1MXXA

Crystal titration experiments (ampa co-crystals soaked in 100 um brw)
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
publication title Probing the Function, Conformational Plasticity, and Dimer-Dimer Contacts of the GluR2 Ligand-Binding Core: Studies of 5-Substituted Willardiines and GluR2 S1S2 in the Crystal
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 85
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxxA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxxA01
3U1OA 4ZDMA 5ISUA 3G3JA 1ZLQA 3RLFE 3QUJA 4NF5A 3CVGA 2E0SA 1QUKA 2ZNTA 1R1NA 3RTFB 5K2YA 3PUWE 3IX1A 5F1QA 1SW5A 5LOMA 2F7AA 2OWTA 4I9DA 2DS9A 4XTCQ 3RT6B 5AA1A 4JWOA 1CB6A 3R7XA 1HSEA 4ISUA 1GVCA 3TTMA 2O1MA 1VFEA 1D4NA 1PB8A 3VXBA 3RTWB 1LAXA 2E1SA 1MY2A 2G93A 2DSFA 3DP8A 2H25A 4K3FA 1B7HA 4BDLA 5KDTA 1MM6A 5KCJB 2AL4A 1IQ7A 3IB0A 2PVUA 1LFGA 3C31A 4ECFA 2R9JA 3FXUA 1BP5A 3QUFA 2F36A 4LZ8A 3N94A 3KN3A 3VVFA 3VLUA 4JBZA 3RPWA 1Y4TA 5DYHA 4GRKA 4POXA 4YKPA 5BUUA 4XKRA 3FJMA 5J1DA 3C35A 4NF6A 1GV8A 5CRYA 4NWCA 3TCGA 2DWJA 1LLSA 2UVIA 1IZ1A 3OO8A 4QFKA 3SEVA 1HSLA 3MP1A 3KZGA 3IOWA 4U1ZA 2D3IA 4DCXA 3KN8A 3W9WA 3I5OA 1A7LA 4DIGA 3PUXE 4MH5A 2M8CA 1ZU0A 4NF4B 4LZ7A 4PFTA 3D4GA 3OSQA 1B32A 2XX7A 1MY4A 2A5SA 3H6WA 3S9LC 1EZOA 1LAGE 3SEUA 5JTYB 3SERA 4G8HA 4TQUQ 2DWHA 3H03A 3B6WA 4ZS9A 2QMXA 2F78A 4IY6A 3CRBA 4OZ9A 2RC9A 2D5WA 3ILTB 4KYSA 1DTGA 4F3PA 1D3KA 2PMSA 3S2VA 4NMYA 3MUQA 1PBQA 3EHSA 1IIWA 2DVCA 2XXYA 5H8NA 3MZ1A 1TXFA 1YAEA 3A3CA 1A55A 2Y7WA 2OZZA 1Q1KA 1US4A 3TCHA 2Q8JA 1MXZA 3KOSA 3BFTA 5ELVA 1DPEA 4H5GA 3CR9A 3ZKLA 4DCYA 4IO3A 1UQWA 4GQOA 4EUOA 1J1NA 4ZE8A 2DWAA 2X7QA 3FXRA 2I3VA 2BJJX 1OQGA 5DVIA 4TLMB 1XHYA 3KN7A 3MZBA 3FATA 4WXJA 1LFHA 