4G2ZA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with mefenamic acid at 1.90 a resolution
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
b'YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of C-lobe of Bovine lactoferrin Complexed with Mefenamic acid at 1.90 A Resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
molecule tags Metal binding protein
total genus 117
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2012-07-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4g2zA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4g2zA02
3K6XA 4ZEDA 3IJOB 3K6WA 1Z7NE 3KEIA 2I3VA 2ZYMA 3IB0A 5CMBA 1B32A 1H76A 1UIUA 1B4HA 2D21A 2Z23A 3TUSA 3OO6A 3K1MA 4U4SA 5AA2B 1LB9A 4ND9A 1MXZA 3MUQA 2NOOA 3P7IA 4DXUA 3CR9A 1SI0A 5I56A 4JSDA 1OLCA 1MQHA 3T9XB 3H4ZA 3KOSA 4EQ7A 3O6HA 3DLNA 4PFWA 3B6TA 1PC3A 4LUBA 1O64A 4U23A 1XT8A 1PEBA 1A8FA 2A5TB 4NF6A 1JQFA 1MDP1 4NTLA 3N6UA 4FAJA 1JW4A 2F97A 4ZEIA 1I6AA 3EHTA 3SKPA 5IAIA 3Q25A 5AA2A 1S7YA 3EF7A 3H6VA 3D4CA 1O7TA 5HPQA 1A7LA 3CSBA 3MJNA 1ZJLA 2ZNSA 3N6TA 2ABHA 3VDFA 4AB6A 2GFEA 2O68A 1IXHA 3QIMA 3KN7A 4ZE9A 3C36A 2A5TA 3QSLA 3KGCA 4ESXA 4F19A 1YAEA 4QFPA 1NH8A 1MXUA 2ZNUA 4Q5TA 4ZZEA 1DSNA 3K01A 1FTKA 4ZZAA 3MQ9A 4OQOA 3U92A 1P1UA 3FATA 3HN0A 3E3KA 4LZ8A 3H06B 2VP1A 2WKYA 5DVIA 3UK4A 2XXRA 4IGTA 4X1DA 4IGRA 3HSTA 1VSOA 3RY3A 3S9NC 2G29A 3CVGA 1NNFA 2DP8A 4IO6A 2F35A 4DE8A 1LSTA 3FXUA 5EHSA 2RCAA 4C0RA 3TCHA 1O63A 2O51A 1TWYA 2BJJX 2GHBA 4POWA 2I49A 3KJTA 3K6VA 2PBWA 5CI5A 1BIYA 1Y3QA 3C31A 1R9LA 4MH5A 3T9VA 4JSOA 1SW4A 4KR5A 1A54A 3LR1A 1D3KA 1LLSA 4TQUQ 4KQPA 1IXIA 1LAGE 3G3HA 2XXQA 5L8DA 1B3GA 3JV9A 3WAFA 1YTVA 4YU0A 4F22A 3QXMA 1MY1A 2M8CA 3MW0A 3K1NA 2Z8EA 4F39A 5H8FB 4R2FA 3M3FA 