4G2ZA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with mefenamic acid at 1.90 a resolution
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords Lactotransferrin
publication title Crystal Structure of C-lobe of Bovine lactoferrin Complexed with Mefenamic acid at 1.90 A Resolution
rcsb
molecule tags Metal binding protein
total genus 117
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2012-07-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4g2zA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4g2zA02
1B4HA 3ILUB 1US4A 3EHTA 2XXXA 2WKYA 4YKKA 2B3BA 2PBWA 3K6VA 4NMYA 2DXRA 3EQ1A 2OJTA 2YJPA 2Y7RA 1IXHA 2UYFA 2D21A 5ITOA 1URGA 3T9VA 1LB8A 3OSRA 4R72A 3QYTA 5I56B 5FHNA 1EZOA 4YMAA 2Q2CA 4UACA 3MZBA 5DYHA 3L6HA 3FV2A 1DTZA 2O51A 4F19A 1H45A 4OFOA 2AYSA 4NF4B 1CE2A 3VLUA 1SYHA 4QRZA 2R6GE 1PC3A 2HZLA 4FE8A 5AA2D 4XKPA 2ZYMA 4EF1A 2VHAA 4OYVA 3PUYE 1IUDA 2GFEA 2QMWA 3G3IA 1HSJA 2DWHA 1NL5A 4FEDA 4H5FA 3MUQA 3N6UA 5K2XA 3IORA 5I84A 4OFJA 2I3VA 1SQYA 1ZTYA 3CI8A 1ATGA 3KOTA 3K2DA 1USYH 2X7PA 3C35A 2V3UA 2YPNA 1M5CA 1OLAA 3C33A 4QF9A 3I6VA 4U2RA 1N04A 4ELQA 4XKRA 1XT8A 3IO4A 5AA2B 2HCAA 4U1ZA 1Y20A 3EPEA 1FTLA 3GLBA 4GL0A 2F78A 1MXWA 3WAFA 1F9BA 3OO7A 3IB0A 3K0VA 3IAZA 2P2AA 1JVXA 4ZEKA 1QKBA 1LAHE 3UN6A 4RXLA 4PFYA 5FTIA 4DE8A 2NWJA 5JEIA 2F7AA 2XXWA 3RN8A 2AIXA 1XHYA 2DXYA 4ZDMA 4YMBA 3PPOA 3RUMA 2Q9TA 4E0XA 2F34A 3B6TA 3OXNA 3EF7A 1I6BA 4ISUA 1TT1A 3MQ9A 2XXYA 3LR1A 1B1HA 2O7IA 1LFHA 2VD3A 3T93B 5I58B 1ZMGA 1NH8A 1LBCA 5CI5A 1QUIA 4OWDA 2VD2A 2RCAA 1N3XA 3O6GA 3G3FA 3RY3A 4JB7A 4HS7A 4QFKA 3T9UA 1IZ1A 4YU0A 5I2KB 4NEDA 5I2NA 5H8FB 3BFUA 1I6QA 2G29A 5TP9B 3HO7A 1FQAA 4FJPA 1EU8A 1B5HA 2ZYOA 1MPBA 3SKPA 1ANFA 2VGQA 3N26A 