1N3WA 2QS3A 2REJA 1GR2A 2XX9A 1GTKA 2DXRA 4KCCA 3KBRA 4U21A 3K1PA 1SI1A 3OEKA 3IB1A 3N6UA 5H8SA 2UYEA 4DXBA 2FNCA 3H7MA 3MVWA 4NTLA 5DTBA 3T96B 1JETA 2RF1A 3G7WA 2Z8FA 3N6TA 1T0KA 2RC8A 2PYYA 1JW1A 2I48A 1XC1A 1FQDA 2I4BA 3OO7A 2H99A 5AA2A 2I0CA 3OENA 2V3UA 2DYXA 2RC7A 2Z8EA 3PMVA 5L9OA 4IO4A 5I58B 2B3BA 4GL8A 5ICQA 4XXUA 1IEJA 3FV2A 1A8EA 4R75A 4H6DA 2DE3A 4LONB 1FQCA 1FTKA 1KWHA 4ELOA 3FJGA 4HS7A 3FD3A 3I3VA 3GBBA 3ZSFA 5IAIA 3LSXA 1A40A 2X7PA 4F3BA 3QIMA 3Q26A 3FXQA 5I2KB 1USYH 2Q9TA 1Y9UA 3ZS6A 1BTJA 3IO4A 3FIRA 3HN0A 2F8DA 4R6KA 3OOAA 1USYE 4F29A 4WKMA 3SEWA 3IORA 4GWOA 2H98A 3IOTA 3R26A 2Z23A 1I69A 2YJPA 5TU0A 3O2AA 4ZZEA 3MBPA 3BFUA 5M2VA 1US5A 1BLFA 1RKMA 3TTNA 4F31B 3VE1B 3TTKA 5FHNA 1B3GA 1VFDA 2XXTA 1Y1ZA 3KEIA 2UYFA 1TT1A 2PT1A 4U23A 4KHZE 4YB7A 4RNSA 4FE8A 4R74A 4WEDA 1AL3A 4ESXA 4ZE9A 1N04A 3JV9A 3HPIA 4YMBA 3USDA 3KSJA 2GHBA 3BBRA 4THIA 1PEBA 4C0RA 4RYAA 2UVHA 4H1XA 3EHTA 1EZPA 4EF2A 5H8FA 1OQHA 1O64A 2ESNA 2XXUA 3DP6A 4G77A 1FCKA 2Y7RA 5I56A 4EQBA 1SYIA 3C4MA 1B4HA 3VFJA 1MG1A 2PBWA 5TPAA 5CBRA 2O6AA 3N26A 2OJTA 4X1DA 5AA4A 3MP8A 2QPQA 2VOZA 1SDXA 5AA2D 2UVJA 1B46A 4GXSB 5A5XB 3MZ9A 1MPCA 2VD3A 2ANJA 4OVJA 1MXVA 1A8FA 2XHDA 1LCTA 4GOTA 2RKMA 3FVGA 1Y3NA 4YKKA 4L17A 5EHMA 2GRVA 5H8QA 4OETA 1OVBA 3ZKKA 2AIXA 2I58A 4KCDA 4JWYA 1O7TA 3TEPA 2PT2A 4GL0A 1B1XA 4IO5A 5TP9B 3I6VA 2Q2CA 4JDFA 3UGWA 3CFLA 2QSXA 1IXHA 4H5FA 2ZYMA 3RQTA 3GXAA 1LFIA 1CE2A 4Q30B 5F7VA 3O6GA 2ONKE 5FTHA 1P1OA 3PUZE 4FORA 1VE4A 1Y20A 4ELPA 1YPNA 2FYIA 2ZYNA 1JVXA 3H6UA 3Q27A 4ZECA 3VLWA 1QUIA 1B7ZA 2DWIA 4OFOA 1P1UA 2V3QA 4IO7A 4YMAA 4UACA 1R6ZA 3C9HA 1ZMGA 1YTVA 4IB2A 3E4RA 3C33A 3TODA 4R6HA 3K6VA 4BDOA 4X48A 5I59B 3K1NA 3TFLA 4HCYA 3TZAA 3N5LA 