2A5TB

Crystal structure of the nr1/nr2a ligand-binding cores complex
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
278
structure length
276
Chain Sequence
NHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords N-methyl-D-aspartate receptor NMDAR1-4a subunit
publication title Subunit arrangement and function in NMDA receptors
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Metal transport,membrane protein
total genus 80
structure length 276
sequence length 278
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-06-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2a5tB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2a5tB02
2RCBA 3U93A 1URSA 3FJ7A 3H3GA 3SETA 3KJ7A 1IITA 3N94A 4G68B 1GTKA 2E1SA 4ZE9A 4X1BA 3IOTA 4LATA 5F1QA 3Q28A 1URGA 2Q88A 4I1DA 4NF5B 4OXVA 3T9UA 3N6TA 4OEVA 1FQEA 2I58A 5H8SA 4MLQA 3T9VA 2P1SA 1SYHA 2RINA 2Q2CA 1XOCA 3Q26A 3PU5A 3FJGA 4QSDA 5I2KB 4GXSB 4R6KA 4X48A 5FHOA 5AA4A 4PE5B 4IY6A 1MXWA 4GL8A 4KYDA 1MXZA 1MY3A 3LC8A 1S50A 4MH5A 3SEVA 3VE1B 5AA3A 1MPDA 1NFTA 4U1ZA 5KCJB 3IB1A 1JW5A 3DLNA 2DE2A 2Q89A 4BDRA 3KJTA 1QUKA 3MW0A 4JSOA 4F1YA 1LCTA 4RY1A 1ZKBA 1MDP1 1M5CA 4YKJA 3G3JA 3TDJA 1MY0A 1J1NA 5AA2A 3T9XB 4KFQA 2P0SA 1FQCA 2V84A 4YU0A 2VGQA 3UA8A 2DXRA 1N7WA 4PP0A 3RGYA 4IO2A 1B6HA 3OO7A 4FJPA 4RNSA 2PT1A 3C34A 3K1MA 3A3UA 1R6ZA 1JW1A 3O6GA 3RT6B 3K2DA 3U8QA 1A8FA 1L5TA 4LUBA 2XXTA 3CFLA 3K6XA 2NXOA 1MPBA 2ZYMA 1LB9A 2NWJA 2ALUA 3T66A 2E0SA 1QUIA 2O68A 4OMBA 1Q1KA 4O3BA 3PGFA 1TWYA 2Q2AA 2OWSA 3H6UA 3IL1B 4YICA 2NUVA 2VOZA 3MVXA 5TU0A 3FATA 1B7UA 1QKAA 1TFDA 5AA2D 1A8EA 4G77A 5CMKA 4OQOA 3B6QA 3ZSFA 1BLFA 3KSXA 4DXCA 2DWAA 1I69A 1B1XA 2O84X 1SW5A 3MVYA 2F97A 2O1MA 2DVCA 3A3CA 2OBGA 5KDTA 4MLVA 5DTBA 3B6WA 5L9MA 