1MXXA

Crystal titration experiments (ampa co-crystals soaked in 100 um brw)
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
publication title Probing the Function, Conformational Plasticity, and Dimer-Dimer Contacts of the GluR2 Ligand-Binding Core: Studies of 5-Substituted Willardiines and GluR2 S1S2 in the Crystal
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 85
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxxA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxxA01
3WAFA 1A55A 1MM7A 5ISUA 4HTGA 4G8NA 3RLFE 5I57A 2HZKA 1N3XA 1B46A 4YKIA 4IO7A 1A54A 5AA4A 3JZJA 4EQ7A 3FGSA 5ITPA 1YCJA 1T0KA 3C33A 1B3EA 1UIUA 4LUBA 1GGGA 4IO3A 1XHYA 4U4XA 4MLQA 2HQ0A 2R6GE 2DWHA 3TEPA 3UGWA 1PB8A 3H6TA 3PUVE 1H45A 3R7XA 2YPNA 3CIJA 4FATA 1LFHA 1MXVA 2AIXA 3IJOB 4HCYA 2Y7KA 4YKKA 3TTMA 1OQGA 3G3JA 4GIZA 1GVCA 1AIVA 1CE2A 4ZEKA 5DVFA 3IO6A 1QUIA 2F6PA 1M5DA 1LB8A 3G3IA 5L9OA 2X26A 4YICA 1XC1A 3QAXA 4NWCA 2F7AA 2E0SA 3QYTA 5LOMA 3HHGA 3IB1A 1FQEA 2ABHA 1BIYA 1ZTYA 5JEIA 4FEBA 4NEDA 2H99A 3PPRA 1QUJA 3MJNA 3EHTA 4OESA 1OVTA 2DOJA 2HAUA 5DT6A 4FECA 4JXIA 4HW8A 4QF9A 2CZLA 4DDDA 3MAMA 1LCTA 3M3FA 3JYRA 3TQLA 1JEUA 2UVIA 4GOTA 3ECRA 2XXIA 2DXRA 3LR1A 4BDNA 1LAFE 3EF7A 1SW2A 4F1YA 1USYH 4P11A 3O2AA 3F11A 2VP1A 2VGQA 3IAZA 4RJZA 1F9BA 1MY1A 4QRZA 2RC9A 3S9MC 3TTRA 1NNTA 4PQJA 4DZ1A 4BLAA 3MP1A 1R1NA 1MH4A 5I59B 4XTCQ 5AE4A 3FXUA 5B70A 1Y4TA 2Q2CA 4F3GA 3L6HA 2HAVA 4KD5A 1H76A 2Y7PA 1SQYA 5H8HB 2V84A 2QMWA 1ANFA 4WKMA 1SI0A 4NF5B 5DEXB 3L6GA 4GQOA 1FTKA 2PYYA 4TOZA 3MW0A 1KWHA 3OENA 4ONYA 4ZZEA 4N6PA 2F6GA 2RF1A 1JW1A 4O3AA 3V5AA 3ONMA 2ONRA 3PV0E 4R75A 2Z8FA 5H8NA 4POWA 2XXQA 1Q1KA 3KSJA 1WDNA 3FXRA 3KJTA 3MZ1A 4AB5A 1R6ZA 3OXNA 3PPPA 