2XXVA 2HZKA 1F9BA 4O3CA 3PUVE 1P1QA 2P0SA 2Y7KA 4ND9A 5DT6A 4QSDA 3GZGA 3H6VA 1UIVA 3L6GA 4NE4A 3DLNA 1MM7A 3KOTA 1UTBB 1FQFA 4IY5A 1MQHA 4OENA 4IO2A 3C32A 3EPEA 4OFLA 1DOTA 2D21A 1SVXB 1FW0A 1I6QA 1XT8A 4RA1A 2HAUA 3OSRA 1B1HA 3E13X 3TCFA 1B6HA 2ZXTA 5I2NB 5KCJA 4RK9A 1MPDA 4R2BA 4AB6A 2IA4A 4U4XA 3MAMA 4MLQA 4F3SA 2I6EA 3O9PA 2OK2A 4N07A 3SESA 2V25A 5CMBA 1QW0A 1ZKBA 2QRYA 4PFWA 3FGSA 4RPOA 2O84X 3ODBA 2HFBA 4P11A 3W9VA 2F97A 3QSLA 4PP0A 3LUYA 3S9EA 5AA3A 3OXNA 4R9FA 4U22A 2REGA 3CG3A 4LQ2A 2O7IA 1FQBA 3W15C 3OO9A 1XVYA 2XD2A 1BKAA 4EQ9A 3K6WA 3IB2A 2B3FA 4IO6A 3ECRA 1P1NA 3KJTA 1B7UA 3EHUA 4GIZA 1PB7A 3FV1A 2UVGA 4NF4A 4OERA 1MDP1 3SETA 3VVDA 3OEMA 1B3EA 5AE4A 3JZJA 4ESWA 3TKDA 3IJXB 1PB9A 3FVKA 5FTIA 4LATA 4R6YA 4Q8RA 1H76A 4LVQA 3KSXA 4BDMA 1LB8A 1WODA 5CBSA 1NL5A 5BWJA 3MP6A 3F11A 1LAFE 2Z8DA 3MPLA 1XS5A 4ZZAA 5L9MA 3CFXA 1OLCA 2AYSA 4NEDA 1MQJA 3UP9A 1H3DA 5CM6A 5H8HA 3SEXA 2RINA 2YLNA 5I84A 2Q89A 4G4PA 1Z7NE 2O7UA 4FATA 2NOOA 3FJ7A 3LSFB 3U94A 3LC8A 3MC2A 1JQFA 4KR5A 3PUYE 4OEUA 1QUJA 3O6HA 3DP4A 2XXHA 1POY1 4QFNA 3CFZA 1RYOA 5AA2B 2XD3A 4RXLA 1YCJA 3C34A 4EXKA 4ZEIA 3TYHA 1B2HA 3CSBA 2NWJA 3CSGA 4X9TA 1PBPA 2Y7IA 3GBAA 4EXLA 1MQDA 3FVOA 4H65A 3M8UA 4ZEDA 3SEYA 5CMCA 3IAZA 1SBPA 4RY1A 2A5TB 3TTRA 1MDQA 1JEUA 2FA7A 3AXFA 4M1VA 4YZZA 1DSNA 2RCAA 4H8JA 4I8CA 1D9YA 1Y3PA 1S50A 3UIFA 1MY3A 2F5XA 5DEXB 3G3GA 3SDFA 4EQ7A 1NMUA 4GF8A 4E0XA 1N7WA 4XKPA 4UA8A 1HSJA 1PDAA 4QF9A 4G68C 3R6UA 2HZLA 1P1WA 3G3KA 5I57B 3VV5A 5L8DA 3V83A 2I4CA 4XKNA 4Z0IA 3T93B 4GVOA 1LBCA 4OQOA 4QSEA 1PC3A 1NNTA 4P0IA 1S7YA 4R9GA 3C36A 1MY0A 1MH3A 4XIGQ 4F1VA 5DVJA 3VLVA 3ILUB 2THIA 1LAHE 4YKJA 3EN3A 4TOZA 3LSLA 2GHAA 2NUVA 5HPQA 3UA8A 4O3AA 5ITOA 3OMBA 