4ISUA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j) in complex with the antagonist (2r)-ikm-159 at 2.3a resolution.
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein/antagonist
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Studies on an (S)-2-amino-3-(3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazolyl)propionic acid (AMPA) receptor antagonist IKM-159: asymmetric synthesis, neuroactivity, and structural characterization.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 80
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-01-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4isuA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4isuA02
3MVZA 3E9XA 4OQOA 1ZKBA 3U8QA 1B4HA 2GH9A 3TFLA 5JTYA 2HEUA 4H6DA 2WKYA 1LBBA 1IXGA 3B7DA 1URGA 4K3FA 4NE4A 2DSFA 1D9VA 3ZSFA 2Y7RA 3CFLA 1B5HA 2Q2AA 2F6PA 4U23A 2AL5A 4R2BA 1FTMA 5L9SA 3OO8A 4H8JA 3MZ1A 4XIGQ 5EYFA 3E4RA 2OCUA 2DOJA 1MS7A 3C33A 3FJMA 3PMWA 4OZ9A 3O29A 3IOTA 1POTA 3CSBA 3ODBA 2ABHA 3LBSA 3R7XA 4G8MA 3VLVA 4FEBA 2PBWA 1MY4A 3MVWA 2KLFA 4F1YA 3MC2A 2ZXTA 1PB9A 2XX9A 2X7QA 4ESXA 1VFEA 3T93B 1MXUA 5AA2A 1SW4A 3P7IA 4MBPA 1P1OA 4YMAA 2RC9A 2I6EA 3S2VA 1N04A 5L8DA 4KYDA 1OIBA 3O97A 4TQUQ 2VD2A 3GBBA 1JETA 3MVXA 1B52A 3G3HA 5CM6A 3PMVA 4POWA 5CC2A 1EZPA 4F1UA 3OOAA 2QS3A 1B32A 3IOWA 3HHFA 3CI8A 3OO6A 4YU0A 4R2FA 2OWTA 2XXPA 2H9BA 4GRKA 3A09A 4R74A 4NF5A 4GVOA 1I6AA 1B4ZA 1MQJA 3KSXA 1Y3PA 1M5FA 4P11A 1POY1 1FQCA 3QXMA 4OERA 3GLBA 3OEMA 4KPTA 3EHSA 1VSOA 4EXKA 4RPNA 1LCFA 3UORA 3E13X 1ZMGA 4OHNA 2HAVA 4YB6A 1OMPA 4NF8A 3K1MA 2Q8JA 3UGWA 4HCWA 3CSGA 3L6GA 4IO2A 5DEXA 1JVYA 1B3EA 3DP8A 1BTJA 4R6KA 1H76A 5JTYB 1MDP1 4PE5B 4YMBA 3SDFA 2V84A 4ZZEA 4ZEDA 2XD3A 1D9YA 1QVSA 3T22A 3MWBA 3O66A 