1H76A

The crystal structure of diferric porcine serum transferrin
Total Genus 229
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
229
sequence length
685
structure length
677
Chain Sequence
b'QKTVRWCTISNQEANKCSSFRENMSKAVKNGPLVSCVKKSSYLDCIKAIRDKEADAVTLDAGLVFEAGLAPYNLKPVVAEFYGQKDNPQTHYYAVAVVKKGSNFQWNQLQGKRSCHTGLGRSAGWIIPMGLLYDQLPEPRKPIEKAVASFFSSSCVPCADPVNFPKLCQQCAGKGAEKCACSNHEPYFGYAGAFNCLKEDAGDVAFVKHSTVLENLPDKADRDQYELLCRDNTRRPVDDYENCYLAQVPSHAVVARSVDGQEDSIWELLNQAQEHFGRDKSPDFQLFSSSHGKDLLFKDSANGFLKIPSKMDSSLYLGYQYVTALRNLREEECKKVRWCAIGHEETQKCDAWSINSGGKIECVSAENTEDCIAKIVKGEADAMSLDGGYIYIAGKCGLVPVLAENYKTEGENCVNTPEKGYLAVAVVKKSSGPDLNWNNLKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLYNKINSCKFDQFFGEGCAPGSQRNSSLCALCIGSERAPGRECLANNHERYYGYTGAFRCLVEKGDVAFVKDQVVQQNTDGKNKDDWAKDLKQMDFELLCQNGAREPVDNAENCHLARAPNHAVVARDDKVTCVAEELLKQQAQFGRHVTDCSSSFCMFKSNTKDLLFRDDTQCLARVGKTTYESYLGADYITAVANLRKCSTSKLLEACTFHSA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords SEROTRANSFERRIN
molecule tags Iron transport
publication title The Crystal and Molecular Structures of Diferric Porcine and Rabbit Serum Transferrins at Resolutions of 2.15 And 2.60A, Respectively
pubmed doi rcsb
total genus 229
structure length 677
sequence length 685
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h76A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h76A04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h76A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h76A03
