3FJGA

Crystal structure of 3pg bound peb3
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
231
structure length
231
Chain Sequence
DVNLYGPGGPHTALKDIANKYSEKTGVKVNVNFGPQATWFEKAKKDADILFGASDQSALAIASDFGKDFNVSKIKPLYFREAIILTQKGNPLKIKGLKDLANKKVRIVVPEGAGKSNTSGTGVWEDMIGRTQDIKTIQNFRNNIVAFVPNSGSARKLFAQDQADAWITWIDWSKSNPDIGTAVAIEKDLVVYRTFNVIAKEGASKETQDFIAYLSSKEAKEIFKKYGWREH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Specificity of Campylobacter jejuni adhesin PEB3 for phosphates and structural differences among its ligand complexes.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Campylobacter jejuni
molecule keywords Major antigenic peptide PEB3
total genus 82
structure length 231
sequence length 231
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-12-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fjgA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fjgA02
3FGSA 3EHTA 5EHSA 2ZNUA 3FJ7A 4JB7A 4F22A 4F2OA 2DXRA 4GIZA 3O29A 3MVYA 4FATA 1MM6A 5AA2D 5H8NA 2UYFA 4ISUA 1Y3NA 4FEBA 5DVJA 4LP2B 3C31A 4R2BA 4DXUA 3SESA 3FXUA 4IO4A 3LC8A 5A5XB 1NH7A 3MWBA 3R7XA 1JEUA 2RCAA 4YZZA 3C4MA 3G3GA 3OMBA 3RN8A 1T0KA 3KG2A 2DOJA 1IITA 3RTWB 4MBPA 4R6KA 4YMBA 3OO7A 4TOZA 5KZTA 3FV2A 1B58A 4ECFA 4G4PA 1BIYA 2I0CA 3OEMA 1LCFA 3SEYA 5ICQA 1A8EA 3PPPA 3MQ9A 3ZSFA 3RPWA 3H6VA 2XXWA 3O6HA 3C34A 1NNFA 3TEPA 3Q26A 1UIVA 4U4XA 2H98A 1LB8A 2XXHA 2Z8DA 3W9VA 4F39A 2F7BA 3FJGA 1RYOA 5EYFA 2B3BA 5FHNA 1Y20A 3CFLA 4KPTA 3UGWA 4H8IA 3S9MC 3PPQA 2H4IA 3IOUA 3C32A 1SD3A 1IZ1A 1MXXA 2DXYA 5I57B 2QL3A 1R9QA 3K1PA 4I1DA 3HHGA 2CZLA 1EU8A 3TELA 2Y7PA 4U23A 5CMBA 4ELRA 2AYSA 3HHFA 4IO5A 3TPAA 3C9HA 4Q5TA 2VD3A 3D4GA 1MS7A 5KCJB 2VP1A 2THIA 2O69A 1P1WA 3K6XA 4LUBA 2DWJA 3PPOA 1B3HA 1IUDA 2YLNA 2E1SA 4QF9A 3VE1B 1I6AA 3PGFA 1TFDA 