3PUYE

Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to amp-pnp after crystal soaking of the pretranslocation state
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITKASAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Maltose transporter subunit; periplasmic-binding component o
publication title Crystal structure of the maltose transporter in a pretranslocation intermediate state.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Transport protein, membrane protein
total genus 118
structure length 374
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puyE02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puyE01
2XXIA 4RNSA 5H8FB 4DXCA 1IZ1A 3N6UA 2DXRA 1Y9UA 4GLIA 5H8NB 3RNNA 5I2NB 1USYH 1I6AA 3N6TA 3ZKLA 2PVUA 3LBSA 4U4SA 2F6GA 4OERA 3PMWA 3VFJA 3TCFA 3PPNA 4OXVA 3RPWA 2V84A 4MFIA 2D5WA 2DOJA 4ELOA 2F36A 4BDOA 1SI0A 3IR1A 4GXAA 2YJPA 3K4UA 4RPOA 1SW1A 4WEDA 3VDFA 4Z7EA 3G3JA 1NH7A 4U23A 4DXUA 2PMSA 3OO6A 4PFWA 4PFTA 3DELB 3MZBA 1Y4TA 3USDA 2NVUB 5ITOA 4F1UA 4PE5B 4NF4B 2HAVA 1XHYA 2UXAA 1MH4A 4F22A 1FTLA 1PB7A 5FHNA 1UTBA 3U94A 3RTFB 2G29A 4ESWA 2B65A 3H6WA 2DE3A 1FTMA 3MP6A 3FVOA 4F1VA 4GRKA 3SEUA 4OETA 1FQDA 4U22A 4DZ1A 1SW5A 4ZE9A 3W9VA 4OMBA 4XKRA 5JTYB 3K1NA 5K2YA 1USYE 3K1MA 4E0WA 4H6DA 5CRYA 5AA2B 3MP8A 2XD2A 3PMVA 2VHAA 2IEEA 3M8UA 2Z22A 4F3GA 1RYXA 1N04A 4IB2A 3GBAA 1PB9A 1B3EA 1LAGE 4XXUA 1B4HA 1PB8A 4HTGA 5AA4B 1A8EA 4QSDA 4EQBA 1TFDA 5ICQA 2AL5A 3PPQA 3GZGA 2P0SA 1L5TA 2UVIA 3JYRA 4RPNA 1LAHE 3EF7A 3RTWB 3LUYA 4EF1A 1Q1KA 1SW4A 4YICA 4IY6A 3C9HA 3PUYE 4IY5A 4IGRA 2AL4A 3VV5A 1A55A 1N76A 4RA1A 3OD7A 1URDA 3V83A 1IQ7A 2I3WA 2XHDA 2Y7RA 1MXZA 1DSNA 4BDNA 1LB9A 5FTIA 4NWDA 5KDTB 1NMUA 4F19A 3Q27A 1P1UA 4R6KA 1IXIA 1ZTYA 1FQFA 3O6IA 1LAFE 3QUFA 4OZ9A 3AXFA 1M5CA 1PDAA 4TLLB 4LQ5A 4QFLA 2OZZA 3K2DA 2HZKA 4GL8A 1NKXA 1EZ9A 1ZIUA 3R6UA 1B52A 4U1OA 4KCCA 3H6VA 3OEMA 3TTRA 3BKIB 1Y3QA 4H8IA 4TQUQ 5AE4A 4Q0CA 4ZE8A 1GR2A 2DP8A 2DE4A 3TCGA 