2F7CA

Catm effector binding domain with its effector cis,cis-muconate
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
216
structure length
216
Chain Sequence
SQTLRIGYVSSLLYGLLPEIIYLFRQQNPEIHIELIECGTKDQINALKQGKIDLGFGRLKITDPAIRRIVLHKEQLKLAIHKHHHPNQFAATGVHLSQIIDEPMLLYPVSQKPNFATFIQSLFTELGLVPSKLTEIREIQLALGLVAAGEGVCIVPASAMDIGVKNLLYIPILDDDAYSPISLAVRNMDHSNYIPKILACVQEVFATHHIRPLIES
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords HTH-type transcriptional regulator catM
publication title Distinct Effector-binding Sites Enable Synergistic Transcriptional Activation by BenM, a LysR-type Regulator.
pubmed doi rcsb
source organism Acinetobacter baylyi
molecule tags Gene regulation
total genus 61
structure length 216
sequence length 216
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2f7cA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2f7cA02
3CI8A 2I3VA 3P7IA 4N07A 1A40A 1P1WA 4KHZE 5KZTA 1ZIUA 3MVYA 3ZSFA 1HSLA 2V84A 3MZ1A 4YB6A 2ZYOA 3RT6B 4RJZA 2DWJA 5I2NA 3VVEA 4QSCA 2I3WA 4WEPA 3TQWA 3PUYE 4LP2B 3QYTA 3HSTA 1P1OA 3FVGA 2OJTA 3H4ZA 5A5XB 1XC1A 3CFLA 1N04A 3SEUA 4YICA 2GH9A 3G3HA 3KG2A 4ZZAA 4YU0A 3VXBA 3MP1A 2DXYA 1B7ZA 1B32A 4R2BA 4PFTA 2GFEA 4MFIA 3VE1B 2ANJA 5ITPA 4KQPA 2Y7RA 3E4RA 4H1XA 3PPOA 4KYSA 4AB5A 3C34A 1SW1A 4POWA 1JEVA 2Z8EA 3SEWA 3TQLA 3RUMA 1QUJA 1MY1A 2HAVA 5FHMA 2G29A 4LQ5A 4NF6A 1FW0A 1FCKA 1Y1MA 2I58A 1MQHA 2XD3A 1VFDA 1QKAA 3HCQA 2ZMBA 4DZ1A 3KGCA 2QRYA 4BDMA 4G8NA 2A5SA 1B6HA 3HPIA 4LZ8A 5L9OA 5H8FA 3H6TA 5AA2B 1SI1A 3T22A 1VSOA 3JZJA 2PMSA 3TCFA 2F7BA 3D4GA 1FTOA 1B05A 5BUUA 4LQ2A 4ZZEA 4RK2A 4KYDA 4PFUA 5CBSA 3MVXA 1NNTA 2UVHA 5AA1A 3KN8A 1FQEA 1LGBC 2O51A 2I4BA 3K6WA 4RNSA 4DIGA 2R6GE 1LB9A 1VFEA 1KWHA 3EPEA 3V5AA 1LBCA 3MBPA 4XTCQ 2DWAA 1Y3QA 2HFBA 1LCTA 3RTFB 