5I2NA

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with n-ethyl-7-{[2-fluoro-3-(trifluoromethyl)phenyl]methyl}-2-methyl-5-oxo-5h-[1,3]thiazolo[3,2-a]pyrimidine-3-carboxamide (compound 29)
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
279
structure length
277
Chain Sequence
DNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Discovery of GluN2A-Selective NMDA Receptor Positive Allosteric Modulators (PAMs): Tuning Deactivation Kinetics via Structure-Based Design.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
total genus 82
structure length 277
sequence length 279
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i2nA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i2nA02
3I3VA 2PT2A 1QUJA 3Q27A 1B32A 2PMSA 4FJPA 4ZZEA 2AIXA 4OESA 3TCFA 3C35A 2DOJA 3CFXA 5TPAB 4FEDA 1BP5A 4QF9A 1LGBC 3KGCA 4PFTA 1SI0A 3FVKA 5CI5A 3PUWE 3OO8A 4ELPA 1ZMGA 4BLAA 3QSLA 5I59B 1LB8A 3UN6A 4YICA 2O1LA 2F78A 3RUMA 4BDQA 2Y7KA 4OHNA 1QUKA 4PE5B 3OO9A 1DMBA 4Q5TA 3PV0E 3MPLA 1XVYA 3TTKA 1IEJA 1S7YA 3PU5A 2QMWA 3Q25A 1D4NA 2VOZA 2V3QA 4G8HA 1M5EA 4GL8A 4F2QA 3MP8A 3KOSA 2Q2CA 4F19A 1URSA 4YAHX 3TODA 1MS7A 3T66A 1FQBA 4NEDA 1A8FA 4BDOA 1MH4A 4N6PA 5ITOA 1KWHA 1IZ1A 3PGFA 2OJTA 1NNPA 1B7HA 2OBGA 2F6PA 4MFIA 4LZ5A 1SVXB 1LFIA 4IGRA 3TMGA 1Y3PA 2UYEA 1RYOA 1B5IA 5A5XB 2F7BA 4YKKA 3IAZA 2CMOA 1ANFA 4LUBA 3A09A 3R6UA 2A5TB 1EU8A 4THIA 1GVCA 2F34A 2M8CA 4IO3A 5I56B 4RNSA 3RTWB 3GZGA 1P1WA 3H03A 4GOTA 2VD3A 3O6HA 2NXOA 3EQ1A 5I2KB 2UVIA 4K3FA 1SD3A 3TTRA 3MW0A 1EZOA 3G3KA 3MJNA 5H8HA 4U21A 1FCKA 4TQUQ 5F7VA 1II5A 4BDRA 2H9BA 3O97A 5HM4B 1LAGE 4H5GA 3TQWA 3U8QA 3QUJA 1EH3A 1JEUA 2IEEA 2W7YA 3I6VA 1VFDA 1MQJA 3O6IA 4NF4A 4GFRA 4NF8A 3SERA 1NH7A 4YMBA 4MBPA 1DPEA 4JSOA 1H45A 3QXMA 