1MXVA

Crystal titration experiments (ampa co-crystals soaked in 10 mm brw)
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
publication title Probing the Function, Conformational Plasticity, and Dimer-Dimer Contacts of the GluR2 Ligand-Binding Core: Studies of 5-Substituted Willardiines and GluR2 S1S2 in the Crystal
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 84
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxvA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxvA01
5H8NA 4BLAA 4GIZA 4EQ7A 2O7IA 5AA4A 1DOTA 4QRZA 1GTKA 1BKAA 5AA2A 3TTNA 3QIMA 3C9HA 4NWCA 1M5DA 5I57A 5DEXA 1WODA 1LBCA 3CIJA 3SESA 4GL8A 4POWA 4Z7EA 5FTIA 4R6YA 4F2OA 1FTKA 2PVUA 5TP9A 3EHTA 1MM7A 1ZIUA 3IX1A 4KI0E 1XT8A 2QS2A 2XXRA 1JQFA 4RK2A 1OQHA 1D3KA 4ONYA 4ECFA 3QAXA 4U2RA 3KFMA 1ZTYA 4F3BA 1SI1A 1VFDA 1FTOA 4I8CA 1B5IA 1A7LA 1MY4A 3R7XA 1LFHA 5A5XA 2GH9A 3O9PA 2ABHA 1QUJA 1HSEA 3K4UA 1A40A 4NE4A 5KCJB 5KZTA 2V3TA 5H8FB 3WAEA 1MXZA 1LCTA 5CI5A 1QULA 5K2XA 4H6DA 3TTRA 3PPNA 4KCDA 3QSLA 3TQLA 1DPPA 4LATA 4Z0IA 3SERA 3VV5A 3FVNA 3PV0E 1WDNA 4BDOA 3MC2A 3TCGA 3G7WA 5CC2A 2DP8A 4R74A 5ELVA 2Q2AA 2XXVA 2ZYKA 3H3GA 4H65A 4HCYA 1SW5A 4RPOA 4G68B 4Q5TA 2XXHA 3M3KA 1IXCA 1VSOA 3MUQA 3O6HA 2XHDA 5AA4B 1OVBA 2QS1A 3FASA 4PETA 1Q1KA 1P1OA 1ANFA 5AA2B 1QJMA 1ZKBA 3TAJA 5B70A 3RUMA 4PQJA 3RTWB 3KJTA 4G8NA 1MY1A 1Q35A 5ISUA 4YKKA 4F3SA 4HCWA 3T66A 3T96B 4F1UA 2ANJA 1AIVA 2LAOA 2OWTA 4IB2A 1SQYA 3TELA 4NF6B 4ZE9A 2GRVA 4YAHX 3A3UA 3ECRA 4O3CA 5HBCA 1LAFE 3ILUB 1IZ1A 2RCAA 1YAEA 1B40A 3MWBA 3TMGA 1UTBA 2PBWA 2OWSA 1MM6A 5CM6A 3PUWE 4PP0A 3S2VA 4DCXA 1JW4A 4R6HA 4P0IA 4ND9A 4EQ9A 1QUIA 4PFWA 1ZBMA 1MDQA 5A5XB 2I4CA 2O7UA 3T9VA 4P0GA 2Y7PA 2V84A 1HSLA 3DP6A 