2A5TB

Crystal structure of the nr1/nr2a ligand-binding cores complex
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
278
structure length
276
Chain Sequence
NHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Metal transport,membrane protein
molecule keywords N-methyl-D-aspartate receptor NMDAR1-4a subunit
publication title Subunit arrangement and function in NMDA receptors
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 80
structure length 276
sequence length 278
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-06-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2a5tB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2a5tB02
2H25A 5JEIA 2VD3A 4LONB 2XXTA 3O9PA 4XKPA 5I59A 2H5YA 2H9BA 2Z23A 2A5SA 3LR1A 1UQWA 3GBAA 1ELJA 4ELPA 1B3EA 3FXRA 5J1DA 1ZU0A 4OFJA 1URGA 2UVIA 1A8FA 2GH9A 2RCBA 4X1DA 4U1ZA 1YPNA 5TP9A 2QMXA 1TWYA 3RN8A 4HCWA 1XC1A 1NNFA 3IORA 4I1DA 1WDNA 1LBBA 1A55A 5AA1A 3M3FA 5AA2B 5I57B 3H4ZA 5DVIA 5JTYB 1O64A 2F8DA 3DM0A 4GXAA 4H67A 3N6UA 2THIA 1B05A 5AA4A 4EDPA 2F78A 1IXCA 2B3BA 5EHMA 1FQEA 1B9JA 1MPBA 4YKPA 2UVGA 3ZSFA 2RC8A 3O97A 1Y9UA 1BIYA 4OXVA 5DEXB 3KGCA 4R73A 3PUYE 3QUFA 4OZ9A 2H99A 1A54A 1ZIUA 4UA8A 1EU8A 2I0BA 5CBSA 4BDQA 1II5A 2QMWA 3QYTA 2HAUA 4C1UA 2E1SA 4O3AA 4RK9A 3K6XA 3PUWE 1FTKA 2NUVA 3S9MC 2D5WA 4ZZEA 4P11A 2I4CA 3O66A 3KG2A 1LFHA 2R71A 4R9GA 4KI0E 2Y7PA 2V3QA 4FEDA 2ZNUA 4LP2B 2XX7A 4FIMA 1B1HA 5AA3A 1LFGA 2UYEA 2XXVA 1AIVA 3UIFA 1D9VA 4LATA 1B7UA 1LAFE 5BUUA 4QFLA 2PMSA 4GF8A 3C31A 2DWIA 5I84A 2WKYA 1QUIA 3T93B 1ZBMA 4ND9A 3TQLA 1Y3QA 3CG1A 1Z7ME 2M8CA 4TQUQ 3MVXA 1QUJA 1N84A 2FA7A 3BKIB 1TXFA 2XXXA 4GXSB 2V3UA 3CVGA 1OQGA 3G3KA 4YAHX 3TFLA 3IO4A 3DP8A 3BFTA 5I56B 1USYH 1SW4A 4DIGA 4ELOA 4WEPA 4NTLA 4QF9A 