3FJGA

Crystal structure of 3pg bound peb3
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
231
structure length
231
Chain Sequence
DVNLYGPGGPHTALKDIANKYSEKTGVKVNVNFGPQATWFEKAKKDADILFGASDQSALAIASDFGKDFNVSKIKPLYFREAIILTQKGNPLKIKGLKDLANKKVRIVVPEGAGKSNTSGTGVWEDMIGRTQDIKTIQNFRNNIVAFVPNSGSARKLFAQDQADAWITWIDWSKSNPDIGTAVAIEKDLVVYRTFNVIAKEGASKETQDFIAYLSSKEAKEIFKKYGWREH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
source organism Campylobacter jejuni
publication title Specificity of Campylobacter jejuni adhesin PEB3 for phosphates and structural differences among its ligand complexes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Major antigenic peptide PEB3
total genus 82
structure length 231
sequence length 231
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-12-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fjgA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fjgA02
1M5BA 5TPAA 3OELA 3RN8A 3S2VA 4ND9A 3TTNA 3WAFA 4NF4A 1O7TA 1IIWA 3KZGA 5FHNA 3K0VA 3V83A 4IO6A 1Z7ME 2OBGA 4L17A 3TTLA 1WODA 4KD5A 2KLFA 2O1LA 1MXVA 4FATA 1DPEA 3IB1A 5JEIA 3SESA 4FE8A 3TELA 4NF5B 3QXMA 4F19A 3IK6B 3UIFA 2I58A 1LFHA 4EF1A 1J1NA 3FJGA 1Y4TA 4IGTA 5I59A 1XVYA 2GHAA 4YU0A 2XXPA 4G8MA 3LC8A 4I8CA 4PFWA 4YKPA 3MAMA 4MFIA 2O51A 2OJTA 1POTA 3HSTA 5A5XB 5I2KB 4F3GA 4IB2A 4POXA 3IJXB 3FJMA 3D4GA 1B46A 2AIXA 1YAEA 1MXYA 2Z8FA 5H8HA 3E4RA 1GGGA 3EPEA 1A40A 3U8QA 1FTJA 3FJ7A 3G3IA 4FIMA 4OESA 4EQ7A 1TWYA 3MWBA 4OMBA 1RKMA 3KSJA 3S9MC 2I49A 5FHOA 1R9LA 3EF7A 2YJPA 3CFXA 2D3IA 3IAZA 1B3LA 2X7QA 2AYSA 1Y3NA 4RNSA 3TQLA 1L5TA 3EHUA 1US4A 2QL3A 1Y9UA 5H8QB 2Q89A 2XXRA 4ESWA 3ZS6A 2Y7PA 5I57B 4GF8A 2Z8EA 4AQ4A 1O63A 1B52A 4JSDA 3O29A 1MXZA 1MY1A 3FASA 2HZKA 4EF2A 5AA1A 3U93A 1DOTA 4G8NA 1I6AA 4X9TA 1M5FA 3FUZA 4OFOA 3HN0A 