4MF3A

Crystal structure of human grik1 complexed with a 6-(tetrazolyl)aryl decahydroisoquinoline antagonist
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
SLANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title GluK1 antagonists from 6-(tetrazolyl)phenyl decahydroisoquinoline derivatives: in vitro profile and in vivo analgesic efficacy.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Signaling protein
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, kainate 1
total genus 80
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-08-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4mf3A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4mf3A02
2VP1A 1IUDA 1A54A 3M8UA 3IO4A 3QSLA 4YB5A 4ECFA 5BUUA 4U4XA 3IJOB 1H3DA 1FQCA 2KLFA 1PEBA 1TXFA 3ILUB 1I6QA 2XD3A 3C32A 2PT1A 1FW0A 1GTKA 2UVJA 4ND9A 3TAJA 1H44A 3IL1B 5EYFA 2H5YA 2ZYOA 3TZAA 2DOJA 4MLVA 4GD5A 4LZ7A 1IZ1A 1MXVA 3OO9A 3L6GA 5AA1A 1MXXA 1MPCA 4U22A 3W15C 3QUFA 1BKAA 5I84A 3L6HA 1Q35A 4LQ5A 1A99A 2Y84A 3DP6A 3Q26A 1YCJA 4G68C 4IO4A 3CI8A 4M1VA 4MFIA 4ONYA 2ONKE 3FVKA 2XXIA 1Y3PA 1JEVA 1WODA 2PBWA 2AL4A 3B6WA 4RY1A 5TP9B 5F7VA 3VVDA 2X7QA 1PB7A 2DVCA 4YMBA 3K6UA 4HCYA 3SEXA 1ZIUA 3TODA 3I3VA 4KHZE 4NF8B 5DVJA 3K1PA 2Q9TA 2PYYA 3N26A 2DE4A 1UTBA 2DS9A 1LB9A 1MY1A 2O68A 3MQ9A 1IXHA 1VR5A 4O3AA 4UACA 4KQPA 1LFGA 1OIBA 1BLFA 4TLLB 4C1TA 2DE3A 1FTOA 3PD8A 1QKBA 1JETA 3LC8A 4KYEA 1Z7NE 3MP8A 1B5HA 2ONRA 2ZMBA 3FXRA 4N13A 5KZTA 3BFTA 2R9JA 3EF7A 3PD9A 3TDJA 3TQLA 1IXGA 2Q2CA 4KI0E 3LSFB 3AXFA 1NNPA 1QJMA 1B3GA 4GF8A 1OVBA 3VLUA 1FQAA 2E0SA 5HPQA 3KOSA 5H8QB 4C0RA 4KR5A 1LAHE 2DXYA 1A55A 4FE8A 4XKRA 4YKKA 4GXSB 4YZZA 3OMBA 4R75A 2DXRA 4JB7A 4OVJA 5I2NA 1MXWA 1B5IA 4R2FA 1PB8A 4EQ7A 3QXMA 5CMCA 