2VD2A

The crystal structure of hisg from b. subtilis
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
212
structure length
212
Chain Sequence
AMGKLLTMAMPKGRIFEEAAGLLRQAGYRLPEEFEDSRKLIIDVPEENLRFILAKPMDVTTYVEHGVADVGIAGKDVMLEEERDVYEVLDLNISKCHLAVAGLPNTDWSGVAPRIATKYPNVASSYFREQGEQVEIIKLNGSIELAPLIGLADRIVDIVSTGQTLKENGLVETEHICDITSRFIVNPVSYRMKDDVIDEMASRLSLVVEGET
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The Crystal Structure of Hisg from B. Subtilis
rcsb
molecule tags Transferase
source organism Bacillus subtilis
molecule keywords ATP PHOSPHORIBOSYLTRANSFERASE
total genus 52
structure length 212
sequence length 212
ec nomenclature ec 2.4.2.17: ATP phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2007-09-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01634 HisG ATP phosphoribosyltransferase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2vd2A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2vd2A02
4FECA 3H6TA 1EZPA 1A54A 3TCHA 4RK2A 3UORA 1AH5A 4NF8B 3O28A 5F1QA 4ONYA 3JV9A 2HZLA 2R71A 3O6IA 1MXZA 2NXOA 3OMBA 2IA4A 4Q0CA 3VDFA 3LSLA 4YU0A 2PX1A 3MP1A 1I6AA 1JW1A 5H8HB 5JEIA 2VD2A 4U23A 2F6PA 2Q88A 3C4MA 3O2AA 2YJPA 5AA3A 3C31A 3H03A 3VVDA 3PUYE 1JVXA 2G93A 2OWTA 1B3HA 5A5XA 3TTKA 1PEBA 3CR9A 3IX1A 3T93B 5TU0A 3CFXA 1OMPA 4I8CA 5M2VA 1QJMA 3K02A 2BJJX 1LBBA 3U72A 3SERA 3O6GA 3HPIA 4ZEKA 2KLFA 1NNTA 1DSNA 4DE8A 2UYFA 2O51A 3VV5A 3DELB 3QIMA 1IZ1A 1FQEA 2HEUA 1FTOA 4O3CA 1QUKA 2Y7IA 4DXCA 5CMCA 1O7TA 1ELJA 1US5A 3K0VA 4BDLA 5ICTA 2F36A 2ABHA 3GLBA 1J1NA 3V5AA 4MBPA 3MPLA 4BLAA 3RUMA 1GR2A 1USYE 5JK4A 3GBBA 1AMFA 4OTEA 3PMXA 3FATA 3SDFA 2HQ0A 3HHGA 3FJMA 3TQWA 4Q30B 4DLDA 4QRZA 4YICA 4G68B 4TLLB 4KPTA 1NNPA 1B1XA 2F97A 3FIRA 1WDNA 4G4PA 1FTMA 1NMUA 3DP4A 1MXVA 3PMVA 1FTJA 2R9JA 3H06B 1PDAA 1YPNA 