1H76A

The crystal structure of diferric porcine serum transferrin
Total Genus 229
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
229
sequence length
685
structure length
677
Chain Sequence
QKTVRWCTISNQEANKCSSFRENMSKAVKNGPLVSCVKKSSYLDCIKAIRDKEADAVTLDAGLVFEAGLAPYNLKPVVAEFYGQKDNPQTHYYAVAVVKKGSNFQWNQLQGKRSCHTGLGRSAGWIIPMGLLYDQLPEPRKPIEKAVASFFSSSCVPCADPVNFPKLCQQCAGKGAEKCACSNHEPYFGYAGAFNCLKEDAGDVAFVKHSTVLENLPDKADRDQYELLCRDNTRRPVDDYENCYLAQVPSHAVVARSVDGQEDSIWELLNQAQEHFGRDKSPDFQLFSSSHGKDLLFKDSANGFLKIPSKMDSSLYLGYQYVTALRNLREEECKKVRWCAIGHEETQKCDAWSINSGGKIECVSAENTEDCIAKIVKGEADAMSLDGGYIYIAGKCGLVPVLAENYKTEGENCVNTPEKGYLAVAVVKKSSGPDLNWNNLKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLYNKINSCKFDQFFGEGCAPGSQRNSSLCALCIGSERAPGRECLANNHERYYGYTGAFRCLVEKGDVAFVKDQVVQQNTDGKNKDDWAKDLKQMDFELLCQNGAREPVDNAENCHLARAPNHAVVARDDKVTCVAEELLKQQAQFGRHVTDCSSSFCMFKSNTKDLLFRDDTQCLARVGKTTYESYLGADYITAVANLRKCSTSKLLEACTFHSA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Iron transport
molecule keywords SEROTRANSFERRIN
publication title The Crystal and Molecular Structures of Diferric Porcine and Rabbit Serum Transferrins at Resolutions of 2.15 And 2.60A, Respectively
pubmed doi rcsb
total genus 229
structure length 677
sequence length 685
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h76A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h76A04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h76A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h76A03
