5I58A

Glutamate- and glycine-bound glun1/glun2a agonist binding domains with mpx-004
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
283
structure length
257
Chain Sequence
STRLKIVTIHQEPFVYVKPTMSDGTCVKKVICTGPVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein, receptor
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 71
structure length 257
sequence length 283
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i58A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i58A02
4I8CA 4JDFA 2ZNTA 1FTKA 5CM6A 4JBZA 4GIZA 1N7XA 3A09A 1SVXB 3QAXA 5I59A 3D4CA 4G77A 3S4UA 4BDNA 4NF8A 2REGA 1VSOA 1LAXA 1MM7A 2V93A 3TTRA 1A55A 1AL3A 3UA8A 4IY6A 2PX1A 1IEJA 3VXCA 4YKJA 1NKXA 5AA4B 3FJMA 4NF5A 4ZEFA 3L6HA 1A99A 5H8HA 4ZZAA 2XXQA 3IX1A 3W15C 3IB2A 3PUVE 1IIWA 1XVXA 5FHOA 3RPWA 1ELJA 1O64A 4H0WA 5TPAB 3MWBA 5IKBA 4BLAA 1B7UA 1OQHA 3S9MC 1B3LA 2ONKE 2NXOA 3T96B 4OETA 1N04A 3KGCA 4F39A 2Y7RA 4IO6A 4PFWA 1FQEA 3G3KA 2G29A 5L9MA 2ZYMA 3G3JA 3PMVA 1B3FA 1GR2A 1ZKBA 3MZ9A 3MP8A 2Q88A 2I48A 3FVGA 4G68B 1QKAA 1Y3NA 3P7IA 4TQUQ 1BP5A 3K1PA 2PT1A 2UVIA 4FIMA 2O1LA 3E9XA 4N13A 3PUWE 2R71A 2KLFA 1JEVA 3H7MA 1FTMA 1MS7A 2DWAA 3EHUA 3OD7A 4YKIA 1I69A 4FAJA 2HXWA 4OESA 4F1VA 5CI5A 1NFTA 3K1MA 4UA8A 1JW5A 2UVGA 4MBPA 1PB7A 1PBPA 2QMWA 3MC2A 5I2KA 4F19A 4F18A 1GTKA 1SBPA 1SW2A 3HPIA 3RY3A 4E0XA 4IO3A 1LFHA 2OZZA 3UORA 3E13X 3CFXA 5HM4B 5ELVA 4FORA 3U72A 4LQ2A 4XTCQ 1TXFA 3EN3A 1SYHA 4XKNA 3OXNA 1MY0A 4ZEBA 1I6BA 3V83A 4IO2A 2AYSA 3IL1B 3TCFA 2RCBA 2PVUA 1BIYA 1MQGA 4IB2A 1B0HA 4ELPA 1MH3A 5CMKA 3ONMA 4IGRA 4ISUA 1P1UA 2B3BA 3ZKLA 1SYIA 3VLUA 4DLDA 1FQBA 3DLNA 2FNCA 3PUXE 2XXXA 1P1QA 1QW0A 1JQFA 3MVWA 3GZGA 3PV0E 1MQIA 2QS2A 4O3AA 1IXGA 5TP9A 