4YKIA

Mnemiopsis leidyi ml032222a iglur lbd glycine complex
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
247
structure length
247
Chain Sequence
LIGRHLRLGSVEEQPFMFFATEGCEGNDCWSGMVNDMVVKLSEDLGFTYEYIQPDDRKFGALNKTTNEWNGMIRDLLDDKTDMIAIDLSTNSARKSAIDYSFPFMDAGIKAVVKGEGTTLNQVLELLDQDKYKWGVIGSRHPETLLKTHRDSRYSRLVDEGVELKDLNHAIETLRGGLFVFIDEGPVLAHNLISDCDVFSVGEEFQSFEYAFGLPKDSPYKSLIDSHLLKFREEGFIDILWEKWSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Glycine activated ion channel subunits encoded by ctenophore glutamate receptor genes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ML032222a iGluR
molecule tags Membrane protein
source organism Mnemiopsis leidyi
total genus 79
structure length 247
sequence length 247
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-03-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10613 Lig_chan-Glu_bd Ligated ion channel L-glutamate- and glycine-binding site
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ykiA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ykiA02
1N3WA 2XX9A 5ISUA 5B7DA 4F1VA 1B0HA 4NWCA 2O69A 5L9MA 5EHSA 2ZNSA 4EF2A 3P7IA 2H25A 5DYHA 1ZLQA 4JB7A 3ZSFA 4DE8A 3VXBA 3KN7A 2XXHA 2V84A 3H03A 4LQ5A 4BDRA 1M5CA 3O66A 4ONYA 3KN8A 4KHZE 2I49A 1MPDA 2OCUA 4R2BA 5KCJB 3K6UA 2UVGA 2VOZA 5DVIA 1MQIA 1DMBA 2I3VA 1MQDA 2F8DA 5DVFA 3C32A 4QFNA 4TQUQ 1OVBA 3HHGA 2OBGA 1UQWA 5TP9B 1URGA 4NF4B 1OVTA 4Q0CA 4ZEBA 3K6VA 2HQ0A 5KDTA 2DOJA 3C4MA 2DQVA 5FTIA 1MY0A 2X7PA 1NKXA 3FVKA 4RK2A 2FYIA 3USDA 3ZS6A 4PE5B 4GF8A 4R75A 3C35A 1JNFA 3IK6B 4C1UA 4KD5A 4F31B 1FCKA 4GD5A 1RYOA 3FJGA 1URSA 2UYEA 2PT2A 1DPEA 3IORA 5DVJA 1LAXA 4QFOA 4P11A 3ODBA 4U22A 2XHDA 2Y7KA 3G3GA 2OWSA 1R9QA 3PD8A 3FGSA 4YU0A 1Z7ME 3O6GA 1EZ9A 1Y4CA 1DTGA 1JW4A 2OJTA 4OHNA 3TZAA 3SKPA 3SEWA 1HSEA 4O3BA 3MVWA 2VD3A 3QAXA 