1H76A

The crystal structure of diferric porcine serum transferrin
Total Genus 229
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
229
sequence length
685
structure length
677
Chain Sequence
QKTVRWCTISNQEANKCSSFRENMSKAVKNGPLVSCVKKSSYLDCIKAIRDKEADAVTLDAGLVFEAGLAPYNLKPVVAEFYGQKDNPQTHYYAVAVVKKGSNFQWNQLQGKRSCHTGLGRSAGWIIPMGLLYDQLPEPRKPIEKAVASFFSSSCVPCADPVNFPKLCQQCAGKGAEKCACSNHEPYFGYAGAFNCLKEDAGDVAFVKHSTVLENLPDKADRDQYELLCRDNTRRPVDDYENCYLAQVPSHAVVARSVDGQEDSIWELLNQAQEHFGRDKSPDFQLFSSSHGKDLLFKDSANGFLKIPSKMDSSLYLGYQYVTALRNLREEECKKVRWCAIGHEETQKCDAWSINSGGKIECVSAENTEDCIAKIVKGEADAMSLDGGYIYIAGKCGLVPVLAENYKTEGENCVNTPEKGYLAVAVVKKSSGPDLNWNNLKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLYNKINSCKFDQFFGEGCAPGSQRNSSLCALCIGSERAPGRECLANNHERYYGYTGAFRCLVEKGDVAFVKDQVVQQNTDGKNKDDWAKDLKQMDFELLCQNGAREPVDNAENCHLARAPNHAVVARDDKVTCVAEELLKQQAQFGRHVTDCSSSFCMFKSNTKDLLFRDDTQCLARVGKTTYESYLGADYITAVANLRKCSTSKLLEACTFHSA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Iron transport
publication title The Crystal and Molecular Structures of Diferric Porcine and Rabbit Serum Transferrins at Resolutions of 2.15 And 2.60A, Respectively
pubmed doi rcsb
molecule keywords SEROTRANSFERRIN
total genus 229
structure length 677
sequence length 685
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h76A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h76A04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h76A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h76A03
