4U1OA

Glua2flip slbd complexed with kainate and (r,r)-2b crystal form c
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
ANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein, membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Structure and Dynamics of AMPA Receptor GluA2 in Resting, Pre-Open, and Desensitized States.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 86
structure length 262
sequence length 262
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u1oA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u1oA02
1M5EA 1H3DA 2FNCA 3FVKA 4GLIA 3S9NC 3ODBA 4ZZAA 1D9YA 5FTHA 4F2OA 3IOVA 4F39A 3CFZA 3FJMA 3OSRA 4EDPA 3TCHA 1XT8A 4ELOA 5FHMA 3G7WA 1USYE 2I6EA 3VXCA 4F3SA 1O7TA 1PB7A 2PYYA 3SEXA 4U1OA 3T9VA 3HPIA 2HAVA 4Q0CA 3K0VA 3C4MA 4OMBA 2PT1A 3QK6A 5ITPA 3Q29A 1LAXA 3U92A 2NWJA 4G8HA 4RY1A 4C1UA 4HCYA 1LGBC 1UIVA 1FQBA 5JTYB 3RGYA 4OHNA 1ZU0A 1MQHA 1IUDA 3CVGA 3A3UA 3PPPA 4NE4A 4F2QA 4O3BA 4I8CA 3S4UA 1NMUA 3TYHA 2ZMBA 3CFLA 4QFLA 1XVXA 1XS5A 3DP8A 5CMCA 1H45A 3PD9A 3FXQA 1R6ZA 1BP5A 2F5XA 2D21A 3MVWA 1N84A 4LP2B 1FQFA 3LUYA 3DM0A 1MY2A 1A40A 1HSJA 1FW0A 2P2AA 4PP0A 4FEBA 3CI8A 4NF5B 1A54A 3H6UA 4U22A 1A55A 3DELB 3K6VA 1VFEA 3Q26A 1J1NA 2OK2A 3FD3A 3O9PA 5ELVA 3FXUA 3N5LA 1L5TA 1URDA 4QSEA 3BFUA 3QYTA 3RT8A 3IJXB 4DLDA 3KEIA 1CE2A 4MBPA 3GBAA 1IITA 4QFKA 3EF7A 4JXIA 3U72A 1US5A 4E0WA 1H43A 4BDNA 3IL1B 4L17A 4ZZEA 3S9MC 4F31B 3IB2A 3L6HA 4X9TA 3PUWE 3A09A 2YLNA 1BLFA 3PPOA 1NL5A 4WXJA 4H6DA 1FTKA 3FATA 2HZLA 1IQ7A 2KLFA 4NF5A 3KZGA 4GFRA 4R73A 1OLAA 1FQAA 1B3HA 3OMBA 3SEUA 1N7WA 5CMKA 4GXAA 1MPDA 4BDMA 5IAIA 1VSOA 1B32A 2OLBA 1LBBA 4HW8A 1FQEA 1NNPA 4PQJA 2M8CA 1QKBA 5H8FA 1SQYA 3KBRA 4RK2A 3IB1A 3PUVE 4LQ2A 