3VXBA 5TP9A 2PX1A 3OOAA 4XXUA 5J1DA 5LOMA 4Z7EA 3CFLA 3CR9A 1B52A 4JSDA 1SI1A 3PUWE 4JBZA 4LONB 5AA3A 5H8FA 4YKIA 1ELJA 1MY2A 1P1NA 2G29A 2I49A 5CI5A 4IB2A 1AMFA 3KZGA 4NMYA 3T22A 1FQDA 5BWJA 3FVOA 1SI0A 5ELVA 3OO6A 1LSTA 1BTJA 3RT8A 3SEWA 3PV0E 3Q25A 1IXCA 1B46A 2V93A 4OMBA 4POWA 3UK4A 1H45A 3TPAA 4PFUA 4BDLA 2RF1A 3IAZA 4MLQA 3HHGA 2ALUA 2O7UA 3MP6A 4PQJA 4EXLA 3VVFA 5IKBA 1MG1A 1MXYA 1UQWA 1S50A 2THIA 5K2YA 3TYHA 2XXXA 5KDTB 3D4GA 3MPLA 2Y7KA 2RC9A 2F36A 3PMWA 4XTCQ 1N3WA 1HSEA 1H76A 5ICTA 3U8QA 3OD7A 1NL5A 1QUIA 4PFYA 4Q5TA 1NMUA 3A09A 2LAOA 4NF5A 1JQFA 3N6UA 5FHNA 1B2HA 1IQ7A 2NVUB 4HCWA 1MY3A 1Y3NA 4RNSA 2DQVA 1J1NA 4IY5A 4U23A 3T9HB 5H8NB 1XT8A 2DP8A 2XX7A 3CSGA 3K6WA 2OLBA 3OEKA 4Q30B 1Y20A 1NKXA 3R26A 3EHSA 3RT6B 3VE1B 5I2NB 3K6VA 2OWTA 5TPAA 3T93B 5CC2A 2D21A 2PMSA 3VFJA 3GBBA 4NWCA 2XXUA 4OEVA 3SEUA 2I3VA 2O6AA 5CBRA 3UA8A 4KPTA 2PVUA 4IO5A 4E0WA 1FCKA 1B1HA 1FTLA 2V3UA 3T9XB 2GHBA 4RPNA 2CZLA 2H9BA 1LAGE 3E3KA 2XXTA 5H8SA 2I3WA 4PETA 2F7AA 5H8FB 1MXUA 1ZU0A 2G93A 4GWOA 4P11A 4QFKA 2REGA 3VV5A 3QUJA 4QFLA 4TQUQ 1LAFE 1R9QA 1SYIA 1SQYA 3C34A 3U1OA 3USDA 1URDA 1B40A 5FTIA 3IB2A 4QSEA 4FAJA 4KYDA 1DMBA 1SVXB 4ZS9A 5FHOA 1GR2A 1B0HA 3B6TA 3FATA 2H25A 2UYEA 1MM6A 3ECRA 4GQOA 3N6TA 4NF6A 5ISUA 3T9VA 3UORA 4ZZEA 3UN6A 4FJPA 3PPPA 1XHYA 2RCAA 5K2XA 3RGYA 3VDFA 2ZNUA 1HSJA 4F3SA 5A5XB 2X7PA 1B1XA 4LP2B 1LFHA 4R6YA 2XXHA 1ATGA 3TTLA 1O64A 1Y9UA 1FTKA 2F7BA 1AL3A 1SDXA 4PP0A 4R2BA 3RQTA 4LUBA 5DEXA 1TFDA 2ZNSA 2D3IA 5AA2D 5I57B 1JNFA 1D3KA 1EU8A 1VFDA 2W7YA 2XXVA 2HQ0A 2I0BA 3N94A 4H5FA 3KN8A 3MBPA 3BFUA 3BKIB 3G3KA 3OO8A 2B65A 1O63A 1QW0A 3E4RA 3FASA 3KGCA 4Q0CA 3CVGA 4UA8A 4I62A 4LQ2A 2F5XA 1B4ZA 4G2ZA 1POTA 2VD3A 5DVIA 4F3BA 1MQIA 4X1BA 1MQDA 4RXLA 3K6XA 4IO7A 4E0XA 