4XTCQ 4JWOA 1URGA 1UTBB 4FAJA 1O63A 1WODA 1POY1 2O7IA 1Y9UA 1JEVA 2G29A 2NVUB 4THIA 3FV2A 4L17A 3G3JA 3DELB 1MPBA 1XS5A 1B0LA 4XIGQ 4NF4B 3AXFA 3UK4A 1JQFA 1IUDA 1NNTA 1P1WA 3V83A 4F3PA 2VD3A 3U1OA 4Z7EA 2DE4A 4ZE9A 3CG3A 3K0VA 4GFRA 3SESA 3EHSA 3FV1A 2D3IA 3I6VA 3L6HA 1YTVA 2ZYOA 2QL3A 4HCYA 2REGA 1Y3PA 4ELQA 2QS2A 4LONB 1WDNA 3FVNA 1H76A 3RY3A 1PBPA 3TTMA 4QSEA 5TP9A 1MH4A 2OJTA 1LAXA 1SBPA 3B7DA 2I0BA 1B1XA 3TCGA 1B9JA 4H5GA 1GTKA 1QW0A 4DCYA 1XVYA 4AB6A 2F34A 3O2AA 4H6DA 4ONYA 1AOVA 1AIVA 2XXQA 2I4BA 1O7TA 1P99A 5J1DA 4H65A 1B7UA 4LQ2A 4YZZA 2Y7WA 3T9UA 4EXKA 2E0SA 5H8NA 4R74A 4NWDA 2O68A 1GVCA 3OD7A 3O28A 1B7ZA 5DVFA 1SVXB 4F39A 2RCBA 1XC1A 1VFEA 1D9VA 4F2OA 1S50A 3PPQA 3KN8A 5HBCA 2RC7A 3TYHA 4IO3A 3K6UA 3O6GA 3VVEA 1KWHA 5AA4B 4H8JA 1N84A 3VLUA 1M5EA 2AL4A 1Y4TA 3TELA 4H67A 1HSLA 5TU0A 1SI0A 1JNFA 3TKDA 4C0RA 3OO6A 5H8SA 4OERA 4XKPA 4F1UA 4NF8A 4GRKA 4QF9A 3UN6A 4RPNA 2GHAA 3TQLA 4RXLA 4I9DA 1PB8A 4GXAA 3A3UA 3PGFA 2RKMA 4YAHX 3D4CA 4MLVA 2Q9TA 1USYE 4Q5TA 1PC3A 4G77A 1LCFA 3FXQA 5H8QB 2X7PA 4ND9A 4XKQA 4FECA 4QHQA 3K6VA 3TEPA 1BIYA 2VOZA 3IK6B 4KCDA 5I57A 3IOUA 2H98A 4U21A 5AA4A 1DPPA 3EPEA 3OELA 3ZSFA 3FUZA 3TZAA 2Y84A 4RYAA 2QS4A 1D9YA 3B6TA 3H7MA 5FTHA 4G8HA 1XHYA 5I2KB 3IOTA 1NH7A 2DXRA 4OMBA 1R9LA 3MBPA 1MDQA 1MY3A 2V25A 1A40A 4F29A 5DT6A 4DE8A 1T0KA 2ZMBA 4PFYA 3PV0E 3KOTA 4H0WA 5K2XA 2IA4A 2O6AA 3K1MA 3E4RA 1B40A 4IO7A 3M3KA 1MQIA 2AYSA 4FIMA 4ZZEA 4EQ7A 2VGQA 4YB5A 3TAJA 1MG1A 5I58A 3OENA 4OZ9A 1NKXA 3DP4A 4OESA 1LFHA 5FTIA 4YB7A 2QMXA 5ISUA 1J1NA 3RLFE 4IY6A 3KEIA 1DOTA 5I2NB 2QSXA 1VE4A 2DWAA 1MRPA 5KDTB 3Q25A 2H25A 3QK6A 5ICTA 3HV1A 1LB9A 5AA3A 5CMCA 3GBAA 3DP6A 2PYYA 1R1NA 3K02A 3KJ7A 3LSXA 1ZU0A 2WKYA 4M4GA 2ZNSA 4PETA 3V5AA 5I59B 4TQUQ 3C9HA 1LSTA 4KHZE 3KOSA 1MXWA 4POWA 1MPDA 3IR1A 1TWYA 3OO7A 3H6TA 2I58A 3MUQA 3RNNA 3IAZA 4IO2A 3T9VA 1B51A 2ALUA 1PB7A 5M2VA 2ONSA 4U4XA 3KSJA 5CI5A 3RGYA 3SKPA 1BKAA 3MVYA 4JBZA 1Y1MA 2FA7A 4MFIA 3KZGA 1URDA 5H8HA 4GF8A 3MPKA 5EHSA 5AA2B 1AMFA 4U2RA 3ONMA 1ANFA 3S9LC 3CSBA 2PT1A 