3RLFE

Crystal structure of the maltose-binding protein/maltose transporter complex in an outward-facing conformation bound to mgamppnp
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITKASAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Snapshots of the maltose transporter during ATP hydrolysis.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Hydrolase/transport protein
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
total genus 122
structure length 374
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-04-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rlfE02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rlfE01
3CG3A 3D4GA 3N5LA 1A8EA 1TT1A 1B0HA 1UTHB 4OFLA 1Y4TA 3HSTA 2F6GA 1DMBA 3BFTA 3KSXA 2R9JA 3ONMA 2REJA 4QHQA 5CBSA 1LLSA 2NUVA 3OELA 5I57B 1XC1A 1QULA 1IUDA 1MDP1 2UVHA 3OSQA 3P7IA 4C1TA 3RT6B 4U1OA 3CSBA 4ZEIA 1Y9UA 4H8JA 1D9YA 3T93B 2DE3A 4C0RA 2PT1A 1B52A 1Q1KA 3FVGA 2ALUA 4POXA 3H6TA 2F8DA 3DM0A 1PBQA 4F22A 1FQFA 2A5TA 4M1VA 5DT6A 3H06B 3OO6A 4NMYA 1ANFA 3V8XB 1B51A 4PE5B 1AH5A 1P1QA 4UA8A 5FHNA 5ITOA 1ZMGA 3RNNA 3OD7A 2I3WA 4YB6A 3IX1A 3OOAA 3T22A 5AA4A 1Z7NE 1IITA 3KJ7A 1IXIA 4OWDA 2X7QA 3TZAA 4DXCA 1B58A 4ZEKA 2UVJA 1JW4A 3ILUB 3MWBA 1EU8A 3G3HA 2XXQA 3W9VA 3CFZA 4PFWA 1SQYA 3DP4A 4ZE8A 5JTYB 1LFIA 3K01A 3KFMA 4LZ7A 1GVCA 2XXPA 3KGCA 3QAXA 2I48A 2I3VA 5H8FB 4ZEFA 3TCFA 3UN6A 3T9HB 2NXOA 3PPNA 1VFEA 4PFUA 5H8HA 2ESNA 3HHFA 1HSJA 4IO6A 4OEVA 4IY5A 1H76A 1XVXA 4DCYA 3O6HA 1YAEA 2ONSA 1WDNA 4X48A 1FQCA 4K3FA 3MBPA 2Y7WA 1XS5A 4QFNA 3THIA 4BDOA 5I57A 2QMWA 3TUSA 2RKMA 3CFLA 4O3AA 1SDXA 4OMBA 4AB5A 1Y1MA 4XKNA 3V5AA 1QVSA 3M8UA 1BTJA 2GHAA 5JTYA 4R73A 2XXVA 3ZSFA 5L8DA 4XIGQ 3PUWE 2XXRA 5CM6A 1T0KA 3KOSA 3S4UA 4XKPA 5A5XB 5I2KB 4GQOA 2Z8FA 5CRYA 2W7YA 3G3KA 5EHMA 2A5SA 4FE8A 4IO7A 4R74A 2Y7KA 5I56B 3SERA 4LATA 3EF7A 4NEDA 4RYAA 3VLUA 2XXIA 2VHAA 3DELB 3E13X 4LP2B 4GWOA 5KCJA 1MM6A 1N7XA 4TOZA 1Y3QA 5FHOA 5I59B 1FQDA 1XHYA 