3N94A

Crystal structure of human pituitary adenylate cyclase 1 receptor-short n-terminal extracellular domain
Total Genus 154
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
154
sequence length
466
structure length
466
Chain Sequence
IEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTNAAAEFAIFKKEQAMCLEKIQRANELMGFNDSSPGCPGMWDNITCWKPAHVGEMVLVSCPELFRIFNPDQDMGVVSRNCTEDGWSEPFPHYFDACGFDEYE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Membrane receptor
molecule keywords Fusion protein of Maltose-binding periplasmic protein and pi
publication title Crystal Structure of the PAC1R Extracellular Domain Unifies a Consensus Fold for Hormone Recognition by Class B G-Protein Coupled Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 154
structure length 466
sequence length 466
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-05-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF02793 HRM Hormone receptor domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3n94A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3n94A01
3BFTA 4KI0E 2PMSA 4N6PA 1ELJA 1I6QA 3K00A 3H06B 4U2RA 3FVGA 2GHAA 5I2KA 4QFNA 4EF2A 3VE1B 1NNPA 4UACA 2QSXA 2H9BA 4Q5TA 1R1NA 1MY4A 1POTA 3CG3A 4PE5B 3I3VA 4FECA 5CMCA 3QYTA 3UN6A 1N3XA 5EHSA 4IGRA 2IEEA 1Y3QA 4F31B 5AA4A 4KYSA 1GTKA 4NF4B 1LB8A 5H8FB 4NTLA 5HPQA 4BDLA 2DE2A 4XXUA 3S2VA 1P1NA 4F3GA 1JQFA 2PX1A 2X7PA 1UTBB 3SEXA 3U8QA 3R26A 1JEVA 1QULA 5EHMA 3TKDA 2Z8EA 3O2AA 2XXUA 3PD8A 4KYDA 3O6HA 1B52A 1XS5A 4G2ZA 5A5XB 1OLAA 4JXIA 1PC3A 3V89B 4OTEA 3PPRA 4R72A 4EF1A 3HPIA 3ONMA 4LUBA 1MDP1 3O9PA 3T9HB 4BDMA 4LQ2A 3JZJA 5H8HB 2PBWA 3N94A 4DXUA 3K02A 4M4GA 1H3DA 1NH8A 4QSCA 1T0KA 4YMBA 1NMUA 2DWHA 2Z8FA 1MXVA 4UA8A 1FW0A 2AYSA 2REJA 4IY5A 1TFAA 3DP4A 1EZ9A 1SW1A 4OQOA 3DP6A 5FTHA 1LAXA 3MVYA 1I6AA 4R9FA 1B3LA 2ONSA 3HO7A 3SESA 3G7WA 3ZKLA 1H45A 1XOCA 2ANJA 2V84A 1B3HA 5AA1A 1DSNA 3PD9A 3H6TA 3KJTA 2F35A 1JEUA 3MBPA 2VD3A 3C33A 5BWJA 2XXWA 4F3PA 1YPNA 2PT2A 2XXTA 4RXLA 4GOTA 5F7VA 1LSTA 2D3IA 4PP0A 1IXCA 1Y20A 