1MRPA

Ferric-binding protein from haemophilus influenzae
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
309
structure length
309
Chain Sequence
DITVYNGQHKEAATAVAKAFEQETGIKVTLNSGKSEQLAGQLKEEGDKTPADVFYTEQTATFADLSEAGLLAPISEQTIQQTAQKGVPLAPKKDWIALSGRSRVVVYDHTKLSEKDMEKSVLDYATPKWKGKIGYVSTSGAFLEQVVALSKMKGDKVALNWLKGLKENGKLYAKNSVALQAVENGEVPAALINNYYWYNLAKEKGVENLKSRLYFVRHQDPGALVSYSGAAVLKASKNQAEAQKFVDFLASKKGQEALVAARAEYPLRADVVSPFNLEPYEKLEAPVVSATTAQDKEHAIKLIEEAGLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Iron transport
source organism Haemophilus influenzae
publication title Structure of Haemophilus influenzae Fe(+3)-binding protein reveals convergent evolution within a superfamily.
pubmed doi rcsb
molecule keywords FERRIC IRON BINDING PROTEIN
total genus 126
structure length 309
sequence length 309
ec nomenclature
pdb deposition date 1997-05-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mrpA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mrpA01
1MXWA 4BDQA 1SW1A 1VE4A 1CE2A 4EXLA 4DXUA 1O7TA 5CRYA 3OO9A 3TAJA 2X7PA 3SESA 2I58A 1XT8A 2ZYOA 3PUVE 1A7LA 1EU8A 1MQDA 3USDA 1QKBA 1RKMA 1N7WA 2ALUA 2O7IA 3EPEA 1OIBA 1B1XA 1RYOA 1QUIA 5M2VA 5JK4A 4YKJA 2QS1A 2UVIA 1HSJA 4QFOA 4LATA 3PD8A 3KOTA 2F36A 1MH3A 3PD9A 1OMPA 5K2XA 1FTOA 3MVZA 2UXAA 1NFTA 5KCJB 1QJMA 2OBGA 2ESNA 5CBRA 1EZOA 4DDDA 4JXIA 4WKMA 1FQBA 1B40A 4OVJA 4F31B 4DXBA 4H5GA 1Y3PA 3MUQA 2B3BA 2O6AA 3FZVA 4R74A 1HSLA 4PFWA 3Q28A 3C9HA 2DXRA 3KN3A 4F1UA 1FTLA 4OTEA 3IJXB 1SW5A 3FD3A 3R7XA 1SYIA 3VDFA 3C33A 1LFGA 4GXSB 5TPAA 3FV1A 3VE1B 4XIGQ 1VSOA 1POY1 3RNNA 3U94A 4EXKA 2ZNTA 3KJTA 3B6WA 4BDMA 1UTBA 3KGCA 1LAGE 1S9TA 3U8QA 1PEBA 3QXMA 2ONRA 1DMBA 4F3GA 3G3FA 2OK2A 4U23A 1LLSA 2XD3A 1SI0A 4XTCQ 2NUVA 4I8CA 4F18A 5B7DA 3U93A 4YZZA 2KLFA 2OLBA 4JBZA 3VV5A 1B7HA 