3G3KA 1II5A 3TFLA 3MAMA 4X1DA 2UVHA 4DLDA 4H1XA 1B2HA 3GLBA 3EHUA 4LUBA 3TUSA 1B3HA 4ZEFA 4PFYA 2QS3A 4NF8B 5I84A 1LB8A 3TQLA 3D4CA 1AIVA 3FVNA 3IOVA 4YAHX 3B6WA 2HCAA 4RJZA 4X48A 1DPEA 2RINA 1LLSA 1PEBA 2V25A 1B7HA 3KN3A 1OVTA 2Y84A 2RKMA 5LOMA 4ESXA 3T9HB 3CSBA 3MVZA 2Q88A 1MM7A 5IAIA 1DMBA 4WEPA 1VE4A 5I59B 2XXUA 2NXOA 4ZS9A 3A3UA 1LBBA 1XS5A 1QKAA 3FASA 4OEUA 2VP1A 3RLFE 2XXVA 3HO7A 3C35A 3H03A 1B0LA 2V93A 3T22A 1IXCA 4TLMB 4PFUA 4N07A 4N13A 4EQ7A 4FJPA 4MBPA 1DTGA 3N26A 5B70A 4Q30B 3V8XB 1EH3A 1FTKA 2QRYA 5TP9B 2QMXA 3O29A 3K0VA 3ECRA 4KYDA 3HSTA 3CVGA 5ITPA 3TZAA 4DCYA 5EYFA 2WKYA 2H9BA 3WAFA 1CE2A 1UIVA 1D9YA 3O97A 1MQGA 1JW1A 1N7XA 1UTHB 3CFLA 3KGCA 1Y1ZA 4E0XA 3K00A 4ZEKA 4EQ9A 4LONB 3MVWA 4G8HA 1BTJA 5H8QA 2RC7A 2ZYKA 4FEBA 2DXYA 2F78A 1R6ZA 1ELJA 3SERA 5CBRA 3MUQA 4ZZAA 1B3LA 1SVXB 3EPEA 3LSWA 4QFKA 2Z23A 4YB5A 3PUXE 5HM4B 2Y7WA 4OQOA 4MLVA 4LZ7A 1CB6A 1FQCA 1LCTA 2PYYA 3JV9A 2HQ0A 3I3VA 1FQEA 4R9GA 5A5XB 2ONSA 1OQHA 4EDPA 3TELA 1MY3A 4JSOA 3PPOA 3OO8A 4XKNA 3K6XA 1ZMGA 1O64A 4RK2A 3C31A 3TPAA 1B51A 1EU8A 4C1TA 3K01A 1B7ZA 3KBRA 5HBCA 4LP2B 3IORA 3QAXA 3O2AA 4XIGQ 2O84X 4QHQA 3T96B 2IA4A 3EQ1A 2QSXA 4GD5A 3TQWA 2D21A 1DOTA 5I56A 3QSLA 2DS9A 2I49A 2PBWA 4DE8A 3K1PA 1B6HA 2OWSA 2O6AA 3DP8A 3IK6B 5H8HA 1O63A 1MQIA 1JVYA 2A5TB 3V5AA 5CMBA 4NWCA 3PUZE 1JEUA 5FTHA 3U93A 3TTMA 1LFIA 4KYEA 1POTA 3IB2A 1SBPA 5H8SA 3T66A 1QUJA 1IITA 1FW0A 2XXYA 1LGBC 2DWIA 1YTVA 2UYFA 3ZSFA 1NFTA 4NEDA 1QW0A 3FXUA 3CG1A 4H5GA 4P11A 4OFLA 1MQJA 4YZZA 1MS7A 2RC8A 3HHGA 1US5A 3O6GA 5HPQA 3RN8A 4H8JA 4EUOA 1QUIA 4Z0IA 3OSQA 4JDFA 2UYEA 4G68A 2HFBA 1BKAA 2QL3A 2I48A 2VGQA 1N7WA 2I58A 2DWHA 4GL0A 2Q9TA 2R71A 3TKDA 1FTOA 1B1HA 2QS1A 2Q8JA 3ILTB 1SYIA 3QXMA 3TCHA 3SEVA 1D3KA 3IX1A 3S2VA 1TFAA 3MWBA 1Y3PA 5ICTA 1NH8A 5CI5A 4XKQA 4BLAA 1MPCA 1XVYA 3IOUA 4G68C 3MJNA 3SKPA 4OWDA 4R2FA 3UA8A 1IIWA 3SDFA 2ZNTA 3Q28A 2F35A 3W9WA 2E0SA 2O69A 1BIYA 4OFJA 2ZNSA 2XXXA 3HPIA 5I2KB 3G3GA 5F7VA 4MF3A 