1MXVA

Crystal titration experiments (ampa co-crystals soaked in 10 mm brw)
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
publication title Probing the Function, Conformational Plasticity, and Dimer-Dimer Contacts of the GluR2 Ligand-Binding Core: Studies of 5-Substituted Willardiines and GluR2 S1S2 in the Crystal
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 84
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxvA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxvA01
2HEUA 2VD2A 3QXMA 3VXCA 3N6UA 1Y3QA 4KYEA 2ANJA 3E13X 4BDMA 2DXYA 1N7XA 4U23A 3K1MA 5DVFA 5BWJA 4PQJA 4R73A 2RKMA 4EXLA 4NF8B 1D9VA 4G8MA 4F2QA 3Q26A 5ITPA 1OVBA 4EQ7A 3O2AA 1XVXA 4GVOA 1GV8A 4H8JA 3RLFE 2DE4A 1MXYA 3KSJA 4H0WA 3MJNA 4LA9A 1D9YA 3C31A 4U1OA 3IOTA 1B0HA 5H8NB 1SW4A 4ZDMA 1MY0A 1Y4CA 1FTMA 1O64A 3PMWA 3UP9A 2XX7A 3N94A 3FXUA 3KBRA 3V89B 2HFBA 3OO7A 1SYHA 4F3SA 5H8QB 1SVXB 4JBZA 2OWTA 1UTHA 3OD7A 1N0TA 3CG1A 3C36A 3MPLA 2R9JA 1UTHB 3U8QA 3H7MA 2F7AA 4OERA 3OSRA 1LAXA 3WAEA 3B6TA 2NUVA 3CIJA 5CMMA 3S4UA 1II5A 2ZNTA 3FJGA 4ZEDA 1R9QA 1EU8A 4KFQA 3MVYA 4R9FA 3K0VA 1N04A 2RC8A 2H25A 3VVFA 3C34A 4C1UA 1QW0A 3QYTA 3UN6A 3GZGA 4KPTA 3IB0A 4F3PA 5BUUA 3K02A 2DWJA 2G93A 3PUWE 4P0IA 3QK6A 4YICA 1DPPA 3G3KA 4GWOA 3MWBA 4NMYA 3G7WA 3Q28A 3TPAA 5TP9B 1Z7ME 3VLWA 2VOZA 3KFMA 3FV1A 3VLUA 1Y9UA 3EPEA 1P1WA 1S9TA 1NH7A 2PT1A 1QULA 4ZE8A 5AA4B 3IB1A 3LSFB 2AL4A 1QUJA 2I4CA 4Q0CA 1YTVA 2OLBA 1B3FA 3OSQA 4YB7A 3D4GA 1S7YA 2V3QA 1NNPA 1MQJA 5TPAA 3VE1B 4C0RA 1JETA 5TPAB 1PB9A 4F29A 3TMGA 1VR5A 1Q1KA 2UVIA 2Q89A 3ILTB 4ONYA 3FVOA 3OEMA 4KQPA 2YPNA 1P1QA 1Y1ZA 2F7CA 1LSTA 3TTRA 3DP4A 4G4PA 3FD3A 3E9XA 1MDQA 3HHGA 3K1NA 3IOUA 1Y3NA 1LGBC 1BTJA 2RCAA 2UYFA 