3THIA

Thiaminase i from bacillus thiaminolyticus
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
362
structure length
362
Chain Sequence
ITLKVAIYPYVPDPARFQAAVLDQWQRQEPGVKLEFTDWDSYSADPPDDLDVFVLDSIFLSHFVDAGYLLPFGSQDIDQAEDVLPFALQGAKRNGEVYGLPQILCTNLLFYRKGDLKIGQVDNIYELYKKIGTSHSEQIPPPQNKGLLINMAGGTTKASMYLEALIDVTGQYTEYDLLPPLDPLNDKVIRGLRLLINMAGEKPSQYVPEDGDAYVRASWFAQGSGRAFIGYSESMMRMGDYAEQVRFKPISSSAGQDIPLFYSDVVSVNSKTAHPELAKKLANVMASADTVEQALRPQADGQYPQYLLPARHQVYEALMQDYPIYSELAQIVNKPSNRVFRLGPEVRTWLKDAKQVLPEALG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
source organism Bacillus subtilis
publication title Crystal structure of thiaminase-I from Bacillus thiaminolyticus at 2.0 A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (THIAMINASE I)
total genus 116
structure length 362
sequence length 362
ec nomenclature ec 2.5.1.2: Thiamine pyridinylase.
pdb deposition date 1998-10-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3thiA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3thiA02
3C36A 4H8IA 4JSDA 2Q89A 2XXIA 1VFDA 1URDA 3HV1A 5H8NA 5IKBA 5CBSA 4LQ2A 4DXCA 3RTFB 3OENA 4R2FA 4OZ9A 4U22A 4E0WA 2O7UA 4LQ5A 3FXQA 1QULA 3MP1A 5JK4A 1S7YA 4TLMB 4AB6A 2AL4A 1B0HA 2HEUA 2B65A 1MPCA 1N7XA 2Z22A 1LB9A 1A7LA 1Z7NE 1POTA 4H6DA 1US5A 3FGSA 1Y3PA 2YLNA 1XVXA 4NWDA 1D4NA 4F39A 3H06B 4NEDA 3KN7A 3PGFA 4ZE8A 2GH9A 2KLFA 3TUSA 4NTLA 1VE4A 3MVXA 1DPPA 1B7HA 2OK2A 2QPQA 5ICTA 2ZNSA 2HAUA 4WEDA 4FECA 1UTHA 1DTGA 4ND9A 3FVGA 2XXQA 4BDOA 1BIYA 1J1NA 4ZEBA 3RGYA 3IOVA 3C32A 3GBAA 4RPOA 1YCJA 1H44A 3GXAA 4GXSB 1A55A 4LUBA 3IOUA 1B3LA 2Q9TA 3KJ7A 1ATGA 2H5YA 1JW1A 4JDFA 1BKAA 5EYFA 1B3HA 2DWAA 1R1NA 1RKMA 4WEPA 3UK4A 4OENA 5A5XB 4GLIA 4O3BA 4QF9A 1PB9A 4KYDA 4N6PA 3A09A 3OO9A 1SW4A 2QJEA 2RCBA 5TPAB 3V5AA 3JV9A 4EXLA 5J1DA 4MLQA 1LGBC 1Y1ZA 1MY0A 2P2AA 2QS1A 3QIMA 4PFYA 4DDDA 4FIMA 3H6WA 3T93B 3MVYA 4F2QA 4OMBA 2DE4A 4GL8A 5I59B 4C0RA 3PMXA 5I56A 3CI8A 4U1OA 1XVYA 5I84A 3Q28A 3T9VA 5DVJA 4FORA 3KOTA 4DXUA 2RC9A 3CR9A 4IGTA 3S4UA 3KN8A 1TXFA 3K01A 1MQIA 