3RLFE

Crystal structure of the maltose-binding protein/maltose transporter complex in an outward-facing conformation bound to mgamppnp
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITKASAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/transport protein
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
publication title Snapshots of the maltose transporter during ATP hydrolysis.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 122
structure length 374
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-04-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rlfE02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rlfE01
2PT1A 3OO8A 3PD8A 3MP8A 3MUQA 2FYIA 4RY1A 4ZZAA 1A55A 4ZS9A 3LC8A 3H3GA 5IKBA 3SERA 2HEUA 1Y3QA 1ZU0A 4DCXA 4R6KA 4OETA 1MDQA 3T9HB 3P7IA 3I6VA 4FATA 5EYFA 1MY1A 1Q1KA 4DIGA 1B3FA 4ZEBA 3O97A 4R2BA 1GV8A 3FVGA 1JEUA 4GFRA 2I3VA 3H6TA 2DS9A 4LQ2A 4OENA 1S50A 4NF8A 4NE4A 1HSJA 4WEPA 1MQJA 1YAEA 5I2NB 4NWDA 4LATA 1UQWA 3SEVA 3FJGA 2AIXA 5KDTB 1Q35A 1QVSA 3FGSA 3D4CA 4KCDA 4F22A 4PFTA 1MY0A 3KJTA 2OWSA 2FNCA 3ILUB 5TPAB 2QMWA 3CVGA 2G29A 3ODBA 3CFXA 5H8SA 4HS7A 4C1TA 3OSRA 2HZLA 4F31B 1GR2A 1MDP1 3LUYA 3QAXA 3Q26A 2I58A 3FXUA 5FTHA 1IITA 1PBPA 1PBQA 1USYH 1RYXA 2KLFA 2ZYOA 2Y7KA 3Q25A 1A7LA 4Q30B 1RYOA 4BDQA 2F34A 1M5CA 2I0CA 1MXXA 5CBRA 3V8XB 2Z22A 1A54A 2ZYMA 1DTZA 2XXPA 5FHMA 3HSTA 5TU0A 2RCAA 3Q29A 5H8NB 3HO7A 4TOZA 2QS4A 1BIYA 2F35A 5HPQA 4M1VA 4UACA 3MPKA 2PT2A 1PB8A 4KYSA 4BLAA 1DPEA 2D21A 5CM6A 3TDJA 3ZKLA 1BP5A 3C9HA 3IOUA 3LSXA 5FHNA 5JK4A 1NNFA 1IXCA 3S9LC 4KHZE 2I6EA 5FHOA 5L8DA 5I58B 5ELVA 3TEPA 1FQBA 5CMKA 3FATA 4UA8A 4PQJA 4JSOA 3H6WA 5DTBA 2UVGA 1IXIA 1XS5A 5ICTA 2NXOA 3ILTB 3K6XA 3SDFA 2M8CA 4GQOA 4QSEA 2REGA 3K0VA 4KQPA 1N3XA 1FQAA 3PUWE 1Y4TA 3KEIA 3HPIA 2H5YA 3MP1A 4KPTA 1D9VA 4QRZA 1M5BA 4OERA 1USYE 3PMWA 2Q2CA 4YU0A 1SI1A 3PUYE 5AA4A 2A5TA 2ESNA 2Y7IA 5HBCA 4BDOA 1XVXA 4Q5TA 3M8UA 1LAGE 3UK4A 4Q0CA 4OFOA 4DE8A 