4G2ZA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with mefenamic acid at 1.90 a resolution
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Metal binding protein
publication title Crystal Structure of C-lobe of Bovine lactoferrin Complexed with Mefenamic acid at 1.90 A Resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 117
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2012-07-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4g2zA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4g2zA02
1B51A 1JETA 4XKPA 2Y7IA 1II5A 4JB7A 3LBSA 2O51A 2V25A 3OXNA 4XTCQ 3D4CA 3QIMA 1B5IA 2Y84A 4KYEA 3O6HA 2I0BA 3MP8A 1B4HA 1SQYA 1O64A 2QS1A 2CZLA 1OLCA 3PU5A 1SYIA 4X1DA 1NNTA 4YMAA 1S9TA 5HPQA 5EHSA 3F11A 4U1OA 5CBRA 4GXSB 1KWHA 2F35A 2Q89A 3PMWA 4G68C 3FJ7A 3B7DA 1POY1 1XVXA 1P1QA 3FUZA 4MFIA 3E13X 1AMFA 1SW4A 3K1PA 2O6AA 4YB6A 5L9SA 1QUIA 1M5DA 1LGBC 4K3FA 4HW8A 2HAVA 4EUOA 4IO2A 1MPDA 1OMPA 2YJPA 1SW5A 1QJMA 1B3GA 5L8DA 3OEMA 3FXUA 1B4ZA 2RCBA 2O69A 4R74A 2V3QA 2ALUA 2HCAA 3ILUB 4H8JA 1URDA 3BKIB 4NF8B 1JW1A 2F78A 3PUVE 1NNFA 3TUSA 4JSDA 3CG3A 3R26A 1VE4A 1IXGA 4ZE9A 4QFPA 2Z8FA 1B7ZA 1SW2A 3BFTA 2QL3A 2X26A 1I6BA 1RYOA 4OENA 4YICA 4F1YA 3N6UA 2QS3A 2XXWA 4RXLA 3BBRA 4YMBA 5K2XA 4PP0A 2ONSA 4HTGA 4F3GA 1PC3A 2O1LA 3LR1A 3LSWA 1T0KA 3G3KA 5AA4B 1B40A 3PPPA 4JXIA 1RYXA 4KYDA 1EZ9A 1MY3A 1Y9UA 1IZ1A 3N94A 1IEJA 4BDMA 2GH9A 4EXKA 1MY1A 4DCYA 3M3KA 4QFLA 4U1ZA 4YKJA 4BDOA 3KZGA 3IAZA 5CMCA 3MP1A 5I84A 1MS7A 3K6VA 1Y3PA 3G3HA 4PFYA 3UP9A 3CG1A 3Q27A 4MF3A 3FV1A 2XX7A 4R2BA 5CMKA 4OTEA 2DXYA 2PX1A 5F1QA 5H8FB 3RT6B 1A8FA 4OFJA 4GOTA 3S9NC 4MBPA 1ZLQA 3TQLA 4GWOA 1D3KA 4Q0CA 4DCXA 4N6PA 3V5AA 1XOCA 1IQ7A 5A5XA 2XXTA 3LSFB 3CVGA 