3RLFE

Crystal structure of the maltose-binding protein/maltose transporter complex in an outward-facing conformation bound to mgamppnp
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITKASAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/transport protein
source organism Escherichia coli
publication title Snapshots of the maltose transporter during ATP hydrolysis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
total genus 122
structure length 374
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-04-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rlfE02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rlfE01
3SEVA 5DVJA 2CMOA 4WXJA 4F3BA 3TTKA 2QJEA 1DPPA 4IO5A 2QMXA 4ZZAA 3KEIA 2YPNA 3PD9A 4DIGA 4G2ZA 3GBAA 3MPKA 4PFTA 1LBBA 1UQWA 4GRKA 4F2QA 2QL3A 3KJTA 3RLFE 2UVJA 2Q9TA 2RC7A 3RUMA 2F35A 2Y7WA 1PDAA 1XT8A 2QS4A 2D5WA 1II5A 1URGA 1Y1MA 2A5SA 4PFYA 1MDP1 1PB7A 4H6DA 1EZ9A 5M2VA 1Y3QA 4F1UA 2Q2AA 3OSRA 2H25A 1IXGA 4X1BA 1USYE 3AXFA 5H8SA 2QS2A 3LSFB 2OWSA 3RN8A 1H76A 4R73A 1JW5A 5BWJA 1AOVA 3IB1A 1ZLQA 4XXUA 3T22A 3RT8A 3N94A 5H8HA 1UIUA 1POY1 5FTHA 3FGSA 3KGCA 2V84A 1B4ZA 4WEPA 4GIZA 3IJXB 4ELOA 3MW0A 2I6EA 5I57A 4YB5A 5L9MA 4ISUA 5FHMA 1FQAA 5JK4A 2OBGA 5ITOA 3T9HB 1NH8A 2XX8A 3QUJA 2AYSA 1MM7A 4QSEA 1B3EA 5EYFA 3MVYA 4EF2A 4LVQA 1FTKA 4BDLA 5L9OA 4MLQA 1GGGA 1IXHA 1ZBMA 2XXXA 1FQFA 1LAHE 2GFEA 1I6AA 2D3IA 3IORA 4LZ8A 2XXQA 1LFGA 2R9JA 3RTWB 3SERA 4U4XA 4TLLB 3PPNA 2REGA 4DZ1A 1B7UA 1SBPA 2B3FA 3IOTA 2UXAA 2HFBA 1NL5A 2VD2A 5TP9A 3OENA 1OLAA 4EQ9A 3GBBA 5AA2A 2AIXA 2ABHA 3UGWA 5B70A 1SYHA 4ZE9A 1BLFA 1B5JA 4MF3A 3HPIA 3PUVE 1ZTYA 1DOTA 3IB2A 1NNPA 4F19A 1Y1ZA 1N7XA 2DQVA 1L5TA 4ZDMA 3C9HA 4FECA 4KD5A 2PX1A 1S7YA 4EF1A 3GLBA 3VLVA 4OVJA 3EHUA 3VDFA 3PUZE 1Y3NA 3HN0A 1XS5A 2YLNA 2Z22A 3VXBA 4FATA 5H8HB 3A09A 1ZU0A 4YICA 5KZTA 4YB7A 3R6UA 1F9BA 1A55A 5ELVA 3MBPA 4JWOA 4IO7A 2ZMBA 4KFQA 3G3IA 1GVCA 4YMBA 2OK2A 3C32A 4NE4A 2ZNTA 5CRYA 3LSLA 