2VOZA

Apo futa2 from synechocystis pcc6803
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
313
structure length
313
Chain Sequence
RTINLYSSRHYNTDDALYDAFGEVNLIEASAEELIERIQSEGANSPGDILFTVDAGMLWRAEQAGLFQPVRSGKLNERIPENLRHPDGLWYGFTQRARVLYYSRDRVNPADLSTYEALADPQWRGKILVRPSSNVYNLSLTASRIAIHGEPETRRWLQGLVGNFARQPEGNDTAQIRAIAAGIGDVAIANSYYYIRLQKSTDPADQEVVEKVSLFFPNTGSGERGTHVNVSGAGVLKNAPNRDAAIAFLEYLASDDAQRYFAEGNNEYPVIPGVPIDPVLAAHGQLKGDPLNVSNLGRYQPDSARLMNEVGWQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Metal binding protein
publication title Futa2 is a Ferric Binding Protein from Synechocystis Pcc 6803.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PERIPLASMIC IRON-BINDING PROTEIN
total genus 123
structure length 313
sequence length 313
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13343 SBP_bac_6 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2vozA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2vozA02
3KN8A 2Y7RA 1SYIA 1IITA 3N6TA 2GHAA 4KR5A 1O7TA 3LSXA 3MWBA 3VV5A 4XKRA 4O3AA 4JXIA 1IQ7A 2DWHA 4BDQA 1B7HA 4E0XA 3MP8A 3R6UA 1MXYA 1N0TA 1R6ZA 4FJPA 1MG1A 3C36A 4YICA 3DP4A 5H8NA 1J1NA 3M3KA 4OEVA 4I9DA 4KCDA 1URSA 3W9WA 2GHBA 3E9XA 3PMWA 2PYYA 1Y4TA 5ICTA 3HN0A 2UXAA 3TYHA 5EYFA 3PPOA 1VFEA 2DVCA 4LUBA 3RTFB 1B4HA 1GR2A 2UVJA 1JW5A 4GWOA 4PETA 3FASA 1ZKBA 3SEVA 4FATA 1KWHA 2NUVA 1LBCA 1N84A 3K01A 4KFQA 3PUZE 4JSOA 3IOTA 4OFLA 2CZLA 1IUDA 1FTJA 1ZBMA 3B6TA 1JVYA 1AOVA 3H4ZA 1A54A 1VFDA 3CSBA 4KD5A 1OLCA 3U1OA 3ONMA 3TCGA 3CRBA 1EU8A 2I49A 1Q35A 3OMBA 2QS2A 2O84X 3OO7A 1MPCA 1PC3A 1OVBA 2XX8A 1I6QA 4WEPA 4LONB 3MVYA 3H3GA 1TFDA 1PB8A 1DPPA 3TFLA 2Y7PA 1WODA 1N76A 4JDFA 4QSEA 2I0CA 4DXUA 4KI0E 4G77A 1QW0A 3E13X 2HZLA 4NF5A 5LOMA 4H67A 5M2VA 2UVGA 3GXAA 3Q27A 2DWJA 3HHFA 3FVOA 5TP9B 3VLVA 4JWOA 4LQ5A 