2VD2A

The crystal structure of hisg from b. subtilis
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
212
structure length
212
Chain Sequence
AMGKLLTMAMPKGRIFEEAAGLLRQAGYRLPEEFEDSRKLIIDVPEENLRFILAKPMDVTTYVEHGVADVGIAGKDVMLEEERDVYEVLDLNISKCHLAVAGLPNTDWSGVAPRIATKYPNVASSYFREQGEQVEIIKLNGSIELAPLIGLADRIVDIVSTGQTLKENGLVETEHICDITSRFIVNPVSYRMKDDVIDEMASRLSLVVEGET
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords ATP PHOSPHORIBOSYLTRANSFERASE
publication title The Crystal Structure of Hisg from B. Subtilis
rcsb
source organism Bacillus subtilis
total genus 52
structure length 212
sequence length 212
ec nomenclature ec 2.4.2.17: ATP phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2007-09-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01634 HisG ATP phosphoribosyltransferase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2vd2A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2vd2A02
2QS4A 1UTHA 3T66A 4ZECA 3OO7A 2AL4A 1FQFA 5DVJA 1PEBA 5KCJB 3KFMA 1NL5A 4YKJA 3EN3A 4OFOA 4LUBA 2O1LA 3I5OA 2RC8A 3K02A 5I56A 2XXUA 4K3FA 3RTWB 4F3BA 4PFWA 3B6WA 3KN7A 1QUJA 2Y7KA 3TPAA 4DXUA 3E13X 4GF8A 1Y3QA 2Q88A 4TLMB 4X48A 4OYVA 4RK2A 2XXVA 4U4SA 4U23A 4R72A 1B0LA 4RK9A 4X1DA 2VGQA 4IGTA 1ZMGA 3BBRA 1SW1A 2VD2A 1RKMA 3N6TA 5ITOA 1TT1A 4OESA 5F7VA 1DMBA 3MP1A 3TYHA 4JBZA 1DPEA 3WAEA 2HZKA 2YJPA 5H8QB 1J1NA 4F2OA 1B4ZA 1N7XA 1WDNA 3K2DA 1QW0A 4TLLB 3PD9A 1OQHA 2H4IA 2ZNTA 2ZXTA 2I6EA 3FXUA 3M8UA 1WVJA 4H8IA 4ZE8A 3QAXA 4WXJA 1VE4A 2F35A 4N07A 3MQ9A 1XS5A 1ZBMA 2OLBA 4HTGA 2QJEA 1FCKA 5CM6A 4OZ9A 3R26A 4OFJA 2G93A 3C4MA 1DOTA 1MXUA 5EHSA 2UVJA 1QULA 1NNKA 4R2FA 3U94A 1URDA 3A3CA 3KSXA 1P1QA 4P11A 5AA2D 1B05A 3CVGA 1MXZA 1B40A 2XXPA 3VXCA 1LGBC 4LZ5A 2UVGA 1A7LA 4Z7EA 2REGA 3JZJA 4GL8A 4Q0CA 5AA2A 4ZE9A 2VP1A 4TOZA 