5A5XA 3WAFA 5I56A 1LFHA 4ZEKA 3MUQA 2LAOA 4HW8A 5K2YA 2W7YA 1A8EA 4JSOA 4JDFA 4Q5TA 4UA8A 4QFKA 3LC8A 1FW0A 2DWIA 2P2AA 3IOWA 3G7WA 3DM0A 1N84A 1XHYA 3OXNA 5JEIA 2NVUB 2O1MA 2XXHA 4RK9A 1FTLA 4OETA 2Z8EA 3E3KA 3FD3A 3ILTB 5H8NA 3QSLA 3JZJA 4KCCA 4GOTA 2UYEA 3BFUA 2HZKA 3EHTA 1GV8A 1HSEA 2PT1A 5I2NB 1CB6A 1UTBA 3MVWA 1IIWA 5DVFA 3FVKA 3PMXA 4NF5B 1OVBA 4YKPA 1SI0A 3MVZA 5AA2B 1EU8A 4OFJA 3OEMA 3PUXE 3RT6B 4GL8A 1SQYA 1VFEA 1N76A 2NWJA 2RCBA 2UYFA 1PBQA 3OO9A 2F97A 1CE2A 3ZS6A 4G8HA 3N6TA 3G3FA 4QFLA 3CFXA 3DP8A 1AL3A 2PYYA 1NFTA 3ZKLA 4KI0E 4DXBA 3SDFA 3IJOB 3CRBA 4F18A 5ICTA 2Q89A 3TCFA 3KOTA 4LP2B 1YAEA 3OMBA 4P0GA 2Z8FA 4ZEBA 1XVYA 3SEXA 3TELA 3RGYA 3OSQA 4H8JA 1EH3A 2XXVA 3LSXA 2DVCA 3FV1A 1P1WA 3EQ1A 2BJJX 1J1NA 1FQBA 2XXYA 5KDTA 4LA9A 3ONMA 4RY1A 3VXCA 2VD3A 3PV0E 3SESA 3H6TA 4EQ7A 1ZKBA 2V93A 2DE3A 4XTCQ 2FNCA 4R9GA 4UACA 3S4UA 2IA4A 3ZKKA 5IAIA 3U94A 4LZ5A 3T66A 1QKBA 3KG2A 2QPQA 3CSGA 4ESWA 4OQOA 5TU0A 3OO8A 3I6VA 1LB8A 4E0WA 4MH5A 1MY4A 5AA2D 4IB2A 1LCFA 1MQHA 3CIJA 4LONB 1A99A 3O66A 4F31B 5FHNA 4EDPA 3QXMA 4RYAA 1Y9UA 3Q26A 5I2KA 1B3LA 5F7VA 1ATGA 4U2RA 3ILUB 1QUKA 2THIA 3TCHA 1NNFA 3B6TA 3T93B 4JWYA 4OFLA 1QKAA 2DWHA 3K6WA 4ELQA 1B9JA 1XOCA 1B51A 1IITA 2ZNSA 2ZNUA 5BUUA 1IQ7A 4QFOA 4R2BA 3UORA 3LSWA 2GHAA 4BDQA 4G68C 4IY6A 1JQFA 2PVUA 1LGBC 4HCWA 1HSLA 2XXWA 1PB9A 2GRVA 4JXIA 1QUIA 4U1ZA 3Q28A 1MPBA 1S9TA 1FTJA 2ZYMA 2Q8JA 1B46A 3SEWA 3TUSA 3OEKA 3TKDA 4QHQA 3GXAA 4L17A 1LBCA 4U23A 2OZZA 1B58A 3H6UA 4X48A 3FIRA 3HCQA 1VSOA 4R75A 2QRYA 5I59A 3CFZA 4QF9A 4R9FA 1MXZA 1OQHA 4U4SA 4NWDA 1OVTA 3W9WA 3N26A 3VFJA 2XXRA 4LZ7A 2KLFA 3V89B 1Z7NE 4OWDA 2F7BA 4GWOA 1Q1KA 2P0SA 3S9EA 3TDJA 4KCDA 1B1XA 1URDA 4DCYA 3TYHA 5H8FB 1UTHA 4ND9A 5J1DA 2QMWA 1O7TA 1FQCA 4NF6B 1QW0A 4PQJA 4FEDA 4IO3A 4EXKA 1Y4TA 1BTJA 3K1MA 1M5DA 2G93A 2RF1A 4LQ2A 4H67A 5L8DA 3TMGA 5KCJA 2CZLA 2ESNA 1Y20A 3C34A 2FA7A 3G3HA 3IO6A 4GXAA 1SYIA 3THIA 5CMCA 3FVGA 2F36A 4MBPA 3K00A 2F5XA 2ONRA 2HQ0A 