3TAJA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with nabumetone at 1.7a resolution
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of C-lobe of bovine lactoferrin complexed with Nabumetone at 1.7A resolution
rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 112
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2011-08-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tajA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tajA02
2DVZA 4R74A 3OELA 2A5SA 3PD8A 4YMBA 1B7HA 1CE2A 2I3VA 3SEWA 1B58A 2XXWA 3BBRA 1ZMGA 4NE4A 4G8NA 3K6WA 1M5CA 3FATA 4LP2B 5H8HB 5I57A 2ESNA 2VHAA 2DWIA 1Y20A 5TU0A 3PUVE 3S2VA 3KSXA 4X9TA 4F3GA 4NMYA 1LCFA 1IXHA 2Q88A 3OO8A 3TTLA 3VLWA 4EUOA 4XKPA 3EHUA 3JV9A 1USYE 2IEEA 1N04A 3SDFA 4LONB 1B32A 3LUYA 4AB5A 4YB7A 1TWYA 4QFOA 3CSBA 1DTZA 1SI1A 3IOTA 4U23A 2V84A 4FIMA 4RK2A 2REJA 3L6GA 1IXGA 4GRKA 1KWHA 2X26A 5H8NB 3QIMA 1NKXA 1UIVA 2F35A 4MF3A 1XVYA 1H76A 3Q28A 1DTGA 2P0SA 2QSXA 3I3VA 1B4HA 4OMBA 2DWAA 4LZ7A 4G2ZA 4QFLA 4YB6A 4F18A 2G93A 3DP6A 5CC2A 5KDTB 1R1NA 1M5FA 1IUDA 1VFDA 2NXOA 2RKMA 3MPKA 1JVYA 3TTRA 4YKPA 2ZXTA 2VGQA 1N3XA 3CFXA 2CMOA 4XKRA 1FQEA 3TMGA 5AA2A 5A5XA 3EHTA 3FD3A 1LLSA 4P0GA 4QSEA 1XC1A 2Y84A 4YKKA 2UYFA 4OQOA 1H3DA 1DMBA 1LAHE 2GFEA 5JTYB 1OVBA 5BUUA 2D3IA 4G68B 1FQDA 2LAOA 3RT8A 4BDMA 2VD3A 3IL1B 2V3UA 4JBZA 4ESWA 2V3TA 4QFPA 5CMBA 3EF7A 5F1QA 3VXCA 4TOZA 2V93A 5I2KB 4ZEIA 2I3WA 2QS2A 1PB7A 3TTKA 3K01A 2PT2A 1MPCA 1BLFA 1EZ9A 1N0TA 1Z7ME 1P1NA 1SD3A 3H6VA 3K02A 4GVOA 4P11A 4XIGQ 3ZKKA 3KN3A 3L6HA 3PMVA 1MQIA 3Q27A 3U8QA 3IB2A 2Q2AA 1N7XA 2XD2A 3KJTA 1GGGA 4U4SA 5CM6A 2QPQA 4GOTA 2OWTA 4IY5A 3O9PA 1F9BA 4OENA 4E0XA 3O29A 3MPLA 2O84X 1RKMA 2Q9TA 2BJJX 5ISUA 