3IL1B

Crystal structure of the ampa subunit glur2 bound to the allosteric modulator, idra-21
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Probing the allosteric modulator binding site of GluR2 with thiazide derivatives
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 84
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence E, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3il1B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3il1B02
4Q5TA 4N6PA 4ZE8A 2NVUB 4EXKA 4G68C 2VD3A 4ZEDA 1QVSA 1MQDA 4DCYA 1MXWA 4RNSA 4JXIA 2HZLA 4F2OA 1IUDA 4EF2A 1B2HA 2OLBA 2Z22A 1N84A 1BP5A 3F11A 1VSOA 3CFXA 4GL8A 1H44A 1LAHE 4LZ5A 1M5DA 4F1VA 2NOOA 3VFJA 1B3LA 2R9JA 3S9MC 2XXWA 1MS7A 3KFMA 3FJMA 3OENA 2G29A 3LSFB 3K6VA 5TU0A 4AQ4A 3FXUA 4KI0E 3RUMA 1B0HA 1SBPA 2HAUA 5TPAA 2I0BA 1ZBMA 4NF8B 1XC1A 1Y4TA 1WVJA 4GFRA 3LR1A 3U94A 1D4NA 4NF8A 1MXVA 4IO5A 5ISUA 1Y4CA 3IL1B 1II5A 4OESA 4Q0CA 4LATA 4EQBA 3H6UA 4M1VA 3S4UA 5CMCA 4KD5A 2V3UA 4G68A 4YMBA 1PB7A 3RT6B 1YTVA 3E13X 2IEEA 1WODA 3MPLA 1UIVA 5AA4A 4F1UA 3HCQA 4EUOA 3DP4A 4RA1A 2Q8JA 2FA7A 4NF6B 2AL5A 3VVEA 5H8SA 3OELA 4X9TA 4NWCA 3MZ1A 5I2NB 3GZGA 5L9SA 3K00A 2DQVA 2H9BA 3OD7A 5I2NA 2KLFA 2OBGA 4NE4A 3G7WA 3QSLA 2ZNSA 4I8CA 3ILUB 1POTA 2RCBA 3H06B 4QFNA 4I9DA 3TTLA 1FQCA 4DXCA 4WEDA 2BJJX 4WKMA 3VXCA 1DMBA 4H8IA 2F97A 4BDLA 3SEXA 5BUUA 3O97A 4JWYA 1XHYA 4GIZA 4G2ZA 2V84A 2O7IA 4Q30B 1Y20A 1Q1KA 4F1YA 4FAJA 2DE2A 4C0RA 2UVJA 1MXXA 1MQHA 3TAJA 1N76A 3TKDA 2H99A 1H76A 3OO6A 4LZ8A 3TDJA 4HCWA 1XT8A 2GH9A 3E9XA 4P0GA 4QF9A 3G3HA 2YLNA 1Z7NE 3R7XA 3MQ9A 3DP8A 3MPKA 2M8CA 3H6WA 3ECRA 3O66A 2A5SA 1H3DA 3KJTA 2OWTA 3PPOA 3N94A 3SEVA 3SKPA 2H25A 1FQEA 3PPQA 4OETA 2XXVA 1S7YA 1LCTA 