2I49A 4OMBA 1CB6A 2Q2CA 5EHMA 4FATA 1Q35A 3A3UA 1SI1A 2PMSA 2I48A 3RPWA 2V93A 3PPNA 3UN6A 3H4ZA 4ESWA 1XVYA 1FQFA 2V3QA 4NTLA 3ZKKA 2NOOA 3DP4A 2Y84A 2O1LA 4U22A 3PUXE 5AA4A 3JV9A 5KDTA 1Y1MA 2Z22A 2FNCA 2F97A 4YKPA 4ELOA 1AH5A 1H3DA 3RTWB 3C36A 3JZJA 3K0VA 4PFTA 1A7LA 1XT8A 4R72A 2D3IA 3CR9A 1MQIA 3RUMA 3SESA 2ALUA 4ELRA 4G77A 5HBCA 4FORA 4GXAA 2I3VA 3FGSA 4YKIA 5H8FA 4F2OA 4NF5B 3Q25A 3VLWA 4RK9A 3VLUA 1RYXA 4BDNA 1SVXB 2QJEA 4QFLA 4PP0A 4MH5A 2REJA 4DXCA 4I9DA 2LAOA 2ONKE 4PQJA 3VE1B 3TAJA 1VFDA 1B2HA 4IB2A 3K02A 3RLFE 2IEEA 4JB7A 1B46A 3TTKA 4GIZA 5DVIA 5KCJB 3K1NA 2DXRA 4NF8B 1ATGA 4MLVA 4N07A 1PB7A 3K00A 4RY1A 1M5DA 1MXYA 1B0HA 5DEXB 4ND9A 5TPAB 3Q26A 1PC3A 2PYYA 1NFTA 1JW1A 1QKBA 4JWXA 2XXTA 1UIUA 2XXUA 1BLFA 4BDLA 4UA8A 4M4GA 5B70A 4OXVA 1Y20A 4LUBA 1QKAA 1B58A 4ZEFA 3KZGA 1IUDA 3KEIA 2O69A 1Y4TA 3TODA 3H7MA 1EZ9A 3O28A 4F1VA 2XXXA 1LFIA 4N6PA 5L9OA 2XXIA 5CMKA 4OFLA 4H67A 3RT6B 4O3CA 4Z7EA 2OLBA 4U1ZA 3TTMA 3VDFA 2F7BA 4MLQA 4H65A 1QULA 4IO4A 3UK4A 1WODA 4PFWA 3N6TA 1PDAA 1MM7A 2F35A 3IJOB 3A3CA 5FHMA 3UIFA 1HSLA 1H43A 3MUQA 2Q89A 4HTGA 3U92A 2A5TA 3PPOA 3VXBA 1B1HA 1LLSA 4G8HA 3N6UA 4TLLB 2DQVA 3O9PA 1JEUA 2F78A 5ICQA 3QUJA 3AXFA 1Y1ZA 4RYAA 3PMXA 4DLDA 2F5XA 4JXIA 2DE3A 4LZ8A 2Y7IA 2R71A 4F31B 1NKXA 1YPNA 4FIMA 3MQ9A 3S9MC 1CE2A 3OSRA 5HPQA 5BWJA 4G68B 3TQLA 1MM6A 2DVZA 3CIJA 4KI0E 2A5SA 4RNSA 1US5A 2Q88A 3Q29A 2Z23A 1M5EA 3C35A 3U72A 1FQEA 4FJPA 2H5YA 2V3TA 2QS2A 3KN7A 5I84A 2QS1A 2FYIA 4YB7A 1DTZA 4KHZE 5H8HA 2VGQA 4NWCA 1FW0A 3B6QA 2I4CA 2PT1A 5CMCA 2VP1A 3TZAA 1AOVA 3W9WA 5CBSA 3B6TA 3FV2A 4F3SA 4I8CA 1WDNA 1YAEA 3QAXA 3MVYA 5I58B 3O2AA 3IO4A 4JSOA 2QS4A 4E0XA 2R9JA 4LATA 3ZS6A 4QF9A 2Y7WA 1SYIA 4OWDA 2RCBA 1B05A 3IB1A 3CG1A 3HHGA 1O64A 3IB2A 3QYTA 2O1MA 