2GHBA

Thermotoga maritima maltotriose binding protein, ligand free form
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
373
structure length
373
Chain Sequence
QPKLTIWCSEKQVDILQKLGEEFKAKYGVEVEVQYVNFQDIKSKFLTAAPEGQGADIIVGAHDWVGELAVNGLIEPIPNFSDLKNFYETALNAFSYGGKLYGIPYAMEAIALIYNKDYVPEPPKTMDELIEIAKQIDEEFGGEVRGFITSAAEFYYIAPFIFGYGGYVFKQTEKGLDVNDIGLANEGAIKGVKLLKRLVDEGILDPSDNYQIMDSMFREGQAAMIINGPWAIKAYKDAGIDYGVAPIPDLEPGVPARPFVGVQGFMVNAKSPNKLLAIEFLTSFIAKKETMYRIYLGDPRLPSRKDVLELVKDNPDVVGFTLSAANGIPMPNVPQMAAVWAAMNDALNLVVNGKATVEEALKNAVERIKAQIQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein
publication title T. maritima maltotriose binding protein open form
rcsb
source organism Thermotoga maritima
molecule tags Sugar binding protein
total genus 119
structure length 373
sequence length 373
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-03-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ghbA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ghbA01
5DVFA 4DCXA 2D3IA 4ZS9A 3H6TA 3IO6A 3U1OA 3FGSA 4NWCA 3EHSA 4OMBA 1MY0A 5HM4B 2HXWA 4IO2A 2XXVA 1DTZA 4F1UA 4C0RA 1N76A 2F5XA 4FATA 3OO8A 2I3VA 1ZLQA 3TCHA 5L9MA 4JWXA 3UIFA 3VXBA 3FXQA 1IXCA 3LR1A 5H8NB 1HSJA 2ZMBA 1SW2A 1VSOA 2HQ0A 5DEXA 2XXTA 1LCFA 3JV9A 4KR5A 5I2NA 3TUSA 1QUKA 4OFJA 2V84A 3U93A 3FIRA 2A5TA 1F9BA 3BBRA 2CZLA 1QW0A 4P0GA 3HN0A 1BKAA 3A09A 3BKIB 4MF3A 4F3PA 1LAXA 3LBSA 3S4UA 2X26A 3TQWA 2ESNA 1T0KA 3IAZA 1AIVA 3E9XA 2XXRA 4NF4A 4ZDMA 3SEXA 5I58B 2P1SA 3E3KA 3EF7A 5I57A 2VP1A 3K0VA 1PB9A 3QUJA 1UTBA 1MY3A 2XXIA 5H8QB 3THIA 4LZ7A 4X1DA 4GXAA 4JWOA 4R6KA 4TQUQ 2OJTA 3FV2A 3HPIA 4M1VA 1FTMA 1I6AA 2QS4A 4HCYA 2UVIA 3GZGA 1M5CA 1Y4TA 4RK9A 3FJGA 2ZYNA 4F3SA 1IIWA 1LLSA 2F34A 1SW5A 3DP4A 1JQFA 3UN6A 3OO7A 3FASA 3VV5A 3OSRA 4Q5TA 3KSJA 3IO4A 2ANJA 2PT1A 3FVGA 5FHOA 2XD3A 2FNCA 4NEDA 2P0SA 3CSGA 1VFEA 2HAUA 2Z22A 1NNPA 2W7YA 3O9PA 3ZKLA 3TTMA 3VVEA 4LA9A 3O29A 5DYHA 4ZEFA 3A3CA 5F7VA 4FJPA 2HZLA 4QSDA 1H43A 1II5A 3AXFA 1SVXB 1IXHA 5IAIA 4FECA 5I84A 1XVXA 4IY6A 3N26A 