3RLFE

Crystal structure of the maltose-binding protein/maltose transporter complex in an outward-facing conformation bound to mgamppnp
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITKASAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
publication title Snapshots of the maltose transporter during ATP hydrolysis.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Hydrolase/transport protein
total genus 122
structure length 374
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-04-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rlfE02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rlfE01
1LFGA 1SW2A 3PU5A 2QJEA 4HCWA 2DE2A 4PFUA 4QSCA 1FTKA 4Q5TA 4OFLA 2FA7A 5I59A 4ZZEA 1AOVA 3BFUA 1QKBA 5H8NA 3S9LC 4RA1A 3SERA 3LBSA 3TTKA 3ONMA 1QUKA 4F18A 4FORA 4YKIA 1IXHA 2DYXA 3TPAA 2ANJA 1ZLQA 3ILTB 3UN6A 3IB0A 3KJ7A 1Y3PA 1LAFE 2NWJA 2A5TA 2ALUA 1P1OA 3VE1B 4X1BA 3PUXE 1MY1A 1XVXA 1WVJA 4NF6A 5H8HB 5CRYA 4PFTA 2DWIA 3EQ1A 3TELA 5H8SA 3SESA 4ELRA 4UA8A 3ZSFA 3A3UA 5FTIA 4BDOA 1FQBA 5KZTA 2HAVA 3EHTA 4NWCA 3VVEA 2H5YA 5IAIA 3FV2A 5F1QA 2UYFA 3MVZA 4K3FA 4QRZA 1B58A 3DP4A 1ANFA 1USYH 1D3KA 1MQGA 1KWHA 2ONSA 5TP9B 1OVTA 4F31B 2CMOA 3C32A 1MXWA 3S9MC 2Y84A 2XHDA 4ESXA 3O6IA 1M5BA 3BFTA 4P0IA 2DS9A 3CI8A 2WKYA 3KBRA 5L9OA 1TFDA 1LCTA 4MH5A 3RTWB 3FATA 1LFIA 3TCGA 5BUUA 1IXCA 4OWDA 4H5GA 1VSOA 1LBCA 4WEPA 4RXLA 4LZ7A 1BIYA 3CRBA 1MDQA 5CBSA 1PDAA 4YKKA 5FHNA 2P0SA 1VFEA 3O6HA 3GLBA 3FJ7A 1B1HA 2O84X 3SEUA 2R71A 5BWJA 1HSJA 2O1MA 2XX9A 3HCQA 3M3LA 4LONB 2OJTA 3P7IA 1LB8A 2AYSA 1WODA 3K00A 4XXUA 4BDQA 1RYOA 2QRYA 4OENA 4POXA 1M5DA 3FVNA 4F3PA 1GGGA 4IO2A 1II5A 2VD2A 1PBPA 5LOMA 3E13X 2G93A 2F35A 4YKJA 1B2HA 3CFLA 2DXRA 2RCBA 4IGTA 1MPCA 4GL8A 3L6HA 4ZZAA 4R2FA 1XS5A 4N6PA 4PE5B 3G7WA 1Q1KA 3MZBA 1AIVA 2DOJA 1MY0A 1MY4A 3EF7A 3PUVE 3W15C 4OXVA 4E0XA 3HV1A 3S9EA 2HZLA 3HN0A 2XX7A 4EQBA 3PMVA 4GF8A 4FIMA 4MLVA 1Y9UA 4N07A 2PBWA 1H45A 1SW4A 1YAEA 4Z7EA 3IOTA 