1H76A

The crystal structure of diferric porcine serum transferrin
Total Genus 229
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
229
sequence length
685
structure length
677
Chain Sequence
QKTVRWCTISNQEANKCSSFRENMSKAVKNGPLVSCVKKSSYLDCIKAIRDKEADAVTLDAGLVFEAGLAPYNLKPVVAEFYGQKDNPQTHYYAVAVVKKGSNFQWNQLQGKRSCHTGLGRSAGWIIPMGLLYDQLPEPRKPIEKAVASFFSSSCVPCADPVNFPKLCQQCAGKGAEKCACSNHEPYFGYAGAFNCLKEDAGDVAFVKHSTVLENLPDKADRDQYELLCRDNTRRPVDDYENCYLAQVPSHAVVARSVDGQEDSIWELLNQAQEHFGRDKSPDFQLFSSSHGKDLLFKDSANGFLKIPSKMDSSLYLGYQYVTALRNLREEECKKVRWCAIGHEETQKCDAWSINSGGKIECVSAENTEDCIAKIVKGEADAMSLDGGYIYIAGKCGLVPVLAENYKTEGENCVNTPEKGYLAVAVVKKSSGPDLNWNNLKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLYNKINSCKFDQFFGEGCAPGSQRNSSLCALCIGSERAPGRECLANNHERYYGYTGAFRCLVEKGDVAFVKDQVVQQNTDGKNKDDWAKDLKQMDFELLCQNGAREPVDNAENCHLARAPNHAVVARDDKVTCVAEELLKQQAQFGRHVTDCSSSFCMFKSNTKDLLFRDDTQCLARVGKTTYESYLGADYITAVANLRKCSTSKLLEACTFHSA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords SEROTRANSFERRIN
publication title The Crystal and Molecular Structures of Diferric Porcine and Rabbit Serum Transferrins at Resolutions of 2.15 And 2.60A, Respectively
pubmed doi rcsb
molecule tags Iron transport
total genus 229
structure length 677
sequence length 685
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h76A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h76A04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h76A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h76A03
