3N94A

Crystal structure of human pituitary adenylate cyclase 1 receptor-short n-terminal extracellular domain
Total Genus 154
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
154
sequence length
466
structure length
466
Chain Sequence
IEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTNAAAEFAIFKKEQAMCLEKIQRANELMGFNDSSPGCPGMWDNITCWKPAHVGEMVLVSCPELFRIFNPDQDMGVVSRNCTEDGWSEPFPHYFDACGFDEYE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Membrane receptor
source organism Escherichia coli
publication title Crystal Structure of the PAC1R Extracellular Domain Unifies a Consensus Fold for Hormone Recognition by Class B G-Protein Coupled Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Fusion protein of Maltose-binding periplasmic protein and pi
total genus 154
structure length 466
sequence length 466
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-05-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF02793 HRM Hormone receptor domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3n94A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3n94A01
2G29A 4BDOA 1NL5A 4ZEKA 3O6HA 1ZIUA 3PU5A 1B2HA 3TPAA 2QMWA 3IJXB 4JWYA 5EYFA 3UIFA 4F2QA 1UTBA 1B05A 1XS5A 5KZTA 4JBZA 1PEBA 1A55A 4G4PA 5FHMA 3TCFA 1UTHA 3FV1A 4JWXA 3HV1A 3PUZE 3LSXA 4LQ5A 1B6HA 4KD5A 4GL8A 4NEDA 2B65A 2F36A 2UXAA 1MXWA 3RLFE 2QS3A 3E4RA 3OO7A 1PBPA 4R6HA 4QSEA 4OXVA 1FTOA 1FQFA 1R9QA 3MVYA 1L5TA 3MZ9A 2OWSA 3L6HA 1ZKBA 4R2FA 2OWTA 4IY6A 3K1PA 1JVXA 5DEXA 1BIYA 5A5XB 2O68A 2Q88A 2XHDA 2HAVA 3FZVA 2PBWA 1RYOA 3PD8A 3SEWA 4OMBA 4O3AA 2UVHA 4DDDA 5DTBA 1BKAA 1CB6A 2ZMBA 1OQHA 2IA4A 3H06B 3EHUA 4QFNA 3SEYA 1QKAA 5HPQA 1LFGA 4H6DA 3HCQA 2ALUA 4KYEA 2RINA 5ICTA 4IO7A 3CSBA 3PUVE 1S50A 1GR2A 2ONSA 3O29A 2Z8EA 4ONYA 4X9TA 3VLVA 1F9BA 4XXUA 4JXIA 4F22A 3EPEA 4I1DA 1HSLA 4YU0A 2XXIA 4ESWA 4R9FA 3ZKLA 3VXBA 3N5LA 4R72A 3JZJA 3IO4A 1FTKA 4JDFA 3C9HA 1UQWA 5AA3A 4OETA 3MC2A 3S9LC 1D9YA 2QPQA 4TQUQ 1TXFA 2I6EA 4QSCA 3LSLA 5BUUA 1Q35A 4HW8A 4EDPA 3RPWA 3IR1A 3UGWA 4QFPA 3GBBA 1A8FA 2Z22A 