2A5TB

Crystal structure of the nr1/nr2a ligand-binding cores complex
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
278
structure length
276
Chain Sequence
NHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Subunit arrangement and function in NMDA receptors
pubmed doi rcsb
molecule tags Metal transport,membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords N-methyl-D-aspartate receptor NMDAR1-4a subunit
total genus 80
structure length 276
sequence length 278
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-06-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2a5tB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2a5tB02
5F7VA 4ZDMA 2YPNA 3ODBA 3OEKA 2DWIA 1EH3A 1MXVA 5L9OA 1FTLA 2GHBA 3T93B 3K01A 3G3FA 1BTJA 2ZMBA 4TLLB 2XXWA 2ESNA 4OWDA 3C33A 1ZJLA 1QKAA 1LB8A 4KI0E 5HBCA 1AL3A 3OENA 3CFZA 3SEXA 3IJXB 5JK4A 1OVTA 2I6EA 4NF4A 1R1NA 3AXFA 3U93A 1WODA 4RYAA 5ELVA 2I4BA 3HV1A 4R6YA 4EDPA 2QJEA 4XKQA 1SW1A 4GIZA 3V8XB 2R9JA 5FTHA 1A7LA 2CZLA 1M5FA 1MS7A 3MP8A 1SW5A 3LUYA 4F3SA 5BWJA 2ALUA 1GTKA 4F39A 2Q89A 3U92A 1OQHA 1AMFA 4IO3A 4AB6A 3TQWA 2NOOA 4MLQA 2R6GE 4U21A 2F6PA 2UVHA 3JZJA 4G68C 3QAXA 1P1WA 1PB7A 3LC8A 2RINA 2Q9TA 1QKBA 3OEMA 1D9VA 1IXIA 1DPPA 2PMSA 3H6UA 3K0VA 3PMVA 3CI8A 3TTMA 1A99A 4OEUA 1BIYA 3G3JA 4R74A 1MXXA 3KN3A 3IOTA 3C31A 3KSJA 4M1VA 5CBSA 4ISUA 1USYH 3K1PA 4EXLA 5AA2D 1EZ9A 3RN8A 2O1LA 4HCWA 3M3KA 5FHNA 4LZ8A 1ZKBA 2ZNTA 4X9TA 3FIRA 3KJTA 2ZNSA 4F3GA 1B52A 2Q2AA 3FVNA 5CMMA 3FV1A 3IR1A 4FECA 2UXAA 2AL5A 1MQDA 4GL8A 1HSEA 1XHYA 1YPNA 4FEBA 5KCJB 1JNFA 1Q1KA 5H8QA 4ZE9A 1JW4A 3CIJA 4AQ4A 2YLNA 4F1UA 1ZMGA 3MUQA 4ZEFA 1URDA 3RNNA 1UIVA 5CRYA 2XXQA 3OSRA 3IL1B 2F7CA 3Q28A 5KDTB 3I5OA 3VVFA 1B51A 4BDOA 4DLDA 4IY6A 3B6TA 2DS9A 3MZ1A 5H8HA 3K2DA 4WKMA 1MY0A 3DELB 2XXVA 5HPQA 5I84A 1JVXA 4F3PA 2CMOA 2NWJA 5ITOA 2I48A 5DEXB 3UIFA 4UACA 3PD8A 1IXCA 4ZEKA 1AOVA 4ECFA 3PUYE 3IX1A 1I6BA 3QSLA 3N5LA 3I3VA 4PE5B 3K6UA 1OQGA 5JTYB 4YMBA 2X26A 2I4CA 