4YKIA

Mnemiopsis leidyi ml032222a iglur lbd glycine complex
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
247
structure length
247
Chain Sequence
LIGRHLRLGSVEEQPFMFFATEGCEGNDCWSGMVNDMVVKLSEDLGFTYEYIQPDDRKFGALNKTTNEWNGMIRDLLDDKTDMIAIDLSTNSARKSAIDYSFPFMDAGIKAVVKGEGTTLNQVLELLDQDKYKWGVIGSRHPETLLKTHRDSRYSRLVDEGVELKDLNHAIETLRGGLFVFIDEGPVLAHNLISDCDVFSVGEEFQSFEYAFGLPKDSPYKSLIDSHLLKFREEGFIDILWEKWSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Glycine activated ion channel subunits encoded by ctenophore glutamate receptor genes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ML032222a iGluR
molecule tags Membrane protein
source organism Mnemiopsis leidyi
total genus 79
structure length 247
sequence length 247
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-03-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10613 Lig_chan-Glu_bd Ligated ion channel L-glutamate- and glycine-binding site
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ykiA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ykiA02
3IOUA 2ALUA 3RTFB 4EF1A 1II5A 2NUVA 3BKIB 4X1DA 2ZYOA 5CMCA 3MVXA 5IKBA 2I4BA 4YMBA 4AQ4A 3OXNA 1SW1A 1JW4A 2D21A 4NEDA 5KZTA 4F2OA 3MAMA 5DVJA 4NWDA 4JSOA 3FJGA 2NVUB 3VDFA 3CIJA 1Q1KA 1TWYA 4KCDA 3V89B 1CB6A 2RF1A 4G68C 4IO7A 1MXUA 1EZ9A 2O69A 4ESXA 1P99A 1B9JA 4DLDA 3HPIA 4MLQA 1XVXA 1L5TA 2CZLA 2XXYA 2DYXA 4HS7A 5FTHA 5CM6A 4K3FA 4PFTA 4TQUQ 2ZYKA 4ELQA 3HHFA 2A5TB 1OLAA 3QUFA 3OENA 1LCFA 5I58B 1QUKA 4GFRA 1A99A 4H6DA 1MXYA 3PUZE 3UK4A 3LBSA 3FATA 3WAFA 3B7DA 4N07A 3C35A 3TEPA 1NH7A 4ISUA 1JVYA 4ZEDA 4R2BA 3MC2A 3L6GA 3SEYA 1S9TA 1UTBB 4QSEA 5KDTA 2VHAA 2XX9A 3OO9A 4GLIA 4WKMA 1TFAA 3S9MC 1OIBA 4NF6A 1WODA 1BLFA 1PBPA 3PD8A 2DWIA 1GVCA 1QKBA 1IIWA 3MVYA 4BDOA 3PD9A 3SEXA 4OHNA 4JWOA 1GTKA 1OQHA 2DE4A 4AB5A 4F1UA 3GXAA 