3IO6A 3HSTA 2VGQA 1SYHA 4LUBA 3PPNA 1B4ZA 3EHSA 5K2YA 3K01A 4NMYA 4FAJA 3LSXA 1YAEA 3VVDA 5KZTA 1NL5A 1XS5A 4GRKA 3T9XB 5H8SA 3N26A 2F5XA 4F18A 5KCJA 2PT2A 4LA9A 1JW4A 4E0XA 1QW0A 3TYHA 3FUZA 3TDJA 2ZXTA 1LAXA 3MBPA 2Q89A 4Q30B 2F7CA 4PP0A 3DELB 5ISUA 2QJEA 5A5XB 5DVFA 3OEMA 2V84A 3PUZE 4OENA 3B7DA 2H98A 3ILTB 2ABHA 3G3JA 4OQOA 1SI1A 5AA4B 4KQPA 2YJPA 5DYHA 2FNCA 1PEBA 1P99A 2UYFA 4GQOA 4IO4A 1OQHA 1Y3PA 1Y3NA 3DLNA 2HXWA 4IB2A 2OBGA 1MRPA 1Q1KA 2E0SA 4YMAA 3FASA 4U21A 2PT1A 2DE4A 4ECFA 1OIBA 2P0SA 3RQTA 3WAFA 4R74A 1QKAA 4ZEKA 1NKXA 3QAXA 2DWAA 1IIWA 2DS9A 1GGGA 4QSDA 4NF8A 2DYXA 3U1OA 2KLFA 1US5A 3MVWA 4EQ7A 1M5BA 2NOOA 2Y7WA 1POY1 4G8MA 2REGA 1I69A 3IB0A 1A7LA 4H6DA 4YB6A 2Q88A 4YKKA 4FE8A 4YKIA 1JETA 4IGRA 1N7XA 1MY2A 3MP1A 4NF6B 4Q5TA 1H44A 3RY3A 4IY6A 3SKPA 2DXRA 1XVXA 4H8IA 4OETA 4MLQA 4WXJA 1FQAA 1N7WA 3FVKA 4PQJA 2XD3A 3I3VA 5TPAA 4LQ5A 5FHMA 3V5AA 3VE1B 1ZKBA 2CZLA 5CMKA 3A09A 3C35A 3S9LC 1NH8A 2Z8EA 1LAHE 1S7YA 4ZEIA 5H8FA 4F2QA 4H5FA 4QSCA 2R6GE 4P0GA 2G29A 4F1YA 2ZYNA 1URDA 1M5DA 2HFBA 4NEDA 3KBRA 3RT6B 2P1SA 1DPPA 3W15C 1B6HA 1QVSA 1LCTA 1IXIA 4QFOA 4LZ5A 5B70A 3MVYA 3JYRA 3H3GA 5H8HB 2I4BA 2DE3A 3FD3A 4FJPA 3MZBA 1MXYA 1Y20A 3KN8A 3VLWA 4BLAA 4QHQA 2RCAA 1H45A 1MY4A 3QUJA 3RTWB 4EXLA 2AYSA 3SEXA 1DSNA 3H6VA 4OYVA 3LC8A 2OZZA 3O6GA 1LSTA 4JBZA 4F3PA 1SBPA 1B3LA 2V93A 4NF4A 3H6TA 4OEVA 2NWJA 3FIRA 2QPQA 4FECA 4X1BA 4Q8RA 1HSLA 1FCKA 1GVCA 2O1MA 1ZJLA 3O6HA 4ZS9A 3HV1A 1GTKA 4N07A 1P1NA 3TKDA 1LBCA 3M3KA 4BDNA 1MXZA 5EYFA 1I6AA 1LLSA 5FHNA 1NMUA 3Q29A 2QS4A 4U4SA 1AMFA 2X7PA 4IO6A 5LOMA 2Q2CA 3GLBA 3K0VA 3SEYA 2I6EA 2ONSA 3EPEA 1SDXA 3E13X 1XT8A 3V8XB 1OVTA 1YTVA 5DTBA 4FATA 4NF5B 4IY5A 1UIVA 4ESWA 1DPEA 3O28A 1N0TA 3CFXA 3BFUA 3HN0A 4IO3A 4LQ2A 4LZ8A 