3PUYE

Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to amp-pnp after crystal soaking of the pretranslocation state
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITKASAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Maltose transporter subunit; periplasmic-binding component o
publication title Crystal structure of the maltose transporter in a pretranslocation intermediate state.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Transport protein, membrane protein
total genus 118
structure length 374
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puyE02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puyE01
4OZ9A 5ELVA 3SESA 4UACA 4ESXA 1EZOA 3QUFA 3MP1A 1D9YA 4L17A 3CFZA 4BDOA 3PUYE 3I3VA 4KQPA 4ZECA 4HW8A 3WAFA 1Q35A 5CMCA 1A7LA 1B2HA 3B7DA 1PBQA 3EPEA 2O69A 1O64A 4R72A 2ONKE 3E3KA 4MFIA 1NH8A 3HPIA 3RY3A 3G3GA 4EDPA 3BFTA 4ZEFA 3R7XA 3GXAA 2QS1A 1CB6A 2RF1A 5H8FB 4XKNA 3TFLA 2BJJX 4ONYA 2XX8A 2O1MA 3T66A 4U4XA 2M8CA 4G68C 1I6AA 4U22A 4EF2A 4M4GA 4POWA 1F9BA 3CG3A 3RPWA 2GHBA 1SI1A 2P2AA 1B52A 4OEUA 2X7PA 2XXTA 4LZ7A 1Q1KA 1SBPA 3THIA 2Q89A 4GL8A 4YAHX 1PB8A 5FTIA 2XX9A 4H8JA 1SW1A 3TQWA 4ZE9A 1NL5A 5JK4A 4KYDA 1AOVA 2GFEA 4NE4A 2PYYA 1MPCA 3CFXA 2OLBA 2HXWA 4GXSB 1VR5A 3B6WA 1MS7A 3PPRA 4NTLA 3MP8A 3OMBA 4MH5A 1GR2A 4GF8A 2HCAA 1UTHA 3MWBA 3MZBA 4ZZEA 3CIJA 3L6GA 4GFRA 3PMVA 4YKKA 3EN3A 1URDA 4G8NA 1N04A 1JQFA 1ZIUA 1N7XA 2KLFA 2VGQA 2H99A 5H8NA 4F19A 2G29A 2QL3A 1Y9UA 4TOZA 3LC8A 1BLFA 2HZKA 3KOTA 2NOOA 3O2AA 1MM7A 3VDFA 2GRVA 1Y4CA 2YLNA 1MY0A 4YU0A 3PD8A 5L9OA 1B1HA 3BKIB 3FVOA 3IJXB 3O28A 4H0WA 4OQOA 3ZKKA 4F1VA 3FUZA 4JWYA 2RC9A 2DWAA 2XXWA 3E13X 3CSBA 5TP9A 5I57A 4EF1A 1VFEA 1B5IA 3LSXA 1N0TA 5B70A 3B6QA 2UVIA 1M5FA 4X9TA 1BP5A 2FNCA 3EHSA 1LGBC 4YMAA 4NF5A 4NF4A 4ND9A 5K2XA 5I2NB 4BLAA 3SKPA 2G93A 3FGSA 3CRBA 1NH7A 1B7ZA 3H4ZA 3KGCA 1M5CA 1PB7A 1FQFA 3OSRA 5BUUA 2I3WA 5CRYA 3OO9A 4POXA 1JVYA 3L6HA 3T9UA 4JWXA 1B3GA 3TTLA 4R2BA 