1H44A 2F36A 5I2NB 3MQ9A 1QULA 4O3CA 2ZNTA 3MVXA 4I9DA 4OTEA 3CG1A 1R6ZA 1HSEA 4EXKA 2XXPA 3MVYA 1LAXA 2HQ0A 1B32A 4JSDA 2A5SA 4WKMA 1RYXA 5CM6A 2UVHA 4QFOA 3TTRA 3TKDA 3T9UA 2E0SA 1XT8A 1MXXA 3IO6A 1A8EA 4DLDA 3T96B 5ISUA 3FVKA 2D3IA 4ZEBA 4NF8A 2ESNA 3UA8A 1FW0A 1B3FA 2I0BA 1YCJA 1XHYA 1A55A 3H6WA 5I2KA 3FXRA 2D5WA 3LR1A 1B5JA 3S9NC 5TPAA 2H99A 1MRPA 2NUVA 2Q9TA 4YB6A 1NNKA 3LUYA 3L6GA 1N7WA 1LBBA 4XKPA 4YAHX 4BDRA 4QFNA 4H0WA 4QFKA 4F22A 3B7DA 4OMBA 1MXUA 1SI1A 1TWYA 3ZS6A 4C0RA 3OEKA 1IIWA 3CFXA 1NL5A 3LSLA 4GIZA 4I62A 4ZE9A 2I4BA 4KYSA 4BLAA 3O9PA 4R72A 2ONRA 4NF5A 1LGBC 1HSLA 1M5EA 4QF9A 4OERA 3FJGA 1DPPA 3FVOA 3G3JA 4BDLA 4JSOA 4RK9A 2Q2CA 3SDFA 2ZNSA 3W9VA 3TCHA 4PFYA 1DMBA 4OEVA 2I3VA 4RJZA 1FQCA 3CVGA 1LFHA 3R6UA 2QS3A 5I2NA 5JTYB 1I6AA 4U4SA 4BDMA 5AA2B 4EQ7A 1RKMA 3OMBA 5I56A 1R9LA 4THIA 1B0LA 1BP5A 1XC1A 4X48A 3MZ9A 4DCYA 5CMKA 4LA9A 4E0WA 3I5OA 3H3GA 3PMXA 3SEVA 4DIGA 4EF1A 1XVYA 1TT1A 1JVXA 1LAHE 4KFQA 1FTJA 3QAXA 4NMYA 4F1VA 1XOCA 3S4UA 3K0VA 2Z8EA 4R6KA 4OEUA 1H76A 2XD2A 1A54A 1LCFA 1IXGA 4EXLA 1P1QA 3IB1A 2GRVA 3DP8A 3A3CA 1B3EA 1IITA 4I8CA 1FTMA 3IOVA 2IA4A 2F7BA 3K6XA 2Y7PA 4P0GA 1MY3A 1OQHA 3I3VA 3SETA 4PFWA 3G3GA 4FEBA 2I6EA 3Q27A 3ZKKA 1PB7A 1N76A 3IL1B 2DWHA 2VP1A 4JWXA 4NWDA 3TQLA 4GRKA 4F39A 2QS1A 4H8IA 1UTHA 3TYHA 3B6TA 1A7LA 4R2BA 3U72A 3IK6B 1PC3A 1B3LA 1OLAA 4FAJA 3SKPA 3PPQA 3TZAA 4HW8A 1JEVA 5CMBA 1B05A 2V3UA 3KN8A 3C36A 3RT6B 2ZYOA 4QFPA 3JYRA 3CFZA 1ZJLA 3A09A 3TAJA 3H4ZA 3N6UA 2QPQA 2H4IA 1SDXA 3DM0A 4F1YA 3THIA 1F9BA 5I58B 3HHFA 5HM4B 1GR2A 2ZMBA 3N26A 3ZKLA 4ND9A 4ZE8A 3OO9A 2DSFA 4AB5A 2RC9A 1B40A 4XKQA 4KCDA 3U93A 4PETA 2Q8JA 2QMXA 2YPNA 3T9XB 2V25A 2ZYKA 3T9VA 1NFTA 4HTGA 3BKIB 5FHOA 1PB8A 2V3QA 1B5HA 3SEWA 4ELPA 2Y7WA 3KOTA 3K6WA 2DE3A 1B52A 4IGRA 4U1ZA 3VLWA 3FXUA 2F5XA 2H9BA 4GQOA 4ZEDA 4GL0A 1SYHA 3MP6A 5K2YA 3MPLA 3FVGA 1POTA 5CI5A 1Y3QA 3SEYA 1B1XA 4WXJA 2HZKA 4X9TA 3FZVA 4ONYA 4DXBA 3H6VA 1FQDA 2P1SA 4IY5A 3MPKA 4C1UA 