3T9UA

Cnqx bound to an oxidized double cysteine mutant (a452c/s652c) of the ligand binding domain of glua2
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGCRDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDCGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mechanism of AMPA Receptor Activation by Partial Agonists: DISULFIDE TRAPPING OF CLOSED LOBE CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t9uA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t9uA02
4OFJA 3G3JA 3V5AA 1B3FA 2ONSA 2DWIA 3IOVA 4QFOA 4P11A 1M5BA 3PUYE 3JYRA 4MFIA 3TELA 1DSNA 1B32A 2V93A 3G3GA 1MQJA 1MXZA 1URSA 2DVCA 2XXUA 3ODBA 4KYEA 1B1XA 2QMXA 1H43A 4OXVA 2F78A 2DWHA 3C32A 4DE8A 1B6HA 2RC9A 3O9PA 4OFLA 3UA8A 1S50A 2ZXTA 3RT6B 3RT8A 2AIXA 2H5YA 1BKAA 1B7HA 4AQ4A 4JDFA 4KPTA 4RYAA 1AH5A 4C0RA 4HTGA 4DDDA 2ZYNA 4H65A 3UK4A 4BDRA 3SEXA 3VXBA 4RXLA 4YICA 1OVTA 4LZ7A 4TOZA 1PEBA 1ZTYA 1UTBA 3KN3A 2IA4A 2Q88A 1JW1A 4NTLA 1USYE 3T9VA 1US5A 1N7WA 3MW0A 2RC7A 1YCJA 2DP8A 1I69A 4YKKA 4YKJA 4PFWA 2E1SA 4N07A 3EPEA 4OERA 2XXIA 2O6AA 1MQIA 3LR1A 3KOTA 1D3KA 3TTLA 3KBRA 3PPNA 5H8FB 1MQGA 5HBCA 3IJOB 2UVHA 1A54A 3H6UA 4O3CA 5AA4A 4IO7A 1LGBC 3FATA 3VLUA 4H8IA 2P1SA 4NF4B 3CI8A 3HN0A 3OELA 4U1ZA 1B3GA 1FQBA 2UYEA 1LAXA 2Y7KA 4RK2A 4BDOA 5I58A 3CG1A 1MH4A 2UXAA 4KYSA 1URDA 2M8CA 3IB2A 1MS7A 1QUIA 2F36A 2W7YA 5TP9B 2Y7RA 5J1DA 4F29A 2QS1A 1MY4A 4U1OA 3IL1B 1POY1 2R71A 3O2AA 3KJ7A 2QPQA 1JNFA 4IO4A 1B46A 3BFUA 1B0HA 3A3CA 5DVIA 4NWCA 3VVDA 2KLFA 3GLBA 1B1HA 2GH9A 5BWJA 2XXTA 2ANJA 4FEDA 5I56B 3T93B 4YB5A 3W9WA 3UGWA 4F1YA 3LC8A 1ZJLA 1OQGA 2YPNA 3TQLA 4Z7EA 2NOOA 3WAFA 3CG3A 1O64A 4KD5A 3K6XA 2HCAA 3K1NA 3PPOA 3H06B 1EZPA 2DE4A 4G68C 3EQ1A 1FQCA 1R1NA 