3KFMA 4IO3A 4DZ1A 1MQGA 2DVCA 4DCXA 1VE4A 2HZKA 3VVEA 3PD9A 3G3HA 3C34A 3O9PA 3THIA 4DXCA 1Q35A 4GXAA 2ZYOA 4NWCA 3MVZA 1JVXA 2DQVA 1JVYA 4N6PA 3H6UA 3PPRA 2Y7RA 4IO7A 2G93A 3H6TA 3CFZA 1VR5A 2F6PA 4MBPA 4R6YA 2O1MA 3FV1A 3MQ9A 2B3BA 3M3LA 2QS2A 1Z7ME 1O63A 4GD5A 3IJOB 1AOVA 2E1SA 2OWSA 5EHSA 3T96B 3EHTA 3O97A 4JBZA 3TEPA 3RUMA 4F1YA 5F1QA 1FTMA 3LSLA 1JETA 3N26A 1B7HA 2YLNA 5CMMA 2VD3A 1R6ZA 4C1UA 3O2AA 1A99A 2YPNA 4PQJA 1RYOA 1JNFA 1XC1A 1ZBMA 5JK4A 1D3KA 4QFNA 1OIBA 2AIXA 5ISUA 3RQTA 3TCGA 3TUSA 5L9MA 1D4NA 4OERA 5DVFA 1H76A 4BDLA 3MVWA 1N0TA 4R74A 2I48A 2VD2A 3C4MA 5I84A 1MQJA 3K1NA 5TU0A 4MLQA 1MM7A 4G77A 1Y20A 1BP5A 4MH5A 3S9LC 3TFLA 2O84X 4H1XA 5L9OA 3A3CA 1UTBA 1YCJA 2UYFA 5KCJB 4QFPA 3IOWA 4M4GA 5HM4B 4PP0A 4YMBA 1ZJLA 1IXHA 2PVUA 4EF1A 4ISUA 4KYSA 1H44A 1USYE 4ZEFA 3OELA 2QS4A 5I59A 4H5FA 3UIFA 5DEXB 1J1NA 4BLAA 1GR2A 4F22A 3LBSA 2ONKE 1EZOA 2I3WA 4NE4A 3IO6A 3H6WA 2P0SA 4R72A 1LLSA 4QSDA 1A8FA 4DDDA 1A54A 1PEBA 4RY1A 2O1LA 3GXAA 1M5DA 3PUZE 4XIGQ 3EQ1A 1NKXA 4ELOA 4NTLA 3BKIB 3R6UA 2DWAA 4NF4B 2I6EA 4NMYA 3EF7A 3SKPA 5BUUA 3TAJA 3C31A 3EPEA 2ZNTA 4O3CA 4O3AA 3HSTA 5DEXA 2AL5A 4GL8A 1S50A 1FW0A 4G2ZA 2ZNSA 4KR5A 2UXAA 1FTLA 5HPQA 1DPPA 4IO6A 3N6TA 1I69A 3KGCA 1NFTA 3WAEA 1A55A 4U1ZA 3KOSA 2QPQA 4R2BA 4JSDA 4WKMA 3UGWA 4BDMA 5KDTB 3N5LA 1LSTA 4PFWA 4Q0CA 3FASA 3TELA 3P7IA 1RKMA 3G3KA 1KWHA 1MXUA 1D9VA 1URGA 4JDFA 4KFQA 3ZKLA 4GL0A 3RT8A 1MPBA 3FXUA 3IB0A 5H8HB 1MDP1 2G29A 4G8HA 1IXGA 5CBRA 3VXCA 3PGFA 3PMVA 1FQCA 1ZTYA 3FXQA 3PUXE 3OOAA 1A7LA 5TP9A 1O64A 4RXLA 3B6WA 2QS1A 4YAHX 4ND9A 3CSGA 2Y84A 3LUYA 4IO4A 5I56A 3KN3A 2F6GA 3Q27A 2PX1A 2DWIA 5JTYA 2F36A 1LB9A 3SEYA 1MXWA 1XOCA 4ELQA 4OESA 4DLDA 1FTJA 4KD5A 3VXBA 1RYXA 2OJTA 4U2RA 3S4UA 1FCKA 1VFDA 3T93B 3OD7A 3FD3A 3MW0A 3FJMA 5I2KB 2XXYA 4UA8A 1SYIA 1NH8A 4HS7A 4QSEA 4RYAA 5AA3A 3TODA 1B58A 4G68B 4F19A 1QUJA 2Q2CA 3FJGA 4OZ9A 4YICA 4OYVA 3ZKKA 1QULA 3K6VA 1JW5A 4ESWA 1IZ1A 5H8FA 2D3IA 2UVHA 1POY1 3M3KA 5DTBA 3USDA 4FJPA 1MH3A 4LUBA 2XX9A 1SW5A 1MY3A 4IO5A 3L6GA 1SVXB 3KSXA 