3EN3A 4FIMA 4LATA 4DXBA 2P2AA 3N94A 4IO4A 1SI0A 4LVQA 5ICQA 5CBRA 4IB2A 3A3CA 2QS3A 5FHMA 3MPKA 3OMBA 1HSLA 2A5TB 4TLMB 2GFEA 3KN7A 4K3FA 4GD5A 3CG1A 1PB9A 3TFLA 4BLAA 5ICTA 1PBPA 3FZVA 1VR5A 1MH3A 4PFYA 4DCXA 2VHAA 2DE4A 4RNSA 4OFOA 4QSDA 1YTVA 3A09A 1LAHE 1JVYA 3RTWB 4I8CA 1DSNA 3HPIA 1B40A 3G3IA 1JEVA 1POTA 4QRZA 3TCFA 1B2HA 1I6AA 3VVDA 5FTIA 1Y3PA 1MQHA 2LAOA 1LAFE 4G8HA 4X1DA 4X1BA 5AE4A 5ISUA 1ZLQA 5IKBA 4G68B 2I0BA 3TQLA 2VP1A 1A40A 1CE2A 3KG2A 4MLVA 4ELOA 3RUMA 2O7IA 5CMKA 2R71A 2H5YA 3UK4A 3OXNA 4IO6A 1B3GA 5AA4A 1N04A 3EHTA 3FXQA 2H25A 1Y4CA 2AIXA 4NF6A 4BDNA 3O9PA 2G93A 2I3WA 1MY1A 4YAHX 1IXHA 2F7BA 4KFQA 5DVIA 4F1VA 2DVCA 4JB7A 3DM0A 2Y7KA 3MPLA 2PBWA 2P0SA 2D5WA 3C35A 2ZYKA 3GBAA 2BJJX 1DTZA 4YB5A 2Z8EA 3IO4A 1IQ7A 2XD2A 3G3GA 1QUIA 3HSTA 3W9VA 4GQOA 3T66A 3C4MA 3ZSFA 2FNCA 5H8FB 4NEDA 2DYXA 2ZYNA 4LONB 5JEIA 3FASA 4O3CA 4YKPA 4H5FA 1EZOA 3KFMA 4POXA 3C36A 4ZZAA 2B3BA 4QFPA 3SKPA 1LBCA 5TPAB 3KZGA 4F19A 3MJNA 3H4ZA 3R26A 4U1ZA 1IXGA 1GV8A 4KCCA 3E9XA 3PGFA 1ZTYA 1MY4A 3SESA 3P7IA 4F2OA 3ZS6A 1MPDA 3GLBA 1AH5A 5J1DA 1BKAA 1ZIUA 4OVJA 1MXUA 4XXUA 2W7YA 3LR1A 4Q8RA 2H99A 3RT8A 5I2KB 1OLAA 5I2NB 4FJPA 4HTGA 1B0HA 2O51A 3E13X 1N3XA 3BKIB 4YKJA 1ATGA 3KN8A 3QIMA 1XVXA 3W9WA 2Y7PA 5DVJA 5CMCA 4R9GA 4ZS9A 1NNTA 1Y9UA 3MVWA 2IA4A 2UYEA 3T22A 4H8IA 3IO6A 1S9TA 4N07A 4C1UA 3ZKKA 2F5XA 4PETA 1LGBC 3M3LA 4U23A 1B32A 2XXTA 3PUVE 4XKRA 3SEWA 1RYXA 4MF3A 5AA1A 5H8SA 4F29A 1O63A 3PPRA 4H67A 4NF8B 3S9MC 4KD5A 3H03A 4JSDA 3QUFA 1RKMA 5HM4B 3G3HA 1PC3A 4EUOA 2YJPA 5TP9A 5DT6A 3R6UA 3HCQA 1SQYA 1MY3A 2Z8FA 2F34A 3FATA 1NH7A 1A54A 3S2VA 1NNPA 2E1SA 3TDJA 4MBPA 3O29A 3VLUA 5H8NB 1LSTA 1IZ1A 4C0RA 1UTBA 4RK9A 1MRPA 2D3IA 3O97A 1H44A 4UA8A 1M5BA 2OLBA 5DTBA 4H6DA 2XXIA 2B3FA 2XXHA 2V84A 3EHUA 1B3EA 4RJZA 2HZLA 4ELPA 2Q2CA 4O3BA 4WEDA 2DXYA 4YKKA 2XXUA 1B1XA 1ZBMA 3QYTA 3K6WA 1D9YA 3KGCA 1B7ZA 3VXBA 3IJOB 3CSBA 3U94A 4HS7A 4LZ5A 3TELA 1B9JA 1DOTA 4QFOA 3IORA 4GOTA 1FW0A 4R6KA 4ZEDA 1QUKA 