3THIA

Thiaminase i from bacillus thiaminolyticus
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
362
structure length
362
Chain Sequence
ITLKVAIYPYVPDPARFQAAVLDQWQRQEPGVKLEFTDWDSYSADPPDDLDVFVLDSIFLSHFVDAGYLLPFGSQDIDQAEDVLPFALQGAKRNGEVYGLPQILCTNLLFYRKGDLKIGQVDNIYELYKKIGTSHSEQIPPPQNKGLLINMAGGTTKASMYLEALIDVTGQYTEYDLLPPLDPLNDKVIRGLRLLINMAGEKPSQYVPEDGDAYVRASWFAQGSGRAFIGYSESMMRMGDYAEQVRFKPISSSAGQDIPLFYSDVVSVNSKTAHPELAKKLANVMASADTVEQALRPQADGQYPQYLLPARHQVYEALMQDYPIYSELAQIVNKPSNRVFRLGPEVRTWLKDAKQVLPEALG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords PROTEIN (THIAMINASE I)
publication title Crystal structure of thiaminase-I from Bacillus thiaminolyticus at 2.0 A resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Bacillus subtilis
molecule tags Transferase
total genus 116
structure length 362
sequence length 362
ec nomenclature ec 2.5.1.2: Thiamine pyridinylase.
pdb deposition date 1998-10-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3thiA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3thiA02
4QFOA 3KOSA 1OQGA 1N7WA 2D21A 2REJA 3N94A 1WVJA 5CBRA 1B1HA 4EF1A 2O68A 4N13A 5I84A 5BWJA 2B65A 2HXWA 2XXHA 1TT1A 4HCWA 1IQ7A 4I1DA 1MXUA 2G93A 4OFLA 3IR1A 2DOJA 3RTWB 2UVIA 4NF5A 4F2QA 4BDLA 2UVJA 3PUWE 4OFOA 3KEIA 1B7ZA 1FW0A 4MLQA 4X1BA 4ZZAA 4ISUA 3S2VA 3D4CA 3H3GA 4RPNA 3SEXA 4PQJA 4R6HA 1B40A 1A7LA 5AA4B 3IO4A 1OLAA 4NMYA 2E1SA 4KFQA 4P11A 1URGA 4ZS9A 3SDFA 3SEVA 1FTKA 1SW4A 3ZKKA 1P1WA 1QW0A 1VSOA 2O7UA 4K3FA 4ZEDA 5B7DA 3TCGA 4AB6A 3IX1A 3Q25A 2P1SA 3SETA 2XXTA 2NXOA 2XXVA 2AL5A 4GWOA 2XXXA 1QKAA 4HTGA 1B46A 1ZIUA 2ANJA 3FIRA 3FJMA 5DYHA 2A5TA 4C0RA 2PX1A 3FVGA 1N76A 5FHOA 2V3TA 1IXIA 1L5TA 1ZKBA 2ZYMA 2B3FA 4G68A 1EZ9A 3RT8A 5AA4A 1P1QA 2RINA 1DSNA 2GH9A 1MDQA 1FQBA 3LSWA 4FECA 1DTGA 3TTNA 3DP4A 2XX7A 3IB1A 1XHYA 3G3GA 1XT8A 3O97A 2Y7KA 4C1UA 3RNNA 4KPTA 3FJ7A 1I6AA 3K6UA 2F7AA 3PUZE 3TQWA 4XKQA 4IGTA 3TYHA 4BDNA 4R2BA 5AA2D 1BP5A 3FGSA 3C33A 3MP1A 3GBAA 1Z7ME 2ZNUA 4F1VA 1B3GA 5H8HA 1AMFA 4TLLB 2OWTA 3MUQA 3MVWA 1FCKA 