1D9VA

Haemophilus influenzae ferric-binding protein apo form
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
309
structure length
309
Chain Sequence
DITVYNGQHKEAATAVAKAFEQETGIKVTLNSGKSEQLAGQLKEEGDKTPADVFYTEQTATFADLSEAGLLAPISEQTIQQTAQKGVPLAPKKDWIALSGRSRVVVYDHTKLSEKDMEKSVLDYATPKWKGKIGYVSTSGAFLEQVVALSKMKGDKVALNWLKGLKENGKLYAKNSVALQAVENGEVPAALINNYYWYNLAKEKGVENLKSRLYFVRHQDPGALVSYSGAAVLKASKNQAEAQKFVDFLASKKGQEALVAARAEYPLRADVVSPFNLEPYEKLEAPVVSATTAQDKEHAIKLIEEAGLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Metal binding protein
source organism Haemophilus influenzae
publication title Crystallographic and biochemical analyses of the metal-free Haemophilus influenzae Fe3+-binding protein.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (iron-utilization periplasmic protein)
total genus 115
structure length 309
sequence length 309
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-10-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1d9vA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1d9vA01
3PMWA 5EYFA 1DOTA 3MP1A 1SDXA 3IX1A 4P0IA 4LQ2A 2FYIA 2V3QA 3EHUA 3TTNA 2UVJA 4F39A 2Y7IA 1BIYA 1P1NA 5I57B 3KSJA 2NXOA 3IB0A 1MXZA 5L9OA 4ELQA 1YCJA 1NMUA 4OENA 4BLAA 4TLLB 4EXLA 4QSDA 3G3KA 5FHMA 1IQ7A 1AOVA 5EHSA 3W15C 4GWOA 5FTHA 1MY1A 5H8NA 3B6QA 3TZAA 3IR1A 2RKMA 3UIFA 4XTCQ 5CI5A 1I6AA 1URSA 2HAUA 1D9YA 1T0KA 1SYHA 3PPOA 2WKYA 1MY3A 1BLFA 4JDFA 3VXCA 1QULA 1H43A 5H8NB 3VFJA 3T22A 1FQDA 3O6GA 1NH7A 4JSOA 3FVKA 4OFJA 4X48A 3S9EA 3GZGA 5F1QA 3ZKLA 1AMFA 3C9HA 4U1ZA 3Q27A 5ISUA 2DXRA 1WODA 4U21A 2DE3A 1USYE 3CVGA 1F9BA 4ONYA 1N04A 4R72A 4U4SA 2LAOA 1FTJA 3E9XA 3FJMA 2I0BA 2RCBA 2ZMBA 1NH8A 2R6GE 2DSFA 2ZYNA 4P11A 4ZZAA 4GVOA 3MVWA 2NVUB 4NF4A 4ISUA 3E3KA 2HZKA 3KGCA 5BUUA 4ZDMA 4MLQA 2O7IA 2UVGA 3BKIB 4BDOA 2AL4A 1FCKA 4H8JA 