3RLFE

Crystal structure of the maltose-binding protein/maltose transporter complex in an outward-facing conformation bound to mgamppnp
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITKASAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Snapshots of the maltose transporter during ATP hydrolysis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
molecule tags Hydrolase/transport protein
source organism Escherichia coli
total genus 122
structure length 374
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-04-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rlfE02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rlfE01
3B6WA 1EZ9A 4X1BA 1MRPA 3K6WA 4OTEA 4NF6B 1P1WA 4ZDMA 2GFEA 1TXFA 4QSDA 4FATA 2XXXA 3DLNA 4YKKA 2Y7IA 1Y20A 4XIGQ 1NNKA 2HQ0A 5H8QB 1UTBA 5AA4B 3TQLA 4R6YA 1URGA 4TLLB 5ELVA 3TMGA 5CBSA 4HCYA 3H6TA 3C35A 3PUWE 5L8DA 3ZS6A 4X1DA 2NUVA 2REJA 2ZYOA 1LSTA 1A40A 2ZNSA 1QUKA 2DWAA 1POTA 3IOTA 3DELB 3FXQA 1MQJA 3T9XB 4OERA 4U1OA 4RPNA 4JDFA 1OVBA 4F39A 5CM6A 2HEUA 4H8IA 2F7BA 1B0HA 3FV2A 4EF2A 3FD3A 2THIA 2UYFA 1UTHA 5J1DA 3U92A 1JVYA 4DXBA 2AYSA 4KD5A 3O6IA 1S9TA 2Z22A 3O97A 1JW5A 4OEVA 2NXOA 3CSBA 1MY1A 1LAGE 2DVZA 4RK2A 4F1VA 2OCUA 1HSLA 3D4CA 1B3FA 3MP8A 3T9UA 1H76A 4QSEA 1VFEA 1B0LA 1USYE 1IQ7A 2P1SA 3IJXB 2V3QA 3IB1A 3SKPA 2UXAA 5TP9A 3FVOA 3TCGA 4QFLA 2R6GE 1B2HA 3T9HB 1DMBA 3N5LA 2VD2A 2I0CA 3S9EA 1FTMA 2O69A 1SBPA 4NF5A 4IGTA 1QULA 5DVJA 2HFBA 3CG3A 3T66A 4QFNA 3MVZA 4C0RA 1H45A 1GVCA 3E3KA 4OWDA 4TLMB 3VVEA 1LFGA 4MH5A 5KCJA 1MY0A 3L6GA 2OK2A 3C9HA 1XOCA 3R6UA 4LZ7A 2Q89A 4NF6A 2Y7KA 2Y7WA 4YB6A 3H7MA 4BDMA 1B5JA 5F7VA 3G3KA 2QSXA 2XXIA 1FCKA 4U1ZA 3TZAA 2RINA 1ANFA 5H8QA 4GQOA 1GTKA 2H98A 4LVQA 2UYEA 3GZGA 5AA4A 4BDOA 5JTYB 2H4IA 2ONRA 1MXWA 3CI8A 2VD3A 3U1OA 3KN3A 3BFUA 2XXTA 4FJPA 1POY1 5F1QA 2CMOA 3VLWA 2RC8A 3PPPA 2Y7PA 1WDNA 1HSEA 3ONMA 3MQ9A 3K0VA 3MJNA 4OHNA 3QUFA 5EHSA 3KFMA 3K6XA 1Y1MA 4ZECA 2DS9A 3LC8A 4PFUA 2HAVA 