3E13X 3IOUA 1PC3A 1UQWA 4O3CA 1D9VA 1BIYA 2AL4A 3C32A 3IX1A 4H6DA 2F34A 1YPNA 1IXGA 1RYXA 2H99A 3K0VA 4IO2A 3QSLA 3GXAA 3TELA 4DXCA 2LAOA 4H5FA 4ONYA 2YLNA 1PEBA 4RJZA 1MY1A 4EDPA 5TP9A 2I3VA 4OHNA 3CSBA 3K6VA 1FTMA 1GVCA 2O51A 4QRZA 1FTJA 3OXNA 1QKAA 5I84A 3VLUA 1Y3PA 3BBRA 4LQ5A 5CMBA 2HZKA 2I0CA 2XXXA 1Y9UA 2H4IA 1LLSA 1EU8A 2DE3A 3P7IA 2B3FA 2DYXA 4BDNA 4E0WA 1JQFA 2P1SA 3TUSA 5K2XA 5I56B 1B6HA 4U21A 2AIXA 2FA7A 5KDTA 3TTMA 5CMMA 5BWJA 4EQBA 2W7YA 3M8UA 1QKBA 4R72A 1VE4A 3K4UA 3QXMA 3K01A 1N7XA 2I0BA 4MH5A 1TWYA 1MQJA 1R9LA 3RNNA 1XHYA 1CE2A 3SETA 1M5DA 3M3FA 1MY3A 3L6GA 5CRYA 2XXTA 3DM0A 1H45A 4I62A 5AA2B 4Q30B 1POTA 5F7VA 4X9TA 4R2FA 3MC2A 1LBBA 2Q2AA 1IEJA 2UYEA 4EXLA 1MXVA 1AIVA 1NKXA 4M1VA 3EHSA 3EQ1A 3T9UA 3O29A 4QFLA 2HQ0A 1IITA 1US5A 3O6HA 1IUDA 2ZNSA 1I69A 5H8NB 3B7DA 4C1TA 4G8NA 4N13A 1I6QA 3VDFA 4JWOA 5I57A 2HZLA 4RYAA 1Z7NE 4NF4A 4GOTA 3TQLA 1MPDA 1UTBB 4GVOA 4KYSA 3MWBA 1LCFA 2OLBA 2RINA 3CSGA 2H9BA 4AQ4A 2HXWA 5KCJA 3EPEA 4OESA 3FXRA 4ZE9A 1D4NA 2UVIA 2I3WA 4TOZA 4DCYA 1ZKBA 1EZ9A 3IAZA 1LFHA 1LCTA 2RC7A 3VFJA 4YKKA 2H5YA 2Y7PA 1B1HA 3MJNA 4DE8A 3IJOB 3GLBA 1BLFA 3IB1A 4U4SA 3HN0A 4BLAA 4MF3A 4X1DA 3AXFA 1N84A 3HHGA 3IO6A 3IORA 3QIMA 4WEDA 4IO7A 3FJMA 4POWA 4PE5B 3IL1B 3G3FA 1A54A 1SI0A 4XTCQ 5CMKA 5DVJA 4F29A 4QSEA 3PPQA 4YKPA 1S7YA 1XVYA 1XOCA 4NF5B 5L9SA 1B40A 3MZ1A 5BUUA 1R6ZA 2XXQA 4F2QA 3W9VA 3MVZA 4KHZE 4YB6A 2IEEA 2X7PA 4AB5A 3KSXA 3VXBA 3V8XB 4YMBA 1DTZA 2DXRA 4P11A 3K02A 3TCGA 4FECA 2PT1A 1YAEA 2F7CA 2OZZA 2I4BA 4ZEBA 2G29A 5I56A 1J1NA 3MZBA 1PBPA 2ONKE 2XD3A 4ZE8A 2BJJX 4EF2A 3H6TA 4PP0A 3S2VA 2IA4A 3UORA 2VGQA 4KFQA 5DVFA 4GWOA 3MP6A 3FUZA 2DQVA 1B2HA 3LSLA 1VSOA 4BDMA 1NNFA 4JWXA 4XIGQ 3PMVA 3VXCA 3LR1A 4U1OA 4OXVA 4FE8A 2WKYA 4H8JA 3KN7A 3VLVA 3QK6A 4IO5A 3TEPA 1MY2A 1FTLA 5AA2A 2F7AA 1PDAA 4F1VA 2H25A 4ND9A 5I2KB 3EN3A 2F36A 3SEYA 3K1PA 2ESNA 3KG2A 2ZYMA 4DXBA 3VVDA 5DTBA 3M3LA 3TQWA 1P1OA 4ELPA 4GXAA 5H8NA 2DWJA 3E3KA 5ISUA 1MDQA 3N26A 3SKPA 2XXPA 3ECRA 2VD2A 3O2AA 1SVXB 4QFNA 4OZ9A 5ELVA 5ITPA 1SDXA 