1D9VA

Haemophilus influenzae ferric-binding protein apo form
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
309
structure length
309
Chain Sequence
DITVYNGQHKEAATAVAKAFEQETGIKVTLNSGKSEQLAGQLKEEGDKTPADVFYTEQTATFADLSEAGLLAPISEQTIQQTAQKGVPLAPKKDWIALSGRSRVVVYDHTKLSEKDMEKSVLDYATPKWKGKIGYVSTSGAFLEQVVALSKMKGDKVALNWLKGLKENGKLYAKNSVALQAVENGEVPAALINNYYWYNLAKEKGVENLKSRLYFVRHQDPGALVSYSGAAVLKASKNQAEAQKFVDFLASKKGQEALVAARAEYPLRADVVSPFNLEPYEKLEAPVVSATTAQDKEHAIKLIEEAGLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Metal binding protein
molecule keywords PROTEIN (iron-utilization periplasmic protein)
publication title Crystallographic and biochemical analyses of the metal-free Haemophilus influenzae Fe3+-binding protein.
pubmed doi rcsb
source organism Haemophilus influenzae
total genus 115
structure length 309
sequence length 309
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-10-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1d9vA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1d9vA01
4ELOA 2ABHA 3W15C 1D9VA 3RT6B 4IY5A 5I58A 3Q27A 1N3XA 3TQLA 2XXXA 3JZJA 3S2VA 4LQ2A 4LZ7A 2F36A 4R9GA 3FVKA 1B1XA 4POXA 2OJTA 3H3GA 3G3GA 4KCDA 1VSOA 3ILTB 1QUJA 3H6WA 3S9EA 2ZYMA 3UA8A 2QS1A 3IAZA 1Y3QA 4FJPA 3MC2A 1GTKA 2ONSA 3TCHA 3E9XA 4OFLA 4KYDA 1EZOA 2Y84A 2VGQA 3H03A 3HPIA 1MXXA 4GRKA 4FEBA 2A5SA 3C31A 1XS5A 1B5JA 4MLQA 4OXVA 2GHAA 1SQYA 1URDA 3Q28A 1NNFA 1OQGA 1XHYA 1XVXA 2OLBA 1QKBA 2VHAA 4KHZE 1D3KA 4ZEDA 5LOMA 1MQDA 4H5GA 1USYH 4Z7EA 2B65A 3VFJA 3OO8A 4L17A 2QJEA 4ZEBA 3TMGA 4HS7A 4F1VA 3N6TA 3SEVA 3CSBA 3LR1A 1PB8A 1Z7ME 2XX8A 1XVYA 5AA2D 4GFRA 5IKBA 4E0WA 5CBRA 3C35A 5H8QB 4YKIA 4LP2B 4QRZA 5DTBA 1MY0A 2HAUA 3KEIA 1FTOA 2QL3A 4DXUA 4PFUA 4YB6A 4KQPA 2I4BA 2F8DA 3I6VA 4EXKA 2DXRA 4O3AA 3G3FA 3K1PA 3KSJA 2XXVA 4Q8RA 1SI1A 3MAMA 