5KDTA

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with gne0723
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
280
structure length
278
Chain Sequence
DNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGICH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
publication title Discovery of GluN2A-Selective NMDA Receptor Positive Allosteric Modulators (PAMs): Tuning Deactivation Kinetics via Structure-Based Design.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
total genus 82
structure length 278
sequence length 280
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-06-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5kdtA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5kdtA02
2DWHA 3PD9A 3TQLA 1S7YA 4TOZA 3O29A 1Z7ME 3O28A 3QXMA 4U21A 4G8MA 4F3GA 2ESNA 1QUKA 2H25A 1MY1A 1EZOA 4KYDA 3FVNA 4POXA 1QJMA 4ZE8A 1P99A 3W15C 2O84X 3RTFB 3B6WA 1NL5A 4OFOA 3MP1A 3OMBA 3MZ9A 1AIVA 2XXUA 5ELVA 2GRVA 2PVUA 1B05A 1M5BA 4BDLA 1WODA 4NWDA 1USYE 1BIYA 3ODBA 4OTEA 4X48A 5DEXA 4G8NA 1QKAA 3ILUB 4G68A 1MXVA 3VV5A 4R9FA 1SBPA 2R9JA 1Y3QA 3EHSA 2QS4A 3MW0A 4XKPA 4POWA 1O64A 1OLCA 3E9XA 1NFTA 3IO4A 1CB6A 1SW1A 3Q26A 3OO9A 3OEKA 4TLMB 1TFAA 4DLDA 1WDNA 4JWXA 1B3GA 2A5TA 3FVKA 2D5WA 4F1UA 2Z23A 1B40A 3L6GA 4ESWA 2BJJX 4HTGA 2DE3A 3K6XA 2O7UA 4GD5A 2PX1A 1SI0A 1B52A 1POY1 2I3VA 2XXTA 1RYOA 5A5XB 3VFJA 2X26A 3TTLA 2R6GE 2V84A 4GVOA 1Q35A 2Y7WA 4IO2A 5CRYA 4YKIA 3IR1A 1EZPA 1N76A 1ANFA 3CRBA 4PE5B 4BDQA 2OJTA 4YB5A 1B58A 1KWHA 1HSJA 4HS7A 2NVUB 5I2NA 5JEIA 3KN7A 3EN3A 1MG1A 1N7XA 1JNFA 4G77A 2P2AA 4YKPA 4R9GA 4AQ4A 3K02A 4X1BA 4KR5A 3C34A 4H6DA 1B32A 3HSTA 3I6VA 3MPLA 3GZGA 4OETA 1ATGA 1P1WA 2OWTA 2GH9A 2DE4A 3SETA 1LAFE 3TUSA 5EHSA 4I62A 5H8SA 4XKNA 5AA2A 3TCHA 