3PUYE

Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to amp-pnp after crystal soaking of the pretranslocation state
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITKASAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transport protein, membrane protein
molecule keywords Maltose transporter subunit; periplasmic-binding component o
publication title Crystal structure of the maltose transporter in a pretranslocation intermediate state.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 118
structure length 374
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puyE02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puyE01
1A7LA 1H76A 1SYIA 3MWBA 3PV0E 3HCQA 3FGSA 3VVEA 1B3EA 3TCFA 1OVBA 4KYEA 3FASA 2D3IA 1LBCA 2ZXTA 4FIMA 2HAUA 1O64A 4IO6A 2REGA 1MY1A 4DXBA 3C33A 3DELB 3G7WA 3O97A 3O9PA 4ELRA 3OO6A 3T96B 1MY3A 2H25A 4EXLA 1S50A 3PU5A 3W9WA 2XX7A 3HHGA 1M5CA 3TELA 3C32A 3H6TA 1FTMA 1GGGA 4LP2B 5CRYA 5JTYB 4MLQA 1POY1 5L9MA 3G3FA 1FQFA 4WKMA 1LB8A 3G3HA 3OO8A 1QUKA 1MXXA 1HSEA 4F22A 4YB6A 3N26A 1DTGA 2XHDA 2F7CA 1EZOA 5AA4B 2WKYA 2CZLA 1HSJA 1PC3A 2F6PA 3PMVA 4F31B 5ELVA 1PBQA 1IQ7A 3M8UA 3GBAA 3MAMA 1IIWA 5F1QA 2DSFA 3FJMA 3ZKKA 4GFRA 1ELJA 2F35A 4U4XA 5FHOA 3BKIB 3PD9A 3IB2A 3ODBA 4HCYA 2XXTA 2I0CA 1F9BA 5EYFA 5CM6A 2D21A 3QUJA 4F3BA 5JTYA 4ELQA 2NOOA 3W15C 2HCAA 1SDXA 4UA8A 2ANJA 1PBPA 3K02A 1Q35A 1SVXB 2HXWA 3HHFA 3G3GA 1MPBA 2QRYA 1QVSA 2UYFA 2V25A 2PVUA 5EHMA 1NFTA 1B51A 4QFPA 1RYOA 1NNTA 1VFDA 2E1SA 4PE5B 1B4ZA 3TODA 2AYSA 2GHAA 3KJTA 1BTJA 1UIUA 1H44A 2O69A 5TPAA 3G3JA 1US4A 3K1MA 5KCJA 1N7WA 3N94A 3CR9A 3MZ9A 4JWXA 2DE2A 3DP8A 1SQYA 4FEDA 2YPNA 5ICQA 4LZ5A 4RK2A 4H5GA 4DE8A 4U1OA 2ESNA 3ILUB 2OLBA 1MY4A 3TQLA 4X9TA 2F78A 3V5AA 4G8MA 2THIA 4N13A 1NH8A 4H5FA 3KGCA 4XKQA 5CBSA 1HSLA 4GD5A 3SEWA 2GH9A 1Z7ME 1S9TA 4RPNA 1JETA 3MVZA 4PFYA 3RT6B 4EXKA 3U8QA 2F36A 1Y20A 3H7MA 1NH7A 2DYXA 3KSXA 1BP5A 5F7VA 4OESA 1ATGA 4KR5A 4R9FA 4F18A 4PQJA 4DLDA 