1MXWA 3L6HA 3DM0A 5FTHA 1SBPA 1OIBA 2H99A 1WVJA 2DQVA 2XD2A 2VHAA 3H6TA 4RPNA 2OLBA 3C4MA 1OVTA 4RPOA 4F39A 3TEPA 2DE2A 1EU8A 1L5TA 5I57A 4LZ5A 4GF8A 3ZS6A 1CE2A 3HN0A 3KG2A 1A54A 4PQJA 4OHNA 1FCKA 2F7BA 3DELB 4G8MA 4BLAA 3QYTA 2ZYNA 1YAEA 4OFOA 2B65A 1WDNA 3UGWA 5I56B 3MWBA 3ZSFA 1N7XA 1I6QA 3PMVA 1OQGA 1B58A 2G93A 5ICQA 3PPQA 2QRYA 3PUZE 3SERA 4GXAA 2XXIA 3OELA 4IGRA 2UVIA 1IXIA 3RY3A 4F3SA 2I58A 4EF1A 4HCWA 1MXZA 4LZ8A 1UIUA 4NWDA 2PBWA 4LZ7A 1B6HA 2HZLA 1UTBA 3T22A 1SI0A 1MDQA 3HCQA 4F2QA 2DVZA 3V89B 3K6WA 1NKXA 1B7UA 3KJTA 3IB0A 4N07A 1ZBMA 3THIA 5EYFA 4F22A 1FTMA 2BJJX 3FVGA 4O3AA 5HBCA 2UYFA 5I59B 1XVYA 4FEDA 1YPNA 3G3FA 4WEPA 5DEXB 2DSFA 4NWCA 2UVGA 4G77A 3FATA 5CI5A 2P2AA 3ILTB 4THIA 3G3IA 4WEDA 3PV0E 3FJMA 1ATGA 5B70A 4ECFA 1MXVA 1EZOA 1FQCA 3G3JA 1FTJA 5IKBA 3GXAA 3T9UA 3ODBA 3TTKA 3IL1B 1B32A 3VDFA 1AIVA 2OJTA 3S2VA 1LAFE 2HXWA 1LFGA 1US4A 4EQ9A 3R6UA 4QHQA 1LCFA 2OBGA 2ONKE 4HS7A 2DXRA 2H25A 2RKMA 2ZYMA 2XX8A 1FQAA 2RF1A 1AOVA 2DWAA 3OO6A 5DYHA 2XXQA 5TPAA 3TCFA 5H8HA 4H67A 1LBCA 3VE1B 2I0CA 1P99A 3KN8A 3TTLA 5DVFA 5H8NB 5KDTA 3H03A 4QF9A 4DXCA 3S9LC 3FZVA 3MC2A 4AB5A 2PMSA 4DE8A 2M8CA 2I3WA 4OERA 3N5LA 2ABHA 1BKAA 4EQ7A 1PBQA 3QXMA 2Y7RA 4FJPA 4KCDA 3A3CA 3CIJA 4YAHX 2HZKA 4WXJA 1BP5A 1UTHA 5I57B 2ZNUA 3OSRA 4AQ4A 4U23A 4EF2A 5EHMA 3TCGA 4XKRA 3EHTA 5I2KA 1USYE 5H8QA 1LLSA 5AA3A 4BDQA 4F2OA 1P1WA 2LAOA 3O6IA 1SW1A 1DPPA 1UQWA 4UA8A 5ITOA 4N13A 4I8CA 2Q8JA 2DOJA 1R1NA 1R9LA 2HQ0A 4R6HA 4LA9A 1AL3A 1RKMA 2QPQA 1B3HA 2NXOA 1DOTA 4G8NA 1ZJLA 1PB7A 3VLVA 2REJA 3U8QA 3H4ZA 4KQPA 3FXRA 3C31A 1A7LA 5J1DA 4XKQA 1IXHA 4RYAA 1N3WA 3W9VA 3U92A 3U94A 2O68A 2O7UA 1B1HA 3IOVA 1QUJA 4NF4B 4DXBA 2F97A 1FTKA 2H4IA 4GLIA 4IY6A 3OO7A 3MUQA 