2DE3A 3U8QA 4F3PA 4G8HA 1GV8A 3FUZA 2REGA 4U1ZA 1XVXA 2F34A 5DVJA 2REJA 4BDNA 3H6UA 4Q0CA 3IO6A 3AXFA 3UP9A 3IB2A 1M5CA 1JETA 2DYXA 1UTBB 5FTIA 2DQVA 2HAVA 3I3VA 1NNPA 2X26A 3FD3A 3FJGA 3JYRA 1B5IA 1B3EA 4F18A 2ZYKA 1QUJA 5H8FA 2DWJA 1YPNA 2H98A 2PMSA 2P1SA 4EDPA 1LFHA 3OSQA 4ECFA 4GVOA 1QVSA 3I6VA 4YAHX 5EHMA 1SVXB 2OJTA 1MDQA 1B58A 5I2NA 2GH9A 4XKPA 4MLVA 1A99A 2F7AA 3MZ1A 3RUMA 5H8HB 4RA1A 3IO4A 3A3UA 3FVKA 3E9XA 1URSA 1UTBA 1PBQA 3FASA 3MBPA 2F6GA 3TTNA 4JB7A 1YCJA 1GTKA 1IEJA 2DOJA 4I1DA 4XKQA 1B7ZA 2RC8A 1LCFA 3V8XB 5FHNA 4G68B 2O84X 1POTA 3M3LA 2Q88A 1NL5A 2VOZA 1BLFA 1LGBC 1B3FA 2PT1A 2UVJA 1H3DA 4R9GA 3MP8A 3EN3A 3SEVA 2ESNA 3LSWA 5JEIA 1LBCA 3VLWA 5BUUA 1MH3A 3VV5A 3MZ9A 1B3HA 1P99A 4QRZA 5H8HA 1MXWA 4ISUA 4OERA 4IY5A 1IIWA 3Q27A 1B05A 3RLFE 1US4A 4OESA 3S9LC 4OFLA 3MAMA 1IZ1A 4U1OA 3T93B 3U94A 1IQ7A 1B0LA 4G68A 3QK6A 3U93A 4E0WA 1MY0A 1Z7ME 4IO2A 3OSRA 2Y7RA 3HCQA 3L6HA 4OHNA 5KDTB 3VVDA 4KYEA 4OEUA 1LAFE 4R75A 2QS1A 4LATA 3KZGA 1R6ZA 3A09A 4F3GA 2P0SA 2R71A 3OEKA 3ILUB 3HV1A 2X7QA 1J1NA 5B70A 1P1OA 4P0IA 4F3SA 1R1NA 3RTWB 1MPCA 1LB8A 4H6DA 4YB7A 2FYIA 3TCGA 2I0BA 4OMBA 3CFZA 3CIJA 1F9BA 3TTKA 3SETA 4ELPA 4NEDA 1S50A 2ZNTA 3E4RA 4Z7EA 2R6GE 5H8SA 1MG1A 2Q89A 1PDAA 4O3AA 1DTZA 2DWHA 3RTFB 4H0WA 1B51A 1N84A 2UVHA 1SQYA 4WXJA 4N07A 2XD2A 1Y1ZA 4R6HA 3G3JA 3PU5A 3C35A 4IO3A 2B3BA 1I6QA 5FTHA 2ZXTA 4EQ9A 4ELOA 1ZTYA 1TFAA 2OBGA 3S4UA 3B7DA 1NFTA 2B65A 3ONMA 3HHGA 5EYFA 2V93A 2F36A 3IOTA 1SW2A 3C32A 1NH7A 3KOTA 4N6PA 4OTEA 1Q35A 3OELA 4G4PA 3VVFA 4HTGA 4JXIA 4RY1A 1AOVA 1MM6A 3VVEA 4KYSA 5H8NB 4RXLA 1QKBA 2NUVA 1JVYA 4TLLB 3MPKA 1QW0A 4NF5B 2NXOA 5A5XA 3FZVA 3RPWA 1SW5A 4G2ZA 1AH5A 3OD7A 1FCKA 2DSFA 2H5YA 3T96B 4U21A 5CBRA 4WKMA 3N5LA 4XTCQ 