2UXAA

Crystal structure of the glur2-flip ligand binding domain, r/g unedited.
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
ENKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLRTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Developmentally Regulated, Combinatorial RNA Processing Modulates Ampa Receptor Biogenesis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR SUBUNIT GLUR2-FLIP
total genus 79
structure length 261
sequence length 261
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2uxaA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2uxaA02
4MLVA 4RJZA 3VLVA 1P1WA 3S9NC 3MVXA 2F5XA 2XXYA 4FJPA 4U2RA 4TQUQ 2O1MA 3O2AA 4XXUA 3E13X 3IO4A 4RXLA 1BLFA 1SW2A 4YMAA 1DMBA 3TCGA 4F2OA 4YZZA 1MH3A 1SW4A 3K6UA 2O51A 2DXYA 2OLBA 3KBRA 1USYE 2B3FA 2OK2A 3SEXA 3OO8A 1MM6A 4DE8A 5A5XA 2F6GA 3CFXA 3DELB 2PYYA 4DLDA 5H8HA 2I4CA 4R6YA 5JTYA 1CE2A 5CBRA 4Q0CA 1OLCA 4O3AA 3FVOA 1PB8A 4GXSB 2PBWA 1MY2A 5EYFA 1OLAA 3ODBA 4OHNA 5ISUA 4ZE8A 5FHOA 4NF5A 4G4PA 3DLNA 4DXUA 1RYXA 3LC8A 1MXVA 3KGCA 3C4MA 1DSNA 4EUOA 1B5JA 4PFWA 4M4GA 1XVXA 1Z7NE 3FXRA 4GF8A 1B4ZA 5IAIA 3O6GA 3EPEA 4E0WA 1URDA 4M1VA 4F31B 1HSEA 1USYH 4OETA 1M5BA 4IO5A 3RTFB 5CRYA 2ONRA 2ZYKA 3IR1A 4OQOA 2PT2A 1B3EA 1IXGA 1WDNA 1GVCA 3GZGA 3C9HA 3CVGA 5I58B 2DWJA 3CI8A 4ZEDA 3PUVE 2Y7IA 1WVJA 5JK4A 1FQEA 3LUYA 2QMWA 2E1SA 1AMFA 4UA8A 4GLIA 2REGA 2I58A 4G8NA 3KSXA 1QKBA 3K4UA 1OQGA 1SQYA 3HV1A 5TP9A 2NXOA 2I0CA 3EN3A 1SVXB 3OMBA 3UP9A 1I6BA 3O6HA 1MXYA 3UIFA 1PBPA 3T9UA 1Q35A 2R6GE 4ZE9A 3G3KA 5CM6A 1VR5A 3LBSA 3MVWA 4DIGA 2VP1A 3OD7A 2XHDA 4FATA 4OESA 3TTRA 3GLBA 3T9HB 3K6VA 2ZNUA 4KYEA 3K1PA 3TAJA 2VD3A 4JWYA 3FZVA 1B3FA 1H76A 1URGA 1Y3QA 3DM0A 4WEPA 4YB7A 3VV5A 3VE1B 1AH5A 2DWIA 2CZLA 4P11A 3U8QA 2E0SA 2NVUB 1IUDA 1LAHE 3SEYA 1PB9A 4N13A 1MQDA 1I6AA 3PMVA 2XD2A 2V93A 5B70A 3QXMA 4RPOA 1ZBMA 1MQGA 1I69A 1MXXA 2HZKA 3F11A 3M8UA 4HCYA 4MLQA 5H8NA 1D3KA 2UVJA 4H8JA 4HW8A 2DOJA 1MXWA 3FXQA 3VFJA 