4U1OA

Glua2flip slbd complexed with kainate and (r,r)-2b crystal form c
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
ANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure and Dynamics of AMPA Receptor GluA2 in Resting, Pre-Open, and Desensitized States.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Transport protein, membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 86
structure length 262
sequence length 262
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u1oA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u1oA02
4R9FA 4N07A 1P1QA 4NWCA 5I2KA 4MH5A 1MQDA 2ZNTA 3M3FA 1DPPA 4Q8RA 4EQBA 4WKMA 2WKYA 1N84A 4DXBA 4G4PA 3PU5A 3L6HA 4LQ2A 3H03A 3TCGA 2I49A 5I2NB 3I6VA 4UA8A 3U1OA 2I4CA 1OVBA 1MY3A 2E0SA 3UK4A 2KLFA 2Z23A 3U8QA 3VFJA 4PFTA 4R75A 2B3FA 3H6UA 4ESWA 4X48A 5JTYB 3M3LA 3E13X 3U93A 3IOWA 2UVGA 2PVUA 4KPTA 4F19A 5TP9A 3R6UA 1Y3QA 4ONYA 5EHSA 2O7IA 3IOUA 1JVXA 4DIGA 2DXRA 3LSWA 1IXCA 2Q9TA 3BBRA 3EQ1A 3MP1A 4EDPA 4P11A 1M5FA 3RNNA 1MPBA 1JW1A 1MDQA 2Z8EA 1PB7A 2F6GA 3THIA 5F7VA 2VGQA 4QF9A 2ZYMA 3K1NA 4IO6A 4DDDA 3RUMA 4ZDMA 4L17A 4KHZE 2E1SA 4EF2A 2GFEA 3WAEA 4OXVA 2ZYNA 3RLFE 3C35A 2HFBA 4KYSA 4QSEA 4G8HA 4GRKA 3O9PA 3KN7A 2FNCA 3ZS6A 3MZ9A 1I69A 2O7UA 4Z0IA 1LB8A 4KYDA 1XVXA 4POWA 1A99A 3PMWA 5L9OA 2I0CA 4U23A 5ITOA 4LUBA 3CVGA 3H7MA 4RPNA 3RT8A 1S50A 5EHMA 3TMGA 2NUVA 1B4HA 2QS4A 1JW5A 3GZGA 3ONMA 4EXKA 4NTLA 2F7AA 2P0SA 4LZ7A 1MY2A 1N7WA 2Y7WA 1N0TA 3SDFA 3V83A 1NNFA 1N7XA 2Y7PA 4RYAA 2REJA 3VV5A 5L8DA 4GL0A 1IQ7A 5H8QA 4ZZEA 3PUVE 3KOTA 1QUIA 1POTA 5FTIA 5I56A 1SW4A 2F97A 3RN8A 3K01A 2F8DA 1LSTA 4H65A 1MXWA 4NF6B 2RINA 3RY3A 2O68A 3VDFA 3OEKA 4F2QA 3C4MA 3N26A 1VR5A 2HZLA 3G3KA 3MP6A 3SKPA 4I9DA 