1N76A 1FTOA 2P2AA 3THIA 4BLAA 1LGBC 4GRKA 1P99A 3O6IA 3B6TA 2PYYA 1B3LA 3HPIA 2RC8A 3KN7A 1A8EA 1ZU0A 2I49A 5JK4A 1P1NA 5AA3A 1DTZA 3GZGA 3OD7A 1B9JA 1B40A 1B4HA 3KN3A 3MVYA 2I6EA 3CFXA 4XKNA 2D5WA 2W7YA 3FXQA 3C4MA 4G68C 1I6QA 4QFOA 2XXIA 3MVWA 4KFQA 4JB7A 4F29A 1M5FA 1B5HA 3UORA 2V84A 4DCXA 3FVKA 2OWTA 1D3KA 4F19A 4ZEIA 1LFIA 1UTBA 1B0HA 4QSCA 5M2VA 3KBRA 2G29A 3RN8A 4QFKA 4OZ9A 3V83A 4XKRA 5J1DA 1ZKBA 3BFUA 1JVXA 4C1TA 2UYEA 5TP9B 3EHTA 2ZYKA 4R2FA 4OWDA 4IO4A 5CMKA 2HZLA 4ZEKA 3N5LA 2HQ0A 1AL3A 1B32A 2HEUA 1Q1KA 4H8IA 5B70A 3IOTA 1MPCA 2R71A 4PFWA 1FCKA 5DVJA 4F1UA 2F97A 4R2BA 4GQOA 4NE4A 3MP6A 2XXHA 4NF5B 2Q2AA 1CB6A 4F3PA 2ALUA 3C35A 4ZEDA 5AA2B 3TYHA 1R1NA 2RC9A 2XD2A 3M3LA 4WXJA 4DCYA 2IA4A 4U1ZA 3K0VA 4H8JA 1O63A 3CG3A 3WAFA 4IO5A 4ZECA 4LONB 3CFZA 2RC7A 4IO2A 3MP1A 4RNSA 3O6GA 4AB6A 1LBBA 4H65A 2R6GE 4EDPA 3GBBA 3SERA 3ONMA 4ZEBA 5AE4A 4P0GA 2XXUA 1MY2A 1P1WA 1RKMA 3KN8A 2DOJA 4ZE8A 4NF5A 3JYRA 5DT6A 1OLCA 4BDMA 3R7XA 2Y84A 5I2NA 2ZYNA 2X26A 2XXRA 4C0RA 4KPTA 2RINA 4F39A 1Y1ZA 1QUJA 3RGYA 3FJ7A 3RQTA 4QRZA 3VVFA 4O3AA 4HTGA 2YJPA 3I5OA 2DWHA 3FVNA 2ONKE 1R6ZA 3H6UA 3RLFE 5I2KA 3TEPA 4NF4B 4NMYA 1B5JA 2VGQA 4NTLA 2GFEA 1CE2A 2PBWA 2Z23A 4QSDA 1GV8A 3IAZA 1N04A 2I58A 2O1LA 1JW5A 2UVHA 1NKXA 4TLMB 5AA1A 2Z8EA 4ZZAA 2OWSA 2O7UA 3OO7A 3K4UA 2V3TA 1PB9A 1URDA 2Q9TA 4KHZE 1H43A 4R9GA 4DDDA 4ESXA 1VR5A 2ZYMA 1JEVA 3FZVA 2PT1A 5IAIA 2UVJA 5ITOA 3I3VA 4NF4A 4G8HA 4E0XA 1D9YA 1R9LA 2FYIA 1YAEA 1MRPA 3TPAA 4YICA 5HM4B 1NL5A 2X7PA 1XC1A 3DP4A 2O7IA 1FQEA 1I69A 1MH4A 2X7QA 1N3WA 4PFUA 3Q29A 4NF8B 5CBRA 1B7HA 5CMCA 3GLBA 3U72A 2DS9A 4H6DA 4PFTA 1POTA 4DZ1A 1EU8A 2QS1A 3ZSFA 4OYVA 4N6PA 4OERA 2F34A 2Z22A 3M3FA 3QSLA 1OQGA 1MM7A 3UN6A 4U2RA 5KDTA 1N84A 4KQPA 1SD3A 5DYHA 5A5XB 3RTFB 1FTKA 3SDFA 2DWIA 2A5TA 2VHAA 2I3WA 5BUUA 4MFIA 4OFLA 1Y4TA 4U23A 4TLLB 3O28A 3PUZE 1IXHA 3QYTA 4ZZEA 1SW1A 3IOWA 3K1NA 3EF7A 5KZTA 3PPNA 1B05A 1JQFA 3BFTA 3U92A 3EN3A 4G8NA 3TTLA 2OZZA 4NWCA 