4KQPA 3MAMA 1YAEA 3K2DA 4Q5TA 3VVDA 4R75A 2QL3A 3KN3A 3CIJA 3G3IA 3H03A 3KN8A 2Y7WA 5DYHA 3S2VA 4F2OA 3R7XA 2OK2A 2VGQA 2M8CA 2ZNSA 1B0LA 4NWCA 3FD3A 4YB6A 1FCKA 4BDLA 1SW4A 4DE8A 3M3FA 4H6DA 1LCTA 2BJJX 2OLBA 1D4NA 2NOOA 4F29A 2HAVA 3IB0A 3V89B 1B1HA 2W7YA 4EQ7A 2ZYNA 4LQ5A 4F3SA 3UP9A 4OFLA 3Q26A 4U4XA 1POY1 4TLLB 5ISUA 4H5FA 2NUVA 1BKAA 3EQ1A 2DE3A 3PD9A 3SESA 1MY4A 4QFOA 1N0TA 3GBAA 1QUIA 2Z8EA 4EF2A 3IJXB 5A5XA 2H4IA 4TOZA 1B46A 1ZTYA 1UTHB 5KDTB 1VE4A 1LFGA 5DEXA 1B9JA 3O28A 2VD2A 1FQFA 2Q8JA 3FV2A 4NWDA 5H8NB 1Z7NE 5I57A 2F97A 4PFTA 3A3UA 5EHMA 4OENA 1HSJA 3OENA 1MQJA 3OSRA 4FE8A 2GHBA 4JSDA 3DP8A 2THIA 5FTIA 3FATA 3SETA 1MXXA 2H98A 5I58A 2H99A 1JEUA 4PETA 1B32A 1XC1A 1IITA 1D9VA 2CMOA 3KJ7A 1XOCA 3JZJA 4RYAA 3TPAA 1B3HA 4U1ZA 3IR1A 2HEUA 1VFEA 1B5IA 4I62A 4LP2B 5HPQA 2UVJA 4L17A 3GLBA 3C36A 1S7YA 3MQ9A 4GL0A 4G68C 3OSQA 3CFLA 4N6PA 3U8QA 3IOTA 1HSLA 4KYDA 3CVGA 1SI0A 3B6TA 3BFTA 3OOAA 2P2AA 4I9DA 4ELQA 1SW1A 3QIMA 3B6WA 5TU0A 3HN0A 1H45A 1D9YA 1O7TA 4YB7A 1OQGA 3W9VA 1H76A 3A3CA 2ALUA 2ZNUA 3QUJA 1B4HA 1N3WA 3LSWA 4POWA 5JTYA 4U1OA 4IO4A 3N5LA 4NEDA 1DTZA 4JB7A 1GGGA 1DTGA 1AH5A 3PMWA 4G8HA 2I58A 3K02A 1IQ7A 2XXWA 4LZ8A 3TDJA 4F1UA 2VD3A 3B6QA 3T93B 2Y7IA 2OWTA 1B4ZA 3TEPA 2ZXTA 1B1XA 3GXAA 2X7QA 1FQAA 1MXZA 4JWOA 2OBGA 4KCCA 3MVZA 1EU8A 3L6GA 3EPEA 1DPEA 1Y1ZA 2O1MA 2P1SA 5L8DA 3KZGA 1I6QA 1HSEA 5CMMA 4KD5A 3V8XB 3SDFA 4P11A 1PC3A 4LVQA 1FQCA 5AA1A 1MG1A 2ONRA 1ANFA 2GHAA 3FIRA 3K6UA 1B3EA 4YZZA 1MXUA 4KYSA 3C4MA 2UXAA 3IJOB 1LFIA 3FXUA 1URDA 4Z0IA 1FTOA 1TWYA 2IEEA 2HZLA 4NTLA 4QF9A 4WEDA 5I2NA 1QVSA 2V3TA 3FXQA 1LBCA 1B7ZA 4H5GA 2V3QA 4KYEA 3VDFA 3WAFA 2H9BA 2XX8A 3FVNA 3RNNA 1OMPA 4OZ9A 3N26A 3LSFB 2DSFA 4GL8A 1B5HA 4R6KA 