3TAJA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with nabumetone at 1.7a resolution
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lactotransferrin
publication title Crystal structure of C-lobe of bovine lactoferrin complexed with Nabumetone at 1.7A resolution
rcsb
total genus 112
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2011-08-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tajA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tajA02
1B5JA 5F7VA 3PD9A 2OWSA 2XXRA 1SW2A 5CM6A 3FVGA 4N13A 4BDMA 2F6GA 3O6GA 1JNFA 1QKAA 1FTMA 4P0IA 3Q25A 1MM7A 4JXIA 4X1BA 2XXVA 4OEVA 5JTYB 2ONRA 2Z23A 3V8XB 1BTJA 1DPEA 3V89B 3EPEA 3N6TA 5I58B 1RYXA 3DELB 4YU0A 3MVXA 1Q35A 3K6XA 4OWDA 5TU0A 3QXMA 5I56A 1SQYA 2XXQA 4L17A 4R73A 4H0WA 4NMYA 1A7LA 2H98A 1B5HA 4KYSA 3C36A 5K2YA 2XHDA 4PQJA 3UP9A 4FJPA 3O6HA 3FGSA 2YJPA 5JK4A 2P2AA 4GF8A 2Z8DA 4PP0A 3U72A 2X7PA 3K2DA 4YAHX 3TODA 1LAGE 3PV0E 2Y84A 4LA9A 3B7DA 3PUXE 4RXLA 3VXBA 3TUSA 3O97A 3HHFA 1MPDA 3EHTA 5CMMA 5JTYA 3ZSFA 3VDFA 1QW0A 4LQ5A 3UK4A 3BFTA 2X26A 4YMAA 2F78A 1JEUA 1MH3A 4IB2A 1WDNA 5BUUA 5I58A 3M3LA 3PUYE 4RY1A 3UN6A 2R9JA 1H3DA 4GVOA 4NF5B 1FQAA 4BLAA 1NNFA 3T22A 2REJA 3IR1A 4RK2A 4EF1A 4C1UA 2G29A 2V3TA 3K1NA 4ONYA 4BDNA 2VP1A 3THIA 5TP9B 1M5DA 1ZKBA 1MQDA 4KPTA 4R75A 1WODA 1VR5A 4MLVA 4JSOA 3MVWA 4MLQA 3GXAA 1SW1A 2OBGA 3G3IA 3MP8A 3CG3A 1Z7NE 2G93A 4X48A 3TAJA 1PBQA 4GXAA 5H8HB 2KLFA 4QFNA 4YB7A 4G77A 5I59B 5HPQA 4AB6A 1S7YA 3OSQA 2OZZA 5AA4B 1LGBC 2NVUB 2RKMA 2DXYA 2UYEA 5CC2A 1CE2A 1QJMA 2DQVA 2F7BA 3S9LC 4G4PA 2M8CA 4NF5A 4IY5A 2I6EA 2Z8EA 3EHUA 3C34A 4LVQA 4KYEA 1OQHA 5B7DA 3KSJA 2AYSA 3QYTA 4OQOA 4NWCA 2REGA 3TZAA 4R6HA 5TP9A 3OO8A 4YKPA 4OFJA 1NH7A 