2H4IA 4QRZA 1JW4A 3KEIA 4NEDA 4R73A 1POY1 1RYOA 4F1UA 3G3GA 4IO3A 3TQWA 1LAXA 2RINA 3MUQA 3G3JA 2QMXA 3UA8A 3H3GA 2YJPA 3CG1A 4ISUA 1ZKBA 3DP4A 1P1UA 2X7QA 3TTLA 4JSDA 1URSA 2DSFA 5ITPA 1H45A 1SW1A 2O1LA 1POTA 3KN8A 3DP6A 1N76A 1S9TA 4LZ8A 1ZIUA 3HN0A 3RY3A 1R1NA 1OMPA 1QUKA 4OWDA 1P99A 2RC7A 4DDDA 2WKYA 5I2NB 1TT1A 3PMXA 1YPNA 1Z7ME 5I59B 1US5A 3V89B 1SI1A 1FQDA 2DQVA 2H25A 3IAZA 1L5TA 3H6VA 1IIWA 4BDQA 1Y4TA 3U72A 3CIJA 5LOMA 2ZYMA 3HHFA 1LB9A 1IITA 4NF8B 3U1OA 4F19A 3ZS6A 5I56B 5JEIA 1B7ZA 1MQJA 3FVGA 1XOCA 1MY4A 4XKNA 4EXLA 3K1NA 3CRBA 3FV2A 3OSRA 2CMOA 2V3UA 5H8FA 5I84A 2UYFA 2XXRA 1JVYA 1MH4A 1Y20A 3RQTA 5TPAA 1MDP1 3ZKKA 5I2KA 4HCWA 2X26A 3ZKLA 1O63A 2O7IA 1DPEA 1ZJLA 4WXJA 2Z8DA 1YCJA 1UIUA 3LSWA 4EF1A 4MFIA 1WODA 1B3LA 3C35A 1GTKA 4H8IA 4GD5A 1MY0A 1GV8A 3OEKA 4NMYA 2D5WA 3Q25A 2AL5A 1N7WA 3MC2A 2A5TA 4RYAA 3BKIB 4OENA 3KOTA 4IO7A 3RTWB 5L9OA 3TEPA 4G8MA 2XXQA 1OVBA 4PFUA 4GL8A 3M3LA 3H6UA 1HSLA 4PFTA 4GFRA 4F3BA 2P2AA 4XKQA 2I4BA 3TPAA 3MZ1A 5H8QA 5DEXB 3VLWA 5AA2A 3PPOA 2HAVA 3GBAA 4ELOA 3SEUA 3D4GA 4LQ2A 4GWOA 4F22A 3A3UA 3N6TA 1A55A 1IZ1A 2OBGA 1Y9UA 2FA7A 3EF7A 3I5OA 5J1DA 3FUZA 1MPCA 3JZJA 5M2VA 2F34A 2Q2CA 4QFNA 1TFDA 3V83A 2GFEA 4RK9A 3FIRA 4R2FA 2QS3A 3CFZA 4KI0E 2P0SA 4IO6A 4X1DA 3N5LA 1UTHA 3H6WA 3KSJA 3VXCA 1ZMGA 3AXFA 3TMGA 1LAFE 4ZEFA 1B4HA 3FVKA 2F7CA 4POXA 3TCHA 1QUJA 1FTMA 4I9DA 2AYSA 1O7TA 4MF3A 3G7WA 2BJJX 3BFTA 3ILTB 1LCTA 2F6PA 4I8CA 1A54A 1LBBA 2O68A 1QJMA 4R74A 3C33A 1R9LA 3FV1A 1CB6A 3PUXE 1LGBC 3VVFA 4PFYA 1SW5A 4OFJA 4ZEIA 1P1NA 4DCXA 3E3KA 4MBPA 2ZNSA 3K02A 4MH5A 1YTVA 3IJOB 2QJEA 1M5FA 1N04A 2W7YA 2XXIA 2AL4A 2O6AA 3ONMA 4EQBA 3S9LC 2DP8A 4O3BA 1JNFA 3G3FA 4YAHX 1MG1A 3O28A 4ESXA 3VDFA 4NF4A 2HXWA 3IJXB 1UTBB 3DP8A 1B2HA 5AA1A 3M3FA 1B46A 2Q89A 2F97A 1SYHA 3PV0E 1TXFA 3G3IA 3TUSA 5BUUA 5CMBA 3BFUA 2R9JA 4POWA 1VFDA 1B0LA 1DTGA 3N6UA 1TWYA 2HEUA 1M5CA 4H1XA 1II5A 3THIA 3IOVA 3RNNA 1FQCA 2ZYOA 1B5HA 4LA9A 5DVJA 3K2DA 4LQ5A 4KYSA 