2RC8A 3QUJA 1LB9A 2NWJA 3PUXE 2P0SA 1UQWA 4WKMA 1PBPA 4ZE9A 4QFNA 4ZE8A 4JWOA 3KJTA 4BDMA 2DQVA 1EZOA 4L17A 1LAFE 1MY0A 2I6EA 2ZYKA 2D5WA 5L9SA 1POTA 4DCYA 4IO5A 3K01A 2V3TA 4OQOA 4DXBA 1MXVA 3MZ1A 3OXNA 3FIRA 3FZVA 1P1NA 3T9UA 4LATA 3UIFA 4ELQA 1QUKA 3A3UA 3OEMA 4GFRA 4WEDA 3ECRA 2AL4A 1OVBA 4EQBA 1ZMGA 4IO6A 4I8CA 1XOCA 5H8QA 4BLAA 2V3UA 3W9VA 1NNKA 3MP1A 4NF6B 4RK9A 2B3BA 3SEUA 3CSBA 3Q29A 1AOVA 1QKBA 4EUOA 1Z7ME 1PB8A 1P1OA 3VDFA 3RTFB 2Z8DA 4YB7A 4RJZA 5CMBA 4E0WA 5IKBA 2UVGA 1IIWA 4KR5A 2ZMBA 1RYXA 2HZLA 2IEEA 1GR2A 4LZ8A 2A5TB 3T9XB 1P99A 3EHSA 1MY1A 4E0XA 5DEXB 3LSXA 4DLDA 4H6DA 4ZEIA 4OZ9A 5CC2A 3BFTA 2F34A 3IO6A 3VVEA 1NKXA 3UP9A 4PQJA 3QXMA 2GRVA 1N76A 1FTLA 1UIUA 4ZECA 1AIVA 3I6VA 4P0IA 3K6WA 5JTYB 5I57B 5CMCA 1ELJA 5ICTA 3THIA 2Q89A 3ILUB 5AA1A 3U93A 2RCAA 1SDXA 4QHQA 4ZDMA 4BDLA 1R9LA 2O1MA 4DXUA 1XC1A 3C9HA 4Z0IA 2XX9A 4F31B 3MZBA 2Q2AA 3BBRA 1NH7A 2Z22A 4LUBA 3PUZE 1HSLA 1LFHA 1USYH 1B0LA 4DIGA 1FQAA 1NMUA 2P2AA 3TTKA 1Y1ZA 3ZKKA 4F1VA 5FHMA 2XHDA 4WXJA 1B4HA 1JW5A 1Y3QA 3BKIB 2NXOA 4R2FA 1RKMA 1P1WA 3E13X 4N13A 2O84X 1MY2A 2I4CA 3LSFB 3CVGA 2QS3A 2D3IA 1A99A 1Y3NA 3EF7A 1NL5A 3OENA 4R6HA 4QSCA 4R9FA 1LSTA 2H9BA 3R26A 3DM0A 4NF8B 5A5XB 1KWHA 2PMSA 2B65A 3U92A 3MVXA 2Z8EA 5AE4A 4UA8A 3RGYA 1DPEA 4JB7A 3C34A 5KCJB 2Q8JA 1PB9A 4EF1A 2OZZA 4ESXA 3MVZA 2NVUB 1ZLQA 3TODA 4XKNA 2I0BA 4KCDA 1MPDA 4LZ5A 3IB0A 2XX8A 1UIVA 5TPAB 4RPNA 3C33A 3A09A 1OLCA 1M5CA 5DVJA 5ISUA 3KOSA 4NEDA 1ZIUA 3OSRA 2O51A 3IJXB 3H03A 5H8FA 4MLQA 5ICQA 4KHZE 1US4A 5ELVA 1O7TA 3O29A 1LBCA 2V3QA 1Y20A 4NF4A 4Q0CA 2V84A 2CMOA 2Q2CA 4OESA 1DPPA 2ZNSA 4F2QA 4ZEFA 5H8SA 1VFDA 3IAZA 4LP2B 1H45A 2I49A 2Y84A 1SD3A 2R9JA 4H5FA 5TP9A 1UTHB 3TDJA 4M4GA 1LCTA 