2ZNUA 3OD7A 1B40A 1LAFE 2OCUA 5B7DA 1NL5A 1SI0A 3BFUA 4X1BA 1MH3A 4OVJA 1ZTYA 2XXPA 1SYHA 4Q8RA 1MQJA 1XT8A 3EQ1A 2Y7WA 3HN0A 3IB0A 3KEIA 3H7MA 5JEIA 1URSA 1H76A 4F3BA 4NF6B 3BKIB 3K1PA 3K6UA 4QFNA 4R75A 4OHNA 4RPNA 2DP8A 4HW8A 2RINA 2X26A 4RA1A 1B5IA 1LAHE 2Q9TA 3GLBA 3RNNA 2HXWA 3KJ7A 1IXHA 1JVXA 5CMMA 1ZBMA 4Z0IA 2F97A 1QUKA 1TT1A 3K1NA 3OXNA 5H8FB 2ZYMA 3S9MC 2HQ0A 3IOWA 4R9GA 3VVDA 5I56A 3TTKA 1SW2A 4KCDA 2RCAA 1LCFA 4G77A 2I0CA 4L17A 2Z23A 2QPQA 3S9NC 1B46A 4F2QA 4PP0A 4R74A 3SERA 1JVYA 3N26A 4P0GA 1EH3A 4HCWA 1PBQA 4YAHX 2RC7A 4EQ7A 1PEBA 4FECA 1JW1A 3T9XB 4XIGQ 2NVUB 1MXUA 4U4SA 1PBPA 4R72A 4ECFA 4BDNA 4R6KA 3PU5A 1WODA 2HCAA 2DVZA 3DLNA 2PBWA 4TLLB 4EXLA 5ICQA 4PETA 2XXXA 4ZE9A 1SBPA 4NMYA 1QVSA 1URGA 1FQCA 2QS1A 3QSLA 1S50A 3DP6A 1IUDA 1SYIA 2F6PA 4XKPA 4IO2A 1DTZA 5BWJA 1PB8A 4F29A 5DT6A 3UGWA 4GVOA 3ZS6A 2Y7KA 2F36A 1B3LA 4OYVA 1MXZA 4GF8A 1S7YA 5TP9A 3VDFA 5CMKA 4NF5A 1OLAA 1MPBA 1FTLA 1Y3PA 1URDA 1RKMA 1NNPA 3D4CA 4ZEIA 4F3GA 1JW4A 3FJMA 3ILTB 3FJ7A 3ONMA 1CE2A 1TXFA 2XXYA 1A8EA 4PFWA 4QSDA 4I62A 5J1DA 3KBRA 3L6GA 4ND9A 1OLCA 1JEUA 3USDA 5H8QA 1B7HA 2D3IA 1MQDA 2CZLA 3Q27A 4GL0A 3OENA 1Y20A 4DXUA 3ECRA 1B0HA 1OIBA 1Y4CA 3ILUB 4YKIA 4YKJA 4H8IA 2DSFA 2G93A 4GXAA 5AA4A 2PT1A 4JB7A 1ZLQA 4BDRA 1SQYA 4FEDA 1QJMA 2E0SA 1O64A 1P99A 3PPQA 1I6AA 4I1DA 2XX8A 3SDFA 1HSEA 3CR9A 1AH5A 3R26A 3MQ9A 1B0LA 2OWTA 4FATA 2Y7IA 4G68C 3OSQA 1MH4A 1WDNA 2F34A 1M5EA 4GL8A 2O7IA 3PD9A 1D9VA 2OZZA 1FQBA 4ONYA 1ZU0A 3HHFA 4GQOA 4POXA 5TP9B 4NF5B 2PT2A 4OFLA 4OZ9A 2ZXTA 3LBSA 1TWYA 4WKMA 3U8QA 1B58A 1WVJA 4QFOA 1FQDA 2B3BA 1LLSA 5CMCA 3FVOA 3FIRA 4DCYA 2V3QA 3W15C 3TMGA 5EHMA 1ATGA 3H3GA 1AMFA 1RYXA 1ELJA 3WAFA 5H8QB 4OTEA 4IO4A 3S9EA 3E9XA 1MXWA 2UVIA 5CMBA 1SDXA 4E0WA 4PE5B 2VGQA 2ABHA 1Z7ME 4OMBA 4G8HA 5AA4B 4Q0CA 