4RJZA 5TP9A 2GRVA 3LSFB 1B0HA 1N3XA 2UVGA 5K2XA 2AL4A 1LB8A 3OENA 3G3FA 4NTLA 3S9LC 4F18A 1PC3A 3RQTA 2QS3A 3PUVE 1MXYA 2GHAA 1LBCA 3TELA 3TCHA 5H8HB 3OXNA 4LVQA 4RA1A 4ZEFA 1H45A 2B3BA 1D3KA 1MS7A 3G3GA 1QW0A 3H6VA 4QFPA 4Z0IA 2Z22A 4EF1A 4WEPA 4C0RA 4ONYA 5FTHA 1P1NA 1MQGA 3OEKA 4NF8B 3MBPA 1ZTYA 4H5FA 4FORA 1Y1MA 3IX1A 4LZ7A 2O6AA 1IXCA 4IO6A 3PD8A 2F36A 4GQOA 3CSGA 4F29A 3D4CA 1YCJA 1SDXA 4GWOA 4XIGQ 1A99A 1B46A 2D5WA 3C9HA 3BFTA 2ZNUA 3FXRA 4OFJA 4U1OA 1B0LA 2GH9A 1UTHB 1QKBA 4N13A 3H06B 5CC2A 3VVEA 2V3TA 1NL5A 4BDLA 3TMGA 3F11A 2VP1A 4JXIA 4EDPA 4DXBA 3OO6A 1UTBB 4TOZA 3MZ9A 2H5YA 4AB5A 1B3LA 3H6WA 3Q29A 1FTKA 4HW8A 5H8FB 5EHSA 3FVGA 3BKIB 4AQ4A 1B32A 5DT6A 5ITOA 4EQBA 4YAHX 3PUZE 2Z8DA 1Z7ME 4ZE8A 3O28A 4TLMB 2F78A 3S9EA 4KI0E 1B3FA 2A5SA 3IOUA 2RKMA 4LZ5A 1MY2A 3TODA 4IO5A 4TLLB 2QSXA 1I6BA 3QYTA 3WAFA 1LCFA 4H5GA 2Y84A 4JWXA 5DVFA 3CFXA 3EHSA 4H6DA 2B3FA 1IXHA 4NF4A 5H8QB 1B3EA 2OJTA 1MXXA 1MQIA 3M3KA 2REGA 4KPTA 2RC7A 3OSRA 5CM6A 2ONRA 3IR1A 1MXUA 3SEXA 2ABHA 2XXXA 1B40A 1MG1A 3LSWA 2I49A 3K6WA 4Z7EA 5I58A 1IQ7A 2I6EA 3C31A 3ODBA 3VV5A 4EXKA 4ELPA 5EYFA 2V3UA 3MWBA 1IIWA 2UVHA 1A40A 3SEWA 2VD3A 4QSEA 2ZNTA 3CG1A 1EZ9A 4QFKA 1QJMA 4K3FA 1O64A 2QMWA 1QULA 1Y1ZA 2R71A 3TEPA 3PD9A 4IO7A 2FNCA 4RK2A 2UVIA 1CB6A 4HTGA 3CRBA 3TPAA 1XT8A 4LP2B 1TT1A 1DOTA 2QRYA 3E9XA 2I4CA 3W15C 3OMBA 4YKKA 3L6GA 1SI1A 5B70A 1ZJLA 4FEBA 3PUYE 1US4A 1VFEA 1MM7A 1TFAA 5I57A 2HCAA 3O29A 1I6QA 3KZGA 4JSDA 4YB5A 2DE4A 4MBPA 2F7AA 1P99A 1M5DA 3TFLA 4YKIA 2F35A 5DVIA 1LAXA 1RYXA 1OLAA 1NNKA 2ZYNA 1SQYA 1O7TA 1MY4A 1JW4A 3KBRA 3MP1A 3TQLA 2F5XA 1D9YA 2PBWA 1H3DA 5TPAA 2WKYA 2QPQA 2Q8JA 3C36A 3VDFA 2A5TA 3FVNA 3SEYA 3IB0A 3Q27A 1UIUA 3LUYA 3OD7A 3O66A 2H4IA 5H8NB 2GHBA 4KQPA 4U23A 2PX1A 