1VFDA 3RTFB 4M1VA 4ELRA 3RY3A 2V3TA 1MQDA 2ZYKA 3R6UA 4KCDA 4DXCA 1N7XA 4ECFA 3MP8A 2ONRA 4YMAA 3G3FA 3C4MA 5JTYB 3SERA 4BDNA 5FTIA 3FGSA 5AA2A 3FVKA 4KYEA 4C1TA 3Q26A 1JVYA 1IXIA 2F6GA 4QFLA 5EHMA 2QS2A 2THIA 3C33A 3W15C 2QS3A 2O84X 1NFTA 4LZ5A 2DS9A 3ILTB 2NXOA 4BDMA 1XS5A 2O7UA 2UXAA 4H5GA 4JSOA 4KFQA 3VVEA 1IXGA 1MXUA 1FQDA 1LSTA 3G3KA 2E0SA 1PBPA 3KJ7A 4YKJA 2Q2AA 4OTEA 4GLIA 4P0IA 3Q28A 1JETA 2VHAA 3E9XA 3KBRA 3PPOA 4WEDA 1OIBA 4ZECA 1EZPA 3SEYA 5BUUA 1MDQA 4LA9A 4F3SA 3O28A 2RF1A 1LAHE 4FEDA 4DDDA 4P11A 4YAHX 3S9LC 2HQ0A 4GIZA 3RT8A 3UA8A 4LUBA 4YKIA 5EYFA 1P99A 3K6VA 1Y1ZA 3BKIB 5HBCA 3MVZA 1DSNA 4DCYA 3OXNA 1IZ1A 4KCCA 2UYFA 5CC2A 2O7IA 2QPQA 1JW1A 3UK4A 4Z7EA 2DWJA 3Q29A 4IO5A 2UVHA 3FZVA 4LZ7A 1MPCA 2ZYNA 4Q5TA 2IA4A 4OVJA 3L6HA 3N26A 4U2RA 3TYHA 1B05A 3ZSFA 2R6GE 1PEBA 3G3HA 3I3VA 2AL4A 2I4CA 1LBCA 4NTLA 4KR5A 3OSRA 1UTHB 4RPOA 3TTRA 2UVIA 3KN3A 4XKNA 2PBWA 4IGRA 5B70A 4ZZAA 4F2QA 3PMXA 1ZBMA 4R72A 5F1QA 1II5A 3VLUA 1MQHA 2HFBA 1IQ7A 1UIVA 4HS7A 5FHMA 4DZ1A 4OERA 1YCJA 5AA4B 2H25A 1PBQA 3Q25A 4X1DA 5CMMA 1JEVA 5KCJA 4ELOA 2XXTA 4I1DA 4OXVA 3I6VA 2UVGA 4Q8RA 3ECRA 1N04A 4PFTA 4F1VA 3GBAA 4YB5A 2ABHA 4DXBA 4NMYA 2I6EA 3CG3A 4R6YA 1MDP1 3V89B 3H3GA 3IX1A 4U4SA 3T9UA 2XXQA 1FQBA 3KN8A 5JK4A 4ZS9A 1A99A 3TFLA 3MPKA 3UP9A 4E0XA 1OLCA 3LBSA 1IITA 3IOUA 5K2XA 4MH5A 1LFIA 3C9HA 3RPWA 2PT2A 4YICA 2HZLA 1N84A 2XHDA 3RLFE 4NF8A 3M3LA 1Z7NE 4QF9A 1GR2A 4ELPA 3B6WA 4G4PA 3RT6B 2ONSA 3N94A 3V5AA 4POWA 5DYHA 4NWCA 3W9WA 3LUYA 4FJPA 1B3EA 4IO7A 4BDRA 3H6UA 3O2AA 4XKRA 4G68A 1T0KA 2XX7A 1B0LA 4XXUA 4H5FA 2A5TA 4QHQA 2F36A 2DWIA 4NF6A 3PPNA 2XXWA 3VVDA 4LQ2A 3OO6A 1MG1A 4LVQA 3FV1A 1ATGA 3IL1B 3KSXA 1NNPA 1PB7A 1PDAA 2DSFA 1B5HA 1VE4A 3UORA 1URGA 4U23A 2Q9TA 2P1SA 1N3XA 3RNNA 2D21A 3G7WA 1P1NA 3TTMA 4HW8A 3RGYA 3K6XA 