1MXXA

Crystal titration experiments (ampa co-crystals soaked in 100 um brw)
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Probing the Function, Conformational Plasticity, and Dimer-Dimer Contacts of the GluR2 Ligand-Binding Core: Studies of 5-Substituted Willardiines and GluR2 S1S2 in the Crystal
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
total genus 85
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxxA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxxA01
1MXVA 3K00A 1LBCA 4H1XA 4MF3A 3USDA 3FVOA 5ISUA 3ONMA 3K0VA 4UACA 3RT8A 4U22A 1EZPA 4OEVA 4ELPA 1B58A 4ND9A 5M2VA 1YPNA 2UVGA 1Q35A 4Q8RA 4EDPA 1OQHA 2ONKE 4R9FA 3EHUA 5F1QA 3KBRA 4NF8A 2D21A 2Q9TA 5AE4A 1Y1MA 3TZAA 3OENA 3MWBA 2XD2A 4H5GA 5I58A 5CMKA 1ATGA 1MQHA 5A5XA 2DYXA 1FQAA 4QFNA 2Y7KA 2DWAA 3MW0A 4IY5A 3T93B 2VD2A 3TFLA 3KSJA 4ZS9A 4HS7A 4LUBA 1JETA 1IQ7A 1UTHA 1B4ZA 4GVOA 4JDFA 1N84A 1F9BA 1BP5A 1SYHA 3TTMA 2Z22A 2FYIA 1A8EA 2OBGA 2H25A 1VE4A 2B65A 2RCAA 4ELOA 3CSGA 2O6AA 3LBSA 5AA3A 4U23A 4GLIA 4Z7EA 5IAIA 4OETA 2QSXA 4GD5A 2DP8A 2H4IA 1IXGA 2UYFA 5JTYB 3T22A 1VR5A 2BJJX 3Q28A 3FVGA 5ITOA 1RYOA 1LAFE 4OQOA 2XXYA 5KCJB 3K6VA 4F1YA 1SI1A 4GL0A 2DVZA 4OFLA 3FGSA 1IXIA 2Y7RA 5FTIA 1EZOA 3UP9A 3W9VA 4POXA 1FQBA 3QUFA 1N04A 3IB1A 2Q2AA 1N0TA 4K3FA 3O6HA 5CC2A 2Z8DA 1A99A 4QRZA 4I9DA 5I2KB 1R6ZA 4U21A 3RQTA 4XIGQ 3RT6B 3QXMA 2ANJA 4QFKA 4GXSB 2XXWA 5ICTA 4ZEKA 2PT2A 4R74A 4H8JA 4ELQA 3S9MC 1B3FA 3ILTB 4YKJA 4C1TA 3VLVA 5DYHA 2V3TA 1Z7NE 2D3IA 1UIUA 4C0RA 3AXFA 1LCTA 2XX8A 3GXAA 4FEBA 5H8NB 5I59B 4R6YA 4ZZEA 5EHMA 1IZ1A 3KJTA 3FXUA 3ZKLA 3EPEA 1A55A 4LQ5A 4PFUA 5I2NA 1Y1ZA 1CE2A 4XKNA 3W9WA 2NWJA 1LSTA 2DWIA 3H7MA 4DXCA 1WDNA 2QMWA 1B05A 3VVEA 4H6DA 