1MRPA

Ferric-binding protein from haemophilus influenzae
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
309
structure length
309
Chain Sequence
DITVYNGQHKEAATAVAKAFEQETGIKVTLNSGKSEQLAGQLKEEGDKTPADVFYTEQTATFADLSEAGLLAPISEQTIQQTAQKGVPLAPKKDWIALSGRSRVVVYDHTKLSEKDMEKSVLDYATPKWKGKIGYVSTSGAFLEQVVALSKMKGDKVALNWLKGLKENGKLYAKNSVALQAVENGEVPAALINNYYWYNLAKEKGVENLKSRLYFVRHQDPGALVSYSGAAVLKASKNQAEAQKFVDFLASKKGQEALVAARAEYPLRADVVSPFNLEPYEKLEAPVVSATTAQDKEHAIKLIEEAGLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords FERRIC IRON BINDING PROTEIN
publication title Structure of Haemophilus influenzae Fe(+3)-binding protein reveals convergent evolution within a superfamily.
pubmed doi rcsb
source organism Haemophilus influenzae
molecule tags Iron transport
total genus 126
structure length 309
sequence length 309
ec nomenclature
pdb deposition date 1997-05-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mrpA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mrpA01
3OMBA 4DXCA 3TODA 4F1YA 1XVXA 1FQCA 3ILUB 3MZ9A 1HSLA 4EXKA 4ISUA 3Q27A 1MPCA 1JW4A 3TAJA 3FGSA 3W9VA 3Q28A 1WVJA 4HCWA 4RK2A 4EUOA 4F1UA 1LGBC 4NF8A 4KD5A 4MLVA 3C36A 1MPDA 1S9TA 4YB5A 3FJ7A 4IY5A 3IOVA 2H5YA 1I69A 3H6WA 1F9BA 5L8DA 4IGTA 1A99A 4JWXA 4LZ8A 4YKIA 1EZOA 1VSOA 1Y3NA 1S7YA 3MW0A 4R6KA 1DTZA 4ELRA 1EZ9A 4X1DA 4I9DA 5KZTA 3TUSA 3RUMA 2P2AA 3IB0A 2DE2A 3KN8A 4OFJA 3MVZA 5I57A 2QS1A 4ESWA 4TQUQ 4OVJA 1ELJA 3IL1B 1XVYA 1SW1A 4Z0IA 2ALUA 1XC1A 3UORA 1R9LA 1B7UA 4C1TA 2KLFA 3H6VA 2GH9A 4DIGA 3VDFA 3KN7A 5FTIA 1I6BA 2Q89A 3TKDA 5CMKA 2VHAA 3OXNA 3LR1A 3FV1A 1LAGE 3VLWA 2Y7KA 2O84X 4R6HA 5AA2A 4YKJA 1SBPA 3B6QA 4AB5A 4E0XA 5KDTB 3VLVA 3CFXA 4GFRA 3RQTA 4KYSA 1N7WA 1SW2A 1NNFA 1H45A 1L5TA 1LLSA 2QMXA 3Q26A 2XXHA 1ZU0A 4BLAA 3DM0A 4IB2A 3PPOA 2DWIA 4XKQA 3SEVA 4O3AA 