2Z23A 5DVFA 5KCJB 1P1UA 2F6GA 1QUIA 2XXQA 3FUZA 1GVCA 3KGCA 2VHAA 5ICTA 3GBBA 2ZXTA 1LB9A 3H7MA 4OQOA 3D4CA 4F3GA 2DXYA 3IOUA 3KOSA 2F78A 3VDFA 5JK4A 3HHGA 3Q28A 1IEJA 4TQUQ 5AA3A 1R1NA 5DTBA 2NVUB 4FATA 1MXZA 4OYVA 4F3SA 4FE8A 3WAFA 4GLIA 4P11A 1URDA 2GFEA 3MP8A 2F8DA 3TCFA 2O68A 5I57B 2B65A 4MBPA 2X26A 4U1OA 5I58A 4RK2A 1EH3A 2I49A 2DE4A 1B46A 1H3DA 5H8HA 2Q88A 5ITPA 2NOOA 1ZTYA 2CZLA 1OIBA 1QW0A 3M3KA 1PB9A 3O2AA 1L5TA 3Q25A 4ISUA 3BBRA 3TTMA 1MDP1 5L9MA 2OCUA 2B3BA 4GWOA 4KI0E 1QUJA 2PVUA 3UK4A 3IOWA 4ZEFA 4NTLA 1N7XA 1O64A 1Y20A 5KDTB 5F7VA 4YICA 1MPBA 3CIJA 2UVIA 4XKNA 4QSEA 4I1DA 3LSWA 5TP9A 1IXIA 4ECFA 3MVWA 3CG3A 4OVJA 3MJNA 4GOTA 3WAEA 3K6VA 2X7PA 1MQHA 1URSA 5FTHA 2QMWA 2REJA 3TTNA 2F34A 4O3BA 4OHNA 4NE4A 2AL5A 4LUBA 1D9YA 4AQ4A 1B3GA 3RQTA 4EDPA 1YPNA 4TLLB 1QJMA 5KCJA 2O69A 1Y1MA 4NF4B 2UVGA 3EN3A 3VVFA 3MWBA 5A5XB 1Y1ZA 3C33A 3MP1A 4POWA 3E3KA 2V93A 1R9QA 2YLNA 3IB2A 4LZ5A 3U92A 3T9HB 3V8XB 2BJJX 3VFJA 4ZEKA 3E9XA 3FV1A 2GHAA 3D4GA 2I4CA 1YTVA 2F7AA 1D4NA 2F97A 1IZ1A 2ONKE 4OFOA 3FD3A 4QFLA 3OO6A 4Q30B 4IO6A 1SI0A 2UXAA 2O7IA 3K1MA 2FYIA 4OZ9A 3PUWE 1US4A 4Z0IA 5I57A 2DP8A 5M2VA 4RY1A 2XXYA 2I3WA 2NXOA 3ODBA 1IUDA 3TEPA 1NH8A 4KYEA 3RPWA 2IEEA 1H43A 1QKAA 3GZGA 1ZBMA 4ZS9A 1B7ZA 1FCKA 3VXBA 4EF2A 4QHQA 1MS7A 3HSTA 5I59B 1D9VA 1SD3A 1SVXB 5H8NB 1Y4TA 1ZKBA 2RF1A 4RPOA 3C35A 1ZIUA 2UVJA 3H6UA 2Z8FA 1TFAA 3KN7A 3RY3A 1IQ7A 4M4GA 1FQAA 2HCAA 4U23A 1EZOA 2F6PA 2I0CA 4H67A 2RC8A 4OFJA 1JNFA 2I58A 2A5TB 3IX1A 1I6BA 4MF3A 3TFLA 4YKPA 3PGFA 1MQDA 4R6HA 4NF6B 2OK2A 2PT1A 3K01A 1URGA 3V89B 5HPQA 4ZDMA 3MAMA 2AIXA 2R9JA 1MM7A 2XXVA 3RTFB 3U94A 2PYYA 3RUMA 3K4UA 2H25A 3CR9A 1S50A 2ZYNA 3HO7A 3KSXA 4NF4A 2XXXA 2XXTA 2KLFA 2Y7KA 3TMGA 3PD8A 2OLBA 3PUYE 3KEIA 4IY6A 5CMCA 4UACA 3O28A 1POY1 3KSJA 3QSLA 2RINA 4YZZA 3IAZA 1I6QA 2DWJA 4G8MA 1MH3A 5EHSA 4G68C 3LC8A 1ELJA 1MQIA 1WDNA 1GV8A 3V83A 1FTOA 5L9SA 3FIRA 4R75A 3PUZE 3FXQA 1JW1A 3PPNA 3G3IA 3AXFA 3M3FA 4U4XA 