3RLFE

Crystal structure of the maltose-binding protein/maltose transporter complex in an outward-facing conformation bound to mgamppnp
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
b'KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITKASAS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
publication title Snapshots of the maltose transporter during ATP hydrolysis.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Hydrolase/transport protein
total genus 122
structure length 374
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-04-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rlfE02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rlfE01
1H76A 4HW8A 1B6HA 4Q5TA 3Q25A 1AL3A 1R9QA 3JV9A 3K0VA 2I4CA 4FEBA 2I6EA 2QMWA 3C35A 5EHSA 4H65A 2ZNUA 1ZIUA 3ZS6A 3SEYA 3DM0A 1DMBA 4IGRA 1B7UA 1N7WA 3CG3A 5DVJA 1IXHA 3FV1A 5KCJA 2Z23A 3MP1A 3N6TA 2Y7IA 4AB5A 3K6XA 4XTCQ 3HO7A 4XKRA 1MG1A 4HCWA 1URDA 4C1TA 3FIRA 3T93B 2DS9A 1JNFA 2F6GA 5JTYB 1FTOA 1B5HA 1ZKBA 4X1DA 2RC7A 4AB6A 2CZLA 4RNSA 1QW0A 3H7MA 1DTGA 1I6BA 2Q8JA 3IJOB 3TTLA 3TFLA 1PDAA 1FQEA 1B32A 3EHTA 4PQJA 1SYHA 3CVGA 1A8EA 1FW0A 3EPEA 1UQWA 3Q27A 5BUUA 1MRPA 2ESNA 4FORA 3LR1A 5ITOA 2DWHA 5J1DA 3OSRA 4KYDA 2THIA 4PETA 2O68A 1B3EA 3OEMA 2OWTA 1P1WA 3T9VA 1LFHA 4Q8RA 3IO6A 5CMCA 2RC9A 3EN3A 3UK4A 2Y84A 2F7BA 4F3SA 2OBGA 2XXWA 4EXKA 5FHNA 1R1NA 2I0CA 4NF8B 3VLUA 4LZ5A 4PFTA 4GLIA 2H5YA 3UP9A 3PMXA 1B4ZA 2E0SA 2A5TA 4KCDA 3PV0E 4NMYA 5L9SA 4XKNA 2GHAA 3GBBA 4R9FA 3FJGA 1POY1 4BDQA 4X48A 4FEDA 1MY0A 3IOUA 1AOVA 4BDOA 4JB7A 5ICQA 5B70A 4PFWA 1PB8A 3KJ7A 3H4ZA 1ANFA 4LVQA 4KHZE 3FZVA 3K2DA 3UIFA 3MVWA 4DXCA 4NF5A 5K2XA 4OTEA 5DVFA 4THIA 4IY6A 3TDJA 2ZNSA 4XKQA 3K00A 4P0GA 2NOOA 3PPOA 4F39A 3LBSA 3SKPA 4I62A 1JVXA 3FASA 5A5XB 3G3FA 3KEIA 3SESA 1SYIA 1EZ9A 3TQWA 3FD3A 1YCJA 1IQ7A 2Q89A 5FTIA 4QFPA 4OZ9A 5KZTA 1JEVA 1NNFA 1LBCA 3BBRA 3PUWE 3O28A 1XT8A 4F2OA 4U4SA 1USYH 3UORA 2DP8A 4FIMA 2P0SA 5DEXB 1UTHA 