1MPCA 1RYOA 3KZGA 3PUZE 3MZ1A 4H5FA 1JW5A 2HZLA 4MLQA 5H8HA 5KCJB 3K1PA 2NUVA 4M4GA 2PT1A 1P1NA 3B6TA 1LAHE 1LBCA 1MY3A 3CVGA 1SW1A 3VV5A 3FV2A 1B3FA 1N7XA 2I6EA 4GWOA 1DTGA 3Q28A 1LCFA 4FEBA 3S9EA 4YB5A 4ONYA 1H43A 1UIVA 4MF3A 4RK9A 1B3GA 2F8DA 4R72A 5FHOA 4JWXA 1PB8A 1EZOA 4R6YA 3H6UA 4ZEIA 3TKDA 1MM6A 2RCAA 3M3LA 4WKMA 1DOTA 5JTYA 4LUBA 1PC3A 3N6UA 3PUWE 3LSXA 4YZZA 2B3FA 1B7UA 4IO5A 4ZZAA 1EZPA 1Y9UA 5I2KA 2I0BA 2ZNSA 3O6HA 4ZEFA 3LSFB 1RKMA 3UP9A 3KGCA 3KN8A 2UYEA 4FECA 1MXXA 2ONSA 3H3GA 2DP8A 4IO2A 4X9TA 2I3WA 2ONRA 1I69A 4XIGQ 1B58A 1DSNA 3O6GA 4F3SA 1VSOA 4HTGA 2Z8FA 2I58A 4O3AA 3W9WA 2W7YA 1B5JA 3FJMA 4LZ7A 4NTLA 4OERA 1H3DA 3PPPA 2O6AA 5TP9A 3QIMA 3SEVA 4DE8A 3PGFA 4EQ9A 3SETA 2Q89A 3OMBA 4NF4A 3OEMA 3R26A 4OMBA 1RYXA 4OESA 2Q8JA 1LAXA 5CMMA 4EXLA 4U4SA 4G68C 3PPRA 3U1OA 1PDAA 2Z23A 3MBPA 2ZYOA 4XKPA 4F3PA 4IGTA 4MBPA 3PD8A 3TTRA 1MDQA 3MVXA 4X1DA 1B5HA 1A8EA 4BDMA 3OELA 4KHZE 2OZZA 1H44A 2XXHA 4EF2A 3SEXA 2RC7A 1OVTA 3T9VA 1YPNA 4QSCA 1SVXB 1Z7NE 4RYAA 3EQ1A 1N04A 3A3CA 4FE8A 4FORA 1IXIA 2DWHA 3GBBA 3UIFA 4U1ZA 5DTBA 2V84A 4P0IA 1FTOA 4NF5A 3KFMA 3TCFA 2F35A 4L17A 1NH7A 4TLMB 4UACA 3FJGA 4F19A 2DVCA 1BIYA 4TOZA 1QKAA 3EHSA 5DVFA 1IXHA 1D9YA 2E0SA 2H99A 3O2AA 5I2NA 2VHAA 1QUJA 3IJOB 2F6GA 3V89B 4ELRA 4I62A 3UK4A 3HN0A 2B65A 4GL0A 4G8MA 4U23A 3G3GA 3MC2A 5CI5A 5CM6A 3H7MA 4BDNA 2RINA 1IZ1A 5H8FB 3U93A 1AH5A 1JEVA 4PFTA 4R6KA 2HAUA 2VGQA 4OFJA 2VP1A 4ELQA 2F34A 2Z22A 3BFUA 1FQBA 1ZLQA 3H03A 4ELPA 2HXWA 1M5DA 3MVYA 1FCKA 5TPAB 3RT8A 1A54A 4H67A 2REGA 1NKXA 3SEWA 4QSEA 3MW0A 1TT1A 2P1SA 2XHDA 3H6TA 4G4PA 4H8JA 4LA9A 1PBPA 1YTVA 4LVQA 4ND9A 5IAIA 2WKYA 2XXIA 2DWIA 2F97A 2PT2A 3MQ9A 2QMXA 4RNSA 1SW4A 1MY2A 3K6XA 4AB6A 2QL3A 1FQEA 1H45A 1NNKA 4LONB 2H5YA 4ZS9A 2I4BA 4PE5B 4YKJA 4JDFA 2Q2AA 3CG3A 3MUQA 1ANFA 3GLBA 5A5XB 3EN3A 2I49A 1SDXA 3OO6A 5I84A 1CB6A 4Q0CA 1FTMA 1FQDA 2DYXA 5EHSA 4G68A 1JEUA 1UQWA 2GHBA 3I3VA 4WEDA 2XXQA 5KZTA 4EF1A 3CIJA 3RPWA 5B7DA 2PX1A 4YMBA 2I48A 3JYRA 1URDA 1A99A 3TDJA 5DT6A 3IJXB 5AA4A 4NMYA 3N6TA 5L9SA 