4QSCA 1PC3A 2RCBA 5KCJA 5JEIA 4M4GA 1PBPA 1QJMA 3T9VA 3H6UA 1UQWA 1S7YA 2D3IA 2QJEA 2Q2AA 4KFQA 4QFNA 1JW5A 3FD3A 1B05A 5DYHA 1J1NA 2ZYMA 2XD3A 1H45A 4P0GA 2RC9A 5DEXB 5DT6A 1MRPA 4WXJA 4EF2A 3U72A 4FE8A 3MPKA 3EN3A 3P7IA 1H76A 1FTJA 1AOVA 4OHNA 3TEPA 1NNFA 3L6GA 1I6QA 3LSFB 2OJTA 4I9DA 1ZU0A 3L6HA 3G7WA 3OXNA 2OBGA 3ILUB 2R9JA 3N94A 3QUJA 4IO4A 2GFEA 2FNCA 3VXCA 2UVJA 3CIJA 4ZECA 2CZLA 3FUZA 4NF6B 1B40A 5TPAA 3TAJA 3VLUA 1LFHA 3OMBA 2H25A 4BDQA 1VR5A 3MC2A 5I58B 3IOWA 2OK2A 4FORA 3VVFA 2THIA 1MPDA 2I4CA 1GTKA 1H44A 4GOTA 2P1SA 4OFOA 1OMPA 4GFRA 3FZVA 4FECA 3SEWA 2XX8A 3O6HA 1MY2A 3QIMA 3SEXA 3SEYA 1GGGA 1LCFA 4NF5B 1B1XA 4EXLA 3SETA 2ABHA 2X7PA 2KLFA 4TOZA 1ZBMA 4ZZEA 4RY1A 4YU0A 2FYIA 4GQOA 4IO7A 4RK9A 4KYSA 3MW0A 4U4XA 4I8CA 1B46A 1B0HA 1Z7NE 2DVCA 5H8FA 2ESNA 1N3WA 1N84A 3KSXA 2RF1A 2V3TA 3DLNA 3CR9A 4F2OA 2VD2A 4U2RA 5H8NA 3OOAA 5FHMA 5I2NA 3PMXA 2XXQA 3K6VA 4YMAA 1Y4CA 4JXIA 3M3KA 3KJTA 3PGFA 3HV1A 2F97A 3KJ7A 1RYOA 1B5HA 1WODA 2I3VA 2DE2A 3BBRA 4R6YA 1MY0A 2H98A 3PD8A 4HW8A 4U21A 2DWAA 3PPRA 4O3CA 4U1ZA 1ATGA 3TDJA 3TYHA 2W7YA 2XXRA 3CFZA 3A09A 3U92A 1Y3NA 4JSDA 1OLAA 4F1YA 2LAOA 3MVXA 3B7DA 4L17A 1HSEA 4NF4A 1MQHA 4UA8A 1QVSA 1MG1A 4LZ5A 1YAEA 5DTBA 4AQ4A 5JK4A 1R9QA 4N6PA 2AIXA 3MZ1A 1MY4A 3C33A 2ONKE 1QKBA 3A3CA 3G3FA 1SQYA 1MXVA 3B6TA 1KWHA 3Q29A 5ELVA 3RQTA 4BDMA 1A40A 1WVJA 2P2AA 5JTYA 3ODBA 1TWYA 2REJA 5L9SA 1N3XA 2O7UA 1OQGA 2XXHA 3S4UA 4JB7A 1EZPA 4POWA 5AA2A 4MH5A 2O51A 5DVFA 3FV2A 2XX9A 1RKMA 2V3QA 1LBCA 2O7IA 3FVGA 4FATA 3TODA 3C4MA 3KOSA 2F34A 1UTBB 5AA4A 4QFOA 4R6HA 1ZKBA 3IO6A 2Q2CA 4P0IA 2RCAA 4IO3A 4F18A 4JWOA 4H0WA 4XKPA 4ECFA 5CMKA 2VD3A 3OENA 4R73A 3B6QA 3KN7A 5L9OA 3PUWE 4NF6A 1IXGA 1Q35A 3TTLA 2Y7PA 1D9VA 1LAXA 3R26A 1M5DA 2PT2A 2UVGA 1I6BA 3UGWA 1FQAA 1MXWA 4YKIA 4WKMA 4AB5A 1DTZA 4C1UA 3KOTA 5K2XA 1S50A 3VLVA 1A54A 3DM0A 2O68A 2X7QA 1OVBA 1HSLA 5KDTA 2ONRA 4G77A 1XT8A 3D4GA 3C34A 1VFEA 3OO7A 4YKJA 4NF5A 2A5SA 3S9LC 4RYAA 2V3UA 3E13X 3QK6A 