1N84A 2F7BA 4DCXA 4M1VA 1TFDA 2GHAA 1R9LA 4OZ9A 1NH8A 4U2RA 1N3WA 4PE5B 3G3IA 5TPAB 2Y7KA 4JWYA 1FTMA 2F7CA 1LSTA 3T96B 4Q0CA 1MRPA 3B7DA 1NFTA 4ELPA 3QK6A 5TP9B 2F7AA 4NF5A 3S9NC 1P1WA 1UTHA 1XT8A 2O51A 3CFZA 5CMMA 4F2OA 4DXBA 4JSDA 3O6GA 2R71A 1JEUA 1DPEA 4RPOA 2R6GE 5FTHA 3SKPA 4ESXA 2FNCA 4R9FA 4EXLA 4JB7A 1D9VA 2XXUA 4IO6A 4WXJA 1Y1MA 5CMKA 1MPDA 4O3BA 4ZDMA 2ZNUA 3SEXA 3SETA 1LFGA 3DELB 2DP8A 2HZKA 1MDQA 4NF6A 4O3AA 5I59A 4NF4B 2F6PA 3IOWA 5H8QB 3MAMA 5J1DA 3DM0A 3IORA 1FTJA 3UORA 4FAJA 1XOCA 3GBBA 2B3BA 2GH9A 4BDQA 1UTBB 4FECA 1GR2A 3C33A 1B4ZA 3FXUA 4DDDA 1LGBC 3MVYA 4X1DA 5DTBA 4IO2A 1AIVA 3N6TA 4HTGA 2DOJA 1VE4A 3ZS6A 2I4CA 3GZGA 2Y7RA 1XS5A 1YCJA 2A5TB 2REGA 4RXLA 3HV1A 3RNNA 3CI8A 3RUMA 3USDA 1UIUA 3IAZA 4YZZA 5AA3A 1ZBMA 1R6ZA 3C36A 3QUFA 3KN7A 1ZKBA 4Z0IA 4F3BA 4KYEA 4F39A 1NNKA 2ZYOA 1MXVA 1I6BA 3H6TA 2A5TA 2RCAA 3MZBA 3SEVA 3IOVA 1Y9UA 3TKDA 2H25A 3F11A 1YTVA 1IXIA 5DVFA 4NWCA 1N7WA 3H7MA 3UN6A 2XXPA 3GXAA 3M3LA 4IGTA 5JEIA 4PP0A 3ZSFA 2HFBA 1MXXA 4QSCA 1Y1ZA 3OMBA 4KD5A 3OSRA 3N5LA 2H4IA 3MVXA 2XXRA 3G3KA 3JZJA 3HHFA 3O2AA 3PUXE 4H65A 2QS4A 1QKBA 3V5AA 4BDLA 2Q89A 5AA4B 4NF4A 3TFLA 3TODA 4MFIA 3D4GA 3C31A 4RNSA 4YKJA 4GXSB 1PB8A 3OO7A 1FTKA 4LZ8A 3TTNA 3M3KA 5I2NB 5ICQA 2HXWA 2DVCA 3SEUA 1AL3A 3MWBA 4BLAA 4R6YA 5EYFA 5CBSA 1PB9A 4IO5A 2O68A 3FVOA 4GL0A 2Z8EA 3KOTA 4FATA 1PDAA 4ZZEA 4KYSA 2F78A 1ANFA 1QW0A 2Z8FA 3A09A 3C34A 4R6KA 3G3JA 3TQWA 2DS9A 1Y3NA 3G3HA 2ALUA 3KJ7A 3MP1A 3T66A 2I48A 1QUJA 4P0IA 1S9TA 1HSLA 1B3LA 2DE2A 3BFTA 1ELJA 1FTOA 3I6VA 3KOSA 4GL8A 4H0WA 1B3FA 4OFOA 3U94A 1MY3A 4ZEFA 4POXA 5CMCA 2DWHA 4ZE8A 2FA7A 3ONMA 3K4UA 4ELQA 1MH3A 4NWDA 3PGFA 1FTLA 2QMXA 4R75A 4DXUA 1JW4A 2PYYA 1OVTA 4PQJA 