1TWYA 2A5TB 4G68A 5FTIA 4E0WA 1F9BA 1S50A 4TLMB 4ISUA 4KI0E 5FHMA 3VVFA 4PFTA 4RNSA 3OENA 3QK6A 5M2VA 3IB2A 1P1UA 3H6VA 3K00A 5JTYA 3GBBA 2OWTA 1Y3QA 5I2NA 1FQEA 4H1XA 3T9XB 2HEUA 2UXAA 2RC8A 3TTMA 3O28A 2W7YA 4R75A 2F6PA 2X7QA 5TU0A 3TQWA 3IOUA 3UORA 4I9DA 4MLVA 3P7IA 2IA4A 3SEYA 4M1VA 3E3KA 3M3FA 4R2FA 5TP9A 5ITPA 5AA2A 3KFMA 3GBAA 4EDPA 1Y4CA 1QKAA 5JK4A 3Q28A 2G29A 2XXPA 3PPRA 1XHYA 3R7XA 3N26A 4NF5B 5KDTB 1H45A 4FEBA 1I69A 1MG1A 2ANJA 1PEBA 1BLFA 5I58B 1UIVA 1HSJA 4RJZA 1PDAA 3C35A 3TFLA 4QFNA 1US5A 5DVJA 2VP1A 2O84X 5BWJA 3KSXA 4F18A 4FATA 4Q30B 2OZZA 3KN3A 3N6TA 1YTVA 1H43A 1OQHA 1MQIA 3GLBA 4G2ZA 1Z7NE 5KCJA 4F3BA 3VVEA 1POTA 4H5GA 3O66A 3PUYE 1MXXA 3K6XA 1H3DA 1MXUA 3K1MA 4POXA 4JBZA 2DYXA 3SEUA 1Q1KA 1XT8A 4IO4A 2DWIA 4JSOA 2F34A 4ZEDA 1P1NA 2XXYA 3C32A 4KFQA 3OD7A 2QS2A 5FHOA 3CR9A 3USDA 1GTKA 2V3UA 1JW5A 2F36A 4QFKA 4DZ1A 2WKYA 3CFLA 4XKNA 1PB9A 1URSA 4FORA 4O3CA 1SVXB 1B05A 2V93A 4IY5A 1JQFA 4QSCA 1LBBA 1EH3A 3QSLA 3MJNA 3KOSA 4Z7EA 1B3LA 1B0LA 4ZE8A 1SD3A 3JV9A 3HHFA 3HPIA 3JYRA 4IO7A 3O29A 1LSTA 1VR5A 1ZKBA 2PVUA 4FECA 2DE3A 1M5CA 2ZYOA 5F7VA 3TYHA 4QSEA 1H76A 5KZTA 1B46A 1LB8A 4BDLA 4RA1A 3U93A 1HSEA 4OEVA 2Q9TA 3WAEA 3OSQA 3PUXE 3EN3A 3O97A 4PE5B 4I1DA 4KPTA 4ELRA 2OK2A 1B3EA 4U4SA 4QFOA 4DDDA 1M5FA 4GVOA 2XX9A 3FGSA 4H0WA 1MH3A 2QSXA 4GFRA 3ZKKA 3TDJA 1B5JA 2Q2CA 2NUVA 5DTBA 4NF8A 4OESA 3K01A 1FQBA 1ZTYA 2Z8DA 3LSXA 2V3TA 1FQFA 3T9HB 3M8UA 4P0GA 3EHUA 4ZECA 5AA2D 1VFDA 3TPAA 1Q35A 2P0SA 1JVXA 2HAUA 4KR5A 3T93B 4LVQA 2Z23A 3HV1A 2Y7KA 2GHBA 3EHSA 1QW0A 2D21A 3IR1A 3KGCA 2ESNA 1Y3NA 2F7CA 4Q8RA 2IEEA 4AB6A 3MW0A 4X48A 4ND9A 3DP4A 3KSJA 4TLLB 2Y7WA 4EXLA 1MPCA 1N7WA 3TTRA 5JEIA 4ESXA 4U22A 3I3VA 5LOMA 2XXXA 1I6AA 3K1NA 2V84A 