1UIVA 3OO9A 3B6TA 3SEVA 4JB7A 1AL3A 1MQHA 1MDQA 4U4SA 1AH5A 5AA1A 4XKNA 4MLQA 2UVIA 2F7AA 5DEXB 4G4PA 3G7WA 3DP6A 3GBAA 5K2YA 4KCCA 4ZEIA 5I2NB 1B5HA 2UVHA 1SW2A 3JYRA 3OEMA 1CE2A 1NL5A 3HSTA 5L9SA 1N76A 2QMXA 4R72A 3MZ1A 3U93A 4KYDA 4F29A 5DVIA 2NOOA 4GVOA 3K01A 1YAEA 4U21A 3LR1A 1Q1KA 4OESA 3QSLA 1BLFA 4HCWA 2VP1A 3F11A 3MUQA 4MLVA 1LGBC 4DIGA 4NF4B 4BDNA 4NWCA 2DWJA 1NNFA 2F34A 4YKJA 3W9WA 4XXUA 4ESXA 3ZSFA 3CFZA 5IAIA 4OVJA 3G3JA 1NMUA 4R9GA 3IB0A 2VHAA 3S4UA 4FORA 1B05A 3PUZE 1JNFA 1DOTA 3O6HA 4MF3A 4TQUQ 3FVGA 4AB6A 3UK4A 1B52A 2UVGA 4AQ4A 3FATA 2W7YA 2AL4A 3A3CA 2QS2A 3WAFA 3BKIB 3N94A 2XHDA 4LA9A 3THIA 5DYHA 4H5GA 4KQPA 2Z8EA 1PC3A 5AA3A 4OETA 4EXKA 1OMPA 3H03A 1ZIUA 4X48A 2AIXA 3RT8A 3C34A 1O7TA 1UQWA 3K1NA 3PUYE 4HTGA 3C32A 4RK9A 5CMCA 3H6WA 1LB9A 1LLSA 4LONB 2WKYA 5FTHA 2YPNA 3E4RA 3TQWA 1LFHA 1IXIA 3TTRA 5HM4B 2BJJX 2R9JA 1EZOA 2AL5A 1UIUA 1VFDA 1Y3NA 2I4BA 2QRYA 4POWA 3E13X 2RKMA 3EN3A 1LAXA 4PP0A 4EUOA 3W9VA 4JWYA 1M5FA 5EHMA 5TPAA 2Z8FA 1MXVA 5JEIA 1NKXA 4YAHX 4YZZA 3I3VA 1S7YA 4FEBA 3R7XA 3TELA 2VOZA 1BKAA 3PD8A 2XXPA 1N3WA 4YKIA 1LB8A 2B65A 4H65A 2Q2AA 3HPIA 4KHZE 5CMMA 3T22A 3VLUA 3RTWB 3LSLA 4XKRA 3S9LC 2Q9TA 4H0WA 5KCJB 1XS5A 3PMXA 3K2DA 3PGFA 3MPKA 3MVYA 4WXJA 3PPOA 3FJGA 3G3GA 1P1QA 4JSOA 3IAZA 2Y7RA 1D3KA 1LCTA 3H3GA 3C31A 4KPTA 1IXHA 5H8NB 2UVJA 2XXRA 5CC2A 2ANJA 3U72A 2P2AA 4NF4A 1URSA 2F8DA 4Q0CA 1MY3A 3BFTA 5FHMA 1I6QA 1B3LA 5LOMA 3K6VA 3IOWA 3H4ZA 3TUSA 3TEPA 4GFRA 1QUJA 2LAOA 1MQDA 5EYFA 3O28A 3PV0E 2Y84A 1B9JA 2A5TA 4I62A 4DXUA 3M3KA 4K3FA 3QIMA 4DCXA 4GLIA 3OMBA 2GHBA 1VSOA 3IK6B 3Q27A 4PETA 4ZE9A 5I58B 1US5A 1XHYA 2B3BA 5H8FA 1P1NA 3H6VA 2O6AA 3EHUA 4O3BA 3ZKKA 2DQVA 3RN8A 5ISUA 3CFXA 4NF8A 5L9MA 4QSCA 1B6HA 2F5XA 5M2VA 1Y4TA 2Q88A 3UA8A 1CB6A 1MY4A 2ONKE 1MDP1 4JSDA 1N3XA 1KWHA 1US4A 2ESNA 4Q30B 2DXYA 4NEDA 1ELJA 3PPQA 4AB5A 3FUZA 1B7ZA 4YB7A 4F18A 4THIA 4POXA 1VE4A 4F3PA 4BDRA 5KDTB 1LBBA 3LBSA 2O68A 3ODBA 4N07A 2HZKA 1NNTA 2XXWA 3S2VA 