3MZ1A 1RYXA 5KZTA 3QYTA 4R9GA 3QSLA 3K6UA 1MY1A 1PBPA 4OXVA 5DEXA 4EF1A 1DPPA 1D4NA 1UTBA 2XX9A 3MQ9A 4OFJA 1OIBA 1VSOA 1ZJLA 3E3KA 1IITA 3N26A 4OTEA 3W9WA 5H8QA 1A40A 1S50A 3SERA 1FCKA 1IQ7A 5I2NA 1QUKA 1ZTYA 3MC2A 4OHNA 5FHNA 5HM4B 3V83A 5FHMA 1URSA 2CZLA 2HAVA 4ZEDA 3I5OA 4JSOA 3TELA 1B05A 3IB0A 4F1YA 3T22A 4Z7EA 2VD2A 1FQCA 5HBCA 4NEDA 1H44A 5DT6A 2RF1A 4F29A 4QF9A 4R2FA 1UTHB 2E0SA 5DEXB 3TZAA 2DXYA 2Y7WA 4NF5B 4OYVA 1POY1 4PFUA 1NNPA 1LCTA 5F7VA 4KI0E 3HPIA 5TP9A 2XHDA 1BKAA 3PPQA 4BDNA 1PC3A 3LR1A 4C1TA 1NMUA 2RC7A 4R72A 3ZKLA 3M8UA 3T9HB 1M5EA 1Q35A 1P1OA 1B3GA 4BDOA 3RN8A 1SDXA 2YPNA 2THIA 3MW0A 4KCCA 1TXFA 4MBPA 4XTCQ 3B6QA 3N6UA 2ZYKA 2ONSA 3JYRA 4DIGA 3MVWA 1Y4CA 5L8DA 5I84A 1POTA 1XVXA 4GF8A 2ANJA 5HPQA 1QULA 2ZYNA 2WKYA 3EQ1A 4KYDA 4ECFA 3O6IA 2NVUB 1SW1A 3TCFA 4ONYA 1BIYA 4G8HA 4N13A 4Q5TA 3EPEA 3G3FA 3MUQA 3PPNA 1NL5A 1B2HA 1Y3PA 4HS7A 4YU0A 3DLNA 3M3FA 1TFAA 4TLMB 4IGRA 3FV1A 5CBRA 3B6WA 4OEVA 1T0KA 1B3HA 2HQ0A 4FORA 4U22A 2O1LA 3Q25A 5I59B 1LAFE 1B1HA 3C35A 4EQ7A 3IJOB 4F19A 4F31B 1NNFA 2QRYA 2FYIA 2UVIA 4FJPA 3S9MC 3S9LC 4KPTA 5AA4A 2DYXA 4WEDA 1VR5A 1D9YA 3VVEA 4E0WA 2I49A 2OWSA 3IK6B 3RQTA 3V8XB 2DE4A 2UXAA 2VOZA 4DLDA 1QUIA 2H5YA 4FEDA 2YLNA 1I6QA 1MXWA 3FVKA 4PFWA 5A5XB 5L9OA 4R73A 3FJ7A 3SEYA 4EF2A 4HW8A 5AA2B 3VXBA 1SYIA 2QL3A 3U72A 1A7LA 3T93B 3W15C 3LSWA 2AL5A 1OQGA 1QVSA 2I0CA 3A3CA 3CSGA 3FVNA 4JDFA 3PMXA 3PPOA 3MP6A 4THIA 4RY1A 5EHMA 3FASA 1MM7A 1MPBA 3LSFB 3OENA 4FEBA 3TEPA 2W7YA 3E4RA 4EXKA 1MY2A 1ZLQA 2XXHA 1B46A 2H98A 1DOTA 4M4GA 3TAJA 1Y3QA 3U92A 4F22A 3FJMA 2XXXA 2X7QA 2XXTA 4LATA 3LBSA 4DE8A 1II5A 4MLVA 2NOOA 4OETA 2KLFA 3RPWA 4UACA 3S4UA 4BDRA 3H6UA 5JK4A 3C32A 3CG3A 4I9DA 3V89B 1SYHA 