1MXVA

Crystal titration experiments (ampa co-crystals soaked in 10 mm brw)
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
publication title Probing the Function, Conformational Plasticity, and Dimer-Dimer Contacts of the GluR2 Ligand-Binding Core: Studies of 5-Substituted Willardiines and GluR2 S1S2 in the Crystal
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 84
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxvA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxvA01
3G7WA 3FXUA 1B5JA 2HAVA 3TODA 2YJPA 4PFTA 3G3HA 3SESA 3FJMA 1FTLA 4OQOA 5AA4B 1QVSA 3BFTA 1B3GA 1PC3A 1SBPA 1I69A 1VSOA 1ZMGA 4OYVA 3ZSFA 4YKJA 4U23A 2QJEA 5I57B 2G93A 5A5XA 5H8FA 2ZNUA 4RY1A 4LUBA 1N0TA 4GIZA 3QYTA 4ESWA 4ZDMA 1A8FA 5I2KA 1T0KA 3CRBA 1QJMA 3H7MA 3CR9A 4M1VA 1JW5A 1ZU0A 1OVTA 3HV1A 3ECRA 4ZE9A 1FQCA 1LFGA 1SI1A 4KFQA 3LC8A 1PEBA 1US4A 4KCCA 1S50A 4H6DA 1FTKA 4FAJA 1GR2A 5DVJA 4EDPA 4DCXA 3BBRA 4IO2A 1M5BA 3K6VA 4LZ8A 4IO4A 4U22A 4OXVA 4FJPA 2W7YA 3TFLA 4LP2B 1DTGA 3VVFA 1MRPA 3TCFA 2F6PA 3N26A 1A40A 2O6AA 1B3EA 5ELVA 3HO7A 1UTBB 2QS1A 4KD5A 4BDLA 2RC7A 1I6QA 5K2YA 3TMGA 5FHNA 1P1OA 1UIUA 4THIA 1IQ7A 1H44A 2ABHA 4G4PA 3AXFA 1A8EA 3LSFB 3QK6A 3LSWA 4EF1A 3TCHA 3PUYE 5CMBA 4R6KA 5TPAA 3CSGA 1HSJA 4P0IA 3VVDA 4RPOA 1B46A 4PQJA 2A5SA 3CSBA 4TQUQ 2VGQA 3QSLA 2FA7A 3VDFA 1QW0A 3VXBA 3EHTA 3FZVA 4OTEA 3V8XB 4EXLA 5I58A 1B52A 2NWJA 2F35A 4ZEBA 1D3KA 5H8NB 4GL0A 1SDXA 5IAIA 5DYHA 4POWA 4F1YA 4GLIA 4LONB 1IITA 1H3DA 1OVBA 5CBSA 4U4SA 2THIA 3SEVA 4TOZA 4ISUA 1EZPA 2YLNA 4KQPA 2RC8A 5TP9A 4ZEKA 2DXYA 3EF7A 1QUJA 3IJOB 3TEPA 1SW4A 3QAXA 4JSDA 1ZTYA 4LQ2A 3ZKKA 1NNTA 1Q35A 1MXUA 2XXIA 2I3VA 4JWOA 2V25A 2PVUA 4F3BA 2IEEA 5AA4A 1M5DA 2F8DA 1MY1A 