4JXIA 2DS9A 2XX9A 1B46A 2DVZA 4P11A 2UYEA 1A40A 1DMBA 1O63A 3L6GA 2X7QA 2PX1A 3TMGA 3TQWA 3V83A 4M4GA 2G93A 2NWJA 1SQYA 3A3UA 1NNKA 4NWDA 3FJGA 2ZYKA 2RCAA 3WAEA 2DWJA 3K1PA 3EHUA 3L6HA 3TZAA 2H4IA 4AQ4A 4H8JA 2UXAA 4DCXA 1TXFA 4NF8B 4R75A 3LSWA 4ZE8A 4GXSB 2DE3A 2XX8A 1N3XA 4F1VA 4EQ9A 3C31A 3PUYE 4LA9A 5BUUA 3FVGA 2AYSA 2ZNUA 2BJJX 2V93A 4ZS9A 2CMOA 4JWYA 2Y84A 1MQHA 4LQ2A 3QSLA 3FXQA 1B5IA 4P0GA 3SEXA 4DZ1A 1RYXA 5I57B 5I59A 2OWSA 3O97A 1QUIA 1ZBMA 2D5WA 3U92A 2QS4A 4C0RA 4OESA 1SW4A 3FJMA 5H8HA 4OYVA 3G3IA 2H25A 1ZKBA 1ZMGA 5ISUA 1B3EA 3H6UA 1VR5A 5IKBA 1GV8A 2F7AA 3MPLA 4ZEBA 3K1NA 5AA2B 2Y7PA 1MXYA 2QS2A 3O9PA 1IXGA 4ONYA 2RC7A 3C32A 4OERA 4XKRA 1N04A 4KPTA 5L9OA 3U8QA 5EHMA 1QUKA 3FXUA 5AE4A 4XXUA 2O6AA 2GFEA 2ANJA 2X26A 3GBAA 2VD2A 4C1UA 4GL0A 4WEPA 2R71A 3CFZA 5CMMA 2Y7WA 2VGQA 5I84A 3S2VA 1ZLQA 2HFBA 3K2DA 4PE5B 1P1OA 4QSDA 4OETA 3EHSA 3OD7A 4LZ7A 2FYIA 3FVKA 1H3DA 1NH8A 3ZKKA 3TEPA 2A5SA 1B32A 4G8HA 1OLCA 1Y4TA 3KN3A 2YPNA 1YCJA 2Q2AA 3ZS6A 4RYAA 1XOCA 4XIGQ 3IO4A 4RPOA 4R72A 4U21A 3VLUA 3KZGA 4G77A 1A8EA 3EF7A 2PYYA 2H99A 4GWOA 3MUQA 2AL5A 1BKAA 1US5A 3TTNA 2NUVA 4EQBA 1I6AA 3VXBA 3TCGA 4JBZA 2DWHA 2XXXA 3MZBA 3QAXA 2X7PA 1B9JA 1H44A 3PPQA 4PFWA 1LCFA 3LBSA 4IO6A 2F97A 4GVOA 4GQOA 1N84A 4GL8A 3VE1B 2VD3A 4RPNA 3OELA 4RNSA 4Q8RA 3VFJA 3PMWA 4JSDA 2D21A 2B3BA 1N3WA 3G3FA 5CRYA 3KEIA 3QIMA 3ZSFA 5AA2D 4Q30B 5JEIA 5EHSA 5I59B 1QJMA 4GRKA 3S9NC 1QW0A 1R9QA 3RY3A 4LVQA 3VXCA 1LAXA 1Z7ME 2DXRA 1PB7A 3KBRA 4U4SA 2E1SA 5KCJA 2XXIA 2QRYA 5H8HB 3RTFB 3TPAA 2DSFA 2Z22A 4F3GA 3LC8A 1IXIA 3T96B 4ELQA 1OVBA 3FIRA 2DXYA 5IAIA 2H9BA 2B65A 3EN3A 4KCCA 3OO7A 1J1NA 1EH3A 3MPKA 2O51A 3WAFA 4NF6A 2RF1A 3JV9A 3FXRA 1M5EA 4OEVA 4F19A 4G8NA 4XTCQ 1H43A 3MAMA 5DVIA 3PMVA 3D4GA 3QXMA 4FAJA 4EDPA 4BDLA 4U2RA 1MRPA 2AIXA 2XXVA 3RGYA 1N7XA 