3FJ7A

Crystal structure of l-phospholactate bound peb3
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
231
structure length
231
Chain Sequence
b'DVNLYGPGGPHTALKDIANKYSEKTGVKVNVNFGPQATWFEKAKKDADILFGASDQSALAIASDFGKDFNVSKIKPLYFREAIILTQKGNPLKIKGLKDLANKKVRIVVPEGAGKSNTSGTGVWEDMIGRTQDIKTIQNFRNNIVAFVPNSGSARKLFAQDQADAWITWIDWSKSNPDIGTAVAIEKDLVVYRTFNVIAKEGASKETQDFIAYLSSKEAKEIFKKYGWREH'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Specificity of Campylobacter jejuni adhesin PEB3 for phosphates and structural differences among its ligand complexes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Major antigenic peptide PEB3
source organism Campylobacter jejuni
molecule tags Protein binding
total genus 85
structure length 231
sequence length 231
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-12-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fj7A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fj7A02
2A5TA 1LB8A 4GL0A 2XXXA 3KJTA 1JW4A 1FTMA 4HS7A 1R1NA 4ZEFA 4IY5A 4NF4B 2R6GE 3KFMA 1ZKBA 1LAXA 1ZTYA 4FEDA 2QJEA 3Q27A 1PBQA 3FUZA 3FGSA 5HBCA 4OESA 4R2FA 3EHSA 3T22A 1US5A 1O63A 3T9XB 4NEDA 4YKPA 4KI0E 3RQTA 1QUJA 3MWBA 1EZ9A 3TAJA 1ZIUA 4MLQA 3K2DA 3IOUA 3VLUA 3RGYA 3KBRA 1NL5A 2UYEA 1JVYA 3KOSA 5FTIA 3SEVA 3Q28A 2QS3A 1FTOA 2NWJA 1IXHA 3OOAA 1GGGA 1MQIA 3I5OA 1RKMA 3UP9A 1TXFA 3IO6A 3A09A 2DWAA 1MH3A 4NF8B 3HCQA 3EPEA 1B0LA 2Z8DA 4I62A 2DP8A 1MY1A 1QJMA 4LZ7A 2H9BA 3E9XA 3OO8A 3V8XB 3VLVA 3ILUB 4GXAA 3C35A 1NNKA 3FVNA 2ZNTA 5DVIA 3TMGA 2R71A 4IB2A 3HHGA 4N13A 1SW1A 3G3JA 2W7YA 4X1BA 2PT1A 3MVZA 2H5YA 3OEKA 3ZKLA 1OQHA 2Q2AA 4KQPA 5H8SA 4JB7A 1SDXA 4F19A 4ELQA 3SKPA 1LAFE 4R6YA 4H1XA 5I2NA 5CBSA 2F6GA 4DXUA 5I56B 3HPIA 4OFLA 3UA8A 2GHAA 3MVWA 4OFJA 3H6TA 1B05A 3L6GA 5BWJA 5ITPA 4TOZA 1NKXA 1MXVA 