1MXVA

Crystal titration experiments (ampa co-crystals soaked in 10 mm brw)
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Probing the Function, Conformational Plasticity, and Dimer-Dimer Contacts of the GluR2 Ligand-Binding Core: Studies of 5-Substituted Willardiines and GluR2 S1S2 in the Crystal
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
total genus 84
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxvA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxvA01
2HZLA 2B65A 2ONKE 3TZAA 1US5A 1M5DA 1YTVA 1B52A 1URSA 2XXUA 2REJA 3FJMA 2GH9A 5HBCA 5L9SA 4TQUQ 3DELB 3QUJA 3N6TA 1FQEA 4KFQA 1B9JA 1FTJA 4Q0CA 4P0IA 4BDRA 4FAJA 3V83A 4IY5A 2GRVA 1B3HA 1B46A 2M8CA 1A8FA 4EQ9A 1FQBA 3K2DA 4U1ZA 3S9EA 2F6PA 1NFTA 1P1OA 3HHGA 4OETA 1EZPA 4OQOA 4POXA 3N5LA 5ISUA 5I2KB 3TODA 1R6ZA 1B0HA 5KCJA 4N07A 4OTEA 1M5CA 4PFTA 4PFUA 2I6EA 2OLBA 3LSLA 4MF3A 1O63A 2WKYA 5L8DA 3CI8A 3TTMA 1LSTA 1PEBA 2PT2A 1ZKBA 3QYTA 1WVJA 1CE2A 4OENA 1CB6A 4QSCA 3A3CA 3H6VA 2I58A 3Q25A 3SEWA 1JW4A 1OLCA 3PPRA 3SESA 3PGFA 4PE5B 1MPCA 4RK2A 2I0CA 1B5JA 4NF6B 3RT8A 2H99A 2F35A 3PD8A 1GGGA 4NE4A 5KDTA 5CC2A 4G77A 2H98A 1MS7A 1Y1ZA 2XD3A 1EU8A 3TMGA 3TYHA 2QS1A 1UTHA 1B3EA 3M8UA 3R6UA 1OQGA 1NNTA 2O51A 4R75A 3UN6A 5I84A 2F78A 1XVYA 4GL0A 2HFBA 5FHMA 5A5XB 1IQ7A 4QFKA 3SERA 1AH5A 1ZJLA 3DP4A 1LB9A 3CFLA 4LONB 4ZE9A 4Q5TA 1IUDA 2CMOA 3K4UA 4LP2B 3MW0A 3K6VA 2VD2A 3O29A 2X7PA 4ZE8A 1B3LA 3WAFA 4YZZA 4DCYA 1QKAA 3MZ1A 3TFLA 2UVIA 3UP9A 2B3BA 4RJZA 1LCTA 1FTLA 4XTCQ 4ZEKA 2ZMBA 4THIA 1N7XA 4K3FA 2ZYMA 2F97A 2HAUA 3OEKA 4ZEDA 3LC8A 3O66A 1FQDA 2RKMA 3N6UA 1MXVA 2DOJA 4KD5A 3M3LA 3EQ1A 4PQJA 1SQYA 2Y7KA 1TXFA 1MH4A 4YKJA 5J1DA 1D4NA 2RCAA 2D21A 3U8QA 5KCJB 1RYXA 