5KDTA

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with gne0723
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
280
structure length
278
Chain Sequence
DNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGICH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Discovery of GluN2A-Selective NMDA Receptor Positive Allosteric Modulators (PAMs): Tuning Deactivation Kinetics via Structure-Based Design.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
total genus 82
structure length 278
sequence length 280
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-06-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5kdtA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5kdtA02
3U72A 4H8IA 1JVYA 1GR2A 4KHZE 3GXAA 3UIFA 2AL5A 3V8XB 1H76A 4NMYA 5I58B 1MM6A 1XOCA 4OERA 1YAEA 2FYIA 2HFBA 4KYDA 3RUMA 1IXGA 3QK6A 4MLVA 4QSEA 1ZIUA 3A09A 4EQBA 3FJMA 4TLLB 1N7WA 4XKNA 4M4GA 1XVYA 1JW5A 3MVXA 3QUJA 4R6HA 1B1HA 5EYFA 1IZ1A 1DOTA 1B3HA 1QULA 3C34A 1O7TA 5DVIA 3SEVA 1FTJA 2DSFA 2ZNTA 1S50A 3KJ7A 1B32A 2PYYA 2RC9A 1JEUA 4IY5A 5KCJB 3O2AA 4E0XA 3FJ7A 3IO4A 5EHMA 4EQ7A 3MP6A 1LFGA 1AIVA 1SI1A 3IORA 2QJEA 1NL5A 2UVHA 5J1DA 1B3FA 1MXZA 4POWA 3IJXB 5CM6A 4DZ1A 2DWIA 4N13A 5HBCA 2FNCA 2ZYOA 1BP5A 1KWHA 1Y3NA 2Q8JA 1HSLA 4ESWA 2OWSA 4OMBA 1Y1ZA 1BTJA 1H3DA 1Q35A 4MLQA 2VD3A 4RXLA 3THIA 3KBRA 1L5TA 2XX8A 2DWAA 4KCCA 3T9HB 3Q28A 5TP9A 4HW8A 4NF4A 1NMUA 1MXWA 1VFDA 4F29A 1OQGA 1QW0A 1XVXA 2ESNA 3K1MA 4Q30B 2WKYA 1MY0A 2XD2A 3WAEA 4BDNA 3LSFB 3S9MC 3MPLA 2OBGA 2IA4A 1ZMGA 1N0TA 3UGWA 1NKXA 1UIUA 3CG3A 3K6XA 3HSTA 4GIZA 4F2QA 1WODA 2PT1A 1M5EA 2I3VA 3PPRA 4NF6A 3KSXA 2Y7WA 3FVKA 2LAOA 1SYHA 3BFTA 3UA8A 2DE3A 3QUFA 1MQDA 1RYXA 2I4BA 2I6EA 2O7IA 3DLNA 4OFOA 3O6IA 3TCGA 5CMBA 3T22A 