1JVXA 1B5IA 4LVQA 4MLVA 3T9VA 4FEDA 4TLLB 4R6YA 3JZJA 1BTJA 2Z8EA 4LUBA 4QFKA 2XX9A 2QS4A 1JETA 3TEPA 1UTHA 1LGBC 2O1LA 4LQ5A 4JWOA 4OFJA 5CC2A 2Q89A 1SW4A 1Z7ME 4E0WA 1TXFA 3EPEA 1DTGA 2V25A 2LAOA 4F29A 4RYAA 1MM7A 4ZEKA 2Y7KA 3IX1A 4JB7A 4YKIA 1SYIA 4R9FA 4YMAA 3VXBA 3B6QA 2Y7RA 3PUZE 4YU0A 2GHAA 2D5WA 5DVIA 1MXUA 2XXIA 5DEXA 5CMKA 3MZ9A 3TPAA 1A54A 3CR9A 1MQJA 5B7DA 2PBWA 4ZZAA 2GRVA 3UORA 1FTOA 3G3IA 3VV5A 4K3FA 3VE1B 4X48A 1B4ZA 1OQGA 2X7QA 3H03A 1MXZA 3GXAA 4YKJA 3KSXA 1VE4A 2ANJA 1TFAA 5L9MA 2O7UA 3U72A 3QAXA 4FORA 4R73A 4OFOA 2ZYNA 1A7LA 1PB8A 4NMYA 1GVCA 4WXJA 1NH7A 4H65A 4HW8A 1ZU0A 2QS2A 2OCUA 3RLFE 4EDPA 3IB0A 2V3TA 2QSXA 2Z8FA 2O68A 1AH5A 2AL4A 3Q26A 5J1DA 1JQFA 4U4SA 1IXGA 3TTKA 4RK9A 1YPNA 3FXRA 4IO3A 4EQ7A 3TQWA 1ZMGA 1OMPA 3MUQA 2ZNUA 2ZXTA 2RINA 4GWOA 5TP9A 1QUJA 3TCHA 3TMGA 4QRZA 4YICA 5DTBA 3Q28A 5A5XA 5K2YA 3A3UA 2F8DA 2DE3A 1NNFA 1ZIUA 4O3AA 3G3GA 5EYFA 2OK2A 4GD5A 2Y84A 1N7WA 2ZYKA 4ZEIA 3EHTA 2E1SA 2CMOA 3IAZA 5KCJA 3GBBA 4R9GA 1N04A 3BBRA 3CRBA 4DXUA 1IZ1A 3MVXA 4QSDA 2RKMA 2VOZA 4LP2B 3MJNA 1S50A 4HTGA 3DP6A 4RPOA 1AIVA 5I2KB 3MP1A 3OMBA 4TOZA 1B51A 1NKXA 1XVYA 4IO4A 4PETA 4XKRA 3L6HA 4DCXA 3K6UA 5I59B 5FTIA 2VHAA 4JSOA 3TELA 2Y7PA 2DE4A 1FQDA 2UVIA 1EU8A 3MBPA 2VP1A 1MQGA 1NL5A 4LQ2A 1B9JA 4P0IA 5B70A 1B3EA 5HBCA 1GGGA 3RPWA 2DVZA 1SI0A 1HSEA 2XXXA 2Y7WA 4ZDMA 5K2XA 4NF4B 4ZS9A 4ZEFA 4QHQA 3SDFA 4Z0IA 1P1UA 2XXPA 3OXNA 4BDQA 2DOJA 1USYH 4X1BA 1NH8A 3FVOA 5M2VA 3A3CA 1FTKA 3GBAA 2AYSA 5I57B 3D4GA 2O6AA 3IOUA 3IOTA 2F7BA 1Y1MA 2PX1A 1H43A 3S9NC 4ELRA 3FVKA 3UP9A 1B1HA 2WKYA 4PP0A 3W15C 4JWXA 3GLBA 2DWHA 3OO9A 3VLVA 5CMMA 5L8DA 1OIBA 1O64A 2PMSA 1R9LA 1YAEA 5ICQA 2ONKE 3ODBA 1A8EA 1JEUA 1MDQA 5AA1A 