5DYHA 1B0LA 5ICTA 4R6HA 3F11A 1Y20A 3FVOA 1OLCA 2D3IA 3T9HB 3E13X 2RF1A 1XC1A 2QMWA 3FUZA 2RINA 1B7ZA 3HHFA 2QPQA 2X26A 4EF2A 3OO8A 3O29A 3EN3A 5I2NB 1B3FA 3CIJA 3O66A 4DCXA 4QFPA 1FTMA 3MZBA 3MZ1A 4RNSA 3V5AA 4QSDA 1URGA 4H8JA 4ESWA 3DP6A 2D5WA 3ILUB 1URSA 4C1TA 4YZZA 3MP8A 2QMXA 3VVEA 1MXWA 1O64A 2Y84A 3HO7A 2QJEA 3G3FA 4GF8A 1Y3QA 4PFYA 4IO7A 2AYSA 3USDA 4YKPA 1O63A 1IXCA 4G8NA 2Q89A 2V93A 4OFLA 2I0CA 1Y4CA 3IOUA 3MC2A 4OESA 4QFOA 2ANJA 1ZLQA 2F6PA 4MLVA 4Q5TA 3LSWA 4RXLA 1TFAA 5I2NA 4H8IA 4N07A 5M2VA 1FQCA 2VP1A 4DDDA 1MM6A 3K1NA 3MUQA 1M5FA 4OXVA 1UIUA 3PD8A 4G68C 1F9BA 1TWYA 1Y1ZA 2UVIA 4KD5A 1MXVA 3IO6A 2Q88A 2O1LA 3MAMA 1QULA 4H0WA 4MH5A 3KSXA 3T9UA 1JETA 3HV1A 3C33A 4F3GA 4KI0E 3FVGA 1MG1A 2V84A 2ALUA 1BTJA 1OQGA 3PU5A 2PBWA 4F3PA 1FQDA 1JQFA 3VFJA 5TP9B 3VVFA 1LFHA 1Q1KA 3SEVA 5L9SA 2ZNUA 3CR9A 1YPNA 2I4CA 2Z8EA 4LZ5A 4N13A 3WAEA 4JB7A 1SYIA 3G3KA 4YU0A 1ATGA 2XXTA 3K02A 4LZ8A 3PGFA 1I6QA 4LA9A 3W15C 1YCJA 2QL3A 2DWIA 4IO6A 2I3VA 1B3GA 5ICQA 3EHSA 4EQ7A 2ONSA 4ELRA 1JW5A 3FV2A 1DOTA 1ANFA 4LONB 4ESXA 4GQOA 3MWBA 3R7XA 2DP8A 4IY5A 5L8DA 5EHMA 4ZEBA 4MLQA 1ZJLA 4G4PA 4G2ZA 1EZ9A 2E1SA 2B65A 3KG2A 4HCWA 3H03A 1XOCA 1B6HA 4U4XA 3RTWB 3KFMA 3TZAA 5K2YA 2UYFA 4F19A 2RCBA 1A99A 4NF4A 4K3FA 2XHDA 4I1DA 3PUZE 4BDLA 4KYEA 4H5FA 4DXUA 3D4GA 1R1NA 2RC8A 5I58A 1IXGA 5EYFA 2P0SA 3THIA 5ISUA 2G93A 2Z23A 1N3WA 3B6TA 1LCTA 4GIZA 2XXRA 5KCJA 4FECA 3VVDA 2ONKE 3RUMA 3IX1A 1Z7NE 4WKMA 4JWYA 3MVYA 2O84X 4Q8RA 2VD2A 1B5JA 5A5XB 4UACA 1RYOA 1GR2A 4I62A 2GHAA 3BBRA 1N0TA 3V89B 5H8NB 3MP6A 2XX8A 3QUJA 5DEXB 3ZSFA 2O6AA 2B3BA 2Z8DA 1UQWA 4YICA 4FORA 3H6VA 2DE2A 1OVBA 5TU0A 1FTJA 2REGA 2DS9A 4U23A 4ZEFA 4TOZA 4IO5A 3PMVA 3KOTA 1MXXA 2Q9TA 2XXPA 4EQ9A 3VV5A 1P99A 