3MPLA 1O7TA 4U21A 2Q8JA 5F1QA 5LOMA 3RT8A 2YLNA 3QIMA 3HO7A 3C4MA 3PUZE 4U22A 1JQFA 3K1MA 1IXCA 1S9TA 4F31B 4ZDMA 1LFHA 4F19A 2CMOA 3MUQA 2Z22A 4BLAA 3LSLA 2F7CA 3KJTA 3LSWA 3T66A 3TFLA 1B2HA 4E0XA 4GLIA 3VFJA 1B5JA 1GTKA 2Q89A 3L6HA 1NNKA 3B6QA 3WAEA 2E1SA 3Q25A 3IORA 1H45A 2ZYKA 1MPDA 2DYXA 4IGTA 3G3FA 4OESA 3EF7A 1NNFA 1B3HA 2F7AA 1USYE 5CM6A 3LR1A 2PX1A 2RKMA 5I57A 1H44A 4ZEFA 1OVBA 2XXTA 1A99A 1LAGE 2THIA 3OO7A 5I58A 5AA2D 5I2NB 3H03A 4PQJA 1B4ZA 1VE4A 3TDJA 2UXAA 2QS3A 2RCBA 1USYH 3TUSA 2DVCA 2I4CA 5ELVA 2RF1A 4P0IA 4MBPA 3AXFA 1OVTA 3B6TA 3EHUA 4NF8A 4OENA 1IITA 3KZGA 3N94A 3PMXA 1IXGA 3G7WA 2O1MA 5HM4B 4GD5A 2XX7A 3M3LA 4RY1A 4YB5A 3R6UA 1OMPA 3N6TA 4KD5A 3FGSA 3OEMA 1FTKA 4DLDA 1N3WA 1EU8A 3KN3A 4QFLA 5L8DA 2XXQA 4I9DA 2AL5A 4HCYA 2F8DA 4BDLA 1R6ZA 1GGGA 3K6VA 5FHNA 3FASA 1P1UA 1LFGA 2RC9A 3MPKA 3FVNA 4QHQA 5CBRA 3TTRA 3IJXB 3MP8A 5L9SA 1DMBA 1D4NA 4R6HA 2OBGA 2IEEA 1AL3A 1GV8A 3EN3A 1MM7A 1IXIA 5M2VA 4Z7EA 5I57B 4G8MA 3I6VA 1JETA 4GIZA 1QW0A 3TKDA 4IO5A 4O3CA 2R9JA 1MPCA 4AQ4A 5I58B 1B1HA 2REJA 4YB7A 3TELA 5DVJA 4X48A 5H8SA 1Q1KA 4YKPA 3O2AA 4QF9A 3RPWA 4TQUQ 4OFJA 2M8CA 4XKRA 2DWIA 4EDPA 1A8FA 4NF8B 5I59A 1BP5A 3JYRA 2O84X 4FAJA 1SW5A 2F35A 2I48A 1XVYA 4OETA 1OQGA 3TAJA 1MS7A 2ESNA 4K3FA 3K02A 3EHTA 5TU0A 2VHAA 3TCGA 2ALUA 4DXBA 1N0TA 2QL3A 3OMBA 1QUIA 2VOZA 4LONB 3RLFE 3TEPA 3SETA 4FJPA 3FVKA 3THIA 1XVXA 2V3TA 4M4GA 1XS5A 4IY5A 4OFOA 2FNCA 3HV1A 3BBRA 2ZYNA 2XXUA 4N13A 1FQAA 4DE8A 4X9TA 5F7VA 3O6IA 1H3DA 2XXVA 4YMBA 3I5OA 5AA3A 3SEYA 4N6PA 4GWOA 3R7XA 4ELQA 1D9YA 1FTMA 5H8NA 3DP4A 2X7PA 3V89B 4RK9A 3MAMA 3VV5A 3T9VA 1P1QA 4F1UA 4KR5A 3C9HA 4JSOA 3S9LC 5TPAA 3SKPA 3IAZA 3MVZA 4EQ9A 1TFDA 3OEKA 5H8HA 1CB6A 2O69A 3U72A 2W7YA 3VXCA 1N7WA 2XXWA 3MZBA 3O97A 4H65A 2F5XA 3OSRA 4JXIA 2Z8FA 3CFZA 3LUYA 