3EHTA

Crystal structure of the extracellular domain of human corticotropin releasing factor receptor type 1 (crfr1) in complex with crf
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
452
structure length
452
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPETWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTNAAAEFSLQDQHCESLSLASNISGLQCNASVDLIGTCWPRSPAGQLVVRPCPAFFYGVRYNTTNNGYRECLANGSWAARVNYSECQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Membrane protein
source organism Escherichia coli
publication title Molecular Recognition of Corticotropin-releasing Factor by Its G-protein-coupled Receptor CRFR1.
pubmed doi rcsb
molecule keywords FUSION PROTEIN OF CRFR1 EXTRACELLULAR DOMAIN AND MBP
total genus 123
structure length 452
sequence length 452
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF02793 HRM Hormone receptor domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ehtA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ehtA01
4.10.1240.10 Few Secondary Structures Irregular Hormone receptor fold GPCR, family 2, extracellular hormone receptor domain 3ehtA03
4ESXA 1SW5A 3MQ9A 1FW0A 3WAFA 3O6HA 1SQYA 3K0VA 4RYAA 4NF8A 3MZ9A 3F11A 4YB6A 2V3QA 4ZEKA 3T66A 1Y3QA 4MF3A 3G3IA 2F6PA 3U8QA 2GRVA 3TPAA 1J1NA 2RC7A 3LSXA 4EQ7A 1IUDA 4PFWA 1PB8A 3IJOB 2CMOA 4GF8A 4HW8A 3SKPA 1POY1 3FVOA 4F3PA 3T9XB 2X7QA 1OVBA 4RA1A 4F31B 4TLMB 3U1OA 4JSOA 3KN3A 3UK4A 3MUQA 1IXHA 4G2ZA 4DIGA 3E4RA 3R26A 1TWYA 1ZBMA 3HHGA 5H8NA 1FQFA 3S9EA 4LZ5A 4NWCA 4FAJA 1RYOA 3FATA 3C36A 2ABHA 3QYTA 4BDLA 5A5XA 4AB5A 3H6VA 3IOTA 1HSJA 5FHOA 2DE4A 3OXNA 5F1QA 4E0XA 4UACA 1D3KA 3OMBA 3OO6A 4G77A 4GIZA 1TFDA 4PQJA 3N26A 4XKRA 5AA2D 1UTHA 1MXZA 3FXRA 3CFLA 4YKJA 2AL5A 1B46A 4KPTA 1ZKBA 1QUJA 3CSGA 4R2BA 4LP2B 4I1DA 3FXQA 3FGSA 1O7TA 2VD2A 5A5XB 4LQ2A 4IO2A 2NWJA 3EPEA 2HQ0A 4OVJA 4NF6B 4F3GA 1EZ9A 3VVFA 3KSXA 3V5AA 3PPPA 1A7LA 4F2QA 3IOVA 4MH5A 1I6BA 2PT1A 2BJJX 3FV2A 4RXLA 3C35A 1S7YA 3E3KA 3G3JA 3TAJA 1SW1A 4IO4A 4KR5A 5AA1A 3O66A 1BTJA 2V93A 1PBPA 1Y3NA 2XX7A 4WXJA 1B7ZA 1N7XA 1P1WA 2Q2AA 