4MF3A

Crystal structure of human grik1 complexed with a 6-(tetrazolyl)aryl decahydroisoquinoline antagonist
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
SLANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Signaling protein
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, kainate 1
publication title GluK1 antagonists from 6-(tetrazolyl)phenyl decahydroisoquinoline derivatives: in vitro profile and in vivo analgesic efficacy.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 80
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-08-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4mf3A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4mf3A02
1RKMA 2DE4A 1JW4A 4ZE9A 4RXLA 2Y7KA 1UTHB 1A8EA 2UYFA 3U8QA 1YAEA 1M5BA 3S9EA 4R73A 3THIA 3OOAA 4U4XA 1A55A 2QL3A 3R6UA 3RUMA 2XHDA 1B5JA 1I6AA 4ECFA 2P2AA 1N76A 4FE8A 1SVXB 2F35A 3R26A 4G77A 4IO5A 4F1UA 1MXZA 1OVTA 5FTIA 4YZZA 4FAJA 2YLNA 1JQFA 3U94A 4YMBA 4BDLA 4L17A 5BUUA 3Q26A 3QAXA 3PV0E 3FVGA 1FQDA 5ITOA 3W9VA 3D4GA 5EHMA 1B32A 2DSFA 3TTKA 4POWA 2I49A 2W7YA 2RKMA 4IGRA 3VV5A 4WEPA 2Z23A 1RYOA 3H6TA 3IO6A 1PC3A 2Z22A 3N94A 5AA2D 2O6AA 5I57A 3SEUA 1P1QA 1JEUA 3KN3A 4YKIA 4ELQA 3DP6A 3A3CA 4ZS9A 1SW1A 3VLUA 1LAHE 3TFLA 5ISUA 3C33A 5H8NB 2Q9TA 5H8FB 4YU0A 1BIYA 3RT6B 4ZZEA 2Q88A 1B1HA 4U1ZA 3I3VA 3IL1B 1AOVA 3S9LC 5I59A 1D4NA 2O7UA 1LB9A 1IITA 1IXCA 2Y7WA 3FD3A 1PB7A 4YKPA 3MZ1A 3U1OA 3FGSA 2DXYA 3TTMA 1P1NA 4KCCA 5M2VA 2PMSA 4QFKA 3PMVA 4GD5A 3HSTA 1H44A 2VD3A 1MG1A 3O29A 5CRYA 1PBQA 5DYHA 3UK4A 3CFXA 3W9WA 2UVJA 2DXRA 4OMBA 1B7HA 3FUZA 4QRZA 5AA2A 4JB7A 1XT8A 1ZIUA 2XXIA 4NE4A 3C36A 3FV1A 3FJMA 2B3FA 3KJTA 2ONSA 5FTHA 2X7QA 1SYHA 1HSEA 1MQIA 3MP1A 4OHNA 3GBBA 4OXVA 3K2DA 2F8DA 2AYSA 3G7WA 3OSQA 