3PUYE

Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to amp-pnp after crystal soaking of the pretranslocation state
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITKASAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transport protein, membrane protein
molecule keywords Maltose transporter subunit; periplasmic-binding component o
publication title Crystal structure of the maltose transporter in a pretranslocation intermediate state.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 118
structure length 374
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puyE02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puyE01
1EZOA 1AH5A 4ZS9A 1IIWA 2AIXA 5FTIA 1LB8A 4U1OA 3OEKA 1YTVA 1L5TA 1ZU0A 4Z7EA 1JVXA 4RA1A 3MP1A 3HV1A 5HM4B 4QHQA 4OESA 1LFHA 4U1ZA 1B9JA 5ISUA 1B3LA 4F19A 2G93A 1M5EA 3V5AA 2A5TA 3RTWB 1ZIUA 3PD9A 1B58A 4PFYA 3MBPA 3PPQA 1NL5A 3L6GA 3KEIA 4LZ5A 2ZYMA 3KOTA 4OFOA 1OVTA 1MG1A 1TFAA 5JK4A 4X48A 5M2VA 3IOTA 3KG2A 1DSNA 2I0BA 1D9VA 2Y7WA 4G8NA 2QS3A 3LUYA 5DVIA 4P0GA 3CG3A 4R6HA 1UTBA 4YKIA 2Y7KA 1LAGE 1OMPA 2P2AA 4ZE9A 5KCJA 1ANFA 4FEBA 2F97A 4FJPA 3FZVA 4G77A 5B7DA 2RC7A 4JSDA 4F29A 3G3IA 3KJTA 5DVFA 4Q0CA 2HFBA 3MVXA 3I3VA 1NFTA 2V3TA 4WXJA 1TFDA 4EF1A 1N3WA 4O3BA 3FXQA 1XC1A 1FQDA 4DDDA 2F7CA 1POTA 1LBBA 2F6GA 2DXYA 1IEJA 3DP4A 4OTEA 3G3FA 3RY3A 4QSCA 3RT8A 1MXWA 5KDTA 3CR9A 4PFWA 3PMXA 3OO6A 4BDOA 2ALUA 5IAIA 4EDPA 4R2FA 1HSLA 2P0SA 1LLSA 2DVCA 4YMBA 3U92A 3I5OA 3N6UA 4H5FA 1SI1A 2UXAA 3VV5A 1A54A 1IXCA 3Q28A 4NTLA 4NWCA 5ICQA 2XX8A 1MPBA 3B6QA 2D5WA 2A5TB 3PPNA 3QXMA 2O68A 3HO7A 1QULA 1UIVA 4RPNA 1WODA 1B4ZA 3KN7A 1SW2A 3H6VA 1NH7A 4RJZA 3VE1B 5AA2A 5A5XA 1QJMA 3Q29A 3OELA 1D4NA 3PUVE 5DEXA 1MQDA 2VD3A 3U72A 4U22A 3BKIB 1S9TA 3UP9A 1Y3QA 4KCDA 2F5XA 4H67A 4KYDA 3G3JA 4DXCA 1UTBB 2UYEA 4JWYA 2UVIA 2XXRA 3PUWE 1B32A 3S9EA 3ILUB 2DQVA 2O1LA 1Q1KA 4U4SA 1RYXA 1LSTA 5KCJB 3OO7A 3WAEA 4E0WA 4R6KA 1B2HA 3A3UA 1JW4A 3KSJA 4OEUA 4IGRA 