3MP6A 1VFDA 2ZNSA 4ZEDA 3TAJA 4X9TA 1WDNA 3FV2A 2P2AA 4RYAA 5I2NB 3TCGA 2I0BA 1XC1A 5AA2B 1PB8A 4KYSA 3Q25A 3PUWE 4R75A 3O2AA 3K1PA 2X26A 2XX8A 4I8CA 2F6PA 1JEVA 3H4ZA 5DEXB 5M2VA 4AB6A 3MJNA 3FZVA 5L9OA 4I62A 2Z8FA 2QMXA 1OMPA 3JZJA 4YMBA 2ESNA 3MVWA 1POTA 2LAOA 4DDDA 4U21A 4GVOA 1RYOA 3CI8A 3HCQA 1ZMGA 3E13X 4ELOA 4OERA 1AOVA 3QUFA 1MH4A 4G68A 4GLIA 3BBRA 2W7YA 2ONSA 1OVBA 3FVKA 4FEDA 3TCFA 1FTOA 2O7IA 1MM6A 2UYEA 1NMUA 1WODA 3O6HA 2H9BA 3G3IA 4NEDA 3QSLA 4PFWA 1AL3A 1S9TA 1PDAA 4R9GA 3KEIA 3LR1A 1Q35A 3TTMA 3IJOB 1N7XA 4OENA 2Q9TA 3QK6A 5ICQA 1M5EA 4KCCA 5KDTB 3ECRA 5EHMA 2ZMBA 1PB7A 3RTFB 3G3KA 4PFTA 4JDFA 2XX7A 4JBZA 4U22A 3RNNA 3TUSA 4THIA 1IZ1A 4OVJA 2DWIA 3SDFA 3U1OA 1LAGE 2O69A 4JWYA 4ELQA 4LZ8A 4WXJA 4G8NA 3L6HA 4DXUA 1FQAA 1OVTA 4HCYA 4DIGA 5KCJA 4OZ9A 1T0KA 3TTRA 3KG2A 1TXFA 4DZ1A 1D9VA 4F3GA 2AIXA 1XS5A 3FJMA 3KN7A 3S2VA 3EN3A 4QFOA 5I56A 3TTKA 3O6IA 1B3GA 3CSBA 4PFYA 2ONKE 2H98A 4OTEA 3UP9A 3PPQA 4IY5A 2XXRA 4M1VA 4PFUA 1DPEA 1R9QA 5CI5A 1A55A 1VSOA 3IB2A 1P1UA 4IGTA 3OO9A 1JVXA 4GXAA 1BP5A 4UACA 1SBPA 3RTWB 1PEBA 4H0WA 3R7XA 2Y7IA 4GD5A 1FQDA 4ISUA 1B2HA 4NF6B 4BDQA 1AIVA 1MPCA 4JWOA 3HHFA 5BWJA 2XXWA 4Q0CA 1EZOA 2F7BA 1WVJA 3HPIA 3N6UA 3TTLA 3ZKLA 5CMMA 2YPNA 3HSTA 4BDMA 2OWTA 4XKPA 1MDQA 4F2OA 3KOTA 4H67A 1M5BA 4UA8A 4R9FA 4KCDA 2DWHA 2GFEA 3W9VA 1SYIA 2G93A 1HSJA 2HFBA 1OQGA 1B7HA 3FXQA 1US5A 4G4PA 1POY1 1Y4CA 3FD3A 3KOSA 4F1UA 3M8UA 1SI0A 2IEEA 4R2FA 1Y9UA 3KFMA 1UIVA 3N26A 3U92A 5JTYB 4NWDA 2UXAA 2XD2A 2HAVA 4G68C 5BUUA 1BKAA 3SESA 3LBSA 4ESXA 5L9SA 5H8HA 4EXLA 2X7QA 3T9HB 3O9PA 3IOVA 1IXGA 1MQDA 2FA7A 5ICTA 1FTJA 5I58B 4FAJA 5LOMA 3UORA 1P1WA 5JEIA 3T96B 1B4HA 1SVXB 3IO4A 1JETA 1LGBC 3IJXB 4OFLA 3PPNA 3MVZA 2DS9A 1B5JA 4HS7A 2XXQA 3B6TA 4R6HA 