2XX8A 2DWIA 2DQVA 3QXMA 4H5FA 4F1VA 3SETA 1A54A 4LZ7A 3O97A 3VVDA 1FTLA 1MXUA 4LQ5A 4FEDA 1N3XA 3IO6A 1MDP1 3ZS6A 2ZNTA 2QPQA 1PEBA 1IXHA 4HW8A 4RPOA 3PPOA 2O1MA 3CG1A 5ITOA 3USDA 1M5DA 2P1SA 3BKIB 2YJPA 4RA1A 2ESNA 3U8QA 3IL1B 1B3GA 2D21A 3MZ9A 2HXWA 1B4HA 1XT8A 3H6WA 1Q1KA 2F78A 4YKKA 1NMUA 1PBQA 3MZ1A 1M5BA 3C36A 4G8NA 3G3FA 4NE4A 4ZEBA 1NNKA 5A5XB 4HCWA 4ISUA 5TP9B 5IAIA 1FW0A 4FATA 1MM6A 2XXIA 3IO4A 1SYIA 4E0XA 2AIXA 2V3TA 3M3FA 2HEUA 5HM4B 1B32A 1LFIA 5L9MA 1O64A 1ZBMA 4IGRA 2VHAA 2F36A 4JWYA 3GXAA 3SEXA 4R6HA 4EF2A 4BDRA 3T22A 5KCJA 3U93A 2UVHA 4OVJA 4OTEA 3VV5A 5B70A 4FORA 2Q88A 2UVGA 3HHGA 1SW2A 5CBSA 4KYDA 4R9GA 4R72A 5H8NB 4ZEDA 3TFLA 2OCUA 1OQHA 3I3VA 2O84X 1MQDA 4GD5A 4WEDA 3RT8A 3CRBA 2PMSA 3R26A 1S7YA 2F8DA 4BLAA 3QUJA 3H03A 4O3CA 1SYHA 4RK2A 5BWJA 5A5XA 4F19A 4C1UA 2Z8DA 4GLIA 2F7CA 2HAVA 5L8DA 3HPIA 1ELJA 1OQGA 5CC2A 1Z7NE 4U1ZA 2HZLA 1WVJA 1B7HA 1OIBA 4X48A 2ANJA 1PB9A 3FJGA 3KJTA 1QVSA 5L9SA 3PMXA 2DWHA 4NF8B 4DCXA 4IO4A 2NOOA 4IO6A 3H4ZA 2Y7IA 5I84A 1LGBC 1YCJA 1N04A 2OZZA 3TQWA 1QUJA 2YLNA 1S9TA 2NUVA 4FEBA 3W9VA 3MP1A 3V89B 1A55A 1Y20A 4WKMA 1BP5A 2F5XA 1N0TA 2DP8A 3A3CA 4H1XA 1GR2A 4POXA 3E9XA 3GBBA 3B6WA 2LAOA 3FZVA 3EF7A 4OQOA 2DE3A 1FQBA 1CE2A 1MQGA 3VXBA 5F1QA 3W15C 3S9MC 1ZIUA 1ZKBA 4LP2B 2XD2A 4X1DA 5K2YA 2ZYKA 3MWBA 3K00A 3H3GA 1B4ZA 3OEMA 5I57B 4PFTA 1JVXA 3CIJA 3UP9A 2G93A 3K1PA 1PDAA 1QULA 2PBWA 3DP8A 3RUMA 4BDLA 2HZKA 1EU8A 3VLVA 2XXVA 4F1YA 3TTNA 5B7DA 1MM7A 4PQJA 1EH3A 3BBRA 2Q2CA 1FTOA 1JVYA 3T93B 1NH8A 2V93A 1I6QA 1I6AA 1DSNA 1LBCA 1SW4A 4I8CA 5CRYA 1FQFA 3ZKKA 1TFAA 3IOVA 4Q30B 1DMBA 1FTKA 2Z22A 3LSFB 4TLMB 3C4MA 3T9HB 5I58B 2UVJA 4QFKA 5ICQA 2GH9A 1JW1A 3S2VA 3THIA 3K4UA 2GRVA 1MXYA 2B3BA 2B3FA 2Z8EA 2E1SA 1LCTA 1FQAA 4I1DA 2F97A 2F7BA 1B3FA 3SEVA 3OO9A 