2WKYA 2ONSA 4KD5A 1OQGA 3HPIA 1XC1A 2XXWA 4XXUA 2F7AA 5TPAA 3W9VA 3S9NC 1MH4A 3LUYA 4RYAA 2Q88A 3LR1A 1M5EA 1HSLA 5DVFA 4DDDA 3V5AA 4OMBA 4FIMA 3GBAA 4NF6B 3IJXB 2UVJA 1IIWA 2OCUA 3TAJA 2D21A 2V93A 1B46A 1MQDA 4ESXA 3PPOA 4PFYA 3BBRA 3TCFA 4E0WA 2DVCA 3VXBA 2QS3A 4IY6A 1PDAA 3RUMA 3IX1A 2ZYKA 4I8CA 4QFNA 3EHTA 2O68A 1DOTA 3PMXA 4DXCA 1D9VA 4ZEIA 3E13X 1B3EA 4I1DA 3MQ9A 5H8HB 1GV8A 4NF8B 3VLUA 4GF8A 3VVDA 2UVHA 3OO7A 4WKMA 2XXHA 4BDMA 5BUUA 1P1NA 5M2VA 2O51A 2FYIA 1US5A 3IB2A 3EHUA 4G68B 4RJZA 3CFXA 3F11A 3G3FA 4P0GA 2I58A 4NMYA 1US4A 3FIRA 2YLNA 4ZE9A 3QSLA 3ONMA 2F6PA 1MXYA 2ONKE 4QFLA 1SW4A 3LSFB 3N5LA 4U1ZA 3IOWA 4QHQA 1Y9UA 5ICTA 1H3DA 3G7WA 1OLAA 2FA7A 4C0RA 2ZYNA 3FXQA 4AB5A 3GBBA 4F1VA 5ITOA 4PFUA 3QUFA 4QFOA 3DP6A 3LSLA 1DPEA 4IY5A 1UTHB 4MF3A 4NEDA 4U22A 3RTWB 1LCTA 3O6GA 4DXBA 2THIA 3HCQA 3VVEA 3MWBA 3OD7A 3TTRA 3MPKA 1LAGE 4DE8A 1USYH 4DIGA 3K1PA 4Q8RA 1N84A 1II5A 2NWJA 1S50A 4F3SA 3FJGA 1AOVA 3Q25A 4QRZA 1A40A 4ELPA 3IORA 3GXAA 1J1NA 3K6VA 4O3CA 3H3GA 2XXQA 4WEDA 5CC2A 4R2FA 2I3WA 3TKDA 1XS5A 4C1TA 4FORA 3K1NA 4XIGQ 3LSXA 4OHNA 1PBPA 4X1DA 3PUWE 3FGSA 3TELA 2I0CA 2QS2A 1B5IA 1YAEA 1OVBA 4JDFA 3G3JA 4G4PA 3MUQA 4O3BA 2B3FA 1I69A 4ZEBA 3KOSA 4IO4A 1PB9A 2ABHA 1SW2A 1XT8A 3S9MC 3R26A 5HBCA 1A99A 1BTJA 1SD3A 1UTBA 2PYYA 3CFLA 5KCJB 3FATA 3DP4A 4F39A 4R6YA 5I59A 3PUVE 4WXJA 3H6TA 2DE2A 4F3PA 4OXVA 3FVOA 3T9VA 1SDXA 1WVJA 1JEVA 1FCKA 1A54A 3IAZA 4GL8A 1BP5A 4X9TA 3IOUA 3H6UA 1FTJA 4RPOA 4C1UA 3JV9A 3JZJA 2F35A 1URGA 5H8FB 3PPRA 5JK4A 1UIVA 3THIA 4O3AA 4LP2B 5CBSA 3VLVA 3H06B 3IB0A 4LZ8A 1FQFA 1GGGA 3UGWA 3IL1B 4Q5TA 3U94A 2RC8A 4ZDMA 3N6TA 2VP1A 1AMFA 5TP9A 3BFUA 2Z22A 3OOAA 4HCWA 1MXZA 1GTKA 1QUIA 2E1SA 3FD3A 1MY4A 1SW5A 2ZYOA 3M3KA 3CSBA 4JSOA 4Q30B 5I58B 4F2QA 2IA4A 