1H76A

The crystal structure of diferric porcine serum transferrin
Total Genus 229
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
229
sequence length
685
structure length
677
Chain Sequence
QKTVRWCTISNQEANKCSSFRENMSKAVKNGPLVSCVKKSSYLDCIKAIRDKEADAVTLDAGLVFEAGLAPYNLKPVVAEFYGQKDNPQTHYYAVAVVKKGSNFQWNQLQGKRSCHTGLGRSAGWIIPMGLLYDQLPEPRKPIEKAVASFFSSSCVPCADPVNFPKLCQQCAGKGAEKCACSNHEPYFGYAGAFNCLKEDAGDVAFVKHSTVLENLPDKADRDQYELLCRDNTRRPVDDYENCYLAQVPSHAVVARSVDGQEDSIWELLNQAQEHFGRDKSPDFQLFSSSHGKDLLFKDSANGFLKIPSKMDSSLYLGYQYVTALRNLREEECKKVRWCAIGHEETQKCDAWSINSGGKIECVSAENTEDCIAKIVKGEADAMSLDGGYIYIAGKCGLVPVLAENYKTEGENCVNTPEKGYLAVAVVKKSSGPDLNWNNLKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLYNKINSCKFDQFFGEGCAPGSQRNSSLCALCIGSERAPGRECLANNHERYYGYTGAFRCLVEKGDVAFVKDQVVQQNTDGKNKDDWAKDLKQMDFELLCQNGAREPVDNAENCHLARAPNHAVVARDDKVTCVAEELLKQQAQFGRHVTDCSSSFCMFKSNTKDLLFRDDTQCLARVGKTTYESYLGADYITAVANLRKCSTSKLLEACTFHSA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title The Crystal and Molecular Structures of Diferric Porcine and Rabbit Serum Transferrins at Resolutions of 2.15 And 2.60A, Respectively
pubmed doi rcsb
molecule tags Iron transport
molecule keywords SEROTRANSFERRIN
total genus 229
structure length 677
sequence length 685
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h76A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h76A04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h76A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h76A03