5I56B 3V8XB 3O6GA 2P0SA 4G2ZA 2I49A 4IB2A 5I59B 2V93A 1L5TA 4Q30B 3O29A 5KDTA 5ISUA 3O6HA 1PB9A 3S4UA 3O28A 3PD8A 3C35A 2DE4A 2DS9A 2FA7A 2H5YA 3LC8A 3K4UA 4O3AA 2Q2AA 1I6QA 2UYEA 1AIVA 5DEXA 1J1NA 1LB8A 3O9PA 3N5LA 4LZ7A 4QFPA 4F3SA 3Q28A 5JTYA 5HBCA 4U2RA 1MY2A 1JW5A 3A09A 4RYAA 3CFXA 2IA4A 2P1SA 1I6BA 2Q88A 4IO7A 3MJNA 3FXUA 3IK6B 4YMAA 1R9LA 2NOOA 3OO9A 3PUXE 4EF2A 3LSXA 1N7XA 4ELRA 4RPOA 4WEDA 5H8NB 3G3GA 4UACA 1Y3NA 2Y7PA 3C31A 1O63A 3HHGA 1MG1A 5TPAB 4ZEDA 2DXRA 3OO8A 5H8HB 5DVIA 2WKYA 4UA8A 3FV1A 2FYIA 1DSNA 3E3KA 4ELPA 3G3JA 4H6DA 5FTHA 2GRVA 4FORA 1SD3A 4XXUA 3VLWA 1MM6A 3BFTA 3FATA 4NE4A 2QJEA 3C33A 5KCJA 3IX1A 3TPAA 4YKKA 4OQOA 4ELOA 1IIWA 2XXIA 1MDQA 3A3UA 1MY0A 3VLVA 2ZNSA 3MC2A 4AB6A 1B3EA 4OWDA 4F1VA 1EZPA 1GVCA 3TODA 5KDTB 4ZECA 4G68A 3UP9A 5FTIA 3TYHA 3K0VA 2XX9A 3PUVE 2O68A 3UA8A 4NWCA 5DEXB 3IR1A 3UORA 2HEUA 3JV9A 3IB1A 5JTYB 1ZJLA 2DQVA 3MP6A 3RTWB 3KSXA 2AIXA 3H6WA 2NWJA 1II5A 1UTHA 3Q26A 1MQIA 3K01A 1MDP1 3H06B 4ISUA 1B5HA 4OEVA 3IOVA 3KOSA 4O3BA 1D3KA 2BJJX 3FJGA 4RXLA 4FE8A 5DVFA 2KLFA 1ZKBA 2X7QA 1N84A 4ZEBA 2OWSA 3PUWE 4P11A 1VR5A 1QKBA 3MVWA 5AA2A 3M3FA 3IJOB 4R9FA 3UK4A 2YPNA 5HPQA 3G3KA 4FEBA 2F78A 1MQGA 3PPNA 3PPPA 1R1NA 3IOTA 5CI5A 4KI0E 1B3FA 1ANFA 4EUOA 5KCJB 3U93A 4C0RA 1UIUA 2QMWA 3K00A 4HTGA 1XOCA 5IKBA 2H25A 3Q29A 1IQ7A 4C1TA 2QS4A 1LFIA 1M5BA 4G68B 2O7UA 1HSJA 4R73A 2NXOA 4THIA 4H0WA 3RGYA 2Y84A 5DTBA 1M5FA 1NH8A 2XXHA 3ODBA 2QS2A 3G3IA 1P1NA 3CRBA 3SEVA 3FD3A 4KCCA 4XKQA 1UTHB 2R71A 5EYFA 3OELA 4R6YA 3M8UA 1XHYA 1RYOA 3CVGA 1MXVA 5EHSA 3PV0E 2V3UA 2Q2CA 4WXJA 1H43A 1MY3A 3RN8A 1NH7A 4LA9A 3DM0A 4F2OA 3PGFA 4F39A 4GOTA 3GXAA 2H9BA 3SEXA 2VD3A 1MRPA 4GXSB 1LAXA 2GHAA 1BKAA 2B65A 2DE2A 2HAUA 3A3CA 1ZMGA 3DELB 2QMXA 2AYSA 3PPRA 2GHBA 5I2KA 5ICTA 1AOVA 3CSGA 1PDAA 1GR2A 