1B6HA 2VHAA 3S9LC 1Q1KA 1MY0A 1B1XA 3TZAA 5AE4A 3MAMA 1Y4TA 4JSDA 5FTHA 4M4GA 3V83A 3C32A 1MDQA 2RKMA 1YTVA 3U92A 4EXLA 4GWOA 4ELQA 2OWSA 1ZJLA 3Q27A 3UP9A 4XKQA 4ONYA 3OSQA 3KN3A 4ELRA 3MVZA 3TTKA 1I6AA 1Y1ZA 3E4RA 5AA2D 4FEBA 4NF4A 3H6WA 4OYVA 4ZEFA 3OXNA 4IO7A 3TTNA 5H8NB 2B3BA 5CBRA 1FQAA 2ZNUA 2DWJA 2W7YA 4FAJA 1RKMA 3H7MA 4FE8A 1MPDA 5AA4A 3KEIA 1JETA 2DS9A 4YAHX 3JYRA 2Q8JA 3PU5A 1POTA 3O2AA 4R73A 4OEUA 3T93B 4H65A 1FTKA 3OO8A 4EQ7A 3DM0A 1IXIA 3H6VA 4QSCA 1D9YA 3FUZA 1N3WA 3MVXA 2XXYA 4IGTA 3CR9A 1IXCA 2ZNSA 4RPNA 2Y84A 2ZNTA 3PPPA 2O69A 4KCDA 2UXAA 3Q29A 4AB6A 1R9QA 4GIZA 4N07A 3TPAA 4LATA 1B7UA 3S4UA 4FEDA 5CMKA 3PMVA 2R71A 1MM7A 4KHZE 2B65A 3CG1A 4F19A 5K2YA 3FZVA 1DMBA 2X7QA 2ALUA 4NF5B 1P1QA 3PPQA 3SDFA 2ANJA 3RN8A 3M8UA 4R72A 2HZKA 1JEUA 2I6EA 2HAUA 3SEVA 1EU8A 5B7DA 4NE4A 4F18A 3KN8A 4R6KA 3TODA 1ZMGA 2GHAA 2VGQA 3KZGA 5AA1A 2Y7RA 3O97A 5I56A 3IOTA 4U4SA 3RLFE 1M5CA 2Q2CA 1QVSA 3K4UA 2XX7A 2GHBA 4H8JA 1B0HA 4RNSA 5TU0A 1JVXA 1OVTA 1LLSA 2XXIA 1MXUA 3Q28A 5F7VA 4ISUA 4P11A 5I57A 1N04A 4M1VA 5KDTA 3KBRA 3O6IA 3PGFA 2OLBA 5I2KA 3M3LA 3FVGA 4IO6A 5FHNA 3TTMA 5DVJA 1GVCA 3SEWA 4IB2A 5DEXB 4GFRA 2VD3A 3P7IA 1MXXA 3RQTA 1DTGA 1AH5A 2ZMBA 2O6AA 1FQDA 1ZIUA 4PFWA 1LAXA 2I0BA 4HCYA 3N26A 2I49A 4KI0E 1XOCA 1Y1MA 3MP6A 4Z7EA 4R2BA 2REGA 4MBPA 1CE2A 3DP8A 3H4ZA 4UA8A 2QS1A 3T9HB 2QRYA 1SVXB 2A5TB 1L5TA 5K2XA 3E3KA 1A7LA 4H8IA 1NMUA 1NH8A 2A5SA 3K00A 1JVYA 3KSJA 3MP8A 2XD3A 5AA4B 1Y20A 1O7TA 2AYSA 4NTLA 1PBQA 4GXSB 2F36A 3PD8A 3UK4A 5L9SA 4H1XA 2F6GA 3TYHA 4MFIA 3N6UA 1D4NA 1JQFA 5L9MA 3EF7A 5H8QA 2HZLA 1NKXA 1AL3A 1R6ZA 4QFKA 2V3UA 1S9TA 3HN0A 2AIXA 2XXRA 5I2NB 4MLQA 3G3KA 3O6HA 3D4GA 4LONB 2H5YA 3VE1B 3VDFA 1IUDA 2AL4A 2Q2AA 5A5XA 4LVQA 3TQWA 2QSXA 1LCFA 1PB7A 3PUZE 3L6HA 