2GHBA

Thermotoga maritima maltotriose binding protein, ligand free form
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
373
structure length
373
Chain Sequence
QPKLTIWCSEKQVDILQKLGEEFKAKYGVEVEVQYVNFQDIKSKFLTAAPEGQGADIIVGAHDWVGELAVNGLIEPIPNFSDLKNFYETALNAFSYGGKLYGIPYAMEAIALIYNKDYVPEPPKTMDELIEIAKQIDEEFGGEVRGFITSAAEFYYIAPFIFGYGGYVFKQTEKGLDVNDIGLANEGAIKGVKLLKRLVDEGILDPSDNYQIMDSMFREGQAAMIINGPWAIKAYKDAGIDYGVAPIPDLEPGVPARPFVGVQGFMVNAKSPNKLLAIEFLTSFIAKKETMYRIYLGDPRLPSRKDVLELVKDNPDVVGFTLSAANGIPMPNVPQMAAVWAAMNDALNLVVNGKATVEEALKNAVERIKAQIQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title T. maritima maltotriose binding protein open form
rcsb
molecule keywords maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein
molecule tags Sugar binding protein
source organism Thermotoga maritima
total genus 119
structure length 373
sequence length 373
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-03-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ghbA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ghbA01
2Y7KA 1EH3A 4F19A 3H3GA 5ITOA 4DXUA 4XKQA 3ZS6A 1SD3A 3V8XB 2PX1A 5AA3A 2VD3A 4H8IA 2DVZA 4QFNA 2I0CA 2GRVA 4KPTA 1GVCA 1QW0A 3IX1A 2NOOA 1O64A 1EZPA 5F7VA 3TKDA 2F78A 2ANJA 5I84A 3EF7A 1MQIA 1MY3A 1IXGA 3KFMA 1XS5A 3M8UA 4PP0A 4HS7A 4PQJA 3FZVA 1NNKA 2Z22A 3OOAA 2YLNA 4O3AA 4KFQA 4F3SA 1WVJA 4U21A 4OFLA 3TQLA 4R2BA 1PBPA 4UACA 3V5AA 3FV2A 2F36A 1EZ9A 3C36A 2V93A 4EQ9A 5IKBA 1LBBA 3TCGA 2PYYA 1PDAA 4UA8A 1OVTA 2PT2A 4GL0A 4KD5A 3TUSA 4XKRA 4X1BA 1NH7A 1UTBA 1ZBMA 5ELVA 1MXWA 4GIZA 1SW5A 3Q27A 2XXQA 2ZYMA 1J1NA 3SDFA 3SESA 1FTMA 4LA9A 1AL3A 3OSRA 1YAEA 1H45A 2IA4A 3HHFA 2QRYA 4K3FA 4M1VA 4I1DA 3VVDA 1DSNA 3D4GA 1RYOA 4JXIA 3N6TA 5I58A 4OEVA 3FATA 3E13X 3OXNA 4TLLB 4RYAA 3KN7A 1GGGA 2GFEA 2ABHA 1I6AA 4YMBA 1FQAA 1IIWA 2RCBA 2NXOA 4U22A 2VP1A 1SI0A 1OLCA 3K6UA 1IZ1A 2UVIA 2WKYA 3TZAA 1DMBA 4G2ZA 3H4ZA 2REGA 3VXCA 4GL8A 4R6YA 1XHYA 1B46A 2KLFA 2V84A 3IR1A 3QUJA 3VLWA 4RXLA 3H06B 1HSJA 2F35A 1TT1A 1PB8A 1MY2A 2Y84A 2XXXA 3HN0A 3I6VA 