4YKJA 2XX7A 2I4BA 2ALUA 1USYH 2R71A 4DXCA 4XKPA 1LCTA 4BLAA 3K1PA 4H0WA 5CMKA 4DLDA 3S9NC 4G68A 1LAGE 4NTLA 1MDQA 2F8DA 3IO4A 4X9TA 1I69A 2Y7IA 4POWA 3C35A 3RQTA 5LOMA 4OEUA 4F3SA 1OMPA 3C31A 2I4CA 2UVGA 1SVXB 2ZXTA 3VLUA 2O84X 4ZEDA 5JTYA 2Y7KA 1PBPA 5HBCA 4F3PA 2O7IA 1FTOA 1B52A 1A8FA 1N3WA 3MC2A 3FJGA 3TEPA 4DCXA 5AA4A 1B32A 3QUFA 1JEUA 3F11A 3O28A 1NKXA 3RNNA 3MZBA 3O9PA 1PEBA 1M5CA 2RC9A 3O29A 1B7ZA 4I8CA 4F1YA 1MPCA 4R6KA 4RJZA 3O6IA 2F7AA 2OLBA 5EHMA 2VGQA 2VHAA 4KYEA 1EZPA 3M3LA 1WODA 3H3GA 4EXLA 3CG3A 2M8CA 1MS7A 3T96B 3IOVA 1P1NA 3TPAA 1H45A 1Z7ME 4TOZA 2UVHA 1AH5A 1QJMA 3TTLA 4IY5A 3DP4A 3FV2A 3TODA 1R1NA 4YKKA 3MP6A 5I57B 1B1HA 3D4GA 3EPEA 5KCJB 5CI5A 4AB6A 5DTBA 3P7IA 2O68A 4QFNA 2H4IA 4IO6A 1B3GA 4THIA 3K1NA 4GD5A 3H4ZA 3PPPA 2PBWA 1MQDA 4OERA 4NMYA 4NWCA 4NF4A 4KHZE 4NF8A 4IGTA 3MQ9A 5K2XA 1MG1A 3K6UA 3UA8A 5DYHA 3CI8A 4U22A 1B5IA 1D4NA 1N3XA 4DXUA 2DS9A 3O97A 1P1OA 1LAXA 4ZS9A 1VFDA 3FZVA 4RNSA 3LBSA 3I3VA 3PU5A 4R6YA 1D9VA 2VOZA 3JYRA 3KN3A 1H44A 4KPTA 5TP9B 1JEVA 2R6GE 4JB7A 3SEUA 2Y84A 2DVZA 3BBRA 3FJMA 3KZGA 2I0CA 4OYVA 3K0VA 1B0LA 1TWYA 2PMSA 2HAVA 1SW1A 5AA4B 4FAJA 1ELJA 4OENA 5DEXA 4GQOA 3C33A 2XXUA 3TZAA 1D3KA 3M3KA 2XHDA 2RC8A 1B05A 1BIYA 2F7CA 1RYOA 2RCAA 2FYIA 4QSDA 4RPOA 5TPAA 4FJPA 4F1VA 5CBSA 1MH3A 4PFUA 1N7WA 1MXYA 2GH9A 4R72A 3V83A 3R7XA 1VE4A 5F1QA 2DXRA 2XD2A 2I3VA 3MPLA 1AMFA 4BDMA 1O63A 1LB9A 3QIMA 3KN7A 3FVNA 1OLCA 1JW4A 4C1UA 2O6AA 4BDOA 1SW4A 1ZMGA 5A5XB 5I56B 1A54A 4YZZA 3QK6A 2DE4A 2Q88A 5I58A 1HSJA 1OIBA 2A5TA 4ZEIA 1VR5A 2B65A 5L9SA 3HSTA 2NXOA 3OELA 3PPQA 3L6HA 3U72A 2YJPA 3V5AA 3U1OA 4OESA 4IGRA 1ZIUA 3KSJA 2I58A 4FEBA 3HV1A 2ZYOA 1FQDA 3BKIB 1SDXA 4E0XA 3R26A 1B40A 5H8NB 3Q27A 2XXTA 3ZSFA 5CMBA 4EUOA 2HEUA 4QRZA 4BDNA 1P99A 4TLMB 1UTBB 1O64A 3K2DA 3TTNA 1P1QA 1R9LA 4ZEFA 1SD3A 1ZJLA 1TFDA 4XKNA 1MY3A 3PPRA 1MY0A 1YPNA 3T9XB 4BDRA 1AIVA 3PMVA 2XX9A 1B2HA 3N5LA 1A7LA 4IO2A 4P11A 1MH4A 2V3QA 3G3JA 3K01A 4KR5A 2F34A 4H5GA 3TQWA 