5J1DA 5I56A 2LAOA 4QSDA 4EUOA 3IOVA 1EH3A 1ZMGA 1MXWA 1POTA 3H6UA 5LOMA 3TTLA 4C1UA 3K1NA 3SEUA 1ZLQA 1N76A 3TTMA 3CSBA 1B4ZA 4C0RA 3WAEA 4R75A 3DP4A 2I6EA 3K4UA 3R26A 1OVTA 2V25A 1NKXA 2F8DA 1A7LA 4R72A 2XXRA 3OSRA 3CR9A 4UACA 1WODA 4NF6A 4JWYA 2H25A 2XXXA 4F29A 4H5FA 1Z7NE 1S7YA 3U94A 4X48A 3BKIB 2UVIA 1Z7ME 3RNNA 3H6TA 1B5IA 1MY3A 2I58A 2REJA 3IB0A 4RY1A 2F35A 1PBQA 3GBAA 4H0WA 4Q8RA 5DYHA 3K6WA 3QYTA 2NXOA 1B1XA 2X7QA 3IO4A 3Q25A 1B7UA 5L9MA 5CMCA 1SW2A 2Y7KA 3KJTA 1O63A 5AA4A 3GZGA 2ZYMA 1Y1ZA 4U1OA 2ZNTA 4F3BA 4WXJA 4P0IA 5ITOA 5CMKA 3ECRA 4M1VA 1N3WA 3MC2A 4IGRA 1IXCA 1I6BA 2PMSA 1FTKA 1SW4A 3H6WA 1D9YA 3FUZA 4G68A 1FQEA 5FHOA 3JV9A 3IK6B 5I59A 1LBBA 1A54A 1B2HA 3HO7A 3UP9A 2VOZA 2I4BA 3UIFA 4BDRA 1BKAA 3PPRA 2V3UA 1MG1A 1B52A 1AOVA 3IJXB 1I6QA 3E4RA 2Y7RA 1PDAA 3RY3A 3PMVA 3QAXA 2NVUB 4MLVA 1DMBA 3SKPA 4Z7EA 4LZ5A 1JETA 3G3JA 1WVJA 3VDFA 4QHQA 3SERA 3OXNA 3B6WA 4POXA 3T93B 4MLQA 1ATGA 4PQJA 3VLUA 1FQFA 1IXHA 3WAFA 3CRBA 3PV0E 5A5XA 5H8SA 3QUFA 3PUXE 3SETA 2AL4A 2I3WA 2GRVA 2F6GA 4FE8A 3N5LA 4ZECA 1OMPA 3I5OA 1O64A 5I2KB 2PX1A 3P7IA 1VFDA 1PBPA 4ZZEA 4QFPA 4OEUA 4ESWA 3Q29A 1SBPA 2ZXTA 1L5TA 2ONRA 4JXIA 4H8JA 3G3KA 4WEDA 1TFAA 5M2VA 1LAXA 2VHAA 3PD9A 1BTJA 2D3IA 5F1QA 3JYRA 2G29A 1XC1A 1OIBA 3LSFB 1MY1A 4PE5B 3MVWA 1ZBMA 2P0SA 5L9OA 2VGQA 1QKBA 2DVCA 1S50A 4NF6B 3UA8A 4JBZA 3PUYE 4FEDA 5I57A 1MQIA 4KI0E 3A3UA 5CMMA 1N84A 4QFOA 2QS1A 4F3PA 4AB5A 2RKMA 1Q1KA 3DP8A 3HSTA 1JW1A 1Y4CA 2B3FA 1FQCA 1XVYA 3KOSA 3RLFE 4LQ2A 3A3CA 4G77A 4ZDMA 4IO3A 2AL5A 4LONB 5JTYB 5KCJA 1Y4TA 2XD2A 3RQTA 1YPNA 1LB9A 4X1DA 4NF5B 1MXVA 3PMWA 1UTBA 2HQ0A 1FTJA 3N6TA 3PUVE 4F31B 4OEVA 1H3DA 1D9VA 1QVSA 2F36A 2FA7A 3IO6A 3OELA 1MH3A 4RK9A 3ONMA 3PD8A 4FORA 1MPCA 3K1MA 4U4SA 2GHBA 3CSGA 3TCHA 1LCTA 1GR2A 3N94A 3PUWE 2REGA 1YCJA 1EZPA 