1D9VA

Haemophilus influenzae ferric-binding protein apo form
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
309
structure length
309
Chain Sequence
DITVYNGQHKEAATAVAKAFEQETGIKVTLNSGKSEQLAGQLKEEGDKTPADVFYTEQTATFADLSEAGLLAPISEQTIQQTAQKGVPLAPKKDWIALSGRSRVVVYDHTKLSEKDMEKSVLDYATPKWKGKIGYVSTSGAFLEQVVALSKMKGDKVALNWLKGLKENGKLYAKNSVALQAVENGEVPAALINNYYWYNLAKEKGVENLKSRLYFVRHQDPGALVSYSGAAVLKASKNQAEAQKFVDFLASKKGQEALVAARAEYPLRADVVSPFNLEPYEKLEAPVVSATTAQDKEHAIKLIEEAGLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords PROTEIN (iron-utilization periplasmic protein)
publication title Crystallographic and biochemical analyses of the metal-free Haemophilus influenzae Fe3+-binding protein.
pubmed doi rcsb
source organism Haemophilus influenzae
molecule tags Metal binding protein
total genus 115
structure length 309
sequence length 309
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-10-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1d9vA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1d9vA01
3KJ7A 3SESA 1Y1MA 4I1DA 3TTKA 5TPAB 1YTVA 1B3GA 2NUVA 4ZEFA 4IO7A 3LBSA 4ZE8A 5ITPA 5DTBA 3K00A 1Y9UA 2RINA 1DOTA 3S9LC 2F7AA 2VD3A 1FW0A 1A7LA 3CRBA 1QJMA 3K6XA 3T66A 1RKMA 3E9XA 1MPCA 1LBCA 2NXOA 4BDOA 2F6GA 1FQAA 2F36A 1AH5A 1S9TA 3U94A 1URDA 3FD3A 2ZNTA 2OZZA 4GF8A 1M5DA 2Y7WA 3MUQA 4HS7A 2O7IA 1YAEA 3VVDA 3SEXA 4ZEIA 1H44A 1I6AA 5L9MA 4JBZA 3U92A 4U4SA 4PFTA 2HAUA 1UTHA 4G4PA 2DE2A 4LQ5A 4YU0A 3N6UA 2VGQA 5H8QA 1QKBA 1A8FA 3HV1A 1FTMA 3GBAA 5DVJA 2IA4A 1MDP1 5A5XA 3E3KA 3KGCA 3PMWA 1ZJLA 2DWAA 4RK2A 3RNNA 4GVOA 4JDFA 4EQ9A 5L8DA 4F31B 1J1NA 3K2DA 4NF8A 3FXUA 3T9HB 1UIVA 1ZBMA 4GFRA 1Y3NA 3V5AA 1PB7A 2XD3A 1PB9A 2UYFA 3I3VA 4X48A 1YCJA 3B6QA 2DOJA 3IB1A 3RN8A 3MPLA 2F35A 3D4CA 4K3FA 4H8JA 1PBQA 4GL8A 2DWIA 2XXUA 2Q9TA 3VXCA 4RJZA 