1SI0A

Crystal structure of mannheimia haemolytica ferric iron-binding protein a in a closed conformation
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
316
structure length
316
Chain Sequence
ANEVNVYSYRQPYLIEPMLKNFEKDTGIKVNIIFADKGLVDRVKQEGELSPADVLLTVDISRVMEIVNADLAQKIDSKVLEKNIPAQFRDSNDQWFGLTTRARVIYTSKDRVGKLPAGFDYLDLAKPEYKGKVCVRSGKNSYNVSLFAAMIEHYGIEKTKAFLEGLKANLARKPQGGDRDQVKAIKEGICDYSIGNSYYYGKMLDDEKQKSWAEAAIINFPSGEHGTHKNISGVVIAKHSPNKANAVKLIEYLSGEKAQGLYAELNHEYPVKEGIEPSAIVKGWGTFKSDTIKLEDIAKNYEAALKLVDEVKFDDF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords iron binding protein FbpA
publication title Structural basis for iron binding and release by a novel class of periplasmic iron-binding proteins found in gram-negative pathogens.
pubmed doi rcsb
source organism Mannheimia haemolytica
molecule tags Metal binding protein
total genus 126
structure length 316
sequence length 316
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13343 SBP_bac_6 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1si0A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1si0A02
3O6IA 5EHMA 3FASA 5BUUA 4RPOA 4GL8A 1GTKA 2OK2A 2DWIA 2AIXA 4KQPA 3FV1A 1UIVA 2O69A 3V8XB 4EQBA 4C1UA 2UVIA 3S9LC 4YKJA 2VHAA 1ATGA 4F29A 4GXSB 4LZ5A 2O1MA 2ZNUA 2Z8FA 3IOTA 4HTGA 1D3KA 3N26A 2R71A 5IAIA 3MZ9A 1T0KA 3E3KA 5H8NB 2OCUA 3MC2A 2F34A 1FQDA 5H8HB 5H8HA 3IJOB 1SYHA 1MXWA 3MP6A 3VVDA 1BLFA 1URDA 1LGBC 3PUXE 3IB2A 5I2KB 4Q8RA 5I2KA 3DP4A 4IY6A 3U72A 4N07A 3SEVA 4DXUA 4TLMB 4OFLA 1JNFA 2CZLA 3OEKA 3ZS6A 2YPNA 3KJ7A 1LB8A 1LBBA 4U1OA 1XC1A 1USYH 4KYEA 2E1SA 1B40A 3Q25A 3VLVA 3ILTB 3THIA 4IO3A 4MBPA 4RPNA 3KSJA 4NF6A 1IZ1A 3TTNA 3IO6A 4DCXA 4KYSA 2H25A 4ZE8A 1XVYA 3FD3A 3OXNA 1P1WA 2XX8A 2ZYOA 2E0SA 1MQGA 2XHDA 2X7QA 3ZSFA 3JZJA 2XX9A 3OEMA 2ONKE 4LP2B 4RYAA 4IB2A 2Z8DA 1N0TA 1Z7ME 1R9QA 2ALUA 1II5A 2B3FA 3G7WA 1NNTA 4OMBA 1WDNA 4JSOA 3IK6B 3KBRA 1PB9A 3R6UA 4BDRA 3IAZA 4YMBA 1SBPA 4ELRA 3M3FA 5AE4A 3D4GA 4I8CA 3KZGA 1LAGE 1N76A 1NH8A 3GXAA 4GOTA 1MXUA 1PC3A 1P1NA 5ITPA 3KFMA 3TCGA 