2QL3A 3T9XB 1MXUA 5B70A 1Y1MA 3KFMA 3GBBA 4Q8RA 1B5JA 5JTYA 3KZGA 4JSDA 4YKKA 5H8NB 1HSEA 5CBSA 2RC7A 5L8DA 3LC8A 2REJA 5KZTA 4H6DA 3QAXA 2Y7WA 3RT8A 3MJNA 3RQTA 1Y4CA 5DT6A 2D3IA 2F34A 4PQJA 2OCUA 3TCGA 2GFEA 2HZLA 3N6TA 2XX7A 1PDAA 3OELA 2CZLA 3G3GA 4KI0E 3ZKLA 1UIUA 5AA2B 3T9HB 4OHNA 3DLNA 3G3HA 5DYHA 3IOVA 3R26A 4HCYA 1MQGA 4DXCA 4N07A 1FQFA 3U1OA 1MM6A 2Z8FA 2RCBA 1AMFA 4QHQA 1MY0A 3TUSA 2XXQA 3PUYE 4KPTA 4OFJA 2X26A 4WEPA 4Z0IA 3KEIA 5F1QA 3GXAA 1MXYA 3MC2A 4PFTA 4C1TA 1Q35A 4ISUA 1R9QA 3CFZA 1IEJA 3IO6A 4OXVA 1YAEA 4QSDA 2R71A 3VLVA 2XX9A 3SEYA 3IK6B 4H1XA 5CMBA 2DSFA 1P1OA 3PPQA 3VVFA 4POWA 2UYFA 2O1MA 2Q2AA 3EF7A 4AB6A 5I2KA 3K1MA 3PPPA 1MY1A 4OESA 1MXVA 1O64A 1Y4TA 2XXXA 1B5HA 5LOMA 5AA3A 2DS9A 2Z23A 3QSLA 3FGSA 2XX8A 4RPNA 3SDFA 1P1WA 4ND9A 4H0WA 5AA4B 3W15C 1JQFA 4FEDA 3IORA 1ZU0A 2X7QA 4NWCA 2NXOA 3FVGA 3MZ9A 2THIA 3LSLA 2VD3A 2FYIA 2Y7IA 5ELVA 5CMMA 3IB2A 4PFYA 3S9EA 5FHMA 4GOTA 1OVTA 4F39A 2DWAA 3H4ZA 3N26A 5KCJA 3HPIA 4ZEBA 2I0CA 1NH8A 2DQVA 3LUYA 4U1ZA 1BKAA 4G68C 1AIVA 1NMUA 2XXVA 2RC8A 2I6EA 1MS7A 1H45A 5IKBA 3Q27A 3UA8A 1GV8A 4FE8A 3TTLA 1JEVA 1B2HA 2Q8JA 3MPLA 4KYEA 1Y3NA 4U4SA 4JB7A 1Z7ME 3IOUA 3GZGA 4QFKA 3DM0A 2O7UA 5CI5A 1MXXA 3QIMA 5I56B 4WXJA 4HTGA 2Z8DA 4G4PA 3IR1A 1VR5A 4O3AA 4EQBA 4QFLA 1NKXA 2AYSA 1LFIA 4N6PA 2GHBA 4GWOA 1SYHA 1LAHE 2I0BA 3HSTA 1EZ9A 3QK6A 1Y3QA 4N13A 2H99A 1JETA 3FVOA 1M5CA 3OEMA 1M5BA 3RN8A 4GRKA 1H44A 3IB1A 3RLFE 5I2NA 3IB0A 1B3HA 3PUWE 1M5EA 4TQUQ 3FXRA 3O2AA 3CFLA 4NF5A 3MZ1A 4H67A 3CIJA 5DEXB 3JZJA 1DOTA 2AL5A 4GXAA 4R6YA 4POXA 2XXPA 1MQIA 2ZXTA 1XHYA 3PMVA 3SKPA 1GR2A 4F2OA 4G8HA 5H8SA 3Q29A 4K3FA 1DPPA 1MY2A 3M3LA 2I48A 1IUDA 2IA4A 2DE4A 2V93A 4ZZEA 5I57B 4QSCA 1N84A 2ZMBA 3K01A 4LVQA 5FHOA 4FORA 3UGWA 2Z8EA 1B46A 5H8QB 1IQ7A 3HO7A 3RUMA 1MQHA 3I6VA 1B51A 3KSJA 2O68A 