3RN8A 3D4CA 3MC2A 3QXMA 3H06B 4F3PA 3G3IA 2F7CA 5L9MA 4XXUA 5HPQA 4RA1A 3QK6A 3RY3A 1N0TA 2F6PA 4ELOA 3USDA 3O6HA 3MZ1A 5DTBA 3CFLA 2F34A 4HTGA 5HM4B 4DXBA 1NNFA 3H6TA 2IA4A 4LUBA 1POY1 1H44A 2Z22A 3N6TA 1SW4A 3KN3A 2HCAA 3PUZE 2H98A 4YMBA 1HSLA 3QSLA 4GF8A 3E13X 1R9QA 4QRZA 2XXXA 3GBBA 2A5SA 4FECA 1MDQA 1MQDA 2Z8DA 3CG3A 4Z7EA 2V3UA 4KYEA 1Y1ZA 3PD9A 1Q35A 3A09A 5I2NA 4EF1A 4TOZA 1LB9A 3M3LA 1N76A 3K1NA 3GLBA 1JW1A 2AIXA 4QFLA 1NNTA 4GLIA 3CRBA 1B5JA 2NOOA 3D4GA 5A5XA 5FTIA 4KCDA 1MPDA 5H8FA 2DWIA 1IITA 2GFEA 5I2NB 2P1SA 5H8HA 4PFYA 2Q8JA 4XKPA 1B05A 4X1DA 3RNNA 2B65A 4R2FA 3FJ7A 1FTKA 4H65A 2G29A 2ZXTA 2F36A 3C31A 3UA8A 3ZS6A 5A5XB 5H8FB 2UVHA 3MVZA 4G8NA 5H8HB 3OSQA 1B9JA 2PX1A 5CMKA 3VXBA 3IB1A 3V89B 3K6XA 4ESXA 1ELJA 4YB6A 3CSBA 4Q0CA 1RYXA 4F3SA 1B3EA 4AB5A 1A55A 3LSFB 2Z8EA 4YB5A 5HBCA 3Q29A 3BBRA 3UORA 4YKJA 2P2AA 4GXSB 1LCFA 3IJXB 1MRPA 1Y4TA 4GRKA 3MZ9A 1AIVA 1M5EA 2Q2AA 4Z0IA 2XXWA 1IZ1A 1A54A 1VR5A 3OMBA 1UTHA 2O6AA 4PP0A 2XXQA 1JW5A 4XKQA 4ZEIA 4Q8RA 4LVQA 2V84A 2XXHA 3WAEA 4X9TA 3OEKA 3VLWA 4LONB 3TAJA 2UVIA 3MUQA 2PMSA 2HQ0A 1UTHB 3H7MA 4DCYA 1XS5A 1B5IA 1BKAA 3T9HB 2XXVA 4EUOA 1FQCA 4IB2A 3RGYA 3EF7A 1DTGA 4R6KA 1A99A 4RYAA 1B4ZA 2H99A 3S4UA 5I84A 2QRYA 4DDDA 3M3KA 5TPAB 3OO7A 3IOVA 5JK4A 2HAVA 1J1NA 1O7TA 2Q89A 2Q2CA 3QAXA 4FATA 3K01A 3PPPA 1EZPA 3W9VA 1UTBB 3O28A 4C1TA 4LA9A 3EHSA 1RKMA 3TYHA 3K00A 3I6VA 4F3BA 1XHYA 2QS3A 1NKXA 2QL3A 4XIGQ 2GH9A 3A3UA 4PQJA 3SDFA 3QUFA 4GL8A 3LUYA 3MP6A 3PV0E 4ELRA 1XC1A 1B6HA 3T96B 2CMOA 1Y20A 4M4GA 4PETA 2VGQA 2Y84A 5DVFA 3EHTA 4YB7A 2ALUA 2I4CA 3S9LC 1FQBA 3FATA 4UA8A 4F18A 4OTEA 3LSXA 5H8QA 2X26A 2HXWA 3EPEA 3TTKA 4F19A 4U23A 4POWA 3RUMA 4NWDA 3FGSA 3T66A 4H67A 1FTLA 5AA1A 3H4ZA 3A3CA 3PPRA 4KCCA 1BTJA 1UIUA 1MXYA 4FIMA 2I3VA 5H8QB 1WVJA 1M5DA 2DYXA 1IXIA 3TODA 2DWAA 3N26A 3K4UA 