3RN8A 1H44A 4NF6B 2Z23A 3THIA 3SEVA 3CG1A 5AA3A 1R9QA 2Z8DA 3RUMA 1UTBA 3TTKA 4HCYA 1OIBA 1UTHB 2UVHA 4YB5A 4IY5A 5JK4A 4LUBA 4OETA 4AB6A 4OEUA 2RF1A 5ICQA 3Q26A 4X48A 4LONB 3RPWA 3WAEA 1SW5A 1VFEA 1QULA 3U94A 5DVIA 2HCAA 1GR2A 2REJA 2YJPA 5H8HB 4F18A 5FHNA 4OFOA 4U1ZA 3HCQA 2ZYNA 2QMWA 4R6YA 1DSNA 3FATA 1B51A 3KGCA 4N6PA 2B65A 4DIGA 4FJPA 4ZZEA 5B70A 3V83A 2A5TB 2V84A 1MXWA 1N7WA 1DOTA 4EXKA 2CZLA 5I58B 4KQPA 1D3KA 1ZTYA 3IB2A 1I6AA 4R6KA 1MG1A 5DYHA 3KFMA 4NF5A 1SW2A 4GQOA 3BFTA 5KZTA 4JXIA 3TTLA 1LB9A 4OFLA 1B0LA 3RQTA 2P0SA 4YB7A 2I4CA 3PPOA 3O28A 3KN3A 4IB2A 2Z8FA 4UACA 1Q1KA 1B5JA 3IO4A 2NOOA 3RGYA 1MDP1 4KCDA 1ZJLA 2V3QA 2OJTA 3IR1A 1ZU0A 5AA1A 4FIMA 1B4ZA 1JW5A 3LBSA 3FD3A 4YICA 1SBPA 4BDLA 4IO6A 4ZEIA 4EQ9A 3MVYA 1B7UA 2UVJA 3FXQA 3E9XA 1QVSA 3UIFA 4DDDA 4UA8A 3N5LA 1AOVA 2F97A 3RTFB 1NNKA 1TFAA 1OQHA 4F3BA 2Y84A 3KOTA 3KOSA 4JSDA 3TCFA 1LAHE 3Q25A 4WEPA 2PX1A 4OMBA 3SESA 2X7QA 5CBSA 2XD2A 3FIRA 1OVBA 2GFEA 3DP6A 1N3WA 2YPNA 4H65A 1P99A 1ZIUA 4FEDA 4ZEFA 3HHFA 5CC2A 3LUYA 3T9XB 4ZEDA 1IZ1A 3O6GA 1OMPA 5H8QB 4F39A 3HSTA 3EHTA 4XKPA 3IOVA 1MY4A 4MFIA 4NF8B 4IY6A 3K6UA 4RPNA 3EF7A 3M3KA 1B4HA 5I2KA 2XHDA 5L8DA 1ATGA 4YAHX 3PD8A 5CMCA 4O3BA 2Q89A 3K1MA 3PUVE 4YKIA 1B3FA 4LQ2A 4R2BA 3KSJA 4R6HA 1DTGA 4YZZA 3OO7A 3UP9A 4KCCA 2OWTA 3MP8A 4NF6A 5HBCA 4PQJA 1FTKA 3GZGA 3OOAA 1UTHA 4WKMA 3O97A 4DLDA 5CM6A 3GBAA 1TXFA 1B9JA 3RT6B 2DOJA 3TTRA 1B58A 3CVGA 4ZECA 4LVQA 4JWYA 4QFKA 4QHQA 4FEBA 1GTKA 4U22A 5ITOA 2DSFA 3GBBA 3FGSA 2DWAA 5H8HA 3BKIB 1HSEA 2V25A 2Z22A 3H4ZA 1II5A 5EHSA 4DXUA 3A3CA 3H06B 1ANFA 3QUFA 3K6WA 2A5TA 4QSCA 3KEIA 2QJEA 1SYIA 2PYYA 2ABHA 5I58A 1YTVA 2DWHA 4MBPA 3FV2A 3TPAA 4GLIA 4HS7A 3B6QA 1Z7ME 1ZLQA 3BFUA 5AA4B 4OERA 2O69A 2Q2CA 3G3IA 4RPOA 4YKJA 4RA1A 1P1NA 4O3AA 1L5TA 2RC9A 