2RF1A 2X26A 4IO2A 4ZE9A 4EQ7A 5I2NA 1B0LA 2G93A 2DXRA 1HSEA 4XXUA 1TFAA 4LZ5A 3SETA 1MH3A 3K02A 1Y3NA 2HAUA 4FJPA 1R9QA 1VE4A 1FTJA 1BKAA 2OWTA 3MVWA 1MY4A 1SD3A 2VOZA 4R6YA 1MY0A 4R6KA 5TP9B 4ECFA 3CRBA 5H8QB 3H03A 2FNCA 2Z8DA 1JNFA 3C4MA 3G7WA 3T9VA 4NF6B 4ZS9A 1UTHA 3O2AA 3R26A 4P0GA 5CMMA 4R9FA 1LAGE 4F18A 1M5BA 1POTA 3SEUA 3N26A 4QFPA 1US5A 3GZGA 3LBSA 1MXXA 4R72A 5H8NA 1RYOA 1H3DA 2H25A 4JSDA 3MVYA 3TPAA 2V84A 1POY1 2H9BA 4KYDA 1MQJA 3N6TA 4FEDA 1MQIA 4QSCA 3PD9A 4NF8A 5H8QA 4BLAA 3KG2A 5DYHA 3SESA 2PBWA 3JV9A 5LOMA 2DE4A 1RKMA 2F6PA 3TDJA 5I58A 3FV2A 3FXUA 5AA2B 3VVDA 3TYHA 5CMCA 1ZTYA 1UIVA 1FQEA 1YTVA 2O1LA 3C33A 3LC8A 4DCXA 1JW1A 2B3FA 4X1BA 1QKBA 3WAEA 4U2RA 4F1YA 2V93A 2O51A 2DWIA 2O6AA 2PX1A 4O3BA 4OFOA 3K00A 3LR1A 4U1ZA 2HQ0A 1B5HA 1MXYA 1NFTA 3IORA 5FTIA 2I0CA 3KZGA 1LBCA 5DVFA 3B6WA 1O7TA 1DTZA 5AA2A 1QUIA 1B6HA 4JXIA 3ZKKA 3OENA 1ZIUA 2VGQA 1S7YA 2RC8A 5DVIA 3C36A 3C32A 3GLBA 3VLWA 1IQ7A 1VR5A 2HZKA 2ZYKA 4QSDA 5KDTA 1MXUA 2I6EA 1AMFA 2PT2A 4OXVA 4R6HA 2HFBA 1N0TA 4NF5A 2DXYA 4GL8A 4LZ8A 3IOWA 2DOJA 3RQTA 4Z0IA 3UIFA 3PGFA 4YU0A 4C1UA 3M3KA 3FXRA 1EZOA 4IO4A 1LGBC 3O6GA 2ZNSA 3FJMA 2NOOA 3RTWB 3B7DA 2OCUA 2Z23A 3VVEA 4I9DA 2AL4A 4R9GA 3MZBA 4YB7A 1LAHE 4OVJA 5H8NB 1MXZA 1UTBA 3RGYA 3IJXB 4N13A 5CBRA 3PV0E 2DS9A 3DP8A 4F3PA 1UIUA 4L17A 2V3TA 2XHDA 3K6UA 3VV5A 2F36A 1PDAA 4H0WA 4HCWA 4KHZE 1SW4A 1OQGA 1Y3PA 4GFRA 4NF8B 4BDLA 1YPNA 1B9JA 2PYYA 3IB1A 3LSWA 3VXBA 2KLFA 3Q26A 3TTKA 3C34A 2Y84A 1NNFA 1PC3A 5J1DA 4Q30B 2O7IA 3MUQA 1GGGA 1QUJA 4QRZA 4PFTA 1NL5A 2V3QA 2H99A 4IGRA 1M5FA 2BJJX 5TU0A 1USYE 5ICTA 5IKBA 3TEPA 2QL3A 1J1NA 1P1UA 4ESWA 3TTMA 2ZNTA 3H3GA 4G68B 1FTMA 1FTKA 2Y7PA 3I5OA 1CB6A 4G2ZA 1N7WA 4U4XA 5CI5A 1PEBA 2DVZA 4MF3A 4R2BA 4DZ1A 5EYFA 2XXXA 2OZZA 3LSXA 3RPWA 3KN7A 2Q9TA 3V89B 3LSFB 5F1QA 1N3XA 1ZJLA 5ITPA 5HPQA 3S9LC 1TFDA 2OBGA 3G3FA 3W15C 4LONB 1LFGA 1OMPA 4GL0A 1N84A 2B3BA 1XVYA 1B2HA 2HAVA 2ZYOA 4YKJA 3RY3A 4EF1A 4BDNA 4MLVA 4ESXA 3EN3A 