1YAEA 3SEWA 1NNTA 2P1SA 2XXXA 2CZLA 2ANJA 3PMWA 2HEUA 1NFTA 3GBAA 5JTYB 3HHGA 4NWDA 3KJ7A 4F1YA 3O9PA 3MAMA 1FTKA 1NKXA 1MM6A 5TP9A 5HBCA 5CC2A 1N7XA 2R9JA 3BFTA 2ALUA 2HAUA 5DYHA 3FV1A 1UTBA 4H1XA 3Q29A 3ZKKA 4I9DA 4F3BA 3HPIA 4JSDA 3OSRA 4AB6A 2P0SA 1M5DA 1GR2A 3OEMA 1AOVA 4Q30B 3TDJA 3KN8A 2XXHA 1M5BA 4QFLA 4PFYA 2I49A 1NL5A 4RK2A 2KLFA 4JWYA 5CMKA 5EYFA 4XIGQ 3UP9A 3SKPA 2Z23A 3T96B 3CIJA 3FJMA 1UTHB 2DXRA 2XD2A 2YPNA 3RLFE 2Y84A 3E3KA 3IJOB 1B1HA 3C34A 3ILUB 4EQ9A 1N3WA 3K02A 2Q8JA 2DQVA 1P1OA 3TUSA 3PPNA 1SYIA 1BLFA 2THIA 4L17A 4JWOA 2D3IA 4F31B 1TXFA 2Z8EA 2F5XA 5DEXA 4FEBA 1AL3A 1POTA 2RINA 5BUUA 3V83A 1SI1A 3MVYA 3G3GA 4ONYA 1MXXA 1GV8A 4XKQA 1MXZA 5EHMA 3B6TA 1BKAA 1Y1MA 1LLSA 1JW5A 4PFUA 3CSBA 4U23A 1Y4CA 4E0XA 4U4SA 2I4BA 1R1NA 4YB5A 1B9JA 3KBRA 1B3HA 5ELVA 1ZU0A 1PBQA 1MY0A 2VD2A 4KI0E 3HO7A 5KCJA 3FZVA 4O3AA 5LOMA 4QRZA 5I84A 3KOTA 4X1DA 4R2FA 3D4CA 3KFMA 1B2HA 2DWIA 3MP6A 1M5CA 2Y7WA 1YPNA 3USDA 3DP8A 5H8FB 4AQ4A 2OZZA 1MY3A 3M3LA 2F8DA 2I6EA 4RK9A 2OCUA 4HCYA 3TELA 4OMBA 2ZNSA 3TTLA 3K1MA 4H8IA 3IOUA 4MLVA 3VV5A 3MPKA 4WXJA 2HQ0A 3S9EA 4EQ7A 2OLBA 3V5AA 2F7AA 3BBRA 1DTZA 2V84A 3FGSA 2HFBA 1CE2A 1HSEA 3SEVA 1R9QA 2O6AA 1H43A 5KDTB 1S9TA 5I57A 3SEYA 3H6WA 4WKMA 2XX9A 1YTVA 2DE4A 2XXPA 1I6QA 4RYAA 2YLNA 5FTHA 3ONMA 5H8QA 1R6ZA 2PX1A 2I3WA 3U94A 1T0KA 1LBBA 1MY4A 3C36A 4Q8RA 1LAXA 1OVBA 4PQJA 4GXAA 5ICQA 3S9NC 1NH8A 2DXYA 2D21A 4NWCA 3PPRA 2X7PA 5CBSA 3IO6A 3CSGA 3TPAA 4FORA 2RKMA 2F36A 4U22A 3N5LA 4HS7A 4NTLA 3DP4A 1M5FA 4NMYA 2H4IA 2P2AA 3L6HA 1P1UA 2AL5A 3M3FA 3CFLA 1JW1A 3PD9A 4R72A 4QFNA 5L9SA 4U1OA 5I58B 5H8SA 3TEPA 2R6GE 1JEVA 2XXRA 1SQYA 4QSEA 3PPPA 4PETA 3AXFA 3OSQA 3VLUA 4EF1A 1VSOA 5I2NA 3SEXA 2RF1A 5CMCA 1B58A 2VP1A 4WEDA 1IXIA 3R26A 4R2BA 2NWJA 2XX8A 