2UVJA 2LAOA 4G8HA 3VVDA 2QSXA 3UGWA 1OVBA 1RYOA 5DT6A 5HPQA 5TPAA 4EQBA 4NTLA 2QS2A 1N0TA 4OFLA 4X9TA 4KPTA 2H5YA 5CM6A 1ZJLA 3K6VA 1OIBA 1B3HA 3SEVA 3N6UA 1MS7A 1GTKA 1B32A 4OERA 1P1OA 3SEYA 4EF2A 2PYYA 1QVSA 3BFTA 2DWJA 3L6GA 3TTLA 5I56A 4EXLA 1Y4CA 3OEKA 1OVTA 2RC9A 3IB1A 3FXUA 2GRVA 4KYSA 4JDFA 4R6HA 2I0CA 4XTCQ 4YU0A 5CMMA 1UQWA 4YAHX 4NE4A 1XT8A 3KJ7A 3VLVA 4YB5A 4POXA 5H8FA 2Z8FA 1ZKBA 2REJA 3JYRA 1Q1KA 2R71A 5AA2A 3LSXA 2V25A 4ELOA 4U21A 1RKMA 4GWOA 1P1QA 3TODA 4LP2B 3VFJA 2DE3A 1EU8A 1ZIUA 1URSA 3DELB 3K6WA 4ZEIA 2Q9TA 4OQOA 1LBBA 1B5HA 1PBPA 4O3CA 1OLAA 3KN8A 3KFMA 2AL4A 3RY3A 4I1DA 4ONYA 2Z8EA 4IO6A 1GV8A 3T22A 2IEEA 5KCJB 2O51A 4Q30B 1EZOA 3PPNA 1SW4A 2VD3A 1B7HA 3UK4A 3K6UA 1PB7A 4ESWA 3CSBA 4GVOA 1NH8A 3MQ9A 4GRKA 1H44A 3EHUA 3IOUA 4I62A 1MY1A 1URDA 4HCWA 4MFIA 2OK2A 4U23A 4YKPA 2PX1A 2DE4A 2Z8DA 1OQGA 4XKRA 3KGCA 4GIZA 3VVFA 3VXCA 1SBPA 1O7TA 4G8NA 1WDNA 2OCUA 1HSLA 1N84A 5ISUA 1JW1A 5A5XB 3LSLA 4FAJA 4G4PA 2QPQA 4GD5A 1Z7NE 4EQ7A 3OO6A 2UYFA 2DWAA 1ELJA 1B5JA 3C33A 4RY1A 1MY4A 2Y7IA 2ALUA 5ELVA 1I6QA 4ISUA 4NF5B 2X7PA 2RCBA 2H98A 1RYXA 4QSEA 1XOCA 3CFZA 4H6DA 3C4MA 3QYTA 3U94A 3TDJA 4R72A 3UORA 1SDXA 3ILUB 4F22A 2Q89A 1TT1A 2AYSA 1B3FA 4QFPA 5AA3A 1Z7ME 5JK4A 1B9JA 4QHQA 4RPOA 3JZJA 1MXWA 4DXCA 2DSFA 3SEUA 2O7IA 5AA2D 2Y7PA 4H8IA 3CFXA 1QKAA 1R6ZA 1FQDA 2DS9A 4PETA 3C9HA 2WKYA 1SI0A 1UTHA 3T96B 3PGFA 3MPKA 3FJ7A 3PUWE 1OLCA 4DE8A 3H3GA 2XXHA 3S9NC 1PBQA 3HV1A 3FVNA 5H8HB 4GL8A 1LAFE 3KOSA 2D21A 3TTRA 2D5WA 4G2ZA 4LUBA 2NOOA 3GBBA 4RJZA 2V3QA 4N07A 2HAVA 3BFUA 4F1VA 4PFTA 3M3LA 3T9VA 4GFRA 2UVHA 3HHFA 3M3FA 4XKNA 2NUVA 5CMCA 4OENA 3PUXE 4LONB 1B58A 4EDPA 2I58A 3IB2A 2O69A 3GLBA 2I4CA 1AMFA 4KCCA 1I6BA 4MH5A 1YAEA 1NH7A 5CBSA 3LUYA 4IB2A 1Y20A 3E4RA 3I5OA 4OZ9A 3B7DA 2P2AA 4OVJA 1LCTA 3KOTA 3QUFA 3N6TA 3GXAA 2QRYA 5FHMA 1N04A 2Y7WA 4HW8A 1JW5A 5DTBA 1HSEA 3G7WA 3V8XB 3MW0A 4P11A 3KG2A 5IKBA 3H4ZA 3H6UA 1A54A 4FE8A 3ONMA 3PD9A 3K2DA 3DP8A 4DCYA 3IK6B 1OMPA 4N13A 2O84X 3IJXB 2F7AA 3KEIA 3EN3A 3G3JA 3TCGA 1PC3A 3O66A 