3PD8A 2HZKA 2I48A 3B6TA 3ZSFA 3T9UA 4LVQA 1MQDA 5H8QA 5DVFA 1NL5A 4ISUA 1US4A 1H43A 4F19A 2DXYA 2BJJX 4KPTA 4YKJA 3KOSA 3FUZA 3KOTA 4UA8A 4YMBA 2HEUA 1B3HA 1MQHA 1N0TA 1RYOA 3MP8A 4U23A 3PPPA 3TPAA 1ZJLA 2VD3A 4FJPA 2O6AA 3JZJA 2ALUA 4OQOA 4YU0A 1IUDA 3VLVA 5IAIA 3Q26A 3WAFA 3I5OA 1POY1 2THIA 2GHBA 1HSJA 2H5YA 3V83A 1MY2A 3OO7A 4ZECA 2V3UA 2F35A 4YMAA 4IGRA 4XKRA 5I58B 1JEVA 4F1YA 4KYEA 5H8HB 4OXVA 4QFPA 3TODA 5I2KA 3OXNA 4NF8B 4NF4A 2UVIA 4GQOA 3FJGA 1GV8A 2DS9A 2ZNTA 4OFJA 3JYRA 1SW2A 5I59B 4YKIA 4THIA 1JVXA 1MY3A 3QK6A 4ZEKA 1SVXB 1ZLQA 3KN8A 3RGYA 5BWJA 1FQCA 2F34A 4NF5B 2QRYA 1LLSA 3S9LC 3G3JA 1ZMGA 1I6QA 3VXCA 4LQ2A 3A3CA 3K0VA 4E0XA 1LB8A 1EZPA 2Z22A 4ELQA 4C1UA 1H45A 4JBZA 3BFUA 4FIMA 4M1VA 3FVOA 2ZNUA 1IXIA 1B3LA 3LUYA 2DOJA 4XXUA 2Y7RA 1MQJA 4IY5A 3C32A 2AL4A 3MQ9A 3SETA 1B3FA 1URGA 3H6VA 4L17A 4JXIA 1SYIA 1Y4TA 2QL3A 3C34A 3MVZA 3DP8A 2PT2A 5KDTB 2ZYOA 1R6ZA 1Y3QA 3MZ1A 3EN3A 4UACA 3G3HA 3TFLA 3V8XB 4G8MA 4KCCA 4R2FA 1AOVA 2CMOA 2KLFA 5JEIA 4BDLA 4X48A 1PB8A 1MXXA 4OEUA 3TCHA 4O3AA 1JNFA 4LONB 4TLLB 4IO2A 5CRYA 2PT1A 2B3FA 1GR2A 4XTCQ 4LZ8A 3ZS6A 1FQBA 1NNPA 1PB9A 3IJOB 1MH3A 1P1QA 2RC7A 3H6WA 4IO5A 5JTYB 3RT8A 4KYDA 3U1OA 1I6AA 3L6GA 5CBSA 1MRPA 4XKQA 4ESWA 2I6EA 3T22A 2VD2A 4PFTA 3UN6A 4GVOA 3CG3A 1O63A 4GXAA 1SDXA 3BBRA 3AXFA 4OEVA 4R6KA 5EYFA 4H8JA 4PE5B 1LBBA 2XX9A 1QKAA 2H98A 4I9DA 1MQIA 4FECA 2F78A 3MVXA 3TEPA 3U8QA 3MVYA 2RC9A 1Z7ME 4ELOA 4OESA 4G8HA 4GOTA 3MPLA 4NTLA 3V5AA 4H5FA 4ESXA 2V25A 3GXAA 4ZE8A 3RPWA 1POTA 1NH7A 3G3FA 3MJNA 3OEMA 2UYEA 4RXLA 5CBRA 1IITA 4DXUA 3MVWA 3VVFA 2FYIA 1XHYA 1N3WA 3OELA 2A5TB 2Z23A 3OENA 3OEKA 5EHMA 3C35A 1UIUA 2UVJA 1JVYA 2XXPA 3IB2A 2H25A 1AH5A 3QXMA 4TQUQ 4RA1A 2Q2CA 5I56B 