2GHBA

Thermotoga maritima maltotriose binding protein, ligand free form
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
373
structure length
373
Chain Sequence
QPKLTIWCSEKQVDILQKLGEEFKAKYGVEVEVQYVNFQDIKSKFLTAAPEGQGADIIVGAHDWVGELAVNGLIEPIPNFSDLKNFYETALNAFSYGGKLYGIPYAMEAIALIYNKDYVPEPPKTMDELIEIAKQIDEEFGGEVRGFITSAAEFYYIAPFIFGYGGYVFKQTEKGLDVNDIGLANEGAIKGVKLLKRLVDEGILDPSDNYQIMDSMFREGQAAMIINGPWAIKAYKDAGIDYGVAPIPDLEPGVPARPFVGVQGFMVNAKSPNKLLAIEFLTSFIAKKETMYRIYLGDPRLPSRKDVLELVKDNPDVVGFTLSAANGIPMPNVPQMAAVWAAMNDALNLVVNGKATVEEALKNAVERIKAQIQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Sugar binding protein
molecule keywords maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein
publication title T. maritima maltotriose binding protein open form
rcsb
source organism Thermotoga maritima
total genus 119
structure length 373
sequence length 373
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-03-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ghbA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ghbA01
2D5WA 1LBCA 1Y3QA 5ICTA 4LZ8A 1A40A 2XXRA 4DZ1A 3PMXA 3GXAA 3K1MA 1AIVA 3PPPA 4DE8A 3G3GA 4WEDA 3BKIB 3C9HA 4POWA 3FJMA 3RLFE 2XX9A 4IO6A 1DMBA 1NFTA 5ITPA 4ZDMA 4NE4A 1LCTA 3TPAA 3TTLA 4OVJA 3N26A 2DOJA 2DXYA 5A5XA 3IO4A 3O6IA 3KBRA 5AA4A 4FAJA 4KHZE 2PBWA 2F8DA 1N7WA 4OFLA 3H06B 2DWAA 3MZ9A 5I2KA 2M8CA 4HW8A 3UN6A 3FXRA 4OESA 3PMWA 3G3KA 4N07A 5F1QA 1FTOA 3ILTB 3TCHA 5I2NA 3CI8A 3OD7A 4FE8A 4QFKA 2CZLA 4YB6A 4F31B 4G8MA 5KDTA 1YCJA 4GIZA 4ZECA 4F39A 1MS7A 2RKMA 4F3BA 4GL8A 5AA2D 4PP0A 4H6DA 2I48A 2RC7A 4NF5B 4NWCA 1FQFA 3K6WA 3MPLA 2Y7WA 5H8NA 3IB0A 4G68A 4R72A 4BDMA 4IY5A 1N7XA 3CIJA 3A3UA 3TTKA 3H4ZA 2I4BA 3G3JA 5EYFA 2QS4A 1VR5A 2G29A 3TZAA 4R2FA 4ZS9A 2DSFA 3CVGA 1D9VA 4OERA 4TLMB 1LGBC 4Q5TA 1PB8A 1S50A 1IXIA 5KCJB 