1URSA 2DP8A 2XXTA 3KN8A 4BDRA 3PPPA 1MDQA 4AB6A 2F7AA 4IB2A 4M4GA 1OVBA 4YMBA 3QUJA 2FA7A 3L6HA 4QFLA 2AIXA 4GVOA 2O84X 4NWDA 5HBCA 4H67A 3DLNA 1WODA 4OFJA 1I69A 1MG1A 3HO7A 4G77A 3SEXA 3EQ1A 3OO9A 3FJ7A 1SYIA 4MLQA 2RC7A 1SI0A 1LAFE 2H4IA 3H6WA 3A09A 3G3IA 1P1OA 3MVXA 3K1NA 4QF9A 2I49A 4Q0CA 4WKMA 5I56A 3IJOB 4ONYA 3TODA 3PUVE 1MQGA 2DWHA 2PMSA 3IO6A 4U21A 4EDPA 4FORA 4F39A 1ATGA 1Y1ZA 3T66A 3USDA 4LA9A 2DYXA 3SEVA 1NNTA 4POWA 2F78A 2NWJA 4FIMA 4TLMB 3O6IA 3SEYA 3OO7A 4I1DA 3MAMA 4OESA 5DVJA 2GRVA 3GBAA 3QK6A 4GXAA 1LCFA 3MZ9A 3ECRA 1NNPA 1B7UA 1JEUA 1SBPA 3FXQA 1S9TA 3N6UA 3HPIA 4DIGA 2RCAA 3IOVA 4OYVA 4H8IA 5TP9A 2DWAA 5H8SA 2VD2A 1F9BA 2Q89A 2ZMBA 3TTRA 1DOTA 1PBPA 3K4UA 3FVOA 1M5DA 4RY1A 3UK4A 5K2XA 1GTKA 1O64A 3FATA 3MP1A 1URDA 3K6WA 4X9TA 4F1VA 5CMBA 2XD3A 4P11A 1KWHA 3DP6A 1A54A 3A3CA 2X7PA 4OENA 3OSRA 3MPKA 3A3UA 4KFQA 1A99A 1B7HA 1JEVA 1AOVA 1EZPA 4GLIA 3CVGA 3K6XA 1MPDA 5EHSA 2I0BA 3UP9A 3OXNA 3TQWA 3TTLA 4IGTA 3I3VA 3Q28A 4HS7A 4GXSB 3RT8A 2XXYA 2O68A 4KYEA 2I58A 4AQ4A 4F3SA 3Q29A 1OQHA 1B4HA 2DWJA 3MW0A 4KPTA 4F29A 4RPNA 3K2DA 4TQUQ 4JDFA 4UACA 1YCJA 1XT8A 4ZZEA 5HM4B 4ZDMA 1US4A 3VFJA 1R1NA 1B40A 2P0SA 2D3IA 5ISUA 2UYFA 4N07A 1B3LA 3PUYE 3C35A 4R2FA 5JK4A 2DSFA 2OJTA 2XX9A 3PMWA 5F7VA 2NVUB 1SYHA 3R6UA 3E9XA 4R75A 4U22A 3U94A 1B1XA 3TAJA 3PPQA 2VP1A 3S9EA 4U23A 3KEIA 3SEWA 3CIJA 3H4ZA 3E3KA 1PB8A 4YKKA 3HN0A 3U92A 4QFKA 4IO3A 4RK2A 1AL3A 1MY1A 3GXAA 1OVTA 5ELVA 4E0XA 4E0WA 4DXBA 5CMKA 3KOTA 2HEUA 2YPNA 3B6TA 4G8HA 4KD5A 1B5JA 1JW5A 3N94A 2UVGA 3K0VA 4KCDA 1B3HA 1JVYA 1MS7A 1QUKA 5TPAA 4ZEDA 5I2NB 2QS4A 1LCTA 1MY3A 1P1WA 3IL1B 3OEMA 4NE4A 3C9HA 3ODBA 4G68A 4X1DA 5H8HB 4Q8RA 4ELRA 4EUOA 3F11A 2H5YA 3PMVA 2Q8JA 4KYSA 1UQWA 3AXFA 5ICQA 2QRYA 2Z8EA 1A7LA 3O66A 4JWXA 5FHMA 3TCHA 2A5TB 3K1PA 1FTLA 2QPQA 3LSLA 4YZZA 1OLCA 4FECA 3QUFA 5FTHA 4GF8A 4RXLA 4G68C 2P1SA 3UGWA 5B70A 5L9MA 2I4CA 3U8QA 4Q5TA 3TQLA 2Y7RA 1BIYA 2WKYA 1NNKA 4JWOA 4OETA 1B32A 1Y4CA 4OQOA 4G8MA 