2B3BA 4YZZA 1O7TA 1NMUA 4NTLA 4H65A 1JNFA 1FQDA 4F29A 3TMGA 1B3FA 2H98A 3IX1A 3HSTA 3PPNA 4YB7A 4PFWA 1N84A 2DP8A 5A5XB 3VV5A 4KCCA 3KEIA 4ELQA 1MQHA 3K0VA 1LFIA 3UA8A 1FTOA 1URGA 1SDXA 3FJGA 3IJXB 3OOAA 3RUMA 3OO8A 2AIXA 4LP2B 1LFHA 1FW0A 2XXHA 1O63A 3VLUA 4H6DA 4R9GA 5H8FA 1EZPA 3W9WA 2FNCA 2Y7PA 4YU0A 3LSLA 3E4RA 3OMBA 1Z7ME 1LAGE 1PBPA 2XHDA 5K2YA 3TCHA 3K2DA 2GFEA 1MY2A 3HHGA 4R6YA 4DLDA 1LAHE 4OMBA 1QUKA 4Q5TA 3TKDA 1XC1A 2B3FA 2ZNSA 1OVBA 3RN8A 3SDFA 4FE8A 3IK6B 4E0XA 2GRVA 2KLFA 1M5EA 2RCAA 3MVWA 4YKIA 3PUWE 1ZU0A 2F8DA 4LQ2A 1TFAA 1MPBA 2DS9A 4JWOA 1N76A 3CI8A 1UTBB 4BDRA 5CM6A 5ELVA 4OXVA 2DWHA 1D4NA 3RT8A 3V83A 3VXBA 3SEWA 1Y20A 1IUDA 4ZDMA 2QS4A 3H3GA 5BUUA 4BDNA 5I56A 4PFUA 3RPWA 4OVJA 2P1SA 2I3VA 3VVDA 4ZZEA 3DP8A 5CC2A 3IOTA 1NH7A 3T66A 1NH8A 2ZNTA 1CB6A 3MPLA 3C33A 2I48A 4OETA 4QSDA 3U72A 3K4UA 1R6ZA 4GL8A 1A8EA 2QMWA 2I4BA 4YKKA 3FVNA 1ANFA 4OWDA 3I6VA 1NFTA 1DPEA 3SEVA 1B5HA 2UYEA 3ECRA 5IAIA 4RK2A 3UIFA 3ZKLA 3TTNA 4ZEBA 3I5OA 4F3PA 4IO5A 4GIZA 2FA7A 2I49A 3E9XA 4LQ5A 3VXCA 1JW4A 2F6GA 4NMYA 3RTWB 2R71A 3KN7A 2ONRA 4LUBA 5B7DA 2UVJA 3LUYA 4OQOA 3TZAA 5H8SA 5I59A 1B52A 4IO3A 2Z8EA 2A5SA 5CRYA 3SEXA 2XXRA 3MZ9A 1MQJA 4F1UA 4Z0IA 1NNPA 5DEXA 3HO7A 4U4XA 3PMXA 2R9JA 3RGYA 5HM4B 1NNKA 3WAFA 4L17A 1N0TA 4GD5A 3W15C 3Q26A 3K6UA 2F7AA 5TPAB 4R9FA 3D4GA 2THIA 5H8HB 2NVUB 3O2AA 1GV8A 4FIMA 3C36A 3CSGA 1XS5A 3ONMA 2ZXTA 1JEVA 3S9EA 1J1NA 1B9JA 3CSBA 4XIGQ 1MH4A 4FAJA 4XXUA 2YLNA 2DWJA 4HCYA 1DTZA 2FYIA 3RQTA 1B7HA 1NL5A 3G7WA 2VGQA 1DSNA 3PPOA 5CMBA 4KYSA 2X7PA 3FXQA 2PT1A 2D5WA 1VFEA 1R9QA 3IO4A 4G4PA 3VLWA 2REGA 1MDP1 4U21A 3JZJA 1UTHB 1GGGA 4NF6A 3UK4A 3O9PA 3MBPA 1VSOA 3MAMA 4ZZAA 4X9TA 1GVCA 4ONYA 1A55A 5I2KB 4C1UA 5H8QB 