2DWJA 3O97A 1BP5A 1B0LA 4YKKA 4RYAA 5FTIA 3MC2A 3PGFA 1LAHE 3N94A 3S2VA 4OEUA 1OQGA 2F34A 4G8HA 2PT1A 4R6YA 4BDQA 3CG3A 3Q25A 4EQ7A 4FIMA 2VD2A 3FVOA 3O6IA 4GL0A 1MPBA 4MF3A 1WODA 2PVUA 4OESA 1IXGA 1WVJA 3TYHA 3MBPA 3MVXA 5AA2D 4C1TA 3H6UA 3RTWB 2ONRA 3MVWA 2O68A 1GV8A 5I84A 3MW0A 2XD2A 5CM6A 2Q8JA 5IAIA 5DVFA 4F22A 3Q28A 4L17A 2ZNSA 1B5IA 2OWTA 1FQBA 3O6GA 4IGTA 3C33A 1UTBA 4EUOA 1US4A 1MG1A 3PD8A 4TOZA 2GHBA 2QJEA 4N07A 1BIYA 4C1UA 2I3VA 2THIA 1B7ZA 4KFQA 1N84A 4U22A 2V3QA 4F1YA 4G68C 1B7HA 4ECFA 1A55A 3KSJA 1OVTA 1SD3A 3FJMA 4OFOA 4DDDA 1B9JA 1B5HA 1ATGA 2RF1A 2Z8DA 4OYVA 2QMXA 1XOCA 4YKJA 3LR1A 4IO6A 4WEPA 2B65A 4U21A 4H6DA 2FYIA 3IR1A 1MM6A 3N26A 1QUIA 3UIFA 3ILTB 2XXWA 3ONMA 1LGBC 3VE1B 1R9QA 4G8MA 4R9GA 3HHFA 4OFJA 4P11A 4GQOA 1OVBA 3TTMA 3IORA 4YAHX 3MP1A 3H7MA 4M4GA 3OSQA 3JZJA 1M5FA 3Q26A 1O64A 3IB0A 3R7XA 3QYTA 5FHOA 1Y3QA 5EYFA 5ITOA 2E0SA 2AIXA 3CI8A 3BBRA 4FEDA 1Q1KA 1ZTYA 3HN0A 4F3GA 4AQ4A 2HQ0A 1H45A 5DEXB 3QXMA 5DVIA 4XKPA 4EF1A 1RYOA 5M2VA 5LOMA 4DIGA 1LSTA 2OCUA 3VLWA 3N5LA 3PPRA 1GVCA 4H0WA 1B58A 1B40A 4OZ9A 4MH5A 4AB6A 3CSGA 2V25A 5HPQA 1OMPA 4ZZAA 5CMBA 4BDNA 2F97A 2H4IA 2QMWA 3PUWE 4R6KA 3HHGA 4G68A 1GGGA 4FATA 3L6GA 1F9BA 5I59B 3THIA 2XX7A 3C35A 3FUZA 4OERA 4H5FA 3LSXA 4IO2A 4KYEA 4RPOA 4FORA 1PBPA 3EPEA 3QIMA 5I58A 2D21A 2I0BA 2XX8A 1JQFA 1MQJA 5KDTA 2I4BA 4OFLA 4U4XA 1NKXA 1EZPA 3RTFB 2XXIA 4DE8A 5CI5A 4NE4A 3FV2A 4E0XA 2FNCA 3BFUA 4LZ5A 4EDPA 3FV1A 4IB2A 2REJA 3IO6A 2A5TA 3CFLA 5ICQA 5CBRA 2GFEA 4NF4A 5AA2B 1B7UA 2HCAA 3EHUA 2DXYA 1NMUA 1YPNA 1MQIA 4F29A 4QF9A 4R75A 3G3GA 3TTRA 1Y1ZA 1D4NA 3SKPA 2HZLA 4E0WA 1LFIA 4GD5A 2NOOA 5FHNA 1M5CA 1SYIA 1IIWA 1B3EA 4H5GA 3UK4A 4NMYA 1ZMGA 4EQBA 3C32A 4UACA 1B4ZA 1MY3A 3GZGA 1USYE 3OEMA 3PUVE 2I48A 1B3HA 3ZSFA 2Q88A 1XHYA 4IO3A 4KCCA 3PD9A 1ZLQA 1B3LA 1N7WA 4U23A 1JW4A 