2F78A 3QUJA 4KHZE 5FTHA 1PBPA 1JW1A 2RINA 3GZGA 1OVBA 3UIFA 3C4MA 1B0HA 1SBPA 4IO5A 2ZMBA 5ELVA 1MDP1 2F36A 1NNPA 1FTMA 2DVZA 2NUVA 4GWOA 5I2KA 2I3WA 3OENA 3FXRA 4F18A 4OFLA 1USYH 2LAOA 2RKMA 2VP1A 4BDMA 5KDTB 5EYFA 2I3VA 4N13A 4G4PA 1LCTA 1R9QA 4FATA 5CC2A 4XIGQ 1N04A 2O7UA 4EQ9A 2ABHA 1B52A 5I56A 3U8QA 2I58A 3FD3A 2Z8EA 2DWJA 2Y84A 4NWDA 3OSQA 3G3HA 4TLLB 5TPAA 1QVSA 4LUBA 1BLFA 2FYIA 4KD5A 4NF4B 4ZZAA 1P1UA 4QFNA 2F6PA 5H8FA 4P11A 3S9MC 4KCCA 3EN3A 4KPTA 4NMYA 3MVWA 1MQIA 4JDFA 1BP5A 5AA2B 3Q26A 5A5XB 2I6EA 4QSDA 1H76A 5DEXB 4N07A 4GRKA 3G3GA 3O2AA 4MFIA 1TT1A 1XOCA 3F11A 3JZJA 3FV2A 2F7BA 4YKKA 3MUQA 3JV9A 4R2BA 5TU0A 2H4IA 2O51A 1B5HA 1H45A 2YPNA 5H8QA 3S2VA 2O6AA 3GBBA 1B40A 2VD2A 4YKPA 4IO6A 3CFZA 2I4CA 1IUDA 2ZYOA 3MZ1A 3TCHA 2XHDA 3M3FA 3RN8A 2X7QA 3C35A 3CG1A 4I9DA 4F1YA 1YPNA 1B7HA 3LSLA 2V93A 4G2ZA 3SEYA 4ELQA 1FTLA 4NF6A 3IX1A 3Q25A 3FASA 3E3KA 4NE4A 5CMMA 4KR5A 3M8UA 1M5CA 5K2XA 5I2KB 3B6TA 2GHAA 1JNFA 2UVJA 3HCQA 1FQCA 1AIVA 2W7YA 3HPIA 3K00A 3K02A 3QIMA 2ZYKA 1VSOA 4POXA 4K3FA 1MQHA 4ZEIA 4GVOA 3RPWA 5I56B 5L9OA 5L8DA 4GLIA 1H3DA 3ODBA 1R1NA 2XXIA 1OQGA 5I57B 3UA8A 3DELB 1IXIA 4YAHX 4ESWA 1PBQA 1B3HA 4XTCQ 2Q8JA 1MPCA 4GQOA 3TTMA 4F3BA 3RTFB 2XX9A 3N5LA 3VVEA 1FQEA 5TPAB 3BBRA 3DLNA 4AQ4A 5H8NB 5H8FB 3SEXA 3EQ1A 3MVYA 2V3UA 4ZEFA 4KI0E 3PPRA 2I48A 1CE2A 4RK9A 3KGCA 4ZEBA 4HTGA 3TTRA 2QMXA 1LGBC 1CB6A 3FUZA 1SYIA 3RQTA 3OSRA 3MZBA 3TCGA 2Q89A 3S4UA 2XXTA 1IZ1A 1F9BA 3IJOB 1SYHA 5H8QB 1EU8A 2F34A 1N3XA 1PDAA 1GV8A 1FQAA 2R71A 4Q30B 1B05A 2I49A 2H99A 3RLFE 2F8DA 4I62A 3G7WA 2GHBA 2RC8A 2QRYA 1I6BA 4ZZEA 3ZS6A 1UIUA 4NF6B 3FJ7A 1N84A 2HCAA 3N26A 3T96B 3OD7A 4ELPA 4KYSA 3M3LA 3O6GA 4BLAA 3A09A 4QSEA 1B1HA 5CMCA 4PETA 3TYHA 4GF8A 3H6UA 3U94A 4BDLA 4BDQA 4BDNA 2IEEA 4H5GA 3AXFA 3T22A 3O66A 1GTKA 1M5DA 2DS9A 4ND9A 5CMKA 3KOSA 2ZNSA 1LCFA 3QUFA 3C33A 2QPQA 2THIA 2H25A 4F3PA 3FVOA 2DE4A 1XHYA 5TP9A 4X9TA 4PQJA 4YMAA 3TCFA 4XXUA 3SERA 1SW4A 1MY0A 2AL4A 2QS1A 