2HZLA 3LUYA 3B6WA 3K00A 4ECFA 3TZAA 3FUZA 3KEIA 5I57A 2XX9A 2H9BA 4U21A 5I59B 3TDJA 1FQBA 4KYEA 4G8MA 3MP1A 2Q8JA 4OVJA 3TTKA 3C32A 3SDFA 1MM6A 4DLDA 1Y9UA 3FVGA 3MP8A 2FYIA 4IY5A 3RGYA 4HCYA 3N94A 4Q8RA 3H4ZA 3DELB 4Q30B 3IB1A 1HSEA 2R71A 4JWYA 2UVJA 3KG2A 4PFYA 4G8NA 3ODBA 1F9BA 1USYE 4POXA 5KCJB 3CG1A 2Z23A 3O97A 5AA2D 4HS7A 3EN3A 1ELJA 3IORA 1H43A 3EQ1A 1B7ZA 5JEIA 4YKPA 2BJJX 1B5HA 3S4UA 4OEVA 2DP8A 3KSXA 3A3UA 3U1OA 2CMOA 4NF6B 3PGFA 1MY4A 3SKPA 3RT6B 3RTWB 3EPEA 2KLFA 5CRYA 5JK4A 4EF2A 2O7IA 4N07A 3UGWA 1Z7ME 2NOOA 5DT6A 1LBBA 4GXAA 4ZEFA 2H25A 2UVHA 1POTA 4IGTA 4OERA 2R6GE 3CFXA 4GXSB 3QUFA 1US5A 1NMUA 4EQ9A 1XC1A 3MQ9A 2Y7PA 4G77A 3MBPA 4ELRA 3FJ7A 4YMAA 1NNFA 4RJZA 3IB0A 3V5AA 3ONMA 2QMWA 1A54A 4G68B 4F2QA 1LCFA 4PFUA 1WVJA 4DZ1A 1LB8A 4I9DA 4R73A 2HEUA 2ZYMA 3Q26A 4HTGA 3D4GA 5F1QA 4F31B 1Q1KA 1DMBA 2RCBA 1JVYA 1I6BA 2RC9A 2GFEA 2HFBA 2I58A 3I5OA 2I4BA 3MAMA 4PE5B 4YB6A 4PFWA 3FXRA 3MZ1A 1MDP1 1IEJA 1O64A 3PU5A 2XXXA 3SERA 3IX1A 5BUUA 5CM6A 2XX8A 1MS7A 1DPEA 2O51A 4I62A 3IAZA 4FIMA 2Q89A 3PD9A 4HCWA 3O9PA 1FCKA 3PPPA 1NFTA 3FIRA 4NF4B 4F3PA 4QF9A 3MPKA 3Q29A 4NE4A 4U1OA 4OEUA 1RYOA 2HCAA 4DDDA 3QIMA 5I59A 5FHMA 1YAEA 1UTHB 1MY0A 1EU8A 3T66A 3T9UA 4NTLA 5DEXB 2X26A 4KPTA 4ZZAA 5BWJA 5CC2A 1VFEA 1B3LA 3EHSA 4U1ZA 5FHOA 3QXMA 3F11A 3PUVE 1XOCA 1NKXA 2QRYA 3RUMA 1SI0A 1KWHA 3M3FA 4JDFA 3RY3A 1MM7A 1VR5A 1YPNA 2I3WA 1B2HA 3IOWA 4ZEDA 5KCJA 2Z22A 4BDMA 4ONYA 1TFDA 4L17A 3FVNA 2DXRA 4ESXA 4DCYA 4M4GA 4H8JA 1D4NA 2GRVA 5CI5A 2DS9A 1N84A 3SEWA 1MXYA 1B0LA 4F3SA 5EHSA 1B32A 3FASA 4RXLA 4GVOA 2DVCA 1MXZA 2QS4A 3DM0A 3K1PA 3VFJA 4R9FA 2OJTA 4IO6A 4NF6A 1ZKBA 1FQDA 2X7PA 2UVGA 4X48A 4MFIA 3TCGA 3K01A 5DVIA 1URGA 2OK2A 2VHAA 3FXQA 