3IL1B

Crystal structure of the ampa subunit glur2 bound to the allosteric modulator, idra-21
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Probing the allosteric modulator binding site of GluR2 with thiazide derivatives
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 84
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence E, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3il1B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3il1B02
4XIGQ 2O7IA 4U1ZA 1N84A 2O1LA 4ELRA 4KYEA 1TWYA 3MP6A 1OVTA 2F5XA 5L8DA 5H8SA 1QKBA 4QHQA 2AL4A 4G8HA 2ZYKA 2ZXTA 2XX9A 3MVZA 3EHUA 3K6UA 2ZNTA 3OO6A 3RTFB 4NE4A 4I9DA 4R2FA 1MXYA 1PB7A 4QSCA 3O6IA 3C35A 5HPQA 3O6HA 4OETA 3KSJA 1FQCA 4IO2A 1ZMGA 1ANFA 3HPIA 3S9NC 3IO4A 5CMKA 2XXUA 4G2ZA 1O63A 2Z22A 3KEIA 2Z23A 3O2AA 1B4ZA 1PBQA 1PB8A 4YZZA 3IR1A 4FORA 4RXLA 4GXSB 3OENA 1J1NA 3FUZA 1EU8A 3PUVE 3Q28A 1B3EA 1VFEA 5DVFA 5JTYB 1AL3A 2RINA 3KSXA 2F6PA 3PU5A 3CG1A 3OSRA 4BDQA 3VFJA 1JW5A 1QJMA 1FQFA 1ZIUA 4MFIA 4P0GA 3VDFA 1PC3A 5H8FA 2Y7KA 2ONKE 4IGRA 2H25A 1MQIA 3RUMA 4OYVA 1UTBA 1I6AA 2HZLA 3MVWA 4POXA 1A99A 1DSNA 1XVXA 1N7XA 1S50A 4JDFA 1P1NA 1MY2A 2F7BA 3CR9A 1IIWA 1I69A 1POY1 1NH8A 1B32A 4R2BA 4GLIA 1FQDA 3THIA 3PUWE 4H8IA 3DM0A 3G3GA 3H03A 4FATA 1GGGA 4I1DA 5TPAB 1B51A 4R9GA 1CB6A 1MY1A 1M5FA 3EN3A 3LR1A 1B05A 2NOOA 4JBZA 1AH5A 5EHMA 4MH5A 2O7UA 4IB2A 3Q27A 4C1TA 3E13X 5DYHA 2ESNA 3O9PA 4OTEA 3H3GA 2HXWA 3PUYE 5TU0A 3CFZA 5I58A 3CRBA 2QL3A 1PDAA 3PMXA 3T9UA 3SEWA 1B1XA 2ABHA 4N07A 2H9BA 3O97A 3TAJA 1D9YA 4C1UA 4O3CA 4YB5A 3R6UA 3IO6A 1YAEA 4PP0A 3VLWA 1NNFA 1N7WA 3D4GA 3O66A 1R6ZA 4RK9A 1MXXA 3BFTA 3HHGA 2PT1A 5F7VA 2XD2A 3RTWB 2Y7WA 3EPEA 3MP8A 4G8NA 5I59A 4HS7A 4ELPA 