4QFPA 1VFEA 4F39A 4EXLA 2ABHA 3O29A 3BFTA 4DXBA 4QFOA 1FQAA 2I48A 3WAEA 1B7UA 5DT6A 1MXYA 3V83A 3B7DA 5CI5A 1UQWA 3I5OA 1MH3A 4MH5A 1PC3A 3IJXB 4DZ1A 1CE2A 2DWJA 1DOTA 2ZMBA 2RCAA 4H67A 2P1SA 4IY5A 4F3SA 1CB6A 3ZSFA 1B1XA 1JW5A 1M5EA 1EZ9A 2HAVA 4G8MA 4JBZA 3KOSA 3HPIA 1A99A 5CBSA 4OYVA 3H7MA 1OQHA 4BDMA 3UN6A 1B32A 3PUYE 4NF6A 4O3BA 2ZYMA 2PT2A 1ELJA 4R74A 3FVNA 2Z8DA 4O3CA 1UTBB 4XKPA 3R26A 3V5AA 5KZTA 3C9HA 2D3IA 5FHNA 4PFTA 2NXOA 3BFUA 3HHGA 3FJGA 2XX8A 3QK6A 1XOCA 3HSTA 3PPNA 1NNPA 3KN8A 1LB8A 2DP8A 1RYOA 3IK6B 4R6KA 3M3KA 3PUVE 4ISUA 1DPEA 3JV9A 2A5TB 1USYE 3IR1A 3QYTA 3EHSA 1WDNA 4NEDA 3DELB 4H8JA 1R6ZA 4KYEA 2DXYA 3K1PA 3HN0A 4LZ7A 1B3HA 1OLAA 2UVHA 1MY4A 4RXLA 2PVUA 1IITA 1B05A 1LAGE 3PD8A 4DE8A 2ONSA 4F3GA 1R1NA 4MF3A 4ELQA 3SEUA 3QUFA 3CFLA 1MM6A 4ZZEA 3N26A 4GF8A 4KCCA 4EQ9A 1QULA 1P99A 2UXAA 5AA3A 5H8FB 3I3VA 3T93B 3D4CA 3FD3A 4NF5B 3RY3A 1I69A 3U8QA 3SERA 5AE4A 5I56B 5H8FA 5JK4A 3K4UA 3MZBA 3CSBA 3E3KA 3IOWA 4YB7A 2O1MA 4IGTA 4KR5A 1RYXA 2XXUA 2F34A 5KDTB 1B4HA 4GQOA 1ZJLA 3MVYA 3VLWA 4GVOA 5AA2D 1B6HA 1M5CA 2REGA 3H4ZA 4XIGQ 4C1TA 2Y7IA 2GFEA 4BDRA 4TQUQ 4IO6A 1FTJA 3VVFA 3PD9A 3A09A 3HV1A 3FV2A 2OZZA 4YZZA 4RPNA 3C34A 3OO7A 1MH4A 3EF7A 5JEIA 4IO2A 1QKAA 4ZE9A 2QRYA 2I6EA 2F6GA 1PDAA 2Q9TA 1B0LA 1FCKA 3FVGA 1ANFA 1MPDA 4R6HA 4YB6A 4KYSA 5FHOA 4U22A 3UGWA 5AA2B 1EZPA 2I58A 1MY2A 1O63A 3DLNA 4FJPA 5JTYB 3UIFA 1A55A 1L5TA 2R6GE 4BDNA 1SQYA 1QUIA 2XHDA 3ILTB 5JTYA 1QKBA 1LAFE 2ONRA 3OSRA 1FTMA 3CSGA 3KG2A 2DWIA 1LCFA 3IO4A 3QIMA 3Q25A 4R72A 3CI8A 1LAXA 3OEKA 1J1NA 3OO8A 3OEMA 3RTFB 1HSLA 4Q8RA 4G8NA 3U93A 5HPQA 4H1XA 1MPBA 4M4GA 4MFIA 2I49A 3K6XA 4KHZE 3V8XB 1MDP1 3U92A 3EQ1A 1URDA 4FECA 3PMVA 1BKAA 1POY1 2B3BA 3CFZA 