2UVIA 1YPNA 1VSOA 2YJPA 3IJOB 1IEJA 3USDA 2DP8A 5AA2B 2RINA 4RY1A 3LBSA 3T9UA 4ZEDA 2P0SA 3WAFA 4BLAA 2PT2A 1EH3A 4HW8A 3C4MA 1TT1A 3KJTA 5TPAB 4IGRA 1F9BA 4JWOA 4L17A 5CMMA 4KYSA 5CMCA 4OWDA 1P1OA 3S2VA 4OENA 1QW0A 2I4BA 3H03A 3R7XA 3BFTA 2OBGA 2ONRA 3MZBA 2YPNA 3QIMA 5DVIA 5HPQA 4TQUQ 4YZZA 3A3CA 3C9HA 2P1SA 4U2RA 1PB8A 3EQ1A 5JTYA 1JW4A 5F1QA 4QFPA 1LFGA 3HO7A 3VLWA 4ELOA 1B51A 2D3IA 3V89B 2RCBA 5HM4B 1M5FA 2I48A 3MVWA 2X7PA 1MPCA 4DXUA 3PUXE 1A8EA 1SYIA 4U4XA 4U1OA 1NNFA 2I4CA 1ZKBA 4GRKA 1B5HA 2NUVA 4RK2A 4F3BA 3ZKLA 2DYXA 1DPPA 1H44A 3PV0E 3SEUA 3K2DA 2PBWA 3KG2A 4DZ1A 4KQPA 5FTIA 4OEVA 3HHGA 4DCYA 3ZS6A 4I9DA 4KCCA 1FQCA 4GXAA 4MH5A 3D4CA 5L9OA 5H8HA 4GL0A 4THIA 2G93A 1O63A 4EDPA 3K6UA 4EXKA 4QSDA 3SESA 1MXWA 4NF8A 2XXXA 1ZU0A 3IOVA 4ZS9A 4BDNA 1NH7A 4G2ZA 1YCJA 3FJ7A 3CVGA 1LFIA 3WAEA 4PP0A 3K0VA 5L8DA 1B3HA 1IITA 3RNNA 3G3HA 3BKIB 1QULA 3AXFA 4U23A 1PEBA 3IK6B 1ZLQA 1P1UA 1A8FA 3I5OA 2HCAA 1TFDA 2DXRA 3FXRA 1B4HA 3ZKKA 2G29A 4H67A 4FJPA 1NNPA 2F7BA 1B7HA 1I6BA 3K6WA 4XKRA 4QSEA 5H8QB 2Q89A 2Y7KA 2F97A 5ICQA 3V8XB 4EQBA 2QMWA 1H76A 3FV1A 5KZTA 1LSTA 3CI8A 3RGYA 1H43A 3GLBA 2Z8EA 2PMSA 4LQ2A 1D3KA 2DWIA 1UTHA 1I6QA 3T96B 3B6TA 4BDOA 4PETA 4PQJA 1HSEA 2Z8DA 1URSA 2F78A 1OIBA 3RT8A 1DTZA 3EPEA 3OO6A 2LAOA 3G3GA 3N94A 4F31B 4R6HA 3KOTA 2XXPA 4K3FA 3SKPA 2OK2A 1XHYA 4OFJA 2DOJA 1N3XA 2VD2A 4LQ5A 4YKJA 1LB8A 5FHOA 1Y3PA 4JBZA 2CMOA 4Z0IA 1UTBB 1B3LA 1TXFA 2XD2A 3CFZA 1B4ZA 4N13A 4RXLA 1B2HA 5IAIA 5I59B 2E0SA 1VR5A 4EUOA 3KFMA 3DELB 1MY2A 4YB6A 3ECRA 3MBPA 4KFQA 4OQOA 1VE4A 1SYHA 4YMBA 1VFDA 3CIJA 4GOTA 1T0KA 2F5XA 5J1DA 3UA8A 4OZ9A 3OELA 2ZYMA 2IEEA 2O1LA 2REJA 3W9WA 5EYFA 2NXOA 3C31A 5JTYB 1OMPA 3TMGA 3U72A 3TCGA 2PT1A 3MZ1A 1FQBA 5KCJA 4ZZEA 3O9PA 4LUBA 2O7IA 3HHFA 3T9XB 