4MF3A

Crystal structure of human grik1 complexed with a 6-(tetrazolyl)aryl decahydroisoquinoline antagonist
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
SLANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title GluK1 antagonists from 6-(tetrazolyl)phenyl decahydroisoquinoline derivatives: in vitro profile and in vivo analgesic efficacy.
pubmed doi rcsb
molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, kainate 1
total genus 80
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-08-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4mf3A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4mf3A02
1MXXA 1I6QA 3JYRA 2Q2CA 4R6YA 3VLWA 3RT6B 5TU0A 4Q8RA 3TFLA 1Y3PA 1BLFA 1AOVA 3VDFA 1URSA 4FE8A 1JETA 2CZLA 4HCWA 1H3DA 3QXMA 3O9PA 3O66A 3UGWA 1HSJA 3SEVA 2PVUA 1VFDA 1SW5A 2UVJA 2V3UA 3C9HA 2AL5A 3K4UA 4LQ5A 1B3LA 3MQ9A 4MH5A 3IB2A 3O29A 5FHNA 1QULA 3U92A 4R75A 2OLBA 3VLVA 2ANJA 3PMXA 1XOCA 2F8DA 5BUUA 3G3IA 1O64A 5I59A 4KYDA 4H65A 4NF5A 4DDDA 2Y7PA 3TODA 3SERA 1B51A 4R72A 5H8QB 3FASA 1LAXA 2XXRA 2XD3A 2O7IA 5AA4B 3IX1A 1AIVA 2G29A 3K1PA 3TCHA 1LCFA 3OXNA 3IOUA 1P1OA 3OO6A 1DTGA 1B4HA 3PPNA 4IO3A 5I57A 2REJA 2Z8FA 4JWYA 2ONSA 2XX9A 3RPWA 4GLIA 2XX8A 4X9TA 2REGA 1M5BA 3KGCA 2RC7A 3I5OA 1NFTA 4F2OA 5B7DA 3RGYA 3ECRA 2G93A 4YB6A 3OO8A 1GGGA 4WEDA 2FYIA 5ITOA 3PD8A 1B5JA 4PFYA 3VVEA 3T96B 1OVBA 4U4XA 3KOTA 3I6VA 3RLFE 4NF4B 5CMMA 4F29A 4NF6A 1S9TA 2QJEA 4DCYA 4E0XA 3MVWA 1XT8A 1IUDA 5JEIA 1EU8A 1B5IA 1POY1 1D9YA 4H8IA 3LUYA 1OQGA 1JVXA 1PDAA 1KWHA 1ZTYA 1NH8A 1IXGA 3GXAA 3B7DA 1WODA 2XD2A 3T9VA 1Y1MA 3KJTA 3TUSA 4U4SA 3T9HB 2VOZA 1URGA 4P0IA 1USYE 4G77A 4F18A 2Y7IA 4G8NA 4QF9A 2HFBA 3KBRA 1IXHA 1CE2A 2RKMA 1QVSA 2DP8A 1SW4A 2XXQA 2OCUA 5I56B 