3GZGA 4R6HA 5I58A 2PX1A 1FQFA 3IK6B 1S9TA 3K00A 4NE4A 3K1MA 3FGSA 2F6GA 4ELRA 3TCGA 3IX1A 5ICTA 4M1VA 3WAEA 2DQVA 3O2AA 4N13A 3OD7A 3G3GA 3VV5A 4F3GA 2DWHA 3OO7A 1N3WA 3MJNA 5KDTA 2Y7IA 4QFNA 1PBQA 4H1XA 3G3HA 4LZ7A 1Y1MA 3A3UA 2RF1A 4OERA 3VXCA 1L5TA 2V3TA 2AL4A 4JDFA 3S2VA 4LVQA 4G68B 2XX9A 4DXCA 1MM7A 4RJZA 5JK4A 1MXVA 5H8NB 3D4CA 3C4MA 1FTLA 2ESNA 3FJGA 4R2FA 1YCJA 3TQWA 5I2NB 4OESA 1XHYA 3H7MA 3H6WA 2PYYA 3PMWA 1MDP1 5I2KB 4OWDA 4GD5A 3KN3A 1SQYA 2O69A 3T9VA 4NF4B 1B51A 3MW0A 3IOUA 4H0WA 2QS1A 3L6HA 3M3LA 4IGTA 1P1WA 2UVJA 2I3WA 3I6VA 3LUYA 2XXRA 3RPWA 3MWBA 1UIUA 1SW1A 2Q9TA 4OFOA 4G8NA 4F29A 2QRYA 2XXUA 4NWDA 3PMVA 4L17A 4Z0IA 1M5CA 1UTBA 4G2ZA 3EHTA 3UN6A 3VVEA 4PFTA 3V83A 3OMBA 4EXKA 5CRYA 3FV1A 3Q27A 4JWYA 5EHSA 5I59B 3OSRA 4H5GA 4U1OA 3JZJA 1M5FA 2GHAA 2ALUA 2ZYOA 4R72A 1D3KA 2XXIA 1FQBA 1WODA 2OWTA 5TP9B 4JB7A 1BP5A 1T0KA 2X26A 1LGBC 2YPNA 1FTOA 1EH3A 1OLAA 5IKBA 2UVHA 3QIMA 1AL3A 4YU0A 3EN3A 3U72A 3CFZA 1MQHA 1UTHA 4BDMA 1URSA 4BDLA 1B40A 3T66A 1FTJA 4QFKA 3TMGA 1MM6A 3KZGA 3IB1A 1WVJA 3T9HB 4PETA 3ZKLA 5CBRA 1R6ZA 5CC2A 2VHAA 4FEBA 1JEVA 2F34A 1ZMGA 1GV8A 3TTKA 2RC9A 1NNPA 3MAMA 3K6UA 2A5TA 2YLNA 1R1NA 1MY1A 4KYDA 1MG1A 4GIZA 4Q0CA 2DOJA 4ZZAA 2NXOA 4MBPA 5CMCA 2DSFA 1OVBA 3HHFA 1TFAA 3TTRA 3K2DA 4ONYA 3QSLA 1JW1A 1F9BA 3LSFB 3VVFA 3OENA 3ONMA 4R6KA 3LSLA 3MPLA 3TAJA 1B3HA 3PD8A 3TUSA 1ATGA 1H76A 2AIXA 3FATA 1SW2A 4EUOA 4MH5A 4YZZA 3K6WA 1MH3A 3TEPA 5FTIA 3EF7A 3BBRA 3PPQA 3IOWA 2GRVA 1ZLQA 2OLBA 3P7IA 1B0HA 4EQBA 4AB6A 4RY1A 4X48A 3UGWA 4PFYA 2HQ0A 2OK2A 3H6UA 3UK4A 3UP9A 2Z8DA 1VE4A 1PB7A 2VP1A 3KJTA 5I57A 3PU5A 1P1UA 4XKNA 4ZEDA 1D4NA 1LAGE 1QULA 4XXUA 4RA1A 1B4HA 5L9MA 3TZAA 3OELA 4H8JA 3SESA 3K4UA 2NVUB 1FTMA 1MDQA 2W7YA 3TODA 2B3FA 1B5JA 4MF3A 