1NH7A 4ESWA 4YB7A 4FIMA 3PU5A 5H8HB 4H65A 4Q0CA 2IA4A 5ELVA 3ZSFA 4BDRA 4GVOA 3CVGA 3FXQA 3SEUA 4GXSB 4P11A 2P0SA 4RY1A 1D9YA 4TLLB 2I4BA 3C36A 4QFNA 3SEYA 2QSXA 5AE4A 3FUZA 1KWHA 2Z8EA 1B32A 4JWOA 3THIA 3K01A 1ELJA 3KJTA 2Z23A 2Z22A 4BDNA 1B52A 1N84A 1H76A 1A8FA 5A5XA 4NF5B 3EHSA 2Q88A 4AQ4A 4POWA 3KGCA 1II5A 2I48A 3FGSA 1MDP1 3GXAA 3ONMA 1MY4A 3IJOB 4N07A 1MXUA 2DWIA 3V89B 5DTBA 1MY3A 4ZE8A 3FV1A 3KBRA 2V3TA 1OLCA 5EHMA 3TODA 3VVEA 3VDFA 1SW4A 3H06B 2F6GA 3R6UA 1SW2A 3LSLA 3OO9A 4EQ7A 1FQEA 4ZZAA 4AB5A 1P1NA 2LAOA 4RYAA 4LQ2A 4O3AA 3FATA 3CFXA 3D4GA 4U23A 5CMKA 1UTHA 4OENA 3VXBA 1A8EA 1XS5A 1DSNA 4QFLA 4KYEA 3FD3A 1TFAA 3OELA 1Y4TA 4LZ8A 5DVJA 3QAXA 1BTJA 3K1PA 2NOOA 3C32A 1DPEA 2PT1A 2RKMA 1XOCA 4OERA 4RNSA 3O66A 1LAXA 2BJJX 3TTNA 3C4MA 3RPWA 3VV5A 2FYIA 2GH9A 3UGWA 1OMPA 1S7YA 4H6DA 3TEPA 4HTGA 4YKPA 4GXAA 3JYRA 1B7HA 2HAUA 4KQPA 2V84A 2H25A 3VVDA 2XXIA 5H8QA 5EYFA 3PD8A 3EHUA 4F1UA 5I56A 2XX9A 5ISUA 3LSFB 4NWCA 4KHZE 2DWAA 2UVJA 3TZAA 2F6PA 2Y7WA 1EH3A 2DSFA 1SYIA 3MVXA 1P1OA 2KLFA 4Q5TA 3VLWA 3PMXA 1B7ZA 5TPAA 4NF4A 3R7XA 4QFPA 4FORA 3DP6A 5F7VA 2DE2A 2IEEA 1PB9A 2O69A 3CR9A 4DLDA 3O2AA 3I3VA 4NE4A 1B7UA 3Q27A 3O29A 3OSQA 4ESXA 1MXYA 3O28A 3H3GA 3OEKA 3MZ9A 3HN0A 2A5SA 4ELOA 2O6AA 1MXVA 3IOTA 3N94A 5DT6A 3HHFA 5KCJB 2ZMBA 3ODBA 4LUBA 4YKIA 3PPNA 4N6PA 4F22A 2OK2A 3QUFA 2OWTA 1M5EA 3KN8A 3HHGA 4ECFA 4X9TA 1YAEA 3RNNA 3OEMA 5I59B 2O84X 4Q30B 2XX8A 1A54A 4MLQA 1MQJA 4IO3A 5CMMA 1IITA 1R1NA 2GHAA 5BWJA 2F35A 4BLAA 2QPQA 1TWYA 3TDJA 2UVHA 1GTKA 3RTWB 4PFTA 1ZIUA 5TU0A 4LVQA 1FCKA 3T66A 1D3KA 1FTKA 3DP4A 1HSEA 3DM0A 1UTBB 1RYXA 1JVYA 2HFBA 4IGTA 4ZEIA 3IB2A 1JW4A 3P7IA 4OEVA 4XXUA 3DP8A 4GLIA 4JWYA 4U22A 1FW0A 1A7LA 1OQHA 1Y4CA 5FTHA 4IY6A 