3G7WA 2OBGA 5CMBA 5DT6A 3RGYA 1LSTA 1AH5A 5AA2B 2H5YA 2UVIA 4TLLB 4ZEKA 3JYRA 4Q5TA 3PUWE 3DP8A 4JB7A 3TEPA 1B3GA 3DLNA 2QRYA 4TLMB 1LGBC 3FJ7A 1WVJA 5I57B 5K2YA 2ZXTA 2ZYNA 4ONYA 2DVCA 3K00A 1XC1A 2ONKE 3N5LA 1CB6A 4DXBA 4ZE9A 3KN3A 5DEXB 3IL1B 4F39A 4O3BA 4LVQA 1QUKA 4U2RA 3KJ7A 1S7YA 4ZZEA 4BDQA 3S9NC 4G68A 3IOTA 2Q8JA 1HSJA 3I3VA 3OSQA 3HO7A 1MRPA 2Q89A 5L9SA 2ZNTA 4N13A 1O64A 2HXWA 1O7TA 4OZ9A 1OMPA 3JV9A 1Y20A 2Q88A 1JW5A 2XXWA 1H45A 2E0SA 1SW4A 5A5XA 3TPAA 4RNSA 1SYHA 2RCAA 1NMUA 1B52A 1VE4A 1Y3NA 4PFTA 5H8FA 4G77A 1TT1A 4YICA 5EHMA 5TP9B 2DWIA 4H8JA 1OIBA 2YJPA 2P0SA 2X7PA 4H8IA 4JXIA 3TELA 2ZMBA 1DSNA 1IIWA 3CRBA 3Q26A 3VVEA 1MY4A 4PFWA 4HTGA 5EYFA 4U4SA 4ZE8A 5HM4B 1AL3A 1EH3A 1OQHA 4K3FA 1UTHA 2CMOA 1A8EA 3A09A 4P0GA 3RQTA 1IITA 1SDXA 2F5XA 4Q0CA 1DTGA 4ZEIA 2Y7RA 3D4CA 3DELB 3MVZA 1A8FA 3LSLA 2ZNUA 3HCQA 3MWBA 5L9MA 2Y7KA 4DIGA 5I59A 1RKMA 5AA4A 1B1HA 3FJMA 1B4HA 3MPLA 3T9VA 4YAHX 3PUZE 3FZVA 4RY1A 1XOCA 4KFQA 4QSCA 4NEDA 3OOAA 3U92A 1R9QA 5I2NB 4EF2A 2O84X 3O2AA 4NWDA 4XKPA 2I0CA 4U22A 1A40A 2I4CA 2XHDA 2ZYKA 3KZGA 3TQWA 2H9BA 1EZ9A 1L5TA 1JNFA 2R6GE 3KFMA 4IGRA 3IR1A 1B7ZA 2FNCA 3KBRA 2THIA 1LFGA 3PUVE 3TTKA 2Y7PA 4PFYA 5JEIA 2P2AA 3CVGA 2CZLA 2OCUA 4YKKA 1UTBA 3PV0E 2GRVA 4F1UA 2RINA 1Y1MA 1ZIUA 4QSDA 2H4IA 3A3CA 3HV1A 3Q29A 4GF8A 1B0LA 3TYHA 3QXMA 1FW0A 3LC8A 2KLFA 4WEPA 4OENA 4R6YA 3MW0A 3PMXA 3O6HA 1RYOA 2XXHA 3IB0A 4JDFA 5BWJA 3MUQA 2O68A 1OLCA 3VE1B 3U8QA 1WDNA 4ZEFA 1JVYA 1RYXA 3QK6A 3V8XB 4FAJA 4N6PA 2F7AA 3O66A 5TPAB 1LAGE 3F11A 4ELRA 4F18A 2O6AA 3VVDA 5I2KB 4DE8A 4RK9A 1LAHE 4F3BA 1ZJLA 3OD7A 2AYSA 4DCYA 2I49A 1MPCA 1Q1KA 4R6KA 1YCJA 4NWCA 4M4GA 1KWHA 1AIVA 1QKAA 2I58A 1A54A 4QFNA 5TU0A 2NVUB 4DDDA 2DVZA 3USDA 4RYAA 1AOVA 2QPQA 1FTLA 3SERA 4GL8A 4JSOA 2Z8FA 5CI5A 3VDFA 3B6WA 3K2DA 3PPQA 4I8CA 4FIMA 5JTYB 