3CG3A 2Z23A 2ABHA 4R6KA 5CBSA 3KEIA 1MH4A 5I2NA 3T9XB 2DWAA 3RGYA 1HSLA 4KCCA 3HO7A 1UTHA 3O97A 5AA1A 3WAFA 1DSNA 2V25A 3T93B 3PPNA 3LBSA 4LZ7A 3UP9A 4F1YA 1SI0A 4THIA 3M8UA 1H44A 3VDFA 1T0KA 1RYOA 1B1XA 4OERA 4F3BA 1MY1A 4PFTA 4EF2A 1FQEA 4OENA 3GBAA 2YLNA 3FJMA 3FVGA 1B2HA 5F1QA 4RPNA 4OFOA 1S50A 2Y7WA 5CMBA 4I8CA 4H65A 4DZ1A 4XXUA 4F22A 3ODBA 2B3FA 3EN3A 4R73A 1D9YA 2I4CA 5DTBA 4RPOA 1OMPA 5L9MA 3KJ7A 3KBRA 1D9VA 3MVXA 1TFAA 3N6UA 2DWIA 1BIYA 1NKXA 3H6VA 1LAGE 3MW0A 3QUJA 1LFIA 1JEUA 3PUVE 4GXSB 3SERA 4AQ4A 3TPAA 3U93A 2DXRA 3K1MA 4LP2B 1FTOA 1QVSA 2ZNUA 2G29A 2ZYKA 2DQVA 1Z7ME 2F7CA 3LSWA 1URGA 5FTHA 2OJTA 2CMOA 3O6GA 5AE4A 1OVTA 3Q25A 5JK4A 2NXOA 3MPKA 4R2BA 1N04A 2F35A 2Z8FA 4I1DA 2ESNA 5EHSA 2DSFA 3FJ7A 4ESWA 4QFOA 4NE4A 4QFNA 5HBCA 1MQJA 3MJNA 4ELRA 4FIMA 4MBPA 2OCUA 1NMUA 2Q89A 2ZNSA 2QPQA 3PD8A 2QJEA 4FEDA 1XT8A 4O3BA 3T66A 2I0BA 4ISUA 4HTGA 2HCAA 3VXCA 4ECFA 3FXQA 3EPEA 4U1OA 2R9JA 2ANJA 3TTMA 4TOZA 3I6VA 1B9JA 2REGA 2YJPA 2UYFA 2UVHA 5TU0A 3T9HB 2X7QA 4U4SA 5H8SA 2E0SA 1B3GA 5CMKA 3IORA 4KYSA 4GL8A 5TPAB 3EQ1A 3H7MA 1NH8A 1URDA 2QS3A 2UYEA 1P99A 2PVUA 2H98A 5CMMA 3O6HA 3QXMA 1OIBA 1I69A 3K6UA 1LLSA 4ZDMA 4EXKA 3G7WA 4PFWA 3S2VA 1B40A 3QAXA 5I58B 4DDDA 3G3JA 3QYTA 2I3WA 5I84A 4EDPA 1MQHA 3S9LC 3IOVA 1PEBA 1JEVA 1H45A 1I6BA 4LATA 1DTGA 3I3VA 1XS5A 3FGSA 3FJGA 4LQ2A 1LB9A 4QFLA 1P1UA 3DLNA 3PMXA 2ALUA 2DE2A 4YB7A 4U23A 4QHQA 4EQBA 4OYVA 2X26A 3R7XA 2H25A 1QUKA 4QFPA 2V3TA 4LVQA 4GVOA 1A55A 1ANFA 1FQFA 4IGTA 4YB6A 2REJA 1QUJA 1YTVA 4TLMB 1LAFE 3KG2A 5TP9A 3D4GA 1FQBA 4R6YA 1P1OA 4RXLA 3VE1B 3OO8A 5EHMA 2ONKE 4NF6B 5I57B 3O29A 2O6AA 3USDA 1JW1A 2XXIA 2QRYA 3FVNA 2IA4A 5A5XB 3TTRA 1JQFA 3CIJA 3H06B 1Q1KA 1II5A 2LAOA 1JW4A 4F31B 4QSDA 3D4CA 4KYDA 1LAXA 1PB9A 3TELA 1EZOA 1P1QA 4AB6A 1FCKA 2GH9A 2O1MA 4H8JA 2F8DA 