1ANFA 5HM4B 3TAJA 1KWHA 1GTKA 4POXA 2RKMA 3PUWE 3U8QA 1MQGA 3OD7A 1MPDA 4GXSB 4JSDA 3PGFA 1M5FA 4F2OA 2F78A 1RYXA 3K02A 1TXFA 2I0BA 5KDTB 4M1VA 1MY2A 3E9XA 4DE8A 2X7PA 5I58B 4JWXA 3PMWA 2REJA 5ITPA 5FHOA 5H8QA 2H9BA 4N07A 4R6HA 3E13X 1H3DA 3H06B 4H8IA 3A3CA 1H43A 1SW2A 1Y3PA 2O1LA 1MQIA 3CG1A 3O2AA 3MJNA 4H1XA 4M4GA 4I1DA 3K4UA 1WVJA 3K6VA 1I6QA 2O51A 4FORA 4F3GA 1I6BA 5AA3A 5FTIA 1T0KA 4G8NA 3FXRA 3KBRA 4ZZEA 1B3FA 1S50A 1UIVA 3D4CA 4PE5B 2F6PA 4RA1A 2V25A 1MRPA 1SW5A 5I2KB 3TCGA 3IOUA 1B0HA 3B6QA 5CC2A 1MXXA 3CFLA 4YU0A 3L6GA 4LATA 1GR2A 4OZ9A 3W15C 2ZYKA 2VP1A 3N6UA 4ZE8A 4C1TA 1MY1A 3VE1B 3EHSA 4QSCA 2HAUA 4NEDA 3H6WA 1LSTA 4U21A 1R9QA 1A40A 3CSBA 3KJ7A 1NMUA 3Q25A 2OJTA 4ELPA 3T9UA 3S2VA 5DT6A 1URSA 4ESXA 4GL0A 3SKPA 4WEDA 4ECFA 3PD8A 3M3FA 3FXQA 4R2FA 4K3FA 1R6ZA 2G29A 4Q30B 3TTMA 3O6GA 4GFRA 4KYSA 1LLSA 3U92A 3A3UA 3UN6A 3BFTA 2QS1A 3KFMA 3KN8A 2DXYA 1NNKA 3DLNA 2AL4A 3OO6A 3M8UA 1FQEA 2DYXA 3SEYA 5H8QB 1BP5A 3MVXA 4YMAA 4RPNA 1MQJA 4OTEA 5I59B 4U1OA 3VLWA 1M5EA 3OOAA 3T9VA 3FJ7A 1US4A 2IEEA 4O3CA 3RPWA 2D21A 2DWAA 4IO4A 4F39A 3G3KA 5CM6A 2X26A 1SI1A 5I2NA 1QUJA 4NF5A 4G4PA 1IXIA 1D9YA 4OHNA 4YAHX 3OO7A 4WKMA 3H03A 1RKMA 1UTHB 3KSXA 4H65A 3IX1A 4YB6A 1DTGA 4ELRA 1Q35A 1Y4CA 3TFLA 5ICQA 3KOSA 5AE4A 1DTZA 1FCKA 4GLIA 1MXUA 4TQUQ 2QSXA 3MP1A 4LUBA 3TQLA 1POTA 4G8MA 3EN3A 3UP9A 4YKIA 5I84A 3MZ9A 1PC3A 5CBRA 3Q29A 3MZ1A 3ODBA 3FVOA 4OEVA 4PP0A 1LFIA 4ZECA 4AB5A 2DOJA 1TFAA 4O3AA 2DWJA 1WDNA 2UVIA 2E1SA 3E4RA 2XXIA 4G68B 2RINA 1JVYA 3MP8A 2X7QA 4C0RA 2V3UA 1XVXA 3VVEA 2H5YA 2GHBA 4G77A 3UIFA 2H99A 2O7UA 1JVXA 3H7MA 3HHFA 4GVOA 3PUYE 4XKQA 3S9LC 3FATA 2B3BA 5AA1A 3VVFA 4X1DA 3CVGA 3B6WA 3IK6B 5JTYB 2OCUA 2I49A 3HO7A 3H6VA 1M5BA 1IEJA 3EF7A 2I48A 4P0IA 2P1SA 4DDDA 2DE2A 4EQBA 4LQ5A 1XC1A 1BKAA 4QFPA 2QS3A 3USDA 3PPOA 4RK2A 4O3BA 2HCAA 1QULA 3I5OA 4MFIA 3LUYA 1DMBA 2WKYA 1IXCA 3U93A 4F29A 3TTRA 2XXPA 2ANJA 2E0SA 4F22A 4JBZA 4XKRA 1JNFA 3FUZA 3VVDA 3HHGA 2HXWA 5EHSA 