5CBRA 4ESXA 3B6WA 2QS3A 3T96B 4N13A 4G68B 2HAVA 4QSCA 1M5FA 3OO6A 3ODBA 2Z8EA 1AIVA 1AMFA 2Y7WA 5H8HB 1A55A 4FAJA 2Y7RA 1HSJA 2ZYOA 1N3XA 4OETA 1B3FA 1P99A 1Y4TA 1QUIA 3IB2A 4YMAA 3FVKA 1S9TA 2H25A 1B5IA 1SW2A 4EQ9A 3MJNA 3I3VA 2ZYNA 1H45A 4ZZAA 1N04A 3U1OA 4WEDA 4OFLA 4N6PA 3CG1A 4IGTA 2UYFA 1QKBA 1URGA 1LFIA 3PPNA 4OENA 4RPOA 4DIGA 2DOJA 2F8DA 5I59B 5EHMA 1O64A 4IO7A 3C33A 1DPPA 2AIXA 3HV1A 4YB7A 5LOMA 4BDRA 4WKMA 2QL3A 4EF2A 3H6TA 5ICTA 2RCBA 1US5A 2O7IA 3RN8A 2B3BA 3M3LA 3ONMA 1Y3NA 3TTKA 2GFEA 5JEIA 3MW0A 3KOTA 4Q0CA 1QUJA 4KYSA 4ZE9A 3IORA 3G3HA 1MS7A 1MXVA 3KSJA 4POWA 4EQ7A 4BDLA 3K02A 3I6VA 1J1NA 4RA1A 1ELJA 2OWSA 4PFYA 4MBPA 3HCQA 4JSOA 3MZ1A 3OO8A 5F1QA 4KCCA 4FATA 1SI0A 4QHQA 1JVYA 4U22A 5DYHA 3SERA 5ITPA 1M5CA 4PFUA 4R6YA 1SI1A 2BJJX 5DTBA 5H8NA 2PX1A 2UVGA 2LAOA 3Q29A 3CSBA 1FQCA 1P1OA 4AQ4A 5CMKA 3AXFA 1MQGA 4U1OA 3IJXB 3R6UA 3IL1B 3Q28A 5DVIA 1N0TA 2AL4A 1TFAA 2O1MA 5HM4B 2X7PA 1LAXA 5AA4B 2XXHA 5I58B 1VFDA 3CIJA 1NL5A 3RUMA 3A3CA 2DXRA 4TOZA 2OLBA 5AA1A 3QAXA 2DE2A 5L9MA 5EYFA 4OQOA 1PBPA 3GZGA 3C9HA 2QJEA 5I57A 4NF6A 5CRYA 1B46A 2PT2A 4H67A 4P0IA 4LA9A 2Q2CA 1DTZA 3SDFA 2I3VA 5F7VA 3TELA 2XX8A 3M3FA 2XX7A 4IO6A 2QMXA 3I5OA 2GRVA 3OD7A 1MQJA 3THIA 1SVXB 4I8CA 2QSXA 1H43A 4MH5A 1Y1ZA 2F7CA 1MXXA 1QKAA 4F2QA 1I6AA 5FTHA 1OQHA 3K1NA 2Q2AA 1LSTA 1MPCA 3IX1A 4PE5B 4NF4B 3C34A 1LBBA 3DP8A 2QRYA 1LAGE 3FUZA 3G3KA 3H6VA 1GV8A 3TCHA 1JEUA 2DVZA 4HS7A 5I2KB 5AE4A 4E0XA 2XXPA 2FYIA 5IAIA 2DXYA 3S9EA 1MY2A 3LSLA 1A8FA 3L6HA 1VSOA 1IXIA 3OELA 3HPIA 3TUSA 1M5DA 1B9JA 2R9JA 3OO7A 4OWDA 4XKPA 1IZ1A 1N76A 2YPNA 3TPAA 4KD5A 2O69A 2XXTA 3V83A 2AL5A 4RY1A 3ILTB 2DWIA 3IAZA 4NTLA 3T9UA 4WEPA 5KDTB 2HAUA 2O7UA 1MY4A 4XXUA 1RYXA 2HFBA 4YAHX 3VXCA 1MM6A 4IO2A 2VP1A 1NKXA 3CI8A 1NNKA 1HSLA 3VVDA 2OK2A 4TLLB 1QVSA 5TP9B 4F1VA 2I0BA 2HZKA 1GR2A 4BDMA 2ALUA 3MQ9A 3MVYA 4YB6A 3VFJA 3C36A 4H8JA 2Z8FA 4LQ5A 3IO4A 1SW1A 4R72A 1CE2A 1P1NA 4QFNA 5H8FA 4QRZA 2ZYMA 4ELQA 2UVHA 4ELPA 2F6PA 4HTGA 