3H4ZA 2DVCA 2G93A 3HPIA 3PPQA 1SW1A 4I1DA 3H6UA 2DOJA 3RTFB 4R9GA 1B1XA 3FVNA 1XVXA 2QRYA 4NF5B 3KSXA 3EN3A 2ZNTA 3IOUA 3ONMA 4F19A 2O51A 3EQ1A 1MXYA 5IKBA 1MPDA 4HW8A 3S9NC 3MBPA 1M5CA 3TPAA 1LB9A 3RQTA 4PFWA 1LCFA 4F31B 2G29A 1JQFA 3OD7A 1HSLA 2DS9A 1P1UA 2QS1A 3G3IA 1B05A 4YMAA 4FATA 3U1OA 4PQJA 4POXA 3B6TA 4ELPA 2RINA 4HS7A 4KCCA 4NF4B 4WKMA 4NF4A 3OELA 4YZZA 4F3GA 4U23A 1B3EA 2FYIA 4QFPA 1DOTA 5I59B 2RC9A 3G3FA 1QUJA 1NKXA 1MS7A 2I48A 3O9PA 4C1TA 2H98A 1LAXA 2GHBA 4RJZA 2R6GE 3E4RA 4KFQA 3HV1A 2Y7WA 3L6HA 2F6GA 2THIA 1SI1A 2XX7A 1GR2A 3Q27A 2Y7RA 2QJEA 2DVZA 3K6WA 4YB6A 5DT6A 4N6PA 3HO7A 2F6PA 4ECFA 4GFRA 1Y3QA 2RC7A 4OFJA 3RT8A 3MZ1A 2O7IA 1DMBA 4PFUA 2I0BA 1B4HA 1FQCA 4G8NA 5TPAB 1D9VA 3IR1A 3K00A 4O3CA 5TPAA 2DE3A 1Y3NA 3RNNA 4DE8A 3N5LA 3C34A 2QS4A 1B32A 3ECRA 1IUDA 2UVGA 3PUWE 3MP8A 2REJA 3TZAA 4QRZA 5TP9B 1FQEA 5TP9A 4ZECA 4KPTA 4AB5A 2QMXA 1Y1ZA 4JXIA 3S4UA 5I57B 3JV9A 4XKPA 2IEEA 5I57A 4ZZAA 2D3IA 2VD2A 1MPBA 1IQ7A 1NNPA 3DP6A 5L9OA 5I2NA 3QUJA 2H4IA 5ICQA 1XS5A 3C32A 4OEVA 3PV0E 3BFTA 4IO7A 3O2AA 3RN8A 4XXUA 2B65A 4R6KA 3C35A 5ISUA 2V3QA 1B4ZA 3H06B 3QSLA 5AA4A 3FUZA 4KR5A 2DP8A 3FVKA 1GVCA 3ODBA 3W9WA 4XKQA 4G77A 2DWJA 1N7XA 4F39A 2DQVA 1H44A 4NE4A 2I3WA 3I3VA 3PPRA 3O6HA 3SETA 5F1QA 2NUVA 4F2QA 4F22A 1AL3A 2GHAA 3TTRA 3GBAA 4FAJA 2IA4A 3SDFA 5I56B 3RGYA 1GV8A 4BDLA 5I56A 1TXFA 3VE1B 3JYRA 4OWDA 3G3JA 4R2BA 4PFTA 3CSBA 5H8FB 5H8FA 1B3HA 4QFLA 5DVIA 4KI0E 2Q88A 5TU0A 3VFJA 2XXPA 3FJ7A 4FIMA 4UACA 1QW0A 3VV5A 1SVXB 3VXCA 1D4NA 2NOOA 4H65A 4AQ4A 1ZTYA 3SEWA 4U22A 3D4CA 1H43A 1A40A 3LSWA 1B1HA 2VP1A 1NMUA 2RKMA 3PPOA 1AIVA 3MWBA 3T9HB 1LCTA 1JEVA 5KDTA 4ZDMA 4BDQA 4MF3A 4ESWA 1QVSA 3G3GA 3K4UA 2PMSA 3QAXA 2W7YA 1H45A 2F35A 4BLAA 4OFOA 5F7VA 3PUYE 4JWXA 4YU0A 2UVJA 4DXBA 4R9FA 4R75A 1B3GA 2GRVA 4BDMA 5BWJA 2ZYKA 3FVGA 3TTKA 3PGFA 2QMWA 5FTIA 4IGTA 1GGGA 2DE2A 3FIRA 1B5IA 1YCJA 4ELOA 3T9UA 1Y1MA 1P1OA 2HZKA 1JVYA 3IOVA 1MQDA 3N6TA 2OLBA 4ZS9A 4IGRA 2Q89A 1P1QA 5L9MA 2X26A 3K0VA 4WEPA 5H8NA 5CM6A 4OYVA 3PMXA 4LA9A 1B6HA 1USYE 3FJGA 3OENA 2XXWA 