3RLFE

Crystal structure of the maltose-binding protein/maltose transporter complex in an outward-facing conformation bound to mgamppnp
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITKASAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Snapshots of the maltose transporter during ATP hydrolysis.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Hydrolase/transport protein
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
total genus 122
structure length 374
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-04-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rlfE02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rlfE01
1IUDA 2GH9A 1UTBA 2RC9A 1QULA 3G3JA 1SW2A 4H67A 4M1VA 5JEIA 4F22A 3H6TA 5BUUA 5F1QA 4GIZA 4BLAA 1MH4A 3GXAA 1PB7A 5HPQA 1N84A 4ZZAA 3V89B 4DLDA 2VHAA 3S9LC 1IQ7A 3TPAA 2IEEA 2P2AA 3B6QA 3M3LA 2ZMBA 1QUJA 1XVXA 3IOVA 4AQ4A 2Y7KA 5KDTB 3K4UA 3VE1B 4EF1A 1O64A 3FJGA 1SQYA 2FNCA 3MVXA 3PUXE 4ZEFA 1B7UA 3TCGA 2XX8A 2V3QA 3DP8A 3T9VA 2DS9A 3FJ7A 2F7CA 2ONSA 2F97A 4DCXA 1M5BA 4ZZEA 3VVFA 4F18A 3K0VA 2HZLA 2VD2A 4Z0IA 3RNNA 3KJ7A 1OQHA 2B3BA 3FV1A 4F2OA 3H06B 2Y84A 4ZE9A 4E0WA 3G3FA 3G3KA 3UP9A 4HS7A 4POWA 2I6EA 3H4ZA 4U21A 1T0KA 5DT6A 1JW1A 1IXIA 1UTHA 3M3KA 1JVXA 1S50A 3CFXA 3LSWA 1NH7A 4KYSA 3W9VA 3RLFE 2VGQA 3QUFA 5CBRA 1FQFA 3C31A 5TPAB 2KLFA 1F9BA 3UGWA 1FQDA 3MQ9A 4PETA 1MPCA 2O7IA 1PBQA 4H8JA 3OOAA 4K3FA 2NVUB 5I58B 1FTLA 2XXVA 5A5XA 2UVIA 1B51A 4PQJA 4OENA 4YKPA 3OEKA 3OELA 2H98A 1IZ1A 4TOZA 4YU0A 3RUMA 5FHMA 4MFIA 4OERA 1LFHA 3PUVE 3WAFA 1ZKBA 3SKPA 1MQDA 4EDPA 3D4GA 2XX9A 4I9DA 4P0GA 4Q8RA 5I57B 4ELQA 1R1NA 3TZAA 4N07A 4HCYA 5CI5A 4TQUQ 1B2HA 3JYRA 4IO4A 4O3AA 4OVJA 2OWTA 3IJOB 3DM0A 2VP1A 3IORA 3OSQA 1SBPA 1ANFA 3T66A 4ELRA 2FYIA 2XXXA 4PFYA 3Q26A 3ONMA 4JSDA 5ISUA 3QSLA 1URGA 2F36A 4LQ5A 3U1OA 5AA2D 1TXFA 1LB9A 2RC7A 1EZOA 4N13A 4OETA 2V93A 1QKBA 2F5XA 3DP4A 1MY4A 4PP0A 1VFEA 4LATA 1IITA 5TP9B 1ZTYA 1MPBA 3K01A 3MVYA 