1MQJA 4KCDA 1UIUA 4EQBA 4XKNA 1I69A 2NWJA 3RPWA 2YJPA 5H8HB 2NUVA 3VLWA 4LVQA 1Q35A 4ZZAA 4TLLB 3K02A 3M3FA 4R75A 4JWOA 3T66A 1QKBA 3VLUA 1MPBA 3PMVA 4FEDA 5CRYA 1Y20A 2ONRA 4PFWA 4XIGQ 4NF5B 4LATA 2BJJX 2HXWA 3QK6A 1S9TA 1R6ZA 1BP5A 1QKAA 4R9GA 3QYTA 4JWXA 3CFZA 3LUYA 4GVOA 2OWTA 2Q2AA 2THIA 1JETA 3Q25A 4R72A 5TP9B 3OO8A 3K4UA 2F6GA 1JVYA 1VSOA 1JW4A 1B7UA 2AL5A 1II5A 5I58A 1Y9UA 1EZ9A 3MJNA 2I4BA 2IEEA 1FTJA 2P1SA 1ELJA 4EQ7A 4R6YA 1OMPA 1I6QA 4WKMA 5KDTA 2I58A 2A5TB 4IGRA 4R2BA 4YKKA 4P0GA 1ZLQA 3PPQA 3PPOA 1MXUA 3K0VA 1GR2A 1IIWA 1N0TA 2O6AA 2I3VA 1D3KA 3HHFA 4OWDA 3SEYA 1HSLA 3G3KA 3FVOA 4UACA 5JTYB 3TFLA 4JWYA 4GWOA 3HPIA 3TTRA 4F19A 4HW8A 3OOAA 1HSJA 4LZ7A 1B51A 1MG1A 2PX1A 2RC8A 2P0SA 3O97A 5F1QA 4RA1A 1JEVA 3K1MA 3TKDA 4OTEA 3DP8A 2ABHA 3RT6B 5B70A 1UQWA 3OO6A 3TPAA 1MDP1 3PUWE 5H8NB 4ELPA 2Q2CA 1UIVA 1NNTA 2DWJA 3I5OA 3D4CA 5ITOA 1MXXA 2DSFA 3I3VA 1ZIUA 3EHSA 2F34A 1QW0A 1LBCA 5DTBA 2LAOA 1A54A 3KBRA 5I2NB 3IB2A 3KEIA 4Z0IA 3C35A 4GL0A 2E0SA 3C4MA 3EHUA 3N5LA 3PU5A 3OEKA 1FW0A 1US4A 1Z7ME 1MXYA 3IB0A 3VFJA 1YAEA 5H8QA 4G8MA 1SVXB 5AA2A 3TQLA 3DELB 3UN6A 1AL3A 3S9NC 2UVIA 3LBSA 2G29A 4OERA 4BDNA 2W7YA 2OBGA 3R26A 5K2XA 1WDNA 2D5WA 3EPEA 3KFMA 4NF4A 4N07A 1TFAA 3TTNA 2DVCA 4E0XA 1GV8A 1LAGE 3RUMA 3IB1A 3PUYE 4QHQA 4Q30B 4HS7A 3QUFA 1N3XA 1B3FA 3SEWA 4DLDA 4L17A 1B5IA 3K6XA 2PT1A 4R6HA 2XX8A 1D9YA 4QRZA 3K2DA 3MC2A 2ZYMA 3T9HB 1IQ7A 2REJA 2QL3A 3PUVE 4F1UA 1SYIA 3QAXA 3H3GA 3ZSFA 2V3TA 3T9UA 4KQPA 2UYFA 3OD7A 4OFJA 3IJXB 1Q1KA 3SDFA 2F5XA 4F3PA 2REGA 4RXLA 4GF8A 3CSBA 1DPEA 1LFIA 1SI0A 3JZJA 5L8DA 1WVJA 4KR5A 4QFPA 4XKPA 3MVZA 5I2NA 4X9TA 1TWYA 1M5DA 2Z8EA 5I56B 1B52A 3PPRA 3K6WA 4BDLA 3I6VA 3TODA 1FTMA 1OVTA 2XXRA 3FIRA 2QMXA 3RNNA 5TU0A 2V93A 2I49A 1RYXA 2O68A 5ISUA 1NH8A 2R71A 3MPLA 4LP2B 1A8EA 2H4IA 3W9WA 1ZJLA 4C1UA 3AXFA 2DOJA 3VDFA 1SW5A 1ZMGA 4RNSA 4GRKA 2G93A 1R9LA 2DWIA 3BBRA 3P7IA 3WAEA 1LCFA 5AA2D 3M3KA 3LC8A 4POXA 4PFTA 1OIBA 2DP8A 2V84A 1GVCA 3SKPA 3RLFE 1JNFA 3N94A 3ZKLA 5LOMA 1OLCA 4X1DA 1B2HA 1AMFA 4JXIA 2DXYA 