2B65A 5CM6A 2GHAA 4DDDA 2PT2A 4IO7A 4XTCQ 3DELB 1MXYA 3VVEA 2I48A 2ONSA 1QUIA 2WKYA 1UTHB 2XXYA 3H7MA 1NH8A 1Q35A 2M8CA 3M3LA 3TCFA 3K02A 3KZGA 1LAFE 2UYEA 3TQLA 3TMGA 3VLVA 1OLCA 1B0HA 2D5WA 1MPBA 2NUVA 1MH4A 4P0GA 1A8FA 5FTHA 1MXUA 1MRPA 1P1QA 3EN3A 4NTLA 1IXIA 1PC3A 5H8HB 4ELPA 4YKJA 4BDLA 5AA2B 5ISUA 1QW0A 1NNKA 4GOTA 2OZZA 4HW8A 1Y3PA 3KFMA 2DE4A 4XKNA 2QS3A 1B05A 4F1UA 4O3AA 2VD2A 4YKIA 4BDMA 1H43A 4K3FA 4ND9A 4QFNA 4ONYA 3KN7A 1TXFA 2ANJA 2YPNA 5CRYA 3EPEA 2HZKA 3FXQA 4WKMA 1NNPA 1R1NA 4P11A 5BWJA 3U92A 4JDFA 4UA8A 5DTBA 3MW0A 3B6TA 3E13X 2XX8A 3OO6A 3R6UA 4YKPA 3TODA 1PB7A 1USYE 4WEPA 1XVXA 3OD7A 1AH5A 3TTRA 3CVGA 1B0LA 2DWIA 1FW0A 3IL1B 2OK2A 2HAVA 5KDTA 4ELQA 4JWXA 2O84X 3QK6A 3O66A 1B40A 1ZIUA 1LBCA 4HTGA 3M8UA 3L6HA 4H1XA 2OWSA 3LSLA 2NWJA 3QSLA 4ZE8A 3AXFA 4MFIA 1R6ZA 1URDA 5I2KA 1UTBB 1URSA 1H45A 4F3SA 2Q9TA 1JQFA 1MY2A 3RT6B 2IEEA 3H06B 4KCCA 1MPDA 4U1ZA 3MP1A 2F5XA 4XIGQ 3FATA 3FIRA 1ZTYA 2H9BA 3IOTA 2DWAA 1USYH 4OTEA 3GBBA 1DTZA 1OQHA 2CMOA 3QUJA 2BJJX 1FTLA 1Y1MA 3MP6A 2FYIA 4H5GA 4LVQA 1SW5A 4RPNA 2XXUA 2XXTA 3MVZA 4O3CA 4MF3A 3OO8A 2DE3A 3S9LC 3K01A 1EZOA 2OCUA 4F1YA 1JEVA 3N6UA 4TLMB 1TWYA 2O51A 4R74A 2Z22A 4M4GA 5JTYA 3KSXA 4RK2A 4DIGA 4NF5A 1MM7A 4ZEBA 4H67A 5ELVA 2UVJA 3D4CA 5TPAB 5BUUA 1LFGA 3SEWA 3IOWA 1M5FA 4EF2A 3EHSA 4OENA 4YAHX 4Q30B 1POY1 3VV5A 1NFTA 2PT1A 4R9GA 1WDNA 4YICA 4OMBA 5DVFA 5H8QB 3OOAA 5L9SA 1B3FA 4ZE9A 1DSNA 1MY0A 4AB6A 1FCKA 2RC8A 4ELOA 1DTGA 2DQVA 3E9XA 3MP8A 3O6GA 4QRZA 4PFWA 4KD5A 1UTHA 4F1VA 1F9BA 4I9DA 4DCYA 3KEIA 3U1OA 2QPQA 1XT8A 2H5YA 3LSXA 5ITPA 1J1NA 4PP0A 1GV8A 1B51A 1B5JA 1JW5A 2Y7IA 4OFLA 5KDTB 1B7ZA 4G8HA 5L8DA 3O6IA 3L6GA 1P99A 4EXLA 5DT6A 5H8HA 3TAJA 3W9WA 1FQAA 3JZJA 5AA2A 2QJEA 1SYIA 2Y84A 3OSQA 4OHNA 2X7PA 4YU0A 3USDA 2F78A 4OETA 4NF8B 2V84A 