4ISUA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j) in complex with the antagonist (2r)-ikm-159 at 2.3a resolution.
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
b'KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Studies on an (S)-2-amino-3-(3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazolyl)propionic acid (AMPA) receptor antagonist IKM-159: asymmetric synthesis, neuroactivity, and structural characterization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein/antagonist
total genus 80
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-01-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4isuA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4isuA02
4R73A 2PBWA 1QUKA 1FTJA 4X1BA 2PT1A 5I2NB 1A54A 1FTMA 2QS4A 3PMVA 1IXIA 1LFGA 2DE2A 2UXAA 3TYHA 4BDRA 5I58A 4H8JA 3IO6A 4ZZAA 5FHNA 1CB6A 3IR1A 2IEEA 1OMPA 1B32A 4XIGQ 3MJNA 1B3HA 1B5IA 1JEVA 3MQ9A 4PE5B 4QFOA 2Y7WA 5I84A 2XXYA 1S50A 4EF1A 4I8CA 4F1UA 3K6WA 3OO9A 3OSRA 4KCDA 2O51A 4FEDA 4IB2A 1DSNA 3O9PA 1MPCA 4UACA 5AE4A 5JK4A 4Q30B 3EN3A 5F7VA 3Q26A 3CG3A 1A8EA 5HBCA 2I6EA 1Q35A 3SEVA 3TCGA 1ZKBA 4O3BA 2RC8A 4RXLA 3N26A 2Q8JA 4R9FA 4OTEA 2P2AA 1IEJA 3C4MA 1FQEA 2OZZA 5AA1A 3KJTA 4DXUA 3FXUA 4KFQA 1RYXA 1YTVA 4G4PA 3M3LA 2Q89A 3G3IA 1I6BA 1EZ9A 1VR5A 3PUYE 3S2VA 1QW0A 3FD3A 3LR1A 3SEUA 2PX1A 5HPQA 1T0KA 4GIZA 2BJJX 3U8QA 1PBQA 4ND9A 4UA8A 3MZ1A 4DE8A 5H8SA 1TFDA 2IA4A 5ICQA 1LAGE 3OSQA 1AIVA 1B0HA 1WVJA 1A8FA 3TCHA 4EXLA 1MQJA 1YAEA 2VGQA 1B7ZA 3OXNA 5LOMA 4OZ9A 4YU0A 3TTLA 4IO2A 2XXVA 3SESA 2A5TB 4I1DA 3I6VA 4E0XA 1S9TA 4OVJA 4JSOA 4YB5A 1EZPA 3R6UA 1NNFA 4KCCA 2X26A 1MXYA 3T9XB 3PUZE 4EF2A 3PPNA 3TTNA 2DVCA 4GXAA 3CFLA 1NNTA 1J1NA 1MDQA 2F7BA 1B7HA 4F29A 2Y7IA 3LBSA 2D3IA 4DLDA 