1L5TA 5AA4A 2ZNSA 1I69A 3T96B 1DOTA 4F2QA 4NF5A 3IX1A 1B5IA 3FASA 2F5XA 3TUSA 1H76A 4ZDMA 4JSDA 4RYAA 3PMXA 3VFJA 4F1VA 1AOVA 4G8NA 3TPAA 2YPNA 3K00A 5BUUA 2A5SA 3MP6A 3KN8A 1ANFA 1Y1MA 1B51A 2QMXA 1XHYA 4NF8B 2FYIA 1QUIA 2Y7RA 2Z23A 4EQ7A 3G3IA 2ZYOA 3G7WA 3QAXA 1P1QA 4TOZA 4LA9A 3PUVE 5DT6A 3T66A 3FXQA 3PD9A 3RQTA 2DSFA 3EPEA 3W9WA 4H5FA 3A3UA 4LQ2A 4U21A 1MQHA 4MLVA 3TTKA 4JB7A 2O6AA 1SYHA 3S9MC 1H44A 1MY2A 4OESA 3UGWA 4C1UA 3K1PA 3DP6A 2DP8A 4KYEA 1POTA 3IR1A 4Q30B 2DWJA 4OXVA 3V8XB 1A54A 1B4HA 1MXUA 1OLAA 3LSXA 3T9HB 2CZLA 2RC9A 3MPLA 1NMUA 4GVOA 4RPNA 2GHBA 1DMBA 4U22A 4U1OA 4UA8A 2O1LA 3VVEA 5AA2A 1A99A 3EHTA 2OJTA 4MH5A 1RYOA 2QS2A 2DWHA 2ZYKA 3PPPA 4P11A 3EN3A 1LAXA 2UVGA 1FW0A 1SYIA 1HSEA 2H4IA 3GXAA 4RXLA 4X9TA 4U4SA 1MPBA 1B7HA 3KBRA 1SW2A 2RCBA 3G3GA 4JWXA 2XX7A 3O6IA 4YKIA 3EF7A 3OXNA 1Q35A 4JWYA 1AMFA 3CVGA 4ZEFA 3RY3A 3ZKLA 3S4UA 1S7YA 5CM6A 4JSOA 3TELA 2HAVA 3Q28A 3CSGA 1BP5A 1D9YA 1LFIA 2QL3A 2XD2A 1XS5A 1PBPA 5KZTA 1HSJA 2DQVA 2G93A 2O7IA 1MQGA 4OERA 4HS7A 3UORA 1ZMGA 5EYFA 4F22A 4HW8A 3B6TA 4EF2A 4JDFA 3BBRA 2F8DA 4YB7A 1UQWA 2E0SA 1J1NA 4LATA 4QF9A 4R9FA 5DTBA 3V5AA 4C0RA 4IO2A 5FHNA 1Z7ME 5ITOA 3QIMA 4N13A 1B4ZA 4KHZE 4I9DA 1MDP1 4NWDA 4R2FA 2XX8A 4X1DA 1D9VA 4OYVA 4XKPA 3T22A 2O68A 3ZSFA 3N94A 4EXLA 3TCHA 1EH3A 1MY1A 1VFDA 1XT8A 3MAMA 4E0XA 3QK6A 3THIA 3MZBA 1ELJA 3C36A 1DTGA 5IAIA 3Q26A 2XHDA 3USDA 5H8FA 1R9LA 4G8HA 5JTYA 1NNPA 3H06B 3G3FA 1B5HA 2OWTA 1P99A 2ESNA 2FNCA 1S9TA 2XXHA 5B70A 3RNNA 4YICA 3MQ9A 5DVJA 4EQBA 1LAGE 4RA1A 1OIBA 1A7LA 3R7XA 1QJMA 5DYHA 5K2XA 1T0KA 2F6GA 2I48A 4WEPA 5M2VA 3TEPA 4O3CA 5I57A 2QS4A 1KWHA 3MUQA 1NNKA 1SW1A 1YAEA 3OSRA 3T93B 1MXZA 2RC8A 3QSLA 1UTHB 2VHAA 1YPNA 3VVFA 3TCFA 