3LR1A 4RK2A 4ZZEA 1MXVA 4YMAA 3M8UA 4GD5A 3CSGA 5L9MA 4IY6A 4I8CA 2ZYNA 4XKQA 1T0KA 3A3UA 3O28A 3R7XA 3R6UA 2Z8FA 4I1DA 1PEBA 4I9DA 3IOWA 4ZE9A 1USYH 3PV0E 3Q26A 3G3GA 3FZVA 4U4XA 5I58B 2O84X 4AB5A 2D3IA 3K6VA 2DE3A 4U21A 3PUXE 4R74A 2DYXA 2GFEA 3E3KA 2UXAA 4PFUA 3G3IA 4F29A 2FA7A 4KYSA 2F8DA 4H0WA 3VXCA 2O69A 4R73A 4DXBA 1JEUA 5AA4A 3MW0A 1O63A 1XOCA 5KDTB 3EQ1A 3F11A 4BDRA 4ISUA 3O6GA 1SYHA 2M8CA 3FJMA 3ILTB 3L6HA 5CBRA 1B05A 5CMMA 1IXGA 3H6VA 4NMYA 2Z23A 3VVEA 4NF6A 2DXRA 4OXVA 4AQ4A 4QFLA 1UTBA 3VXBA 2QSXA 4XXUA 3RY3A 4NWCA 2HZKA 3VVDA 2VD3A 2XXWA 3U93A 4H5FA 4JSOA 4KPTA 2V3QA 4F3SA 1PDAA 1EZPA 1I6AA 1XHYA 2I0BA 1Y3QA 4UA8A 2ONSA 2Y7PA 3PPPA 2X26A 1FTKA 5DEXA 4HTGA 4KFQA 2VHAA 1MY2A 3BKIB 1B5JA 4RPNA 3KG2A 1PC3A 1NKXA 3B6QA 3C9HA 3V89B 1SD3A 2Y84A 1HSEA 1P1OA 1IEJA 3TCGA 4QSEA 3RQTA 3MWBA 1AH5A 3SEVA 4IB2A 4G68A 3FUZA 3GZGA 4OHNA 1LFHA 2NXOA 1QVSA 2XXXA 3M3LA 3C33A 4O3AA 4RYAA 4PETA 2X7PA 3ECRA 2XXPA 4M1VA 5H8QB 3LSFB 5JEIA 5AA2B 4LONB 5KCJA 4BLAA 2O51A 5DT6A 1FQEA 3TTMA 3IORA 3B7DA 4YKIA 3B6TA 1USYE 3MP8A 1B32A 2O1LA 1EU8A 4G8HA 4LZ8A 3BFTA 4GFRA 4NF4B 3MAMA 3T9XB 1LAHE 4ESWA 4P11A 1JVXA 1OLAA 3USDA 4HCWA 3C31A 4H65A 1P1QA 2R9JA 4H67A 5DVFA 2GRVA 1OQGA 4IO7A 1QUJA 2AIXA 5H8FA 3T22A 2A5SA 1OVBA 5HBCA 2PMSA 2XX7A 3PMWA 1FQCA 1GGGA 3L6GA 1AIVA 1IUDA 3MVWA 1MXZA 3N6UA 4MBPA 2PBWA 5FHOA 5AE4A 2PYYA 4GOTA 1GTKA 3UP9A 2QS2A 1DMBA 2DQVA 4F1YA 3SETA 5BUUA 3QXMA 2ZYKA 2ONKE 5K2YA 1H76A 1QUKA 1L5TA 2F7CA 3SEXA 1ZBMA 2ESNA 2RKMA 2VOZA 4OEVA 2I48A 2UYEA 5F7VA 1N76A 2XXUA 4IO2A 5CMBA 3C34A 5EHSA 3CG3A 3JYRA 5I57A 2VGQA 3ILUB 3IR1A 2F7AA 4JBZA 4F3BA 1O7TA 2ZNUA 4K3FA 1B58A 4GXAA 1FQDA 1N84A 4G77A 3K1PA 3GLBA 1H45A 5ELVA 3LSLA 1NNFA 5CI5A 4RJZA 3BFUA 4F1VA 4F31B 4N13A 4FE8A 1VFEA 4GQOA 3WAFA 3U1OA 2E1SA 4MLVA 4QSDA 3O9PA 1A40A 1SW1A 1JQFA 4U4SA 2XHDA 1LSTA 1PB8A 2F78A 1B9JA 1LB8A 3MBPA 4OQOA 1TFDA 3TTKA 1H43A 5FHNA 1M5BA 3FV2A 3PD8A 3MP6A 1FCKA 2FNCA 3FATA 4EF2A 3U72A 4EXKA 2UVGA 3CFLA 2HFBA 1TT1A 3CFXA 4KYEA 3TAJA 1LAXA 4BDMA 3TELA 3UIFA 2B3BA 