2QS2A 3QXMA 1FQDA 1JNFA 1FTOA 1B6HA 2ZYNA 3MBPA 3RTFB 2DSFA 4KFQA 2A5SA 4ZEIA 4DE8A 1PEBA 5TP9B 3IX1A 4KR5A 3DLNA 4OZ9A 1B5HA 3LUYA 1A55A 4IO6A 2ESNA 3G3HA 1UQWA 2XHDA 1N04A 2HFBA 1NNTA 2D21A 2XXIA 4H6DA 4DCXA 1B3LA 3ODBA 4BDQA 4R73A 1DPEA 3K00A 4YMAA 4ESXA 3S2VA 2XXVA 1P1UA 1JVXA 3H3GA 1N7XA 5CBRA 3KGCA 3EF7A 3KSJA 1MY4A 1HSLA 4ZEDA 4YB5A 3HV1A 3FVOA 4BLAA 5CC2A 4NF4B 5B70A 3KN8A 2I3VA 5K2YA 1URGA 1CB6A 3HCQA 1AL3A 4DLDA 3V89B 2OBGA 3TTNA 2OWTA 3MPLA 3HN0A 4KYSA 2HEUA 4GXSB 1LLSA 3O97A 3PMXA 4R2FA 3TCGA 1GGGA 3MVXA 2XD3A 1RKMA 4F2QA 1GVCA 1QJMA 3C35A 5H8FB 1VFEA 1XHYA 1P1OA 1MDQA 4HCWA 3A09A 3M3KA 1LGBC 2RCBA 3FD3A 4XKQA 2O7IA 1D3KA 5FTIA 1EZ9A 1CE2A 4N07A 2X26A 3T9XB 3SEXA 2Q88A 3FZVA 1HSJA 1N3XA 1KWHA 2RC7A 5DEXB 4QFKA 3CG1A 1SQYA 4EQ7A 3VXBA 2IA4A 3T9UA 4DXCA 1OQGA 1QKAA 4DXBA 3ILUB 4EQ9A 4LATA 4TQUQ 3VXCA 4OESA 3ILTB 3MZ9A 4U22A 4GWOA 3S9EA 1MQJA 4JWOA 4RYAA 5F7VA 4RJZA 4NWDA 1B3GA 2O6AA 2DS9A 3BBRA 4OQOA 1PB9A 2GFEA 5TPAA 2A5TB 3G3IA 3VVDA 2FNCA 1FTMA 4FJPA 3PU5A 2YJPA 1BLFA 3GLBA 2F7CA 4ZZAA 4THIA 5H8QA 2Y7WA 3IAZA 1YAEA 3V83A 3E3KA 2ONKE 2RINA 3B7DA 2E0SA 4Z0IA 3U72A 1M5BA 4C1TA 3K0VA 2DWHA 5TU0A 4BDNA 2Z23A 3UN6A 1R9LA 3ZS6A 4ZEFA 4ZS9A 4G8MA 2Z8EA 2UVHA 3K2DA 3KOTA 1ZJLA 3MZ1A 5HBCA 2NOOA 2DE2A 1H76A 3K6UA 4PETA 4L17A 2Z8FA 1LSTA 3PPNA 2R6GE 4LA9A 2I0BA 1DPPA 3FVNA 4QSEA 3V5AA 1VSOA 4NF8A 4RNSA 1IQ7A 4N6PA 4JSDA 3SDFA 1SI1A 1TT1A 1M5EA 2I49A 4I62A 2O7UA 1B32A 1LAHE 3LSWA 2H99A 1B46A 5I58B 3OEKA 5TP9A 2HCAA 3UK4A 4U21A 2Q2CA 3T9HB 2P2AA 4LQ5A 1N7WA 1BP5A 3TDJA 2DYXA 3N26A 5IKBA 4TLLB 4NE4A 4XKRA 5AA3A 3EHUA 4PFYA 3S4UA 4YB6A 4XXUA 3RGYA 3H4ZA 2ZNSA 4OVJA 5JK4A 4RA1A 3O9PA 5DVIA 4IY6A 4KQPA 3ZKLA 3MAMA 3IB2A 1VE4A 4IO2A 4GVOA 3FXRA 1B1HA 4PFUA 3T66A 4Q0CA 5B7DA 1SW1A 4GRKA 3S9NC 2V3QA 1RYXA 4POWA 4KYEA 