5I56A 3KZGA 4I9DA 1SBPA 1IITA 3RPWA 4EXLA 5HBCA 2IEEA 1ZMGA 1Y20A 3KN8A 4YKJA 4MFIA 3FVOA 3OO9A 3TCGA 5I2NA 3RNNA 1B52A 2XHDA 3DP6A 4GL8A 3B6TA 2VD3A 1JQFA 4X9TA 1D9YA 3FV2A 5CM6A 4DZ1A 4OMBA 3KN7A 4K3FA 4RK9A 2V3QA 4DCXA 2H9BA 4NWCA 1H3DA 1PB9A 3G3IA 4GF8A 3C32A 4F1YA 1UIVA 1O63A 2I48A 4F3GA 3UA8A 3HSTA 4R9GA 4H8IA 2PYYA 1XHYA 3B7DA 4DE8A 4ELRA 4ELOA 2ZNTA 2R6GE 1TT1A 5B7DA 2P2AA 4KYEA 2HCAA 1D9VA 1DOTA 1YPNA 3BKIB 2A5SA 4R74A 4RK2A 1BTJA 3VE1B 1SDXA 4G8NA 1GTKA 4YKKA 4YKPA 4WXJA 2RF1A 2XX9A 1F9BA 3A3UA 1LGBC 2RCAA 3FXUA 2Y7KA 1B2HA 2AYSA 4NEDA 3SEWA 4JXIA 4LATA 4IB2A 3TTRA 5H8QA 1B3HA 4IO4A 1VE4A 1LFGA 1FTMA 1LB9A 2D3IA 2V93A 1IXCA 3S9NC 1EZOA 1IIWA 3FATA 2NVUB 3MPKA 4G8MA 1QJMA 1MH3A 1B05A 4ECFA 1II5A 3SETA 2ABHA 3O6IA 1MXWA 4YMBA 3CSGA 3K4UA 3IOTA 3O6GA 2H4IA 3LSWA 1EU8A 4DDDA 2PMSA 4EQBA 3S2VA 1USYE 1URSA 1WVJA 3E3KA 2DSFA 4FJPA 4QSDA 3A09A 3PD9A 1OVBA 4NF4A 4O3CA 1OMPA 4U23A 1LB8A 1MY1A 1FQBA 4KQPA 3D4GA 1ATGA 1L5TA 1HSEA 5TU0A 1Y3PA 2ANJA 3MAMA 2YJPA 4OYVA 4MLQA 3QXMA 4ZS9A 2QS1A 4DXUA 1B5JA 4XIGQ 1VR5A 1H44A 4M1VA 4DCYA 4FE8A 3TKDA 4QSEA 3QIMA 1B58A 3KBRA 5ELVA 4ZEIA 3JZJA 4OEUA 1ZBMA 5JTYA 4JSDA 2HQ0A 1QULA 4IO3A 5KDTA 1GGGA 3V8XB 2OZZA 2VHAA 4ZEFA 4RXLA 4KFQA 2D5WA 4C0RA 4P11A 2X26A 4BLAA 1BKAA 2CMOA 1UTBB 3OEKA 3QSLA 2DWJA 4H1XA 2XD2A 2QPQA 1FQDA 4F1UA 4GQOA 4JWXA 4LUBA 3H6UA 3G7WA 3MWBA 4JDFA 5IKBA 4R73A 3PU5A 4F22A 1JETA 1MDQA 1CB6A 1B51A 4GOTA 1NNTA 3IK6B 2ZYKA 3G3JA 3SEVA 1UIUA 1MH4A 1MY3A 3N26A 3BFUA 1NH8A 4QFLA 2XD3A 2XXRA 3KG2A 3MPLA 1FQAA 1MPBA 3MBPA 4OFJA 3PGFA 3VV5A 2F36A 4NF8A 1N7XA 4TQUQ 1MXZA 2ONRA 1TFDA 3N6UA 1ZU0A 4LZ8A 1P1QA 3TTMA 3CRBA 3O6HA 3P7IA 4Z0IA 1XS5A 3BFTA 2WKYA 1IEJA 4JBZA 2A5TB 1FTJA 3FGSA 1MXYA 4FECA 4MLVA 4ZECA 1R9LA 1S50A 2V3TA 2P1SA 2O51A 1MM7A 3LC8A 4G4PA 3PPRA 2ONSA 3IB1A 1A99A 4LONB 4NF5B 3PPQA 4EUOA 1R6ZA 4DLDA 2FA7A 3OSQA 3O2AA 2V84A 3FVGA 1NMUA 3TCFA 1B0LA 5K2YA 3T66A 5CMBA 2REGA 5A5XA 2V3UA 3PUVE 3PUZE 4KI0E 2VOZA 3FJMA 