1SI0A 1N7XA 4FATA 1J1NA 3VDFA 1CB6A 2O1LA 3EN3A 3O6HA 4NEDA 5DVJA 4G77A 1I6BA 3U8QA 4GOTA 2O51A 1Y3PA 4QFKA 1LBCA 1MXYA 1B4HA 1Y20A 3ILTB 1B05A 1NNFA 1JW5A 2OCUA 1TFDA 3TCFA 5EHMA 4R74A 5LOMA 1ZJLA 1FTOA 1PB8A 4XKPA 2HQ0A 3TODA 5DVIA 1LB8A 3RT6B 2NXOA 2Q2AA 4KYEA 3ZS6A 5I84A 5HM4B 5L9OA 4DXUA 4QSCA 2DOJA 2OJTA 3B7DA 1PB9A 5AE4A 4YMAA 4KD5A 1B3LA 3PPNA 4RNSA 1M5CA 1B5JA 4GF8A 1JEUA 1IIWA 4OESA 5H8HA 3K2DA 3KOTA 2O69A 4DDDA 1NL5A 3MWBA 4MLQA 1Y1ZA 3MVWA 3MPLA 3A3CA 4Q30B 1M5EA 4FEDA 3LSFB 4YAHX 1N04A 3H6VA 5FTHA 5KCJA 3O6GA 3P7IA 1LFGA 4X1DA 2XXQA 1EH3A 5ICQA 5B70A 1Y1MA 4QFNA 1ZU0A 4JBZA 4FAJA 3C35A 2P0SA 1NMUA 4GXAA 5L9SA 3SDFA 5M2VA 2WKYA 1NFTA 4R75A 2QSXA 2PT2A 3PD8A 4X48A 2QS2A 4NF5A 3K00A 2RF1A 3LBSA 2GHBA 4WKMA 2E0SA 1MPDA 2DVZA 2Z8DA 4GWOA 1LGBC 2XXUA 3KN3A 3OENA 4QF9A 4F39A 3IOTA 2Q89A 4F29A 2M8CA 3OD7A 1OVBA 2V3UA 3MZ1A 1QJMA 3O6IA 5DVFA 1A7LA 1OMPA 4LQ2A 3RT8A 3TFLA 3UORA 2ESNA 3OEMA 4GL8A 4EQBA 4FE8A 3TQWA 5KZTA 1MY0A 4OFOA 4HTGA 3OO9A 5B7DA 3FVOA 2XXTA 1Y3NA 1S7YA 3N6UA 1I6QA 4KFQA 3MBPA 2D5WA 1P1OA 5K2YA 5I2KA 2R71A 4H65A 1B58A 5L8DA 3E4RA 5J1DA 1YAEA 3SEUA 3HSTA 2V3TA 3O97A 4R6YA 4F1VA 2DP8A 1PEBA 3C33A 5BWJA 5H8FB 3PPPA 5ELVA 3U94A 1O7TA 3S4UA 1D9VA 3SEVA 4QFLA 3T9XB 4ESWA 4HW8A 3ODBA 5I59A 3MUQA 4F2QA 2I3WA 3DP6A 4JWOA 4QSEA 1LAHE 2HFBA 2DE4A 3IJXB 3EF7A 3T96B 2VD3A 3CG1A 4OQOA 5EYFA 3TTKA 4YKKA 3T9HB 3VVDA 2UYFA 4GVOA 3KSJA 1USYE 4G8MA 3QAXA 1B0HA 1SW1A 4OHNA 3T22A 4RXLA 3EHSA 5AA2B 3RTWB 1ELJA 2QJEA 4YKIA 4OYVA 3KOSA 1UTHB 3MZBA 1JETA 4ZEIA 1B3GA 2HXWA 2Z8FA 4RPNA 1XC1A 4H5GA 3CFLA 1XVYA 2OLBA 2QMXA 3SEYA 1POY1 5I58A 2OK2A 1DSNA 1SYIA 2F6PA 3H03A 4KCDA 1M5DA 3KJTA 3QUJA 3Q25A 2RCBA 4YZZA 4FIMA 3KBRA 3C4MA 4H0WA 4AB6A 4EF2A 1TFAA 3W15C 1AOVA 1LFIA 3FATA 3RTFB 4FEBA 5H8QA 2NWJA 3O2AA 4JDFA 2I3VA 1RKMA 4KCCA 2XD2A 2Y7IA 3D4CA 3FUZA 1R9LA 5H8HB 5AA3A 5I56B 1B4ZA 3VLUA 3FVNA 1HSJA 2QS3A 1GV8A 1YPNA 3H6WA 1WVJA 3KN8A 3MP6A 1FW0A 3PGFA 3CSBA 3SEWA 5CMKA 4JWXA 