2I0BA 3LR1A 3CFLA 1B7UA 4X1DA 1MXXA 3TKDA 5DVIA 2V3TA 1EZ9A 1R9LA 1SDXA 1GGGA 5L9SA 3KOTA 4OVJA 1Y3QA 4LA9A 3TTRA 1DOTA 3IR1A 4DIGA 2OK2A 4NF5A 2H4IA 1P99A 3E9XA 2XXWA 3S2VA 1IITA 2F7CA 4RK2A 5CM6A 3SEUA 4G68C 5AE4A 3O6HA 1B1XA 4N13A 1TT1A 3FXRA 4HW8A 4OXVA 3UP9A 4R9GA 2HAVA 5I2NB 1IQ7A 1MH4A 1B2HA 5F7VA 4RA1A 4IY5A 4GLIA 5B70A 1ZMGA 3MZ9A 1LCTA 3LSXA 3H06B 3B7DA 1USYH 2YJPA 4F1VA 1IIWA 2W7YA 2RINA 2I4CA 3CRBA 1BIYA 2BJJX 2HAUA 4LONB 1Q1KA 4FAJA 2DYXA 1GV8A 2Z8DA 1DMBA 2B65A 1SYHA 3C35A 4R9FA 1NNPA 3FVOA 5ICQA 1WVJA 3QYTA 2A5TB 3OSQA 5FHNA 2QMWA 4PETA 5CC2A 1HSEA 1N76A 3K6WA 3EHUA 4NWDA 3MC2A 2UYEA 4U4SA 3FZVA 4PFTA 3MPLA 4KQPA 5FHOA 2ABHA 4OWDA 1NH7A 2V3UA 1ZKBA 2UVJA 2V3QA 3JYRA 4LZ8A 5CI5A 1PDAA 3KEIA 3HO7A 4F2QA 5I57B 2THIA 1NNTA 4F29A 1FQFA 2DXRA 2I49A 3QK6A 3CR9A 1ZU0A 2QMXA 3KG2A 3ILUB 4ZECA 3E3KA 4DCYA 1EH3A 2Q88A 3OENA 4EXLA 3T9XB 1MPDA 2H9BA 1XS5A 4XXUA 3B6TA 2PBWA 2VP1A 1OQHA 2OBGA 2DP8A 3M3FA 4M1VA 1TXFA 4YKKA 1Y4CA 4OEUA 4LATA 4QSCA 4R2FA 1EU8A 1FTOA 4ZEIA 5LOMA 4Q8RA 4PFUA 3RPWA 2P2AA 1O7TA 3CIJA 3TCFA 4RPOA 4U4XA 1JW4A 2O68A 4GIZA 1B05A 1D9YA 2KLFA 3KJ7A 1MQDA 4DXUA 4HCWA 3BFTA 3N6UA 3D4CA 4KYDA 3OO9A 1Y4TA 2GH9A 3HN0A 5AA2D 4ZDMA 1MY2A 3RGYA 1QW0A 4GQOA 3MP1A 3GLBA 3TMGA 1VSOA 4ELRA 3PD8A 4C1TA 1US5A 2O69A 4PFYA 3U93A 2XHDA 1XHYA 3S9EA 3FV2A 4POWA 4LQ2A 4XKNA 1XVXA 1MQHA 3V5AA 3E4RA 4IGRA 1HSLA 2M8CA 3G3JA 1M5CA 3QSLA 2O7IA 4FE8A 2NVUB 1S9TA 3ZS6A 1T0KA 2CMOA 5AA2B 4H67A 2DS9A 3MPKA 4ESXA 3VDFA 3S9NC 1CB6A 3H6VA 1DTGA 3R7XA 5DYHA 3D4GA 3ZSFA 2AYSA 2ESNA 4ONYA 3DELB 3K02A 3HHFA 3H4ZA 5KCJA 1MS7A 1N7WA 1LFIA 3T22A 3I3VA 1I6AA 2IA4A 3G7WA 5H8NB 1Y3PA 1MPCA 3IOVA 4ZE8A 1OMPA 4IY6A 4QF9A 5AA2A 4K3FA 1LCFA 4XKQA 2P1SA 1LBBA 1B1HA 3HV1A 4GRKA 3FATA 1A40A 1M5EA 2I4BA 4LP2B 4TLMB 5IAIA 