4HS7A

2.6 angstrom structure of the extracellular solute-binding protein from staphylococcus aureus in complex with peg.
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
376
structure length
376
Chain Sequence
KDKPNQLTMWVDGDKQMAFYKKITDQYTKKTGIKVKLVNIGQNDQLENISLDAPAGKGPDIFFLAHDNTGSAYLQGLAAEIKLSKDELKGFNKQALKAMNYDNKQLALPAIVETTALFYNKKLVKNAPQTLEEVEANAAKLTDSKKKQYGMLFDAKNFYFNYPFLFGNDDYIFKKNGSEYDIHQLGLNSKHVVKNAERLQKWYDKGYLPKAATHDVMIGLFKEGKVGQFVTGPWNINEYQETFGKDLGVTTLPTDGGKPMKPFLGVRGWYLSEYSKHKYWAKDLMLYITSKDTLQKYTDEMSEITGRVDVKSSNPNLKVFEKQARHAEPMPNIPEMRQVWEPMGNASIFISNGKNPKQALDEATNDITQNIKILHP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Bacterial extracellular solute-binding protein, putative
publication title 2.6 Angstrom Structure of the Extracellular Solute-binding Protein from Staphylococcus aureus in complex with PEG.
rcsb
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus
molecule tags Solute-binding protein
total genus 132
structure length 376
sequence length 376
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-10-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4hs7A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4hs7A02
4LZ5A 1DPPA 1RYXA 3E9XA 1Z7ME 1Y3PA 3H4ZA 1R9LA 3THIA 3BFUA 1MY2A 5H8QB 1NKXA 2RC9A 2DE2A 1EZ9A 4G68B 2F8DA 3VXCA 2B3FA 1TFDA 3K2DA 5DTBA 4OFOA 3K1PA 4MF3A 1H44A 2R6GE 4QSCA 4ZECA 4AB6A 1SD3A 2O1LA 5CMCA 2UYFA 5ITOA 4Q0CA 4YB6A 1ELJA 4F22A 3IL1B 5I57B 3SEVA 1IUDA 2A5TA 3ONMA 5DVFA 4G2ZA 1Y1ZA 1PBPA 4GOTA 2O84X 3OSQA 1MY4A 4H0WA 4ESXA 4I8CA 3V83A 4DDDA 2NVUB 1XHYA 5TPAB 1NNKA 1YAEA 4IO2A 4RNSA 3U94A 1B7HA 3FIRA 2H98A 2OK2A 3PUWE 1QKAA 1SW5A 2P1SA 3AXFA 2PBWA 5FHNA 1LLSA 2HZLA 5I84A 2VD2A 2ONSA 2DVZA 4ELRA 5ITPA 1MDQA 2I6EA 4BDRA 1UTHB 4Q30B 3GBAA 3IO6A 3O2AA 5HPQA 5ICQA 2D21A 1Y1MA 4GFRA 3FD3A 3PD9A 3R7XA 3UA8A 4AB5A 