4FORA 1SBPA 1NH8A 4F3BA 5TPAB 3G3GA 4R9FA 5I2NB 1MY2A 4TLMB 4IO5A 3D4CA 3TYHA 1JNFA 4G8MA 3BKIB 3KN3A 2Y7KA 3MP6A 4THIA 4OFOA 4RY1A 2RC9A 5AA4B 1DPPA 4NF6B 4L17A 4F22A 3RUMA 3LSXA 2GHBA 3K1MA 2E1SA 3IJXB 3FVGA 4P11A 1PDAA 4LP2B 3THIA 5AA2D 3U92A 2VHAA 3VVFA 4JWYA 4YB6A 1MPDA 4HW8A 1Y1ZA 3K0VA 4G4PA 1BKAA 4QSCA 4NWCA 5TP9A 1FTKA 2Q89A 1PEBA 1S7YA 4POWA 5BUUA 4QFPA 3VXCA 3K1NA 1B9JA 3T9UA 3CFXA 4ESXA 4KD5A 2GH9A 1MY4A 1Y20A 4WXJA 4POXA 1Y9UA 3O97A 1LLSA 3H6WA 3IOTA 1B3FA 3BFUA 1MDQA 1I6AA 5A5XA 4EF2A 3N5LA 5DVJA 4U1OA 3U94A 1QULA 3I3VA 1DMBA 1DTZA 4C1TA 4ELPA 4BDOA 3LSWA 5I59A 2ZYOA 5AA3A 4F3SA 1TFAA 4FIMA 5JEIA 4RPNA 1B3LA 3OELA 2DWHA 3IORA 3HN0A 3HSTA 3G7WA 4IO3A 5A5XB 1NNPA 2ABHA 4KYDA 1KWHA 2CMOA 4X48A 1Y1MA 5CMKA 2H25A 2Z23A 4Z0IA 3N26A 2GFEA 3PUZE 1US4A 4JDFA 4BDMA 2VD3A 2O84X 1B4HA 5L9SA 4QSDA 4ZE8A 2YLNA 1A8FA 1IZ1A 4ZZAA 3S9EA 2ESNA 4Q30B 1B5JA 1ZLQA 2H98A 2QPQA 4LONB 1MPCA 1YCJA 3LSFB 1GVCA 3SERA 3SESA 3G3FA 3CI8A 1MS7A 4OMBA 2Q8JA 1B46A 3TQLA 3ZSFA 3CFZA 3WAFA 4X1DA 1YAEA 4I8CA 1WODA 4Z7EA 1MXYA 3UORA 1VE4A 2XXHA 2DE3A 2I3VA 3JYRA 4OTEA 4FAJA 4ZECA 2PVUA 2GRVA 4PE5B 4K3FA 2AIXA 1T0KA 1Y3QA 1SYIA 1B7ZA 3N94A 3JZJA 2ONKE 1QUKA 2AL4A 4U21A 3TTRA 2I48A 1R9LA 3MP8A 2QS2A 1B0HA 5M2VA 1MQDA 3M3LA 4G68C 3V5AA 4IO6A 4F1VA 1LB9A 1GTKA 2DVZA 1IIWA 3PD9A 4R73A 2XX8A 4QFNA 1LAGE 2ZYMA 4OZ9A 1OVTA 2X7PA 3OO9A 2OLBA 1B7HA 2F78A 2OJTA 1UIVA 4IO7A 1LGBC 3EHTA 3IR1A 2RCBA 5I58A 4RK9A 2ZXTA 4ND9A 4YU0A 2XXPA 3VE1B 1NH7A 5EYFA 3O6IA 2LAOA 3FXRA 4OETA 4NF5A 4U2RA 2F5XA 4U4SA 4KPTA 4OEUA 5B70A 2VOZA 1B51A 1EZOA 2R9JA 2XXVA 3UGWA 2V25A 1FTLA 3FXUA 3B6TA 2THIA 3QUFA 5H8HA 1FTJA 1SI1A 5I58B 1B40A 2P2AA 4ONYA 4RXLA 3DLNA 4FEBA 4EDPA 1XOCA 4GRKA 1FQFA 3A3UA 3QIMA 1ATGA 1POTA 5H8FB 1FQAA 3MZ1A 2V84A 3E13X 1MH4A 3R26A 1M5BA 4EXKA 2DWIA 