2QJEA 2ZMBA 3W9WA 5L9MA 1JVXA 2DVZA 2X26A 4ZZAA 4JB7A 3ILUB 2B3FA 5LOMA 4DXBA 4GOTA 1PEBA 1P99A 1NL5A 3PPNA 5H8FB 3JYRA 1DPPA 2HFBA 1I6BA 3M3FA 3GBBA 1N3XA 4Z7EA 1IEJA 4OWDA 4RPOA 3HCQA 1FTMA 4XKPA 4H67A 3FXQA 4PFYA 4F2OA 2X7PA 5EHSA 4F3GA 2QS4A 3OELA 1Y1MA 1JW4A 4GXAA 5ELVA 3IAZA 4EUOA 2I4CA 1LBBA 1SW2A 3CSGA 5ISUA 3K02A 4QFNA 3B7DA 3HO7A 1M5DA 2UXAA 2RC9A 4RPNA 1JETA 3FJGA 4KFQA 5KDTA 5CMBA 1AIVA 4JWXA 4O3BA 2Z8EA 5KZTA 3M3LA 3Q25A 1CE2A 2F6GA 2UYFA 5FTIA 3IB2A 2RKMA 3G3JA 2XX8A 5HM4B 2VHAA 4IO4A 5DTBA 4H6DA 1SD3A 3PPOA 1B3GA 2CMOA 5CI5A 2UVJA 1NKXA 5CRYA 3GXAA 2E0SA 2DXRA 1OLAA 2R9JA 4F29A 1IXHA 1TFDA 2NXOA 3W15C 4BDRA 2XXIA 3MZBA 3E4RA 3FZVA 1B7ZA 4R9FA 1IZ1A 4JSOA 4ZE8A 1AOVA 1S7YA 4LQ5A 2F36A 2XX7A 3T9VA 3DP6A 1LFIA 3K2DA 4LATA 3FVOA 1BKAA 1BP5A 5I59B 2DSFA 1L5TA 5FTHA 4U1OA 1SYIA 1B52A 3S4UA 4NTLA 4F18A 3QYTA 1UTHA 1FTJA 2UVIA 1MG1A 3G3FA 1T0KA 1NH7A 4GQOA 3RLFE 2DE3A 5HBCA 3AXFA 4ZS9A 2ANJA 3C34A 1OQGA 1M5BA 3B6WA 3PPQA 4NF8B 1RYXA 4IO5A 1FTLA 3RPWA 1Q35A 3OEMA 2GHBA 2QRYA 5I2KA 5DVJA 1DMBA 3C36A 3IL1B 2HAVA 2F34A 3MAMA 2AIXA 2DE2A 2P1SA 2M8CA 3T22A 4PFTA 3VXCA 2OLBA 4NWCA 2HCAA 3O29A 2OWTA 5J1DA 3UK4A 1FW0A 1MXZA 3MWBA 2UVGA 2DE4A 4OEUA 2O1MA 4DE8A 1Y3NA 3C9HA 1DTZA 4H8JA 1P1QA 5AA3A 1IXGA 2CZLA 5F1QA 1TT1A 1Y3PA 4M1VA 2I3VA 4ZE9A 2RF1A 2YJPA 2XXVA 3OO8A 2Z8FA 4ZDMA 3EF7A 2P2AA 3K6WA 1USYE 1JQFA 5K2XA 4PETA 4R6HA 3H06B 2O68A 3IX1A 3VLVA 3M3KA 5BWJA 1MPCA 1XC1A 4Q8RA 1H76A 4JWYA 3LSXA 2REGA 1PBPA 4YKPA 1R9QA 3Q29A 2QSXA 1MH4A 3VE1B 2R71A 2F7AA 1M5EA 2OJTA 1FQEA 5AA2D 4LUBA 2DYXA 4AB5A 1DPEA 3T9HB 3TMGA 3MZ9A 3FXUA 3C4MA 3TCGA 2X7QA 3I6VA 4HW8A 2KLFA 3FD3A 1GTKA 2GHAA 4IY6A 2O51A 3OMBA 4XXUA 5I2KB 1MQHA 1B3LA 3KZGA 