1SI0A

Crystal structure of mannheimia haemolytica ferric iron-binding protein a in a closed conformation
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
316
structure length
316
Chain Sequence
ANEVNVYSYRQPYLIEPMLKNFEKDTGIKVNIIFADKGLVDRVKQEGELSPADVLLTVDISRVMEIVNADLAQKIDSKVLEKNIPAQFRDSNDQWFGLTTRARVIYTSKDRVGKLPAGFDYLDLAKPEYKGKVCVRSGKNSYNVSLFAAMIEHYGIEKTKAFLEGLKANLARKPQGGDRDQVKAIKEGICDYSIGNSYYYGKMLDDEKQKSWAEAAIINFPSGEHGTHKNISGVVIAKHSPNKANAVKLIEYLSGEKAQGLYAELNHEYPVKEGIEPSAIVKGWGTFKSDTIKLEDIAKNYEAALKLVDEVKFDDF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for iron binding and release by a novel class of periplasmic iron-binding proteins found in gram-negative pathogens.
pubmed doi rcsb
molecule keywords iron binding protein FbpA
molecule tags Metal binding protein
source organism Mannheimia haemolytica
total genus 126
structure length 316
sequence length 316
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13343 SBP_bac_6 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1si0A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1si0A02
2PT1A 2OBGA 5JTYA 3KSXA 1MXWA 1MQJA 3IJOB 3MWBA 3FVNA 2QRYA 5FHMA 1B3EA 1EZPA 3M3KA 4H65A 3OO7A 2H5YA 3EQ1A 3I5OA 4PFWA 3PUXE 3MZ9A 3MUQA 1A8EA 3DM0A 1LFGA 1ZLQA 2XXPA 1Z7NE 3V5AA 2I6EA 3DLNA 5I84A 1MDQA 3U92A 1F9BA 4R6HA 3C34A 1GTKA 1IEJA 4U22A 1UIUA 5DT6A 2I3WA 3BFTA 1Y1MA 3QUJA 4ZE9A 1PBPA 3FVGA 4RXLA 2WKYA 2DWJA 1IITA 3Q25A 2I3VA 2A5SA 2I0CA 5BUUA 5DTBA 1QJMA 1B5JA 2HEUA 4NEDA 4TOZA 3KN7A 4U2RA 2O7UA 4KD5A 1TWYA 3O6IA 1GVCA 3VVEA 4I9DA 3O6HA 3VLWA 3MZ1A 5ICQA 3U93A 3HSTA 1B7UA 1BKAA 1QUKA 4ZEFA 2NVUB 1EZOA 2XHDA 4F3SA 3CVGA 3O97A 3LSFB 3K01A 3CFLA 3T9UA 1MS7A 3FZVA 1O63A 4QFOA 2Z8EA 1UTHA 4R6KA 1ZMGA 1VSOA 4YB6A 1LB9A 4OXVA 2DWAA 3IB0A 3CFZA 4R75A 4JBZA 4QF9A 1N04A 4ZEIA 4KCDA 4ZDMA 2H99A 3E4RA 4BDNA 2PVUA 3H06B 1BLFA 1QUIA 5CMKA 4DXUA 1AL3A 3CRBA 1LLSA 3DP6A 2FYIA 1B6HA 1O7TA 3MBPA 3FATA 3UN6A 3IAZA 3TQWA 1EU8A 3PUWE 2F7AA 1B40A 4R6YA 2F78A 1LAXA 1M5FA 1FTJA 3VVDA 4G77A 3HO7A 3QSLA 4JWOA 2RC7A 1QVSA 