1O7TA 4G4PA 3M3LA 1MH3A 4QFLA 4ZZEA 1RYOA 1BTJA 4R72A 4RPOA 3U92A 2I0BA 4X9TA 4WKMA 5CMBA 3N6UA 2O84X 3DM0A 4KHZE 1M5CA 3MPLA 3ONMA 3FJGA 5H8NA 1DSNA 1I6BA 2X7QA 4FE8A 4N6PA 5I2KB 3UA8A 5I84A 4RXLA 3RN8A 2GHAA 2ZYOA 1LAXA 1MM7A 3OOAA 3QYTA 4TLLB 4R6HA 2XX9A 1QULA 1R1NA 1OVBA 4R74A 4NF6A 5ICTA 2DVZA 5L9SA 1VR5A 3JYRA 1H43A 1LCTA 1RYXA 2HCAA 4P0GA 3UN6A 4F19A 5HPQA 2Y7PA 4F3PA 4MH5A 4LVQA 3ILTB 1EZOA 4IGTA 4JDFA 1OLAA 4GOTA 3S4UA 3PPPA 2CMOA 1Z7ME 2P1SA 3FZVA 5DVJA 1NNFA 5I2NA 1XS5A 3ZKLA 1NFTA 2ZYMA 3IAZA 1MG1A 4GXSB 2Q89A 4I8CA 5KCJA 4IY6A 5AA3A 1A54A 1AL3A 3CFZA 5CI5A 2F35A 2P0SA 2QS1A 2CZLA 1MXXA 2ABHA 1I6QA 1YTVA 2PVUA 4LZ5A 3CFXA 4OFOA 4OHNA 3GBAA 1LFHA 4EXKA 5BWJA 4ELOA 2F36A 3MBPA 3GBBA 1TXFA 2ESNA 1EU8A 5L9OA 5EHSA 2OWSA 2I48A 3EHUA 4O3BA 5H8SA 4OMBA 1A55A 5H8NB 3ODBA 2XXIA 4PFUA 2O69A 3T9HB 3RT8A 1SW5A 3OENA 3BKIB 3H6VA 1B9JA 3CI8A 4ZEFA 4TQUQ 1ZKBA 3MW0A 1LSTA 4ZECA 2NOOA 1PB9A 4EQ9A 3KZGA 2UXAA 1SW1A 4X1DA 1MS7A 3LBSA 1GR2A 3QSLA 3MJNA 1US5A 4LATA 4YKJA 4ESWA 1NKXA 4PP0A 4U4SA 1FTKA 1N7WA 1B51A 1NH8A 4U1ZA 1IEJA 3O28A 1OMPA 2V25A 1JVYA 1WODA 4H6DA 5FTIA 3V5AA 2ZNSA 2ZYKA 1A7LA 2RC7A 5DTBA 3M3FA 1BP5A 1FQAA 1ZJLA 1URDA 2GH9A 2H5YA 4GVOA 4I9DA 3LSXA 4NEDA 4QFKA 4RY1A 2UVJA 4F1YA 3TEPA 1Y4CA 4TOZA 1JW4A 4OETA 1B05A 2D5WA 2XXUA 1WVJA 4QFPA 4EF2A 3O2AA 5I2NB 3FVOA 3N6TA 3B6WA 1A40A 1OQHA 3FGSA 1GTKA 2Y7WA 4U2RA 4G77A 4ONYA 3UORA 2XD3A 2ZYNA 3FXQA 1Y4TA 4IB2A 3EQ1A 4U4XA 3IB0A 1MPCA 4RPNA 3RTFB 5ICQA 3OO9A 3PMVA 1B3LA 1CE2A 3PMXA 4K3FA 3VLUA 2RKMA 3DP8A 1FQBA 5TPAB 1SYIA 2PMSA 2PT2A 3T9XB 1T0KA 3VLWA 2PX1A 2RINA 3PPQA 4OVJA 3JZJA 1GV8A 3OSQA 1US4A 3S9MC 3O6GA 4GXAA 4MLVA 2XX7A 4X48A 4XTCQ 2NVUB 4F29A 3PD9A 4DLDA 4JBZA 3KOTA 1A8FA 3K00A 5J1DA 1IITA 2BJJX 4NF5A 4U22A 1JW5A 2I3WA 3G3HA 1B40A 4F18A 5B7DA 1QUJA 1DOTA 1HSLA 4QSCA 4G68B 1EZPA 4PFTA 1Y1MA 2XXWA 1UTBA 3MVXA 4R2FA 3TFLA 2DS9A 1I69A 1QKAA 1A99A 4QFOA 4R6KA 1TFAA 2R6GE 4ZEBA 4MFIA 4YAHX 4YKPA 5DT6A 4ELPA 1N3WA 2RC9A 2QPQA 3V89B 4UA8A 3LSFB 3CSGA 3PUVE 4ELQA 1LFIA 3A3CA 2H98A 