4F22A 4ZDMA 4ZZAA 3FXRA 3MVWA 4IB2A 1RYXA 4TOZA 5B7DA 3OELA 4G68B 3BFUA 1RKMA 2A5TA 3GXAA 3FJGA 4YB6A 2VGQA 1F9BA 3H6TA 1LFHA 4NF5A 3HHFA 2XXUA 4IO4A 1PB9A 2FA7A 5AA4A 4F29A 4Z7EA 1H3DA 3IB0A 4RY1A 4UACA 3UK4A 3MZBA 1GGGA 4QSCA 1Q35A 2ZNTA 4ZECA 4X48A 4R6HA 5AE4A 1O64A 3K1NA 2DVCA 4C1TA 3E13X 3K4UA 4I1DA 1LFGA 1FTMA 3VDFA 3W9WA 4H5FA 3CFZA 1B6HA 2ZYKA 4AB5A 2E1SA 1XC1A 4Z0IA 1IXGA 3MQ9A 3UIFA 3ZS6A 3TFLA 3WAFA 1HSJA 2RC8A 2RC7A 2HXWA 4QFPA 2DWAA 3TYHA 3RGYA 4U4XA 2WKYA 3UORA 5H8NA 5CMBA 3N94A 1LCTA 3K6VA 1MQHA 2G29A 1LSTA 3RT8A 3O6GA 4ZEBA 3T9XB 4LATA 1PB8A 1Y3NA 3TCGA 3TQLA 4P11A 2DVZA 1XVXA 1LAHE 5CRYA 4O3BA 2Q9TA 5DVJA 3H7MA 3IX1A 3N26A 1QW0A 1VE4A 4XTCQ 1Y9UA 3FD3A 1FTLA 3CG1A 2HCAA 3MP1A 4KQPA 3SDFA 3C31A 4ZEKA 2R71A 4DDDA 2O7IA 2H5YA 5DTBA 3B7DA 3KSXA 5L8DA 2DE3A 4H6DA 4H8JA 3DM0A 4EXLA 4FAJA 3QUFA 5AA2B 4ZEDA 1ZIUA 3GBBA 4HTGA 4DLDA 2X26A 2A5SA 3L6GA 3THIA 3UA8A 3S4UA 2RCAA 1FTJA 4R9FA 2O69A 3A3UA 4GIZA 3IJXB 4JWXA 5H8HB 4C1UA 4Q0CA 3MWBA 1B40A 2ZMBA 1AMFA 4I62A 2LAOA 2QJEA 2HZKA 1B3LA 1US5A 4OENA 3G3HA 2GRVA 4KYDA 1FW0A 1B3EA 3U72A 1PBPA 1P1QA 1SDXA 1A40A 2PT1A 4DCYA 1QUIA 4TLMB 2O84X 4NF4B 3HCQA 2PVUA 1URGA 4NF8B 4LZ8A 2I0CA 4LQ2A 4ZS9A 1BTJA 3LUYA 2DWJA 3CR9A 2XXYA 5CM6A 1POY1 1MDQA 4G8NA 1A54A 3PD8A 1Z7NE 4BDNA 3R7XA 4PP0A 1H76A 3RTFB 3RY3A 2B3BA 2AL4A 3EHUA 1TFDA 4NE4A 1B4ZA 1IXCA 1OIBA 1Z7ME 5TU0A 1SW1A 4N13A 4YU0A 1DSNA 3OENA 5IAIA 1LBCA 2I3VA 2O7UA 4OFJA 4LP2B 1B7ZA 4BDMA 4DCXA 5ICTA 4F3SA 3P7IA 2O1MA 1FTOA 1UTBB 3IB2A 1JETA 4TLLB 3MVXA 1N76A 5ISUA 4H65A 4I8CA 2QSXA 3TTNA 3PUVE 1MG1A 3ZSFA 2DYXA 4R6KA 4NF6A 3IOTA 2V93A 1USYE 4MF3A 5EHSA 4JB7A 1MPDA 3H4ZA 4EUOA 4WEPA 3EN3A 4MH5A 4GVOA 2OWSA 3FVOA 1UQWA 4DE8A 4JBZA 4OQOA 5JEIA 4KYEA 5DT6A 3T22A 4O3CA 5B70A 