2M8CA 2Q9TA 4G2ZA 2OLBA 3K6XA 4MBPA 1ELJA 2XXWA 1R6ZA 3MJNA 1MY0A 4IO3A 3SEVA 5LOMA 4QRZA 3TTRA 1B1HA 1Q35A 4N07A 3PUZE 5H8NB 1LBBA 3GXAA 4GWOA 3ILUB 4GXSB 4NF8A 3LC8A 2XD2A 3G3HA 3JV9A 3CSBA 1IXIA 3H6UA 3RUMA 3SKPA 4EQ7A 1OVBA 4NTLA 2ALUA 4G8HA 1NMUA 4YICA 1I6BA 4R2BA 3SEYA 2REJA 4F1VA 3FIRA 1MY3A 2QS2A 3UGWA 3TTKA 1SYIA 1OLAA 1B52A 3B7DA 4E0WA 3RT8A 5J1DA 3OENA 1GV8A 5HBCA 4G68C 1TXFA 4OFJA 1B32A 4DDDA 4LA9A 1SW2A 4OFLA 4L17A 3HPIA 4TLLB 3TQLA 4LQ5A 4F3PA 3S9LC 4YKPA 1LAFE 3FUZA 4H1XA 1Q1KA 5ITOA 2XX8A 3U94A 3A09A 3OOAA 5H8HB 4P11A 2VD2A 1FTOA 4MF3A 1XVYA 3VXCA 2DVZA 4IY5A 3OMBA 1QKBA 4KR5A 1H45A 2ONSA 5I57B 3MZBA 1B3HA 2HXWA 5CRYA 1GGGA 5KCJA 2CZLA 1I6AA 3PPOA 4DZ1A 4GQOA 3H3GA 1MPCA 3N26A 4OESA 4OZ9A 2A5TA 4Q8RA 1PB7A 1PB9A 4PFTA 5CMBA 3PD9A 3ZKKA 3IB1A 3SEUA 4X1BA 1M5EA 2XX7A 3KFMA 3MC2A 3IR1A 3IX1A 5DEXA 3UA8A 5CMMA 3GLBA 3S9EA 1SW1A 3K00A 1NL5A 3T66A 5DVFA 4R9GA 4ND9A 4DIGA 3CI8A 1VFDA 1P1WA 2DXRA 3EF7A 1FQEA 1UQWA 2IEEA 3IORA 2G29A 2G93A 3VVFA 4M1VA 3H6VA 2O1MA 2E0SA 5TPAB 4ZS9A 1SYHA 2X26A 3IK6B 4IO5A 1I69A 3D4CA 4FIMA 5HM4B 2DVCA 4KYEA 1NH7A 3VLVA 3MQ9A 1T0KA 1B0HA 1YAEA 4Q0CA 2QPQA 2F6GA 3B6QA 4ONYA 2HZLA 3K1MA 2THIA 1NFTA 2PX1A 2D5WA 1TFDA 2UVIA 2DOJA 1JQFA 3HHFA 3M8UA 4LP2B 3PD8A 3TELA 4H8IA 3PGFA 2XXHA 4IGTA 3Q29A 2I4BA 1FQCA 2O7IA 2ZYKA 1B0LA 1MPDA 4FATA 2X7QA 5KZTA 3TEPA 4NF4A 3IO4A 4POXA 5I58A 3O66A 4H0WA 2UVGA 3VV5A 4YMBA 4F19A 1POY1 2Q2AA 3V8XB 4LONB 1FQFA 4EDPA 3W15C 1Y4CA 3U8QA 2Q2CA 4NWCA 3KGCA 2ZXTA 3ZS6A 2DWHA 2DE3A 2XXIA 3N6TA 1DTZA 1MY4A 5KDTA 3FV2A 4KYDA 1XS5A 3LSLA 2F6PA 4DXCA 1NNTA 5I2NA 1OIBA 1N3XA 4ZZEA 2PBWA 1MM6A 4I8CA 3RLFE 1P99A 1IQ7A 4KI0E 3PV0E 3GZGA 2Q8JA 1QUJA 3PUYE 2B65A 4H67A 3SETA 5JTYB 2V25A 3G7WA 4ECFA 4DCXA 2FA7A 1B51A 5TU0A 4NF6A 4O3BA 1US4A 5H8FB 1HSLA 4H5GA 1KWHA 3I3VA 1RYXA 3MVYA 3C9HA 5H8SA 1XOCA 4KCCA 2O69A 1MQHA 4IO6A 2UYEA 3GBAA 5AA4B 4PP0A 4Z0IA 2XXXA 1B1XA 2H4IA 3PPPA 4XKQA 4IB2A 3RQTA 1VR5A 2O84X 4QSEA 4FAJA 3EHTA 2R6GE 2XXVA 3RPWA 3W9WA 2F8DA 1YCJA 3VLUA 4OEVA 1TFAA 2QL3A 3A3CA 4H6DA 1QKAA 