2HXWA 1XVXA 4EUOA 3FVOA 4FATA 4M4GA 3TAJA 3K02A 1ZU0A 3QXMA 5HBCA 4LZ7A 4G4PA 2DWJA 4BLAA 4YZZA 2O7UA 4GIZA 4THIA 5I57B 5DEXB 3KSJA 1XS5A 1MY1A 4G77A 5AE4A 1VE4A 2Q2AA 3FXQA 1QKAA 4PFWA 3PPRA 1BP5A 3JZJA 4FE8A 3OSRA 4R2FA 1OQHA 3MVYA 3E4RA 1US4A 1VFDA 1IQ7A 1OLCA 3G7WA 1LB8A 3KFMA 3TCFA 4OERA 2AL4A 4RPNA 4F19A 2OK2A 3OO6A 1MXUA 2ALUA 4M1VA 3FJMA 2VHAA 3QUFA 3TELA 2QS2A 1LAFE 5H8QB 2F7AA 2OLBA 4EQBA 5I56A 3T9UA 1B32A 4FORA 2AL5A 4NF8A 3EN3A 4ZDMA 1IIWA 1ZTYA 2UVIA 4HCYA 4ISUA 4POXA 1P99A 4MFIA 4X48A 1MRPA 2PT1A 1MXVA 2Z8EA 1NL5A 4F1YA 4NF6A 4C0RA 1B1HA 4O3CA 1NNKA 2O1MA 1PB7A 1PB9A 2DE3A 3RPWA 3OENA 3ZKLA 3TDJA 2RC7A 3CRBA 1BLFA 3OO7A 4MH5A 1N3XA 2I0BA 4IO2A 3QUJA 5B70A 3MC2A 4JWOA 3C33A 2A5TB 2GH9A 3FUZA 2F7CA 2XXXA 2R6GE 3ONMA 4XKQA 2QSXA 2ESNA 3E3KA 3CG1A 1MDQA 1N04A 3C31A 4ZZAA 2DWIA 1D9VA 1UTBB 3E13X 1ZIUA 2RINA 4OVJA 3A3UA 2ZMBA 5ITOA 4F3SA 4QF9A 3PPQA 1Y4TA 2Z23A 2Y84A 3FZVA 4U1ZA 2XXIA 4X1BA 4G68A 3S9NC 3K1MA 5CI5A 2I58A 1IEJA 1FTKA 2V3QA 3MPLA 1DPPA 2ZYKA 4OEUA 5I2KA 3LR1A 1D4NA 4QSEA 1QULA 5EHMA 4HCWA 1EH3A 1LAHE 3CFXA 2I48A 3U8QA 1P1WA 1SI1A 4OWDA 4UACA 3G3FA 5TPAA 2YPNA 3SESA 1JVXA 3R7XA 4KCDA 3CI8A 4DXBA 1ELJA 1B3HA 2GRVA 4F1UA 4LUBA 3OO9A 2QS1A 4X9TA 4OFLA 4H5FA 3FVNA 2ONSA 4G8MA 1BTJA 4DLDA 4XKRA 1AIVA 3MW0A 1MM7A 4FJPA 3EPEA 4QFPA 1A8FA 5I59B 3I5OA 4ELRA 1PC3A 4RPOA 5CRYA 1MPCA 3SEYA 3WAFA 2XX8A 4AQ4A 2XXYA 3OOAA 3PMVA 3BBRA 1POTA 1LGBC 2DWHA 4Q5TA 1QVSA 2O1LA 3G3JA 4XIGQ 1JW1A 3JV9A 4AB5A 3VFJA 1SI0A 2XXPA 4F3BA 2H99A 3B6WA 4OTEA 4RYAA 3FVGA 1JQFA 4R72A 3CFZA 1MM6A 3VLWA 3K1NA 1R9LA 3TKDA 1L5TA 3SETA 4JSDA 4U21A 2BJJX 1WODA 1CE2A 4ZEKA 1B9JA 3W15C 1LCFA 1US5A 1EU8A 2ZYMA 4OESA 1FQAA 4FECA 1LCTA 3O29A 4LVQA 1GR2A 2B65A 1B7UA 1M5DA 2G29A 4EDPA 4UA8A 5KCJA 2Q89A 2PX1A 4ZE8A 2H98A 1D3KA 4PP0A 2QS3A 3PGFA 1LBBA 1SW1A 3K2DA 