3FGSA

Crystal structure of g65r/k206e double mutant of the n-lobe human transferrin
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
Knots found
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
DKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDARLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVEHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural and Functional Consequences of the Substitution of Glycine 65 with Arginine in the N-Lobe of Human Transferrin.
pubmed doi rcsb
molecule tags Metal transport
source organism Homo sapiens
molecule keywords Serotransferrin
total genus 99
structure length 329
sequence length 329
other databases KnotProt 2.0: S
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-12-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fgsA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fgsA02
5CRYA 1SW4A 1PEBA 2F35A 2F5XA 1PB9A 3PMWA 3B6WA 2R9JA 2DVCA 1R1NA 2IA4A 4ZZAA 4U23A 3TKDA 1IQ7A 4OETA 3QUJA 3Q25A 4RK9A 1O63A 3RUMA 1B32A 3PMXA 3FXQA 3OD7A 3PPRA 3UA8A 4IO2A 5CM6A 3PPNA 2NVUB 2XD2A 3KSJA 1OQGA 2Q89A 1FQDA 4LONB 3WAEA 4NWCA 2Z22A 2OBGA 5ITPA 4YKPA 2AL5A 4BLAA 5F7VA 1WDNA 3QAXA 1B3FA 4PFWA 2H9BA 2WKYA 4OYVA 4ONYA 2DYXA 2DWAA 3PMVA 4UA8A 5DVJA 4F3PA 1NH8A 4LZ5A 1TWYA 3IJXB 3T66A 3CSBA 1OQHA 1B3LA 3SDFA 2P2AA 4F2QA 4ZECA 3RLFE 2R71A 4RYAA 4EXKA 2HFBA 1OIBA 4YU0A 4G2ZA 2DVZA 5DEXA 2H98A 1FQCA 4QF9A 2THIA 3OXNA 1L5TA 1B05A 3QSLA 2ZYKA 2PMSA 1BKAA 4TOZA 1PBQA 3K6XA 2YLNA 2XX8A 2V84A 3K1MA 4KCDA 3SERA 1II5A 4O3AA 1VFDA 1EH3A 4GOTA 4BDNA 3TEPA 3TTRA 3IO6A 5AA1A 2OJTA 1TFAA 2CZLA 4FAJA 2F7BA 3QXMA 3KZGA 4G8HA 2Y7KA 4JWOA 5M2VA 5L8DA 4MH5A 2XX7A 4IO6A 3N5LA 3KN7A 1N0TA 2Y7PA 1RKMA 2NOOA 5I56A 3CG1A 1XOCA 2I49A 1LLSA 1QKAA 4O3CA 1TXFA 2AL4A 4G68B 4GF8A 1MPBA 5HM4B 4WEDA 3PUYE 2NUVA 2VP1A 5TPAB 4H5GA 4RJZA 1Y1MA 1IIWA 3VVEA 5KDTA 1B1XA 4R2BA 4RY1A 3TDJA 3ONMA 4RA1A 4G77A 4H65A 2I3WA 4FEDA 3MZBA 4IGRA 3UORA 4U4SA 3U1OA 1NNKA 2ZNUA 5CI5A 3SEUA 3LR1A 4DE8A 1ELJA 