2O1MA 1N7XA 1P1WA 4G77A 3T93B 2XXUA 3TEPA 2Z22A 4H65A 4ELQA 2PVUA 1PBPA 2A5TB 3VLWA 4YB6A 4GOTA 2ONRA 5A5XA 1NH7A 4GVOA 1QKAA 1I6AA 5H8NA 1B1XA 4OVJA 2F7AA 3C34A 5DEXA 2QS2A 5FTIA 2H99A 4HTGA 3H3GA 1B4HA 4OFOA 1WVJA 4KCCA 5L9OA 2HAUA 2GH9A 2BJJX 4OEVA 4JWOA 3BFTA 5AA1A 4EQBA 4R75A 3AXFA 1PB9A 3TCGA 3FVNA 4IO2A 1Y3NA 2CZLA 1FCKA 5EHSA 1H44A 4FATA 4IY6A 1AL3A 1B5IA 4R72A 1D4NA 2XD3A 1NNTA 1B1HA 2O51A 1Y1MA 3PPQA 5H8FB 3PUXE 4ECFA 2NUVA 3UN6A 2ZYOA 4HS7A 5CMMA 2ZYNA 2A5TA 5AE4A 4NF6A 3MBPA 1ELJA 4JWXA 3FGSA 3QXMA 2RCAA 2XX7A 5HPQA 4NEDA 1JEUA 3VE1B 1MXZA 3HN0A 2O7IA 1B51A 1I69A 4RJZA 3W9VA 1FTOA 2P1SA 1MY3A 4C0RA 3TQWA 4ZECA 2V3TA 1LFIA 1LCFA 1MXUA 1VE4A 4YB5A 3TTRA 2Q8JA 5DVJA 2XXQA 1MQJA 4QF9A 3DLNA 2IEEA 1MDP1 3MVZA 5KZTA 2PT2A 4RYAA 4KHZE 5HM4B 2V3UA 1PEBA 3QAXA 3UK4A 3UIFA 4JSOA 2QRYA 4MFIA 1Y9UA 3H6TA 3TCFA 4PFTA 4Z0IA 2X7QA 4OTEA 4DIGA 1LAGE 3TDJA 4ZS9A 2AL5A 1KWHA 3ECRA 1IXHA 1FTLA 4KR5A 1NNFA 5AA4B 3GLBA 3LR1A 1LSTA 2DVZA 5HBCA 1Y4TA 3I6VA 3OOAA 2OWTA 3RT6B 3KN8A 4F29A 1MY0A 1WDNA 1JVYA 1GTKA 1YAEA 4ND9A 4GRKA 5I59B 4ZEKA 1UTBA 2X7PA 1ZKBA 1BIYA 3RQTA 4IO3A 1IXIA 3LSXA 2PMSA 4I9DA 4KYSA 3UORA 1IZ1A 2Q2AA 3Q27A 4DE8A 3TAJA 3SEWA 1QUKA 4GL8A 4R74A 1M5BA 2O7UA 3C9HA 1Y3PA 3O6HA 5AA4A 4U21A 2VOZA 3SKPA 1R9QA 2DWHA 1ZBMA 5CBRA 1M5CA 3FJGA 5AA2D 2R71A 1B4ZA 3OO6A 1MM7A 5F7VA 1US4A 5LOMA 1B9JA 5I59A 5B7DA 2I0BA 3E4RA 2O68A 2F6GA 2UVHA 2E0SA 4R2BA 4EF1A 1WODA 3O28A 1P1UA 1B40A 4KFQA 3U1OA 2F7BA 1USYH 4POXA 1P1QA 4RA1A 3PUYE 3MP1A 3OO7A 4JDFA 1MQGA 2REJA 2I49A 2NXOA 3KSJA 4XTCQ 4NTLA 5FHNA 1LAFE 3I5OA 5TPAA 5AA2B 2HZKA 1LB9A 2DQVA 3P7IA 3V8XB 3IJOB 2A5SA 1OMPA 5H8SA 4AB6A 4LATA 4BDOA 3Q28A 1VFDA 3KN3A 3OXNA 1D3KA 3LSFB 1AOVA 3MJNA 4QFNA 2ZYKA 