4G2ZA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with mefenamic acid at 1.90 a resolution
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Metal binding protein
molecule keywords Lactotransferrin
publication title Crystal Structure of C-lobe of Bovine lactoferrin Complexed with Mefenamic acid at 1.90 A Resolution
rcsb
total genus 117
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2012-07-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4g2zA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4g2zA02
2ONSA 1FQFA 1QKBA 2ZYNA 4H67A 2Z8DA 3IOUA 3C9HA 3K0VA 1B05A 2Q8JA 4R6HA 3HCQA 1R6ZA 3PUZE 4IGRA 3O97A 3PPNA 1A8FA 1NKXA 1BLFA 1JEVA 4G68A 1D9YA 4NEDA 1ZTYA 2Y84A 1TXFA 3FUZA 1B9JA 3M3KA 5LOMA 1ZU0A 4TLLB 2A5SA 4WKMA 3TYHA 3K1MA 4Z7EA 1XVYA 2IA4A 2REJA 1S50A 5CMKA 3UN6A 3VDFA 3LSFB 1B5IA 5KCJB 3H3GA 4R72A 4QRZA 2V3QA 1DTGA 4F3SA 4G77A 3MPLA 3FVGA 1SW4A 1NNFA 4R6KA 4JWYA 4LVQA 1IXCA 2DWHA 1MQIA 2D3IA 1ZJLA 4DE8A 4JXIA 3S9LC 3O6IA 2NWJA 4N6PA 4KCDA 3FZVA 4OEVA 1YCJA 2XXTA 1H3DA 2UXAA 4M1VA 1B2HA 4O3BA 5B7DA 4JBZA 1JW5A 4LQ2A 2Z8FA 1D3KA 1B3GA 4GIZA 1P1NA 3VVDA 4AQ4A 4OTEA 2OJTA 2O68A 4FIMA 4H1XA 4C1TA 4FJPA 1LB9A 1Y1ZA 5CMMA 3B7DA 3I5OA 4BDLA 4BDRA 5TP9A 3FVOA 1XVXA 1MY1A 1B46A 1P1WA 3OMBA 3ZKKA 3V8XB 4I8CA 4PQJA 4ELRA 3DP6A 5I2NA 2PX1A 4E0XA 3E4RA 4OHNA 3SEXA 1GGGA 3H06B 4G68C 3P7IA 3TTLA 4ZZAA 4MLVA 3MZBA 3SERA 4JB7A 3FJMA 5BUUA 2GFEA 4E0WA 1ZKBA 2I3VA 1SW5A 5AA3A 1FTJA 4GWOA 1S7YA 2X7PA 1B58A 3MWBA 5ITPA 1WODA 4XXUA 2ONKE 3U72A 4F1VA 2Y7IA 3K6XA 1SD3A 1LB8A 3CI8A 2OCUA 2GRVA 4O3CA 1Q35A 2HCAA 3RGYA 4OEUA 3EHTA 3JZJA 4ZEIA 1MY4A 3RT8A 1UTBA 4KQPA 1EZ9A 1B5JA 2P0SA 3U92A 2BJJX 5FHMA 5BWJA 3K6VA 1LBCA 1FTOA 4LUBA 1RKMA 