3SEXA 2M8CA 1JW5A 3E13X 3USDA 3EF7A 5FHMA 4OVJA 3QUFA 1KWHA 4GIZA 3H03A 3VLVA 1O7TA 3KJTA 3T9HB 3FVNA 2F5XA 3EHUA 4Q30B 5DEXA 1UTHB 2OCUA 5HPQA 2F97A 5DT6A 1T0KA 1A7LA 2NXOA 3IB0A 1LCTA 4GXSB 1B1HA 4I1DA 1GVCA 4G68A 3U92A 3Q26A 3WAFA 2GHBA 3R7XA 3MP8A 5TPAB 4OESA 1MPDA 2H99A 2PT1A 3R26A 3OXNA 4BDNA 3ZKKA 5H8HA 4R6HA 4KR5A 3KFMA 1IUDA 4ND9A 1MQDA 3JYRA 3HHFA 2F34A 2I4BA 1A54A 4R2FA 2E1SA 4YB5A 3T9XB 2NWJA 4ESWA 4ZZEA 4ZEDA 5L9OA 2B65A 1LAHE 2REJA 2I58A 1B0HA 3OMBA 3VDFA 3IR1A 3U8QA 4U1ZA 1NFTA 3U94A 1XC1A 3M3KA 1EH3A 4Z7EA 3CFXA 3QUJA 2DE3A 4F31B 2Q9TA 3DLNA 1OVTA 3E4RA 4QFKA 4R75A 1YTVA 3TODA 5I59A 4O3BA 4U2RA 1Q1KA 1BIYA 3S9MC 1DPEA 1QUKA 4QF9A 4GL0A 1FQFA 2G29A 4YKIA 3W9WA 3T22A 2XXUA 1UTBA 3K6VA 3RTWB 2UVIA 2RKMA 3TYHA 3W15C 1PC3A 4RYAA 4YZZA 4GD5A 3KSXA 3ZKLA 1N3WA 3TMGA 1OLCA 1VFEA 4R2BA 1SW5A 1NNPA 2F35A 5ISUA 3H06B 2I49A 4QFOA 3MZ9A 3G3GA 3O97A 4MF3A 1IXGA 5CI5A 3C31A 1A40A 2HXWA 1B4HA 1AH5A 1MDP1 3VXBA 2ZXTA 3O29A 3GLBA 5H8NB 3PD8A 1TXFA 2D21A 3PPPA 1JW4A 1WDNA 3O66A 3K6WA 3QYTA 4F18A 4RJZA 4YU0A 1PB7A 3RTFB 4ONYA 3UN6A 4OERA 5CMMA 4GXAA 1Q35A 4OXVA 1DSNA 3SEUA 5BWJA 2QS4A 5AA2D 1P1UA 5AA4A 3H6WA 2DYXA 2G93A 5I58A 5L8DA 4G77A 2R71A 1BLFA 2ONKE 4DXBA 2O84X 4JWYA 2NUVA 4ZE8A 3K01A 1M5EA 3S4UA 4H5FA 3FXRA 4H0WA 5AA2B 5I57B 1XOCA 4NF6B 4X1BA 2HZLA 3DELB 1Y1MA 2DWAA 2H98A 2Y7PA 4GVOA 3W9VA 1PBQA 1Y4CA 4JWOA 1FTKA 1N84A 3MC2A 2DVCA 4O3AA 1I69A 2QS2A 4G68C 2RINA 3UGWA 2PVUA 3QK6A 4ZEKA 3FXQA 1M5BA 4RPNA 1Y9UA 3VVEA 1BP5A 3E9XA 3KN3A 4F3BA 2KLFA 4LP2B 4GRKA 2XXQA 3RLFE 3RQTA 4IY5A 1I6QA 1POTA 4F29A 3S9LC 1FTLA 2VD2A 3VVFA 2F7AA 4H5GA 2RC8A 2Z8DA 1Y3QA 1B1XA 3TEPA 2B3FA 3KGCA 5TPAA 1LCFA 3EQ1A 3B6QA 5I2KA 3MUQA 1NH7A 5H8SA 2XXXA 4POXA 3CR9A 3IOVA 1SD3A 5KCJB 4R6KA 4NWDA 3TTNA 2X7QA 4OHNA 4U21A 1ZJLA 1LAFE 1MQIA 4OEVA 5JK4A 5I84A 3CFLA 1JW1A 1B7HA 1RYOA 3PMVA 3LSFB 1TWYA 4L17A 4H6DA 3TAJA 1B40A 2FNCA 4LZ7A 3PMWA 1ZLQA 3H3GA 1SW4A 3MVZA 3RY3A 3TQLA 5TP9A 3HHGA 3IOWA 1MQHA 5FHOA 