5CMBA 2GHAA 3MP8A 4OWDA 2RC8A 2RINA 1USYE 4ISUA 4G8HA 5CM6A 4ZE9A 3A3CA 5M2VA 1POY1 3DP4A 4LQ5A 2F97A 1P1WA 3H6WA 4DXUA 3FZVA 3TODA 3A09A 4X48A 1B9JA 4OFLA 1BTJA 4NF6A 2GHBA 4PP0A 3C4MA 4GVOA 1URSA 1N3WA 2R9JA 4OXVA 1HSJA 5ITOA 2UXAA 3RNNA 3K6UA 2O69A 4YB7A 1QKAA 3O6IA 1PB9A 4GL8A 5B7DA 3V8XB 1FQCA 4TLMB 3TQWA 2P0SA 3BFTA 4WEDA 5I57B 2HFBA 3PUWE 2XXVA 5J1DA 5AA4B 3IOVA 1OQHA 3CFLA 4O3BA 1Y4CA 4P0IA 4PFYA 2V3TA 1LSTA 1JW4A 1Y1MA 2ZXTA 3Q27A 3KZGA 5AA3A 2ZYNA 3DP8A 4DLDA 4F1VA 2QSXA 1DTZA 3FJMA 1LAHE 3PPQA 4DIGA 3VFJA 4EDPA 3D4GA 4FAJA 2O7IA 4QSCA 4G68C 2P1SA 4F22A 1SDXA 4X1BA 2DVCA 3MVWA 2HEUA 4L17A 4XKNA 2ZNSA 1XS5A 3O66A 3TCGA 4WXJA 1JQFA 3V83A 2ESNA 4FJPA 4POXA 3K6VA 4YZZA 2XXYA 3DLNA 3CSBA 2R71A 1B3FA 2OWTA 4QSEA 3PUXE 1O7TA 4GL0A 1QJMA 4KHZE 5H8HA 3PU5A 2RKMA 5FTHA 3CFXA 4KFQA 3UIFA 1I69A 5DEXA 4C1TA 1IQ7A 3IOTA 1ZMGA 4F19A 4H0WA 1URDA 4BDLA 3KOTA 1WODA 3LSFB 2GH9A 1VR5A 4AQ4A 5DVJA 1B7HA 3CI8A 1GV8A 4GD5A 3GBBA 3BBRA 3VVEA 1ATGA 1GTKA 1AOVA 1TT1A 4H5FA 1P1NA 3R26A 4LVQA 1TXFA 3B6WA 1QVSA 2AL4A 3N6UA 1GR2A 5TU0A 3TKDA 3B7DA 4TLLB 4QSDA 5KZTA 4PFUA 4YKJA 1B1XA 4R9GA 4H5GA 3T22A 1MM6A 2PT1A 1B3HA 2CMOA 3FIRA 1YPNA 2UVJA 1B7UA 3U93A 1MXYA 5FTIA 4F2OA 1D9VA 1VFEA 3TTNA 3TPAA 4IO5A 5BWJA 2QMXA 2QS4A 4IGTA 1DOTA 4LZ5A 3MVYA 1N84A 3RGYA 1JVYA 2IA4A 1IXHA 4JBZA 1CB6A 1P1QA 2V3QA 4X1DA 4BDRA 3TYHA 3D4CA 4P0GA 2NVUB 3TTLA 1IITA 3OO8A 1BKAA 1O63A 2ZNTA 5AA2D 1Z7ME 3IX1A 3HHFA 2A5SA 4RYAA 1J1NA 2PVUA 3M3KA 2I58A 1SW5A 3CFZA 3GXAA 3MQ9A 4KYDA 2AL5A 4LP2B 3RN8A 1NH8A 3DELB 2Y7IA 3RTWB 2YLNA 1IIWA 4OVJA 3RT6B 3SEXA 4UACA 5H8NB 3OO9A 5AA1A 4MF3A 4JB7A 2G29A 3TDJA 5JTYB 2UVGA 4EUOA 5K2XA 1N04A 4JSOA 5BUUA 3MWBA 3LSWA 2F35A 3H6UA 4HCWA 1B0HA 