1FTJA 4NWDA 1B6HA 1US4A 2UVJA 3PUWE 4X9TA 1DPPA 2DE3A 1H45A 1LAFE 1GGGA 2HEUA 4Q5TA 5L9MA 3R26A 3BFUA 3THIA 2DSFA 2ONRA 3USDA 3A09A 2F7BA 1A8FA 1B32A 1DTZA 3L6HA 3TTRA 4F1UA 4G8NA 3K1NA 3DLNA 3GZGA 1P1UA 3FXQA 1FTKA 4KR5A 4KPTA 1LAXA 1ZIUA 4DCYA 3IL1B 1MY1A 3FASA 3O29A 4TLMB 1MXUA 2RC8A 3O28A 5CMMA 5HBCA 4DXCA 1HSLA 4NF5B 3I5OA 4EXKA 3MC2A 5CC2A 4IGTA 3K1MA 5H8NB 2I4BA 3PU5A 4KHZE 2UVHA 3TAJA 4GLIA 3U92A 3IK6B 1AL3A 3V5AA 3EHUA 4I8CA 4ZECA 4BDLA 1B7ZA 1OVTA 1AIVA 3M8UA 1PBPA 2HCAA 4FORA 4YB5A 1GTKA 1I69A 3IO6A 2DWJA 1Y4CA 2DE2A 4YMBA 1DMBA 4R2FA 1FQCA 5I2KB 4OFLA 2Z23A 3PUYE 1A40A 1S9TA 4KYDA 2W7YA 1FCKA 2Q9TA 4GRKA 4L17A 4OZ9A 1B52A 5CBSA 3FD3A 1A8EA 1H76A 2UXAA 2FA7A 3PMXA 3R7XA 3IR1A 3MZ9A 4Z7EA 5H8FA 1IXGA 3CIJA 2DQVA 1B40A 3B6TA 3TYHA 4EXLA 3S2VA 1NNTA 4IO2A 1MQJA 4O3BA 1FQAA 1LBBA 2Y7WA 3G3IA 4HCWA 5TU0A 1OLAA 3Q29A 4LP2B 3OXNA 4R6HA 5FHOA 4F3BA 1QVSA 3MVZA 4P0IA 3C9HA 1QKAA 1R9QA 1LCFA 2YJPA 3FJMA 5AA2A 1Z7ME 3I3VA 3CRBA 3SESA 1MXZA 2I4CA 2XXIA 1N76A 4NE4A 2XHDA 2B3FA 3K02A 3U93A 2F7AA 4BDOA 4G2ZA 4RYAA 4ND9A 2OZZA 2R9JA 3C34A 4G68C 5DYHA 1IXHA 1VE4A 1B46A 3H3GA 3PMVA 1QUKA 1B1XA 2PYYA 4JB7A 2QRYA 2X7PA 4EQ9A 3IX1A 3M3FA 4F3PA 2Q88A 1OQGA 3HHFA 1XHYA 2DXYA 4POXA 1NKXA 3IB0A 3LSXA 2ZXTA 3K6UA 2ZNSA 3FXRA 3IO4A 3V83A 5JTYA 3FGSA 5ITPA 2XXWA 3MP1A 2CZLA 1VR5A 2LAOA 3LC8A 3O9PA 1DOTA 4NF4B 3T93B 1UQWA 1EU8A 3U72A 4R9GA 5H8SA 4F3GA 5I56A 3S9EA 3K6WA 4UACA 2Q8JA 1EZPA 2PT1A 5K2XA 1OIBA 3HCQA 3IOUA 1FQBA 4WXJA 1NNKA 2REJA 4I62A 3VXBA 1XT8A 2R6GE 2YPNA 4G68A 3FXUA 3KGCA 1P1NA 4P11A 5I59B 4XKQA 1A54A 4H5FA 4R9FA 4U1ZA 3UIFA 4IO5A 1SD3A 4R73A 4GL0A 4MF3A 4YB6A 1JQFA 4XXUA 2O6AA 4THIA 1SW5A 3CSGA 3RPWA 1LSTA 3HV1A 3LR1A 1URSA 3IB1A 4G4PA 5AA4B 1O63A 3WAEA 1VSOA 1EZ9A 2ALUA 2I48A 3C32A 4MH5A 3SEXA 4BDQA 1FTMA 2QL3A 4NF6A 4NWCA 2F8DA 5ITOA 4XIGQ 2F78A 1Q1KA 1SDXA 3KSXA 5EHSA 1QUIA 2Y7PA 4KI0E 3E13X 5CRYA 3K6VA 3V8XB 3UK4A 3TCHA 1BKAA 4JXIA 3W9WA 2HAVA 2ZYKA 1RYOA 3RY3A 1KWHA 