3H4ZA 4QF9A 5FHNA 1B3HA 1VFEA 3GBAA 3O28A 4G2ZA 1P1UA 4JSDA 3AXFA 2PYYA 5CMKA 4H0WA 3VE1B 4BDQA 1M5FA 4U23A 4LVQA 3RPWA 2QRYA 3RLFE 1S7YA 4OEVA 4R72A 3TPAA 2ESNA 2VD3A 5TU0A 1I6AA 4ZS9A 3PPPA 4R9GA 5CI5A 4R73A 2OBGA 4MBPA 1GVCA 3OO9A 4GQOA 5I56A 3HO7A 3K0VA 3PUWE 1B7UA 2OJTA 4OVJA 4R6YA 1H3DA 4OENA 1LB8A 3M8UA 2F7BA 4TQUQ 2CZLA 1QUJA 2F35A 2PBWA 5I2NB 1MM6A 1IXGA 1PB7A 4G8HA 1N0TA 2QJEA 1Z7NE 3OOAA 1NNTA 4YZZA 4KYDA 1JEUA 1DOTA 3FVGA 1H76A 3E9XA 3Q28A 1WVJA 4QSEA 1YAEA 3VV5A 2GHAA 1IXIA 3PGFA 3IOWA 5L8DA 2AL5A 3U94A 4IGTA 3LBSA 1TFDA 1JW4A 4OTEA 1MDP1 3GZGA 4NE4A 3T9HB 1ZKBA 3VLWA 3KN8A 4EXKA 2OWTA 3TUSA 1XT8A 5CMMA 3VXCA 2HEUA 2PT2A 5ITOA 3KGCA 4X1DA 3K00A 5EHMA 2R6GE 3JZJA 3RUMA 1LBBA 3FGSA 5M2VA 4NF5B 2H4IA 4H67A 2QS4A 4NF6A 3TMGA 1SI1A 3S2VA 1M5DA 4QRZA 4KI0E 1A8FA 2HZKA 5LOMA 2F7AA 4FATA 3PPQA 1Y3PA 1ZBMA 3USDA 3TTMA 1MXUA 3OSQA 4G68B 4FORA 4OEUA 1TT1A 1DMBA 4I1DA 5DT6A 5DTBA 5H8NB 5KZTA 2A5TA 3FASA 2VP1A 5BUUA 2DOJA 3ILTB 3K1MA 4YMAA 3H6WA 1A55A 2XXVA 1R9QA 5AA2B 3PMWA 5DEXA 3FV1A 2Y7WA 1MH3A 3QAXA 4F3PA 2A5SA 1IZ1A 4R74A 3VLVA 4NMYA 3P7IA 3FXRA 4OWDA 4RY1A 3QSLA 1IXHA 4JSOA 2DWAA 3T22A 3SEYA 1MPCA 2X7QA 2VGQA 2QS2A 1H44A 3G7WA 5JTYA 5CM6A 4G8NA 5I57A 4H5GA 4IY5A 3KZGA 3QUFA 1FTKA 2X7PA 4G8MA 4NWDA 3MC2A 3RTWB 3O6HA 1WODA 3IX1A 4GIZA 2PX1A 3GXAA 4QSDA 4R75A 4R2BA 3ZKLA 1SYHA 1A8EA 4IO2A 3U1OA 1LCFA 2XXYA 3C36A 5FTHA 3M3KA 3K1PA 3V89B 2DSFA 5JK4A 4I9DA 2X26A 3MQ9A 2ZNTA 3V83A 4XXUA 1VR5A 5DVFA 4U2RA 5IAIA 4FJPA 2PT1A 1Y1MA 2DE2A 3CFZA 3PD8A 4G4PA 1S9TA 1MXWA 1HSJA 5I59B 1MRPA 1J1NA 2QSXA 4Q5TA 3N26A 1FQFA 5L9OA 4U4SA 2RKMA 4XKPA 1T0KA 3SERA 2O7UA 1WDNA 2GFEA 5A5XA 1I6QA 4FE8A 4RNSA 4PFUA 5FHOA 3Q26A 4K3FA 4GXSB 2ABHA 1B7ZA 