4ESXA 1AOVA 4F3GA 1LBCA 2NOOA 5A5XA 2Y7PA 2RF1A 1LCFA 2E1SA 4QHQA 5I56A 3G3KA 1OLCA 1B05A 4MH5A 4E0XA 2UYFA 4XKRA 3LSXA 3M3FA 3SEXA 1MY2A 1H44A 4EF1A 1NH8A 4R9FA 1BTJA 5I59A 5I2KB 3M3LA 3WAEA 4R73A 1ZJLA 1DSNA 4XTCQ 3O6GA 1XVXA 2H9BA 1NNFA 3Q28A 1FTMA 4ELOA 5IAIA 3FV1A 3DP8A 1UTHB 1DTGA 1N76A 4G4PA 1M5BA 2HFBA 2O6AA 3S9MC 1A99A 3C4MA 1FQAA 2AL5A 2XD3A 3O28A 5CM6A 4YU0A 3H7MA 1MXXA 3TTNA 4WXJA 4GLIA 1B3FA 2VHAA 4WEDA 1A8FA 2AYSA 3TMGA 1II5A 3ZSFA 5L9OA 4MFIA 1M5CA 3IO6A 3UP9A 4PFYA 4OERA 4OWDA 2VOZA 2VD3A 1OQGA 3TTMA 1LFIA 1NNPA 3TODA 3LBSA 3OSQA 3K1NA 4TQUQ 1PDAA 2DYXA 2XXQA 2UXAA 4R2FA 3RGYA 5M2VA 4GVOA 3R7XA 3KN8A 4NWDA 2NUVA 4U4SA 4F29A 3BKIB 1J1NA 4NMYA 4NF8B 3DP4A 3QIMA 5EHSA 4HCYA 4O3AA 2RCAA 1B7HA 2GRVA 2I0BA 1Y3QA 4F31B 5B7DA 2F36A 5AA3A 2D3IA 3B6WA 2QMXA 3TYHA 1XC1A 2HAVA 3MPLA 3IOTA 4AB5A 1R9QA 4H5FA 1P1UA 1PBQA 4ZEBA 4KYSA 1FTKA 3AXFA 3K02A 2W7YA 4QFLA 1URDA 2VGQA 1S9TA 3R26A 3N94A 4U1OA 2HAUA 1DPEA 1LAGE 2YPNA 3QK6A 1ZIUA 1JW1A 1YPNA 3RNNA 1D9YA 3TCFA 4GXAA 4KFQA 3U72A 2UVHA 1YTVA 4OTEA 2REGA 1SI0A 4RK9A 3RTWB 3A3UA 4BLAA 4YKKA 4G68A 2F5XA 2Z8DA 1LSTA 2RINA 4KQPA 4ZEDA 3LUYA 3VXBA 5KCJB 3Q27A 4QSDA 4RPNA 3IL1B 4OHNA 3TCGA 1LB8A 3CG1A 1A55A 4U23A 5AE4A 2A5TB 1SVXB 5F1QA 4GD5A 4YAHX 1TT1A 1MY1A 3FXQA 2OK2A 4IY6A 3R6UA 1AMFA 4HTGA 2LAOA 1MH4A 4LZ5A 2DE2A 2P2AA 1N3WA 1H3DA 5DEXB 5H8HA 3S2VA 2IA4A 4WEPA 1UIVA 3JYRA 4I62A 3T96B 4K3FA 2Q89A 5DVJA 1IXHA 2H25A 3MW0A 4GFRA 4HW8A 3MVZA 4YKIA 4GOTA 5IKBA 2QS3A 4GF8A 1LAHE 1WVJA 1B2HA 5AA2B 3SEWA 1LCTA 4BDQA 2F97A 3KG2A 3CIJA 1FCKA 1PB8A 4LATA 4UA8A 4Q30B 3G3IA 3KJTA 3TCHA 4GL0A 2XXTA 4XKNA 3FVOA 5L9SA 1MRPA 3K4UA 3K6WA 3QAXA 3T93B 3HCQA 1USYE 1WODA 3ONMA 4OVJA 2FNCA 2ZNTA 3L6HA 1MQGA 5FHOA 4BDRA 3RN8A 4F1YA 2RKMA 1US5A 4BDLA 4RK2A 3MP8A 4POWA 5EYFA 3OEKA 4GL8A 4NF4B 4R74A 1MDP1 4FEBA 1FQDA 4P0IA 1NNKA 3ECRA 4RJZA 2YLNA 1D3KA 3IOVA 3G3FA 1B9JA 4RA1A 2VP1A 3TDJA 5DYHA 5AA1A 3OXNA 3FJ7A 5KDTB 1B5IA 2ZNUA 3O29A 4H8JA 5DVIA 2O68A 4JWXA 4UACA 1H43A 1UTBA 1SD3A 1D9VA 1OMPA 4F18A 2YJPA 1L5TA 3PPNA 3UIFA 