4F1YA 5DT6A 2H9BA 2HFBA 4DCXA 3PUYE 4EQ9A 3U8QA 3UN6A 4KYEA 2HAVA 4ND9A 3A3UA 1FTOA 1H45A 1LBBA 4XTCQ 3K01A 5TP9B 1JW1A 3DLNA 1VFEA 3G3IA 4OVJA 4H0WA 4GLIA 3VXCA 5H8FA 2QJEA 2V3TA 1IZ1A 2AL5A 5CMBA 3B6QA 1B7ZA 2DXYA 2RC9A 4YB7A 2HQ0A 4YKKA 1OQHA 1LFHA 3OSRA 1N0TA 1FTMA 2XHDA 4OESA 1IXHA 3SEXA 4H5GA 1EZ9A 3KJ7A 4LA9A 3TDJA 3O66A 1M5DA 4E0XA 4RA1A 3C35A 1ZBMA 4G68C 2M8CA 4QF9A 4LZ5A 2UVGA 2XX8A 1IXGA 2RC7A 3VVFA 1ELJA 1Y4CA 3QAXA 3FXUA 2QPQA 3CG3A 5ITPA 1B1HA 4JWYA 2F7CA 4MLVA 1LBCA 1SI1A 3I3VA 1MPBA 5I58A 1MQJA 5I84A 2XXVA 4RK9A 3IB1A 1MM6A 1BKAA 4ZECA 4NF4B 2Z8FA 4FATA 3PMWA 3U1OA 5B70A 4KPTA 5ISUA 5FHMA 1A55A 4EF1A 2KLFA 3QYTA 3TFLA 1R9LA 4YICA 5DYHA 3ZSFA 3QK6A 4F2OA 1MRPA 1MQIA 2NOOA 1UQWA 2F34A 4EF2A 1QKBA 1TWYA 2Q9TA 4Q0CA 1B0LA 3LSWA 3MC2A 4YMAA 1FQEA 1N7WA 3RT6B 5CM6A 2DWAA 2GFEA 4LZ7A 5H8NA 2QMXA 3RPWA 1QUJA 4ECFA 4F22A 3T22A 3LC8A 1DSNA 1PC3A 1B3FA 3HV1A 5EHMA 2UYEA 4WEPA 1ZTYA 1Z7NE 3IO6A 3ILTB 2OZZA 3S9EA 4JB7A 2Y7IA 1B5JA 3T66A 2DQVA 1FTLA 2F8DA 1B9JA 1MY3A 4R75A 4H5FA 2ZXTA 5DTBA 2RF1A 1XVYA 2DVZA 4IO5A 2O1MA 3MVYA 1RYXA 3UIFA 3OEMA 2DSFA 2V3QA 1XVXA 4NWCA 4BDRA 3KGCA 4TLLB 4OFLA 3FASA 1MQHA 3C33A 2RCAA 1MQGA 4JXIA 2QL3A 1UIUA 3SEYA 4GQOA 4IO3A 5CI5A 4R74A 1MH3A 2FNCA 4PFTA 2XX9A 2H99A 1FW0A 3SERA 3QUJA 5BWJA 5LOMA 4P0IA 3PPNA 3TEPA 1MDP1 2CZLA 1LGBC 2V25A 3C36A 1URDA 5I56B 1NNKA 1MS7A 2UYFA 2HEUA 5IKBA 3FJMA 4F29A 1SQYA 3UORA 3A09A 3M3FA 3KSXA 1R1NA 2VOZA 2HXWA 3U93A 3CSGA 3OENA 1LAHE 1JW5A 3MJNA 3K1MA 4NF5A 4YU0A 4ZZAA 1LB9A 1GR2A 3R6UA 1Y3NA 1NNTA 2H4IA 3B7DA 2Y7PA 1BLFA 1IQ7A 4UACA 4FECA 5AA3A 2H98A 5I57B 5KDTB 4N6PA 4NF6A 3RY3A 4ZEKA 3FV2A 4OERA 4G8HA 5I2KB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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