5I58A 2RC8A 3SEVA 1JEVA 4TQUQ 4X1DA 5DT6A 1DPEA 3MP1A 1P1WA 3O28A 1URDA 2B3BA 1IZ1A 1T0KA 1EZ9A 4IY5A 5CMBA 5I84A 1SW1A 2P1SA 2I0CA 1GV8A 4MLVA 2O7UA 1MY1A 3U8QA 4NF6A 2XXUA 3I6VA 4AQ4A 1N3WA 3U94A 1VFEA 1IUDA 2UYFA 1ANFA 5L9OA 2B65A 4KFQA 1B3EA 5I58B 2VD3A 1D3KA 1LB8A 1SI0A 2F7CA 2DWIA 4GVOA 3SETA 3DELB 2DXYA 1OLCA 3USDA 3I5OA 1DTGA 2XD3A 3F11A 1QUIA 4NF6B 3MVXA 4I62A 3KGCA 2ONRA 1KWHA 3Q28A 1YPNA 1US5A 2AYSA 1URGA 1N7XA 2DE4A 1FTMA 4ELQA 4YMBA 3MPKA 4TLLB 2IEEA 3L6GA 5ICQA 4NF5B 3UK4A 1QVSA 1ZTYA 5JK4A 4DXUA 1UTBA 2Z23A 4L17A 2UVGA 3OSQA 2F6GA 1MQHA 4U4XA 1D9YA 2HCAA 1IXHA 4MBPA 3TUSA 2ZXTA 1QUKA 3UGWA 2F6PA 1WVJA 3KJTA 2F36A 1SYHA 2O6AA 3K01A 3ZKKA 1NNPA 4NWDA 1NFTA 2DXRA 1Y1ZA 4ZEBA 1Y4TA 5ITOA 3C35A 3V5AA 2QMWA 3PD9A 2DSFA 3E3KA 5KZTA 1MRPA 3PPOA 2GFEA 1Y3QA 4OXVA 2H5YA 4ZEIA 4C1TA 3T22A 3H06B 1FTKA 5CBSA 1QW0A 3V8XB 4LQ5A 4PE5B 1EU8A 2D21A 1JEUA 2O51A 4ND9A 5I2KA 1TT1A 1FTLA 4ELOA 2Z8FA 3QYTA 3PU5A 4HS7A 1LBBA 3K4UA 1MPDA 2F7AA 3H7MA 4F29A 1XT8A 3H6TA 3VXCA 4YKKA 1MM6A 3CSGA 1A54A 2OZZA 3OOAA 4ESXA 3E13X 1LB9A 1UIUA 3OEMA 1N04A 4F1VA 3U93A 2XXHA 4NF4A 1B4ZA 1LAFE 5I2KB 2F8DA 2GH9A 3W9WA 4ELRA 4PETA 3C4MA 1MDP1 4U2RA 2DOJA 3A3UA 1I6QA 4OEUA 1DSNA 4F1UA 1D9VA 2QSXA 3RY3A 2Z8EA 3PUWE 4ISUA 3MPLA 1Y4CA 1JW4A 3G3HA 1MXYA 4QHQA 1JNFA 1P99A 2O1MA 4POWA 2Q8JA 4JWYA 2O68A 1AMFA 3IOWA 3DLNA 1AIVA 4K3FA 3K00A 1MQIA 3VXBA 5B7DA 3KBRA 1MG1A 4XIGQ 1B51A 4Q30B 3S9LC 1B6HA 4JWXA 5K2YA 3G7WA 4QFLA 4QRZA 3G3GA 2G29A 2GHAA 2Q2CA 3O97A 2KLFA 4F22A 2XXYA 2Q9TA 4JB7A 3FXUA 2ONKE 5A5XA 3D4CA 5HPQA 4N13A 4FE8A 1GVCA 4C1UA 3U72A 3TAJA 2X7PA 4I9DA 4IGTA 3BFUA 4KI0E 1ZMGA 4AB5A 1B0HA 1MQDA 1US4A 2HXWA 4YICA 3TELA 1OVTA 4QFKA 2RC9A 3D4GA 3HN0A 4OFLA 1ZJLA 3EN3A 2RKMA 3BKIB 3OENA 1MY0A 1OVBA 5DVIA 4OERA 3IOTA 4F3GA 3O6HA 2D5WA 3MVYA 1BIYA 3B7DA 3TCHA 3KN8A 4TLMB 5AE4A 1Y9UA 4DZ1A 4R6HA 5H8SA 1PDAA 4OHNA 4X1BA 2O1LA 3ILTB 4OZ9A 3PGFA 1FTJA 3S9EA 3VLUA 2DE2A 3ZKLA 3P7IA 2XXQA 3IB2A 3MW0A 3VLVA 4DDDA 3HCQA 3UP9A 5KCJA 3O2AA 1GGGA 3ZS6A 