4U1OA

Glua2flip slbd complexed with kainate and (r,r)-2b crystal form c
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
ANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Structure and Dynamics of AMPA Receptor GluA2 in Resting, Pre-Open, and Desensitized States.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein, membrane protein
total genus 86
structure length 262
sequence length 262
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u1oA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u1oA02
4LQ5A 2V93A 3FV1A 1B5HA 4IGTA 3KZGA 3O29A 4XKNA 2Z8EA 1OLAA 4KFQA 5TPAB 3THIA 1WODA 4HCWA 2THIA 1N7WA 4YU0A 2F7BA 2RKMA 1BP5A 1H76A 2PVUA 1LAFE 4AQ4A 4YMBA 1QKAA 4O3BA 3FJ7A 3C31A 2NVUB 4IO5A 1FTMA 4JXIA 4H0WA 4OESA 5BWJA 3G7WA 4OFLA 1Y4CA 3KJTA 1ZMGA 1S50A 4HW8A 3FVGA 4N6PA 4PFTA 5J1DA 3IK6B 3OSRA 5I56B 2QMWA 4HCYA 1OIBA 2G93A 4ELOA 1PDAA 3TPAA 4R2BA 3FATA 3KN7A 2OZZA 3IB0A 4M4GA 4XKQA 4I62A 4LZ8A 4XTCQ 1P1QA 3HPIA 3U1OA 2ONSA 3PMVA 5AA4A 3Q29A 4YMAA 1NH7A 1EZOA 4PFYA 1S9TA 3DLNA 3UK4A 3HHGA 4F2QA 2OCUA 2QRYA 5AE4A 4RPNA 1Z7NE 4KCCA 2XD2A 1IXHA 2ZYOA 4F1UA 1LLSA 4JSDA 4THIA 4NMYA 3HO7A 1P1UA 3O28A 2H25A 1GGGA 4JWOA 4U1ZA 3W9WA 5ICQA 3W15C 4MBPA 5ELVA 1QKBA 2Y7IA 3IO4A 3K6WA 4FIMA 3DP8A 4G68C 2ZXTA 1LAHE 4QSEA 1S7YA 4BLAA 3B7DA 2XXRA 1EZ9A 2F8DA 2UYFA 2X7QA 1AL3A 3TEPA 1PBQA 4G8HA 3V5AA 5F7VA 3EN3A 2PT2A 1MPCA 1FQFA 3JYRA 3IB1A 2I49A 3TFLA 5DVJA 3B6TA 2XXPA 4DZ1A 4EF1A 2VGQA 1D9VA 3ZKLA 1A40A 1MRPA 2Y7KA 1R6ZA 2PYYA 3PUVE 3MUQA 3H06B 5DEXA 2UVIA 3DELB 4G68A 3FZVA 3N26A 1CB6A 3LBSA 4QFNA 2I6EA 4FECA 2HEUA 2XXWA 4HS7A 4OYVA 4BDMA 5IAIA 2GRVA 4JWYA 4MLQA 2O6AA 4N13A 1ZKBA 1PB9A 1FQCA 1NFTA 3N5LA 4Z0IA 1IEJA 4ESXA 1H3DA 4QRZA 