1FQEA 3RNNA 3IR1A 3FD3A 1SYHA 5TP9A 4P0IA 3TQLA 3IB1A 4NF4A 3C34A 1B2HA 4F39A 1JVYA 5BWJA 2UVJA 2P0SA 3IB0A 2RCBA 3FV2A 3PUWE 4KQPA 5J1DA 3PMWA 5L8DA 1POY1 3T93B 2REJA 2UYFA 5H8HB 4E0WA 5H8FA 4DCXA 4PQJA 4GL0A 4U1OA 3G3HA 4HTGA 4NEDA 5IKBA 4DXCA 4EQ9A 3CIJA 4G68C 3T9XB 3PPPA 4Z7EA 5TU0A 3OXNA 4TOZA 4PFYA 1QKBA 1B40A 5AA2D 2O7IA 1MY2A 4N13A 1N0TA 4RNSA 3SERA 4R9FA 3S4UA 1LSTA 1RKMA 1Y9UA 3THIA 4QSDA 3MQ9A 3OD7A 4ND9A 4R6KA 3CG3A 3HO7A 3N26A 1FQCA 1SW5A 2HZKA 1P1QA 3KJ7A 3PU5A 5JK4A 3H3GA 2IA4A 4U4SA 2E1SA 1B52A 1SW4A 3ILUB 2Q8JA 3IO4A 1B51A 3U72A 1F9BA 3K01A 4BDNA 2H4IA 3VXCA 3KG2A 2DP8A 1LFGA 2LAOA 4G2ZA 4BDQA 3O6IA 4NF5B 4YAHX 2VGQA 5I57A 5DEXA 2QJEA 5HM4B 4N6PA 3DP8A 4GOTA 3VVEA 4OFOA 1MY4A 3E9XA 1P1OA 1OIBA 4KR5A 3TTRA 4YMAA 3GBAA 2YJPA 4QFKA 1B58A 2ZYNA 2O68A 5LOMA 1IXCA 2G93A 1B7ZA 3O6HA 4IO5A 1ZMGA 2DE4A 3K6XA 1YCJA 1Y3PA 1B3GA 3FV1A 4H65A 3GZGA 1SVXB 3DELB 5H8QA 3T22A 1SDXA 2O51A 2ABHA 4OXVA 2PVUA 4FEBA 4TLMB 2F6GA 1Y1ZA 3GLBA 3Q26A 3N5LA 3PUZE 3D4CA 1ATGA 3UP9A 2A5SA 3EF7A 1B4HA 2DSFA 4ZEIA 2GHAA 4H1XA 4MF3A 4ZE9A 4Z0IA 1LLSA 4YB6A 3V83A 2ZNUA 4GFRA 3R26A 4LZ8A 4FAJA 1NNPA 3H7MA 4LQ2A 1VSOA 2THIA 2KLFA 3TTNA 5I58B 1IITA 1GTKA 5AA1A 2F6PA 3MAMA 2A5TA 1EZOA 4EQ7A 2XD2A 3SEUA 3BKIB 3O9PA 3K00A 3UORA 1DSNA 3QYTA 3F11A 3MPKA 1B3LA 3H6TA 4BDMA 5JEIA 1B6HA 1MQJA 4E0XA 2V3TA 4DZ1A 1I69A 4ZECA 4H8IA 2W7YA 5I84A 1NMUA 1JEUA 1M5BA 1MY3A 4YKPA 2DVCA 3TTKA 4GQOA 3KJTA 3O28A 3PPNA 3UK4A 5HPQA 3TFLA 2PBWA 3FASA 4IY6A 1FTLA 5CMMA 3UA8A 5AA2B 4LATA 3KZGA 1B46A 2ZNTA 2DXYA 5CBRA 5K2YA 3V8XB 3KOTA 4IO6A 4ELOA 4KYSA 3B7DA 2Q2CA 2Y7WA 3VVDA 1WVJA 2I4BA 4BDLA 1RYXA 3RTFB 2B3BA 4H0WA 1Y20A 4ZZEA 1YAEA 1FQDA 1DOTA 5I56B 3PUXE 3IAZA 1XHYA 3MZ9A 1MXYA 3PUVE 3M3FA 4XKNA 1S7YA 4ESXA 1IXIA 3H6WA 5AA4B 4KCCA 1B05A 4NWDA 1MQHA 2RKMA 5JTYB 4O3AA 5I59A 5ITPA 1AOVA 