1LFIA 3PUXE 1H43A 4XXUA 3W15C 1LGBC 3V5AA 1TT1A 1B3GA 1FTOA 1YCJA 3TDJA 1M5BA 1NH8A 3D4CA 1Y4CA 1LSTA 2F8DA 5FTHA 1UIUA 3C33A 4NTLA 2PMSA 4ZZAA 3RTWB 2V3TA 3MPLA 2XXHA 1AL3A 1FQAA 4IO4A 4OQOA 1FW0A 2UXAA 1LAFE 4H0WA 1O63A 2H98A 1JVYA 2XX9A 1R1NA 2D3IA 2XXIA 2FNCA 4OVJA 3TYHA 3OEMA 4H5GA 3W9WA 3JV9A 1A99A 5TU0A 4C0RA 1NFTA 3T22A 3ZSFA 5H8QA 2NWJA 2AL5A 1P1WA 3IOTA 2O1LA 1IQ7A 4ESXA 1M5FA 3DLNA 1O7TA 1MPCA 1OLCA 4NF8A 1LAGE 2M8CA 1IXHA 1HSJA 2ANJA 2RC8A 3CR9A 4YMAA 3UGWA 2Y7IA 3CFLA 1JW1A 4ELOA 1A8EA 1JEUA 2O68A 4F1YA 4NEDA 2RCAA 1ZBMA 4IGTA 3KJTA 3H7MA 4KYDA 3FV1A 3G7WA 2FYIA 3PPPA 4HW8A 4R73A 4Q0CA 4QFOA 5CBRA 4GL0A 3B6TA 4U4XA 4GD5A 4TLLB 5JTYB 4LA9A 3VV5A 1OVTA 1ELJA 3K6XA 2HAVA 1PBQA 4RY1A 1EH3A 2Z8EA 1BKAA 3I5OA 1TFDA 3VLWA 3H6WA 1B0HA 3O66A 4L17A 1T0KA 3FASA 4C1UA 3TZAA 3PUZE 2VP1A 2F7BA 5H8SA 4E0XA 2P2AA 3C34A 2A5SA 1B3HA 4TQUQ 3MPKA 4IO3A 4OTEA 4BDQA 4Q8RA 2RKMA 5FHMA 4G8MA 4G68B 4X1BA 1POY1 5A5XB 4JDFA 1WDNA 5J1DA 1A8FA 3MAMA 3K2DA 4TLMB 3DELB 3K1NA 2F6GA 3F11A 1Y1ZA 1MQHA 1H3DA 1OLAA 4EQ7A 3LC8A 5AA4A 1LAXA 2THIA 1QJMA 1I6BA 3HV1A 1LFGA 1MM6A 2VHAA 1USYH 1Y20A 2DVZA 4I9DA 1S50A 4RXLA 2B3BA 2G93A 5I2NB 2ZNUA 3K00A 1PB9A 1RKMA 3FVKA 1B3LA 3UA8A 3U8QA 1Y1MA 4Q5TA 1XVXA 2CMOA 3HPIA 2XXRA 3VVEA 1AMFA 4WXJA 3LSXA 1B32A 1QW0A 1MQDA 3ILTB 3Q29A 3USDA 5AE4A 4P0GA 1B7HA 2V93A 1KWHA 1AH5A 1JVXA 3N6TA 5HM4B 3SEWA 4GF8A 5H8FB 4U2RA 2OCUA 1VR5A 1FQEA 2ZYOA 2R6GE 3T9HB 1MY0A 3S9LC 3FJGA 3O9PA 4THIA 2Q8JA 2QS3A 1SD3A 1EZOA 3ZS6A 4NWDA 4P0IA 5ICTA 3N6UA 4GRKA 3CRBA 3VE1B 3D4GA 4JB7A 1N3XA 4JBZA 4XKRA 3OEKA 2O6AA 4R75A 5TPAB 1MQGA 1SW4A 4G4PA 3S9NC 3ZKLA 1MXYA 4F22A 3O6IA 4ELQA 5EYFA 4OWDA 2F6PA 4F2OA 4F1UA 1DPPA 4EUOA 2V3UA 2QL3A 1N0TA 2F5XA 3G3GA 5JTYA 3OSQA 1FQBA 1GV8A 2GRVA 2NUVA 4OEVA 1NMUA 