1LFIA 1USYE 4I62A 2VHAA 3TPAA 3IB1A 3GXAA 2OBGA 2UYEA 2B65A 1M5CA 4GL0A 5CI5A 1FTLA 3N5LA 3K1NA 3N6UA 3LSXA 4OENA 1S50A 5A5XB 3TYHA 5FHNA 3HCQA 3B6TA 4FIMA 3ZKKA 3T66A 4GQOA 4O3AA 3CIJA 1B3FA 1OVBA 3A09A 2I58A 3P7IA 2XXXA 3PMXA 3ONMA 5FHMA 3MP6A 4RA1A 1O7TA 4TQUQ 1MXWA 2I4BA 3RNNA 3LUYA 1CB6A 4X1BA 2REGA 5DEXB 2RF1A 4JWYA 5F7VA 1MXVA 4NEDA 1ZLQA 2NWJA 5AE4A 3T22A 1S7YA 2R71A 4QFNA 3ZSFA 3BFTA 1SW2A 5I56B 2O7IA 1Y3PA 2NVUB 4ZECA 3RTWB 2WKYA 4PFUA 3JZJA 2XX8A 1FQCA 3L6HA 2UVGA 2AIXA 4QFPA 3FIRA 5KDTB 1B1XA 3C9HA 2NOOA 4FATA 1GVCA 2ZYNA 4DZ1A 5DVJA 3MUQA 4C1UA 3FVKA 2V3UA 4JWOA 1Y4CA 3DP8A 1UTBB 1GV8A 4N13A 4MFIA 3IB0A 1AH5A 3L6GA 5HBCA 2O51A 4C0RA 1PDAA 1NNFA 3G3FA 4XKPA 2QMWA 4ZEFA 4THIA 1B6HA 2ESNA 1QUJA 3AXFA 1B3EA 2PX1A 4R75A 4MLVA 3TCGA 1N7XA 3KZGA 1R9LA 4EXLA 4F3SA 4EF1A 3KOTA 3CG1A 4EUOA 5AA4B 2NUVA 4PFYA 3H4ZA 5ITPA 2DWHA 1BTJA 1GTKA 4FJPA 1Y3NA 3FVNA 2DYXA 1ZJLA 2QPQA 4QSEA 5FHOA 3V8XB 3JV9A 3HHGA 1LB8A 1SI0A 3ILUB 4R72A 4DIGA 3LSLA 3TODA 4NWCA 1ZMGA 1PEBA 2DVCA 1O63A 1IXIA 1NNTA 4NF6B 3SDFA 5KCJB 1SQYA 2XXVA 4OEUA 4KYEA 2AL5A 4FEDA 3KG2A 3O6GA 1ANFA 4KYDA 5CMKA 3GBAA 2F7BA 1BP5A 1FTMA 3FATA 1TXFA 2HCAA 4OFOA 4UA8A 1B3GA 4IGTA 4IO7A 2A5TA 4GWOA 3K1PA 2BJJX 2I0BA 3UA8A 3OEKA 2F6GA 3MP8A 2XD3A 4LA9A 5JTYB 3CSBA 1QKBA 3FJGA 3KFMA 1Y4TA 4GLIA 1EZOA 1N0TA 2ONKE 2VGQA 3KN7A 4DLDA 4GOTA 1Y1ZA 5I2KA 2OZZA 4DE8A 1B3HA 1IIWA 4QFOA 4EQBA 4ND9A 4ISUA 3LC8A 4NF5A 3CVGA 3PU5A 5I2NA 1H76A 3PGFA 3TAJA 4YKKA 3PPQA 1H43A 3DELB 3IJXB 4MF3A 3CI8A 1QW0A 1IUDA 3K4UA 3N6TA 1XC1A 4ZEBA 2Z8EA 3OELA 3TELA 1QUIA 3OO8A 4E0WA 1A54A 2XXUA 2M8CA 3T9XB 2VD2A 3K1MA 1LBCA 1LBBA 1VR5A 1DSNA 4XXUA 1LCTA 1P1UA 2HEUA 1URSA 3E13X 3FASA 4ELRA 3ODBA 2I4CA 4PQJA 1Q35A 4ELPA 3MAMA 4EXKA 4F3PA 1FQAA 4I9DA 