1P99A 1B51A 2ZYNA 3KOTA 2XXYA 3TTRA 2Q89A 4X9TA 1VFDA 3UP9A 3C35A 3LSLA 4HW8A 3AXFA 4AQ4A 3RQTA 2IEEA 1P1NA 3QK6A 4TLLB 5I84A 1FTOA 4OEUA 3K1NA 2ZNUA 2ONSA 4LONB 2O84X 4OTEA 1A8EA 3OXNA 5KCJA 4ZEDA 4RA1A 4F1UA 2PMSA 3R7XA 4JWXA 2NWJA 1LFIA 1IZ1A 3FUZA 1SW2A 4G8NA 1B46A 4ELRA 3SEUA 1OQHA 4ZE8A 3E3KA 2OJTA 2I0BA 4WXJA 4BDLA 1MH3A 1IIWA 4N07A 2E0SA 4YB7A 3TCHA 3FIRA 4NF6A 2ZYKA 4ZEIA 1H45A 3JYRA 1M5DA 2GFEA 2XHDA 1D4NA 2VHAA 3RNNA 4U4XA 1T0KA 3H4ZA 2VP1A 4JWOA 3C4MA 2DSFA 5DT6A 3IR1A 4LZ8A 1SBPA 3GXAA 4GF8A 3PMVA 4NWCA 3KN3A 3PPOA 3QXMA 2OCUA 1L5TA 3C31A 4RK2A 1ZTYA 4RNSA 2DOJA 3DP4A 2D5WA 3KOSA 4G77A 3SEYA 4F3PA 4BDNA 3L6GA 5A5XA 1R9QA 1NNTA 3MZ1A 3RPWA 3MAMA 4RPOA 4EXLA 1B52A 2XXWA 3SESA 2HAVA 4LZ7A 3W9VA 3KBRA 1NFTA 4GL0A 3VVFA 1TFAA 1MQIA 1QW0A 1N76A 4P0IA 1O63A 4XKPA 1OVBA 3VVDA 3PPPA 1GVCA 3MVXA 1POTA 3B6TA 1AIVA 4R73A 1SI0A 3CIJA 3IX1A 4JDFA 4JXIA 1UTHA 3OEMA 1Y3NA 5AE4A 3IO6A 3IB2A 4ELOA 5ITPA 2F97A 3FASA 2QJEA 4TLMB 1FTKA 1MXYA 3PGFA 2V3UA 3BFUA 1GTKA 5AA4B 2QS1A 3ECRA 4QSDA 3TFLA 1B1XA 4MFIA 2XXHA 3UGWA 2QL3A 4YKKA 2GRVA 4PETA 3C32A 1P1OA 3KN8A 2UYFA 5EHSA 2VD3A 2H4IA 1MPBA 3PV0E 3QIMA 1Z7NE 1URGA 4EDPA 1B4ZA 4R74A 1B3LA 1H76A 3G3KA 1MY4A 2Q2AA 4DDDA 1QJMA 3TQLA 2O51A 1MM6A 1B3GA 1II5A 4F19A 5I59B 4QFNA 1JW1A 5I2KA 4Z0IA 3LSWA 2DE2A 5KCJB 4GWOA 4EXKA 3SEWA 4JB7A 2GHAA 5AA2B 4XIGQ 2VOZA 3N6UA 2O7UA 2UVIA 3M3LA 5DYHA 4DXUA 1FTJA 4POXA 1Y3PA 2XXQA 5L9OA 2CMOA 4RYAA 3QUFA 4O3CA 3EHSA 4R2FA 4F3BA 1IQ7A 4YMBA 2Y84A 2AL4A 4C1UA 4BDRA 5I57A 1SVXB 3LR1A 1B6HA 4F39A 3OELA 3EN3A 3OOAA 1Y20A 3K1PA 4U22A 1B0HA 4NMYA 1MY3A 2O7IA 2X7PA 1SDXA 2G93A 4KYEA 3S9MC 2Y7PA 3HHFA 4LQ5A 3U8QA 1GGGA 4IO7A 3K01A 2F78A 3CI8A 4FJPA 3H03A 3MZBA 1Y1MA 1PEBA 4RXLA 2HZKA 2RC9A 3N26A 3IJOB 4NF5B 3FJ7A 2PX1A 3TAJA 4E0XA 1B7ZA 4PFYA 2H25A 1JETA 3BKIB 1MRPA 5HM4B 4EF2A 4DXCA 4N6PA 3U94A 2O6AA 4THIA 4KD5A 4KYDA 4YKPA 3SKPA 3S4UA 4G8HA 2GH9A 5TP9B 4KI0E 3JZJA 1MM7A 3U93A 5AA2D 3FD3A 2BJJX 3VV5A 