2UVJA 3Q28A 2BJJX 1R9LA 3KN3A 1VFEA 4OERA 4P0GA 5L9OA 4GXSB 4LVQA 1ATGA 1PB7A 4YKIA 5AA1A 3U1OA 2UXAA 1ZBMA 3I5OA 3JYRA 4IY6A 1DTGA 4FE8A 2NOOA 1MQIA 2ZYOA 5DEXB 4RJZA 4R74A 4YKJA 3EHSA 1A8EA 4M4GA 4IO7A 1QKAA 3G7WA 4X1BA 3N6TA 1J1NA 2XXTA 3PPQA 4MLQA 2F97A 3C32A 3TZAA 3PUYE 1PDAA 4POWA 3C9HA 3DELB 4R6YA 3LSLA 4R73A 3G3JA 3SESA 4RXLA 5TPAA 1B46A 1I6BA 4IO6A 4C0RA 2XXQA 1O7TA 2Y7IA 3OO6A 1FQCA 3TTMA 2V3TA 4RPNA 5KCJB 5DVIA 1JW4A 1B52A 4YB7A 5I59A 1OLAA 3IR1A 1N3XA 4G68C 2F6GA 1XS5A 3Q26A 3MVZA 2Q2AA 2ZYMA 1B3GA 4N07A 3RNNA 2AYSA 3IO4A 3A3CA 1XOCA 2DWHA 3GLBA 3ILTB 3IL1B 3IORA 4KPTA 4ESWA 3V8XB 2ABHA 2QRYA 4XXUA 3E4RA 4R75A 2F35A 4G4PA 3VFJA 3K01A 4GF8A 4ZE9A 3H3GA 2XHDA 3S9MC 3FASA 3ODBA 3H6VA 4QFKA 5I57B 1EZ9A 3HN0A 3K6XA 2IA4A 3C4MA 3IOVA 1Y20A 3H6UA 2G93A 4U1ZA 3QYTA 5J1DA 2OK2A 4R9GA 2UVGA 3LC8A 4OETA 1OLCA 2I0BA 5H8QB 3K6UA 3OEKA 1UIUA 1MXYA 5A5XA 4LA9A 3KG2A 3VLWA 2HZLA 1N7WA 5FTIA 1I6AA 3RPWA 2V3UA 3VVDA 1H44A 4F1UA 4KHZE 4IO2A 4DIGA 3S2VA 1ZTYA 3PUXE 1MRPA 4EF2A 5I56A 4OZ9A 4F18A 2D5WA 2XXWA 4HCWA 3H06B 1N0TA 3K1PA 1SYHA 1US4A 4G8MA 5I2KA 3FXUA 3K6WA 4KFQA 1NNKA 4U2RA 4EDPA 4GD5A 1B5JA 4F3PA 4EXKA 1ZKBA 2QS4A 2DS9A 3VXBA 1MPCA 1TT1A 1AIVA 3BKIB 3OXNA 4H67A 5L9MA 1YCJA 5JK4A 3O66A 1IITA 3MZ9A 3OO7A 5I2NB 3DLNA 3M3KA 4LONB 4ELOA 4DXBA 3FVGA 3CG3A 1B5HA 1LAFE 4QFOA 4P0IA 1JVXA 2H25A 3WAEA 1QKBA 4GWOA 2NVUB 1SW5A 2O68A 4XKPA 3HV1A 2GHBA 5FHOA 3LSWA 5AA2A 3LSFB 4M1VA 1B4HA 4G2ZA 4E0WA 3B6WA 1MXWA 2ESNA 5JTYA 3SETA 4GLIA 3OD7A 4NF5B 4XKNA 4G77A 1SBPA 3FJ7A 1USYH 5M2VA 1Q1KA 5AA4B 3EHTA 3G3IA 1URDA 4YZZA 3MC2A 4FATA 2Y7RA 2Y7PA 4YKPA 2Q89A 2QS1A 2QPQA 5HPQA 1LCFA 2ONRA 4KD5A 3B6QA 3RQTA 4FIMA 1MQGA 4ISUA 2GFEA 4KR5A 2QL3A 4BDLA 5F1QA 1MH3A 4ECFA 1PEBA 3KN7A 4RPOA 3SEUA 2PYYA 