2UXAA 4G68B 4JB7A 4N6PA 5B7DA 4F29A 1N7WA 4PQJA 2XXXA 2FYIA 1QUIA 5JEIA 4KFQA 3GBAA 4EF1A 5DEXB 1IITA 4F1YA 1B1XA 3T9XB 4WEPA 3T9HB 2DE2A 3IB0A 5I2NB 2CMOA 2I48A 1MQGA 2B65A 5EHSA 1B0HA 1MRPA 3SKPA 2A5TB 3SETA 2G29A 3F11A 4R9GA 2DP8A 2XXUA 4M4GA 2OLBA 3Q25A 4G8MA 2PMSA 1B7UA 4K3FA 2OBGA 4NF4B 1D3KA 2E1SA 3B6QA 2I49A 1O63A 5LOMA 5I57B 1MPBA 4BDRA 1UTBB 2I4BA 3EPEA 5EHMA 2H4IA 3O6GA 3PPOA 1MPDA 1QJMA 2VGQA 4F18A 1P99A 2A5SA 4OXVA 4ECFA 2YPNA 3C31A 2XXPA 2RF1A 4LZ5A 1B1HA 3MVZA 5K2XA 3K02A 2DWIA 1H45A 3RQTA 3R6UA 4Q8RA 1B7ZA 1MY2A 5DVJA 5L9OA 4KD5A 3TMGA 1SD3A 3Q29A 4QSCA 5TP9A 3TQLA 3OMBA 4ZE9A 3A3UA 2Q2CA 1JVXA 3ODBA 2O1MA 3MZ1A 3OO9A 1L5TA 3RUMA 3R7XA 1JEVA 1YCJA 1DSNA 1N3XA 1AOVA 4POWA 4QFKA 5CMBA 5KZTA 1B2HA 3O2AA 3RTFB 3FV1A 4R9FA 3PMXA 5KCJA 4OEVA 2DOJA 3LC8A 4ZZAA 3R26A 3RTWB 5I2KA 3TYHA 2REGA 4U1OA 2RINA 3LSWA 2H25A 4GQOA 5DVIA 3CI8A 4F2OA 2H99A 4MLVA 1B3GA 4TLMB 5TPAB 1KWHA 3IOTA 4NF8A 3DLNA 3VDFA 1M5EA 4BDLA 2PVUA 1MQJA 4JSOA 3ECRA 3O97A 1A55A 4LQ2A 4GF8A 2ZNUA 2R9JA 1ANFA 2F7BA 4R75A 2DWHA 3FJMA 2F6GA 2QL3A 4YMBA 3W9VA 2VHAA 3G3HA 1OQHA 1B4HA 4KCDA 1MXUA 1YTVA 5I56B 4XKPA 3OXNA 2Y7KA 3D4GA 2F36A 1IXGA 3MP8A 2X7QA 2V3TA 3B6WA 1IXIA 4UACA 4ZECA 4I9DA 4ELRA 1NKXA 1XHYA 3I6VA 3O6IA 2Q8JA 3CG1A 3EQ1A 1MH4A 1B40A 1POTA 4F3BA 3KSXA 1GVCA 1LFHA 2XXQA 3K6XA 4DDDA 4QFNA 2QMWA 4L17A 1R9QA 5KDTB 5H8FB 2QS1A 4OEUA 3C35A 3QK6A 5HBCA 5AA2B 1B51A 3OENA 4C1UA 5I59A 4GXSB 1H76A 1FTJA 4NF6A 1Y9UA 4WEDA 3DM0A 2E0SA 1JNFA 3KJTA 5CRYA 5FHNA 4U1ZA 3S9EA 1NNKA 1BIYA 3FUZA 3T93B 2YLNA 4QF9A 4R6YA 1MM6A 2DQVA 4X1BA 3RLFE 5JTYA 5TU0A 4FEBA 3LSFB 1NNTA 2I3WA 4EQ9A 2GHAA 2ZYOA 1A8FA 2XXYA 4JXIA 3TFLA 3K4UA 3IOWA 1EH3A 5AA4B 3MP1A 1XC1A 4BLAA 1ATGA 1UIUA 4ZE8A 3TKDA 4TOZA 1LFIA 4JSDA 1LAGE 3C36A 4PFYA 5CMKA 4QRZA 4QFOA 4WXJA 4E0WA 4BDQA 2ONSA 4H8JA 4OHNA 2AIXA 3QSLA 2GH9A 3G3GA 1LSTA 2XX8A 2F78A 5L8DA 1Y3NA 3W15C 5CBRA 2F7CA 4QFLA 2H9BA 3K1PA 3H06B 1LGBC 3MVWA 1PDAA 3IORA 4X48A 3TPAA 4ZEKA 2PBWA 1B52A 5ITOA 2DVZA 2I6EA 4OETA 2QMXA 3PPRA 5H8NA 3IOVA 1MXZA 