1VFDA 1LFGA 2FYIA 4IO3A 3UORA 2HFBA 3TMGA 3HV1A 2HZKA 1B46A 3K6VA 3RQTA 1HSLA 2Q2AA 4BDMA 1B5IA 1QKAA 5KZTA 4IO4A 4F3BA 5CM6A 3QUJA 3I5OA 1NH8A 2UVIA 1IEJA 4H8JA 2QJEA 1JVXA 3K0VA 3PUVE 3R7XA 4F19A 4ONYA 1ATGA 5TPAA 5TU0A 1URDA 1MDQA 1M5FA 2NXOA 2Z8FA 3T9HB 2ZNSA 5IKBA 4YB6A 4Z7EA 1MRPA 2ZMBA 3I6VA 1CE2A 1MY4A 2HAVA 1LSTA 2CMOA 3TUSA 2I48A 4DXBA 1B7UA 3PPRA 4P0GA 2H99A 4AB5A 3OO6A 2F36A 4OESA 3SEWA 1PB8A 2H4IA 3PMWA 1US4A 3BFUA 1TT1A 2I3WA 2RC8A 3PUWE 4U2RA 4LZ8A 1F9BA 2RCBA 5K2YA 1MPDA 5HM4B 3VFJA 3G3HA 2ZYOA 4WEDA 3B6WA 4LZ5A 3U93A 3LSWA 1II5A 3D4CA 1XVYA 4PE5B 5I58A 1OLAA 1VFEA 3IOWA 3ZKLA 3TZAA 4ESWA 5H8HB 4JSOA 3F11A 1OMPA 2OWTA 4KCDA 4F2QA 3SERA 4F31B 1IXHA 2DQVA 1MY2A 3KN8A 3ECRA 4G68A 3HN0A 2Z8DA 2THIA 3S9NC 3CFZA 3CG3A 2V84A 4OTEA 5JK4A 2A5SA 1N7WA 3VXBA 1DMBA 5IAIA 4NF4A 1SD3A 1I6QA 3PPNA 2QS4A 4F29A 3FV2A 4RK9A 4OQOA 1SI1A 3K6UA 1D9YA 4KR5A 1EU8A 4IO6A 4R6KA 2P1SA 4DCXA 2D5WA 5AA3A 3KBRA 4PETA 2XX7A 3UGWA 1I69A 1IXGA 4RY1A 3V89B 4NF8A 4R6YA 3C4MA 4EQ7A 1Q1KA 4F1YA 4OERA 4OFJA 3RTFB 3DP4A 3TTRA 1M5DA 2DWIA 1ELJA 4DDDA 2ZNUA 3K6XA 3SEYA 4AQ4A 1B2HA 5H8QA 3EHUA 4ZE8A 4GVOA 4R6HA 3T9UA 5ELVA 2VOZA 3S2VA 4F22A 1P1OA 4EDPA 1D3KA 4KI0E 2GHBA 3MC2A 1MQHA 1NH7A 5I57B 3T96B 1DOTA 1JVYA 4I1DA 3G3GA 3SEXA 3MVYA 5F1QA 3TTNA 4GF8A 3IOVA 3EHSA 3H6UA 3JYRA 3SKPA 2PT1A 3RN8A 2I3VA 4KHZE 5TP9A 5CMMA 1USYH 5CMCA 3MPKA 1P99A 3MQ9A 3PUZE 1AIVA 1HSJA 3OD7A 2OJTA 3VDFA 4BDOA 4KQPA 5I59B 1SW5A 1QVSA 4KD5A 3H7MA 1TFDA 3Q29A 2F7CA 2ABHA 5HPQA 1JEVA 3O6IA 3QIMA 1FW0A 3V83A 3RGYA 3C35A 4Q0CA 3LSFB 4G8MA 3KSXA 2XXWA 2FA7A 1OQHA 3OENA 1R6ZA 2UVHA 3S4UA 1YCJA 4LZ7A 3Q28A 4QHQA 2ALUA 5AA2B 3M3KA 2X26A 5B70A 4EQ9A 3W15C 2F7AA 4TLLB 2ZYMA 4LQ5A 2GFEA 3FZVA 2ZXTA 4IO2A 4RPNA 1A40A 4MBPA 