4H65A 1D9VA 4BDNA 2XXTA 3B6TA 3FV2A 2QL3A 3O6GA 1MQDA 2UXAA 4MH5A 1OVTA 3CI8A 3LSWA 3RNNA 1US4A 1YAEA 1I6AA 3KG2A 3QSLA 1N04A 1II5A 5L9SA 2I58A 1GGGA 1OQGA 2RC9A 1FTOA 3H7MA 1NMUA 4EF1A 4F1YA 1B1HA 3C9HA 4C1UA 4EXKA 1B5IA 3VDFA 1A54A 3SESA 1LFGA 4QSDA 1SVXB 1OIBA 3TCFA 3K6WA 5I59B 4R73A 3TDJA 1MPCA 3LC8A 3IJXB 4KQPA 2A5TB 3KJ7A 4OTEA 1B46A 1SD3A 1S50A 4GIZA 3D4CA 4NF6A 1Y1ZA 1MPBA 1TXFA 3OEMA 1B3EA 1ZTYA 4POXA 3S9EA 4NF5B 3AXFA 5FHMA 3TCGA 3EHUA 1B7ZA 1B0HA 2Y7WA 2ONKE 1ELJA 3QUJA 3V83A 3IB0A 2X26A 4RPNA 4Z0IA 5HM4B 3QK6A 1YPNA 2F36A 3KBRA 2Y84A 5BWJA 3PMWA 4KCCA 3KZGA 2NOOA 1ZIUA 2PYYA 4NWDA 3O29A 3MP6A 1UTHB 5L9OA 2RCBA 4UACA 3PPOA 2ZMBA 3HSTA 3H6UA 4BDOA 4PETA 3RLFE 2O7UA 1UQWA 4JWYA 2RCAA 3CFZA 1DPPA 4G8HA 2R71A 3TQLA 2ZYMA 1NNTA 1H45A 4ELRA 4ESXA 5JTYA 5EHMA 1IITA 1LCFA 4OQOA 1FQAA 3UA8A 1B9JA 1LBBA 4ZEDA 1M5CA 4PE5B 1HSJA 4OEUA 2DYXA 4KHZE 3T93B 2OWTA 3KSJA 2UVHA 4E0WA 5TPAB 1ANFA 3DELB 5DTBA 3PPPA 3FVGA 1H76A 3OENA 4MBPA 1PBQA 5TP9A 3T9XB 4N13A 1MRPA 3RUMA 4G2ZA 4FATA 4EQ9A 1RYOA 1T0KA 3SDFA 4IO3A 3PUXE 1IXHA 2DWJA 3IOUA 1I6BA 1P1OA 3O97A 1CE2A 3N26A 1Q1KA 1MY4A 3U8QA 1Z7NE 4OWDA 1B2HA 2THIA 4THIA 2Y7IA 1IEJA 1LAFE 1I6QA 1GVCA 3FVNA 2F5XA 4ECFA 1SBPA 3DLNA 1ZKBA 4ZEFA 1TFAA 2F6PA 5FHNA 1B51A 1LFHA 2ONRA 1MDQA 2UYEA 4KR5A 2H99A 4XKRA 2DP8A 3IORA 4LVQA 3DM0A 2XX7A 4X1BA 4YZZA 1IUDA 3W9WA 4QFKA 2QMWA 2DVCA 5I2NA 5K2XA 2E0SA 3T9VA 4ELPA 1Y3PA 1IXGA 4JXIA 4YB5A 2O68A 3W15C 4FJPA 3M3LA 5H8NB 2W7YA 1KWHA 1ATGA 4YMBA 1HSLA 4DXBA 1B3FA 1EZ9A 2Q9TA 2GRVA 1URSA 5ISUA 3H6WA 4RXLA 2PVUA 3PUVE 4R6KA 3TTNA 3IL1B 5ICQA 3FD3A 3IO6A 1MQIA 3Q26A 5DT6A 1FTLA 2XXXA 3K0VA 4ZZAA 4NF8A 4QSEA 2UVIA 3IB1A 2QMXA 5H8FA 1SQYA 2UYFA 2R9JA 5CRYA 5L9MA 4KI0E 2XXIA 4UA8A 1MDP1 4DCXA 1M5BA 2ZNSA 4QRZA 4PFUA 1QVSA 2F97A 1MXWA 2OK2A 3C32A 