3G3FA 3OO8A 4PP0A 4RPNA 3KN7A 5CMCA 1USYE 4NWCA 3I6VA 4EUOA 1FQAA 4FORA 1SI0A 4KFQA 2FNCA 3ILTB 5CMBA 1EU8A 5FTIA 1ELJA 1QKAA 3S9MC 3G3KA 2ZNUA 3QYTA 5EYFA 3U1OA 3FJGA 4GL0A 1H43A 1JEUA 4K3FA 4NTLA 1F9BA 2RC8A 3KN8A 1SW2A 4IO2A 4QSDA 3B6TA 4DLDA 1I69A 2F78A 3OSRA 4DZ1A 3A3CA 2F97A 4ELQA 2OZZA 2XXPA 2O84X 3C34A 1XT8A 3OXNA 2O51A 1SVXB 3MPKA 1H44A 3CSBA 4G68B 4YKKA 3LC8A 4H5GA 4F3GA 3FGSA 2QPQA 3PMWA 2A5TA 5F7VA 1B3HA 3KJ7A 3TFLA 1B32A 3PMXA 3HSTA 1LAHE 4RXLA 5K2YA 4F19A 3SEWA 2XX8A 3HV1A 1NL5A 2RC9A 2B3FA 4ECFA 2F7BA 4JSDA 2UVIA 2DE3A 2FYIA 2QMWA 2W7YA 3DLNA 4LA9A 4X1BA 3CRBA 5CC2A 3KOTA 2GH9A 2QSXA 5L9OA 2RCBA 1WVJA 5I59A 4Z0IA 1JW4A 3MP1A 3VLVA 2DSFA 5ICTA 3K01A 4ESWA 4P0GA 4NF8A 5AA4A 1OVTA 4PFYA 4JWOA 1QULA 2ALUA 3K2DA 2F35A 3JYRA 2KLFA 2AYSA 2HEUA 3L6HA 3N6TA 3MQ9A 3KSJA 3TEPA 5TP9B 2B3BA 2B65A 5ITOA 2RINA 3RN8A 5I56A 1B3EA 4GVOA 3PUWE 4F3PA 2UYFA 1UTHB 2PMSA 1DSNA 1IXGA 4GQOA 3PUVE 4U2RA 2Y7WA 2YLNA 3RT6B 1MXVA 1XHYA 4P0IA 1CE2A 3M8UA 5B70A 1XC1A 2D5WA 1HSLA 4IO5A 1PBPA 3TCGA 3SEUA 1B0LA 1HSEA 2V25A 4YB7A 1Y9UA 2E1SA 2VHAA 3MP6A 1MH4A 2H5YA 1LSTA 1OQGA 1B3LA 3KEIA 1MQDA 4IO6A 4R6YA 4EDPA 2I4BA 4LONB 1JETA 3PMVA 3EQ1A 4RY1A 3I3VA 3OO6A 5CI5A 1MQHA 3G3HA 1P1UA 3MVYA 3TQLA 2XXIA 1LCFA 4YMAA 4F39A 2R71A 1LAFE 2X7QA 3HN0A 4IO3A 1UTBB 2Y7RA 3C4MA 4JSOA 5DYHA 3MBPA 1N7WA 5FTHA 3EHUA 2GHBA 2E0SA 1JNFA 4ZZEA 3OEMA 3H4ZA 4KR5A 4Q0CA 4U22A 3FV2A 4KPTA 5H8FA 3ONMA 4GLIA 1M5FA 3U94A 1FQCA 3IORA 4R75A 1GR2A 3MZ9A 3D4GA 2RF1A 1Y1MA 1OLAA 2O1LA 4XKRA 1MG1A 3IO6A 1GTKA 4TLMB 1MY3A 2NVUB 3TUSA 4YKJA 3THIA 3BFUA 3LSLA 3DM0A 4FEBA 2O7IA 4IY5A 4DXBA 4GXSB 1ANFA 2QJEA 5DT6A 2YJPA 5DVJA 3PD9A 1B1XA 2P2AA 3K1NA 4C0RA 3B6WA 3QXMA 4FE8A 2I3WA 2DE4A 4ELPA 4QFPA 