3FZVA 1PEBA 1QUJA 4ELPA 5K2YA 4O3BA 4GOTA 4YZZA 1P1NA 1JW4A 1NL5A 1QKBA 3TEPA 3MZBA 3V5AA 4R73A 4NWDA 1N3WA 3N5LA 4ND9A 3TAJA 1B3LA 4F39A 1NNFA 1A40A 2Q2AA 4UA8A 5AE4A 3MAMA 3K01A 3FATA 1R9LA 4H5GA 3VLWA 4P0IA 4RYAA 5I58A 2Y7RA 1B6HA 2NVUB 4FORA 4DXBA 2ZYKA 3PPPA 1DPEA 3SEWA 1DOTA 3ZS6A 3KBRA 2HFBA 4GL0A 1DMBA 3FVOA 4O3AA 2OZZA 3CVGA 3Q27A 4THIA 4G68A 5H8QA 3PMWA 4IO7A 4KYEA 4LQ5A 2B3FA 1JVYA 1ZU0A 1D9YA 4F31B 4KHZE 3ZKKA 2ONRA 1FTKA 4MLQA 1M5DA 1SQYA 1JETA 1US4A 1UTHB 2VOZA 2O7UA 4F3GA 2F6PA 3E13X 3HO7A 4IGRA 2HCAA 3B6TA 1VR5A 4PP0A 3SERA 1MH3A 1FCKA 3U8QA 2ONKE 3OSQA 4DXUA 3VLUA 4U4XA 4IGTA 3EHTA 2XX7A 1EZPA 2Y84A 1UIVA 1ZMGA 1TFAA 1LFGA 2M8CA 4GLIA 3U72A 1WVJA 1ZBMA 1A99A 4LATA 1J1NA 3Q28A 2Z23A 2QJEA 3MVYA 3MZ9A 4R2BA 3ZSFA 1S9TA 4ZEBA 1B0LA 1BP5A 4AB6A 3WAFA 2AL5A 4WKMA 1MXVA 3RN8A 4HS7A 1CB6A 3MPLA 5FTHA 1LB9A 3TZAA 3MVXA 1MDQA 3O28A 4EXKA 3CRBA 2ZNSA 5L9SA 3PU5A 3HSTA 1POY1 3P7IA 3W9WA 4H0WA 3SESA 1FQEA 4H5FA 1TFDA 3TCFA 3H6VA 2IA4A 3OEMA 2DXRA 4JBZA 1MQIA 3K1NA 4BDOA 4DIGA 3MJNA 1VE4A 1FQFA 4XIGQ 4OYVA 4DZ1A 1QULA 4KYDA 5ITPA 3KZGA 4MBPA 3H03A 4YKKA 3HCQA 3Q26A 3USDA 4DLDA 2BJJX 2O6AA 1MXXA 4PE5B 4ESXA 4YICA 1LB8A 1URGA 4HTGA 3KN7A 3MWBA 4KQPA 5EYFA 4U4SA 2ZYMA 3CFLA 4IY5A 2XXWA 4XXUA 3VE1B 2YJPA 2XHDA 5BWJA 3PPQA 3I3VA 3FXRA 1NFTA 1P1UA 2RC7A 1AH5A 4EUOA 1YPNA 3FVKA 2RC8A 1CE2A 1IQ7A 4Q0CA 2F35A 5B70A 4BDMA 1BTJA 3RT6B 2DVCA 4ZEDA 4LVQA 4H1XA 2HZKA 4IO5A 1FQBA 4OTEA 2OWTA 3RGYA 1B3EA 5ICTA 3L6HA 2O1LA 1M5BA 4F19A 3PUVE 3G3IA 3QIMA 4TLLB 3H7MA 3HHGA 4Z7EA 3OELA 3IR1A 4H65A 4R74A 4YKJA 3FD3A 1MPCA 4AB5A 1MDP1 3MP6A 1NMUA 4PFUA 4E0XA 3CG3A 2V93A 4G77A 2V3UA 1MXYA 1FTOA 1B46A 5F1QA 1MM7A 1SW1A 4H67A 3OD7A 2ABHA 1TWYA 5AA1A 5KDTA 4YB7A 1Q35A 4IO3A 4RA1A 3CIJA 3TTNA 1M5FA 5TP9B 1FQAA 3G3KA 1IEJA 1TXFA 1WODA 3RT8A 3MBPA 5A5XA 4U22A 5CI5A 3S2VA 2I0BA 2R6GE 5BUUA 4YKIA 3RPWA 2NXOA 3N94A 1FW0A 1SYIA 1MQHA 2RKMA 3PMVA 3S9MC 2ZXTA 4JWYA 1S50A 3T9UA 3UP9A 2ZNTA 4U2RA 3QXMA 1DPPA 4OESA 5J1DA 4BDNA 1GR2A 3QAXA 4OWDA 4AQ4A 1SYHA 4RNSA 