2F7CA

Catm effector binding domain with its effector cis,cis-muconate
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
216
structure length
216
Chain Sequence
SQTLRIGYVSSLLYGLLPEIIYLFRQQNPEIHIELIECGTKDQINALKQGKIDLGFGRLKITDPAIRRIVLHKEQLKLAIHKHHHPNQFAATGVHLSQIIDEPMLLYPVSQKPNFATFIQSLFTELGLVPSKLTEIREIQLALGLVAAGEGVCIVPASAMDIGVKNLLYIPILDDDAYSPISLAVRNMDHSNYIPKILACVQEVFATHHIRPLIES
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Distinct Effector-binding Sites Enable Synergistic Transcriptional Activation by BenM, a LysR-type Regulator.
pubmed doi rcsb
molecule tags Gene regulation
source organism Acinetobacter baylyi
molecule keywords HTH-type transcriptional regulator catM
total genus 61
structure length 216
sequence length 216
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2f7cA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2f7cA02
3M3FA 2H25A 3CFZA 3RTWB 4ZEBA 3S4UA 4LONB 1QUJA 2DWJA 1OMPA 4QFPA 4BDNA 1IZ1A 5KCJA 4MH5A 3U93A 4BDMA 1NKXA 1IXCA 4UACA 3H6TA 3CFXA 3OXNA 1S9TA 1FQCA 2XX7A 5AA2D 3MP6A 1QKAA 3N6TA 1B7ZA 3LR1A 2O69A 4GF8A 2RC9A 4RA1A 3K1NA 1OLCA 4OQOA 1B3LA 4ZE8A 5AA2A 1MPCA 2A5TB 1Q35A 3K00A 3LC8A 3MP8A 2XXQA 3U92A 1H44A 3D4CA 3FXRA 3FIRA 3CRBA 3EHSA 3T9HB 2YPNA 4F18A 1XVXA 1JVYA 1RYOA 2FYIA 1NFTA 4G4PA 4R9GA 2PBWA 1II5A 1POY1 5CBRA 1BIYA 4FORA 1OQHA 2PYYA 1NNKA 4DXBA 3TTKA 4IO6A 4WKMA 5H8QA 2ONRA 3CIJA 1YCJA 3OSRA 3IO6A 1AH5A 1OLAA 1WDNA 3T9VA 3IOTA 3USDA 3PPRA 2Q89A 3B7DA 3MZBA 3BKIB 3FZVA 5DVJA 1LFIA 3JYRA 1B32A 4H8JA 4NF6A 4Z0IA 2RCBA 1IXHA 3E4RA 4N13A 2V93A 1VSOA 5TU0A 1MXUA 3L6HA 4RXLA 4XKQA 1FTKA 2RINA 3MW0A 5H8NA 2F97A 1P1QA 2Y7WA 1US4A 2Y7IA 2GRVA 1PDAA 2KLFA 2ANJA 1B1HA 3C4MA 4YZZA 2M8CA 3IB1A 4WEPA 3TQWA 1R9QA 2PT1A 3VE1B 2PX1A 5I2NA 2I48A 4RYAA 5L9SA 4R73A 1TFAA 