3PMWA 2H99A 2O68A 3CFZA 3JV9A 4PFUA 5IKBA 4RY1A 1BLFA 4WEDA 1LLSA 2ONKE 5H8QB 3MPKA 1H43A 1N3XA 2O1MA 3R6UA 3TEPA 1MQHA 2QS1A 3GBAA 1CE2A 1MDQA 4XKNA 4PFTA 3TELA 2RCAA 4OFJA 1YTVA 2ZYMA 5CMCA 1UIVA 1Y4TA 1ZLQA 2REGA 3VVEA 1XOCA 4GD5A 4OEVA 1L5TA 1B5HA 2F34A 3PPQA 4QSDA 1Q35A 5DEXA 4DXBA 4KQPA 4UA8A 3TTMA 4C0RA 1NH8A 2YLNA 3IAZA 3UN6A 1H3DA 1N7WA 3TTLA 4ZEDA 3MJNA 4RK9A 4RPOA 3BBRA 4YKJA 4IGRA 1P99A 4ISUA 4R2BA 1SW4A 5I2NB 3LSLA 2NOOA 5ICTA 2UVGA 2ZYOA 3G3HA 3S9MC 1B3HA 1GR2A 2A5TB 4IO7A 2X26A 3N26A 4IY5A 2H9BA 4DZ1A 4JSOA 1ZBMA 3HN0A 5IAIA 2H5YA 2GRVA 2AL4A 3FV2A 5H8NA 1MDP1 1UTBB 1D3KA 1LAGE 1BP5A 3VLVA 4WEPA 3FVKA 4U2RA 4OWDA 4IO3A 2ABHA 4NTLA 1SYHA 2I0BA 4RJZA 3AXFA 3ILUB 4ZEBA 4ZDMA 1B0LA 3OMBA 1ZMGA 3KG2A 3KFMA 4OEUA 4XKRA 2XX7A 4EUOA 4FJPA 1FQEA 4E0XA 3HPIA 4NF4A 4ELOA 2NUVA 4LVQA 1A99A 1USYH 2DWAA 4Q0CA 4U1OA 2DWIA 5F7VA 4ZEKA 3TMGA 1PDAA 1POTA 1SVXB 1WODA 2ZNUA 3KEIA 3UA8A 3BKIB 1P1QA 2QMWA 1MY2A 2B65A 4NF8B 4LZ7A 4U23A 3O66A 3EQ1A 4G68B 2A5SA 1MH3A 3GBBA 3RGYA 2PMSA 1AH5A 3L6GA 3TKDA 3QK6A 3PD9A 4BDNA 3JZJA 1RYXA 2G93A 3CVGA 5JK4A 1D4NA 4M4GA 1JW4A 1JVYA 1Z7NE 3PPRA 2P1SA 1I6AA 1MY3A 2X7QA 1DPEA 2XXPA 4GQOA 2PVUA 2XXHA 3OO6A 4I1DA 3B6WA 4O3CA 4ZS9A 3TQLA 4C1UA 2O7UA 3PV0E 4MLVA 2D21A 1MXWA 3N94A 1B3FA 2GFEA 3CG3A 4PFWA 2PX1A 2XXYA 4IB2A 5CMBA 3SETA 3VFJA 4DE8A 1ATGA 1TT1A 3FZVA 3Q28A 2D3IA 2ZNTA 2HZKA 1PC3A 3CR9A 1MXXA 3IOWA 3PPOA 4GFRA 1A55A 2CMOA 4X1BA 4TLLB 4R72A 1B9JA 4PE5B 3RQTA 1Y3QA 1YCJA 4F1YA 1Y9UA 3H6UA 1VFDA 2F6GA 3HHGA 3CI8A 3Q27A 2PBWA 3F11A 2XD3A 2F35A 4XTCQ 3G7WA 4AB5A 3HO7A 4ZE8A 3TDJA 1M5FA 1MQIA 3K6XA 3QYTA 5JTYB 2Q2CA 5I57A 3QIMA 1P1WA 4H6DA 2OBGA 1II5A 3TUSA 5KDTA 4F3SA 3MW0A 3ECRA 3G3GA 1AMFA 4H8IA 3EHTA 5DEXB 2H4IA 1JEVA 2V84A 3ZKLA 4GXSB 4H1XA 4OTEA 3S9NC 3MAMA 3QXMA 1MG1A 3VV5A 2Z22A 3N6TA 1SI1A 4QHQA 3T9UA 4IO6A 4ESXA 3OO7A 3ZSFA 5I2NA 2ZYNA 1H44A 3IB2A 2A5TA 3PUZE 2Y7RA 4G8HA 5AA1A 3TTNA 2DVCA 4QFPA 1B1HA 1WDNA 4R6KA 2DYXA 1UIUA 