2V25A

Structure of the campylobacter jejuni antigen peb1a, an aspartate and glutamate receptor with bound aspartate
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
231
structure length
231
Chain Sequence
GKLESIKSKGQLIVGVKNDVPHYALLDQATGEIKGFEVDVAKLLAKSILGDDKKIKLVAVNAKTRGPLLDNGSVDAVIATFTITPERKRIYNFSEPYYQDAIGLLVLKEKKYKSLADMKGANIGVAQAATTKKAIGEAAKKIGIDVKFSEFPDYPSIKAALDAKRVDAFSVDKSILLGYVDDKSEILPDSFEPQSYGIVTKKDDPAFAKYVDDFVKEHKNEIDALAKKWGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords MAJOR CELL-BINDING FACTOR
publication title A Bacterial Virulence Factor with a Dual Role as an Adhesin and a Solute Binding-Protein: The Crystal Structure at 1.5 A Resolution of the Peb1A Protein from the Food-Borne Human Pathogen Campylobacter Jejuni
pubmed doi rcsb
source organism Campylobacter jejuni
molecule tags Receptor
total genus 79
structure length 231
sequence length 231
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-06-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2v25A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2v25A02
4OETA 4GLIA 1POY1 1P1OA 2F6PA 2ABHA 4ZEBA 2XXPA 3CSGA 3K02A 3IOTA 3MBPA 4GOTA 1DOTA 3KN8A 4U2RA 3PUXE 3TPAA 3EN3A 3DP4A 1N84A 3A3UA 5I58B 1TFDA 3OMBA 1SQYA 1LB9A 4XKRA 2CZLA 2F7BA 1DTZA 5KDTB 3FGSA 4R6HA 3T22A 4YZZA 1FTLA 3FJGA 1AH5A 4OQOA 1QULA 4JWOA 4RK2A 3K4UA 1JW1A 3SEYA 2DE2A 1SDXA 3LSWA 1QKBA 1SW4A 4F1VA 3T9UA 3KOTA 4R9GA 3Q27A 1PBQA 1MM6A 2XD2A 3BFTA 1MPBA 5JEIA 3VXCA 2XHDA 2I49A 4RK9A 3Q28A 3U92A 2I3VA 3EF7A 1IZ1A 3AXFA 4EF2A 1URSA 3K0VA 2KLFA 1OIBA 1I6BA 4G68A 3M8UA 4WEDA 2F5XA 5B70A 2UXAA 2RCAA 3MWBA 4NEDA 2I4CA 3IX1A 4BDLA 4XXUA 1DMBA 4KCCA 1XC1A 3TDJA 3H4ZA 4KYSA 1SW5A 1B52A 4RPNA 3E9XA 3PUWE 4QHQA 2I48A 3C33A 1MDP1 4XTCQ 1QUIA 4DXCA 2F35A 1B3HA 2DWJA 3QK6A 5DEXA 3K1NA 2ONRA 1F9BA 2XX7A 3B6QA 