5I57A 4F3GA 2YPNA 3QK6A 1ZLQA 4WKMA 1JVXA 3TTMA 1ATGA 4BDOA 3S2VA 1Y3NA 4AB5A 3S9EA 3P7IA 3OOAA 1NL5A 4NF6A 5AA4B 1A99A 4YB6A 2HFBA 3MP6A 1N84A 1FCKA 5KDTB 4RA1A 4TLLB 3MPLA 2Q2AA 3KG2A 2DVZA 2ABHA 5AA2D 1BKAA 2DE4A 1N3XA 2GHAA 3ILUB 2O7UA 2DE3A 1EZPA 1JW5A 5KCJA 1D9VA 2Y7WA 2OWSA 1B7UA 4TOZA 3H03A 4N6PA 4FEBA 3S4UA 2QSXA 1LFGA 1A7LA 2PT1A 3T93B 1VE4A 3HPIA 2YLNA 3A09A 1B9JA 2Z23A 4ESWA 3QUFA 1B32A 3KOSA 1NNFA 5K2XA 2HCAA 2XD3A 4EQ9A 2XX9A 1UIVA 4ZEKA 3PU5A 4PQJA 4KCDA 1TFAA 1XHYA 3C32A 3B6WA 1B05A 2Q88A 4X48A 3VLUA 4NE4A 3QIMA 4U1ZA 5IKBA 4IY6A 1FQBA 5DYHA 1NNKA 1FW0A 3PUYE 1N3WA 2QS4A 1FQAA 1IQ7A 1SD3A 3SERA 1MM7A 4ZZAA 5KZTA 4R6HA 3O66A 5EHSA 2PVUA 1XT8A 3L6GA 2XXTA 3KN3A 4JSOA 3FD3A 5AE4A 3O29A 3PGFA 4OXVA 4QFPA 3TQLA 3SEWA 1Y4CA 2PX1A 4GQOA 5CI5A 1B51A 3FGSA 1LB8A 2GRVA 1FTOA 4FE8A 4OMBA 2XXVA 4PE5B 2B65A 2RCAA 4KQPA 3ZSFA 3B7DA 2F7AA 4OTEA 2F7BA 3C31A 5I58A 1H44A 2QS1A 3U92A 3RT8A 4FAJA 5A5XB 4NWDA 3MQ9A 1OIBA 1B3GA 5H8HB 1MXUA 3H06B 4F1VA 5DVFA 5JTYB 3R26A 1MXZA 2NOOA 3RN8A 2I3VA 3O97A 1NNPA 3RPWA 3Q29A 4P0IA 5TU0A 3TYHA 2H98A 2XXWA 4FEDA 2F78A 3JV9A 4Z7EA 2XXUA 3C34A 2R71A 3OO9A 4NF5B 3LSXA 3CG3A 4C1TA 4DXCA 3IO6A 1MPDA 2G29A 2XXXA 1B7HA 1ANFA 4FIMA 4H0WA 2XX8A 3GBBA 1D4NA 1Y1ZA 4ZZEA 2H9BA 1ELJA 4PP0A 5L9SA 4BDRA 2I48A 2VOZA 2UVGA 3WAFA 1JEUA 3TKDA 4JB7A 3T9VA 5ICQA 5HPQA 1MQIA 3WAEA 4U23A 3VVEA 2I3WA 3MZ9A 1D9YA 3E4RA 3CFLA 2O84X 4GVOA 4ELPA 3OO6A 1PBQA 3IOWA 1I6QA 3K6XA 3Q26A 5CC2A 4ELQA 1RKMA 1S50A 4EQ7A 1JEVA 1M5EA 2DS9A 3RUMA 4Q8RA 5TP9B 5K2YA 2Q8JA 3TTKA 5FHNA 3IORA 2FYIA 5HM4B 4YMBA 2XX7A 1EZ9A 4U22A 1ZU0A 2Y7RA 5ICTA 2VD2A 1EH3A 2IA4A 4XTCQ 5ELVA 5BWJA 4Q5TA 4LONB 1BTJA 1DOTA 1P1OA 2I49A 3MZBA 5CBSA 4I62A 3V8XB 4X1BA 3B6QA 4ND9A 2NWJA 2VGQA 3PUWE 1S7YA 2M8CA 2D3IA 4ECFA 2OWTA 1A40A 2V25A 4G8HA 3SDFA 2FNCA 1R6ZA 3G3HA 1JW1A 2ONKE 4IGTA 2D21A 1AOVA 4FORA 4ZS9A 2GHBA 3LSFB 4OYVA 4UACA 2RC8A 1NFTA 4QFOA 2F35A 3MVYA 2Z22A 1YAEA 3MP1A 2QL3A 1PEBA 1EZOA 