5KDTA

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with gne0723
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
280
structure length
278
Chain Sequence
DNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGICH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
publication title Discovery of GluN2A-Selective NMDA Receptor Positive Allosteric Modulators (PAMs): Tuning Deactivation Kinetics via Structure-Based Design.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transport protein
total genus 82
structure length 278
sequence length 280
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-06-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5kdtA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5kdtA02
5CMCA 3HPIA 4WKMA 2I6EA 1NNTA 1JVXA 4BLAA 2DYXA 1M5FA 3TCFA 4QFKA 3LSFB 4P0GA 1MXYA 1M5CA 3TTLA 2Y84A 1FQAA 1MH4A 4XIGQ 3Q26A 2XXXA 4YU0A 1S7YA 2I0CA 3TTNA 5I2KB 2F34A 3L6HA 3VE1B 2F5XA 2HEUA 3DM0A 1B3LA 4NF8A 2DSFA 3TEPA 3KBRA 4ND9A 5TPAA 5DEXB 4OEUA 3A3UA 4F3PA 1LB8A 4OFJA 3E13X 1I6QA 3V89B 3HO7A 4R6YA 2ZMBA 2XD2A 3RT6B 3FVOA 5LOMA 1NMUA 1Q1KA 3O28A 4LZ5A 4RPNA 4ZEBA 4KPTA 1MRPA 4F19A 1O7TA 4U22A 5CMMA 2DWAA 5DYHA 3MUQA 4R6KA 3H6TA 3ILTB 2F7AA 5HM4B 4PFTA 2I49A 2HCAA 3K0VA 1P1WA 1JQFA 3H6WA 2O69A 2Y7KA 1F9BA 2XX9A 5F1QA 1IXHA 2Q9TA 1OQGA 1BTJA 1H76A 4KD5A 4F22A 1A55A 5AA3A 5JEIA 3TZAA 3IL1B 1H44A 3GBAA 3S9EA 3U94A 1FQBA 1QVSA 4DE8A 2RF1A 3QK6A 3QSLA 2Z23A 3FXUA 2CZLA 3MW0A 4IGTA 3M3FA 2UVHA 2B3FA 1SYIA 2Q2CA 2XXPA 4PFWA 2R6GE 3I6VA 1B3HA 1QUJA 2Q2AA 4RK9A 1OLAA 1S9TA 3G3IA 4FATA 2V25A 2IA4A 1QJMA 4GXSB 4RPOA 3KFMA 3OO6A 3USDA 1ZBMA 1SW4A 2HZLA 4GIZA 4QFPA 5HPQA 4F2QA 4DLDA 2FNCA 1NFTA 3CSGA 1RKMA 4YB7A 3AXFA 3UIFA 4YMBA 3KN8A 3R7XA 4JSOA 1MQDA 3O6GA 2O7IA 1EH3A 1YPNA 4R9GA 2O1LA 2GFEA 3RTWB 3H4ZA 1H45A 3EN3A 1MXXA 1L5TA 2E0SA 1O64A 2QSXA 4BDNA 5CI5A 3K02A 3S2VA 3T96B 1UTBA 5ITOA 3CSBA 2VP1A 2OBGA 5K2YA 3HV1A 2VGQA 3C36A 4LONB 1P1UA 3SKPA 3TTMA 1NNFA 4IY5A 