3I6VA 3P7IA 4GXSB 3IOUA 1B3GA 3TUSA 1D3KA 1PB9A 1DOTA 3OXNA 3UGWA 2ONSA 2Q9TA 3CI8A 5I2NA 3QSLA 2RC9A 1S50A 2HZKA 3IAZA 4I8CA 4G68A 1Z7NE 4U4XA 4F3SA 1BTJA 1EZ9A 4JSOA 1Z7ME 4YKJA 4LZ7A 1RYOA 2Y7IA 1SD3A 5HBCA 3USDA 3LBSA 2F7AA 2XD2A 4XKRA 2ONKE 4GIZA 3K6VA 3O29A 5AA3A 3QK6A 4IO2A 1XT8A 1LAHE 4OVJA 3W9WA 4QFKA 2Q2CA 3W15C 2HXWA 3O97A 2O84X 1PC3A 2R9JA 4KFQA 2HQ0A 1B6HA 4Q5TA 4GXAA 4G8MA 3VLWA 3MVZA 4E0XA 4LATA 3H3GA 4G68C 4MLQA 1B51A 2DE2A 2HZLA 1AOVA 1MQGA 4POWA 5CI5A 2PMSA 2PT1A 3O28A 1T0KA 4C1UA 4M4GA 1IXHA 4LQ2A 3S9NC 3H06B 3SETA 4MF3A 2GFEA 4DLDA 2DOJA 4QRZA 2V25A 1Y4CA 4OQOA 1I6AA 4JWOA 3ZSFA 1N76A 5TP9B 3T9VA 2QSXA 1UTHA 3E13X 3TTLA 2R6GE 3K1NA 2GH9A 4YB7A 4XKQA 1MH4A 3SEWA 4MH5A 3MP6A 4ELRA 4HS7A 3D4CA 4HCWA 3MPKA 2PBWA 2ONRA 5H8HA 4OYVA 3UK4A 1URDA 2V3QA 5I58A 3K01A 2DYXA 4L17A 4OXVA 2UVHA 2REGA 3OEMA 5DT6A 3K6XA 4OWDA 4G68B 1B46A 2NWJA 3IOWA 4ZDMA 3IOVA 3KJ7A 5CBSA 3MP8A 3C32A 3D4GA 5I84A 3IL1B 3C31A 4X1DA 3JYRA 1AMFA 3H03A 5EHMA 2X26A 1WVJA 1LAXA 2HAUA 1N7XA 1P1QA 1J1NA 1MDQA 4H0WA 2OBGA 2KLFA 4P0IA 2M8CA 2X7PA 2H5YA 2NXOA 2ANJA 4XKPA 4IY6A 4ONYA 3EPEA 1PEBA 1ATGA 2YLNA 1JW5A 3VVFA 5FHOA 1ZMGA 2Z8DA 1JEVA 2VOZA 3PD8A 5JTYA 1HSEA 1SW1A 3MJNA 1B5JA 1Y3NA 3FVKA 1Y20A 2NOOA 3FATA 1US4A 2RCBA 3R7XA 2XXHA 3UN6A 4FORA 4XKNA 2PX1A 2I0CA 3VVDA 4M1VA 3LSFB 2Y7RA 3K1PA 3H4ZA 3K0VA 3O6IA 1IXGA 3LR1A 3C9HA 3EF7A 5EHSA 4EQBA 5L9MA 2QS4A 4DXBA 2BJJX 3OMBA 4ZECA 3PPOA 2XXYA 4NF5A 2B65A 1XS5A 1JETA 5AA4A 4RPOA 3LSWA 4MLVA 1Y1MA 1VFEA 1HSJA 2O69A 4ISUA 3E4RA 3E9XA 1AL3A 5CMBA 4WEPA 1MM7A 5FHMA 4JWXA 5H8HB 1DTGA 1A8EA 4ESXA 2PVUA 4DCYA 3HN0A 2OCUA 5I58B 1LFGA 3TELA 1LB9A 3TPAA 3SDFA 3GBAA 3R6UA 2QJEA 4OZ9A 1NNKA 1B0LA 2V84A 2QL3A 3HSTA 5BUUA 4UACA 1URSA 1BKAA 3PMWA 2DWHA 1QUJA 3VLVA 4OEVA 4IO3A 3Q27A 4ECFA 2CZLA 3DM0A 4U21A 2RCAA 4KYEA 2XD3A 3PUZE 2VGQA 1FCKA 5H8SA 5AE4A 3FIRA 4PFTA 2UVGA 2FA7A 2OZZA 1N7WA 4YB6A 4DCXA 3THIA 4PP0A 1S7YA 3U93A 3T9XB 2ZNUA 3RGYA 1MPDA 1ELJA 4F31B 