3OSRA 2OCUA 4ZE8A 4F18A 3ILTB 4TOZA 2OJTA 4IGTA 4Z0IA 5FHMA 4DCYA 2HZLA 1MY0A 5KCJB 2NOOA 1FQBA 1F9BA 2O51A 4H5GA 3S4UA 4FECA 4XIGQ 3K1NA 3OSQA 4MBPA 1N0TA 3HO7A 3VLVA 4KYSA 4FEBA 3TCFA 1OQHA 5ICQA 1SW4A 2ZYKA 5I59A 1ZTYA 4OTEA 1M5EA 1XS5A 3P7IA 4GOTA 5I56B 1A40A 1KWHA 2XX9A 4EF2A 3EQ1A 2XX8A 3CIJA 1EZ9A 1D9YA 2Q88A 4NWDA 2QS3A 3QK6A 3E9XA 4YKPA 2Z8FA 1DOTA 1MDQA 5AA2A 2NWJA 4ZEIA 2QRYA 4YU0A 4QF9A 2H98A 2E1SA 3K1MA 4TLMB 3V83A 1M5CA 3DM0A 4KFQA 3MVWA 2OBGA 3FV1A 3TTMA 3IR1A 1RYOA 3JYRA 4G4PA 3G3FA 5TU0A 3HPIA 1MRPA 2Q89A 1B9JA 3FD3A 2QJEA 1N3XA 1QVSA 5L9MA 4EF1A 3VXCA 4RK2A 2UVHA 3BBRA 3DELB 3B7DA 3IOTA 3TFLA 3W9WA 1I6AA 2Z8EA 2UXAA 3IJXB 3QAXA 1UIVA 2F34A 2F6GA 3H7MA 3SERA 3TMGA 2BJJX 2REJA 4BDNA 5HM4B 1P1QA 3H4ZA 3QIMA 5H8HA 5ITPA 1YPNA 4YB6A 1MQGA 3FGSA 3H06B 2I4CA 3HCQA 2GHAA 3ZSFA 5KCJA 4C1UA 4ZEBA 2ZNTA 2XXPA 4IO2A 5I59B 2XXYA 4ZZAA 3MVZA 3S2VA 1Q1KA 2A5SA 4U1OA 4OFOA 2M8CA 2Z8DA 1BIYA 4KD5A 3TCGA 4ISUA 1DTGA 2ABHA 3C33A 3M3KA 4NTLA 3MUQA 1DTZA 1GGGA 4NE4A 3EHTA 4RA1A 1XC1A 5DEXB 5KDTA 2HFBA 1SW5A 4ZEFA 5AA2B 4I1DA 4EQBA 4OFJA 5F1QA 4POXA 3DP8A 4ZDMA 3UP9A 2AL5A 3ZKKA 3TQWA 4ESWA 4GVOA 2D5WA 3CG3A 1XVXA 3MVYA 4H8JA 4MH5A 4K3FA 4DE8A 1NH7A 1NFTA 3C9HA 4I8CA 2QL3A 5DYHA 2XXRA 3UIFA 3O2AA 5I2KB 1B3FA 1ZLQA 2Z22A 4KCDA 4H65A 3KBRA 3S9NC 2RC7A 1JW1A 4F2OA 2IA4A 3WAEA 1UTHA 3MZ9A 3O9PA 2VHAA 4HTGA 4DDDA 4DXBA 3H6TA 3IORA 1AOVA 4F1YA 1MS7A 1ZBMA 4RJZA 1ZMGA 2XXWA 1M5BA 4DIGA 4O3BA 1OMPA 2QSXA 3KSXA 1I69A 4F2QA 4F22A 5CMKA 1FQEA 3SESA 3W9VA 2O1LA 3O66A 4G8HA 3FUZA 3PMVA 3Q27A 2F7CA 4WEDA 3ODBA 3GBAA 3DP4A 5EHMA 2YJPA 1SW2A 3CFZA 3RNNA 2P2AA 3EPEA 2F8DA 1H43A 4ELPA 4G68B 3R7XA 1ZJLA 4G8MA 1MPBA 4QHQA 4QRZA 4ZECA 1USYE 4JWYA 4L17A 1WDNA 2DWJA 3MJNA 4NF6B 5AA4B 1A7LA 