3UGWA 4R2FA 3O6GA 3TTRA 2H25A 1FQBA 3EHUA 2RCAA 1XOCA 1PBPA 2A5TA 2VHAA 4R74A 1SYIA 3PMWA 4QFLA 5I2KB 2I6EA 3EQ1A 5AA3A 2F8DA 3LBSA 3TDJA 3TTKA 5I58B 5I59A 3R6UA 1WVJA 1FTKA 2Z8DA 3VLVA 1IXIA 3IORA 2Y7WA 2XXYA 4EXKA 2CZLA 5IKBA 5H8NB 3UORA 4F39A 1MY1A 2DS9A 2ZYOA 3TPAA 4FJPA 1LFGA 3ONMA 2QS3A 3QIMA 3DELB 2XD3A 2Z8FA 5ITOA 3MVWA 2ANJA 3N26A 4BDQA 2OK2A 1P99A 3G3HA 3ILUB 3MUQA 1IUDA 4C1UA 4NF8B 1Y3NA 2F7CA 1YTVA 4I9DA 4MF3A 3FASA 1Y20A 1MG1A 3T9VA 3KBRA 3U94A 1QULA 1N3XA 3H06B 1FCKA 1MQIA 1P1NA 4GWOA 4DCYA 4O3CA 4FAJA 1QJMA 2NWJA 3VV5A 1MY3A 3ILTB 1ZBMA 1IEJA 1P1WA 1Y3QA 4YICA 1UTBB 3OD7A 1IXGA 4JB7A 4FEBA 4IY5A 3IJOB 4C1TA 4WEDA 2PVUA 1NNTA 1PB9A 2X7QA 5L9SA 2F5XA 4WEPA 2Q2AA 2B3FA 1N76A 1LAFE 4TLLB 3KJTA 3IB2A 3H6TA 1XHYA 3QUJA 3Q26A 3S2VA 1LCFA 4E0WA 3K6VA 5IAIA 1H3DA 4Q8RA 4F1UA 4DZ1A 2OWSA 4YB5A 2R6GE 3IOWA 3DM0A 2XXHA 3CR9A 3P7IA 5EYFA 4ZEIA 1WDNA 4F31B 3FATA 1SW5A 1H43A 1M5BA 2F7AA 1Z7ME 2DP8A 1GGGA 3TZAA 2XX7A 3A3CA 4WXJA 3IB1A 1OLAA 3T22A 4Z0IA 5H8FA 5H8SA 5DTBA 4KFQA 1M5DA 2F35A 4K3FA 2E0SA 1B9JA 4KHZE 2PMSA 5AA2D 4G77A 3PPQA 1JNFA 1SW4A 2DWJA 4O3BA 4U1ZA 1A8FA 2ALUA 4I8CA 3ZKLA 4OVJA 1R6ZA 4FECA 3PMXA 4PFUA 2XXRA 4EXLA 3EHTA 1B7HA 3SEXA 4U2RA 4TLMB 1H45A 4QFNA 1MQHA 3KEIA 3DP8A 3EF7A 5AA2B 1ZKBA 4BDRA 4Z7EA 4ISUA 2VOZA 2Y7IA 1MY4A 4LQ5A 3VVEA 1IQ7A 1N3WA 1P1QA 2PT1A 3K6UA 1ZMGA 1Y1ZA 4RYAA 3FVKA 2QMWA 2ZNUA 3M8UA 3UIFA 5CMBA 2FYIA 2D3IA 4PP0A 3VLWA 3V83A 3TCHA 3HO7A 3ZSFA 4GOTA 3RN8A 3N94A 4P0GA 2I0BA 1QUJA 4R73A 3H3GA 2F36A 3PUWE 2B3BA 1JW5A 1TT1A 4FATA 1WODA 4BDLA 3SEYA 1B46A 5CM6A 4GRKA 4DLDA 3KZGA 5BWJA 2XXXA 1ZU0A 4EQBA 5B7DA 4JXIA 2O7IA 4YKPA 2YPNA 5L8DA 1LB9A 1AMFA 3UN6A 2REJA 1QVSA 4QF9A 1MQGA 5ICQA 1B3FA 3I5OA 4XKRA 4ZEDA 1H44A 5CBSA 4X48A 2THIA 4OERA 1DPEA 3W9WA 2V93A 5I2NA 2XXIA 4RK9A 3Q27A 1JVXA 2OCUA 2P1SA 4GIZA 3U1OA 4XKQA 3BBRA 3TCGA 5FHOA 3RT8A 1Y1MA 3MP6A 2OJTA 4YKIA 4JBZA 2F34A 2QSXA 2ZNTA 2OWTA 1NKXA 2O68A 1DSNA 4LVQA 4IO6A 2I0CA 3GLBA 