3CIJA 3TCHA 2OJTA 3OO6A 3B6WA 3EQ1A 5I2KA 2UVGA 3LSFB 3UN6A 5JTYB 1N3WA 1MQGA 5H8HA 4H65A 4R72A 4GOTA 1MH4A 3QUJA 1PEBA 3KJTA 3TMGA 1OLCA 1LFGA 1QKAA 4FJPA 3H4ZA 3JV9A 4LQ2A 4F3BA 2I58A 1IXIA 4I62A 2Y7RA 1SW2A 3PPNA 2RC9A 3FIRA 4KYSA 3PMXA 5ISUA 3U93A 2ZNUA 4F18A 4YKPA 4GXSB 1NL5A 3H03A 3G3KA 3U72A 2IEEA 2YLNA 4F3SA 3C34A 4KQPA 1ELJA 2E1SA 1N76A 5DEXA 3M8UA 2DP8A 1RYXA 3B7DA 5ELVA 3T96B 4G8NA 3TCFA 4QHQA 1MY1A 3LC8A 3TKDA 1I6BA 4RY1A 1B2HA 5AA4A 3TTLA 2RCAA 2X7PA 3B6TA 3W9WA 1HSLA 4P0IA 2UVIA 4U2RA 2D5WA 3KOSA 2AL4A 1SW5A 3T9VA 3CFXA 1Q35A 3OOAA 3K6UA 3MVYA 4ZEKA 4ESWA 2DWHA 3T9UA 3Q27A 3OSRA 1P1UA 1SW1A 4NF5A 3VLUA 4QFKA 3TQWA 3IX1A 3SEUA 3V8XB 4EXLA 4IGRA 1VFDA 1Z7NE 3USDA 2FA7A 4FECA 1XC1A 4WXJA 4QFOA 1AIVA 2Y7KA 4EF2A 2PT2A 4KCDA 1R9LA 1II5A 2Y7PA 3VVEA 2M8CA 1SBPA 4OTEA 3IOUA 3FXRA 5AE4A 3UA8A 3S4UA 5I2NA 4OMBA 1SVXB 1MXWA 3A3CA 2DQVA 3M3KA 2OBGA 1QW0A 1JEUA 1IZ1A 1QVSA 4PE5B 4EXKA 4Q0CA 3WAEA 3PUYE 4JWXA 5B70A 3TCGA 4DZ1A 1POY1 1R1NA 2O51A 3TPAA 1KWHA 2PBWA 3HPIA 1NH7A 4RK9A 4RA1A 3RY3A 1LAFE 4I8CA 3O28A 3KSXA 2REGA 1VR5A 2H98A 3O29A 4LA9A 4OEVA 1I69A 4X1BA 2RC7A 3IOTA 2I3WA 2P1SA 2RCBA 4JWYA 4ZEDA 3D4GA 5AA3A 2Y84A 4Q5TA 5H8FA 2VOZA 2UVJA 1ZIUA 3TUSA 4IO5A 5I56A 4FEBA 2CMOA 3KZGA 3M3LA 4N13A 3CG1A 3OO9A 4YZZA 4NF6B 5KCJA 2Q2AA 1JNFA 2QL3A 1URGA 1US5A 3EHTA 4H1XA 3CR9A 4IO4A 3OMBA 1FCKA 5I57B 2DS9A 1FTKA 3WAFA 4YB6A 2Z8FA 4OETA 4THIA 3KOTA 2R71A 5TPAA 4PFYA 3TZAA 3C31A 4JB7A 1BKAA 2B3BA 4YMBA 1B1HA 3KN8A 2AL5A 2QS4A 4F1VA 3L6HA 5TP9B 2YPNA 3ZKKA 4XKQA 1SQYA 4Q30B 1BTJA 4O3CA 4NWDA 2DE4A 4G2ZA 3OO8A 2Q2CA 1SW4A 3HCQA 1Y3PA 2PMSA 2QS1A 1EU8A 1JW1A 5CMCA 3KFMA 3PPPA 1FTJA 5DT6A 5CRYA 4GIZA 2XXPA 3IB2A 2DE3A 5F1QA 1B05A 2I49A 2GHAA 5BWJA 3SEWA 1MM7A 1IUDA 4QSCA 2R9JA 1DTZA 3T22A 3G7WA 3MVZA 1Y20A 1DSNA 2O1LA 3TQLA 3ILUB 5L9OA 4H67A 