3FGSA

Crystal structure of g65r/k206e double mutant of the n-lobe human transferrin
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
Knots found
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
DKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDARLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVEHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Metal transport
molecule keywords Serotransferrin
publication title Structural and Functional Consequences of the Substitution of Glycine 65 with Arginine in the N-Lobe of Human Transferrin.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 99
structure length 329
sequence length 329
other databases KnotProt 2.0: S
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-12-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fgsA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fgsA02
3T9HB 2ONSA 4WEDA 4QSDA 5H8NB 4F3SA 4F3PA 2VD3A 2XXXA 4JWYA 4XKQA 5B70A 2Y7PA 4GXAA 1D9YA 3H6UA 1FTKA 3K1PA 1MY3A 1QVSA 2F7AA 1VSOA 3K4UA 4GRKA 3IB1A 2GHAA 4IO3A 2VP1A 1I6QA 3TTNA 4P11A 3BFUA 3MZBA 3B6WA 1MPCA 2XXIA 2I4BA 1NNKA 3VXCA 1TWYA 4F31B 1A8EA 2REGA 1SW5A 2G29A 3I3VA 1EU8A 1B5IA 1EZPA 2B3BA 5H8HB 5ELVA 4LONB 1B1HA 1M5EA 2H5YA 1O63A 3CSGA 5TPAA 4FEBA 4JDFA 5DEXA 1B1XA 3KGCA 4JXIA 4ONYA 3TPAA 1II5A 4DZ1A 2AIXA 4PETA 2F97A 2HZKA 3CSBA 2XXWA 1JEVA 4RPOA 4EQ7A 3VE1B 4LQ5A 4F39A 4YAHX 4G77A 4DCYA 4Q30B 4R74A 3HN0A 2GH9A 3FXRA 2F6PA 1M5DA 3G3KA 2PX1A 2XXPA 4R9FA 3KOSA 1M5BA 3TQLA 2XXRA 2F36A 4C1TA 3U94A 2DVCA 2UVIA 2ZNUA 5I2KA 1Z7ME 5L8DA 4FIMA 5F7VA 1ZKBA 1US4A 3FXQA 4R75A 4YKIA 3TKDA 2Z8DA 3IK6B 3PU5A 1AOVA 3TYHA 4ZZAA 3TAJA 3G3HA 4I1DA 3B6TA 1QKBA 4RJZA 4F29A 3EN3A 3E13X 4OEVA 4OETA 1P99A 5DTBA 1VFEA 1UTBB 5AA4B 1MXUA 3MPKA 4TQUQ 3VVDA 4PFTA 3HHFA 1DPEA 2UVHA 4TOZA 1B52A 3FASA 1IITA 1Z7NE 2Y7IA 4OFLA 1JETA 1FQAA 4YKJA 1B9JA 2I49A 1OQGA 2XXQA 5JEIA 3W9VA 3LUYA 1IXIA 1DPPA 2Z23A 2XD3A 3EF7A 3N6UA 2DYXA 2UYEA 4QFNA 2PYYA 4IO7A 2ESNA 1JW4A 4M4GA 3MP8A 1EH3A 