1R9QA 3ZKKA 5KCJB 2I3VA 4F39A 1JNFA 2DWJA 4ESXA 4KR5A 2I49A 1MXUA 3O6IA 2IEEA 4F1UA 4KHZE 4IO2A 4KD5A 2AL5A 3OSQA 2D21A 3VFJA 3LBSA 4HW8A 4F31B 2XX8A 5K2XA 1Z7NE 2R9JA 1US4A 1O63A 2IA4A 4KCCA 1MY3A 4POWA 1B7HA 5M2VA 2DP8A 5L9OA 2PVUA 5CMBA 3H06B 3THIA 4ZEBA 1IQ7A 1O7TA 2ONKE 1BKAA 3PV0E 3F11A 4KFQA 3Q28A 4OEUA 2DXYA 2F97A 2Y84A 1N76A 4U23A 3FJMA 3K6VA 1B7ZA 3FV2A 3VDFA 2X7QA 3LSWA 3U92A 1RKMA 3TTLA 4E0WA 4OFLA 1DMBA 1JVXA 3EHUA 3IOVA 1B32A 3OXNA 3SETA 1Y4TA 1OMPA 3CG3A 3K02A 1FW0A 3CR9A 3PMXA 4NF8B 4XKRA 4QRZA 4ZECA 2VD2A 5I56A 1DTGA 1Y4CA 1POTA 1I6QA 1QJMA 5CMMA 2CMOA 1MH4A 3OO8A 4HS7A 1B3FA 3SEVA 1MQIA 2ANJA 1B0LA 1CB6A 3I5OA 4DE8A 1CE2A 1B3GA 1TT1A 1B58A 3RGYA 1IITA 4DXUA 2DVZA 3W9WA 1LB8A 4ZEFA 2QS2A 1HSEA 2F35A 3FVNA 3MUQA 1USYE 3N5LA 2F7AA 1MXWA 4QFPA 2ZYMA 2FYIA 3IB2A 3R6UA 1DTZA 1OLCA 1SW5A 4ISUA 5TPAB 3C33A 3Q26A 3KSJA 4JWXA 1ANFA 3USDA 1QKBA 3L6GA 4KPTA 2Z8FA 1FQCA 4OHNA 5A5XA 3E3KA 4WKMA 3GBBA 3OO6A 3OOAA 1VR5A 5HBCA 1MY0A 3JV9A 5H8FB 1LCFA 4GOTA 4IO7A 4TOZA 4RYAA 4ZDMA 1B2HA 1N3XA 4U22A 3A3CA 4EF1A 3RNNA 1ZTYA 2ONRA 3G7WA 4F19A 3T22A 3W9VA 2QS3A 1MS7A 5ICQA 1B52A 1XOCA 3FZVA 4BDRA 4DZ1A 1IEJA 3DP4A 4RNSA 4IO5A 1PBPA 2VOZA 4OMBA 1D9YA 4DDDA 4PFUA 1JQFA 3G3FA 2O84X 3R7XA 3OO9A 4DXBA 1NH7A 3H03A 3RUMA 3ECRA 1PB9A 5FTHA 5CI5A 1NNKA 2F7BA 3TELA 1PC3A 3ILUB 4X9TA 1SYIA 3UORA 1IUDA 3FXUA 1H43A 3SEUA 2XXYA 5DT6A 4ZE9A 3IJXB 1IXGA 3B6TA 3TTMA 2O6AA 4GVOA 1MQDA 5F1QA 2HEUA 1B1XA 1MXXA 2BJJX 2O7IA 2O68A 3N6TA 3K1PA 3PPPA 3KOSA 2I48A 3TPAA 4GL0A 3KJ7A 4OTEA 4G4PA 5ITOA 4F1VA 2Z22A 1LB9A 2PBWA 4O3BA 4JSOA 1QUKA 2RINA 4NF6A 2G93A 4TLMB 4QSEA 4R6YA 2QSXA 2V25A 1RYXA 3UA8A 5TU0A 4AQ4A 2XXQA 1A8EA 1JEUA 4POXA 1JW5A 4JXIA 5B7DA 1SD3A 2OJTA 3CSBA 3B6WA 3FVOA 1SI0A 