2IA4A 4U22A 3K1PA 1D9YA 3OO8A 4LUBA 3FVGA 5AA4A 1B5IA 2H25A 2OWSA 4LA9A 3EPEA 4LZ5A 4NF6B 1R6ZA 1DTGA 1N3WA 1IXCA 5TPAA 4DIGA 2O84X 2QS4A 1URDA 1XS5A 2UYEA 1B7HA 1MM6A 1LCTA 5A5XB 3BFTA 1MS7A 2V25A 4OMBA 2Z8EA 2RKMA 3I6VA 4U4SA 4BDRA 4QFOA 4F19A 1QW0A 1OLCA 2AIXA 2VOZA 4QRZA 3E3KA 3N5LA 3A3UA 4IY6A 4C1TA 2E1SA 2G29A 2THIA 1MQGA 1B3EA 3KZGA 2QPQA 4LZ8A 3H7MA 4JWYA 4RK2A 3SERA 4ELPA 2XXRA 3KN7A 4U4XA 3C36A 4EQ7A 1MM7A 4YICA 3GLBA 1IEJA 4NF8A 1BIYA 2I0CA 4YB7A 1N0TA 1BTJA 1US5A 2ANJA 2I58A 4ONYA 5DTBA 5FTIA 1GVCA 3VXCA 4OXVA 1MRPA 5KCJB 4NMYA 3MP8A 2HAUA 2GHAA 1JNFA 1NNPA 2RINA 4MBPA 2DWHA 2BJJX 4ECFA 1HSEA 5TP9A 3ZKKA 3LUYA 3OSRA 3RN8A 2DXRA 2I49A 3VLWA 4F31B 4RA1A 4FECA 1TWYA 5FHNA 3DELB 1MXVA 2AL5A 4LONB 4BDMA 5CM6A 2AYSA 3E9XA 3FIRA 4N6PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OVRA 1UTBA 3HFUA 3G3JA 3H6TA 4GWZA 4GIZA 1PB7A 2PFZA 4GX6A 4ZZAA 4DLDA 3B6QA 2P2AA 2ZMBA 4AQ4A 4EF1A 1SQYA 3PUXE 3TCGA 2F7CA 1M5BA 4PCDA 2VD2A 4Z0IA 3FV1A 3H06B 3UP9A 4POWA 2I6EA 5DT6A 1NV1A 1NH7A 5TPAB 1FBHA 2O7IA 2NVUB 1FTLA 2HHMA 3OEKA 3RUMA 4OERA 1LFHA 4ELQA 5CI5A 3JYRA 4IO4A 2OWTA 3IJOB 2VP1A 5ISUA 3U1OA 2RC7A 4N13A 3DP4A 4PAKA 1IITA 3MVYA 1SI0A 1N7XA 4FATA 1J1NA 2O1LA 4NEDA 3O6HA 3U8QA 4GOTA 2O51A 2OCUA 1ZJLA 4XKPA 3TODA 4I3EA 5HM4B 4XFEA 4KD5A 3PPNA 1M5CA 4DDDA 1JEUA 4FEDA 3LSFB 5FTHA 1LFGA 4X1DA 2XXQA 4FAJA 2P0SA 3SDFA 4H45A 4NAPA 2QS2A 3LBSA 4WKMA 2Z8DA 2XXUA 3OENA 4F39A 3MZ1A 1A7LA 1RDYA 3RT8A 3TFLA 4FE8A 1MY0A 3OO9A 5B7DA 5K2YA 1INPA 5I2KA 2D5WA 4H65A 5BWJA 3O97A 3C33A 1PEBA 4QFLA 2R8TA 2VD3A 4YKKA 3KSJA 1USYE 1B0HA 2WBBA 1ELJA 3KOSA 2HXWA 3RYDA 2RCBA 4FIMA 3C4MA 4AB6A 1TFAA 1D9QA 2I3VA 5I56B 3FVNA 1HSJA 1GV8A 3PUWE 1DPPA 4O7MA 2HEUA 4NN3A 4P9KA 3K1NA 3GZGA 4KPTA 1LAXA 1VDWA 1MY1A 3FASA 1MXUA 5CMMA 1HSLA 1LBYA 5EQAA 4KHZE 3TAJA 3B8BA 1OVTA 4YB5A 1Y4CA 2DE2A 3RN8A 2W7YA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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