4N07A 4RK2A 1HSEA 3FXQA 1NFTA 3M3KA 3IO6A 4OEVA 2NVUB 5I2KA 3M3FA 1XVXA 1OQGA 5JTYB 5I58A 2HEUA 1R9LA 3E4RA 5H8HB 2QRYA 3TCFA 3T93B 1VFDA 3QAXA 4IGRA 1BTJA 5L9MA 1AH5A 2DE3A 5I56B 1B4HA 3G3FA 2X26A 2NXOA 4G8MA 4QFKA 2QPQA 1GVCA 3OOAA 3UP9A 3GBBA 4AB6A 2RINA 1CE2A 5J1DA 3O9PA 4YZZA 3IOTA 1UQWA 1GTKA 3RLFE 5DT6A 4G4PA 3FJMA 1URSA 2GH9A 1A54A 4NF8A 4LUBA 2AL4A 2DSFA 3TTMA 3K00A 3VXCA 2PBWA 3N5LA 1S9TA 3HSTA 4NWCA 4OWDA 3DP4A 3HV1A 1H76A 4IO4A 3TTNA 3S9MC 3GBAA 3FV2A 1MH4A 3MVYA 1UTBA 2REGA 4RXLA 4ELRA 5DVJA 1MXZA 4HCYA 3VXBA 4GVOA 3MZ9A 4QSDA 3OEMA 5EHMA 5ISUA 2QJEA 3QXMA 1MXYA 3H7MA 1AIVA 2ESNA 2DE2A 4QFOA 5DYHA 5KCJB 4IO3A 3S4UA 3DLNA 4U23A 2DYXA 5HPQA 3Q25A 2I49A 2ZYMA 4F1YA 5KDTB 4PFWA 1JW1A 4HS7A 1D9VA 1S50A 2QS4A 1IIWA 1LAGE 1TWYA 3VFJA 3H6WA 2AL5A 2QS2A 4F29A 4F3SA 2I4CA 1EZ9A 3K1MA 1B3LA 1TFDA 3MAMA 2Y7RA 3H6VA 4OENA 3PV0E 2VD2A 4GQOA 2OBGA 2PT2A 2D21A 4JSDA 1R1NA 4FEDA 4LA9A 4R6HA 1I6BA 3K1PA 5AA4B 5H8QB 5CMKA 4IO5A 4ZEBA 5TU0A 1MDQA 4KYEA 3CSGA 4H67A 2W7YA 4Q0CA 1BKAA 1FTJA 1RYOA 2LAOA 1IXHA 1B3HA 5CBRA 2AIXA 4MLVA 4FIMA 3TODA 3V5AA 3G3JA 2UVJA 1Y4TA 2H9BA 4YKJA 3SDFA 3B6TA 5I84A 3RNNA 4O3AA 5CMMA 1LFIA 1J1NA 3IAZA 5AA2A 4KD5A 3ZS6A 4BDMA 3TMGA 3C35A 3TEPA 4THIA 1MM6A 1YPNA 1Z7NE 4H5FA 1MXVA 4U1OA 1ATGA 3PUXE 3K6XA 4LATA 3IB0A 4LP2B 4DCXA 2ZNSA 4PFTA 2O51A 4H1XA 2PX1A 1ZTYA 1UIUA 5HM4B 2IEEA 2O84X 1BIYA 3LSFB 4OFLA 1B58A 3IL1B 1HSLA 1US4A 3QSLA 4F2QA 4NWDA 2AYSA 3O6HA 1AL3A 4MLQA 1QUKA 4BDNA 3HHGA 2F6PA 4ELQA 3PPNA 3K6WA 1B3EA 3HN0A 1KWHA 4OETA 2R71A 1FW0A 1FTLA 3FD3A 3KSXA 1DOTA 4IGTA 3CVGA 5DEXB 2O1LA 1DTGA 5A5XB 3N6UA 1XC1A 3VLUA 1B32A 2V25A 3IOVA 1MDP1 3K1NA 4OXVA 4DXBA 4N13A 3G3KA 3RT6B 4YB7A 4OFOA 3UK4A 4Q30B 1RKMA 2WKYA 3AXFA 3M3LA 4ZE8A 3K4UA 1ZJLA 4P11A 3W15C 2D5WA 4GXAA 3TKDA 5DVFA 2Z8EA 3Q29A 1SYHA 1D4NA 1EZPA 4IO7A 1SD3A 2XXVA 3SEWA 1O63A 2ZYNA 5JTYA 2DXYA 4QRZA 3U72A 5H8HA 3RGYA 1VSOA 3SERA 5I56A 4XXUA 1B1XA 2OZZA 2XXUA 3V8XB 1SI0A 4ZS9A 4F3GA 