4IO5A 1J1NA 1B0LA 5I58B 3TTMA 3ZSFA 2DVZA 5KCJB 3T96B 2GHBA 5CMMA 2REGA 3C32A 2DVCA 1A99A 4ZE8A 1B58A 3VE1B 4RY1A 2OLBA 2XXVA 4L17A 3ONMA 4GF8A 4JB7A 2ANJA 3TMGA 2DOJA 4RPOA 1I6BA 5AA2A 2HZLA 2V84A 5FHOA 4DCYA 3FVGA 5BWJA 1RYXA 1B46A 4P11A 1PB8A 1JVYA 4UA8A 4YMBA 4N6PA 4ZECA 1UTHB 3PMVA 3BFUA 3O2AA 1IZ1A 3DELB 1S7YA 3KOTA 1DMBA 2HZKA 4DIGA 4FJPA 4RK2A 2XD2A 4QF9A 3O6IA 1GGGA 3VLWA 5LOMA 3C36A 4QHQA 3S9NC 2XXHA 2DWIA 3S2VA 1QUKA 2Y7KA 3K01A 3FASA 4NWCA 3LSFB 3O6GA 4X1DA 4YKJA 5DEXB 1NFTA 4IO2A 4TLLB 4IO6A 1MQIA 1SW1A 3CSGA 4GQOA 3THIA 4MH5A 4WEPA 1QW0A 4DXUA 3B6QA 5CBRA 1B1HA 4OVJA 3T22A 4I9DA 4HS7A 4C0RA 2HFBA 2LAOA 1VFEA 3C34A 3OD7A 4G68C 3LR1A 4U2RA 2OCUA 3RGYA 2Z8DA 1B3GA 1LAHE 3OEMA 2V25A 4NF4A 1ZLQA 3H6UA 2UVJA 3EHSA 1LAGE 3ILTB 3PMWA 4NTLA 4WXJA 2DSFA 3VLUA 2QS2A 3MP1A 3W9WA 4ZZEA 4LP2B 3G3FA 3TUSA 2PT2A 2R6GE 4F3PA 2V3UA 1N0TA 3DP8A 4NE4A 3TZAA 1FQDA 3TQWA 2RCBA 4OWDA 1Q1KA 4DCXA 3H4ZA 4MLVA 3MZBA 4QSDA 2Q9TA 2NVUB 1IEJA 4GIZA 1M5DA 3K6VA 3VV5A 1QULA 1Y3PA 5DVJA 4U23A 3T9UA 1NH8A 1VE4A 2DWJA 1WDNA 4FEDA 3GXAA 3T66A 2F8DA 4RNSA 1B3LA 3N6UA 1Y1MA 4F2OA 1JEVA 5IKBA 2DE4A 1DPEA 1JNFA 2ZNTA 2QJEA 3PPQA 4JSDA 1MY0A 3QYTA 2THIA 4K3FA 5H8QA 1MY4A 2H25A 3Q25A 5ELVA 3ECRA 2F97A 2QSXA 3IO6A 1N3WA 1TFDA 1HSJA 1A7LA 1MQGA 2GFEA 1SW4A 1S9TA 2YPNA 5B70A 3FJ7A 1IXHA 1JEUA 2XXXA 4F19A 2KLFA 3BKIB 3SESA 1JQFA 1P1QA 4O3CA 1GTKA 3G3IA 3FXRA 3KBRA 2E0SA 1BLFA 4F18A 3K6XA 3EN3A 2H5YA 1FQAA 1DPPA 1JW4A 1FTLA 3OO6A 4ELOA 3HN0A 1D3KA 1MXXA 1MY2A 3MP6A 1MXZA 4H1XA 3N94A 3IOVA 2BJJX 3T9XB 1NMUA 2DXYA 5H8HB 3MBPA 2H98A 3FJGA 3LC8A 3G3GA 2W7YA 5DT6A 2O7UA 4R73A 5K2YA 4ELQA 2D3IA 3WAEA 1O63A 2F34A 2XXTA 2HXWA 3VVDA 2I48A 3RT6B 4G8HA 1M5FA 4BDQA 3MUQA 1AH5A 1SW2A 3H03A 3SETA 1M5CA 1RKMA 1M5BA 2HAUA 5J1DA 3H6WA 4QFLA 4X48A 1MDQA 1MDP1 3MP8A 3MAMA 5HBCA 4NF6B 3A09A 4R6YA 4R74A 3M3LA 3VVEA 3BFTA 2I4BA 4FIMA 1MXUA 3FGSA 1AL3A 3IX1A 4H8JA 1ZBMA 4G8NA 3OOAA 2Y7WA 1LBBA 4DE8A 1B3EA 1OMPA 3VVFA 3TAJA 1Y3NA 2V3QA 2Q89A 3GZGA 3CI8A 2AL5A 5I2NB 3CIJA 1TFAA 3FVOA 3W15C 2CZLA 5JTYA 3IL1B 