4GF8A 2NOOA 2HQ0A 2HAVA 3UIFA 4RA1A 1OQGA 1SQYA 5H8HB 2DSFA 3FVOA 5ITOA 5ELVA 5ICTA 1PC3A 4KHZE 3PPPA 5I2KA 4LZ5A 4HCYA 1ZU0A 3RPWA 2I0BA 3H6UA 4YMBA 2A5TB 3O2AA 1QKBA 4I9DA 4N6PA 1GV8A 1SVXB 4XKNA 2Y84A 3E3KA 3TELA 3E4RA 1URSA 3U1OA 3O29A 4F39A 4BDQA 4WEPA 4O3AA 5L8DA 1HSJA 4OHNA 3SETA 1VFDA 5I57A 4ZEKA 4OENA 1YTVA 1PB9A 3CIJA 3JV9A 1RYOA 3T9VA 2XXIA 3BBRA 1QUIA 4LZ8A 1Z7ME 5F1QA 4Q0CA 1SYHA 4DDDA 1NMUA 4E0WA 4G8NA 2F7CA 1BTJA 3TPAA 3K6VA 1NNTA 5DTBA 3S9LC 4RK2A 3B6WA 2YPNA 4GQOA 3FV1A 2FNCA 1H45A 5KDTA 1P1NA 1IXIA 5AA2A 4DE8A 4FATA 3LUYA 4GIZA 5H8QA 5B7DA 2RC8A 4C0RA 3IK6B 3K1PA 3MP1A 1MPBA 1B32A 2I6EA 5HPQA 3QYTA 3CFLA 2QS4A 4C1UA 2RF1A 1A8EA 1EZPA 4ZZEA 5EHSA 3H3GA 1UTHA 2I4CA 2IA4A 4FJPA 1MXZA 2DYXA 5TU0A 5FHOA 2VGQA 5AA2B 5ICQA 4ZS9A 2RINA 3CSBA 3Q25A 3DP6A 4LATA 4GFRA 2XXUA 5IKBA 1H43A 4Q8RA 4DCYA 4RJZA 3BFTA 1IITA 3FD3A 2REJA 5CM6A 3IJOB 1UTHB 4OQOA 4M1VA 3OMBA 3RN8A 3VFJA 4DXBA 2G29A 4F3PA 2ALUA 4TQUQ 3MQ9A 2H99A 1POY1 3G3KA 2H4IA 3IB2A 1JW1A 2UVGA 1J1NA 3ODBA 3DP8A 4GXSB 1IXGA 2YJPA 4ECFA 4U1ZA 3T66A 4IY6A 4EQ7A 3GZGA 2OWSA 3G3HA 3C32A 2I4BA 4R6HA 3B7DA 3PU5A 4R6KA 1Q35A 4MBPA 5L9OA 2UVIA 2OCUA 3MZBA 3Q26A 4QRZA 5J1DA 1P1QA 5FTHA 4JSDA 4IGTA 5K2XA 3PMVA 1B7UA 3PPQA 2QMWA 1JETA 1B3HA 4G68A 5TP9B 3VDFA 3KN7A 1FQBA 1DSNA 2O1LA 4G8HA 1JW5A 3O28A 1ZJLA 3SEUA 5K2YA 4F1YA 4X9TA 3TODA 2QSXA 1JVXA 5LOMA 3MUQA 1OVBA 1FW0A 1I6QA 2Y7WA 4LUBA 4HTGA 1HSLA 3OO7A 3RT8A 3ZKKA 1QVSA 4WEDA 2E0SA 2DOJA 5H8NA 3C4MA 5CRYA 4EQBA 2CZLA 1LBBA 3GBBA 3W15C 1RYXA 2X7QA 5I59B 1JEUA 4LA9A 1SW5A 1UIUA 3VVEA 3CVGA 1I69A 2F8DA 2Y7RA 1H3DA 4H5FA 2V3UA 4QHQA 2UYFA 4Q5TA 1MY3A 3V89B 1R6ZA 4N07A 3K6XA 4R74A 5CMCA 1Y3PA 1BLFA 3M8UA 3KSJA 2Q2CA 4ZEBA 3V83A 3IL1B 4F18A 3PPOA 2DWJA 3K6UA 3PGFA 3K02A 3TEPA 4YZZA 1R9QA 5JTYA 4LQ2A 2RCAA 3ONMA 2OWTA 