4ZZEA 1LFGA 2Z8EA 1YPNA 4H1XA 3JV9A 3V89B 4QF9A 1O63A 3DP4A 3BFUA 2ZYKA 3EQ1A 2I3WA 3FVOA 2AL5A 4G2ZA 3FGSA 2XD3A 3O97A 3MP8A 2ZXTA 1P1OA 1SW1A 3MC2A 3H7MA 2I48A 3RY3A 4HCWA 1FQBA 1UTHA 1IEJA 1KWHA 5CBRA 4OFOA 4DCYA 3SERA 2F7CA 1B51A 1S7YA 1VR5A 4F1VA 1MH3A 4EQ7A 5I59A 3UIFA 4QFLA 1DTGA 1A7LA 3JYRA 4R74A 5H8FA 5IAIA 3K0VA 3OOAA 3TYHA 2XXIA 1QUJA 3I3VA 5F7VA 4IO4A 5TPAB 1NKXA 3CVGA 3T22A 3EHUA 2QS2A 2A5TB 4POWA 3KGCA 2V25A 1F9BA 5B7DA 1YTVA 4E0WA 2XX9A 1Y4TA 1JQFA 5FHNA 1LFIA 4X1DA 1OQHA 2PVUA 2PT2A 2QJEA 1R9LA 2I0CA 5A5XA 1H44A 3FV1A 3H6TA 2DQVA 3U72A 3FIRA 5K2YA 3PMVA 4FECA 4XKNA 3U94A 4ECFA 4C1TA 2B65A 1MY1A 4R72A 3ZS6A 3UGWA 4Q8RA 5AA1A 4F22A 1EH3A 5AA4B 2OK2A 4H8IA 4BLAA 2VD2A 3CG3A 2DP8A 3LSXA 3GBBA 4GF8A 1IXIA 2DXYA 3KN8A 4DLDA 5HBCA 5FTIA 5AE4A 2O1LA 4YB6A 3C33A 1BIYA 3TZAA 1AH5A 4DCXA 3FXUA 1N0TA 1MQJA 3VLUA 4BDOA 2H25A 2DOJA 3CR9A 2R9JA 5I84A 4R2BA 4RK9A 2HZLA 4U4SA 4R73A 2QL3A 4POXA 4IGRA 4BDNA 4GFRA 1JVYA 4L17A 3UN6A 4U4XA 2XXYA 1HSEA 2IA4A 3PV0E 2Z23A 1USYE 5CMCA 5DVJA 4GL0A 2O7UA 2HQ0A 3P7IA 3S9MC 3C32A 4R6YA 3THIA 5JK4A 2D3IA 1GGGA 1R1NA 4OHNA 4F39A 2O51A 1ELJA 3QAXA 1DMBA 4QHQA 1II5A 1PBQA 1EZPA 4KR5A 1M5FA 3V83A 5J1DA 1SD3A 4ZZAA 4GRKA 5H8NA 3K01A 4FE8A 2V93A 4NF5A 3HO7A 1B9JA 1B5IA 3VLWA 1QVSA 5I56B 1SW2A 3KN3A 4ZDMA 1XVXA 5CRYA 5I2NA 3QIMA 5HPQA 3TTNA 1Y3PA 4Q30B 3GLBA 4ZECA 2Y7KA 3D4GA 3OO8A 5I2KA 3E4RA 1JNFA 5DEXA 4M4GA 5TP9B 4OWDA 4ND9A 3QXMA 1Y3QA 4WKMA 5ITPA 3MZBA 3VLVA 3S9NC 4ELRA 3WAEA 3GXAA 2XXHA 4EQ9A 5CBSA 1P1QA 3MUQA 3M3LA 2OCUA 1XHYA 2BJJX 1JEUA 2NVUB 1B4ZA 3MAMA 4XXUA 2YLNA 1LSTA 3OELA 2QS1A 2HZKA 1N76A 4N6PA 4F3PA 1LFHA 4RPOA 4G8MA 1N3WA 3MQ9A 3I6VA 3T93B 4XTCQ 4JB7A 4Q5TA 2HEUA 4EF2A 1FQFA 4P11A 3EF7A 2RC9A 5IKBA 3A09A 1N04A 