3FATA 2QSXA 5H8SA 4YMAA 1UTHB 2BJJX 1OQHA 4QFNA 3DP4A 5H8QB 3K4UA 1P1NA 5A5XB 3FGSA 3VFJA 2X26A 2VP1A 1Y4CA 3SEYA 4O3BA 4Q8RA 4JWOA 3FVGA 5TU0A 4IY5A 4BDLA 4NF8B 3TODA 4UA8A 2PX1A 4HCWA 1MXVA 1MQHA 2ANJA 2O6AA 3Q29A 4F39A 4LUBA 5EHSA 3DP6A 5BUUA 1IEJA 3VVFA 2B3FA 4LATA 4N6PA 3C36A 2V84A 3IK6B 3H6WA 2LAOA 3T93B 3SETA 3FJGA 5HBCA 1B1XA 2DYXA 3TFLA 1DTGA 1M5BA 2F7CA 1IITA 3DM0A 3TAJA 2DXRA 4YB7A 1FTLA 3VXBA 3K02A 1D3KA 3H3GA 2XXHA 4NTLA 2XX9A 4MFIA 2QS2A 3R26A 1MDQA 4ELPA 1CB6A 1LCTA 1JVXA 1N7XA 3ZS6A 1A8EA 3E13X 4DXCA 2G93A 4HW8A 5H8NB 3RQTA 3I6VA 1B3FA 1FQCA 1N0TA 1S7YA 2ESNA 1N04A 4R2FA 3TELA 1LFHA 4C0RA 3FASA 5FHMA 2ZYOA 3S9NC 4O3AA 1B5JA 1D9VA 2F5XA 2ALUA 2XXYA 3FVKA 5CMKA 4OQOA 2A5SA 3VDFA 3RGYA 1N3XA 1MH3A 3W15C 2ONKE 3PUXE 1A99A 1UTBB 3KG2A 2XXVA 4OHNA 5ICTA 3S9MC 2H5YA 5CC2A 2HZKA 2ABHA 3RPWA 1H76A 2F78A 3G3HA 4GLIA 1NNFA 4ELRA 5F7VA 2QS3A 3KBRA 1AMFA 4KI0E 3OD7A 3RUMA 3G3FA 2I0CA 5K2XA 4ZECA 1M5EA 4FAJA 1WDNA 2I4CA 1LB9A 1LLSA 1H43A 3IAZA 1TT1A 4KHZE 2VHAA 3CSBA 4QSDA 3SEVA 3QSLA 4YB5A 1SYHA 3DLNA 4ONYA 1MXUA 4BDMA 3RT6B 4R9FA 1IXCA 3QAXA 4I9DA 3G3IA 2DVZA 2XHDA 1ANFA 4YKIA 4TLMB 4AB5A 4X1DA 1TFAA 1IQ7A 2H25A 4ELQA 4BLAA 3QUFA 1FTOA 4JSDA 1B0HA 2I6EA 4RXLA 1SI1A 3GLBA 2R6GE 1GR2A 4OVJA 4G77A 3BKIB 1D9YA 2Q89A 3R6UA 3S9EA 3TEPA 3PPQA 1B46A 3ZKLA 1XVXA 3HSTA 4ZS9A 2XXQA 1PB8A 4IY6A 3H06B 4HTGA 2UYEA 4PFUA 3IO4A 2O84X 3T9XB 1MXXA 5IKBA 4KPTA 1BLFA 1TFDA 3MP6A 2V3UA 4MLQA 1MS7A 3K1MA 1NFTA 4GRKA 3KN7A 4M1VA 2OK2A 5I59A 1MXYA 3W9VA 4Z7EA 3UORA 3RT8A 1ZKBA 1LBBA 4PFWA 3IL1B 3AXFA 2OLBA 3H6VA 3TTNA 1VE4A 3F11A 3V83A 4XTCQ 4U1ZA 4OXVA 1FQFA 3C9HA 4G68B 4POWA 2F6PA 3C4MA 1UIUA 2GH9A 3V89B 2ZYKA 4R6HA 1JETA 3MQ9A 3VLVA 2ZXTA 4ISUA 1POTA 5AA2A 4F1UA 1SDXA 3LUYA 3O66A 5I58B 4PP0A 3PU5A 5KDTB 1UQWA 3A09A 3K6VA 1MY2A 3UP9A 4ZDMA 1MXZA 3M3FA 