4RPOA 2UVHA 3N6TA 1IXGA 1CB6A 1A99A 1P1UA 2XX9A 1UTHA 3H4ZA 1USYH 3TFLA 1RYXA 3FV2A 5DEXB 4FEBA 2Q88A 4I1DA 1Y3PA 4X9TA 1USYE 4GQOA 1N76A 3MZ1A 4G68C 5I59A 4BDQA 1FCKA 1JVXA 2VOZA 1LFHA 1N3XA 1MQGA 4ZEDA 4XKNA 4KYEA 3HHFA 4EQ9A 2XXTA 2ABHA 3VLWA 2M8CA 2PT2A 1ZIUA 3KSXA 4R73A 3EQ1A 4RPNA 2X7QA 3DP8A 1R9LA 3QIMA 2VD2A 2QMXA 3LC8A 1VR5A 1B40A 4QSCA 3KOSA 3MWBA 4YB6A 2FYIA 3EF7A 3JYRA 5F1QA 3R6UA 4IY6A 1XHYA 4H0WA 3MVZA 5B70A 5EHMA 2V3TA 5I59B 3FV1A 5FHOA 3T9HB 1NNTA 5H8NA 3CR9A 5I56B 2I6EA 3TTLA 4IO4A 4E0WA 1P1QA 1MH3A 1EZOA 3SEXA 5H8FA 2QS2A 3VDFA 3K0VA 3H6VA 4GL8A 4XTCQ 3M3FA 2OWTA 3E4RA 4KCCA 1HSLA 4OTEA 1MQJA 2XXPA 1XC1A 4MLQA 4LA9A 5ELVA 4ZDMA 4ZE9A 5KDTB 2QL3A 4Q5TA 3IAZA 5K2XA 5H8QA 4FORA 2ALUA 1SW2A 3S4UA 5H8FB 5L9MA 1MXVA 4WEPA 4PQJA 1MY4A 5LOMA 3KEIA 1SQYA 4G4PA 4G8NA 1YTVA 4H5FA 2I58A 3TPAA 4DXBA 1BTJA 4DCXA 4P0IA 4F3SA 2UVIA 1H3DA 2O84X 5FHNA 2F78A 5H8QB 5AA2A 4UACA 3IK6B 3V89B 5I57A 3FVNA 4OESA 1MXXA 3Q27A 4EQBA 2B3FA 4GL0A 4PFTA 4I8CA 2PT1A 1SI1A 4NEDA 2OLBA 3K2DA 3KOTA 3RTWB 1D4NA 3H6WA 3PPPA 2E0SA 3RGYA 3TTNA 5AA3A 3M8UA 3PUZE 5AA2B 2Q2AA 1Z7NE 1I6AA 4RNSA 4ZEFA 3OO9A 4WXJA 3CG3A 3IB1A 5ICTA 4OQOA 4OVJA 3OO7A 3CFXA 3FVKA 3HHGA 3TTMA 3GBBA 1JETA 2REGA 2HEUA 4NF8A 3CRBA 2QRYA 3T96B 3LUYA 1H45A 1UTBB 2H25A 2RF1A 4EUOA 2F97A 3RN8A 2XXIA 2I3VA 2ANJA 5AA4A 1POY1 1ATGA 4BDRA 1PB8A 5BWJA 3CFZA 1B58A 4OFOA 3FATA 1MDQA 3SEWA 1DMBA 4ECFA 1LGBC 3BBRA 3M3LA 4QSDA 4NF8B 4EF1A 3GLBA 2DWJA 4GFRA 2QS4A 2I4CA 1UQWA 1SW5A 4HCWA 4H67A 5TP9A 3G3KA 5AA4B 4XKRA 4QFNA 2PVUA 4ZE8A 3FXRA 1NNFA 5DVFA 4Q8RA 1A40A 2I0BA 3FUZA 1POTA 2HAVA 4R9FA 3MP6A 3G3FA 3CVGA 1Y20A 1EZPA 2E1SA 3FVOA 2D3IA 3C33A 3DP4A 2QS3A 3N6UA 2Y84A 3OO6A 3OEKA 1FQBA 4POXA 3RNNA 1QUJA 3PD8A 4E0XA 1JW5A 1CE2A 4FECA 3RT8A 4OENA 1NMUA 4NF4B 1YCJA 2DQVA 5ISUA 4KR5A 2F34A 4LQ2A 3IJOB 1ZBMA 4R6KA 2YJPA 1B46A 1B5JA 1IXIA 2ZNSA 1SYIA 5FTIA 4OMBA 2XXWA 1N7WA 1MM7A 2VGQA 2Y7RA 1MY2A 5AA2D 1B0LA 3SKPA 4DIGA 2ESNA 1B52A 3KN3A 2DWHA 2GHBA 3RQTA 3MAMA 3THIA 1P1OA 