4EUOA 5TPAB 2Y7WA 3QXMA 3FJ7A 3K1MA 2Q8JA 3K1PA 2XD3A 5H8QB 5FTHA 1B7ZA 1ZIUA 3OO7A 4IO2A 4R73A 4NF4A 1B5JA 5EHMA 4ZZAA 5CMBA 1MRPA 4KI0E 5I58B 3H7MA 4EQ7A 4U22A 3PUVE 1SI1A 3RTWB 1B6HA 3HCQA 2I3VA 1GVCA 1P1QA 2RC7A 1Z7NE 3WAFA 5JEIA 3VE1B 3Q25A 3VVDA 1OVBA 3IOTA 4ZEBA 1N3WA 3MJNA 4JB7A 5H8QA 3O28A 4IGTA 3T66A 4EF2A 1P1NA 3DP6A 4UACA 1FQDA 1XT8A 2QRYA 1SI0A 3C36A 1LAXA 1H43A 3BBRA 5I58A 2GFEA 5KDTA 3RLFE 4JWXA 3KZGA 1QUKA 5J1DA 1LBCA 4ZZEA 1P1OA 3OO6A 1N3XA 4R75A 1LFGA 2DE4A 1QUIA 3FVKA 1OQGA 4R6KA 4RNSA 4GF8A 5AA4B 3OSRA 3KN7A 3A09A 4NEDA 1YTVA 5KZTA 5DVJA 1B40A 1R9QA 3U72A 4QFOA 5H8HA 5EYFA 3T9VA 2UVGA 4DE8A 3C32A 2XXQA 4FEBA 3DP8A 4YKIA 3TTMA 4BDNA 4FECA 2DOJA 4KPTA 1TWYA 2RC9A 2DE2A 2ZYNA 1LB8A 3FVNA 4F3GA 1MXYA 1URSA 2OCUA 1B32A 1IXCA 3QAXA 4XKPA 2ONSA 2XXRA 1R1NA 1AH5A 4EQ9A 3K0VA 3GBBA 4EQBA 5AA1A 2HCAA 5I2KA 2RC8A 4YB6A 4NF6B 3PMWA 3K2DA 5ICTA 3SESA 4G68A 5CBSA 2XXIA 2H98A 3QUJA 2E0SA 3U1OA 1QVSA 1IXIA 4HCYA 4GVOA 2F7BA 3CFXA 1BTJA 4JXIA 4TQUQ 3QIMA 1LGBC 1PB9A 3RY3A 3TYHA 2REGA 4KCDA 2DWJA 5CRYA 1MDQA 1XVYA 3IORA 2DWHA 4I9DA 2HFBA 1YPNA 4YZZA 2NWJA 4O3BA 4AQ4A 1MXVA 3KBRA 3UN6A 3KN8A 2FNCA 3K00A 2FYIA 2I0CA 3CVGA 4AB5A 1IUDA 1FQAA 3K6UA 5ITOA 2R71A 4P0GA 1VFEA 4YKJA 1YAEA 3O6GA 3MZBA 1P1WA 3F11A 3U92A 2Q2AA 1B5HA 4JWOA 4OTEA 2V84A 3IB1A 3Q29A 2PT1A 3GZGA 4F2OA 4OFJA 2QJEA 3SETA 4FORA 1B3FA 1WDNA 1MY4A 4FIMA 5I2NA 1UQWA 2D21A 4FEDA 4OFOA 1B3EA 4EDPA 4X1BA 2GHBA 3O6IA 2R6GE 3GBAA 2QL3A 3CG3A 2REJA 4KCCA 4QFLA 3SEVA 1M5BA 3T9UA 4I8CA 4I1DA 4H5GA 2O7UA 2F34A 2A5TA 1ATGA 2RF1A 3PPPA 3ILTB 3FUZA 3LSFB 4H8JA 4OMBA 4JWYA 3TQLA 3FIRA 2Z8FA 1A8EA 1UTHB 3KJTA 2F35A 3UA8A 1II5A 4Z7EA 3AXFA 3IJXB 4X48A 3IK6B 2Y7KA 1B4HA 2Z23A 4RJZA 2NXOA 2XX7A 2XXPA 4QHQA 1JEUA 5I57A 4P11A 1B46A 3C33A 4H6DA 