3D4GA 3O9PA 3T66A 5CC2A 2E1SA 2Y7IA 4IO4A 2QMWA 4G8HA 3SERA 4H65A 3R7XA 2Z8EA 2Q88A 5CRYA 1USYE 3MP8A 4QRZA 1NFTA 1LAGE 1MQJA 3RUMA 1QVSA 1OQGA 1B3LA 3E3KA 1UIUA 5CMCA 1ZBMA 4FAJA 2GFEA 5H8NB 2DXRA 3CR9A 3KG2A 1M5CA 5DEXA 1JVYA 3QUJA 1IIWA 3KN3A 2Y7PA 5I56B 3TYHA 3K00A 3ZKKA 4Q8RA 3UORA 1QULA 4XXUA 1UTBB 2ZNUA 3RY3A 4YMAA 1MY1A 4QFKA 1POY1 3FVGA 2DE3A 3Q29A 1LB8A 4RY1A 1S50A 1HSJA 1ZTYA 4KD5A 4TLLB 4BDQA 4DCXA 4EQBA 4O3CA 2HFBA 4EDPA 1Q35A 3E4RA 5K2YA 1ATGA 1MY0A 1WODA 4AB5A 3OD7A 4JWOA 3IO4A 3KSXA 2PMSA 4KCDA 3PPQA 1XT8A 3LSWA 1OMPA 3OOAA 3PUYE 1P1OA 3QAXA 1FTJA 3TTNA 3TZAA 3C4MA 3VVEA 1MPDA 2XD2A 4KI0E 4NF6A 1GVCA 2Z8DA 4R74A 4GVOA 1N0TA 2QS2A 2VD3A 4C1TA 2F6PA 4MH5A 4GFRA 4GXSB 3FD3A 3IAZA 1PEBA 4GRKA 2P0SA 1Y4TA 2AYSA 4OTEA 2DXYA 1LGBC 3FASA 3MZBA 3ZKLA 3N26A 1N7WA 3TPAA 4TQUQ 2CZLA 3DLNA 1XHYA 4NE4A 1B0LA 1JW4A 3ECRA 3VLWA 2XXVA 1A40A 3CSBA 3IR1A 4GD5A 2RKMA 1MY4A 3CRBA 4MFIA 5K2XA 3K2DA 1S9TA 3K01A 3MWBA 3OXNA 1LFHA 1A55A 1XOCA 3TMGA 3W15C 3JV9A 4KCCA 5EHMA 1B3HA 1VE4A 2ALUA 2ZNTA 3U8QA 4RXLA 1B1HA 1MS7A 1FTLA 4BLAA 4LQ5A 2GRVA 1BTJA 2YJPA 3G3KA 2V25A 1JNFA 3TELA 4KYSA 2M8CA 4RPOA 3FVOA 1VFDA 4OXVA 1AMFA 1XS5A 3ILTB 1WDNA 4H5GA 1DPPA 2QRYA 4DCYA 4I9DA 4DZ1A 1LFIA 3TFLA 3EF7A 4KPTA 1SI0A 1LCTA 1T0KA 1D4NA 2F7CA 2DWAA 1NH8A 2I3VA 2ANJA 5AA3A 2YPNA 4GLIA 4QFNA 4LZ5A 3M8UA 3RNNA 1MM7A 1TWYA 2O84X 3C32A 3RLFE 3T22A 4ZECA 1ZMGA 4MLVA 2H98A 2I0CA 2Y7KA 3O28A 4N6PA 5FHMA 3O97A 3GBAA 3O29A 4P0GA 1B05A 1EH3A 3M3FA 4WEPA 3H6VA 4EUOA 2X7QA 1US5A 2REJA 5JTYB 3TCHA 5FTHA 2DSFA 2O68A 1ELJA 1IITA 4K3FA 4R73A 4Z0IA 4G8NA 5DVIA 2X26A 3IB0A 1I6BA 3T9HB 4F31B 5L8DA 3KN7A 3K4UA 1SYHA 3CFXA 3IX1A 4KQPA 3VVFA 3QSLA 4F1YA 3TQLA 5CBRA 3E13X 1B1XA 3FUZA 4THIA 5I2NB 3LR1A 3SKPA 5I2KB 3THIA 1B9JA 1B51A 4IGRA 