3FJGA

Crystal structure of 3pg bound peb3
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
231
structure length
231
Chain Sequence
DVNLYGPGGPHTALKDIANKYSEKTGVKVNVNFGPQATWFEKAKKDADILFGASDQSALAIASDFGKDFNVSKIKPLYFREAIILTQKGNPLKIKGLKDLANKKVRIVVPEGAGKSNTSGTGVWEDMIGRTQDIKTIQNFRNNIVAFVPNSGSARKLFAQDQADAWITWIDWSKSNPDIGTAVAIEKDLVVYRTFNVIAKEGASKETQDFIAYLSSKEAKEIFKKYGWREH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Specificity of Campylobacter jejuni adhesin PEB3 for phosphates and structural differences among its ligand complexes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Major antigenic peptide PEB3
source organism Campylobacter jejuni
molecule tags Transport protein
total genus 82
structure length 231
sequence length 231
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-12-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fjgA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fjgA02
4LONB 1FQAA 4RNSA 4H0WA 3G3JA 2D3IA 2M8CA 3FXRA 3LSWA 3G3KA 3H4ZA 3WAFA 5CC2A 3SEUA 2F97A 4GVOA 1CB6A 1ZTYA 3S2VA 1FQDA 5FHOA 4G8MA 1SI0A 1B1HA 3D4CA 3S9LC 4E0WA 1Y3NA 3OMBA 4IY5A 2VGQA 3V89B 1LAHE 1QVSA 2ZYOA 3PU5A 1XS5A 4BDLA 1RYXA 2F6PA 3L6HA 1D3KA 1B5IA 3E4RA 2UVIA 4H67A 3T9UA 3ZKKA 3PUXE 1UTHA 2VD2A 2I3WA 2YLNA 3FD3A 2UYEA 2V84A 1NNFA 5I2KA 3UORA 1I6QA 1LBCA 3T96B 1JNFA 4WKMA 3VVEA 5KCJB 1YTVA 3RTWB 1LLSA 1B3GA 4PFYA 4ZE8A 2A5TB 1P99A 1ZKBA 4JXIA 4F3SA 3VLUA 2UVHA 5K2XA 3MBPA 1P1OA 2OJTA 1MG1A 1NMUA 3HHGA 4H5GA 2I4CA 4R75A 3LSFB 3CI8A 3RUMA 2ZMBA 2KLFA 5KDTB 4ISUA 1ZIUA 4ELQA 1SBPA 4EF1A 3FASA 5CMKA 3FXQA 5DEXB 1F9BA 2HAVA 4PFTA 5AA2B 4QFKA 2XXUA 4OQOA 4E0XA 3RGYA 3VVFA 4EF2A 1A99A 1XVXA 3PMVA 2I49A 3UP9A 4YMAA 3RTFB 2XXVA 5H8QA 1AOVA 1LGBC 3UGWA 1JVXA 3OO9A 3TTMA 1MXVA 4MFIA 4KHZE 2OCUA 4NF5A 4ELPA 4FAJA 