3V5AA 1MY4A 2F6GA 2G29A 1Y20A 1I69A 3C4MA 3MWBA 3JYRA 4M1VA 1OMPA 3FVGA 4DXCA 1MM7A 4NWDA 4F2OA 5A5XA 4JSOA 4JWOA 5I2NB 4I9DA 2ONSA 1I6AA 4IGTA 4ZEFA 3VVDA 5ITPA 4E0WA 3LSXA 4YMBA 3E9XA 4RK9A 4QF9A 4R9FA 1B7UA 3ZKKA 3T9UA 3S2VA 1PB7A 4F22A 4O3BA 2XXVA 1UTHA 3IOTA 4EF2A 1B3LA 5DYHA 3TZAA 3VXCA 2V25A 3FVOA 2UVGA 3CR9A 2AYSA 1DMBA 3VVFA 4YZZA 3SERA 3MPKA 4H67A 2R6GE 1LBBA 3GLBA 2BJJX 3I3VA 4DCYA 3ILUB 3PD9A 4KCDA 3H06B 1FW0A 3G3HA 1P1UA 1S9TA 3AXFA 5DVJA 3B7DA 3MZBA 4YKPA 1MG1A 4HS7A 4ELQA 4IO5A 5FTHA 3ZKLA 2Y7KA 3SEUA 4YMAA 1N3WA 3C36A 3R26A 4G8NA 4OFJA 4QFNA 3BFUA 4NF4B 1NNTA 1ZKBA 3OELA 3O66A 3MVYA 3T93B 2HEUA 1WVJA 1FQEA 4OYVA 4ZECA 3IAZA 4DIGA 2DVZA 4KFQA 4O3CA 5DEXA 4ZEKA 4R72A 3MQ9A 3ZSFA 3PUWE 1EH3A 2XXYA 1MY2A 3IB1A 4I8CA 3SEYA 4P0GA 4POXA 3RQTA 3UP9A 4DE8A 1CB6A 1FQFA 3Q26A 5TU0A 3K00A 1TFAA 4YB7A 2XXIA 4ZE8A 4DLDA 2XHDA 5KZTA 4AB5A 1N76A 5AA2A 4JWXA 3TQWA 3OO8A 2XXRA 1HSEA 4FEDA 1B5IA 2B65A 1IEJA 1POTA 2HAUA 2X7PA 4ZZEA 2NOOA 3R6UA 3VV5A 5AA4B 2XXUA 1J1NA 5H8QA 3S4UA 2O84X 4IY6A 3ODBA 4YU0A 2F7BA 2I3WA 3RT6B 3TELA 5IKBA 1N3XA 3KFMA 4RNSA 4ZS9A 4MBPA 3GBAA 3MZ9A 1IXHA 1GGGA 2UYEA 2QS3A 4OQOA 1MDP1 4RA1A 2HQ0A 3O97A 4N07A 3OO9A 4F18A 4ELRA 2DXRA 2ONRA 1B1XA 1MXXA 3B6WA 3LBSA 1NH7A 1SYIA 3U93A 1UTHB 1XT8A 4NEDA 2ABHA 3RTFB 1MS7A 1SDXA 3OEKA 4JDFA 1HSJA 3MUQA 4RYAA 5I59B 4LP2B 1A99A 4QHQA 1B40A 4XKRA 3N26A 1MQJA 3LC8A 1LSTA 1LCTA 2OLBA 2DS9A 4G4PA 3GBBA 3K01A 2CMOA 2GFEA 1QKAA 1B0HA 3TUSA 4PFUA 4FE8A 4LZ8A 3K6WA 3MZ1A 4DXUA 3G3GA 3RLFE 2O1MA 5DTBA 3FVNA 3G7WA 3CFZA 1DPEA 1YPNA 2F34A 1QVSA 3U1OA 3OOAA 4WEDA 2GRVA 4X48A 3MAMA 1YTVA 3G3JA 5I57B 3B6QA 3QSLA 1MPBA 4IO7A 4NF5A 4OETA 1BKAA 4AB6A 4X9TA 4JXIA 4H6DA 4JB7A 5TP9B 5HPQA 4H5GA 3B6TA 4N6PA 4WKMA 1MXYA 1YCJA 3MVZA 