3IL1B 4NWCA 3K1MA 1FTLA 5CI5A 2RC9A 3SESA 3A3UA 4U1ZA 3THIA 4F29A 1FTKA 1PBPA 3H3GA 1MPBA 2ZYMA 2XXUA 1SI0A 3V8XB 5TP9A 2O1MA 2FNCA 3Q28A 5I2NA 4Z0IA 1B32A 4X9TA 4GL0A 4IO4A 2V3QA 3FV1A 2XXVA 1LCFA 5KCJA 2E0SA 5L8DA 4F1YA 4R74A 4R9GA 4XKPA 3G3KA 1P99A 1MQGA 4GOTA 3HCQA 4I62A 2OZZA 3KOTA 3PUVE 1OVTA 1Y1MA 2XXXA 3MC2A 1A8FA 3DM0A 1GVCA 1IQ7A 1LAGE 1Q1KA 3DP8A 3TEPA 3T66A 3MBPA 3K1NA 1FQAA 5IAIA 2P2AA 2A5SA 1MM6A 2QMXA 3U92A 3RNNA 4RJZA 3SKPA 1DTGA 3QYTA 1NFTA 1LAHE 2FA7A 3QK6A 3E4RA 3S9MC 3N5LA 4F2OA 1SW5A 1MY0A 2QS4A 1M5DA 3F11A 3SEUA 1R9QA 5DEXA 3LSFB 3VVFA 3QUJA 3TTLA 1B58A 3VXCA 4RXLA 5DVIA 2DWIA 3FZVA 2M8CA 3KJ7A 2DXRA 3RGYA 2B3FA 1UTHB 1YCJA 3TTMA 2NOOA 1IXGA 1POY1 1OQGA 5CMKA 1MQHA 2I48A 4OENA 2HAVA 3TZAA 5H8SA 3TUSA 3C33A 2XXHA 3G3JA 2F5XA 4EDPA 3IAZA 3MAMA 4G8NA 3K00A 5TPAB 3O97A 3KG2A 1P1OA 3QSLA 3QUFA 3HO7A 4WEDA 4H5FA 4XIGQ 3MUQA 5B7DA 2REGA 2R6GE 2H9BA 4LQ5A 1MQJA 4JWXA 1YAEA 3PUWE 3RTWB 1B0HA 3CVGA 3ZSFA 4HW8A 2QJEA 2F35A 5FTHA 2VD3A 2Q2CA 3PU5A 3ONMA 2F78A 2PYYA 4RK9A 1A55A 1CE2A 2H25A 3T9HB 1NL5A 2F7BA 4OESA 3EHSA 3B6WA 1QUIA 3UIFA 2NVUB 1N04A 2XD3A 4G68C 4NEDA 2Q8JA 4NE4A 3VXBA 2XXYA 3FVKA 1FQDA 3O6HA 3RLFE 4GD5A 3EQ1A 2REJA 4ISUA 1D4NA 1MQDA 3K1PA 3LC8A 5DVJA 4UACA 4LA9A 5BWJA 2Z23A 2ZNUA 1HSLA 3ZS6A 2PMSA 3TYHA 2ZYNA 1NKXA 4M4GA 3PD8A 4H1XA 1LGBC 1MXWA 2HCAA 3IR1A 1Y4TA 1H45A 2ONSA 3JYRA 4NF4A 2Y7WA 1M5BA 3TTRA 3M8UA 4OQOA 1GV8A 2ZYOA 3FJGA 4F3BA 4OXVA 3FVOA 5H8NB 2I4CA 4NWDA 3OO6A 4ZEIA 3T9VA 1USYH 4NF8A 2Z8DA 3M3LA 1TT1A 1N3WA 3U8QA 5ITOA 4Q8RA 4F1UA 3P7IA 1B5JA 3EPEA 1IIWA 4LZ7A 1Z7ME 1RKMA 4G77A 4L17A 3O66A 4ZDMA 4OZ9A 3W15C 2CMOA 2Y7PA 2O68A 5H8HA 4ESWA 5F7VA 5CC2A 2QSXA 5EHSA 5DYHA 4C1UA 4G8MA 1T0KA 1UQWA 3S9NC 2UYEA 1Y20A 3EN3A 3IB1A 1MH4A 2XXQA 4DCYA 4P0GA 3VLWA 3FD3A 3QXMA 1US4A 1MDQA 3IK6B 