1N3XA 2HZLA 2UVIA 2REGA 4BDOA 1Q35A 3IL1B 4O3BA 3TQLA 4FE8A 1N3WA 4QFPA 5BUUA 1Y4TA 3S2VA 4H5GA 5J1DA 3D4CA 1POTA 4ISUA 1MY3A 3IORA 2HXWA 4GVOA 3CR9A 5TP9B 1JW5A 3W9WA 5H8FB 4F2OA 3RQTA 3IB1A 4O3CA 4ELPA 1SDXA 3CFXA 4YKKA 3Q25A 3USDA 2Y7WA 1NL5A 4JXIA 2VD3A 5AA3A 4AB6A 3TCFA 5KZTA 4IGTA 1WODA 4DDDA 1MH4A 1MM6A 1URDA 2Z8FA 3TODA 4BDQA 3HPIA 2IEEA 2HAVA 2O1MA 3KSJA 5EYFA 1JEUA 4GWOA 1B4ZA 2QMXA 3V89B 3PUVE 3ECRA 2L27A 4Z0IA 3LSWA 2RC8A 2YJPA 4JBZA 2Q8JA 4O3AA 2I3WA 3GBAA 3EQ1A 4KYDA 3JV9A 4JDFA 1P1QA 4OEUA 2PMSA 2XXHA 1MDP1 5L8DA 1LB9A 2XXXA 3DP8A 3LSLA 3RTWB 3VE1B 4NF5A 2REJA 1FQCA 1I6QA 2O6AA 4ZEFA 4OMBA 5F7VA 3K1MA 2I3VA 5KCJA 2YLNA 4HJ0A 4NWDA 4DLDA 4X9TA 4GL8A 1B2HA 3L2JA 1II5A 4OTEA 2B65A 1MQHA 4U4XA 3OSQA 4GFRA 3OO9A 5II0A 1USYH 1Y20A 3T22A 1LAFE 4NF5B 1OVTA 4R2FA 4QSDA 4TOZA 3CSBA 5KCJB 4FATA 2A5TA 1N84A 1JEVA 3CRBA 1LFHA 1Z7ME 5I58A 2QS3A 1XHYA 4RK9A 2O1LA 3RN8A 1IXGA 2ESNA 3TTRA 1ZLQA 4JWYA 4YMBA 1B9JA 5CBRA 4MLVA 4YB7A 1OIBA 1B3GA 4QFNA 3UORA 3C33A 4R6KA 4X48A 4KFQA 4F19A 4H67A 4P0IA 4ECFA 1QVSA 3VXCA 3O6IA 2R71A 3OSRA 4QF9A 3E13X 5CMBA 5I57A 3QIMA 3MZBA 4QRZA 1IITA 4POWA 1FTLA 2NUVA 1GGGA 4KQPA 1B4HA 5HBCA 4G8NA 4DXCA 2A5TB 2ZYOA 4I9DA 3HV1A 4E0WA 2Q9TA 3N6UA 3KG2A 3A3CA 1R6ZA 1IQ7A 2F8DA 2ZNUA 1DOTA 3KEIA 4IO3A 4OWDA 2O51A 1IEJA 3KGCA 4OFLA 5JTYA 1Y4CA 2XXVA 5TPAB 3MVXA 4OYVA 4YB5A 5I57B 3PUWE 1Y1ZA 3IOUA 2H98A 3U93A 4KD5A 3ZKKA 1FQDA 2E1SA 1WVJA 1FTKA 3FJ7A 4XXUA 2AL4A 1IZ1A 4YU0A 2FYIA 4G8HA 1LBBA 3V8XB 2ANJA 5DT6A 1AMFA 2DXRA 4QSEA 3PD8A 2ONSA 3PUYE 1QUIA 1B3FA 4ERSA 5JTYB 4DCXA 1PC3A 2F34A 3HSTA 4YICA 2XD3A 3W9VA 1N7WA 2OBGA 4Z7EA 3OENA 3K1NA 5ITOA 3PU5A 3PGFA 1ZIUA 1OQGA 2NVUB 2B3BA 5L9MA 4RPOA 1U34A 3D4GA 3TQWA 1VFEA 2F7BA 1DTZA 1MY0A 1Z7NE 3O28A 3U92A 5BWJA 4H8IA 1BIYA 5H8SA 2P2AA 4NE4A 2GH9A 3KOTA 3H7MA 1FQEA 2XDGA 1A99A 4ELOA 5AA4A 2RC9A 2DYXA 4BLAA 1S50A 3TUSA 1RYXA 1FTJA 1MY1A 4Q5TA 1MPCA 2ONRA 4U23A 4ZZAA 3MBPA 4JB7A 1SYIA 5DVFA 1JNFA 3OD7A 1XS5A 2Z8EA 2G93A 5CMCA 3K6WA 2OWSA 2I48A 3RNNA 4LZ7A 4GD5A 4PP0A 5CI5A 4TLLB 4NF8B 3TTNA 5EHMA 3PPOA 4N13A 2XXQA 3K6UA 1A8FA 