4IO6A 4BDRA 3TTKA 3E9XA 2ZXTA 3BBRA 3G3JA 5ELVA 2NWJA 5B70A 5I57A 2ZYMA 1B5IA 3B6QA 4JXIA 4OWDA 3SESA 5ICTA 1BKAA 2HEUA 1IQ7A 1P99A 1MH4A 4RA1A 4R6HA 3CSGA 3L6HA 4RPNA 1Z7ME 2DVZA 1FTKA 2AIXA 5M2VA 1VR5A 1J1NA 3TQWA 4ESWA 1N3WA 2O7UA 2NXOA 2OBGA 3RTFB 3LC8A 3T93B 1NMUA 1QUKA 3RTWB 1FQFA 4OEUA 4Z7EA 4LZ8A 5EYFA 3LBSA 1JVXA 3UA8A 2G93A 3O66A 1PB9A 2QS1A 2OWSA 3MP6A 2THIA 5J1DA 3V8XB 3OSQA 3PUVE 3TTMA 3OO9A 1P1WA 4GF8A 2D3IA 4OZ9A 5H8QB 4KFQA 1SW2A 2A5TA 2DQVA 4FJPA 2F7BA 4G2ZA 1FQCA 3OO7A 3IOWA 3K1NA 4OFLA 4U1OA 1GV8A 5JEIA 3MPLA 2RF1A 2ONKE 1I6AA 3HHFA 3PUXE 3Q27A 5ITPA 4OFOA 1LBBA 3KSJA 2H25A 3ZS6A 2A5SA 1BP5A 3CG1A 4NF8A 1MXVA 5ISUA 3S2VA 3TUSA 4PFYA 1DMBA 3PMVA 3A09A 3FXQA 1QJMA 3HCQA 5F1QA 3W9VA 1LSTA 1GGGA 3IORA 4PETA 3K6VA 4YKIA 4YAHX 4ZDMA 3VE1B 3IOVA 2GHAA 1OVBA 3DP4A 4OVJA 4YB6A 2F36A 3G7WA 2GH9A 3RQTA 3S4UA 3MAMA 3FJ7A 2BJJX 5CMBA 4HCYA 2Y7RA 3CFLA 3V5AA 4ZE8A 3ZSFA 4F29A 2FYIA 3N94A 5DYHA 4HW8A 2HQ0A 4JSOA 1B7ZA 4XTCQ 3K02A 1B40A 1I6QA 2V93A 3IB1A 5I59B 5L9OA 1Y3QA 2Q2CA 3CI8A 3KBRA 2OCUA 4QF9A 3SEUA 5I58B 1JQFA 5A5XA 3GZGA 1O63A 2ZYKA 2NOOA 4R75A 3K0VA 4YU0A 2UYFA 3T9XB 3FVKA 4BDOA 4F3GA 3KEIA 1GTKA 4GXAA 4C1UA 1D9VA 3VLVA 3HSTA 3ODBA 2XXPA 1F9BA 2QJEA 4PFUA 4U2RA 5H8HB 4DXCA 4N07A 3JZJA 3I5OA 2XXWA 3GXAA 3EPEA 3UGWA 1TXFA 3IK6B 4X1BA 4YICA 4H8IA 3VFJA 5AA4B 1KWHA 5TP9B 4POXA 1OIBA 4QSDA 2XX7A 1R1NA 1HSEA 1SD3A 4YB7A 3D4CA 3PU5A 5JK4A 2OLBA 1UTHB 1LFGA 3M3KA 4OYVA 3TEPA 3OO8A 1H76A 5I57B 2H4IA 3K6UA 1Q1KA 1MRPA 4XKQA 3DELB 1YAEA 4F39A 1P1UA 1LLSA 2DWJA 2IEEA 3C31A 2UVIA 2Y7WA 4G77A 5H8NA 3PV0E 1B3EA 1LB9A 1MH3A 1JW1A 3KJ7A 3VXBA 1MPBA 1MXZA 4F22A 1IEJA 3IO6A 1B6HA 3G3FA 5AA2D 5I56A 2FA7A 4EXKA 4KYDA 5AA1A 4QFOA 3MVWA 3MZ9A 1DTZA 4Q5TA 4R9FA 4PP0A 3V83A 4NF5B 5AA2A 1D3KA 4ECFA 1R6ZA 