3BFTA 4F39A 4Q0CA 5H8FA 3FJ7A 1DPPA 2XXVA 2YLNA 1Y3QA 5DVFA 1WVJA 3QIMA 1FCKA 3ILTB 4LP2B 3FVKA 4RJZA 2HAUA 1Q1KA 2HQ0A 3FXQA 2OBGA 3RY3A 2QJEA 3T96B 1YPNA 4F19A 4F3PA 2ONSA 4U4XA 2DXYA 3TTRA 2QMWA 4DE8A 5BUUA 3EF7A 5I2KB 4DCYA 4PFTA 3MVZA 3IAZA 4OTEA 3PU5A 1SW1A 5CMMA 1Y20A 4G68B 2Q9TA 3QK6A 2VOZA 3U72A 4Q30B 3UN6A 4LA9A 1MQGA 2X7PA 2ZMBA 1B58A 3VFJA 1PB8A 2NUVA 4NEDA 3KBRA 3PUXE 1BP5A 2OWTA 3EQ1A 4Q8RA 4ND9A 4TQUQ 3N26A 4EXLA 3LSFB 4X9TA 3H6VA 1I6BA 4PETA 2Z8DA 1MY3A 2UXAA 4IO4A 3PUVE 3PGFA 4U4SA 4FJPA 4QFOA 4ZEKA 1LFHA 4IY5A 1XS5A 5KCJB 3WAFA 2IA4A 2B3BA 2Y7PA 5BWJA 2O1LA 5K2YA 5AA4B 2B3FA 3FUZA 3OELA 3ECRA 2V3UA 2ZYNA 2UVJA 1JW5A 3ZKKA 3TTLA 1HSJA 3K4UA 1OVBA 1S7YA 5I57A 1N04A 2RC8A 3UORA 2ALUA 1B7UA 4OENA 1FQFA 4GXSB 1LAXA 3ILUB 5FHMA 2R71A 1B3FA 4POXA 1LCTA 5AA2B 1D9VA 1UTBA 2O68A 3K01A 4I8CA 5CC2A 1LBCA 3RQTA 2UVGA 3Q26A 3C35A 1A8EA 1H3DA 3CG3A 4ZS9A 3K6VA 1POTA 4HCWA 5A5XA 4YMAA 3K2DA 3DM0A 3C32A 3IORA 3O6GA 1PEBA 5H8HA 4F3BA 2GHAA 3VVEA 3S2VA 4EQBA 1Y1MA 3Q25A 2W7YA 3IR1A 3MVYA 4KHZE 1ZU0A 3IJOB 4PQJA 5H8QB 2DE3A 2V3TA 2HZKA 1P1WA 2QPQA 3IO4A 5TP9A 3SKPA 1FTOA 3QXMA 5F7VA 2ABHA 1LAFE 1I69A 4KCDA 5HPQA 4M4GA 4OHNA 4THIA 4XIGQ 1N7XA 3MPKA 1B3GA 4K3FA 1H45A 2UYFA 1US5A 3HHFA 4XKRA 1EZPA 4ISUA 2REJA 1O63A 3IOWA 1MY2A 3N5LA 4POWA 5H8NB 3CVGA 5M2VA 3O97A 1IEJA 1TXFA 1ZIUA 3O2AA 1O64A 4ZZAA 1Z7ME 3T93B 1B0HA 5I2NB 5I58A 1GTKA 1FQAA 1N3XA 5CBSA 4YAHX 1ZLQA 3MQ9A 4QRZA 4F22A 3CR9A 4EQ9A 5H8FB 4IGRA 3BBRA 4TOZA 4PE5B 1J1NA 2RKMA 1ATGA 4F1YA 1ANFA 4R72A 4EXKA 3U94A 1RKMA 1TT1A 2CZLA 3THIA 1MDP1 3TAJA 1NL5A 4H67A 4IB2A 3MP1A 2OWSA 4X48A 4QF9A 3SDFA 5I84A 3PV0E 3OO8A 1FTMA 3OO7A 2DVCA 1USYH 3LSWA 1MXVA 1IITA 4NF5A 4JWXA 2H9BA 1NH8A 3TTNA 4P11A 4U1OA 3T66A 2DE2A 1H43A 3RTFB 3FVOA 3IOUA 1XHYA 1ZTYA 4U22A 3VLVA 