2XXTA 4BDQA 4FIMA 2NXOA 4XTCQ 4BDMA 4C1TA 1IITA 2Z22A 3IOVA 2OK2A 4NE4A 5KDTB 3FD3A 4G8MA 4QFKA 3TYHA 3H6UA 2THIA 1AL3A 4LQ2A 1IXIA 4MH5A 4DXBA 3MJNA 1ZLQA 2O68A 3IK6B 4UACA 3TTNA 3N6TA 3PUZE 1SBPA 3ILTB 4ZE9A 4ESXA 2E1SA 3VLVA 5CMCA 5BUUA 3C35A 2PVUA 1QUJA 2DE2A 5FHOA 1II5A 2O6AA 5CI5A 1ANFA 5FHNA 4PFTA 4EXLA 2QS1A 1PBQA 2HAVA 1MY3A 1URDA 4U2RA 3RT8A 2A5TB 4R75A 4GL0A 3FXRA 1O64A 4OTEA 4GLIA 2REJA 4KR5A 2H5YA 1XS5A 4BDRA 2VOZA 3IB2A 2F97A 5L9SA 1B9JA 2R71A 5ELVA 5LOMA 1SVXB 3MP8A 1R6ZA 3ECRA 3FGSA 1B5JA 4FJPA 2PT2A 4ZEIA 5KCJA 3SDFA 4F1YA 1O63A 3MBPA 4FATA 2F36A 4F3GA 1URGA 3KSJA 2A5SA 1VE4A 4DCXA 3CSBA 3FZVA 2OCUA 5H8NA 2B3FA 2F8DA 1LB8A 1TT1A 2DXYA 4MF3A 4QRZA 4RPNA 3A3CA 4LA9A 1LAHE 2ZYKA 4Q0CA 1GV8A 1DTGA 3T96B 1QKBA 4F39A 1P1QA 3EPEA 4FAJA 1USYH 3EHTA 5H8HA 3QAXA 1A7LA 3G3IA 3S9EA 1B0LA 1NNPA 4IB2A 3V83A 2RC8A 3H6VA 1N84A 1FQDA 4GL8A 4LATA 1JETA 2ZNUA 4KYEA 2M8CA 2OWTA 3CRBA 4GRKA 5F1QA 3SEXA 3VLWA 1MXUA 2V3TA 5H8SA 3H3GA 1OLCA 3H6TA 4MFIA 3GZGA 4OEVA 1ZJLA 4R6YA 1SW1A 1UTBA 4U1ZA 2DVCA 2Q2CA 4YKJA 3SEWA 2GHAA 5IAIA 2REGA 2RCAA 3HHFA 3S9NC 2DYXA 2QMWA 1LCFA 1B46A 2QL3A 4KPTA 1NH8A 1TWYA 1USYE 1ZTYA 2RKMA 3HHGA 1FTLA 2V3QA 3OO7A 4G68B 3TKDA 2I48A 3LR1A 1Y3PA 3MVWA 2B3BA 3EHUA 3OSQA 4XKQA 3KOSA 4DDDA 2Y7PA 3QIMA 3W9WA 5I56B 1RYOA 5CMMA 2NUVA 2QS2A 3R7XA 5L9OA 2I0CA 1EZ9A 4KI0E 2Y84A 3MC2A 1EZPA 1JW4A 2PMSA 5JTYA 4H0WA 3TCFA 4F1VA 1MRPA 5FHMA 3IOWA 1B4ZA 1D4NA 2Q9TA 5I2KB 3QXMA 3DP8A 4O3AA 1IXCA 1Y9UA 1Z7ME 2UYFA 3KOTA 4ONYA 2F7AA 3SESA 3T9XB 4F3SA 1OIBA 2DWHA 1MXVA 2I0BA 3C33A 3G3KA 2VP1A 1BIYA 4GF8A 4YB6A 1B58A 3D4GA 3KGCA 1IIWA 3G3FA 3U94A 3O6GA 2P0SA 3TMGA 4X1BA 2UVJA 4ISUA 4R2BA 3TODA 4QFOA 1AOVA 3KN8A 1NNFA 4P11A 2ZNSA 3F11A 3N6UA 4G77A 4OWDA 2V93A 3HV1A 2Q89A 2RF1A 