1UQWA 1USYH 1NNFA 2VHAA 3AXFA 4RPNA 1FCKA 4P0IA 2NOOA 2F34A 3H03A 3RT8A 1GVCA 3M3FA 4EUOA 4NE4A 2I3VA 1EU8A 1AMFA 3PMWA 5L8DA 1FTMA 3V5AA 2OZZA 4ZEBA 3EPEA 3PPOA 2XXPA 2XHDA 4N07A 1OLCA 3VVFA 3VXBA 1NH8A 3HN0A 3IAZA 4P0GA 4TQUQ 1YAEA 2XXVA 4XKRA 5DYHA 2THIA 3DP8A 4LQ5A 3PPRA 4KYEA 3PMXA 2AYSA 4FATA 4LA9A 4H65A 3DP6A 3MPLA 2G29A 3W9WA 4FIMA 1H76A 5KZTA 4YZZA 3LSLA 1D4NA 3C35A 3PUXE 1B58A 1A54A 2RF1A 4LONB 3RUMA 3ONMA 4NF4B 1B5HA 1VE4A 4YMAA 2D21A 1ATGA 1NH7A 4KD5A 4LQ2A 4F3BA 3CFZA 3MZ1A 2HAUA 4WEDA 4OETA 1LAHE 3R26A 3K00A 3G3HA 1GR2A 4NF6A 4U2RA 3PPPA 5I59B 1HSLA 1ANFA 2CMOA 2KLFA 3V8XB 4NF8A 2ZYOA 1ZU0A 2OLBA 5CMBA 4ZEIA 2I4BA 4O3CA 3RN8A 3SKPA 3KSJA 2ANJA 4H8JA 1MQHA 4NMYA 4MFIA 1SW4A 3I5OA 3K1NA 2UVJA 2QS4A 1ZLQA 2FYIA 4F31B 3HHGA 4GIZA 3SEUA 3K6VA 4MF3A 3S4UA 1Z7NE 4F3SA 2PYYA 4E0XA 4QFNA 3ZKKA 1RKMA 4I9DA 1Y20A 5ISUA 1ZBMA 1PBPA 3VVDA 4RXLA 4OEUA 3RLFE 4O3AA 1MXVA 2YJPA 1ZIUA 1B7ZA 4ZEKA 3TQWA 3IK6B 5JTYA 3DM0A 3IO6A 3ILUB 4PETA 5I57B 3VFJA 1NNTA 1B05A 1UTBA 4YB7A 3FASA 4QRZA 5FHMA 3E3KA 4ZS9A 2RC8A 4OESA 1LAFE 2XXUA 4IB2A 5A5XB 3C4MA 2F6GA 2X7PA 4XKQA 2Y7RA 2DSFA 3K02A 3OEMA 3VXCA 3EHTA 3ILTB 2V3QA 3GBAA 4DE8A 1GV8A 3R6UA 3N5LA 2CZLA 3GZGA 1FTLA 1DSNA 3UK4A 2RCAA 1B3HA 4IO3A 1Y3NA 2Y7WA 1NNPA 3DELB 3HV1A 3OSQA 1N84A 4YKPA 1CE2A 5H8QA 3TKDA 2HXWA 2PMSA 2REJA 3K4UA 1LBBA 4QSCA 1OIBA 2F8DA 3QUJA 3CIJA 1DPPA 4ESWA 2M8CA 3B7DA 3FUZA 1H43A 2R6GE 1FW0A 1B52A 1I6AA 3RPWA 3K6UA 4NWCA 2H99A 5ELVA 1MRPA 2DYXA 4GOTA 2Y7PA 3IOWA 3MPKA 3IORA 5HM4B 1DTZA 1PB9A 2DWJA 2UYFA 4OYVA 4F2QA 4F19A 1URDA 4C1UA 1LLSA 1BTJA 4KHZE 2DVZA 4G8HA 1IUDA 3USDA 1B1HA 2DE3A 1XVYA 3G7WA 4PQJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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