2DSFA 4KD5A 1ZJLA 3G3HA 2XXTA 3IOWA 4LVQA 3SDFA 1MXXA 5CMKA 2XXPA 1NNPA 3U92A 4IY5A 4ZS9A 2R6GE 1Z7ME 3K6WA 4NTLA 4F3BA 2ZNUA 1LLSA 4K3FA 3MZBA 3FVKA 4AQ4A 4KQPA 2DVZA 1VSOA 1YAEA 2I6EA 3O66A 2VP1A 4P0IA 4DZ1A 2H99A 3QSLA 3VLWA 3IORA 4N6PA 4NF5B 3OSQA 4U1OA 1IIWA 2REJA 3OMBA 5DVJA 4WEPA 4QFNA 3MPLA 1FQEA 3LC8A 4G4PA 3G3IA 2I0CA 3T9XB 3PUVE 4OFOA 4ZEIA 1MY2A 4G68A 4N07A 1A8FA 3KG2A 3D4GA 2PX1A 1NL5A 5DTBA 2Z8FA 5H8HB 1MQJA 1OVTA 4R2BA 1FQDA 1RYOA 3TMGA 3ZKLA 4QSDA 4R2FA 2HAUA 4OHNA 2I4CA 1FCKA 3MQ9A 5CBRA 1F9BA 2PT2A 4QRZA 3TPAA 3GLBA 4OETA 3PMVA 3WAFA 3KSXA 3U94A 4R73A 1IXIA 4ZZAA 2X26A 3K01A 4FJPA 4GL8A 4G2ZA 3G3GA 4F22A 2FYIA 1Y3NA 4PFUA 2UYEA 1FQCA 3FATA 1TFDA 5TPAA 2PVUA 1IEJA 4NF5A 4YKPA 4QFOA 1MPCA 4PE5B 4KI0E 3TODA 3C35A 1SD3A 3KFMA 3SEWA 4F3SA 3N94A 1B3EA 1HSEA 3VFJA 3H6UA 5JTYA 3K1NA 3WAEA 1LBBA 2RCAA 2O69A 4IB2A 3IX1A 3FD3A 3QIMA 2DE2A 4H8IA 3DLNA 3LR1A 1QUIA 4IO5A 1I6BA 1B1HA 5DEXB 4LZ5A 3OSRA 4OENA 1MY1A 3RN8A 4JDFA 4XXUA 3T96B 5I56A 2V3UA 3H6VA 4OFLA 3MC2A 1Y3QA 3GZGA 3FJ7A 4C1TA 1L5TA 2A5TA 1P1QA 1RYXA 4EQBA 3UGWA 3PPRA 5KCJB 3HO7A 2XD3A 1SW1A 3F11A 1YPNA 2R71A 4DLDA 4NMYA 4ZECA 4HS7A 3FVGA 3N5LA 3TCHA 4RJZA 2XXHA 2CMOA 2ONRA 1Q35A 1IXCA 4DIGA 1JETA 4GXSB 4Z0IA 4G68C 1II5A 2XX7A 1ATGA 3LSLA 4P11A 2RF1A 1LFGA 5CMBA 2QRYA 1OLAA 2GFEA 1BTJA 3G7WA 3U72A 3RTFB 4JB7A 5DEXA 4DXCA 4N13A 4F31B 3TDJA 1URSA 4JSOA 1US4A 3SEUA 3TUSA 4GOTA 4UA8A 4GL0A 4U4SA 4JXIA 1B05A 2W7YA 2BJJX 2XXWA 3QAXA 2ABHA 1MQHA 4OXVA 4ZEKA 4NF6A 4ESXA 1QUKA 1N3WA 2V84A 3QUFA 4MH5A 4YU0A 4GIZA 1M5FA 4OYVA 1H45A 1A7LA 5CMMA 1VR5A 3HN0A 1AH5A 3CR9A 1IITA 4KYSA 1XVXA 3UA8A 5DVIA 3S4UA 5EHMA 2B65A 1A99A 1XOCA 2ZYNA 4AB5A 1MY0A 3LUYA 2R9JA 4WXJA 1QKAA 1ZMGA 4F3GA 3H06B 4EQ9A 4LUBA 4R6YA 3BFTA 1AL3A 4JSDA 1H44A 2I48A 