5DEXA 3C31A 1A8FA 5M2VA 2D5WA 2XHDA 4ZEFA 1RYOA 1N04A 3HHGA 1YPNA 1R9QA 1GGGA 3TZAA 4C1TA 1B3HA 3GLBA 1JEVA 1M5BA 2YJPA 4XIGQ 1JVXA 3DLNA 2Y7IA 4RK2A 3UIFA 3JZJA 4JWYA 4MBPA 3V89B 5I59B 1SD3A 3TODA 1B1XA 3N6TA 2XD3A 1MY2A 1YCJA 4IO5A 2V3QA 3LSXA 3V8XB 1LBCA 3W9WA 3KOTA 1B6HA 4FAJA 3K1PA 3CG3A 2HZLA 4KYSA 4YICA 3DP6A 3PUYE 5I57B 2O51A 1A54A 1B5JA 2Y7PA 4KQPA 1LB8A 4Z7EA 2UVGA 4JWXA 5LOMA 4O3CA 5KDTB 3BFUA 4QSEA 1MXZA 1Y1MA 3H6UA 1TFAA 3JYRA 4R9GA 4NEDA 4E0XA 2X26A 1SDXA 1I69A 5FHNA 4L17A 2DE4A 5A5XB 3VV5A 2QS4A 4TLMB 3OD7A 1LAHE 3TTKA 5TPAB 5I57A 2B3BA 2HZKA 4EUOA 3FXRA 2I4CA 1NMUA 3K6XA 3I5OA 4H5FA 3TTMA 3MPKA 4KCCA 1QULA 3U72A 3ZSFA 1YTVA 1MY4A 4HS7A 4R72A 4WEDA 5KDTA 1ZBMA 2Y84A 3TAJA 3MVYA 2XXYA 3KSXA 4RA1A 1MY1A 3BFTA 5IAIA 5ISUA 3PD8A 1XVXA 2H4IA 1J1NA 1XS5A 3IO6A 4QFPA 3M8UA 1O63A 3ILUB 2DWJA 2PBWA 3G3KA 3CVGA 1TXFA 1H43A 4LZ5A 4ZEBA 5TPAA 1XOCA 3IJXB 2A5SA 1PC3A 5FHMA 3IOTA 1QKBA 3VE1B 2KLFA 4YMAA 4UACA 3FASA 3OSQA 4M1VA 3U92A 4R73A 4ND9A 3FXUA 2O1MA 4KYEA 3VVEA 4OHNA 1OLCA 4YKIA 1ZMGA 4LZ7A 2DVZA 3TUSA 1B52A 3WAEA 4PFTA 4U1ZA 1Q1KA 1P1NA 2VOZA 3I3VA 4F29A 3IOVA 1B3FA 3HCQA 1OIBA 3VLUA 2REGA 4QFNA 3QSLA 3MZBA 2F35A 2DWIA 4OENA 3O6GA 2PT1A 3M3FA 4LONB 4OEVA 4U21A 3TKDA 3CG1A 3VVFA 1JVYA 2XX9A 4I9DA 1JETA 2AYSA 2OWSA 1IITA 4Q8RA 2X7PA 3U1OA 3ILTB 2Q89A 4NWDA 2UVHA 2AL4A 5JTYB 1LCTA 4F3SA 4X1DA 3MP8A 4QFKA 5ICTA 5CMMA 4YB7A 3DELB 1QVSA 1LB9A 4NF8B 5J1DA 2XXWA 1II5A 2RC7A 1JQFA 3TFLA 2ESNA 4G77A 4LATA 1BIYA 1NKXA 2FYIA 2QL3A 3OEMA 5FTHA 3OENA 1B9JA 5EYFA 3MC2A 3KJ7A 3UA8A 2I6EA 2ZYNA 4U1OA 5KCJA 3B6QA 3OELA 2IEEA 1P99A 3RN8A 1N3WA 2I0CA 4DXBA 5DTBA 4NF5B 5JTYA 3S9EA 1UIUA 3MZ9A 4NF8A 5HM4B 2Q2CA 5AA1A 2QS3A 1DOTA 4JSOA 4GLIA 3S9LC 3OO9A 3TCFA 4ELRA 1O64A 2Z8FA 2ZXTA 3B7DA 1PEBA 4YZZA 4F1UA 1B5IA 1NH7A 4G8NA 4JWOA 4KCDA 4EQ7A 3S9MC 1FQDA 3CFLA 5CRYA 4JSDA 5BUUA 4YU0A 4WKMA 1ATGA 3BKIB 1AL3A 1NNKA 4R6KA 3S9NC 5DVFA 1SW2A 1A8EA 2A5TB 4GVOA 4AB5A 1GTKA 1PB8A 1EZOA 3CFZA 1POY1 3RGYA 2Q8JA 1DPPA 2F7CA 1BKAA 4GD5A 1B7HA 4G68B 4KR5A 4OVJA 3QYTA 