3TKDA 1SI1A 3H6TA 4GFRA 1R9QA 3C33A 1Y3NA 2RCAA 3IOTA 2A5TB 2XX7A 3W15C 2P1SA 4YMBA 4ISUA 2ESNA 1M5EA 1ZMGA 3MZ1A 3TTNA 1US5A 3N94A 3SEYA 1N0TA 4R73A 3GXAA 1Y4TA 3OD7A 5H8HB 4DXCA 3M3LA 5J1DA 4I62A 4QSEA 1GV8A 1EH3A 2D21A 2G93A 3KSXA 1MY0A 3CFZA 1ZIUA 2QMXA 3T22A 1VFEA 4ZDMA 4YZZA 2HXWA 2ZNSA 3IJXB 4RJZA 2DYXA 4EQ7A 5I84A 5JTYB 1OMPA 4I1DA 2ONRA 1AMFA 2VD3A 1QW0A 3VXBA 5I59B 5F1QA 4ZE9A 1IQ7A 2O7UA 5ISUA 5DEXB 5I2KA 4IGTA 2Y7PA 3S2VA 4LP2B 3V83A 1UQWA 4NF8B 1M5BA 3RTFB 4Q8RA 4FAJA 5AA4B 5KDTA 3O2AA 5M2VA 4NF6A 2ZYKA 2XXYA 1MRPA 3K00A 1JW1A 1DOTA 1PC3A 1TFAA 3CIJA 3IB0A 5TU0A 1JQFA 2CZLA 4WEPA 1P1OA 4G2ZA 5CRYA 1ATGA 3IX1A 2H25A 1RYXA 4EQ9A 3TELA 5JEIA 4BDOA 5A5XA 3BKIB 3FATA 1MM6A 3KJTA 4OERA 1Z7NE 3QAXA 4OENA 1QUKA 1CB6A 3W9WA 3RUMA 2THIA 4BLAA 1OIBA 4YB5A 1LCTA 2DWAA 4WEDA 1NMUA 2R6GE 3VLUA 3O29A 3VXCA 1B4HA 1FCKA 1TFDA 4PFTA 2F7CA 2DXYA 2H4IA 2VGQA 3PV0E 3H6UA 5I58A 2REGA 1R9LA 3VLWA 3OELA 2I0BA 3TDJA 3ILUB 1SDXA 3IJOB 4MBPA 2NOOA 4OYVA 3H7MA 4LQ5A 3GBAA 3O6HA 3CFLA 4G4PA 4RK2A 4NMYA 2F36A 1IZ1A 3AXFA 1B1HA 1OQHA 3C36A 3T93B 4U1ZA 1PBQA 3MJNA 4TQUQ 1HSJA 3CFXA 3PGFA 2F7AA 2PT1A 1YTVA 3KBRA 4NE4A 2XXVA 4ESXA 1B4ZA 4H5FA 5L9MA 5AE4A 1TWYA 2RC7A 2XXRA 2V93A 3TTRA 3LBSA 3RNNA 2O69A 2XXUA 3PPQA 3E13X 4OMBA 1LAXA 2UVGA 1A55A 3BFTA 1MXYA 1URGA 3JV9A 4BDQA 1H76A 4G8NA 4EXKA 3OO7A 3UIFA 3OOAA 2ZYOA 2Z22A 3SKPA 1NNTA 4AB6A 4ZEBA 3TPAA 1MY2A 2OWTA 1AH5A 4EF1A 3T66A 2DOJA 1BP5A 3FD3A 4C1UA 4H8IA 3TAJA 3V89B 2XXXA 4X9TA 4OQOA 1US4A 1JVYA 1B52A 5H8NA 1BTJA 3FJ7A 2CMOA 4F3BA 4ELOA 4EXLA 2DXRA 1I6QA 4ZECA 3V5AA 2HAVA 3N5LA 3UORA 3FV1A 3B6QA 3VE1B 4OZ9A 4OESA 3TQWA 3DP4A 3H6WA 2DVCA 4HW8A 3MVWA 4MLQA 2PT2A 3SEVA 1O63A 4PE5B 3TTKA 3GZGA 3MUQA 3KG2A 