3SEXA 4F3BA 2HXWA 5CMBA 3G3HA 4IO6A 2ZXTA 4HS7A 4NTLA 5DTBA 3HV1A 2RCBA 3OEKA 1OQHA 3HN0A 3M3LA 1MPDA 1R9LA 1IITA 1OLAA 1TFAA 3L6HA 3EHSA 3OENA 1A54A 2ABHA 4PFTA 2OLBA 1O63A 4OEUA 3KOTA 4RYAA 1B3HA 1PEBA 4PFYA 4U2RA 1B46A 1LBCA 1ZBMA 3CG1A 1LAFE 1PBQA 3ILUB 3SEWA 5ICTA 2H25A 3VLVA 3QK6A 1SI1A 1AIVA 1PB9A 3MPLA 4G8NA 3WAEA 2FNCA 1Y3QA 4YB5A 4QRZA 5H8NA 1H3DA 2RCAA 1IZ1A 1O64A 4DLDA 2ZNUA 1MXZA 1YPNA 3TDJA 3W15C 4G2ZA 4DE8A 2XX8A 2PBWA 3O9PA 3PMWA 1DPPA 2QS4A 4KFQA 3SDFA 5JK4A 4N6PA 4OYVA 3MZBA 5A5XA 1QW0A 3OSRA 3RUMA 5CBRA 4TOZA 2FYIA 3C33A 3PD9A 3RGYA 2H5YA 4ISUA 3O2AA 3PMVA 2QJEA 3O29A 3QAXA 4IB2A 3FJ7A 3FVKA 3HHGA 4O3CA 2P0SA 3EF7A 3VFJA 2DE2A 1QKBA 3TCFA 3UGWA 5I58A 1Y1ZA 5TPAB 1FQCA 4GL8A 4IY5A 5H8HA 1PDAA 2GHAA 3CR9A 1D9VA 3RLFE 1ZTYA 4Z7EA 3USDA 4OFLA 5DT6A 4NE4A 1XVXA 1JW1A 3FV1A 2I4CA 4GXAA 2F78A 1IXCA 4F3SA 4I1DA 1MXUA 1XVYA 1N0TA 2ALUA 2E1SA 1SI0A 2OZZA 4YKPA 2F6PA 3LSWA 3G3FA 5KDTA 2RC9A 1FQBA 1N04A 3A09A 1OLCA 2RC7A 4R6HA 3CSGA 3M3FA 1F9BA 3T9VA 1DPEA 4OENA 4XKQA 1B51A 2I0BA 1LCFA 1URDA 1R9QA 1B1XA 4JBZA 3FJMA 2OBGA 1QVSA 5B70A 4BDLA 1N7WA 5DVFA 1B4HA 4WKMA 1PBPA 4U4XA 1B7HA 3IB2A 2O7UA 1JEVA 2FA7A 1Z7NE 1Q35A 3MWBA 4DXCA 3IL1B 5I57B 2DOJA 1I69A 4XTCQ 1D4NA 3GXAA 2DSFA 4X9TA 4F22A 5IKBA 4LZ5A 4EF1A 2ZYMA 3BBRA 4P11A 4L17A 2Z8DA 2PYYA 1AMFA 3EHTA 1A55A 2H9BA 4G68A 1P1UA 4UA8A 2A5TB 1MH3A 1ZU0A 3G3IA 4QFOA 1MH4A 1H43A 1TWYA 2QS3A 2M8CA 5I56A 4ZZAA 1Y9UA 4H1XA 3KGCA 1PB7A 4LUBA 3C36A 1SVXB 5H8FB 3CFLA 2HZLA 4EDPA 3IJOB 4ELRA 5I59B 2O7IA 4JWXA 4NF8B 4IO2A 1JW4A 1M5DA 2I49A 3OELA 3KSJA 4IY6A 1Y3PA 4GF8A 4R2BA 1ATGA 2QMWA 4OZ9A 3PPRA 5TU0A 4IO3A 1B32A 1OIBA 2G29A 1FW0A 5I2KB 3CVGA 2F36A 1QUIA 5L9OA 3R26A 1BTJA 1FTOA 4EQBA 3TTLA 4F3GA 3VDFA 3UIFA 3FXUA 3TAJA 3FXRA 3SEUA 4QHQA 2XXUA 4JXIA 2ZYNA 3OO8A 1TT1A 3MW0A 4RXLA 2RF1A 2O1LA 3PU5A 2X7PA 1B40A 4P0IA 3T93B 3K02A 4G8MA 4M4GA 1D9YA 2V3TA 2XD2A 1SD3A 1B3EA 3IORA 4OQOA 3LSXA 3O66A 5K2XA 4ZS9A 5BWJA 2XXVA 1FTKA 