4G8HA 4M1VA 1JEVA 1MPDA 2V3QA 1PB8A 1FQBA 2DWIA 4YKKA 2I0BA 4OTEA 3IO6A 3JYRA 4RA1A 2H5YA 4EUOA 1B40A 1AL3A 1JVXA 2OCUA 2DWAA 2B3BA 4F19A 5LOMA 3TQLA 4OESA 1XVYA 4G68C 3QUFA 2G29A 3IORA 3EQ1A 4NF5A 2XD3A 2RC7A 4X1BA 3CIJA 3LSXA 2O7IA 2GRVA 4KHZE 4N13A 4IGTA 4E0XA 3LSFB 1PDAA 4R6YA 5K2XA 4ESXA 3PPQA 3O29A 1ZU0A 2FNCA 4MBPA 3OD7A 5H8SA 4GVOA 3IOUA 3N26A 5BWJA 1H44A 3O6GA 4C1TA 4UACA 4HS7A 3CSBA 1O64A 3VE1B 3PU5A 1YAEA 4NWDA 4WEPA 1EZPA 3MAMA 5CMMA 3CRBA 1B3FA 4X1DA 4U23A 3DP8A 1YPNA 3PMWA 1OQGA 4L17A 4YAHX 5L9MA 4I8CA 4MLQA 2AIXA 5DTBA 3ZKKA 2ZXTA 2PMSA 4G2ZA 2HAVA 4YICA 3CR9A 1BLFA 4Q8RA 3TCHA 4Q5TA 3MQ9A 3LBSA 4GFRA 4FECA 2ZYMA 2IEEA 4IO5A 1Q1KA 3K2DA 1IITA 3HO7A 3KEIA 3GBAA 4ZEDA 4R2BA 3OOAA 1MY0A 1SVXB 5I58A 1R9LA 3BKIB 5H8FA 3KZGA 3ZS6A 4POXA 2XXRA 4G77A 1LAFE 3TUSA 1ZIUA 5TP9A 3QIMA 3UK4A 3D4CA 4ZZAA 2XXIA 4GXAA 4XKNA 1OVBA 2OLBA 1NNFA 2ANJA 1Q35A 4KYDA 2XXTA 3PPRA 4DIGA 4R2FA 2QJEA 1GV8A 3TAJA 3THIA 4THIA 3HV1A 2YLNA 3KSJA 2H98A 1URDA 4RY1A 2I0CA 2I4BA 1D9YA 1O63A 3QSLA 2Q9TA 1SBPA 4FJPA 1M5BA 3U72A 3EHSA 5A5XB 2V3UA 3C4MA 2ZYNA 4YMBA 1B1XA 3UIFA 3USDA 1MXUA 4NF8A 2Q8JA 1EZOA 1QVSA 3KJ7A 3PPNA 2AYSA 3M3FA 4F31B 1Y3NA 1N0TA 1Z7NE 4H5GA 5I57B 1HSEA 4X48A 3RY3A 1MDQA 4WKMA 3TELA 3IB1A 1Y3QA 4BDQA 1N04A 1T0KA 1S50A 2DVZA 3O6IA 2VGQA 1XHYA 4YB5A 1MY4A 2IA4A 4ISUA 5ITOA 3MVXA 2Y7PA 4GL8A 2OWSA 1A40A 1MQHA 1UTBB 3ECRA 4P0IA 1GVCA 1J1NA 5CMBA 3C32A 1LAGE 3CG3A 2M8CA 2GFEA 1PBPA 3G3HA 1JEUA 2OBGA 3K6UA 4OXVA 3IL1B 1BP5A 3FZVA 3FV1A 4OMBA 1JVYA 2B65A 2REJA 2ZYKA 5M2VA 1IXGA 1DSNA 1M5FA 4OEUA 5JK4A 2ZNUA 2Y7IA 1AOVA 4KCDA 5EHMA 1Z7ME 3PD8A 3VLVA 4MH5A 3CG1A 3B6TA 4G8NA 1QKAA 4LP2B 2R6GE 3FXRA 1S7YA 2B3FA 4ZEFA 3Q26A 1CB6A 3W9WA 2A5SA 1B7ZA 1LBCA 4OFOA 2HAUA 3T66A 5I56A 5DT6A 4JWYA 1NKXA 4PP0A 3VVEA 2R9JA 5L9SA 2VP1A 5AA2A 2V84A 3S2VA 3VVDA 4DZ1A 