5DEXB 3BKIB 1Y3PA 3QUFA 1Y20A 4OETA 4EQ7A 4F3BA 5H8FA 4R2BA 1MQIA 1R9LA 3LSLA 3ONMA 3QYTA 1Y1ZA 4ISUA 1DPEA 3LUYA 1SYIA 3ILUB 4OHNA 4FIMA 4JBZA 4KR5A 3WAEA 4IY6A 5HPQA 4I8CA 5KDTA 3PD9A 1HSLA 1N84A 2V3UA 1CE2A 3PPOA 4IB2A 3P7IA 3AXFA 4JWYA 1EZ9A 4NWCA 4Q30B 3FATA 1XVXA 2H9BA 1QW0A 4F2OA 3CFZA 3K6WA 1MXYA 3HPIA 3R6UA 4E0XA 1B46A 2R9JA 4ELOA 1A8FA 1XC1A 2B3BA 3HHGA 4XKNA 2F7AA 2XXTA 3FZVA 4GOTA 5AA2B 1II5A 2RC9A 3B6WA 1IXCA 3FXRA 4DLDA 1FQAA 4NF8B 3EHUA 4ZZEA 2F5XA 5ITOA 4GIZA 3VDFA 2OK2A 3MVZA 1B4ZA 1MXWA 2UVHA 1R9QA 5TU0A 1WVJA 1M5EA 2I4CA 2O1LA 2XX8A 4NWDA 3WAFA 4F1VA 4M1VA 4DDDA 4ZE9A 4QFPA 1MQGA 4LQ2A 5KCJA 3N5LA 3I6VA 1QUIA 4GQOA 4WXJA 2ZMBA 5ICQA 2XXXA 2PVUA 3DM0A 2HZKA 1JETA 2PBWA 1Y3NA 3B7DA 3U92A 1ZU0A 4JSDA 3SDFA 4P11A 3F11A 3HV1A 4NEDA 1NNPA 5BUUA 4I1DA 4HCWA 2P2AA 1USYH 1IUDA 2RCBA 4QHQA 3DP6A 2HCAA 3QXMA 3MPKA 3OSRA 4LATA 1PB7A 4X48A 4H0WA 1L5TA 4DIGA 2OJTA 3TCGA 4G68B 1SI1A 4U21A 2RC8A 2FNCA 3S9NC 4F2QA 3TODA 1LAFE 1MQHA 1OQHA 2PYYA 4YKPA 1XVYA 2NVUB 1B4HA 3KJTA 4JB7A 4QFLA 5TPAA 1N76A 2UXAA 3C33A 2D5WA 5AE4A 3PMXA 4OQOA 4ZEDA 2O51A 1ZIUA 2R71A 3EHTA 1AOVA 1AL3A 3H4ZA 1PBQA 3BFTA 3FIRA 3H06B 3H6WA 4N13A 3T96B 2ZYNA 4UA8A 3USDA 4BDLA 4DXUA 1POTA 4R9GA 4F18A 4HS7A 1N3XA 4H1XA 1UTHA 3TTLA 3L6GA 4F1UA 4O3BA 1ZKBA 2VOZA 3RN8A 4U4XA 1M5FA 3PPNA 2DE2A 2KLFA 3DP8A 3OENA 4POWA 2F78A 3K1MA 2QPQA 2G29A 3IOTA 4PFWA 3FVNA 1UTBA 3G3HA 1B7HA 2Y84A 4OEVA 3TAJA 1Y4CA 1MDP1 2DE4A 2AL5A 3C9HA 3FGSA 1P1QA 5FHNA 3C36A 1SQYA 2R6GE 4NF6B 4KYEA 5BWJA 4NF4B 3C35A 2YLNA 2O1MA 2QSXA 4ZEKA 1MQDA 5H8SA 3IB2A 5CMKA 1OLCA 1S7YA 4LP2B 4ZEBA 1TFDA 5FTIA 1QKBA 1O7TA 2XXRA 4YKKA 4E0WA 1VFEA 2UVJA 1B0HA 4RJZA 1US4A 1O64A 4XKRA 5KDTB 2UVGA 5LOMA 1ZJLA 5HBCA 1B32A 1B52A 1URSA 1Y1MA 3KOTA 3FV1A 4IO3A 1OLAA 4PQJA 