3IK6B 4KI0E 3GXAA 3K4UA 4DZ1A 2FYIA 1L5TA 4FIMA 3TQWA 3MVYA 3UK4A 1YAEA 4LUBA 1R9QA 1TFDA 2AIXA 5CMMA 3TCGA 3V8XB 3E4RA 3LSWA 1MRPA 3H7MA 1N84A 2XXQA 4OERA 3UP9A 5I59B 2PT1A 2F8DA 1ZIUA 1AMFA 3MWBA 1Y3QA 1B1XA 4GQOA 3GLBA 3EHSA 4G8NA 4YB5A 1DPEA 4QF9A 3RT6B 3RY3A 4F1VA 3VXBA 5H8FA 2QS2A 3H03A 3ZSFA 1LAGE 2DE2A 3KJTA 5DEXB 2DWHA 4XKPA 3S9EA 1MY3A 4JWYA 2AL4A 2V84A 3UGWA 1PBPA 4IO3A 1JNFA 1M5BA 3C31A 3N94A 4GLIA 3G3FA 4MBPA 3PPRA 4MLQA 5L8DA 2B3BA 3MP1A 3PU5A 3U94A 3KFMA 4G8MA 1N76A 4LQ2A 5F1QA 5AA4A 2DE3A 2H9BA 4GL8A 1MDP1 4JSDA 1ELJA 4NE4A 1PDAA 1QVSA 4XXUA 4LP2B 1D9YA 2QS3A 1FQDA 4NF4B 4PETA 1SQYA 4H1XA 4PE5B 2HAVA 4QSEA 3K2DA 4YMBA 3OEMA 3W9WA 1MQJA 2V93A 4JB7A 4N07A 5H8HA 1SI1A 5ITPA 3FV2A 3KSXA 3RNNA 3PUYE 4ZDMA 1WDNA 1B6HA 1SBPA 1F9BA 1M5EA 4ZEDA 3S9LC 4OESA 5LOMA 1FQFA 3SERA 1HSJA 4JWXA 2VHAA 4EQ7A 1Q35A 1B3FA 3RUMA 1UIVA 5L9MA 1IXGA 3SEXA 1XVYA 4ESXA 1IQ7A 3A09A 3IL1B 1IXCA 2HZLA 5H8HB 3T66A 5JEIA 1PC3A 3CIJA 1JETA 2DOJA 1M5FA 1O63A 3C33A 3DP4A 2YLNA 3FATA 3QUFA 5H8QA 1URSA 3E3KA 3VDFA 2B3FA 3TYHA 4LA9A 2PYYA 4OEUA 5CMKA 2OK2A 2F5XA 1XC1A 3HV1A 3ECRA 5I57B 1PBQA 4IGRA 1MY0A 2UYFA 2F97A 2Y84A 1MM6A 2DXYA 1SYHA 3IOWA 1VFDA 4G68C 3C4MA 3KN8A 3R6UA 3U1OA 2ZXTA 3FD3A 4ND9A 1P99A 1ZU0A 3O6HA 3ZS6A 1RKMA 4OTEA 2XXRA 4TLMB 1MDQA 4GWOA 4QRZA 3G3GA 3TODA 4HCWA 4KYDA 2Y7RA 4RNSA 1Q1KA 1URGA 3H6WA 4R6YA 4U1OA 1B58A 3DELB 4ZEKA 4F1UA 4EXLA 1N0TA 1QKBA 2ONRA 5DEXA 2OWTA 1AOVA 3MZ9A 3B7DA 3KOSA 1Y20A 3ILUB 2HEUA 1B5JA 5ELVA 4DXUA 4RJZA 4UACA 2O7UA 1FTMA 1S7YA 3FASA 1DPPA 1BLFA 1B0LA 4NF8B 3RGYA 1TT1A 5CBRA 2DP8A 2F6PA 2DYXA 1LAHE 5JTYA 2IEEA 1IUDA 3O66A 4ZEIA 2A5SA 1P1OA 3UIFA 3Q26A 4KR5A 4N13A 4QHQA 4GF8A 4BDOA 3KSJA 3IJOB 4I1DA 5AA1A 1FQEA 2D3IA 5BUUA 1B5HA 1YCJA 4H8IA 1LBCA 4R9FA 1H44A 2DQVA 1M5DA 