1NNTA 3KJ7A 3TELA 5J1DA 2RCBA 1UTHB 2Q2CA 1JEVA 4K3FA 1ZLQA 1URGA 3TEPA 4QHQA 2ZYNA 2CZLA 5LOMA 2PT2A 2AYSA 2DWIA 3HO7A 3MVWA 4KPTA 5AA3A 5H8NA 1XHYA 3GBBA 2ONSA 4U2RA 5BWJA 2RC7A 5ICQA 4KCCA 3SEYA 5AE4A 4NF5A 2UVIA 3KBRA 3ILTB 3IOWA 1Y3NA 4R74A 4DXBA 3EQ1A 2A5SA 3CG1A 1BKAA 5K2XA 3PUWE 3T22A 1OIBA 3BFUA 1N7XA 3O2AA 2XXTA 5FHMA 2ONRA 4GOTA 3RGYA 3O97A 3ODBA 4HCWA 2RF1A 1RYXA 2QPQA 2OK2A 1UTHA 3BFTA 1VFDA 3RN8A 1R9QA 3KFMA 1OQHA 4H8IA 4QFLA 5JK4A 1PB8A 3W15C 1B40A 1PB7A 1NNKA 2XD3A 3PMVA 1MRPA 2I48A 4LZ5A 4GL8A 1B3LA 4LQ5A 4ZDMA 4JWYA 3K1PA 4UACA 5AA2D 1EH3A 3IJXB 2D5WA 3O66A 4DXCA 2IA4A 2Q8JA 2Z8FA 4U22A 3KN8A 1P1WA 5ITPA 2RC9A 1RYOA 5CMCA 4ONYA 3RT8A 3M8UA 3S9EA 4F29A 3MVZA 1PBPA 3QUFA 2V3UA 4DCXA 1QUIA 3T9UA 2THIA 1FW0A 3JZJA 4BDQA 1S9TA 5I2KB 3ZKLA 2CMOA 4NF8B 4H5FA 1FTLA 4RJZA 2O69A 2XX9A 4BDMA 3IR1A 1LAXA 3G3FA 3PPNA 1DPPA 4IB2A 2P2AA 4ZS9A 4EXLA 1Y4CA 1B46A 3IORA 1CE2A 1SBPA 1HSJA 3UIFA 1H44A 2W7YA 5CM6A 4DDDA 3U1OA 3VLVA 3H6WA 2VD3A 3IOVA 3LSXA 3FIRA 1EU8A 4DIGA 2ONKE 4NF8A 5CBSA 3FGSA 3L6GA 4L17A 2OWSA 5L9SA 2PVUA 2DXYA 5CRYA 1MPDA 1A55A 1B5JA 1XC1A 3IX1A 5I57B 3T66A 4C1TA 3W9WA 3TFLA 3SDFA 1BP5A 1N3WA 1MY3A 1ZU0A 1A8EA 2QS2A 3PPQA 1XS5A 4PP0A 3IL1B 3ECRA 3R7XA 5I84A 1OVTA 5AA1A 5F1QA 5FHOA 3KSJA 1MXVA 4BLAA 1M5EA 2YLNA 3UGWA 3PUXE 1NMUA 4NE4A 3THIA 1ZKBA 3CG3A 4FJPA 2G93A 4MLQA 1FQFA 4R73A 4F1UA 5CMMA 4OENA 3F11A 2AIXA 2QJEA 4KFQA 1N3XA 4GFRA 3ZKKA 1FTMA 3C4MA 3CI8A 4GQOA 2O6AA 2VGQA 4U4XA 2XXYA 2O1MA 3C33A 2UXAA 3OO8A 3PD8A 1IXCA 4O3CA 1M5BA 1H43A 3D4GA 3HPIA 1N04A 3OO7A 5I58B 4YMAA 3TDJA 3FXRA 3CFXA 1JW1A 1AIVA 3CFLA 2E1SA 3TMGA 3MWBA 4NF4B 4HW8A 3S9MC 1Q1KA 5CC2A 1JEUA 2HXWA 2HZKA 4YICA 5L9MA 4PFUA 3IK6B 4PE5B 5TPAB 4ZE8A 5IKBA 4IY6A 