1JEVA 2H25A 5KCJA 1QJMA 2RINA 4IB2A 4EQ9A 1PDAA 3LSWA 2NUVA 1M5EA 4HCYA 1XHYA 3FJGA 2DYXA 4QFPA 4LQ2A 5TPAA 1SW2A 2ZYOA 4POXA 2OLBA 3TCFA 4KQPA 2HXWA 3FJMA 4POWA 4OETA 1EZ9A 2ZNUA 4F18A 4YKIA 4DZ1A 4ELRA 2DXYA 1SVXB 4EDPA 4C1UA 3VFJA 1MY3A 3L6HA 2AYSA 2F97A 2OWSA 2YJPA 1SI0A 4F19A 5CBSA 4RPOA 3R6UA 1L5TA 2HAVA 4F3BA 2VHAA 1SBPA 2I4BA 4JWYA 3EHUA 5B70A 4DXCA 3M3FA 1B05A 4P0GA 4JBZA 1AL3A 4OYVA 1UTHA 5HM4B 4HW8A 3RNNA 1MQHA 5I84A 3SDFA 1NNFA 3CRBA 3IR1A 2YLNA 3Q27A 3MBPA 2Z8FA 4AB6A 4EF2A 3U72A 1PBQA 5CBRA 3I5OA 1CE2A 3DLNA 4YU0A 2XX7A 1DTZA 3K02A 4IO3A 2ALUA 3TZAA 2O68A 3UORA 3H6VA 3HV1A 5KDTB 3IO4A 3MZ9A 2E0SA 1VE4A 3D4GA 3SKPA 3OD7A 5CRYA 3TYHA 4FECA 1FQDA 1YPNA 4MF3A 3O6GA 3DP6A 1URGA 1OMPA 2LAOA 5I2NA 3PUVE 3V8XB 4U22A 2XXHA 4YAHX 2Y7PA 1N84A 4GD5A 1LFGA 4WEPA 1TXFA 2V25A 3E4RA 1A40A 4ECFA 2QMWA 1O63A 1B40A 1QULA 4F3SA 1IEJA 3D4CA 3CSGA 3PD9A 3M3LA 4HS7A 4ONYA 3B6TA 2F5XA 4C1TA 1FW0A 3G3KA 3RY3A 4PFTA 3HHFA 4ESWA 1SYIA 2O7IA 1HSEA 1B5JA 1MG1A 2I3VA 1Q1KA 2G29A 1ANFA 4X48A 5K2YA 1Y4CA 1MPBA 3KG2A 1B2HA 1SW5A 3G3HA 1ATGA 3FUZA 3FD3A 2F7CA 3ZSFA 1EU8A 4IY6A 4NF5A 2REJA 3LUYA 3SETA 3UN6A 3F11A 3IORA 3SESA 5I2KB 1TFAA 3DP8A 1F9BA 1QVSA 2XXXA 3FXUA 3E3KA 1D4NA 3K4UA 3S9LC 3H7MA 3O6IA 1SW1A 1MXXA 1FTOA 1OIBA 3GBBA 5H8HB 4G68A 1SQYA 2QL3A 2FA7A 5H8NA 2WKYA 3G3FA 2DVZA 2THIA 2Z23A 5AA2A 3ONMA 3RQTA 4PE5B 2Y7IA 2GHBA 3PU5A 4KFQA 1PC3A 1B4ZA 1FTJA 4LONB 1GTKA 2REGA 3CIJA 3O66A 5JEIA 3SEVA 4ISUA 3IK6B 2UVJA 2I58A 3CR9A 5B7DA 1OLAA 2FYIA 3N6UA 3HCQA 4F39A 3N5LA 1Y4TA 3B7DA 4I62A 4O3BA 1XS5A 4TLMB 4ZEKA 3TFLA 5EYFA 3U8QA 2BJJX 3WAEA 3H3GA 1B3EA 3FV2A 1QKAA 1UTBB 4ELPA 3KSJA 4PP0A 3TKDA 2OK2A 3TTRA 2FNCA 2UVIA 1NH8A 3MVYA 3S9MC 5K2XA 1B9JA 