2XXQA 1SYHA 3MPLA 2AIXA 2QS1A 3U93A 2Y7KA 3FGSA 4TLMB 3H6VA 4R6YA 2F36A 1XVYA 2W7YA 3OELA 1IXCA 2DP8A 2HFBA 4NF5A 4OZ9A 2NUVA 3R26A 4PFTA 1BKAA 3G3HA 2DQVA 4NF4A 3I6VA 3BKIB 5KDTB 3O97A 3PD8A 2M8CA 4GD5A 4YICA 2F97A 1FTLA 2F7BA 1B9JA 1LAGE 2V25A 1IZ1A 5H8HB 3Q26A 1TFAA 4THIA 2HQ0A 4C0RA 3TQLA 3IK6B 2LAOA 2Y7IA 2ZYNA 2QS3A 1L5TA 3PUYE 2ZNSA 3L6GA 3USDA 2XHDA 3KSXA 4G77A 2I3WA 4OETA 2DYXA 4Z0IA 2XXTA 4KCCA 2I4CA 4KYSA 4FEDA 1A99A 3K00A 5JK4A 1DMBA 1LAFE 2ANJA 1BP5A 5DT6A 1US5A 3V89B 2P0SA 4IO7A 3KFMA 4POXA 3U72A 3CSBA 2FNCA 3OO8A 1FQCA 3TPAA 1P99A 1EH3A 1HSEA 2RINA 4LATA 3QUFA 1IQ7A 1BLFA 1N7XA 5M2VA 4LQ2A 3UK4A 4QFKA 2RC8A 3BBRA 3PMWA 4BDNA 4JB7A 4F39A 5AA3A 1JEUA 3O9PA 1B0HA 2VGQA 3OD7A 3TTRA 4R2BA 4JBZA 2B65A 2I48A 2GFEA 3PMVA 1N04A 5CBSA 2CZLA 4LP2B 5H8QA 3FXQA 4RYAA 1QKBA 1R9QA 4KD5A 4F1VA 3K01A 1DOTA 5DYHA 3O6IA 1ANFA 4OWDA 1OQHA 1QJMA 2OWSA 2QPQA 3SDFA 4R73A 4RA1A 3JZJA 1LCTA 5H8FA 3EF7A 3IO4A 4NEDA 4GWOA 3ZKLA 1LGBC 3TCFA 1QUIA 4OFJA 1Q1KA 3VVDA 3QSLA 3K1NA 3FATA 4ELOA 2HCAA 4MLVA 2DOJA 4NWDA 3VLUA 2UVGA 1P1QA 4FAJA 1S9TA 2GH9A 3TUSA 4F1YA 1SI1A 4U23A 5ELVA 4PFWA 4R74A 2THIA 3W9VA 1A8EA 2RCBA 2V84A 5TPAA 4IO6A 2RKMA 1M5CA 1USYE 3TKDA 4M1VA 2ONKE 3KEIA 1MY0A 4FEBA 4YZZA 3B6WA 5AA2B 1NNTA 2P2AA 5CM6A 5L9SA 1I6AA 1II5A 3T93B 2I0CA 1JVYA 1SDXA 3EQ1A 2Y84A 3HV1A 3B6QA 1N3WA 1H76A 3WAEA 1RKMA 1I6QA 2Z22A 3IB1A 5CC2A 5JTYB 3RNNA 4GXSB 4L17A 1NNPA 4H1XA 2NWJA 3C34A 1ZBMA 3E13X 3HSTA 3TTKA 4DE8A 4G68C 2O51A 2Q2CA 3S2VA 1VSOA 4XXUA 3WAFA 1XT8A 2PT1A 2IEEA 3FUZA 4EDPA 2NOOA 4HTGA 3TEPA 3MJNA 3CFZA 2XXHA 3H06B 3K6WA 4NMYA 1LB9A 2Z23A 3OEMA 4LZ7A 3TMGA 3IAZA 2RF1A 4YU0A 4G4PA 4OENA 1H45A 4MBPA 3K6UA 3RTWB 1UTBB 2DWAA 2X26A 1POTA 3FVNA 4ZE9A 1XC1A 3RLFE 1Y3QA 3D4CA 1QULA 4POWA 1P1WA 3PUVE 3ODBA 1N76A 1IITA 3IORA 4ZZEA 3V8XB 1OLAA 4RY1A 2XXUA 5DEXA 3TTLA 3T9VA 4YMBA 2Q9TA 