3KSXA 4EQ7A 2REGA 1QULA 4Q0CA 4NF4B 1JW5A 2Y7WA 4IY5A 3FJMA 3RT6B 3U8QA 3BFUA 2QS4A 4R9FA 1URSA 4ESWA 1SW2A 2ZXTA 2DOJA 2HCAA 1FCKA 2Y7RA 2F8DA 3RPWA 4YU0A 3MWBA 1UQWA 2PYYA 1R9LA 2Y7IA 3RY3A 3V83A 2P1SA 1XS5A 3M8UA 3IB0A 1UTHA 2PVUA 4E0XA 2RCBA 5B70A 2AYSA 2A5SA 3B6QA 1P1OA 3MVYA 1WDNA 3IOUA 3TKDA 1TFDA 1VSOA 4NMYA 4GWOA 1P1QA 1Q35A 2FA7A 3MP6A 2Q8JA 2XHDA 3T96B 4MFIA 3PPOA 4G68A 4GF8A 4KYEA 1FQAA 5K2XA 1OIBA 1MXZA 3LSLA 3PPPA 1P99A 1J1NA 3TPAA 4BDMA 3TEPA 1MXWA 4WXJA 3OO8A 2AL4A 4RK2A 3TTRA 5LOMA 1LFHA 1JW1A 3MQ9A 3T9HB 4OXVA 4EXKA 4JSOA 1SVXB 3FVKA 3TZAA 2UVGA 3MAMA 1NFTA 3O6HA 1B46A 4RA1A 3VXCA 1TFAA 4ZEIA 1M5CA 2DP8A 4IGRA 4ZEBA 2Q88A 3K1NA 4OEVA 4WEPA 3QUJA 3EHSA 3H7MA 3IOWA 1B4ZA 2REJA 4EF2A 3SEYA 1LCFA 3UN6A 3VLVA 4GXAA 1US5A 4GFRA 3HO7A 2OWTA 1B3HA 2V3QA 3DLNA 3OO7A 3B7DA 4BDQA 3EPEA 4DZ1A 1TWYA 3FVGA 1SD3A 5H8HB 2ZYMA 5TU0A 3JV9A 1LLSA 5I56A 1MQGA 1FTJA 1N7XA 3UGWA 5A5XA 2VGQA 4NF5A 1MXYA 3RTFB 1YCJA 3K6VA 5TPAA 2QPQA 3CVGA 3OELA 4PFWA 4QSEA 4OMBA 1IITA 2NVUB 2DSFA 4LUBA 3VVEA 1US4A 3S9NC 3O66A 2QRYA 4GRKA 3H6VA 5L8DA 3MZ9A 3WAFA 2G29A 3HHFA 3TCGA 2VOZA 5I59A 5I58A 4GVOA 4IO7A 3DP4A 1IIWA 1RYOA 4Z0IA 3S9EA 1GR2A 3T9UA 4LQ2A 2OWSA 2O1MA 4F31B 1A8FA 3PPQA 5I2KA 5I2NA 4OTEA 1M5EA 1S50A 1H76A 3S4UA 4YICA 5I57A 3F11A 5K2YA 3R7XA 2ONSA 4ZZEA 4JWYA 2DXRA 4G2ZA 4I62A 2HXWA 4ONYA 1VFEA 2DQVA 2DWJA 4PQJA 2O84X 3MP1A 1A55A 1KWHA 4BDRA 4PP0A 1FQFA 3MZBA 1ZU0A 3U72A 2WKYA 2DE3A 1NNKA 1H43A 4X48A 2OBGA 1N3WA 3S9LC 4U22A 4XIGQ 2UYFA 2HAUA 4TQUQ 2QMWA 4RY1A 5KZTA 1MM7A 3PD9A 3THIA 2HFBA 4GLIA 2PT2A 4I9DA 3IOVA 3H6WA 1PB8A 3MW0A 4N6PA 2X7PA 4GL0A 2QMXA 4EQ9A 1EU8A 3A3UA 2O68A 4G4PA 4FAJA 4RXLA 1TT1A 2Y84A 1YAEA 4IO5A 3PUWE 4QHQA 2QSXA 3SEUA 3Q29A 4LQ5A 1ELJA 1SBPA 2Z23A 2ABHA 5AA4B 2XXXA 4DDDA 2V3UA 3CFLA 2XXYA 4NF6B 3RGYA 4POWA 3VFJA 2PX1A 4P0IA 1VE4A 3PMXA 1AIVA 4EF1A 4JWOA 3PUXE 1O64A 2H98A 2QS2A 4AB5A 1LCTA 1IEJA 2DVZA 1URGA 3UORA 4P0GA 1OMPA 1QUJA 4R6HA 1MQJA 3IB1A 4DIGA 5L9SA 3T9VA 