3Q25A 3RT8A 3IB2A 1D4NA 4KR5A 3TODA 2O1MA 3V8XB 4TLLB 2ONKE 4F18A 1NL5A 1IXCA 3T9XB 1EH3A 4R9FA 2V25A 4ECFA 2W7YA 3RUMA 3U1OA 2Z8EA 2WKYA 3IO4A 1GTKA 2F97A 3ZKLA 3UORA 5CBSA 4MLVA 3MP6A 4TQUQ 1I6AA 4PFYA 4H67A 1NMUA 4G4PA 3GXAA 4YB6A 2UVJA 1IEJA 2DS9A 3HHFA 4HCWA 4H8IA 5JTYB 3G3JA 4O3BA 3EHUA 4FEBA 3K6XA 2FA7A 4ZE9A 3EPEA 4QFOA 1B5JA 2ZNSA 1P1WA 4F2OA 2DE4A 4E0WA 4NTLA 2XXUA 4LVQA 3T9VA 3HN0A 1Y4CA 3VV5A 5AA4B 3OO8A 1LSTA 1PB7A 2I3WA 1MS7A 2PT2A 3K6VA 4IB2A 3DP6A 3HSTA 4U4XA 2Z8FA 3SEUA 3VDFA 2X7PA 5F7VA 1EZ9A 1XT8A 3U94A 1SI0A 2UYFA 2ZMBA 1SW2A 1II5A 3N5LA 3KFMA 4NF4A 1B51A 1DPEA 2Q2CA 3L6HA 4WXJA 5EHSA 5AA2D 1OMPA 3M3LA 3MVWA 3K01A 4QSEA 2F78A 2F34A 3SKPA 2NUVA 3FATA 3MVYA 4RXLA 5H8QB 2BJJX 5H8HB 4YKJA 3BBRA 4KYEA 4BDRA 4F3PA 1MRPA 1UQWA 3B6WA 3L6GA 5I57A 2D21A 3FJ7A 3KG2A 5ISUA 5CRYA 3UN6A 3O28A 4YMAA 5KCJA 2GHBA 4ZS9A 1D9VA 2XXQA 3LR1A 1MQJA 3F11A 3PV0E 2QS2A 2FYIA 1FCKA 4AB6A 2Q88A 1IXIA 5DVIA 1UIUA 4BDNA 2F7AA 2O84X 3ILTB 4AB5A 3OO9A 3TTRA 4H8JA 1UTHA 2A5TB 1UTBA 3RNNA 4U22A 1KWHA 1MQGA 3ILUB 3A3CA 4H65A 3OXNA 2XXXA 3KSXA 2QS1A 3KBRA 3G3IA 1XVXA 1N7WA 2ESNA 4NF6A 2PT1A 3A09A 1S9TA 4LZ8A 4PFTA 4LZ5A 4XKQA 2Y7RA 2UYEA 3RN8A 2AL5A 2PYYA 4QFKA 1LFHA 4F2QA 2RC8A 4U4SA 2H99A 5H8NA 1H45A 3VVFA 2XXYA 4C0RA 4JSOA 4JDFA 1N3WA 1A54A 3R6UA 3I6VA 4GXSB 4DLDA 2AL4A 4JXIA 3JZJA 4N07A 4EQ7A 2ZYOA 5I2KA 2DQVA 1LAHE 4IGRA 3W9VA 2E0SA 1A7LA 1SW1A 1BKAA 3IOVA 3IOWA 4O3AA 5DYHA 4LUBA 2O1LA 3GBBA 3SESA 5DVFA 4OWDA 1LFIA 2QL3A 3MW0A 4QRZA 4F3BA 1RYXA 3TTMA 5EYFA 3CFLA 1B2HA 2HXWA 3GZGA 3QUJA 5KDTA 1USYH 2OK2A 1Y1MA 3TCFA 3U8QA 2O68A 2F8DA 1UIVA 2XXVA 4OVJA 3KJTA 1LCTA 1B5IA 3TEPA 3G3GA 1YTVA 3FJMA 1NNTA 3FD3A 1MXWA 4KQPA 4FEDA 4QSDA 1N3XA 4DXBA 4OFLA 2I58A 3M3KA 1XOCA 1FTJA 1IUDA 2D5WA 5CMCA 4JWXA 3CFXA 1AIVA 1B58A 3EHTA 3CVGA 1B3LA 1FQAA 1QJMA 4UA8A 3OEKA 