2XX9A 1MPCA 3VFJA 5I58A 4FE8A 4OTEA 1GR2A 1Q35A 2XXTA 3C33A 4O3BA 4R9GA 5I59B 3O6GA 3S9EA 4N6PA 4N13A 2M8CA 2OK2A 1XS5A 3IOWA 1B4HA 3FV2A 2Z8DA 4IO6A 1AMFA 2F34A 4PFTA 4DXBA 2YLNA 2DQVA 1Y3PA 2F8DA 4ISUA 3L6HA 4PETA 1VFDA 3ECRA 4F2OA 3KZGA 2I0CA 4OZ9A 3T9HB 1A54A 3SEVA 1LBBA 3HSTA 2GH9A 2X7QA 2LAOA 4GF8A 2QMXA 1EZOA 4ZECA 4ZEBA 1NNFA 4GRKA 3FASA 1H43A 4FJPA 3RGYA 1IUDA 2FNCA 4TOZA 5ICTA 1N76A 2DYXA 2AL5A 4LUBA 1IEJA 3H03A 1IXHA 5H8FB 2E0SA 5CBRA 4OESA 5AA2A 2WKYA 2KLFA 3RTWB 4ND9A 3HO7A 2F97A 3E4RA 4XKPA 2XD2A 1MQDA 4QFNA 2I0BA 4YKIA 2G29A 3FJMA 4Z7EA 4OMBA 1B3LA 4Z0IA 4IY5A 4FEBA 3L6GA 1M5DA 5HBCA 5DYHA 3G3FA 1MDP1 3PUZE 2F35A 3HPIA 3IAZA 1I6QA 4OFLA 1M5BA 4I9DA 4U4XA 4EF1A 1B7HA 4F1UA 1MY4A 3FVGA 4NF4A 1RYXA 2H99A 2QSXA 4RNSA 1PBQA 4OHNA 3G3HA 5AA2D 3PPPA 5FHMA 3OMBA 1I69A 2I4BA 2H9BA 1B5HA 1N3XA 5I2NA 1IXCA 5KCJB 3F11A 5ELVA 2AIXA 3RNNA 3DP8A 2P1SA 2F5XA 4TLLB 3CI8A 1SW2A 3HN0A 1IXIA 4G68A 2Q2AA 4GLIA 1N84A 1URSA 1SDXA 1YAEA 4NE4A 2RCBA 3H6UA 1WVJA 2REJA 4JWXA 2XXXA 3D4CA 1MM7A 1MY3A 2D5WA 2Y7PA 4QFPA 4H1XA 1NMUA 1FQCA 4LQ5A 4TQUQ 3TYHA 2ZNSA 3U92A 5JTYB 1MPBA 1H76A 3V5AA 1DSNA 3K6VA 3U72A 2Z8FA 1B3GA 1VSOA 3I3VA 3RQTA 3CFXA 2HAUA 3EHSA 5I56A 1YCJA 3PGFA 5I56B 4MBPA 2ZMBA 4I62A 2F6GA 2FYIA 2Y7IA 2RF1A 2XD3A 5AE4A 3TUSA 3EHUA 4G2ZA 1Z7NE 4RY1A 1BLFA 1B5JA 4HTGA 5CMCA 5CM6A 2XXRA 2V84A 1IIWA 3FUZA 1VE4A 2UVHA 4AB5A 1AL3A 1IITA 4GL8A 4QHQA 3SETA 3JZJA 1KWHA 1ATGA 3PPRA 5A5XB 4JDFA 3LSLA 4I1DA 3N5LA 4YMBA 1UQWA 1NKXA 3K01A 5DTBA 3KGCA 1ZIUA 2PT2A 1H45A 3CSBA 2ONRA 2NVUB 3OEKA 1B58A 2OWSA 4ZEIA 2F78A 4LZ7A 2DE2A 3K6UA 3Q27A 3Q25A 4AQ4A 3ODBA 2H98A 3E3KA 1XHYA 4U21A 1TFDA 3MAMA 4OFJA 4EQBA 3KEIA 2Z8EA 3GLBA 4NF8A 1URDA 4R2BA 1UTBB 