3W15C 4R2BA 5CMKA 2RF1A 1B58A 2VHAA 1MY3A 4OFOA 4ELRA 2ZMBA 3C36A 4ZECA 4I1DA 4DCYA 4YICA 1LBCA 1JQFA 3IOUA 5CMMA 2LAOA 2OJTA 3TCFA 1J1NA 4QFLA 4H5GA 2ZNTA 4H67A 4C1UA 4F29A 5H8SA 5I2NA 1JETA 3IX1A 3KJ7A 3VXBA 3QUJA 5I59A 5H8NB 2UXAA 3T96B 4KPTA 3KN7A 5HBCA 2Q9TA 3I6VA 4RY1A 2O69A 3OXNA 1FQFA 4DXBA 3IB2A 3PD9A 3EHTA 3CSGA 3A3CA 4NF8A 1T0KA 3U94A 5I56A 3L6HA 4IGRA 4HS7A 1QULA 2UYEA 3T9XB 1FTLA 2ESNA 4N07A 3VVDA 1NH8A 4JWXA 4XKPA 4KHZE 3H7MA 4KR5A 4AQ4A 4LP2B 5DT6A 1MDQA 2THIA 3FJ7A 3O6IA 4BDNA 3N94A 3H6TA 4XKRA 4KD5A 2F36A 4OERA 3CR9A 3MVZA 4Q30B 2Z8EA 1N0TA 1NKXA 2ZXTA 2DYXA 4U1OA 1FTKA 3OELA 3R6UA 2UVHA 1OVTA 2DVCA 5AA3A 3LSLA 1KWHA 3HO7A 4R9GA 3T66A 3JYRA 1ZTYA 4O3CA 4HTGA 3KJTA 3N26A 3MJNA 3MW0A 1MS7A 1GR2A 3MP8A 3K1MA 1IEJA 3SKPA 4RNSA 1R9QA 4TLMB 4GOTA 2V3QA 4F1YA 4G77A 1PC3A 2X7PA 1LFIA 3ECRA 2A5SA 3MWBA 1B0HA 1FTJA 5DTBA 5H8FB 2QS2A 4IO4A 2G93A 4F39A 3GXAA 5I2KB 5TPAB 5DEXA 5L9MA 2NUVA 1LCFA 4R75A 4ZEBA 3RLFE 1DTZA 1VSOA 2H99A 2IEEA 1GGGA 3V5AA 4G68B 1DPPA 4OVJA 3PPRA 1NNTA 2QPQA 2PMSA 4IO2A 4R6KA 3FATA 4L17A 4LATA 4KCCA 4DZ1A 1PB7A 1SYIA 4YKKA 1LSTA 1B1HA 4ONYA 3FXUA 4BDLA 3QYTA 1Q1KA 1H3DA 1SBPA 4F2QA 2A5TB 2Y7PA 2OCUA 3UN6A 3O9PA 4YB5A 1IXCA 1OQHA 2ALUA 5EHMA 3RGYA 4PETA 1O64A 4IB2A 2HQ0A 3FVNA 5B7DA 4GL0A 1US4A 3OSQA 3HCQA 4YKPA 1EU8A 1B40A 2UVIA 5F7VA 3IK6B 3TELA 5H8QB 1F9BA 3TZAA 4AB6A 5AA2B 4THIA 4WEDA 4KYDA 3S9MC 3TODA 4OZ9A 1Y3PA 4QF9A 1XVYA 2HZLA 2ONSA 3MPKA 3M3KA 4X9TA 1B52A 4F3SA 3K6WA 2KLFA 3PMWA 1QW0A 2I6EA 4GIZA 1B3HA 3EQ1A 1MPBA 4GRKA 3IOTA 1QKAA 3MAMA 4QSCA 1AL3A 4KFQA 4LZ7A 4QFKA 2I0BA 4GXAA 3H4ZA 2XXHA 3USDA 1XC1A 4QHQA 1MY1A 1UTHB 3RT6B 4YKJA 3T22A 4BDMA 1NMUA 1UTBA 1B6HA 2H5YA 4EF2A 3K01A 3IL1B 3KFMA 5F1QA 4JDFA 4NTLA 3SETA 2RCBA 3OEMA 1M5DA 4JBZA 2GH9A 3MBPA 3HSTA 1PDAA 4LZ5A 3TDJA 1SDXA 2V3TA 3BBRA 4C0RA 2P1SA 2DXRA 1A8EA 2REJA 4R72A 3EHUA 4JXIA 3OENA 4EXKA 3FJMA 1HSJA 3IB1A 4G68C 1H43A 1LLSA 1MQHA 1QVSA 4IY5A 4QSEA 1P1QA 1LAGE 1B5IA 