3T9XB 5L9SA 1MG1A 5DEXB 1P1WA 4HCWA 3K2DA 4WEDA 1SYIA 4H5GA 2XD3A 2VD2A 2X26A 2XX7A 2YPNA 1UTHB 1XHYA 1JVXA 5H8FB 3K1MA 4DLDA 4FEBA 1H43A 3ONMA 2XXRA 2I4CA 4IB2A 3MC2A 2O1LA 4GOTA 1JW4A 1D9YA 4I62A 1SW4A 1M5EA 3UA8A 3E9XA 1VE4A 4H1XA 2F7CA 3CSGA 3S9EA 1SW1A 3IB1A 1B7UA 3FV1A 1ZBMA 3IAZA 1NKXA 3MP6A 3U1OA 3U72A 2I49A 2Z8DA 4H5FA 4DXBA 3GLBA 3V83A 1URDA 4R6YA 1UIUA 1O64A 3VLWA 5IAIA 2O1MA 5I56A 2GHBA 5I2KB 1TWYA 4F3SA 1F9BA 4QFLA 4F3GA 4AB5A 5JTYA 2O69A 2ABHA 3S2VA 2D3IA 1LLSA 3VDFA 2NUVA 1EZOA 1CE2A 2Z23A 1MXWA 4L17A 2ZXTA 1D3KA 1B40A 3FVNA 3A3UA 3TTKA 1B0LA 1I69A 1DOTA 2FA7A 2F6GA 2H99A 2VGQA 2Q88A 3DP6A 4ECFA 1MS7A 3TTLA 4QFOA 1P1UA 3RUMA 2Z8FA 5H8HA 4U1OA 4ZZEA 3R26A 4ELPA 1PB7A 3OO6A 2AYSA 4OESA 4N13A 3DP8A 1TXFA 1R6ZA 3EPEA 5J1DA 3O9PA 3QSLA 4NEDA 3G3IA 4NF8B 4OZ9A 4IO2A 4XKNA 1N3WA 1A99A 4H6DA 1JW5A 3ZKKA 2ZNTA 4NF4A 1OMPA 3TYHA 3MVWA 2DXYA 3EHUA 3THIA 4FEDA 4GXAA 4EF1A 1YPNA 2V84A 2XXUA 4PE5B 3VXBA 3HV1A 3E13X 3TZAA 4OFJA 1HSLA 3A3CA 3I5OA 3L6HA 3RT8A 2O68A 3KSJA 2R9JA 1AH5A 1LAXA 5F1QA 3VLVA 3QYTA 1AMFA 4OHNA 2RC8A 1N0TA 4QSCA 2DVZA 4G68A 3TUSA 1XVYA 2XXIA 1B3EA 2YLNA 5ISUA 3K4UA 1SYHA 2F6PA 1LB8A 4XKRA 3K6UA 3B7DA 1VSOA 3G3GA 4R72A 1B7HA 3MJNA 3KGCA 4IO6A 1ZKBA 4LP2B 3TCGA 1EZ9A 3GZGA 4ESXA 1URSA 1NNKA 3GBBA 4POWA 1OLAA 2W7YA 1FTLA 1PB9A 3RTWB 3D4GA 1EU8A 1FW0A 4EQBA 3I3VA 3PPNA 1OLCA 1ZLQA 1Z7ME 3FV2A 2F8DA 5I56B 1JEVA 1I6AA 1N7XA 3WAEA 1JQFA 2P0SA 3OENA 2UYEA 5ICQA 1AOVA 5TPAA 4IO4A 4GD5A 4YB6A 4IO5A 2HFBA 4F2OA 4DCYA 2DYXA 4RK9A 2QPQA 3Q27A 3PPRA 3RY3A 3VFJA 4JSDA 4G4PA 3GBAA 2F7AA 1LFGA 1MQGA 4QHQA 4Q8RA 2A5TB 3T93B 5CRYA 3O6IA 4YKIA 1OIBA 2ALUA 4ONYA 3CSBA 2NOOA 3H6UA 4QFPA 4IY5A 4YAHX 1LAHE 2E1SA 3CRBA 5K2XA 5H8NA 4LUBA 3TTNA 3PUVE 2V3TA 2QS3A 1B05A 4FIMA 4ESWA 3EF7A 2Y7RA 4OFLA 3IOTA 3VVEA 3N5LA 2RF1A 1OQGA 3MWBA 3KZGA 2R71A 3C36A 2DWIA 4KFQA 2REJA 2DE4A 2X7QA 4NF4B 3K00A 1MY2A 4KCCA 5I58A 3TCFA 3OO7A 2UVHA 2QRYA 2Y7WA 4F1VA 5B70A 4U4SA 1LCFA 3T9VA 4OQOA 