4GOTA 1PDAA 1LAGE 1FTJA 3CFXA 1JVXA 5IAIA 2XD3A 3CRBA 3LR1A 4OVJA 4Q5TA 3T9HB 3CFLA 3T96B 3QYTA 3C34A 4BDRA 4ZEBA 3MZ1A 3H03A 5KZTA 2Q2AA 5AA4B 4NEDA 3TZAA 2NXOA 4G68C 1EH3A 4YAHX 3OMBA 5DYHA 3ECRA 4GXAA 4DCYA 5BUUA 5M2VA 2HCAA 2FNCA 4O3AA 1LLSA 4YMAA 1XVXA 4JDFA 3KGCA 3V89B 2XXHA 4KYDA 5IKBA 3SEXA 3K01A 1NH8A 3VV5A 3PGFA 4AQ4A 1B52A 4I8CA 4QFOA 3PV0E 3SEYA 4XKQA 5B70A 3K4UA 5TU0A 3VFJA 4IO5A 2XXRA 1XOCA 1UTBA 3FZVA 1SDXA 4OENA 1FW0A 1FTKA 4KPTA 4WEPA 4ZS9A 3VLUA 4JWXA 3BKIB 3VLWA 1YTVA 1ZLQA 4GXSB 3MPKA 1QJMA 1MQHA 1UIVA 3RQTA 1VR5A 5DVIA 1BKAA 3H3GA 3RTFB 1FQDA 4G68A 1USYH 3VVEA 1MH4A 4F3SA 1SW2A 4R6YA 4EXLA 3PUZE 1LAXA 2G29A 2D21A 2FA7A 1NNPA 2O51A 2XX9A 2DWIA 3TELA 4RY1A 4KCDA 3IOVA 4F1UA 2OBGA 4LZ8A 2DSFA 3GLBA 3ILUB 3HHGA 5KDTA 5I57A 2REJA 3FJGA 1LB8A 1AMFA 4ESWA 2O69A 4F19A 3JYRA 4I1DA 5L8DA 5DEXB 2ONSA 4ELQA 4ZDMA 5B7DA 3QXMA 1CB6A 4U22A 1LCTA 1O63A 2DXRA 2V93A 1EZOA 2XX8A 2P0SA 1N7WA 1B7UA 4E0XA 1N3XA 1MY1A 4JSDA 1IIWA 3MJNA 2HEUA 1JNFA 3VXBA 5H8HB 3QUFA 1FQEA 3FV1A 4EDPA 3HHFA 3PPQA 3FXQA 1HSEA 1I69A 4GD5A 1S9TA 2QPQA 5I2KA 3IJOB 1XC1A 2B3FA 5CMMA 3EHSA 2VD3A 4IY5A 2HZLA 3MAMA 3PUYE 4QFPA 4NF4A 4ZZEA 3IOTA 4HCYA 2O6AA 3EPEA 4H6DA 4YB6A 1SYHA 3TTRA 2D3IA 4F39A 5ELVA 1OMPA 4G8MA 3HCQA 2RF1A 3VVDA 4U1OA 4FIMA 3KOSA 3L6HA 2RINA 4YKPA 2V3QA 1B5HA 1Y9UA 4LA9A 2PT2A 2ZYNA 3HV1A 1XHYA 4X9TA 3FVOA 1MS7A 4GQOA 5KCJA 2AIXA 1B5JA 5CMCA 1VFEA 5H8FB 2V25A 4XKPA 1BLFA 3TFLA 2ZNUA 3DP8A 2CZLA 1TWYA 4LP2B 4OMBA 3HN0A 2F6GA 4QSCA 4IGRA 4AB6A 1IZ1A 4I62A 4HW8A 2RC7A 4H8JA 3SERA 3TTLA 4MF3A 3LSFB 2CMOA 2H98A 5HBCA 4AB5A 1MPDA 2Z8EA 3LBSA 2PX1A 3LSLA 3OOAA 3IAZA 3K1MA 3SEWA 5I56B 3UP9A 4F3GA 2M8CA 4Q8RA 2GHAA 5CI5A 3H06B 4OFLA 1L5TA 1S7YA 4KYEA 2A5SA 2I0CA 3TAJA 3TTKA 5H8QA 3C31A 1OLAA 1O7TA 1UIUA 3SKPA 1B4HA 3G7WA 4FEBA 