4G68A 3H6WA 3HO7A 2I4BA 5AA1A 2Z23A 1ZJLA 2VOZA 1SW4A 3C32A 5HBCA 4ZS9A 3N5LA 1QUKA 1JW1A 1BKAA 3O2AA 3CG1A 2X26A 3TCFA 4GRKA 1B4HA 1YPNA 3ZKLA 2ESNA 1JEUA 4HCWA 5TP9A 3PUWE 4F3GA 1VR5A 4IGTA 1H76A 5H8NA 3VXBA 3W15C 4THIA 4I62A 2B3BA 2F7AA 3PUXE 3QSLA 1MPBA 1FTLA 2Q2AA 3G3KA 4JSDA 3S9LC 3MQ9A 1B32A 3O29A 2HAUA 3TTLA 3A09A 1TXFA 4ESWA 1MH4A 1ANFA 1MDQA 2OBGA 1Y4TA 1P1NA 2I0BA 1POY1 1FQCA 2XXHA 4OESA 5DT6A 3T9VA 4YU0A 4GOTA 3ONMA 2XXVA 1AMFA 3L6HA 4EXLA 1IXIA 4BDNA 2QJEA 4RPOA 3T96B 2DXYA 2O51A 4N07A 1AIVA 1R9QA 3PUVE 3RT8A 2F8DA 1B2HA 3EHUA 3IOTA 4P11A 1ZKBA 2V3TA 1LBCA 4LZ8A 2QSXA 3FGSA 3MJNA 1ZLQA 4C1UA 3F11A 4H6DA 2F7BA 1URDA 4DE8A 3O6GA 4KI0E 1UTBB 2A5SA 1A8FA 4Q8RA 3ZKKA 4KYSA 3GXAA 4F1UA 2R71A 3LBSA 4DCYA 2O68A 3SKPA 1FQEA 3PGFA 5L9OA 4JSOA 4RJZA 4LONB 1KWHA 1A8EA 2ZNTA 1SYHA 1SW1A 3U92A 3MVYA 4U1OA 5AA4A 3S9NC 2B3FA 2DE4A 3FUZA 4QHQA 2ZNUA 3PUZE 4LP2B 4I9DA 4WXJA 5I58B 1ZMGA 3H6VA 3G3JA 3ODBA 3K4UA 2Y7IA 5FTHA 1ATGA 3KOSA 2XX7A 2OWTA 3MZ1A 2Q2CA 4QSDA 3FD3A 3M3KA 3TTKA 4DIGA 3RQTA 1MDP1 4PE5B 3TEPA 4R73A 3M3LA 3DP6A 1B5JA 3BKIB 2I58A 1MS7A 3EPEA 1R6ZA 3JV9A 4ESXA 5ICQA 4OEUA 1PB9A 1MXVA 3S2VA 4O3BA 4YKIA 3KN3A 2RC9A 1LSTA 1RYXA 1L5TA 1USYE 1B3LA 4G68B 4FE8A 3FVOA 2X7PA 4Q5TA 2DS9A 2DWAA 2HFBA 5IAIA 3K02A 1XOCA 1Z7NE 3Q28A 5I59A 3KBRA 1D4NA 5I2NA 4ND9A 5CM6A 3U72A 2D5WA 3RLFE 1B7ZA 2ONSA 3C4MA 3EHSA 4KHZE 3T9HB 2G93A 1GV8A 2NWJA 2I4CA 4LUBA 5H8NB 2I6EA 2DP8A 3KJ7A 4G8NA 2QS2A 3U8QA 1LFIA 4ELRA 1MM6A 3KGCA 1F9BA 3CSBA 2DE3A 2O1MA 4XIGQ 2DXRA 3W9VA 2F6PA 4GVOA 2Q88A 3LUYA 3OELA 1SI1A 2XXPA 2DWIA 3VLVA 2UVJA 1B52A 3IOVA 4PFWA 4X9TA 5BUUA 1B0HA 3FXUA 3LR1A 3K1PA 1P1UA 1MXYA 5EYFA 4G8HA 1LAFE 2UYFA 4OVJA 5AA2A 2P0SA 3TODA 1ZTYA 3O9PA 3O66A 1Y1MA 3IB2A 3CFXA 4NEDA 4XTCQ 2O1LA 2UYEA 2I48A 2X7QA 4F39A 1B7HA 1FTOA 4ELQA 1LLSA 5CRYA 5J1DA 1DTZA 4X48A 3TCHA 3GLBA 1P1WA 1B40A 3MPLA 4Q30B 3UP9A 1NNTA 3FVGA 2R9JA 2Z8FA 3TYHA 1FCKA 2ZYKA 4DCXA 2H25A 1VE4A 2O7IA 5CBSA 3C34A 2F7CA 3HSTA 1QULA 3CFLA 4FECA 2AIXA 3EHTA 5KZTA 2OLBA 2VGQA 5AA4B 3PMVA 3VDFA 