4O3CA 1MY3A 4RYAA 1I69A 2PT2A 3ONMA 4RY1A 4OETA 3TKDA 3FJMA 5CRYA 5JTYB 1NNFA 2QS2A 2AL5A 3LSXA 3TEPA 3PUXE 4DXUA 1R6ZA 1DTZA 4TLMB 4GOTA 1P1OA 1B5IA 3TTNA 2DP8A 1I6QA 5ITPA 1ZLQA 2O7IA 4EXLA 5L9SA 1GR2A 2DE3A 4NF5B 3TQWA 3CVGA 5ITOA 5AA4B 3DP6A 1VR5A 5DTBA 4FE8A 4LP2B 4GL0A 3TFLA 3ZKKA 3PUYE 3MQ9A 1NMUA 4OENA 4LQ5A 4AB6A 3W9VA 3MWBA 4OHNA 1USYE 5B70A 2OWSA 4QFPA 3KN3A 4GL8A 1QKBA 5I59A 2DXRA 3O6HA 2I4BA 3EHUA 4ELOA 3TODA 5BWJA 5LOMA 3K1MA 2H9BA 4Z0IA 4F1VA 3BFTA 1OLCA 1QKAA 1SDXA 2OK2A 2H98A 5JEIA 4IB2A 3IORA 1D9YA 1A8FA 5ICTA 4LONB 4F2QA 3T93B 4FAJA 4UA8A 4HW8A 5KZTA 1BIYA 3ECRA 3B7DA 4EUOA 3PPPA 3TTKA 1N0TA 2Q2AA 4JBZA 1UQWA 4WEDA 1TWYA 4NF8A 2QMWA 3UORA 3CSBA 5F1QA 5AA1A 4O3AA 2B3FA 4DIGA 4NEDA 3S9LC 4N6PA 1URGA 3K6WA 1P1NA 3V8XB 3QYTA 4PFUA 4X1BA 2FNCA 2AYSA 4QFOA 1US5A 1DPPA 4H6DA 2NVUB 1H43A 3T9HB 5AA2D 3TAJA 1Y4TA 1A99A 3TZAA 1MY4A 4R73A 3MAMA 3VXBA 1MY2A 3TMGA 4IY5A 4R9GA 1MXUA 2Z23A 4DZ1A 1O7TA 1XVXA 1DPEA 2XXWA 2P1SA 2RF1A 2ZNTA 1B4HA 1QUIA 1NNTA 4ZE8A 5HPQA 3K4UA 3CRBA 2Q88A 1SI0A 3H7MA 3U1OA 3M3KA 1XVYA 5F7VA 1YAEA 5K2YA 4U2RA 2Z22A 3BFUA 1IITA 3V83A 3FJGA 4FECA 4IGTA 4LVQA 2Y7PA 4NF4A 4G8HA 1FQFA 3EHSA 2HEUA 3N6TA 1FQBA 4JB7A 3RNNA 4R72A 4BDRA 5I59B 1M5FA 1FTJA 2WKYA 2XXPA 3C36A 4RNSA 1KWHA 1MXZA 3G3KA 2Z8FA 3WAFA 4AB5A 4YB5A 2ESNA 4QF9A 1A7LA 4YZZA 3SKPA 4F39A 1FTKA 4C0RA 1MXXA 4F2OA 2ZYNA 4R75A 1VE4A 3FVNA 3KN8A 4HCYA 3ILTB 3CIJA 4PE5B 2XX7A 3O9PA 4NF8B 3PV0E 1B1XA 3VDFA 4EXKA 2E1SA 1LAFE 1A55A 4H8IA 2OLBA 3A3CA 3VXCA 1QW0A 3GLBA 1MQJA 1Q35A 3V89B 3GXAA 1P99A 4OMBA 1P1WA 5I2NB 4YU0A 4F1UA 1EH3A 1M5BA 5J1DA 1IQ7A 2D21A 4F22A 2YJPA 4DE8A 2PYYA 4JXIA 2DWIA 2OJTA 2CMOA 3LC8A 3H6TA 5DVJA 3ZKLA 3OOAA 1Y1ZA 1TXFA 3CFXA 3HHGA 1B7ZA 1JVYA 4QFLA 4R6YA 3IR1A 4ZEKA 4R9FA 2E0SA 4F3GA 2D3IA 2REJA 3IB0A 5I57A 3IB1A 5CM6A 3FGSA 4H1XA 1OQHA 3C34A 1DMBA 4RXLA 1B3EA 3RT6B 2A5SA 5H8NA 4EQ7A 3SEUA 4ZEDA 4LA9A 3MC2A 2B3BA 1EZPA 2UYFA 2DWAA 3KZGA 3MPLA 5CBRA 1PB8A 3FVGA 