4I62A 4F19A 1B40A 3FXRA 3BBRA 4YMAA 3IOWA 1NL5A 4POWA 3U92A 3KG2A 3QUJA 5FTIA 5KCJB 4E0XA 3GXAA 4C1TA 2VOZA 4X1DA 2F34A 1OQGA 1ZBMA 4G77A 3T66A 2QS1A 1ZIUA 1B5JA 4DXBA 4OESA 3OEMA 3KN7A 4NF5B 4IO6A 1M5BA 1JVYA 1O64A 1LAHE 4KFQA 4XKRA 1MY2A 2XXYA 1IUDA 3FXQA 3IOVA 4BDNA 1YTVA 3M8UA 1I69A 3MC2A 2PT1A 4GVOA 3D4GA 1JNFA 4JBZA 4ZEBA 1B4HA 4F1UA 4H65A 4ELQA 2A5TA 3W15C 2OCUA 1YCJA 1ZJLA 3CI8A 4KPTA 4H67A 1B6HA 2V3UA 3C32A 3TTMA 4PFUA 1IQ7A 3C34A 5L9MA 5BUUA 3E9XA 4O3CA 3G3IA 3A3CA 4BDOA 5L8DA 4LP2B 4R9GA 2O68A 4U23A 3K01A 3MJNA 5TPAB 2F6PA 4ZEIA 4JSDA 2P2AA 2OBGA 3CSGA 2ZYKA 2XX9A 2F78A 1EH3A 3H6UA 5JTYA 4TOZA 5F1QA 4IO7A 4H0WA 4ZE8A 2Q9TA 5CRYA 2HZLA 3CRBA 4NEDA 4OHNA 3ZKKA 2O7IA 4U4XA 2DP8A 4NWCA 4G68B 2UYEA 4EQ7A 3EN3A 2F7AA 3K4UA 2XXPA 4IB2A 1BLFA 1MQJA 1N7WA 1PDAA 4OWDA 5CBRA 4LZ5A 1JW5A 4IO4A 3OO6A 3VV5A 4U22A 3ODBA 3CIJA 2OJTA 4H8JA 5AE4A 1AH5A 1OMPA 3RT6B 4DZ1A 1WVJA 5H8QA 5HBCA 2F7CA 4F29A 2I3VA 2WKYA 1P1WA 4EUOA 4OFOA 3H6WA 1MDQA 3KOTA 5ITPA 4XKQA 1Q1KA 4ZE9A 2DXRA 2ZYNA 4FIMA 4LONB 3HHFA 4RY1A 3H03A 1M5DA 4DLDA 1FQDA 4YB5A 4JB7A 5I57B 3RQTA 2R6GE 3MVZA 4RK2A 4H6DA 1POY1 2DYXA 3SEUA 1SD3A 5H8FA 2Y7IA 2XX8A 3IJOB 3TPAA 3OXNA 3MZ9A 3L6HA 2R9JA 1UTBA 1GV8A 2E1SA 2DE3A 1LGBC 2DVCA 3OEKA 3K6UA 3WAFA 4ESWA 1Y3PA 2D5WA 2ESNA 2RINA 4G4PA 3SERA 1MXXA 4R75A 3BFUA 3G3JA 3FJMA 2QMWA 1B58A 1Y1ZA 1NNTA 1HSJA 3VLWA 2HZKA 4Q30B 4DE8A 3D4CA 3EF7A 4GQOA 4R6KA 5HM4B 1IXHA 2XD3A 1SYIA 4F3SA 3V8XB 2XXIA 3MUQA 4JSOA 1Y3NA 1DOTA 1WODA 1DMBA 3VLUA 3PMWA 3AXFA 5JEIA 3JV9A 1IXGA 4ND9A 4GFRA 4GWOA 2O1LA 3KN8A 4R73A 4Z7EA 5CMKA 4H5GA 3OO9A 1LLSA 4F18A 1UTHB 4EXLA 4GLIA 1II5A 1URDA 2I58A 3OD7A 3LC8A 1RYXA 5ICQA 3KN3A 3TTRA 4LVQA 4H8IA 4OETA 4ELRA 3RUMA 1QVSA 3Q25A 2OLBA 3IB0A 1FTJA 3CG1A 3VLVA 5TP9B 1LFHA 1LCFA 1SW2A 2F7BA 2H5YA 2I0BA 1VFDA 3S9MC 3MZBA 5I56B 2Z8DA 3TCHA 4EXKA 1IZ1A 3UORA 2FNCA 3GBAA 1JETA 2RCBA 4G8HA 2F5XA 1KWHA 2XXHA 3K2DA 4AB6A 4XIGQ 3LSFB 1B5IA 1A55A 3K6WA 3PPPA 1NNFA 2DS9A 5CMMA 3FVKA 3IB2A 2G93A 2QS2A 4ZEDA 3O28A 3VDFA 3FJGA 4KD5A 4NF5A 3UIFA 4E0WA 