4YKIA 5FTHA 3PD8A 1VFEA 3UK4A 3I3VA 3SEVA 4LVQA 2AIXA 1Y1MA 4FECA 3KZGA 3D4CA 5AA4A 2B3BA 3IB0A 2RKMA 4BLAA 3FASA 2DE2A 2F8DA 5ITOA 5DVIA 5KDTA 1N7XA 4XIGQ 4U4XA 4K3FA 2QRYA 4R9FA 1B1XA 1LFHA 3QSLA 4OFLA 1IXIA 3OO7A 1MRPA 2ZYNA 3PPQA 4OEVA 3K00A 4NF4B 4Z0IA 3CSBA 4EDPA 4G68A 3Q27A 3HHGA 4F18A 2XXPA 4OEUA 1A8FA 2HAUA 3FJGA 5FHMA 1IXHA 4H65A 3W9VA 4G2ZA 4RK2A 3Q28A 1SI0A 2DWAA 2ANJA 3EHSA 4H5FA 1QUIA 5L8DA 5FTIA 4U21A 4JWOA 3R7XA 1UQWA 4H6DA 4E0XA 3B6TA 5CMCA 4YU0A 4U4SA 3E9XA 4LUBA 5I57B 3U93A 4RPNA 3UORA 4QSDA 3UGWA 2Y7KA 4ZDMA 3PPNA 1AIVA 2RC9A 3LR1A 3QAXA 4NF6B 2V84A 2OZZA 4P0GA 3PUZE 1BIYA 2DWHA 3TFLA 2Y84A 3W9WA 1XS5A 1BP5A 3PPPA 3K0VA 2Z8FA 4NWCA 5KCJB 1NH7A 3TTNA 4F3PA 3SESA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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1SVXB 2ZZXA 3OMBA 3UP9A 1I6BA 3O6HA 1MXYA 3UIFA 4JVIA 1PBPA 3T9UA 1Q35A 2R6GE 4LN5A 4ZE9A 3G3KA 5CM6A 1VR5A 3LBSA 3MVWA 4DIGA 2VP1A 3OD7A 2XHDA 2JJKA 4FATA 4OESA 3TTRA 3GLBA 3K6VA 3T9HB 2ZNUA 4KYEA 2QFLA 4OVTA 3K1PA 3E79A 3TAJA 1SPIA 2VD3A 4JWYA 4MNPA 1XI6A 3IFCA 3FZVA 1B3FA 1H76A 1URGA 1Y3QA 3DM0A 4WEPA 4YB7A 2PFYA 3VV5A 4PDHA 3VE1B 1YZ0A 1AH5A 2DWIA 4MHFA 2CZLA 4P11A 3U8QA 2E0SA 2NVUB 1IUDA 1LAHE 3SEYA 1PB9A 4N13A 4PBHA 1MQDA 1I6AA 3PMVA 2XD2A 2V93A 5B70A 3QXMA 2CZIA 2P3VA 4RPOA 1ZBMA 1MQGA 4AS4A 1I69A 1MXXA 2HZKA 3F11A 3M8UA 4HCYA 4MLQA 5H8NA 1D3KA 2UVJA 4H8JA 4HW8A 2DOJA 1MXWA 3FXQA 1EYIA 3VFJA 4GWUA 2H4IA 3ISPA 4QRZA 1JW4A 4O8MA 3KEIA 4NEDA 4R73A 1POY1 1RYOA 4F1UA 3G3GA 4IO3A 3KC1A 3TQWA 4PFIA 1LAXA 2RINA 3MUQA 3G3JA 4DI4B 2QMXA 3UA8A 3H3GA 2YJPA 3CG1A 4ISUA 1AWBA 3BIHA 1ZKBA 3DP4A 1P1UA 2X7QA 2VT5A 3TTLA 4JSDA 1URSA 2DSFA 5ITPA 1H45A 1NUWA 1SW1A 2O1LA 1POTA 3KN8A 3DP6A 1N76A 1S9TA 4LZ8A 1ZIUA 4PFBA 3HN0A 3RY3A 1R1NA 4PDDA 1EYKA 3MSTA 1LBZA 1NV6A 1OMPA 1QUKA 4OWDA 1P99A 2RC7A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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