3O6GA 1ZIUA 2F5XA 4GL8A 4FECA 3EN3A 3DM0A 1RYOA 2ONRA 3MVWA 4ELQA 1S7YA 3FJ7A 4FJPA 4ELPA 3KN8A 1MM6A 2HEUA 3UP9A 3IB2A 2PVUA 4I9DA 1R6ZA 3KN3A 3MWBA 5FTIA 4X9TA 3IX1A 4OVJA 3PUZE 5TU0A 2PMSA 2UVHA 4PP0A 4QFLA 2OLBA 4LZ8A 1FQAA 3FVGA 4IO5A 4YMAA 2Z8FA 1N84A 4U1ZA 1JW1A 2XXXA 2Q88A 4Q5TA 1MPCA 2F6GA 2VP1A 3H6UA 3MUQA 4ZEIA 4ZS9A 4OHNA 1GV8A 1NH8A 3M3KA 2Y7WA 1N3XA 1N7WA 3KOTA 4ZDMA 4MFIA 3JYRA 4JWYA 3U8QA 3RN8A 2E0SA 3QUJA 2O7UA 3E4RA 3G3GA 1NH7A 4O3BA 4QFOA 4GL0A 2BJJX 4FIMA 3M3FA 2OJTA 4U2RA 3VV5A 1IIWA 3DELB 4R6HA 5H8NA 4NWCA 3DP4A 4XKQA 4ZZAA 4LONB 1D3KA 3TCHA 2E1SA 3VVFA 5I58A 5I2NA 5A5XA 3SEWA 2VD3A 2XXYA 1B51A 3OSRA 1B5IA 5IAIA 1MXVA 4U21A 3N6TA 3TTNA 1OLCA 3Q28A 3IOTA 4F1UA 1LAHE 1Y4CA 4JWXA 2ALUA 1Q35A 5AA2D 4XTCQ 3OO9A 5JTYA 3MP1A 3G3KA 4XKPA 3CVGA 3G3FA 1B4ZA 1JW5A 2QS2A 1POY1 3TAJA 4ZEDA 2ZNUA 4ZEFA 1LCFA 1B32A 1EZPA 1B7UA 3CG3A 4NF6B 3LBSA 1M5BA 2GHBA 3HO7A 3SKPA 2G29A 3CR9A 4X1BA 3PPQA 3Q29A 2X7QA 2H25A 3CFLA 3QYTA 2OWTA 3MVXA 2UVIA 4O3AA 5EHMA 2QMWA 4OERA 2QRYA 1IXHA 2AL4A 5AA4B 1FTJA 4H8IA 3M3LA 2HZKA 2REJA 3KN7A 4NF8A 4BDOA 3K6XA 1GGGA 2YJPA 5KCJA 5BWJA 4OEVA 1HSLA 1MH4A 1SYIA 4C1UA 1EU8A 3B7DA 3T22A 4KYEA 1MM7A 3CSGA 1JQFA 2F35A 1OMPA 3HCQA 3C31A 2QL3A 3FJMA 4X1DA 3UIFA 4OMBA 3ZS6A 2VOZA 3ZKKA 3MVZA 2RC7A 4KHZE 3S4UA 3C33A 4QRZA 4EXLA 1AMFA 1B2HA 1DSNA 4ESWA 1LFHA 2I4BA 1FQFA 4U1OA 5I59B 1MDP1 3UN6A 3IOUA 3D4GA 4G68A 3IOVA 1O63A 2V3UA 5CI5A 2O6AA 3G3IA 1Y3NA 4R72A 3OMBA 4WKMA 4WEPA 4GRKA 3N26A 3SERA 3G7WA 4QF9A 3ILUB 4IO3A 4EF1A 2ESNA 5I57A 1VFDA 1TT1A 4G8MA 1JEVA 4HCYA 1MXUA 3HHGA 2ZYOA 2XXPA 4ZEKA 3RT6B 3PGFA 3HHFA 3T96B 1SI0A 3MPKA 3TODA 1T0KA 2A5TB 1PB8A 4F3GA 3R6UA 4N07A 2XXVA 3SEYA 3A3UA 2F78A 2OZZA 3TELA 2PYYA 5FHMA 2FYIA 5J1DA 1B05A 1XVXA 4PFUA 3LSWA 4IGTA 4OESA 4GLIA 3TCGA 2HAUA 1P1NA 1JETA 1IXIA 4YAHX 3TZAA 2F34A 1MQDA 1JNFA 4PE5B 1AIVA 