4THIA 4ELOA 1QKBA 1Y1ZA 1QVSA 2UYFA 5BWJA 3PV0E 3C33A 3PGFA 3ONMA 3K6UA 3OO9A 4G8MA 4PFUA 3FVNA 2F6GA 1BTJA 3T9VA 3W9WA 3TFLA 1DOTA 2P0SA 4I1DA 3CRBA 2UVGA 2Q9TA 3LUYA 2HZKA 3OSRA 1P1QA 4JWOA 1AL3A 4GXAA 2HAUA 1MPBA 4OTEA 4PETA 3S9LC 1P1UA 4BDMA 3KFMA 1LBBA 3G3JA 4R6YA 4RK9A 4R2FA 4F18A 5M2VA 2I3VA 1MY2A 2O69A 3G3GA 1IITA 2WKYA 3ECRA 5A5XA 3N6UA 3KSJA 4U4XA 3FD3A 4GD5A 1XS5A 5CI5A 1TT1A 5AA1A 3E13X 3PPNA 5KCJB 3EQ1A 1OQHA 2Y7IA 5TP9A 3IOTA 2XXRA 3H4ZA 5TPAB 2V84A 3CG1A 1DPPA 1LFHA 3MC2A 5J1DA 3RT6B 1WDNA 1Q1KA 4NF6B 3O28A 2W7YA 3O6IA 1FCKA 3FATA 2PT1A 2GHAA 5L9MA 4U1ZA 3TYHA 4FORA 1JVXA 2HEUA 3OO6A 1JW1A 1IQ7A 3UIFA 3IJXB 4X1BA 2ZYOA 3Q25A 1TFAA 2THIA 2O68A 4LONB 3VVEA 4NF4A 4R2BA 4KFQA 3UGWA 5ITPA 1HSJA 2I6EA 2XD2A 4PFTA 3TTMA 4DE8A 3LSLA 1P99A 1GGGA 1QULA 4AB6A 4WKMA 3TCFA 3IK6B 1FW0A 3QYTA 1B40A 1B7HA 1DSNA 3H3GA 3O29A 2RCBA 3IAZA 1SI0A 3F11A 4R73A 3SEUA 3CI8A 1PDAA 5H8SA 3TELA 3TTKA 1EZPA 5DVJA 2HCAA 2I4CA 2YLNA 1NH7A 3JYRA 4H65A 2V3UA 4ND9A 2PT2A 3PU5A 1FQAA 4KQPA 5F1QA 3H06B 3CFLA 1FTOA 3R7XA 4QSCA 4GOTA 1NL5A 4N6PA 5I56A 4EF1A 2I0BA 1URGA 4KYEA 3MBPA 4BDOA 1SYIA 3HHFA 3PPPA 3MVWA 2XXTA 1ZTYA 2Z8FA 4FE8A 1B2HA 2Q8JA 1USYH 4ELPA 1A55A 1LSTA 5FHNA 3MP6A 4ZECA 1LB9A 5TP9B 3UP9A 2F36A 2ZYNA 2OLBA 1A54A 2Q2CA 3H6TA 2IEEA 5FTHA 5CM6A 5TU0A 4UACA 3ODBA 3IOUA 3OEMA 3B6WA 3E9XA 3U1OA 3AXFA 1B3GA 4JSOA 3SDFA 2P1SA 3PUWE 1R1NA 4OEUA 3CIJA 4QFPA 1FQBA 5H8NA 3SETA 3FUZA 4QFNA 3SKPA 1URSA 4IO7A 1M5FA 5B70A 3M3LA 3O66A 3C35A 4FECA 3H03A 4NF4B 2F78A 3CSBA 3PD8A 4U22A 3C34A 3RT8A 1YPNA 3THIA 3HO7A 1MDP1 1PBPA 4U1OA 4G68C 3EHTA 4X9TA 4YZZA 3W15C 4POXA 1FTJA 1HSEA 5HPQA 2I3WA 1JEUA 3GLBA 3IOWA 4RXLA 2I0CA 5HM4B 1B05A 1B5HA 2Z8EA 2QL3A 1B1HA 3SERA 4H8IA 4OMBA 2ONRA 4RJZA 4BDRA 2Z23A 4HCYA 2QS3A 1TWYA 3PPRA 5H8QA 4U23A 3ILTB 1MY4A 1MS7A 4DLDA 