5EYFA 2OLBA 4G8MA 4BDNA 3TTNA 2NUVA 3HHFA 1MM7A 5B7DA 1I6QA 3KJ7A 4E0XA 4NTLA 3OO8A 1LFGA 1NMUA 2ZXTA 3BFTA 3MP8A 4YU0A 4GIZA 3S9EA 4NWCA 4OFJA 4P0GA 1H3DA 3OD7A 3PPNA 2Q88A 4F2QA 4FE8A 3WAEA 5DEXA 2RC9A 1XVYA 4F3PA 1H43A 3W15C 4NF4A 1USYH 4GOTA 2AIXA 4NF6A 2E1SA 3EN3A 4QF9A 2QJEA 2VHAA 3UA8A 4EXLA 3KZGA 4G68B 2I0BA 1VSOA 2OK2A 1RKMA 1GTKA 3M8UA 4IO7A 1EH3A 3H6TA 2Z23A 4EQBA 3N5LA 4R75A 1B3LA 2HZKA 3TKDA 4FAJA 2PX1A 4GXAA 2HCAA 1SQYA 1UIVA 2F5XA 4NE4A 4OYVA 1EZ9A 2O68A 1LBBA 3RTFB 5CMMA 2XXHA 1FTJA 3CIJA 3P7IA 4R72A 1SW4A 1PEBA 3A09A 1SW5A 3CG3A 3E4RA 4R6HA 2HAVA 3OMBA 4OENA 1B5JA 2QS4A 3MBPA 3CFZA 4IGRA 1P1QA 4O3AA 2GH9A 2V25A 5HM4B 3OOAA 1OLAA 5TP9B 3IOTA 4XXUA 1MH3A 2Z8FA 4FEDA 4IO2A 2XXXA 5HBCA 4OHNA 3C9HA 4PFYA 1MXUA 4OESA 3MPLA 3N6TA 4BDOA 3PGFA 5H8HA 4YMAA 4X1BA 1OLCA 1S7YA 3IOWA 3TDJA 4PP0A 5CM6A 1JW1A 3IO6A 5TPAB 2B3FA 3CRBA 3V89B 4MFIA 2RCBA 4YKKA 2NXOA 2DE4A 1NNKA 1I6AA 2RF1A 2QPQA 3PV0E 5F7VA 3MZBA 3F11A 3UK4A 2ZYKA 3FXQA 2O7UA 3K6UA 1SW2A 5L9OA 2VGQA 1URSA 2X7QA 2VD3A 3SESA 2RC8A 3D4CA 3TYHA 3PD9A 2Y84A 2DXYA 3SEYA 5KZTA 4G2ZA 3PUWE 1SBPA 4FORA 5FHMA 1S9TA 2OWTA 4R73A 3K01A 1BKAA 3VLWA 4O3BA 3SERA 1TXFA 2KLFA 1MXZA 2A5TB 2F7CA 2ALUA 1QUJA 1B5HA 2XHDA 1QUKA 1LFIA 3H6UA 4F3SA 3QSLA 3D4GA 2G93A 2Y7WA 4P11A 2OJTA 5JTYA 2E0SA 4LVQA 3FV1A 3K4UA 1H44A 4BDLA 3VLUA 1MY0A 1IXCA 1NKXA 5JEIA 2XX7A 2ZMBA 5KCJA 3E3KA 3FUZA 3MC2A 3VV5A 1MY4A 1O63A 1XC1A 3ODBA 1KWHA 2O84X 2NVUB 3K02A 3THIA 1MQJA 3GLBA 3KN7A 4IO6A 4DZ1A 4GFRA 1R9QA 3HCQA 2PMSA 5I2KA 3OELA 4RNSA 3M3LA 3L6GA 3O29A 1QJMA 3KOSA 3DLNA 1MPCA 3T9UA 4KYDA 5AA2A 2DVCA 4RYAA 5H8HB 4LZ5A 2ZNUA 1JEUA 4H8IA 4KI0E 3GBAA 5H8NA 4XKRA 5I59A 2V3QA 4NEDA 3GZGA 1P1NA 2AYSA 1SDXA 3IO4A 