4WXJA 3PD9A 3E13X 2REGA 3M8UA 3CR9A 5HPQA 2AL5A 5FHMA 5AA3A 2HZLA 4U4SA 5L8DA 1SBPA 4IY6A 4P11A 3OSRA 1JW1A 3Q29A 5I2NA 1PBPA 4X1DA 1LAXA 4GXSB 3VLWA 1VE4A 4OFOA 4XKNA 1DSNA 2VP1A 2Z8EA 4ELRA 3A09A 4DIGA 4DCYA 5K2YA 1OIBA 3IO6A 1FTJA 1EZ9A 1SI0A 1II5A 1LAHE 2NXOA 2I3VA 4G77A 4C0RA 1FQEA 4U1ZA 5DVJA 4FAJA 3K6XA 1B3GA 1FQFA 4OFLA 5AA1A 3OSQA 4X9TA 3IOVA 4FEDA 4IO3A 4F31B 1S7YA 4TOZA 3R6UA 3JV9A 3LBSA 1D4NA 1B2HA 1XC1A 4N07A 3KBRA 1GVCA 5H8NB 1B46A 3C36A 2Q88A 2OZZA 3HHGA 3TUSA 2P2AA 1M5EA 3H7MA 3FVGA 1F9BA 3O6IA 5I57B 5DEXB 3G3IA 4TLMB 2X7PA 5ICQA 3KSXA 1YPNA 1QVSA 4QFOA 2V3QA 1IEJA 2F6GA 3C31A 3RLFE 2AIXA 4O3BA 4IO4A 3GLBA 2Q9TA 1BTJA 3RT6B 2QS3A 3PU5A 3CVGA 2DQVA 3USDA 2F8DA 5TP9B 3H4ZA 5ITPA 2PMSA 1YCJA 3TTLA 1AMFA 4RYAA 2O51A 1FTMA 4QFKA 2F6PA 4IO6A 3KN3A 4GLIA 4LP2B 3KGCA 3PMVA 2DYXA 2QJEA 3KSJA 3IK6B 1BIYA 4MF3A 1B32A 5BUUA 5LOMA 3DP4A 4FE8A 1MS7A 4U21A 3PUXE 4K3FA 3VLUA 3M3FA 3VXBA 1Y3NA 1TT1A 2Y7KA 3D4GA 1PC3A 1NH8A 4R9FA 2HFBA 5H8SA 1OLAA 2ZYNA 3TYHA 1P1NA 3H06B 3PUYE 4RJZA 2G93A 2ONRA 2DWIA 4KR5A 3HPIA 4IO7A 1XVXA 3PPRA 3IB0A 3KEIA 1EH3A 3CFZA 1Y20A 4OMBA 3TCFA 4MBPA 3RN8A 1QUKA 3IR1A 2H9BA 1OQGA 2UVGA 4F29A 3DELB 1B51A 3FVKA 4EXLA 4R2BA 2F7CA 5DTBA 1M5FA 4H1XA 4Q0CA 2QSXA 3O2AA 2O1MA 4YICA 1IXGA 3W15C 1Y9UA 3LR1A 4NEDA 4I62A 4DE8A 4X1BA 5CMMA 1A8EA 1NNTA 3W9VA 2XD3A 4MH5A 5J1DA 2XXYA 3N94A 4BDMA 5CMKA 1I6BA 1URDA 2DVCA 4DDDA 4U22A 4PFYA 1YTVA 4YB7A 3B7DA 3O28A 4OVJA 3IOTA 4I1DA 2NOOA 1QKBA 1XOCA 3MP1A 1P1UA 2YPNA 2R6GE 4GF8A 4OETA 1NFTA 4MLVA 2RINA 1UTBB 4C1TA 5DYHA 3EPEA 1B0HA 3MAMA 4G4PA 1AL3A 3T9XB 1KWHA 4N6PA 2G29A 2DE2A 2AYSA 1LFGA 1PEBA 1R1NA 1LSTA 5DT6A 4OWDA 4QFLA 1SYHA 3U72A 2VOZA 2NVUB 3HHFA 3IJXB 1H3DA 4JSDA 2R71A 