4G8NA 3TDJA 5ITOA 2HCAA 1GR2A 1CE2A 4YMBA 3MVXA 1VFEA 2HAVA 3RUMA 4DXCA 1FTJA 1B05A 2XXHA 1XVYA 4KI0E 1JEVA 3D4GA 2PVUA 5DYHA 2VD2A 1O7TA 1NNPA 1LGBC 2V25A 1MRPA 4LZ8A 4RY1A 3JV9A 3GBBA 4R74A 1GVCA 1MXXA 5LOMA 5I57B 3LSLA 5IKBA 4N07A 3DELB 2Q2CA 4LATA 1SW2A 4P0GA 1MQHA 4GFRA 1MPDA 3RN8A 1B7HA 1QVSA 3QAXA 2XHDA 4GD5A 1UTBB 4G68C 2V84A 1D4NA 3PMXA 4IGTA 1WODA 1SYHA 5A5XB 2E1SA 3F11A 4JBZA 2Y7KA 5DEXA 4JWYA 3FV1A 2Q2AA 5H8HB 2ZYMA 5CMKA 4PFUA 1SDXA 3MUQA 1Y3PA 3LBSA 3SEWA 3LSXA 5HM4B 2D3IA 3FJGA 1FTLA 1MM7A 5L9OA 2NOOA 4AB6A 5TP9B 3B6WA 2O1MA 1PB7A 1EH3A 1B2HA 3M3KA 4H6DA 4ELRA 1ZJLA 3QUJA 3H03A 4U2RA 4OVJA 5J1DA 4OYVA 3C34A 4QSCA 3ONMA 1P1UA 2UYEA 1MXYA 4LZ5A 1LBBA 4JSDA 4H5GA 3PPQA 2QL3A 2XXTA 3MAMA 3OSQA 4U21A 2OZZA 3IOVA 2DE4A 3TELA 5CRYA 5I58B 3M8UA 3U1OA 2A5SA 4X1BA 3TEPA 3M3LA 4JSOA 2XXIA 1A40A 4GXAA 5ICTA 2PT2A 3UP9A 3KSXA 1YAEA 3E13X 4Q5TA 1UTHA 3RT8A 2R9JA 1S50A 4YKKA 1XC1A 4FAJA 5ELVA 2DSFA 3A09A 1A55A 1PBPA 4F31B 2F7CA 2YJPA 5H8SA 1PBQA 5JEIA 3I3VA 5DT6A 3O9PA 3MZ1A 5AA3A 1USYE 1M5CA 2VHAA 1QJMA 1IIWA 1B3HA 2F35A 1YTVA 2XXWA 2F5XA 3KSJA 4NF5B 4O3CA 3VLWA 2I0CA 2DYXA 5JK4A 2HFBA 3R6UA 4OFJA 1SVXB 3TTMA 1DTGA 4C0RA 1T0KA 1Y4CA 3EN3A 1URGA 1M5BA 5FTIA 1B6HA 1B4ZA 1P1OA 2DS9A 1SI1A 5FTHA 2XX9A 3C33A 2P1SA 2BJJX 3PD9A 2GFEA 1SW5A 4I9DA 3K6WA 3KN3A 4NF8A 4RPNA 3T9XB 2QS1A 3SETA 4YICA 4WXJA 4GVOA 3PMVA 2ZNSA 1LB8A 3K1MA 4EUOA 3K1PA 1B51A 4QSDA 3OMBA 4QFNA 4FEDA 4AQ4A 2CMOA 4FECA 2OLBA 3PPOA 5FHNA 1I6QA 4OEUA 4GL0A 1LAHE 4E0WA 3A3UA 1H76A 3S9MC 2F34A 3PUZE 1DMBA 5EHMA 2HXWA 1M5FA 4XKPA 3MJNA 3MZ9A 4ZZEA 2LAOA 2F7BA 4KQPA 4OZ9A 4H1XA 3W9WA 5CMBA 3G3GA 2O7UA 3H3GA 3H6WA 3W15C 4H0WA 1Y4TA 4MF3A 3ZSFA 3VLUA 2F36A 1VFDA 2H98A 1DTZA 4PP0A 4YKIA 4F2OA 2GHBA 3RLFE 3TKDA 4H5FA 4EF1A 3H06B 4P0IA 1IXGA 4TLLB 