1A54A 3FZVA 2UVJA 3OOAA 1EZ9A 2XD2A 1EZOA 5I84A 1JNFA 1I69A 4OXVA 1B3GA 4F18A 1N76A 1B7UA 1LBBA 4M1VA 5K2XA 4MLQA 4EXKA 4QRZA 2D21A 3KOTA 1Q35A 4IGRA 2UYFA 3MZ9A 4ESXA 4DDDA 3T93B 3KFMA 2F6GA 5CC2A 3IO6A 3W9VA 3GBAA 4IO6A 5JK4A 3RY3A 1DPEA 2V25A 3QK6A 3IL1B 1A55A 1YTVA 3OO6A 1YPNA 1UTBA 3K6XA 1US4A 3GZGA 1DTGA 1POY1 3I3VA 2HZKA 3C36A 3RQTA 3TTNA 3PMVA 2H98A 3IO4A 4JBZA 3FV2A 4KFQA 4DXCA 1T0KA 5L9MA 2D5WA 3SESA 2LAOA 1B9JA 4TLMB 5IAIA 1Y1ZA 1F9BA 2A5TA 2I6EA 4KYEA 2NUVA 4MF3A 2VD2A 4QFKA 3H6VA 3MWBA 1YCJA 5I2KB 3O66A 1FQFA 1N3XA 4JWXA 1YAEA 3CG1A 4MLVA 2O1LA 3CSBA 4NF4A 4LATA 1MY4A 4FIMA 5FHOA 4JWOA 2ONKE 4MH5A 4OEUA 1DOTA 3U1OA 2Z8DA 3TTMA 5DYHA 1BLFA 3VVFA 2H4IA 4EF1A 3T96B 3ZKLA 5AE4A 3EHSA 2UVGA 3TTLA 4QSEA 2ZNTA 1TFAA 4IY6A 3M3KA 4ZE8A 3VLUA 1A7LA 4BDQA 1BIYA 5B70A 3E13X 4Q5TA 4U1OA 3H6UA 4F1YA 4GRKA 4NTLA 3T9HB 4F3PA 1FTJA 1UTBB 1B52A 4JSDA 3IOUA 2H99A 4H5FA 5K2YA 3TCHA 2REGA 4TOZA 4U4XA 2DWHA 3CIJA 4JWYA 2XXRA 3QUJA 4X1DA 4NEDA 3U94A 2P2AA 4G4PA 2ONSA 3FXRA 4F22A 4LVQA 2DOJA 3K2DA 3IB2A 3QAXA 2I0BA 4U23A 2PVUA 4BDOA 4LZ5A 3N6UA 2A5TB 3ZKKA 2O6AA 3B6WA 2VP1A 2DE3A 1LSTA 2YJPA 3UN6A 1QULA 4R2FA 4NF4B 1Z7NE 2XHDA 3GBBA 2PYYA 4GFRA 3KSJA 3B7DA 1US5A 3S2VA 3FXQA 3W9WA 1BTJA 1M5CA 4H8JA 1Y4TA 1B1XA 1NKXA 4ESWA 2OLBA 1NFTA 5A5XA 4C1UA 2OK2A 4KPTA 4XKNA 2HZLA 1MXYA 3DP8A 1B4HA 2AL4A 3UIFA 1UIVA 4I8CA 3TZAA 4OERA 4H5GA 3V83A 3FUZA 4IO3A 3U92A 4YZZA 2B3FA 2RC8A 4LUBA 1B51A 4EQBA 3MW0A 4NWDA 1Y9UA 4PFYA 3LSFB 4U1ZA 3C32A 1R9QA 4ZS9A 1SW4A 3KN7A 1DPPA 3T9UA 1M5DA 1MXXA 5ITOA 3QXMA 5CRYA 1UQWA 1PC3A 4JDFA 1OQHA 1IEJA 4DCXA 4H67A 3PMWA 1PB7A 1IZ1A 1SVXB 1NMUA 2ONRA 1POTA 4HS7A 3F11A 3CG3A 3QUFA 2QSXA 4ZEKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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