3KEIA 1B5JA 3HCQA 3H4ZA 1JVXA 1SW2A 3VE1B 3CI8A 3H06B 4DIGA 4JBZA 1GV8A 3BFTA 4G8NA 4QF9A 4YKPA 4LVQA 4PETA 2CMOA 3VLWA 4F3PA 4NF8A 1BLFA 4OTEA 4JWYA 5CMMA 1MH3A 3IAZA 2M8CA 1I69A 3KFMA 2XXTA 2YLNA 4GWOA 3W15C 2DSFA 3IB0A 3F11A 3KN8A 4F2QA 4Q8RA 4QFPA 4KQPA 2BJJX 3FGSA 1H43A 4IGTA 1OLCA 1VFDA 3RT8A 5I59A 5DVJA 4JWXA 1MXYA 4IO6A 1NNTA 4X1BA 4LA9A 2H5YA 3ZS6A 3CRBA 3GXAA 4H5FA 1GVCA 1MQDA 4DCXA 4O3AA 2X26A 5M2VA 3KSJA 3FVKA 1MXUA 4PQJA 3IL1B 1Z7ME 3T9XB 1MY1A 2F7BA 3VVEA 4GXSB 2HXWA 2NUVA 4G2ZA 5TP9A 4ZEDA 3OSRA 1US4A 1M5BA 1WDNA 2ZYOA 4ONYA 2FA7A 1NNPA 4G4PA 3FIRA 1HSJA 2B3FA 2QMWA 1MDP1 5EHSA 3LSXA 1T0KA 1P99A 4I1DA 4ZEIA 4THIA 1UTHA 1S9TA 1B3GA 2F8DA 1MPBA 2R6GE 1M5FA 2B3BA 4R9FA 2I0BA 1R1NA 1XC1A 5CC2A 1URSA 4AB6A 4YMBA 4LQ2A 2Z8EA 3KZGA 4OESA 1SYHA 2GHBA 3H6TA 2AYSA 4ZDMA 1TT1A 4F3SA 5A5XA 4H65A 3UN6A 3PUVE 3TMGA 5EHMA 4ND9A 2XX7A 5ISUA 2E1SA 2F6PA 4QRZA 5H8QB 2ANJA 4ELRA 3PPPA 2F5XA 2OCUA 1VSOA 1YPNA 1R9LA 2F7CA 3ZKKA 2H4IA 3FJ7A 3RY3A 3OEKA 4EXKA 5BWJA 3IJOB 4R72A 4HCYA 4RXLA 3PV0E 1P1NA 2OLBA 1OIBA 2HAUA 3MP1A 5FHOA 5AA1A 3O9PA 1M5EA 4ELPA 2PT1A 3M3LA 3C36A 3T93B 2Y7KA 4NTLA 4ISUA 3TTKA 2QPQA 4YB6A 2A5TA 3FJGA 2XXPA 4R2BA 4M1VA 2ZYNA 2GH9A 4FIMA 1MM6A 1POY1 3HN0A 4PP0A 4X9TA 1LSTA 3K6WA 5I57B 1B4ZA 4F29A 1QULA 3K6UA 4KD5A 3ONMA 3LSLA 5I56B 1UIUA 1P1QA 1D4NA 1YCJA 3H7MA 2HEUA 4YB7A 3RT6B 4KR5A 1JNFA 1XOCA 1B3FA 1P1OA 4HS7A 3MPLA 1URGA 2I4BA 2GHAA 3O28A 3PD9A 5H8HB 1QUKA 2ZNUA 3JZJA 4UACA 4I62A 4R74A 2Y7IA 1B7UA 3Q25A 1B9JA 4XTCQ 3I5OA 3DP4A 3Q26A 2H99A 3H3GA 1ZJLA 2NOOA 2Z8FA 3MZ9A 2XXWA 1JETA 4R75A 1PBQA 3IJXB 3LC8A 2G93A 3SESA 3PU5A 1SDXA 3BFUA 3V89B 4G68B 1B58A 5L8DA 4KI0E 3UIFA 4ELQA 2I0CA 4KHZE 4GVOA 3R7XA 3S9EA 3IOTA 5I2KA 3G3HA 5AA2D 1NNKA 3FJMA 3O66A 3WAEA 3OELA 1F9BA 1MXXA 4FAJA 4DXBA 2PX1A 3TTNA 3DP6A 4KPTA 4F31B 1A7LA 1JW4A 4F39A 1SD3A 4DDDA 3CG3A 3S9NC 5DEXA 2YPNA 4LZ8A 4GIZA 1H3DA 5CM6A 1FQBA 3GBBA 2HZLA 2QS2A 4YKKA 2DYXA 3G3IA 3FXRA 4Q5TA 3S9MC 