4X1BA 4YKKA 3TZAA 1DTGA 3V5AA 1B9JA 2DE2A 4WEPA 4RK9A 2YJPA 1TXFA 1FQAA 1OQGA 1I69A 2DVCA 1B0HA 3IOUA 5I58A 3K0VA 3SERA 3FVGA 4GXAA 3PMXA 3LUYA 1LFIA 3VLUA 3FVOA 2Y84A 5DEXB 4P11A 3H03A 3O6IA 4I62A 2I4CA 5CMKA 4NF4A 1MY4A 4HCYA 1Y3PA 3TCFA 3PD9A 1B7UA 4ZEKA 3K2DA 3N26A 5TPAA 3K02A 5B7DA 2FNCA 3SESA 4M4GA 1SD3A 3IB1A 4GIZA 1VE4A 1M5DA 3S2VA 5HM4B 2AL4A 5HBCA 4M1VA 3O29A 4YKJA 4JWXA 5DYHA 4IO5A 1EZOA 4EXKA 2QMXA 2XX7A 5KDTA 5DEXA 1B1XA 1MM7A 3QAXA 4YKPA 5KCJB 4POXA 3KG2A 4LQ2A 1KWHA 5I59B 1N76A 2V25A 4AQ4A 1ANFA 1FQBA 5JTYB 4QF9A 4F2QA 1OLAA 2RKMA 3UORA 2QRYA 2O1LA 2HAUA 2F5XA 2Z22A 3MP1A 2HFBA 3FVNA 3OOAA 3FJMA 1Y20A 3DP6A 3TODA 1JW5A 1DPEA 4YKIA 1JVXA 5ISUA 1OMPA 1EZ9A 4H1XA 2ZYOA 4RPOA 4RK2A 3I5OA 3MPLA 3G3IA 5I59A 3KN3A 1FQDA 4GXSB 4DZ1A 5JTYA 4RNSA 4I9DA 1UIVA 1FTOA 3ZS6A 3FXQA 1USYE 5TU0A 1LFGA 3TTMA 3LSLA 4R6YA 3FJ7A 3OEMA 4TOZA 5AA4B 2O7UA 1IITA 3OO9A 3N94A 5F7VA 3QUJA 3USDA 3K4UA 3Q29A 1LCTA 4G8NA 1P1QA 1A40A 4OZ9A 2F8DA 1N0TA 1B52A 1LBBA 3RQTA 5L9OA 3GLBA 3O9PA 3B6WA 2I58A 2H4IA 1WODA 3OENA 3V89B 3TQWA 3PPPA 4Q30B 4X48A 4RPNA 3K6UA 1SYHA 4XKRA 2HQ0A 4C1UA 4JWOA 2LAOA 1GVCA 5AA4A 2F78A 4LA9A 3G3GA 2XXIA 1SDXA 2UYEA 2PX1A 2VD2A 4OEVA 4EF2A 3GXAA 4OETA 2FA7A 2Y7IA 4LVQA 4NMYA 4X9TA 1FTJA 1UQWA 2GHAA 2QL3A 3Q28A 1MPBA 1MQDA 3T9HB 2I4BA 3A3CA 4ZEFA 2GRVA 4OFJA 3MC2A 4KD5A 2QS3A 3DP4A 3MVXA 1PB9A 4FORA 3GZGA 2XHDA 4LZ7A 4DLDA 3SEWA 4OYVA 1POY1 2O7IA 1D9VA 1IUDA 2ALUA 4G77A 4OXVA 3C34A 5H8QB 4KI0E 4KHZE 2YPNA 3TQLA 2Y7PA 1NKXA 4YZZA 4GRKA 1HSEA 2I3WA 1QJMA 1MH4A 3PMWA 2F6PA 4OVJA 2F7CA 3Q26A 4QFKA 3G3KA 2Q9TA 1QKAA 3MVYA 1L5TA 2QMWA 3O28A 4R6KA 4FE8A 3O6GA 3PPRA 4RYAA 3MZBA 3OXNA 4OWDA 3VE1B 4GD5A 5H8QA 4BDOA 3RNNA 2AL5A 4G68C 2DXRA 3LC8A 2DS9A 