2DE4A 3TMGA 1NKXA 5I56B 1SI1A 2AIXA 5BWJA 3QAXA 1TFAA 3O9PA 2CMOA 2HXWA 3C36A 1Z7NE 4RNSA 1UQWA 3I6VA 5DYHA 2GFEA 3TKDA 4FJPA 1P1NA 3HN0A 3FVNA 4E0XA 4Z0IA 4Q0CA 1FQCA 1I69A 1PBPA 1A8FA 4HCWA 2AL5A 2IA4A 4GWOA 1IIWA 2YLNA 1ZU0A 3N94A 1LLSA 3OEMA 4OFOA 2NOOA 3O6HA 4HTGA 1R1NA 1B4ZA 3W9VA 3KOSA 4F3GA 4YAHX 2I4CA 1AMFA 1NL5A 3GBAA 3TTRA 3KJTA 4H5GA 1B4HA 1MDP1 2Q2AA 3KN3A 4DXBA 1B52A 3FASA 4QF9A 5H8FB 4NF4B 2Q89A 4U4XA 5I59A 4F1VA 1ZKBA 3QK6A 4XIGQ 2Z8EA 3KN7A 1NNTA 3H03A 1UTBB 3OO6A 3O2AA 2I0CA 3FXQA 1MQGA 3C33A 4P0GA 1USYH 1Y4TA 4PQJA 4LQ2A 1IITA 1LFHA 3DP4A 3C32A 4IO7A 2Z8DA 1ATGA 4R75A 5I57A 1FQAA 2F35A 1M5DA 4U21A 4LZ7A 1N3WA 1VE4A 1T0KA 2O7UA 3KN8A 1FTMA 4G8HA 3T22A 3S9EA 4TQUQ 5CRYA 1I6AA 3LSLA 1F9BA 4C1TA 2H25A 3R7XA 2OJTA 4H5FA 3TTMA 4E0WA 3MVWA 2GHAA 3U8QA 5TP9B 3FUZA 3KSXA 3RY3A 3OO9A 2KLFA 1H43A 1P99A 1US5A 3U94A 2E0SA 2UYEA 2I58A 4POXA 3THIA 4U22A 1IQ7A 2HAVA 3TDJA 5TU0A 4OZ9A 3JYRA 4G4PA 4LVQA 3E9XA 1LCFA 3ILUB 3K01A 4XTCQ 3BBRA 1Y20A 3TUSA 2O84X 2F7BA 4NF8B 5ISUA 1FQDA 2P1SA 1H3DA 1PB7A 3M3KA 3N6UA 4G2ZA 2H9BA 3PUZE 1J1NA 3B6WA 1LAXA 4MLQA 2YJPA 4EXKA 3UIFA 4R9FA 4EQ7A 4X1DA 3EF7A 1LB8A 4HCYA 4JBZA 3SDFA 3IB1A 3PD8A 4EF2A 4U1ZA 2UVIA 2FA7A 1FTJA 3QUJA 3MPKA 3T9VA 4DCYA 1EZ9A 3K6UA 1MXZA 1B3HA 1P1QA 3S9NC 2X26A 1MXUA 4G77A 2NXOA 3E4RA 3Q29A 5DVFA 2ZMBA 3CFLA 2XHDA 5JTYA 2RC9A 4X1BA 4OEUA 5FHNA 2RF1A 4QRZA 1D9YA 1P1OA 3LC8A 3EHTA 1AL3A 1SD3A 5HBCA 4H65A 1QKAA 2A5TB 4MBPA 1LFGA 1NH8A 3B7DA 3VDFA 2DYXA 4M1VA 3IOVA 3K4UA 4DLDA 4GL0A 1LAFE 4QFOA 3KSJA 3CG1A 2DQVA 4LP2B 2PVUA 2H99A 2RINA 3USDA 5H8QB 4FATA 3H6WA 1NNPA 4N6PA 2F7CA 5H8SA 1LAGE 4JDFA 1O7TA 3Q25A 5LOMA 3EPEA 3I5OA 1ZLQA 3IB2A 4PETA 3D4CA 2FNCA 3MAMA 4DXUA 3FZVA 2VOZA 1NMUA 3UP9A 5CMCA 1YTVA 1QKBA 1B05A 3DP8A 3LSFB 3VE1B 1JETA 3E3KA 5M2VA 3VLUA 3O97A 2QMXA 1MPCA 5DEXB 3IJXB 