4NWCA 3THIA 3WAEA 5B70A 1SDXA 1MPDA 1FQCA 3K1NA 3D4CA 3K6XA 2OZZA 1JEVA 3B6TA 3I3VA 4L17A 4NF8A 1MQGA 4ZZAA 1OLCA 3IB2A 2I4BA 4WEDA 3OEKA 1B3HA 3P7IA 4ZE8A 1XHYA 2O6AA 4F22A 4M4GA 2ZNTA 4NMYA 4Q5TA 3PMWA 4XIGQ 3T96B 4F3SA 2Z8EA 2Q2AA 1Z7NE 1NNKA 1S50A 4OQOA 3K0VA 1D9VA 2XXHA 1Y3PA 1S9TA 2QRYA 3D4GA 5CM6A 3HSTA 4ISUA 4KFQA 4NF5B 5KCJB 3MAMA 3MZBA 1MY4A 2VOZA 3N5LA 4IO2A 1MXYA 1OQGA 4KYEA 1B52A 2IA4A 1OIBA 5HBCA 5ITOA 3RPWA 2Z23A 3T22A 3BBRA 5I56B 2RF1A 3Q25A 3HHGA 2WKYA 5I59A 1Y1ZA 3KN7A 3O6IA 1FCKA 5FTHA 3U72A 1SW4A 3BFUA 3HO7A 4DIGA 4HW8A 4BDLA 3FJMA 2M8CA 5DYHA 5I2KA 5HM4B 1DTZA 4H65A 2W7YA 3EN3A 4O3CA 2R71A 3H06B 3LSLA 3C36A 3L6GA 3PGFA 4LZ7A 2Z8DA 2HAUA 2H99A 2D21A 3EHTA 1R9LA 1D3KA 2OJTA 3QAXA 3SEYA 1B3EA 1ZLQA 3K6WA 4Z7EA 3IB1A 1MQDA 3LC8A 1P1UA 4LQ5A 3Q27A 4R9GA 3F11A 4EUOA 4H5FA 2XXYA 3OO6A 3PPNA 5TP9B 3H6UA 2Z22A 4H8JA 4DE8A 4QSDA 1H76A 5CMCA 2XXPA 3FVGA 1POTA 3K6UA 4WXJA 4F39A 3FUZA 4Q0CA 2F34A 4QFNA 1JQFA 3FV1A 1VSOA 4DDDA 1QUKA 2AL5A 3IORA 3OO7A 4FEDA 1HSEA 2DSFA 3RTWB 1B4ZA 1N3XA 2DWIA 3H3GA 4MF3A 4GD5A 3RLFE 4FECA 3VVEA 4BLAA 1N7XA 5FHMA 4JWOA 3SDFA 2F78A 1KWHA 3TELA 3IO4A 3S9NC 1MY1A 3TKDA 3QK6A 4H5GA 4BDNA 1Y3NA 1NNTA 4PFWA 3IJXB 4OWDA 3S2VA 4ZE9A 5TPAA 4PQJA 1SD3A 4BDRA 2ONSA 3KBRA 1BIYA 2A5TB 2O51A 3T9UA 4JSOA 4EDPA 5IAIA 2UVIA 1ANFA 3O9PA 4IO5A 1DTGA 4PFYA 2Q8JA 2X26A 1JVXA 3MQ9A 3PV0E 2F7BA 2NWJA 4E0XA 1ZBMA 4IO7A 2ONKE 3DP6A 1LLSA 1LBBA 3Q29A 1VFEA 4KYSA 3N26A 1LAFE 1AH5A 5F7VA 4OZ9A 3GZGA 1XT8A 2I0CA 3K6VA 4H0WA 4YB6A 3T93B 5I58A 3K1MA 4F2QA 2REJA 5I58B 2KLFA 3FVNA 4OEVA 1MPBA 3C32A 1VE4A 2F7CA 3CFLA 1JW1A 4GIZA 3TPAA 3VV5A 1LB9A 2XHDA 2PBWA 2I49A 3QXMA 3KGCA 2QL3A 3KN3A 3MVWA 4POXA 5CBSA 3OELA 1PB8A 3CSBA 2Q9TA 4FORA 3SETA 4AB5A 3MC2A 2G29A 4X1BA 1FTLA 3OXNA 2I6EA 