3PUWE 4GLIA 1JQFA 3OOAA 5I59A 3SESA 4R9FA 4RNSA 3RPWA 4X1DA 4NMYA 4H65A 3OEKA 3IJXB 4NF6B 4OESA 3L6GA 4BDRA 3DP8A 1QUIA 1JW1A 5B70A 4C1TA 3PMWA 1UTHB 1MPBA 1R1NA 2VP1A 2ZYOA 4QHQA 4ZECA 3ODBA 1TWYA 3I6VA 1MY4A 5ISUA 3TMGA 1QULA 3R26A 3MVWA 1MQJA 3KEIA 3Q27A 3G7WA 3KN7A 4QFKA 3VXCA 4PFYA 3A3CA 1B40A 1R9LA 2HZLA 5HBCA 3VV5A 1N7WA 3TQLA 3TZAA 4GOTA 2H5YA 2E0SA 4NE4A 3SEUA 3RNNA 4U1ZA 1R6ZA 1SI0A 4NWDA 3QYTA 3TPAA 4ONYA 1B46A 3H4ZA 3OENA 4O3BA 3TFLA 5JTYA 3IL1B 1F9BA 4R2BA 3BFUA 3IB2A 4LQ5A 1N84A 1NH7A 2GH9A 3C36A 1B4HA 2G29A 4KCCA 2ZNUA 4NF8B 3TCHA 3Q28A 1GV8A 3MBPA 3N6UA 3KG2A 2NXOA 2DWHA 2DQVA 4DLDA 3K6XA 3O66A 1MDQA 3E9XA 3AXFA 3B6TA 3R7XA 1RYXA 1A54A 3S9NC 2NVUB 1D3KA 3WAEA 3KZGA 3V8XB 4LZ7A 4GWOA 3GZGA 3V83A 1DPEA 1ZKBA 2XX8A 3TUSA 3OEMA 1A8FA 1BLFA 2DWAA 1SBPA 4ECFA 2F7AA 4G2ZA 1Y1ZA 1N3WA 2WKYA 2REGA 3DP4A 3RT6B 1URDA 5CI5A 4G68A 1OQGA 2NWJA 4QSEA 5AE4A 5L8DA 4KD5A 3H6UA 1ZMGA 4LVQA 4YB6A 1CB6A 4HCYA 2D5WA 4R75A 1UIVA 1B9JA 3UA8A 2I3WA 2UVIA 3FXUA 1URSA 1XT8A 1MY0A 4OERA 5B7DA 2OCUA 3FVNA 2ESNA 2DVZA 4BDOA 1DOTA 3HV1A 3O6HA 4FE8A 3HO7A 2XXRA 2AL5A 4ZEIA 1P1NA 4LQ2A 5AA4A 2O51A 4FIMA 2G93A 4NF4A 4EF2A 5EHSA 1PB9A 1MXWA 5I59B 2I4BA 4G77A 1GGGA 1PC3A 3JZJA 1QW0A 2QMXA 1VE4A 3G3FA 3HN0A 2F78A 4NWCA 4F1VA 3U8QA 1N76A 1LCFA 3GBAA 1IQ7A 3SEXA 3IX1A 4MFIA 5DVIA 3UIFA 1Y9UA 2H99A 4OXVA 4BDQA 2V3QA 1OVTA 4XXUA 4L17A 4O3AA 1MH4A 1NNFA 3VDFA 1EZOA 4IY6A 2THIA 3VVFA 1JETA 1MS7A 3PPPA 1LSTA 2Z8EA 2I3VA 2AL4A 5ITPA 2FNCA 3OD7A 3MWBA 1DSNA 3FD3A 1JNFA 2OJTA 4ZE9A 3TCFA 2Y7RA 1JEUA 2QS4A 5AA1A 1EU8A 1HSEA 5KDTA 3HSTA 3G3KA 2Q8JA 2R6GE 4ZEDA 5JTYB 3MPLA 2XXYA 3FATA 3CSGA 3SEVA 1A7LA 1B5IA 2I49A 1B52A 4IO2A 2QSXA 2QRYA 4EQ7A 1EZ9A 4OFOA 1LLSA 2F6PA 4OMBA 4RK2A 4DIGA 3SEYA 3ZKLA 2AYSA 4XTCQ 4F1UA 4BLAA 4Z7EA 2OK2A 3HPIA 