4O3AA 3TCHA 1CE2A 4Q5TA 1OMPA 3A3UA 4JXIA 1JQFA 3DELB 1D3KA 1P99A 2P0SA 3QUFA 3GXAA 1B32A 2P2AA 3MZ9A 5H8NA 3SEWA 3TZAA 2HAVA 4OXVA 1OLCA 2A5TA 3LSXA 1ELJA 2A5TB 3LUYA 4F31B 3A09A 3EQ1A 1SW5A 4RYAA 1B1XA 5H8QA 1UIUA 4E0XA 4X48A 3MP8A 3FZVA 2RC9A 1NH8A 1MS7A 3ILUB 4ZEFA 1H44A 1MQHA 3K00A 3N6TA 1JW1A 3TCGA 4NTLA 3G3IA 3FATA 4LVQA 1QKAA 3MZBA 3TTMA 4DXCA 4LP2B 2XXPA 1HSJA 3OOAA 3FGSA 3O6HA 3IO6A 5L9SA 3K4UA 4BDOA 3FVNA 1Y20A 4P0GA 2V3TA 3C35A 3KOTA 3T9XB 4WXJA 3DLNA 4R6KA 2Z23A 3VV5A 2QL3A 3PUXE 5I2KA 3T9VA 5I2KB 1JNFA 4PP0A 1J1NA 1POTA 4XKNA 5KZTA 4FATA 5TP9A 1TT1A 4ZZEA 1B2HA 3MW0A 3KOSA 4XXUA 5B70A 4ESXA 1US5A 2ZYMA 4G77A 3FVKA 3B6WA 3PMVA 3PPQA 4RA1A 3VLVA 1MM6A 3TELA 5AA4A 4IGTA 4OEUA 1TFAA 1ZKBA 1ZLQA 2X7PA 3T22A 2O68A 3SDFA 1B51A 3MQ9A 4RJZA 3OO6A 1M5EA 4LATA 3EN3A 4RK9A 2QS3A 2CZLA 3HHFA 3K6WA 2XXYA 2I3VA 2ZYOA 1ZBMA 4GOTA 4LQ2A 2O51A 4UA8A 4JSOA 4BDRA 2XXVA 4PFYA 1OQHA 2Y7KA 3MP6A 3BBRA 4NF6B 3UORA 1P1UA 5H8HA 1B3HA 3UIFA 1B3EA 2THIA 3TTNA 5H8HB 3QAXA 3IR1A 5HM4B 1OVTA 3CVGA 4O3CA 1AH5A 1HSLA 1LCFA 1R1NA 2CMOA 4GD5A 5EHSA 3VVEA 4DCYA 4OQOA 4WEPA 1USYH 1Y1MA 2O1MA 3HCQA 3TAJA 3OO8A 4GXAA 1MPDA 5I59A 1WDNA 4H8IA 4IB2A 1OLAA 1FW0A 1P1NA 2B3FA 4OWDA 4YB6A 4ESWA 3SEXA 3O66A 4DLDA 4K3FA 1QUIA 3P7IA 3PV0E 1LB8A 3RT8A 3N26A 1TWYA 2ZYNA 3QSLA 3C9HA 3SESA 1OIBA 2D21A 1FQDA 1AIVA 5L9MA 3KJTA 3FJ7A 4KR5A 1N3WA 3V8XB 1B7ZA 3BKIB 1MY1A 3UGWA 2OBGA 4EQ9A 2AYSA 4YB5A 4E0WA 4U22A 3MVZA 2DWHA 2W7YA 3T93B 3U1OA 3TDJA 2I48A 4NF5B 2PBWA 1NNTA 1SW1A 4XKRA 1JVXA 1VFEA 1BIYA 2I49A 5H8FA 1EH3A 5IAIA 1Y4TA 1MG1A 3OO9A 3V83A 3PD9A 3S9NC 1M5CA 3KN8A 1B52A 2UVGA 3TODA 4QFKA 3KN7A 1B46A 2V93A 2XXHA 2ONKE 3WAFA 4U4SA 5HPQA 1A8FA 1S50A 3A3CA 3LSWA 1R6ZA 4FEDA 