1MXUA 2O68A 3C31A 1UIVA 2DE4A 4R75A 4R72A 4GF8A 3E13X 1IEJA 3KEIA 2Z8FA 1MXVA 3USDA 2NVUB 4F2QA 3IK6B 2VOZA 2AIXA 1B6HA 3RNNA 1B1XA 3U93A 3Q25A 1D9VA 4ND9A 1OLAA 4I9DA 3B6WA 5EHSA 1QJMA 3TCHA 1GR2A 4U22A 3KG2A 3G3IA 1M5DA 2RCBA 5FHMA 5JEIA 2XX9A 1MQDA 3IB1A 4X48A 3EPEA 5AA4A 2HZKA 1R9QA 3FIRA 2GRVA 3LSFB 3IO4A 3B7DA 4EF1A 4YB7A 2P1SA 1JW4A 4KYSA 3QK6A 4OVJA 1JNFA 1A8FA 4H67A 3KOSA 4YKKA 1DSNA 5L8DA 3DP6A 3E9XA 1AIVA 5CMMA 5DVIA 4KYDA 3IJXB 4U21A 3K2DA 2QMWA 5H8NB 1LAHE 1N3XA 1MH3A 1TT1A 4EQ9A 3EHUA 4EQBA 2Z8DA 5B7DA 1P1OA 2F5XA 3TKDA 5CMBA 2UVIA 3UGWA 3A3CA 1FQDA 3T9UA 4KCDA 5I57B 2Y7RA 1LB9A 5CI5A 2ZYOA 4M4GA 3MVXA 2H9BA 3V89B 1YCJA 5CC2A 4YKJA 1S7YA 3N6TA 2O51A 4JWOA 5AA2D 4C1UA 4YU0A 2I4BA 3GXAA 2AL4A 3PUWE 2QJEA 2HAVA 1B7UA 1AMFA 1MXZA 4R6KA 1LAFE 2B3FA 3TTKA 3DLNA 5ICTA 1LSTA 3E4RA 1N0TA 1ZJLA 1DOTA 2ZNTA 5DEXB 1QULA 4GWOA 3O6HA 3TAJA 2QSXA 3N6UA 4F3SA 2DP8A 1M5BA 4TOZA 3S9LC 3H4ZA 2DE3A 5FHNA 3PPQA 4HCWA 3QXMA 5HBCA 1B3GA 1LCFA 1JW1A 4QF9A 3U94A 3PPRA 3UA8A 5H8QB 3VVDA 2Q8JA 1OVTA 1TWYA 2OCUA 4IB2A 1L5TA 3VFJA 1D4NA 2XD3A 4EF2A 1NMUA 3P7IA 4YKIA 5DEXA 4QFLA 3TTNA 3TFLA 4X1BA 3PUVE 3C9HA 1FTJA 3UP9A 1QUIA 3M3KA 4LUBA 2Y7WA 4P11A 5ISUA 2OK2A 3CSGA 3V8XB 2NWJA 3C34A 3PMWA 5FTIA 1USYE 1YPNA 3F11A 4GLIA 1B2HA 3D4GA 5H8QA 3S9NC 3RUMA 3HSTA 1UQWA 4QHQA 3CVGA 1WDNA 1IXCA 3Q27A 4O3CA 1B0LA 2VD2A 3PMXA 4EUOA 1A99A 4BDQA 2LAOA 3VLUA 2P0SA 1AOVA 1Y3PA 4U4SA 4XKPA 3IB0A 5TP9A 3VLVA 3CG1A 4MF3A 3FATA 1FW0A 1PEBA 3VXBA 2G93A 4BDNA 4BDRA 2H98A 3PUXE 4OFOA 2F8DA 3ECRA 1A55A 4G2ZA 4IGRA 1Y9UA 3LC8A 2XXQA 2DXYA 3SETA 3MJNA 1MY0A 5AA2A 3KJ7A 3MP8A 4THIA 4RK9A 2HFBA 1MDP1 4OENA 1XHYA 1IITA 1VE4A 2AL5A 3IR1A 4UACA 1IZ1A 3AXFA 4RY1A 2NXOA 3K00A 4ZDMA 4G68B 4HS7A 4IO7A 1B1HA 1SW2A 5H8FB 4F3GA 3KZGA 1ANFA 3IL1B 3OO9A 2XXYA 4MBPA 1M5EA 3TTRA 2I3VA 2OBGA 3TMGA 4GXAA 3QAXA 5LOMA 4FJPA 4G77A 4DXCA 3TCGA 5DTBA 4E0WA 1RYXA 1Y3NA 3VXCA 4Q30B 3KOTA 4BDOA 1JVYA 3PGFA 1I6BA 1BKAA 1QW0A 4XXUA 3OSQA 