3KFMA 4NF4A 4PFUA 4TQUQ 1ZMGA 3ODBA 1EU8A 4QHQA 2F5XA 2JNDA 1A55A 2R6GE 1VE4A 3T9HB 4WEDA 3S9NC 3CIJA 3IX1A 3MC2A 4RY1A 3RPWA 3ONMA 3VVEA 4HS7A 3RTFB 2JODA 5I59A 4F3BA 2XHDA 4EQBA 4MLQA 3Q28A 3G3KA 4L17A 1YCJA 2OZZA 3W15C 4R6YA 2XX9A 3ILUB 1MM7A 4OESA 4H1XA 2PYYA 5H8NB 4NF4B 3SERA 5K2YA 1LAHE 4LZ8A 5CMKA 1MPBA 2Y7KA 3GZGA 3S9MC 4ND9A 3LUYA 3UP9A 3BFTA 2KLFA 3IO4A 5I59B 2V25A 3KOSA 5DTBA 3ZSFA 2I4BA 2OCUA 3CG1A 2RKMA 4U1ZA 3L6HA 5I2NA 2ZMBA 2DQVA 3PMVA 4FEBA 3FVKA 5EHSA 3FVGA 2ZXTA 5ITPA 1UTHB 3K6VA 1QKAA 3S9LC 2Z8DA 2Y7RA 4HCWA 5FTHA 2D5WA 2DVZA 4RK2A 3VLVA 3FVNA 2UVJA 2O7UA 2I0CA 1B1XA 2O68A 3E9XA 4KI0E 5AA2A 1I69A 1NNTA 4KCDA 4KYEA 4IY5A 5DVIA 1B58A 3SEUA 1AIVA 3Q29A 4G4PA 2V84A 3KBRA 2UYEA 3TTLA 4ELRA 2UXAA 2QS2A 5ICQA 3T9UA 2F36A 5H8HA 3QK6A 1JW1A 2R9JA 3ILTB 4Q30B 2VHAA 3PMWA 3HO7A 5CRYA 3PV0E 4DLQA 2QJEA 1IXIA 1UTBA 4DXBA 1MQDA 1OQHA 4LATA 4ZEIA 1MXVA 1B5JA 3MVWA 1L5TA 3P7IA 3G7WA 3OO7A 3VLWA 4OZ9A 1LB8A 1B7HA 1NMUA 3UN6A 5H8HB 3KN8A 1DTGA 1ATGA 3EHSA 3FV1A 1SBPA 2PT2A 1JVXA 5FHNA 4C1UA 1N76A 3RT6B 3I6VA 3FASA 2DOJA 1I6AA 5JEIA 3K02A 3VVDA 3PD9A 1TXFA 2WKYA 4R73A 1SW2A 4OHNA 3PUXE 3H6UA 2GHBA 1H3DA 3QUJA 2OJTA 3K2DA 1LGBC 2XXPA 4GOTA 2I49A 1AOVA 3M3FA 2ALUA 2RCBA 2H4IA 4XIGQ 3OOAA 1A40A 2QS1A 2ZYMA 4NTLA 2DP8A 2DWIA 2V3TA 2F7CA 1YPNA 2H5YA 3MPKA 1ELJA 1NNKA 1M5DA 2DVCA 1JW4A 4EXLA 3ZKLA 4YKIA 4DLOA 3MWBA 1LCFA 2QKHA 1B3LA 3L6GA 5CM6A 2DE2A 1XVYA 2Q2CA 2OLBA 1QW0A 1M5EA 3C34A 2GFEA 4DXUA 2YPNA 2QMWA 5FTIA 4NMYA 1H44A 4EF2A 1TT1A 4GQOA 3AQFB 1SI1A 4F1YA 3N6TA 4G8MA 3TZAA 2DWHA 1A8EA 4H5FA 3FZVA 3K6XA 2CZLA 5I84A 5FHMA 4C1TA 2I0BA 1JQFA 3V83A 1FCKA 1B51A 4ZS9A 1MDQA 1XVXA 1NNFA 3OELA 4HTGA 4OETA 3MPLA 3LR1A 4QFLA 4BDMA 3DLNA 2Z23A 5I58B 3G3GA 3MZ1A 3T93B 3SEYA 3TKDA 1FTMA 2ONKE 1D4NA 3VFJA 2B3FA 2Q89A 3QAXA 1ZJLA 1UIUA 3SEXA 1GVCA 5JK4A 3IR1A 4K3FA 5L9SA 1SW4A 3IB2A 5AE4A 1MXYA 1DMBA 3CG3A 1HSLA 3H06B 4F1UA 1US4A 1B5HA 1GV8A 1LBCA 3PPRA 4ZEBA 4ONYA 3FXUA 1TFAA 3QUFA 2LAOA 4U21A 5CC2A 4OXVA 3IOWA 2HZKA 2Q88A 1LFIA 1BLFA 2QSXA 4HCYA 1EZOA 4LF3C 3QSLA 1UQWA 2ZYKA 3OO8A 1B40A 1P99A 