1ZTYA 1MH3A 4U4XA 1XVXA 1GV8A 1USYE 5F7VA 1UIUA 3QAXA 4IO3A 3MZ1A 3HO7A 3PUYE 2A5TA 2VP1A 3UORA 2VD2A 3EHTA 5JEIA 2XD3A 5H8QB 2DE2A 1EU8A 5H8NA 5ISUA 3FUZA 1IIWA 5FTIA 1MXYA 5DVIA 1Y4CA 2AYSA 1MQHA 4ZZAA 4OEUA 1H43A 1JW5A 4KR5A 4PQJA 1SQYA 4ZEBA 1JW1A 2Y7RA 2F7BA 1NH7A 4FORA 3IOWA 4XTCQ 1URGA 3S9MC 4G77A 2RKMA 3QIMA 2O84X 5F1QA 3CFXA 1US5A 3G3JA 3H3GA 5AE4A 3KN8A 4ZDMA 4MF3A 1IXCA 2R9JA 1D4NA 1H44A 3CFLA 2GRVA 1A8EA 3HPIA 1N3XA 1B9JA 4FATA 3FJMA 1PC3A 3FATA 4ZE9A 1MH4A 2XXWA 3R6UA 3VDFA 2P0SA 2RC7A 4EUOA 4UACA 3A3UA 4R9GA 3KSXA 1FCKA 4EQ7A 4MFIA 4YB6A 1B52A 3SERA 3FV2A 1MQJA 2PYYA 4WEDA 3HHFA 4ELPA 1Z7ME 2ESNA 5AA4B 4X1BA 1FTJA 4OFJA 2O69A 3QK6A 3L6GA 3R7XA 4TOZA 2XXYA 4F3SA 1YCJA 4R75A 4KYDA 4LZ5A 2D21A 5DYHA 5I59A 1AOVA 4DXCA 1YAEA 1NNPA 4OENA 3K00A 3RUMA 1AMFA 3CRBA 1SI0A 4MLQA 1IXIA 4OZ9A 1Z7NE 4OQOA 1MS7A 3KG2A 3G7WA 2Z8FA 2QMXA 1UTBB 1EH3A 1H3DA 3U72A 1BP5A 4YB5A 5CMBA 3DP6A 3DLNA 3IAZA 4AQ4A 4NF5A 3ZKKA 1HSEA 1DTGA 2RCAA 3D4GA 3TELA 4KI0E 1I6AA 4XKNA 2NWJA 5TU0A 1XT8A 3KOSA 1JETA 1MQDA 1URSA 2O6AA 3RY3A 3TCGA 4GLIA 3MQ9A 4ZEDA 5HM4B 3MVXA 3HHGA 3KJ7A 2A5TB 1B1XA 3RT8A 1SBPA 5CBSA 3CFZA 3DP4A 5CI5A 3Q27A 1Y9UA 2PT1A 5H8NB 4ISUA 4KQPA 4LZ8A 1LCFA 2Q8JA 4LQ2A 1SDXA 1EZOA 2OBGA 1UIVA 5TPAA 1YTVA 4OHNA 2F6PA 3M3FA 3K6WA 1B3HA 4F1UA 3BBRA 3K1MA 3O9PA 1URDA 4BLAA 4NF8A 3IB1A 2I0CA 1FQBA 5IAIA 2NOOA 4ZEFA 4KPTA 2GHAA 4P0GA 4GXSB 1LGBC 4AB6A 4H65A 4MBPA 2X7QA 1MPDA 2Y7PA 3E9XA 4IO4A 2H4IA 5I56A 1MM6A 5CMCA 5I84A 2DWAA 1I6QA 4OERA 5H8FA 4GOTA 2VD3A 4F3GA 1USYH 1LFHA 1ZU0A 4H0WA 3MWBA 1B40A 1NNKA 1N84A 4U21A 2XXPA 4U1OA 2I4CA 4HCYA 4KCDA 2ZXTA 3KSJA 4Q0CA 1LAFE 4LZ7A 3FXUA 3SEVA 3N6TA 1QKBA 1SYHA 5AA2B 1LAXA 5AA1A 4F1VA 5B7DA 2GH9A 4PETA 4QRZA 3C4MA 4FAJA 1FQCA 3LUYA 4O3BA 3T9VA 4U22A 1Y4TA 1LB8A 3B6TA 1A40A 2XX8A 4RPNA 1P99A 3U93A 1B5HA 3PGFA 4LUBA 4U4SA 2Q2CA 2DP8A 1POTA 3S4UA 1IQ7A 3ILUB 4I62A 3K2DA 4H5GA 3IORA 3RQTA 3QUFA 1IITA 3JV9A 1OQGA 2HCAA 4ESXA 2E1SA 4POWA 1ELJA 2X26A 4BDMA 2Y7IA 4GWOA 2ZYKA 3PPRA 3OO9A 1I69A 3Q29A 4YB7A 4F3BA 2ONRA 1NKXA 