4IO4A 4AQ4A 5K2YA 3A3UA 4Q8RA 1DTZA 2DQVA 3H4ZA 3K02A 3DELB 4OZ9A 3M3FA 3IJOB 3QYTA 1SW4A 5AA1A 5H8FA 1IUDA 2V84A 2F6PA 1M5BA 1B05A 2YJPA 3U8QA 4G8HA 4LUBA 4UA8A 2Z8DA 3VLUA 1FTKA 2QPQA 4G68C 3K6VA 1B5HA 4KD5A 3S9LC 1A8FA 1N04A 2P2AA 2QMXA 2Y7RA 1Z7NE 3OSRA 4FECA 5ISUA 2GH9A 3OENA 4ZZAA 4EUOA 1QJMA 2ALUA 4OESA 2YLNA 4ZDMA 4GXAA 3C32A 5KDTA 2X26A 3N94A 3SKPA 2XX7A 3PMVA 3W15C 4EXKA 1GTKA 1CE2A 3CI8A 1Y3QA 3O29A 3RTWB 3TDJA 5JEIA 1UQWA 5H8QB 3L6GA 4G68A 3TQLA 5CBRA 3VE1B 3MP1A 4R74A 1ZU0A 2UVIA 3D4CA 2HZLA 3K1NA 3O9PA 4F3PA 1B52A 2O1LA 2F78A 1XC1A 2RC7A 4YICA 1MH3A 2VGQA 1PBPA 3CFLA 3TAJA 3FASA 4YAHX 1VFEA 1QUKA 1DPPA 3I6VA 1A40A 1M5DA 2A5TA 1B2HA 1Y4TA 3PPPA 1PEBA 5JTYB 3TTRA 1DSNA 5AE4A 1I6BA 1SD3A 3CIJA 4I62A 3UK4A 1PB9A 1URSA 2D3IA 4ND9A 4R2FA 5CRYA 4EQ9A 1R1NA 4FORA 1OQHA 4H8JA 4ZEBA 1XHYA 4HCWA 5DVFA 5HM4B 4XIGQ 4BDOA 4IO6A 1S7YA 3LSLA 3VDFA 2H98A 2ZMBA 2CZLA 2I4CA 5H8NB 4R73A 1MY1A 3K6UA 3V89B 3TEPA 3Q27A 5H8HB 5ITOA 2H4IA 3EQ1A 1MQGA 1MPCA 3O28A 3IR1A 4NWCA 4U4SA 4EF1A 3FJGA 5AA2D 3UN6A 2PBWA 1B7ZA 2KLFA 4G2ZA 3PU5A 2O51A 4RK2A 4XXUA 3P7IA 5FTIA 4ECFA 3K4UA 3CVGA 3KEIA 4YKIA 1MH4A 2ZYNA 4OXVA 3USDA 3HPIA 4LVQA 1OLAA 2D21A 2ZYMA 2F5XA 1UTBB 2XD3A 4YKKA 1SQYA 2D5WA 4PP0A 5ICTA 1MDQA 2GHBA 3OMBA 4QFLA 1FTMA 1JNFA 3PD8A 2PX1A 1TXFA 3O6HA 2P1SA 4JWYA 3VVEA 2I49A 1D3KA 3H7MA 5DT6A 4IGRA 3KZGA 1D9YA 1P1NA 3PUVE 2DWJA 3VXBA 3E3KA 3EF7A 4TQUQ 5F7VA 5AA4A 3TTLA 3RN8A 4JSDA 4RJZA 5I58A 3Q29A 3KJTA 5CBSA 1FQCA 3FV2A 5K2XA 2R9JA 1Y1MA 4IO3A 4TOZA 1TFDA 3FXQA 4H65A 3OO6A 1BLFA 4H5FA 2HXWA 2H99A 3PV0E 3U92A 2OJTA 2VHAA 1LAFE 3L6HA 3W9VA 1B4HA 3LSWA 2H9BA 5I2KA 2Z8EA 4I1DA 1T0KA 4QSDA 4JBZA 1A54A 2AL4A 2O69A 4KYSA 4Z0IA 4QSCA 5I59A 5CC2A 1AH5A 2XXWA 4KQPA 4QFPA 3OXNA 3TPAA 1B6HA 