3U93A 4R75A 4TQUQ 3CG3A 4WKMA 2OBGA 2ZNSA 1TFAA 3OXNA 2F8DA 2V3TA 2PVUA 3QIMA 4FIMA 4IY5A 2THIA 1LBCA 4ZEIA 2DS9A 2DVCA 3K1NA 4FEDA 3O6GA 4DDDA 3MPKA 3D4CA 3ONMA 4KI0E 2VD2A 1UIVA 4F1YA 1D9VA 4FEBA 4U2RA 2YPNA 3TZAA 2F97A 4KD5A 1II5A 1MRPA 3A3UA 1ZTYA 1GV8A 3TCHA 4F31B 4IGTA 4FE8A 3SDFA 2DWHA 1EZOA 3RT6B 3DP8A 1ATGA 1VSOA 4KYDA 3IOUA 1HSJA 2OZZA 3KJTA 5KCJA 2LAOA 3QXMA 2O69A 2AYSA 4EQBA 4RY1A 1GVCA 3TQLA 1R1NA 1MDP1 3MBPA 1P1UA 3H6VA 3MUQA 4Q0CA 1I6QA 1MM7A 4BDLA 1MS7A 3N26A 3LUYA 5A5XA 3IK6B 3EQ1A 5M2VA 4U4XA 1OIBA 3PGFA 1OVBA 4KHZE 1A7LA 4LP2B 2ZYOA 3KOTA 3S2VA 4NF5A 3TDJA 3U72A 3WAEA 5CMCA 2XXYA 5L9OA 1KWHA 2FA7A 4QFOA 2DXYA 1VR5A 3FVKA 2Y84A 2V93A 4DXUA 4Q5TA 2DQVA 3SEXA 4O3AA 4OEVA 4LZ8A 4X9TA 3I5OA 3R26A 5I56A 1URDA 1XOCA 3EHSA 3VV5A 1Z7ME 3HSTA 3V5AA 2VOZA 3CI8A 4FECA 2UVHA 2Y7PA 3F11A 2I4BA 3OO7A 1LB9A 4R6YA 4BDOA 3PPPA 4GIZA 3FV1A 4N13A 2QS1A 3KN7A 3G7WA 2W7YA 1OLCA 4ZEKA 4AB6A 4FJPA 3ECRA 3QSLA 1N3WA 3T93B 1Y4TA 2Q9TA 2BJJX 1URSA 1IQ7A 3P7IA 1YCJA 2HZKA 1H44A 2Q2AA 4YMBA 4YAHX 5ITPA 5L9SA 2RCBA 3E9XA 3USDA 4NMYA 1LAHE 5DEXA 4Q30B 4EDPA 3GBAA 5CBRA 2F7CA 1UTBB 2RC7A 5H8NA 2Q89A 5KCJB 3ODBA 3T66A 3H4ZA 4JXIA 4YKJA 3ZKKA 4OENA 4DZ1A 5FHOA 2Q88A 5CC2A 1SVXB 5H8QA 2PYYA 3RN8A 4U23A 2PBWA 5B7DA 3MC2A 2HQ0A 3IOVA 1HSEA 3MQ9A 3SEVA 1SQYA 3MVXA 2A5TA 4NF5B 1URGA 4OFOA 1Y20A 1F9BA 3N6TA 4EF2A 4IO3A 3CIJA 4RNSA 2R6GE 1QUKA 3KN3A 2Y7RA 4JWOA 4I62A 3LSWA 1SW5A 1MY4A 3K6VA 5I56B 2XXPA 3IB1A 5I58B 3TTLA 5I2NA 2XXHA 4GD5A 1NNTA 4R72A 2QMXA 1D3KA 4YB6A 2XHDA 2V3UA 2A5SA 4F3SA 1LAGE 2GH9A 3U1OA 3VLUA 5CBSA 3N94A 3V89B 3WAFA 1TXFA 1MXUA 3SESA 5IKBA 5I84A 2UYEA 3W9VA 3MJNA 3UN6A 4ESWA 2VGQA 4ZEFA 2OK2A 2B3BA 4G68C 4NEDA 1FQBA 3S9MC 2Z8DA 