1OVBA 3OOAA 1Q35A 4U21A 1MXVA 4G2ZA 1LSTA 2ZYMA 1SQYA 4IO4A 4ZEIA 5ITOA 3G3FA 4GFRA 3TTLA 4XIGQ 4YMAA 1NMUA 3O29A 4N13A 4AB6A 3RLFE 3UGWA 2D21A 2M8CA 1DSNA 3TODA 1TXFA 2HXWA 1M5CA 2XXWA 3QUFA 2QSXA 3KZGA 1MG1A 3TQWA 5J1DA 3T22A 3SEXA 3OD7A 4G4PA 4G68B 5DVJA 3K02A 1CE2A 2FNCA 4RYAA 3EHSA 1VE4A 4EUOA 3CSGA 3Q26A 2REGA 3QK6A 4OESA 3C31A 1B5IA 1US5A 5B7DA 1P99A 5JTYA 1B7UA 5AA2A 3VXCA 1BTJA 1NKXA 2V3TA 3U8QA 3VLUA 3M8UA 3OELA 2GH9A 4FECA 2GHBA 2VGQA 4L17A 1P1NA 4R9FA 5ELVA 2I48A 4OETA 3DLNA 3K6UA 1Z7ME 4IB2A 5CMMA 1JQFA 5AA4B 5CBRA 4RNSA 1S9TA 1JW5A 2X7QA 2H98A 4XTCQ 4ELOA 5HBCA 4NEDA 1B9JA 1FQEA 3N6TA 3RT8A 2XXIA 1A99A 3B6WA 4IO5A 2HAUA 5H8FB 3G3HA 5H8QB 3PPPA 2PMSA 4DE8A 5DT6A 4DZ1A 4H6DA 4H1XA 1S7YA 1Y4CA 3RNNA 1AH5A 3V5AA 3EPEA 4GVOA 3IORA 1PBQA 2DWAA 3EHUA 4Q0CA 2OZZA 1UTBB 1JVYA 4IO3A 4WEDA 3PV0E 2Y7IA 2QL3A 4EQ9A 3C34A 2OWSA 3OO8A 2O6AA 1A40A 1UIVA 4M1VA 3R26A 3RN8A 1LLSA 1DTZA 4GD5A 1B3HA 5IKBA 1N3XA 3FASA 4KPTA 1SYIA 4NF8B 3ECRA 2RCAA 3K1PA 1JEUA 1J1NA 2VD3A 5EHMA 1M5FA 3QYTA 3I6VA 3T66A 3O97A 4KYDA 4G68A 2XD3A 4YB7A 2Z22A 4TLMB 3ILUB 5I2KB 5DVIA 4KR5A 2OWTA 4X1DA 4YMBA 4Q8RA 1AL3A 3DELB 5TPAB 3FJMA 1VR5A 5TU0A 3G3KA 3GXAA 2E1SA 3T93B 4G8HA 2DVZA 1FTLA 4H65A 4C1TA 4LP2B 2YJPA 4HCYA 2QS4A 1LAGE 4LVQA 3PPRA 3MZ1A 5DEXB 2Z8DA 3MW0A 4ELQA 5DYHA 2R6GE 3H06B 5CC2A 4H8JA 3LSFB 3KN3A 3DP6A 3IJXB 1FQFA 4IO7A 3K1NA 4JDFA 4NF5B 3LSXA 2HEUA 5AA4A 4DXCA 4JWYA 4RPNA 2ZNUA 2W7YA 2Q2AA 3RGYA 4FJPA 3TUSA 1EZPA 4QSDA 2V84A 4XKRA 2G29A 1N3WA 5K2XA 5H8FA 3H03A 1Y3NA 3MBPA 4JXIA 5H8QA 4YB5A 3CSBA 1QVSA 1DOTA 1ZU0A 4FEDA 5I56B 3VLVA 1OLCA 5ICQA 1DTGA 5B70A 3PPOA 3S2VA 3C9HA 4F19A 2DQVA 2O1LA 4GXAA 1SW5A 4U22A 4ZECA 4R73A 1UTBA 3E4RA 4GXSB 2Y7RA 2O7UA 3QIMA 4F2OA 1EU8A 3B6QA 1P1WA 3K2DA 1MQJA 1NNTA 4YU0A 5AA2D 5EYFA 1NNPA 1Z7NE 5L8DA 3QUJA 3TDJA 1MH4A 1O7TA 4LQ2A 1OMPA 4JBZA 1B4HA 3PD9A 4O3AA 1T0KA 3F11A 2XX8A 3FGSA 2DVCA 3OENA 2XXUA 3HPIA 3IJOB 1I69A 1N04A 2O51A 1SW1A 1ZMGA 4JB7A 