3FVNA 3HCQA 1LCFA 2XXRA 3QAXA 2WKYA 1OIBA 2ONSA 4F3GA 3TTLA 1MPBA 1JW4A 1M5CA 4KI0E 1IXGA 3PMXA 3FASA 4YU0A 4DDDA 5I2KA 3HO7A 4GXAA 1WVJA 4KPTA 4LUBA 4O3BA 1URSA 3U93A 3MQ9A 1OVTA 1SQYA 1B51A 1NH7A 3RUMA 2V93A 3K0VA 2F6PA 2GH9A 3KJ7A 3PMWA 1SW1A 2Y84A 1NNFA 2XXWA 4ZEKA 3H4ZA 2R71A 4NF8B 3TPAA 4QHQA 3IR1A 1ZTYA 4Z7EA 1NKXA 2ZNUA 3PPQA 4RK2A 4LQ5A 3TQLA 4BDRA 4FEDA 4MFIA 4FECA 1SW4A 4QFOA 1QKAA 4OXVA 2QS4A 4G68B 1ANFA 3K2DA 1ZBMA 4HW8A 2DE2A 1N0TA 2PX1A 5H8QB 2HCAA 4NF5B 2O51A 4C1UA 1B58A 4QFPA 4OYVA 1UIUA 5HBCA 1SW2A 5EYFA 1WDNA 3TUSA 1POTA 5CI5A 1P99A 1UTHA 4KQPA 3T9HB 3IOUA 2CZLA 2I3WA 3S4UA 2Q2AA 4OEVA 2Q88A 4OTEA 4R2FA 5CMKA 5IKBA 4YB6A 1XOCA 4PFUA 4P0GA 4JSDA 3EF7A 5A5XA 4R73A 4JWXA 1DPPA 3K6UA 1IXIA 1DTZA 4TLLB 3L6HA 3K6XA 3RN8A 2P1SA 3ONMA 3HSTA 5FHOA 3OELA 2KLFA 1AH5A 3A09A 1VSOA 4JB7A 4GLIA 1NNKA 4PFYA 4LP2B 2QS2A 1H44A 5KDTB 4HTGA 1URDA 3DM0A 4NWDA 4DXUA 1IXCA 2XXIA 5TP9A 4MBPA 4FAJA 1FQAA 3HV1A 3V89B 5HM4B 1QVSA 1MY1A 3K00A 3THIA 1MS7A 3Q28A 2VP1A 2H9BA 3CIJA 4LZ5A 1NH8A 1B4ZA 2H5YA 1SYHA 4WEPA 1I6AA 4OHNA 5FHMA 3JYRA 3RGYA 4NF6B 3G3IA 4OFJA 2I0BA 3PPOA 2VD2A 3MPKA 3O28A 1SI0A 4Q5TA 5I59A 1AOVA 2CMOA 2XXPA 3H6TA 4R72A 4H8IA 2HQ0A 4PETA 3OD7A 3TDJA 1QJMA 3O29A 3PPRA 4BLAA 1H43A 1OMPA 3HHGA 4YKIA 3S9MC 1QKBA 2VGQA 1UTBA 2Y7PA 3H06B 4F39A 3MVXA 2F7BA 4DZ1A 4I62A 2AL5A 2ZYOA 4DE8A 1Q35A 1M5BA 3VXCA 1FTJA 3SKPA 1B0HA 4QSCA 3O6IA 4BDQA 4F19A 3RNNA 3V8XB 3E9XA 3K4UA 5I2NA 2GFEA 3IL1B 2DVZA 4POWA 3PV0E 1N76A 2O1LA 3PD8A 2G29A 2OLBA 4U4SA 1MXWA 1B3FA 2NXOA 2HEUA 1H45A 1LBBA 2ZYKA 3PPPA 1II5A 5H8NB 5ITPA 3IO6A 4MLVA 3M3LA 1LGBC 1R9LA 4DLDA 3CG1A 4F1UA 4KYEA 5JTYA 4LA9A 4ELRA 1Y4CA 3LSWA 4YB5A 4ZEFA 4H67A 3T9UA 4HCWA 3WAFA 3IJOB 4IGTA 