3OELA 5FTHA 3IX1A 4JXIA 2QS1A 5B7DA 3KZGA 3T22A 3H6VA 3IOVA 4RA1A 3FVNA 1UTHB 4YB6A 3TODA 1Y3PA 1MXZA 5AA2A 4ZECA 3OO7A 4QFNA 1FTKA 3CI8A 3FJ7A 1NH7A 3FIRA 2DXRA 3OO8A 3VDFA 2O1MA 4LATA 4NF4B 2H5YA 2Z8EA 1XVYA 1LCFA 3PMXA 2BJJX 4KQPA 1ZU0A 4XKQA 3K6UA 1HSJA 4Z7EA 4MBPA 3H06B 3ZKKA 1MY3A 1VSOA 2X7QA 5L8DA 2O6AA 3KJ7A 4I62A 3V5AA 1H43A 2OCUA 1B05A 4RNSA 3MP1A 1XVXA 1IUDA 4H65A 2P0SA 3MZ1A 2I3VA 5H8HA 4X9TA 2XXHA 4KYEA 2FA7A 3QAXA 4PP0A 4DDDA 5K2XA 2R9JA 3PGFA 1B5IA 2OZZA 2YLNA 2QRYA 2AL5A 4QSDA 4GL8A 4HW8A 4FEDA 1NNPA 1XOCA 3TTRA 3GZGA 1D4NA 4K3FA 1PBQA 3F11A 2DOJA 2DE4A 3IO4A 1SW1A 3A09A 3T9UA 4DIGA 1ATGA 4HCYA 1JEUA 3W15C 1N84A 1ELJA 1QKAA 3IORA 2PMSA 4BDQA 3K1PA 3TAJA 4JWOA 2P2AA 1B5JA 1USYE 4L17A 5ITPA 1IXIA 3H03A 4C1TA 5A5XB 1OIBA 4HTGA 3G7WA 1LSTA 4EQ9A 4QF9A 1MPDA 1PB8A 3SEVA 1CB6A 3U72A 1MQHA 1B4HA 1B6HA 3FV2A 3D4GA 5I2KA 5ISUA 3K2DA 2YPNA 1FTLA 3TYHA 3G3KA 4F3BA 5KCJB 3R6UA 3VXBA 5J1DA 4OTEA 2DVZA 1N3WA 5DEXA 4KI0E 4MLVA 4LZ7A 3S9LC 3B6WA 4ZEKA 1ZTYA 1FQCA 1B7ZA 4U1OA 3TFLA 4Q8RA 5DVIA 2PYYA 1B9JA 4EQBA 5IKBA 4F1VA 3L6GA 5ELVA 1IQ7A 4MH5A 1MQJA 3A3CA 2B3BA 3KSJA 1LFHA 3IJOB 3M3KA 2PT1A 4BDLA 2CMOA 4I1DA 3U8QA 3ILUB 5ICTA 4ZS9A 2I4CA 4X48A 5I58B 3PMWA 1FCKA 1T0KA 4GD5A 4OENA 2DWJA 3QUFA 1MY1A 3D4CA 1B40A 4OYVA 4G4PA 4EXKA 2Y7IA 1ZLQA 4ZEFA 4X1DA 4LZ8A 3V8XB 4G68A 2RC8A 4C0RA 4OEVA 1MY2A 4WEPA 4F3SA 1QUKA 4G8HA 1MXWA 3LSWA 4IO5A 4F39A 2LAOA 4R73A 2REGA 3RGYA 1QUIA 2H25A 4EXLA 3PUWE 3CFLA 1EZOA 1VR5A 3R26A 5L9OA 1AOVA 3U1OA 2KLFA 1UIUA 4LQ2A 3SETA 4HCWA 1XC1A 3RQTA 4PFYA 3UGWA 3QYTA 1FQFA 4QFLA 2RC7A 1JW4A 2XHDA 1ZJLA 2IEEA 2ONRA 3WAEA 2I58A 5H8FB 1JVYA 2QS4A 3CRBA 3IB0A 3PPRA 3PPPA 5ICQA 2F97A 1XS5A 1DMBA 3IOTA 1N7WA 4YICA 4ESWA 1OMPA 1II5A 4F29A 4IO6A 2I48A 1M5DA 2Z8FA 2NUVA 4THIA 3OMBA 1MY0A 1SW2A 1XHYA 3CVGA 3O29A 3GLBA 3RUMA 4DZ1A 2DQVA 1Y1MA 1AH5A 2XXYA 3TUSA 3JV9A 4F1UA 2XX8A 2QMWA 4YB5A 3PU5A 1PBPA 3HHFA 2ONSA 1Y20A 3N6TA 3OSQA 5I59B 1B32A 3SEYA 1SI1A 4RXLA 4GVOA 4Z0IA 3BKIB 