2Q9TA 4G68B 1PBPA 3KG2A 1S7YA 3Q26A 1NNKA 2QS4A 1CB6A 1DTZA 2ONSA 2P1SA 2Q88A 3ECRA 1IXCA 5ISUA 4U21A 1A55A 3RTWB 1MPBA 3EHUA 2V3UA 1FQEA 3Q25A 4IO3A 2I4CA 4R6HA 3O28A 3FJMA 4UACA 1MH4A 1P1NA 3TKDA 1B3LA 3S9NC 4NF4A 3V5AA 2XXYA 4QFNA 3WAFA 1QUKA 2DVCA 5DVIA 1FTKA 3BFUA 4XKNA 3MBPA 2QS2A 1D3KA 2H5YA 2QSXA 5AA4A 4RYAA 4YB5A 2DE2A 1TWYA 4ZE8A 4IY6A 3T22A 4YKPA 3HCQA 4C1UA 2RINA 3CSGA 4ZDMA 4TLLB 2DVZA 4R73A 3E9XA 2I49A 2H9BA 3IOWA 5AE4A 1B3EA 3A09A 4I1DA 1Q1KA 5DVFA 4KYDA 5I58B 1I6BA 5AA2D 3C31A 2Y7RA 1QULA 2XXTA 4OFOA 3UP9A 4DCYA 3T66A 4NMYA 1XVXA 1TT1A 3QUJA 2A5TB 5L9SA 3PU5A 4LZ7A 3V89B 4QSEA 4X48A 1UQWA 3BFTA 3DP6A 4IGRA 4GFRA 4GLIA 4F22A 4OWDA 2HQ0A 2DWIA 1R1NA 5A5XB 2VD2A 1DPEA 5HM4B 1LSTA 3H6UA 2R6GE 1BTJA 3G3KA 4R9GA 4QF9A 1D9YA 2F7BA 3SEVA 3CVGA 1MRPA 3FASA 1SBPA 3EHSA 1H43A 3GLBA 3BKIB 4Q30B 1URDA 4F3SA 3IX1A 3T9UA 5KDTA 4HS7A 1VFDA 2I4BA 2NWJA 3FXQA 3MAMA 3TPAA 3UN6A 4LONB 2OJTA 1B6HA 1R6ZA 5EHSA 4IGTA 1IXGA 1MXZA 3KJ7A 1SQYA 4L17A 2ZNSA 1NNFA 2DWHA 4NF6A 4M4GA 1B52A 4XXUA 3CRBA 4ZZAA 1VFEA 4AQ4A 3MW0A 2V3TA 5ICTA 2RKMA 4R75A 1J1NA 1L5TA 3PMWA 5F7VA 2RCAA 1ZBMA 4NF8B 1UTHB 4ELOA 5H8FB 3KN8A 5H8HA 2WKYA 3A3CA 4HCWA 1PBQA 4H8JA 1TXFA 4LZ8A 4JDFA 3V83A 1SW2A 4ZECA 4ONYA 1LB8A 3I5OA 1MPCA 1JEUA 1LCTA 1I6AA 4UA8A 4QRZA 3MVYA 1JVXA 3M3FA 4ZEIA 1ZKBA 1B4ZA 1IXHA 4RJZA 1QW0A 4OFLA 1UIVA 3C34A 1M5FA 2M8CA 1NNPA 4MH5A 2XXHA 3A3UA 3C32A 2DXYA 2QS3A 2D21A 4U22A 4F1VA 1A8FA 1N3WA 3K00A 3O66A 3SEXA 3OO6A 1XC1A 1B58A 1TFDA 1KWHA 2A5SA 4YICA 2HZKA 4OENA 4KFQA 1PB8A 5EYFA 2O51A 2QJEA 2E1SA 4R9FA 2GRVA 4O3BA 4ELQA 4GL8A 3OENA 2HAUA 4IB2A 3E4RA 2DYXA 4IO7A 3ZSFA 1WODA 3K6UA 4YMAA 3O9PA 1T0KA 1ANFA 1OQHA 5AA1A 1MDP1 1JNFA 2H98A 2ZYNA 1BLFA 3CFXA 4JSOA 3HV1A 2R9JA 4Q5TA 5CC2A 1GGGA 5FHNA 1II5A 4G8NA 2VOZA 4EDPA 1YCJA 1BP5A 3S4UA 3UORA 1P1UA 