3KN3A 4JBZA 3PMXA 3W15C 1B1XA 3IOUA 3OO9A 5B70A 1MQHA 4NWDA 2F78A 1LFIA 1BLFA 4H5GA 3VLWA 1MY2A 4G68A 3L6HA 1LFHA 3OELA 3WAEA 4U2RA 3THIA 1Y4TA 3SETA 2F97A 1B9JA 2Y7KA 4AB6A 4QSEA 1WDNA 1Y1ZA 2X7QA 3I3VA 1VFDA 2Q2AA 2DQVA 2RINA 4GQOA 4IO5A 1B40A 4F3GA 3A09A 3C9HA 1AH5A 3OMBA 4XIGQ 5B7DA 1GV8A 2M8CA 5CMMA 3IB2A 3MZ9A 1QKAA 3C35A 3FVKA 3VLUA 2PBWA 3TTRA 3C4MA 3FATA 1AOVA 1SW5A 4FE8A 1Y20A 4GD5A 1P1QA 4LZ5A 4U4XA 5KDTB 4YU0A 1JW1A 2ZNTA 4OESA 2OBGA 4NF4A 1Y4CA 3VXCA 4GFRA 4TLMB 4R6HA 5I2NB 3VE1B 1P1WA 2RCAA 2DOJA 3TTNA 1QKBA 2RKMA 3KOSA 3LBSA 4I8CA 3UIFA 1Y3PA 3MVXA 3DP4A 3OSQA 1M5EA 1BTJA 1JNFA 4YMBA 1NNKA 3UORA 5ISUA 4XXUA 4KCDA 3USDA 4R75A 5DEXA 2LAOA 4K3FA 1N04A 1MXXA 1ZJLA 4ELOA 4FEBA 1SYIA 4AB5A 1ZIUA 3O66A 2I6EA 1B05A 4KYSA 4MLVA 2F6GA 3KGCA 4ZS9A 5CMCA 1S9TA 4Q0CA 3HSTA 5JTYB 2XXRA 3T22A 2ZNSA 1LGBC 2AYSA 2DSFA 2DWJA 4FEDA 2Y7IA 3FVOA 1B6HA 4WKMA 4R9GA 1CB6A 2Z8FA 2ZXTA 2XX7A 2Y7WA 1NL5A 2QMXA 2OWTA 4O3BA 1XVXA 4QFPA 3OENA 3MP6A 3SEXA 4C1TA 4H0WA 3IL1B 4XKQA 2REGA 2V3QA 1FTMA 1TXFA 1PDAA 1UIVA 1OQGA 3CFLA 1Z7NE 1N76A 2B3FA 1BP5A 5TU0A 3U8QA 5H8QB 2VD2A 2F36A 3C31A 3ZS6A 3N5LA 1URDA 1OMPA 3N6TA 4DXUA 1IIWA 1FTOA 2G29A 5IKBA 3GLBA 2YPNA 3PMVA 2AL4A 3RLFE 5ICTA 3GXAA 3TUSA 3I6VA 4ELQA 2O84X 3OEMA 1PB9A 4F19A 1MQJA 3VVEA 3T9XB 3KFMA 2ESNA 3JYRA 3GBBA 1LCTA 3TYHA 3O2AA 3H03A 3O6IA 1OLAA 2XXWA 2D21A 1ANFA 1URSA 3KJ7A 4N13A 5FTHA 2A5TB 3Q28A 3K02A 3G3KA 2DE4A 4KI0E 1GGGA 4LQ5A 1JETA 3R26A 3E13X 3Q27A 3MVZA 1WODA 3RQTA 1IXHA 2E1SA 3O29A 5AA1A 1QUIA 1LB9A 3RNNA 2O1LA 3DLNA 3HPIA 2F34A 1SVXB 1UTBA 1ZLQA 3P7IA 4N6PA 2D3IA 2P2AA 2DE3A 3K6XA 3K6UA 4NMYA 4BDOA 5I56B 5A5XB 1A55A 5H8FB 2V3UA 1MQDA 3JZJA 3IR1A 5KDTA 3V89B 3TTLA 1YCJA 4OFJA 4LATA 