5EYFA 3MC2A 1Z7ME 5IKBA 2H4IA 1LAXA 3K6UA 2ZYOA 3IOVA 4P11A 4R6YA 3GXAA 4LZ8A 1SDXA 5CC2A 1LFGA 1LAGE 4F3BA 3C34A 3G3IA 4HW8A 4KHZE 5IAIA 1WODA 4PP0A 3ECRA 3IO4A 4F18A 3FGSA 5DTBA 4U22A 1VSOA 3R26A 1I69A 4F31B 4BDLA 4ZEKA 4R72A 1MPCA 3HV1A 3VV5A 4NMYA 2RINA 3OELA 4HCYA 4HTGA 2XHDA 4IO7A 2REJA 3IORA 5DYHA 2XXRA 2HZLA 3TCFA 1LAHE 3K1NA 1S50A 1B7UA 3PV0E 5CMCA 3LBSA 1HSJA 4GLIA 5A5XB 4EXLA 3MQ9A 3SESA 1S9TA 4YAHX 1HSEA 3ILUB 1PBPA 1B4HA 2DS9A 3O9PA 1AOVA 1P1NA 4LZ7A 4OWDA 1AL3A 5FTHA 3FZVA 2RCAA 4JBZA 3O6GA 4DXCA 3FJGA 3K02A 3SEYA 3HPIA 4GIZA 2LAOA 3TMGA 1ZKBA 2AIXA 2I48A 3TQWA 2QPQA 3TCGA 4H1XA 1LBCA 1NL5A 3T9VA 4EDPA 3FJMA 1BLFA 3HO7A 4O3BA 3H03A 4LATA 1Q35A 1A8FA 1RYOA 2FNCA 4JXIA 3LSWA 4GRKA 4DCYA 1XS5A 4OEVA 3FD3A 2VHAA 5I2NA 1B3HA 3MJNA 1B7ZA 4IB2A 2RCBA 4KYSA 1OLAA 3V83A 4G68A 4Z7EA 1XVXA 1I6BA 2QJEA 3PUVE 4BDOA 3VVDA 3K1PA 1QULA 1DPPA 4EF2A 5BUUA 5KCJB 2UXAA 3UIFA 3W9VA 2PYYA 2ZYMA 3R7XA 5TPAA 1Y3NA 4F19A 1ZLQA 1IEJA 2OCUA 1UTHB 5JEIA 3DP6A 3PPQA 5L9SA 1B3GA 4R2FA 3PUXE 1IXCA 4N07A 3TODA 1OMPA 2Y7WA 4LVQA 1B1HA 1YAEA 5I2NB 1MXZA 2CMOA 2P0SA 1R6ZA 2RC7A 3FASA 3IR1A 5HBCA 4XXUA 4F1YA 2DE3A 1ZU0A 2NXOA 1MH4A 4YMAA 4U1OA 1H44A 3TZAA 3MUQA 4MFIA 1B9JA 2ONSA 2DP8A 3MP8A 4GXAA 1M5CA 4F2OA 4F39A 3O66A 3EHSA 3ZSFA 4U21A 4QFOA 5CMKA 3RT6B 1XVYA 3K6WA 3U92A 1BP5A 4Z0IA 4KYDA 5H8NB 3UN6A 3E9XA 3M3KA 3H6UA 4JDFA 4R9GA 4H6DA 1S7YA 3I3VA 3L6HA 3T9XB 1URSA 3IOUA 1MS7A 1DOTA 3C9HA 4U1ZA 4RXLA 2FA7A 2PX1A 4P0GA 5CMMA 4PFYA 3VFJA 3EPEA 3LSLA 1MXWA 1IITA 3AXFA 3O29A 1Q1KA 4FIMA 1B5HA 4AB6A 1B5IA 1B7HA 4LP2B 2BJJX 3TTKA 4PFUA 1UIVA 3A09A 3QUFA 1O7TA 3Q29A 2V3QA 3C31A 1DTZA 4Q0CA 2ZNTA 1QKBA 4GD5A 3A3CA 4X48A 3G3JA 4C0RA 3JZJA 2O7IA 3IB0A 2ZYNA 3OO8A 3IX1A 3OSRA 4NF5A 1MXUA 1A55A 3EHTA 1JVYA 4EQ7A 3MBPA 4KQPA 4MF3A 4KPTA 3C36A 4GWOA 4H8IA 4IO3A 1VE4A 3MVWA 2X26A 3HSTA 4LUBA 3O6IA 2GRVA 3WAFA 1GR2A 4RK2A 1FQEA 2UVJA 3FIRA 2ZMBA 2HQ0A 2HZKA 4YKJA 1SVXB 3RPWA 4H8JA 1M5FA 3KG2A 4ELPA 3FJ7A 3EHUA 3S2VA 5I57B 4FJPA 1FQAA 1F9BA 2UYEA 