2GFEA 1R9LA 1R1NA 3CRBA 1FQAA 2XXPA 1MH3A 3OO6A 2O84X 2OJTA 1PB7A 1S50A 1UTHA 1EZPA 3H7MA 1Y4CA 2DSFA 2QJEA 4LQ2A 1TFDA 4R9FA 3AXFA 1Y1ZA 2OBGA 4H5GA 3FJGA 3G7WA 4ZDMA 2F6GA 1FQCA 1DPEA 1TWYA 3G3FA 4GOTA 3O66A 1Y3NA 4RYAA 4XKRA 1MPCA 2Z22A 4NTLA 4ELQA 2QPQA 5L9MA 1Y3PA 4F22A 3E13X 2I49A 3MW0A 3A3UA 4DXUA 1SW5A 1QJMA 2ZYKA 5H8HB 1VE4A 1MPDA 4GXAA 3E3KA 3TEPA 1S9TA 5DEXB 1XC1A 3KJTA 3TDJA 3PMVA 2I0BA 1S7YA 4XXUA 1MPBA 4I62A 2LAOA 4N6PA 3MJNA 5I2KA 2CZLA 3IAZA 2HFBA 1MS7A 1N3XA 1SYIA 4QFLA 3D4GA 3HN0A 5I2NA 4F3GA 4H6DA 3T96B 3T9HB 3CIJA 4I8CA 3A3CA 4OMBA 1A99A 3N6UA 2V3UA 3USDA 2DE2A 2QS2A 4U22A 3E4RA 1DTZA 5I56A 2DXRA 5DVIA 1PB9A 1UTBB 3EF7A 4LP2B 4JDFA 2H25A 2XXRA 1YAEA 3H03A 4R2FA 3PPOA 2XXIA 3SEYA 4XKPA 4KYDA 1N84A 3DP8A 3FV2A 4JXIA 2HCAA 2BJJX 2DYXA 4IY6A 2O69A 3MWBA 3HHFA 2F8DA 4NE4A 4QSCA 3FVKA 1LBBA 3C35A 3T22A 3VFJA 3N26A 1ZLQA 1UTBA 1PBPA 2UYEA 2NUVA 5ELVA 5I58B 3R6UA 4IO3A 3O29A 3O6IA 4LA9A 2YLNA 3PPRA 1LLSA 4G2ZA 2F97A 1SVXB 4EQBA 3RQTA 3CFXA 5HPQA 3LR1A 4F39A 4OQOA 3CI8A 3RUMA 2PYYA 3JV9A 4P0GA 1PBQA 4YB5A 5H8NA 1MG1A 3R7XA 2QRYA 4OYVA 5CMKA 3OO8A 5I58A 2O7IA 1POTA 2PVUA 2P0SA 4LZ8A 3C36A 3I6VA 3HSTA 2ZNTA 4H8IA 2F6PA 2F5XA 4DZ1A 1NFTA 4ZZEA 2I4BA 2UYFA 4R74A 4XTCQ 2OCUA 4F1YA 3CSGA 4HW8A 1QUKA 3RPWA 4G8HA 3QIMA 4O3AA 4ESXA 4NWCA 1P1UA 3IL1B 3K4UA 3RT6B 2RCAA 3OMBA 1FQFA 4ONYA 2ZNSA 4KD5A 1MQGA 4GFRA 1IZ1A 4ZECA 1AOVA 3MAMA 3KFMA 1D3KA 4GF8A 4FATA 2I58A 4IO4A 5DT6A 4YKKA 1OVTA 3E9XA 1B3EA 1LFIA 1MXYA 5H8FB 3RTFB 1LAXA 3GBBA 3S4UA 4DCYA 5ITPA 3H6WA 5H8QA 4AQ4A 1OVBA 2V25A 3PPNA 2ZYOA 2W7YA 1BTJA 1URSA 1MM6A 1IXGA 3TQLA 4DCXA 3SEUA 5F1QA 5TP9B 1B4ZA 1LAGE 2CMOA 3PD9A 2P2AA 3PUVE 4ZE9A 4ECFA 2ONKE 1B05A 1MQDA 4POWA 5B70A 5H8FA 5EHMA 2NOOA 3UN6A 4Z0IA 3QXMA 3QUFA 1B5HA 3K2DA 1IXHA 4H0WA 4IO7A 3VLVA 1H3DA 4FEDA 5KCJB 3G3JA 1NL5A 1EH3A 2IA4A 3T93B 5TP9A 3KG2A 3O9PA 4EF2A 1ANFA 2F7BA 4JBZA 4FEBA 3KGCA 4NF6A 3THIA 4BDMA 3CSBA 2VP1A 5FTIA 1Y3QA 4E0WA 3LUYA 2QMXA 5L9OA 3QAXA 2X7QA 2M8CA 2VHAA 2F36A 2XXUA 2UXAA 3OO7A 4TQUQ 2QSXA 3SEWA 1SBPA 1LAFE 