3IK6B 1YTVA 2HZLA 3M3LA 3EQ1A 5EHSA 3K0VA 4RK9A 1H43A 2DWJA 5AA4A 5CRYA 4QFNA 1PB8A 4XIGQ 3P7IA 4I1DA 5L9MA 4LVQA 1ZKBA 4E0XA 4LZ5A 3TQLA 2QRYA 2DE2A 3IR1A 3QUJA 4NF8A 3RY3A 4UA8A 4GD5A 1MY0A 2GFEA 1EU8A 4YAHX 4KYEA 2O51A 1QUJA 2GHBA 1D9YA 4H1XA 3KN3A 4KCCA 3TTKA 5CBSA 1Z7ME 4F3PA 4BLAA 4IO4A 1P1WA 3CG3A 4EQ9A 1MY3A 5AA3A 1P1NA 1ZLQA 3W9VA 4Q8RA 2OLBA 2ONSA 4F39A 1T0KA 2Y7IA 4TLLB 3IX1A 4ZEKA 1SYIA 2UVHA 3TMGA 1B3HA 4XKPA 3DM0A 2XD3A 1FCKA 3H03A 4C1UA 1Y3NA 2H4IA 4H65A 4N13A 3KG2A 1TFDA 3SESA 3UA8A 1B0LA 3OD7A 4OQOA 2ZNSA 1B6HA 4LQ2A 2PVUA 2CMOA 3DP6A 4ECFA 4YB5A 2I49A 4YKKA 4GXSB 4U21A 1B58A 3TCHA 4I62A 2YPNA 3I5OA 3H6WA 1ZIUA 4KYSA 1MY4A 4NF4B 3CSGA 3ILUB 4DZ1A 3PU5A 4F22A 3MUQA 2UVIA 1PBQA 2XXTA 4POXA 4JBZA 4H0WA 4R75A 1QUIA 1Y9UA 1A8EA 3G7WA 3H06B 3HSTA 3VE1B 2V84A 3CFXA 3ZSFA 4H5FA 1QVSA 5ELVA 4F2QA 1SBPA 3LC8A 5AA2A 2GRVA 3DP4A 2H98A 3T93B 2ZNUA 5H8NB 5EHMA 2Y84A 4QF9A 1RYXA 3U93A 4OFLA 2M8CA 5CC2A 2Q88A 2F78A 5AA1A 1R9LA 3KOSA 3EHSA 4MBPA 2QMXA 2F34A 3EHTA 2QS4A 4OMBA 1VFEA 1BP5A 4XKRA 3HN0A 3GZGA 1J1NA 3PPNA 4LZ7A 1H45A 4NF5B 3A3UA 5I2NB 5TP9B 1QW0A 4NMYA 1EZOA 4MF3A 4H67A 3ZKKA 2ZYNA 2F5XA 4U4XA 5FTIA 1SW4A 1KWHA 3SKPA 1AL3A 5ITPA 2V3TA 5FHMA 4N6PA 3MW0A 1DOTA 4WEPA 5DT6A 1B5HA 4GWOA 5I84A 3E9XA 3I3VA 2ANJA 4HW8A 3RN8A 3T22A 3CFLA 1DTGA 3TUSA 4KYDA 4EXLA 1Y20A 1SD3A 3TQWA 1YPNA 4ZEBA 2REJA 4C1TA 3LSLA 1QULA 3IJOB 1B46A 1A7LA 3FZVA 3O9PA 2F6GA 3TELA 1MRPA 2F7BA 2LAOA 1B3FA 2PYYA 1Y1ZA 1GV8A 4DE8A 3HV1A 1B2HA 4X1BA 3FXRA 4Q0CA 3PPPA 3TTNA 1OQGA 3EHUA 2HFBA 4LQ5A 4ZE8A 2ESNA 2DE3A 3VLUA 1B32A 3N94A 1MH4A 4MLVA 1QKAA 4QRZA 2PMSA 3N6TA 1LFGA 4OESA 5L8DA 2R9JA 3MBPA 3TTRA 3R26A 4F3SA 4Q5TA 1Y3PA 3U94A 2Q2CA 4XTCQ 3FXQA 3CSBA 4XKQA 3O6GA 4GIZA 3RUMA 3O29A 2O6AA 2V93A 1MXWA 3MJNA 4ONYA 3FV2A 4I8CA 2A5TA 3G3KA 4U1OA 3AXFA 4THIA 4KQPA 