5TP9A 1JEUA 4ZECA 1HSEA 1JW4A 1SW5A 2ESNA 3QUFA 3OO8A 3TKDA 1Y4TA 3K6UA 4ELPA 2DWIA 4NF6B 5H8QA 3MAMA 4OMBA 1MXZA 1LFHA 4NF5A 5EHMA 5CC2A 1B3GA 4C1UA 1MXVA 4RNSA 1B4ZA 1EZ9A 1I6QA 2ABHA 3K6VA 3LR1A 3MP1A 1AIVA 5B70A 1A54A 2HQ0A 1IXGA 2F34A 4EQ9A 4IO4A 2DS9A 5CBSA 1B46A 3I6VA 2ANJA 2AL4A 4IO7A 3E9XA 2ZYOA 1R9LA 2PYYA 2UVJA 1IIWA 1PEBA 3B6TA 3PMXA 3K1PA 3OD7A 5A5XB 2O1LA 1Z7ME 4F22A 5FHNA 3VDFA 2B3FA 1A40A 3Q26A 5I56B 3LSWA 5H8FA 2XXUA 3CFXA 2GHAA 1SQYA 1A7LA 3KEIA 4Z7EA 1MXYA 3PMVA 5FTIA 3OO9A 1B4HA 5I59B 5AA4A 2V84A 1B5HA 3V83A 2OJTA 4JB7A 2BJJX 2OWTA 2ZYMA 4G8NA 1MXUA 2I49A 3C31A 4O3CA 4TLMB 1EH3A 4JSDA 3EHSA 1Y3NA 4DXBA 5ISUA 1S50A 1S7YA 2OCUA 3C33A 4U4XA 3HHGA 4EXLA 4DE8A 3EHUA 4FE8A 4M4GA 4P0GA 2GHBA 4JXIA 4X9TA 1FQBA 3W9VA 4U21A 3V89B 2GH9A 2AIXA 1MQIA 1OVTA 3PMWA 3PU5A 2I48A 4JDFA 5F7VA 2ONRA 5I2KA 4I1DA 3VE1B 2D21A 3MPKA 2DSFA 3O2AA 1QW0A 3D4GA 1JVXA 5AA2D 4LVQA 4F1UA 3G3JA 4AB6A 4BDMA 1Y1ZA 3MVWA 3C35A 5K2YA 3RTFB 1USYH 4THIA 4IGRA 4DLDA 4EXKA 3OEMA 2V3TA 2Q88A 4LUBA 4FECA 1SW4A 3BFUA 4YMAA 3FGSA 4C0RA 4F39A 5L9MA 1SI1A 3TFLA 3IJXB 2DQVA 5L8DA 3RY3A 2XXYA 1ZTYA 4KPTA 2Z23A 3TZAA 4G8MA 3H6TA 5CI5A 2H98A 3KZGA 3TTLA 3WAFA 4PFUA 5FTHA 2F35A 1Y9UA 1DMBA 1AH5A 5CBRA 4MLVA 2DXYA 3SESA 1BIYA 1JW5A 4R72A 4ISUA 3T9VA 1MG1A 3MVXA 3CG3A 2O51A 2ZYNA 4Q5TA 3KOSA 3F11A 4OYVA 1XHYA 2GFEA 2V93A 3FVKA 3FXUA 3FD3A 3OELA 3S4UA 2QJEA 2B3BA 1NKXA 1N0TA 2QS4A 1JNFA 1BP5A 4QSCA 1Y20A 2P0SA 3PPRA 3DELB 4GIZA 1IUDA 1IZ1A 1B3LA 5H8NA 1N84A 4G68B 1CB6A 2XX9A 3JZJA 1MH3A 3ODBA 1N7WA 2Y7IA 4XIGQ 3EN3A 1HSJA 4QFKA 4RY1A 1FW0A 1OQHA 3K2DA 3N6UA 3UORA 3HN0A 4OENA 2OWSA 2HZKA 1R1NA 3EPEA 2Z8FA 4OQOA 1IXCA 3FXRA 5CMCA 1ZU0A 2PT2A 3E3KA 3SDFA 1URSA 3OSRA 4FJPA 3CR9A 1WDNA 1O64A 1JEVA 4NE4A 4QFNA 4ESWA 4AQ4A 5JEIA 3MP6A 1D4NA 3FJGA 4KHZE 4QFPA 2X7PA 1JETA 1B58A 4FEDA 5HPQA 2OZZA 2XXRA 2P1SA 3C32A 3KOTA 2Y7WA 3PUVE 1B7ZA 1VFEA 3PPQA 4JWYA 1M5DA 2CMOA 3H6WA 3U1OA 2RC9A 3C36A 4HS7A 3IOUA 3KJ7A 4EF2A 1CE2A 5I57A 2HCAA 4N6PA 1QULA 4OFOA 2I4CA 1RKMA 2PMSA 2Z22A 1MQDA 1SBPA 4YB5A 4ELRA 