2AL4A 2ZYKA 4JWOA 3B6TA 4ZS9A 3QAXA 1LSTA 3OELA 3O29A 3MP6A 3KJTA 2UVIA 3PPQA 4QSEA 3IB2A 3MZ9A 5ISUA 3PPNA 1YTVA 4RY1A 3R26A 2V3TA 2DXYA 4IGTA 2A5TB 3RT8A 3BBRA 1B5HA 4EQ9A 2IEEA 2O84X 3WAFA 4G8HA 1IXCA 4DCXA 3K4UA 2OLBA 4EUOA 4R9FA 3W9VA 1M5EA 4GF8A 1MQIA 3O9PA 3FUZA 3KOSA 4MF3A 5ITPA 1UIVA 3B6QA 1ZU0A 3U93A 5KDTB 1DOTA 2RC7A 4YKPA 2OJTA 3FJ7A 3TKDA 1NNKA 1EU8A 3OD7A 3MVZA 3MJNA 4AQ4A 4G68A 4FIMA 1XC1A 2CZLA 1B2HA 1VR5A 2OBGA 2XXTA 4FAJA 1RYXA 3PMWA 4EXKA 4ELPA 4GLIA 1MDP1 1DPEA 1VFEA 1BKAA 4R6HA 1SI1A 1PB8A 2Y7KA 3OSQA 4DXBA 4FATA 4QFOA 2DQVA 4U1OA 1QUJA 5EHMA 3CG3A 1L5TA 3IB0A 1Y3NA 4LUBA 1XOCA 4G2ZA 4Q5TA 2V84A 1P1QA 2HZKA 2OWSA 4U2RA 4IO6A 2ZXTA 3RN8A 1QULA 3T96B 3U94A 1B3LA 3M3FA 2VGQA 2QS3A 3Q26A 1B1HA 5JTYB 2Q2AA 3TMGA 1MS7A 4KCDA 2I58A 2XXIA 3TAJA 4OFOA 3FV2A 3Q27A 3SEYA 2RC8A 1BP5A 4OWDA 3SEWA 2OCUA 4GFRA 5CBSA 3GZGA 4K3FA 1XHYA 4LZ8A 5BUUA 4M1VA 3PPRA 1MRPA 3MWBA 1LBCA 4F31B 3L6HA 3MQ9A 1O63A 1SVXB 1M5CA 4JB7A 1B51A 3EF7A 2VHAA 3B7DA 3N94A 4RPOA 2DYXA 2QRYA 1DMBA 4ZE8A 3N6UA 4F2QA 3C32A 3OXNA 5IKBA 2XD2A 3H6VA 4IB2A 4RYAA 2WKYA 4R73A 4AB6A 4LZ5A 4H65A 3GXAA 3S4UA 2RINA 2AIXA 3FVGA 2P1SA 4F18A 4TQUQ 1QVSA 1UTBB 4EXLA 4P0IA 5ELVA 3ODBA 4OEUA 4KI0E 3L6GA 4H0WA 1UTHA 2THIA 3CI8A 5TP9B 5I84A 4ECFA 3IOVA 2QPQA 4LATA 3KZGA 4U4XA 3E9XA 2D5WA 3C34A 1POTA 2D3IA 3S2VA 5H8FB 1B7UA 1A99A 4AB5A 4QFNA 1N84A 1B0LA 1AOVA 2G29A 3MVXA 1ZKBA 1B7ZA 1XS5A 2H5YA 4ESXA 3LUYA 5FHNA 4BDQA 1B4ZA 2QS2A 1JETA 1N7XA 1H43A 3K6VA 3H7MA 3HSTA 3MZBA 2H4IA 3GBAA 5B70A 4BDRA 4C0RA 1JEUA 1B40A 4KYSA 5I59B 2Q9TA 1BLFA 1JW5A 2XXPA 4N07A 2UVJA 1PB9A 1MXXA 2GHBA 3TODA 4IO3A 4ZZAA 5HM4B 2GHAA 4GRKA 5I2KB 5AA2B 4Z7EA 2V93A 1F9BA 4ZECA 5I58A 2HXWA 1PBQA 1DPPA 5FTIA 2DWHA 3PUZE 3FXRA 5H8QB 4KD5A 1B5IA 4I1DA 3KFMA 3HV1A 5AA4B 4OFJA 4OETA 1GGGA 4ZEDA 