3K6XA 4MF3A 4BDNA 3K0VA 4F22A 5F1QA 3C33A 4I9DA 4DDDA 1MY4A 4U4XA 5M2VA 5DTBA 1IXGA 5JTYA 2F78A 4WXJA 4QF9A 3JYRA 1PB8A 3RY3A 3E3KA 3H3GA 4G68C 3K00A 3ECRA 1TT1A 3H6UA 3H6WA 2UVHA 4R72A 4F31B 4RPOA 4IY5A 1H44A 2VOZA 1NNPA 1MXXA 3W9VA 5CMBA 2V25A 2DQVA 1S7YA 1M5DA 3O66A 2RC7A 2E0SA 4GXSB 2F97A 4ELRA 1B51A 4IO7A 2XXRA 4MBPA 3TTRA 3T9VA 3OO7A 2OBGA 3IK6B 4ELQA 1D9YA 4HCWA 2ZYOA 4Z7EA 1SVXB 3K6VA 5CMKA 3RTFB 3FVKA 1PB9A 4R6HA 1R9QA 3IOVA 3OENA 1DPPA 4AQ4A 3MW0A 1NNKA 1O63A 5AA4A 2Y7KA 3RTWB 3PPQA 3W9WA 2B3BA 4F1YA 4Z0IA 2ANJA 3VDFA 5KCJB 3D4CA 1Y9UA 2F8DA 5I2KA 1TXFA 5FTIA 3VLVA 2RINA 1B1HA 3OEKA 4C1TA 3G3FA 1F9BA 2ONRA 2QRYA 3IOUA 4AB6A 1SYIA 2REGA 1MG1A 2P1SA 1B3EA 3B6WA 1ANFA 4TLMB 1FQCA 1MQGA 2AL4A 5KDTB 3CR9A 2VHAA 3LSFB 4R9GA 3RLFE 3BFUA 2QS1A 2XX8A 4O3AA 5K2XA 1LCTA 3UN6A 1A40A 2NVUB 3E13X 2XXUA 4U21A 5H8QA 4H8IA 4BDMA 1POTA 4H65A 2VP1A 1FTLA 3QYTA 1Y4CA 1IXHA 3K02A 4FJPA 4U2RA 1B6HA 1MS7A 3T66A 4QFKA 4G77A 2O1MA 3K1NA 3IX1A 2H98A 1RKMA 5I56A 3OELA 1NMUA 4QSEA 3HHFA 3O6GA 5H8NB 2XD2A 4PFYA 3FZVA 3UIFA 1Y1MA 1VE4A 3VVFA 3ONMA 4IO3A 4DXBA 3FJMA 3LSXA 3HN0A 5I57B 3PPOA 3FVOA 4YKKA 1MH3A 3EHTA 5EHSA 4PP0A 3ODBA 1A99A 2HAUA 3RN8A 1MY0A 4NF6B 1UTBB 3MZBA 2XXTA 2UYFA 2QJEA 1JW4A 4XTCQ 4NTLA 4R75A 1JVXA 3A3CA 3DP6A 1SQYA 3MP1A 1MPBA 1QVSA 2O84X 4ZEBA 3VLUA 2D21A 2O7IA 5I58B 4KI0E 2XXWA 3V83A 4GQOA 2CMOA 3MC2A 2ZYNA 4HS7A 4U23A 4C1UA 3CVGA 1MM6A 1H43A 4ZEFA 2CZLA 3O6HA 4KHZE 4EDPA 3B6QA 3EPEA 1MY1A 2V3QA 1I6QA 4YKJA 1B05A 1B40A 4ZDMA 1D3KA 2I4CA 3PUVE 3H06B 3MBPA 1R6ZA 3DLNA 1SD3A 4LP2B 2B65A 3PUXE 2Z22A 3O2AA 3RQTA 1QJMA 1LBCA 1XT8A 5DVFA 2V84A 1YCJA 3Q25A 4F2QA 2ZYMA 1XS5A 3MVZA 3N5LA 2I58A 3PMWA 2ONSA 4AB5A 4YKIA 3LC8A 1JETA 1FTOA 1FQAA 1Y4TA 1SDXA 4EQ9A 1QULA 3CSBA 4LZ7A 