1MXZA 1S7YA 1B9JA 3DLNA 3G3FA 4OENA 4RPNA 5DT6A 2DSFA 1JW1A 2Q9TA 4ZS9A 2Y7IA 4L17A 1UTBB 2GRVA 1QKBA 3OMBA 1UTHA 1B0HA 2R9JA 4U1OA 4YKPA 3PMXA 4G8MA 2PMSA 2B3FA 3PUWE 4QRZA 3O66A 3PPNA 1JQFA 3G3IA 3ONMA 5I59B 3CI8A 1Y1ZA 2F5XA 1B51A 2XX8A 4F18A 4GOTA 1I6QA 2OWTA 1MY0A 2ZXTA 4ECFA 3MAMA 4BDQA 2CZLA 3B6QA 2OZZA 4E0WA 4OEVA 1PBPA 2VGQA 4OHNA 5HBCA 4ZEDA 1GTKA 5BWJA 1LAGE 5FHMA 1CE2A 3SDFA 2F78A 5ITPA 1Y3NA 2ANJA 3E13X 3N94A 1N7XA 1MG1A 2F8DA 1PB7A 2DE3A 1ANFA 3VV5A 2O51A 1URDA 1PC3A 1SW4A 2NOOA 3UORA 3VLUA 3I6VA 2X26A 4LQ5A 3EHSA 3K4UA 4YU0A 4N07A 1JEVA 2DXYA 4HTGA 2DVZA 4IB2A 1MQIA 5B7DA 1F9BA 1M5FA 5ELVA 4P0IA 4OETA 1PBQA 3PU5A 4MF3A 2XXVA 3I5OA 2LAOA 1LFHA 1B52A 3TCHA 1Y1MA 3MVYA 2QS3A 4H0WA 4U23A 4MLVA 4H8IA 3HPIA 4WXJA 1SBPA 1UIUA 3RNNA 1OVTA 3BFUA 3FGSA 4MFIA 2ZYKA 3IOUA 2QSXA 1I6BA 3CG1A 2PT2A 3U8QA 1POTA 4JSOA 4PE5B 1DTZA 1TFDA 4G8NA 2X7QA 3S9MC 5M2VA 3IL1B 4F3SA 4TOZA 5H8NA 3VVFA 3VLWA 5CMCA 2ALUA 3TPAA 3FVGA 1EZPA 3QUFA 2FA7A 5A5XB 3R26A 1B5IA 4AB6A 5IKBA 1ZLQA 5TP9B 1H45A 2Z22A 3H03A 4ELPA 1HSJA 3ECRA 5I56B 1SW1A 2H25A 4Q5TA 5TPAA 5JTYB 3K6XA 1ELJA 2XXUA 1US4A 5H8SA 3U94A 4BDOA 4GXSB 2ONRA 3DP4A 2WKYA 3PPOA 2HZLA 4WEDA 3SEWA 3UK4A 5L8DA 3OO8A 3VFJA 3SEXA 1BLFA 4U21A 5A5XA 3TTNA 2HQ0A 2ZYMA 1AL3A 2V93A 1QJMA 2X7PA 1NL5A 2OLBA 3TQWA 1NNFA 4POXA 3KSJA 4KHZE 5H8FB 1AIVA 1FQBA 4DXBA 5CMKA 4XKRA 3MBPA 1WODA 2IEEA 4XTCQ 2Q89A 1DPEA 3G3GA 2O6AA 1UIVA 4E0XA 2XXHA 3MVXA 1Y9UA 3LC8A 1LAFE 4NF8B 3V89B 5K2YA 2D5WA 3MUQA 3IB2A 4KYEA 3L6HA 2F97A 1FQEA 5AA4A 1LAHE 3HHGA 1TFAA 1SD3A 1IEJA 1SQYA 3VLVA 1P1UA 1MY1A 2PYYA 3C9HA 3EN3A 4NF5B 1B3LA 1SW2A 3TTLA 2RCAA 4OFLA 4F1UA 4EXKA 4R6HA 2GHAA 4X9TA 2H5YA 4WEPA 4H65A 2NUVA 3PPQA 2F7AA 3OEKA 3O29A 4NF8A 1FTKA 3RT6B 4YB7A 2UVIA 2XXXA 4LVQA 3TZAA 3TDJA 4Z0IA 