4ZE8A 4I1DA 3TTLA 2XXRA 1FQEA 4DCYA 2M8CA 4H65A 3T9XB 3UP9A 1F9BA 2HZKA 4IGTA 1Y1ZA 2F36A 2DE2A 4ELRA 3PV0E 3I6VA 3IAZA 1L5TA 3Q27A 1GVCA 4H5GA 3CRBA 4BDLA 1N0TA 1Y20A 2RKMA 2ANJA 4NE4A 3ONMA 1P1UA 4OZ9A 3V5AA 4KPTA 3VDFA 4E0WA 4ZECA 3G3KA 4TOZA 5KCJA 3TODA 1B7UA 4YB6A 1I69A 3OSQA 1FTKA 1TXFA 4U4XA 2V93A 1PBQA 4OETA 4C1TA 3LSWA 2THIA 1P1NA 4U4SA 3OO9A 4F22A 1SW4A 1XVYA 3USDA 3BBRA 3IB2A 2E0SA 5KDTA 3CG3A 3O2AA 3DP8A 2GHAA 2RCAA 3FVOA 2F78A 5AA3A 5AA2B 1MDP1 4OQOA 4EQBA 3K02A 3UA8A 4P11A 1B3FA 1DMBA 2F97A 1LAXA 1XC1A 3ECRA 4O3AA 2HAVA 3MVXA 3FGSA 5IAIA 3LBSA 2XX9A 1BP5A 4QFNA 4LZ7A 1UIUA 5DYHA 2XD3A 5DEXA 4F18A 1B7HA 3TUSA 2ONRA 4KYSA 1B5HA 3LSFB 1MPBA 2VD3A 3QK6A 3WAEA 2HEUA 5JTYA 3VV5A 4THIA 1MM6A 2NUVA 2O6AA 4PFUA 3FXRA 2QS1A 4L17A 3H6TA 4DXUA 3PUZE 3KOTA 1B4HA 1NNFA 3TTKA 4ELQA 4JDFA 2H4IA 4F3BA 1SI1A 4H8JA 3M3FA 1B05A 5TP9B 3KEIA 2A5TA 5CMBA 1DTGA 4OERA 2OJTA 1MDQA 2Z22A 3RLFE 3L6HA 1JQFA 4OHNA 3K00A 3MVZA 1ANFA 1S7YA 1UTBB 1WVJA 3OD7A 1VFDA 4QSCA 1IUDA 1R9QA 2O69A 4KQPA 3E4RA 1POY1 3FUZA 3E3KA 4QFLA 3TCHA 4F1YA 3PU5A 4JXIA 4OFLA 4G8MA 4LP2B 4OESA 5CI5A 5EHMA 2OCUA 3D4GA 2HQ0A 3B6WA 2PT1A 1NKXA 5EYFA 4U1OA 4ND9A 3EQ1A 2RC8A 4R75A 2OK2A 4KHZE 1XT8A 3V89B 1MH4A 3KOSA 1R6ZA 2GRVA 2OZZA 1M5DA 3SDFA 1EZPA 2IEEA 1LBBA 3HN0A 3U1OA 1SYHA 3ILUB 1NL5A 4FE8A 3PPNA 4YZZA 3GZGA 2H9BA 4YKIA 5ITPA 2I49A 3K4UA 3O6GA 3FXUA 1N84A 4R73A 1NMUA 2UVIA 1QW0A 1MQIA 1JEUA 3OO6A 3N6TA 2QL3A 1B3LA 1H3DA 3FV2A 1USYE 4R72A 1B5IA 3EF7A 4OFJA 1B6HA 1NH8A 2V25A 5H8QB 2ZNUA 1MY2A 1I6QA 4IO2A 4U2RA 4Z7EA 1B5JA 1Z7NE 4HW8A 3RQTA 2ZYOA 4R2BA 1N7WA 3K6XA 3Q25A 4FATA 2XX7A 1GGGA 1Z7ME 2UVJA 5B7DA 1UTHB 5H8FA 1SDXA 4XKPA 3VE1B 3OOAA 3Q26A 4R2FA 2ONKE 1FTMA 5FHOA 1O7TA 3TTNA 3MC2A 2RC7A 1OLCA 2VD2A 1LAGE 2Z8DA 5CM6A 1BLFA 3VLWA 1HSJA 3KBRA 4G8NA 4Q5TA 1PDAA 1Y3QA 1A8EA 3G7WA 4PFTA 3ZKLA 4MH5A 3BFTA 4N13A 3N6UA 4FEDA 1PEBA 1Y4TA 4QFKA 4NWDA 5BUUA 2V3TA 3D4CA 3SERA 3MBPA 5M2VA 1MG1A 2NXOA 1CB6A 2FYIA 4GXSB 1QVSA 