1I6BA 3L6GA 1DTZA 3O97A 1O64A 2NWJA 1I6QA 4GLIA 3I6VA 2HAUA 3MJNA 4F2OA 3K0VA 1Z7NE 4ZEDA 3H6UA 2RCAA 3U93A 4GXSB 3M8UA 4GVOA 2GHBA 4RK9A 4OETA 2UXAA 4IO3A 4JDFA 4OENA 5F7VA 2Z8FA 2QMWA 3UGWA 1UTHB 4RJZA 4JXIA 3IJXB 4MLVA 2HCAA 3LUYA 2X26A 5ICQA 1A54A 3CSGA 1M5EA 4R6HA 3IB2A 4ELPA 1B7HA 1MS7A 1NH8A 4YMBA 3LSLA 4IB2A 4RXLA 5A5XB 2XX7A 3DP4A 3FATA 1VR5A 3QIMA 3HCQA 3RLFE 1ZJLA 3N6UA 1XT8A 4F3GA 4G8NA 4RY1A 3VDFA 1O63A 3TTLA 1NNTA 2ONRA 2RF1A 2P1SA 3HHFA 1GGGA 3OELA 3CFLA 2VP1A 4X1DA 2XXWA 2R9JA 2Z22A 2DWAA 2WKYA 4R73A 3MZ1A 4HW8A 4JWYA 2I4CA 1A7LA 1Q1KA 1MDP1 4DXUA 2Y7RA 3D4GA 1SQYA 1J1NA 3MUQA 4EXKA 3OEKA 5ICTA 1A8EA 1Y1MA 1LFIA 3VLVA 3RN8A 1PBPA 2F7BA 1JEVA 4JSOA 1NNFA 4EF1A 3PD9A 5AA3A 2RC8A 4IGTA 1H3DA 4KYEA 2QRYA 3PV0E 1ZKBA 1Q35A 3QSLA 1JETA 2XD3A 4QSCA 3C36A 1MH3A 4NTLA 2V93A 1QUJA 2F5XA 1N7WA 4JBZA 2D21A 3M3LA 4OYVA 2ZXTA 3MP8A 5I2NB 3DP6A 3MVZA 4WXJA 3AXFA 3U92A 2GFEA 4N07A 3Q27A 5H8SA 3CSBA 4IGRA 3TMGA 1LAGE 3TUSA 2RC9A 2FNCA 4FIMA 1I6AA 4DIGA 2XXRA 3K4UA 4Q8RA 3FXUA 4R9GA 2M8CA 2XXQA 3N6TA 4NF5A 1MXXA 1HSLA 1M5FA 1T0KA 2UVHA 1PBQA 3CVGA 1BIYA 4OEVA 4I1DA 1AMFA 2O84X 2PYYA 3R6UA 5H8NB 1FTJA 1QUIA 3MVXA 2F97A 1A55A 4LZ5A 2IEEA 3EHTA 5CMBA 5IAIA 4F3PA 2ZYOA 4NE4A 1TFAA 3MBPA 1IXGA 1PDAA 2XXUA 1GV8A 3K1PA 3OEMA 5FHNA 3W9WA 5ELVA 2QPQA 3H06B 4PETA 4OQOA 4OMBA 3IX1A 3ILTB 1B0LA 1B5HA 4POWA 1SW2A 2X7QA 5L9OA 2YLNA 2Q9TA 2HEUA 2NUVA 3A3CA 2H9BA 5H8FB 2F34A 3B6TA 2Z8DA 3CR9A 1VFEA 1S50A 4EXLA 3Q29A 3TYHA 2Y7PA 4F29A 3T66A 3H4ZA 4PFUA 4GRKA 3S9MC 5L9SA 1H45A 1MPBA 3HPIA 3N94A 1P1UA 1B5IA 4AB6A 1A99A 3EQ1A 3VE1B 4JWXA 3TTMA 3WAEA 2HAVA 5I58A 1SBPA 4FEDA 4H5GA 1NFTA 3T9VA 1H76A 4H67A 5KDTB 4H8JA 1B5JA 2I0CA 3UN6A 3OSQA 4P0GA 2XXTA 1TWYA 1AL3A 4RA1A 3ZKKA 3K6WA 3HSTA 3JYRA 4ECFA 2NOOA 3RT8A 2I6EA 3GXAA 1TT1A 1XC1A 2FA7A 1UIUA 4LONB 2NVUB 