2DWJA 5K2XA 2YPNA 2XXVA 5ELVA 4HS7A 4QFOA 1MH4A 5I2KA 2UYFA 1A55A 1JQFA 3RNNA 2XHDA 4G8NA 3IR1A 5KZTA 3LSFB 4IGRA 4R73A 4R9GA 3RGYA 3RTFB 1AMFA 1QUKA 4EXLA 3PPRA 2HAUA 3U94A 1SQYA 3EHUA 2A5TB 3FASA 4X9TA 3ZKLA 3S9EA 1USYH 4BDRA 4IO3A 2THIA 3TKDA 5M2VA 3W15C 3LR1A 1LFGA 4KCDA 2QRYA 1JNFA 2B65A 4G4PA 3RN8A 1PEBA 3CVGA 3S9LC 2UVIA 5J1DA 2GHAA 1B7UA 5ICTA 3I6VA 3CRBA 4G2ZA 4GD5A 4XKPA 1SW2A 4EQ7A 1LAFE 3TCFA 1MXXA 3VFJA 4ZECA 1S9TA 1IQ7A 3N26A 3O6HA 4ELPA 5A5XB 4XKQA 1P1WA 1SW1A 1LGBC 2DE2A 2ZYNA 4RK2A 3E3KA 1MDQA 2FA7A 5H8HB 5H8SA 4THIA 3MJNA 2I58A 2O51A 5KCJA 1R9LA 4LA9A 1DMBA 4R6HA 3MPKA 3G7WA 3N94A 4XXUA 5TPAA 4KD5A 2GHBA 1TXFA 2QSXA 4GFRA 3T96B 3KN3A 4OVJA 4BLAA 1HSJA 3MZBA 3OEKA 5FTIA 4QFNA 4C0RA 2PX1A 2Y7PA 3C4MA 1TWYA 2M8CA 1FTOA 5EHSA 1P99A 3HO7A 2P1SA 1R6ZA 5FHOA 4DE8A 1I6QA 3MPLA 3EF7A 2RKMA 3OO9A 1LAHE 1NL5A 1LAXA 5I2KB 3VXCA 3L6HA 4JWOA 4M1VA 3MBPA 4ONYA 3EHTA 1XVXA 3SEXA 4OTEA 4PFUA 1XHYA 4DXBA 2XD2A 4NEDA 4NMYA 1B3GA 4DIGA 3FXQA 4LONB 1R1NA 3U1OA 1NMUA 3JYRA 4LZ7A 2OJTA 1OLCA 1UTBB 3W9VA 3V83A 1I6BA 4EF2A 2XXWA 1JVXA 3PPQA 1DPPA 3RY3A 2YJPA 1T0KA 4F29A 2NUVA 3V8XB 4IO5A 1US4A 1A8EA 4GF8A 1B1XA 1QJMA 3EPEA 3PU5A 3HPIA 3FVNA 5JK4A 1ZIUA 3BKIB 3ONMA 2QMWA 1GGGA 1Y3NA 4G68A 1AIVA 1MPBA 1OQGA 3FJ7A 4KYEA 4NF6B 1MQDA 1Y3QA 4ZEIA 1MY1A 3PPPA 3N5LA 2H99A 3GXAA 3KGCA 1FQDA 3G3IA 3PUZE 3TCHA 1PB8A 3C32A 3LSLA 3IORA 2DWAA 1ZTYA 2VD3A 2UVGA 1B5JA 1SI0A 4XTCQ 1DTGA 3SKPA 1SW5A 4IO6A 3KSJA 3G3GA 1O63A 4ZE8A 3H06B 1B9JA 1D4NA 4WEDA 2NVUB 5I58A 3OMBA 3RT8A 3SEVA 1B40A 2HZLA 4EQBA 4E0WA 1B5IA 2XXHA 3TCGA 1MXZA 1IZ1A 3IJXB 3TMGA 4QSEA 4KCCA 1OLAA 3HSTA 3H6VA 1A8FA 1BIYA 4BDOA 4IY5A 4Q30B 5I2NA 3H6UA 2F34A 4R9FA 4QSCA 3H6TA 4O3BA 4F19A 1DOTA 2QMXA 1LB9A 3TTNA 1LB8A 1ELJA 2P2AA 