1BKAA 3JV9A 2ZNUA 1B3GA 3CSBA 4FATA 3IAZA 3SERA 2V25A 2Z8EA 2RKMA 4NF6A 3T9HB 4F3PA 3H3GA 4F39A 3OXNA 4F31B 2RCBA 1N84A 4ZEKA 4LZ7A 3ODBA 4RK9A 3W9VA 4ZE9A 1PB8A 4I62A 2VHAA 4GFRA 3TTKA 4YB5A 3IO4A 4GWOA 3DM0A 1H3DA 1NMUA 1B0LA 2XXTA 1N04A 4THIA 2XD2A 1L5TA 4QFKA 1DSNA 1QKAA 3Q26A 3OEMA 3RN8A 1MM6A 3IX1A 3RTFB 3K01A 1B3HA 2Y7PA 3JZJA 2HXWA 3LSWA 3Q28A 3W15C 4YMAA 4OQOA 4TLLB 2A5SA 4Q30B 3MP6A 3MWBA 3A3UA 2VOZA 3M8UA 5K2XA 4C0RA 2I58A 1OLCA 1B4ZA 3MP8A 4BDRA 3V83A 1AMFA 2H99A 3MZ1A 4G4PA 5FTIA 2ZMBA 3W9WA 3V8XB 2HEUA 1OLAA 2AL4A 1NNKA 3PV0E 4LZ5A 3PUYE 4F3BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3KFMA 4IO3A 4DZ1A 1MQGA 5IGAA 2DVCA 4DCXA 2HXRA 1VE4A 2HZKA 3VVEA 5IM2A 3PD9A 3G3HA 2FVZA 3C34A 3T0JA 3O9PA 4MEVA 3THIA 4DXCA 1Q35A 4GXAA 2ZYOA 4NWCA 3MVZA 1JVXA 4P1EA 2DQVA 1JVYA 1YYZA 4N6PA 3H6UA 3PPRA 2Y7RA 4IO7A 2G93A 3H6TA 3NOHA 1FBFA 3CFZA 1VR5A 2F6PA 4MBPA 4R6YA 2O1MA 3FV1A 4PFIA 3MQ9A 2B3BA 3M3LA 4N8GA 2QS2A 1Z7ME 1O63A 4GD5A 3IJOB 1AOVA 2E1SA 2OWSA 5EHSA 5EYHA 5A5LA 3T96B 4OANA 3EHTA 4PAIA 3O97A 4JBZA 3TEPA 3RUMA 4F1YA 5F1QA 1FTMA 3LSLA 1JETA 3N26A 1B7HA 2YLNA 5CMMA 2VD3A 1R6ZA 4C1UA 3O2AA 1A99A 2YPNA 4PQJA 1RYOA 1JNFA 1XC1A 1ZBMA 2F3DA 5JK4A 1D3KA 4QFNA 1OIBA 2AIXA 5ISUA 1QGXA 3RQTA 1CNQA 2QVRA 3TCGA 3TUSA 5L9MA 2VPOA 1D4NA 4OERA 5DVFA 1H76A 4BDLA 3MVWA 1N0TA 4R74A 2FIEA 2XWKA 2I48A 2VD2A 3C4MA 5I84A 1MQJA 3FBPA 3K1NA 5TU0A 4MLQA 1MM7A 4G77A 1Y20A 1BP5A 4MH5A 3S9LC 3RYDA 3TFLA 2O84X 4H1XA 5L9OA 3A3CA 1UTBA 1YCJA 2UYFA 5KCJB 4QFPA 3IOWA 4M4GA 5HM4B 4PP0A 4YMBA 1ZJLA 1IXHA 2PVUA 4EF1A 4ISUA 5IZZA 4KYSA 1H44A 4X8RA 1USYE 4NAPA 4ZEFA 3OELA 2QS4A 5I59A 4GX4A 4H5FA 3UIFA 5DEXB 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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