2F34A 3T9XB 4ZE9A 4TLLB 1JNFA 2XXPA 1SYIA 1TT1A 1CE2A 1LAHE 1MH4A 3EHSA 3GBBA 2PYYA 3PU5A 3OEKA 3MC2A 1XHYA 4XKPA 1IXGA 4ZZEA 2ABHA 4NF5A 1BP5A 3M3LA 4XKRA 5IAIA 1SI0A 3G3IA 4AB5A 1DTZA 3FIRA 1B2HA 1MQJA 3H6VA 4R6YA 1PB9A 3VVDA 5CMMA 4QSEA 2NVUB 1IEJA 2DP8A 1IZ1A 4IB2A 3C34A 4RPOA 4KI0E 4YKIA 3SETA 4KD5A 1AH5A 4X48A 1OMPA 4R6HA 3HO7A 3U92A 2I3VA 5KCJA 4U23A 4R2BA 4QFNA 5I56A 3R6UA 2B65A 1ANFA 4THIA 1LFIA 4RYAA 5HM4B 1SW4A 2BJJX 4YKKA 2XD2A 5AA1A 1DTGA 5ELVA 1B40A 4LATA 4OMBA 3TQWA 1XT8A 2H5YA 2F36A 3KZGA 4EQ9A 4DDDA 5BUUA 2THIA 5JK4A 3OO8A 1JQFA 2DWJA 4YKJA 2XXYA 2DWHA 3Q28A 2F97A 1P1WA 3IAZA 1B3GA 2OWTA 3SKPA 3CFXA 3S9MC 3RUMA 1Y1ZA 3PMVA 5JEIA 5EHSA 4F2OA 2Q88A 2XXHA 4YU0A 3ZSFA 1MQIA 1Y3NA 2F5XA 1MPDA 1MM7A 3QUFA 4KYDA 2Y84A 4EF1A 1I6QA 1MG1A 4MH5A 1EU8A 5H8FA 4NF4A 1B7HA 3KGCA 3DP6A 4EDPA 3EHUA 1URSA 3OO7A 3Q27A 1B5JA 3FJGA 1OLCA 3OSQA 1UTBA 2I6EA 1NNFA 4OENA 3EQ1A 3IJOB 4ESWA 4OETA 1MY2A 4GXAA 4X9TA 3OELA 2G93A 4BLAA 3CG3A 4BDLA 1QJMA 1H45A 4XKQA 3VVEA 1ZBMA 3IO6A 1FQEA 3TCFA 1URDA 4KQPA 4RJZA 4F19A 2F6PA 4P11A 5TPAB 2QS1A 3M8UA 4OFJA 2IEEA 4BDRA 2ONKE 1Y3PA 1Y4CA 4ESXA 1TXFA 4GOTA 4IO5A 5ITOA 3TQLA 3CSGA 4EQBA 2ZYOA 3TEPA 2V93A 3PD9A 2AL4A 5TP9A 4IY6A 2XXWA 1UTHB 1DOTA 2B3BA 2F78A 4U2RA 2GRVA 2Y7KA 1A54A 4GF8A 3JZJA 3K2DA 4KYSA 3IR1A 4ONYA 4KYEA 5DVJA 2DWIA 4FECA 3L6GA 4EUOA 4C0RA 5H8HB 3S4UA 4ELOA 4ELRA 4WEPA 3ODBA 2HAUA 4OHNA 1FTLA 2H98A 2V84A 2Y7PA 4LONB 4R6KA 2ONRA 5CM6A 5FHOA 3OSRA 4NF8A 4R74A 5FTHA 5FTIA 4F1YA 3LSWA 1S7YA 3IOTA 1TFDA 1WVJA 2ONSA 3GZGA 5I58B 1ZIUA 2ZYKA 1P1UA 1MXWA 2ZNTA 2O1LA 4NF6B 5HPQA 1WDNA 4RY1A 2X7QA 3FVGA 4OWDA 1Y9UA 3PUVE 3B6QA 3V5AA 3RT6B 3FXUA 3RN8A 3TODA 4GQOA 3O29A 3K02A 2RCAA 2ANJA 2E1SA 3G7WA 2Y7RA 3FV2A 3MVZA 3N5LA 4Q8RA 1DSNA 3RQTA 3VV5A 3MW0A 4QSDA 4TOZA 1A99A 2XD3A 3I3VA 3MBPA 4LZ5A 2ESNA 