2I58A 4KR5A 2Q2CA 2PVUA 2OWSA 3Q25A 3IO4A 4ZEFA 1BIYA 2I3WA 1Y4CA 2D5WA 1USYH 4ZEKA 3UP9A 3C4MA 1PB8A 1B58A 4KYEA 4FEDA 1IIWA 5KZTA 3I6VA 3CRBA 1MQGA 3KOSA 1MY2A 1R1NA 1OVTA 1A8EA 4LZ8A 2Q8JA 1MQIA 1I6AA 2QS1A 2V25A 4H8JA 2HCAA 3N26A 1GGGA 3U8QA 1ZMGA 1A7LA 4MBPA 2I3VA 2ZNTA 3RY3A 2F7CA 5I57A 4U22A 3IR1A 2OJTA 4ND9A 4R2FA 3VXCA 3N6TA 5A5XB 3LSFB 4JWOA 3RTFB 3OO7A 2DE4A 1LAHE 3JZJA 3V89B 3VVFA 5ICQA 3N6UA 5FHNA 1RYOA 3HCQA 3SESA 3DP8A 3KBRA 1N7XA 4C1UA 4YU0A 1XC1A 2CZLA 4RJZA 1SDXA 3H06B 5HBCA 3Q26A 4F2QA 5I59A 5H8HB 2PMSA 3S9NC 3OXNA 4GD5A 4NMYA 4GIZA 1II5A 3VVDA 3CIJA 2A5SA 3T96B 2XX9A 4N13A 1EH3A 4R73A 3FZVA 5I2KA 5CI5A 2PT1A 2O1MA 1NH8A 3I5OA 5FTIA 3V5AA 4Q5TA 5B7DA 4ESWA 4M1VA 4MFIA 4LATA 4F2OA 3A3UA 1B7UA 3Q28A 3HO7A 4PE5B 1MG1A 5BUUA 1MXXA 3ECRA 1SW5A 2DWIA 4OXVA 3P7IA 1Z7ME 3U94A 4FE8A 3UORA 5CMKA 2I48A 4H5FA 1A8FA 2XXYA 3TCHA 2PT2A 3H6UA 1FQAA 2DVCA 3DM0A 1JQFA 4KI0E 2VGQA 4ELQA 3QXMA 1GV8A 4ZEDA 3D4GA 2YJPA 3KN7A 4RNSA 4F19A 3TTKA 1N84A 1IEJA 4IO4A 5CRYA 5AA2A 1SYIA 3KJTA 1NNPA 1SW1A 5FHOA 3RPWA 1JVXA 1WVJA 4LQ2A 4G68B 5H8SA 2DXRA 2R71A 2V3UA 4RA1A 3K4UA 3MP1A 3DP4A 4O3AA 3KJ7A 5I56B 4GL0A 2NVUB 3GLBA 1SYHA 4ZE8A 1FTJA 4QFKA 4H6DA 3KN8A 4YMBA 4ZZEA 1B4ZA 2GRVA 3M8UA 3UN6A 1IUDA 2IEEA 1EZPA 2ZYKA 3B7DA 3LUYA 1ZLQA 3SERA 4UACA 4DCYA 4EXLA 3RT6B 4DDDA 2E0SA 4R6KA 1HSJA 2F6GA 1L5TA 4RPOA 4PQJA 3TODA 2PX1A 4ECFA 4LP2B 2DWHA 1I6BA 2V84A 4EQ9A 3EPEA 4QF9A 1M5EA 2X7QA 4GOTA 3RNNA 1MS7A 2ONSA 3VE1B 1YCJA 4KYSA 3EQ1A 5HPQA 1IXGA 1FQEA 1B1HA 1OQGA 2F97A 3TFLA 3K1PA 3FGSA 2HAUA 3OD7A 1LFIA 1XT8A 1GR2A 4F1UA 2GH9A 1H44A 4WEPA 3MP6A 5I84A 3PUXE 3HHFA 2KLFA 2DYXA 2ZMBA 1SW4A 3ILTB 1QKAA 3KEIA 4OFOA 2Z23A 4BDQA 4HW8A 3S9MC 3GBBA 4OMBA 3MAMA 2QL3A 3AXFA 4U23A 4KCDA 4R75A 3QUJA 1A99A 1RYXA 3MZ9A 4LQ5A 2XD3A 4ELOA 1M5CA 4F31B 3E9XA 4G8HA 1ZKBA 1EU8A 4FAJA 2D3IA 4I9DA 4BLAA 1JETA 4F1YA 3TYHA 1FQFA 2XX7A 2I6EA 4IO7A 4GXSB 3OOAA 2NWJA 3K00A 5AA2D 3FASA 3OO6A 1NFTA 4RY1A 1TFDA 2O84X 