2QMXA 3R6UA 3D4GA 1PB7A 1M5DA 2I3WA 3KN8A 5AE4A 3KZGA 4OEVA 1Q1KA 2F6PA 4BDRA 4OWDA 1GR2A 2A5SA 1ZBMA 3H06B 2FYIA 3PUXE 2I49A 4ZE9A 5JTYB 3LSLA 3USDA 1URGA 3PUYE 4I1DA 3MVYA 2O1MA 5CBRA 4AB5A 2Z22A 1A54A 1NNFA 2HCAA 4E0XA 1N3WA 5CI5A 5AA1A 2DS9A 3ILTB 3M3FA 1UTBA 1XT8A 3C31A 3IX1A 3I6VA 1FQEA 1LFHA 2Z8EA 1MXUA 3T93B 3GXAA 2ZYNA 2UVHA 5IAIA 4QFOA 3KEIA 3FVKA 5L9MA 4F1UA 3MPKA 3H03A 1OLAA 2XX7A 1UQWA 4H8JA 4EF1A 3MZ9A 3K4UA 1Y4TA 4H67A 2P1SA 1MQHA 1MM6A 3PD8A 1D3KA 3RTWB 3CSGA 4P0GA 4DZ1A 3PMWA 3IB0A 1BP5A 4UACA 4IO2A 3RY3A 4LQ5A 4YB7A 3TCHA 1WDNA 5DT6A 4H5GA 3EN3A 5CC2A 3CG1A 1AL3A 3HV1A 1B1XA 3FZVA 1D4NA 3PPRA 3O6GA 4NF5B 4M4GA 3TCFA 4NF4A 3QXMA 3S9NC 1M5EA 4FECA 4PQJA 1WVJA 1N76A 3EQ1A 4UA8A 2XD2A 3T96B 2V93A 1H76A 3G3IA 4AQ4A 1VR5A 5DVFA 2HAUA 4OVJA 3MC2A 2F35A 3L6HA 2KLFA 4YKKA 1LBCA 4KCDA 3TCGA 1NFTA 5HM4B 3QSLA 3S2VA 4XKRA 3FJGA 2QRYA 3C33A 2PMSA 1B3GA 1B3EA 3PUWE 1F9BA 1B6HA 3K00A 3FV2A 1P1UA 5F7VA 1Z7NE 2HZKA 2HXWA 1N84A 2QL3A 2F7AA 5CMMA 1MDP1 1HSEA 5I2KB 4NF8A 1EH3A 1URDA 4DXCA 4NTLA 1BIYA 4ELOA 4R72A 2Y7PA 1LCTA 3O6HA 1FQDA 4U23A 2UXAA 2XD3A 3CRBA 3LC8A 4R2BA 3LBSA 1B5IA 3ZS6A 3IOWA 4KCCA 4PFYA 2X26A 4MH5A 1A55A 1ZMGA 5KZTA 1N7XA 2O6AA 4TLLB 4RNSA 5I57B 5I56A 2HFBA 3H4ZA 4JXIA 3QK6A 3U8QA 4F2QA 4H8IA 1YPNA 2V3TA 1MY0A 1XVYA 4QSEA 4GLIA 3H7MA 4KYEA 1IQ7A 1B58A 3TTLA 5I84A 3T9HB 3RLFE 5TPAA 1N04A 1O7TA 1I6BA 3OXNA 4YMAA 4PP0A 3FJ7A 1USYE 5KDTB 4YAHX 3IAZA 4G2ZA 3EF7A 1P1WA 5H8QB 3C34A 1O64A 3W9VA 2DXYA 1TWYA 1A99A 2PT2A 2Y7IA 4YKIA 1A7LA 2Z8FA 4NMYA 1L5TA 4AB6A 5AA4A 3FIRA 3LR1A 1LFGA 3K01A 3FJMA 4NF6A 4H65A 4XIGQ 1TT1A 2ZMBA 2O51A 2XXWA 2O69A 3TDJA 1SW4A 1MXXA 4R9GA 2RC7A 3OEMA 3S9MC 4GVOA 1LFIA 3OD7A 3MJNA 1SW2A 1AOVA 2DVCA 3MAMA 1M5FA 4EUOA 1MM7A 4OERA 1P1OA 4ISUA 1B4ZA 1MQGA 2NUVA 4GOTA 3TKDA 3CR9A 4YB5A 