3G3KA 1N84A 4ELOA 1B3FA 3KSXA 3T93B 1A54A 3RGYA 2PYYA 2GRVA 1PB8A 1UIVA 3VVFA 3FUZA 3S9NC 1B46A 1NH7A 5DVIA 3PGFA 1S7YA 3MPKA 3LR1A 5I2NB 4HW8A 4U4SA 1DPEA 4YB7A 4KHZE 3CVGA 2ABHA 1ATGA 4M1VA 1FTMA 1Y9UA 1VE4A 3DELB 3SKPA 2Y7WA 3HV1A 4R2FA 1US5A 1ZKBA 1A99A 4FEDA 3EHUA 5DYHA 3UA8A 4JWYA 1XVXA 4JWOA 4OVJA 5H8NB 3KSJA 1A7LA 3A3UA 1MG1A 4MLQA 2REGA 3IO4A 2FYIA 1MQDA 3E13X 1L5TA 4BDQA 2XXXA 1CE2A 5TPAA 4ZZAA 3VVDA 3KEIA 4PFTA 4KQPA 5KDTA 1QJMA 5I59A 4OFJA 4U21A 2GFEA 1JW4A 4LQ5A 1QKAA 3THIA 4OZ9A 1P1OA 3FXUA 4RPNA 2QMXA 2ZNUA 5I2KB 3Q28A 1MY0A 4F22A 3QK6A 4NF8A 3ILTB 3DP8A 5AA2B 1MM7A 1D3KA 1MS7A 2ONRA 3SDFA 1JVXA 2PVUA 3B6QA 4NMYA 2OZZA 3S9EA 4LATA 3QSLA 2XXQA 1WDNA 3C31A 1S9TA 2AIXA 4QFLA 3PUZE 3IO6A 2HAUA 3ZSFA 2ZNTA 1AOVA 4MBPA 5AA4B 1UQWA 2DXYA 2OK2A 3TODA 1Y4TA 1N3WA 5L9SA 4MFIA 3TFLA 2H25A 1FQCA 4IO5A 3H7MA 2A5SA 3MVXA 2DE4A 3OELA 5I57A 2M8CA 2ZNSA 3FVNA 2Q89A 1J1NA 3OO8A 1B7ZA 5CBSA 4ZECA 1PEBA 5CM6A 1SI1A 4XKNA 2VD2A 1B3EA 1B7HA 3LSLA 4Z0IA 3P7IA 5CI5A 3TAJA 4TLLB 2O51A 3VFJA 1D9YA 1IIWA 4OENA 2I3WA 2UVGA 4O3AA 1B0LA 2DVZA 5K2YA 1MRPA 3GLBA 3VVEA 1QW0A 5CC2A 3MP6A 1LB9A 3HN0A 4OERA 3TELA 3U72A 3OENA 1QKBA 3TCFA 4XTCQ 4GRKA 3I6VA 2UYFA 3B6TA 3IX1A 3N5LA 3O66A 3G3FA 3DLNA 2UVIA 1MM6A 2YLNA 2P1SA 3MQ9A 2I6EA 4F3BA 3Q29A 2OWSA 3S9LC 5ITOA 3TTLA 5DT6A 4POXA 1EZOA 2X26A 1M5EA 1S50A 1SVXB 1OLCA 2Y7RA 2RC9A 4KYEA 3A09A 3UK4A 3M3FA 2CMOA 4YU0A 3IR1A 3E3KA 4RPOA 3IK6B 3N6TA 3PPOA 1PB9A 1VR5A 1N7XA 2P0SA 3IORA 4FE8A 3T9XB 3PUWE 3OSRA 1Z7ME 1AL3A 1OVBA 5TP9A 1LCTA 1TFDA 4N07A 3H4ZA 4TLMB 4ZEKA 2O69A 4NF6B 3TZAA 1MXWA 2HFBA 3KZGA 1FTOA 4IO3A 2DWJA 1URSA 3N6UA 4YKPA 1DPPA 4U1ZA 3FVOA 2XHDA 5DVFA 4RA1A 2LAOA 3FV2A 2F6GA 1MPDA 2ALUA 3MW0A 2Z23A 1ZTYA 4OMBA 4NF4A 4FAJA 3C4MA 2VP1A 2QS4A 1OQHA 3IL1B 5DVJA 4YKJA 2XXRA 1XVYA 1IEJA 3T96B 2GHBA 4LZ7A 3PUVE 1H44A 5DEXB 2D21A 4KR5A 4I9DA 3T22A 2A5TB 3O29A 4RK9A 2QPQA 2Y84A 4IY6A 1MH4A 1FQBA 3CFXA 5A5XA 4DDDA 1NKXA 3GZGA 2H99A 4F2QA 2B65A 4HCWA 4GXSB 4NE4A 3K0VA 1D4NA 3C35A 3MP8A 2XXVA 4X1BA 2F8DA 4N13A 3VXBA 4LZ8A 