4RXLA 1TXFA 1SW5A 3T9XB 1LBBA 3Q25A 4P0GA 4WEDA 5I58A 4JSDA 4JB7A 1US4A 5H8QB 2VD2A 1US5A 4F1VA 4QFLA 3PUVE 1ELJA 3ILTB 4H8IA 4EQBA 4TOZA 2I3VA 4POWA 1FTOA 1XVYA 3MWBA 3PGFA 4KI0E 1UTBA 4KPTA 4LZ8A 5H8SA 1IXHA 3FD3A 2OK2A 4RY1A 4ZZEA 4H8JA 1JW1A 1FQCA 4KHZE 3QYTA 5I59B 1POTA 1SI1A 1UIUA 4ZS9A 3G3FA 2RC8A 3GBBA 3MQ9A 1LAGE 3MZ9A 4YB7A 1PC3A 1POY1 4M1VA 2OBGA 2UYFA 3RT6B 4ESWA 3H7MA 1M5BA 4QHQA 3MPLA 1ZU0A 3PPOA 3CFZA 4I9DA 5HM4B 1LFIA 3RTWB 3KGCA 3EF7A 3L6HA 4FATA 4ZDMA 1AIVA 2B3FA 5AE4A 4BDRA 3TCGA 5TU0A 5ICTA 1H76A 2Q89A 2YLNA 4OETA 5I56B 3TAJA 3K6UA 2H99A 3K00A 1MDQA 1P1UA 4TLMB 3FV1A 1N76A 2Y7KA 3DLNA 1MXXA 3TDJA 3SERA 5A5XB 3WAEA 4MFIA 2V3QA 3FVGA 1SI0A 1HSJA 3A09A 3FGSA 1MXVA 2DXRA 3O97A 2XXXA 1MPDA 4ELOA 2UXAA 1N0TA 1B7HA 1PDAA 3KBRA 1B4HA 3FJMA 3K4UA 3TODA 3IORA 3K1NA 4DDDA 3ZKLA 1OVTA 3PUXE 3HO7A 4G8MA 1D4NA 1B5JA 5DVFA 3PMVA 1XS5A 1JETA 1SW2A 2A5SA 2QMWA 4QSDA 1BIYA 2DOJA 4HTGA 3IL1B 2D5WA 4ZEIA 2Y7RA 2RC7A 1A55A 3RT8A 3Q26A 1M5FA 1DMBA 3EN3A 4GVOA 2Z8EA 2QS2A 4DXUA 2THIA 2X7QA 2Q2AA 2VGQA 1DPEA 1IITA 1Y4TA 1FQDA 4JWYA 2X7PA 1MPCA 1XHYA 2HAVA 2O1LA 3MZBA 1LAFE 4IGRA 1SDXA 3OELA 1MQJA 2UYEA 1SQYA 3ECRA 3MZ1A 3W15C 5KCJB 3K6VA 2B3BA 2Z8DA 3OO6A 4FIMA 1H44A 1B1XA 2RC9A 1N3XA 4NF4A 4UACA 3O66A 4IGTA 1FQAA 1I6AA 1P1OA 2FNCA 3CR9A 1JQFA 3K6WA 2R6GE 1LBCA 3G3HA 5ISUA 1OVBA 3VXBA 4E0WA 3LSXA 1B4ZA 2W7YA 1B1HA 3IO6A 3QSLA 1YCJA 4WXJA 2OJTA 4DXCA 1LAHE 4XXUA 5H8FB 1OLCA 3N6UA 1R1NA 1B40A 3QAXA 2AYSA 3GLBA 4JWXA 4PFUA 3K1MA 3BBRA 1Y4CA 2P2AA 1FW0A 5H8NA 3RPWA 3VLWA 3C4MA 3RGYA 1MPBA 5HBCA 3A3CA 2I0CA 4R6KA 4OTEA 1N3WA 4GL0A 2DQVA 4X9TA 4OWDA 3S4UA 4OVJA 2AIXA 4GOTA 2P0SA 3CI8A 3PPRA 5I2KB 1A8FA 4OEUA 3IOTA 4NF5A 5I2NA 5TP9A 2F97A 3VXCA 4PFYA 4P0IA 1EZPA 3O6IA 3M3FA 1S7YA 4OENA 4YU0A 3C36A 5H8HB 1VSOA 5JEIA 3SDFA 3C31A 3SEWA 3TTMA 1MQHA 1O7TA 