4OERA 2P2AA 2I4CA 4ISUA 4WXJA 1N7XA 2ZYKA 1XVYA 4OVJA 1P1NA 3O29A 2RKMA 5I59B 1AH5A 3CI8A 1FTMA 1D9VA 1XVXA 1NNTA 4NTLA 3MP6A 3DP4A 4RXLA 1NNFA 2ALUA 1USYH 5FTIA 3KSXA 3IL1B 1URSA 4NMYA 2WKYA 1ZLQA 3UGWA 1QULA 2DWJA 3UP9A 3SDFA 1MQIA 1N3XA 1B46A 3TEPA 5FHNA 4G8NA 1GTKA 5ISUA 3E9XA 4NWDA 4Q5TA 1B4HA 2QS1A 1B3FA 2I0CA 5CMCA 3GBBA 2ZXTA 3PPNA 4IGTA 4G68B 2P0SA 1DOTA 1GR2A 3PMVA 1MXVA 2NXOA 1N04A 1OLCA 3KOTA 2HAVA 1TFAA 3G7WA 3OENA 4R6HA 1MRPA 3KBRA 3FVGA 4POWA 5I56B 5CBSA 4R2BA 1FTJA 3MP1A 2ZYNA 3T9VA 1ZU0A 4G68C 5HM4B 2I58A 4IB2A 2D21A 1EZOA 4EDPA 1LAFE 5EYFA 3S4UA 4X48A 5FHMA 3FV1A 4UA8A 4BDNA 1SW1A 3ONMA 3FGSA 2QJEA 4MLQA 3PPOA 2DVZA 4H0WA 3U8QA 1LB8A 1IIWA 1KWHA 1XT8A 3KEIA 1UQWA 4LUBA 1BP5A 4IO6A 3S9MC 1H45A 3TZAA 1IUDA 1B6HA 4U1OA 3FVOA 4C1UA 3A3CA 3QIMA 5H8QA 5EHMA 3MVYA 3Q25A 1SBPA 4NF5B 4KHZE 3MJNA 1QUIA 4I8CA 4OMBA 2UVGA 1RYXA 2OLBA 2UVJA 1OIBA 3PGFA 1MQDA 3L6HA 2R71A 5I84A 3MC2A 1IXCA 1A40A 3I6VA 3SEWA 4NWCA 1MXZA 1A99A 3K2DA 1SW4A 4EXKA 4PFUA 3MVXA 4H5FA 1LSTA 3T9XB 5BWJA 5I57B 1VFDA 1CB6A 5H8FB 1MQJA 1B2HA 1P1QA 2Y7KA 3MBPA 5ITPA 3VFJA 3CIJA 3GXAA 4H1XA 1IEJA 2FYIA 4HTGA 3VVFA 4RY1A 5AA1A 3SERA 4EUOA 5KCJA 4BDLA 1MXXA 1MM6A 3K6UA 2HAUA 4E0XA 1B7ZA 1VR5A 2ZMBA 1PC3A 4YB6A 4U22A 2V3QA 3TTLA 3OO8A 3TTKA 3K1MA 4QHQA 4PFYA 1D3KA 3IJOB 3SEVA 1PDAA 1XOCA 3OOAA 3I5OA 2V93A 2P1SA 3Q26A 4JWXA 4Z0IA 3S9LC 4ND9A 5L9OA 1B32A 3RY3A 2BJJX 4NF4B 1B51A 2V84A 3EHSA 4R6KA 5B7DA 4U1ZA 1Y4CA 1LBBA 4U23A 3T22A 3LR1A 3CG1A 4BDOA 3QYTA 3T93B 3S9NC 5IAIA 1WODA 1YPNA 3H6TA 5HBCA 1FW0A 1LFGA 2B3FA 3MUQA 4YU0A 4GLIA 4XKNA 5H8NA 4KI0E 3R26A 2OWTA 4ZEBA 2DXRA 2QRYA 4OYVA 3IJXB 2DE4A 2HXWA 4WEPA 4NEDA 3CFZA 4G2ZA 4M1VA 1H76A 4DXUA 1B0HA 2O68A 4OTEA 2Z8FA 1B58A 4ZE8A 1OVTA 3OXNA 3K0VA 3RQTA 3FJMA 4U2RA 3H7MA 2XHDA 4AQ4A 4DCXA 3WAFA 1PEBA 2Y7RA 1NMUA 4THIA 3LSFB 1N76A 1WVJA 1RKMA 1Y4TA 3W9WA 2AL4A 2OZZA 3M3LA 1DMBA 3LBSA 2VHAA 1USYE 2OK2A 4YICA 3OELA 5H8HA 3TCFA 1MY0A 1LB9A 4LZ5A 4PFWA 4GFRA 3M3KA 4P0GA 2DQVA 3PV0E 3PUZE 2X26A 2DE3A 