2O1LA 1Y3PA 3OEMA 1SW1A 3CIJA 3KSXA 4ZE9A 3ECRA 1RYOA 1D3KA 2Y7RA 1PC3A 3KN7A 3ZKKA 4PP0A 1PB7A 3EHTA 1JW4A 4YB6A 4R75A 2I0CA 3H6WA 1FQCA 2I49A 2RCBA 1TFAA 3DP6A 4QF9A 3I5OA 2FYIA 4BDMA 3MP8A 2PBWA 4R2FA 2YLNA 1TFDA 1Y1ZA 4GQOA 1OIBA 4NF5B 5I56B 4QFPA 3LSWA 4JSDA 3M3KA 5I57B 3VVEA 3OSRA 4IO5A 1MXYA 4BDNA 4F1VA 4KR5A 3VLUA 3E3KA 5H8NA 1URGA 4YKKA 4R2BA 1LAFE 3T9XB 3TELA 1LB8A 1SW4A 1SD3A 4WEPA 3TQLA 1EZ9A 1B3EA 2D21A 2XXWA 4PFYA 2P0SA 2Y84A 2Z22A 1LAXA 1LCTA 1URSA 2NUVA 3C36A 1LFIA 4TLMB 4TOZA 1SBPA 2DVZA 3MVWA 4H5GA 4LP2B 1ZIUA 3N6TA 4PQJA 2PVUA 3MW0A 4EQBA 3TCFA 1H3DA 3CFZA 1UIUA 1JQFA 4LQ2A 2RKMA 4HTGA 4POXA 4XTCQ 2X7QA 3FXQA 2AYSA 1B7HA 4R72A 4YZZA 5K2XA 2DS9A 4IO7A 4GXSB 3C35A 1IXHA 2ALUA 3G3HA 2F7CA 4JSOA 4DXUA 4RPNA 4FEBA 4IO2A 2GH9A 2V3UA 4JBZA 2YPNA 3OEKA 4U21A 3IOTA 3PD9A 1LFGA 4GIZA 4ELQA 2A5TA 2DE2A 5LOMA 1HSEA 1S50A 1BTJA 4MLQA 2O69A 5DT6A 4F22A 4HS7A 1Z7NE 3IO4A 4N13A 3FXUA 1SYHA 3H6UA 3V89B 1AIVA 4PFWA 3IJOB 3CFLA 2VP1A 4EQ7A 3R7XA 2H99A 1ZTYA 4OMBA 4H8JA 1XVXA 2W7YA 1FW0A 4NF6B 4FJPA 1SQYA 1NH7A 3G3GA 5KDTA 3KEIA 3UN6A 5CBRA 4YKIA 4IY6A 4H8IA 1TWYA 3LSXA 4YMAA 5CMBA 3C9HA 4F3GA 4IY5A 2O7IA 1IUDA 3SETA 4O3AA 2ONRA 1I6BA 4MFIA 1SW2A 2HAUA 3UP9A 5L9MA 3MPKA 5AA2D 3K6XA 4LONB 4OEVA 3UA8A 3USDA 4XKQA 2F8DA 4HCWA 1NNFA 5KZTA 1H76A 1R9LA 4F19A 4F3PA 2I0BA 2UXAA 3ILUB 1MM7A 1I69A 4JXIA 3K6WA 3Q29A 2NWJA 3TFLA 5CRYA 1WODA 3MVYA 1B46A 4DZ1A 4OHNA 1P1NA 3AXFA 3SEVA 4QSCA 5A5XB 2E1SA 1URDA 1IEJA 3EHUA 1FQFA 5JTYA 1MXUA 4GVOA 1A7LA 4I9DA 3FGSA 1XVYA 3RQTA 3RY3A 1H44A 2ANJA 3TCGA 1ZBMA 3BKIB 1FQBA 3IOUA 3KGCA 4O3BA 2XX7A 4H6DA 2HFBA 1N76A 3CRBA 3G3FA 3TPAA 2VOZA 1AL3A 2DE3A 3G3IA 1ZMGA 3SEXA 2DE4A 3OO9A 1EH3A 1IITA 3I3VA 4POWA 4P11A 3K2DA 3E13X 4KCCA 3LR1A 3PPOA 3KBRA 4JWYA 3DLNA 4KFQA 1OLCA 1NH8A 4RA1A 1JVYA 4YAHX 