3PV0E 2O7UA 3KJTA 3MVZA 2I48A 2XX8A 1B0HA 1A40A 4OYVA 1JEUA 1QJMA 5TPAB 3USDA 3FVNA 5FHOA 4PE5B 4YKJA 3I6VA 1Z7NE 4GXAA 1MY2A 2DP8A 3OOAA 4G68B 1HSLA 3V5AA 3LSWA 3D4GA 1WDNA 2ZYMA 3G3IA 3LSFB 4FORA 1MDP1 3H4ZA 1O64A 3KN8A 3TKDA 3TYHA 3LR1A 3DELB 2F35A 5I57B 4RPNA 2NXOA 1N84A 3V83A 1UTHB 1S50A 2E0SA 4IY6A 4ZECA 1NNTA 2DS9A 1ZMGA 4DXBA 4F31B 3TCFA 4G77A 1GR2A 1O63A 3FVKA 3TTLA 3R7XA 1XOCA 3IB2A 1PB9A 1FTJA 4FEBA 1NNPA 5BWJA 4R9FA 2R71A 4HCYA 4R72A 5DEXB 3PUWE 3FXUA 2F7AA 3KJ7A 3T9UA 3OO7A 5H8QA 1FTKA 4GL8A 3RQTA 1TT1A 3FIRA 1LB8A 2QSXA 4PETA 3IO4A 4GQOA 3T96B 4ND9A 4U1ZA 2HZKA 4R2FA 4LATA 1MQIA 1F9BA 3T9VA 3OEKA 4FAJA 4LP2B 1Q35A 2I58A 1Y3QA 5DYHA 4DCYA 3JZJA 4IB2A 2DVCA 5ICQA 4R74A 4XKNA 3TPAA 3N26A 1N7XA 1R9QA 4RK2A 5I59A 2RINA 4NWCA 1B7UA 1AMFA 3HHGA 1JEVA 3GBAA 1B05A 5EYFA 2RKMA 5B70A 3S2VA 2VD3A 4QFOA 1M5DA 2ONKE 3N5LA 1GGGA 4ELPA 1B3GA 1MQGA 1BKAA 1DSNA 2PBWA 5JTYB 2PT1A 3S9NC 2XXUA 4FEDA 4G2ZA 1D3KA 2QPQA 4G8NA 1HSEA 3IOVA 2XXIA 3SEUA 3UN6A 1B5IA 2VP1A 2V3UA 4JXIA 5F7VA 4YZZA 4F3BA 5JK4A 2HCAA 3FVOA 3FUZA 3Q28A 2OCUA 5I56A 1MG1A 1Y1MA 2H9BA 1PB7A 1P1QA 1EH3A 3LUYA 4O3BA 1LB9A 2AL4A 1B52A 4EXKA 3QK6A 4QSCA 3M8UA 2ZNTA 3VLVA 3VVEA 4EUOA 2NWJA 5A5XA 4RA1A 3U1OA 4R6YA 3OSRA 3B6QA 2XD2A 2O1MA 3B6WA 2UVJA 2QS1A 3RNNA 2DXYA 1DTZA 3FJ7A 4R73A 2B65A 5AA2D 3H6VA 4OERA 1MM6A 4FECA 1H3DA 5CMMA 3E13X 2O84X 4LA9A 2GH9A 2REGA 1NH8A 1USYH 2RCAA 2OZZA 1CE2A 2X26A 4U22A 4YKPA 1MS7A 4OXVA 4EF2A 4KR5A 4R9GA 3C34A 4O3AA 3B6TA 3PMXA 1VFDA 2IA4A 3O2AA 4G8HA 5LOMA 2QS3A 2QJEA 2KLFA 1N04A 2Z23A 1M5CA 1R6ZA 2PX1A 3MVWA 3S9LC 3E4RA 5IAIA 3C32A 4OEVA 3E3KA 3TFLA 4BDMA 1MH3A 5KCJA 4YKIA 3QIMA 3UIFA 3HCQA 4G4PA 2WKYA 3O6HA 1RYOA 1NFTA 4FE8A 2XXRA 3U92A 4F3GA 5ITOA 3Q29A 2YJPA 4BDQA 1NNFA 3O28A 5CMBA 2H5YA 1ZTYA 3ZS6A 2E1SA 3IJXB 2O68A 2P1SA 4NE4A 5L9SA 3KSJA 