3PU5A 3PMVA 4H8JA 4Q8RA 1FTOA 4WKMA 5FHNA 1NKXA 2HAVA 4OFJA 1OIBA 3FXUA 2XXUA 4TQUQ 1UTHB 2OWTA 1MH3A 2F35A 3SESA 3RUMA 4LZ8A 2XXVA 3IJXB 1II5A 3H6WA 3IK6B 3IO4A 3MZ9A 1POY1 4FEDA 2XXQA 4C1TA 1OLAA 1B7UA 3TDJA 4TOZA 2XXXA 1B3FA 1LFIA 1FW0A 1Y3PA 1ZTYA 1MY1A 2ZXTA 3PGFA 4H65A 5DYHA 3IO6A 1R9LA 1ZKBA 4THIA 4MBPA 3K6UA 3KSXA 4GFRA 1MM6A 4U23A 2DSFA 1O64A 1JEUA 1YCJA 3CSGA 3R26A 2IA4A 4I1DA 3CFLA 1JQFA 3T66A 3EHTA 1Y9UA 3HHFA 3MW0A 1H44A 1NH8A 1WDNA 3N94A 1O63A 3FV1A 4IO7A 3VFJA 3SEVA 4FIMA 1VFDA 1ZJLA 4R74A 3QAXA 2GRVA 3DP8A 3IB2A 1MXYA 1PB7A 4IO4A 4YICA 1MS7A 3K2DA 3VLUA 1GVCA 1ZBMA 1MXVA 3KFMA 2G29A 2VHAA 4RK2A 5IKBA 1QUKA 3TQLA 3T9UA 1LBCA 4OERA 1A40A 3KBRA 2O1MA 1SQYA 1GGGA 4GD5A 3B6WA 3L6HA 4KQPA 4EF2A 1RKMA 1MRPA 1SW5A 1SVXB 3OO9A 3OO8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1EZOA 1AH5A 4ZS9A 1IIWA 2AIXA 5FTIA 1LB8A 4U1OA 4QBAA 3OEKA 1YTVA 1L5TA 1ZU0A 4Z7EA 1JVXA 4RA1A 3MP1A 2Q74A 3HV1A 5HM4B 4QHQA 4OVTA 2DDKA 1FBFA 4OESA 1LFHA 4U1ZA 1B9JA 5ISUA 2WBDA 1B3LA 4F19A 2G93A 1M5EA 3V5AA 2A5TA 3RTWB 1ZIUA 3PD9A 1B58A 4PFYA 3MBPA 3PPQA 1NL5A 3L6GA 3KEIA 4LZ5A 2ZYMA 3KOTA 4OFOA 4P8BA 1OVTA 2QVRA 1MG1A 2R8TA 1TFAA 5JK4A 4X48A 5M2VA 3IOTA 1LBVA 3KG2A 1DSNA 2I0BA 1D9VA 2VPOA 2Y7WA 4PAFA 4G8NA 2QS3A 3LUYA 5DVIA 5IZ3B 4PF6A 4P0GA 3CG3A 1IMAA 4R6HA 1UTBA 4YKIA 2Y7KA 1FJ6A 1LAGE 3LV0A 5LDZA 2PFZA 1OMPA 2P2AA 2Y5LA 4ZE9A 5KCJA 1ANFA 4FEBA 3E79A 2F97A 4FJPA 3FZVA 2OWZA 4G77A 1EYKA 5B7DA 2RC7A 4JSDA 4F29A 3G3IA 3KJTA 5DVFA 4Q0CA 2HFBA 3MVXA 4O8MA 3I3VA 1NFTA 1SPIA 2V3TA 4WXJA 1TFDA 4EF1A 1N3WA 4O3BA 3FXQA 2WYKA 1XC1A 1FQDA 4DDDA 2F7CA 1POTA 1LBBA 2F6GA 2DXYA 1IEJA 3DP4A 4OTEA 3G3FA 3RY3A 4QSCA 3RT8A 3MSTA 1MXWA 5KDTA 5LTCA 1NI9A 3CR9A 4PFWA 3PMXA 3OO6A 2FHYA 4BDOA 2ALUA 4HE0A 5IAIA 4EDPA 4R2FA 1HSLA 2P0SA 1LLSA 4OANA 2DVCA 2XWVA 4YMBA 3U92A 3I5OA 2CEXA 3N6UA 4H5FA 2ZZWA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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