3PGFA 4ND9A 3K1NA 4X1DA 2Z8DA 4MFIA 2I0BA 4H0WA 1GGGA 4WKMA 3ZKKA 1VFDA 3MZBA 3M3KA 1YTVA 3FV2A 2H98A 3FXUA 4G8MA 4H5FA 3SESA 4OESA 2GFEA 3E4RA 2I3WA 4I1DA 5I56A 4R9FA 4BLAA 1M5CA 2RC7A 1ATGA 1JVXA 5F7VA 3VXCA 2REJA 4ECFA 4KYSA 3KOTA 4EQBA 1ZTYA 3ILUB 4LQ5A 3UORA 1B5IA 1IEJA 3PD9A 3DM0A 1B51A 1POTA 4DCXA 4THIA 3RLFE 2O1MA 3OEMA 5B7DA 3MP1A 3U1OA 1NFTA 3QUFA 1HSEA 1B3FA 3ECRA 1ZU0A 3H6VA 1MDQA 2OWSA 2REGA 3OXNA 2VD2A 1XT8A 3PPRA 3EHSA 4U1ZA 3KN8A 4EF1A 4MLVA 3EN3A 1H76A 2XX9A 1B58A 3VVFA 1NL5A 3R7XA 3P7IA 1MM6A 3LUYA 3H06B 5H8HA 4FE8A 3C36A 3O6GA 3IB1A 4OQOA 1GV8A 2R9JA 3MP8A 4U1OA 2NWJA 4LONB 3EHTA 4H65A 3FD3A 1FQFA 4RK2A 5H8SA 1US4A 2B3FA 2NXOA 3B6QA 4IY6A 2M8CA 5L9OA 1MY2A 4IGTA 3O6IA 3WAFA 1VFEA 3N6UA 1PDAA 1UIUA 1OVTA 5FTIA 1JW4A 1JEVA 3AXFA 1H44A 3K01A 2Z22A 3GLBA 5AE4A 1B9JA 4OVJA 4Q30B 3K4UA 3MBPA 5EHSA 2RC8A 3OO7A 4GVOA 4YMAA 3FJGA 4NF6B 3K6WA 1M5FA 2QMXA 1B5HA 5K2XA 2UVHA 5JK4A 1TFDA 1CE2A 4I9DA 5FHOA 4OETA 4ZECA 3ODBA 1SW1A 2I48A 1UQWA 5I84A 3KOSA 3TTMA 2PVUA 2DOJA 3B7DA 3VXBA 2O69A 2F34A 1S50A 3UN6A 4QFKA 3TFLA 3THIA 1DTZA 4DXCA 4F29A 3O97A 4U4XA 1P1WA 4YMBA 3OENA 1MQHA 3CIJA 3R6UA 3S4UA 2DP8A 2HFBA 4R2BA 3Q25A 5H8NB 4G68B 4G4PA 1P1QA 4XKRA 5TP9A 4JWOA 3K1MA 5IAIA 2DXYA 1I69A 4BDMA 2RKMA 2V3QA 4GOTA 3OELA 1JW1A 1QULA 5AA1A 3H6UA 3IORA 3H6TA 4ELPA 1US5A 1LBBA 5J1DA 5FHMA 3BKIB 2XD2A 3EQ1A 4YB7A 5CMKA 5A5XB 2ZNSA 2PT1A 4OERA 1H43A 4QSEA 1B7UA 3TTNA 5CRYA 5H8FB 1LCFA 3T66A 3ZKLA 2GHBA 4GL0A 2AL5A 1IXIA 4F3PA 1M5EA 5F1QA 2UYFA 1QJMA 2PX1A 2XXPA 3C34A 2W7YA 4UACA 4F31B 4FATA 2PBWA 2DWHA 5CM6A 2RCBA 3I5OA 3FASA 4FORA 3RNNA 3VLWA 3TCFA 4RXLA 1MPDA 1GVCA 4RPNA 1Q35A 1UTHB 4EDPA 2ALUA 4R75A 1NNTA 5DVFA 3GBBA 2HZLA 3IK6B 4WEDA 3A3UA 1MQIA 3BFTA 3FV1A 2QSXA 2WKYA 1B6HA 3T93B 4GIZA 4JSDA 2I6EA 1IXHA 4LATA 2D5WA 1SBPA 4QFLA 3PPNA 1ELJA 