3E9XA 1B40A 1H45A 4XTCQ 1WDNA 3LSWA 3LR1A 1D4NA 4BDNA 1PB8A 3G3JA 2G29A 1NNPA 2ABHA 4YU0A 2RKMA 2H98A 1QVSA 2XXWA 2Q9TA 1LFHA 3T9HB 5IAIA 4GXAA 1FQEA 4H6DA 3FVKA 2XXQA 5CM6A 3DELB 4HTGA 1LLSA 3K6UA 1AL3A 3IB1A 1N3XA 2X26A 3QUJA 5I2KB 1FQDA 1DTZA 2Q2CA 1VSOA 4H0WA 4EQBA 4KD5A 3WAFA 3PPPA 1BIYA 4IO7A 5KDTB 4G8MA 4NF6B 1FTMA 4MFIA 1AIVA 1I6BA 3IL1B 5I2NB 4KYSA 3MAMA 4RYAA 2QS4A 1MXWA 4RK9A 3OEKA 3O9PA 4OXVA 5TPAA 4F1YA 1JVXA 3IAZA 1RYOA 2YPNA 4KYEA 3USDA 1EZPA 3G3IA 3QK6A 4YICA 3FXUA 1B7ZA 2F5XA 4ZE8A 4ZS9A 4LZ5A 1LGBC 1B0HA 2H99A 1Y20A 1DMBA 1PB7A 3ZS6A 1BKAA 4ZEKA 2PYYA 2NXOA 3Q26A 5HBCA 1Y4CA 1SBPA 4QFOA 4NF5A 4DDDA 3OO9A 4YAHX 2ZNTA 1L5TA 1Z7ME 4ND9A 3HPIA 4DIGA 4ZEFA 5DTBA 3VV5A 3IO4A 1B7HA 4LZ7A 2I6EA 4U21A 4PFUA 3S9EA 3K02A 1NH8A 4YKPA 1FTKA 2HAUA 5H8QA 1AOVA 3H6VA 3IB2A 1P99A 4H8JA 1KWHA 3IOWA 3TMGA 3K4UA 3FASA 3GBBA 3RY3A 4HCYA 2NUVA 2QS2A 1ZBMA 3Q25A 4R9FA 4UA8A 1S9TA 4QFKA 3RTWB 3RLFE 2M8CA 3R26A 3UA8A 2OWSA 2I49A 1XOCA 1IEJA 3D4CA 1QJMA 1A40A 3PPRA 2O1MA 3U8QA 4DXUA 4NF4A 3LSXA 2HZLA 3T96B 3E3KA 4X48A 4QSCA 4YB6A 2Z8EA 4M4GA 5H8NB 2UYEA 3OENA 2PVUA 1M5DA 3KOSA 1SYHA 5H8SA 3Q27A 1ZLQA 3R7XA 1IUDA 3IR1A 2H9BA 1A8EA 1MQGA 2V84A 3CG1A 1YPNA 2V3UA 3ZSFA 2XXHA 3KN3A 3PUYE 3HHGA 2Y7KA 1N7XA 4F2QA 2OBGA 2ZXTA 3TZAA 2I58A 5EHMA 4RA1A 3ECRA 4GL8A 2F34A 5AA2A 4GOTA 1B3FA 2GHAA 3EPEA 3TTMA 3EF7A 4U4XA 1PB9A 5IKBA 2Q2AA 5HM4B 1IXHA 4YKIA 1A7LA 2QS1A 3EHSA 3T9XB 3Q28A 4H65A 5I57A 1IITA 2AL5A 3OSQA 3O66A 3QUFA 3SESA 4IO4A 1LAGE 1NFTA 3MVXA 3SDFA 1XS5A 1MDP1 4OVJA 2HQ0A 4LATA 2VP1A 1UTHA 1P1QA 4N07A 4JDFA 4HCWA 4THIA 1NH7A 1POY1 4F1UA 1Y3QA 4DCXA 1VR5A 2VD2A 5DVIA 5I56B 1IXIA 1LFIA 1J1NA 3IOVA 3KZGA 2OK2A 3UK4A 1MS7A 1OVBA 4N13A 4X1DA 1TT1A 1MH3A 