3TCHA 4OTEA 2I0CA 2GHAA 3Q29A 2YPNA 3BKIB 1MDQA 3DP4A 5CRYA 4ZZAA 1H45A 3DP8A 1B40A 4GWOA 4H67A 2THIA 3TAJA 3OO6A 1XT8A 2OCUA 3TPAA 3IR1A 3TQWA 3IX1A 4DIGA 4R6KA 1AMFA 4JWXA 5LOMA 1JNFA 4F1VA 2XD3A 3MPKA 5ELVA 3CFXA 1GR2A 2HAUA 2D5WA 3KG2A 1MRPA 1MDP1 4EXKA 4JXIA 4IB2A 1XOCA 3OSRA 4I1DA 3SEVA 5IKBA 4HW8A 3U72A 2CZLA 3VVFA 1MM6A 2OZZA 1LAGE 1Y3PA 2DXRA 3EF7A 3Q25A 2X7PA 4FIMA 5FTHA 1A7LA 3K2DA 3C34A 4FECA 3B7DA 1IUDA 3K6WA 3I6VA 2PBWA 2UYEA 4KYSA 1T0KA 1B0HA 3V83A 4G68A 2O7IA 2WKYA 2Y7PA 3MVZA 1D9VA 4TOZA 2LAOA 3KN3A 3ECRA 3FASA 1ZKBA 4NF5B 3RY3A 3IORA 2I58A 3CR9A 1M5BA 1IEJA 3MUQA 2AL4A 3LR1A 4YKIA 3TTLA 3G3IA 1LGBC 3PMWA 2ZYNA 3MP1A 3IAZA 3I5OA 3K1NA 4YMBA 2UXAA 4LP2B 4KCDA 3O66A 5DVJA 5CBRA 3PUZE 3U1OA 5AA2B 4AQ4A 4I8CA 1TWYA 4Q0CA 4EQ9A 4ZEFA 4R9GA 1Q1KA 4OFOA 3U92A 1DSNA 3C4MA 4XTCQ 4JSDA 3TMGA 3O2AA 4LA9A 2OWSA 5TP9A 4WEPA 4ESWA 3ZKKA 3FZVA 3ZS6A 1EU8A 1SD3A 1QKBA 3PMVA 4AB5A 2P0SA 4KFQA 2DSFA 1SYIA 5ICQA 4N07A 3VE1B 4M4GA 1OQGA 2F6GA 5TPAA 2ONSA 3IOUA 5CI5A 4AB6A 2O1LA 3QK6A 1MQGA 1LAHE 1GGGA 5H8SA 4RK2A 4DXUA 1P1WA 3T9VA 3T9XB 3S2VA 2F8DA 4H65A 1B9JA 3H4ZA 3MVXA 4Q5TA 1PDAA 2I48A 1NH7A 4OEUA 3B6TA 4QFOA 2ESNA 4X9TA 3R7XA 3VXCA 5L8DA 1II5A 4KQPA 1JVXA 5L9MA 1DMBA 4IY6A 1L5TA 4RJZA 2A5TA 2XXRA 3KEIA 1UTBA 3KFMA 1AL3A 1FQDA 2F7AA 5CBSA 4F22A 2AL5A 3OO7A 3HPIA 1B7HA 4F31B 4F3GA 1A54A 3FJ7A 2DE3A 1MH4A 4R2BA 4U1OA 1QKAA 3FVNA 1SI0A 1Y4TA 1S50A 2X26A 4YZZA 2PYYA 3QUJA 3PPQA 3PPRA 1JEVA 3MAMA 2F36A 4NWDA 1B7ZA 2I4BA 2V3UA 4ECFA 3IOVA 2O51A 3ILUB 4JBZA 4QSDA 3G7WA 1NNTA 3VFJA 3U93A 3C33A 4LQ2A 5FHOA 4G68C 2DQVA 2ZYOA 5L9SA 4RPNA 3E13X 4QHQA 5J1DA 4ZEDA 3T96B 4O3CA 3K1PA 4EUOA 1LAXA 1B32A 2ZYMA 3VXBA 1D4NA 1N3WA 5I56A 3G3JA 3SETA 