3H03A 3ILUB 3QIMA 5JEIA 4Q0CA 4HCWA 3IO4A 3MVZA 4RY1A 2VGQA 4BDOA 5ITOA 2HXWA 3QXMA 3UK4A 5H8QB 3CIJA 5H8QA 3W15C 1A55A 4F18A 3TTLA 3V83A 2ZNSA 2ONRA 3B7DA 1A8EA 2I4BA 3HHFA 1O63A 2ESNA 4EF2A 3VVFA 4KD5A 3T22A 4ISUA 5I58B 4OESA 1UQWA 1Y9UA 1MDQA 1SD3A 4EUOA 1MXXA 3VXBA 3KN8A 1M5EA 3UN6A 3BKIB 2KLFA 4EXKA 1F9BA 3K6VA 3T66A 3L6GA 1B5HA 3H7MA 1MM6A 1BKAA 4OTEA 3SKPA 5LOMA 1URSA 3EPEA 3E13X 3LC8A 4GRKA 1RYOA 2O84X 3PD9A 4LATA 3Q28A 2VOZA 4LQ5A 3K1MA 5KCJB 3H6VA 5EYFA 2V84A 4F3SA 2D21A 1EZPA 1NNFA 4FECA 3OSQA 3MPLA 4LQ2A 4O3AA 5AA3A 5FHMA 4IY5A 4YB7A 4OVJA 4U4XA 3FATA 3CG3A 3TYHA 1Q1KA 4P11A 1Y4CA 1QUKA 1SW4A 4O3BA 4XKRA 1MH3A 3TELA 4OEUA 1BTJA 3CR9A 4NF5A 1MQIA 3MVXA 3H6WA 3CG1A 5KZTA 4GVOA 2A5SA 3GZGA 2GH9A 3F11A 1MY1A 2I4CA 4GQOA 3S9EA 2YJPA 5B7DA 4ONYA 4R6YA 1DTZA 5M2VA 1Y20A 1B46A 5CBRA 4FEBA 5CBSA 4QSCA 5J1DA 1YPNA 3QK6A 2ONSA 3CSGA 1EU8A 3TTMA 4G2ZA 1QJMA 5AA2B 2H5YA 3UA8A 5DVFA 3LBSA 1MQHA 3UP9A 1EZ9A 2XXIA 1B7ZA 1FTOA 4ZEIA 3KN7A 1A99A 1POTA 3MW0A 1IXCA 2I58A 5I59A 3PPPA 3ZKKA 1FTJA 2P1SA 3DM0A 1H76A 4OHNA 2XXUA 2PYYA 3CFLA 1IIWA 1UTBB 1OQHA 5FHOA 1QULA 3O66A 3U92A 5A5XB 1D9YA 4F1YA 2F7AA 1O64A 2H9BA 3MP1A 3MPKA 2DWAA 2I3VA 4R72A 3TUSA 3BFUA 4MFIA 2PT2A 2ZXTA 3RT6B 1R9LA 3M8UA 1QKAA 4QFNA 1NNKA 1N3XA 5CI5A 4U1ZA 4X1BA 4IO4A 4H1XA 2V3TA 5CMMA 4U21A 3RPWA 3VLUA 4DLDA 1WVJA 1TFDA 2O1LA 4OENA 1ANFA 2XXTA 2QS2A 1KWHA 3IB0A 3G3KA 3FXRA 3SEUA 4PFYA 3VDFA 2OWTA 1ZIUA 2HAVA 3B6QA 1JW5A 4F3PA 3PUZE 1MG1A 3KG2A 1LAHE 3T9VA 3V89B 4R73A 4XTCQ 1ZJLA 3HSTA 4AB6A 3T9XB 4ZEDA 3DP8A 4EQ7A 4NMYA 2FNCA 4Z7EA 4X1DA 3LR1A 2Z22A 1OLAA 1EZOA 4H0WA 2GFEA 3GBBA 4H5FA 3E9XA 3KGCA 1B3FA 4THIA 3H6TA 5JTYB 2PVUA 1XT8A 4NF8B 4NEDA 1TWYA 3FXQA 4F2OA 4YKIA 2F5XA 1HSJA 1OVTA 1B2HA 1UTHB 4P0GA 1UTHA 1Y4TA 3TCFA 2B3BA 3TFLA 2DXRA 1JEUA 1R1NA 1ZMGA 3W9VA 1NFTA 1CB6A 2Y84A 3PU5A 3G3HA 2XXHA 3OO8A 2NXOA 4PP0A 1ZKBA 3FGSA 1N04A 2UYEA 4KHZE 4R74A 1FCKA 3CFXA 3CFZA 5CMKA 4WEDA 4OERA 3R7XA 2PBWA 3M3KA 4LZ8A 2Y7KA 1QUIA 2R9JA 1N84A 3OSRA 4GLIA 1SW2A 3TCHA 3CVGA 1LFGA 4ELQA 1ELJA 1B7UA 1I6QA 