1I6AA 3PPOA 2QJEA 2UVGA 1NKXA 1DPPA 2YJPA 2M8CA 5TU0A 2X26A 3PUYE 5TPAB 3JZJA 1NNKA 1MS7A 4ZEDA 1UTHA 5H8SA 3Q27A 4TLMB 5CMBA 3C33A 5BWJA 5H8NA 3DP6A 2H98A 2V84A 1LGBC 1IXCA 3OO9A 4G8NA 1P1QA 2GRVA 2OK2A 1Z7ME 4XTCQ 1N3XA 3K6XA 4YAHX 4NF4A 3G3HA 3ECRA 4H67A 3UA8A 3E3KA 4FECA 3UK4A 5KZTA 1B0HA 1B7HA 4XXUA 1TXFA 4EF2A 1MM7A 3O2AA 1LAXA 2PVUA 4EF1A 3PUVE 4OERA 4EQ7A 1B7UA 3FGSA 2A5SA 1M5EA 3PPNA 3Q28A 4Q0CA 3FVGA 2ZNSA 1QW0A 3Q29A 4AQ4A 4ECFA 1LLSA 4IB2A 4ZE9A 3CFXA 2GH9A 3OSRA 3RY3A 4DXCA 3CG3A 4UA8A 3G3GA 2P1SA 2Q88A 4M1VA 5I2NB 1B51A 2ZYNA 3LBSA 4Q30B 1KWHA 4C1UA 4OZ9A 1IZ1A 3IAZA 4R9FA 1BKAA 1LFGA 4XKNA 3C35A 3RTFB 2RCBA 1PDAA 4ZZEA 5FHOA 1ANFA 2O7UA 3K1MA 5L9MA 1D9VA 3VVEA 5AA2D 1GR2A 4X1BA 1CE2A 3K01A 3KSXA 3ZKLA 4U2RA 1B3FA 1DTGA 3MWBA 1JETA 1YTVA 5JTYB 5IAIA 3TDJA 1B0LA 4U23A 1N7XA 3EHUA 2OWSA 2OWTA 3SESA 2V3QA 2F36A 1N76A 3O66A 4OFOA 1LAGE 1URSA 3V83A 4O3BA 2B65A 3FD3A 3PMVA 1PEBA 2XXTA 4E0XA 5A5XA 4OESA 2HAVA 3KN7A 2Y7PA 3JYRA 2DE2A 3U92A 4DXBA 2QPQA 5CBRA 3VVFA 2Y7RA 1NL5A 4KHZE 1JEVA 3TCGA 4JB7A 4POXA 4WXJA 3TELA 5CMKA 2DS9A 2ANJA 2XXIA 4LVQA 5JK4A 4GLIA 2V3TA 2ONKE 1MPBA 3TTKA 5EHMA 1PB7A 4LUBA 2Q8JA 3SERA 4OQOA 1SYHA 3OEKA 3FJGA 4R74A 3T66A 3K00A 3MQ9A 3HSTA 2A5TB 1D3KA 2REJA 5TP9B 1TT1A 1EZPA 3VFJA 4QHQA 4MFIA 3KG2A 1HSLA 2QL3A 2DVCA 4YKJA 3QIMA 1M5BA 1UIVA 2HAUA 1JW1A 4OWDA 3T93B 2Y7WA 2QMXA 3MVZA 3QXMA 3LC8A 3N26A 3VV5A 3CFZA 3HN0A 3O6HA 1LBCA 3ZS6A 1B1HA 1I69A 1B46A 3LUYA 2I0BA 2XXQA 5I58A 3DP4A 5KDTB 4G68C 4F18A 1SD3A 4JWXA 4BDOA 2PT2A 1H3DA 4JDFA 2OJTA 2E1SA 1B5HA 5I56B 4XKPA 1WVJA 3BBRA 4GOTA 2DWIA 1R9QA 2ZYMA 5H8HB 2ABHA 2F7CA 3B6TA 4FIMA 3PD9A 1B2HA 4WEDA 5AA4B 5DVFA 1MH3A 1OVTA 3S9NC 3TCHA 5H8QB 3FV1A 2F35A 3QUJA 4DCXA 3N6UA 1MM6A 1TFAA 4ESXA 4JBZA 2QS3A 3B6QA 4QSEA 4RYAA 1VFEA 3MAMA 4POWA 1FTOA 4F2OA 3GBBA 4R2FA 4AB5A 5I57B 1B3GA 4NF6B 4I9DA 1BLFA 2Z22A 4NTLA 2OLBA 5H8FA 1LBBA 1A7LA 4U4SA 4OVJA 1SDXA 3FVKA 3MBPA 4F3GA 2XXRA 2F6GA 4ELPA 3O6IA 2DWHA 1PC3A 1GGGA 