2VD2A 3MVXA 2XX9A 1ZTYA 3N6UA 2P2AA 4GWOA 4I62A 5H8FA 3VE1B 2F6GA 2V3QA 2DS9A 2THIA 3ECRA 4ZE8A 1B5IA 3C32A 2HCAA 2QMWA 4YMBA 5JEIA 5FHMA 1TT1A 3RQTA 5AE4A 3SERA 3MJNA 3RT6B 4G8MA 1UTBA 5L9OA 2I49A 4BDMA 3QYTA 3E3KA 3FJMA 3BFUA 4NF4A 1H3DA 3PMWA 2O51A 2DXYA 4R9FA 2F7AA 3C34A 3TTKA 4OFJA 3N6TA 1B5HA 1JEUA 1CB6A 1ZLQA 3C33A 1MH3A 1B58A 1D4NA 3TTLA 1H43A 1R9QA 4OEUA 3PUWE 3HSTA 5LOMA 2H5YA 4MBPA 3IB2A 3R6UA 2QS1A 4R6KA 3EN3A 3IB0A 4Q0CA 3OOAA 3HHFA 5KZTA 4X1BA 1QKBA 1FTJA 3KBRA 1TXFA 3MAMA 1IQ7A 1OLCA 1UIVA 2KLFA 1NFTA 2Q8JA 1N7WA 2XXXA 4F2QA 4OWDA 5ITPA 3MW0A 4YB6A 4DXUA 2QS3A 4YKJA 1SQYA 3FXUA 1IXGA 3KN3A 5ELVA 1LAFE 3C31A 3KN7A 3S9EA 1JW4A 1USYH 3FIRA 2XXRA 3B6QA 1RKMA 4KFQA 2I3WA 4LATA 3IB1A 5CM6A 3CFLA 3I5OA 2M8CA 3VDFA 3SEYA 5FHNA 2RINA 5FHOA 2DWJA 3UIFA 4RY1A 4G68B 1B46A 4R75A 4ZDMA 1MY4A 2IEEA 2I3VA 3MP8A 4Q8RA 3OEKA 3VXCA 1JW5A 1SI1A 4U22A 1I69A 2F6PA 3FGSA 1A8EA 3HCQA 1Y1ZA 3V8XB 3E13X 1UTHB 2XXYA 3ILUB 4O3BA 2DYXA 3P7IA 1EZOA 3EHUA 3G3KA 2UVIA 1P1UA 1DTGA 3OXNA 3MVZA 1B3HA 4ZEFA 3PPPA 2ONKE 4O3AA 2Q89A 1LAHE 1UQWA 1GV8A 5TPAB 2A5SA 4EF1A 4XKNA 4BDOA 1IZ1A 4RK9A 3CFZA 4YICA 1D3KA 2ZYMA 4EUOA 2QJEA 3CSGA 1LB8A 1N7XA 4DDDA 2UXAA 1US5A 2Z23A 4U23A 3PUYE 4YKIA 2RC9A 1POTA 4BDNA 5JTYB 2OK2A 3IJXB 3JV9A 1B2HA 2YPNA 4TOZA 1QJMA 2H4IA 2NWJA 2UYFA 4MLQA 1B5JA 4GVOA 4FE8A 3RPWA 5H8QA 3O29A 2XHDA 3W9WA 2RC8A 3O6HA 4NEDA 1LAGE 3TTRA 3N26A 4ELOA 1B6HA 4QFPA 3EHTA 5I56B 3Q28A 5EYFA 5AA2D 4KCCA 2XXUA 1UTHA 2D5WA 2P0SA 1GGGA 5DYHA 5BUUA 2A5TB 3RTWB 5I2KA 4KYEA 1UIUA 3MP6A 1B52A 5IKBA 3EQ1A 2Y7KA 2HQ0A 2O1LA 5HPQA 4X9TA 4DXBA 3L6GA 3UORA 1SDXA 4RNSA 4ESWA 3O9PA 2Y7PA 2OBGA 4EXLA 3CI8A 4P0GA 3Q27A 3S9NC 4KR5A 1NNFA 4YMAA 2NXOA 4QFLA 4NWCA 3KGCA 4M1VA 2Y7RA 1MXZA 3VVFA 4QSCA 2DVCA 4IGTA 3M8UA 2FNCA 3PUXE 