1Z7ME 4JWYA 1LCFA 3KN7A 2DXRA 1EH3A 4M1VA 1B3HA 5H8HA 4EXLA 3SEVA 5M2VA 3K6UA 4MF3A 5I59A 2VD3A 3TYHA 5AA4A 3M3FA 3SEUA 3K4UA 5ISUA 3HPIA 3LSLA 4FIMA 1B05A 3LBSA 1II5A 4QF9A 3IOTA 4EXKA 4O3AA 1MG1A 3H4ZA 2NWJA 5L9SA 3F11A 4ZEIA 3R6UA 4FEBA 4ELPA 1B7UA 3N26A 3PPQA 2A5TB 4KYDA 1IUDA 3SEYA 5ITOA 1TWYA 1A8EA 3CR9A 1M5CA 3PMVA 4R6KA 2QS3A 3OO7A 4Q30B 1DTZA 3IAZA 2FA7A 4OXVA 1M5EA 1P1NA 2F6PA 3ILTB 1AIVA 1JW4A 4U4XA 1B6HA 2ZNUA 2Q9TA 1MQHA 3K1PA 3A09A 2O7UA 3MBPA 1SYIA 3V83A 4OEUA 4GWOA 2ZYMA 2H9BA 2QSXA 3JV9A 3RQTA 1MY2A 3K01A 3MAMA 4X1DA 1Q1KA 4QSEA 2D5WA 4ELQA 1B51A 2DE3A 3I5OA 3OEMA 3MPLA 1AOVA 1IIWA 2Y7WA 2XX8A 1PEBA 3K6VA 3I6VA 4LZ7A 4KR5A 3BFUA 3O2AA 3VVEA 1MXUA 4LONB 1AL3A 3RT6B 2A5TA 5CBSA 3E13X 4U2RA 2QMXA 2XXXA 1GV8A 1B2HA 1SI1A 3TCGA 3GZGA 3OENA 3IOVA 1OVTA 3PGFA 2O1MA 3FXQA 4R2BA 1A40A 5ICTA 4DCXA 4YB6A 1N84A 2H4IA 1XVXA 1HSJA 4ESWA 3H6VA 2H5YA 1N7WA 4FATA 4NF4B 3T9UA 4EQ9A 3BBRA 4OETA 3VXCA 4DE8A 3CIJA 3PMXA 3KFMA 3S2VA 4QFOA 1POY1 3ECRA 4R6YA 4KFQA 2I0BA 4KI0E 4RJZA 4OFLA 2Q8JA 1I6QA 1QUJA 1SI0A 3PUWE 5DEXB 3RLFE 1O63A 4AB5A 5JEIA 4H5FA 3LSWA 2QPQA 3RT8A 3R7XA 1NNKA 4IO4A 3VV5A 1OQGA 3PD8A 4JWOA 2UVHA 3FVOA 2I3WA 5ICQA 5AA3A 5H8FB 5CMBA 3ILUB 3FD3A 2XX9A 2QS2A 3ZKKA 3LSXA 3TTMA 1UIVA 1PB7A 2B3FA 4RPNA 3E4RA 4ZECA 3IJOB 4DLDA 4NF4A 5EYFA 2W7YA 3RPWA 4G8MA 2HZKA 2R71A 2I4CA 3B6WA 3MUQA 1NKXA 2I0CA 5TPAB 3UORA 4WKMA 4I9DA 2QS4A 4H1XA 2GHBA 2XXHA 3A3CA 2V25A 3ODBA 4NEDA 3G3FA 5DEXA 1Y3PA 3FASA 4C0RA 5CBRA 4ZEFA 1US4A 4OZ9A 2GRVA 4NF6B 2XD2A 2F7AA 5DT6A 3HCQA 3CSBA 3CFLA 3Q27A 3W15C 1B32A 4N07A 2PMSA 4RPOA 3MP6A 1Y4TA 4F2OA 4H6DA 1B3EA 1YCJA 2DS9A 2A5SA 3U92A 3USDA 5H8FA 4JB7A 1BP5A 3G3HA 2HXWA 3KSXA 2ALUA 3VLUA 5FHNA 