3DELB 3KJTA 1XT8A 4NF5B 2H99A 4U1ZA 4R2BA 1MXUA 2HXWA 4PETA 2GHBA 1IEJA 4H5FA 1R9LA 3VLVA 2AIXA 1DSNA 4ONYA 3G3FA 2FYIA 2PX1A 1N0TA 2VD3A 1GTKA 4YMAA 3PUXE 3RT8A 3EPEA 1LCTA 1SVXB 3PV0E 4G8MA 1B1XA 1MPCA 2AL4A 5I59A 4NE4A 4LP2B 2PBWA 1Y4TA 3FUZA 1FQDA 2RKMA 3IJXB 3IOWA 1B58A 5AA1A 1I6BA 1AMFA 4F31B 3FATA 3GXAA 4LQ5A 1Y4CA 3ODBA 1A40A 4OXVA 4TQUQ 4OETA 1Y1ZA 4KYDA 2V3UA 1YCJA 3LSLA 1R6ZA 2VOZA 1B3EA 3IR1A 4ISUA 4BDMA 4HS7A 5B70A 3FJMA 1UQWA 3BFTA 4GL0A 1LAFE 1USYH 4IO2A 4OFLA 4ZDMA 1POTA 3IB1A 1Z7NE 5FHNA 2X7PA 3MZBA 3EQ1A 2RINA 3FXRA 2R71A 2G29A 4IY6A 2XXUA 4H1XA 1D9YA 4U4XA 4IO3A 2HQ0A 4FAJA 4FORA 3TQLA 1B4ZA 1FTMA 3K1NA 4DCYA 1SI0A 2D5WA 5EHSA 1MY4A 2F78A 4F1YA 2O68A 3DLNA 1EU8A 1MXVA 3MPKA 2XX7A 4G68B 1OVBA 4N13A 1A99A 4IO7A 1MDQA 1PB9A 2ZYOA 1Y3NA 5I2NA 2I4BA 4NF8B 2NVUB 3C31A 1Y9UA 4PE5B 3O97A 3HCQA 2F6PA 5M2VA 3TPAA 1QKBA 5DT6A 2Q89A 3LSXA 1P1OA 4TLLB 1S50A 4BDRA 1P1NA 2F7BA 1A8FA 4KR5A 3RLFE 5FTIA 3OEMA 4MLQA 3EHSA 1VE4A 4KFQA 1SBPA 4ZZAA 4N07A 4RY1A 4JSDA 3THIA 4R75A 2NOOA 3HHGA 1NH8A 1OQHA 2HFBA 1DOTA 5JTYA 5CM6A 1YAEA 2H9BA 4LA9A 4ELOA 4FE8A 4FEBA 4ZEIA 3WAFA 4GWOA 4OMBA 3M8UA 3KOSA 1AIVA 1P99A 4NMYA 4FJPA 1IIWA 3K4UA 4O3CA 1A8EA 1US4A 4YZZA 1IXGA 3P7IA 3SDFA 3ZSFA 3E9XA 2UVJA 3E4RA 3B7DA 4ZE8A 2O84X 4N6PA 3EHTA 1LFIA 2VD2A 1GVCA 4ELQA 4M4GA 3C34A 2UYFA 1A54A 2ZNTA 1N04A 3T9VA 1AL3A 4G77A 3IK6B 3UORA 3LR1A 1MQGA 1MG1A 3O9PA 3W9WA 2WKYA 4KCCA 4IGRA 5F7VA 3VLUA 2UVIA 3MJNA 4MF3A 5AE4A 1FQEA 3Q25A 1FW0A 3S9MC 3T9XB 2ZYKA 3FZVA 2ALUA 2Z8DA 1DPEA 2A5TA 1O63A 5TP9A 2DXYA 1Q35A 4R6HA 1TWYA 5H8NB 3IOUA 2DP8A 3OXNA 3MVWA 1B52A 1TFDA 4NEDA 4YKIA 4GFRA 1OLCA 3I5OA 2GHAA 3FXQA 3M3LA 1R1NA 2UXAA 3TMGA 1WDNA 2ESNA 1RYOA 5HBCA 3MPLA 3CR9A 3TKDA 3SEUA 4IO4A 1POY1 4QFOA 5BUUA 3KN3A 5KDTA 3PUZE 4YKPA 4DXUA 2QS2A 4UACA 4KYSA 5I56A 1UTBB 3MVYA 1BP5A 2UYEA 3UP9A 4H6DA 3CIJA 3MP6A 4KCDA 3RN8A 5DTBA 5KCJA 3VVDA 5AA4A 3SEXA 3N94A 1ZKBA 2XXWA 3MP8A 5H8QA 3K6VA 5CBSA 3OD7A 3T9HB 4Q5TA 1SQYA 4NWDA 1Y3QA 