2F8DA 5L9OA 3SEVA 3OMBA 3VVDA 4Z0IA 1A54A 4GF8A 2Y7WA 1SYHA 4IO3A 1XT8A 1WVJA 2G29A 3RLFE 1NMUA 1ANFA 2I4CA 1LSTA 2NOOA 1I6QA 5H8FA 5FHNA 1JNFA 1VR5A 2IEEA 2O7IA 3CRBA 5DTBA 5B7DA 1IEJA 1IZ1A 1PEBA 5KDTB 3BFUA 3FASA 3MP8A 3OEMA 1USYE 3OO8A 2DWAA 2I0BA 3K6XA 5CI5A 3VVFA 4U4SA 4NF6B 5J1DA 5I2KA 2XHDA 1URSA 3UORA 1B7ZA 3IB1A 4LUBA 4MH5A 1XC1A 4AB6A 5CBRA 2G93A 1I69A 5DVIA 2OWSA 2XX7A 2GHAA 2DVZA 4RJZA 3C9HA 1IXGA 5H8HA 5K2YA 2ONRA 2F36A 4O3CA 4F29A 4YB6A 3TZAA 2RCBA 1LFHA 4NTLA 2HXWA 4H5GA 5F1QA 3MP6A 4F19A 5AA4B 1RKMA 1FTLA 2F6PA 3H6UA 3EPEA 3DP8A 1YAEA 2BJJX 3OSQA 1I6BA 1DPPA 3K1PA 4IO6A 4ELRA 5TPAA 2I3WA 2Z8FA 3PPQA 1ATGA 2VOZA 4NF8B 2V25A 4YICA 5BUUA 2FYIA 3U8QA 3MP1A 5HPQA 4DIGA 4IO5A 4G68A 4EDPA 3T9HB 1M5EA 1UIVA 3M3KA 3KZGA 1NNKA 5I57A 4BDLA 4PQJA 1UTHA 3S9EA 3KOTA 2XXQA 4C0RA 3JYRA 3R6UA 2Q8JA 4JDFA 4F1YA 4GRKA 3PUYE 2I6EA 4DCXA 3KFMA 1ZBMA 4OFOA 1B51A 1MXZA 4U23A 5DEXA 4Z7EA 1IXCA 1LGBC 3U72A 1LCTA 3KN7A 4X48A 2XXPA 4R6HA 3VFJA 4ZEFA 1UQWA 3W9WA 1IXIA 3CVGA 1D9VA 2PT2A 2HAUA 2ZXTA 3G3GA 2H25A 3UGWA 4OFJA 4QFPA 1N7WA 2FA7A 2HQ0A 3K2DA 4RNSA 1JVXA 2Y7PA 4EQ7A 3KSXA 3D4CA 3K02A 4PFWA 4P11A 2D3IA 4RPOA 1LAXA 1MQDA 1MY1A 4OZ9A 2DWHA 2XXWA 4RYAA 3V8XB 3MPKA 2QL3A 3Q27A 3KEIA 1IQ7A 1IUDA 3G3JA 4F18A 3PMWA 4IY5A 1ZJLA 3BFTA 5JTYA 5CMKA 3IOWA 4KD5A 4IO2A 1B3LA 3THIA 1B3EA 1SVXB 4YMAA 1JW5A 3ONMA 4PP0A 5AA2B 4KFQA 2DSFA 4HCWA 2AL5A 4U2RA 5M2VA 1NKXA 1FQEA 1FQBA 2OWTA 3CG1A 2ZMBA 4FJPA 1AH5A 1VE4A 3ODBA 1MM7A 4M4GA 1AOVA 4ZZAA 1FQFA 3C33A 3K01A 3T66A 3SETA 1OMPA 3H3GA 2ABHA 3H6TA 3VV5A 2Q9TA 1URGA 2XXVA 4QFKA 2Z22A 4BDNA 3IAZA 1URDA 2HEUA 4ZE9A 1BTJA 4L17A 4LONB 4Q30B 3JV9A 2F7CA 3QXMA 3UP9A 3F11A 3IB0A 5K2XA 2XXHA 2UVGA 1LLSA 1FTMA 1NL5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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