3G7WA 3S9NC 5AA2A 4H5FA 4EQBA 4OESA 1MH4A 4F3GA 1ZKBA 3E4RA 4O3AA 3JV9A 3FUZA 4BDNA 1B3GA 3HN0A 2RINA 4F2OA 4WEPA 1MQHA 4MFIA 1OQHA 1ZU0A 5AA2B 2O1MA 1P1QA 4JB7A 5ICTA 3S2VA 3PMVA 3FVOA 3HSTA 3H3GA 1B51A 5AA3A 5EHMA 4KYDA 4IO2A 2GRVA 5I56A 4I8CA 1M5FA 2OLBA 2OWSA 3CFZA 2UYFA 4OYVA 3QUJA 2I6EA 4NMYA 4JWOA 4EXKA 2HFBA 2O7UA 3G3HA 2D3IA 1DPEA 1N7XA 3O66A 2M8CA 3EN3A 2DWHA 1QUJA 5JEIA 1P1OA 3SKPA 2DP8A 2Y7WA 5I56B 1Y4CA 1FW0A 5CMCA 1IEJA 3MAMA 4QF9A 1BP5A 1LBCA 3SEYA 5KDTA 1R1NA 4GQOA 3MVYA 3KJ7A 4LZ7A 4AB6A 3R7XA 2OCUA 1QUKA 2Y7KA 1H3DA 4DXCA 3TDJA 4E0XA 3Q26A 4GL0A 4GD5A 1LFIA 2PT1A 4H0WA 4G8MA 2ZYOA 5KDTB 4M1VA 3FZVA 2OK2A 1LGBC 1QUIA 4IO6A 1AL3A 3UK4A 1MXWA 2BJJX 1D9VA 4G68A 2Z23A 2PBWA 4LQ5A 3THIA 2VP1A 3OOAA 1A7LA 4FJPA 2H9BA 2XXUA 3KN7A 3BFTA 3Q25A 5CBRA 1OMPA 1Q1KA 3EQ1A 1LB8A 1Y3PA 4RY1A 1MH3A 1SBPA 1JNFA 4G68B 2REGA 3M3FA 2O1LA 1OIBA 2QMWA 4IO3A 3C4MA 2V25A 5B7DA 2O84X 4Q30B 2D5WA 3IK6B 1M5BA 1SW5A 4U22A 3IO4A 4YKKA 1VSOA 3FD3A 1IXHA 1DPPA 1USYH 1L5TA 1EZ9A 2I48A 4ZE9A 3KBRA 3TCHA 2RC7A 3FXRA 3TFLA 3C35A 1YPNA 2I49A 3PU5A 2DS9A 4HS7A 3G3FA 2RCAA 5DEXA 5DVJA 4ZEFA 4XKRA 1MQIA 4LZ5A 2F8DA 3OENA 1B58A 2NWJA 1OVTA 1HSEA 1GGGA 4IO4A 4F31B 2DE4A 3U1OA 2I58A 1A8FA 5ITPA 5DEXB 1B5HA 3U72A 2XXTA 4ZZEA 3KEIA 2PYYA 1JQFA 4OMBA 2QS2A 4PE5B 3KG2A 3VDFA 4QFNA 3PMXA 4LZ8A 4G8HA 2ABHA 1URDA 5AA2D 3DLNA 4PFWA 4XKNA 3OXNA 3QYTA 3K6WA 3H6VA 4R6YA 4F22A 1B0HA 1JEVA 3TTLA 1IXGA 2ONKE 4DLDA 3RTFB 4OZ9A 3C36A 4RK9A 3LR1A 3HHFA 4YICA 3R26A 3O2AA 3FVNA 3TKDA 3W9WA 3PPNA 2VHAA 1LFHA 3OO9A 4ND9A 1O64A 4KD5A 3CSGA 4RNSA 4JWXA 3QIMA 3IB2A 1QVSA 3SERA 3K1PA 1A8EA 5ITOA 3TPAA 1ANFA 5JTYA 4U1OA 5BWJA 4I62A 4R9FA 4AQ4A 4FAJA 1Z7ME 1FTMA 1VFEA 1JVXA 1CB6A 1B3HA 1QKAA 1FQFA 2X7QA 3MP8A 2QJEA 4N6PA 4EDPA 1I6BA 3KSXA 1ZLQA 5JTYB 3U94A 1A40A 4OEUA 3PD8A 5TPAA 3B7DA 