3FGSA 3UN6A 3IK6B 1L5TA 2I0BA 1O63A 5I2NA 3S9NC 4KYDA 2XXPA 4BDNA 3TPAA 4XTCQ 4QSCA 4JWXA 4OWDA 4GRKA 4QFKA 5H8NA 3KN8A 3B7DA 1OQHA 3IO6A 5CBRA 4P0GA 2P1SA 4QFNA 3KZGA 4C0RA 3MVYA 2PT1A 1IZ1A 4NF5B 4WEPA 3S9LC 2E0SA 5KZTA 4DXCA 4G68C 3H6WA 3B6QA 1B4HA 2O68A 3KOTA 5JTYA 2QS2A 2XD3A 2P0SA 4Z7EA 2DWAA 1VE4A 2NUVA 4WXJA 2ONRA 4RK9A 3R6UA 2V84A 2R9JA 1ZBMA 3T93B 1XHYA 4O3AA 4H5FA 1AMFA 2UYFA 4ZEIA 3ILUB 4R6YA 1EZ9A 1POY1 2CZLA 4I1DA 5AA2B 4LZ7A 4YAHX 4G8HA 5L9MA 3U93A 3CVGA 3H3GA 3EHUA 5HBCA 3H6UA 5LOMA 1R6ZA 5H8QA 5TPAB 4OFOA 2DE2A 2Y84A 2O1MA 3G3JA 2Q2CA 5HPQA 2DWIA 2Y7RA 3E9XA 1TWYA 2F5XA 4BDRA 3OEKA 1SW2A 1LAGE 2VD3A 4GL8A 2XXHA 3K2DA 3JV9A 3RT8A 2D5WA 1XT8A 4JXIA 1MPDA 3PPNA 5L8DA 4F29A 2RF1A 2XXVA 2F7BA 1N7WA 1SD3A 1MPBA 3FV1A 4DE8A 1H76A 4Q5TA 3MPLA 2O69A 2DYXA 3GZGA 2A5TA 4H65A 3RPWA 1N7XA 3U94A 3SEYA 2PT2A 3M3KA 4YICA 4EXKA 3PUWE 1FW0A 1B3FA 1LAFE 5K2XA 3KN7A 1QUKA 1MH3A 1MY3A 2XXUA 3LR1A 5ICQA 1XVYA 3LSLA 2VOZA 1B0HA 4OFLA 4KR5A 2HQ0A 2V3TA 3S2VA 4BDQA 2I4CA 5I56A 2B65A 1AIVA 2V93A 1PB7A 1N3XA 2GHBA 4IY6A 1TT1A 4TLLB 4NWCA 1MH4A 4F22A 4UA8A 2OWSA 4YB7A 1QULA 3HN0A 4F39A 1P1NA 2QS3A 4AQ4A 4F1UA 1YTVA 4R2BA 3MUQA 1CE2A 3K4UA 3C36A 1IXIA 2O7UA 4PETA 1B4ZA 1P1UA 3B6TA 1RYXA 3OO6A 4ELPA 1DSNA 4QHQA 1GTKA 3PV0E 3KBRA 4MF3A 4NF8B 3KJTA 1A7LA 4OMBA 3IOTA 3PMWA 4NF5A 2ONKE 2XHDA 4Z0IA 3PPRA 1Y1MA 4YKIA 1B7HA 1R1NA 2Q9TA 4QFLA 3KSJA 5F7VA 3FD3A 1DTZA 5L9OA 2I0CA 1ATGA 3C33A 2XXTA 3V83A 1D9YA 1SYHA 2XXYA 3RTFB 5H8HB 1FTJA 4YKKA 4ZECA 2ZYOA 1J1NA 3TQWA 5AA3A 4F1VA 1B3HA 4UACA 3PPQA 5AA2A 3U92A 3S9MC 1B7UA 3RN8A 1B1HA 3UA8A 2AIXA 2Q88A 4YB5A 2ZYNA 1IXCA 3CFZA 3O6HA 2OCUA 3DP6A 5CMKA 1UTHA 1PBQA 1LAXA 3MWBA 1LAHE 4RYAA 2FNCA 3IO4A 4NEDA 