4IGRA 4Q8RA 1AOVA 3MVXA 4FIMA 2REGA 3ZKLA 3IO6A 3B6QA 3VV5A 3V83A 1UTBB 1QJMA 4XKPA 3KSXA 4R9FA 3IOUA 1B5IA 1R6ZA 1FQDA 3Q29A 3JV9A 1YTVA 3SEYA 2DE3A 4G68C 1B3GA 3KG2A 4H67A 3RQTA 3TPAA 4ZEBA 1M5BA 2O51A 1DTGA 3O6GA 1S50A 4QFPA 4Z0IA 4PFWA 3TKDA 1MM7A 2OWTA 4EQ7A 2IA4A 1NH7A 1MM6A 4IO5A 1WODA 5AE4A 1ZJLA 3PUVE 1MXYA 1UTHB 4C1TA 1SQYA 2XXHA 3MBPA 4E0WA 2H99A 1DSNA 4YMAA 5ITPA 4FECA 1RKMA 2YLNA 2XXQA 3V8XB 5JTYA 1BP5A 1T0KA 4NWDA 3IX1A 1MPCA 2G93A 2F35A 4GWOA 4GRKA 4I8CA 2D21A 1P99A 5TP9B 2DP8A 2V93A 3OSQA 3FIRA 4R74A 1P1OA 3IOVA 5AA2B 3K1MA 3TTMA 2B3FA 1JEUA 4OFJA 3FVNA 1FTLA 5ITOA 4YICA 4NF5B 5DEXA 4P0GA 3VXBA 2QPQA 4E0XA 5I2NA 3TTNA 3MC2A 3K6UA 3PPNA 1J1NA 3QYTA 2X26A 3KZGA 1DTZA 3MVWA 4ONYA 4G77A 4WEDA 3SETA 4ELPA 1VR5A 1MPBA 4DZ1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3B6WA 1EZ9A 4X1BA 1MRPA 2FIXA 3K6WA 4OTEA 4NF6B 3MYUA 1P1WA 4HE1A 4ZDMA 2GFEA 1TXFA 2HPGA 4QSDA 4FATA 2XXXA 3DLNA 4YKKA 2Y7IA 1Y20A 4XIGQ 1NNKA 2HQ0A 5H8QB 4OVPA 1UTBA 5AA4B 4MMPA 3TQLA 4R6YA 1URGA 4TLLB 5ELVA 3TMGA 1DCUA 1NUXA 5CBSA 4HCYA 3H6TA 3C35A 3PUWE 5L8DA 3ZS6A 4X1DA 3RYDA 2NUVA 2REJA 2ZYOA 1RDZA 1LSTA 1A40A 2ZNSA 2WBDA 1QUKA 2DWAA 1POTA 3IOTA 3DELB 3FXQA 1MQJA 3T9XB 4OERA 5EYHA 2WYKA 1CNQA 1INPA 4U1OA 4RPNA 4JDFA 1NV0A 1OVBA 5IZ3A 4F39A 5CM6A 2HEUA 4H8IA 2F7BA 1B0HA 3FV2A 1RDYA 4EF2A 3FD3A 4MEVA 2THIA 2UYFA 1UTHA 5J1DA 3U92A 1FPGA 1JVYA 4PE3A 4DXBA 2AYSA 1D9QA 4KD5A 3O6IA 1S9TA 2Z22A 3O97A 1JW5A 4OEVA 2NXOA 2QVVA 3CSBA 1MY1A 1IMCA 1LAGE 2DVZA 4RK2A 4F1VA 4P47A 4NG7A 2OCUA 1HSLA 4P8BA 2VPOA 3D4CA 1B3FA 3MP8A 3T9UA 1H76A 1FJ6A 4QSEA 1VFEA 1B0LA 1USYE 1IQ7A 2P1SA 3IJXB 2V3QA 3IB1A 3SKPA 2UXAA 5TP9A 3FVOA 3TCGA 4QFLA 2R6GE 4JVDA 1XI6A 1B2HA 3T9HB 1DMBA 3N5LA 1FBGA 3B50A 4P1LA 2VD2A 2I0CA 3S9EA 1FTMA 3QMFA 2O69A 1SBPA 4NF5A 4N81A 4N8GA 4IGTA 1QULA 5DVJA 2HFBA 3CG3A 3T66A 4QFNA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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