4HW8A 2BJJX 4QFPA 2VOZA 5AA4B 3RTFB 3ONMA 4BDLA 1B4ZA 4I62A 3W9WA 2IEEA 5HBCA 5AA3A 1LBCA 2DSFA 4IO2A 5HPQA 2A5TB 3V83A 1WODA 3SEWA 3G3HA 3SETA 2F97A 2HZKA 4WXJA 2NOOA 1R6ZA 2G29A 4EUOA 1YAEA 3OSRA 3SDFA 4FECA 3UIFA 2V93A 2XXTA 1LLSA 3D4GA 3MPKA 3C33A 2OWTA 1NNKA 1I6BA 4NF8A 3M8UA 3MQ9A 3H7MA 1DOTA 3OEKA 4ISUA 4GWOA 3M3FA 3T22A 4QHQA 1UTBB 2X26A 4NF5B 4H67A 3MVXA 3PD8A 3RY3A 2YLNA 4FEDA 4ESXA 3FVGA 2DYXA 1MM7A 4U23A 4MH5A 3CSGA 1M5BA 5CBSA 1TXFA 1ZKBA 4OEUA 1JEUA 2ZYOA 1D9YA 3FVNA 4O3CA 1POY1 1MG1A 3GZGA 4POWA 3OO6A 3H4ZA 2DWJA 3CR9A 3GXAA 3VLVA 3IO4A 4YU0A 2DS9A 2B3BA 1B46A 4OEVA 3V5AA 1ANFA 2DE3A 3SKPA 5B70A 3TODA 1FTJA 1MH4A 2X7QA 3PU5A 1N0TA 4IO5A 5KCJA 4F19A 4MBPA 1H3DA 4HCWA 2Q9TA 3E3KA 1MY3A 3OMBA 1FQAA 3CI8A 1BLFA 3VV5A 5ITPA 1ZLQA 4XIGQ 3HSTA 1MXYA 3U94A 4C1UA 5ICTA 3UP9A 5KDTB 2DE4A 3K0VA 3VLUA 4R6HA 1LFIA 2ONRA 2FA7A 1R1NA 4EQ7A 5ICQA 4NF4B 1LAXA 3B6TA 4C0RA 2XXRA 3PPPA 2YPNA 4R74A 3PUXE 1P1NA 1FQCA 3PPOA 2PMSA 5KZTA 1NH7A 3C4MA 2Y7WA 5CMCA 4DZ1A 3K02A 1N7XA 3TCGA 3O28A 4GQOA 4TOZA 1MXVA 1SYIA 5I58B 4X48A 4YZZA 3MZ1A 1FQBA 4X9TA 2VP1A 2V25A 3T9XB 1OLAA 4KCCA 4HCYA 1FTMA 3QSLA 3R26A 3IOUA 4KR5A 2O7IA 3HHFA 5I56B 3U93A 2RF1A 1BTJA 3KGCA 3S9LC 1MDP1 2V84A 5DVJA 4IO7A 5FHNA 2UVJA 2O1LA 1O63A 4H1XA 2QS2A 4MF3A 3RPWA 3O9PA 3MP6A 1N84A 1MQJA 4BDRA 2V3TA 5H8QA 4AB6A 1SI0A 4KD5A 1SW5A 2Z23A 5ITOA 4M1VA 4U21A 3PUYE 3MVWA 3FXRA 4C1TA 4EXLA 1Z7NE 2F78A 1LFHA 3CFZA 2GH9A 3SEUA 5ISUA 1QW0A 1F9BA 5FTHA 2PT2A 3N26A 4GLIA 1B3HA 2O7UA 3FIRA 3TKDA 1N3WA 1NH8A 1HSLA 3FGSA 1Y1ZA 1GR2A 5AA2A 3G3KA 1NKXA 5DYHA 4AB5A 4OMBA 5H8HB 3IOVA 2UYEA 3T9UA 3RT8A 3RN8A 2G93A 2E1SA 1LCTA 1EZPA 1B3LA 3E13X 2ESNA 4XKQA 1BP5A 2HAVA 5I57A 1B7HA 1R9LA 4ESWA 1PB9A 1B3EA 4NF6A 3IX1A 4IO6A 4P0IA 1FTKA 4F3GA 4OHNA 2LAOA 3C32A 3T9HB 2UVGA 5DEXA 4JBZA 1TFAA 4LZ8A 1P99A 