1D9VA 1O63A 4DZ1A 5AA2D 3S9LC 3ZKLA 3PMXA 4X9TA 1IXHA 1JVYA 4QHQA 3UGWA 2Z8DA 1D9YA 1JNFA 4RA1A 2DP8A 3MUQA 1OQGA 4KCCA 4EQBA 2HAVA 4OVJA 2X7QA 4OXVA 5KZTA 3EF7A 1FQEA 5H8NB 2OWTA 1D3KA 2H99A 3DP6A 3LR1A 2RC9A 1UTHA 4LQ5A 4YMAA 4JXIA 1VR5A 2ZYNA 1NNFA 2Z22A 4F39A 4F3GA 4ZEFA 1MPBA 4GRKA 3T93B 1DPPA 4OWDA 4KCDA 1SW4A 3O28A 1MXVA 4ELRA 2ONKE 2YJPA 4LZ7A 3VVEA 1TFAA 1HSLA 2Z8FA 1MQDA 2DE2A 2REJA 3W9VA 2B65A 4KYSA 3LBSA 2QS2A 3OOAA 2I58A 1TWYA 1B3FA 2ONSA 2Q88A 3O2AA 4OEUA 5AA3A 2NUVA 4GL0A 1L5TA 3JZJA 3N6UA 2DSFA 4F2OA 2ZXTA 2FYIA 1B1XA 4IY5A 3FATA 1SW2A 4PFWA 2ZNUA 2I4CA 4QSDA 3KZGA 1WODA 1OQHA 2UVHA 1A55A 2V25A 1I69A 5TP9B 5FHNA 3QIMA 2O51A 3IOWA 1QVSA 3VE1B 1B05A 3VLVA 3KJTA 3V89B 1B0LA 1MDP1 3TAJA 3T9HB 1XT8A 5H8FA 3C33A 4ZEIA 1N84A 3FXQA 1GTKA 5FHMA 5K2XA 2B3FA 3QK6A 5BWJA 3FUZA 3TKDA 3U93A 2QMXA 3HSTA 4IGTA 4ELQA 3PPOA 2GH9A 4FECA 4XKRA 1NMUA 1Y4TA 3JV9A 3U92A 1B51A 3FV2A 1IUDA 3K00A 5K2YA 2XXIA 5DVFA 4H0WA 2REGA 1S50A 5KDTA 4ESXA 4GQOA 3VXCA 1B0HA 1MM7A 2PBWA 1IIWA 1ELJA 1JQFA 4DXUA 1MY1A 1DOTA 3G3FA 1P99A 1ZJLA 3RT6B 4IO5A 2XXVA 2E0SA 3ECRA 2QS3A 3F11A 1N04A 3OMBA 1FQAA 3T9UA 2UYFA 1XHYA 4OFLA 1P1NA 1WDNA 2RCBA 3FVNA 5ITPA 1QULA 4OEVA 3TCHA 1ZLQA 3RN8A 1OMPA 4HW8A 1IQ7A 4UA8A 3M8UA 2H98A 1QJMA 1WVJA 3IB1A 3PUZE 3W15C 3D4GA 1LB9A 3CVGA 1A7LA 1B7UA 3E9XA 1UIVA 4NF6B 2XX7A 2F7CA 1EZPA 1MY2A 3KEIA 1OVTA 3T9VA 1PC3A 4OFOA 2XD3A 5IKBA 1Y1ZA 3PMVA 5CMMA 3LSXA 1BIYA 3QAXA 4ND9A 5I58A 1AH5A 1A99A 3CRBA 4POXA 3CI8A 1CB6A 4ZE8A 4OTEA 2VHAA 3O29A 2I48A 3EPEA 3VVFA 4F1VA 3K2DA 3KSJA 3MBPA 1Y3QA 4OYVA 3IK6B 2GHAA 2FNCA 4JDFA 4DXCA 3MZ1A 1FQDA 5CBRA 3FIRA 3K0VA 1FQFA 1MXUA 4G68A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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