1P1NA 1SQYA 1OIBA 3BFUA 3Q28A 1UTHA 4F18A 3O28A 1FTKA 5JK4A 4R9GA 4MLQA 1A8FA 4LA9A 1P1UA 1TT1A 3UORA 1UIUA 3LSFB 1D4NA 3V8XB 1B5IA 5DVFA 3Q29A 2DWAA 4ELOA 4MLVA 2BJJX 1ZMGA 3H4ZA 1LFHA 1NKXA 4K3FA 4M4GA 1ZLQA 2M8CA 4GD5A 4RNSA 5AA2B 1B51A 4R2FA 1VE4A 4H1XA 1IXHA 1MM6A 3KJ7A 2REGA 2YJPA 4H5GA 3R7XA 4C0RA 1GTKA 4FIMA 5DEXB 5K2YA 1MPDA 1M5CA 3R26A 4KI0E 2B3BA 2AYSA 2F35A 1Y3NA 2RCAA 3PMVA 1TXFA 4HS7A 4LVQA 5TU0A 1OLAA 4GF8A 3TCFA 4BDOA 3K1PA 4ESXA 3FJMA 2DYXA 3IAZA 5I57A 2AL4A 3C9HA 1F9BA 2XXWA 3VE1B 1Y20A 2XXRA 4Q5TA 3T9UA 1LFGA 4U22A 3MQ9A 1AH5A 4F3PA 3PGFA 5CMBA 4NF4B 4C1UA 3DELB 3RGYA 5AA2D 1PBQA 1B1HA 3G7WA 2ONSA 2A5TB 1LAFE 3PPOA 2XXUA 2G93A 3CRBA 4JWXA 2AIXA 3H3GA 1MXXA 3USDA 3S9EA 1JEUA 5DT6A 2Y84A 3M8UA 2PBWA 3VVDA 1P1WA 4FE8A 2PT2A 4U21A 1IUDA 4BDLA 1UTBA 5FHMA 5HBCA 1RKMA 1IXIA 4O3AA 4OFLA 2XX7A 4R6HA 1R9QA 3T66A 5AA3A 3K02A 3QK6A 4I62A 4F1YA 2I6EA 3OENA 3VLWA 5CMKA 4OESA 4JDFA 3RTFB 1B9JA 3MWBA 3MZ1A 4UACA 2F5XA 3B6WA 3PUXE 3KN3A 3FVKA 1MG1A 3IO4A 1T0KA 5TP9B 3UA8A 1ZTYA 1Y9UA 5L9MA 1NNTA 1B5HA 3IB0A 1B7ZA 3VVEA 1H45A 2ZNUA 4DE8A 3B6TA 2R9JA 1JNFA 1DPEA 3QSLA 4PQJA 3FVOA 1B05A 4JSOA 4G8MA 3UGWA 3LSLA 4EXLA 4QFPA 3FXUA 1GVCA 2B65A 4DXCA 3MJNA 2Z8DA 1EZ9A 4XTCQ 2DXYA 2QS3A 3C31A 3W9WA 3MVZA 3QUJA 4OEVA 3K6XA 4IGTA 2X7PA 3IOTA 2YPNA 3PPRA 1Y3PA 1LFIA 4JB7A 4PFUA 1Y1ZA 3CFLA 2F7BA 4TOZA 5CMCA 4P0IA 1ZIUA 3PD9A 3EHSA 1YTVA 4R74A 1D9YA 2Q8JA 5I59B 3OOAA 1IITA 5DYHA 1BP5A 1Q35A 3HV1A 3KFMA 1P99A 3IB2A 2YLNA 3QAXA 2PMSA 3RTWB 3VVFA 4ZEIA 2UVHA 2ANJA 3V5AA 3S2VA 3UP9A 1Z7NE 3FIRA 2V3TA 2RF1A 1PEBA 2ZMBA 1O64A 3TCHA 5LOMA 3VLUA 1H44A 2Z8FA 3KBRA 3IJOB 4GOTA 2XXPA 3UN6A 4QFKA 1JW4A 2D21A 5I56B 2PYYA 3S4UA 4F3BA 3N94A 1NH7A 3MVXA 3T9VA 1R9LA 2V3QA 