3K02A 3MWBA 1OLCA 2FNCA 2R71A 3L6GA 1SW5A 1Y1ZA 1T0KA 3LSXA 3EN3A 4FE8A 5LOMA 2HEUA 3C36A 1M5BA 4G77A 4KFQA 1SD3A 2H5YA 3T66A 2G93A 1QJMA 1ATGA 5I58B 3QXMA 4IGRA 3W9VA 3N6UA 3S2VA 2I0CA 2X7PA 5H8NB 1DTZA 5ICTA 2AIXA 3CG3A 3G3FA 3MC2A 3PMXA 1FQBA 2HFBA 3G3KA 5CM6A 3P7IA 5H8NA 3IO6A 4OWDA 2UYEA 4RJZA 1OVTA 2Q88A 1IQ7A 1QUKA 4P11A 4QSCA 3RT8A 4I62A 4GOTA 2HQ0A 5I2KA 3ZKLA 1M5FA 1P1QA 4YKKA 1SW1A 4QFLA 5I59A 3V89B 4E0XA 4H0WA 3FV1A 5DVJA 1B46A 1IEJA 2PT1A 3T9XB 1MY0A 1HSJA 3C31A 5L9OA 3LC8A 2YJPA 3B6TA 4KCDA 2QJEA 4FEBA 2HCAA 3PUWE 5FTHA 4F22A 3K6WA 3OOAA 4NF4A 3RN8A 1H45A 4R2FA 1LFHA 1TFDA 1I6AA 4R2BA 3KGCA 3VDFA 1US5A 1B52A 3THIA 2DVCA 4XXUA 3TYHA 3KBRA 5F1QA 1URSA 4H5FA 1RKMA 3O6IA 2XD3A 3K01A 3MVWA 4EF1A 1ZLQA 1PBPA 3TCFA 2REJA 2B65A 4HCYA 1DPPA 1LFIA 4G4PA 4PE5B 4PFUA 5I57A 4LA9A 2O51A 2VGQA 1IIWA 3UK4A 4GL0A 5CMBA 3PMWA 4POWA 4ELOA 1Q35A 1BIYA 1Y9UA 3KN3A 3RTWB 4HS7A 2I4BA 2I4CA 3T9UA 3VLUA 3CG1A 3LUYA 3PPRA 5TPAB 1IXHA 3U1OA 2QL3A 1SI1A 4OTEA 4THIA 3C4MA 3M8UA 1GR2A 4MLQA 2H4IA 1VFDA 2DYXA 4U4XA 2Q2CA 2DWAA 1US4A 3M3LA 3OSQA 1A8FA 1PBQA 4OZ9A 3LSLA 4ESXA 4IY6A 1B40A 3ZKKA 4H5GA 3Q27A 3W9WA 4GXSB 4G68B 1ZKBA 2HZKA 4IO7A 5EHMA 5AA4B 3QUJA 3LSWA 2FYIA 1B5HA 2UVGA 3O2AA 4DDDA 3SEWA 4OHNA 1P1WA 1JW4A 1P1OA 2PYYA 5DYHA 5IKBA 3ZS6A 4KYDA 2XX7A 4GRKA 1B3GA 1D9VA 4AB5A 1JVYA 1D9YA 4OFLA 4F3BA 4LONB 3MVZA 4QSEA 1JW1A 1UTBA 2NWJA 3T9HB 3N6TA 4U1ZA 1DSNA 2F36A 2X26A 4N13A 1AL3A 2DSFA 4GLIA 1NFTA 5CRYA 1TT1A 3M3FA 3IOVA 1AOVA 2F6PA 2O84X 4OVJA 1TWYA 2I3WA 3TFLA 1I6QA 2XD2A 3T22A 3PPPA 4IB2A 1S9TA 2A5TA 2HXWA 3VVDA 3HHFA 4OEUA 3PGFA 3O6GA 1YCJA 3FXQA 2GHBA 3KSJA 4BDOA 3S9EA 2XXHA 3FATA 3TQLA 2RC7A 1PEBA 2I3VA 3FASA 1Y3QA 4KQPA 3BKIB 