3MVZA 4TLLB 1Y20A 4PFTA 1VFEA 2E1SA 2NXOA 4DXBA 2PT2A 3KEIA 3TQWA 3RTWB 3H6UA 3K1MA 5TPAA 2FYIA 1P1QA 1XC1A 2HZLA 1EZOA 1VFDA 4FAJA 1QUIA 3U94A 1ZBMA 4H67A 3LR1A 3MZ9A 4THIA 3KN8A 3C31A 4NF6A 3VLWA 4NWDA 3PUVE 2PBWA 2ONSA 2OWTA 1RYOA 1Y4CA 4QFPA 4Q5TA 1XOCA 5J1DA 3PPPA 1PDAA 2H25A 2OK2A 1T0KA 4H8IA 1B46A 3LSFB 2THIA 3ZKLA 1NFTA 1JVYA 1IZ1A 3C35A 1MY3A 2V84A 1R1NA 1A99A 1FQDA 2PX1A 4Q8RA 1MQIA 2DE2A 3KGCA 4F39A 2UXAA 1TFAA 1XT8A 3IJXB 1PB9A 2BJJX 3IB0A 4I62A 4DDDA 2DE4A 5EHMA 4U23A 3DLNA 3SDFA 1BLFA 1H45A 5L8DA 3KBRA 2D21A 3S9MC 4OENA 1N0TA 2HQ0A 4ND9A 4PETA 4TQUQ 4TOZA 4P0GA 4R9FA 1URDA 4GL0A 2D3IA 1O64A 1Y9UA 1ELJA 1MXXA 1IXHA 2X7QA 4P11A 3MC2A 1S50A 4MFIA 5EHSA 1LBBA 2HEUA 5AE4A 4O3CA 4ZE9A 3MPKA 1ZU0A 2HCAA 2RCAA 1B0LA 1GVCA 2DVZA 4F3GA 3OELA 4Z0IA 5KZTA 2O51A 1HSEA 2NUVA 2WKYA 3EF7A 3T9XB 4JSDA 3UGWA 1I69A 3EQ1A 1B4ZA 3HV1A 3TTLA 4BDOA 3O29A 3OEKA 4PFYA 1JETA 1JW1A 4F22A 2F7CA 4QHQA 3IL1B 3TELA 4GIZA 3SESA 2UVGA 4QRZA 2I48A 2CZLA 2E0SA 3B6TA 4I1DA 3TPAA 2PVUA 4F29A 3MVYA 3Q29A 1QUKA 2RC7A 1I6AA 3IORA 1ANFA 4NE4A 1SVXB 3GBBA 3N94A 4GRKA 3MZBA 3OOAA 5DVIA 1AMFA 4YB5A 3H06B 4YMBA 3FVNA 1A54A 4PE5B 3MP1A 3TCFA 2DVCA 3FJGA 1EZ9A 3E9XA 1YTVA 3D4CA 3G3GA 3TCHA 2I58A 4GLIA 3LUYA 4IO2A 2Q89A 4HCYA 4AQ4A 4G8NA 4ECFA 1URSA 1ZIUA 4F1YA 1B3FA 4YKKA 4E0XA 4FE8A 5I57B 4KHZE 4OESA 3U1OA 1MDQA 4MBPA 3K6WA 3PPNA 1DTGA 3KZGA 3HHGA 4HTGA 3E3KA 2ZYOA 3FV2A 4YZZA 2DWHA 3FIRA 1HSLA 3P7IA 3PUZE 3DM0A 1MY0A 1POTA 3IO4A 1D3KA 4G2ZA 1J1NA 1F9BA 4DZ1A 2ZMBA 3CRBA 1US5A 3SEWA 3FVKA 1IEJA 1P1OA 1LAFE 1USYE 1OLAA 1USYH 3QIMA 4RA1A 3KOSA 1MS7A 3PPOA 3KOTA 3H3GA 3O28A 2DP8A 4G8HA 4LZ8A 1SDXA 2ZNTA 3CVGA 4FEDA 3GLBA 1P1UA 3T96B 4ELOA 4LUBA 2XXTA 4H65A 3I3VA 