4ELQA 3IORA 1MPDA 3BBRA 4XXUA 1XC1A 3FXQA 1US5A 3IO4A 1S7YA 4RPNA 3KJ7A 5L9MA 4F1YA 4O3AA 4G68B 4RJZA 3RLFE 1N04A 4NF6B 2UVJA 3MVZA 1EZPA 2ANJA 3TMGA 4U21A 3O28A 4GIZA 3OO9A 1NH7A 5LOMA 1M5FA 3T66A 1JNFA 4ZEKA 3E4RA 3DELB 2Q8JA 3FJMA 1B2HA 1PC3A 1B32A 3RGYA 2PYYA 1Y1ZA 2R6GE 4X1BA 2P2AA 4GLIA 5A5XB 1LBBA 3U92A 1KWHA 3LSFB 1B9JA 4G8MA 4XKQA 2DVCA 3K02A 4E0WA 1H44A 1JVYA 1RKMA 4OWDA 4OVJA 1I6BA 4IGRA 1MQDA 2F5XA 3N6TA 1LBCA 3UORA 3OSQA 1FCKA 1CB6A 4LZ5A 4X48A 1VR5A 2QSXA 1MPCA 3T96B 2DP8A 4H0WA 2RC7A 2YJPA 4XTCQ 3IJXB 5BWJA 1A8FA 3TODA 4FECA 4ZE9A 4LVQA 4HCYA 1SD3A 1US4A 4I8CA 3PPQA 1B1HA 2XXTA 1BLFA 3DLNA 4GVOA 2ONRA 1TT1A 2I4BA 4H8IA 5FTIA 2B65A 1LAFE 1QUIA 4F2QA 1HSEA 3JV9A 1FQFA 4LA9A 4IO3A 2XD2A 4C0RA 2WKYA 3SETA 4KR5A 4X1DA 4DZ1A 3O6HA 4NTLA 2DWHA 2Q9TA 1FTMA 1WODA 4EUOA 4EQ9A 1N7WA 1A40A 5JEIA 1B3HA 3H06B 4OXVA 4GL8A 3O2AA 2DE3A 3IOVA 1UTBA 4JWYA 5K2YA 4H65A 3H6VA 3EHTA 1ZJLA 2OK2A 3CFLA 2THIA 3KG2A 1H3DA 2QMXA 4OEVA 5B7DA 4EQ7A 3LBSA 3OEKA 4QF9A 3K6WA 5CMBA 3VXCA 3T9UA 4GRKA 1FQCA 4R9GA 4I9DA 5I57B 3FVOA 2XXXA 2ONKE 1IXHA 3M3FA 3M3KA 1QULA 3A09A 3UIFA 2I3WA 1UIVA 2DXRA 2AL5A 3W9WA 5CI5A 3PUXE 2F36A 3CG3A 4TQUQ 3MPLA 4YZZA 3HCQA 2A5SA 1LCTA 4JBZA 1S9TA 1IEJA 2XXVA 2HXWA 4WKMA 3RT6B 3QUJA 1TFDA 1B5JA 4P0GA 1NMUA 1J1NA 4OMBA 4YICA 1NL5A 3ZS6A 3FZVA 3CG1A 3BFTA 3PU5A 2XX8A 4H8JA 4PFUA 2V93A 1WDNA 1YCJA 4AB6A 1P1QA 4Z7EA 1ATGA 4F18A 3O66A 5H8QA 5I59A 4MF3A 4QFKA 5M2VA 3K6VA 4PFWA 4YB5A 3F11A 2HQ0A 2QS2A 2I48A 4GXSB 3MZ9A 3KSXA 3O6GA 5AA2A 1QKBA 3R6UA 2Z8EA 3OMBA 2H98A 4U1ZA 1OVTA 1O7TA 3IK6B 1EH3A 4FORA 2P1SA 4MBPA 5CMCA 2OZZA 5DVJA 3CR9A 3RTFB 1MXVA 3VLUA 4K3FA 1NH8A 4IY6A 4H67A 5KZTA 5AA1A 1IXGA 1LGBC 4MLQA 4PP0A 1DTGA 1PDAA 3UN6A 3IB0A 4F29A 3H7MA 2NVUB 3V5AA 1B5IA 1LB9A 1BKAA 1R9LA 3OD7A 3TKDA 2CZLA 2UXAA 2IA4A 3ZSFA 1MQHA 3USDA 1ELJA 1SW5A 3RN8A 2V25A 4M4GA 4G2ZA 4I1DA 1YTVA 2OWTA 1Y4CA 4NF5A 1B58A 4U2RA 5I2NA 3HN0A 4OYVA 5ITOA 2HAUA 4HTGA 1POY1 1UTBB 5KDTA 