2H98A 4NF4B 2QS1A 3CG3A 1R9LA 1N3XA 2F78A 4R9FA 1P1OA 1QW0A 3RLFE 4OEUA 5JEIA 3MW0A 2DVCA 2CMOA 1JNFA 3M8UA 2XXYA 5I58B 3FIRA 3EHTA 1S7YA 3G3HA 4G68B 3QIMA 4JBZA 3C35A 4NWCA 3B6WA 5ITOA 1SD3A 3SDFA 3R6UA 4WEPA 3VLUA 2F7CA 5KCJB 3DP4A 2RC7A 4R2FA 1TFDA 1MY1A 3E3KA 4OYVA 1EZPA 5AA2A 3OSQA 5CBSA 4EXLA 3H06B 3TTLA 1ZTYA 2UVGA 5IKBA 4XIGQ 1DSNA 2UXAA 2I4BA 3S9EA 2FA7A 4BDQA 3B6QA 4R9GA 4DZ1A 3G3IA 3PV0E 1EU8A 3FV1A 3FZVA 1UTHA 4FEDA 4PE5B 2DXRA 3MPKA 2GFEA 3O97A 3MZ9A 3H6WA 2H9BA 4Z7EA 4G68A 1B58A 3E9XA 3QSLA 2OJTA 1N76A 1BKAA 3K01A 4GXSB 5I2KB 2XXXA 4FIMA 1II5A 4NF8A 4DCYA 4ELPA 1MRPA 2Y7PA 4P0GA 1SVXB 1I6BA 1LBCA 4ISUA 1RYXA 3FJ7A 3VLVA 4OQOA 2HCAA 1SI0A 3ILTB 3OELA 3M3LA 4X1BA 1DMBA 1A8EA 2DE3A 1PC3A 4Q30B 5FHOA 5DT6A 2ZNTA 2FYIA 5DTBA 4THIA 1D9VA 2F97A 2ZYMA 4OWDA 4F1VA 3PPNA 4QSCA 4YKJA 4P0IA 5K2XA 2H25A 4G8MA 4O3CA 4WEDA 2HEUA 2O69A 4GWOA 1QUJA 1IIWA 3T66A 2I3WA 4EUOA 3CG1A 3T9XB 5I2KA 4EXKA 4F3BA 3C36A 1Q35A 2QS4A 2F34A 4DXCA 3U94A 2ZXTA 3K6UA 3TMGA 3TUSA 3IO4A 1OVTA 4H67A 1S9TA 4NF6B 3I3VA 2Y7KA 3CRBA 1HSEA 3T22A 3IOTA 2HFBA 1NFTA 4YB7A 2ZNSA 2V3QA 1B3LA 4YKIA 2VGQA 1JVXA 3IAZA 3N26A 4R6YA 3GXAA 2XD2A 1XVYA 1A7LA 1DPPA 4OETA 1MH4A 1ZIUA 3UGWA 2VHAA 3TELA 2F36A 3KN7A 1RKMA 4PFUA 3TTKA 3CSGA 1JEVA 4ZDMA 4BLAA 1OQHA 3BKIB 2YJPA 3ZKLA 2W7YA 1SDXA 2NVUB 1GV8A 4U1ZA 5H8HB 3TTNA 5JTYA 2DWAA 4FJPA 2DXYA 1H76A 2HQ0A 4NWDA 3N6UA 3HSTA 3MVXA 4TLLB 3VDFA 3C31A 5JK4A 3K4UA 2AIXA 4ONYA 1PDAA 1GVCA 4ZEDA 3EQ1A 4LZ7A 4YKKA 2QS3A 2YPNA 4X48A 4RPOA 3HHGA 2R9JA 1QVSA 2OCUA 1B7UA 5CC2A 1SW1A 2LAOA 4BDRA 4QHQA 4OFJA 2QSXA 1LFGA 3H4ZA 4RK9A 1UTBB 3LSLA 1DPEA 3TFLA 3M3KA 4DXBA 3ZKKA 4GD5A 4AQ4A 5CI5A 1NH8A 3U93A 1POY1 3RN8A 1NNKA 5H8HA 4ZEIA 3PMXA 4ZE8A 2VD3A 