4LQ5A 3GBAA 3T9UA 4QSDA 3A3UA 1MS7A 2HAUA 2PBWA 4HCWA 2ZNSA 4NF6B 4TLLB 4GFRA 4OERA 2DWJA 3QAXA 4KHZE 2O1MA 4N07A 4ELRA 5DVIA 3OOAA 1B5IA 4H1XA 3OEMA 3OO6A 4IO4A 1IEJA 2O69A 2ZMBA 3THIA 2RINA 2P1SA 3VLUA 5I56B 1JETA 3Q26A 5I57B 3TDJA 1H45A 2H99A 4RK9A 3KBRA 5JTYA 2AYSA 5IKBA 2P2AA 1FQFA 2D5WA 1IIWA 1O64A 1URDA 1JNFA 5L9MA 4HCYA 4KFQA 4OESA 1Q1KA 2PT1A 1B3EA 3OD7A 1LFIA 2GHBA 4H6DA 4Q30B 2O7IA 4RA1A 3CVGA 4ZS9A 4U4XA 4ZECA 3O66A 1JEVA 1OMPA 4AQ4A 5KDTA 1OQHA 4WKMA 5I58A 3LSLA 4OEUA 4X48A 5H8SA 4YICA 3PUYE 3U1OA 1MH4A 4EDPA 4ELOA 2E1SA 3VFJA 3PMWA 5H8NA 2XXVA 4H5GA 3HHGA 1A99A 1SQYA 3FZVA 5FHOA 1EZPA 3K2DA 1MQDA 4YB5A 3VVDA 5B7DA 2I6EA 4GXAA 1LAXA 3PD9A 4H5FA 1LBCA 4POWA 2XXYA 3KGCA 2F5XA 3O6HA 3VDFA 3PPPA 1A8EA 5K2XA 3VLVA 5H8FB 1IXCA 3FVGA 3RTWB 2I4BA 3ODBA 3UA8A 4KR5A 3UP9A 5I2KA 2I0BA 4U21A 1YAEA 3TCGA 3K6VA 4G77A 1ZIUA 4C1UA 4LVQA 2HEUA 3PPRA 5ITPA 1MXYA 3MZ9A 3CR9A 4OFLA 1R9QA 4IO3A 3MJNA 4NTLA 3HN0A 1AH5A 4G68A 3O97A 3TTMA 4KCDA 5M2VA 1O63A 1A55A 2ONRA 1SVXB 3IX1A 2HCAA 2UVHA 2Y7IA 5AE4A 3HSTA 3TUSA 1N76A 2QS3A 3VVFA 3LC8A 3IO4A 2Q8JA 1GVCA 1B51A 2XXQA 4F1VA 2NUVA 4IO7A 1B40A 1US5A 2Q2CA 2OLBA 3LSXA 4F1UA 5LOMA 3FV2A 3H4ZA 3K1MA 5AA2D 3SESA 4AB6A 4QHQA 1B5HA 3DP8A 3ILUB 3E13X 1MM6A 2Y7PA 3FJGA 3IOUA 1S7YA 1DSNA 1Y4TA 1US4A 3P7IA 3RT6B 2F6GA 3WAEA 4DZ1A 1MQHA 3S9EA 5DVJA 1USYH 5DYHA 4EQ9A 2YJPA 4G8MA 4X1BA 2OCUA 1JW5A 4XKQA 2AIXA 1GTKA 1B52A 4N6PA 2D21A 1I6AA 2OBGA 4H67A 4R2BA 2ABHA 2ZNTA 3FGSA 1SI0A 3FUZA 3B6TA 1SW5A 4UA8A 3R26A 4NF8A 2RC9A 5FTIA 5KCJB 4F3PA 5ITOA 4F3SA 1MY4A 1B0HA 1PEBA 2RC8A 3KSJA 3G3GA 3G7WA 3DP4A 2QMWA 3K0VA 5CRYA 4C0RA 2OJTA 3CFLA 5L9SA 4GD5A 1AMFA 1LFHA 3KN8A 5H8HA 2ONKE 3C4MA 4H8JA 2PVUA 1MXZA 