3KN7A 3O6IA 1PC3A 3KN3A 2I58A 3T9XB 3FJ7A 1URGA 4ZDMA 4OMBA 5EHSA 2Q8JA 1OVTA 3LUYA 4DXUA 4NEDA 3S9NC 3F11A 3QK6A 1DMBA 3O97A 4H6DA 4G68B 2O6AA 1B7UA 4NF6B 2DE4A 2UVHA 4JSOA 2DOJA 1OIBA 2P0SA 1B5HA 3PGFA 1NMUA 4QFPA 4H65A 2Q88A 1LCTA 4ZZAA 4F22A 1OVBA 1ELJA 4EQ9A 1I69A 1LLSA 2GHAA 3C34A 4RY1A 1N7WA 1JETA 3RTWB 3RUMA 4GL0A 5JEIA 1LFHA 4F3PA 4G8HA 5KZTA 1A55A 4R6KA 4X1BA 3KFMA 3K01A 4KCCA 3W9VA 3MVXA 3DP6A 5KCJA 3OO6A 3LR1A 2IA4A 1ZLQA 3TUSA 5KDTA 2V3QA 4G2ZA 5ICTA 3FVGA 1QKBA 2F6GA 1NNKA 4X1DA 4WKMA 2DVZA 1HSJA 4AB5A 1POTA 1XS5A 3OO7A 3MZ1A 1B6HA 1II5A 1MXUA 3PPOA 3QYTA 5LOMA 3IX1A 3RQTA 3WAEA 1DTZA 1TXFA 3T9HB 3TYHA 1FTOA 2H4IA 2ONRA 1JW4A 5TPAB 1A99A 1MRPA 3JZJA 4DIGA 4R9FA 5AA4A 3USDA 5H8QA 2UVGA 3LSWA 2XHDA 1N84A 3FXUA 4ESWA 3ODBA 5F1QA 4PQJA 2VP1A 2DXRA 2XXPA 4OTEA 1SQYA 4OHNA 3TQLA 2ZXTA 1EH3A 2VD3A 3D4GA 4ECFA 3IK6B 1B0LA 2UYEA 1SDXA 1FTMA 4RJZA 4N6PA 4QHQA 2RKMA 2F7BA 1FQEA 1US5A 1MPBA 2HAUA 2RCBA 1RYXA 4EUOA 3MW0A 3K2DA 3VE1B 3MBPA 4KCDA 2XXQA 4YMBA 1UIVA 1FQDA 2Z23A 3K02A 2A5SA 4AQ4A 4KR5A 4C0RA 1EU8A 4OYVA 5K2YA 3TELA 4TQUQ 5M2VA 2DWIA 3HCQA 1OLCA 4RPOA 4LONB 2UYFA 4DDDA 1OQHA 2F97A 4HCWA 5CI5A 2Q2CA 1P1UA 3OENA 3U92A 4RPNA 3Q28A 2H5YA 1NNPA 2RC7A 5DVIA 4FORA 3C33A 4H5GA 4R6YA 1YCJA 1MXWA 2HQ0A 3RTFB 1MY2A 2B65A 2H98A 4LZ8A 3N6TA 2FA7A 3FV1A 4JWOA 3H6UA 1I6QA 4MBPA 4LQ2A 4KPTA 4P0IA 4Q5TA 4F18A 3GZGA 1B40A 1DPPA 2XD2A 3BFUA 5AA1A 3VVFA 1MH3A 1FQAA 1TFAA 3MPLA 3LSLA 3U93A 1D3KA 1LAHE 2DQVA 3C31A 5DEXA 1SW2A 3FJGA 1UTHB 3CI8A 3S9EA 5A5XA 4R9GA 4I1DA 1YAEA 2Y7PA 3VVDA 2UXAA 3SEVA 2NUVA 1POY1 2HZLA 4EQ7A 3JYRA 1L5TA 3C4MA 4F3BA 2ZYKA 1SVXB 3V89B 3UA8A 3OELA 4GLIA 4E0XA 1LB8A 4PETA 2HAVA 3PPPA 2RC8A 3OSQA 3O66A 3C9HA 3CFLA 3FZVA 3I6VA 4DXCA 1Y3PA 2R9JA 2Y84A 1IXCA 3A09A 3C32A 3D4CA 1LAXA 3PD9A 1USYE 5TP9B 5I57B 4LZ5A 5FTHA 1LBCA 5CC2A 4JDFA 3KN8A 1PEBA 3KSJA 2I3VA 3KG2A 3O29A 4DE8A 3MPKA 2DVCA 1IITA 2I48A 4NF5B 4XIGQ 4NF4B 4RNSA 3U8QA 3ECRA 2V3TA 3MQ9A 3SEUA 4OFJA 