2Y84A 4FORA 4QF9A 1H44A 2E0SA 5H8QB 4NWDA 2CZLA 1MXYA 2VHAA 4ZEBA 1T0KA 1B4HA 1RYXA 2P1SA 3N6UA 1A99A 4DXBA 3OOAA 3EHUA 2OBGA 3DLNA 3VE1B 1FW0A 3SDFA 2XX7A 1USYE 4H0WA 4H67A 3MW0A 1DTZA 2GFEA 4LZ7A 4ZEDA 2PYYA 4G68C 1B1HA 4R73A 1J1NA 2QMXA 3RQTA 3K6WA 1A54A 2HCAA 2XX8A 4G2ZA 1GGGA 3CRBA 5IKBA 2RCBA 1UIVA 1MPBA 4GRKA 2XXXA 3LSXA 3Q27A 5FHNA 2GHAA 2OLBA 5F1QA 4OZ9A 4BDRA 1MQGA 5I2KB 3D4CA 4NF4B 1B6HA 2I3WA 4RPNA 1SD3A 1WVJA 3TZAA 3K1PA 1B58A 2REJA 3HO7A 5KCJA 2ZMBA 5H8FA 1N76A 3IB1A 2O1LA 4ZEIA 2F7BA 1O7TA 4GWOA 2DXRA 1M5CA 3N6TA 4AB6A 1A55A 1IXHA 1N7XA 2I49A 2XXWA 3VVEA 3IOWA 1DMBA 2DWJA 2IA4A 4JDFA 5ITOA 2I4BA 4U1OA 4AB5A 1A8FA 2HQ0A 2ZXTA 4LA9A 1LCFA 3Q28A 1B3EA 2HXWA 1EU8A 4KYSA 1B5JA 4BDQA 3E4RA 4GFRA 1BP5A 3LSWA 3K02A 4YB6A 4POXA 4XIGQ 2NUVA 1XS5A 3IO4A 1MXVA 3QUJA 2H99A 3SEUA 2P0SA 4R72A 3ZKKA 1DTGA 2XXUA 3GZGA 3OMBA 1EZOA 2IEEA 2O69A 3MZBA 4F1VA 3EHSA 2ONKE 3BKIB 2XXTA 3L6HA 1NKXA 1TWYA 3TKDA 4OTEA 4NF6A 1B05A 2D5WA 4F2QA 1R9LA 4Q8RA 1MXUA 2UYFA 4KHZE 2I58A 4JSOA 4WEDA 3O29A 2DWAA 2XXQA 3F11A 1XVYA 3K1NA 4LUBA 4RK9A 3IL1B 4F22A 2Y7IA 4RNSA 3PMWA 1UTHA 4QSDA 3GBBA 5CMCA 3EF7A 1B5HA 3VVDA 2Z8DA 4ELPA 1SW4A 4N13A 1B4ZA 3ODBA 4YZZA 1TFDA 4QSEA 3OD7A 4RY1A 3KJ7A 3CSBA 1M5BA 4JWOA 3KN7A 2I0BA 3UK4A 3ZKLA 4GL0A 2D3IA 3FD3A 3CFLA 5HM4B 3TDJA 1NNKA 1MPDA 3B6QA 1D9VA 3UP9A 4MLQA 1I69A 1ELJA 3FV2A 2F97A 3C33A 3PPQA 3FJMA 5L9SA 4H5GA 2Q89A 4FEBA 3HV1A 2DE3A 1PDAA 1CB6A 3O66A 3S9MC 3G3KA 3CG1A 4XKPA 3OO9A 4QFNA 2F36A 3O97A 4OYVA 1N7WA 4DXCA 5L9MA 3K2DA 3VDFA 3I3VA 3OO6A 4EXKA 1LFIA 3H03A 4OERA 1D9YA 2QPQA 3K00A 5B7DA 4DZ1A 1CE2A 3CFXA 3TTMA 4LQ5A 3UGWA 1VR5A 2R9JA 3PPOA 1USYH 2XXIA 3UIFA 2UVHA 5I58A 4NMYA 4JWYA 4JWXA 3OO8A 1B0LA 5L9OA 