2HCAA 1D4NA 4H1XA 1IXCA 4G4PA 3T96B 3S9MC 1S50A 3T9XB 1SW2A 1I6BA 3MZ1A 3GBBA 1JVXA 4ZZAA 3RTFB 1LSTA 5DEXA 3BBRA 4TLLB 4LQ5A 3K1MA 4IO5A 5KCJB 4PETA 3PUZE 5H8FA 4KI0E 1IXGA 3EHSA 3KSJA 3QXMA 1Y20A 1GV8A 3VVFA 2QS3A 1DPPA 3H7MA 4YAHX 1LFHA 1IZ1A 3HHGA 3CR9A 3IOUA 4Z7EA 3JZJA 2R6GE 3U1OA 4QFOA 4F2QA 3IB0A 1ZLQA 3IAZA 1SW5A 3WAFA 4EQ9A 1H45A 1MXVA 5DTBA 5M2VA 4HW8A 4DXUA 1FCKA 3LUYA 3O9PA 2OK2A 3K6VA 3QSLA 4MBPA 3SDFA 1L5TA 1H43A 1FTOA 2G29A 3U72A 2HXWA 3FVNA 2YLNA 1RYXA 2AYSA 2ONRA 2XX8A 1D9VA 1CE2A 3RN8A 4YKIA 3UA8A 3VE1B 2YJPA 3PPOA 1MY2A 4FAJA 4LVQA 2CMOA 1N04A 3SKPA 4ELQA 4DLDA 1PB9A 3L6GA 1B05A 3T9UA 3ZKLA 2ZNUA 1TWYA 1IIWA 4WEDA 1VFDA 4F2OA 3MJNA 4EXKA 5JEIA 1B7ZA 2QSXA 1B3FA 1NH7A 2E1SA 2ZXTA 3PPRA 4JBZA 4F19A 1BP5A 3IOTA 3KBRA 3MPLA 3Q25A 3Q27A 4G8NA 4WEPA 2D21A 4XKQA 2QS1A 4FEBA 4F1UA 3VLVA 2ANJA 2Q2CA 2XX7A 3IR1A 1Z7ME 3VDFA 3TCGA 4KCCA 3FD3A 4I62A 4ISUA 1D3KA 5DEXB 3JYRA 3IO4A 3IB2A 4U4SA 4H6DA 2ABHA 2DE2A 1B3EA 2H98A 4ZEBA 4EQBA 2PVUA 1MXWA 1MQHA 1ELJA 5A5XA 5I2KA 5IAIA 2F5XA 2AL5A 4H65A 4YB5A 1FW0A 4PP0A 2UVIA 3R7XA 1B3GA 2XXWA 3TMGA 2D5WA 2F7CA 3TFLA 4OZ9A 2O7UA 3PD8A 4GOTA 3TELA 3VXCA 2RC9A 1II5A 4H5GA 4MFIA 4OTEA 1DSNA 4THIA 1UTBB 2Z22A 1NKXA 4N6PA 4BDQA 2FYIA 4QSEA 4XTCQ 1FQBA 4BDMA 3PUXE 5AA2D 4HTGA 1M5CA 1SI1A 3B6QA 3OMBA 2REGA 4I8CA 4RPOA 1IXHA 1IEJA 2V3UA 3U93A 5KDTB 4O3CA 1QW0A 1I6AA 3FASA 4EF2A 1EH3A 3V83A 2OWSA 3QIMA 1B4ZA 1WVJA 4RA1A 1I6QA 1A55A 1H44A 1ZKBA 4ELOA 2O69A 1A40A 2Y7IA 2QJEA 3MQ9A 4NTLA 3RUMA 1BLFA 1MRPA 4P0IA 3O28A 4YMAA 5AE4A 5I84A 2F34A 3MP6A 2Q88A 4DDDA 4ND9A 2V25A 3CI8A 3OO8A 4OHNA 1SVXB 3G3JA 1ZBMA 1JQFA 5L9SA 1AIVA 1LB8A 1NMUA 3G3GA 3O97A 3MP8A 1A8FA 4ZECA 4OEUA 4JSOA 2UYEA 1B46A 1SW1A 1P1NA 4YKPA 5K2YA 4NF4A 1DPEA 1NH8A 3FJGA 3HV1A 4RJZA 1QJMA 3EHTA 1MPBA 4F3GA 1R9LA 2OLBA 3FZVA 4OERA 4GRKA 4RNSA 2QS2A 3C31A 4LQ2A 1XOCA 1DTGA 2XXUA 5BWJA 4NF4B 1MPCA 3TTNA 3FVKA 3BKIB 5AA1A 2GFEA 3D4CA 2DQVA 4GD5A 2CZLA 1LAXA 3KJTA 4RK9A 