2YPNA 3OEMA 4F19A 3PGFA 3M8UA 3PPQA 4U1OA 1Q1KA 4IO2A 3DP4A 1OVBA 4C0RA 3PPOA 3K0VA 2E0SA 1B3GA 2DE4A 2UXAA 3EHSA 3PPNA 2HCAA 4C1UA 1VSOA 3HO7A 1RKMA 2ANJA 3DP6A 1MQIA 4PE5B 3H03A 3IOUA 4Q5TA 3SETA 3T66A 5I57A 3E13X 1D9VA 4OEUA 5M2VA 2I58A 1R9LA 4U21A 1B51A 1B7HA 3C9HA 3BKIB 5I2NA 1FQBA 1I6QA 3RGYA 3FUZA 4OHNA 1LB9A 1SI0A 3RY3A 4NF6B 3LUYA 1M5FA 4LQ5A 4F31B 2HZKA 4PFWA 3FATA 2G93A 2H25A 1NNKA 2QS4A 3C31A 2XX9A 2NVUB 3TCHA 2XXXA 1FCKA 5L8DA 5ICQA 3K1PA 4GD5A 3KG2A 4TLMB 4WEPA 3TTMA 3T9VA 2W7YA 1P1OA 4U4XA 1SW2A 2XXPA 5A5XB 4ELOA 2Z23A 1US4A 1POY1 2Q88A 4GXSB 2V3UA 4PFYA 3K2DA 4GFRA 4WXJA 1PB8A 5CMKA 3E4RA 1LAGE 3Q25A 4GWOA 4ELPA 1ZBMA 3VFJA 1MQHA 1P99A 2VD2A 4FEBA 4NTLA 3HCQA 4GOTA 1SW5A 1Y4CA 1MPDA 1LGBC 2O7UA 2ZXTA 4OFLA 4R9GA 1LFIA 1EZOA 5I56A 1AMFA 4U23A 3IX1A 1ELJA 5B70A 4ZEDA 3ONMA 4LONB 2F35A 4RPOA 4F1UA 1EU8A 4LZ7A 1VR5A 1US5A 3IO6A 2F7CA 3H6WA 3EN3A 3CG1A 3M3LA 4EDPA 3HN0A 4P0IA 1LLSA 3PMXA 3IL1B 1JQFA 1H43A 1LBCA 2X7QA 3M3KA 4XKPA 1F9BA 1QUIA 3JZJA 3N5LA 3UORA 2Y7IA 3TTKA 1A55A 3OD7A 4F3BA 2IEEA 4LZ5A 4YB5A 1R9QA 1GVCA 1FTOA 4OVJA 5TPAB 3IB0A 4X1DA 1IQ7A 5AA3A 1B3EA 1A8EA 1JVXA 5TPAA 4PQJA 2Q2AA 2XXQA 2Z8FA 1UIVA 3JV9A 4K3FA 4BDLA 4Z7EA 4BLAA 2XXHA 3KN3A 3ZS6A 1PC3A 4R6KA 2NWJA 4GVOA 1PDAA 3KN7A 3PMWA 4NF5B 5B7DA 4U22A 5BWJA 3FIRA 4RY1A 4OENA 4GQOA 5H8FB 4L17A 5DEXB 5L9MA 4HTGA 3WAFA 2FA7A 1JW1A 4HCYA 1WDNA 3PUXE 2DP8A 4PETA 1LFHA 1ATGA 1NFTA 5JK4A 3CFXA 1H45A 1H44A 3BBRA 1JEVA 3MW0A 4NF8B 3DM0A 2DOJA 2ONKE 4THIA 3RPWA 1OVTA 2RINA 3FV1A 3TFLA 5I84A 3FXUA 4NF8A 3PUYE 1LAXA 1N7XA 2QRYA 1FQAA 1P1WA 2AIXA 2QSXA 2RCBA 1M5CA 4H1XA 3RNNA 3CSGA 2OZZA 5EHSA 5AA2B 3I5OA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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