1AH5A 1OQGA 1GR2A 1VSOA 2F36A 1MDP1 1URGA 1II5A 3EF7A 2H25A 5H8HB 1XHYA 3OOAA 4OEUA 1OLCA 2DE3A 3I5OA 4NF5B 1ELJA 2H5YA 3MP8A 2F35A 1Z7ME 3T22A 1H76A 2F7CA 3CRBA 4HW8A 3HHGA 3KOTA 3KN7A 3BKIB 1B52A 4TOZA 5L8DA 2WKYA 1D9VA 1B0LA 4X1DA 2F5XA 4RY1A 4GL0A 3RUMA 3C9HA 3TPAA 3PD9A 4P11A 4RK2A 1P1UA 4R2BA 2HAVA 1N7WA 3EHSA 4FORA 3K6UA 5H8FA 2DXRA 3LUYA 1P1NA 1UIUA 2QL3A 4OMBA 1US4A 3OO6A 4FEBA 2XXXA 1SW2A 5CRYA 2XD3A 5ITPA 2DWAA 3KN3A 3HPIA 4KPTA 5ISUA 2XX7A 4N13A 3U93A 4RJZA 3FGSA 3QAXA 4YB7A 4R2FA 3QUFA 4EXKA 2ZMBA 2XHDA 2DOJA 1JW1A 4DXCA 2AYSA 3CIJA 5CMCA 4X48A 1N3XA 4ESXA 2ALUA 3F11A 3FV2A 4OQOA 3TEPA 3C34A 2HXWA 1UIVA 3QK6A 3QUJA 1D4NA 3VVEA 1N0TA 2GHAA 3KBRA 1PDAA 1LB9A 4L17A 3N94A 1BLFA 2Z8EA 1MXVA 2D5WA 1LSTA 5JTYB 4KQPA 3WAFA 4OYVA 1R1NA 4MLVA 2RKMA 3H4ZA 1UQWA 1IXCA 2Z23A 3E4RA 2XXHA 3U92A 5L9MA 3KSXA 3LSWA 4H1XA 2DS9A 4F2OA 1B7UA 4QRZA 2O6AA 3N6UA 4IY6A 4BDLA 4LVQA 2ZNSA 4OENA 3CG1A 1DTGA 3VVDA 3RNNA 4YAHX 4RPNA 4FIMA 1URDA 5DT6A 3IORA 1DTZA 4DIGA 4ZZEA 1IUDA 3DELB 2H9BA 4MLQA 3U72A 1O7TA 4JXIA 1OQHA 1OLAA 4F3SA 3TELA 2XX9A 4NF8A 2O68A 2W7YA 3M3FA 3KJ7A 4GVOA 3ILTB 4YZZA 2OLBA 4EUOA 4RNSA 1B3GA 4ONYA 4OXVA 2G29A 4TLLB 2PMSA 3S9EA 4NWCA 2Q2AA 3WAEA 1PC3A 3FATA 2B3FA 3MAMA 2REJA 3VXCA 4GLIA 4N6PA 3VE1B 3FUZA 1M5EA 5AA4B 3K2DA 1M5FA 2YLNA 1CE2A 3PUWE 1NH8A 5I2KB 3OEMA 3KG2A 4F19A 2OJTA 1N84A 3DP4A 4ECFA 4I62A 3VLWA 4Q5TA 4EQBA 2RF1A 3KN8A 4LQ5A 2F7AA 1ZMGA 1QKAA 5A5XA 2QMWA 3USDA 5FHMA 4ZE8A 2DSFA 3PU5A 4Q0CA 3I3VA 3C32A 5H8QB 1P1QA 2H99A 3GBAA 3SEXA 3MPLA 1URSA 2NXOA 3JZJA 3EQ1A 4U1ZA 4F3PA 3SETA 5CBSA 2PYYA 3ZKLA 3FV1A 1ATGA 4JWXA 1LAXA 2FNCA 1NL5A 2RCBA 2VD3A 2OWTA 5I56B 4LZ8A 3FVGA 3K4UA 1BP5A 3PGFA 1AOVA 2V93A 3RGYA 4BDQA 3S9LC 5I59A 3GBBA 2ZNUA 1GTKA 4MFIA 1XVYA 4G2ZA 