4RYAA 4F1UA 4GL0A 3IB0A 4KR5A 2D3IA 1QULA 5CMMA 3FIRA 1O7TA 5DEXB 1MH3A 2IEEA 1US5A 1USYH 1P1WA 1LB8A 2Q2CA 5H8QB 1ZJLA 1DTGA 2FYIA 4R6KA 3OEKA 3PPRA 3U94A 3TQWA 4QSDA 1A8EA 4HTGA 1OQHA 4F2QA 1BTJA 2XXRA 4XKNA 4H5GA 3V8XB 3TCFA 3U8QA 4QF9A 4GVOA 4BLAA 1JNFA 2A5TB 5KDTB 1VE4A 3GZGA 2HAUA 3U92A 1N0TA 3OO9A 1NMUA 4OFJA 5JK4A 3TPAA 4UACA 3B6QA 4F3PA 1WODA 2RC8A 1SBPA 1H45A 3TFLA 1MQGA 2I0CA 2G93A 1NNPA 3Q26A 2VD3A 2D21A 3KOSA 1EZPA 1H43A 2GRVA 5I2NB 3A09A 3UIFA 3N6UA 3UA8A 3C31A 3TYHA 2PMSA 4H1XA 3FV2A 3KGCA 1MDQA 3G3IA 3IJOB 3L6GA 5JEIA 3LSLA 2NUVA 2V3QA 3K6XA 4ZEBA 3SEYA 1LGBC 3O28A 3UP9A 3K00A 3B6TA 4X48A 1A55A 3IOWA 4OHNA 2VP1A 4PQJA 4F19A 3KBRA 4EQ9A 1IXCA 1UTHB 1XT8A 2RCAA 3HHFA 4QFKA 2YLNA 2XXWA 3OSQA 4Z0IA 2QPQA 3TUSA 3SEUA 2I3WA 1A54A 2GFEA 2XXXA 2ZNUA 4ELOA 3R7XA 1H3DA 2Y7IA 5TPAA 2I49A 1B5HA 3H7MA 3KFMA 3VVFA 2ZYNA 1MPDA 3RGYA 3MW0A 5AA4A 1A40A 4ND9A 3BFUA 3VVDA 2OWSA 4N6PA 4E0XA 4C0RA 4LQ2A 3SKPA 3IOTA 4PFWA 3G3KA 4R73A 2H99A 1QW0A 3DP4A 4RK2A 4OXVA 1JVYA 1B40A 2WKYA 1N04A 1YTVA 1RKMA 4GRKA 4MLVA 3RQTA 3H6UA 3K1MA 4ESXA 2DWIA 1MM6A 5ICQA 4OQOA 2DWJA 4GF8A 1B58A 3DLNA 1QUIA 4YU0A 4R74A 5TP9A 4H5FA 4POWA 1Y4CA 3PUXE 4F39A 4LZ5A 3HV1A 4MF3A 4X1BA 2IA4A 1S9TA 1LFGA 1WVJA 4FAJA 1FQAA 2FNCA 3BKIB 3KJ7A 4G68A 4RA1A 3TELA 4DXCA 1FTKA 1JW1A 1IXIA 3OOAA 3ILTB 1UIUA 4LZ7A 3PV0E 2ONRA 4QRZA 2H5YA 3FVNA 4EXLA 1XHYA 3RY3A 3FASA 4TLLB 3KG2A 1POTA 1LAFE 4KCCA 4DIGA 4H65A 4EXKA 2D5WA 2B65A 4MBPA 3H6TA 3L6HA 4QFLA 3ZS6A 3PMVA 4GL8A 3K01A 2PT2A 3TODA 1LSTA 4KYSA 4JSDA 5AA4B 4HCYA 2I0BA 1MXWA 3H6WA 1MXVA 2AL5A 3QK6A 1EH3A 5ICTA 1B5IA 2NVUB 1B3HA 2XXTA 3E3KA 3IORA 3FGSA 4TLMB 1JEUA 3ZKLA 3FJMA 5FHMA 4LONB 5DVIA 1B6HA 4ECFA 1XS5A 1LAXA 