1IIWA 4RJZA 4NE4A 3VLUA 2DOJA 1QUKA 3P7IA 4IO3A 1ATGA 4PFWA 1MXXA 3SEVA 1OLAA 4QF9A 3JV9A 2DVCA 4EF1A 3GLBA 4IO2A 3TMGA 3PUVE 5DEXB 4H6DA 4AQ4A 1EU8A 3MP8A 2Y84A 3QXMA 3Q29A 2OJTA 1B7HA 4OERA 3FVOA 1SD3A 2UVIA 1GR2A 3DM0A 2THIA 2H9BA 2R71A 1RYOA 5AA4A 4KFQA 3KN7A 4BDOA 5FHNA 1RKMA 3E4RA 3UP9A 4OHNA 2X7QA 3N6TA 2DYXA 2G93A 1LGBC 5HM4B 4H1XA 1MY2A 1POTA 2GH9A 5CM6A 1YCJA 4I62A 4GL0A 1LAXA 2HQ0A 3IAZA 3PMXA 4LONB 1A99A 5CMKA 3I5OA 5ELVA 4IO4A 3MZ1A 2XX9A 5K2YA 4GWOA 2HEUA 1OVTA 3TFLA 2Y7KA 2Y7WA 3SEWA 1Y20A 3MUQA 3VXBA 2RC9A 1IQ7A 4LQ2A 3SDFA 2VOZA 4JBZA 1NNPA 3K6WA 1JW5A 2DP8A 2DSFA 4Z7EA 3G7WA 3FV2A 1MH4A 3H7MA 1I69A 3MJNA 1MG1A 1P1UA 4LATA 4ZDMA 1QW0A 1MY3A 3MP1A 4RNSA 1QUJA 2A5TA 1IXHA 3R26A 4YB7A 2XXHA 3OEMA 4EDPA 3FVNA 3S9NC 5I59B 4F1YA 4QFLA 4FAJA 4ELOA 2QMXA 4RPOA 4FATA 1WDNA 4POWA 2QMWA 2NXOA 5ICTA 4DDDA 2LAOA 3WAFA 1NNKA 4EQBA 3C34A 3TTKA 4R72A 1VR5A 1ZKBA 1TXFA 1TWYA 1R1NA 1ZLQA 3VFJA 1MH3A 4G8MA 1HSJA 3DLNA 5CC2A 3VLWA 1B3EA 3S9MC 1BIYA 1JQFA 3H6UA 3FIRA 3PUYE 4U1ZA 3S9LC 1BTJA 3OSRA 2RKMA 3K1PA 3O2AA 1B05A 1VFEA 5H8FB 4OENA 5TPAB 3HCQA 3C31A 5TP9B 2H4IA 1B32A 5IAIA 1MXZA 2RCBA 3C36A 1R9QA 1N76A 4JB7A 1B4HA 4YU0A 4K3FA 1M5EA 1AMFA 2GHAA 2Z8DA 3WAEA 5B7DA 1B9JA 4PQJA 2REGA 3QAXA 1B4ZA 4GF8A 3C9HA 1Y3PA 3SETA 1OLCA 1Y9UA 2ALUA 2VD3A 4MF3A 3H6VA 4EQ9A 2HZKA 1MY1A 3E3KA 4I1DA 4RYAA 1NH8A 4DXUA 3MC2A 4NF8B 3TCGA 4R73A 5I2NB 4Q30B 5FHOA 3KGCA 5ICQA 2UVGA 4ZEIA 3PPPA 1LB8A 3OSQA 4KD5A 1LCFA 4DE8A 1LFGA 1US4A 2RINA 3RLFE 1NFTA 3RQTA 1PB9A 1ELJA 4ZEKA 2P1SA 4IY5A 5A5XA 2VHAA 3IJXB 1FQDA 4JSDA 1ZTYA 3S4UA 3OO6A 4BLAA 1FQFA 1P1QA 1B3GA 4R74A 1MQDA 3RTWB 3PMVA 3KN3A 4HW8A 3FVGA 2HZLA 2P0SA 3OENA 4FE8A 4C1UA 3MVZA 3H06B 2V93A 1M5DA 4HTGA 4M4GA 1HSLA 4IO7A 5FTIA 2YJPA 2QS3A 2RF1A 4GD5A 1FTMA 3T9HB 4EXKA 1TFAA 1URGA 3FASA 4NMYA 3N94A 3R7XA 5KZTA 