4IO5A 4NWCA 1FQAA 4DXCA 4EUOA 1Y9UA 2ABHA 4PETA 1B6HA 3VE1B 1OVBA 1GV8A 3DM0A 5I2KA 4P0GA 2V25A 1WODA 3GBAA 3OO6A 5H8NA 4ZEBA 4F18A 4FEBA 3H3GA 1OVTA 2B3FA 3FV1A 4DE8A 4F39A 4IGRA 1HSLA 1ATGA 1POY1 2DXRA 3VLVA 1O64A 1IXIA 4KQPA 3FV2A 1B3FA 3PPQA 3MVXA 2HZKA 1QUKA 4MBPA 3HN0A 1ZBMA 4GF8A 2I0BA 4X1BA 1B2HA 4R73A 3K1NA 1QUJA 1Z7NE 2DS9A 3OEMA 5H8SA 1P1WA 2XX9A 1MXXA 1IXCA 3LR1A 1MY0A 2VD3A 4WXJA 3UIFA 1Y4CA 5DVIA 4RK9A 5EHMA 3T9UA 1NL5A 4GL8A 4BDQA 2AYSA 1PB9A 4F1UA 3P7IA 2ALUA 3EHUA 2D3IA 3C34A 4OFOA 4UACA 5I59A 3IO6A 3W15C 3E3KA 1JETA 4FEDA 2Y7PA 4RNSA 5CMBA 4POWA 3H4ZA 2RINA 3CFXA 2XXXA 4M4GA 2V3UA 3JV9A 1N0TA 1FQFA 1N04A 4DCXA 3OO9A 2ZNUA 4BDOA 3RUMA 2GFEA 4TLLB 2THIA 1AL3A 2PX1A 2H5YA 1USYH 3M3KA 3PPNA 1XVXA 2VP1A 4MFIA 4O3BA 5H8FB 1SI0A 1BLFA 2DXYA 5HM4B 3ECRA 5ICQA 2ZXTA 3IORA 1N84A 4YU0A 3SDFA 3PV0E 1Y3NA 2RF1A 3PUZE 4EF1A 4GXSB 1FQCA 4G68A 1IEJA 3H03A 3BFTA 3PUXE 4LVQA 4KYDA 1LFGA 5IKBA 3CRBA 1S50A 4QRZA 1FCKA 1P1NA 2F7BA 2IA4A 3O6HA 1SDXA 5TPAA 3T9XB 2UYFA 4H0WA 4QSEA 3U92A 3MBPA 3Q29A 4PFYA 5CMKA 1B3GA 2O84X 3RLFE 2PBWA 2QRYA 3OOAA 2GHAA 3H6TA 5DVFA 3TTLA 3IJXB 1FTOA 1GVCA 3MWBA 4R6HA 3HPIA 5EHSA 5L9MA 1B1HA 4GOTA 4L17A 4TLMB 2UXAA 3MVYA 4N6PA 4YMBA 1N3XA 1B1XA 4M1VA 2XXPA 4ZZEA 3CG3A 2HQ0A 1I6BA 4HCYA 3UK4A 3GZGA 1N7WA 2I3VA 2V3TA 2X26A 3PMVA 3RT6B 3TKDA 1URGA 2DE4A 3GLBA 4XIGQ 4E0WA 5I56A 1BKAA 2ZNTA 3B6WA 2I4BA 3FUZA 3IK6B 3KEIA 1MM7A 3ONMA 4G2ZA 4NMYA 5H8HB 1ZLQA 3OO7A 3OMBA 4BDNA 2G29A 2P2AA 1IZ1A 2D5WA 3I6VA 4IY6A 2NVUB 1LLSA 3FXUA 5CRYA 3OD7A 5B7DA 3IOWA 3F11A 1R1NA 1NNFA 3ODBA 3FVGA 4H8IA 1QW0A 1M5BA 2XXIA 3FD3A 4JWOA 4F3GA 1JW5A 5I58B 3G3KA 3IOUA 3KFMA 2DVZA 3RGYA 3FGSA 1AIVA 1JEVA 4YAHX 4IGTA 3FJGA 3JYRA 5F1QA 