5I59A 2VD3A 3S9NC 2I4BA 3PU5A 1B5IA 1TXFA 2R71A 3S2VA 3TKDA 2ZYMA 4XKRA 3H6UA 2F97A 1OIBA 2F7BA 2Q2AA 1FQAA 4KR5A 2M8CA 4PQJA 5AA4B 4NF5B 2LAOA 3M3FA 1JETA 1MH4A 4NF6A 4DE8A 1N76A 3BFUA 1OLAA 2ONKE 3E4RA 3FV1A 2IEEA 3FIRA 2E0SA 2XXHA 3KN3A 5TPAB 3ZS6A 3W9WA 1GR2A 1O63A 1USYH 3CG1A 3EHUA 3PMXA 4LUBA 2ZYNA 3QYTA 4IY6A 1MM7A 4FATA 1URGA 3H6VA 3FUZA 1Q35A 2O1MA 2UXAA 4JB7A 2THIA 5CC2A 3MC2A 1M5EA 2DVCA 2QMXA 3IK6B 3M3LA 3OEKA 4EXLA 5BUUA 3CFXA 3O29A 4H5FA 1B1HA 3RLFE 3CSGA 4MH5A 4ELPA 2GHBA 3ILTB 1MQDA 1N3WA 1P99A 3I6VA 5KZTA 4GIZA 2RINA 4WXJA 3HCQA 4JWYA 1LB9A 4F31B 5B7DA 2IA4A 1R6ZA 2HZLA 2P2AA 4KQPA 5I58B 4HCYA 3FGSA 5L9OA 1VSOA 1EZ9A 2RCBA 2XD2A 4PFYA 2F35A 4YICA 3UORA 4F3BA 1ZU0A 2B65A 1HSLA 2GH9A 1LBBA 1PB7A 3MVZA 1QKAA 3EPEA 5AA3A 4NWCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3EKIA 1FPLA 5IGAA 5CBSA 2NUVA 1MDP1 4C1TA 4H8JA 1D9YA 4NX1A 3B8BA 4PFBA 3FVGA 4O7IA 1PBQA 4F22A 3H06B 1P1QA 4N81A 3RNNA 3OD7A 3IX1A 1IXIA 3MWBA 3KFMA 1AWBA 3TCFA 4ZEFA 1D9QA 3HHFA 1HSJA 1NV2A 1H76A 4GWWA 1WDNA 1QGXA 4X48A 3S9EA 3THIA 3TUSA 2QMWA 2RKMA 1SDXA 3M8UA 5JTYA 1BTJA 3ZSFA 3KOSA 4XKPA 5I2KB 4GQOA 5CRYA 5I56B 4FE8A 2Y7KA 3SERA 3EF7A 2XXIA 4LP2B 1MM6A 3RPLB 1XHYA 1NV0A 5I2NA 2G93A 2F3BA 4PBHA 1Y3NA 1R9QA 1FTJA 2VOZA 5TP9B 3G7WA 3O2AA 1LAGE 3N26A 4R72A 3FXBA 5IZ3A 2V84A 1MQJA 4FEDA 3PD9A 3KG2A 4KXPA 1FQEA 1FPDA 3WAEA 2Y5LA 2V93A 2O51A 1MXYA 5AA2A 1FBGA 1LBCA 1B6HA 4I40A 2VGQA 4N6KA 2RC8A 5DVIA 3C36A 3C32A 3VLWA 2HZKA 1AMFA 4OXVA 2HFBA 4NF5A 4LZ8A 2DOJA 1DBZA 3FXRA 4MNPA 3FJMA 4DI3D 3IJXB 4N13A 3PV0E 1UIUA 4HCWA 3Q26A 1NNFA 4Q30B 4QRZA 1NL5A 2PFYA 4AS5A 2BJJX 5TU0A 1FPEA 2Y5KA 5IKBA 3TEPA 2QL3A 1J1NA 4NN3A 3TTMA 2OZZA 3KN7A 5ITPA 1N3XA 1ZJLA 5HPQA 2OBGA 3G3FA 3NOHA 1B2HA 2HAVA 3EN3A 3KN8A 2DP8A 2XXTA 2WYPA 1OVBA 2FA7A 3HO7A 3SEXA 3OO9A 3FJ7A 4MLQA 2RC7A 5H8QB 2H4IA 3A09A 3G3IA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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