4EDPA 1TFDA 2V93A 1IXGA 2DWAA 3K1PA 1B05A 2O1MA 2XXPA 2H25A 1H76A 1QUIA 4YAHX 4R72A 5CI5A 3TQLA 1LCTA 3SEXA 3OD7A 3H3GA 2CZLA 3K02A 4KR5A 5CBRA 1MM7A 2FNCA 1MQGA 2DE2A 1LFHA 3W9WA 1N7WA 2Z22A 4GWOA 2NWJA 4FIMA 1FQFA 4NE4A 2ZYKA 1QUKA 5TPAB 1A7LA 4EQ9A 1SYIA 3IL1B 4F39A 1QW0A 3KSXA 2BJJX 5H8NB 5M2VA 1OVTA 2UYFA 3U8QA 2F8DA 1MQHA 4QSCA 4LVQA 3B6TA 2QMXA 2Y7WA 1MY1A 4ONYA 5JTYB 4OYVA 3O66A 2RC7A 4GIZA 3QXMA 4YMBA 2H98A 2DXYA 3EF7A 3VVDA 1B51A 4TOZA 1YCJA 4RJZA 1URGA 4LQ5A 3PUYE 3EHTA 3U94A 1SW4A 4ZEBA 2F36A 4YZZA 1PB7A 1B46A 1SI1A 3TZAA 2O68A 4XKQA 5FHNA 5KCJA 4RY1A 4G68B 4QHQA 3RN8A 4GL0A 3VLVA 4YB7A 1M5FA 1D4NA 4FE8A 3L6GA 2B65A 2A5TA 3FATA 1N3XA 4QSEA 3V83A 3C31A 3MPKA 5ELVA 4M4GA 4YB6A 2RC8A 2VP1A 5KDTA 4IO4A 4OWDA 5CMBA 2HFBA 4DZ1A 2ALUA 3KJTA 1VFDA 2F7AA 3U72A 4F18A 1NKXA 3O6IA 3HHFA 5DEXA 1MPBA 1Y4TA 3QUFA 1LSTA 3IB0A 5AA2A 4KCCA 1MRPA 5I57B 1OLAA 2F7BA 5L9MA 4XKNA 4XKPA 2Q8JA 1VR5A 4GXAA 1FQCA 3CSGA 2DE4A 2FA7A 2LAOA 2I58A 4ZEDA 1FTLA 4GXSB 3UK4A 4GQOA 4MLQA 2OBGA 4YKJA 1UTBB 1MPCA 3TMGA 1DMBA 3KFMA 2YPNA 3VE1B 1N04A 3OO8A 4WEDA 1OMPA 3QAXA 3PD8A 1USYE 1SW2A 3FGSA 3W9VA 3KN7A 2DWHA 2B3BA 5H8HB 3RT6B 3FVNA 3PUVE 3Q27A 4RA1A 3S9EA 2DWIA 3LC8A 1QJMA 2RINA 3MP6A 4NF4B 2UVGA 5DVFA 3IOVA 4Z7EA 4UA8A 3RQTA 3EPEA 2HCAA 3MVXA 3O28A 3BBRA 4PP0A 5TPAA 1MXXA 4Q5TA 3HO7A 3K1NA 2A5SA 4NWCA 1RKMA 4ZZAA 5H8NA 1R1NA 2X26A 5JK4A 2Q2AA 1H44A 4Q0CA 4X48A 1QUJA 4JBZA 4IO6A 4XKRA 3K6XA 1B58A 2I4BA 3ILUB 4KYDA 3PGFA 2ZNUA 3C9HA 3DP6A 4HTGA 3GBAA 2UXAA 2HZKA 1LFIA 2F35A 2XXXA 3HPIA 3T22A 1OQGA 3IB2A 4YKKA 4RYAA 1P1WA 3F11A 1B9JA 3BFTA 1WDNA 3O6GA 1IXIA 2NXOA 3TCFA 1Y9UA 2XXTA 2YJPA 1ELJA 2XHDA 5H8FB 1D9VA 3K6UA 4YKIA 1M5CA 3IOUA 4GL8A 2IEEA 3MW0A 4G68A 2H9BA 1MXZA 4LZ5A 1NNPA 3OSQA 2R6GE 3TTLA 1VE4A 2QS2A 1B2HA 1IEJA 2Y7KA 4DXBA 5AA4B 