2VGQA 2I48A 2RC8A 2OZZA 2H5YA 1Y9UA 2XD2A 4WXJA 2V84A 3Q29A 4BLAA 3IB0A 3KBRA 1B51A 3B6TA 1MM7A 2Q88A 3V5AA 2GHBA 3EPEA 3LC8A 1VR5A 3A09A 1GV8A 4G68C 3K6VA 1O7TA 4M4GA 3TTLA 2GRVA 3C4MA 1ZTYA 3VXCA 1N0TA 1JNFA 4PFWA 2Q9TA 1UQWA 4RJZA 3F11A 4H67A 3RLFE 3FUZA 4BDRA 4Q30B 3ZS6A 3K1NA 2FA7A 3MP6A 1OQHA 4ELOA 1HSJA 2DWHA 4XKNA 1LCFA 4KHZE 3V83A 3MQ9A 2ALUA 1LSTA 4YAHX 3TMGA 4POXA 1UTHB 1M5DA 3SESA 1SYHA 1CB6A 3ZKLA 2Q2AA 4EDPA 3PPPA 2VD2A 1D9VA 1SW1A 2D3IA 4IB2A 5L8DA 3MBPA 3TELA 4GXSB 1QUJA 1Q35A 3KSJA 3IORA 4U4XA 2DE3A 1M5FA 2R71A 3PU5A 3TTRA 3KN3A 4BDOA 4QSDA 3TCHA 3U93A 5CMBA 1ZU0A 4P0IA 5TU0A 5IKBA 1MRPA 1IIWA 3WAFA 1CE2A 5CBSA 3HO7A 2I3WA 1H45A 4OEUA 3P7IA 5I2KB 3FXQA 4PP0A 5AE4A 1AIVA 1SQYA 3MZ1A 3K1MA 3PPQA 1B0LA 4NF4B 3PV0E 3G3HA 3IJOB 5I2NB 3LBSA 1FTLA 2H98A 1XVYA 3FVOA 5L9SA 2RKMA 4MLVA 3VVDA 4Q0CA 3SKPA 3RY3A 1USYH 3C32A 5I56B 5F7VA 3T9VA 2Z8EA 4GIZA 4RK9A 2DP8A 4F18A 4OXVA 1F9BA 1B2HA 1LFGA 1B3LA 2DQVA 2ZMBA 4QRZA 4NF4A 4F31B 4R6YA 3EQ1A 3IB2A 4O3BA 2V93A 4ZE8A 3VDFA 2H99A 3QK6A 1MDP1 1LGBC 3VLWA 4WEPA 2Y7RA 2HAUA 2AIXA 1D9YA 1ZJLA 1NNFA 3GXAA 4YKJA 4ELPA 3VXBA 2ONSA 5CMCA 3N5LA 1Z7NE 4X48A 2O6AA 3HPIA 4LVQA 3W9VA 3PGFA 3O2AA 3LSFB 1JW5A 5EHSA 1Y4TA 1M5CA 4BDQA 3UORA 1A40A 1H76A 3BBRA 1ELJA 3B6WA 1KWHA 2DWAA 4F2OA 1EU8A 4TOZA 1JEUA 1NNTA 3FV1A 2XX8A 1FTMA 3OXNA 4U2RA 2I3VA 3U94A 1RKMA 2ABHA 3EHSA 3Q26A 1BLFA 5HBCA 4GL0A 5H8NB 1RYXA 4DXCA 2PMSA 4F3BA 2THIA 1PDAA 5H8SA 1GR2A 5CI5A 3M3KA 2HAVA 1MQHA 3Q28A 4H1XA 1I6BA 1Y20A 2R6GE 3H6VA 4PE5B 3FVNA 2OK2A 1IUDA 1AH5A 2Z8DA 1DMBA 3ONMA 3TPAA 4DLDA 4DE8A 2HQ0A 1B32A 1T0KA 1MQIA 1H44A 1MXXA 2NWJA 3UP9A 4OWDA 1R6ZA 2VD3A 2GHAA 2RCBA 4OERA 1GVCA 1A55A 5KZTA 3C9HA 1N7XA 1VFEA 5I59A 3W15C 3M3LA 1B4HA 3K01A 4HCYA 3KN7A 4YMBA 2QS1A 3PMWA 1LFHA 2F78A 2DS9A 3K6WA 4G4PA 2E0SA 3LSLA 4GQOA 3EN3A 4RY1A 1SI1A 3SERA 3IK6B 1WDNA 1SI0A 4MH5A 5H8QB 3IOWA 3OOAA 5JEIA 4N07A 4OZ9A 5CC2A 4YKPA 5CM6A 4MFIA 1MY3A 3MPLA 3EHUA 1I6QA 3ECRA 3KZGA 5DVJA 2XXQA 3PMXA 2YPNA 2RF1A 1URDA 3ODBA 3QUJA 1JW4A 3EHTA 1HSEA 1WODA 