1D9VA 3VFJA 5BWJA 5I57A 3LC8A 3EHSA 4F3PA 4WEDA 2YPNA 2OCUA 3H03A 1UQWA 3FXRA 1LCTA 1LB8A 4DIGA 4ELRA 2QRYA 4EF2A 1B0HA 3G3KA 4WEPA 3OXNA 3MWBA 4HW8A 3IO6A 4KD5A 2XXUA 2GFEA 4H8JA 1IQ7A 2F8DA 5ITPA 1XVYA 1P1WA 2I49A 4FECA 1R9LA 3TEPA 1OLCA 5B70A 1FTJA 3EN3A 3PU5A 3OMBA 4NF8B 1MY4A 4IO6A 5CI5A 2RCBA 5DVFA 1ZMGA 4G68B 4QSCA 1A55A 3RY3A 2F35A 4HS7A 4M4GA 2RC9A 2RINA 5FHOA 4XKNA 5CMKA 1MQGA 2OJTA 1ZJLA 1P99A 3CSGA 2RF1A 4F1VA 1L5TA 1LFIA 2DWAA 1MPCA 2V93A 4F19A 1NH8A 3IB1A 3IX1A 4JWXA 2QL3A 4XKPA 2IA4A 1JQFA 2F5XA 3CFZA 4ZEDA 1B1XA 3QUFA 1NNTA 1B5IA 5H8SA 2ZYKA 3IK6B 4OTEA 1GR2A 3U93A 3TQLA 2O1LA 1LBCA 3D4GA 2B65A 1MQJA 3HN0A 4ZEBA 3TMGA 2XXWA 4NF8A 4LQ2A 3W9WA 4KCCA 1SD3A 1NNPA 4YICA 1B3GA 4EQ7A 3PPRA 1SBPA 3C9HA 4PFUA 5L9MA 3KJTA 4G68A 4ZE8A 1R6ZA 3WAFA 1LLSA 2Q88A 3U8QA 2B3BA 1N04A 1MPBA 1FQCA 3N6UA 4I8CA 3DP4A 2O6AA 4K3FA 3FXUA 5KDTB 1SW4A 1OMPA 3L6HA 2ZXTA 4U1ZA 3TTKA 3FJ7A 2ABHA 4U21A 3QAXA 3VVFA 2UVIA 3DP6A 5H8QB 2XXPA 3VVDA 1B7ZA 2V3UA 1YPNA 3MZ1A 4ZEKA 4BDQA 1I6BA 3H6WA 4IO3A 4E0WA 4BDLA 3FZVA 1MXYA 3OO6A 4RYAA 4IO5A 3GBAA 4Q0CA 2O84X 4N6PA 1D4NA 1LFHA 2Y7IA 4ISUA 2DWIA 4IGTA 4XKQA 2UYFA 3C32A 4YKJA 2LAOA 1GGGA 1H44A 3QSLA 5KCJB 1KWHA 3H6TA 1N7XA 1DSNA 1N3XA 1MY1A 3S9NC 2Q2CA 1JVXA 1SYHA 3DP8A 1DPPA 5A5XB 4F2QA 1TFDA 3FJMA 4LP2B 5KDTA 1R9QA 2Y7PA 1MRPA 1IITA 5H8QA 4NTLA 1MXVA 5ELVA 1FQEA 3CFXA 1H43A 3K02A 4HCWA 3RN8A 1IXIA 1GTKA 2YLNA 3RTFB 5LOMA 4OMBA 4LATA 2O69A 2Z8FA 3C4MA 3O66A 5I2KB 1JW5A 3MJNA 4EDPA 2DYXA 4JDFA 3ZS6A 3FV1A 3BKIB 1NMUA 1D9YA 2QS1A 3JZJA 1MDP1 4R2FA 1Y3NA 2I4BA 5KCJA 3SEXA 4R9GA 3Q26A 2PYYA 3K0VA 4C1TA 3S4UA 4ZDMA 2HFBA 5A5XA 2HAVA 2VD2A 4U4SA 3G3JA 1PB8A 4QSDA 1FQFA 1UTHB 4BDRA 3TTRA 1YAEA 2AIXA 2XX7A 