2R71A 4OETA 3IO4A 2HQ0A 3KOTA 4GF8A 1P1UA 4LZ8A 1YPNA 4G8NA 2PVUA 3E13X 1US4A 4IO7A 4EXKA 3ECRA 3U93A 4OZ9A 1NL5A 4DCYA 4MBPA 1R9LA 2DVZA 3JZJA 2DOJA 5I57A 1GV8A 2GHBA 2HEUA 2F5XA 2B3FA 2QPQA 1MY0A 2DWJA 1MQDA 2I0BA 3FUZA 4M1VA 1N76A 4IGTA 3K6WA 2RCBA 2Z8EA 5F7VA 4H1XA 4NEDA 1Y4CA 4IB2A 3G3FA 3TQWA 3H6UA 4F2QA 2E1SA 4R2FA 3RT8A 1Z7NE 4R2BA 4ECFA 3U92A 1B5HA 4DE8A 1UTBA 1MY4A 1FTJA 3KZGA 3RLFE 1VFEA 1LAXA 2AL4A 1XVYA 4GOTA 5CMMA 4LATA 1AL3A 1T0KA 4AB5A 4KPTA 1MH4A 3C4MA 3C33A 3PMWA 4OHNA 5H8HA 1AH5A 3PUZE 4HCYA 3MVZA 3IAZA 4LZ7A 1MXWA 2ANJA 4IO2A 5KZTA 1B7HA 1LAGE 1PC3A 4X9TA 3TELA 5H8SA 4U21A 3FJGA 3GZGA 2XX7A 3KJ7A 4DLDA 1MY2A 4NF4A 2FYIA 4BDQA 4XTCQ 1SYHA 1R6ZA 1MH3A 3CIJA 2XX8A 5BUUA 2REGA 3C36A 5L9SA 4RK9A 4P11A 1JW5A 4RPOA 1B1XA 2O7IA 4O3BA 1LB9A 4QFPA 3SDFA 3VFJA 1ZJLA 1AMFA 3QUJA 3TCGA 1JW1A 3VXBA 1N7XA 5A5XB 1B52A 3I5OA 2ZXTA 3QIMA 4L17A 3FVGA 4F1UA 2X7QA 1BLFA 4YU0A 4ZZEA 1BKAA 1B4ZA 2DXRA 4KCDA 4EQ7A 1HSLA 2VHAA 1H3DA 2O84X 2F6GA 1M5EA 4YB5A 1US5A 3C34A 3N6TA 2REJA 3H03A 5FTIA 4NF8B 3M3FA 4JB7A 2ZNTA 4IGRA 1B4HA 2I6EA 4QFNA 4F2OA 3DM0A 2F7CA 3Q26A 2O6AA 4I9DA 1M5DA 5H8FA 4U22A 4GFRA 3PPPA 4NMYA 4O3CA 5DYHA 3Q25A 1MXYA 1Q35A 3IB1A 4MLVA 3G3HA 3K01A 3U1OA 1UIVA 2I48A 4U1OA 1PB9A 3A09A 4QRZA 2OK2A 1SQYA 4F31B 4MF3A 2G29A 2QS3A 3VDFA 5AA4A 1FTMA 3SEVA 1NNTA 4EUOA 1Y1MA 3IK6B 4DDDA 3MC2A 4ELRA 4O3AA 4AQ4A 1B0LA 4AB6A 5IAIA 3LR1A 4C1UA 5ICQA 3FVOA 4PFWA 4X1BA 1B6HA 1A54A 3B6QA 3K6VA 4R6KA 4BLAA 3TTKA 3E9XA 2AIXA 3FJMA 4QF9A 3K1MA 4P0IA 1O64A 1NNKA 5JEIA 4IO5A 3B6WA 3O2AA 2I0CA 5BWJA 5EHMA 1N0TA 4TLLB 3A3CA 2Q2CA 3OEMA 3UA8A 5HM4B 3EN3A 2RKMA 1S7YA 3A3UA 4IY6A 1BP5A 5CMCA 5ISUA 1JVYA 1MM6A 4KYEA 2UVJA 2PMSA 3K00A 5HBCA 1IZ1A 2P1SA 2DS9A 4R6HA 2HZLA 1AIVA 1ANFA 3E3KA 4F3PA 1Y1ZA 4EXLA 4H65A 3TFLA 1Q1KA 5B7DA 1VSOA 