4DCYA 1GR2A 1BLFA 5HM4B 3VLVA 4YKJA 5I58B 4ELQA 5DVJA 4HCYA 3E9XA 2XXPA 4G77A 2Y7RA 4Z7EA 3PUVE 3CFLA 3MVZA 3DP6A 4K3FA 4RK2A 5IAIA 5H8QA 1VFEA 1JVYA 4U2RA 2HAVA 3N94A 5H8HA 3PD9A 3PGFA 4JSDA 3U8QA 4F2OA 1TFDA 2O7UA 4YB5A 3RT8A 4F3SA 4MFIA 4DLDA 4C0RA 2RC7A 3SERA 3TCFA 1RYOA 1B5HA 1IXHA 2UXAA 1P1OA 3RTFB 3HCQA 3KFMA 3IJOB 1Q35A 5KDTB 4U4XA 3OEKA 2OCUA 1SVXB 2DE2A 3FVGA 4O3CA 2DVCA 1A99A 1I6BA 3E4RA 4TLLB 4GLIA 4GWOA 1XVYA 5L8DA 1PDAA 2Q2AA 2I58A 3R26A 2ZNSA 3IAZA 2GHBA 3C32A 4G8HA 4RPNA 4RPOA 3TCHA 3MZ9A 2QL3A 1VSOA 1S50A 4THIA 2Q8JA 4PFWA 4KYEA 1DOTA 5ITPA 3CRBA 4MLVA 1MPDA 2F6PA 3MC2A 3V89B 3MP8A 3G3IA 2F36A 3RLFE 2H4IA 3KEIA 2REJA 4C1TA 2ZMBA 4GL8A 4M4GA 1HSJA 5ELVA 2I0CA 4BDOA 1MPCA 2HCAA 1M5EA 4NF5A 4KYSA 1B46A 3SEWA 4ZE8A 3MZ1A 3VXBA 4YB7A 4JWOA 3CIJA 1UTBB 3IL1B 4P0IA 4FORA 3S9NC 3VLUA 4PE5B 5F7VA 3KOTA 3K1NA 3ZS6A 4KCDA 4WEDA 3HHGA 3GXAA 4RXLA 4GFRA 5AA2A 5CM6A 2P2AA 1B5IA 3M8UA 1Y1ZA 4F22A 1MQJA 5JTYA 1KWHA 4XIGQ 1MQGA 3C36A 3EQ1A 4G68C 2GFEA 2O1LA 3C34A 3FXQA 3MP6A 3QXMA 3T96B 1AOVA 3TTNA 3PUXE 3IOTA 4EF2A 5FHOA 1FQDA 1NNTA 2OWSA 5AA2D 4YICA 5DEXA 2B65A 2ZNTA 4NWCA 3T9UA 3U93A 4F3BA 4I8CA 5BWJA 3IR1A 3S9EA 3PPOA 2XHDA 3QK6A 3PPRA 4YMBA 3MQ9A 3U94A 4OVJA 1UTHB 3S4UA 5H8QB 4G68A 1EZPA 1H3DA 3KN7A 5H8NA 2LAOA 1VFDA 1N04A 2Y7KA 2ZYKA 2O51A 3MPKA 3B6QA 5AE4A 3C9HA 3D4GA 3O29A 5I2NA 3CI8A 4EQ9A 1BTJA 4R75A 3KSXA 5I2KA 4UACA 1EZ9A 3CSGA 4AB5A 4R9FA 4I62A 4N6PA 2D3IA 4R2BA 4XKQA 3Q25A 1NFTA 2A5TB 3FJ7A 1A40A 1AH5A 3HO7A 4XTCQ 1EZOA 2XXWA 5L9SA 1P1QA 2XXHA 3HPIA 1IZ1A 3ODBA 3SDFA 2RKMA 4HTGA 4DCXA 2XD2A 1PB8A 1LFIA 2HZLA 4H65A 1J1NA 2HZKA 5HPQA 1R9LA 3AXFA 4I9DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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