1H45A 3BFTA 1LB8A 1AH5A 3K1NA 3W9VA 4K3FA 3EHUA 4TOZA 2HZKA 4C0RA 4JWXA 1BIYA 3EHSA 4Q5TA 3G3FA 3MQ9A 4JB7A 1P99A 4ELRA 2HAVA 4DXUA 4EQBA 1FTKA 1B1XA 2Y7PA 3CIJA 1N84A 2QS4A 2XD3A 3SEWA 3TYHA 3OO7A 1N3WA 4NE4A 3KN8A 5H8NA 4PFUA 2RF1A 3IJOB 3HHFA 1ZTYA 1M5BA 3G3IA 3PUZE 1B46A 3MVXA 2H98A 3Q28A 5F1QA 3RTFB 1B3FA 3RNNA 2O68A 3HCQA 3IOUA 3MPLA 1MH3A 1ELJA 3CRBA 1SI0A 3E13X 2ALUA 1DTZA 1VR5A 4DIGA 1IITA 1NNPA 3TKDA 4OVJA 3K6UA 4DE8A 4MLVA 3OO9A 4QHQA 2NWJA 4EXLA 3USDA 1B3GA 5AA2B 2QPQA 4KYSA 2Q9TA 1NMUA 3VVDA 2DE2A 4LONB 1IQ7A 1O7TA 1MXZA 3OEKA 1R9LA 2Q88A 5I2KB 1MQDA 4FJPA 4IO3A 3SEYA 5TP9A 3H6UA 4QFKA 1LBBA 4LZ7A 4IO7A 3VFJA 1QJMA 2XX8A 2PBWA 3OO6A 3PPOA 1UTBB 5IKBA 4KR5A 1NH8A 4RK9A 3TTRA 3UP9A 4U23A 1MQHA 3QYTA 1AIVA 4X1BA 1DPPA 3C35A 5KCJA 2UVGA 1Q1KA 3R7XA 2XXQA 1B7UA 3FASA 1B6HA 4NWCA 4NTLA 4RPOA 3PV0E 2RC9A 2XHDA 5I2NB 5LOMA 4EUOA 3TQWA 4POXA 5ISUA 1IXCA 1B58A 5A5XA 4E0WA 3M3KA 4ELPA 4GF8A 4F39A 2DSFA 1N7XA 4OQOA 1MXXA 2PT1A 2CZLA 3FV2A 3MVWA 5DT6A 4WEPA 2UVJA 2O7IA 4BDOA 1URSA 4RNSA 5L9OA 1A7LA 4NF4B 3TMGA 5CRYA 2GHAA 2VOZA 3OENA 2D3IA 5H8FA 3OSQA 2Q2AA 5FHOA 1QUJA 3Q27A 3T93B 4I8CA 2E0SA 5I59A 3ZKKA 4L17A 1SW4A 3K0VA 1TT1A 2O1LA 1B51A 5CMMA 3A3CA 1M5EA 4X9TA 4P0IA 4LA9A 1N76A 2D5WA 4F3SA 4GQOA 4U21A 3N6TA 1SW5A 3MVZA 1DPEA 4ZECA 1FW0A 4RXLA 3O6HA 1F9BA 1US4A 2X26A 4OERA 4YICA 1SYIA 5K2YA 1DOTA 1HSJA 4AB6A 3O6IA 1MH4A 3CSGA 4GRKA 2HFBA 3UGWA 4IO6A 4IO4A 1Y3PA 3FVOA 2NXOA 4EDPA 1JW1A 4PFWA 1BKAA 1SYHA 3BBRA 4NF5B 3IAZA 3MBPA 3CI8A 1POY1 1B4ZA 4UA8A 3SETA 1YCJA 4ECFA 3RLFE 2ZYKA 3N94A 3KN3A 4F3GA 5AA1A 2Q8JA 3T66A 2OJTA 3T9XB 1FQBA 3QK6A 3OOAA 3K02A 1MY2A 4JSOA 3KBRA 1URDA 4PP0A 3RT6B 2XXHA 2ONKE 4RYAA 4EQ7A 4Q30B 1M5CA 1LSTA 4KD5A 1O64A 