3OEKA 1LCTA 5ITPA 4ZEIA 3PV0E 3TTLA 5TPAB 4C1TA 1N7WA 5KDTA 2DWHA 5L9MA 4ND9A 4GRKA 2A5SA 3USDA 2REJA 4JSOA 1TWYA 2ZNSA 4NF4B 3PPOA 1B51A 1QJMA 2O51A 2QS1A 4OYVA 1ANFA 1FTMA 1PBQA 2XXQA 3QXMA 2F7CA 4OTEA 5CMKA 2I3VA 4IB2A 3P7IA 1SVXB 2OJTA 1POY1 5L8DA 3U8QA 3DM0A 4YAHX 5I58A 4U1ZA 1OVBA 4G68A 1N76A 1XVYA 2PMSA 5I56B 4P0IA 5L9OA 5FHNA 4RYAA 4YMAA 4I8CA 1ZJLA 4PFYA 5H8FB 4ECFA 1SW5A 3UK4A 2P2AA 3KZGA 3TCHA 4GD5A 3I5OA 3KEIA 2G93A 1R1NA 3K6UA 4R6KA 2F35A 3FVNA 4R2BA 2D5WA 5CM6A 1XHYA 4Q5TA 1XOCA 2DE3A 3IJOB 1LSTA 3V5AA 3M8UA 4M4GA 3E3KA 2FNCA 4ELRA 1ZMGA 1SD3A 3AXFA 1P1OA 1D9VA 3Q28A 3LBSA 1P1WA 2I3WA 2V93A 4TLMB 2RC9A 3K0VA 5I57A 2HQ0A 1EZPA 3V89B 4LATA 4G8MA 1Y3QA 5EHSA 1PDAA 1MPCA 3C31A 3W9VA 2QRYA 1LFIA 4XKPA 1AIVA 3OMBA 1GVCA 1B4HA 1MG1A 1KWHA 5I2KA 1IUDA 2ZYOA 5M2VA 1YPNA 4LONB 3Q26A 3IOTA 1B7ZA 1SYIA 4F31B 1II5A 4RK9A 4DZ1A 1B7HA 1N04A 4GVOA 1R9LA 4M1VA 2M8CA 3UA8A 3WAFA 4AB5A 2B3FA 2O7IA 2ONKE 3T93B 2AIXA 4YKKA 3U94A 1OLCA 4JWOA 4KFQA 5KDTB 3EF7A 2H99A 3JYRA 2O1MA 3R26A 2UVIA 1QUIA 4XKQA 2HEUA 3A3CA 4YICA 2DXRA 1O7TA 3VFJA 3G3KA 4HCWA 3PUWE 3K4UA 3S9EA 3SEXA 3I3VA 3V8XB 3O28A 4PFUA 5EHMA 3V83A 1B32A 3SDFA 4NWDA 2OK2A 3UN6A 1Y20A 5L9SA 4OEVA 4Z7EA 3UP9A 3MVWA 4G68B 4FEBA 3B6WA 4OFLA 2QS4A 1N7XA 1O64A 3OELA 4FECA 4N07A 3RTFB 4ZS9A 3PPPA 2V3TA 4WKMA 2F6GA 2I0BA 3G3HA 2AL4A 1B5IA 1MXVA 4EXKA 1MY1A 4EXLA 4E0XA 4LA9A 2UYEA 2F7AA 4OFOA 3C35A 1PB9A 5JTYB 3PPNA 1DSNA 3D4CA 4EF1A 4XKRA 5ICQA 3H6VA 1EZ9A 2CMOA 3KGCA 4H67A 5I57B 3N26A 3SEUA 4POXA 3F11A 1LBCA 2Q2AA 3FXQA 4YZZA 1VR5A 3TTNA 2ZYNA 2XX9A 4EQBA 2ZNUA 3K02A 1OIBA 5I2KB 1VFDA 2PX1A 1MM7A 3OXNA 3PUXE 1Y1ZA 3MPKA 3I6VA 2XXRA 4N13A 2Y84A 2F5XA 3CR9A 3TTRA 1NNFA 3MPLA 4EF2A 3QUJA 5H8HA 3TDJA 4PFWA 5DVFA 2Z23A 2NXOA 2FYIA 2IEEA 4YKPA 4HTGA 3H6TA 2ZYMA 3IB2A 3TTKA 3PMXA 4PP0A 5TP9A 4KHZE 4PFTA 3M3KA 1T0KA 3CG1A 4GFRA 1MRPA 3H7MA 5CRYA 4Z0IA 2O1LA 4DLDA 3HSTA 2YJPA 1QUJA 3CG3A 3OSQA 1LLSA 4FE8A 4BDLA 5K2XA 2FA7A 4G2ZA 2P1SA 1B4ZA 1SI1A 4BDNA 3SKPA 2OZZA 3C33A 4NF6A 1TT1A 3E13X 2VGQA 3MW0A 4Q8RA 5I59B 4DXBA 