2PYYA 2R71A 2XXIA 2QMWA 1Y9UA 3G3IA 3OO9A 2RC9A 3C9HA 1FQEA 3LSXA 2UXAA 2F7CA 1DPEA 1LAFE 3U72A 3TZAA 3L6GA 5BUUA 3IO6A 1MXUA 3EPEA 3RUMA 3TUSA 5H8NA 2Q2AA 1IXGA 2HQ0A 1B05A 1B40A 3S9MC 2H25A 3CFXA 4BDNA 3SEXA 1N7WA 4R73A 3T96B 3HHGA 4PE5B 3GBAA 3IOWA 1SVXB 4OFJA 1MXWA 1OVBA 1I6AA 3G3JA 4ELQA 2F35A 2DQVA 3KG2A 1PBPA 1B2HA 1BKAA 4X1BA 3BBRA 2AIXA 4KPTA 1VR5A 3ZSFA 2AL4A 4F2QA 4KI0E 1YPNA 2QS4A 1IZ1A 5ELVA 1MPBA 4E0XA 1P1OA 1USYE 4AQ4A 4PQJA 3O29A 1S9TA 4G8NA 1A55A 4PETA 2P1SA 1MQGA 4JWXA 1MS7A 1SW2A 2O51A 2Q2CA 5CMMA 4ZS9A 4G2ZA 3FATA 2I3VA 4Z0IA 3MVYA 4NTLA 3RTWB 2FYIA 3QAXA 4TQUQ 1Y3PA 1JQFA 2F6GA 3W9VA 3CFLA 4YKJA 3WAEA 1AMFA 2QS3A 1N76A 5I2NA 3FUZA 3IJOB 2DWAA 3TTLA 1MY1A 4PP0A 1D4NA 4OTEA 4F22A 4BDOA 1BIYA 2HEUA 3LSWA 1DMBA 4G68C 3N94A 5I59B 4IB2A 2V3UA 1B32A 1IUDA 1M5DA 1NNPA 4RPOA 1MXZA 1SD3A 4ZDMA 1IXCA 3SEYA 3TTRA 2A5TA 3DP4A 3KSXA 1JETA 3MZ9A 3K6XA 3QYTA 1LB8A 4H6DA 3FXQA 2D21A 1T0KA 2HCAA 2VD3A 2OZZA 3K6UA 4XKNA 3PMWA 4RA1A 4G8HA 4GD5A 1FQDA 1QVSA 4KYEA 2Z8EA 4YKPA 4P11A 2XXUA 1B0HA 3LBSA 4XTCQ 3ZS6A 2DE2A 3FVOA 2ANJA 4OWDA 4GXAA 4NF5A 1PC3A 4LA9A 3TDJA 4LUBA 1N04A 4UA8A 2H99A 3HN0A 1IQ7A 3IB2A 4ZZAA 2XD3A 2Y7IA 3TAJA 4QFOA 1QUIA 1EU8A 5TPAA 5M2VA 4NF8B 1II5A 1LB9A 4GXSB 4R2FA 3BFUA 1PEBA 1PB7A 3UK4A 3L6HA 1DPPA 4IO4A 3CG1A 5DVIA 5CC2A 1PBQA 2XXQA 5I2KA 3V89B 2OK2A 3M3LA 1URSA 1A99A 4QF9A 4EQ9A 2F7BA 3LSFB 1URGA 3CG3A 4IO3A 1MH3A 3K6VA 1FCKA 3IJXB 4N07A 4NE4A 4OFOA 2IA4A 2D3IA 1I6QA 1A7LA 4LZ5A 3QUJA 3EF7A 1P1UA 4JWYA 3PMVA 4R72A 2F6PA 4OYVA 4RJZA 2NUVA 4YB5A 4DLDA 5JTYA 5KDTA 2XX7A 3KJTA 4NMYA 1ZBMA 1J1NA 3DP6A 3MJNA 5L8DA 3EHUA 4NF4A 4XXUA 1ZMGA 2XXYA 4F2OA 1Y4CA 1Y4TA 4F1YA 1UIVA 3UGWA 4F3SA 3KN7A 3QIMA 5KCJB 1TWYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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