2CMOA 1Y3PA 3M3LA 4QSDA 3K02A 4JB7A 2O7UA 4OZ9A 3KJTA 4PE5B 4TQUQ 1FQFA 1QKBA 1SW5A 1N3WA 4C0RA 3TEPA 2YLNA 1MPCA 1ZLQA 3P7IA 1B9JA 4ND9A 4RA1A 3EHSA 5ICTA 3U94A 2DWHA 4IO5A 2OJTA 4QF9A 2XD2A 5K2XA 3LSLA 4JWYA 1PB7A 3DLNA 4ZEKA 2Q9TA 3C4MA 3USDA 2REGA 3TDJA 2OBGA 1B7HA 4TLLB 1PB8A 2F97A 2P2AA 2F36A 1LFIA 2O6AA 3IX1A 2QPQA 5CRYA 1M5DA 3OO9A 3MUQA 3OO6A 5H8SA 1PBPA 1US4A 4OQOA 1NH7A 3K1PA 2UXAA 5DEXB 2HAUA 1PBQA 1LAFE 3HHGA 5DEXA 3K1NA 2ANJA 4JWOA 1I6AA 2X7PA 4JBZA 1M5FA 2ZYMA 3WAEA 4BDNA 2DYXA 4POWA 4H6DA 4LONB 5CMBA 2BJJX 3H3GA 1DPPA 4YKPA 3U93A 2Z23A 1XOCA 4X9TA 4H8IA 1BP5A 2F7CA 2XXRA 5HBCA 3TODA 4GXAA 3V5AA 3I6VA 1MXZA 1S7YA 2RCAA 3KOTA 1JETA 2Y7IA 4ZZEA 4KYDA 4N13A 3RY3A 1HSEA 5I58A 2HEUA 2XXQA 4G4PA 3MVYA 1JW4A 5L8DA 2HZLA 1Q35A 3FXUA 1MXVA 4NF6B 4Q5TA 4DZ1A 3KOSA 4YB5A 5HPQA 4FORA 2Z8EA 4U2RA 5DVJA 3Q26A 1R6ZA 1DSNA 2XD3A 3EHUA 4EDPA 1OQGA 4YKKA 2H99A 3KEIA 1B0LA 1I6BA 2PX1A 2V25A 3Q29A 4X48A 4GL0A 5KCJA 1PDAA 2ZMBA 3CI8A 2QSXA 1CE2A 3KN3A 3FVOA 2RCBA 1MQJA 1IEJA 4JSDA 1MY3A 4NTLA 1UIUA 1A8FA 3TAJA 3RTWB 4ZEFA 4E0WA 5ELVA 3SEYA 1XHYA 2HQ0A 2D5WA 4R2FA 2ABHA 1IITA 3CRBA 4RNSA 2PT1A 3WAFA 1DTGA 2VD3A 3T96B 2HCAA 1AMFA 2XXXA 3VVEA 4YAHX 4LVQA 2I0CA 3K01A 3ZKLA 1VR5A 2AL4A 4G8HA 4MH5A 4Q30B 2ZYNA 3IB1A 1TT1A 3O28A 2F78A 1B3LA 3BBRA 5JK4A 2I49A 1IXIA 3MJNA 1US5A 4F1UA 1P99A 3T93B 4FJPA 3LSXA 4IO6A 1TFAA 4DXCA 4H67A 1VE4A 4E0XA 1SYIA 5AA2A 2P0SA 2UYFA 4MLVA 1OVBA 4LUBA 2I6EA 2OWSA 4PETA 2DE4A 4NWCA 4Z0IA 3MQ9A 1NL5A 1IXHA 3C31A 3UIFA 1WODA 4LZ7A 3AXFA 3FZVA 3EF7A 3OOAA 1IXGA 1SQYA 1A54A 4R6HA 4ESXA 1LBCA 5EHSA 2DXYA 4OETA 1UTBA 1B0HA 1FW0A 3PPNA 1MRPA 5CC2A 4KCDA 1VSOA 4WXJA 5B70A 3TKDA 3FV2A 5A5XA 1PEBA 3SEXA 1M5BA 2Q2AA 3MZBA 1JVXA 2V3UA 3PMVA 3QUFA 3TQWA 1LLSA 2F8DA 1OIBA 2FA7A 3IL1B 3LSFB 1VFEA 4GIZA 1YAEA 4F3BA 3IJXB 4QFOA 2AL5A 1RKMA 5FTHA 4OXVA 1Z7NE 5K2YA 2RC8A 2UVHA 2XXVA 3C9HA 1LSTA 4I62A 1MM7A 1JW1A 5L9SA 1MY0A 4EF1A 1B58A 2M8CA 4U4SA 5FHNA 2NWJA 4G8MA 1H3DA 4GF8A 1S9TA 3TMGA 1I69A 1YTVA 3A3CA 1SDXA 3IORA 1FTKA 4QFKA 3MAMA 3O6GA 2RF1A 4FEDA 