4Q30B 1CB6A 3H6VA 1JNFA 2I4BA 1WDNA 4ZEIA 1GV8A 4PFYA 3AXFA 4RPNA 2UYEA 1Y20A 3PV0E 2OCUA 4U21A 1B51A 3LSLA 2ZNUA 3ZKLA 3ONMA 2F6PA 2H98A 3PPRA 3BBRA 1BLFA 4IO2A 4LATA 1OMPA 1S50A 4YMBA 3MJNA 5I56A 4U1ZA 5KDTB 3VDFA 4NEDA 4U1OA 5K2YA 5TU0A 1KWHA 1EU8A 3A3CA 5I58B 1A8EA 1TT1A 3PMVA 2F8DA 2I3WA 3OD7A 3KN7A 4ESXA 2R9JA 4R2BA 4WKMA 2VOZA 4OHNA 3CR9A 3HHFA 3JYRA 4OQOA 4MF3A 2RC7A 2QMXA 1QW0A 4ZEFA 1NH7A 2DE2A 4C0RA 2G29A 1SYHA 1SW1A 1SI1A 5I2NA 2Y7RA 3OEMA 4PE5B 4OWDA 3OSQA 1RYXA 4JWOA 5M2VA 3SEUA 3N6TA 3VXCA 5H8SA 4OETA 3KJTA 2OZZA 2XXUA 3C34A 4NE4A 4Z0IA 1JQFA 1N7WA 2B3BA 2F34A 4H67A 1UTBA 2YPNA 3T9XB 1FQEA 4IO3A 2V93A 2F35A 2XD2A 4H0WA 4QSEA 1US5A 2HCAA 1USYH 3IOWA 5TP9A 3DLNA 1USYE 3KG2A 5CMKA 2F7AA 3TQWA 1B5JA 1VFEA 1SYIA 3LSXA 3IO4A 4QSCA 4GXSB 2P2AA 1B3HA 1MRPA 3OMBA 3OO8A 3B6QA 2A5SA 1JW5A 1LAFE 3USDA 4FAJA 5DEXB 3K1MA 4XTCQ 2FYIA 2REJA 2QS1A 3QIMA 1I6QA 2W7YA 3SETA 4R9GA 2XXVA 2F78A 1LAGE 4F1UA 4OFLA 3PPQA 1QUJA 2ONKE 2AL5A 2DQVA 3FXUA 1FTMA 5H8NB 3KFMA 2OWSA 3VFJA 3CG1A 3EHSA 2Y7KA 2F7BA 3A3UA 4GFRA 3K02A 1UIUA 3CVGA 3PD9A 3M3KA 1PB8A 3CFZA 4NF5A 3IB0A 1OLAA 2YLNA 1FW0A 4FORA 4RK2A 3MBPA 4KQPA 1FTOA 1SW5A 3M3FA 3FD3A 3GXAA 3TZAA 5ITOA 3SDFA 1B7HA 3MP1A 2RINA 4OENA 2I48A 3VLWA 3WAEA 2Y7WA 5IAIA 1YPNA 4R2FA 2RKMA 4O3BA 5ELVA 1M5DA 5I2KA 5HPQA 2H99A 5DVJA 5J1DA 1NH8A 1TXFA 3S9NC 4DXUA 3C36A 1LCTA 4NF6B 4C1UA 4R73A 3K01A 2ALUA 2VD2A 4DIGA 1N76A 3VVFA 2QRYA 1NNFA 2RCBA 4R6KA 4XIGQ 4OYVA 5H8FB 1XC1A 1MXWA 2B3FA 3FVOA 4F18A 5L9OA 5ITPA 1FTLA 2XX9A 3HO7A 1FQCA 5CMCA 4ZDMA 5TPAB 1B7ZA 1SBPA 3R7XA 3EQ1A 3VXBA 3TEPA 4NF4B 4F3PA 4G8HA 3LSWA 1ZTYA 2Y7IA 1DMBA 1LB9A 4EQBA 2GH9A 1FQAA 3MQ9A 2I0BA 3FV2A 2VD3A 2QSXA 3MVWA 5H8QA 1MY0A 3U1OA 3V8XB 3K4UA 3T66A 4ZEKA 1HSJA 5I57A 1S7YA 5AA2D 3ODBA 3O9PA 3SEXA 5ISUA 1Y3PA 5I59B 