3TDJA 5CBSA 4XTCQ 2CZLA 4FECA 4ESXA 5DVFA 3HHFA 3VVFA 2DOJA 1DTGA 3WAEA 1Y3QA 1FQEA 4QFLA 3H6WA 4G8NA 1IZ1A 3FXRA 3TTLA 1UTHA 3VVDA 1B9JA 1XVXA 1B3LA 1Y1MA 2QSXA 3EN3A 3RLFE 3K00A 2VP1A 5DT6A 1I6BA 2XXYA 4DCYA 1B4ZA 2DS9A 4PP0A 5EYFA 2F97A 2YPNA 3KJ7A 1MPCA 3PPOA 3CR9A 5L9OA 2O84X 1B05A 4LQ2A 4DXCA 2B3BA 1US5A 2V93A 5B7DA 4R9FA 1MY0A 1B4HA 3IX1A 4XIGQ 1EH3A 1DTZA 2G29A 2IA4A 5EHSA 1LCFA 2O1LA 2Q2CA 1URGA 4TOZA 4GIZA 4GL8A 4MH5A 1MXUA 4N6PA 5L8DA 3UP9A 1YPNA 1Z7ME 3IORA 1H45A 4YKJA 1D9VA 2QMXA 5CBRA 1YTVA 3E9XA 1SW4A 1LAXA 4BDRA 3RT8A 4I8CA 2GH9A 5H8NA 1OQGA 3QYTA 4C1TA 5H8FA 1J1NA 3N26A 1SBPA 1QULA 3IOUA 1FQBA 4F3GA 4U4SA 3BKIB 3VVEA 2ONRA 4PFWA 4GRKA 1B40A 4K3FA 1FQFA 3H3GA 4M4GA 4ELOA 4H65A 1IQ7A 4X48A 2I0CA 4WKMA 4ZEKA 1UIUA 4E0XA 4FORA 3A3UA 3E4RA 2GRVA 4LONB 4JDFA 3TCHA 2PVUA 3IOTA 3VXCA 4LATA 3OO9A 3OMBA 4JWXA 5K2XA 1TWYA 1XS5A 4KYSA 3VLVA 1MY1A 2Q89A 4JSDA 4YICA 4RJZA 4OYVA 1M5EA 4BDQA 3HPIA 3MWBA 3PUXE 2D21A 3QSLA 4IY5A 3KOSA 2UXAA 4G2ZA 4POXA 4EF2A 4OETA 1MXXA 1Y9UA 4O3BA 2ZNTA 3M3FA 4F18A 4F2OA 1XOCA 2HAUA 3PD8A 1N84A 2D3IA 4OWDA 5AA1A 1Y20A 2DP8A 1FTKA 3DM0A 1LFHA 1ZKBA 1ZTYA 2Y7RA 1MQJA 3CRBA 2Y84A 4BDNA 1KWHA 2XXTA 3EHTA 1B58A 3TKDA 4H1XA 2PBWA 1A99A 1UQWA 1GGGA 2KLFA 1XHYA 2R9JA 5A5XA 4LVQA 4RNSA 2QS2A 2AL4A 3O28A 2RCAA 3C32A 2A5TB 3ILTB 3IK6B 5CC2A 4N07A 4IY6A 1DPPA 1NL5A 4HCYA 4ZZAA 3G3KA 2DWJA 3IO4A 2DVZA 4GXSB 5L9SA 2E0SA 1P1WA 1L5TA 4OFLA 1TFAA 4DXUA 3IAZA 3B7DA 1B52A 3M3LA 1R1NA 5I2KB 4H0WA 5DEXA 3USDA 5ICQA 3MJNA 5ICTA 4NF5B 3KGCA 4HS7A 4HCWA 5I2NB 1WDNA 1POTA 3PUYE 2H5YA 5I56A 1NNPA 4G68C 1VE4A 1NNKA 3FXQA 4RPOA 2HXWA 3LBSA 1BKAA 3O9PA 5KDTA 2F5XA 2H9BA 4BLAA 3S9MC 2H25A 3TCFA 1JETA 1LAGE 2G93A 3H06B 3Q25A 4QSDA 2Y7PA 2RINA 1BLFA 1UTBA 1MH4A 3MBPA 