4ZEDA 3TDJA 4LVQA 1US5A 2DWAA 1VFDA 2UYFA 1QUKA 1A54A 2F35A 3JZJA 4Q8RA 4FECA 3N7SA 4F22A 1XOCA 3B6WA 3R6UA 1P1UA 1MRPA 3KJTA 4THIA 3H3GA 3SEWA 1S9TA 2OK2A 2F6GA 5K2XA 4ZE9A 2Y84A 4KCCA 1NKXA 3I3VA 3TELA 3MJNA 3RGYA 4I62A 1OMPA 3H6WA 2V3UA 2F7AA 1YAEA 2UVHA 4G68C 1H45A 4QFOA 3PPQA 4NEDA 3K01A 5CBSA 2G29A 3AXFA 1B3EA 1MG1A 2FA7A 3DM0A 2NXOA 4ZZEA 3MVZA 1T0KA 2F97A 4DZ1A 3PPNA 4RPNA 5AA4B 2I58A 3RY3A 1FQAA 2RCAA 2DE3A 5ELVA 4G68A 1M5BA 4H65A 4GXSB 3K00A 3U72A 1CE2A 4F3SA 5I56A 2I4CA 3MP6A 2HEUA 3IAZA 2XXYA 1URSA 4R72A 5HPQA 1KWHA 2IA4A 4BDRA 2H9BA 3MP8A 4F39A 3M3LA 4KHZE 4IO7A 1MH3A 4XKNA 1PBQA 3MAMA 4XTCQ 5DEXA 1B32A 4NF6A 3VV5A 2ZNSA 1CB6A 4YKPA 3GBBA 3HCQA 1EH3A 4G68B 1LLSA 3THIA 4FEDA 1LFGA 3JYRA 1EZPA 1SD3A 3VXBA 4IO6A 4ZDMA 2Y7PA 2UVGA 1ZTYA 4BDNA 1D9YA 1B0HA 4F18A 4PE5B 5I56B 2VP1A 3BBRA 4MBPA 3G3HA 1R1NA 3TMGA 2F78A 2QS4A 5LOMA 2X26A 4QFKA 2PVUA 4OENA 1XC1A 1P1NA 1SI0A 1FQBA 4M4GA 5DEXB 3IOLA 1B5IA 2XD2A 2VOZA 5L9OA 1FTOA 2W7YA 3MVYA 4DE8A 1RKMA 5CMMA 4KYSA 3B6TA 4M1VA 3PUZE 5I2KA 3EN3A 4R9GA 2I6EA 4U1OA 3O6GA 1VSOA 3MW0A 4GLIA 5TP9A 2PX1A 5H8FA 4OERA 4QSCA 3O2AA 4LUBA 4ZECA 1MY4A 1B52A 2QPQA 3H4ZA 3RT8A 1MQGA 4MFIA 2D21A 1PB7A 3MP1A 5I2NB 4OEVA 2M8CA 2E0SA 4P11A 4U2RA 3T96B 3TEPA 1LCTA 3FJMA 3HN0A 5M2VA 5I2KB 1R9LA 3QXMA 4LONB 3FD3A 4H6DA 4OFJA 1SVXB 3SESA 1B7UA 4I8CA 4R6HA 4C0RA 3IK6B 2Y7IA 1XT8A 2AIXA 3RUMA 1IXCA 2X7PA 3C31A 5AA2B 3RLFE 5TU0A 3IJXB 2DXYA 4N07A 3KZGA 4EDPA 4H0WA 3DP4A 1VR5A 4EF1A 3GLBA 4X1DA 3HHFA 3SDFA 3A3UA 4WEPA 4UA8A 4YMAA 2OWTA 4FJPA 4POXA 2JNCA 3BFUA 3LSFB 1BP5A 4IGRA 4DCYA 3BKIB 4H8JA 1IIWA 1H43A 5H8QA 1AL3A 3TTMA 2XXTA 2NOOA 3UA8A 2XX8A 3WAEA 1Y9UA 3O9PA 2DWJA 1UTBB 4IO5A 3FUZA 4AQ4A 4FIMA 2QRYA 1QJMA 2AYSA 4R74A 4N6PA 3VLUA 2XXWA 3EHUA 5KDTA 3KN7A 1QULA 1GR2A 1F9BA 3C4MA 4JSDA 3DELB 2ZYNA 1P1OA 1MXWA 4PFYA 1WDNA 2ZNTA 3C5TA 4RJZA 1DPPA 3PMXA 3A09A 2PBWA 1JETA 3IB0A 4XKQA 4OFOA 1N0TA 1B05A 5H8QB 4PFTA 3KJ7A 1URGA 1MXUA 2H25A 2VGQA 1MQIA 1ZU0A 3CFZA 4YZZA 4U4SA 2P0SA 1UIVA 5DYHA 3UIFA 3VDFA 5IKBA 3SETA 2DSFA 2O69A 3UGWA 1JVYA 1ANFA 1MY2A 5KDTB 3K1PA 