4EXKA 4M1VA 4MLQA 5JEIA 3M3LA 4KCCA 3IJXB 1YPNA 1SQYA 3LR1A 3IX1A 2I58A 3M3KA 1XOCA 1N7WA 4GFRA 2Z22A 1FQEA 5K2XA 2RINA 5I84A 3O9PA 4X1DA 3BFTA 1QKBA 1A7LA 3S2VA 2XX8A 4KYSA 1MH3A 3I5OA 2I3WA 3M8UA 5KCJA 1DOTA 1ZTYA 3MPKA 2Y7WA 5KDTA 2F6PA 3H6VA 1FTOA 5KDTB 1LCTA 3PMXA 5L9OA 4U1ZA 4F3GA 3IO4A 4THIA 2HZKA 5FTHA 3O97A 1RKMA 2QS4A 5CRYA 4JWOA 3H06B 1R9LA 4HCWA 5DEXB 1JEUA 1L5TA 4MF3A 4F19A 5JTYA 2YJPA 1MXXA 3Q29A 3B7DA 2QJEA 2R71A 4G8HA 4KHZE 4KI0E 1GVCA 3MVXA 2O84X 1US4A 5I57B 4C1TA 2DSFA 2A5SA 2ABHA 4QRZA 4QFOA 3EHTA 3O29A 1POY1 4FIMA 1MXWA 2H4IA 5ISUA 1LBCA 3R6UA 1MQGA 2PVUA 1DTGA 1URGA 1FTLA 2VP1A 4JWYA 1NFTA 5A5XA 5CMBA 5DVIA 2PX1A 4WKMA 4RPOA 3T66A 1IZ1A 1LB9A 1USYE 3ONMA 1LAHE 4OETA 1LLSA 3LC8A 1B40A 5ICQA 2O6AA 4EDPA 3OELA 4RPNA 2DXRA 3K2DA 1SI1A 1H3DA 1FQBA 2OJTA 3IL1B 2DOJA 2GFEA 4G68C 3QIMA 2GHBA 1MXZA 3C4MA 1UTBA 1B7UA 3KJ7A 2NOOA 3RY3A 3ZS6A 3CFZA 1F9BA 4OYVA 2QPQA 2UXAA 4ECFA 3KSXA 1MRPA 4JSDA 3K6XA 4OVJA 3S9MC 4X1BA 2ESNA 2HZLA 1O7TA 1QVSA 2RC7A 2GRVA 5M2VA 1IQ7A 5CI5A 3H6TA 4FAJA 1MY2A 4R74A 4TLMB 2IEEA 1SI0A 1QUKA 4U2RA 4Q8RA 3CSGA 4IO4A 1GGGA 3MZ1A 4DIGA 4OEVA 1PEBA 3R7XA 4MH5A 1MQIA 3ZKKA 1FQFA 5LOMA 2Y7RA 3IORA 1RYOA 3OXNA 1OQGA 2ZNUA 4YMAA 5EHMA 2QS2A 3H3GA 1B5IA 3UA8A 5AA3A 1GTKA 3CR9A 4N07A 3BFUA 3M3FA 4ELQA 3CRBA 4DDDA 3DM0A 3ZSFA 1B0LA 3SKPA 3B6QA 1WODA 3H4ZA 4R6YA 4IY6A 3JV9A 2V3UA 3FXRA 1JEVA 3O6IA 4MLVA 1LFHA 3MBPA 4H5FA 3SEYA 4FECA 3FXQA 5JK4A 2REGA 3GBBA 3KG2A 1A40A 2BJJX 2ZXTA 4ELRA 4DCXA 4RXLA 5CC2A 1FCKA 2O69A 5DT6A 3MP1A 1A8EA 1ZMGA 4BDLA 3PD8A 3TEPA 1MXVA 1PB7A 3W9VA 4DXUA 5ITOA 3CG3A 1JVYA 3KN3A 4OFOA 4IO2A 4LZ5A 2PMSA 4ZE9A 1A99A 3TKDA 4ZS9A 1MH4A 4NF6A 4R6HA 1JW5A 1HSEA 5L8DA 2DE3A 2FA7A 1I6BA 