4YKIA 3U93A 4OENA 3E13X 3MPKA 2F7AA 2VD3A 1QJMA 3PUWE 5K2XA 4AQ4A 1SI0A 4KD5A 2HXWA 3M8UA 4YB7A 1FTOA 4G2ZA 3IOUA 3HN0A 2OLBA 2REGA 1EH3A 3H6TA 4E0WA 1B5IA 2O68A 4LZ8A 4EQBA 2B65A 2GRVA 3EPEA 3LUYA 3MVZA 1IXHA 3OO8A 5EYFA 3B6QA 1B7ZA 3MUQA 3TTKA 2NUVA 3FVKA 2XD2A 5KZTA 5AA2A 1B4HA 2HQ0A 3IOVA 5K2YA 3MP8A 4GFRA 3C34A 4LONB 4R75A 2Z8FA 4RK9A 5CRYA 5JTYB 4GL0A 2QMXA 4AB6A 3BFTA 2FA7A 2QJEA 3FIRA 3K01A 2UVGA 1MQHA 1MY2A 3OSRA 1ZTYA 1QUIA 2P2AA 2YPNA 3G3IA 3V83A 3O97A 1J1NA 3AXFA 4XKQA 1MXVA 2AYSA 1LB8A 1SW2A 1P1WA 5TU0A 3SEUA 5A5XA 4C0RA 3VFJA 2THIA 4G8HA 2F6GA 2UVHA 4YKKA 3SEVA 3C9HA 3CR9A 1JEUA 1BKAA 1IZ1A 1MXZA 3A3UA 4NF4A 4RA1A 4F31B 4JXIA 1PB7A 2OCUA 5JK4A 4U21A 2ALUA 1DMBA 3PD8A 5AE4A 4POWA 3G3KA 1MXUA 1A8EA 5FHNA 3VLVA 3VVFA 3L6HA 2E0SA 2DWAA 4FATA 1LFGA 2VP1A 2O7IA 4YZZA 2I3VA 2X7PA 3E9XA 3OD7A 4HS7A 3TZAA 2V3QA 3IR1A 5A5XB 3VVDA 5KDTA 5DVFA 2HZKA 5H8QB 3O29A 1GVCA 4IY5A 4R2BA 3M3KA 3VE1B 1O64A 2V3TA 4GRKA 1ATGA 2UYEA 1MXWA 3KG2A 3QIMA 1B46A 2I58A 4C1TA 2Y7IA 1LCFA 1H3DA 1XVXA 4EF1A 3PUXE 4DCYA 3OMBA 4NF6B 4H67A 4WEPA 1H45A 4HTGA 1B2HA 1MQIA 2A5TA 2R9JA 3I5OA 3K02A 3KEIA 4F3GA 2XXTA 1ZMGA 1UTHB 5EHMA 1N04A 4C1UA 3IOTA 1NL5A 3CVGA 3ZKKA 2YJPA 5AA2B 5FHOA 3SKPA 1FTJA 1P1QA 4XKRA 4KPTA 1OVTA 2LAOA 3USDA 3U8QA 2ANJA 1QW0A 3WAFA 3R7XA 2H25A 2I4CA 3QUJA 3TCFA 3T9VA 1UIUA 3TMGA 3TTNA 3JV9A 4U23A 4FAJA 2RC8A 1UQWA 4P0IA 5DVIA 1II5A 2VD2A 4HCYA 1SVXB 2O1MA 3CG3A 4Q30B 1D4NA 1UTBB 3PUZE 1NNPA 4YICA 1GGGA 3HPIA 2V3UA 3C35A 4OXVA 1B7HA 2XX8A 2DXRA 1POY1 2Q88A 1B32A 2ZMBA 5AA4B 1TWYA 1UTHA 2QMWA 4Z0IA 4YMAA 4Q8RA 3MP6A 4OYVA 4P11A 1USYE 3FJ7A 2DWJA 5TP9A 3TAJA 2DE4A 1B3GA 1XOCA 4KCDA 2HFBA 3FXRA 3SEWA 1Y9UA 1R6ZA 2VGQA 3EF7A 3I6VA 3TTRA 3VXCA 2H4IA 5H8FB 2DVCA 1NH7A 2XXXA 2XXVA 2NXOA 3Q28A 4I62A 4NTLA 