4GIZA 4RA1A 1BLFA 3ZS6A 1URSA 4H67A 1B3HA 4U21A 1BP5A 3FJMA 3C34A 1LAFE 3PD9A 3RQTA 4X1DA 5I2KA 3SEWA 5H8FA 4FATA 2OZZA 5L8DA 3WAEA 3U92A 3OENA 3CSBA 4EXKA 2DS9A 3OO6A 4YB6A 5TP9A 5KZTA 5I57B 3S9NC 3MPKA 3K1MA 3PUXE 3M3LA 5H8HA 1I6AA 4G68C 3O9PA 4NTLA 5AA1A 4MH5A 3EN3A 1FQBA 3IR1A 3R26A 5AA3A 1SD3A 3G3GA 3PPPA 3TAJA 5AA4B 1CB6A 3VE1B 4IO4A 4YKJA 3QIMA 4DXCA 4RPNA 3C9HA 1P1UA 3O6IA 2Y7KA 2A5TB 4X1BA 3FVKA 4GWOA 4F3PA 1RKMA 2FA7A 2QL3A 4NF5A 1DMBA 1MG1A 3I5OA 1GGGA 3Q26A 3MVZA 4XIGQ 3V83A 2O68A 4M1VA 3CIJA 2ESNA 2O1MA 1JQFA 4FEBA 3UORA 4RK2A 1N3WA 4OTEA 5L9SA 3MWBA 3K6WA 3T22A 2GRVA 3FXUA 3TTLA 2D3IA 2R9JA 2XXUA 1NNTA 4BDOA 3MP8A 2UVGA 4F31B 3UP9A 3IB1A 4G4PA 5HM4B 1PB8A 3PV0E 1QVSA 3TTRA 2DE4A 2F5XA 3BKIB 2CMOA 2Y7IA 3KZGA 4GD5A 4NF8A 4KR5A 1S50A 3MAMA 1J1NA 1NKXA 2UXAA 3FVOA 4KFQA 2UYEA 3IOWA 1Y3PA 1EZPA 2RC9A 2QJEA 3V5AA 4TQUQ 1O64A 1POTA 4ELRA 4N13A 1OIBA 2QMXA 1IEJA 2H5YA 1MPDA 1QULA 3JV9A 5ICQA 4G8NA 3TTMA 1US5A 1MQHA 3SEVA 3RLFE 4R75A 1B05A 4QHQA 1VFDA 4HW8A 2H4IA 3UK4A 4ZEBA 4R9FA 3TYHA 2F7BA 3W15C 1IXIA 3DLNA 1LSTA 5HBCA 4Q8RA 2V93A 1MY1A 3E3KA 4F18A 4PQJA 3TCGA 4H1XA 1N7WA 3K4UA 1H3DA 1NNKA 3IK6B 1O7TA 3RGYA 4ELPA 4R9GA 3RTFB 2E1SA 3F11A 1UIUA 3PUZE 2V25A 1MM7A 1LCTA 3CFLA 4FAJA 2V3QA 3TKDA 3Q29A 3FIRA 1SW1A 4EDPA 1BKAA 3M3KA 2F97A 1B6HA 1Y9UA 3L6GA 3BBRA 2X7QA 4WEPA 3TCHA 3E13X 3W9VA 1MY0A 1Y3NA 3VLVA 4R6KA 1ZLQA 1N76A 1WODA 1L5TA 1IIWA 2I4CA 1B5IA 3LUYA 5H8NB 4H0WA 4IB2A 3A3UA 1M5DA 4U4SA 4DCYA 4NF6A 3G3HA 2RC8A 5BUUA 3V8XB 4JBZA 4LONB 2I0CA 2XD3A 1LFGA 3IJXB 1R6ZA 4IO2A 1UTBA 2F7CA 4MFIA 3SDFA 3S9LC 3KN3A 1WDNA 3TMGA 3TTKA 3N5LA 1LFIA 2ZNUA 3CSGA 4FECA 4EXLA 4F3BA 1JNFA 5ITPA 3G3KA 3FXRA 2ONKE 4C0RA 4U1OA 1MDQA 1GV8A 1VE4A 