1B51A 4ZE9A 4GD5A 1O7TA 4RK2A 2V93A 2QL3A 3A09A 1FQBA 4GWOA 1MH4A 4G68B 2LAOA 4G68A 4H5GA 4DCYA 3HCQA 5I2NB 2OZZA 3DELB 1L5TA 1MY2A 4EQ9A 3RLFE 3MVWA 2Q8JA 4IO2A 5JTYA 4NF8A 1FQAA 3S9MC 1N7WA 4RXLA 5AA4B 3B6WA 3OMBA 3R26A 1AH5A 3EHTA 4H8JA 1SI0A 4XIGQ 1DPEA 4L17A 1FTLA 4P0IA 2WKYA 3C33A 5AA1A 5CMCA 4NWDA 1LFHA 3C36A 1MDP1 4XKNA 3SESA 2F7BA 3HN0A 3GLBA 4ZEBA 1OLCA 3IOWA 2O68A 4I9DA 4RK9A 1ZBMA 4UA8A 1J1NA 1S50A 2XXYA 4MLQA 2Q2CA 1ZU0A 1EH3A 4G68C 2HFBA 3K2DA 5AA2D 4QHQA 1POY1 3VLWA 4K3FA 4DDDA 3TQLA 1URGA 1VFDA 4F1VA 1A7LA 1RYXA 2DSFA 4EXLA 3I5OA 3UGWA 4JDFA 3PUVE 3S2VA 2A5TB 3SERA 2A5TA 3K6UA 3O97A 1B52A 3A3UA 3PD8A 3QYTA 4QSEA 4TOZA 5KDTB 4FE8A 1AOVA 1BIYA 5HM4B 1FTMA 3N94A 3LUYA 5DYHA 2Y7PA 4YICA 3N6UA 4M1VA 3U8QA 3OO7A 3PMWA 4DIGA 1B5JA 2NVUB 2AYSA 4M4GA 2QS3A 1MY4A 3K6XA 5DTBA 4HCYA 3UORA 5I84A 3FJMA 3RUMA 1OMPA 3O29A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3O6IA 5EHMA 2CEYA 3FASA 5BUUA 4RPOA 4GL8A 5I5PA 1GTKA 2OK2A 2DWIA 2AIXA 4KQPA 3FV1A 1UIVA 2O69A 4O8MA 3V8XB 4EQBA 4C1UA 1FPLA 3MYUA 2UVIA 3S9LC 4YKJA 1EYIA 2VHAA 1ATGA 4P8BA 5EYHA 1FBHA 4F29A 4I3YA 4GXSB 4LZ5A 2O1MA 2ZNUA 2Z8FA 3IOTA 4HTGA 1D3KA 3N26A 2R71A 5IAIA 3MZ9A 1T0KA 3E3KA 5H8NB 2OCUA 3MC2A 1FBFA 4GWXA 2F34A 4NAPA 1FQDA 4LN5A 5H8HB 5H8HA 3IJOB 1SYHA 4PBHA 1MXWA 3MP6A 3VVDA 4PF8A 1BLFA 1URDA 1LGBC 4NQ8A 4KXPA 3PUXE 3IB2A 5I2KB 4Q8RA 5I2KA 3DP4A 4IY6A 3U72A 4N07A 3SEVA 4DXUA 4TLMB 4OFLA 1JNFA 2CZLA 2WBBA 3OEKA 3ZS6A 2YPNA 3KJ7A 4OVRA 1LB8A 4OA4A 1LBBA 4U1OA 1FBGA 1XC1A 1USYH 4KYEA 1DBZA 2FVZA 2E1SA 1B40A 3Q25A 3VLVA 3ILTB 3THIA 4IO3A 4MBPA 4RPNA 3CHGA 3KSJA 4NF6A 1IZ1A 3TTNA 3IO6A 4DCXA 4KYSA 2H25A 4ZE8A 1XVYA 3FD3A 3OXNA 1P1WA 1NV5A 2XWIA 2XX8A 2ZYOA 2CZKA 2E0SA 1MQGA 1IMAA 2XHDA 2X7QA 3ZSFA 3JZJA 2XX9A 3OEMA 2ONKE 4LP2B 4RYAA 4IB2A 2Z8DA 1N0TA 2PCRA 1Z7ME 1R9QA 2ALUA 1II5A 2B3FA 3BIGA 3G7WA 1NNTA 4OMBA 1WDNA 4JSOA 2ZZWA 3IK6B 3KBRA 1PB9A 1FJ9A 3R6UA 4BDRA 3IAZA 4PC9A 4YMBA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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