4GVOA 1H3DA 2RC8A 5CMBA 4U4XA 2NUVA 1FTKA 4OZ9A 2QJEA 4WEPA 1TFDA 1P1UA 1SVXB 1SDXA 3IOVA 1LFGA 3CRBA 1URSA 4BDLA 2XXXA 4JDFA 3CIJA 4F39A 1XVXA 4I62A 1B1XA 4THIA 5H8HB 4HCYA 1MS7A 1A54A 4I9DA 1N3WA 4F29A 3OOAA 1LGBC 5JTYA 5CBSA 1P1OA 3FXRA 4H8JA 3N6UA 4EXLA 4H65A 1F9BA 1ANFA 3KOSA 1AH5A 1QUIA 3C32A 4IO4A 3HHGA 1AIVA 1ZMGA 2V84A 2UVJA 4XKPA 1H43A 3F11A 1NMUA 3BFTA 2DP8A 2ZXTA 1AL3A 1D4NA 1XHYA 3W9VA 1R1NA 1JW4A 1LB8A 3DM0A 2O68A 2Z8DA 4PFUA 2ZNSA 1MQIA 2OWTA 1M5CA 4FECA 3D4CA 4LQ5A 5LOMA 1VR5A 4GOTA 2F5XA 5B7DA 3K6UA 4HTGA 2HAUA 2LAOA 5IKBA 3UGWA 1DTZA 1A7LA 4MLVA 3GBBA 4F1YA 3CSGA 4F31B 3CI8A 2ESNA 3T22A 1MH3A 3H4ZA 1OVTA 4RA1A 1CE2A 1B7UA 2G93A 3T9VA 4QFPA 3IOTA 3TCGA 1H44A 4M4GA 4DCXA 4F2OA 4R75A 4KYSA 2GHBA 4X48A 3S9EA 3TTKA 2DVCA 4JXIA 4H1XA 3C35A 5AA2B 3IORA 2Z22A 4UA8A 4R9FA 3PUWE 1LAXA 3I5OA 2H9BA 3MVYA 4ZZEA 1AMFA 1PC3A 4PQJA 2V3QA 2Q88A 3PUXE 4QFOA 3MUQA 5DTBA 1Y1MA 4RK9A 3E13X 3K6WA 1UTHA 3K00A 4EUOA 5L9SA 1BIYA 2DWAA 3MP6A 4GD5A 2OLBA 2E1SA 3TAJA 1JVXA 2ZYOA 1MQGA 1LLSA 3QK6A 3QSLA 3B7DA 1ZU0A 4KPTA 2PMSA 2DXYA 4QSDA 3TDJA 1BKAA 4G2ZA 3SEVA 3CFLA 4R74A 1POY1 1SD3A 4MLQA 4F22A 3QYTA 2XX8A 5AA4A 2PVUA 1HSLA 4OFJA 3IR1A 2HAVA 3PD8A 1QUKA 3G3JA 3O97A 3TPAA 3A09A 3U72A 3IJOB 2O1MA 4RY1A 2X26A 4HCWA 1URDA 1IUDA 1QULA 2ZYMA 4WXJA 4TQUQ 1B1HA 3RUMA 3S4UA 1B6HA 4U22A 2V25A 1MY4A 2DE3A 4GQOA 1B58A 1ELJA 3QAXA 1VSOA 1B9JA 1NKXA 2F7CA 4N07A 1DTGA 3C31A 3IB2A 1QJMA 1P1QA 3K2DA 1IXHA 4EQ9A 3FVNA 4KYDA 4GL0A 3JV9A 3BFUA 4Q0CA 3IO6A 1ZIUA 2HEUA 5EHSA 1Y3QA 2VGQA 3MW0A 3H7MA 3O66A 1A8FA 2WKYA 2PX1A 1D9YA 1BP5A 3DP8A 3B6TA 4BDQA 1PB9A 3OO7A 2PT1A 1MM6A 4JBZA 3QUJA 4YZZA 3L6GA 2V3UA 3PGFA 1M5EA 2NWJA 4GWOA 1UQWA 1EZ9A 3ZKKA 1D3KA 1MY2A 1B32A 1ZLQA 2Q2CA 1QVSA 1GTKA 5ICTA 4RJZA 5KCJB 1GVCA 1EZOA 1MH4A 4G68C 3UN6A 4N6PA 