3KBRA 4NMYA 4F18A 3BFTA 3VLUA 4YKJA 2VD2A 3U1OA 3BFUA 3LSFB 3MP6A 4OZ9A 1WDNA 2H5YA 1NH7A 5AA2A 2CZLA 5EYFA 3HV1A 3TQWA 3LC8A 4MBPA 3FXRA 3LSWA 2F35A 4XKPA 3S9LC 5FHOA 3QK6A 2F36A 4U2RA 4ELQA 3VVFA 4ESWA 2V25A 4U4XA 4WKMA 1IZ1A 3KOSA 4YB5A 5FHMA 4BDOA 2ANJA 1R1NA 3ECRA 1UTBA 4G8HA 2R71A 1LB9A 1HSJA 4XTCQ 4GL8A 5CMKA 1TXFA 2QMXA 1R6ZA 3I3VA 5AA4A 5JTYA 3EHSA 3UIFA 3G3IA 2PMSA 2OZZA 3TPAA 1CB6A 1YPNA 3TEPA 1LFHA 3L6HA 4LP2B 3IL1B 3T96B 3DM0A 1FTMA 4I9DA 4LA9A 2AYSA 4QRZA 3SDFA 3SEXA 3C9HA 3MP1A 4KI0E 1XVYA 2D3IA 1TFDA 1EZPA 1IXHA 1UTHA 3Q25A 2O6AA 3KSXA 3TCHA 3SEVA 4QHQA 1URDA 2QS4A 2HZLA 3OMBA 3IOTA 4NF8B 2I3WA 3LSXA 2DXRA 4DCYA 5A5XA 2E0SA 2Q88A 2DVZA 4F2QA 2QL3A 3KN3A 4XXUA 1FQFA 1FQBA 4NF6B 3IJOB 4IO4A 1MH4A 3PUYE 1OMPA 5F1QA 3HN0A 3O2AA 1IUDA 2F78A 3IO6A 4H6DA 2HFBA 1AH5A 4ZEFA 2CMOA 4F22A 1SD3A 1H44A 4MLQA 5DT6A 3KGCA 5FTHA 1N76A 3IOVA 5K2XA 2DYXA 4R6YA 4GXAA 4HS7A 2OWTA 1S9TA 3PPOA 3PMXA 3KEIA 1QUKA 3MWBA 3RQTA 3S2VA 1D9YA 4R74A 3LBSA 3U94A 3TODA 3B6QA 4YICA 4YKIA 4QFLA 2ONKE 1QJMA 1Y3QA 5CMCA 1N84A 1A40A 5CM6A 2D5WA 4WEDA 2AIXA 3IOUA 4G68B 4YB7A 1ANFA 4Q30B 1MG1A 1QW0A 5I2KB 1YTVA 4GWOA 1XOCA 4IO7A 2B3FA 4I8CA 4WEPA 2REGA 3FJ7A 3MZBA 3T9HB 5I2NA 4KPTA 4ZS9A 3RTWB 5BUUA 3V89B 5TPAB 3M3KA 1KWHA 5KZTA 3V5AA 3G3KA 3OO8A 3RT6B 1Y3NA 3DLNA 4U23A 3IOWA 4YKKA 5DTBA 1PB8A 4KFQA 1ZBMA 5H8HA 1B4ZA 3GBBA 1GVCA 1USYH 3RY3A 3S9EA 4DDDA 1II5A 1SYIA 4IY5A 1UIVA 1O7TA 5CBSA 1MXZA 1JW5A 4C1TA 3RGYA 2Y7IA 1USYE 3A09A 1LBCA 4L17A 2V3UA 3EHUA 3W9VA 2NXOA 4I62A 2XXVA 1BKAA 1B3FA 1MQGA 3Q28A 4KYDA 3RUMA 1PEBA 4PFTA 3TCGA 1P1NA 2DS9A 5CC2A 1OQGA 2P2AA 1OLAA 3FIRA 4K3FA 1FW0A 1FTOA 1B3EA 5H8NA 2DE2A 4TLLB 5M2VA 1MXWA 3VV5A 1H43A 1B1XA 3H6VA 1N7XA 4OFJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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