1B6HA 4DCYA 3KGCA 2XD3A 5TPAB 5DVFA 3M3FA 1II5A 4ZEDA 3FIRA 3C31A 4QF9A 4AB5A 4XKQA 1B51A 1DPPA 2HFBA 4UACA 4XIGQ 2XHDA 2ANJA 3DP8A 1VE4A 1EZOA 2VOZA 1MXXA 3HHFA 4F18A 2O6AA 4QHQA 4ONYA 4PFWA 4U23A 1FQBA 3MC2A 2UVJA 4FATA 4QFNA 3ODBA 5KZTA 2XD2A 1B7UA 4KCCA 4NF5B 1MPDA 4MF3A 3FXRA 4I9DA 3RPWA 1URSA 3G7WA 4KYDA 3TCFA 1M5CA 2I48A 3QSLA 3A3UA 3L6GA 3K1PA 1B5HA 5L8DA 3VFJA 5FHNA 2DVZA 2F6PA 4POXA 5CBSA 2I0CA 4F22A 5EHSA 4Q5TA 2DE2A 2QS3A 5L9SA 2DQVA 5H8FB 1QUIA 5H8QB 3O28A 2ZMBA 5K2XA 1VFDA 4OWDA 3MP8A 4WXJA 5CBRA 3CG3A 2PBWA 1NNKA 2QRYA 4JWXA 5KCJA 2V3TA 3W9VA 3C35A 3HO7A 4O3AA 4OFJA 3TCHA 3BBRA 3RQTA 3PUXE 2LAOA 3G3GA 3UGWA 4IY6A 4G8HA 3C32A 3F11A 1MQJA 1UIUA 4LZ8A 4MH5A 1PDAA 1LBBA 2F8DA 5H8HA 2OLBA 1MXZA 4NF4B 1MM7A 4EF2A 5JK4A 5ELVA 1MDQA 1DPEA 4HS7A 2DP8A 3GLBA 1LFGA 3Q29A 2DWJA 4R74A 1N76A 3O6GA 4PETA 1A54A 5JTYA 1USYH 2FA7A 4FEDA 1SYIA 4XKNA 4F31B 4OFOA 1YAEA 5DEXA 1POTA 1URDA 3SETA 2F6GA 1PEBA 4TOZA 3KFMA 1MPCA 1Q1KA 3ZKLA 4GF8A 4OETA 1SQYA 4QFLA 5AA2B 3T9UA 1O7TA 5AA2D 4R2FA 2AIXA 3S4UA 2QL3A 1FW0A 2IEEA 4Q30B 1N84A 1MXUA 1OLCA 4IB2A 2AL4A 1FTLA 4P11A 4BDMA 4NWDA 5I57B 2WKYA 3TODA 3IK6B 3N26A 2UVHA 3LUYA 1O64A 1R1NA 3QIMA 2Q89A 3R6UA 4KHZE 5ICQA 3A09A 5A5XB 4F29A 2Z23A 4U4SA 3N6UA 1T0KA 4GD5A 4F2OA 4RNSA 3EN3A 2I4CA 4GRKA 1IIWA 1QUJA 1A99A 5HPQA 3CSGA 2DWIA 4KI0E 4XKPA 5FHOA 3PPOA 4U1OA 1SW1A 3VVFA 4R2BA 4FECA 1Y3PA 3FXQA 1N3WA 3T9VA 3U93A 2DS9A 3UP9A 5I58B 3MVZA 5AA1A 3FVNA 3H03A 1D9VA 1MPBA 4RPOA 4R9GA 1N04A 3CVGA 2XX9A 3K6WA 3PD8A 3S9NC 2ZYMA 1UIVA 3PU5A 4OFLA 3WAEA 4L17A 1GVCA 3MW0A 3CR9A 1I6AA 2HZKA 2R9JA 4POWA 2Q88A 3VVEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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