2QSXA 4IO4A 4OFLA 1AIVA 1PEBA 4FJPA 4RYAA 3KJ7A 3PPOA 3G3JA 4FEBA 3HHFA 5ISUA 1NMUA 5KDTB 1IIWA 3R26A 4ELRA 4IO6A 2FNCA 4ECFA 4DCXA 2QS4A 2GFEA 5I56A 1FW0A 1LGBC 2GHBA 1P1NA 2Q2CA 3SESA 3K1PA 3TQLA 3W9VA 4F2OA 3MZ1A 1IXIA 2RCBA 3CRBA 1USYH 2ZNUA 4BDMA 3IO6A 5I57A 4YU0A 3TTLA 3DLNA 4O3AA 4XKNA 4BDQA 2O1LA 2Y7KA 3LR1A 4M1VA 1B0HA 3TCHA 4DXBA 3CG1A 3FXUA 5M2VA 4NWDA 3IX1A 3TDJA 3W15C 4THIA 3TUSA 1CB6A 3RQTA 2G93A 4ZS9A 4KQPA 1B7UA 4DXCA 1B1HA 3G7WA 3HCQA 4KCCA 4F3BA 4OFJA 5IKBA 1EZ9A 1MH4A 3H4ZA 4R73A 4G68A 3TTMA 4RK2A 2OBGA 2RCAA 5AA2D 5CC2A 1I6AA 2E1SA 1YPNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1O7TA 4ZZEA 3M3LA 3U92A 1RYOA 2B4MA 2I0BA 4WKMA 3DM0A 4KHZE 3MPLA 3ONMA 4FE8A 1YXIA 2XXKA 1LAXA 3QYTA 2CEXA 2PFZA 4I3EA 2XX9A 1OVBA 2DDKA 1LCTA 5IM2A 1EZOA 4IGTA 1OLAA 1Z7ME 3FZVA 5I2NA 1NNFA 4GXSB 3NOHA 1FPBA 5AA3A 1A54A 1AL3A 2BJIA 3CFZA 2F35A 2QS1A 1YTVA 3ROJA 2F3DA 1NV6A 2ESNA 5L9OA 4P8BA 5IZ3B 4OMBA 1LBVA 3OENA 1IMBA 3MW0A 4ZECA 1SW1A 1MS7A 3QSLA 1US5A 1NKXA 1N7WA 4U1ZA 4DI4B 1NUXA 3V5AA 5DTBA 1URDA 4F1YA 4XF5A 4TOZA 4OETA 3O2AA 1OQHA 3FGSA 2ZYNA 3FXQA 1Y4TA 4U4XA 3OO9A 3PMVA 4FBPA 4PFRA 2PT2A 3T9XB 3VLWA 3JZJA 3OSQA 4F29A 3PD9A 4OVTA 4DLDA 3KOTA 5J1DA 2I3WA 5EQ9A 1HSLA 3TFLA 2DS9A 1I69A 1QKAA 4YAHX 1N3WA 5EQAA 4UA8A 3LSFB 3CSGA 4ELQA 4DZ1A 4XEQA 3UK4A 1YAEA 4N8GA 2WYPA 1MRPA 3MSTA 5H8FA 2WEFA 4HE1A 1LAGE 4KXPA 2DWHA 1MY3A 2AL4A 3UGWA 4IO3A 1M5BA 3B50A 4G8MA 2QVRA 4NE4A 4NF4B 4PETA 4HE0A 4QSEA 3K2DA 1IMEA 1MQJA 1SI1A 5ITPA 4ZDMA 1IMDA 4OESA 2VPOA 4EQ7A 1B3FA 5L9MA 2Y5LA 4GWWA 2DOJA 1O63A 3QUFA 4LA9A 2F5XA 3HV1A 4IGRA 2Y5KA 1MM6A 4ND9A 3MYUA 3ZS6A 3E79A 3G3GA 4N81A 4MEVA 1Q1KA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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