1B0LA 1Y20A 4IO5A 2XXHA 2RINA 4FE8A 5KZTA 3N5LA 3QUJA 1A54A 4H65A 3G3FA 2HCAA 4F1UA 1B4ZA 3T96B 5DVIA 2E0SA 4RPNA 4XIGQ 3MW0A 3RGYA 2GHBA 3LC8A 1Q35A 3ZS6A 4ZECA 5DVJA 3C31A 3KN8A 1B7HA 1SI0A 1MY4A 1YTVA 4N07A 2I48A 2RC7A 1NH7A 4H67A 2QMWA 2DP8A 1H44A 2ANJA 2HEUA 3M3FA 5H8SA 4HCWA 1NL5A 2XX9A 2CMOA 4EQBA 4KYDA 3LSXA 2DWAA 1URGA 5A5XB 2NVUB 1YAEA 1WDNA 3O2AA 1T0KA 3P7IA 5FHOA 2F8DA 1B5JA 3TQWA 4DLDA 3MWBA 5I2NB 5K2XA 2O1LA 3PPRA 2Y7WA 3EPEA 4GWOA 1H3DA 2YJPA 3RTWB 5AA4A 1BTJA 3FXUA 4EQ9A 2G93A 3IX1A 2RCAA 1JNFA 3PUXE 4KFQA 3TDJA 5JTYB 1QUJA 1R6ZA 3S9EA 2OBGA 1PBPA 1Y1MA 4GQOA 1R9QA 1D4NA 1B3EA 1B3LA 5FTHA 3BFTA 3JYRA 2XXYA 1QJMA 3ODBA 2F6GA 1Q1KA 1PB7A 5JK4A 2A5TB 3IOWA 2H99A 4JSOA 2NWJA 3FD3A 5F1QA 1GVCA 3R7XA 3KSJA 2DOJA 2AL5A 1LAHE 5I59A 3N94A 2O51A 4OENA 2Z22A 2QPQA 4OWDA 3GLBA 4RA1A 1ZMGA 3SEYA 2XXVA 1MQHA 3PD8A 4OZ9A 4OXVA 2B65A 3FJ7A 3N6TA 5CRYA 3MVZA 2ONKE 1SDXA 1HSJA 3RT8A 3B7DA 1S9TA 3RNNA 1B7UA 1BLFA 3VLWA 2FA7A 3A09A 3PMXA 1I6BA 3TFLA 3KFMA 1MH3A 4YKKA 2PT2A 3TUSA 3K02A 5AA2B 1JEUA 3OEKA 3FVKA 3KJ7A 3U72A 3BBRA 4G68A 4MFIA 3JZJA 4MBPA 2PVUA 1GGGA 1P1UA 3G3IA 3OO7A 4YMAA 4NF8B 5CMMA 4AB5A 5I56A 2Q2CA 3VV5A 1MY2A 1AL3A 2XX7A 4GIZA 3EQ1A 3UORA 4ZEFA 2ABHA 1OMPA 3OO9A 3CFXA 4LP2B 3C32A 1DTZA 4NF6B 3SEXA 3IO6A 2Q88A 2F5XA 3FVNA 1JQFA 2QS3A 4TLLB 3H6WA 1N0TA 3C35A 2F7BA 2V3UA 4LZ8A 3RT6B 1MDP1 3K1NA 5TP9B 2NOOA 5K2YA 3H4ZA 2PT1A 3Q27A 2F34A 3B6QA 3KN3A 5KDTB 5L9SA 4PE5B 1UTHB 2GFEA 3M8UA 4OQOA 2IEEA 2I3VA 1MG1A 3QXMA 2X7PA 3KZGA 1A55A 4NF5A 1YCJA 3HCQA 4NE4A 4F18A 1URDA 1R1NA 2RCBA 3QAXA 3HO7A 1I69A 2I6EA 1PB8A 1MY1A 4FORA 4OESA 4HS7A 3DELB 4LVQA 4F3BA 4RK9A 3GZGA 2IA4A 3PUYE 4ZEDA 5I57A 3IAZA 5H8FA 1A7LA 1MDQA 1H43A 4XTCQ 4KCDA 1MS7A 4F2QA 2VD2A 1FQEA 3SKPA 3T66A 4ZE9A 2Y84A 4ELRA 2LAOA 5AA3A 2NUVA 5CMBA 4G8MA 5I58B 4IO2A 1POY1 3OMBA 4JSDA 3A3UA 1MPBA 4R72A 4JWOA 1Y3PA 3U93A 4BDQA 3DLNA 2ZYOA 3O9PA 1SVXB 4GL0A 1LFHA 4OHNA 3VLVA 2DSFA 1ELJA 3Q28A 3L6GA 2ZYMA 2H25A 1F9BA 3IR1A 3V83A 4OEUA 1RYOA 4KCCA 1UIUA 