1ZBMA 3VLVA 1B2HA 5H8SA 4LP2B 3I5OA 4OWDA 3UP9A 1URGA 3SEWA 1B3FA 3PPQA 2B3BA 1MG1A 1SW2A 2E1SA 2F6GA 4ZECA 1P1WA 3TMGA 1LSTA 1UTBA 3FASA 1Y3QA 4OETA 3P7IA 4DIGA 3IOUA 4NF8A 1LAXA 3VVEA 3OEMA 3VV5A 4FEBA 3H6WA 4WKMA 2O69A 1FQAA 3OO6A 2V3TA 1MS7A 1H45A 4YMAA 4BDQA 3AXFA 4U2RA 3HPIA 4H5GA 4NF8B 1XT8A 4I1DA 2A5TA 3IOWA 4NTLA 2PVUA 3DP8A 1B7UA 1ZTYA 3FV1A 4X1BA 2ZNSA 1B1HA 1M5CA 1POTA 3CFXA 1MQJA 3TCGA 5KCJB 2F5XA 2A5TB 1DSNA 2DVZA 1OLCA 4HCWA 1ZMGA 4IY5A 3MBPA 3LSLA 2YLNA 4WEDA 3SEVA 2B3FA 1EZOA 1FQEA 2VOZA 2XX8A 1SI1A 3UN6A 1B52A 1NNKA 3HHGA 4YU0A 4TLMB 2AL5A 1SQYA 1MY2A 3DP4A 2THIA 5CRYA 4NF6A 2XX7A 1LLSA 2E0SA 3RTWB 4MBPA 1UIVA 2O51A 3C32A 3F11A 3Q28A 1MM7A 1B32A 3RT6B 3FXQA 2VD2A 1N3XA 1B40A 2Y7RA 4G4PA 5L9SA 2ONRA 1MY4A 2DWJA 3SESA 1H76A 4NF6B 4JSDA 2P0SA 1PB7A 3G3GA 1DTZA 3L6GA 3V5AA 1SVXB 1MQGA 5CMBA 3PUVE 4N07A 4KQPA 1UQWA 1B7ZA 3K1MA 4LATA 2QMXA 4ELPA 1HSJA 4YKPA 3VE1B 5I58A 1B3LA 1AH5A 5CMMA 3HCQA 5CC2A 1TFAA 1NNPA 2YJPA 5KZTA 3KFMA 3FVGA 3SEXA 3TQWA 1IUDA 3K6UA 1YTVA 3MJNA 1TXFA 5I58B 4E0WA 4F2QA 3DELB 3GBAA 1TWYA 3IAZA 4K3FA 5IAIA 4YAHX 3FIRA 2DOJA 2OBGA 2Z8FA 3H6UA 4R74A 3K6VA 1B1XA 2H4IA 2RF1A 1S7YA 3PUYE 3DP6A 3IO6A 1B0LA 5B70A 3IORA 1MPCA 2VD3A 3PUXE 4I9DA 4OFOA 3T9VA 3MPLA 5DT6A 1SYIA 4C1UA 4ZEDA 1ZIUA 1P99A 3SETA 4PFUA 2ANJA 1LAGE 3TELA 5FHOA 1P1UA 2XXIA 2OWTA 4YZZA 2UYEA 4NEDA 3K0VA 4ECFA 1JETA 1IIWA 4MF3A 3PUWE 4NWCA 2F7BA 3O6IA 4Q5TA 3MWBA 1MXUA 2F78A 3C33A 3CI8A 3KOSA 4HW8A 3TQLA 1RYOA 5DVIA 1XVYA 3ONMA 4F29A 1FTOA 3L6HA 1VE4A 1Z7NE 1PB9A 2QS4A 4G68C 2RC8A 1Y3NA 2ESNA 3B6WA 3OSRA 2OZZA 5I59A 3H03A 1XVXA 2XXYA 2RC9A 1KWHA 2Y7PA 3N94A 2V93A 5TU0A 3T93B 2X7PA 3LC8A 3RLFE 1TFDA 2H5YA 2QSXA 4ZE8A 3LSWA 4ZS9A 1LFGA 4NF4B 1LCTA 3IOTA 5I59B 4HCYA 3WAFA 1GR2A 3CIJA 4DCXA 4F1VA 1SI0A 4C0RA 5CM6A 3N5LA 4KPTA 4MLVA 4RXLA 4EF2A 