1Y4CA 4GWOA 1MY3A 3H4ZA 1QW0A 4MH5A 3ZKLA 4XKNA 3RT6B 4RNSA 5CM6A 1JEVA 1DTZA 1VFDA 2Z8FA 4KYDA 4ZEFA 1ATGA 1UTBA 2ZNTA 1EZOA 4GL8A 2V25A 1B05A 3BFTA 3OO8A 4R6YA 4PE5B 3CSGA 3FASA 2OK2A 1D9YA 1CB6A 1LB9A 4IGRA 4C1TA 2F7AA 3IO6A 2I3VA 3A09A 5CMMA 4F39A 1ANFA 2DP8A 5H8FA 4EF1A 5L9OA 2ONKE 2PT1A 5K2YA 3MZ1A 1HSJA 2UVHA 3VFJA 4QFKA 2ZMBA 4YKJA 1LFHA 3LBSA 4H67A 3KSJA 5I2NB 3W9WA 1GTKA 3RPWA 5I59A 2I6EA 2DWJA 4ND9A 3HHFA 4N6PA 5KCJB 4FEDA 3WAEA 3Q25A 5TPAA 1MPDA 1VSOA 4DDDA 3R6UA 2RCAA 3IJXB 5I2KA 5AA2A 2X26A 3UGWA 4MLVA 4ELOA 2DSFA 1B9JA 2O7UA 3HN0A 2B3BA 2XX8A 1O64A 1KWHA 5H8QA 4OYVA 2GFEA 4FE8A 3D4CA 5AA4A 1WVJA 4OERA 4ELRA 2LAOA 4X1DA 4LVQA 3KN3A 1P1UA 5HPQA 5EYFA 5DTBA 4E0XA 4YB7A 3PGFA 4OFLA 4PETA 4JDFA 1B3FA 5AE4A 4PFTA 1SYIA 3T22A 3IOWA 1XT8A 1OVBA 4NMYA 4WXJA 3BFUA 5DEXB 4WKMA 4BDOA 1B52A 2I3WA 4YB5A 4NF5A 5I56A 2DOJA 5I57A 1MPCA 1MY4A 2PT2A 2XHDA 1N7WA 1JNFA 3PUXE 1IXIA 1A8EA 1OQHA 1II5A 3FVNA 1N0TA 4OVJA 5FHOA 2H98A 1B3GA 2AL5A 3TDJA 1LLSA 1M5FA 5L9SA 1S7YA 3IORA 4KYEA 4ZEBA 3JZJA 2Q89A 5I58B 1QKBA 1MH3A 1I6QA 2F6GA 3PV0E 4EF2A 3S9LC 4UA8A 3T9UA 2DVCA 3ILTB 5FHMA 4KQPA 5DVFA 3OENA 2RF1A 2QS1A 1R1NA 1VE4A 1Y9UA 5AA1A 3VE1B 5ICQA 5HBCA 3K01A 4QSDA 4X1BA 2O6AA 3S9EA 1MG1A 4E0WA 4NTLA 3I6VA 4XXUA 4GXAA 4PFUA 3KN8A 3V83A 4KHZE 4DIGA 1TXFA 3VLVA 4X48A 1MY2A 1MY1A 2ESNA 2GRVA 2QMWA 4FORA 2Z8EA 1QKAA 1SDXA 1ZLQA 1P1WA 1R6ZA 3PPPA 4F3SA 2UVGA 4QFLA 4THIA 1A40A 1S9TA 3CG1A 5J1DA 1Y3QA 3D4GA 4U4SA 4R6KA 4QHQA 3U1OA 3CSBA 3A3CA 2B65A 4U22A 3UK4A 1D9VA 2QL3A 1OLAA 3RTFB 1ZJLA 1FCKA 2X7PA 4XKRA 2I4BA 2F34A 2ZNSA 4HCYA 4NF6A 1B4HA 4ZZEA 3N26A 4NF4B 1BIYA 3K6UA 4YMBA 2XXRA 2DWAA 3TTNA 3OOAA 1B6HA 1N3XA 1Q35A 2XX9A 3OO7A 3G7WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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