2PX1A 1MS7A 2E0SA 5L9OA 3MQ9A 5H8HB 1DMBA 4LVQA 2F7BA 4I62A 4GL8A 2XXXA 1IXGA 3K1PA 1JEUA 3CSBA 5H8SA 2ZMBA 4GVOA 1MQJA 4Z7EA 3EHSA 3RY3A 3IJOB 2XXWA 4ESWA 3PPOA 1MM6A 1B7ZA 4Q5TA 3TTMA 1OQHA 3E3KA 2QS4A 4RXLA 3VDFA 1ZLQA 2Y7KA 3MPLA 4IY5A 4IO3A 2V3UA 1SW4A 3IOVA 1NNKA 3MZBA 4MLVA 4G4PA 1TXFA 3K6WA 2A5SA 4ZEFA 1O7TA 2VP1A 4QSEA 3W9VA 4WEDA 4JDFA 4Z0IA 5H8HA 3TZAA 1B3FA 1URGA 1LAXA 3Q28A 4XIGQ 1NNFA 4NF8A 4XTCQ 1A54A 3K6XA 4DIGA 2DQVA 2KLFA 4LA9A 1NNPA 4ECFA 4YB5A 2GHBA 2ABHA 3G3KA 2H5YA 2OJTA 5I56B 5K2YA 3ILTB 1N7XA 3EQ1A 5A5XA 4POWA 3MZ1A 4YKPA 2DWJA 1P1UA 2H99A 3LUYA 3MC2A 4FEBA 2RCAA 3O29A 3CI8A 3A3UA 1MQIA 1VFEA 1PB7A 1VSOA 4MH5A 1SI0A 4IY6A 3VE1B 3MBPA 3H03A 3VLWA 5I58B 3IX1A 4GL0A 3H06B 1LAGE 1WODA 1ZIUA 2Q2CA 3SEVA 5FTHA 3KFMA 5TPAB 4YMBA 3OMBA 4NEDA 3OSRA 5I56A 5KCJB 3FVOA 3UIFA 3JZJA 4Q0CA 4ISUA 3K6UA 2Q89A 1B52A 1TFAA 3KSJA 2PT2A 1GVCA 3LBSA 3K01A 4IGTA 2V3QA 3T9XB 2Y7IA 4LATA 4H0WA 4OMBA 1A40A 4FORA 1URSA 1SYHA 1Y3QA 4R6HA 1EH3A 3RTWB 4DXUA 3UK4A 5I58A 2XXPA 1YTVA 1LCTA 1FQCA 3L6HA 4JSDA 1PB8A 3LSLA 2FA7A 3FUZA 2ZNSA 2UXAA 4LQ2A 3BBRA 4I8CA 2Y7PA 1B3HA 2V93A 1KWHA 3MUQA 1B46A 1QKBA 3FVGA 4RPOA 3FXRA 3LSWA 3RPWA 3MW0A 1LFHA 2O84X 3CIJA 4RYAA 3O66A 3LSXA 2ZNUA 4NWDA 5H8NA 3L6GA 1XS5A 2XXVA 1GTKA 4GIZA 3VV5A 4X1DA 3H6VA 2BJJX 2O6AA 1USYH 1PDAA 3Q26A 4R6YA 3O2AA 3T93B 4FECA 3DM0A 3PUYE 2RF1A 3K6VA 5ITPA 4QFNA 3R6UA 5I57A 1SW5A 4OEVA 3D4CA 1XT8A 1MDQA 3OOAA 4JSOA 1Y1MA 1OIBA 1BLFA 1UTBB 1EZ9A 2B3BA 4FAJA 3TUSA 4JXIA 3MPKA 3R26A 1SI1A 5DVFA 2FNCA 2ONRA 3SEXA 1XVXA 1ZBMA 4L17A 1H45A 4PP0A 2NUVA 3H6WA 2I48A 3LR1A 3CFLA 4JWYA 1UTHB 2QPQA 4BDLA 4OQOA 4YAHX 1FQBA 3A09A 1OMPA 1B5IA 4RJZA 4OEUA 4GOTA 4NF6B 1LFGA 3OXNA 3SKPA 2VD3A 3TDJA 4P0IA 1IXIA 4KCCA 1WVJA 4OFJA 1DPEA 4JBZA 5BWJA 4OTEA 4TQUQ 1I6AA 3OENA 4LZ7A 2M8CA 3OELA 5K2XA 4PETA 2B65A 1MQGA 4N07A 1BIYA 4ZS9A 1ZMGA 3PD8A 1UTHA 4POXA 4LQ5A 3PPPA 1II5A 1MQHA 2QS2A 3OEMA 2I0BA 3QUFA 1Y4CA 2PMSA 3FXUA 4NF6A 4YMAA 