4HW8A 4NWDA 3H7MA 1OLCA 1LBBA 3CFZA 4X1DA 3OO7A 3SESA 1TFAA 3ZSFA 5I84A 3MWBA 1URSA 2V25A 5DT6A 3LUYA 4OESA 2XXWA 4H5FA 2DP8A 3IX1A 4R73A 4U4XA 1WVJA 3HCQA 4PQJA 2DYXA 1I6AA 1PBQA 4FECA 3USDA 3CVGA 5DTBA 2Z23A 5AA1A 4ND9A 4RPNA 1S9TA 5A5XA 1B3HA 4Q8RA 4U23A 5EYFA 1FW0A 5ITOA 2R9JA 3KSJA 3N26A 3SERA 1JEVA 4F19A 1NFTA 2Z8FA 3VV5A 3QK6A 1KWHA 4JWXA 1EH3A 4Q30B 3OENA 1OQHA 1DSNA 4NF8A 3OXNA 1JETA 3ODBA 1B3LA 4YKPA 3TCHA 1PB8A 3O6HA 1ZMGA 2O51A 3DP4A 4BDNA 3QSLA 1B32A 1NH7A 1FCKA 3H06B 1SDXA 4DIGA 1ATGA 4YICA 3N6UA 1IUDA 1Y3PA 3H6WA 4H8IA 2ZYMA 2XXYA 3H6VA 1R9QA 2QJEA 1TWYA 2H99A 3Q28A 4U2RA 5I58B 2DQVA 2O1LA 1URDA 2VD3A 3C35A 4KFQA 4F29A 1I69A 2OWTA 1GGGA 4DCXA 5DVIA 5HPQA 1P1NA 3IOWA 2HAUA 3DP8A 4KYSA 3IJXB 1MXUA 3BFUA 1D9YA 3KOSA 1QKBA 3G7WA 3OEKA 3R6UA 3O29A 1XHYA 2Y7IA 5I56B 4FJPA 3S9MC 4GD5A 2F78A 1B7UA 1DPEA 4POXA 3SEWA 5TU0A 3P7IA 1EZ9A 4TLMB 2THIA 3K4UA 1GVCA 1SW5A 4HS7A 2H5YA 5CM6A 5EHSA 1JW4A 3MZ1A 2XX9A 2HXWA 3TPAA 4ZDMA 4C1TA 1B0HA 3FXUA 3IJOB 4BDRA 3D4GA 3M3KA 5FHMA 3TTRA 2Q89A 2P2AA 2W7YA 4KQPA 3MP8A 3MAMA 2QS1A 4RXLA 4IO3A 4NTLA 1M5BA 3FV2A 3LSLA 2P0SA 4C0RA 3KN8A 2AL5A 5TP9B 3FJ7A 3MUQA 2V3QA 3MQ9A 2QSXA 2NVUB 1H45A 1I6BA 1HSEA 2XD3A 4JWOA 3W15C 2PT1A 1LFGA 2E0SA 4PETA 3O9PA 3M8UA 5J1DA 3R26A 4OVJA 3AXFA 1MPDA 2G93A 1FQBA 4KD5A 3GXAA 2V3UA 4H6DA 4F3BA 1FTKA 4NF6B 2O69A 4U4SA 1SD3A 3VLWA 3LSXA 3SEYA 4N07A 3ILTB 1NH8A 3EHSA 3N5LA 2RF1A 1UIUA 3TODA 4MH5A 3PPOA 3FVKA 4ZECA 5L9OA 4OFOA 3IORA 1B40A 4LA9A 1B5JA 1XT8A 3KN3A 4ZEIA 1USYH 5CBSA 3RY3A 1XOCA 3I3VA 4ESXA 5I59B 1P1QA 2Q88A 2PX1A 4K3FA 2ONKE 4G8HA 3OO6A 2WKYA 5AE4A 2F34A 3CFLA 4G2ZA 2ESNA 3V8XB 5I58A 4UACA 3DELB 2ONRA 3UN6A 1TXFA 3LBSA 3G3IA 2O7UA 2RC9A 1QKAA 3VXCA 1MDP1 4DXCA 1YAEA 4WXJA 3FIRA 4POWA 4OMBA 4R74A 5CRYA 3SETA 1QULA 1IIWA 4WEPA 5I56A 