5H8HB 1SD3A 4FIMA 5CC2A 5K2XA 4M4GA 2V84A 1N7XA 1TFAA 3VVEA 4AQ4A 2B65A 4JXIA 3G3HA 1NNPA 3RT8A 4AB5A 4G2ZA 3HHFA 1VR5A 4Q0CA 2XX8A 1O63A 4XKQA 2OCUA 2F7CA 5JEIA 5KZTA 2O68A 5L9SA 3IOVA 1EZ9A 1QULA 3MJNA 4F1YA 4N13A 2YPNA 3U92A 1FQEA 4G8MA 2X26A 1B05A 3T66A 2IEEA 5ICTA 1MXYA 1B9JA 4KYDA 2ONRA 4OWDA 4MF3A 3FUZA 5B7DA 3UN6A 2DP8A 4ZEBA 3D4CA 4FJPA 4F2OA 3PGFA 2ALUA 2W7YA 1JW5A 1JNFA 1JVYA 4ONYA 3G3FA 3MVYA 3QK6A 2HAVA 3K02A 4FEBA 1BIYA 3A3UA 2ZNSA 3PU5A 3VDFA 3FZVA 3DELB 4GFRA 2O69A 2V3TA 3MWBA 2ZMBA 1ZJLA 2LAOA 4G8NA 4EDPA 2F6GA 3QXMA 1B0LA 5B70A 3S9NC 3TMGA 1FTLA 2F34A 4EF1A 4PQJA 1I6BA 2A5TA 3CI8A 3UORA 3B6TA 1AMFA 3U8QA 5JK4A 4GD5A 3T9VA 1URGA 1RYXA 2DXYA 5I58A 3TAJA 2OBGA 3PD9A 1MQGA 1ELJA 3PPNA 3B6QA 5DEXA 3O97A 5DVFA 2UXAA 1MH4A 1A99A 4YAHX 1B3LA 3K01A 4QRZA 1N84A 3MW0A 3KG2A 1AIVA 2OWSA 4U2RA 3EQ1A 4F2QA 5I57A 2QJEA 1L5TA 3M3KA 1ZIUA 3RY3A 3Q29A 1B3HA 2HXWA 1TWYA 2XXXA 3TELA 2P2AA 4N6PA 1DMBA 1MXUA 4JSOA 1NFTA 3P7IA 1XVXA 4PE5B 1B5JA 2NVUB 3E3KA 3O66A 4DXCA 4F22A 4OESA 3T9XB 1M5FA 2ABHA 4IGRA 1Z7ME 4OMBA 4I1DA 3Q25A 4C1TA 1FTMA 4E0WA 5H8FB 1GGGA 1N3XA 2F35A 1B40A 1IUDA 5I56B 1M5EA 2H4IA 1MXXA 3LBSA 5TPAB 4BDNA 1ATGA 1S9TA 1B5IA 5AA4B 3WAEA 1Y3QA 2DQVA 3QYTA 4ELQA 2RCBA 2Z22A 1D9VA 1B52A 2QL3A 3UK4A 4RPNA 3K1MA 3M3FA 2QS1A 3IK6B 4F18A 1FTOA 4YICA 1JEVA 2QMWA 1B5HA 2VHAA 3T22A 1OLAA 4X1BA 1IITA 1UTHB 3GLBA 3KFMA 1MRPA 4QFLA 1R9QA 1EU8A 3B7DA 3V5AA 3LR1A 1A54A 3KGCA 2I49A 2DOJA 1TFDA 1LSTA 4NF8A 4U1OA 4H0WA 1EH3A 2R6GE 3TQWA 4KFQA 3BKIB 3H3GA 2XXQA 2DE4A 3U72A 4KD5A 1Y1MA 1MQIA 3MVZA 3OO6A 5CMMA 1LB9A 4G68A 4RJZA 5EHSA 1M5DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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