1US5A 1XOCA 4GL0A 3I5OA 4RK9A 1B3LA 1B32A 3FVGA 3MZ1A 4KCCA 1PDAA 1JVXA 1QKAA 1R9LA 4G8NA 2VGQA 3HHFA 3G3HA 4H6DA 3V8XB 1SYHA 1USYH 2H99A 3SKPA 3PU5A 5ITOA 3K4UA 4BDQA 3LSLA 4X1DA 3IOUA 4F1UA 1QUJA 1IXIA 3MAMA 2ZYMA 2B3BA 2HAUA 3ONMA 4OXVA 4ZE9A 4U1ZA 1N04A 1EH3A 4NF8A 4YKJA 5CRYA 1OQGA 1UTBB 3G7WA 1RKMA 2O84X 4H67A 5H8QA 4AB5A 2XD2A 3K2DA 3T96B 3R6UA 1MPDA 1A8FA 1P1UA 3A3UA 1UTHB 3KN3A 3PGFA 4FORA 3V5AA 4GRKA 1P1WA 4LATA 3C4MA 4JDFA 4ELRA 4EQ9A 1EZOA 1NH8A 3ZKLA 4QSDA 2X26A 3TTRA 1JW5A 1JEUA 3HV1A 5DTBA 1US4A 3SEVA 3A3CA 2HEUA 1LCFA 5I58A 2FNCA 3DLNA 4JWXA 1DPEA 3K02A 1SW1A 2DVZA 3E13X 1MQHA 3FXQA 1Z7ME 3MP1A 4JWOA 4JXIA 4NEDA 4THIA 3M3FA 1MY4A 4HW8A 3PPQA 1VSOA 1P1OA 4XKPA 3RTWB 2QS4A 1HSLA 3H3GA 3KJTA 4Q8RA 3IB0A 3FJGA 1TT1A 3MPKA 3VLWA 3QYTA 3U93A 5AA4A 4G68A 4ZEDA 2OWSA 2QMXA 5I56A 4F29A 4R9GA 2F78A 3CSBA 5FTHA 3GXAA 3RPWA 4H1XA 3O6GA 5I2KA 2ZXTA 4ELQA 1PBQA 1B3EA 3SETA 3MW0A 1WVJA 2O69A 1Y1ZA 4ZEKA 3KFMA 4F1VA 3SDFA 4QSCA 4DZ1A 3G3GA 4OQOA 1B0LA 3OELA 2Y7IA 2H4IA 2GH9A 3TEPA 4OYVA 2I48A 2YPNA 3C36A 1CB6A 2V3QA 3LSWA 2I4BA 5TPAB 4BLAA 4XKQA 1FQFA 1ANFA 1DSNA 4ELOA 5CM6A 1MM7A 2QMWA 1B51A 1N7XA 1Y1MA 1N76A 3C35A 3CG1A 1YAEA 2HCAA 3TTKA 4OWDA 1M5DA 3TTNA 4YMAA 2DWHA 5I58B 4LZ5A 4BDMA 5H8NA 4N07A 3PMXA 4QFPA 4X48A 2UVIA 2Z23A 2Y7RA 2ESNA 3O28A 2HAVA 5CMMA 4LA9A 4P0IA 3U92A 4DXCA 1MQJA 3PPOA 2V3TA 4FATA 2I0CA 4NF5B 2QS2A 4R73A 3Q28A 3PPRA 5DT6A 3H6WA 4HS7A 3MZBA 3ZS6A 5L9SA 3H6VA 2B3FA 1LLSA 3CRBA 3FVNA 3FZVA 5JTYB 3TKDA 1LBCA 1T0KA 4F19A 1OLCA 3PUXE 1B5JA 4IY6A 5L8DA 3O6HA 3HN0A 3RN8A 4AQ4A 1DPPA 1LBBA 4R72A 3OENA 3PPNA 2PT2A 4WKMA 4F39A 1A8EA 3S9EA 1M5FA 2GRVA 1B6HA 2RINA 3G3JA 3FJ7A 3T66A 2XXQA 3K00A 5B70A 3Q29A 1AH5A 1JW4A 1EZPA 5A5XA 1P99A 3B6QA 3IOVA 2WKYA 3SEYA 