2I0CA 3ZS6A 2ONSA 3DM0A 4OETA 1Y9UA 3TMGA 3KEIA 3CRBA 3MPLA 3HV1A 5AA2A 1Y3QA 1LCFA 3MUQA 4EF1A 2ZNUA 1NH7A 2G93A 4JWYA 4NF6B 1EZOA 5L8DA 4U1ZA 3FV2A 4FORA 4ZZAA 5FHOA 4EQBA 4U4SA 4G8MA 1MY4A 4E0WA 3H4ZA 3TAJA 4DCYA 4H65A 1QUKA 4XXUA 3DP6A 4PETA 2E1SA 1BLFA 1HSEA 2H9BA 1MQGA 1LBCA 3LC8A 2OJTA 5F7VA 5L9SA 2Z22A 3PD9A 2OBGA 5HBCA 4EXLA 3C36A 4JDFA 1R9LA 2UVHA 2XHDA 2QJEA 3UN6A 3GBAA 4ZEIA 3Q28A 1I6QA 2QRYA 2F8DA 3FVKA 1ZIUA 4FIMA 4H6DA 4QFNA 4JWXA 4ELPA 5CRYA 2Y7RA 2DS9A 1IZ1A 5DTBA 3UK4A 1FTJA 2XX7A 3OD7A 3CVGA 3LSLA 4QFLA 3HPIA 3RUMA 1A7LA 1XVXA 1RKMA 2QL3A 4O3CA 5FHMA 3MC2A 1SYHA 4KR5A 3TCHA 3PPOA 3K02A 2ONKE 3KOSA 4XKRA 3WAEA 1TFDA 3IO4A 1SD3A 1OLAA 2FYIA 2O6AA 4F3SA 3S9LC 1S50A 3U94A 4OHNA 2IEEA 1LFGA 3FASA 3W9WA 3OO6A 1N0TA 4JWOA 3KG2A 4RY1A 1DTGA 4I9DA 1FQFA 1US5A 2O1MA 3QIMA 2PX1A 2DE4A 2Y7WA 5CI5A 4ZEDA 3K01A 3RQTA 3KN3A 5TPAA 2HXWA 2HZLA 1FQBA 1N76A 4BDOA 4EXKA 4IY5A 4NF4B 5CMKA 5CMCA 4I62A 1LGBC 5JTYA 3U8QA 3R6UA 4KQPA 2YJPA 1B0LA 2Q88A 4IO6A 1LLSA 4KPTA 1MPDA 2REJA 1Y3NA 1B5IA 5I84A 4F3BA 2A5TB 3M8UA 1PDAA 1PC3A 2QS2A 5EHMA 3H06B 1B3GA 1UTHA 4K3FA 1FTMA 3ZKLA 1PB7A 1OIBA 1P99A 3M3LA 3K2DA 4ECFA 3ODBA 3FJ7A 2OZZA 1I6BA 1R9QA 4IY6A 4ZE8A 3KN8A 1NNFA 1ZKBA 2B3BA 1LAGE 1B7ZA 3IB2A 1P1OA 2DSFA 1MY2A 3T96B 3HCQA 2UYEA 3PD8A 3I6VA 5EHSA 5I56A 3SEWA 4DXCA 3H03A 3H3GA 3CG1A 4QHQA 3JV9A 3IJXB 5HM4B 4U21A 4BDQA 3CR9A 3TTKA 3B6TA 4QFOA 3E13X 2FNCA 2PMSA 2ALUA 4LONB 1MQDA 3B6QA 4HS7A 4PFTA 1SYIA 2THIA 2Z23A 2XXWA 3G3FA 1DMBA 1FW0A 2Q89A 5H8QB 3IORA 1MDQA 4UA8A 2M8CA 1JEVA 4F1UA 4U2RA 1SW1A 5KDTA 3VLUA 2RCAA 4FE8A 3USDA 3SDFA 4WEPA 2ZYKA 1MRPA 3C34A 3E4RA 1US4A 3ILUB 1DPEA 1MY0A 4H67A 2XXUA 3G3GA 3QXMA 4E0XA 1B5HA 4GLIA 4R72A 4XKQA 