3IB1A 1NMUA 3PUXE 2P0SA 4U2RA 3R6UA 2ZYOA 4ELPA 1EH3A 1I6BA 2XXRA 4XKQA 2QMXA 4POXA 3TZAA 1QW0A 3E4RA 3WAFA 1PB9A 3USDA 3IORA 3TTRA 4NF5A 1NNKA 5I56A 4OQOA 4OERA 1XVXA 1FW0A 4AB6A 3K2DA 1JNFA 3MAMA 3C32A 5CBRA 4GXAA 1BLFA 3KJ7A 3ONMA 5KDTA 1LLSA 2DXRA 1B3FA 1UTHB 4PQJA 4FIMA 3K0VA 3O9PA 1GV8A 3SEYA 2B3FA 2F78A 1AMFA 4ONYA 2Z23A 1URGA 2ZNTA 4F18A 2XXTA 5EHSA 1N3XA 4U21A 4X1DA 5IAIA 1SDXA 5HM4B 3H3GA 3N5LA 5F7VA 1VR5A 2NUVA 2IA4A 2XXYA 3SETA 2CZLA 4UA8A 1MG1A 4ESWA 5FHMA 1N3WA 1ZTYA 4BLAA 4XKNA 3KN7A 3H6VA 5DEXB 4F3PA 1LSTA 2F35A 4YB5A 4NWDA 1B7HA 1SYHA 3C35A 4L17A 4YKPA 4F31B 1P1NA 2UYFA 3KOTA 3S9LC 3MP6A 3O28A 5AA2A 3G3JA 4DLDA 2QS1A 1B5JA 4MBPA 3RNNA 3TTNA 2OWSA 2RC9A 3FJ7A 3KZGA 1GTKA 5I84A 2OJTA 4F2QA 1A40A 3B6WA 3Q29A 1N0TA 2ALUA 3MW0A 2V3QA 4PFWA 2P2AA 3AXFA 4U1OA 2VD2A 4NTLA 3HO7A 1NNTA 4R75A 5H8QB 3K1NA 2F7AA 2F5XA 4OEVA 5BWJA 5TP9B 5DVFA 4DIGA 4ZECA 5H8QA 1FTLA 1LBCA 3RGYA 4OXVA 5ITOA 1MPCA 4XTCQ 5A5XB 3T96B 4Z7EA 2DS9A 3PU5A 3IB2A 1FQFA 1MY3A 3EHUA 3FZVA 5ITPA 1EZOA 1MY1A 3H6TA 3I6VA 3JYRA 2THIA 3UA8A 4ZEBA 1XS5A 4JSDA 1D3KA 3RQTA 1B7ZA 3DM0A 2XXQA 3TTMA 3FUZA 2V93A 1LFGA 4FATA 1Y3PA 5KCJB 4C1UA 3CVGA 3MP8A 2RC8A 1SVXB 4ECFA 4I1DA 5I58A 4ND9A 4OMBA 2H98A 1UIUA 4TLMB 2D21A 1O7TA 4H6DA 3O6HA 1IXCA 4G8HA 1KWHA 2O69A 3IJOB 2F7CA 2E0SA 3SESA 2QMWA 4U23A 3CIJA 1MQIA 3FGSA 1OVBA 3TUSA 3LBSA 3K1MA 3KEIA 4F19A 2YPNA 4KPTA 3TCGA 3C33A 1F9BA 4WEPA 4YAHX 5ELVA 3FIRA 1N7XA 2Q2AA 4N07A 5H8HB 1SW2A 1IXIA 1Y3NA 3TODA 4OENA 4RY1A 2QS3A 5H8HA 2QPQA 1MRPA 2W7YA 1B58A 4PFYA 4JDFA 4RK2A 1R9QA 1JEVA 1LB9A 3PV0E 4UACA 1LBBA 2RF1A 2ESNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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