3TTNA 4R75A 2AL5A 4F2OA 1QKAA 3FXQA 3VLWA 1AIVA 3OSRA 3W9WA 3ECRA 4NWDA 3Q29A 4O3CA 1DOTA 1Y4CA 3U72A 1EU8A 3EHUA 2XXYA 3DP4A 3IB1A 3IO4A 4F3GA 3HO7A 3N6TA 4KFQA 2DXRA 3U93A 3QUJA 1MQJA 2OBGA 2XXQA 4KYSA 4QFKA 2XX9A 4DCXA 2DE2A 2PX1A 2HZLA 2F36A 3SEXA 1B1HA 2AYSA 4RYAA 4KR5A 4BDLA 4F29A 1IXCA 4OXVA 4PFUA 3C36A 2D21A 3VV5A 4U22A 2RKMA 3WAEA 1ANFA 4FE8A 4G68B 3R7XA 3PUVE 2REGA 3SDFA 2O7IA 2P0SA 2NVUB 4ELRA 2ZNUA 3K6WA 4EQ9A 4YICA 4H6DA 3PMXA 5FHMA 5KCJA 1CE2A 4IGRA 1ELJA 4MLVA 4IO4A 1CB6A 3KGCA 3TTMA 4GL8A 3VXBA 1OIBA 3UK4A 3RT6B 4XXUA 2FA7A 3IOVA 4LVQA 3H6VA 2ONRA 3F11A 1AMFA 3QAXA 3O9PA 1JQFA 5H8NB 1DTGA 1D9YA 4BDNA 2NXOA 1M5CA 5DEXA 2D3IA 1PBPA 3RTFB 4ESWA 4U4XA 3O66A 1SD3A 3MW0A 5KCJB 4JSOA 1B2HA 2HEUA 3TQWA 1Y3NA 4XKPA 2DQVA 4GD5A 3DELB 4G77A 3B6QA 2F34A 4PETA 1XS5A 4JBZA 2ZYKA 3C9HA 1N7WA 4MFIA 1OLCA 2Q9TA 5DEXB 2XXRA 3FASA 2OK2A 2O68A 3TUSA 3TTKA 4PFWA 1IEJA 1MXWA 3GBAA 5CMBA 3S4UA 2BJJX 1SI0A 3TFLA 3MBPA 2O7UA 3P7IA 1S50A 2PYYA 4F31B 4PFTA 1D9VA 2M8CA 3MVXA 2VD2A 3SEYA 2VP1A 1XHYA 3CG3A 2ZNSA 3PV0E 3OSQA 2F97A 5JK4A 2DE4A 1MG1A 4WKMA 3DM0A 4JWXA 1VFEA 1II5A 4YKJA 2B3FA 3OO6A 1MRPA 4XTCQ 1PB8A 1LCFA 1A40A 3KSXA 2UVJA 2V3QA 1N3XA 3GLBA 3KJ7A 2B65A 1H44A 2XXTA 4O3BA 3UN6A 1FQCA 1AH5A 2F7BA 1JEVA 4GWOA 3A3CA 4EXLA 1LSTA 4DIGA 3VVDA 3TZAA 2D5WA 3AXFA 3SEWA 5FHNA 3N6UA 1TFDA 2I58A 2OZZA 1UTBB 1VSOA 4BLAA 2IEEA 2G93A 3MPLA 2B3BA 4DLDA 1B5HA 1XVXA 3FATA 3HHFA 3KOTA 1S9TA 4NE4A 4ZEIA 1LAHE 2Q88A 2PBWA 5H8FA 4RPOA 1B52A 3M3KA 4MF3A 4QF9A 4ZDMA 5DYHA 1FCKA 1N0TA 1QW0A 4P0IA 3RNNA 4ZEDA 4HCWA 4XKQA 5ISUA 3PPNA 4H0WA 5EHMA 3KG2A 2ANJA 4QFLA 1DPEA 1IUDA 2ONSA 2WKYA 4OYVA 2XHDA 3OENA 4JWOA 1P99A 1USYH 1XC1A 2I0CA 1OMPA 2QS1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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