2F7CA 3VXBA 1PB8A 1LAHE 1Y3QA 1D3KA 4QHQA 1BIYA 2DWAA 1TFDA 3GBBA 4F31B 3N26A 2Q88A 3O97A 5I56B 1JW1A 1LBBA 1SBPA 4NF8A 5LOMA 2Z8DA 3K1MA 4DDDA 1OMPA 1WDNA 4IO6A 1LCFA 5FTIA 3QXMA 3K6WA 2VGQA 3CG1A 4IB2A 2LAOA 2IEEA 5JTYB 3TQLA 4GFRA 1MQDA 1H43A 2O7UA 2YJPA 3IL1B 3MVZA 3R26A 4BLAA 3RTWB 5I57B 2V3QA 1TFAA 1II5A 3D4GA 3IB2A 3E4RA 2VOZA 4H8JA 4PFWA 1Y3PA 1Q1KA 1YCJA 3HSTA 4F2OA 4F29A 1MXYA 2ZYNA 4H1XA 5KDTB 1EZOA 3L6GA 2XXVA 3EHSA 1PDAA 4RY1A 1ZU0A 1NKXA 1QVSA 1USYE 1UTBA 2O1MA 2Q89A 4YB6A 3KGCA 3C9HA 4ISUA 4XKNA 3IJOB 4ELRA 5AE4A 5I2NA 2F36A 2UVHA 1JNFA 3D4CA 3BKIB 3ILTB 3MP1A 1JVXA 1MY3A 3H7MA 4R6KA 4MLQA 3PU5A 4X48A 3SETA 4AB5A 2X7QA 4GRKA 4QSDA 1UTBB 2NUVA 3UA8A 1A8EA 3E13X 1BTJA 2F34A 1FTKA 2OWSA 3MJNA 4ELQA 2OK2A 3PUYE 4HTGA 2Q9TA 4ESXA 4ESWA 4GXAA 1SW5A 4ZZAA 3C33A 4Q8RA 3O28A 3ILUB 1LB8A 4WKMA 1B32A 4AQ4A 1TT1A 4U2RA 4C1TA 3KZGA 1R9QA 3RN8A 2HCAA 3KJ7A 4R72A 3T9VA 1B58A 4IO3A 2OCUA 4KR5A 3FXRA 1MH3A 4OWDA 3G3HA 5CMMA 3RPWA 3V89B 3VLUA 5AA1A 3VLWA 4FATA 5ICTA 5TP9A 1NH7A 2A5TA 1TWYA 2P1SA 4QFLA 4EXKA 4JBZA 1H45A 2H25A 3OELA 5CMCA 3VV5A 1US4A 3MP8A 3I5OA 4NTLA 4OFJA 3IOVA 4FE8A 4F3PA 2Y7IA 5FHOA 5I58A 2H9BA 4PP0A 4F3SA 2YLNA 1JQFA 4G4PA 1B40A 2QJEA 3KJTA 3B7DA 3TQWA 3KG2A 1MQJA 2PVUA 2QMWA 2XXTA 2O69A 2DYXA 3C35A 3IO4A 4FORA 4OZ9A 5JEIA 4ZECA 3SEVA 2AIXA 1VR5A 1M5FA 3HHFA 2A5TB 3LBSA 4I1DA 3I3VA 5TP9B 3ZKKA 3U1OA 5CBSA 2XXQA 3MPKA 2DE2A 3LUYA 4OVJA 3WAEA 2I3WA 2Z22A 3QUFA 4XXUA 3B6QA 4U23A 2AL4A 2Q2AA 3CFZA 4XKQA 4YKKA 4G8MA 4IO7A 4ELOA 2RC7A 3KSXA 1MPDA 3H6WA 2W7YA 5DEXA 4NEDA 4ZEIA 3AXFA 4QFOA 3SEXA 3FVKA 2AL5A 1IIWA 3S2VA 2I49A 3A09A 1A55A 2KLFA 2PT1A 3O2AA 4KPTA 5L9OA 1JEUA 1MM6A 4ONYA 3IB1A 1I6AA 3LSFB 2Z8FA 1EZ9A 2Y84A 