3B6TA 1LAFE 4GIZA 1II5A 3U92A 5LOMA 1US5A 2ZYKA 1QW0A 5FHNA 1MXXA 2FNCA 2R9JA 1MDP1 4YKIA 4O3CA 3FV2A 3TCFA 2D21A 5F7VA 4DZ1A 1LBBA 4NF5A 3N6UA 2UXAA 4BDMA 1OLAA 2GHAA 3IL1B 1R9LA 1D4NA 1XOCA 1R6ZA 4IGRA 2Q9TA 3HO7A 2KLFA 3TTRA 1B4HA 2QPQA 1JW4A 1IXCA 3DM0A 3JZJA 1ATGA 4GFRA 5I2KA 4NF5B 3KOTA 3ECRA 1YAEA 5CBSA 4TQUQ 3VVDA 2W7YA 4NE4A 1GV8A 2Q88A 4KR5A 4EQ7A 4QSEA 1N3WA 4FE8A 4WXJA 5J1DA 2ONSA 5K2XA 1Y1MA 1JVYA 4F1UA 2XX9A 1D3KA 3SEUA 4PFTA 5I2KB 3CR9A 4RPNA 3S9MC 4OVJA 2DQVA 3G3JA 2F97A 3MQ9A 1PBPA 1PEBA 2YPNA 1QKBA 4KFQA 4POXA 3BFUA 4JBZA 2HEUA 5DYHA 4R9GA 4EQ9A 5ELVA 2AYSA 1VFDA 5M2VA 1N84A 1EH3A 4IY6A 3OELA 4N13A 1PBQA 4H8IA 1QJMA 2G93A 2R71A 3RPWA 4FORA 3M8UA 4RK2A 2IEEA 4U4XA 3RT8A 3VVFA 2O68A 4P0GA 2I4BA 4RJZA 3T9UA 3TUSA 4QHQA 2QS1A 4OXVA 3KJTA 2DVCA 2HZLA 2F35A 3I3VA 5ICQA 1SW1A 4IO7A 1GVCA 1NL5A 1MPBA 4JXIA 4OQOA 1NFTA 4OHNA 2DE2A 4UACA 4R2BA 1OVBA 3MZBA 4KYSA 2H25A 3JYRA 1DMBA 3MW0A 5K2YA 3FJGA 3V8XB 4IO5A 3MPKA 2CZLA 3ILTB 4ESWA 2XXPA 1JEUA 4THIA 4DE8A 4ZEKA 3U8QA 4BDRA 4OERA 1ZJLA 3ODBA 4RPOA 3C34A 1I69A 4QFOA 1TT1A 2XD3A 3ILUB 2OJTA 1PC3A 1MY0A 3R6UA 3K2DA 3K02A 1MXVA 4JWYA 4IGTA 2PT2A 1MM6A 1B7HA 1EU8A 5KCJA 4MH5A 2FA7A 4QSCA 3CG1A 1LAHE 4L17A 3U93A 3TEPA 1CE2A 4OEVA 3KZGA 2GHBA 3OD7A 2XD2A 3HV1A 3IJOB 4H6DA 5TP9A 4GXAA 5AA4A 2ZNUA 4G77A 4ZEBA 3O29A 5AE4A 4KI0E 1Y9UA 1O63A 3ZKKA 1B46A 4OFLA 2XXRA 4R6HA 3T9XB 3MVXA 4F1YA 2ZNTA 1GTKA 5TP9B 2REJA 5AA4B 1US4A 3KN8A 1SD3A 2I3WA 3FXUA 4H1XA 2NUVA 4DXUA 1S9TA 3O97A 1PB8A 3ZSFA 3VLUA 3RQTA 2XHDA 5L8DA 2F7AA 4QFPA 1S50A 3LBSA 4G2ZA 2I0CA 4GOTA 3OO8A 1OQGA 3O9PA 3GXAA 5IKBA 4R75A 3TTMA 1PDAA 2DXYA 4R73A 4FEDA 3PGFA 1N7WA 1I6QA 4KHZE 2ZYMA 4QFKA 4BDLA 3UGWA 1WDNA 4O3BA 5I57A 3V83A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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