3K2DA 3TQLA 3TTRA 3TEPA 1QKAA 3JYRA 1B9JA 3LR1A 1WDNA 1XOCA 1XS5A 3C35A 3K1NA 4YB7A 5EHMA 3G3JA 5TPAB 4FATA 1Y9UA 4G2ZA 3E13X 4U2RA 1B1HA 4U1OA 1UTBB 2O1LA 5IAIA 4P11A 3VVDA 1MY4A 1FQAA 3S9LC 1SI1A 4RK2A 2A5TA 2H4IA 3WAEA 4GL0A 1XVYA 3OMBA 3TMGA 2OWTA 3CSBA 4OEVA 2NVUB 2F6GA 3LSXA 1AL3A 2HAVA 1F9BA 3VXCA 1USYH 2V25A 4OZ9A 3H3GA 1GTKA 2HCAA 4TLMB 3C36A 3G3IA 3OEKA 3ILTB 1LBCA 1A40A 3T96B 3ODBA 2XHDA 4G8MA 4LA9A 5JTYB 1ATGA 3TTMA 3IAZA 4PP0A 4WEDA 2W7YA 4LQ2A 2BJJX 5H8NA 2XD2A 2E0SA 1WVJA 4X1BA 4NWDA 1ELJA 1LB9A 4F1YA 1PC3A 3MQ9A 5CM6A 4RXLA 1I6QA 2ANJA 2RF1A 4JWOA 3D4CA 2OWSA 3IL1B 3MVWA 4LZ5A 1YPNA 2UVGA 2ABHA 2NOOA 4KQPA 1N04A 3UIFA 1LFHA 3W9WA 3K6WA 3FIRA 5AA2A 1N7XA 3DP4A 4FECA 5K2YA 2FA7A 4OERA 3SEUA 4YAHX 4XKQA 4NF8A 4F19A 1QUJA 2F7AA 1UTHA 5H8FA 2AL4A 4NE4A 2GHAA 3K0VA 1Y20A 2DE3A 4R2FA 4M1VA 4EUOA 4MBPA 4EF1A 5TP9B 2G93A 2F78A 4HW8A 5ITOA 1LGBC 2G29A 1OQGA 2UVHA 4OYVA 4E0WA 1H3DA 3MZBA 2UYEA 3M8UA 2F7CA 1M5DA 3OD7A 4JWXA 4RK9A 3SEWA 3V8XB 4BLAA 4U4XA 1B7UA 4BDRA 4ZEDA 5I2KB 4QFPA 4THIA 1P99A 3RGYA 4ELRA 1B7ZA 1FTMA 1URGA 4ESWA 1JW1A 2D5WA 3H6VA 4R6KA 2ZNUA 4YMBA 2UVJA 2B3FA 1MQJA 1BIYA 3KOSA 2F97A 2PBWA 5JEIA 2F5XA 3OSQA 4IO6A 3CI8A 3B6QA 3O29A 1B0HA 3CR9A 3MVXA 1O63A 5L9MA 3VFJA 2PMSA 5DTBA 3S9MC 3K6VA 3O97A 4NTLA 1LAFE 5L9OA 1ZMGA 3GBAA 3VXBA 4GF8A 4X1DA 5I59B 1B3GA 3M3KA 2VGQA 3CG1A 5FTIA 4GD5A 4TOZA 5CMKA 1DTGA 4IO2A 4RA1A 4IO5A 5HPQA 4P0IA 3BBRA 3S2VA 4E0XA 4NEDA 2PYYA 1N76A 2ZYKA 3K1PA 2F8DA 1Z7NE 1IZ1A 2B65A 3OXNA 2V84A 1PB9A 1B5IA 5I56A 2YLNA 3I3VA 3QYTA 5BWJA 1POTA 3LSWA 4RY1A 2Z22A 3O6GA 3IJOB 2YPNA 3FJGA 3MP8A 3H6TA 1EZPA 2O84X 2Y7PA 1R9LA 2DP8A 2ONKE 3H03A 2P2AA 3N6UA 4XKPA 2FNCA 2F35A 1LCFA 4MF3A 3N94A 2PT2A 4KR5A 4YKIA 1FW0A 5I2NB 2GH9A 4GQOA 3TDJA 2PVUA 4YB6A 4FAJA 5TU0A 1OLCA 1A8EA 1GVCA 4IO4A 4LUBA 