4E0WA 1LAFE 5ITOA 3O6HA 4RXLA 5DT6A 1DSNA 2F36A 3VV5A 2DP8A 2LAOA 3PPNA 5HBCA 3QYTA 1T0KA 2V25A 1ZMGA 2GFEA 3IK6B 4KI0E 2F7AA 3RLFE 3KFMA 3IO6A 3CRBA 2QSXA 3KJTA 3H6TA 1B40A 2QPQA 2DYXA 3ZS6A 3FVOA 4ZZEA 3G7WA 4EF1A 3O97A 1UTBB 2QRYA 1LGBC 5AA3A 4I1DA 3KBRA 1H44A 4KFQA 3LSLA 4C1TA 3JV9A 1FTJA 2RC7A 4GOTA 4KPTA 4ZEIA 5B70A 2ZYOA 4OEUA 1NH8A 2ANJA 3DP6A 2HFBA 3SKPA 3TAJA 3K6WA 4P0IA 1MXYA 4N07A 2VOZA 3RN8A 1Q1KA 4NF4B 4R2BA 5AA2B 2NVUB 5I56B 1Z7ME 3RGYA 4GFRA 3TFLA 1R9QA 4GXAA 3MJNA 4PE5B 2XHDA 3OO6A 4K3FA 5JEIA 4NF6B 1WVJA 1XT8A 1LB8A 3OO8A 3MPLA 5H8QB 1SW5A 3HHGA 1SD3A 1M5EA 1PEBA 3TUSA 1ZJLA 2QS3A 4YB5A 4YU0A 4Q0CA 2X7PA 1FTLA 4EXKA 4RA1A 1QUKA 2RKMA 3TELA 4XXUA 4NMYA 1PDAA 3FV1A 5L9SA 1MXVA 2A5TB 1J1NA 3OO7A 1B52A 4QFKA 4JWYA 2RC9A 3O29A 2F8DA 2Y7KA 4GXSB 4JSOA 4NE4A 1IXHA 1N76A 2P0SA 3I5OA 3T9HB 3B7DA 5KCJB 4RPOA 4FJPA 2X26A 2F7CA 1TFDA 3T9XB 3KG2A 1MPDA 4YMBA 2UVHA 1M5DA 5AA4A 4M1VA 2I3WA 4QHQA 4FEBA 1RKMA 4AB5A 2Z22A 3CI8A 4RK9A 1LSTA 2FA7A 4DZ1A 2I3VA 1B05A 2F7BA 1M5FA 2F35A 4XKQA 3TCGA 3BKIB 1A54A 2Q2AA 4R73A 4R9GA 1RYXA 5TPAA 2OWSA 1BLFA 2B65A 4YAHX 2DS9A 3H3GA 1TFAA 3TODA 3KSXA 1MM6A 1OIBA 2E1SA 4R6HA 2H5YA 4U2RA 1IXCA 1D3KA 4PQJA 1IZ1A 1EH3A 1M5CA 4LATA 2GRVA 3K0VA 4BDOA 3IOUA 4G68A 1Y3QA 3DP4A 2DVZA 4LZ5A 2D21A 5CBSA 2XXTA 3KN7A 3VE1B 1XVYA 2VP1A 3IOVA 3OO9A 1ZIUA 5FTHA 5EHSA 3FZVA 5H8FB 4MLQA 1ZU0A 5BUUA 4F1YA 2OCUA 1Y4TA 4QFLA 4RY1A 3KSJA 1RYOA 4OHNA 5F1QA 2Q9TA 4OQOA 3UGWA 1N7WA 3CSGA 2Z8DA 1R1NA 4YMAA 1YPNA 2ZYKA 3VLVA 4XKPA 3ZSFA 3K6VA 1Q35A 1SI1A 4YKPA 5I59B 4R74A 3O6IA 4OFOA 4H65A 2AL5A 4QSEA 2I0CA 4NF8B 5I2NB 4FECA 4M4GA 3C35A 1NNKA 1LLSA 1US4A 1B3GA 3PGFA 3TMGA 1EZ9A 1H43A 3WAEA 4U22A 5LOMA 2H25A 2REJA 3BBRA 