1OLCA 1SW4A 1M5DA 3U93A 3W9VA 4WEPA 2F8DA 2DXRA 3R6UA 4YKIA 3QXMA 1L5TA 4JWOA 3KEIA 1BP5A 1MDP1 1VFEA 1SW2A 2XX8A 4FE8A 4GQOA 4OWDA 2NWJA 4F2QA 2DE3A 1XHYA 4IY6A 2DQVA 4JXIA 3EN3A 5CI5A 1AOVA 4QFKA 1B9JA 1I69A 1LB8A 2ZYMA 2AL4A 3BKIB 1Z7NE 4XXUA 4RYAA 2UVGA 4R6HA 3RY3A 3RLFE 4DCYA 1ATGA 1D3KA 4GIZA 5H8FA 3ILTB 2M8CA 3CIJA 5ICTA 1HSJA 3H03A 1GV8A 3IR1A 4XKNA 2F97A 3VV5A 3KFMA 2Z8DA 3K1PA 1B6HA 4MH5A 1URGA 3H3GA 2UYEA 1MQJA 4NF8B 2H9BA 1P1UA 4RPNA 4YAHX 3R7XA 3RTFB 3TPAA 3CG1A 1B0LA 3IJXB 2O7UA 3QUJA 2VP1A 2V3QA 3OEKA 3WAFA 3H06B 2XX7A 4GWOA 4JWXA 3RGYA 2IA4A 1MXUA 2X7PA 3C9HA 1B7UA 3KG2A 3O28A 4KQPA 2Z23A 3K1NA 3N94A 1YPNA 3IO6A 4Q8RA 1LAGE 1JVXA 4OVJA 1QKAA 3PUZE 1WVJA 3TCHA 4LQ2A 2RCBA 4GLIA 5I58B 1NNTA 1M5BA 1ZU0A 2V25A 3FXQA 1FQAA 1SBPA 4I62A 4PFTA 4ZZAA 1JW1A 1LB9A 4LUBA 4ZE9A 2OZZA 2G29A 3VE1B 2GRVA 4ND9A 4ZEBA 3PUWE 4I8CA 3TYHA 2QJEA 4I1DA 1LBBA 1QJMA 2UVJA 1O7TA 3H6WA 1WODA 3MVZA 2B65A 2R9JA 4L17A 1TT1A 4PFYA 1P1QA 4YMAA 1OLAA 4ISUA 4PETA 4O3CA 4QFNA 4TQUQ 1NH7A 1B5JA 1FW0A 3IB1A 3KZGA 5I56A 2I58A 2O6AA 3GLBA 1HSEA 3D4CA 1B1XA 1JQFA 4U1ZA 3UGWA 1UQWA 1WDNA 1EH3A 3ECRA 4H8IA 3E9XA 1MG1A 4U1OA 3OO9A 1A8FA 4G4PA 4K3FA 1B7ZA 2QS1A 4LZ5A 5KCJA 3PV0E 5IAIA 2Z22A 1P99A 4IB2A 1MQGA 3PU5A 4G68C 5ELVA 1FQBA 4MLQA 3K00A 1BTJA 3MBPA 4ZEKA 1RYOA 3K6XA 3T9XB 4LA9A 2HZLA 5AA1A 2XXIA 4EQBA 3FXRA 1A54A 3HCQA 2F36A 2XD3A 4RJZA 3OXNA 1CB6A 3OSQA 5EHSA 4DXCA 4QRZA 1H43A 2PMSA 2PX1A 1PBQA 3UIFA 3HO7A 5K2YA 1J1NA 5BWJA 3MP8A 3CRBA 3Q29A 1IZ1A 3AXFA 5TPAA 2DSFA 3BFUA 3T9VA 1EU8A 3EHSA 1EZOA 5B70A 2F34A 3UK4A 2OK2A 1MY0A 3TQLA 2B3FA 3FIRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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