2V25A 4H5FA 4JBZA 3O66A 3H6VA 1MQGA 4X1DA 2REJA 4JXIA 4WXJA 4Q8RA 3MVWA 1LLSA 2QS1A 2ZYKA 2R6GE 1WVJA 4QSCA 2FNCA 4UACA 4PFTA 3OXNA 4NMYA 3UIFA 4Z0IA 2QRYA 4H67A 1AMFA 5AA4A 4FEBA 3H03A 3QK6A 3EQ1A 3CFLA 1MQDA 1B7ZA 4P11A 1R9QA 4YMAA 2X7PA 4MLQA 3IB2A 5TPAB 3SEVA 3U72A 3VLWA 3CSGA 4U1OA 4NF6A 1JNFA 1FCKA 5KCJA 2Q8JA 1N04A 4H8IA 4P0IA 2E1SA 3EF7A 1MM6A 4KPTA 2XXRA 3K01A 4R9GA 3T93B 1ZBMA 4HTGA 3OSRA 4XKNA 3FVOA 1B51A 1MPBA 1OIBA 2F78A 3MZ9A 1RYXA 3VE1B 4F1VA 3EPEA 3KEIA 4U23A 3V5AA 3SESA 4NWDA 1PB9A 5DVIA 3ZS6A 1N3XA 3T9VA 1S9TA 4NTLA 3BBRA 2YJPA 1VSOA 3TEPA 5JTYA 5I58B 3DLNA 2HQ0A 1QUKA 2DE2A 1ZU0A 4OVJA 4KFQA 4LUBA 1EZPA 3IJOB 4O3CA 2V3QA 5CMBA 3PD9A 3C31A 2LAOA 1JW1A 1AL3A 3MZBA 4G68B 2DE3A 2OK2A 2V3TA 5H8SA 1QJMA 3MPLA 4NF4B 3FJ7A 4R2BA 2GHAA 4HW8A 1DPEA 2XD2A 4X9TA 1B0HA 4M1VA 4GFRA 1MDP1 4H5GA 4ZDMA 3GLBA 2HZLA 4NF8B 5L9MA 3HO7A 2Y7IA 4IB2A 3GZGA 3G3IA 2O68A 1PBPA 1POY1 5LOMA 2ANJA 4XKRA 1MH3A 3QUFA 3MVXA 4U21A 2PYYA 3Q27A 5H8QB 3TQWA 4G4PA 1NMUA 4ZEDA 3O97A 1Z7NE 5BWJA 3WAFA 2XXPA 3O2AA 4Q30B 1WODA 4U22A 2F6PA 4G8HA 4R74A 3MVZA 4OEVA 1MXYA 4TLMB 2F34A 2PT2A 4ZEIA 1GR2A 1N3WA 2RC9A 5TP9B 4YB5A 3E3KA 5I84A 3O6HA 2RC7A 1SDXA 3IR1A 4LP2B 1LAFE 1FTOA 3SETA 3K02A 1B5HA 5DTBA 4YAHX 2XXHA 2P0SA 4YB7A 4R2FA 1UIVA 3MW0A 1LGBC 3G3JA 1T0KA 3KSJA 1MM7A 1B0LA 3K6WA 1OLCA 2QS3A 4Q5TA 4H6DA 1SYIA 2XX9A 2I6EA 1FTJA 2DWAA 3OO7A 2H98A 1O64A 1NKXA 3FXUA 3QXMA 2OCUA 2O69A 4GXAA 2O1MA 3OEMA 3TQLA 4RYAA 1JW5A 3RPWA 1EZ9A 1A7LA 4F39A 5JEIA 4RK2A 4AB6A 1A8FA 3C34A 1NFTA 2OWSA 1MS7A 4QF9A 3RY3A 3UN6A 3PPPA 3B6QA 5J1DA 1H3DA 4XKQA 1MY3A 3U92A 3M8UA 2IEEA 5H8HA 3LR1A 2OLBA 2XXQA 4OZ9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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