1FQEA 4P0GA 1DOTA 4GIZA 3HHFA 1LFHA 3FVKA 1Z7ME 1NNTA 2ABHA 4RPNA 3DM0A 4OESA 4R73A 5H8FB 1II5A 4ELOA 5L8DA 4X48A 4G68C 2DQVA 4U22A 3OMBA 3MC2A 1B05A 4EUOA 1VFEA 2XXHA 4RNSA 3IO6A 1FQFA 2R9JA 1MPCA 4FATA 4F1UA 3IOTA 3N94A 4U23A 3FD3A 1H44A 4MLVA 2XXIA 4GQOA 1LCTA 3ILTB 4GXSB 1Y4TA 4LZ7A 3R7XA 3V5AA 2ALUA 5TP9A 4YAHX 3FJMA 4KHZE 5ICTA 5F7VA 1OQHA 4E0WA 1UTBA 3MZ9A 2F97A 4WXJA 1MH3A 2O68A 2QS2A 4RA1A 4C1UA 3W9WA 2FNCA 3SEUA 2DWJA 2F5XA 3BKIB 3C35A 1QKAA 1Y4CA 5H8NA 2ONKE 3SKPA 4RJZA 2O1MA 5DVJA 5K2XA 5A5XA 1ZMGA 4MFIA 1AH5A 1RYOA 1SD3A 1FCKA 3CFLA 1SBPA 1MQGA 1I69A 1N3XA 5IKBA 4OFJA 4GWOA 2NWJA 4F1YA 1IITA 2QS3A 2F7CA 3FXRA 4JWOA 1UIVA 1SYIA 1DPEA 4OZ9A 4ZDMA 3LSXA 2R6GE 3S2VA 1MQJA 4BDOA 2I3WA 4N07A 2Q9TA 5I2KB 4X1BA 4ZE9A 4FIMA 4GF8A 3S4UA 4PFTA 3CVGA 1B2HA 1LAGE 3O28A 2M8CA 2NUVA 2KLFA 3C31A 3LBSA 3BFUA 3CIJA 4LVQA 1B6HA 4NWCA 3LSFB 3Q26A 1XS5A 3R26A 3OSRA 3TCGA 3ZS6A 4F39A 4GXAA 2QL3A 4R6KA 3UK4A 3IB0A 1QUJA 3OEMA 3TTRA 1EH3A 3RQTA 3K0VA 4NTLA 4F2QA 4QFOA 3S9MC 3TTMA 2DWHA 3C33A 3KSXA 3L6GA 4OEVA 1FTJA 1B3HA 3H3GA 2I49A 3THIA 1PB7A 4ZECA 1GVCA 1EZPA 3ZKKA 3OSQA 2OWTA 2OWSA 2H5YA 4RPOA 3ZKLA 3O2AA 2GFEA 1N76A 5I59B 1A40A 3DP4A 1VE4A 4XKQA 4NF5B 1QUIA 4LZ5A 4AB5A 4F1VA 3S9EA 2ZYNA 3E3KA 3C36A 2RINA 4LQ2A 3SEXA 4YB5A 1B9JA 3LC8A 4YU0A 5TPAA 4BDQA 3DP6A 4N13A 2XXYA 1O63A 4XIGQ 5FTHA 4IGRA 1MDQA 1MG1A 1I6AA 1Y3NA 5I57B 5CC2A 3CRBA 4U1OA 2BJJX 5EYFA 4C0RA 3OD7A 1B3GA 3MBPA 1QW0A 5FHOA 1MDP1 4P11A 3IK6B 1PBPA 2ZNSA 5CRYA 4ZE8A 4JXIA 1UTHA 3FJ7A 3H4ZA 5AA2A 4DIGA 4BLAA 2FA7A 3MPLA 3S9LC 4KI0E 1NNPA 5FTIA 4I62A 2PBWA 3MZ1A 4M4GA 5H8HA 1N84A 2I48A 3OEKA 4ONYA 4U1ZA 3GZGA 3SETA 4NF6B 1YTVA 1D4NA 1B7ZA 3IAZA 2ZMBA 4EQBA 1DTZA 1MXYA 1ANFA 1HSEA 4GL8A 4EF1A 1AMFA 2F34A 