2I58A 3O2AA 3USDA 2OBGA 4DCYA 1DTGA 4L17A 4Q0CA 1SYHA 1BP5A 4ZEIA 4IO2A 2DYXA 3MJNA 3GXAA 1SW5A 1VFEA 2A5TA 1IUDA 1B58A 2LAOA 4PFYA 2V3QA 3D4CA 2DVCA 2GRVA 3K6XA 3K0VA 1PB8A 1ATGA 4IY6A 3V8XB 1M5DA 2OCUA 1D4NA 3K6VA 4MF3A 4NF5A 1Y3QA 3T22A 2XXPA 5DTBA 2OWTA 3KJ7A 2V25A 3VVDA 4YKKA 4DXBA 3T93B 4FEBA 4NE4A 5AA3A 3O6HA 1PB9A 1II5A 3BBRA 4LP2B 4FEDA 2DWAA 4H5FA 2YJPA 3IR1A 5H8NB 3VVFA 3KSXA 1B3FA 3FZVA 3HSTA 1A8FA 2XXYA 3A3CA 2UVJA 3O6GA 4QRZA 3T66A 2OK2A 1VFDA 5DYHA 1RYOA 2UVHA 2REJA 4UA8A 2DE4A 1BIYA 5JTYA 2F34A 4JDFA 1GTKA 3GZGA 4YICA 1OLAA 1B6HA 3DP6A 2ZNTA 1MM7A 1YTVA 3G7WA 1SDXA 2HAVA 2VOZA 1IZ1A 3EPEA 3K1MA 3KG2A 3G3HA 3G3KA 5H8QB 1D9YA 1POY1 4N07A 5I2NA 1AMFA 4E0WA 1O7TA 4Q5TA 3IX1A 3I5OA 3C4MA 2O1LA 4H0WA 1EU8A 2XD3A 3KOSA 3HCQA 3QUFA 3PMXA 4MLQA 4LUBA 3DP4A 1CE2A 2DP8A 1Y9UA 4OQOA 4XKPA 2HQ0A 2RC8A 4F3PA 4GLIA 2A5TB 4G68A 1P1WA 4KI0E 5I58A 3T9HB 3IO6A 3E3KA 5DEXA 3HHGA 1RKMA 1PBQA 2F5XA 5CC2A 1FTLA 3CR9A 3KOTA 4FJPA 3CSGA 4G2ZA 1USYE 2ESNA 3BFUA 3N26A 4OWDA 1Y20A 1MY0A 3M3FA 4IO5A 2OJTA 4NMYA 1AOVA 4EF2A 1MXWA 1UQWA 1MQGA 1QKAA 4YU0A 2ONKE 4ZEFA 3UA8A 4BDQA 4TOZA 4N13A 1NKXA 1NFTA 2GHBA 1ANFA 5CBSA 2UVIA 4QFKA 1B3HA 3SEYA 4NTLA 5ITOA 3OO8A 4IO3A 4I8CA 4POWA 3RTWB 3SEWA 1IXCA 5JTYB 4NWCA 2B3FA 2PMSA 3T9XB 3CVGA 5JK4A 1VE4A 2ZMBA 1R6ZA 5B7DA 1N76A 4H5GA 5DVFA 1ZIUA 1KWHA 1Y1MA 3K00A 1URDA 2R9JA 3RNNA 2ABHA 5L9SA 1LFIA 1SD3A 3N6TA 4QF9A 5I2NB 5K2XA 1XHYA 4F3BA 1M5BA 4RY1A 3S4UA 3B6TA 3B7DA 2NXOA 4DDDA 1Q35A 1H76A 3R26A 4DXUA 3MZ1A 3TTLA 2G29A 1LBCA 5FHOA 1N0TA 4OXVA 3OENA 4KYDA 3MWBA 2RINA 5K2YA 2PBWA 3HPIA 4G68B 4QFLA 5I58B 2NVUB 3MP1A 3GBBA 5CBRA 5DEXB 2FNCA 1B7ZA 3PUZE 2D3IA 5EYFA 3OEKA 1FTMA 4F31B 4OHNA 1BLFA 3MVYA 5A5XB 2Z8DA 2QJEA 1A7LA 4KHZE 1NNPA 4KCDA 3MP8A 3RLFE 1LB8A 4P0IA 4JB7A 1B4HA 3QUJA 3DLNA 4YAHX 3PD9A 