4R75A 1MY0A 3ONMA 2DVZA 4JB7A 1OLCA 1A99A 4NWCA 3C36A 4OXVA 2F7CA 4GL0A 3I6VA 4NTLA 3MPLA 3HPIA 1AIVA 2NWJA 3R7XA 4R74A 4IO7A 2GH9A 3G3JA 3ILTB 2Z22A 1MM6A 1O64A 3U1OA 2HAVA 2Z8FA 1M5DA 3MW0A 5HPQA 2F78A 2NUVA 3O9PA 3ZS6A 3CSGA 4DXCA 4I9DA 5A5XA 4MLVA 4EQBA 3IK6B 2ANJA 4ISUA 1SW5A 1IQ7A 3H6VA 5DVFA 2OCUA 4FE8A 4BLAA 2Y7PA 4H5FA 3D4GA 1FQBA 4KFQA 1SI1A 1M5EA 1QKBA 3O28A 5LOMA 4H1XA 4DDDA 1R1NA 4POWA 1B1XA 1Y4CA 4MFIA 1PBPA 1MQJA 5J1DA 1LFIA 4OETA 4P0IA 4LATA 2GFEA 1PB7A 3O66A 3MZ9A 5AA2B 3OD7A 5JK4A 3Q28A 3C35A 3E9XA 1LB9A 4RYAA 2OWSA 4TQUQ 3B6QA 3IO4A 1LSTA 2F7BA 1SW4A 4QFNA 3I3VA 3HO7A 2VOZA 4C1TA 3CG1A 3Q25A 2ZYOA 2V84A 4GLIA 5I58A 3BFUA 4Q30B 4YKKA 5I59A 4WKMA 4U21A 3MVYA 4LONB 1N0TA 1POTA 2A5TA 1POY1 3CG3A 4ONYA 3VVFA 4L17A 1IXCA 4JWOA 3FGSA 1H3DA 2YPNA 3FATA 3MP8A 2QRYA 1Y1MA 5F1QA 4IB2A 3RY3A 2AL5A 1Z7ME 3IB2A 2P1SA 5K2YA 4IO6A 1AL3A 4PQJA 2DOJA 2E1SA 3GBAA 4U4XA 1H44A 2OZZA 1ZU0A 3S2VA 3C33A 4H5GA 2DE2A 2I4BA 4JSOA 4NF6B 3IOWA 3MBPA 2O7IA 1JW1A 1D4NA 4FORA 1QKAA 1N76A 2ESNA 3IX1A 2PMSA 1BP5A 5AE4A 1FQCA 1PB9A 4RA1A 1JEUA 4PFYA 2Q2CA 4GWOA 3ZKLA 2BJJX 4FEDA 4DLDA 1VSOA 3Q29A 3PPRA 3DP6A 1B58A 4BDMA 1DTZA 3P7IA 1A8EA 3G3IA 1P99A 3FASA 4G8NA 4M1VA 1RYXA 2Y7RA 3N94A 1B3GA 1OVBA 3FJ7A 4PFTA 3KOTA 3PMVA 2FYIA 4EQ7A 4DZ1A 1LBCA 3FXRA 1JW4A 5TPAA 2I4CA 2V3TA 1N84A 5ITPA 1R9QA 2I48A 3OSRA 3MC2A 2DWHA 4H0WA 5JTYB 1TFDA 3OELA 2XD2A 2R6GE 4ND9A 2Q89A 3TQWA 3U93A 2XXWA 1P1UA 4KD5A 1NFTA 1DTGA 3USDA 3OO9A 1Q35A 4WEDA 1A8FA 1D3KA 3E4RA 3EHTA 4RNSA 3O2AA 1SI0A 1B6HA 3IR1A 4DE8A 5CBRA 5TP9B 4H67A 4EUOA 2Z8DA 4GRKA 4F22A 3G3HA 4F3PA 3PPNA 4EF2A 2F7AA 1MY2A 1MY3A 1US5A 1URGA 4NE4A 1AOVA 3F11A 4ELOA 1JW5A 1SYIA 1EZPA 4F2QA 3RPWA 4ZEKA 4F18A 3CR9A 1BIYA 4FAJA 3O6HA 2ZYKA 4MLQA 4C0RA 5A5XB 1D9YA 3H6TA 2QS3A 2P2AA 3VE1B 4KYSA 4XIGQ 