1NNPA 4OFJA 4UA8A 1B58A 1MXVA 3PUXE 4IO2A 5A5XA 2WKYA 4OETA 3K02A 4FORA 4DIGA 1FTOA 3G3IA 3OEKA 3HV1A 4U4SA 2DXYA 3MVXA 4FIMA 1D4NA 3MVZA 2ONRA 4ESWA 4Q5TA 4FE8A 4QF9A 4NF6B 1IEJA 1P1OA 3FZVA 4ZEKA 2RC9A 2PT2A 4H65A 2O1LA 2G29A 4U23A 2F34A 4THIA 1VFDA 4IGRA 3IOUA 3C34A 2HEUA 4QHQA 3GZGA 3UGWA 3H06B 3L6GA 1MQJA 1M5EA 4OESA 3OSRA 4YB6A 4MF3A 3O6HA 1MY0A 4R75A 2FNCA 4IY5A 5ICQA 3KN8A 4RPOA 4GL8A 1B7UA 3FD3A 4F19A 1UIVA 4KI0E 3L6HA 4LUBA 3Q27A 3O28A 1MH4A 1HSLA 1USYE 3H4ZA 1MXWA 3R26A 4EXKA 4X9TA 4ZEIA 3H6TA 3T9XB 5AA2B 2NVUB 4JB7A 2R9JA 4LQ5A 3CR9A 1OMPA 2Z23A 2QMWA 3T66A 2H9BA 1FQEA 2OLBA 1US5A 3DM0A 2Y7WA 3K0VA 4GRKA 3FATA 4FJPA 1US4A 5AA3A 4PFUA 4H8JA 1NH8A 5JK4A 3U8QA 4RXLA 1IXCA 1FTJA 4RNSA 3UK4A 5K2YA 4G8MA 4EXLA 4PETA 2DVCA 4DDDA 5K2XA 4EQ9A 3K00A 1B0HA 4IO6A 1JW1A 5ITOA 4OTEA 1QUIA 5AA2A 4F3PA 4PFYA 3T9UA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4QFOA 3KOSA 1OQGA 4PF6A 4MNCA 1N7WA 2D21A 2REJA 2FHYA 1WVJA 3N94A 5CBRA 1B1HA 4EF1A 2O68A 4N13A 5I84A 4PTKA 5BWJA 2B65A 2HXWA 2XXHA 3BIGA 1TT1A 4HCWA 1IQ7A 4I1DA 1MXUA 2G93A 2HXRA 4OFLA 3IR1A 2DOJA 3RTWB 2UVIA 4NF5A 4F2QA 4JVIA 1JP4A 4BDLA 1RDXA 2UVJA 3PUWE 4OFOA 2CZIA 3KEIA 1B7ZA 1FW0A 2P3VA 4XFEA 4MLQA 4X1BA 4ZZAA 4ISUA 3S2VA 3D4CA 2WBDA 3H3GA 4RPNA 3IFCA 4AS4A 3SEXA 4PQJA 4R6HA 4P3LA 1B40A 1A7LA 5AA4B 3IO4A 1OLAA 4MAGA 4NMYA 2QVRA 2E1SA 4KFQA 4P11A 1URGA 4ZS9A 3SDFA 3SEVA 1FTKA 1SW4A 3ZKKA 5IM2A 1P1WA 1QW0A 1VSOA 2O7UA 4K3FA 2QVUA 4ZEDA 5B7DA 3TCGA 4AB6A 3IX1A 3Q25A 2P1SA 3SETA 2XXTA 2NXOA 2XXVA 2AL5A 4GWOA 2XXXA 1QKAA 4HTGA 1B46A 1ZIUA 2ANJA 4GBWA 3FIRA 2Q8MA 3FJMA 5DYHA 2A5TA 4C0RA 2PX1A 3FVGA 1N76A 5FHOA 2V3TA 1IXIA 1L5TA 1ZKBA 3T0JA 2ZYMA 2B3FA 4G68A 1EZ9A 3RT8A 5AA4A 1P1QA 2RINA 1DSNA 2GH9A 1MDQA 1FQBA 3LSWA 4FECA 1DTGA 1K9ZA 1LEVA 1G0HA 3TTNA 3DP4A 2XX7A 3IB1A 1DBZA 5ET6A 1XHYA 3G3GA 4OVPA 1XT8A 3O97A 2Y7KA 4C1UA 4MX6A 3RNNA 3KC0A 2FIEA 4KPTA 3FJ7A 1I6AA 3K6UA 4P1LA 2F7AA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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