2DWIA 2ZYKA 4R74A 3EHUA 1UTHB 1JVYA 3N6TA 2R6GE 3TZAA 1BKAA 1ZU0A 3IJXB 3H6TA 1YPNA 2VD2A 3VFJA 4E0WA 1MQIA 1B3LA 2GHBA 4ZEIA 3G7WA 4QSCA 1MXWA 1OIBA 3DP8A 1ZLQA 3Q29A 2Q2CA 2OK2A 5TPAA 4RYAA 1JQFA 3R26A 4X9TA 1GVCA 2F34A 3MVWA 1USYE 1LBBA 4LZ5A 3IJOB 2R9JA 1AMFA 2I4BA 2A5SA 5FTHA 2KLFA 2I0CA 4GL8A 4JBZA 1XVXA 1B46A 5ELVA 1EZOA 4NF4A 5DVIA 2Q88A 1P99A 5BWJA 4POWA 3W15C 4LONB 5B70A 3QXMA 1FCKA 3TMGA 3T93B 5AA2A 4DCXA 4XXUA 2YPNA 3UP9A 2DYXA 2LAOA 3QIMA 1BIYA 3FXRA 4KYDA 4GWOA 2Y7RA 2THIA 3O29A 5DEXA 4LQ2A 3CFZA 4YICA 4OHNA 5CM6A 2UYEA 3H03A 1MY3A 1B3FA 1WODA 3TQLA 5TP9A 4G68A 2ZNTA 3D4GA 1BTJA 1L5TA 4DZ1A 4N07A 3CI8A 1SW4A 3FJ7A 4NF6A 4Q8RA 2NWJA 1MM7A 2X7PA 3MPKA 1USYH 2ESNA 3H6VA 1EH3A 2O7UA 1LFIA 2DWHA 4G8MA 3A3UA 2OWSA 4OFJA 1SI0A 4P0GA 2GFEA 5CI5A 5EYFA 3O28A 2PVUA 2OCUA 4KYSA 2RCAA 2UVIA 1KWHA 3SEWA 1B9JA 1A7LA 2Y7PA 3KFMA 3FJGA 3Q28A 3HCQA 3C36A 3MP6A 1I6AA 3SEYA 3MWBA 5EHMA 2XXIA 3ZKKA 2GH9A 4MH5A 3B6TA 4KR5A 3H7MA 4QSDA 2FA7A 1WDNA 5IKBA 1A55A 2PT2A 4F3BA 4RA1A 3SERA 1N76A 1JEUA 1QKBA 1TWYA 5I2NA 1I69A 4LUBA 4HTGA 4NE4A 5H8FB 3IB0A 4U22A 5CMMA 3IB1A 4YMAA 4YKPA 3TODA 4OESA 4H5FA 1ZIUA 1MY2A 1JNFA 3VV5A 1XC1A 4JSDA 2P0SA 4ZE9A 4H5GA 4GFRA 4G8HA 4FAJA 3O6IA 4U1OA 1SI1A 4QFLA 3TAJA 3V8XB 1HSLA 1Q1KA 5AA3A 2I0BA 2XXQA 1PBPA 1ZBMA 4PETA 3Q27A 4WKMA 5J1DA 3PMXA 1PEBA 3T9HB 2QMXA 3GLBA 3T96B 4ZS9A 4OFOA 3V89B 4C0RA 3ZSFA 2F6PA 4G8NA 2I48A 2V3TA 4ZEDA 1Y1ZA 5H8HA 4QHQA 1POY1 2DXYA 3MVXA 4ELOA 1DOTA 1JW5A 3TFLA 3G3GA 4NF5A 3RT6B 3IB2A 4O3CA 5CC2A 4HCYA 4PFTA 1IQ7A 4GF8A 2UVGA 4YMBA 3L6HA 3E9XA 4RK9A 4H67A 4OEVA 3KEIA 4PFUA 4OERA 4OETA 1DPEA 2ONKE 3DM0A 2DWJA 3FXQA 1M5BA 1MPDA 3IOTA 5ICTA 1SW1A 3FIRA 1OVTA 3PD8A 4PFWA 1NFTA 3AXFA 1N7XA 1NH7A 2O1LA 4NF8B 1MXZA 3S4UA 3C31A 