3QUJA 5BWJA 3DM0A 4FATA 3FVKA 3D4GA 2H99A 4X48A 3THIA 3QSLA 3ZS6A 5HPQA 1D9VA 1MPDA 2F36A 4QFOA 3FV1A 4U1ZA 4G8NA 4POWA 3U92A 2Y7IA 2XD3A 2I4CA 3VV5A 4ZDMA 5DYHA 4OVJA 3G7WA 1DTZA 4G4PA 2PVUA 2R6GE 3IX1A 3S9LC 1NFTA 5HM4B 1LBBA 4HCYA 1MY4A 5AA4B 3ODBA 3OXNA 3KSJA 1MH4A 5L9SA 1P99A 4FEBA 2RCAA 3LSWA 1CB6A 4DE8A 4RY1A 2HCAA 4IO5A 4TOZA 1MM6A 2X7QA 4NF6B 2XXTA 1YPNA 3ZKKA 1UTBB 3HO7A 5FHMA 4YAHX 3E13X 1N3WA 2CZLA 4I62A 1F9BA 3VE1B 3HHGA 4H8JA 4WXJA 5I2KA 3CG1A 1B3EA 3KZGA 3RT8A 3H4ZA 1FQAA 5CM6A 4NF8A 2XX9A 3G3HA 3FJGA 5CMKA 4IY5A 1P1NA 4YB6A 1IXHA 3FXUA 1WODA 1QUIA 4U23A 3FASA 4Q8RA 4IO6A 2AYSA 4MF3A 5DEXB 1MQDA 3O2AA 4FJPA 4ELRA 3KJTA 1N04A 1XT8A 1MXWA 1B5HA 3FXRA 3H7MA 3OMBA 1A99A 4LA9A 3E4RA 4YZZA 3K6UA 2DS9A 3TMGA 4IO3A 2GHBA 1YTVA 4G68B 2F7BA 2Z8DA 3DP4A 4R6KA 4U2RA 2D21A 4YB7A 1URSA 2QS3A 3TTLA 2I0CA 4PE5B 3KOSA 1NNPA 5KCJB 3MZBA 1A8FA 1VR5A 2V25A 3KGCA 1MDQA 5CMCA 1Y3NA 4G2ZA 3EF7A 5IAIA 3DP6A 4ZEFA 3IJOB 1AOVA 1ZKBA 1B40A 3IAZA 3OSRA 4KD5A 4EUOA 1P1WA 4FAJA 2F6PA 3SEUA 1IITA 5AA3A 1JW5A 4Z7EA 2ZYOA 2Q8JA 5DVIA 4LZ5A 4OFLA 1SQYA 1MM7A 1ANFA 2XXHA 4ELOA 4ONYA 5H8FB 3TEPA 1EH3A 3HN0A 3MUQA 3TCHA 2OLBA 3O6IA 1NNKA 2ZNTA 4ECFA 3Q29A 5ITPA 4RK9A 1QJMA 3OELA 1B4ZA 2HQ0A 3W15C 2ALUA 4NE4A 4PP0A 2FYIA 2F35A 3O29A 4Q0CA 1RYOA 2XXVA 1O64A 1FTLA 4OEUA 4O3CA 3CIJA 2RF1A 5AA1A 2QRYA 5H8SA 1OQHA 3OSQA 3EHTA 3UA8A 2IA4A 4OFOA 2B3FA 2HZLA 2ZMBA 1SDXA 4X1BA 1LFGA 3GBBA 1Y4CA 1POY1 3FVNA 2Y7WA 1P1UA 1NH7A 2V3UA 3N6TA 1B1XA 5I57B 3MZ9A 2H9BA 4KI0E 2Q88A 3IOTA 2ANJA 3G3FA 3VVFA 3HSTA 2VP1A 1I6BA 1N7WA 1SW2A 1FTOA 4XTCQ 4R9FA 1EZOA 3S2VA 1ZTYA 1R9QA 2UVJA 3DLNA 5A5XA 1FQBA 1MY1A 2DWHA 2XXYA 1IXCA 1PBQA 4KCCA 4G68C 4XKRA 3K1NA 5TPAA 3V8XB 4DCYA 4ZEIA 2YPNA 1B46A 4YB5A 4TQUQ 3TDJA 4Q5TA 2I3WA 3UGWA 3PUZE 4ZECA 3CVGA 1ZU0A 4C1TA 1Y4TA 4JB7A 3RN8A 2GHAA 3SERA 3O66A 3PD9A 3O6HA 4H5GA 3RTWB 3T96B 5B7DA 4ELQA 5I59A 3TYHA 5ICQA 3FD3A 1M5CA 3OO7A 3TZAA 1M5EA 4F18A 3G3JA 2VD2A 3CRBA 1H3DA 1CE2A 4DZ1A 2RINA 3IO6A 3OEMA 3TQWA 2PT2A 5H8HA 3UORA 3S9MC 4PQJA 5EHMA 4M4GA 