1Z7NE 4OETA 4FE8A 2DVZA 3HN0A 3U1OA 1FTLA 3SEYA 2XX8A 5I2NB 3C36A 1EZPA 2UVGA 4F1VA 3IO6A 4RA1A 3FD3A 3SESA 1XOCA 3S4UA 2QL3A 1T0KA 4KD5A 2F7AA 2DXRA 2ONSA 4KI0E 1MPDA 4OXVA 4R74A 1P1QA 3S2VA 2Q88A 1ZTYA 1AH5A 5I2KB 4ONYA 5I59B 4AQ4A 2I4CA 4EQ7A 5HPQA 4H1XA 3QIMA 3FV2A 4R73A 3ZKLA 3T66A 3FV1A 2REJA 4WEPA 3CRBA 3S9EA 1IUDA 4LZ8A 3JV9A 1LLSA 1XVYA 1J1NA 2R9JA 4Q8RA 2DVCA 5IKBA 4OHNA 3B6QA 2O1MA 4O3BA 2IEEA 1B58A 5I59A 2QMXA 3RT8A 4K3FA 3IOUA 3S9MC 2F6GA 4F2OA 3TQWA 1QKAA 5TU0A 4YZZA 1MXYA 1SBPA 1TFDA 2QS3A 3ZS6A 4ELOA 3FJGA 2RKMA 4G68A 4ELPA 5H8FA 4I1DA 3WAEA 4GXSB 1US5A 4FATA 5I84A 3I6VA 1MXWA 3T9VA 4HW8A 1H3DA 1FQAA 3T9HB 4ZE9A 3SEUA 5KDTB 2CMOA 2DWAA 2H4IA 4M1VA 3H3GA 4F1YA 5L9SA 3HO7A 3T22A 4AB5A 1MG1A 3IORA 3OEKA 1DPPA 3HV1A 2A5TB 2YLNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2CZHA 1A7LA 5IZ3A 1H76A 1SYIA 3MWBA 3PV0E 4NN3A 1NV3A 2QFLA 4DI3D 3HCQA 3FGSA 3VVEA 1AWBA 2JJKA 1B3EA 3TCFA 1OVBA 4KYEA 3FASA 2D3IA 1LBCA 2ZXTA 4FIMA 2HAUA 1JP4A 1O64A 4IO6A 2REGA 4JVIA 1MY1A 4DXBA 3C33A 3DELB 3G7WA 3O97A 3O9PA 4ELRA 3OO6A 3T96B 1MY3A 2H25A 4EXLA 1S50A 3PU5A 3W9WA 2XX7A 3HHGA 2PFZA 3FBPA 1M5CA 3TELA 3C32A 4XF5A 3H6TA 1FTMA 1GGGA 4LP2B 5CRYA 5JTYB 4MLQA 1POY1 5L9MA 3G3FA 1FQFA 4WKMA 1LB8A 3G3HA 3OO8A 1QUKA 1MXXA 1HSEA 4F22A 1INPA 4YB6A 3N26A 1DTGA 2XHDA 1KA1A 2F7CA 1EZOA 5AA4B 2WKYA 2CZLA 1HSJA 1PC3A 2F6PA 3PMVA 4F31B 5ELVA 1PBQA 3GYYA 1IQ7A 3M8UA 3GBAA 3MAMA 1IIWA 5F1QA 2WEFA 2DSFA 3FJMA 3ZKKA 2PCRA 4GFRA 1ELJA 4OVSA 2F35A 4U4XA 5FBPA 5FHOA 3BKIB 3PD9A 3IB2A 3ODBA 4HCYA 4OVQA 2XXTA 2I0CA 1F9BA 5EYFA 5CM6A 2D21A 3QUJA 1FPGA 4F3BA 1EYIA 5JTYA 4ELQA 2NOOA 3W15C 2HCAA 1SDXA 4UA8A 4I3EA 2ANJA 3LUZA 1PBPA 3K02A 1Q35A 4I40A 1SVXB 4FBPA 3B50A 5J16A 2HXWA 3HHFA 4OVTA 1KZ8A 3G3GA 1MPBA 2QRYA 1QVSA 2UYFA 2V25A 2PVUA 5EHMA 1NFTA 1B51A 4QFPA 1RYOA 1NNTA 1VFDA 2E1SA 4PE5B 1B4ZA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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