5L9MA 3S9MC 1IXGA 1MXUA 2DS9A 2HAVA 2O7IA 1FW0A 2QS4A 2O69A 2QS3A 3FXUA 3MP1A 3Q25A 3Q26A 4IY5A 2DOJA 2ESNA 1MG1A 1M5BA 2LAOA 2Q9TA 4H6DA 1BLFA 4R2FA 3PMWA 3OEKA 3MJNA 3VLUA 3A3UA 1NL5A 1B2HA 4DXBA 3QK6A 3T9UA 2XD3A 2VD2A 2XXYA 1URGA 2AL4A 3HO7A 3IL1B 4GL8A 3RGYA 4AQ4A 1SW5A 1YCJA 5I59A 4ESXA 3S9LC 3C34A 1EU8A 2CMOA 3KOSA 5F7VA 5H8QA 3U72A 3UN6A 3SEYA 3IOUA 4OENA 5CBSA 5I58A 1A7LA 3G3IA 1NNTA 1TFAA 2V3TA 2V3QA 2IA4A 2X7PA 3O6IA 3RT6B 2D21A 3VVDA 3U94A 5HM4B 4RK2A 2XXUA 1GR2A 4U22A 4C0RA 5DVJA 1SBPA 1NNFA 2ABHA 2XX9A 2OWTA 4FEDA 2A5TB 5IKBA 4IO7A 4FATA 1AIVA 3VXCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H5FA 5KCJB 2HZLA 3K1PA 2NUVA 2PT1A 1P1NA 4PE3A 1LBCA 3VV5A 1B3FA 2WYKA 5EQ7A 3S9EA 1K9ZA 1UIVA 2F8DA 1PB8A 2CZHA 4ZEIA 4LUBA 3PUWE 1FBDA 1B7UA 1EZPA 2OWZA 2ZNSA 1RKMA 2UYEA 1I69A 1B58A 4O3AA 3W9WA 2W7YA 1B5JA 1FPDA 3SEVA 3SETA 4OMBA 2Q8JA 4EXLA 1RYXA 1LAXA 5CMMA 4HE1A 4U4SA 1B5HA 1A8EA 2GQ1A 1H44A 2XA5A 3T9VA 1YPNA 1FPLA 2DWHA 4U1ZA 3KFMA 3ROJA 2FBPA 4F19A 2E0SA 3O2AA 2F6GA 1NV6A 4BDNA 3U93A 4PFTA 4R6KA 2HAUA 2VGQA 2VP1A 4ELQA 4N8GA 1M5DA 1A54A 4H67A 3SEWA 2XHDA 4LVQA 5IAIA 1PBPA 4OA4A 2F97A 3MQ9A 1SW4A 1NNKA 5IZ3B 2WYPA 5EQ8A 4YKJA 1CB6A 5EHSA 2GHBA 3I3VA 2XXQA 5KZTA 3RPWA 4YMBA 1IMFA 5DT6A 3T66A 2E1SA 1USYE 4NN3A 1QVSA 1B3LA 4FAJA 2GFEA 5H8NB 3CR9A 1JVYA 4PAIA 3UORA 1QULA 5A5LA 1UTBB 4YMAA 1MY1A 4QFKA 1FJ9A 4RY1A 4EQBA 4KD5A 4BDQA 4O3CA 4P8BA 2B4MA 1WODA 4AB5A 4X04A 3KSXA 3PPQA 1XT8A 4MMPA 3TZAA 4DI3D 1FTJA 2HHMA 2Z8DA 2P3NA 5ET7A 3FD3A 4GRKA 1PEBA 2P0SA 1FRPA 5EQ9A 2PCRA 2DXYA 4NE4A 2V4CA 1A40A 3CRBA 3K2DA 3K01A 4NAPA 1XOCA 4RXLA 4UABA 4BLAA 1AMFA 4H5GA 1WDNA 4PTKA 3TFLA 1LCTA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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