4H1XA 5L9MA 4YB7A 4JWXA 2F6GA 2F7AA 3ILTB 3TMGA 3H06B 1Y3NA 2XX8A 3FJ7A 1LFGA 1FQDA 1DPEA 3PMWA 3SETA 2DWHA 4YMAA 4G77A 3CSGA 1D4NA 3KJ7A 2GH9A 4H0WA 3CR9A 2KLFA 4FORA 1D3KA 1LB9A 2XXPA 2X7QA 3C34A 3FJGA 4OYVA 3DP6A 1FTOA 5F1QA 1T0KA 4DXCA 3QXMA 1OVBA 4NTLA 4XKNA 2I0CA 4F2QA 1LFIA 2RC9A 3L6GA 2RF1A 4JBZA 2O7UA 5I56B 2I3VA 3IK6B 5A5XB 4NF8A 3FD3A 4NWCA 1N76A 1H45A 3O28A 4NF5B 3TAJA 4XTCQ 3N26A 2F35A 1FQCA 2B65A 3K1MA 3C32A 2I58A 4KR5A 4LA9A 4M4GA 3HHGA 5EHSA 1B58A 1XOCA 3TYHA 4RPOA 5CC2A 4RPNA 1MPCA 2DWAA 5I59B 5I58B 3CFXA 4DE8A 2D21A 1QJMA 3W15C 3GBBA 5H8NA 4KYDA 3JYRA 1II5A 1Y1MA 1JETA 3SEVA 1FQBA 4Q30B 4QF9A 5DVFA 3C9HA 3GXAA 4ESXA 3H3GA 5I57B 3O6IA 1B1HA 5AA2A 1SYIA 1B0LA 4HCYA 4OENA 4KCDA 3LSXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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1MQDA 4GL8A 1HSEA 1XHYA 1CNQA 1YPNA 4FEBA 5KCJB 1JNFA 1Q1KA 1YXIA 5H8QA 5EYGA 4PF8A 4ZE9A 1JW4A 3CIJA 2CZKA 4AQ4A 4NX1A 2YLNA 4F1UA 1ZMGA 3MUQA 4ZEFA 1URDA 3RNNA 1UIVA 5CRYA 2XXQA 3OSRA 3IL1B 2F7CA 3Q28A 5KDTB 3I5OA 3VVFA 1B51A 4BDOA 4P8BA 4DLDA 1FPBA 4IY6A 3B6TA 3U65A 2DS9A 3MZ1A 5H8HA 3K2DA 4WKMA 1MY0A 3DELB 2XXVA 5HPQA 5I84A 1JVXA 4F3PA 2CMOA 1LBWA 1LBYA 2WBBA 2NWJA 4NHBA 5ITOA 2I48A 5DEXB 3UIFA 4UACA 3PD8A 1FPEA 1IXCA 4N15A 4ZEKA 1AOVA 4ECFA 3PUYE 4KXPA 3IX1A 1I6BA 3QSLA 3N5LA 3I3VA 4PE5B 3K6UA 1OQGA 5JTYB 4YMBA 2X26A 2I4CA 3EN3A 4FIMA 4PFRA 4LATA 4DXBA 2P2AA 3N94A 3MSTA 4IO4A 1SI0A 4LVQA 5ICQA 5CBRA 2KQZA 4IB2A 1KZ8A 3A3CA 2QS3A 5FHMA 3MPKA 3OMBA 1HSLA 2A5TB 5F24A 4TLMB 2GFEA 3KN7A 4K3FA 4GD5A 3CG1A 1PB9A 3TFLA 4BLAA 5ICTA 1PBPA 3FZVA 1FJ6A 1VR5A 1MH3A 4PFYA 4DCXA 2VHAA 2DE4A 4RNSA 4OFOA 4QSDA 1YTVA 3A09A 1LAHE 1YYZA 1JVYA 4N17A 3RTWB 4I8CA 1DSNA 3HPIA 1B40A 3G3IA 1JEVA 1POTA 4QRZA 3TCFA 1B2HA 2ZZWA 1I6AA 3VVDA 5FTIA 1Y3PA 1MQHA 2LAOA 1LAFE 4G8HA 4X1DA 4X1BA 5AE4A 5ISUA 1ZLQA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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