1B52A 4JB7A 1POTA 2P1SA 3SDFA 3G3GA 3IK6B 4KYEA 4G8NA 4I62A 1FTOA 1USYE 2F34A 3R6UA 3MJNA 3IB0A 3N26A 1BTJA 5DT6A 1A8FA 3OO9A 1B46A 3PUYE 2REGA 3JYRA 1B51A 3DP6A 4G8HA 1MG1A 3K1MA 4L17A 2FNCA 1WVJA 4X48A 4XKPA 4F3BA 1VFDA 2I3WA 4DLDA 3IJOB 3C31A 3IB2A 1B4HA 3CG1A 4YKPA 1UTBB 4R2FA 3EQ1A 4IO3A 1GVCA 3HHGA 1MXYA 3Q27A 1FTMA 1P1UA 3LSFB 2DWHA 3GBBA 3KN8A 2DWJA 1LB8A 3SEWA 1B3HA 5H8FA 4OMBA 4LATA 3CI8A 3FIRA 3PMXA 3FD3A 4HCWA 4KR5A 4YAHX 4FJPA 3FJMA 3VVDA 1SW1A 1M5FA 1MY3A 1MPBA 3PPPA 1MXWA 4ZEIA 3EHTA 4PFTA 4PETA 2NOOA 4IO4A 1FQCA 1DPPA 1D9YA 4NF5A 4PFWA 2HFBA 1PB8A 4JSOA 2QS1A 1JVYA 1O64A 1B1XA 2RINA 3R26A 1QW0A 1OIBA 3C32A 4POWA 1LCFA 4LZ8A 3MVYA 1MQIA 4ESXA 3UN6A 1DOTA 2GHBA 3O9PA 4DCYA 4C1UA 2IEEA 3LSXA 3KGCA 1IIWA 2PT1A 3TCGA 1NFTA 4MLQA 1FTLA 5K2YA 5BWJA 3A3UA 5I56B 1SVXB 2YJPA 3PUXE 4H5FA 2H9BA 1TFDA 4TLMB 5CMCA 3A3CA 2QL3A 1B3GA 3V5AA 4F18A 2Q8JA 4MBPA 2XXIA 2HXWA 4RY1A 3ZSFA 4Z0IA 3H6WA 4ZE8A 2R6GE 3SEXA 4KPTA 1JW4A 3MP6A 3CSBA 3HV1A 1ANFA 4BDMA 2Q2CA 2QRYA 3LSLA 1B1HA 2A5SA 1PBPA 4GRKA 4OWDA 1Y4CA 1D3KA 5AA4B 3U94A 3RPWA 1YCJA 2XXVA 4ISUA 1R9LA 4M1VA 3UORA 4U4SA 1US5A 1POY1 4RA1A 4DE8A 3O28A 2H99A 4BDRA 2R9JA 3I3VA 1PB7A 2YLNA 1MY2A 3DM0A 3PUVE 1Y20A 2F7BA 3HN0A 5DTBA 4LZ7A 2XXUA 4N6PA 3SEUA 1Y3NA 5H8FB 4MLVA 4XKQA 3H6VA 3TTKA 3BBRA 5AA2D 3E9XA 1B5IA 1HSEA 1FQEA 3FJGA 1MXXA 1UQWA 3B6WA 4Q30B 2Z8EA 3BFUA 3V8XB 4YB5A 3MQ9A 3VDFA 2F97A 1B6HA 2ABHA 3FVKA 2H98A 3SKPA 2UVHA 1XVXA 1FTKA 1H76A 4N13A 2VOZA 4E0WA 3LSWA 4PE5B 4THIA 4U4XA 2F6PA 1ZMGA 2W7YA 3M3KA 2PVUA 4U1ZA 5BUUA 5DVIA 3G3HA 5KDTB 2ZNTA 1US4A 2G29A 1ZIUA 3H03A 3U8QA 4YB6A 4RXLA 3MVWA 4NMYA 3MZ9A 2REJA 3WAFA 2V93A 3RGYA 3RN8A 3QAXA 4WXJA 3TEPA 2GFEA 2HQ0A 5H8QA 3HO7A 