2XX8A 2O68A 1QUKA 4RK9A 3U72A 3W15C 2OBGA 4ZEKA 3HSTA 2QS2A 4F22A 1MRPA 3L6HA 3K6VA 3O66A 4JB7A 4WXJA 1DPEA 2ZYMA 1B58A 1O63A 3MJNA 4MF3A 2DE3A 3MVXA 1FQBA 3PPNA 4I62A 2A5TA 3G3FA 2UYFA 4U1OA 1B7UA 1UIUA 4DXCA 3K0VA 3UGWA 1OQHA 2QS3A 3CFZA 1B0HA 3T93B 5J1DA 3RTWB 3IOWA 3RT8A 2QRYA 5H8QA 3MP6A 4EXLA 4ISUA 2X7PA 2XX7A 4PFUA 3TAJA 1MH3A 4ZEFA 1MXVA 4YMAA 2XXIA 2Q9TA 4NMYA 3GLBA 2V3UA 3VVFA 5AA2B 5FHMA 4ECFA 3T96B 4LQ5A 1QUIA 1B9JA 3HHGA 5K2XA 3MP1A 3S9LC 1SVXB 2ALUA 4BDNA 1XC1A 5L9MA 2DVZA 1ZJLA 4FIMA 1POY1 3T9UA 3TCGA 2B3FA 1N04A 5DEXA 1GGGA 1OQGA 3PPRA 3K1PA 1RYXA 1Q35A 3PUXE 4H1XA 3V83A 4UACA 2V3QA 1GV8A 3TFLA 3MZBA 3SERA 1MY0A 2DE2A 3MZ1A 1QW0A 3P7IA 3UA8A 2XXTA 2HZLA 4I9DA 3ONMA 3N6TA 4I8CA 3K6XA 4GFRA 1ZTYA 1USYE 1B1HA 5ICQA 4MLVA 4OEVA 2VP1A 3MUQA 4P0IA 1R9LA 1ZMGA 3W9WA 1RYOA 3PV0E 3LR1A 4C1UA 1MXYA 4NTLA 4Z7EA 1M5FA 1B3EA 4NEDA 3HV1A 4YZZA 4IGTA 4PFTA 4Q30B 4FEBA 1YAEA 3C4MA 3H6TA 2NWJA 1XVYA 3MVYA 1OVTA 2VD2A 1POTA 1N76A 4ZZAA 3V8XB 1LSTA 1HSJA 1M5CA 2W7YA 3RPWA 4JWOA 1JW4A 3VXBA 3FVKA 4QFPA 4F2QA 2Q8JA 4XKNA 2Y7IA 2OZZA 1QULA 2NUVA 3ZKLA 1VFDA 4ZEIA 4G8NA 4R9GA 5CMBA 4UA8A 2QJEA 2XXUA 4IO3A 3PGFA 1LB9A 5CI5A 3U93A 1B1XA 4BDOA 1SYHA 1VSOA 3IOUA 2I0BA 5CBRA 2RCBA 3SEVA 2UVHA 1A55A 1O64A 1N3XA 4IO2A 3DELB 4YKPA 1OVBA 3QXMA 3QSLA 4R73A 1MQHA 4RK2A 1HSLA 2PX1A 4AB6A 2OCUA 2QMWA 1BKAA 4RPNA 3SESA 1RKMA 3C31A 2O6AA 4QFLA 1H44A 1R9QA 5L9OA 1YPNA 3OMBA 3H7MA 1B3FA 1MQDA 2I3WA 4PFWA 2QL3A 5TPAA 1MDQA 2PMSA 1VFEA 1LBBA 1FCKA 3JV9A 4YB5A 4F18A 4GLIA 3G3HA 4XXUA 3H3GA 1EH3A 3A3CA 4KCDA 4GVOA 1UTHA 2Z8FA 4F3SA 1SW5A 1M5EA 2XXVA 1ELJA 3FVOA 3SEUA 1GVCA 1PC3A 3CSBA 5A5XB 1HSEA 3OXNA 5AA4B 5H8HA 1MY1A 1XS5A 1JW5A 3QYTA 1EZOA 5I2KB 2P0SA 1N84A 3HHFA 4U4SA 4H67A 3O6GA 3KG2A 3MQ9A 3RGYA 4G68C 1SBPA 3WAFA 5AA3A 1IUDA 4ELQA 2XXXA 2D21A 4NWDA 5I84A 