2DYXA 3U72A 2V93A 3JV9A 4EDPA 5DT6A 1JW4A 1XC1A 4KQPA 3PU5A 1Q1KA 4GFRA 3MJNA 2PX1A 3JZJA 4R9GA 2H99A 4THIA 1N7XA 2XXPA 3DP8A 4R74A 1RYXA 5LOMA 3PV0E 4R6HA 3SESA 4OXVA 1Y3QA 2V3TA 3W15C 1QUKA 4Q5TA 3H6TA 2RC9A 4KCCA 4POWA 2F7BA 2DSFA 2DWIA 1MY3A 1BIYA 2V3QA 1ZIUA 5BWJA 2Y7WA 2QS4A 3M3LA 4YKKA 3MVZA 4OYVA 1AL3A 4O3AA 5EHSA 4LATA 4PFWA 2HCAA 1B1HA 4ZEDA 2XXVA 4OFOA 5KZTA 3U94A 2GH9A 4XKNA 1MM7A 3FVOA 3CG1A 5H8SA 3IR1A 2P1SA 5ISUA 1A55A 3SEWA 3CG3A 3DELB 2LAOA 4YMAA 3GLBA 2NVUB 1IIWA 3HV1A 1QJMA 3V89B 3PUYE 1UIUA 3UP9A 3FV2A 5TP9B 3FXQA 1SI1A 4IY6A 2R71A 4O3BA 3FVNA 3H6VA 4KYEA 3G3JA 1UTBB 3PUZE 5DEXA 2O69A 4EQ7A 1BP5A 2H9BA 4F19A 2ZYOA 3TEPA 3ODBA 5H8NB 3O97A 2Y84A 4JDFA 2UVGA 3KJ7A 4YICA 5A5XB 3MAMA 1URDA 3TAJA 1XVYA 4FEBA 3K01A 2RF1A 2DE2A 3RT8A 2OK2A 4QFPA 1A8EA 3KG2A 3FUZA 1MY0A 1B7HA 3H7MA 4RK2A 3HHGA 2CMOA 3PMWA 1YCJA 4KD5A 3LR1A 3N6TA 1B0LA 3RUMA 4U21A 1DPPA 4YKPA 4X1DA 3HPIA 1MXUA 3SEYA 4AB6A 3KSJA 5EHMA 4LA9A 4DZ1A 4LZ8A 2I3VA 1LAFE 1B1XA 1US5A 5L9OA 3G3FA 3EHSA 1H45A 1DMBA 1OLAA 2Z8EA 1A8FA 1B4ZA 2AYSA 3LSWA 3G3GA 4H67A 2F35A 4FECA 2F78A 2I4CA 2F6PA 3F11A 4PP0A 4OFLA 5CBRA 1MXWA 1XHYA 1A7LA 1PC3A 2QS1A 1LGBC 3K02A 4IGTA 4O3CA 1F9BA 2YLNA 2H4IA 4WKMA 3QUFA 3QAXA 1MPDA 3N5LA 3BFTA 4F22A 1MRPA 2O1LA 4KPTA 1SYHA 4XKRA 4R2FA 4NEDA 2F36A 5AA1A 1B52A 2O51A 4F3SA 3EF7A 2DS9A 2OZZA 2DXRA 1MY4A 1Y9UA 3O6GA 4UA8A 3K00A 5CBSA 2XXWA 1R6ZA 3Q29A 1LBCA 4GVOA 4XTCQ 2I0CA 1GV8A 2RCBA 2X7PA 3QUJA 4IO6A 4MLQA 2B3FA 1FQCA 3C32A 4BDMA 2UYEA 4F31B 4I1DA 4ESWA 5AA2D 5TPAB 5I58A 3RY3A 4G8HA 5AA3A 1RKMA 1ZU0A 1Y1ZA 3SDFA 1B46A 3OO9A 2ZNTA 3K1MA 2O7UA 4DXBA 2QSXA 2VD3A 1MY1A 1B3FA 5DVIA 4TLLB 5JK4A 4KFQA 4FJPA 1YPNA 3VVDA 3MZBA 4OTEA 1D3KA 1UTHB 4XXUA 5I2NA 1P1WA 3MVYA 3TQWA 