1B58A 1LLSA 3PPRA 3OD7A 4F39A 1QUJA 2F6GA 2AL5A 3SKPA 4M4GA 3UGWA 4H6DA 1H45A 1P1WA 2I49A 2HEUA 3B7DA 5ITOA 5TU0A 1LAHE 2I3VA 1TFAA 2AIXA 4GD5A 1QUIA 4NEDA 3ZS6A 4IGRA 2A5TA 1B1XA 4THIA 2ABHA 1VFDA 3TTMA 1LCFA 1MRPA 1FQBA 3IOWA 3LSLA 3KZGA 4R6YA 4F3GA 3M8UA 4JWYA 3THIA 2DP8A 4FE8A 4H0WA 5A5XB 2V3UA 3MUQA 4XKNA 5BUUA 1VFEA 3TKDA 1GV8A 4ELPA 3BFTA 1O64A 3KGCA 1Y3QA 1P1OA 1IIWA 1GGGA 1OVBA 4JB7A 5DYHA 1LB8A 4IO5A 1M5CA 1HSEA 4GRKA 3G3HA 1MQDA 2ZXTA 3ILUB 2X7QA 4JDFA 1DMBA 3MVYA 3S9NC 4QFNA 3HO7A 2NOOA 1HSJA 3SDFA 3C35A 1B2HA 4WEPA 4M1VA 2HQ0A 3RPWA 3VXBA 2RC9A 1B4HA 3GZGA 5I59B 3K01A 3IAZA 2Y84A 1Y20A 2HZKA 5K2YA 4NMYA 3P7IA 5DVJA 3KSJA 1NKXA 1SYHA 2DE4A 1B4ZA 4FATA 1LAFE 1EU8A 3KOSA 2NUVA 4P0IA 2QS2A 2H4IA 4DCYA 1LFHA 5L9SA 1R9LA 1SBPA 3G3JA 3MZ9A 5TPAB 1FQFA 2I3WA 1N3WA 1LGBC 2Z8FA 3GXAA 4LA9A 2E1SA 4BLAA 1XOCA 4POXA 3G3KA 3OO8A 3R7XA 3CSGA 5IAIA 4IGTA 4KYEA 4NWDA 1MH4A 4EQ7A 3U94A 4NF4B 4QFPA 3UA8A 3CFXA 4IO4A 3TTKA 4F1VA 1IZ1A 5KCJA 2QPQA 1MQHA 3PPPA 3UK4A 1B5JA 3IO4A 2Z8DA 5HM4B 5AA2B 1ZJLA 5FHOA 4TQUQ 3M3KA 3JV9A 1FQDA 1PB7A 2UVJA 3QSLA 3PV0E 1AL3A 3BBRA 4FECA 4KD5A 5KDTA 1H3DA 3S9MC 5DEXB 3HV1A 1B5HA 2HCAA 2O69A 2M8CA 1MXUA 4PQJA 3T9UA 1RYOA 3HSTA 5TP9B 5L9OA 4G68B 3FASA 3TDJA 5CBRA 3RT8A 4YB6A 3K1PA 4XKQA 1UTHA 2DVZA 1Y3PA 3A09A 3OMBA 3O97A 3TUSA 5B7DA 4ZEKA 1Y3NA 4GOTA 5JEIA 4OWDA 3U1OA 4U4SA 4OFLA 3TCFA 5KZTA 4IO6A 4K3FA 2QS3A 2HZLA 3L6GA 5H8NA 1FTKA 3UORA 4XKPA 2Q9TA 3IL1B 2FYIA 4LATA 4ESWA 1FW0A 2R71A 2QSXA 4ZECA 2YJPA 2G93A 5I57A 1Z7NE 1ZTYA 2XXPA 2HFBA 4JWOA 3TQWA 1SW5A 4F18A 4WEDA 5AA2D 4R6KA 1UTBA 3K1MA 4BDOA 3FVNA 3V5AA 1US5A 4XKRA 1IITA 2GRVA 4ISUA 1N04A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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