1PB8A 2H9BA 3M3LA 1QKBA 1BTJA 1D9YA 1ELJA 5H8NA 3CRBA 3KOTA 1B1XA 3CFZA 4EQBA 3OEKA 3S4UA 3SETA 1MQGA 3TELA 1N04A 1N3XA 4RY1A 2F5XA 1ZIUA 4PETA 1ZMGA 4G8HA 4JWYA 4ZEIA 1GR2A 3MVXA 4R73A 1USYH 3UN6A 3Q25A 4NE4A 1QVSA 2DVCA 5L9MA 2E1SA 3MPKA 4C0RA 4IO6A 2ZMBA 3DP6A 4ZEKA 2RC9A 3PD8A 3FV2A 4P11A 1Y1ZA 4F1VA 1HSLA 4IB2A 5CMMA 1JEUA 4ESWA 3QAXA 5CBSA 1LAXA 2CMOA 3A3UA 4LONB 3A09A 3PGFA 1MM7A 2I4CA 3IORA 1JVYA 3TODA 3EPEA 1IITA 1MY0A 2GHAA 2AYSA 3MZBA 3DLNA 4ELOA 1FTLA 3H6UA 2XXUA 2D3IA 1SYHA 3FASA 4F19A 4G68B 3B6QA 4C1TA 3MQ9A 1P1OA 4OEUA 3G3GA 4OYVA 1TT1A 3PD9A 5DVIA 2RINA 1B2HA 1LB9A 2RC7A 2HFBA 5ICTA 1OLAA 4OFLA 2PYYA 1MXYA 3RNNA 4O3BA 5JTYB 4R72A 5I2NB 2Q88A 3VFJA 2Z22A 1TFDA 4NF4A 3H06B 4X1BA 3IJOB 4DIGA 1TXFA 3IOWA 3L6GA 2NOOA 1MRPA 4YKPA 4GRKA 1M5BA 1AH5A 4H5FA 5AA1A 1A40A 4R6KA 4DXUA 3CFXA 1MY4A 3MVZA 4IGTA 2UVHA 2A5TA 3SKPA 3O6GA 2NWJA 3EQ1A 2PT2A 2QJEA 3LC8A 4OZ9A 2O7IA 4JDFA 5TP9B 3KJ7A 3RTFB 3TAJA 2ZYKA 2OWSA 4NEDA 4MLQA 5AA2B 4GQOA 4LATA 2XXVA 1DTGA 1Y1MA 4POWA 3QUFA 2YPNA 1IIWA 3OO9A 4F31B 2QMXA 3KBRA 3FVOA 3GZGA 2E0SA 3T96B 3EF7A 3BFUA 3H6WA 3FVKA 3MVYA 3B6WA 2AL4A 1LCTA 4H8IA 1A99A 1Y4TA 4TQUQ 1H44A 2DE4A 2VD2A 2I6EA 5ISUA 3Q29A 5AA4A 1YCJA 3FD3A 4KHZE 4ZS9A 1IXCA 3C9HA 4I62A 4U2RA 5FHNA 2Q2AA 3S9MC 1D9VA 1S7YA 1B0HA 1MM6A 4KD5A 1MQDA 5DT6A 4ZEFA 2H5YA 4QRZA 3IO6A 1QULA 4NF6B 3MP6A 4YB5A 3SESA 2R6GE 3C34A 3FIRA 2O1MA 2XD3A 3IB1A 5KCJB 4WKMA 3B6TA 3AXFA 4ELPA 3U1OA 4NF5A 1BIYA 3MZ1A 3H7MA 3V8XB 4M4GA 4GL0A 5L9OA 1WODA 2AL5A 5AE4A 3K02A 4MH5A 5I58A 2VD3A 3QUJA 4JWXA 3T9VA 4P0IA 2OCUA 4UACA 1DMBA 1SI1A 3RLFE 2VOZA 4RK9A 4TOZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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