4G4PA 5B70A 1XVYA 4JBZA 4KPTA 2RINA 4JWYA 3CI8A 3MZBA 4OESA 2WKYA 1UIUA 3ZKKA 4IO2A 3L6GA 3G3HA 3KSXA 3TAJA 3VLWA 4JSDA 5KDTB 3FIRA 2B65A 3SKPA 1AIVA 1IZ1A 2HEUA 4X9TA 3B6QA 4F39A 2QL3A 3HHGA 2NOOA 4GLIA 3QIMA 2Q2CA 1IXHA 1M5EA 3A09A 5AA4B 3FD3A 4KHZE 3QUFA 3O9PA 3B6WA 1XHYA 4GXAA 2B3BA 3TZAA 1IXCA 1SI1A 2XXTA 2DXYA 1F9BA 4ZECA 1Y3PA 3TDJA 4IO3A 4HW8A 3A3UA 1UTBB 1JNFA 2D5WA 1A99A 5L9OA 3H6TA 2VP1A 4FECA 4H8IA 4F3PA 2O69A 2PT1A 4AB5A 1EZ9A 4EXLA 3IO6A 4ND9A 5K2YA 4TLLB 3IAZA 2OWTA 4JWXA 1ZJLA 1MY3A 5DVIA 3MZ1A 3IB1A 3W15C 2DE3A 3FUZA 2QS1A 4H0WA 3IOUA 3TQWA 2V93A 4XKQA 5CM6A 1EZPA 2HQ0A 3LC8A 1RKMA 3VXBA 1AH5A 4IB2A 4NWCA 2HZKA 3TTLA 4G68C 5BUUA 4ONYA 3ZKLA 1B46A 1NL5A 3OO9A 3G3GA 1BLFA 4PE5B 2XXQA 1N7WA 4QRZA 1MXXA 3THIA 5ICQA 1US4A 3OOAA 4N07A 3F11A 4H5FA 4P0GA 3PPRA 5TPAA 4YKJA 3TTNA 5L8DA 2HFBA 4H5GA 1MM6A 3Q29A 2F6PA 1B5JA 3RPWA 3PUWE 3E4RA 2V3QA 3VVFA 4ZEIA 2V3UA 4DCYA 1SW2A 1BTJA 4WXJA 2F6GA 1LBBA 2Z8EA 4P0IA 4NTLA 4DIGA 5I58A 2Z8DA 2XXXA 4POXA 2ZMBA 3TEPA 3C31A 1LFGA 4MF3A 2O7IA 4PP0A 1M5DA 3K02A 3IX1A 1Y1MA 3TKDA 4OZ9A 2FYIA 4NF4B 2Q2AA 3OO6A 4U1ZA 2KLFA 4L17A 3IK6B 2FNCA 5ITPA 2M8CA 4H1XA 1FQCA 5AA2B 2PX1A 3DP8A 5KCJB 1BKAA 4X1DA 3CG1A 4O3CA 5FHMA 3IB0A 5ITOA 3TQLA 2X7PA 4IY6A 3V89B 2P2AA 1VR5A 3IOWA 2XXHA 4F18A 3U8QA 4ZEBA 1MRPA 3O2AA 2P1SA 3HCQA 3IB2A 2XXWA 1LCTA 3KJTA 3KOTA 4EQ7A 4NF6A 5I57A 3S9MC 1POTA 5A5XA 3E3KA 1LB8A 3ILTB 4U4XA 2I48A 3O66A 5IAIA 4RA1A 3T9UA 3PU5A 1SYHA 3FXUA 4ELPA 5DVJA 3RT8A 1B0HA 3G3FA 4OETA 3Q28A 2Y7KA 3SESA 2RC9A 1B32A 4XKNA 1R9QA 4GRKA 4ZEDA 5H8HB 3C9HA 3KOSA 1ATGA 1CE2A 4ZZAA 2DE4A 5CRYA 3W9VA 3T96B 3PPQA 4F2OA 2IEEA 1IIWA 4XTCQ 2F5XA 4F1VA 3VFJA 3KSJA 3TODA 5KDTA 1MY0A 3MC2A 1B7UA 3T9VA 1D4NA 3K1PA 3CFXA 1VE4A 5JEIA 3DELB 1FQAA 3HV1A 3VVDA 1N3WA 5I56B 3SEXA 4FORA 1SD3A 3H6UA 