3HHFA 3CFXA 4MLQA 5KCJB 5BUUA 1B5IA 1EZOA 4OEVA 2O1MA 3EHTA 5TU0A 3FXQA 5B7DA 4IO2A 5CMCA 1FCKA 3N5LA 3C32A 4HCWA 2ZMBA 1NL5A 3U8QA 3UORA 5J1DA 2Z8DA 4NE4A 4LATA 4KCDA 3UK4A 2GRVA 5DVIA 3IO4A 4ZEBA 1Y20A 1AMFA 4OVJA 3IB1A 3QYTA 5IKBA 1O7TA 1ANFA 4FEDA 4O3BA 5I58A 2DVZA 1SI1A 3KG2A 3RUMA 1LFGA 5KZTA 5F1QA 3K02A 2I6EA 1ZLQA 1JEVA 1MDQA 4QSEA 3EHSA 1JQFA 2REGA 2Q89A 3E4RA 2ALUA 3T9UA 1DPPA 2O1LA 2NWJA 2OWTA 3UP9A 2ZXTA 4K3FA 1IEJA 5AA3A 1XVXA 1B32A 4C0RA 2QS4A 3E9XA 2DWJA 4POXA 5I57A 1IXHA 4NMYA 3VVDA 4IO5A 4F3BA 5L9MA 3MQ9A 5TPAB 1AH5A 1N0TA 3E3KA 1AL3A 1BP5A 4OENA 4BDLA 3MBPA 3THIA 3LR1A 3MVYA 4H67A 3CSGA 4G8MA 1P1WA 2DQVA 1Y1MA 1TXFA 4BDRA 4GF8A 2VOZA 4OYVA 3M3FA 3OO9A 3RGYA 1IUDA 3I6VA 3U1OA 3VXBA 3FATA 1A8FA 1A99A 3FV1A 5CBSA 2F7AA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4GBVA 2XXIA 4RNSA 5H8FB 3B8BA 4DXCA 4NN3A 3QMFA 1IZ1A 3N6UA 2DXRA 1Y9UA 4GLIA 5H8NB 3RNNA 5I2NB 1USYH 1I6AA 5I7IA 3N6TA 3ZKLA 2PVUA 3LBSA 4U4SA 2F6GA 4OERA 3PMWA 3VFJA 3TCFA 3PPNA 4OXVA 3RPWA 2V84A 4MFIA 2D5WA 2DOJA 4ELOA 2F36A 4BDOA 1SI0A 3IR1A 4GXAA 2YJPA 3K4UA 4RPOA 1SW1A 4WEDA 3VDFA 4Z7EA 3G3JA 3KC0A 1RDZA 1NH7A 4N4UA 2Q8MA 2MKZA 4U23A 4AS5A 4DXUA 2PMSA 3OO6A 4PFWA 4PFTA 2CEYA 3DELB 4MCOA 4PAIA 3MZBA 1Y4TA 3USDA 2XA5A 2NVUB 5ITOA 4P56A 4F1UA 1DK4A 4PE5B 4NF4B 2HAVA 1XHYA 2UXAA 5IM2A 1MH4A 4F22A 2XWOA 2KQZA 1FTLA 1PB7A 5FHNA 1UTBA 3U94A 3RTFB 2G29A 4ESWA 2B65A 4NG7A 3H6WA 2DE3A 1FTMA 3MP6A 3FVOA 4F1VA 4GRKA 3SEUA 4OETA 1FQDA 4U22A 4DZ1A 1SW5A 4ZE9A 3W9VA 4OMBA 4JVIA 4XKRA 5JTYB 3K1NA 5K2YA 1USYE 3K1MA 4E0WA 4H6DA 5CRYA 4NAPA 5AA2B 3MP8A 4O94A 2XD2A 3PMVA 2WBDA 2VHAA 2IEEA 3M8UA 2Z22A 4F3GA 1RYXA 1N04A 4IB2A 3GBAA 1PB9A 1B3EA 1LAGE 4XXUA 2Y5LA 1B4HA 1NV6A 1PB8A 4HTGA 5AA4B 1A8EA 4QSDA 4EQBA 4G61A 4N6KA 4I3EA 1TFDA 5ICQA 2AL5A 3PPQA 3GZGA 4MAGA 2P0SA 1L5TA 2UVIA 3JYRA 4RPNA 1LAHE 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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