4JWXA 1BTJA 5I2NB 4GD5A 5KDTB 1CB6A 2PT2A 4KFQA 3LUYA 2O51A 1M5BA 4F29A 3KFMA 3PUWE 1B5HA 5I58A 1GR2A 1SDXA 4NF6A 4KCCA 2UVGA 1I6BA 2UVJA 3HCQA 4K3FA 3VLVA 3U1OA 5H8NB 2VGQA 4G68B 3T66A 2REJA 1B46A 1IXHA 3HPIA 2LAOA 4ZE8A 4YMBA 3CR9A 2ZNSA 4QHQA 1XVXA 4OYVA 1R6ZA 1JEUA 2XXQA 2GHBA 1MY4A 4AQ4A 2Z22A 3AXFA 1XOCA 1Z7ME 1JVYA 3PPQA 1A7LA 3FD3A 1NNKA 1B51A 3D4GA 3OENA 5EHMA 1US4A 5AE4A 3OOAA 4JWYA 2F6GA 4RXLA 4HS7A 3ZKKA 1QVSA 2R71A 1MXXA 2O69A 1NH7A 1UIVA 1SW2A 2GH9A 1OIBA 4YICA 3M3FA 4IO4A 2QPQA 1JW1A 5CBSA 4O3CA 4DCXA 4H8JA 4QSCA 1B7ZA 3VXCA 2I49A 3QIMA 5DVIA 3MP8A 5B7DA 3IK6B 1IXCA 5CMKA 1DPPA 2Q2CA 3E13X 4OQOA 4JSOA 1MY3A 1B5IA 3ECRA 1H76A 5AA2A 3EN3A 4WKMA 4GXSB 3IX1A 3FATA 1SQYA 4DIGA 3T9HB 5I59B 1Y1MA 1FTKA 3K00A 1D4NA 1PBQA 4GRKA 2V25A 3ZS6A 2DVCA 1GTKA 5IKBA 2PT1A 1B0LA 4ZEBA 2O1MA 3LBSA 1MM6A 1S9TA 3F11A 4H8IA 3O28A 5DTBA 4YB7A 3PUYE 4ND9A 1QUJA 5I57B 3WAEA 2AYSA 1WODA 3TYHA 1A8EA 4IGRA 3SEXA 3MWBA 4BDQA 3RNNA 3VFJA 3FGSA 3DM0A 2OLBA 3LSXA 5L8DA 2OWSA 3C35A 4OXVA 3IL1B 3KJ7A 1N0TA 3A09A 3PPOA 3V89B 5B70A 2FYIA 2HFBA 3KOTA 5K2YA 4RA1A 1L5TA 2V3TA 4I1DA 2D3IA 3IORA 3VLWA 4PE5B 1FW0A 1Q1KA 1D3KA 1JVXA 2ZNUA 4JSDA 1BLFA 3BFUA 1BIYA 3CRBA 2HQ0A 5F7VA 1URGA 3UK4A 4KPTA 4ELPA 2VHAA 1B3LA 4FORA 3K1NA 2DS9A 3BFTA 4F3PA 5KZTA 2R9JA 3TTNA 4L17A 4O3BA 1II5A 5DT6A 2HCAA 3KEIA 1B6HA 3B6TA 1JEVA 2WKYA 2QSXA 2HEUA 4N13A 1OLAA 4FEDA 2YPNA 1PDAA 4F1UA 2OK2A 3SEYA 2UXAA 4M4GA 3Q26A 4KR5A 2REGA 4JXIA 1MPBA 1KWHA 1B32A 2ZYNA 3FJ7A 1SW1A 3FV1A 2P2AA 2ZXTA 2F7AA 4MFIA 4ZEDA 2DXRA 4PFYA 1EZPA 4LUBA 3S2VA 3H6UA 4LA9A 4OTEA 3UORA 2VD3A 3R26A 2HZKA 2Z23A 2A5SA 5CC2A 1TWYA 1PEBA 3SEWA 2RC8A 5L9SA 2R6GE 4O3AA 3RTFB 1AOVA 2O7IA 5JTYB 4H0WA 2H4IA 3DLNA 3TELA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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