5H8NA 4XTCQ 1B3LA 1VFDA 3UIFA 1EU8A 2QS2A 3S9NC 1MM7A 4YU0A 3S9LC 1QUKA 3DP4A 4OHNA 3S4UA 4QFLA 3VLVA 3KN8A 3MVXA 4F31B 5I2NB 2HXWA 2PBWA 4LQ2A 3K6VA 2I3VA 3OEKA 3LUYA 3N5LA 3K1PA 2XXQA 2NVUB 3RT8A 5CC2A 2LAOA 3M3FA 1PB8A 2GHBA 3TEPA 3OXNA 3QIMA 4IO4A 2XHDA 5CBSA 4HS7A 2H5YA 5AA3A 4BDLA 3FVKA 5I58B 1B7HA 1GR2A 3T22A 1R6ZA 4ZEIA 3K00A 1Y20A 4OERA 4NMYA 1DSNA 1A55A 3BFTA 1B32A 1JETA 4R9FA 1B3HA 1YCJA 4GVOA 1MXYA 1JEVA 4NF8B 4YKIA 4OEVA 3OSQA 1JVYA 3KEIA 2HQ0A 2RKMA 3U72A 3M3KA 2Q8JA 2QSXA 2I49A 1MQGA 2AYSA 5JEIA 3G3KA 1PC3A 1MG1A 3A09A 5AA4A 4LZ7A 2DS9A 4U2RA 4XXUA 2B65A 4U1ZA 2IA4A 1Y4TA 2PT1A 3H4ZA 1XT8A 2X7PA 1MXXA 3K6XA 3FUZA 3ODBA 5CMBA 2B3BA 2O84X 2KLFA 1NKXA 1P1NA 1AH5A 3R6UA 3A3UA 4YICA 2DWAA 2Z23A 1MH3A 4LQ5A 1BTJA 4R9GA 4F29A 2V3UA 4BDQA 3V8XB 1R9LA 4R6HA 3TUSA 1QUIA 3E3KA 3WAFA 3EF7A 2OJTA 3O6IA 3G3GA 4P0GA 2F8DA 3K1NA 1JQFA 3RN8A 4G4PA 3RGYA 1USYE 3MVZA 3FIRA 3TODA 1H43A 3JV9A 4QHQA 2H25A 2F34A 3S9MC 5FTHA 3GXAA 2D5WA 3UN6A 3TMGA 3ZSFA 2XXYA 4RPOA 1WODA 1UTBB 3U92A 3SEUA 2IEEA 4F1VA 4GFRA 2DXYA 3TTMA 3CIJA 3Q27A 3PMXA 3RT6B 3UGWA 3T9UA 2VHAA 3MZBA 2DE4A 1A40A 3N6UA 4YB7A 4G68B 5FHOA 2WKYA 1XVYA 5CMKA 5DEXA 3SETA 3B7DA 2ABHA 3K6UA 2HAUA 2DQVA 4IY6A 4XKNA 1P1WA 3KN3A 1MXVA 4DIGA 3ZKKA 5KDTB 5I57B 3MUQA 5AA1A 4M4GA 3V5AA 1IXIA 3TCHA 1Y3NA 4G77A 5H8HA 3PD8A 4R2BA 4IO2A 2X7QA 4FECA 4PP0A 3UORA 3GBBA 2ALUA 2HFBA 3FJMA 1LAHE 5H8SA 3PUWE 1F9BA 3KJTA 1FTMA 4O3CA 3L6GA 3MVWA 1N3WA 5EYFA 3GZGA 3THIA 3TKDA 2QS1A 2O1MA 3SEVA 3G3FA 4RJZA 3MWBA 3OO6A 3UK4A 5I2KB 2I3WA 4NF5A 4HCWA 3EQ1A 3W9VA 2I0BA 4QF9A 1NNFA 3OO8A 4NF4B 3CSBA 1ZJLA 5FTIA 5I84A 4N6PA 1GTKA 1M5FA 3LSXA 2DE3A 2H9BA 1GV8A 1NH7A 3PU5A 2YLNA 4O3BA 5ICTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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