4NF5B 1ZLQA 4KD5A 3T93B 3KSXA 3HHFA 3IO4A 4ZS9A 3RT6B 3TCFA 5DEXA 2V3QA 1B3FA 1EH3A 4C0RA 3FVKA 2IEEA 4EQ9A 1US4A 3IOTA 1OVBA 1MDQA 3PPRA 4KCDA 2LAOA 4RNSA 5CMCA 4Z7EA 4DCXA 4P0GA 3TFLA 4MFIA 2YJPA 1ZTYA 5I57A 3MP1A 3B6TA 3KBRA 4DZ1A 1SD3A 5H8QA 3ZS6A 2QRYA 1FQCA 4GVOA 3P7IA 3C4MA 4DLDA 3JV9A 1D9VA 1LBBA 3HHGA 2HXWA 3MP6A 4G68A 4H5FA 4JWYA 1NNTA 3VLWA 3EN3A 1Y1ZA 3TTKA 4MLVA 3ZKKA 1TFAA 3PUXE 4I62A 3G7WA 2H25A 2Y7KA 4ESXA 3FATA 3ILUB 5ICQA 5TP9A 4I9DA 3SETA 3TZAA 1MY3A 1MM7A 1LAXA 3FJ7A 3TODA 3PPOA 3VLUA 1FCKA 3RY3A 3MWBA 3B7DA 1USYE 3FV2A 2VP1A 4F3PA 4NF4B 2DOJA 3E3KA 1DSNA 1JW4A 1H76A 4R2BA 2HEUA 4H8IA 4EQ7A 2AIXA 1IIWA 4FJPA 3PMXA 4OETA 4XKRA 3KN7A 1AOVA 3FVNA 2OZZA 1MG1A 3AXFA 3ONMA 2F6PA 3OOAA 3K6XA 4PFUA 3U92A 4PE5B 3TTNA 4ECFA 1AH5A 3L6GA 5ITPA 1IXIA 3O6HA 3TYHA 4ZE9A 3UK4A 3N5LA 1N3XA 2CMOA 3QUFA 3TCHA 4R72A 2XXWA 2Q89A 2I3WA 4DE8A 1P1QA 1FTJA 3DP8A 1B4HA 2HFBA 3T9VA 2XXIA 1SDXA 3PV0E 1YTVA 4H65A 5I58A 3EQ1A 3H7MA 5I59A 1A99A 1ZJLA 4AB5A 4O3CA 1PB7A 2P0SA 5BUUA 1JVYA 3PPNA 2XXUA 1ZIUA 4ELPA 1NL5A 3H06B 2QMWA 3K4UA 1B05A 2DWJA 4EF2A 1RYXA 2REGA 2O69A 4X9TA 5A5XA 3HN0A 3SERA 3D4GA 3OSRA 3TQWA 4BDNA 3LSFB 3O6IA 4OQOA 5KDTB 1I69A 4F2QA 5J1DA 1N0TA 2QMXA 3U72A 1MPDA 2VHAA 3FXUA 4F3BA 2Y84A 4BDLA 3TELA 3THIA 3R6UA 1URSA 1US5A 1D4NA 3LBSA 4PETA 3PUZE 4ZEKA 5I84A 3K02A 4NF6B 3CG3A 4G77A 1QVSA 3L6HA 4DIGA 5DVJA 4FEBA 4KCCA 1A54A 1SW4A 2QPQA 1IITA 1NH7A 3PGFA 3DELB 4FIMA 3RPWA 3VVEA 4YU0A 4LP2B 3H6WA 3RTFB 1S50A 3W9VA 5FTHA 3OO8A 4OMBA 3OO7A 4F29A 1SVXB 4GIZA 4KHZE 5H8HB 4LQ5A 4RPOA 4OEUA 2PT1A 2RC9A 2PX1A 4Q0CA 4KYSA 3F11A 3FUZA 4IY5A 1FQDA 4ZEFA 3MPKA 2Q2CA 1JW5A 1B32A 2XXRA 5HBCA 3EHTA 2I3VA 4MLQA 2ZYMA 1OLAA 4BDOA 1B0LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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