1CB6A 1UIUA 1MPDA 4LATA 3UP9A 2HFBA 3Q29A 1OQGA 4F2QA 3OXNA 1USYE 1N0TA 2PT2A 4MFIA 2LAOA 1DPEA 3R7XA 4ESWA 3O6GA 1ATGA 1B6HA 2OBGA 2P2AA 1UTHB 4DXUA 5DEXA 4R74A 4PP0A 4R6YA 4KQPA 1VFDA 3OSRA 3IO4A 5KDTA 2RC7A 1NNFA 4LQ5A 2ABHA 2PX1A 3KJTA 3USDA 4G8NA 2VOZA 3JZJA 3GBAA 1BLFA 4BDNA 5AE4A 2QS2A 1B7HA 3VV5A 1UQWA 3KG2A 4HS7A 4DCXA 3C4MA 4TOZA 5JEIA 4F1UA 4H5FA 3H6TA 3JV9A 1MXYA 1JW4A 3OSQA 4KCCA 3O66A 1B4ZA 3UORA 3N5LA 1AMFA 4F3BA 5A5XA 1MM6A 2RKMA 4G77A 2Q89A 3MUQA 3IR1A 3VVDA 1B51A 1BKAA 1SBPA 1O63A 1PEBA 5FHMA 2THIA 3MC2A 1EZ9A 5AA1A 4LZ8A 2UYEA 2XXHA 3N94A 1N84A 3OO7A 3W9WA 3UIFA 4F29A 4PQJA 1NH7A 3U1OA 1A8FA 2XXRA 5I84A 3QXMA 4U2RA 2F7CA 3KFMA 2B3FA 3OEMA 4DDDA 4KHZE 4JWOA 1GTKA 4MLQA 4R9GA 2AL4A 1B0HA 3PMWA 4KD5A 1MY2A 1JETA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LFGA 1SW2A 3PU5A 2R8TA 2QJEA 4HCWA 5ET6A 2DE2A 4PFUA 5EYGA 4QSCA 1NI9A 1FTKA 2CEXA 1FTAA 1KA0A 4Q5TA 4OFLA 2FA7A 5I59A 4ZZEA 1AOVA 3BFUA 1QKBA 5H8NA 3S9LC 4RA1A 4O7MA 3SERA 3LBSA 3TTKA 3ONMA 1QUKA 4F18A 4FORA 4YKIA 1IXHA 2DYXA 3TPAA 2ANJA 1ZLQA 3ILTB 1G0IA 3UN6A 3IB0A 3KJ7A 1Y3PA 3RYDA 1LAFE 4MX6A 2NWJA 2A5TA 2ALUA 1P1OA 3VE1B 4X1BA 5EQ7A 3PUXE 1MY1A 1XVXA 1WVJA 4NF6A 5H8HB 5CRYA 4PFTA 2DWIA 3EQ1A 3TELA 5H8SA 3SESA 4ELRA 4UA8A 1XI6A 3ZSFA 1K9ZA 3A3UA 5FTIA 4OVPA 4BDOA 4GWWA 1FQBA 3E79A 5KZTA 1IMDA 1LBYA 5I7IA 2HAVA 3EHTA 4NWCA 3VVEA 4P1EA 2H5YA 5IAIA 3FV2A 5F1QA 1JP4A 2UYFA 3MVZA 4MCOA 4K3FA 4QRZA 1B58A 3RPLB 3DP4A 1ANFA 4I3YA 1USYH 1D3KA 4N91A 1MQGA 1KWHA 2ONSA 4XFEA 1OVTA 5TP9B 4F31B 2CMOA 2CZKA 3C32A 1MXWA 3S9MC 2HPGA 1YXIA 2Y84A 2XHDA 4ESXA 3O6IA 1M5BA 3BFTA 4P0IA 2DS9A 3LUZA 3CI8A 2WKYA 3KBRA 4PGPA 5L9OA 5LTCA 1TFDA 1LCTA 2VT5A 4MH5A 3RTWB 3FATA 1LFIA 3TCGA 5BUUA 1IXCA 4OWDA 4H5GA 1VSOA 1LBCA 4WEPA 4RXLA 4LZ7A 1BIYA 3CRBA 4GWYA 1MDQA 5CBSA 1PDAA 4YKKA 5FHNA 2P0SA 1VFEA 3O6HA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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