5H8QB 2REJA 2XD2A 3PMXA 2OWSA 3SEYA 4DLDA 4TLMB 2QS4A 5FTIA 1B3GA 1PB7A 2I3VA 3V89B 3CVGA 1Y9UA 1LAGE 2DWJA 3PUYE 3T66A 3JZJA 3S9MC 1B9JA 2Q9TA 1BLFA 3PPRA 4NF8A 5JEIA 4R9GA 4H8JA 4GLIA 3D4CA 4NTLA 4YB6A 5H8HA 1BIYA 1Q35A 3SEXA 3K6XA 2THIA 2QL3A 2PBWA 2XX9A 3OEKA 3K01A 1YTVA 4FEDA 1VFEA 1DOTA 4KQPA 1LFHA 4H1XA 3I3VA 2FYIA 2I3WA 3K6VA 4X1DA 1Y4CA 1Y1ZA 4R6HA 4GFRA 5I59B 2OCUA 5I2NB 3OO7A 3MPKA 4EF1A 4HCYA 4G68C 2OJTA 4F1YA 4EQ7A 1B58A 1NH8A 1R9LA 2ZYOA 4QRZA 3VVFA 1JVYA 3IOUA 4H67A 5TPAB 1NL5A 3CRBA 4PFTA 4FIMA 2QS1A 2B65A 5F1QA 3MAMA 5BWJA 4FJPA 1DTGA 2QMXA 4NF4A 5CMCA 1N76A 4HW8A 3ZSFA 3LSWA 4RY1A 2HQ0A 3USDA 5M2VA 1DPPA 1JW4A 1UQWA 1D9YA 2PVUA 2F34A 4G8MA 1XT8A 3FASA 1TFAA 3LSFB 3SETA 2HXWA 4BDRA 3FJ7A 1NNFA 2XXWA 4LATA 4MLVA 3R6UA 2V3UA 3K0VA 3RNNA 3G3FA 2A5TA 5AA2B 1P99A 1IQ7A 2IEEA 2LAOA 4QFLA 2Z8EA 4OETA 3IL1B 4DXBA 2ZMBA 2HCAA 3K1NA 3U1OA 3O28A 3DM0A 4DZ1A 1NFTA 1Z7ME 2E0SA 1EU8A 4PFUA 2F97A 1HSEA 4OFOA 1MXXA 4JBZA 4NF6A 2Y7WA 4LZ5A 4C1TA 3PU5A 4YZZA 4IO6A 3FXRA 1EZOA 4AQ4A 5DVIA 4IO7A 3HHGA 3N94A 3SEUA 3T9XB 1IXCA 1B6HA 1QUIA 3QUFA 4IGRA 4R9FA 1UTHA 1QUJA 1M5CA 3FJGA 1YCJA 4RNSA 4EUOA 3KSJA 4YB7A 4MFIA 3MC2A 5HPQA 3IAZA 3G3IA 3CIJA 1VSOA 4RK2A 1M5DA 4LQ5A 4ZEFA 4LQ2A 2XXYA 1JVXA 1XVXA 1IITA 3OD7A 1FW0A 1MRPA 5CI5A 1B5HA 3H03A 4NF8B 4BLAA 3TFLA 3TELA 3BFUA 1QVSA 5H8QA 3IB1A 4KCCA 1NMUA 4OFJA 2Z8DA 1D9VA 1A54A 1N3XA 1P1OA 2CMOA 1O7TA 4ZE9A 2XD3A 5H8HB 3MZBA 5FHOA 2OK2A 4IO4A 1LAHE 3TTRA 3MUQA 3GBBA 4MF3A 3RN8A 4F3PA 1B1HA 1OQGA 3RTFB 3MVZA 3PPQA 3FXQA 4ELOA 2HAVA 1BTJA 4R72A 1ZU0A 3T93B 2O7UA 1Y3NA 4ZECA 2HZLA 4KYDA 4F18A 4EXKA 4ZDMA 2HEUA 5DTBA 5K2YA 2YPNA 3KG2A 4U23A 5I2KA 3DELB 4HTGA 4KR5A 4P0GA 2DOJA 1N84A 3UA8A 4U4SA 2UVGA 4QFPA 1A55A 1MY1A 5HM4B 3Q25A 2ONKE 4GXSB 4TOZA 5B70A 1JW5A 4NF4B 1MQDA 3PV0E 3QXMA 4XKPA 1GTKA 4OZ9A 4RA1A 5DEXB 4YICA 3C35A 4OYVA 2ZNSA 4BDMA 3KOTA 3UN6A 1OVBA 2DVCA 4BDQA 4JB7A 1N7XA 4H0WA 1ELJA 2O69A 3GZGA 2ALUA 3IJXB 5TPAA 4E0WA 1BP5A 3K2DA 1H44A 5AE4A 2Y7PA 1N0TA 1QJMA 3UGWA 2AL4A 2NVUB 5LOMA 5TU0A 3PMWA 