1JEVA 3OO7A 3LSXA 5DVFA 4LVQA 1A99A 5H8SA 4GF8A 3MJNA 1II5A 4ND9A 1IXGA 3T9VA 3S9EA 2AL5A 5I84A 2UXAA 1RKMA 2PYYA 3OD7A 3T9HB 3K1MA 2I49A 4HW8A 1OLCA 2HAUA 3G3IA 3H06B 3G3FA 4IO7A 4QRZA 2DVZA 3TKDA 5ITOA 3IOVA 2UVIA 4XKPA 2QSXA 1FQAA 4XKRA 1GVCA 4E0XA 4WEDA 5ITPA 4R72A 3H6VA 3TELA 2IA4A 1OIBA 4IB2A 2QL3A 1LLSA 2WKYA 3VV5A 3UK4A 1NH7A 1UQWA 5EYFA 3FV2A 4X1BA 3MC2A 5DTBA 4H1XA 3CG3A 2H99A 2ZYKA 1PBPA 1JVXA 4IGRA 3OO8A 3GBAA 3HHFA 4E0WA 1LBCA 2F7CA 3BKIB 3R7XA 1P99A 1BKAA 3PUZE 4MH5A 1N3WA 3OXNA 4FECA 1USYH 4RA1A 2Z8EA 4F18A 4RNSA 4OHNA 1SW1A 4IO3A 1NNPA 4F2OA 2OZZA 4NF8A 2ALUA 3IJXB 3UP9A 4G2ZA 1EH3A 4EQ7A 4X9TA 1H45A 2HXWA 2QPQA 4H67A 2DWHA 1MDQA 3E3KA 3K1NA 4FORA 5M2VA 3T96B 2B3BA 5L9SA 4R74A 4DXBA 3OSRA 2REJA 4GOTA 5H8HA 1MQGA 3H6TA 3M3LA 2PMSA 4QFOA 4QSDA 2HZKA 2ZMBA 4GWOA 1BIYA 3OOAA 3G3GA 3ZKLA 3TQLA 2VP1A 2Z8DA 3N6UA 5I2KB 4JSOA 4R2FA 3D4CA 5AE4A 2I48A 3BFUA 1M5CA 2XXQA 3PUXE 4ZZEA 1S7YA 2GHAA 3TTMA 1B5IA 1NH8A 3K6WA 2H4IA 5EHMA 2GH9A 4OETA 2F7AA 1JQFA 1IUDA 3W9VA 4XKNA 1O7TA 4RK2A 4OZ9A 3MVWA 4O3CA 4OENA 2PX1A 1MG1A 3MW0A 3WAFA 4LA9A 3DP8A 1FQFA 4KHZE 4JB7A 1Y3NA 1EZOA 2XD2A 3K0VA 3SEUA 1Y3QA 3HCQA 1JEUA 3PD8A 1DPPA 1R9LA 4PP0A 4X1DA 1R9QA 4FATA 4MLQA 1FQEA 4C1UA 2ONSA 4EUOA 3ILTB 5FTIA 4H8IA 4RPNA 3Q25A 1MPCA 1SQYA 1M5FA 3W9WA 2NVUB 1AL3A 3HHGA 5HM4B 3E4RA 2H98A 4ZE8A 2OLBA 1D9VA 1MQIA 3PPOA 1PB8A 3C34A 3QUJA 5J1DA 4BLAA 1HSLA 1XS5A 1DOTA 5I58B 3A3CA 1MXWA 2H5YA 2NXOA 4EQBA 3TAJA 1B51A 3FJGA 3CIJA 1LSTA 3O6GA 3O28A 4DIGA 4P11A 2ANJA 1B58A 1TFAA 3CI8A 3U72A 1I6AA 3M8UA 3MZBA 4YZZA 3VLVA 5TP9B 1MXVA 3L6GA 2UYEA 1JW4A 4MBPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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