5JK4A 5H8HA 1Y3PA 5TU0A 4YKPA 2UXAA 2B65A 4NF8A 5TPAA 3HN0A 4EQBA 2NWJA 3M3LA 3FJ7A 2Q8JA 3P7IA 5I2NB 1OMPA 3SEVA 2ONSA 1UTHB 2RKMA 3VFJA 3H6UA 3IORA 4JB7A 4M4GA 5I59A 3T9HB 3V89B 2O68A 3E9XA 3MP6A 3PUZE 3IAZA 4NF5A 3FV1A 3HCQA 2F5XA 3N26A 5AE4A 3EQ1A 1S9TA 3ILTB 3UORA 3PGFA 1UQWA 4HS7A 5AA2D 4ZZEA 3B6WA 3K1MA 3SEWA 1MY0A 3PUVE 2FA7A 3K6VA 3TQWA 3H6TA 3CSGA 3S4UA 3LSFB 1Y1MA 5KDTA 5M2VA 2OJTA 4HW8A 5F7VA 5I84A 3QUFA 2WKYA 1MPCA 2B3BA 4FATA 2DVZA 3MZ9A 1H76A 2I0CA 3FXQA 2RF1A 3HSTA 1PBQA 2X7QA 3E3KA 1P99A 3U92A 4AQ4A 2YJPA 5FHOA 1Y4CA 2H4IA 3BFTA 1IIWA 2HAVA 1FTLA 3FATA 2OK2A 2M8CA 2E1SA 1ATGA 1OVTA 3SEXA 2XD2A 5ICTA 4QSCA 3KG2A 3IOUA 4HTGA 4GD5A 5JTYA 3FZVA 3KZGA 2V93A 1B52A 5CMBA 1B7HA 1MG1A 4PFUA 1O64A 5TPAB 3RY3A 4QHQA 2ESNA 3SEYA 3FXRA 3QYTA 1MXWA 4EDPA 1QW0A 3THIA 3S9NC 3R26A 4R75A 1PB7A 1MDP1 3S9EA 2YLNA 2DWHA 3FXUA 3FIRA 1URSA 3TTKA 3UA8A 1R9QA 1NNFA 1TXFA 2QS4A 3MPKA 3O6GA 1L5TA 1DPEA 2W7YA 3MBPA 5FTHA 3DM0A 4KFQA 1MH4A 3RNNA 4F18A 1LAGE 4U4XA 1N04A 1JETA 4KD5A 2O84X 1VFEA 3Q25A 1N84A 1FQAA 2FNCA 1Z7NE 4ZZAA 4WKMA 3RTFB 4H8IA 2Y7WA 3G3GA 4R9GA 2A5TA 1B1XA 4KQPA 4LZ5A 2F7AA 3K01A 3K6UA 1US5A 2Z8FA 2ZNSA 4DLDA 3T93B 1LB9A 1B7UA 1N3XA 3SKPA 4YB5A 4F3PA 3FGSA 1P1WA 3N5LA 3I6VA 2X26A 5I56A 4EUOA 4F39A 1Y1ZA 2QMWA 4EF1A 4ZDMA 4MFIA 2D21A 1NMUA 4BDNA 4ZS9A 1LGBC 1JW5A 2VGQA 3U94A 2RC8A 1OLCA 3W9WA 3ONMA 5EHSA 4F3GA 1B7ZA 5DVIA 1IQ7A 1TFAA 2A5SA 4ZEFA 1RKMA 1FCKA 1JEUA 4OENA 4EF2A 1SW1A 1ZU0A 2DSFA 4IGTA 3C4MA 4Q30B 2HAUA 2ZYMA 2OCUA 3LSLA 3CI8A 4E0WA 2PX1A 3GBAA 2DE4A 1FQDA 4WEPA 3PMXA 4G68A 4OHNA 1BLFA 1B9JA 3LC8A 1S50A 3U93A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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