1Y3QA 4NF4A 3THIA 3DM0A 4FECA 4OWDA 2PYYA 1XS5A 2UVGA 3FJMA 3I6VA 3O28A 2PVUA 4KCDA 2R9JA 3DP6A 3FVGA 1A40A 4MH5A 4GQOA 5H8NB 2UXAA 3Q28A 2P1SA 2Q89A 5ICTA 4LZ8A 2QS4A 3IB1A 5H8FA 3FVKA 1US4A 5HPQA 4FAJA 5CBSA 1ELJA 5AA1A 2DVZA 4I8CA 3KN3A 1S9TA 2PBWA 4OXVA 3TUSA 2ABHA 4KYDA 3IORA 3TQWA 3QIMA 2ZYOA 3ZKKA 4GL8A 3CFZA 1GTKA 1M5DA 4O3BA 4BDOA 4OYVA 2HZLA 2QMXA 5DEXA 3IJOB 4G68C 4GXAA 5I84A 4X1BA 5K2XA 3CIJA 5I2NA 4FIMA 4X9TA 2XX9A 1LFIA 1HSEA 2RF1A 3C33A 2W7YA 1PB8A 1N0TA 4HS7A 3TFLA 3F11A 5AE4A 1AMFA 4GLIA 3V8XB 1A99A 3TZAA 2XXQA 3MUQA 4NEDA 3OENA 3MPKA 4KHZE 2A5TA 1DOTA 1OLAA 4EXKA 2XX7A 4RXLA 3TKDA 3KBRA 3EQ1A 4F18A 3TTKA 1H44A 4YKKA 4JSOA 1QUKA 1LAGE 3RT8A 1SI0A 4HCYA 3CI8A 1D4NA 2HXWA 1JW4A 4H65A 3T96B 3O2AA 2V93A 3BFUA 2DP8A 4R6YA 3CFXA 1M5CA 1LFHA 3K6VA 2QSXA 4XKPA 2Q2AA 2OJTA 3H03A 3M3FA 4F3GA 3FASA 3UORA 1O7TA 5JEIA 1QULA 5HM4B 4OERA 5FHMA 2F7AA 3IR1A 5I56B 3PUZE 4GD5A 4QFLA 1XOCA 3HPIA 2GH9A 3VFJA 4U2RA 1Y9UA 4YB7A 3MZBA 3U8QA 1IIWA 1JVYA 2ZYKA 3RUMA 1OVBA 1SDXA 2F97A 4ZEKA 1MDP1 3KJ7A 1UIUA 2V3TA 3BFTA 1AIVA 1NL5A 4RPOA 4EF1A 4QSCA 2O1LA 1ZKBA 2HAUA 3Q27A 2O68A 1IEJA 3GXAA 1YTVA 1MXZA 2F34A 1MQHA 3FV1A 1US5A 4G8NA 1NMUA 2F6PA 2Q8JA 4EQBA 4GFRA 1MQGA 1IXGA 4E0XA 1B9JA 2ZMBA 2QMWA 3SEVA 3TYHA 2KLFA 4E0WA 3VVFA 3G7WA 1B4HA 4OFOA 1ANFA 3OO9A 5I58A 4GF8A 1SYHA 2I4CA 3U93A 3I3VA 3CG3A 3G3FA 2OLBA 1MQDA 4IGTA 5AA4B 4PFTA 4R6HA 3T22A 4G2ZA 4NMYA 3C36A 1FQBA 3LR1A 1B3EA 1B7HA 4IB2A 2ALUA 4DZ1A 3VLWA 4G68B 1P1NA 1II5A 1ZU0A 5I59B 4F19A 4GL0A 5IAIA 1VR5A 4AQ4A 4LZ7A 4NWCA 5EHMA 3T9VA 2QRYA 4EDPA 4R9FA 1QUJA 2G93A 3MJNA 2XXPA 2O1MA 4IY5A 4N13A 4OFJA 5I2NB 3W15C 1I69A 3B6QA 1SVXB 5CI5A 3LBSA 2RC9A 2R71A 2AIXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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