3A3CA 1MRPA 4QSCA 4MH5A 2H98A 4QFNA 1FQFA 1IZ1A 4YICA 3S9EA 1MQGA 1NL5A 1B0LA 2WKYA 3SESA 2Y7RA 4KHZE 4NF5A 5FTHA 3LSXA 2Y7KA 4YMBA 4BDQA 2O7IA 4GIZA 4ZS9A 1BLFA 5CC2A 1LCTA 3MZ1A 3B6WA 4DCXA 4EQ9A 5M2VA 1PBPA 1B1HA 3ONMA 3HCQA 1SI1A 3E9XA 5TP9A 5FTIA 3KSXA 1URGA 1NMUA 4MFIA 3PPNA 1SBPA 1M5FA 2ZXTA 4YU0A 1DOTA 2I6EA 4H1XA 4DIGA 4P0IA 4OYVA 1MQHA 3Q27A 2CMOA 1MY3A 4QFKA 5I2KB 4EF1A 4OESA 3W9VA 4F22A 1S50A 1KWHA 2OJTA 1MS7A 4NF8B 5KZTA 2OCUA 2RC7A 2QMWA 2OWSA 4F3GA 2DVZA 1LAFE 3IL1B 1B4HA 2NOOA 2UVHA 4THIA 2A5TA 1IXIA 2HAVA 1LLSA 2QS4A 1UTHB 3TCFA 3V83A 1DSNA 4EDPA 4ZEDA 3KN3A 1Y1MA 1XS5A 2OZZA 1PB7A 4OETA 3H6TA 3MQ9A 3H03A 3K00A 2XD2A 5JTYA 1B6HA 1B7ZA 3IK6B 4YKPA 2H25A 3MPKA 1BTJA 3IO4A 3U8QA 4IO4A 4YKJA 2O1MA 3FJ7A 2F97A 3H6UA 4ESXA 1B3GA 3VLVA 3EN3A 3U94A 4F2OA 5L9OA 2DE2A 3N26A 1MH3A 2NVUB 1XC1A 4ZEKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3C36A 4H8IA 4JSDA 2Q89A 2XXIA 4PE3A 1VFDA 1URDA 2QVVA 3HV1A 5H8NA 1FPDA 3NOHA 5IKBA 5CBSA 4LQ2A 2KQZA 4DXCA 3RTFB 3OENA 4R2FA 4DI3D 1NV4A 4OZ9A 4U22A 4E0WA 2O7UA 4LQ5A 3FXQA 1QULA 3MP1A 5JK4A 1S7YA 4TLMB 4AB6A 2AL4A 1B0HA 2HEUA 2B65A 2MKZA 1MPCA 1N7XA 2Z22A 1LB9A 1A7LA 1Z7NE 1POTA 4H6DA 1NV1A 1US5A 3FGSA 1Y3PA 2ZZWA 2YLNA 1XVXA 4NWDA 1D4NA 4F39A 1LBYA 3H06B 3GYYA 4NEDA 3KN7A 1EYKA 1G0HA 3PGFA 4ZE8A 2GH9A 4OA4A 2KLFA 3TUSA 4GX6A 4NTLA 5IZ1A 1VE4A 3MVXA 1DPPA 1B7HA 2OK2A 4GWWA 2QPQA 5ICTA 2ZNSA 4XEQA 2HAUA 4WEDA 4FECA 1UTHA 1DTGA 4ND9A 1FBHA 3FVGA 2XXQA 4BDOA 1DBZA 4PBHA 1BIYA 1J1NA 4ZEBA 3RGYA 3IOVA 3C32A 3GBAA 4RPOA 1YCJA 1H44A 3GXAA 4GXSB 1A55A 4LUBA 3IOUA 3PTYA 1B3LA 2CEYA 2Q9TA 3KJ7A 1JP4A 1ATGA 2H5YA 1RDYA 1JW1A 4JDFA 1BKAA 5EYFA 1IMAA 1B3HA 2DWAA 1R1NA 1RKMA 4WEPA 3UK4A 3T1BA 2WYKA 4OENA 5A5XB 4GLIA 4O3BA 4QF9A 1PB9A 4KYDA 4N6PA 3A09A 3OO9A 1SW4A 2QJEA 2RCBA 5TPAB 3V5AA 3U65A 3JV9A 4EXLA 5J1DA 3BIHA 4MLQA 1LGBC 1Y1ZA 4QXDA 1MY0A 2P2AA 2Q8MA 2QS1A 3QIMA 4PFYA 4DDDA 4FIMA 3H6WA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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