2R71A 4GFRA 1AIVA 4F3PA 1PBPA 3RLFE 2DYXA 2I58A 3KJ7A 3PUYE 4IO3A 2XHDA 4OENA 3EHUA 3C31A 4EDPA 5HBCA 5IAIA 1GVCA 2Y7WA 4GL8A 1NNTA 2V84A 1B7HA 4OETA 4ESXA 1TWYA 3LUYA 4F31B 1B58A 3GLBA 3IB1A 3O97A 4FEDA 3MVXA 1MH3A 3UGWA 1MH4A 1VE4A 3U94A 1VFEA 3IOWA 3GZGA 2CMOA 4EXKA 3FV2A 1JVYA 1RYXA 4NF4A 4U4SA 2AIXA 4XKNA 1LB8A 3H6UA 4H0WA 1R1NA 2ANJA 3HSTA 2Q2AA 1XVYA 2YLNA 1GV8A 1LFIA 4R9FA 2NXOA 4DXUA 3MC2A 5JTYA 2HXWA 3RTFB 3LBSA 5I57A 1Y3QA 1UIUA 2NUVA 2VD2A 4QFNA 4QFOA 1I6BA 5CMBA 3TELA 2OZZA 3I6VA 2RKMA 3K01A 3LSXA 4P0GA 2V25A 4RYAA 4GLIA 1NNKA 5L9OA 2VOZA 3VVEA 3IO6A 1BP5A 2QPQA 4PE5B 1FTJA 5M2VA 4OEUA 1TFAA 3OO7A 3T9UA 1L5TA 1D9VA 5DVFA 2GFEA 2RC8A 3TCHA 1B7ZA 3D4CA 4WXJA 1FTMA 2Y7PA 4FIMA 3KOTA 1II5A 1URGA 4GXAA 3LR1A 1MXZA 3EN3A 3O29A 4H8IA 5B7DA 1QUKA 2A5TA 3FJMA 3THIA 2F6PA 2F35A 4U2RA 1IEJA 4AB6A 3M3LA 1N7WA 3RUMA 3V89B 4LVQA 1LCTA 3RY3A 4BDRA 1S9TA 4GIZA 4R6HA 4LZ8A 2FYIA 4WEPA 4EUOA 4OHNA 3O6IA 1B05A 3KN7A 1QULA 2DE2A 4N6PA 4R74A 2F97A 4NF4B 4F3GA 3S9MC 2DWIA 3MWBA 2OK2A 4I9DA 1NNFA 4DCXA 2DWAA 2AYSA 4DLDA 4U21A 3KEIA 1PB9A 1IITA 4X9TA 5H8HB 2O1MA 1ZKBA 1SBPA 4IGRA 4O3CA 3FIRA 4M4GA 4YB7A 5EHSA 3WAFA 2DSFA 2R6GE 4OESA 1D4NA 4BDOA 1Y4CA 1Y4TA 3IK6B 1LAXA 3JZJA 3OXNA 2Q8JA 5CBSA 2HZKA 1OLAA 1POY1 1S7YA 1URSA 2O7IA 2UYFA 3F11A 3FXUA 3IX1A 2FA7A 3KSJA 2ONSA 3KG2A 1YTVA 4OERA 2UVGA 3CFXA 1CE2A 1MDP1 4PFWA 1N84A 1B4HA 2IEEA 3H03A 4JSOA 1OVTA 2I6EA 4IO6A 1PC3A 3PUVE 3PUZE 4PFTA 4R6KA 4OFLA 4RPOA 3N5LA 4YAHX 3U72A 3G3IA 3K0VA 2QS1A 3OEMA 5JK4A 1B3HA 4G77A 4MF3A 1R6ZA 3JV9A 2P1SA 2A5TB 2RCBA 5AE4A 1LGBC 3TUSA 1B7UA 4OZ9A 2P0SA 1O7TA 5JEIA 1SD3A 4YICA 2ZYNA 1IIWA 3S9LC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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