4I62A 4OESA 3JV9A 4GD5A 1A8EA 4G68A 1USYH 3H03A 1IZ1A 4NF6A 3HHFA 4YB6A 1LSTA 1QUIA 1M5EA 4H8IA 3MVZA 1B4ZA 1PDAA 1MQDA 3FIRA 4FE8A 1NNFA 4ZEKA 2DWHA 4NMYA 3CG1A 4QSCA 4ELOA 3C36A 5ITPA 2A5TB 1JEUA 1R9QA 3FVNA 4R75A 1B5JA 1MXXA 4M1VA 1B05A 1XT8A 3TAJA 4U4SA 3PU5A 5I59B 3MJNA 5FHNA 1JEVA 1VE4A 4QSEA 2CMOA 3KJ7A 4XKPA 1P1OA 4RA1A 1B51A 5AE4A 4U21A 3FXRA 3A3UA 3IR1A 4UA8A 5F7VA 3S9LC 3PUZE 1FQCA 1XVYA 1QW0A 3OO8A 1MQJA 4IO2A 3G3IA 2ONSA 1LBBA 1ANFA 3OXNA 4KI0E 4PFYA 3SETA 3E9XA 3OEKA 3IO4A 4XTCQ 2E1SA 1S7YA 3K0VA 2F78A 2Y7KA 2ABHA 3G7WA 5HBCA 4KYSA 3R26A 1OMPA 2YJPA 3KOSA 4IY6A 2V3UA 5FHMA 3MC2A 2Q9TA 4F2OA 2ZMBA 2I4BA 5TPAA 1T0KA 1O7TA 4HTGA 3IOUA 4IB2A 4ELPA 4PE5B 1B0HA 1QKAA 2O7UA 3T96B 2V84A 3PUVE 1MPDA 1A40A 2Z22A 2QMXA 2HFBA 1GV8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OZ9A 5ELVA 3CHGA 3SESA 4UACA 4ESXA 1EZOA 3QUFA 3MP1A 1D9YA 4L17A 4PC9A 4MJOA 3CFZA 4BDOA 3PUYE 3I3VA 4KQPA 4ZECA 4HW8A 3WAFA 1Q35A 5CMCA 1A7LA 4N17A 1B2HA 3B7DA 1PBQA 3EPEA 2O69A 1O64A 4R72A 2ONKE 3E3KA 2VPOA 4MFIA 1NH8A 3HPIA 3RY3A 3G3GA 3LV0A 4EDPA 3BFTA 4ZEFA 3R7XA 3GXAA 4GBVA 4GX3A 1CNQA 2QS1A 1CB6A 2RF1A 4MNIA 5H8FB 4XKNA 5IGAA 3TFLA 2HPGA 2BJJX 4ONYA 4NGUA 2XX8A 2O1MA 4NF0A 1NUZA 3QMFA 3T66A 3KC1A 4U4XA 5IZZA 2M8CA 4G68C 1I6AA 1RDYA 4U22A 4EF2A 4M4GA 4DI4B 4POWA 1F9BA 3CG3A 3RPWA 2GHBA 1SI1A 2P2AA 1B52A 4OEUA 2X7PA 3PTYA 2XXTA 4LZ7A 1Q1KA 1SBPA 3THIA 2Q89A 4GL8A 4YAHX 1PB8A 5FTIA 2XX9A 2XXKA 4H8JA 2CZIA 1SW1A 3TQWA 4ZE9A 4OVRA 1NL5A 5JK4A 4KYDA 1AOVA 2GFEA 1NV6A 4NE4A 2PYYA 1MPCA 3CFXA 2OLBA 2HXWA 4GXSB 1VR5A 3B6WA 1AWBA 1MS7A 3PPRA 4NTLA 3MP8A 2FIXA 3OMBA 4MH5A 1GR2A 2VPNA 4GF8A 2HCAA 1UTHA 3MWBA 3MZBA 1LBVA 3IFCA 4ZZEA 3CIJA 3L6GA 4GFRA 3PMVA 4YKKA 3EN3A 1URDA 4G8NA 1N04A 1JQFA 1ZIUA 1N7XA 5ET6A 2KLFA 2VGQA 2H99A 5H8NA 4F19A 2G29A 2OWZA 2QL3A 1Y9UA 4TOZA 3LC8A 1BLFA 2HZKA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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