1P1QA 4GIZA 4R9GA 4LZ8A 2O7UA 4KI0E 3LSFB 1SW1A 2UVGA 1H76A 3A3UA 4ZEKA 1JEVA 5B7DA 2I6EA 5L9MA 2KLFA 3JZJA 1WODA 1B05A 2R9JA 2QS1A 3C35A 4FAJA 4GXSB 4PETA 3MZ9A 3PV0E 1GGGA 2DXYA 3B6WA 4G68A 1XS5A 1XT8A 3T96B 4RNSA 5A5XA 3L6HA 3A09A 2OWSA 4U23A 4RK2A 3G3KA 1N04A 5JEIA 3RT8A 3U72A 3DP8A 1S9TA 4M4GA 4LATA 4FATA 1SYHA 3CI8A 4G68C 1BP5A 2D21A 3U1OA 1BTJA 2ZMBA 3MP1A 2DWIA 1URDA 3HO7A 2RCBA 3T93B 4H8IA 1FQFA 2DS9A 2GHAA 4K3FA 3TAJA 1IXCA 5FTIA 3H03A 5I2NA 3H6UA 3OO8A 3H6VA 4PFTA 3FVOA 1B46A 4YU0A 4GFRA 3OO6A 2I49A 3SEXA 4OENA 3IB0A 1US4A 3QAXA 1MPBA 3Q28A 4ELRA 1PB7A 4I1DA 3KBRA 3CG3A 2Y7WA 3EHUA 3OD7A 3SERA 4LP2B 3R7XA 2HEUA 1B7ZA 2QSXA 4QF9A 5LOMA 2ZYKA 4KYEA 1RYOA 2O84X 1QUIA 3C9HA 4OYVA 2ONRA 5DEXB 1B5IA 3TMGA 1P1UA 5I59B 5H8FA 1ZMGA 3CIJA 2HFBA 3FXUA 4ZS9A 2GH9A 2DVCA 2XXVA 2AYSA 4FORA 1URSA 2I58A 4OFJA 3PUWE 1MH3A 3FVNA 2I48A 4XKNA 1USYE 2X26A 3FJ7A 3T66A 3MVXA 4F3SA 3OENA 3TTNA 2E0SA 4I8CA 2XX8A 3ZKKA 1B52A 4KD5A 2ZXTA 2REGA 3Q27A 2DP8A 5TPAA 2HAUA 2QPQA 3PMWA 2QRYA 3E4RA 3U93A 1M5CA 3I6VA 3PPNA 3C31A 2XXUA 4H67A 4PFWA 2F35A 1IIWA 3FVGA 4JSOA 5HPQA 4DZ1A 5IKBA 2O7IA 1IXIA 3MVWA 4QFPA 2ZNTA 1FQDA 3QYTA 1EZPA 5DT6A 3LSWA 5IAIA 1Y3NA 2GHBA 5FHOA 3H3GA 1LBCA 2F78A 3C36A 2E1SA 3TFLA 2XXYA 2NXOA 4G77A 1A40A 3ILUB 3R26A 4Z7EA 4KPTA 2DE2A 2QMXA 4BDOA 1PB8A 3KZGA 1NNTA 4HTGA 3RY3A 4ESWA 5CI5A 1B3EA 2Y7KA 3PGFA 3OELA 2DE4A 1MXZA 1A7LA 3KN8A 3RLFE 1DMBA 4BDRA 3KJ7A 3T9VA 3N94A 5TP9B 3CFZA 2VD3A 5AA2D 3CFXA 5M2VA 4N07A 1SQYA 4R74A 1B5HA 3SDFA 3I3VA 3OMBA 2UYFA 3C4MA 4XKQA 2R71A 3IK6B 3V89B 1N76A 3FZVA 4KR5A 1SI1A 4MLVA 1F9BA 2PBWA 3G3JA 5F1QA 3UK4A 1O64A 4LZ5A 1MH4A 2D5WA 1NNPA 3MUQA 2Y7RA 4POXA 2ONSA 4IGRA 4F3PA 1Y4TA 1QUJA 1HSLA 4Z0IA 1JW4A 1LB8A 4G2ZA 3PD9A 3ONMA 1OQGA 2QS4A 2XXWA 4ISUA 2Q88A 1MXUA 