5TU0A 3Q26A 2HCAA 1MY1A 4X48A 1EU8A 1NL5A 3UIFA 1AMFA 1MPBA 2DOJA 4TQUQ 1YAEA 1A8EA 1PB7A 5H8HA 3QXMA 1YTVA 2Y84A 2Z8DA 5DVFA 1B9JA 3TUSA 3I6VA 2I0CA 4DXCA 3JV9A 4R74A 1NNKA 4C1TA 4JBZA 3MZBA 1LFIA 5M2VA 5EHMA 1N3XA 2XXYA 1LGBC 1SBPA 4KYDA 2DWAA 3KSXA 2Z22A 2A5TA 2FYIA 1JW5A 1A8FA 2HAUA 3RQTA 3SERA 3TTNA 4TLLB 1P1WA 3K6XA 4I1DA 1UQWA 3IR1A 2OLBA 3IB2A 1ZIUA 2DQVA 2I3WA 2VHAA 5I58B 4YZZA 2F6GA 1IXIA 3MP8A 1A54A 3PMXA 3V8XB 4GWOA 4H67A 5JTYA 1IUDA 3BKIB 2QS1A 3WAEA 2DVCA 1MM6A 3UORA 1FCKA 4EF2A 4ZS9A 1GV8A 3ZSFA 2P0SA 3PPQA 3FJMA 1JEUA 2XX9A 1I6QA 4G77A 1EH3A 1KWHA 4NWDA 4UACA 4M1VA 2DWHA 2UXAA 3SDFA 1B0LA 2I0BA 2REGA 4Q8RA 1R9QA 1MS7A 1L5TA 2IEEA 2DP8A 3TQLA 1JVYA 4LZ5A 3FJGA 3P7IA 4NF6B 3AXFA 1Y3QA 3KOTA 2ZYNA 5I57A 4ZDMA 5ICTA 4FATA 3S9NC 1ANFA 3V89B 1MQGA 4P0GA 4F1VA 4DDDA 3HV1A 4RK2A 3H4ZA 2OBGA 1H44A 4QFLA 4LUBA 4NEDA 1LCFA 3VLWA 3BFUA 3D4CA 3HN0A 1FQDA 4F29A 3PUWE 1I6AA 4ISUA 4YKKA 3T22A 3DM0A 3PPNA 5A5XB 2CMOA 2ZNUA 4F19A 5HM4B 3TELA 1TWYA 3ODBA 3I3VA 4RA1A 3MPKA 5I56A 1MXUA 2QS2A 5JEIA 1SVXB 2Q89A 4YKPA 4BDQA 3PPRA 3TODA 1TFAA 2ABHA 3ZS6A 3S2VA 3OMBA 3C34A 4NF8B 3TTMA 4AB5A 1MDP1 4H1XA 2F6PA 1MXWA 3IL1B 1B3EA 4C1UA 4ONYA 1B7HA 5DVIA 3C32A 3DP6A 1AOVA 1FTJA 1EZPA 4I9DA 5B7DA 2H4IA 3IOTA 4WKMA 1FQEA 4DCXA 1JW4A 3TAJA 4YB7A 1VE4A 4QSCA 2PMSA 3VXCA 2OK2A 4OHNA 5DTBA 4ZEIA 4ELQA 2P2AA 5EYFA 3O66A 1M5DA 3MP1A 1MQIA 5AA2D 4LP2B 1UTHB 4FEBA 3M3FA 4F31B 2XXTA 4OXVA 4G2ZA 1SD3A 3VXBA 3FVNA 1MY3A 1MXVA 3MP6A 4LVQA 1Y9UA 1N0TA 2O51A 4GXSB 4GD5A 3RN8A 2Z8FA 2QJEA 2O84X 4ZZEA 1SDXA 3ILTB 4R6YA 1DSNA 3E3KA 1JETA 1LB9A 2Y7WA 4H65A 3RUMA 1MY0A 3GXAA 2QL3A 5CBSA 1JNFA 3GLBA 1O63A 1I6BA 3R6UA 3MAMA 2NUVA 2I4BA 1JVXA 1B2HA 3LC8A 4IY6A 3PD8A 1B0HA 