2QS1A 2V3UA 3LSXA 5AA2B 1PBPA 1MXWA 3HO7A 4R2BA 2XX9A 1DPPA 4U22A 3K1MA 4R6HA 4DXBA 1TWYA 4RPOA 3OSQA 1UIVA 2RCBA 4DE8A 2P2AA 3RPWA 5CBRA 5L9MA 4LZ8A 1UQWA 3KSXA 3TELA 1XT8A 1IXGA 3FVOA 1PBQA 3O28A 3SKPA 4GF8A 2GRVA 1M5FA 1PEBA 1B5JA 1H44A 4I1DA 4NF4A 5K2YA 2I4BA 1MQHA 4IO2A 5IAIA 2O51A 3IOUA 1FQDA 3GZGA 3N5LA 2DVZA 2A5TA 3EPEA 3QUJA 4IO4A 2VD3A 3K0VA 5A5XA 4Z0IA 2REGA 4G2ZA 1FTOA 1IUDA 4NF8A 1LB9A 3BFUA 2WKYA 3V89B 3PGFA 3TZAA 3VV5A 4ZECA 4H8IA 4X9TA 3VLVA 2Q8JA 1B4ZA 4ZS9A 3K1PA 1JETA 2FA7A 5CBSA 3K1NA 3G3HA 2XD2A 3PUZE 3EHUA 3MZBA 3ILTB 5IKBA 2BJJX 4EQ9A 1MS7A 4LZ7A 1D9YA 5ELVA 2Q9TA 3T9VA 3MBPA 2ZMBA 4PE5B 4R73A 5ICQA 1UTBA 3U1OA 2PT2A 5H8QA 3SETA 4F39A 3S9EA 3KBRA 3MPKA 4YU0A 2Z8EA 5TPAB 1M5EA 2DXYA 2DWIA 4OYVA 1MG1A 2QS3A 1MY3A 2I48A 3K6WA 4YMAA 3K6XA 3VLWA 4R74A 5DYHA 3PPNA 1MDP1 1Q35A 2VHAA 3AXFA 3PMWA 2OCUA 3TCFA 1FCKA 2PBWA 1B51A 3IR1A 1A8FA 2B3FA 4OFJA 2I3WA 1UTHB 2AYSA 1D3KA 2NUVA 3MVXA 4MLVA 1N7XA 5I2KA 3MP6A 5I58A 2OWSA 1OVBA 5TP9A 2O84X 4RPNA 2V93A 1B1HA 3MVZA 1OMPA 1B32A 4THIA 1A99A 1LBBA 1IXCA 2DE3A 1QW0A 3Q25A 1ELJA 2DP8A 3SERA 1NNPA 5I2NA 4G68B 1B58A 1P1UA 2NOOA 5I56B 2NXOA 4OTEA 3MZ9A 3K00A 4QFPA 3FUZA 5KCJA 2I6EA 4Q0CA 3SEYA 2XXRA 4AB6A 3VVFA 1MH3A 4KI0E 1ZJLA 1TFAA 1DSNA 4ZEFA 2X7PA 4ELOA 3QK6A 1LAXA 4MH5A 4RNSA 3TUSA 3C35A 5KDTB 1VSOA 4OENA 3FJGA 3OOAA 3BKIB 3C31A 3EQ1A 1Z7NE 2Q2AA 3VDFA 1POTA 4JSDA 5F1QA 4ELRA 4ZDMA 4QFKA 4BDMA 2F7CA 3OEMA 1NL5A 3H7MA 4NTLA 3G7WA 4GWOA 4OEUA 4OFOA 4GFRA 2XXXA 1XVYA 4YB5A 1YTVA 2VD2A 3C9HA 3OO7A 1NKXA 4H1XA 3W9VA 1EH3A 4MFIA 4XIGQ 3FATA 5CMMA 1D4NA 4F2QA 3SEVA 3T9XB 1RYOA 2I0BA 4Q8RA 2ANJA 1AMFA 3ZSFA 4IGRA 1YAEA 4MBPA 1B3LA 1H3DA 1XOCA 1MXXA 4PFWA 4ND9A 2VOZA 3FXQA 1B05A 3HSTA 