4ZEBA 5KZTA 4R73A 3MP8A 4XXUA 4DCYA 1QULA 5H8NA 4LZ7A 3FXQA 4MBPA 3IJXB 2YJPA 2X7QA 2A5TB 3I5OA 1OLAA 4NF4B 1B6HA 4WKMA 4F3PA 2UVHA 4LZ8A 1QUKA 2P2AA 1S50A 2D3IA 1MRPA 2QRYA 2DSFA 2O69A 3K6WA 3VV5A 1XT8A 3DELB 3MPKA 2RKMA 3ODBA 1USYH 4P0GA 4KYDA 4OWDA 3EN3A 4BDRA 1HSEA 3MZ1A 2V3TA 3MWBA 1PC3A 1B52A 3HO7A 3IOVA 2GRVA 2DVCA 4POXA 1TWYA 1L5TA 1VSOA 3DP8A 4PQJA 5JTYA 3U8QA 2ZYNA 3E4RA 3U1OA 3OXNA 2NWJA 1NNTA 5FTHA 4QRZA 4WEDA 4R74A 3K0VA 2RC8A 4ESXA 4DXUA 4GWOA 4KD5A 5HM4B 3EHSA 3OENA 4OENA 2H9BA 4QFLA 5I2KB 5H8HB 1O7TA 2OWSA 2O7UA 4LVQA 3P7IA 2Y7IA 4QSEA 2ONSA 1O63A 2ZYMA 4QFPA 2HXWA 1IXHA 1FQEA 4ND9A 4KR5A 3O6HA 1AL3A 1DPPA 1LAXA 3OELA 4TLLB 1MY0A 1FQDA 1Z7ME 1MY4A 2HAVA 5JK4A 2H99A 1B51A 1GTKA 4F2QA 5L9SA 2UXAA 1XS5A 3PPOA 1T0KA 2ZMBA 1B4HA 1EH3A 1OIBA 2AYSA 4F19A 2V93A 2W7YA 2O1MA 1CE2A 4MLVA 5DYHA 4NEDA 1EZ9A 4DCXA 5AA4B 3JYRA 2XXTA 2F8DA 5EHMA 4XIGQ 2F7BA 1P1WA 2KLFA 3K1PA 3LSLA 1H3DA 3BFTA 2HEUA 3O2AA 3IOWA 1EZOA 1R6ZA 4RNSA 4NF5B 3GXAA 3MAMA 3TDJA 1XVYA 3H6TA 4ZZEA 3G3JA 3K1NA 3CFZA 4JSOA 4H8IA 1MPDA 1URSA 1TXFA 3FVNA 3KEIA 2P0SA 1NNKA 1A54A 4YICA 5CMMA 1JW5A 3PMVA 5JEIA 2Z8EA 4X9TA 4HCYA 4Z0IA 1LAGE 4LP2B 1HSJA 4PETA 3UGWA 3KN3A 4RPNA 5I2NB 2CZLA 2QPQA 4FE8A 4F2OA 1P1OA 4XKRA 3EF7A 1JEVA 3A3UA 3MZBA 1P1QA 3MZ9A 3OO7A 4NWCA 4GXAA 3ECRA 1SI0A 1MQDA 2PYYA 4NF6A 3O9PA 1DPEA 4ELOA 1DMBA 1LB8A 1Y4TA 2G29A 2Z22A 1VFEA 1I6QA 1LCFA 3N6TA 2XXXA 2XXRA 5H8FB 3CVGA 1P99A 4ZE9A 5B7DA 4TQUQ 5I57A 5I56B 2NVUB 2HFBA 3PUZE 3K01A 3FZVA 3RLFE 5AA1A 3LSWA 1QUJA 3MJNA 1AOVA 1ZU0A 4DLDA 5KCJB 1B32A 3SDFA 1NH8A 2WKYA 1PDAA 3SERA 3OEKA 5CBSA 3PV0E 4DXBA 4LONB 4JXIA 4R2BA 5TP9A 3QK6A 1A40A 1JVYA 4U1OA 5K2YA 1NNPA 5J1DA 3FJ7A 3IJOB 3GBBA 2Z23A 4XKNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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