3VVDA 2F8DA 4TLMB 3OSQA 2DP8A 1OQHA 5AA1A 1USYE 2RCAA 3KFMA 1NH7A 1EZOA 5I57A 4F3GA 2CZLA 3SEWA 1N7WA 4IGTA 4AB5A 2I4BA 3HCQA 3RQTA 3LC8A 4AB6A 2O6AA 1D3KA 3IB0A 1GTKA 4LP2B 1UIVA 3CG3A 4F18A 1LAGE 5F7VA 1Z7ME 3K01A 2ANJA 3MP1A 4NF4A 3D4GA 3DLNA 4NWDA 1B6HA 4H5GA 4QSDA 3G3JA 1JW5A 3PGFA 3LUYA 3S4UA 1MY0A 2GFEA 2ZMBA 2Y7KA 3T66A 3UA8A 2Q9TA 3PD8A 3TPAA 2G93A 5I56B 3FJGA 2XXRA 3K1PA 2VHAA 3DP6A 4OETA 4DZ1A 3M3FA 4X1BA 1SDXA 3IX1A 3PV0E 1FTJA 1B51A 4EQ9A 5A5XA 1MQHA 4DCYA 1RKMA 1SYHA 4KYSA 2O7IA 2Z8FA 3TTRA 1DPEA 4GOTA 4LVQA 1MG1A 4QHQA 2XX8A 3C9HA 1M5CA 3PUWE 4DXUA 2NXOA 2F7AA 1MPCA 1XOCA 2RINA 3TUSA 3T9UA 1P1UA 4L17A 4MF3A 3IK6B 3WAEA 2RF1A 3GZGA 1L5TA 2XXYA 4EUOA 1S50A 2AYSA 1IEJA 4C1TA 2DE4A 1F9BA 1URDA 4I1DA 4ZEKA 3R6UA 3O6IA 4PFYA 2UVHA 3TELA 1NNFA 1N84A 2Z8DA 1UTHA 4UACA 3VVFA 5CBRA 4HW8A 5FTHA 1FCKA 2DVCA 1ANFA 5I2NB 2HFBA 2HZKA 2V25A 3U93A 4R6YA 1Z7NE 3OXNA 4BDQA 3FUZA 3ECRA 4OFJA 3DM0A 4ECFA 4Q0CA 2D5WA 5L9MA 4HCYA 3G3FA 2Z8EA 1SD3A 5I57B 4H1XA 1QUJA 4JBZA 4KQPA 1QW0A 3QSLA 4POXA 5AA2D 2QPQA 1YTVA 4JWYA 3SEUA 1IITA 2OK2A 3SEYA 5DT6A 2ZNTA 5HM4B 2R6GE 1ZLQA 5JEIA 3V5AA 4YZZA 1N0TA 1UTBA 1I69A 3OD7A 3K6UA 2HXWA 1OVBA 2X26A 5F1QA 3MZ9A 4NF4B 4LQ2A 3SETA 3MP8A 5TP9B 4JDFA 3H3GA 3CFZA 4GXSB 3EQ1A 3PUVE 4H0WA 3FXUA 1VE4A 1B7HA 2DWHA 1FQBA 3H6WA 1URSA 4ZZAA 2ZYKA 1B0LA 2UYEA 3KBRA 2V3UA 3CFXA 2UXAA 2DS9A 3HV1A 4H8IA 2G29A 5DVFA 4ZS9A 4RJZA 5H8QA 3V89B 3KJ7A 4NF6A 1OVTA 2F6GA 3VVEA 1NNTA 5I59B 1H45A 3LSWA 2ONRA 4FECA 4YICA 3MP6A 1IXIA 3MAMA 4Q5TA 5CMMA 3WAFA 1QUIA 4KR5A 4ZE9A 2DXYA 3UP9A 2ZNUA 1TT1A 3K6XA 3QK6A 3IAZA 4X48A 5IAIA 2F7CA 2ZYMA 2O84X 4ZDMA 1M5BA 1B3HA 3QUFA 1Y4CA 3FD3A 4P0GA 1UTHB 3USDA 1MXVA 1J1NA 1VR5A 3MW0A 3M8UA 3TDJA 4LZ5A 3BFTA 3M3LA 2HQ0A 1MQGA 