4MBPA 3LBSA 1USYH 4PETA 4PFYA 5I2KA 2OCUA 3R6UA 4BDRA 1TT1A 1II5A 2ANJA 3PGFA 2IEEA 4F1VA 4UA8A 4F2OA 2HZLA 4F1YA 1AL3A 2V3TA 3TAJA 3PPOA 2PYYA 1US5A 3C9HA 3PUYE 1XOCA 1B4ZA 2DVZA 3PUVE 1MS7A 4JBZA 4MFIA 5I2NB 4YMBA 1Y4TA 1SI1A 3KSXA 2X7PA 1OVBA 4R2BA 2V3QA 2I6EA 4FEBA 3BBRA 2XXWA 4KYDA 1MY2A 3DELB 1Y9UA 1ELJA 4F3BA 5DT6A 5K2YA 1IXGA 4QSDA 1JNFA 3TTLA 1B5HA 2QS4A 3CSGA 5I57A 3EHSA 3M3KA 3E13X 2QSXA 4YB5A 1CB6A 4I8CA 4OFOA 5ICTA 3H7MA 4FECA 2XXPA 3MP6A 4KCDA 2XX8A 3DM0A 1LAHE 3OMBA 3PUZE 4EF1A 4WEDA 3VXCA 3VFJA 2H99A 1AMFA 3H6TA 1SW1A 4Q8RA 4H5GA 4H65A 5DTBA 1GR2A 1HSLA 3IAZA 4P0GA 1P1NA 3B6QA 3EHUA 4EQBA 4LP2B 1ATGA 3CRBA 2Q2AA 4AB5A 1FQCA 2DE4A 2F7BA 1D9YA 2NVUB 4BDLA 2I0CA 4FATA 4TLMB 3H3GA 3LSFB 1QULA 3R26A 2NWJA 1ZMGA 3DP8A 1ZBMA 3FV1A 2HCAA 3UN6A 3TTRA 1FQEA 1TFDA 4ESWA 4ZEBA 4DCYA 5M2VA 1SYIA 1N7WA 2Y7WA 4H8JA 4QSCA 4GWOA 4PQJA 1VFEA 2H25A 2HEUA 4R9FA 4MF3A 1MXXA 2B3FA 4FEDA 3V83A 3BKIB 4THIA 1Y1MA 4N13A 4NWDA 4JDFA 1MXYA 5ITOA 1B2HA 2XXHA 5TP9B 4ZECA 3EPEA 2V84A 1D4NA 1EZPA 1BTJA 4F31B 1URDA 3VXBA 4QSEA 3U72A 4XKNA 1B1HA 4E0XA 2XXVA 2R9JA 4H67A 4ELRA 1I6BA 4YB6A 4XXUA 3QYTA 1ZIUA 3TYHA 4IO4A 1B7HA 4GL0A 2OZZA 2Y7KA 5KZTA 3UA8A 2XXXA 1RKMA 4LONB 1MQIA 3SEUA 5DVFA 3PV0E 4ELQA 2DWAA 4G8MA 4IO7A 4XIGQ 2UYFA 5ELVA 5A5XB 1GGGA 1DMBA 5TP9A 4FIMA 2Z8DA 3K00A 3TPAA 3ZSFA 1WDNA 2KLFA 5KCJA 1DOTA 1MQJA 3W9VA 1VR5A 4QFOA 4R72A 4O3BA 4Z0IA 4QFNA 2XXUA 3WAEA 3RT6B 4HS7A 3SEXA 4EUOA 2D3IA 2H9BA 2VHAA 5I56B 2UVGA 2ZMBA 2OLBA 3G7WA 1T0KA 1H45A 4NWCA 4GF8A 3FV2A 1XVYA 1QUKA 4PFTA 2E0SA 1MQGA 3TKDA 1M5FA 1B6HA 3GBAA 2OWTA 1WVJA 2RINA 3HHFA 4GLIA 4NF6B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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