3VVEA 1NFTA 1Q1KA 1B3FA 2E1SA 4GWOA 4ZEDA 2ALUA 4UA8A 3JZJA 4F1VA 4XKQA 3CFLA 3MZ1A 1B5JA 4MLQA 2P0SA 3TEPA 3CSBA 5TP9B 3S9EA 3EHTA 5K2YA 1QUJA 4OVJA 2XXQA 3N5LA 4XTCQ 1SW4A 1EZ9A 4DCYA 1B1HA 4BDMA 1MQJA 4YMAA 2F78A 2DP8A 1A8FA 4G4PA 2DWAA 1QVSA 4G68B 3MP1A 2H98A 5DT6A 1QKAA 1LFHA 1B0HA 1RYOA 4P11A 3IJXB 3QAXA 4LA9A 5H8HA 5A5XB 1D4NA 4NF4A 4NF8A 3CVGA 1O64A 4G77A 2OCUA 4IO7A 5AA2A 4NF6A 4BDNA 4XKRA 1XVYA 2H4IA 1OMPA 4NWDA 2QS2A 3CFXA 3RT8A 4EQ7A 5BUUA 4QFPA 1MPBA 3PD8A 1UQWA 3TTMA 5AE4A 5B70A 3GLBA 2F35A 4IO6A 1MQDA 3UORA 3LC8A 1BLFA 1Y9UA 3K4UA 3S9LC 3VXBA 3A3CA 4KCDA 3I3VA 3G3HA 1SW1A 4PFUA 4QSEA 4GFRA 3C33A 3QUFA 5ITOA 1IITA 5I57A 3RNNA 4THIA 1SYHA 4E0WA 3SERA 2O6AA 4WEDA 3V83A 1SI1A 3FATA 4P0IA 3MPLA 1BIYA 1YPNA 4LVQA 1N76A 3T9XB 1WDNA 4PE5B 4U22A 2ZYMA 3FVGA 3QUJA 4OESA 3C32A 2DOJA 2G29A 3PD9A 1B9JA 4ZZEA 5FHNA 1SDXA 1P1OA 1DOTA 3ZSFA 5H8NB 3K1PA 4YKIA 3OD7A 2QMWA 2V84A 2I48A 1ZU0A 4OERA 1LCFA 4K3FA 4F22A 3MVYA 4KQPA 4TOZA 3TTRA 1Z7NE 1B7UA 2ONSA 1IUDA 4ISUA 2XD3A 1JEVA 4WEPA 1NNKA 4HCWA 3M8UA 1ZKBA 1SI0A 1US4A 1B46A 4U21A 5AA1A 2REJA 4KPTA 5H8HB 4DCXA 3K0VA 4NF4B 5EYFA 1MY3A 2I6EA 3TTKA 1M5CA 1B0LA 2Q8JA 1B4HA 5AA2B 2V25A 1ZBMA 4NF6B 4ONYA 4X1DA 2NWJA 2HEUA 1ZLQA 1FCKA 2QS3A 3UGWA 1VFDA 1B7HA 1AMFA 2O84X 1Y1ZA 5CM6A 1B2HA 4WXJA 3SETA 3TKDA 1LCTA 3PMWA 4F3BA 3LSFB 4YB7A 1FTOA 1PB9A 3FJ7A 4U4SA 1R9LA 1MY0A 4YICA 5IAIA 3HN0A 4ZECA 5JTYA 3LBSA 2PX1A 3JV9A 4OFLA 3T96B 4RJZA 3DELB 1ELJA 4H0WA 4M4GA 3PUZE 4G8MA 4EF1A 4I8CA 1HSLA 5I57B 4L17A 4YKKA 3KN8A 3TTNA 4OZ9A 4ELQA 4OMBA 1LLSA 4DLDA 1Y3QA 3BBRA 1GR2A 2I58A 3FXRA 4AQ4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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