3LSXA 2H4IA 1B4ZA 2XD2A 3OMBA 4ISUA 3TQWA 4QHQA 1SI0A 4X48A 3UGWA 2O7UA 5H8HA 4F2OA 2Q8JA 3Q27A 1B7UA 4FORA 3PUXE 3UP9A 1HSEA 1N76A 2QL3A 4GL8A 1LFGA 4P0IA 4ZZEA 5JTYB 3I5OA 4MLVA 1N04A 2OWTA 3TUSA 2FA7A 1P1QA 3HCQA 1MXYA 1LFIA 3PPNA 2V25A 5I84A 1TWYA 1MXZA 3R6UA 3TCGA 4FJPA 2E0SA 1OIBA 3RLFE 2HCAA 4R74A 3C9HA 3EHSA 5J1DA 3T9VA 1DTGA 1MY3A 3B6WA 1TT1A 4XKPA 4BLAA 3JYRA 2H98A 5AA2A 3MP1A 4P0GA 4U1OA 2NOOA 2Z22A 2QJEA 2VGQA 2XX7A 4G8NA 2NVUB 3RT8A 2O84X 5H8QB 2Y7PA 4YB6A 1PBPA 1MY1A 3RNNA 5KCJA 3TQLA 2I4CA 3SEYA 2RC8A 3C36A 4Q8RA 1XT8A 3IAZA 3FJ7A 3K1PA 1B1XA 2YPNA 4KCDA 1SQYA 1R9QA 4QF9A 1B5HA 2UVJA 4AB5A 3FGSA 5ICTA 2V93A 3TTNA 1PBQA 3SETA 3PPQA 3TTKA 4R6HA 1HSLA 1DTZA 2ZYOA 4QSDA 1O7TA 1OVTA 1P99A 1I6BA 2CZLA 3FATA 1SBPA 3U94A 3USDA 4PFYA 5TU0A 4GIZA 3OO7A 4EDPA 3CSBA 1FCKA 3LBSA 3G3HA 4MF3A 4G8MA 1IXIA 1GVCA 1D9VA 5K2XA 1O63A 3U1OA 3BKIB 4OEVA 2W7YA 1QUKA 3EQ1A 3EHTA 3LSWA 3MWBA 3ZS6A 2KLFA 3HHGA 5I58B 3RN8A 3HSTA 3MVWA 4THIA 1BTJA 4YKIA 1XHYA 1LBCA 2F36A 3CR9A 4C1UA 2I48A 1A8EA 4RNSA 3K6VA 2HXWA 5ISUA 1FQAA 1UIUA 3U93A 1Q35A 2VHAA 4MH5A 4ZS9A 4QFPA 5AA3A 4DCXA 1B05A 2BJJX 4ELPA 4IGTA 4DIGA 3Q26A 1US4A 2B3FA 2ZMBA 3QIMA 4JDFA 4WXJA 4PQJA 4G68A 1H43A 1LAFE 1LBBA 2V3QA 2I49A 4YKKA 4QFOA 1B0HA 3PMXA 1B32A 4GF8A 1B9JA 2QRYA 3K6XA 1CB6A 1EZPA 5JK4A 5IAIA 2ZXTA 3MZ1A 3H3GA 2YJPA 1A8FA 1SYHA 3O6GA 2DWIA 4NF6A 5LOMA 1FQEA 3S4UA 4WKMA 3CFLA 2DOJA 3MAMA 1Y4CA 4HTGA 4PETA 3L6GA 3V5AA 4KCCA 4JWXA 1FTLA 3FZVA 3IB1A 1EU8A 3PU5A 1GGGA 2RC7A 1USYE 4R2BA 4PFWA 1Z7NE 1USYH 3O97A 1VFEA 1MPBA 1IITA 3TDJA 4ZEFA 3E4RA 4I8CA 5DEXA 4EQBA 2GH9A 2IA4A 3VXCA 2ZYMA 2O1MA 2NUVA 1AIVA 3KBRA 3FASA 2RKMA 2RCAA 4WEPA 5L9OA 1ANFA 2NXOA 3G3GA 2G29A 4OYVA 1MQIA 3N26A 1B3GA 4H5FA 2HEUA 1SW5A 4F1VA 3DM0A 3M3LA 4C0RA 3LUYA 3V83A 4GXAA 4Q0CA 1JW1A 1NNKA 1NFTA 1SW4A 3CFZA 3IOTA 4GL0A 3FD3A 4OXVA 4EQ9A 2Y7KA 1B51A 4GD5A 1VSOA 5KDTB 1XC1A 3PUYE 2NWJA 5I59B 4L17A 2F97A 1SDXA 4TQUQ 1P1UA 4FEBA 1UTHA 4K3FA 2HAVA 1MQHA 2X7QA 3KGCA 1B2HA 2DQVA 4NF8B 2I0CA 2THIA 3T9UA 4X9TA 1BKAA 4HCYA 2UXAA 