1M5CA 4GQOA 2ZXTA 3MVWA 5F7VA 2OWTA 5I2NA 2OWSA 4KPTA 5KDTA 3K2DA 3R7XA 1DTZA 3ODBA 4PP0A 2DOJA 3A09A 1HSJA 1MS7A 2CZLA 4NF6B 4ELRA 4E0WA 3Q29A 3CVGA 1MXVA 3IJOB 3PPNA 1B0HA 2H9BA 3O6IA 2AL5A 4PFWA 3K6XA 3JZJA 3OO8A 4F18A 1FTMA 3JYRA 1OMPA 2OLBA 4ELPA 1Y4CA 1N76A 3FXRA 3LSWA 4LZ8A 3LBSA 4ECFA 3FASA 5I59A 4OEVA 4TLLB 1VFDA 4XKRA 1DPEA 4JWXA 2X7QA 3PD9A 4HTGA 5JK4A 1OVBA 3PU5A 3DM0A 4BDQA 4MF3A 3PUZE 3ILTB 3M3LA 1SW5A 1EZPA 1R6ZA 3FVOA 3T66A 2Q2AA 3Q26A 5AA2A 1B3LA 5AA1A 4LA9A 1P1NA 5H8FB 3CFXA 4UACA 3TCFA 2HFBA 4EDPA 1EZ9A 2F35A 1BLFA 2GHBA 2O7UA 3PD8A 1P1OA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4XTCQ 4JWOA 2F3BA 2R8TA 1URGA 1UTBB 4FAJA 1O63A 1WODA 1POY1 2O7IA 3KC1A 1Y9UA 1JEVA 2G29A 1FBPA 2NVUB 4THIA 1Q9DA 5A5LA 3FV2A 4L17A 1FBGA 4AS4A 2CZIA 3QMFA 3G3JA 3DELB 1MPBA 1XS5A 1B0LA 4XIGQ 4NF4B 3AXFA 3UK4A 1JQFA 3RYDA 1IUDA 1NNTA 1P1WA 3V83A 4F3PA 2VD3A 3U1OA 4Z7EA 2DE4A 4ZE9A 1QGXA 3CG3A 1NV4A 3K0VA 4GFRA 3SESA 3EHSA 3FV1A 2D3IA 3I6VA 1FBHA 3L6HA 1YTVA 2ZYOA 2QL3A 4HCYA 2VPOA 2REGA 1Y3PA 4ELQA 1LBYA 2QS2A 4LONB 1WDNA 3FVNA 1H76A 3RY3A 1PBPA 3TTMA 4QSEA 5TP9A 1MH4A 2OJTA 1LAXA 1SBPA 3B7DA 2I0BA 1B1XA 3TCGA 1B9JA 4H5GA 1GTKA 1QW0A 4DCYA 4NN3A 1FRPA 1XVYA 4AB6A 2F34A 3O2AA 4H6DA 4ONYA 2WEFA 1AOVA 1AIVA 2XXQA 3KBZA 2I4BA 1O7TA 1P99A 5J1DA 4H65A 2WBBA 1B7UA 2ZZXA 4XEQA 1SPIA 4LQ2A 5IZZA 4YZZA 2Y7WA 3T9UA 4EXKA 2E0SA 5H8NA 4R74A 2ZZVA 4HE0A 4NWDA 2O68A 2XWKA 1GVCA 4O7IA 3OD7A 3O28A 1B7ZA 5DVFA 1SVXB 4F39A 2RCBA 4PAIA 1XC1A 1VFEA 1D9VA 4F2OA 1S50A 3PPQA 3KN8A 4PE3A 5HBCA 2RC7A 3TYHA 4IO3A 3K6UA 3O6GA 3VVEA 1KWHA 2XWVA 4O8MA 5AA4B 4H8JA 1N84A 2XXKA 3VLUA 1M5EA 2AL4A 3LUZA 4N15A 4XFEA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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