4X9TA 1UIVA 3CFZA 4R2FA 4WXJA 1CE2A 4NF5B 1PB9A 3O6GA 5BWJA 3M8UA 1WODA 3R6UA 2PYYA 5H8SA 2ZMBA 2Z8FA 5ITPA 3PPQA 1JETA 5H8HB 2ABHA 1PB8A 2AL4A 4POXA 4HCYA 2DVCA 2O6AA 4U23A 4F3BA 3K00A 1P1OA 2R9JA 2YPNA 1I6AA 2XX7A 1A8EA 3IOWA 4ND9A 2B3FA 1LBBA 3U94A 4QSDA 2HAUA 4QSCA 4PFUA 4ESWA 3N94A 2G93A 3LSXA 1AMFA 4X48A 3DM0A 2XXYA 3T9UA 1NNTA 3MZ1A 4PFYA 3FXRA 4GD5A 4ZEKA 4H8IA 2ESNA 4MF3A 4RK2A 3I6VA 4F3PA 1GV8A 2DE4A 1NL5A 5ICQA 4ZE9A 3C34A 1A8FA 5F7VA 2HZKA 2Z23A 4JXIA 4H8JA 2FYIA 3ECRA 2DE2A 4ONYA 3U93A 4THIA 4JWXA 1IXIA 2I4BA 1UQWA 2F6PA 3RT8A 3MZBA 2R6GE 5I2KB 1B5JA 1A7LA 4LONB 3MVYA 3F11A 3H6UA 1P99A 4EQ9A 3RUMA 5FHMA 1LAHE 2O84X 4RNSA 1NH7A 5AE4A 1USYE 3TTMA 1OLCA 1QULA 3PMXA 1B51A 4OFJA 1UTHA 5KDTA 4OYVA 3VFJA 1Y3PA 1USYH 3N6UA 1MY3A 2XXRA 5H8NA 2UYFA 1JVXA 3S9EA 1S50A 3HSTA 1EZOA 3FASA 3SERA 1N3XA 4WEPA 3W9WA 3IB1A 1POTA 4GRKA 4ECFA 4EUOA 2V84A 1URSA 4EXLA 4IO7A 3TCHA 1MXWA 3K1NA 3ODBA 1N84A 2VHAA 4OERA 1DPPA 4AB6A 2O7UA 3OEKA 5K2XA 1MRPA 3D4GA 5DVFA 2XXUA 2XD3A 1MH4A 3O2AA 4OWDA 5K2YA 1QKBA 2QMXA 4OMBA 5DTBA 4DXUA 2NWJA 4U4SA 3Q29A 2DWIA 3K4UA 4G8NA 3SEUA 3VLWA 1Y1MA 3E4RA 3T66A 3TKDA 2Y7PA 2XX9A 5TP9B 1II5A 1QJMA 2OJTA 2F34A 3RTFB 3VVFA 3GBBA 2YJPA 3LBSA 1B6HA 3O9PA 1WDNA 3H6WA 4BDQA 3U1OA 1MDQA 3MW0A 1A40A 3RQTA 4KHZE 4IGTA 2Q89A 3PUZE 4OVJA 4ZEDA 3V5AA 3S9NC 1DOTA 3Q28A 4LA9A 4DCXA 1EZPA 3MP6A 1UIUA 1OVBA 1OLAA 3T22A 1MY2A 3S9LC 3TQWA 3MBPA 2I49A 2DWJA 4KR5A 4AQ4A 2XXPA 3PPRA 2QS4A 2ONSA 2Y84A 3MVXA 3PPPA 2F5XA 3E3KA 2A5SA 3CG3A 5L9OA 1S9TA 5A5XB 1MDP1 4GF8A 4C0RA 2PT2A 5DEXB 3C32A 5DVJA 1GVCA 5I57B 4F31B 2DQVA 3AXFA 3OEMA 1L5TA 1R6ZA 1XHYA 3IAZA 1AOVA 3ZKKA 5KZTA 5I58B 1LAGE 1H3DA 4OTEA 1LB9A 5B7DA 1JW4A 4ZE8A 3T9VA 4ESXA 3PD8A 