3HV1A 1ZIUA 1B0LA 3OSQA 4NF4B 2PMSA 2DE3A 4LZ8A 1UIUA 2UVJA 1JVYA 4ELPA 3KN3A 2XXRA 3DLNA 3CIJA 3JZJA 5TU0A 1MQIA 2PYYA 3MC2A 2NWJA 1IXGA 1FTMA 4LZ5A 1Y4TA 2ONSA 3LSWA 1NH8A 2XXWA 3K02A 1MDQA 2OZZA 2Z8EA 1PBQA 3KN7A 1PB7A 4R2BA 5ELVA 1B7ZA 1MRPA 3K6UA 1IXHA 1MXWA 3K6XA 5A5XA 2XXYA 2E1SA 1SI1A 4NF4A 5I2NB 4ZS9A 1GTKA 4BDMA 1Y20A 4R74A 2HEUA 4GD5A 4ND9A 3C31A 4Z7EA 4GQOA 1DTZA 4KYSA 1IITA 2OBGA 4OEVA 3Q27A 4GWOA 3U72A 4QFPA 4G68C 3SEYA 3IAZA 2Q2CA 4H65A 1F9BA 4DLDA 1QKBA 1VFEA 5DEXB 1URDA 4OHNA 2HXWA 3FJ7A 4IO4A 2V84A 2ANJA 2UYEA 1XOCA 1LFHA 3U94A 3KOSA 4R6YA 3TDJA 2I4CA 3BFUA 4F19A 3ZS6A 1DPEA 2NOOA 2QS3A 1VE4A 3E9XA 4R9GA 4Z0IA 5FTHA 3TTRA 3O9PA 5AA2B 4KI0E 3PMWA 4NF6A 2V93A 5TPAB 1M5EA 4AB6A 3KOTA 3M3FA 4F1YA 2ONRA 5H8NB 3H6UA 3FVOA 4OFLA 4QFNA 1H3DA 3K01A 3RTFB 3G3JA 5CBRA 5HPQA 5ITPA 5JK4A 1ZTYA 1B05A 1UIVA 2R71A 3OO8A 4WEDA 3SKPA 4XKRA 2NXOA 4KCCA 1RKMA 1DSNA 2R6GE 1MG1A 3KSJA 3DP8A 4JXIA 3PPOA 4H67A 4I8CA 3MZ9A 1GR2A 1QULA 1SVXB 1MY4A 4LQ5A 4LUBA 3TTNA 3VXCA 5H8QB 4DXUA 4I62A 4YKPA 4OMBA 3VDFA 3OENA 3K0VA 3L6HA 4DZ1A 5H8HA 4F3BA 3MVWA 4FECA 3O6GA 4LZ7A 1DPPA 2Y7WA 5F7VA 3IB0A 1SW4A 1LGBC 3FVNA 3S9NC 4O3AA 5AA2D 3CSBA 4H5GA 2R9JA 1P1UA 1LBCA 3FATA 4KCDA 3VVDA 1N76A 2FA7A 1OQHA 4FJPA 4NF5B 4U4XA 3C32A 3HO7A 4H6DA 5AA4B 1LAFE 1XC1A 1N3WA 4HCWA 1I6QA 4DXBA 2P0SA 4GIZA 1A40A 1B7UA 3TCGA 2REGA 4RPOA 4BDLA 2DVCA 4YMAA 2QSXA 1O7TA 4YB5A 3IOTA 5BWJA 3CR9A 1SD3A 2F7AA 3TAJA 2QPQA 3FIRA 5CI5A 4DIGA 3C4MA 4ECFA 4GLIA 4G68B 4EDPA 3FZVA 2Q8JA 3SEUA 4FIMA 1VSOA 3W9VA 4OEUA 3U93A 5AA3A 3S9LC 2BJJX 3HCQA 5I59B 5K2YA 1PC3A 5H8QA 3PUWE 2DWIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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