4PFUA 4OHNA 1EZ9A 1HSEA 4GXAA 2W7YA 2D3IA 3UN6A 3MZ9A 4TOZA 5AA2B 3IB2A 4P0IA 4XKRA 5FHMA 3H6UA 3I3VA 2NWJA 2NXOA 4H8JA 3VLWA 5I57A 3MVXA 2VHAA 4U21A 4NF6A 2V93A 1LB9A 4YKKA 4EUOA 4QRZA 1URGA 3U93A 1ZMGA 4PQJA 4RK2A 4O3AA 3SEWA 3VXCA 1BIYA 4NWCA 1J1NA 3DP8A 5I84A 3W9VA 4JWYA 3IO6A 4I8CA 3KOTA 3TQWA 5CC2A 4EDPA 3KGCA 3FASA 4H5GA 3MC2A 3H3GA 3S4UA 4NF5A 3ONMA 3N5LA 3H7MA 4RJZA 1RYXA 4QSCA 1MQIA 1GV8A 2RCAA 1MDP1 1LAHE 4G2ZA 2ZNUA 2THIA 2H4IA 3G3JA 1US5A 1VFDA 2G93A 5EYFA 4GRKA 3PD8A 3EF7A 2F8DA 2AYSA 4E0WA 2O51A 3CG1A 2ZXTA 2D21A 3OOAA 3K6WA 2RC9A 3BFUA 4AB6A 3C9HA 2XD3A 1SW5A 5CRYA 4ELRA 3RPWA 1QULA 2I3WA 4P11A 1JW5A 4H8IA 4R72A 2DE3A 2HZKA 1DTZA 3C32A 1IITA 3OENA 5L9SA 1ZIUA 3PPQA 4H0WA 2XXVA 3KEIA 4GQOA 1WODA 1FTJA 1URDA 3C4MA 1JNFA 4GF8A 5DVJA 3RNNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5CMCA 3HPIA 1FPEA 4WKMA 2I6EA 1NNTA 1JVXA 4BLAA 2DYXA 1M5FA 3TCFA 4QFKA 3LSFB 2FIEA 4P0GA 1MXYA 1M5CA 3SZPA 3TTLA 2Y84A 1FQAA 1MH4A 4XIGQ 3Q26A 2XXXA 4YU0A 1S7YA 2I0CA 3TTNA 5I2KB 2F34A 3L6HA 3VE1B 2F5XA 2HEUA 3DM0A 1B3LA 4NF8A 2DSFA 3B8BA 3TEPA 3KBRA 4ND9A 5TPAA 5DEXB 4OEUA 3A3UA 4HE1A 4F3PA 1LB8A 4OFJA 2Y5LA 3E13X 1I6QA 3V89B 3HO7A 1IMCA 4R6YA 5IGAA 2ZMBA 2XD2A 4I3EA 5ET7A 3RT6B 3FVOA 5LOMA 1NMUA 1Q1KA 3O28A 2HPGA 4LZ5A 4RPNA 4NF0A 4ZEBA 4KPTA 1MRPA 4GX4A 3IFAA 4F19A 1O7TA 4U22A 5CMMA 2DWAA 5DYHA 3MUQA 4PDDA 4R6KA 3H6TA 3ILTB 2KR0A 2OWZA 2F7AA 5EYHA 5HM4B 4OVTA 4PFTA 2I49A 2HCAA 3K0VA 1P1WA 1JQFA 3H6WA 2O69A 2Y7KA 1F9BA 2XX9A 5F1QA 3RPLA 1IXHA 2Q9TA 1FBEA 1OQGA 1BTJA 4N6KA 1H76A 4N17A 4KD5A 4F22A 1A55A 5AA3A 5JEIA 3TZAA 3HFUA 3IL1B 1H44A 3GBAA 3S9EA 3U94A 1FQBA 1QVSA 1NV5A 4DE8A 4MJOA 4OVQA 2RF1A 3QK6A 3QSLA 2Z23A 3FXUA 4H45A 2CZLA 3T1BA 4PAIA 3MW0A 4PTKA 4IGTA 1FTAA 3M3FA 2UVHA 2B3FA 5IZZA 1SYIA 2Q2CA 2XXPA 4PFWA 2R6GE 3I6VA 1B3HA 1QUJA 2Q2AA 4RK9A 1OLAA 1S9TA 3G3IA 4FATA 2V25A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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