1LAFE 4JSOA 3TDJA 5IKBA 4OEUA 1MY3A 5I2NB 3T9HB 1CE2A 4N13A 2NOOA 1L5TA 3EHUA 3MZ9A 5L8DA 5FTHA 4ZE9A 3B7DA 1O7TA 3M3LA 4ZS9A 1UQWA 4OTEA 5AA2D 2I3VA 4BDOA 3PD9A 3GBBA 1IITA 3PMXA 2X7PA 2VOZA 2PBWA 1Y3QA 4LUBA 4ZEKA 3TUSA 1MDQA 1FQEA 5ITPA 1SW1A 3TTNA 4F22A 3IOTA 5LOMA 5DVJA 1GTKA 3ZS6A 2OWSA 1LCFA 4HCWA 4F3GA 3FV1A 3S4UA 2RCAA 3CFXA 3K2DA 2XXIA 3CRBA 2OLBA 2GRVA 4QFLA 3OSRA 2QMWA 5AA3A 1SVXB 4XXUA 3MVYA 3KEIA 3EQ1A 5TP9A 3UIFA 1N3WA 4KI0E 2GFEA 3K0VA 4P0GA 1S50A 3PUWE 3I6VA 4H8JA 3RPWA 3WAEA 4GLIA 3OOAA 2Z8DA 1EZPA 3O97A 4OENA 2ONSA 3T66A 2NUVA 4OERA 2Y7PA 1HSJA 3PPQA 4QSDA 2QRYA 4NF6A 4R6YA 3TEPA 1J1NA 1MS7A 4OFLA 1DPPA 4I62A 2DSFA 4ELOA 2D21A 2Y7RA 4TQUQ 3T9VA 2IA4A 1PBPA 4G68C 1MQJA 3PV0E 2Q9TA 3S9NC 1B3FA 1EU8A 1B3EA 1RYOA 4N6PA 1A8EA 3N94A 1A8FA 3JYRA 1ZBMA 1II5A 4R9GA 1IXCA 1EZOA 1WODA 3V5AA 1JQFA 4PE5B 3CG1A 5I59A 1LB8A 4XIGQ 2V3TA 1H43A 3TAJA 1UTHB 4JSDA 3MJNA 3KGCA 4LP2B 5I2KB 2H4IA 1Z7ME 4OXVA 3H6TA 1XC1A 1O63A 3KG2A 4F1YA 1PEBA 3CG3A 3PPNA 3MVWA 2XD2A 2QS4A 4DXUA 1MQIA 2GHAA 3MP1A 2GH9A 2XXQA 5B70A 3T93B 2PT2A 1POTA 4THIA 1DTZA 1B7ZA 4I8CA 3IR1A 1OVBA 3DLNA 1ZU0A 1IXHA 1GR2A 2XXHA 4G4PA 3IO6A 3KBRA 5ICTA 3BKIB 5I2NA 3HN0A 3CR9A 4QFOA 4JWYA 3ONMA 1FTOA 2ABHA 3TKDA 1N84A 5F1QA 3R7XA 4U1ZA 1IQ7A 4ESWA 1BIYA 1BTJA 3G3GA 4FEBA 3TYHA 1Y20A 4Z0IA 2ZYNA 1OIBA 3MZBA 2Y84A 4OEVA 1ZLQA 3T9XB 3JV9A 2DVCA 5H8QB 4LQ2A 3CSBA 4FORA 2PYYA 3OELA 4PFUA 4I1DA 3ZKLA 3SKPA 3QYTA 1DOTA 4FATA 2QL3A 2D5WA 4FEDA 1TT1A 4F1VA 2XXRA 1DTGA 2OZZA 1PDAA 3HSTA 4GRKA 4JDFA 4ZEFA 4OFJA 3FZVA 3MPLA 4NF5B 3HV1A 2DE3A 1A40A 5JTYA 2ZNSA 4G77A 4BDMA 1JEUA 3Q29A 4EQBA 1A55A 3THIA 2CMOA 2AYSA 3PPRA 3C32A 3RNNA 3GLBA 5K2YA 4R9FA 4RK2A 1POY1
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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