2DQVA 3OSRA 4YZZA 3IOVA 2QS1A 1I6QA 3IB1A 3TPAA 2NWJA 3TKDA 3H6VA 3K6UA 4OFOA 3PPPA 4Z7EA 2XD2A 4G77A 3O6GA 2I48A 1US4A 1MH3A 1MQIA 4OHNA 4R6YA 1OQHA 4F3SA 1TFDA 4FAJA 5H8FA 1B3HA 3IK6B 4OQOA 4M1VA 2ZXTA 4ZE9A 1B3GA 4GVOA 1MRPA 1D9VA 2OZZA 4XKQA 2QSXA 5HPQA 1PB8A 4HW8A 2DE4A 1GGGA 5H8SA 1HSEA 4ZZAA 2ZYOA 3MAMA 4DLDA 3S9MC 4EQ7A 3CFXA 4ZEBA 4IO5A 1FQFA 1AOVA 1NMUA 2XXYA 1B4ZA 5CRYA 4G2ZA 2ZYKA 1YPNA 2RC9A 2DWHA 5M2VA 5JEIA 1XHYA 1RYOA 1SYHA 1LBCA 3ILTB 4XKRA 4HCYA 4C1TA 4YKPA 2QRYA 1ZBMA 4RJZA 1QUKA 4TQUQ 2P2AA 4WEPA 2XXHA 5I57B 2H5YA 5I2NA 4JWOA 3S9LC 2V93A 3PMXA 2THIA 1Y1MA 4G68C 3FJ7A 3CSGA 1SD3A 3G3JA 1DTGA 3O2AA 1B3EA 4IO4A 2VOZA 4NE4A 5ICTA 3O97A 4ELQA 1NH8A 1M5DA 1JVYA 4GWOA 2H99A 1LAGE 3MBPA 2HEUA 4FATA 3K4UA 1WVJA 3C32A 4O3BA 4QRZA 4OFJA 1WDNA 1QJMA 5CC2A 3C34A 3VLVA 4FJPA 2XXXA 2DE3A 1POY1 2A5SA 4MFIA 2H25A 1AL3A 1UTBB 1SW1A 3DLNA 2DP8A 4FEBA 1QKAA 4KQPA 3FVNA 1Z7ME 3U94A 2H4IA 3TUSA 3TTKA 5KZTA 4FEDA 4DXUA 2OWSA 5B70A 1FQBA 2O84X 1JETA 2R71A 2GRVA 4QHQA 1N3XA 3QIMA 3RT6B 2HAUA 5CBSA 2P1SA 4IY5A 3DP8A 4YB5A 2VD3A 4E0WA 4RA1A 3FV2A 4PFYA 2NOOA 3CIJA 2DSFA 1FTOA 1MH4A 3K2DA 3TODA 1B2HA 1YCJA 3W15C 5HM4B 2QPQA 3IL1B 1SI0A 1B32A 3OXNA 3GBAA 3TELA 1BIYA 1OMPA 3N5LA 1Q1KA 4GIZA 1CE2A 3IO6A 1B5JA 3OSQA 1BLFA 1PBPA 2RC8A 4MBPA 4U4SA 1TWYA 5ITPA 3ZSFA 4U2RA 4LQ5A 1OVTA 4H5FA 1QW0A 2ONKE 1XT8A 3PPQA 2UYEA 4GL8A 2OK2A 1VFDA 4YMAA 4RXLA 3P7IA 1SYIA 2I3VA 4GQOA 5H8NB 1DOTA 2GH9A 1R1NA 4THIA 2RKMA 2W7YA 5I58A 4H8JA 4IO7A 1MQJA 4OMBA 3HCQA 3K0VA 2RC7A 5I2KB 2ALUA 3CSBA 3D4GA 1O63A 3BKIB 1XC1A 3LBSA 5BUUA 2O51A 1FCKA 5J1DA 4GXSB 3CI8A 1FQAA 5KCJA 1J1NA 4F3GA 3AXFA 1NL5A 4DCYA 4BDQA 4YB7A 3FXQA 3I5OA 5IKBA 3SEWA 1MQHA 1ZKBA 3A3UA 5F1QA 4LZ5A 4BDRA 