3DP6A 3EHTA 3U94A 1D9VA 2P1SA 4WKMA 4GL0A 3TTKA 3O97A 1NNPA 4JWOA 1O64A 4FORA 4GRKA 3T9VA 1N04A 2FNCA 1NH8A 5B7DA 4IB2A 3SEVA 3C59A 2A5SA 1HSEA 2O7IA 4ELQA 1M5CA 3GXAA 3M8UA 2RF1A 2XXIA 3LC8A 3G3FA 1B3HA 5TPAA 1MPDA 3R7XA 1OLCA 3ZS6A 2O84X 2H99A 1MXXA 1Q1KA 1BKAA 1QKBA 4ZGMA 4U22A 3K4UA 3H6TA 4IY6A 1M5FA 1SYHA 4Q0CA 3FJGA 4EXKA 2XXUA 1MS7A 4RNSA 3N7RA 1H76A 3OEKA 4EUOA 1R9QA 1PB9A 3EF7A 4GXAA 2HAUA 1DPEA 2Z22A 3CI8A 1Y3PA 5ISUA 4EQ9A 5ICTA 1NH7A 1AH5A 3CVGA 2GHAA 3B6QA 3C32A 3TCGA 4R9FA 1LSTA 2HCAA 4F29A 2HFBA 2QL3A 4JWXA 4ESWA 2RINA 3S4UA 1NFTA 3TFLA 4OQOA 5DVJA 3Q27A 5B70A 3LBSA 3M3KA 4R75A 1Y1MA 2DS9A 5HM4B 3Q26A 1B0LA 1MQJA 3H03A 1LAGE 2XXRA 2THIA 4XKPA 1YTVA 4LA9A 4ZE8A 4P0GA 4PETA 2D3IA 3N94A 3TCHA 1B6HA 3OEMA 3IO6A 1LAXA 4X1BA 3C9HA 1B1HA 1PDAA 1GTKA 4YAHX 4F1VA 3I5OA 5IAIA 1DSNA 3FIRA 3N5LA 3TYHA 1USYE 1O63A 3B7DA 4LQ5A 3N7PA 3O29A 1PEBA 1OLAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ESXA 1SW5A 3MQ9A 1FW0A 3WAFA 1EYKA 3O6HA 1SQYA 3K0VA 4RYAA 4NF8A 4P56A 3MZ9A 3F11A 4YB6A 4X8RA 5EQ8A 2V3QA 4ZEKA 3T66A 1Y3QA 4N8GA 2WX9A 4MF3A 3G3IA 2F6PA 1NUYA 3U8QA 2L5VA 2GRVA 3TPAA 1J1NA 2RC7A 3LSXA 3QMFA 4EQ7A 1IUDA 4PFWA 1PB8A 3IJOB 2CMOA 4GF8A 5EQ9A 2FIXA 4HW8A 3SKPA 1POY1 3FVOA 4F3PA 3T9XB 2X7QA 1OVBA 4RA1A 4F31B 4TLMB 3U1OA 4JSOA 3KN3A 3UK4A 3MUQA 4N4UA 1IXHA 4G2ZA 4DIGA 4N81A 3E4RA 3R26A 4XF5A 1TWYA 1ZBMA 3HHGA 5H8NA 1FQFA 3S9EA 4LZ5A 3LV0A 4NWCA 4FAJA 1RYOA 3FATA 3C36A 2ABHA 3QYTA 4BDLA 5A5XA 4AB5A 3H6VA 3E78A 3IOTA 1HSJA 5FHOA 2DE4A 1YZ0A 3OXNA 4GWYA 5F1QA 4E0XA 4UACA 1D3KA 3OMBA 3OO6A 4G77A 4GIZA 1TFDA 4PQJA 3N26A 3KC1A 4XKRA 5AA2D 2XWKA 1UTHA 1MXZA 3FXRA 3CFLA 5LDZA 4YKJA 2AL5A 1B46A 4KPTA 1ZKBA 1QUJA 3CSGA 4R2BA 4LP2B 4I1DA 3FXQA 1FSAA 3FGSA 1O7TA 2VD2A 4NAPA 5A5XB 4LQ2A 4IO2A 2NWJA 3EPEA 2HQ0A 4OVJA 4NF6B 3A29A 4F3GA 1EZ9A 3VVFA 3KSXA 3V5AA 3PPPA 1A7LA 4N6KA 4F2QA 3IOVA 2Y5LA 4MH5A 1I6BA 2PT1A 2BJJX 3FV2A 1FBHA 3C35A 4RXLA 1S7YA 1RDZA 3E3KA 3G3JA 3TAJA 1SW1A 4IO4A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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