4G77A 4IO7A 3VXCA 4YZZA 2THIA 3K00A 3QXMA 2DQVA 4OEUA 3KN7A 3UIFA 1FQDA 1MXZA 1MH3A 3K6XA 4OETA 4LATA 2NVUB 1LCFA 2AL4A 1B40A 1JW1A 5J1DA 4EQBA 2ZNTA 4IO5A 3FJ7A 1UIVA 1P99A 1ZKBA 4THIA 1D9VA 4POXA 3C31A 4BDMA 4GOTA 4Z0IA 4QSEA 3Q25A 1Y1ZA 1IQ7A 3USDA 1D4NA 1QUKA 3IX1A 4KI0E 4DIGA 3ZKLA 3TELA 4OXVA 4HCWA 1Z7NE 2A5TA 2Q8JA 5AA2A 1P1WA 1QKAA 2YLNA 3GZGA 2M8CA 4R6YA 4I62A 1M5BA 1OQGA 1QUJA 2PX1A 3O97A 5ICTA 2XXQA 4OVJA 2H99A 4F3SA 3MPLA 4R74A 2ZYKA 4M4GA 2XD2A 4TOZA 4Z7EA 1PBPA 3KJ7A 1O63A 5M2VA 3JZJA 4ONYA 5CM6A 5CMCA 1NNFA 4KPTA 2ZYNA 3LBSA 1XC1A 1TFDA 4G8HA 4LP2B 4R2BA 4WEDA 3SESA 3W9WA 4OESA 1N0TA 3SEXA 3TFLA 4H8IA 3SETA 4ZECA 5KDTB 2ONSA 5I58A 5JTYB 4G68B 3CG3A 1B3GA 1MRPA 3MC2A 1JEUA 1B1XA 1AH5A 1MQIA 1T0KA 1VR5A 5H8QB 4F2OA 4DDDA 4U4XA 3U93A 3CG1A 2NXOA 1EZ9A 1LAGE 1H44A 2XXVA 4BDLA 1B0LA 4AB6A 4GL8A 1ZJLA 4RJZA 3T96B 3FVNA 3KSJA 4F1VA 1R9QA 1SI1A 3N6TA 4OFLA 1FTMA 1Y1MA 1S9TA 1Q35A 5DEXB 3KOSA 4IGRA 4R2FA 4XTCQ 5TPAB 4JSOA 3S9EA 3LSXA 1NMUA 2O7UA 1VFEA 3U72A 1B9JA 2I3WA 2ALUA 2DVZA 3OOAA 3T9XB 4I8CA 1MH4A 3T9HB 3M8UA 3B6WA 1ZU0A 3ILTB 3MP1A 3PPRA 4C1UA 4YB5A 5K2YA 4F2QA 4O3BA 1B4ZA 2H98A 3OO8A 3O6HA 2REJA 1MM6A 2XX7A 5CBRA 5FHOA 3FVGA 2R71A 4F1YA 5CRYA 3KFMA 1LLSA 4GFRA 1B3LA 5CMBA 4C1TA 2B65A 3AXFA 3PUVE 2I0BA 1N7XA 3CFZA 1MQGA 3TQLA 4ZZEA 3SERA 4YICA 4F29A 4EF2A 2D5WA 4ND9A 4O3CA 5CBSA 5B7DA 3DELB 2CZLA 4H8JA 4R73A 1NNPA 1MQDA 3Q28A 3MP6A 1B51A 4KCCA 4DZ1A 1AIVA 2ZXTA 3MBPA 3LSWA 5H8NA 4OZ9A 3S2VA 4L17A 1ZBMA 3QSLA 5EHSA 2GHBA 2XXRA 3QUJA 3HSTA 1Y3QA 5IKBA 2QS4A 3OMBA 4PFWA 4PP0A 4DXBA 4LZ7A 2ZNSA 1BIYA 4ZE9A 2PVUA 3B6QA 1FQCA 4MF3A 2DYXA 3BFTA 3IO6A 4MBPA 4RPOA 1WVJA 3H4ZA 1XVYA 3FASA 3MJNA 3H6VA 4JWXA 1H43A 5DVFA 4LQ5A 3RT8A 3PUWE 