5I57A 4HCYA 4QSCA 1M5DA 3N94A 3RNNA 3UGWA 1O7TA 4ZE9A 1NNFA 4NF8B 3EHSA 1URDA 1XHYA 3OXNA 4KCCA 1B0LA 2V84A 2HEUA 5I84A 4IO5A 3FXRA 4QSEA 4MH5A 1N7WA 3QIMA 3H3GA 4EF1A 4F29A 5I58B 1AIVA 1CB6A 3PPOA 1M5EA 2R71A 2FA7A 5A5XB 1ZBMA 1ZU0A 2CMOA 1PB9A 4P0IA 4PQJA 3M3FA 4ONYA 2XXTA 2IA4A 4RK9A 4X1DA 1OVTA 4TQUQ 2UVJA 2DOJA 5JK4A 3PD8A 3FV2A 4GF8A 1YAEA 1LLSA 1UTHB 2RC7A 1DPEA 4QFLA 2DS9A 3DELB 3T9HB 4UA8A 1MY1A 2DE2A 1P99A 1GV8A 4OXVA 3RTWB 4ZDMA 1ZTYA 3FATA 1VFEA 1IXHA 4OVJA 4GQOA 1OVBA 2Y7IA 2M8CA 2XX9A 3S9LC 1AOVA 1ELJA 4G77A 3G3KA 5CMBA 1MPDA 2XXPA 4DXBA 1B2HA 3TODA 4EQ7A 1DTGA 1QUIA 3TTRA 4JWOA 1TT1A 5B70A 3RLFE 2GRVA 2H5YA 5DVFA 1JW5A 5EHSA 3TELA 1MS7A 1Y3QA 5ITPA 3C35A 2I3VA 3O6IA 1NL5A 4BLAA 3MZ1A 4RPOA 2Q89A 5AA1A 3K6XA 4YB7A 1I69A 5HPQA 2I6EA 3UIFA 5H8QB 5I57B 3JV9A 2QS2A 1M5CA 1ZLQA 4DCXA 2ONRA 1A40A 1ZJLA 1AH5A 3S9NC 5I2NB 1Y9UA 3L6HA 5TU0A 4QFPA 1PC3A 1B7UA 1N7XA 4H0WA 1XS5A 3N6UA 4WKMA 3KSXA 1FQFA 3LC8A 4WEDA 3OEMA 2O69A 4F19A 2I4CA 2P2AA 2F35A 4YICA 4HTGA 4F2OA 1HSJA 3LUYA 4EF2A 2RKMA 4TLLB 4FATA 5AA4A 2UVIA 3IL1B 4OERA 1FCKA 1FW0A 1URGA 1WODA 2HZLA 4KD5A 1J1NA 1IITA 1OMPA 5DEXB 2QS3A 3H06B 4GL8A 1Z7ME 3QYTA 4NF4B 3TQLA 4NF6B 1QULA 2VP1A 4ZECA 3C36A 3B6QA 1PBQA 4IGTA 3HSTA 1LB9A 4U2RA 4KHZE 3T66A 2B3BA 2F78A 1TFAA 1NNPA 3PU5A 1JQFA 4JWYA 4DDDA 3O6GA 3OEKA 5FHNA 1RYXA 3CFLA 4G4PA 1N3XA 2I49A 3JZJA 1BLFA 3Q26A 3TUSA 5K2XA 4ZEBA 1BIYA 3IJXB 3S4UA 3OSQA 1P1OA 3G3FA 1YTVA 1LFHA 1NH8A 2QMXA 3CVGA 3KOTA 3TCFA 1N76A 4F1UA 1DTZA 1HSLA 1MQDA 3O97A 4ELRA 4F39A 3RUMA 5KDTA 2ZNSA 4LONB 1B3EA 2O1MA 1R1NA 1I6BA 4OZ9A 2XXQA 4BDQA 1QVSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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