1WDNA 2Q88A 1NMUA 3IO4A 5AA2B 4QFKA 5K2YA 2Y7KA 2XXXA 3M3KA 4KCDA 2ZNUA 4F3GA 1OIBA 5HPQA 1ZJLA 4U2RA 5H8HB 1JEVA 2PT2A 5CMCA 4DE8A 3GBBA 1WVJA 1LFIA 2IEEA 3IJXB 4RY1A 3HSTA 2XXTA 2HZKA 4ZEBA 3UA8A 1A54A 1Y20A 3I3VA 5L9SA 1EZ9A 3QSLA 3M3FA 4LP2B 1ELJA 3C34A 4OMBA 1TWYA 3FXUA 3USDA 2RCAA 3PPRA 3TTLA 3VLUA 3IJOB 1IXIA 3N6UA 3C4MA 3FGSA 1OMPA 1SQYA 4GL0A 4QSDA 2PMSA 3TELA 1FW0A 3K6XA 4ZEKA 2DE4A 4JWXA 2A5TA 1PB9A 3WAEA 3R6UA 3MVXA 3O6HA 1D9VA 4NWDA 4H8JA 5KCJA 1SI0A 1IXCA 4ELRA 5L9MA 1LB8A 1IQ7A 4R2BA 2ZYKA 1TFAA 1FQDA 1VR5A 3RTFB 3T66A 4OWDA 4ELPA 1ZLQA 4I8CA 4OQOA 2XHDA 1P1UA 3PPOA 1GR2A 1MY2A 1CB6A 2VHAA 3H6UA 2VD2A 2V25A 2I0BA 3QK6A 3KOSA 4H5GA 4NMYA 4HTGA 4H6DA 4TQUQ 3TYHA 1I6BA 1MQDA 1O7TA 2HAUA 3D4GA 4ESXA 1M5DA 5HBCA 2VP1A 3FV1A 5AE4A 4H0WA 1LLSA 2UVHA 1N7WA 4HS7A 4JB7A 1B0HA 1B7UA 3VXCA 4IO5A 3N26A 1JW5A 2B3BA 3PUXE 2UVIA 1TXFA 2O84X 1PBQA 4QHQA 4PQJA 4I9DA 2NOOA 4UACA 2YPNA 3Q27A 3QIMA 3IOVA 4ZZEA 1FTOA 4FAJA 4IY5A 1TFDA 1H76A 5DEXB 3T9XB 3E13X 1JVYA 1LBBA 3TCFA 2H25A 2UXAA 3MP1A 3EHUA 3OO7A 4PE5B 3MP8A 3RN8A 5JTYA 4XKPA 4ECFA 4KYSA 2OBGA 4C1TA 1LB9A 1OLCA 1EZOA 3VE1B 1LFGA 5KDTA 1IEJA 3RTWB 4NF8A 3TKDA 4BDNA 3OENA 3H6WA 4EF2A 2H98A 1LSTA 4ND9A 4G68A 3UN6A 3T9UA 4JSDA 1N04A 1MQIA 3KZGA 2F6GA 2XXUA 1USYH 5DTBA 2DE3A 4DXUA 4Q30B 1B58A 2YJPA 3E4RA 3B6TA 3BBRA 3CSBA 3PUVE 1TT1A 4DXCA 3KN3A 4YB7A 4YKIA 3T22A 4RYAA 4NE4A 1MH4A 3G7WA 1B32A 4K3FA 2B65A 2I6EA 4YZZA 1Q35A 3FZVA 1BKAA 1JQFA 3EHTA 1BTJA 3G3HA 3D4CA 4ZS9A 2OJTA 2HEUA 2QMXA 1ATGA 4RXLA 3FIRA 3QYTA 2DVZA 4EXLA 3TMGA 3M8UA 1S7YA 1B40A 3MUQA 4H1XA 2D21A 4IB2A 4MBPA 4R9FA 2E0SA 3HN0A 5ELVA 4G2ZA 5FHMA 3P7IA 4QSEA 2D3IA 5CM6A 3FVGA 5ITPA 4JBZA 4LONB 2DOJA 1XVXA 1VSOA 1MM6A 1B5HA 5J1DA 1L5TA 4EXKA 