3G3GA 3QUJA 3W15C 4F1YA 3IK6B 2HXWA 3VXBA 4XTCQ 4RK2A 1A55A 3PU5A 4PFUA 3IB2A 4R2FA 4GIZA 1IXGA 4LZ8A 1LAGE 1ZU0A 3G3JA 5J1DA 2XHDA 4R72A 1MXUA 4AB6A 1O63A 4F1VA 4QSEA 2DVZA 3AXFA 4GXSB 1TXFA 5F7VA 1B4ZA 4GQOA 5I58B 2UYEA 3OENA 3SEUA 2DWIA 3MC2A 1B05A 3TQLA 1SBPA 2NXOA 4JB7A 4FORA 1PDAA 3IJOB 1FTKA 3TFLA 1SYIA 4X9TA 2OCUA 2Y84A 2E1SA 2ONSA 3C32A 2GHAA 2DS9A 4DZ1A 2B3BA 4NF5A 1NNKA 3HV1A 4BDQA 2PYYA 2XXIA 5EYFA 3VDFA 3CFLA 3EF7A 3MUQA 3U93A 4EF2A 2F36A 3S9LC 4YKKA 2R6GE 2F7BA 4IO5A 4G8NA 1P1OA 1LAFE 1UIVA 4NWDA 3LBSA 2I6EA 3UK4A 2XXUA 3O28A 4F3BA 4IO7A 4R75A 3RTFB 1ANFA 1M5FA 3R26A 5H8SA 4HS7A 1D4NA 4ELPA 3PPNA 4YU0A 2OZZA 5AA2B 1B6HA 2XXWA 1I6AA 2DP8A 1EZPA 5IKBA 4IO3A 4WEDA 4QSDA 2O7IA 4BLAA 4KD5A 2NWJA 1LFGA 1XC1A 1ZJLA 4XIGQ 1QJMA 3W9WA 2X26A 2ZYKA 5FHNA 1CB6A 2VGQA 4F39A 5K2YA 2VHAA 3TTKA 4YAHX 3JYRA 2V25A 4P11A 3U94A 3DP6A 3PUVE 4NF4B 3PPOA 4YZZA 4QF9A 2HCAA 1XT8A 2O7UA 3GBAA 2DWAA 2ALUA 4PFWA 4KCDA 4M4GA 4XKQA 4PE5B 4I8CA 3IOVA 1SD3A 5I2NB 4BDNA 4ZZAA 2IA4A 3RUMA 4H5GA 3PUYE 5DEXA 4NEDA 5AA1A 1EZ9A 5F1QA 2Q9TA 4G68B 4UACA 2DVCA 2QMWA 2QS1A 4HW8A 1PC3A 2QRYA 1JW4A 1PBPA 3I6VA 1FQAA 4QFLA 2D3IA 5I57A 3THIA 4H67A 4POWA 2VD3A 2XXQA 4GL0A 2O1LA 1XVYA 3ZKLA 1PB8A 1T0KA 4HCYA 4Q30B 1DTZA 3USDA 3T96B 4L17A 1DMBA 4MFIA 3TCFA 4H65A 1B1HA 4NWCA 4OENA 5B7DA 5CBSA 3RPWA 4LONB 2Q2CA 2H5YA 1FTJA 3T9UA 3TTLA 3SERA 2B65A 5CMKA 5DVJA 4POXA 4ZEKA 1BP5A 1BKAA 1NL5A 3RN8A 4DE8A 1DPEA 4EUOA 3RT6B 3VVDA 5FTIA 1B9JA 4F18A 3H6WA 1LFIA 4KYDA 5TU0A 3FIRA 3TQWA 4YKPA 4YKJA 4QSCA 2HQ0A 4IGRA 4F22A 4ELOA 2UVJA 2Q8JA 5FHOA 2Q88A 4H6DA 3K1PA 3MVWA 1AOVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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