1I6AA 5DTBA 3CG1A 1FW0A 2ZXTA 3K0VA 2ZYKA 5L9MA 1NNTA 3QSLA 2Z23A 2O6AA 4OFLA 1FQDA 2XXUA 4JDFA 1MM6A 4R2FA 3W9VA 3EPEA 1FQEA 2X7QA 4F2QA 3KJ7A 4H8IA 3SERA 4MBPA 2DP8A 3KN8A 4F3SA 2VGQA 3HHGA 3Q29A 2H4IA 3QUFA 1B3EA 1JVXA 1FQBA 3V89B 4JWOA 1B0LA 4RK9A 4GRKA 1Y3NA 5TPAA 2X26A 1MH3A 1BTJA 1ZBMA 1MQIA 5KZTA 3MC2A 3T9UA 2QS3A 3K6UA 2I6EA 4WEDA 4IO7A 5IAIA 4KYEA 1A99A 4KR5A 1VR5A 4ELOA 4ESXA 5DEXB 3C9HA 2RCAA 4IO5A 1M5EA 2XXXA 4QFLA 4TLMB 3O29A 4OETA 4I62A 1LAGE 5I56A 2DXRA 4MLVA 3IK6B 1MQDA 1BKAA 4GQOA 4NF4B 1ELJA 4YB7A 1IUDA 2B65A 2RC7A 1SW4A 3OO6A 4DZ1A 4PFWA 3S9EA 4ZDMA 4JXIA 3TODA 3RGYA 4G8MA 4KFQA 3KOSA 4YKPA 4C1UA 2F8DA 2HEUA 1AIVA 1M5DA 2F6GA 4E0XA 4AB5A 1D9YA 3EHUA 3O6IA 2XD2A 4G8HA 3PD8A 3EHTA 3UGWA 4F29A 1XOCA 3KGCA 2IEEA 2XD3A 2I58A 2DWIA 2A5TA 3G3JA 3ZS6A 1QUKA 4UA8A 4HTGA 2P2AA 1AL3A 4FATA 3DP6A 3P7IA 3FVGA 2VD3A 4DCXA 4HW8A 2ZNTA 3PPNA 3I5OA 4OEVA 5K2XA 2QS2A 4EDPA 4KPTA 5KDTB 4R6HA 3CSBA 2XXPA 1L5TA 4U23A 4HS7A 2DOJA 3S9LC 5CMCA 1QKBA 2P0SA 4ZEFA 3TYHA 1LFGA 2FA7A 4FEBA 5CM6A 1Z7NE 4KYDA 3FJMA 1B1XA 3PUYE 4ELPA 1UIUA 3O28A 4GL8A 1B5HA 1MY1A 4DDDA 1B5JA 5EYFA 1UQWA 2UVHA 1SQYA 2I4CA 4NTLA 2O84X 4YU0A 4OWDA 1MXZA 5FHOA 3VXBA 4ELQA 4ESWA 4KYSA 4N6PA 3K02A 4DXUA 2I0BA 4F3GA 2RF1A 2D21A 3TCGA 5F1QA 1P99A 3T22A 1AOVA 1KWHA 3G3HA 3CI8A 4M1VA 3KOTA 1JW4A 4JB7A 4BDLA 2Q88A 4YB5A 1IXIA 4R6KA 4I1DA 3LUYA 4GIZA 4RPOA 1N0TA 1SD3A 2Y84A 4XKNA 5TPAB 3OO9A 1OIBA 1HSLA 4IO3A 3E3KA 5ICQA 3KFMA 3FGSA 3GXAA 3V5AA 3H7MA 2Z8FA 3KJTA 2ONKE 1MG1A 5I2KA 3GLBA 3CFLA 1TFDA 1AMFA 3HCQA 3FV2A 3VVDA 1LB9A 4LUBA 4MLQA 3C31A 3FASA 2PMSA 2Z22A 3IB0A 1SYIA 5I56B 3UK4A 2O7IA 2AIXA 3B6QA 3N94A 3G3IA 4R6YA 4YKJA 3DLNA 1NMUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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