3TYHA 4H5FA 4RA1A 4RXLA 3TKDA 3FVKA 1P1NA 3RN8A 3IK6B 5AA2D 3PD9A 5FTHA 3QSLA 4IGTA 2RC8A 3ODBA 3MJNA 3OO8A 3T9HB 3RNNA 4RJZA 4QFOA 3LSWA 3TQLA 1M5EA 4F1YA 3GLBA 5I2NA 3MVZA 1B3FA 3IOUA 4KYSA 1WODA 3OSRA 3O97A 3VXCA 1LB9A 3OENA 4F39A 2F78A 5JK4A 4NF5B 1B7UA 3IB0A 2I58A 4IY5A 4IGRA 1XC1A 4OESA 5A5XA 2VOZA 5ITOA 2R71A 4XIGQ 2ABHA 4E0WA 3U1OA 2DYXA 4BDRA 1R6ZA 2UYFA 1MY3A 3O66A 4F29A 2I49A 4QFKA 1OLAA 3B7DA 2WKYA 1H76A 1VSOA 2YLNA 2XX7A 4Q30B 2B3BA 2VHAA 4LVQA 1US4A 3U92A 1BTJA 1WVJA 1B0HA 3TFLA 4H8IA 3RTWB 4C1UA 4PE5B 1NNTA 2XXUA 5CC2A 1OVTA 1FW0A 2QL3A 3EQ1A 4NF8B 1B5JA 5H8SA 1FQEA 3ZS6A 3TEPA 2UVGA 3FD3A 3K1NA 2NUVA 4NMYA 3KN7A 2DS9A 3KFMA 1MPBA 2RF1A 1DTZA 2PVUA 4YKIA 2X7PA 1P1UA 3GBAA 4GL0A 3KJTA 3CVGA 2DQVA 5TP9B 1QVSA 1IXGA 1ATGA 5AA4A 2H9BA 3TODA 4KCCA 4THIA 3FIRA 5KCJA 1CE2A 1PB7A 1DOTA 4EQ9A 1A54A 1H45A 4GXAA 3KN3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2G29A 4BDOA 1NL5A 1EYKA 4ZEKA 3O6HA 1ZIUA 3PU5A 1FJ9A 1B2HA 3TPAA 2QMWA 3IJXB 4JWYA 5ET8A 5EYFA 3UIFA 4F2QA 1UTBA 1IMAA 1B05A 1XS5A 5KZTA 4JBZA 1PEBA 1A55A 4NQ8A 4G4PA 5FHMA 3TCFA 1UTHA 3FV1A 4JWXA 3HV1A 3PUZE 3LSXA 4LQ5A 1B6HA 4KD5A 4GL8A 4NEDA 2B65A 2F36A 2BJIA 2UXAA 1MXWA 3RLFE 3BIGA 2QS3A 3E4RA 3OO7A 1PBPA 4P9KA 4R6HA 4QSEA 4OXVA 1FTOA 1FQFA 1R9QA 4GX4A 3MVYA 1L5TA 3MZ9A 2OWSA 3L6HA 1ZKBA 4R2FA 2OWTA 4IY6A 3K1PA 1JVXA 5DEXA 1BIYA 5A5XB 2O68A 2Q88A 2XHDA 2HAVA 3FZVA 2PBWA 4OVPA 1RYOA 4PGNA 3PD8A 3SEWA 4OMBA 4GWXA 4O3AA 2UVHA 4DDDA 5DTBA 1BKAA 1CB6A 2ZMBA 1OQHA 2IA4A 3H06B 3EHUA 4QFNA 3SEYA 1QKAA 1NV3A 5HPQA 1LFGA 4H6DA 3FXBA 5EQAA 3HCQA 2ALUA 1LEVA 4KYEA 2RINA 5IZ1A 4GX3A 5ICTA 4IO7A 3CSBA 2CZKA 3PUVE 1S50A 1GR2A 2ONSA 3O29A 2Z8EA 4ONYA 4X9TA 3VLVA 1F9BA 4XXUA 4JXIA 4F22A 2QVUA 3EPEA 4I1DA 2WX9A 1HSLA 4YU0A 1BK4A 2XXIA 4ESWA 4R9FA 3ZKLA 3VXBA 3N5LA 4R72A 3JZJA 3IO4A 1FTKA 4JDFA 3C9HA 1UQWA 5AA3A 4PBHA 4OETA 3MC2A 3S9LC 5IZZA 1D9YA 2QPQA 2CEYA 4TQUQ 1K9YA 1TXFA 1IMCA 2I6EA 4QSCA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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