4R9FA 2E0SA 3M3KA 4MFIA 2F6PA 3N94A 3VV5A 1O64A 2R6GE 3KJTA 1UTBA 3U72A 4ZZAA 3E4RA 5I2KA 3R6UA 3K01A 4IO4A 3FASA 2O7UA 3PUXE 2CZLA 1US4A 1MG1A 2F7BA 1LCTA 3MVXA 1UIUA 4R9GA 1I6QA 3DELB 1QUJA 1B0HA 1ZJLA 4HS7A 3IORA 5H8FA 3K6WA 1D3KA 1OMPA 2QSXA 3H7MA 3TDJA 4QFOA 1JETA 3K4UA 4FIMA 1PEBA 4H6DA 1GR2A 1MQIA 2DOJA 1IXHA 1IEJA 3OOAA 1B0LA 1XT8A 1M5CA 3Q29A 4IGRA 3A09A 2XXUA 4ZEKA 5DT6A 4WXJA 4RA1A 3BFTA 2IA4A 5AA4A 4YB6A 2VP1A 3V89B 1UTHA 2O1MA 2ONSA 3M8UA 2O7IA 1AIVA 2I48A 1P1NA 3C9HA 4WEDA 4OZ9A 2AL4A 1MH4A 4NEDA 2M8CA 3U93A 3I6VA 1JQFA 2Y7RA 4PP0A 1MDQA 4HW8A 4PQJA 3UN6A 1WODA 5ELVA 1SI1A 2H98A 3DP8A 2RC9A 4FATA 4K3FA 2QPQA 3UK4A 4F2OA 4TLLB 4F3SA 1FQDA 2RKMA 3V5AA 5I56B 2I49A 4MH5A 1OVTA 3BKIB 3HV1A 3U94A 2HZLA 4LZ5A 5FHMA 1MH3A 2XXQA 2ZYMA 2F35A 1Z7NE 1SVXB 2FA7A 2V3TA 2NOOA 3N5LA 2QMWA 1LFGA 1D9VA 1NMUA 1MXVA 4Z7EA 1T0KA 1MY3A 1B1XA 4YKPA 4ZDMA 1GVCA 1MQJA 4ZE9A 1FQFA 4YMAA 1OQGA 1B3LA 3RPWA 1UTBB 4ESXA 3S9MC 3IJOB 1B52A 4O3CA 5I2KB 4G4PA 1JW5A 5F7VA 4H67A 3CG3A 3K02A 4ZEDA 1B4ZA 1B5JA 4O3BA 3LSXA 3JZJA 4GIZA 1PC3A 2HXWA 1FTKA 5CMCA 5ICTA 5H8FB 1MXZA 2F7CA 4LQ5A 4ZZEA 1AH5A 4GF8A 4KR5A 2OZZA 4BDNA 3I3VA 3FV2A 5TPAA 1TFDA 5LOMA 1MM6A 1FQEA 1YAEA 3TTRA 1MXUA 1JEVA 3RN8A 3LSFB 3KGCA 4YB7A 5AA4B 1UTHB 1Y3PA 2XHDA 4XKNA 4OENA 1Y4CA 2I4BA 3MQ9A 1NNTA 3QK6A 4F22A 4MBPA 2ZNSA 3SESA 1MXXA 4F39A 2XXWA 4I62A 2XX7A 4ECFA 5HBCA 3IB1A 1MQDA 4H1XA 2Q88A 4M1VA 1JNFA 3P7IA 4QSEA 4YMBA 4R74A 1DPEA 1LAFE 3TCHA 4F29A 3FVOA 4OFLA 5KDTA 3PUVE 4F2QA 4HTGA 1CB6A 4LATA 1IIWA 3S9EA 1UIVA 4OFOA 2F8DA 1MY1A 1S50A 2DQVA 2PVUA 5ICQA 3OSQA 3TQLA 5CMBA 3IB2A 3T9UA 4EXLA 1JVYA 1B51A 4TLMB 4EQ7A 4NF5B 4QHQA 2ZXTA 3HN0A 1OIBA 2REGA 4X48A 3ZKLA 1POTA 1LAHE
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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