1LLSA 2IA4A 3EHSA 5CC2A 2GH9A 4C1UA 4EF1A 5H8FB 3V5AA 4ISUA 4UA8A 2Z22A 3F11A 4E0WA 4EDPA 2O1LA 4GFRA 3MP6A 1XVXA 5I56B 4LQ2A 2O6AA 1Z7NE 3N5LA 3V89B 4OFOA 2XXYA 4ZEBA 5M2VA 3RGYA 3K6UA 3OOAA 3M8UA 2PBWA 3L6GA 5I2NB 4ZDMA 1B7ZA 2DE4A 2XXIA 2UVJA 3N94A 4TLMB 4UACA 3WAEA 4NE4A 3ILUB 3U72A 3FJ7A 4YICA 2UXAA 1D4NA 3ECRA 3LSXA 1PEBA 3O9PA 1EZPA 2DQVA 3K1MA 2HEUA 4U4XA 3RT6B 3ZSFA 3PUYE 4HCYA 3HN0A 3RT8A 5AA3A 3GXAA 3LUYA 2UYEA 1FCKA 1US4A 4N07A 4IO5A 3MVXA 3CFZA 4KPTA 3OENA 1OLAA 4G2ZA 5CBSA 2XXVA 1Z7ME 1ZTYA 3KOSA 1B3LA 5AA2A 4F19A 2W7YA 1D3KA 4M4GA 1OQGA 3VLWA 4G8HA 1B3GA 4F3PA 3U93A 1RKMA 3MZBA 5H8QB 1XVYA 2YLNA 2OJTA 2ZMBA 4GWOA 3TZAA 3DP4A 2F78A 1OIBA 4PP0A 3D4CA 1WODA 2Q88A 2I3WA 1MXUA 2V25A 3GBAA 3PUXE 3C4MA 3K1PA 1SQYA 2VGQA 1YAEA 1S7YA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1H76A 4HW8A 1B6HA 2P3VA 4Q5TA 3Q25A 1AL3A 1R9QA 3JV9A 4PF6A 3K0VA 2I4CA 4FEBA 2I6EA 2QMWA 3C35A 5EHSA 4H65A 2ZNUA 1ZIUA 3ZS6A 3SEYA 4H46A 3DM0A 1DMBA 4IGRA 1B7UA 1N7WA 3CG3A 1D9QA 5DVJA 1IXHA 3FV1A 5KCJA 2Z23A 3MP1A 3N6TA 2Y7IA 4AB5A 3K6XA 4XTCQ 3RYDA 3HO7A 4XKRA 1MG1A 4NGUA 4HCWA 1URDA 4C1TA 3FIRA 3T93B 2DS9A 1RDYA 1JNFA 2F6GA 5JTYB 1FTOA 1B5HA 1ZKBA 2FBPA 5EYGA 4X1DA 2RC7A 4AB6A 2CZLA 4RNSA 1QW0A 3H7MA 3MSTA 1DTGA 1I6BA 2Q8JA 1FPBA 3IJOB 1FBDA 3TTLA 3TFLA 1PDAA 1FQEA 1B32A 4NG7A 4PE3A 3EHTA 4PQJA 3LUZA 1SYHA 3CVGA 1A8EA 1FW0A 3EPEA 1UQWA 4MNIA 3Q27A 5BUUA 1MRPA 2ESNA 4FORA 3LR1A 5ITOA 2DWHA 5J1DA 3OSRA 1FPGA 4KYDA 2THIA 4PETA 2O68A 1B3EA 4O7MA 1JP4A 2XWIA 3OEMA 2OWTA 1P1WA 3T9VA 1LFHA 4Q8RA 3IO6A 5CMCA 2RC9A 3EN3A 3UK4A 2Y84A 2F7BA 4F3SA 2OBGA 2XXWA 4EXKA 5FHNA 1R1NA 2I0CA 4NF8B 3VLUA 4LZ5A 4PFTA 4GLIA 4GX3A 2QVUA 2H5YA 3UP9A 3PMXA 1B4ZA 1FPIA 2E0SA 2A5TA 4KCDA 3PV0E 4NMYA 5L9SA 1NV7A 4XKNA 2GHAA 3GBBA 4R9FA 3FJGA 1POY1 4BDQA 4X48A 4FEDA 1MY0A 3IOUA 1AOVA 2ZZWA 4BDOA 4JB7A 5ICQA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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