4YAHX 4I62A 4F3PA 4G68C 1B3LA 1EH3A 1Q1KA 2DYXA 2IA4A 3FVGA 3KN8A 4U1OA 3FVKA 1YCJA 2OWSA 4C1UA 4F39A 1BP5A 1ZJLA 2UVJA 4H5FA 3B6WA 4OESA 2ZNSA 1NNKA 3KJTA 3GBAA 5TU0A 3OELA 4GQOA 4GL8A 1TFAA 1R9QA 1WVJA 1BKAA 1MXWA 1S7YA 5LOMA 4OFOA 1NNPA 2QL3A 5AA2B 2REGA 1IXCA 1N76A 2NWJA 3ILTB 1A99A 2H98A 4DCXA 1EU8A 1AL3A 4OENA 2XX7A 2CMOA 4MFIA 3QIMA 2W7YA 4AQ4A 4JSDA 1N3WA 5DVJA 2I0CA 4QFPA 1JEVA 4QFKA 2I3WA 1A40A 4PETA 5DYHA 4KFQA 3ILUB 1LSTA 4N13A 5CRYA 1II5A 1SBPA 3TQWA 3Q27A 2I0BA 3IL1B 4X1DA 3I5OA 1NH8A 2H4IA 5I56A 2E1SA 5H8QB 4FEDA 1MPDA 1PBQA 5FHNA 1B3FA 1ZBMA 1O7TA 4GLIA 1LBCA 3FXRA 5H8NA 2X7PA 5B7DA 1Y9UA 3C34A 2AL4A 3Q28A 3O6GA 2VOZA 4F3BA 2B3BA 1FQAA 2YLNA 3TYHA 5DTBA 2O7UA 4IY6A 4OEVA 3BBRA 1P1QA 2XXQA 2O68A 1IIWA 1FTLA 2HCAA 5CMBA 4EDPA 2OBGA 4O3AA 3T9HB 2B3FA 1GV8A 2E0SA 3OO7A 4F2QA 5CI5A 3KG2A 1HSEA 2RC7A 3K6VA 1LFHA 1ZU0A 3K4UA 4U21A 4R75A 4RA1A 4U2RA 4WKMA 3M3KA 4XKNA 2ESNA 1XS5A 1IXHA 1MY3A 3G3KA 2D21A 3TEPA 4Z0IA 2GRVA 3F11A 5AA4B 4U4XA 5KDTB 4P0IA 3FZVA 3THIA 1A54A 4WXJA 5ITOA 2PVUA 3LSXA 3VV5A 1JW4A 3FATA 3HN0A 1N3XA 1GVCA 4RXLA 3FV1A 5IKBA 4DDDA 3H03A 3DELB 3EN3A 4FAJA 1RYOA 3D4CA 2DWIA 4OEUA 4WEPA 2F36A 5TP9A 4QRZA 1PBPA 3R26A 2ONSA 5AE4A 2H25A 4F22A 3FVOA 4ZEBA 3SERA 4EF1A 5H8FB 4YKKA 4GWOA 4TOZA 1DSNA 2BJJX 4YKJA 2ZYOA 3K2DA 1TFDA 1H44A 5AA3A 4OYVA 3C31A 3BFUA 1LCTA 5BUUA 1UQWA 4XKRA 1B7ZA 1N7XA 3FIRA 4FE8A 3I3VA 3S9NC 1KWHA 2P0SA 3K6WA 4Q8RA 5H8NB 3KOTA 5K2YA 3T9XB 1MY2A 4ISUA 3TTLA 1GR2A 4IO7A 5I59A 3OENA 3KOSA 1FTKA 4ELQA 4U4SA 2RC8A 4YB5A 1MRPA 2OZZA 3IOUA 3IOVA 4BDMA 3PUYE 3IO6A 5ITPA 4GL0A 4LQ5A 2AIXA 3PD9A 4RPOA 1XC1A 2PT2A 1MH3A 3T9VA 1P1NA 5ISUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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