1NH7A 5KDTB 4HCWA 4ECFA 4GL8A 1MS7A 5EHMA 3S9MC 1D9YA 2PVUA 5DEXA 5I59A 4F3GA 4DCXA 4NMYA 1URGA 3S4UA 2PT2A 1NL5A 3VVFA 1Y3QA 3OSRA 4F19A 3PUYE 4NE4A 3TCHA 4MLQA 3OO9A 3R6UA 1UIVA 4H1XA 1FQCA 5L9OA 3U92A 3IOWA 4F31B 2OBGA 3TODA 1JNFA 4R9FA 3G3HA 1MRPA 1B1XA 4PFYA 1WVJA 1FCKA 1JETA 4RK9A 3PU5A 2OK2A 3MQ9A 3S9EA 3WAFA 4NWCA 3MW0A 3TKDA 3PPRA 2Q9TA 2VOZA 1MM7A 1M5EA 4G8HA 1MXXA 2XX7A 1MQIA 2ALUA 1VFDA 5I57B 1A55A 3MBPA 2QS2A 3ODBA 3IJXB 4NF4B 1DPEA 3UN6A 3DP4A 2NVUB 2O1MA 1CB6A 3JYRA 3PMXA 3SEUA 5KCJB 1Q35A 4LZ7A 4PFUA 5K2YA 1XC1A 4ZDMA 4EF1A 4QSDA 1QUKA 3QUJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3E13X 4N4UA 3IOUA 1PC3A 1UQWA 4O3CA 4XF5A 1D9VA 1BIYA 2AL4A 3C32A 3IX1A 4H6DA 2F34A 1CNQA 1YPNA 1IXGA 1RYXA 2H99A 1KZ8A 3K0VA 4IO2A 3QSLA 4PFRA 3GXAA 3TELA 4DXCA 4JVDA 2LAOA 4H5FA 4ONYA 2YLNA 1PEBA 3CHGA 4RJZA 3HFUA 1MY1A 4EDPA 5TP9A 2I3VA 4OHNA 3CSBA 3K6VA 3LUZA 1FTMA 1GVCA 2O51A 4QRZA 1RDZA 1FTJA 3OXNA 1QKAA 5I84A 3VLUA 1Y3PA 3BBRA 4LQ5A 5CMBA 1Q9DA 2HZKA 2I0CA 2XXXA 1Y9UA 2H4IA 1LLSA 1EU8A 2DE3A 3P7IA 2B3FA 2DYXA 4BDNA 4E0WA 1JQFA 2P1SA 3TUSA 5K2XA 1LBYA 1NUXA 5I56B 1B6HA 1QGXA 4U21A 2AIXA 2FA7A 1NUWA 2Y5LA 2XWKA 5KDTA 3TTMA 5CMMA 5BWJA 4EQBA 1KA0A 3E78A 2W7YA 3M8UA 1QKBA 4R72A 1VE4A 5A5LA 3K4UA 2CZHA 3QXMA 1FBGA 3K01A 1N7XA 1LBWA 2I0BA 4MH5A 2FVZA 1TWYA 5LDZA 1MQJA 1R9LA 5IGAA 4NF0A 3RNNA 1XHYA 1CE2A 3SETA 1FPIA 1M5DA 3M3FA 1MY3A 3L6GA 5CRYA 2XXTA 3DM0A 1H45A 4I62A 3RPLB 5AA2B 1YXIA 4Q30B 4GWWA 1POTA 5F7VA 4X9TA 4R2FA 3MC2A 1LBBA 2Q2AA 1IEJA 2UYEA 1RDXA 4EXLA 1MXVA 1AIVA 1NKXA 4M1VA 3EHSA 3EQ1A 3T9UA 3O29A 4QFLA 2HQ0A 4LN5A 1IITA 1US5A 3O6HA 4PF6A 1IUDA 2ZNSA 2B4MA 1I69A 5H8NB 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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