3S4UA 4QSDA 5DVIA 1OVTA 2RF1A 1SVXB 4IY5A 1SDXA 4PE5B 2I6EA 2OWSA 3GBBA 4P0GA 1POY1 2B3FA 4YAHX 4ZEFA 2Z8DA 3HCQA 1AL3A 2DVCA 1JW5A 4K3FA 3OD7A 3FZVA 2I49A 1B58A 4KYDA 2I58A 2NUVA 2QS3A 4XKNA 4UA8A 1YTVA 2XXTA 1SW5A 1B3EA 1MY2A 1SI0A 3IOUA 2G93A 5F1QA 1B46A 3E9XA 3K02A 3TUSA 3H6WA 3PMWA 3HPIA 1RYOA 3D4CA 2RC7A 1SBPA 2HZKA 2QS2A 2AL5A 4OQOA 4PETA 1DOTA 4PFUA 4IO6A 1PB7A 2QS1A 4LZ5A 5LOMA 3PMVA 4WKMA 5KCJA 4I1DA 5FHMA 2ABHA 3GBAA 3S9MC 1P1QA 4I9DA 3K6UA 1A99A 3VVFA 5I59A 5L9OA 1USYE 2F36A 2H9BA 2ONRA 3PGFA 1LGBC 2XXHA 1OVBA 1MPCA 3CRBA 5B70A 3U1OA 1MXXA 4NF8B 1FTJA 1PBQA 4H5GA 2XHDA 4F39A 2X26A 5JK4A 2FNCA 4P0IA 5I2NB 1YPNA 4ZEDA 1AOVA 2VP1A 3G7WA 4QFOA 2ANJA 4HCYA 4QSCA 4TLMB 1GR2A 3E4RA 1Q1KA 1B0HA 2Y7PA 5KDTA 5JTYA 3MW0A 4G68A 2QRYA 2OCUA 3KSXA 3M3FA 3ECRA 1PDAA 2Q2AA 3MVYA 4JXIA 2DE3A 2Y84A 1DTGA 4XKQA 1JEVA 1A55A 1FTOA 4R6HA 4DCXA 2PYYA 4DXUA 1VSOA 4E0WA 3A3CA 1M5FA 1FQFA 2O1LA 1DPPA 3U8QA 2F8DA 3H6TA 5L9MA 1I69A 2RCBA 3U94A 5HPQA 4MLVA 1UQWA 3QK6A 1QJMA 3A09A 4EUOA 1LB9A 5DEXA 4OMBA 5IAIA 3LC8A 2XXPA 2REGA 5I57A 3K1NA 2HAVA 1URDA 3TCFA 3H6UA 2HEUA 1GVCA 2VOZA 5A5XB 3PPQA 1IXCA 2Q89A 2Z8FA 1IXGA 2E0SA 4GRKA 2DOJA 4EQ9A 3VFJA 4KCDA 3ZKKA 4KD5A 4NWDA 5AA4A 2P1SA 1NFTA 5H8SA 1R9LA 4RK9A 2OBGA 4G2ZA 1TXFA 2PT2A 4KYSA 3TQWA 4LA9A 2W7YA 3TPAA 3G3JA 4F3GA 3RT6B 3MVWA 4ZS9A 3B7DA 4JDFA 3KG2A 3H03A 3MZ1A 1XVXA 1HSLA 3H7MA 1B2HA 4GQOA 1LBBA 2DWJA 3FJGA 1QW0A 1Z7ME 4X48A 2OLBA 1A40A 1YCJA 2HQ0A 4BDQA 1AMFA 1MS7A 4G8MA 3IOVA 1JETA 5CC2A 2PMSA 4NF6B 4JSDA 3HV1A 2RINA 1PEBA 1UTHB 4OHNA 3UA8A 3IL1B 1B3FA 3KEIA 2DP8A 1B5JA 4GF8A 2UVIA 2HXWA 4WXJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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