2DWJA 2ABHA 3HN0A 2O6AA 4RK9A 1ZJLA 2UYFA 3OEMA 4NF8A 4OWDA 5A5XA 2OWTA 4N6PA 4YICA 1MY1A 4QFOA 1CB6A 3OO8A 3OO7A 4U1OA 2FA7A 1FQCA 4IGRA 3A3CA 2DE2A 2Q88A 2CMOA 3JV9A 3KOSA 3MPLA 2XXQA 4XKNA 3LC8A 2I0BA 3HSTA 3SESA 1H3DA 1LLSA 3K1MA 1OLCA 3FZVA 1EZPA 4AQ4A 3O66A 1MPCA 3DM0A 1D3KA 4Q30B 3CR9A 5BWJA 4QSCA 2ONRA 1A7LA 3G3IA 3GLBA 3OELA 3MZBA 4H67A 4LONB 3TTNA 5H8FB 5AE4A 3Q25A 5AA4A 2QL3A 1DMBA 2Y7RA 4KFQA 2UVJA 2I58A 2I4BA 3OD7A 4X9TA 4OENA 1XS5A 5B7DA 2I3WA 2X7QA 3FVGA 4ZEDA 2QS2A 1TFAA 1B58A 1I6BA 1FTLA 3ODBA 5H8HA 4NF4A 4EUOA 1IEJA 5DVIA 2XHDA 1FW0A 1SW5A 3W9VA 1XVYA 4ZE8A 3S9NC 1H76A 2Q2AA 2A5TA 4BLAA 4IO2A 1IZ1A 3IX1A 2LAOA 3FD3A 1DTZA 4NMYA 1LBBA 2IA4A 4TLMB 4F39A 3MP8A 1MS7A 4ELRA 4R73A 4NEDA 4F1UA 2VP1A 3MVWA 5KDTA 2F78A 2XXIA 4ND9A 4OETA 4DCXA 4F2OA 3SETA 3UIFA 3O29A 3TEPA 1MXZA 1PDAA 3TTLA 1EU8A 4PETA 4RY1A 3QYTA 3DP6A 2HAVA 3KJTA 2OCUA 4PP0A 2F34A 4IY6A 1GV8A 4ISUA 5H8QB 3H6WA 1IXGA 3MUQA 3K6VA 4F1VA 3PUZE 1L5TA 4LATA 4AB6A 4OYVA 2FYIA 2XX8A 2UXAA 4EQ9A 3E4RA 3T22A 4FECA 1R6ZA 1B7UA 1B3FA 4YKKA 3B6QA 2OLBA 3D4CA 4GLIA 2NVUB 4OVJA 1H43A 1LCTA 3TYHA 1UTHB 2CZLA 2V84A 1NNPA 5TPAA 3ZKLA 1SVXB 4NWDA 2XX9A 5K2XA 3FATA 1LAHE 1DSNA 2O1LA 4BDMA 1AIVA 1II5A 2ESNA 4I1DA 2UVIA 4NF5A 4QSDA 4I8CA 1JEVA 4G68A 4ZEFA 1MXUA 1B52A 1EZOA 3A09A 4H8IA 4IO3A 3F11A 5ICQA 1S9TA 1SW2A 3HO7A 5EYFA 1USYE 3I3VA 2XXVA 4PFWA 2QJEA 1B3LA 4YMBA 3HHGA 3GBBA 1B1XA 3M3KA 1JQFA 1MDP1 3EPEA 1UQWA 3SEXA 1FQEA 1AMFA 3O6HA 3FV1A 4OZ9A 3SEUA 1B7HA 1B0LA 4R6KA 4X1BA 3LUYA 5I59A 2R6GE 4HCWA 1MY0A 3FASA 1M5EA 4O3CA 5DVJA 1BTJA 3JYRA 2AL5A 1PC3A 4KD5A 2Z22A 1N76A 4P0GA 4OTEA 1IIWA 4U4XA 1PB9A 3CG3A 5DTBA 3VXCA 1NFTA 3FUZA 4BDNA 3G3HA 2H98A 3TTMA 2RCBA 3U72A 3QUFA 1URSA 1OQGA 4EF1A 