4NF5A 1JEUA 3IJOB 3DP6A 5AA4A 1VFDA 3PV0E 4NMYA 3D4CA 5I2KB 3O6HA 2VD2A 2HEUA 1D9VA 1Y3QA 4G68C 4KI0E 4I8CA 1Y1MA 2RCAA 4RXLA 4FIMA 3C34A 3IL1B 1AL3A 1H3DA 3WAEA 4NF8B 4C1TA 2PT2A 4YB6A 2QS3A 3TELA 3PUYE 3C32A 4YMAA 4PFWA 1FQCA 3H6WA 2F97A 1N7XA 1B4ZA 1O64A 1SI1A 1D4NA 4Z0IA 1A8EA 2GHBA 4ELQA 3TTKA 2DXYA 3SDFA 4ZZEA 4RK2A 3UA8A 2B3BA 3MUQA 3G3FA 1B5IA 1LAHE 2F8DA 1XS5A 3MC2A 1LBCA 2DYXA 2KLFA 2G93A 5FTIA 1I69A 1US5A 3V89B 4LZ8A 1A7LA 1MQDA 1P1WA 5ICQA 2O68A 1PB8A 1Y1ZA 1EZ9A 1USYH 2GFEA 5H8HA 1S7YA 5H8SA 3S9LC 2UVGA 3CR9A 3K1MA 5I59B 4R2FA 4NF6B 1R1NA 1ZTYA 3OOAA 3PD8A 3ILTB 3M8UA 4IO4A 1IZ1A 2Q88A 3PUZE 3T66A 3IX1A 1XVYA 2FA7A 3RNNA 2OWSA 3K00A 5JTYB 5CC2A 1USYE 3V83A 4XKQA 5M2VA 1GGGA 3KN3A 1Y3PA 1DTGA 4FEDA 2XD2A 3M3KA 2XX9A 1IUDA 2UYEA 1MG1A 2NWJA 3U92A 4OFOA 1FTLA 2THIA 1B05A 1BLFA 4RPNA 4F2QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5DVFA 1FBFA 4DCXA 2D3IA 4ZS9A 3H6TA 3IO6A 3U1OA 4P1EA 2WYKA 3FGSA 4NWCA 3EHSA 4OMBA 1MY0A 5HM4B 2HXWA 4IO2A 2XXVA 2PCRA 4LN5A 1K9YA 1DTZA 4F1UA 4HE2A 4C0RA 1N76A 5EQ9A 2F5XA 4FATA 3OO8A 2I3VA 1ZLQA 4PDHA 3TCHA 5L9MA 4JWXA 3UIFA 3VXBA 3FXQA 1IXCA 3LR1A 5H8NB 1HSJA 4X04A 2ZMBA 1FJ9A 1SW2A 1VSOA 4FBPA 2HQ0A 5DEXA 2OX3A 2XXTA 1LCFA 3JV9A 4KR5A 2CEYA 5I2NA 3TUSA 1NV3A 1QUKA 4OFJA 5I5PA 2V84A 3U93A 3FIRA 2A5TA 1FBEA 1F9BA 3BBRA 1D9QA 2CZLA 1QW0A 4P0GA 3HN0A 1BKAA 3A09A 3BKIB 4MF3A 4F3PA 5IZZA 1LAXA 3LBSA 3S4UA 2X26A 3TQWA 2ESNA 1T0KA 3IAZA 1AIVA 3E9XA 2XXRA 4NF4A 4ZDMA 3SEXA 5I58B 2P1SA 3E3KA 3EF7A 1IMFA 5I57A 2VP1A 3K0VA 1PB9A 3QUJA 1UTBA 1MY3A 2XXIA 2Q74A 1FPEA 1IMBA 5H8QB 3THIA 4LZ7A 4X1DA 4GXAA 2V4CA 4JWOA 4R6KA 1NUXA 4TQUQ 5I7IA 2OJTA 3FV2A 3HPIA 4M1VA 1FTMA 4PBHA 1I6AA 2QS4A 4HCYA 5IM2A 2UVIA 2QVVA 3GZGA 1M5CA 1NV1A 1Y4TA 4RK9A 3FJGA 2ZYNA 4F3SA 1IIWA 1LLSA 2F34A 1SW5A 3DP4A 1JQFA 4O8MA 4OANA 3UN6A 3OO7A 3FASA 4GX3A 3VV5A 3OSRA 4Q5TA 3KSJA 3IO4A 2ANJA 2PT1A 1G0IA 3FVGA 5FHOA 2XD3A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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