3HPIA 3VE1B 1EH3A 4UACA 3H03A 1MPBA 3E3KA 3MVXA 4JWYA 3FVGA 4QFNA 2ANJA 4KHZE 3GLBA 4ISUA 2CMOA 1TFAA 3TMGA 4RXLA 2I0CA 4P0GA 1OVBA 1ZKBA 4YKKA 1B40A 1LBBA 3T9HB 4QRZA 2QMWA 1HSEA 3T96B 4BLAA 1JEUA 5L8DA 5BWJA 2RC9A 3PUZE 2ZNTA 3GZGA 4NF8B 1MPDA 1MM7A 1ZJLA 3Q27A 2P0SA 4AB6A 1P1WA 4O3CA 3QUFA 3MZ9A 2RCAA 2O6AA 3P7IA 4LP2B 4KI0E 1B3FA 2OK2A 3SEWA 5HM4B 2Y84A 2NVUB 1Y4CA 5A5XA 5AA3A 4TLMB 2Z23A 5KDTA 3R26A 4G68B 3EHTA 3TCFA 3K1PA 3PUVE 5CRYA 5I58A 2ZMBA 2O69A 1FCKA 1D9VA 2A5TB 4TLLB 1WVJA 4N13A 3H06B 5I84A 3T93B 2Q8JA 1QKBA 3MZBA 5FTHA 4GL8A 3DP4A 1DPPA 5DVFA 3SKPA 4E0WA 4ZE8A 5CM6A 5F7VA 4YB6A 3HV1A 4ZEBA 4DE8A 1MXXA 5AE4A 2GRVA 2QS4A 3VV5A 1SI0A 3K1NA 2DOJA 1H45A 1RYOA 1B0HA 2CZLA 3KGCA 4JB7A 1Q1KA 3OO9A 4YB7A 3FATA 3CSBA 2XXIA 3OENA 4TOZA 2DE4A 3KEIA 1LCFA 4RYAA 1OQHA 2XXYA 3O6IA 1FQFA 1B4ZA 2PYYA 3G3GA 4H8IA 3PUYE 4IY5A 3N5LA 2GFEA 3H6WA 5CI5A 4GRKA 3H6TA 3OEKA 1B3GA 2H5YA 3THIA 1A55A 1Q35A 4OEVA 3TODA 2DXRA 4LONB 3PU5A 2H4IA 2NOOA 1H76A 2I3VA 1YTVA 5I56B 2XD3A 3O6HA 4ZE9A 3DP6A 3TCHA 2DWHA 2DVZA 2B65A 5DT6A 4EDPA 1B2HA 1N0TA 1SW4A 3MC2A 4ONYA 4OEUA 2R71A 1XT8A 1IXCA 5ICQA 1QKAA 2X7PA 1I6BA 4PETA 5DEXA 4EXKA 2VP1A 3FIRA 3PPPA 3U92A 4LZ8A 3LSFB 3M8UA 2F97A 4QFKA 3KOTA 1BTJA 1AOVA 5I2NB 5L9MA 3MZ1A 4FEBA 2XXHA 1NNTA 5H8NA 3RTWB 1S9TA 4R6HA 4F3BA 3TUSA 3O6GA 1SQYA 3LR1A 4XKQA 3JZJA 4DLDA 2IEEA 1NNKA 1OQGA 1UTBB 1XOCA 4O3AA 1B5IA 4PP0A 1MY3A 2D5WA 4H6DA 4BDOA 4NWDA 5DVIA 3U94A 4K3FA 3VLVA 1MQJA 1SW2A 2REGA 4GXAA 3ILUB 1NL5A 5TP9B 1IEJA 4G77A 4JWXA 3RQTA 4IY6A 2DYXA 2M8CA 1B4HA 2BJJX 3PMWA 4X1BA 4AB5A 2FNCA 4MBPA 1I69A 3TKDA 4ELQA 2FA7A 5KZTA 2HXWA 1R9QA 3MPLA 3HCQA 5H8FA 3FXQA 4ZEDA 3EN3A 5CBRA 1O64A 1R6ZA 3DELB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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