAA 3MJNA 3M3LA 1NKXA 1MH4A 2XXWA 3K02A 4OYVA 2O84X 4DLDA 5FTHA 4H67A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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