4OWDA 3PD9A 5CI5A 1B05A 1POTA 2O1MA 3ILUB 3U72A 3C36A 3M8UA 3S9EA 1B5JA 3C33A 3O9PA 5CMCA 1PB8A 2F78A 2O7UA 5L9SA 5AA4B 3KOSA 2QS3A 4ZEKA 4DXBA 2VD2A 4OFOA 4YKJA 2QMXA 1LFGA 3IOWA 3RY3A 2XX7A 1JEVA 2AIXA 1MQJA 3CG1A 4GVOA 3U8QA 5CBRA 1SQYA 3CSBA 2VP1A 5FHNA 2F7CA 2ANJA 4LQ2A 4POWA 3IJXB 4MFIA 5KZTA 5H8QA 2X7PA 4KCDA 2YJPA 1LBCA 3FXQA 3QUJA 4YAHX 4LATA 1B52A 4GIZA 4OEUA 2KLFA 1HSEA 2YPNA 4X1DA 4WXJA 5FTIA 3SEXA 5FTHA 2ZNSA 1P1OA 3L6GA 1B4HA 1OQHA 1J1NA 1FTOA 1SW2A 2FNCA 3HSTA 4EQ9A 4E0XA 2DWJA 3VLVA 3JZJA 1CE2A 4KHZE 1B3HA 2XXUA 4WEDA 5DEXB 3TCFA 5AA2A 4F1YA 4YB5A 3QAXA 3FD3A 2LAOA 5FHMA 4KI0E 4FE8A 4G68B 3IX1A 3F11A 3TZAA 5CC2A 2W7YA 2HXWA 3K2DA 2OWSA 5I2KA 2GH9A 4H8IA 2DXRA 4F18A 5I57B 4R9GA 4R72A 2QSXA 4G8MA 2RINA 3K1MA 2I48A 1MDQA 3TCHA 3H03A 4N07A 1XHYA 4F3PA 3OELA 2V3QA 4QSDA 1UTBA 2Y7RA 1A99A 2A5SA 1B7ZA 1QVSA 3CFLA 3H6WA 1IIWA 4ZZAA 2REJA 4OETA 4OFJA 5ITPA 4PE5B 1JQFA 1USYE 4PQJA 3PUYE 5I2NA 2DVZA 3O6GA 4KQPA 3LSXA 3ONMA 4OZ9A 1BTJA 1QUIA 3CFXA 5L8DA 3RT8A 1LCTA 3OEMA 1WVJA 4IB2A 2HZLA 3B6QA 3LUYA 3VLUA 2PX1A 3EQ1A 1TXFA 2V3TA 4TLMB 2AL5A 3MVYA 3LSLA 5K2XA 3SKPA 2UVHA 2DE4A 5KDTA 5H8NB 3CFZA 3D4GA 3H7MA 1HSLA 4NF4A 3PPPA 4ZEDA 3TTLA 4F2OA 1Y1ZA 2G29A 4MF3A 1FTLA 3CVGA 2FA7A 3GZGA 4QFPA 3ECRA 4PETA 2F5XA 2H5YA 2NOOA 1XVYA 2XXVA 4F3BA 1SI1A 5I84A 4Z7EA 1D4NA 3Q25A 2GFEA 4XXUA 2ESNA 1OVBA 2DYXA 4ZE9A 2F35A 1RYXA 2IA4A 1US5A 3RTWB 2H99A 2R6GE 2B3FA 1VFEA 1NNTA 3FXRA 2F34A 1VSOA 2GHBA 1BLFA 3VVFA 1OQGA 1MM7A 3H6VA 5TP9B 3MZ9A 2V3UA 1Y1MA 3G3HA 4H6DA 4OMBA 4NF5A 3PU5A 1QUKA 2VD3A 4GFRA 4IGRA 3T9HB 3RGYA 3C9HA 1LAGE 1QULA 5TPAA 3VV5A 4ZEFA 3T9UA 1YPNA 3IO6A 5KCJB 1PEBA 3LSWA 3PMWA 5HBCA 3S9LC 1UIUA 5ITOA 1RKMA 1RYOA 1VFDA 4RY1A 3A09A 