1BP5A 4R6HA 4ELOA 3JYRA 4HCYA 5AA4A 4ESXA 2RF1A 5H8FB 3RT6B 4LZ5A 4XIGQ 3BBRA 1B7ZA 2DVZA 3VVEA 4DE8A 4GQOA 1MDP1 5DEXB 4ZEKA 3SDFA 3EF7A 1NNFA 4NF8B 3BFUA 3MP6A 1M5FA 3BKIB 3L6HA 4Q0CA 3H6WA 1OQHA 3CR9A 1B4ZA 1ZLQA 1DOTA 3OSRA 1B3LA 1UTBA 1QULA 1MXWA 2OZZA 2D3IA 5F7VA 2H9BA 4KQPA 5FTIA 3K1NA 4EQ9A 3OD7A 3SEUA 4BDNA 1B1HA 1GTKA 3SETA 4GF8A 3S9NC 3OEMA 1B05A 5CMCA 4R74A 3KZGA 3TCFA 3Q26A 2A5TB 1DPEA 3CFLA 4MFIA 1WDNA 4P11A 2QS4A 1GGGA 1A40A 3ILUB 1TXFA 2R6GE 4QF9A 5B7DA 3OELA 2DS9A 1H3DA 4ZZEA 1PBQA 4BDLA 5BWJA 1MS7A 3UIFA 5HPQA 2XXVA 1GV8A 4K3FA 4RJZA 4I62A 4H6DA 1B6HA 5ISUA 5DYHA 1H76A 3MAMA 4MLVA 1FTKA 3M3FA 1SW1A 1XOCA 4IGRA 1Y4CA 4YAHX 2H4IA 3WAEA 1EH3A 4HS7A 5KZTA 2O68A 4G2ZA 3UA8A 4C0RA 4EUOA 2F78A 2H99A 3FXRA 4RK9A 4M1VA 2GFEA 2RCAA 1P1WA 3LSLA 4MH5A 4PFUA 1FW0A 3RLFE 4BDRA 1SW5A 5H8QB 2NWJA 3O6IA 4X1BA 3C34A 4R72A 1MM7A 2E1SA 1ZU0A 3IJXB 1YPNA 4F3GA 3LUYA 4C1TA 1MY2A 4FAJA 1AL3A 3GZGA 3S4UA 4HCWA 2ZNTA 1JVXA 1MXVA 1P1NA 4NF4A 2F7BA 3GLBA 3N94A 2O1LA 1MY4A 2XXRA 4GFRA 3ECRA 4FE8A 1Y20A 4DCXA 5AA2A 5KCJA 3C32A 3K6WA 4PQJA 4OFJA 2HXWA 5DT6A 5FHNA 1HSEA 1O64A 4ZE9A 3MPLA 4JB7A 4Q30B 5CC2A 2Z22A 3BFTA 5FHOA 3PV0E 3P7IA 3ZS6A 3OSQA 4ZEFA 3QK6A 2I58A 3EHSA 1GVCA 4R75A 1NFTA 4IO6A 5I59B 5CBRA 5CI5A 1IEJA 3CFZA 2VD2A 4ZS9A 3U72A 1S7YA 2DOJA 5DVFA 4F19A 1I6AA 1O63A 1Y1ZA 2RCBA 2Q9TA 3DM0A 2FA7A 3C35A 4ELQA 3RUMA 4IY5A 1USYE 4OMBA 2AYSA 2UVIA 2D21A 4N13A 1SW4A 3R26A 3RTWB 1Y3QA 1ZIUA 1QKBA 1Z7NE 2PT2A 4GD5A 5H8HA 1LGBC 3TMGA 1LCFA 3HPIA 1UQWA 4F3SA 2RC7A 1MPDA 3QSLA 4LA9A 3PD9A 3RNNA 1D3KA 1QKAA 2V84A 2AL5A 1MXZA 3CVGA 2ONSA 4E0WA 1B58A 5I2KB 3OXNA 4UACA 1R1NA 3SEWA 1IXGA 5I56A 4YB5A 5H8FA 2VGQA 4RNSA 2I6EA 4DXCA 3V8XB 2OBGA 5DEXA 3VLUA 4N6PA 3TUSA 3KN7A 4NF8A 3HSTA 3TCHA 3GBBA 4UA8A 4OWDA 3MZ9A 1NNTA 3UN6A 2A5SA 3RN8A 