4ZE8A 2Y7RA 2QS1A 2NXOA 3GBBA 1GR2A 3E13X 4C1TA 1FTLA 2V3QA 2ONKE 1SDXA 4JSOA 3N5LA 4EQBA 2DE4A 2ZMBA 1P1QA 3RT6B 1ANFA 4PE5B 1URGA 4XXUA 1N7XA 4FORA 4ELQA 5AA2A 3TUSA 4WKMA 5BWJA 2R9JA 4OETA 3FJMA 4X48A 5ELVA 2V3UA 2ZNSA 1ATGA 2RC8A 1XT8A 4BDOA 5I58B 3QXMA 3KN3A 1MM7A 1ZKBA 4U1ZA 3S9NC 4GRKA 3IOWA 4YKJA 1UTBB 5TPAA 3IB2A 2QMWA 4F3BA 1P1NA 4HCWA 3TAJA 3OO6A 4ZZAA 5JK4A 4F2OA 4ZEKA 1JVYA 4X1DA 5TP9B 2F7CA 3ZKLA 3THIA 2F7BA 4MLQA 3KBRA 5H8QB 5I2NB 3CSGA 3P7IA 3H03A 3TPAA 4RPOA 4NF5B 1LGBC 1P1OA 1ZBMA 3SERA 5K2XA 1POTA 4RYAA 4N13A 5ITPA 4LQ2A 2I58A 2KLFA 2RCBA 2NWJA 4LZ8A 4PETA 3VFJA 4YZZA 4EUOA 1MPBA 3O9PA 3BBRA 3HV1A 4PQJA 1DPPA 3G3GA 3QYTA 1RYOA 4YB7A 4XKPA 2Y84A 3K0VA 3USDA 3T9HB 1VE4A 4F2QA 2Y7KA 2DP8A 4OEUA 1H76A 3KSJA 3ILTB 1PC3A 3UK4A 3T9XB 3T22A 3L6GA 4LZ7A 2R71A 1DOTA 3H4ZA 5ICTA 2QSXA 3FASA 4DCYA 4IO2A 1Y3PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2PT1A 2OBGA 5JTYA 3KSXA 1MXWA 1MQJA 3IJOB 3MWBA 3FVNA 2QRYA 4N6KA 5FHMA 1B3EA 4X8RA 1EZPA 3M3KA 4H65A 3OO7A 2H5YA 3EQ1A 3I5OA 4PFRA 4PFWA 3PUXE 3MZ9A 3MUQA 1A8EA 4H45A 3DM0A 1LFGA 4PTKA 4P47A 1ZLQA 2XXPA 1Z7NE 3V5AA 1FPIA 2I6EA 3DLNA 5I84A 5A5LA 1MDQA 3U92A 1F9BA 1IMFA 4R6HA 3C34A 1GTKA 2FIEA 1IEJA 3D1RA 4U22A 1UIUA 5DT6A 2I3WA 3BFTA 1Y1MA 3QUJA 4ZE9A 1PBPA 3FVGA 4RXLA 2WKYA 2DWJA 1K9YA 1IITA 3Q25A 2I3VA 2A5SA 2I0CA 5BUUA 5DTBA 1QJMA 1B5JA 2HEUA 2P3NA 4NEDA 4TOZA 3KN7A 4U2RA 2O7UA 4PGNA 1KA0A 2ZZXA 1TWYA 4KD5A 3O6IA 1GVCA 4JVCA 5F24A 3VVEA 4I9DA 3O6HA 4NG7A 3VLWA 3MZ1A 5ICQA 3U93A 3HSTA 1B7UA 1BKAA 1QUKA 3E78A 4ZEFA 2B4LA 2NVUB 1EZOA 2XHDA 1NV5A 4F3SA 3CVGA 3O97A 3LSFB 3K01A 3CFLA 3T9UA 4GBVA 1MS7A 3FZVA 1O63A 4QFOA 2Z8EA 5IM2A 1UTHA 4R6KA 1ZMGA 1VSOA 4YB6A 1LB9A 4OXVA 2DWAA 3IB0A 3CFZA 4NAPA 4R75A 4JBZA 4QF9A 1N04A 4ZEIA 4KCDA 4ZDMA 2H99A 3E4RA 4BDNA 2PVUA 3H06B 1BLFA 1QUIA 5CMKA 3KC0A 4DXUA 1AL3A 3CRBA 1LLSA 2CZHA 4P9KA 3DP6A 2FYIA 1B6HA 1O7TA 3MBPA 3FATA 2XWKA 3UN6A 3IAZA 3TQWA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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