2I0BA 1SYIA 2XD2A 3O66A 3F11A 4GVOA 4FJPA 1FCKA 3KN7A 4HCYA 3PUVE 1S50A 2RC9A 4YKPA 3IB0A 5J1DA 4O3AA 3FZVA 2Q9TA 1BKAA 3VVEA 4F22A 4NF4A 4OFOA 2DE2A 4R6YA 3UA8A 2O84X 5LOMA 5CMKA 3TMGA 1FQDA 3SESA 4LQ2A 1FQCA 2E1SA 4KR5A 3VXBA 4LA9A 4ELQA 3K01A 4Q8RA 2R6GE 3RPWA 3TTMA 4JBZA 3H06B 4F1YA 1PBQA 1J1NA 4R9GA 1Y3QA 3PPQA 5TU0A 2H4IA 4IY6A 3TTRA 2M8CA 4O3CA 5CI5A 1P1WA 5TPAB 3BKIB 5DEXB 4FATA 1TFDA 3THIA 1NNPA 3UN6A 2XXUA 4X1BA 3SEUA 4C0RA 1N84A 2HFBA 5IKBA 1ZTYA 4RNSA 3TCHA 1MXWA 4QFKA 4YB5A 3IORA 2RF1A 1LGBC 4ZEKA 4LATA 3RTFB 3GBAA 1DTGA 4GD5A 4PP0A 4WKMA 4YMBA 4AB6A 4N6PA 5EHSA 4X9TA 5DVFA 1AIVA 3IOVA 4L17A 4F3GA 3MAMA 3K6VA 1UIVA 1EZ9A 4K3FA 3RN8A 3QK6A 1B3HA 2Q8JA 1FTLA 3KJTA 4XKPA 5I2KB 1SQYA 3IO4A 1QW0A 2X7QA 1LAGE 4G4PA 2A5SA 1DSNA 4FECA 3T9UA 3FV2A 4FEDA 4F19A 5DT6A 2OCUA 4QFLA 4DXCA 2VOZA 3HHGA 1LFIA 1NH8A 3PUWE 3K6WA 3U92A 4O3BA 5DYHA 3C33A 1MXYA 2F78A 3AXFA 2KLFA 1HSLA 3R6UA 3OO6A 4U4XA 3DM0A 3DP6A 1LAXA 3O6IA 2ZNTA 3ILTB 4ELPA 4ZEIA 4N13A 1LCTA 4RK2A 3V8XB 3EHTA 3E4RA 3VDFA 4MF3A 2OJTA 1Y9UA 1JW1A 1QUKA 1UTBA 4EF1A 4KYEA 4BDMA 2QMXA 4E0WA 4R73A 5A5XA 2FNCA 1ZJLA 3HV1A 1MH4A 1FQFA 3QSLA 1IXGA 4H8JA 4I62A 3S2VA 1ATGA 2F35A 5I2NA 3U1OA 4H6DA 4U4SA 2UYFA 1P1OA 5ITOA 3CRBA 4OFJA 2DS9A 5M2VA 2XX8A 3G3GA 3HPIA 2VGQA 4H5GA 4LZ7A 5JTYA 3OEMA 2DWHA 3V5AA 3EHUA 3D4CA 1SYHA 4ESXA 3LSWA 3O6HA 4KYSA 2O7UA 1L5TA 4ECFA 4KD5A 1NKXA 3CFLA 1A8FA 2DXYA 1ANFA 3G3JA 1Y3NA 4KQPA 3O6GA 4QFOA 2R9JA 4XXUA 1N3WA 2A5TA 1VE4A 4MLVA 1M5FA 2I3WA 1Y1ZA 1B05A 4ZDMA 4RYAA 2ZNSA 1IZ1A 5AE4A 1JW5A 3FIRA 4F2OA 2RC8A 2UXAA 3QUFA 5BUUA 5CBRA 2H98A 4GL8A 4P0IA 2YPNA 3W15C 3CG3A 1GV8A 2O1MA 3ZKLA 3MPLA 1IQ7A 2Q89A 3V89B 2V25A 1TXFA 3WAEA 3MZ9A 4GXSB 1SW2A 5AA2A 4EXLA 3UIFA 1M5CA 1US5A 1OVBA 3ILUB 2V3TA 4H8IA 1OQHA 1HSEA 2THIA 3RLFE 1JVYA 1ZIUA 4QFPA 4YZZA 1LBCA 3OD7A 4NF8A 4FAJA 4HW8A 1ZBMA 2OWSA 4ESWA 3N26A 1O64A 3SETA 2ONRA 4QRZA 5H8QB 2O6AA 5CM6A 1FQBA 1OLAA 2F7CA 2W7YA 3MZ1A 3C4MA 4NF6A 4JB7A 3C36A 3H6VA 3O28A 3LSLA 3PPPA 4PQJA 4QF9A 