3DP6A 1MM6A 1B5HA 3O6HA 1FTMA 3RY3A 4HCYA 1PB8A 5CMMA 5HPQA 1B7HA 4I9DA 2I3WA 3LR1A 3G3GA 4N6PA 3FASA 3W9VA 1JW1A 2DSFA 3C36A 2ONSA 2AL5A 1DSNA 4NF4B 2Z23A 4NF8B 3IB0A 4Z7EA 1JETA 3S9MC 3FXUA 1TT1A 2PT2A 3JV9A 4OFOA 2HZLA 2NOOA 1LAFE 2Z8DA 1MXVA 1US5A 4Q8RA 3IAZA 4GF8A 4Q0CA 5DVIA 3MWBA 4I62A 4FIMA 3ECRA 1QVSA 2Q2CA 3CR9A 4Z0IA 1OQGA 4PETA 3QAXA 3MAMA 3IL1B 5ISUA 3DELB 3V8XB 2DP8A 1B6HA 3C4MA 3QYTA 4OXVA 4H5FA 5DEXB 3RTFB 5H8FA 1P1UA 3GZGA 4PFWA 4OMBA 2NUVA 4AQ4A 4NF6A 5TPAB 1B3HA 5IKBA 1B4HA 3UK4A 3B7DA 1IZ1A 4HS7A 2OWTA 2ZYNA 4KQPA 4HTGA 1MXWA 4N13A 2F6GA 2O69A 3VV5A 2V3TA 1N04A 1N0TA 4XIGQ 3SETA 1NNTA 2ONKE 2H98A 2Y7PA 4MLVA 4R74A 1YTVA 1DPEA 2XD3A 4KYDA 1NH7A 1YCJA 3WAEA 1EZOA 4ONYA 1IUDA 5B7DA 4FE8A 3IR1A 2A5TB 3K6XA 2Y7RA 4RXLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3SEVA 5DVJA 1D9QA 2CMOA 4NG7A 4WXJA 4F3BA 3TTKA 2QJEA 1DPPA 4IO5A 2QMXA 4ZZAA 3KEIA 2YPNA 3SZPA 3PD9A 4DIGA 4G2ZA 4PE3A 3GBAA 3MPKA 4PFTA 1LBBA 4PBQA 1UQWA 4GRKA 4F2QA 2QL3A 1NV2A 3KJTA 5ET7A 3RLFE 2UVJA 2Q9TA 2RC7A 3RUMA 1KA0A 2F35A 2Y7WA 1PDAA 1AWBA 1XT8A 2QS4A 2QFLA 2D5WA 1II5A 1URGA 1Y1MA 2A5SA 2FIEA 4PFYA 1MDP1 1PB7A 4H6DA 1EZ9A 5M2VA 1IMDA 1Y3QA 4F1UA 2Q2AA 3OSRA 2H25A 1IXGA 4X1BA 1USYE 3AXFA 5H8SA 2QS2A 3LSFB 2OWSA 3RN8A 1H76A 4LN5A 5IZZA 4R73A 1JW5A 5BWJA 1AOVA 3IB1A 1ZLQA 4XXUA 3T22A 3RT8A 2GQ1A 1LBVA 3N94A 5H8HA 1UIUA 1POY1 5FTHA 3FGSA 3KGCA 5EYGA 4N15A 2V84A 2WBBA 4PTKA 1B4ZA 2ZZXA 4WEPA 3KBZA 3MSTA 4GIZA 3IJXB 4ELOA 3MW0A 2I6EA 5I57A 4YB5A 5L9MA 1EYJA 4ISUA 5FHMA 1FQAA 1G0IA 4GWWA 3BIGA 5JK4A 2OBGA 5ITOA 3T9HB 1NH8A 2XX8A 3QUJA 2AYSA 1MM7A 4QSEA 1B3EA 2CZHA 5EYFA 3MVYA 4EF2A 4LVQA 4PGPA 1FTKA 4BDLA 4JVDA 5L9OA 4MLQA 1GGGA 1IXHA 1JP4A 1ZBMA 2XXXA 1FQFA 1LAHE 2GFEA 1I6AA 2D3IA 3IORA 4LZ8A 2XXQA 2FBPA 1LFGA 2R9JA 3RTWB 3SERA 4U4XA 4TLLB 3PPNA 2REGA 4DZ1A 1B7UA 1SBPA 4GWXA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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