1FQEA 1QUKA 2RINA 5BUUA 5JTYB 3TTMA 5TP9A 3PD9A 3IL1B 1FQDA 3MVYA 2LAOA 3Q28A 3TPAA 5AA3A 2ZNSA 2DWAA 5DEXA 1XOCA 4ZDMA 1ZIUA 1DPPA 1Y9UA 1VFEA 1NNPA 3FVKA 4YMAA 3G3JA 1MH4A 2HCAA 3DM0A 1WVJA 1R1NA 5F7VA 2V3QA 1IUDA 1QUJA 2DWJA 4MH5A 4MLVA 3KN7A 3B6QA 2B3BA 4G68C 4YKJA 1LSTA 5H8FA 3KFMA 1BTJA 3IOWA 3N94A 1B5HA 1QKAA 2XX9A 5H8HB 5CMMA 3WAFA 3EQ1A 1ZMGA 3G3FA 3G7WA 4ISUA 5DVIA 3HHGA 3T22A 4P11A 1ANFA 5DVFA 4ZECA 2PVUA 1DSNA 2H9BA 3O29A 2ZMBA 3G3HA 2DQVA 1SQYA 2F7BA 3VE1B 3B6WA 3PUZE 1DMBA 4IGTA 3TQWA 3MQ9A 1LFHA 2RKMA 3C34A 1N84A 4U23A 3MBPA 4FE8A 3W15C 4R9FA 1MXZA 5CBSA 4ZEFA 3C33A 5H8QB 5CC2A 3PMXA 5EHMA 3V89B 4ND9A 2OLBA 1AL3A 4O3BA 1XT8A 3SEXA 2RCBA 3MW0A 2B3FA 1I6QA 4R75A 1B4HA 3S9NC 4R6HA 2PBWA 4FAJA 3FXRA 2OBGA 3CFZA 3TELA 4BDMA 1MXUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4PBQA 2PT1A 3OO8A 5ET5A 3PD8A 3MP8A 3MUQA 2FYIA 4RY1A 4ZZAA 1A55A 4ZS9A 3LC8A 3H3GA 5IKBA 3SERA 2HEUA 1Y3QA 1ZU0A 4DCXA 4R6KA 4OANA 1NV0A 4OETA 1MDQA 2PFZA 3T9HB 3P7IA 4MNCA 3I6VA 4FATA 5EYFA 1MY1A 1Q1KA 4DIGA 1B3FA 5EQAA 4ZEBA 3O97A 2VT5A 4R2BA 1GV8A 4P47A 3FVGA 1JEUA 4GFRA 2I3VA 3H6TA 4OA4A 2DS9A 4LQ2A 4OENA 1NV7A 1S50A 4NF8A 4NE4A 1HSJA 2WBBA 4WEPA 1MQJA 1YAEA 5I2NB 4NWDA 4LATA 1UQWA 3SEVA 3FJGA 2AIXA 5KDTB 4PFIA 1Q35A 1QVSA 3FGSA 3D4CA 4KCDA 4F22A 4PFTA 1MY0A 3KJTA 2OWSA 3RPLA 5I3SA 2FNCA 3ILUB 5TPAB 2QMWA 3CVGA 2G29A 3ODBA 3CFXA 5H8SA 4HS7A 4C1TA 3OSRA 2HZLA 4F31B 1GR2A 5EQ9A 1MDP1 3LUYA 3QAXA 3Q26A 2I58A 1IMCA 2FIXA 3FXUA 5FTHA 1IITA 1PBPA 1PBQA 1USYH 1RYXA 1RDZA 2KLFA 2ZYOA 2Y7KA 3Q25A 1A7LA 1FTAA 4Q30B 1RYOA 4BDQA 2F34A 1M5CA 2I0CA 1MXXA 1IMDA 5CBRA 1XI6A 3V8XB 2Z22A 4MIJA 4NGUA 1A54A 2ZYMA 1DTZA 4QXDA 5F24A 2XXPA 5FHMA 3HSTA 5TU0A 2RCAA 3Q29A 5H8NB 3HO7A 4TOZA 1G0IA 2QS4A 2XWVA 4X04A 1BIYA 2F35A 5HPQA 4M1VA 4UACA 2CEYA 3MPKA 2PT2A 4HXVA 4NQ8A 1PB8A 4KYSA 4BLAA 1DPEA 2D21A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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