4C1UA 1URGA 1N7WA 1SI1A 3OMBA 1H43A 3OSRA 3FD3A 4RK9A 5ICTA 2NWJA 3P7IA 3G3KA 3TFLA 4XKPA 3E9XA 1NNKA 5H8FB 3T93B 1EZ9A 1FQAA 3C32A 3O29A 3N26A 3VXCA 3PMVA 1M5CA 4OEVA 5A5XB 3O9PA 2H25A 2KLFA 2F5XA 2F36A 2W7YA 2XD3A 4R9FA 4IB2A 3W15C 3O97A 4NF8B 2DQVA 2X7QA 3Q29A 4LA9A 3KFMA 3N94A 3QUFA 4NMYA 3T9HB 2H98A 3H6VA 4H8JA 5H8SA 1QULA 2Y84A 4G68A 5DVIA 4F31B 3O6GA 4OQOA 4EF2A 2XXTA 3RTFB 1MXZA 3THIA 1IEJA 1WVJA 4F29A 1BP5A 1RYXA 3S4UA 4RA1A 1UTBB 2D5WA 3FV1A 4FEDA 1ZLQA 4YMBA 3EN3A 1ZBMA 4Z7EA 1IXIA 3RY3A 3A3UA 4R6YA 2D21A 4G77A 2ZYMA 3ZKKA 2I3VA 2O1LA 1SBPA 4G4PA 1SW4A 1Y1ZA 1JNFA 3IB0A 3I5OA 3E3KA 4OZ9A 4U23A 2DWAA 2F7BA 3LUYA 4U1OA 4M4GA 3Q26A 4KCDA 3O6HA 2GFEA 5JK4A 1JVXA 1I6AA 3I3VA 3FVNA 2XXPA 3SEUA 1MQJA 1FTLA 5I2KB 5I58B 1M5BA 3GLBA 5TP9B 2H5YA 4NWDA 3S2VA 1EU8A 4GXAA 3U92A 1HSLA 3PUYE 3UP9A 3N6TA 3KGCA 2OLBA 2O68A 4Q30B 5I59A 3UORA 1VFDA 4YB6A 1L5TA 4F3PA 5I2NB 2H4IA 1LFIA 2Z8DA 1SVXB 2O7UA 4LATA 1AH5A 2OK2A 2LAOA 3RT8A 1NMUA 5KCJB 3VXBA 1B6HA 4NF5A 1MXUA 1AL3A 1JW5A 4ESWA 4I8CA 3CSGA 2V25A 4C0RA 2ZYOA 3U72A 4DCXA 4R6KA 2DWJA 2I4CA 4RXLA 4ESXA 3VE1B 4OERA 3VVDA 3PMXA 4KCCA 2RC7A 4N13A 2XXHA 1B4HA 1NFTA 4RK2A 3T9UA 3KJ7A 3OELA 2DYXA 4GXSB 5H8FA 4LQ2A 1QKBA 2F34A 4KYSA 3OEKA 1B52A 4YAHX 4F18A 1EZPA 4KYEA 3HN0A 1O64A 4M1VA 4ZEBA 5HPQA 2QPQA 5FHNA 4YKPA 1MQIA 3KN7A 1B40A 3IK6B 4Q5TA 1A8EA 4OMBA 1A40A 4NE4A 3IL1B 2UYFA 3S9NC 3T66A 2F78A 2D3IA 1VE4A 4N07A 3UA8A 3K4UA 2XX8A 3IOWA 4R2FA 3CG3A 2B65A 1II5A 3EHSA 1MPBA 1S9TA 4GRKA 5EYFA 2HCAA 1B2HA 3SESA 3QSLA 3LBSA 3FVGA 4TQUQ 1S7YA 2DE2A 2I49A 1Y3PA 1ZU0A 1MPCA 4ELQA 1Y20A 5CC2A 1OLCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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