2ONRA 3Q28A 5H8QA 1NL5A 3Q25A 1NNFA 4Q0CA 1R1NA 5AA4A 4QFNA 3LSLA 2P2AA 4QFLA 3MWBA 4KR5A 2DWAA 3CSGA 3A09A 1T0KA 4GOTA 5I58B 4DLDA 5B70A 3O6IA 5HM4B 4QRZA 3B6WA 3U93A 2D5WA 4ZZAA 1ZBMA 2I4BA 3RNNA 1SW1A 2DXYA 1MS7A 1US4A 1JEUA 3CR9A 1PEBA 1PB8A 5I2NB 3L6HA 3A3UA 1MXVA 1JNFA 4HW8A 4ELQA 3TZAA 3V83A 3CFZA 3V8XB 2PYYA 4OHNA 1S50A 4NF4A 3K6UA 5ICQA 3TQLA 1FTMA 4TOZA 1B3EA 4EQ9A 2Q2AA 3MW0A 3U8QA 1UQWA 4F3BA 3U1OA 3H06B 4OERA 2X26A 4Z7EA 3KN7A 4FORA 3UORA 1P1QA 2P0SA 4OEUA 1MXZA 2QMWA 1HSLA 4ISUA 4N6PA 3PPQA 4H5FA 3T93B 4BDLA 2Q89A 2DVCA 3EN3A 1ZKBA 2F7AA 3EQ1A 4F3PA 2GRVA 2A5TB 4RK9A 1P1NA 2HXWA 5KCJB 4LUBA 2Z23A 3IB1A 1H43A 3ZSFA 3EPEA 2VGQA 3TDJA 4JSOA 1M5CA 1SW2A 1M5FA 3PMVA 5I56A 2ESNA 2NXOA 4ZEIA 2I58A 5CMBA 3B6QA 3K2DA 1DSNA 3K6VA 4IO7A 5H8FA 2ZXTA 3ONMA 2HZLA 1NKXA 3FJGA 3AXFA 1NNKA 3MPKA 3PD9A 3IL1B 4YMBA 4PETA 1FTLA 1Z7NE 4GD5A 3VXBA 3GBAA 2X7QA 3IORA 1P99A 4OENA 4DCXA 4G4PA 4QSCA 4TLMB 1FQAA 1MPBA 2V84A 1LAHE 3OELA 4YKJA 5I84A 3H03A 3MP6A 3DLNA 1GTKA 4HCYA 2A5SA 1M5EA 2AIXA 2GHBA 4G8MA 1NH7A 5DVFA 2E1SA 3A3CA 4OVJA 5M2VA 1SVXB 3TPAA 4ZEFA 3HO7A 3VV5A 3KFMA 2PT1A 1OVTA 2IA4A 4WEPA 1J1NA 3ILUB 1YAEA 2W7YA 3OOAA 5JTYB 4IO4A 2XX7A 3W9VA 2RC8A 2O6AA 1POTA 3UIFA 4PFUA 5KDTB 4BDRA 2AL4A 3CI8A 1R9QA 2Z22A 3HCQA 3VFJA 2WKYA 4NF8B 5CI5A 2UYFA 1N0TA 2Y7RA 2Z8DA 3K1NA 4Z0IA 4G68B 1JW1A 3PPPA 3WAFA 2HAVA 4OETA 3PGFA 3G3KA 5IAIA 1MQHA 4L17A 3S9NC 5I2KA 3FATA 1FQBA 3IOWA 1IZ1A 4POXA 5DYHA 2GHAA 4IO2A 2QRYA 1FTKA 5CMKA 4MF3A 2QPQA 2Q8JA 3VVFA 3K6WA 1QKBA 3CFXA 2HQ0A 3E9XA 1SDXA 2ZYMA 1A99A 4AQ4A 3TTKA 4GRKA 3TTNA 2THIA 3KN8A 1R9LA 4M1VA 1N3WA 3PUWE 3KEIA 4FEDA 5F1QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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