4IY5A 2GRVA 1N7WA 1QKAA 3TCGA 3K00A 3MQ9A 5TP9A 1AMFA 4QSCA 3UK4A 4YB7A 3MVWA 4G8HA 1LLSA 4U21A 4XKRA 1IXHA 3IB2A 4I9DA 1FTOA 2QS2A 5KDTA 1CE2A 1XC1A 2REJA 1UTHA 4DXBA 3ZKKA 1B5HA 3D4GA 1MQGA 4DIGA 2HZLA 1BIYA 1MM7A 3ECRA 4BDRA 4GOTA 2HQ0A 1SI1A 3H3GA 3TELA 4BLAA 1POTA 4DDDA 3TODA 1S7YA 3RUMA 1NFTA 5KCJB 3PMWA 1PB9A 4X1DA 1XS5A 4POXA 2YLNA 4MH5A 3FJGA 2PBWA 3O97A 4EF2A 1O7TA 2Q2AA 1R9LA 2D3IA 3IOTA 3USDA 3FATA 1TT1A 3KG2A 4F1VA 2H9BA 4TLMB 4IGRA 1LCFA 3E3KA 4KPTA 1XHYA 3C34A 4ZS9A 4ZZEA 3VLUA 3JV9A 4GF8A 3FUZA 5I58A 1B40A 3CR9A 4ELOA 3DP8A 3H03A 5ICTA 1MPDA 2PMSA 5ICQA 3HSTA 3C9HA 2O7IA 4IO4A 1I6AA 1JVXA 3OSQA 2AYSA 4R2FA 4UACA 3OSRA 3CVGA 1B3GA 2QS4A 3K6XA 4QSEA 5CC2A 2CZLA 2XXTA 3PD9A 4DE8A 1SD3A 2QL3A 3ZSFA 2O69A 2Z8EA 3Q29A 2DWIA 5L9MA 4Z7EA 5HPQA 2D5WA 2QSXA 5AA2D 4Q0CA 3IOUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3T9HB 4OVRA 2ONSA 4WEDA 2ZZWA 4QSDA 5H8NB 4F3SA 4F3PA 5FBPA 2VD3A 2XXXA 4JWYA 4XKQA 5B70A 2Y7PA 4GXAA 1D9YA 3H6UA 1FTKA 3K1PA 1MY3A 1QVSA 2F7AA 3IFAA 1VSOA 3K4UA 4KXPA 4I3YA 4GRKA 3IB1A 1IMDA 2FIEA 2GHAA 4IO3A 2VP1A 1I6QA 3TTNA 1NV6A 4P11A 3BFUA 3MZBA 3B6WA 1MPCA 2XXIA 4N91A 2I4BA 1NNKA 3VXCA 1TWYA 4F31B 1A8EA 3LUZA 4LN5A 2REGA 1SW5A 2G29A 3I3VA 1EU8A 1B5IA 1EZPA 2B3BA 5H8HB 5ELVA 1KA1A 4LONB 1B1HA 4UABA 1M5EA 2H5YA 1O63A 3CSGA 5TPAA 3IFCA 4FEBA 1LBVA 4JDFA 5DEXA 1B1XA 3KGCA 4MHFA 4JXIA 4ONYA 3TPAA 1II5A 4DZ1A 2AIXA 2WBBA 4PETA 2F97A 2HZKA 3CSBA 2XXWA 1JEVA 4RPOA 4EQ7A 3VE1B 4LQ5A 1RDXA 4F39A 1FJ9A 4YAHX 3RPLB 4G77A 4DCYA 4Q30B 4R74A 3HN0A 2GH9A 3FXRA 2F6PA 1M5DA 3G3KA 2PX1A 2XXPA 4R9FA 3KOSA 1M5BA 1DCUA 4N6DA 3TQLA 2QVRA 2XXRA 2F36A 4C1TA 3U94A 2DVCA 2UVIA 2ZNUA 5I2KA 2MKZA 1Z7ME 5L8DA 4PCDA 4FIMA 1FBFA 5F7VA 1ZKBA 1US4A 3FXQA 4R75A 4NQ8A 4YKIA 3TKDA 4I40A 2Z8DA 3IK6B 3PU5A 1AOVA 3TYHA 4ZZAA 4O94A 3TAJA 3G3HA 4I1DA 3B6TA 1QKBA 4JVIA 4RJZA 4F29A 2XXKA 3EN3A 3E13X 4OEVA 4OETA 1P99A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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