2HXWA 1QUJA 3QK6A 1ZJLA 1WODA 1J1NA 2ZMBA 1PB7A 1UTHA 3RUMA 3RQTA 4WXJA 4F18A 3GXAA 1MY3A 1P1OA 1B6HA 3LC8A 2V93A 1A54A 4XKNA 3UGWA 3VLWA 1B40A 2DXRA 4OQOA 1IEJA 4C1TA 3HPIA 4IY5A 3T9UA 3OENA 3MQ9A 4ISUA 1O7TA 4GF8A 1B52A 5KDTA 4H67A 3FZVA 4QFNA 4KQPA 4OXVA 5AE4A 2D5WA 1B3LA 3FASA 2A5SA 3EHSA 3MZ9A 2H99A 5H8HA 3KJ7A 1ZU0A 2Y7RA 3PPOA 4NF4B 4P0GA 3LUYA 1MXYA 1FCKA 5CBRA 2UXAA 4BDLA 4RK9A 2VHAA 1MQJA 4JWOA 2Q2AA 4RK2A 2DWHA 3JV9A 3PV0E 2O69A 1D9YA 1MPDA 3DP8A 2I3VA 3CI8A 1Z7NE 3U92A 4F3BA 3N6UA 2QS4A 5K2YA 1M5DA 1FTMA 2H5YA 1AL3A 1P1UA 1XS5A 4H5GA 3RTFB 1AOVA 2DVCA 2QMXA 3C35A 1MXZA 2D3IA 1SW1A 1TXFA 3PPPA 2ABHA 4K3FA 1BIYA 1URDA 2XD2A 4OYVA 4X48A 2PT2A 4M4GA 2CMOA 2DXYA 2DWJA 3FV1A 4FORA 4QSEA 3W15C 4BDQA 5EYFA 3OXNA 3K1MA 4YB5A 3I3VA 2RCAA 4R9FA 1LBCA 2F7CA 4HCWA 4MH5A 4TOZA 1OVTA 1M5FA 1Y4TA 5B70A 3MBPA 2V3QA 1SQYA 3KSJA 3OEKA 3KG2A 4OFLA 3QIMA 4NE4A 4U22A 5I2KB 4U4SA 3PU5A 4F2QA 3SEXA 1WDNA 2G93A 4EQ9A 3A3CA 3EHTA 1GTKA 2OBGA 1N0TA 3RY3A 4MLQA 1ZMGA 1LB8A 1GVCA 1URSA 4KI0E 4IO4A 3N94A 2Z8DA 5CRYA 4KR5A 1F9BA 5JEIA 1UQWA 3TYHA 1FQEA 3B6TA 3TDJA 3O29A 2AYSA 2DE4A 3SESA 5H8FB 3S9EA 3DP6A 3PPRA 5L9OA 3FV2A 1FTKA 3BFTA 3SETA 4F31B 2I0BA 1YTVA 4DXUA 5CMMA 1KWHA 2ZYKA 3C9HA 4N13A 1MXXA 2XX8A 4JXIA 4YKJA 4NTLA 2KLFA 2QJEA 3QAXA 3IOWA 3VFJA 4IB2A 3VE1B 1M5EA 1YCJA 5AA2A 5ICTA 2REGA 3FVOA 1B58A 4EQBA 4QSDA 1NL5A 1D4NA 4LUBA 1R1NA 4JSDA 1JW4A 2I49A 4E0XA 3IJXB 2XXIA 1B3HA 4R9GA 2R71A 2F7AA 1PBQA 2HAVA 4HS7A 4TLLB 2XD3A 4LVQA 3K4UA 4TQUQ 4HW8A 2DS9A 3MZBA 2H4IA 1TWYA 2IA4A 2I58A 5DVIA 3OO6A 3IJOB 3L6HA 1A55A 1LSTA 2O1MA 3LR1A 1ATGA 3M8UA 3KJTA 1LBBA 1AH5A 3O66A 2O7IA 4YB7A 3O6HA 5L8DA 4FATA 1MH3A 4I62A 1MQGA 3FVKA 4ONYA 1BTJA 1XOCA 4I1DA 1VE4A 5LOMA 3H7MA 5CMBA 1A8FA 1YPNA 1WVJA 4OEUA 3TQWA 5TP9B 1LAXA 3A09A 3W9WA 3H3GA 4EF2A 3PPNA 2R9JA 4AQ4A 3MC2A 3CIJA 1UTBA 5I56B 1NNFA 