1S9TA 2A5TB 1XVYA 4GF8A 5DYHA 3UK4A 5I56A 4C0RA 4FATA 1PC3A 3MP6A 4ZZAA 4EF2A 4ZEKA 2H99A 1NKXA 4AB6A 3MWBA 1II5A 1B5IA 1B3HA 3C31A 3U93A 2P2AA 2DE2A 1B3EA 4F3BA 3KEIA 3HPIA 3R7XA 3OO6A 1MQGA 3RT6B 4I8CA 3O97A 4POWA 4OMBA 4NF6B 2DSFA 4WKMA 3BBRA 5FHNA 5EHMA 2GHBA 2V25A 3VE1B 4QSEA 1JETA 3E9XA 1CE2A 1SW2A 5CMMA 1S50A 1MQHA 3FV1A 2RC8A 4GQOA 5CMBA 4F29A 1UTHB 4NE4A 2D21A 5DVFA 4OERA 3G7WA 3KN8A 2DQVA 2Q89A 1DPEA 4EDPA 5H8FA 4U1ZA 1LB9A 1SDXA 3IO6A 4YKJA 1XC1A 3P7IA 2RF1A 3RY3A 2GH9A 5KCJA 5A5XA 3B6QA 4XKNA 3H7MA 2GHAA 4H5FA 5L9SA 4ISUA 3TMGA 3A3UA 2PMSA 1T0KA 1A40A 3S9EA 3OO8A 3CR9A 1POTA 3LC8A 1B7UA 1MM7A 4G4PA 4BDOA 3AXFA 2XHDA 5I57B 1B05A 3RGYA 1MXUA 1B4ZA 4U4XA 4QFKA 4LZ7A 1O63A 2M8CA 3C9HA 2D3IA 5EHSA 5ISUA 3TDJA 4OXVA 3OSQA 1QKAA 3FIRA 4NWCA 2CZLA 1LCTA 4OTEA 4F2OA 4E0XA 4ZZEA 1US4A 3Q29A 1LFGA 3G3GA 3PD9A 5KDTA 1A99A 2FNCA 3V83A 3T22A 4WEDA 1FQBA 2RKMA 1JNFA 3QYTA 4AB5A 5FHMA 5DVJA 5I2KB 3LSXA 4YMAA 3MW0A 3I5OA 3MVXA 3C33A 3N6UA 1B0LA 4IO5A 4F2QA 2YJPA 3G3HA 1I69A 5CMKA 1N3WA 3K00A 1I6BA 2O6AA 1US5A 1UIUA 4OWDA 4YKPA 1MPCA 5K2XA 3R26A 1IUDA 3MBPA 2VD2A 1PEBA 4KYEA 3DP4A 3HCQA 2DYXA 2AL5A 2NUVA 4N6PA 3S4UA 1I6QA 1PBQA 4EQBA 1TWYA 1FTJA 1B1XA 3TTMA 1M5BA 2F6GA 2H5YA 4TQUQ 4BDLA 4DXCA 1VFDA 3WAEA 5DEXA 3KJTA 1JQFA 4Z0IA 1Q1KA 5JTYA 5I56B 2VHAA 3MZ9A 1Y3PA 1LB8A 3E4RA 3Q26A 1ZIUA 2PT1A 4IO2A 3A3CA 4ELPA 4ZE8A 1MH3A 3PPPA 3TAJA 2W7YA 1NNPA 3VLUA 2E1SA 4Z7EA 1MY0A 1LGBC 2AYSA 2DWHA 3MVWA 4QSCA 2R6GE 4GWOA 3RUMA 1FTKA 1R1NA 4ECFA 3KZGA 4NF5A 1MY4A 3DP8A 4LVQA 4YB5A 4L17A 2HZKA 2QMWA 3O6HA 1P1QA 4MH5A 3N26A 4PETA 5CBRA 1N04A 3OO9A 2ZXTA 4PFYA 3PPNA 4R75A 4JWXA 1FQDA 3BFTA 2OZZA 4R6KA 4NMYA 5H8FB 4F22A 4ZEBA 1URSA 4GD5A 5CC2A 3QAXA 1AH5A 3OMBA 4O3CA 5KCJB 2G29A 5A5XB 1QKBA 4U2RA 4QFOA 3EN3A 3TTNA 2BJJX 3IJOB 4ZEIA 5AA2D 4KCDA 2Y7RA 4M4GA 3ECRA 5L8DA 2F5XA 4JWOA 2P1SA 3THIA 2UXAA 4F31B 3KSXA 2RC7A 4RPNA 4IB2A 2O84X 1AOVA 2XXIA 3W9WA 2V3QA 4MBPA 1OLAA 3OENA 3PD8A 5JK4A 3FJMA 3GBAA 4Q0CA 4JWYA 1M5FA 1H3DA 2QPQA 2I49A 3SERA 2Q8JA 4GXAA 1A7LA 4R2FA 5I57A 