2DSFA 4ESXA 1URGA 3W9VA 2QS3A 1PB7A 3KJ7A 5FHNA 4YZZA 3B7DA 4QRZA 3OSQA 3PV0E 4OFLA 1LAGE 2RF1A 5I56A 4OEUA 5H8SA 2Q88A 3FIRA 4F39A 3OOAA 3H6VA 4R6YA 4ECFA 4G68C 3PMVA 1BIYA 2R71A 4HS7A 4O3BA 1MH3A 1QUJA 5B70A 5KZTA 1A40A 4YICA 1BP5A 1QUIA 4NWDA 2UVHA 1MQGA 3RTWB 5FHOA 2B3BA 5FHMA 3TMGA 3IOUA 1M5FA 1RKMA 2HQ0A 1ZU0A 3GBBA 4LA9A 4ONYA 4QFKA 4RYAA 3WAEA 3RY3A 3RPWA 2ONKE 4QSEA 1R9LA 1H76A 1B1HA 3K1NA 4AQ4A 5I2NA 5AA2D 3TEPA 1FTKA 2DWAA 3K1MA 1YAEA 4ZDMA 3QXMA 5DTBA 2Q2CA 3QAXA 4FATA 4YAHX 1MXUA 4BDRA 4I1DA 4IO2A 4F1YA 4DCYA 3ECRA 1M5CA 5M2VA 3SEVA 5H8NA 1ZMGA 1ZLQA 3KFMA 3KOSA 5EYFA 1MPCA 5B7DA 1AMFA 1FQFA 3MPLA 3ILUB 5I58A 3TYHA 2V3TA 3RTFB 2O6AA 4RJZA 3M3KA 2Q2AA 1F9BA 2AL4A 2I4BA 3EPEA 1GR2A 1N0TA 4WEDA 3QUFA 1RYOA 1Y1MA 3FV1A 3SEWA 2AL5A 1R6ZA 3O6IA 3R7XA 4DXCA 4P11A 3W9WA 5IKBA 5CMBA 3F11A 3IJXB 1TXFA 4H1XA 5ELVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3BFTA 4KI0E 4P1EA 2PMSA 4N6PA 1ELJA 1I6QA 3K00A 1RDYA 5FBPA 3H06B 4U2RA 3FVGA 2GHAA 4OVPA 5I2KA 1YZ0A 1FSAA 4QFNA 4EF2A 3VE1B 1NNPA 4UACA 2QSXA 2H9BA 4Q5TA 1R1NA 1MY4A 3CHGA 1POTA 3CG3A 4PE3A 4PE5B 3I3VA 4G61A 4MNCA 4FECA 5CMCA 1KZ8A 3QYTA 3UN6A 1N3XA 5EHSA 4IGRA 2IEEA 1Y3QA 4F31B 4NHBA 4KYSA 5AA4A 1GTKA 4NF4B 2WYKA 1LB8A 5H8FB 4NTLA 5HPQA 4PBQA 1NV6A 4BDLA 2DE2A 1K9YA 4XXUA 3S2VA 1P1NA 4F3GA 1JQFA 2PX1A 2X7PA 1UTBB 3SEXA 3U8QA 3R26A 1JEVA 1QULA 5EHMA 3TKDA 2Z8EA 3O2AA 4MHFA 2XXUA 3PD8A 4KYDA 3O6HA 1B52A 3IFAA 4IR8A 1XS5A 2F3DA 4G2ZA 5A5XB 4OA4A 1OLAA 4JXIA 1PC3A 1NUZA 3V89B 4OTEA 3PPRA 2FIEA 4MEVA 1JP4A 4R72A 4EF1A 2FBPA 3HPIA 2VPNA 3ONMA 4LUBA 1MDP1 3O9PA 3T9HB 4BDMA 4LQ2A 3JZJA 5H8HB 1K9ZA 2PBWA 3N94A 4DXUA 3K02A 4M4GA 4HE2A 1H3DA 1NH8A 4QSCA 1T0KA 4YMBA 1NMUA 2DWHA 2Z8FA 1MXVA 4HE0A 4UA8A 1FW0A 2AYSA 2REJA 4IY5A 1TFAA 3DP4A 1EZ9A 1SW1A 4OQOA 3DP6A 5FTHA 5ET7A 1LAXA 3MVYA 1I6AA 4R9FA 1B3LA 2ONSA 3HO7A 3SESA 3G7WA 4XEQA 3ZKLA 1LBYA 1H45A 1XOCA 2ANJA 2V84A 3PTYA 1B3HA 5AA1A 1DSNA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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