2Q89A 4P0GA 4F29A 1B5HA 4ONYA 3G3FA 4P11A 2DE3A 2UVHA 2VD2A 3LUYA 3IR1A 4TOZA 3G3KA 4F3GA 2O7UA 4NWCA 1GGGA 3SEXA 3OELA 5AA1A 1B46A 5I56B 4ZECA 2NWJA 3PGFA 5FHMA 4IY6A 2V3TA 3PD9A 1P1NA 5AA2B 4R75A 1B0HA 1MXYA 1I6QA 4MFIA 4PETA 3DELB 4ELQA 2H25A 2QPQA 1H76A 3OO7A 1JETA 1US5A 4Z0IA 4PFUA 1DPPA 1VSOA 3N6UA 1SYHA 3E13X 1O7TA 4BDMA 4ND9A 2OWTA 3HPIA 4OYVA 5I59A 1USYE 1NH7A 1VFDA 4X9TA 4F22A 3T93B 1LLSA 1TT1A 1B7UA 3MZBA 3S9EA 4ZE8A 1PC3A 2O69A 1A55A 1OQHA 1R6ZA 4R6KA 2HFBA 2P2AA 1JW4A 1LBBA 3O97A 1XS5A 1Y1ZA 2NOOA 5HPQA 3ZSFA 2Z23A 2X26A 3H6TA 3TTLA 2D3IA 3TKDA 1FQCA 3O66A 4H0WA 3TQWA 5CBRA 1FW0A 4G68B 5L8DA 5IKBA 4QFNA 3W15C 1ZMGA 2PBWA 3D4GA 4LA9A 1Y4TA 3K1MA 1A8FA 5TPAA 4XKPA 5FTHA 2Z22A 2F7CA 4EXLA 4Q0CA 3B7DA 5J1DA 5I84A 1M5CA 2ZNTA 2F36A 3CI8A 4GQOA 3LC8A 5JTYA 4I9DA 2XX8A 3FVKA 4KI0E 2HCAA 4OZ9A 1PEBA 3V83A 3UGWA 3PPOA 3C35A 4NF4B 3RPWA 5ITPA 3H03A 1WODA 2QRYA 4F39A 2DWHA 1SYIA 1WVJA 4ELPA 1JNFA 4N6PA 1ANFA 5DVJA 3UA8A 4F1UA 4LQ5A 1P99A 1MXVA 4XIGQ 4DCXA 4O3CA 4IO6A 3RT6B 5L9OA 1FTKA 3BFUA 2ONSA 5I2NA 3PUZE 3FXQA 2O6AA 4QFPA 3TZAA 3IK6B 3FXUA 2F6GA 3TYHA 1B6HA 4QSCA 1L5TA 1B1HA 2OZZA 3ODBA 1CE2A 3RTFB 5F1QA 4ESWA 5KCJB 2QS4A 3O9PA 1MM7A 4GRKA 4YKPA 2YPNA 3V5AA 2Q2AA 3SERA 4FIMA 2E1SA 3I3VA 1FQEA 4NF5B 3FUZA 4YKIA 2O51A 5H8QA 3U93A 3O6HA 3T96B 3KOSA 2CMOA 2DXYA 5H8HA 1FTOA 1MQIA 1UTHB 4HCYA 1H43A 3QYTA 4DCYA 3CFZA 4H5FA 3H6WA 4NF6B 1MPCA 2QSXA 3ONMA 5AA3A 2DXRA 3V89B 1DTGA 4GIZA 3RGYA 4ELRA 4PE5B 4ZZEA 3LSLA 2NVUB 1ZJLA 1SI1A 4FORA 1ZBMA 1H3DA 3H3GA 1D3KA 4OEVA 4TLMB 5H8NB 4F3SA 4OFJA 3IJOB 3TTNA 5CI5A 1VE4A 3IB0A 5HBCA 5AE4A 3MZ9A 5I2KB 3HHGA 4U21A 4KPTA 3MPLA 2I6EA 3K00A 4U1OA 1N7XA 1A8EA 2XXWA 5BUUA 2PX1A 4LZ7A 5TU0A 1B0LA 2PVUA 3MPKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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