3S9EA 2ZYNA 4FEBA 4M4GA 3PPPA 3U94A 3KGCA 1XVXA 3H03A 1PBPA 5JTYB 1B51A 1NH7A 3RQTA 1XC1A 2Y84A 4G68B 4F29A 1VSOA 2VHAA 4R9GA 2ONRA 4G8HA 1MQDA 1POY1 3K0VA 5L9SA 3FZVA 3M3LA 3LSFB 2A5TA 3K4UA 1QJMA 1SQYA 2ZYMA 2DYXA 3MUQA 4DXBA 2HAUA 1B52A 2R71A 1ZMGA 3FV2A 2XXYA 1WVJA 2Q8JA 3V83A 1FTLA 4OHNA 2I4BA 4WKMA 3OENA 1NNKA 1ELJA 4YKKA 4GIZA 2I3VA 2XX9A 4IO5A 3MQ9A 4OXVA 1HSJA 4RK2A 2AIXA 3C33A 1UIVA 1DMBA 1B0LA 3V5AA 5H8NB 2VOZA 3CSGA 5ELVA 1H43A 1TT1A 4NMYA 2F36A 4POWA 4DLDA 2Q88A 2BJJX 3KN3A 2NVUB 3TTKA 1FTMA 1CB6A 3UGWA 1DTZA 2ZYOA 4Q8RA 1NNPA 1TWYA 4KYEA 2QMXA 4OQOA 4MLQA 3EHTA 4YZZA 4F1UA 2RKMA 4YU0A 4WEDA 1MPBA 4G8MA 3K2DA 2O7UA 3G3KA 5H8QA 3JV9A 4GL0A 2O51A 1SBPA 3PMVA 1Y3NA 4IO4A 1LFHA 3I5OA 2XXUA 2XXPA 1ZTYA 4GOTA 1MQIA 1LSTA 4YKPA 3LR1A 1USYH 3MP1A 1N7XA 1B5IA 1SVXB 3K6VA 3IL1B 1LAHE 2RC8A 3EHUA 2XX7A 5HM4B 1A7LA 3FATA 4NF5B 4U21A 3PUXE 2F34A 1OQGA 2Y7IA 2AL4A 4NWDA 4OVJA 1M5BA 1A8EA 3KFMA 3AXFA 3DP6A 3G3IA 4G8NA 1OLAA 4YMAA 1PDAA 4YKIA 2W7YA 3B7DA 3JZJA 1US5A 1B3EA 3PGFA 1MDQA 5I59A 4RY1A 4PFYA 4XKPA 4U2RA 1M5CA 2XHDA 5AA3A 4Z0IA 1RYXA 5I2NB 4Z7EA 3PUYE 2OK2A 4C1UA 3ZSFA 2HAVA 2OWSA 1B5HA 2F7AA 1L5TA 1UTHB 3SEYA 4YMBA 3N26A 2DP8A 3FVKA 2QSXA 5K2XA 3IJOB 3IO4A 2XD3A 4EF1A 1AMFA 3MVZA 1N3XA 2P0SA 5IKBA 1MXUA 4QSCA 1Y9UA 1IXIA 5I2KA 5J1DA 2G93A 2VD3A 2YPNA 1R9LA 4Q5TA 2PBWA 1B3HA 3K6XA 2QMWA 1PB7A 1B3FA 5AA2D 3UORA 1A8FA 1SDXA 4OTEA 3C4MA 3OEKA 2XD2A 3K00A 3IR1A 1QUIA 4U22A 4RYAA 4NEDA 3T22A 4BDMA 4IO7A 4F2QA 1YCJA 2PMSA 3MBPA 5JTYA 4TQUQ 4ZE8A 4R2FA 3O28A 3A3CA 3MVWA 4R9FA 4G68A 2ZXTA 1MH3A 1YAEA 3U92A 2H5YA 4QFKA 2F97A 1FQDA 2THIA 1S9TA 3N5LA 4BDOA 1MQGA 3UK4A 4X48A 4BLAA 3RY3A 2GRVA 1JETA 2OLBA 4LZ8A 3FV1A 4OEUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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