5JTYA 2Q89A 3KSXA 4ZECA 3KGCA 1EH3A 4WXJA 5I58B 3CFZA 3JZJA 4KCCA 1A55A 3G3FA 1SBPA 2GHAA 4QFNA 3PPNA 1USYH 3B7DA 3KEIA 1QUJA 3FJGA 3PUWE 1URGA 3WAFA 3QXMA 1FQDA 3GXAA 1GR2A 3SEYA 2DVZA 1US5A 2GHBA 5KCJB 1VSOA 4JBZA 2F6PA 2D5WA 3L6GA 1FTJA 4LZ8A 1LAXA 3EHUA 3KG2A 2VD2A 2F36A 1WODA 1VFEA 1ELJA 5CM6A 4POXA 3BFTA 4NF8B 5A5XB 1MXVA 1I6AA 3T9HB 1MQGA 2VHAA 4ECFA 1S7YA 2OJTA 3TFLA 4OEUA 1SI1A 4FORA 2HZKA 5FHOA 4KCDA 2G29A 3KSJA 4R72A 4TLLB 4YKIA 3OMBA 1B40A 3MPKA 5L9SA 1QVSA 1MXYA 5CI5A 3PUYE 4YB6A 3MW0A 4G8NA 2DVCA 3N6UA 3OO9A 2Y7KA 5ISUA 3T96B 1A40A 3IR1A 4YKJA 3FXRA 3TAJA 3KZGA 2PX1A 3K6WA 3EHTA 4R2BA 3OO6A 5AA4B 4GXAA 3G3GA 3IORA 1QKBA 1ZU0A 1HSLA 1MM7A 4PE5B 2H9BA 4ELPA 3RPWA 3IJXB 3SERA 3E9XA 4MF3A 4DZ1A 1Y4TA 3EF7A 3H6TA 4NF6A 3K00A 1B6HA 2DOJA 2V3UA 3HPIA 4H0WA 4F29A 4XIGQ 1YAEA 3TQLA 5H8HB 1MY4A 1SDXA 3C33A 3VXBA 4YAHX 3Q27A 5AA1A 2NXOA 4KR5A 4AB5A 4X1DA 2DWIA 4IB2A 3ILUB 3MVYA 3T93B 2Q2CA 2IEEA 1UIVA 5KDTB 1A8EA 4LP2B 3DP4A 2O69A 2D3IA 3TQWA 1URDA 4JSDA 1ATGA 1N3WA 2Y7IA 3ECRA 3U92A 3MC2A 3T9XB 1P1OA 2O1MA 1N04A 2V25A 4N13A 3PV0E 4ZEKA 3H06B 4RK2A 3TDJA 3C36A 5I84A 5CMMA 2HCAA 1XOCA 3TZAA 2XD3A 5ELVA 3FGSA 1NNKA 3SEVA 5AA2A 3TTRA 3RQTA 3E3KA 3O6IA 5FHNA 4HTGA 4Q0CA 1LCFA 4U1ZA 3PD8A 5DEXA 1O7TA 1BKAA 1LGBC 1HSJA 2OBGA 3EN3A 2QMXA 4KYEA 2XXTA 4H6DA 3LSXA 4F31B 4XXUA 1QULA 1FTMA 5FTHA 1ANFA 1B0HA 4ZS9A 1M5BA 4E0XA 3KN8A 4YU0A 1RYXA 2F7CA 5TPAB 2PT1A 3CG1A 4RPOA 2HXWA 3HHFA 5IAIA 4GFRA 3Q26A 4F22A 1LB9A 4NF5B 4QFLA 3N6TA 1Y4CA 4G68B 4XKPA 4WEDA 3V89B 3LR1A 2DS9A 2QMWA 1A54A 4OERA 2HQ0A 1KWHA 4JWYA 5H8NA 5CBRA 1B46A 2X26A 4JXIA 3ZKKA 2ZNSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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