5AA2B 4XXUA 1VSOA 3RUMA 3IOWA 4R72A 1PC3A 5IKBA 3KN3A 3T9VA 3M3KA 4RK9A 2FNCA 2DOJA 2GHAA 1B9JA 1EU8A 3M8UA 3QK6A 4DXUA 5I2KA 1QKBA 5AA2D 1XS5A 2Z22A 2Y7KA 4XTCQ 3T93B 2XXIA 4IGRA 1BIYA 1DMBA 3CI8A 3QUJA 5IAIA 3IB2A 3TDJA 2F97A 2UVJA 1DOTA 2ANJA 5CMCA 3SKPA 1FW0A 4FORA 3TKDA 1M5BA 2P0SA 3L6GA 4X9TA 4EQBA 1LSTA 4POWA 1EZPA 3WAEA 1MXWA 1B7HA 2QJEA 3FATA 4IY6A 4YKIA 2F36A 5H8NB 2AL5A 5CRYA 3VLVA 1SW5A 1N3WA 4UA8A 1B1HA 1JEVA 1UTHA 3RNNA 1LB9A 1QVSA 2NOOA 1M5FA 5AA2A 3HO7A 1LAHE 4OVJA 4G68C 3RGYA 5K2XA 5I2NB 3G7WA 1FTOA 1B3LA 4GOTA 1TT1A 2RC8A 4OERA 1B52A 5FHMA 1ZTYA 1LFGA 1AH5A 3FUZA 2V3QA 2OLBA 2O68A 5DTBA 3KJ7A 4U22A 2O7IA 3O6IA 4F31B 4QFKA 2CMOA 5F1QA 2ESNA 2HAUA 3S9EA 4U1OA 3SETA 3A3UA 3O9PA 4GL8A 4QFLA 4ZS9A 4XIGQ 3TTNA 2ONKE 4WXJA 4RNSA 1UTBB 2I3VA 1S9TA 4MH5A 3VE1B 1ATGA 3OSRA 4POXA 3SERA 4DXCA 5DYHA 1OVBA 4H5GA 1FTKA 1A8FA 4GFRA 4KQPA 5H8NA 2XXYA 4ZZEA 4Z7EA 2PT1A 2P1SA 1ZLQA 3T66A 1NL5A 1B4HA 3N5LA 1MXZA 3H7MA 3W9VA 2IEEA 3JYRA 3R26A 1CB6A 2Q2AA 5I2NA 3B6QA 5L9OA 4TLMB 3C33A 2H99A 1B40A 2AL4A 2QMWA 1Y3QA 3Q28A 3IOUA 1Y1MA 4GXSB 4ESXA 5FTIA 4UACA 3KG2A 4O3BA 1UIUA 5HBCA 2VHAA 4IO7A 4F3BA 1LAXA 1PBPA 2VOZA 4XKRA 4R74A 4PFWA 1UTBA 1Y1ZA 4GD5A 3ONMA 3T9HB 4JBZA 2R6GE 3MQ9A 5HM4B 1QULA 1B58A 2F34A 4GQOA 3UIFA 4OFOA 4KCDA 1IXGA 4ZZAA 2VGQA 2GH9A 1VE4A 3TFLA 1MH4A 4EUOA 4F18A 1RKMA 1FTLA 1WVJA 3OD7A 2DSFA 1TXFA 4DCYA 3AXFA 1FCKA 4OHNA 1URGA 3UA8A 3V5AA 3MW0A 2Y7RA 2XD3A 4OYVA 1IXCA 5I84A 3OO9A 2DWJA 1O7TA 5I56B 3HSTA 4LZ5A 3CG1A 4F1UA 1H76A 5DVJA 3PMWA 1FQBA 1XHYA 2ZNSA 1MM6A 4F3SA 1BKAA 1OIBA 5FTHA 3K00A 5AA1A 1N76A 2ZYNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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