4YKPA 3SEUA 1B5JA 1FQBA 5H8SA 3GBBA 2ZNTA 5FTHA 4U4XA 1B7ZA 3C4MA 1VFEA 4IGRA 1GR2A 4IY6A 4EUOA 1H43A 4PETA 1B0LA 3EPEA 1US4A 3G3JA 4FE8A 1B3EA 1CE2A 4F29A 3H6TA 3RPWA 3K0VA 1DTGA 4DIGA 2ZXTA 1B4HA 4H6DA 2UVJA 4F3SA 2GHAA 4JDFA 3OO7A 3VDFA 1LFGA 1OVBA 1S50A 1B46A 3CRBA 1VR5A 3MAMA 4QFPA 4RXLA 4GQOA 1MY1A 5DEXB 4EXKA 2X7PA 4ZEBA 4PQJA 5KZTA 5F1QA 4OTEA 3RGYA 3LSLA 4DZ1A 5HM4B 5I2KA 4KYDA 3U1OA 2QSXA 3IR1A 2DWIA 4UACA 1FQDA 1QUKA 4PFYA 4WEDA 4RPNA 3RT8A 3ECRA 4YKIA 1B5HA 1SW4A 3KGCA 3T9HB 3MP8A 5IKBA 1USYH 5EHSA 3LSFB 4KPTA 3KBRA 1SVXB 2FA7A 1Y20A 2GRVA 4XIGQ 3TTMA 1QW0A 4P11A 3V5AA 4ZE8A 1B1HA 1MQIA 1MQHA 5HBCA 4Q8RA 3S9NC 2DSFA 3H03A 3C36A 1B3FA 4H65A 2DE3A 4RJZA 3T9XB 1FTOA 1SBPA 4G8HA 1PDAA 4RPOA 1A40A 1JVXA 1LFIA 4ECFA 4F3PA 5L9MA 4H5FA 4BDMA 1I6BA 2XXRA 2XXWA 2B3BA 1PB9A 1UIUA 3MVYA 3ZSFA 3S9MC 1MS7A 5B7DA 4KCDA 1Y9UA 3PMXA 3S9LC 4GIZA 2WKYA 3H6WA 4YKKA 4R6KA 5ISUA 5AA1A 3CFXA 4P0IA 1DPEA 2XX7A 3PUXE 1PC3A 4JSOA 5H8NB 3ILTB 5K2XA 3VVEA 1OIBA 4DCYA 3FXRA 3FXUA 5FHOA 3MZ1A 2AL5A 1HSJA 4GVOA 5I58B 5I2NB 1H3DA 3N5LA 4DXCA 5A5XB 3MP6A 3I5OA 2XX9A 2UYEA 2ZYMA 1D9VA 3KZGA 2OCUA 2NXOA 1NMUA 2Z8EA 2V3TA 1PEBA 4UA8A 1ZLQA 4LA9A 1B3GA 4LQ5A 4H8JA 4KFQA 4XKRA 4NF6A 1UIVA 3UORA 4NF5B 1OQGA 4F19A 1CB6A 2Q89A 1QVSA 1MXWA 3HN0A 3K02A 3F11A 2Q8JA 5TP9A 2PX1A 3GZGA 5AA4A 3IB0A 3O28A 1MG1A 5BUUA 3MW0A 1I69A 5I56A 4N6PA 2H9BA 1MPBA 4DLDA 3TFLA 3LSXA 2O68A 1FW0A 4GXAA 3T66A 5DVJA 4BLAA 4EQ7A 3EHUA 4O3CA 3K6VA 1ZKBA 3QXMA 4DCXA 4Z7EA 4NF8B 3Q25A 3KOSA 2YPNA 4DXBA 3VLVA 1O64A 3FJGA 4F2OA 5KCJB 3VXBA 1IXGA 1EZOA 2YLNA 3P7IA 4R75A 2Y7PA 3GLBA 3Q27A 1ZTYA 1NFTA 1A7LA 3E3KA 5CMKA 4E0WA 5F7VA 3CG1A 3DLNA 4QHQA 4R2FA 1MRPA 1B1XA 1SW2A 3OOAA 4G8NA 1DTZA 5I59A 1URGA 4ND9A 2F6PA 3C32A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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