1TFDA 4H8JA 4ESWA 2E1SA 3U94A 1USYH 3UA8A 2DXYA 1Y4TA 3EPEA 3OD7A 1FQAA 4ND9A 3M3LA 3MZ1A 1R1NA 3FVKA 3O97A 4F22A 1B3LA 3K01A 4R6HA 3V83A 3VE1B 1A55A 5EHSA 4R2FA 2B65A 2XXXA 3QIMA 1XVXA 5H8FB 3U92A 3K1PA 1Z7ME 3IORA 3PGFA 1B32A 5I59B 2O69A 3FXUA 5BUUA 3K6VA 4IY5A 1LAXA 4OENA 1P1NA 2DE3A 1OMPA 3T9VA 2R71A 3UN6A 2M8CA 3EHTA 1MXYA 3S9MC 3MC2A 2RC8A 4MH5A 5H8QB 4GL8A 4U22A 3KGCA 4IO2A 3H3GA 1MY4A 2UYEA 2RCAA 1ZBMA 3CG3A 3RPWA 3SEVA 2WKYA 1LFHA 2F7AA 3QUFA 4U2RA 1B40A 1XS5A 2ZYMA 3O2AA 3FIRA 2Z23A 2DS9A 2R9JA 1Q35A 2V25A 4U4SA 5I58A 4YB6A 2I3VA 4RJZA 3SESA 4JDFA 3VVEA 2B3BA 1ZLQA 4YKIA 4O3CA 2F97A 2OWTA 3N6UA 4U4XA 1GTKA 1D3KA 1PBPA 3KG2A 4G4PA 4XKRA 1PC3A 1ATGA 3KFMA 1B5IA 1DMBA 3KJ7A 3U93A 3G3JA 2ZNTA 2P1SA 1I69A 3MWBA 5JK4A 1Y20A 1Y3NA 3WAFA 4OTEA 3OXNA 3EF7A 2D21A 2RCBA 4NF6A 3A3UA 4BDNA 3H6TA 2ZMBA 5AA3A 2Q2CA 1T0KA 2DWIA 2HQ0A 1URGA 3G3KA 2AYSA 4DLDA 4XKPA 1IXGA 5H8HB 3DP4A 4P11A 5CM6A 1IZ1A 3LSFB 3E9XA 4FORA 3PUXE 4DCYA 3FUZA 1GR2A 3MW0A 4R9FA 2BJJX 5DYHA 5HPQA 3KEIA 2V84A 4H5GA 4ZEBA 4BDLA 3OO8A 4FEDA 3VDFA 1XT8A 3K4UA 3QSLA 1DTGA 2AL4A 3C4MA 3G3GA 3R26A 3TDJA 4GLIA 2RC7A 4EXKA 3I5OA 5KDTB 4Q0CA 1GVCA 4H5FA 5CMBA 3MJNA 2A5TB 2XXIA 3IOVA 4R6KA 4QFOA 1MG1A 4R73A 4NF8A 1N04A 2ONRA 3CR9A 3E4RA 1WDNA 4R75A 3TTKA 3LR1A 2YLNA 5B70A 4OEVA 3B6WA 4GL0A 1II5A 1NNFA 1XOCA 1ZU0A 4BDRA 5CMKA 2H9BA 1MPDA 4HTGA 1NKXA 3GBBA 4FAJA 4XIGQ 1B1HA 5H8SA 4U1OA 3T96B 3GBAA 4GXAA 5JTYB 2I58A 1QW0A 2F36A 1OVTA 1D9YA 3FGSA 3L6HA 4O3AA 3K00A 1OLCA 3TCGA 4G8NA 1XC1A 2I4CA 1UIVA 3SEUA 5L9MA 3S4UA 1UTHA 3KSJA 4ZE8A 1H43A 4KYEA 4QF9A 4KPTA 1SW1A 1ZJLA 1M5FA 4GOTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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