5JTYA 4JSDA 3OMBA 1M5BA 2OWSA 2A5SA 2Z8DA 3B6TA 4R74A 5J1DA 2HAUA 3KJ7A 3GBAA 1AH5A 4NE4A 4YKIA 2W7YA 3CI8A 1NKXA 2OK2A 1LSTA 4NTLA 3RTFB 1M5EA 1N84A 2I4BA 1M5DA 4R75A 2QS1A 1SBPA 3CFLA 2XXXA 3IL1B 1GTKA 3ODBA 1B2HA 1FW0A 4YB7A 4ZZEA 4OFJA 1H76A 3CIJA 4XKQA 5JTYB 4WKMA 1PC3A 1MY3A 3FVGA 4GXSB 5TU0A 4QFPA 4G8MA 2YPNA 1QJMA 1A7LA 1O64A 3T9UA 1J1NA 4M1VA 3C32A 3TYHA 1LCFA 4XKPA 2V25A 2R6GE 3N26A 2H99A 1R9QA 2O69A 4YZZA 3W15C 3VVFA 1NH7A 5FHMA 3K6VA 2G93A 1LFIA 4M4GA 2A5TA 2V93A 4N6PA 1A8EA 3N94A 5H8HA 4BDMA 3KFMA 4KD5A 4THIA 3GZGA 5EHSA 3S9NC 1SD3A 2NWJA 3S9MC 4ESWA 3H3GA 1JW1A 2Y7IA 3MZ9A 3Q26A 3JV9A 1TFDA 1LCTA 4ZS9A 1FQFA 3T93B 1H43A 5TP9B 2XXVA 1JQFA 4IO5A 4DLDA 3TQLA 4QSEA 3VE1B 2A5TB 3B6QA 3LSXA 4YB5A 1FTOA 3QK6A 5H8HB 2V3UA 2PBWA 4JSOA 1PB7A 3BFTA 3DM0A 4FATA 5CBRA 3LSFB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5CRYA 4FBPA 1SW4A 1PEBA 2F35A 2F5XA 4NX1A 1PB9A 3PMWA 3B6WA 4PF6A 2R9JA 2DVCA 1R1NA 2IA4A 1Q9DA 4ZZAA 5EQ9A 4U23A 3TKDA 1IQ7A 4OETA 3QUJA 3Q25A 4RK9A 1O63A 3RUMA 1B32A 3PMXA 4XF5A 3FXQA 3OD7A 3PPRA 3UA8A 4IO2A 5CM6A 3PPNA 2NVUB 2XD2A 3KSJA 1OQGA 2Q89A 1FQDA 4LONB 3WAEA 4NWCA 2Z22A 2OBGA 5ITPA 4YKPA 2AL5A 4BLAA 1INPA 5F7VA 1WDNA 3QAXA 1B3FA 4PFWA 1LBWA 2H9BA 2WKYA 5A5LA 4OYVA 4ONYA 2DYXA 2DWAA 3PMVA 4UA8A 2WYPA 4PFBA 5DVJA 4F3PA 1NH8A 4LZ5A 1TWYA 3IJXB 3T66A 3CSBA 1OQHA 1B3LA 4JVDA 2XA5A 2P2AA 3SDFA 4F2QA 4ZECA 3RLFE 2R71A 4RYAA 4EXKA 2HFBA 1OIBA 4N6KA 4YU0A 4G2ZA 2DVZA 5DEXA 2H98A 1FQCA 4QF9A 2THIA 3OXNA 1L5TA 1B05A 3QSLA 2ZYKA 2PMSA 1BKAA 1NV6A 4TOZA 1PBQA 3K6XA 2YLNA 2XX8A 2V84A 3K1MA 4KCDA 3SERA 1II5A 4GBWA 5F24A 4O3AA 1VFDA 1EH3A 4GOTA 3KBZA 4BDNA 3TEPA 4NGUA 3TTRA 3IO6A 5AA1A 2OJTA 1TFAA 2CZLA 4FAJA 4N4UA 2F7BA 3QXMA 3KZGA 4G8HA 2Y7KA 4JWOA 5M2VA 2WYKA 5L8DA 4MH5A 2XX7A 4IO6A 3N5LA 3B8BA 3KN7A 1N0TA 2Y7PA 4PAFA 4PGPA 1RKMA 1AWBA 2NOOA 5I56A 4NHBA 3CG1A 1XOCA 2I49A 5J16A 1FBCA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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