5L9MA 2HAUA 2RCBA 3MAMA 5EHSA 1BTJA 3QYTA 3KSXA 3B6QA 3OO7A 1TWYA 1MM7A 3HHGA 2I3WA 3HPIA 4PETA 3MPLA 4GRKA 4EXLA 2HFBA 3C4MA 5I59A 2XXWA 5AA4B 2H98A 4R6KA 4ZEBA 4XKQA 4F3GA 3ZS6A 1MXYA 4TLLB 4DCXA 3C31A 3FXQA 3N6TA 4ZEDA 1FCKA 1N3XA 1B5HA 3O97A 3OO8A 3IOTA 3T96B 4X9TA 3KN7A 1CB6A 2ONKE 5I58B 2DXRA 3H6TA 1RYOA 3I3VA 1I6BA 1JETA 1LFIA 1B52A 4JWXA 1B5IA 1MDQA 4XIGQ 2I0CA 1FQEA 3N94A 4HCWA 2RF1A 3SEWA 3CFXA 4MH5A 4OFOA 1NNPA 1MQDA 4LA9A 3PMXA 4GL8A 1Y9UA 1N3WA 4XTCQ 3QIMA 4F1UA 4GWOA 2ONRA 4MLVA 4N6PA 3EN3A 1AMFA 1LLSA 3KFMA 4JXIA 1B3LA 5F1QA 2DWJA 5F7VA 1JVYA 3FVOA 4H8JA 2O69A 5ITPA 2VOZA 4Q8RA 4M1VA 1B58A 4ELOA 1YTVA 2XXRA 4GXAA 1QW0A 1DTGA 2XXPA 4GL0A 2PVUA 2OCUA 4NF8A 4O3AA 2XXQA 1XVYA 3R7XA 3Q25A 1IQ7A 1IXCA 1Q35A 3CFLA 3TEPA 4GLIA 1OQHA 3DELB 3T66A 2D21A 3PPRA 3MVWA 1VSOA 3KEIA 4QFKA 1LAGE 1LAHE 3JV9A 3IB1A 4YB6A 1B51A 3TCGA 4F2OA 4GF8A 3MWBA 4ZZEA 2F6GA 3MP8A 1R6ZA 4AB5A 1BP5A 3MJNA 5KDTA 2F8DA 2H99A 3S4UA 3K6VA 4Q30B 2DE3A 2VD2A 4ND9A 1SW4A 5H8QB 3OEKA 5AA3A 3TCHA 4FAJA 1N7XA 4KCCA 3S9EA 4X1BA 5HPQA 3G3IA 4FIMA 3MP6A 4THIA 4U4XA 1P1QA 3OMBA 3B6WA 2O1LA 3OO6A 1JVXA 1JQFA 2XD2A 2XD3A 4LQ5A 4BDNA 1FTMA 1D9YA 3VVFA 3PMVA 4IGRA 4XKRA 5DYHA 2I48A 1EH3A 3L6GA 1A7LA 4F22A 4FEBA 1II5A 3W15C 3FVKA 2F6PA 3TTNA 4G77A 3EHTA 4OMBA 2B3FA 1N04A 1IITA 1ZU0A 2HQ0A 1IUDA 4ZZAA 2G93A 3C35A 3LSLA 3MPKA 4PFYA 3DP4A 1GV8A 3FVNA 3K6UA 4QFLA 4H1XA 1D9VA 4GVOA 1BIYA 3RN8A 4UACA 4GOTA 3TQWA 3IOUA 4EQ7A 5I2KA 2DS9A 5AA2D 1GGGA 3FJ7A 3HSTA 1NFTA 3S9NC 2UYFA 2Q9TA 3QK6A 1BLFA 3PV0E 5FTIA 2ZYMA 3K2DA 3MUQA 5H8HA 4YMBA 1XVXA 4U21A 4OHNA 4YKPA 4RA1A 3TAJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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