4YMAA 2XXVA 4FE8A 4LQ5A 3GBBA 3JZJA 3FXRA 1SBPA 5I84A 2ESNA 2Y7WA 1MPBA 1S50A 1OIBA 1B52A 4UA8A 3OENA 1TXFA 3TQLA 5J1DA 3S9LC 1SW5A 4TLMB 3WAFA 1B3EA 1SW4A 3IORA 4PETA 1MDQA 3O6IA 1JW4A 4XKRA 2ABHA 3UA8A 4F22A 3OO9A 3ONMA 1MQIA 4NMYA 3RTFB 3O2AA 5I56B 3JYRA 4IO4A 3SEYA 4LVQA 4XXUA 4KCDA 4XKPA 3RPWA 5KDTB 3VXBA 3LBSA 5L9MA 4U2RA 4YAHX 3W9WA 5BWJA 2XXWA 4LUBA 3JV9A 5DVIA 2DYXA 1SI1A 2UYEA 1Z7ME 4JSDA 1N04A 1MS7A 5TPAB 3TKDA 3PPRA 4H5GA 3RNNA 4POWA 3B7DA 1MH3A 3KJ7A 4O3AA 5AA3A 3LC8A 5BUUA 1T0KA 4P11A 2OBGA 3N94A 2OZZA 4ZE9A 1JW1A 2RKMA 1P1NA 2R6GE 4F1UA 1MXYA 2IA4A 3KJTA 1QJMA 2G29A 2UVJA 1M5DA 4F1YA 3RY3A 4FAJA 3EPEA 3KOSA 5I56A 2XXIA 1HSLA 2GHBA 3C32A 3OEMA 1AH5A 3PMWA 2THIA 3IK6B 3GZGA 1A8FA 4R6KA 4IB2A 1MQDA 3CSBA 1DTZA 2F8DA 5KDTA 3EHUA 4TQUQ 3S2VA 2Z8FA 1NKXA 4M4GA 3TPAA 3KGCA 3Q25A 3OEKA 3CFXA 4PFWA 3IB0A 1B2HA 2XX9A 3ZS6A 3UP9A 3O6GA 4IGRA 2Y7IA 3TTMA 1B7HA 5F1QA 4F18A 1PBQA 2AL4A 3TODA 4OERA 2OWSA 1MPCA 3QUFA 3HCQA 4GL0A 2DE4A 1TT1A 3T96B 1UTHB 1LB8A 2H4IA 1LLSA 3SESA 1MY4A 5CMBA 4M1VA 3K6WA 3A3CA 1AMFA 5CM6A 1POTA 2WKYA 4KPTA 2NOOA 3G3JA 5CRYA 4KYDA 4IGTA 3K1PA 4RPNA 1EH3A 3IOWA 4OENA 1CB6A 3MQ9A 2F35A 5DVFA 1VR5A 2I58A 5B70A 5I57B 4KQPA 4NF8B 1SYHA 5H8QB 3K00A 3OD7A 4OZ9A 2PX1A 2HXWA 4MF3A 1LAHE 2DOJA 4XKNA 1B46A 3K6XA 1XHYA 1SW2A 4AB5A 1B5HA 5TP9A 3SERA 3IR1A 3V83A 1GGGA 1B0HA 4N6PA 1B05A 4H1XA 4X1DA 3R26A 3H7MA 2XXHA 1PB8A 1DTGA 4E0XA 2Q2CA 2I48A 3U8QA 1AIVA 3M3FA 3FASA 1EZOA 2DSFA 3MPLA 3D4CA 3N6TA 4U4SA 3SETA 3K1MA 3K2DA 2RC9A 5I57A 1YTVA 2DWJA 4XKQA 5H8QA 1IEJA 1ZMGA 2B3FA 1QUIA 2H5YA 3L6GA 2V25A 4YMBA 3G3GA 2Y7RA 2GRVA 4QRZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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