2AIXA 3FJGA 4ZDMA 5CC2A 5CMBA 4GLIA 3LUYA 2D3IA 3N6TA 5M2VA 3G3HA 1B58A 5ICTA 2XXIA 3O66A 3H6VA 4EDPA 2HCAA 2DOJA 3HCQA 2RF1A 2CZLA 1F9BA 3H06B 4R6YA 4UACA 2I6EA 4G2ZA 3KOSA 4LUBA 1O63A 3QSLA 3G3FA 2IA4A 3M3LA 2RC8A 4DIGA 2RCAA 2DXRA 1NNPA 5AA2D 3K01A 3EHSA 4FATA 4IO5A 3UK4A 4C1UA 2E0SA 3QUFA 3R26A 3U92A 4DXCA 5JTYB 4PP0A 4LZ7A 1SQYA 1ZBMA 2O7IA 1UTBA 3SEYA 2XXHA 4MH5A 3OELA 3TTLA 3USDA 3G3GA 2QJEA 4F2QA 1US5A 4QFNA 4X1BA 3RT6B 3MP1A 1M5BA 2PBWA 5FHNA 1Y9UA 4Q30B 4H67A 4GVOA 3RTWB 4HS7A 1P1NA 1B7HA 2F78A 3LR1A 1VR5A 1KWHA 3HHFA 1JVYA 3FGSA 3JYRA 2WKYA 4RPNA 1DMBA 1ZLQA 3EHTA 4G4PA 1BTJA 3KEIA 4NF4A 5AA2A 5DVIA 1MPBA 5I56A 4H1XA 4O3BA 1LCFA 2XXVA 1CB6A 1MQDA 4NF6A 1AIVA 1Y20A 1P1WA 5CBRA 4QFPA 5H8QA 1VFDA 1YTVA 4ZECA 3OMBA 2YLNA 2O51A 3QK6A 3PU5A 3PUYE 4ELOA 4OEVA 2DWHA 1B2HA 3SEXA 3HV1A 4OXVA 2A5TA 2HQ0A 5I84A 2RINA 4QRZA 4DDDA 3TZAA 3C9HA 1MQHA 4YKKA 2UYEA 3Q25A 3TQLA 2QS1A 3FVKA 5KCJA 3UN6A 4O3CA 3Q27A 2GH9A 2I0BA 3FJ7A 4RJZA 2O68A 2PMSA 4FEDA 2DXYA 3ILUB 3K6XA 3ILTB 4U21A 3MUQA 4IY5A 3C33A 4TLMB 1NMUA 3BFUA 4R9FA 4BDMA 3CG1A 3SEVA 3UIFA 1QUJA 1MPCA 4GQOA 3DELB 4XIGQ 3CSBA 3I3VA 4DXBA 4HW8A 4MFIA 4WKMA 1Y4CA 1JNFA 3TTNA 5EYFA 2O69A 1IUDA 1FQDA 3IORA 4EQBA 1TT1A 3IO4A 3TTKA 1URGA 4Z7EA 2F6GA 4P0GA 4X1DA 2D5WA 5J1DA 3VVEA 4YICA 5JK4A 3KOTA 1ATGA 3SEWA 4ZS9A 1NNFA 3FUZA 5CRYA 4XKRA 3QXMA 1YCJA 1SDXA 2XD2A 4Q8RA 3HO7A 3LC8A 4MLVA 3MPKA 3EF7A 4HCWA 3M3KA 3VXBA 5IAIA 4ELRA 4R72A 1R9LA 5H8FA 3C31A 2V3UA 4BDRA 5CMCA 1FW0A 1XS5A 1JW1A 3THIA 1MY1A 4F3GA 4KCDA 4GWOA 2Q2CA 3CR9A 3PPOA 1PBQA 3TYHA 4F22A 4DCYA 3H4ZA 4G8MA 1OVTA 4HTGA 2I4CA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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