1Y3QA 5KDTB 4RK9A 3ILUB 3VVEA 5ITPA 1Y20A 2XXRA 4OHNA 1OMPA 4XXUA 4FEBA 3TPAA 3HV1A 3T9UA 3VV5A 3MP1A 3U94A 1SYIA 3UIFA 4FORA 1GR2A 4QF9A 3WAFA 3UORA 3QK6A 5B7DA 2QS3A 4IO3A 4ZEDA 3CSGA 4WEPA 3K6WA 3OEMA 1IEJA 2XX8A 2H98A 5ICTA 2H9BA 1B51A 1TFDA 2RCAA 1JEVA 1S7YA 3RTWB 1SVXB 3CG3A 1MPDA 4OQOA 1SBPA 4ONYA 1WDNA 3L6GA 3DLNA 2RINA 2ZYNA 3LSLA 3B6TA 5L9MA 4IY6A 1LAXA 3K1MA 4P0IA 3PPOA 3SEVA 1RKMA 3IO4A 3B6WA 2XXUA 3IORA 4YAHX 1OQHA 1UIVA 4DDDA 4H5GA 2ONRA 4YKKA 1HSLA 4IY5A 5JTYB 1IXHA 1USYH 4NWDA 3SEWA 1FQFA 3M3FA 4H65A 3CI8A 1OIBA 4G77A 3RPWA 3IOWA 1CB6A 1H43A 1LCFA 3IB0A 1D3KA 3EQ1A 3H6TA 1MQJA 3QIMA 1MG1A 5H8SA 1SQYA 5TP9B 3JYRA 3TQWA 1N7WA 1URGA 3CFZA 3ILTB 4FAJA 1WODA 4N13A 3MP8A 3O6IA 2XXTA 2UVHA 4NF5B 3E3KA 1MXZA 3IK6B 4JDFA 1B3FA 4MLQA 3FVNA 1M5EA 4POXA 3FVKA 4F1VA 2H4IA 3H6UA 4OENA 2FA7A 4R74A 3VFJA 3B7DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Y7KA 1EH3A 4F19A 3H3GA 5ITOA 4DXUA 5J16A 4XKQA 3ZS6A 1SD3A 3V8XB 2PX1A 5AA3A 4JVIA 2VD3A 4H8IA 2DVZA 4QFNA 2I0CA 2GRVA 4KPTA 1GVCA 1QW0A 4HE2A 3IX1A 2NOOA 1O64A 1EZPA 5F7VA 5IZ1A 3TKDA 2F78A 2ANJA 5I84A 3EF7A 1MQIA 1MY3A 1KA1A 1IXGA 2B4MA 3KFMA 1XS5A 3M8UA 4PP0A 2ZZWA 4GWYA 4HS7A 4PQJA 3FZVA 1NNKA 2Z22A 3OOAA 2YLNA 4O3AA 4KFQA 4F3SA 1WVJA 5IZZA 4U21A 4OFLA 3TQLA 4R2BA 4PAKA 1PBPA 4UACA 3V5AA 3FV2A 2F36A 1FPEA 1EZ9A 3C36A 2V93A 2CZHA 4EQ9A 5IKBA 1LBBA 5EQ7A 3TCGA 2PYYA 1PDAA 4UA8A 1OVTA 4NQ8A 2PT2A 4GL0A 4KD5A 3TUSA 4XKRA 3T0JA 4X1BA 1NH7A 3B8BA 1UTBA 4GWSA 1ZBMA 5ELVA 1MXWA 4GIZA 1SW5A 3Q27A 1RDZA 2XXQA 2ZYMA 1FPBA 1J1NA 3SDFA 3SESA 1FTMA 3RPLB 4LA9A 1LBWA 1AL3A 3OSRA 1IMBA 1YAEA 1H45A 2IA4A 3HHFA 2QRYA 4K3FA 4M1VA 4OVQA 4I1DA 3VVDA 1DSNA 3D4GA 1RYOA 4JXIA 3N6TA 5I58A 4OEVA 4O8MA 3FATA 3E13X 3OXNA 4TLLB 4RYAA 3KN7A 1GGGA 2GFEA 5LDZA 2ABHA 1I6AA 3EKIA 4YMBA 1FQAA 1IIWA 2RCBA 2NXOA 4U22A 2VP1A 1SI0A 3IFCA 1NV6A 1OLCA 3K6UA 1IZ1A 2UVIA 2WKYA 3TZAA 4I3YA 1DMBA 4PC9A 4G2ZA 3H4ZA 2REGA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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