2OCUA

Structure of the complex of c-terminal lobe of bovine lactoferrin with n-(4-hydroxyphenyl) acetamide at 2.38 a resolution
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Lactotransferrin
publication title Structure of the complex of C-terminal lobe of bovine lactoferrin with N-(4-hydroxyphenyl) acetamide at 2.38 A resolution
rcsb
molecule tags Metal binding protein
total genus 106
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2006-12-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ocuA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ocuA02
2B65A 1M5FA 2HCAA 4P11A 1Y20A 1MXZA 4F3GA 4YB6A 1LBBA 3U92A 2F8DA 3TQLA 5EHSA 3T66A 4U4SA 2QSXA 4DCYA 3G3KA 3K0VA 3TTRA 2QS3A 3KG2A 2Y7WA 3G7WA 3MUQA 5L8DA 4OFOA 4G77A 3PU5A 3OSQA 2QMXA 3H03A 2DP8A 1B3FA 3RQTA 4L17A 1B40A 1B52A 1BKAA 2YJPA 3SEUA 3KOSA 1B3EA 4RPOA 4XKQA 1F9BA 4NF6A 3KJ7A 4EF1A 3KEIA 4LP2B 2Q2CA 4OMBA 2QL3A 1SW4A 3K01A 1FW0A 3KSXA 2PT1A 4OEVA 4F2QA 4ZEKA 4LZ7A 2ONKE 3KOTA 4F1VA 1UTHA 4GIZA 1AMFA 3EN3A 1EH3A 2UYFA 3V83A 1Y3PA 2F36A 1J1NA 3D4CA 1A8FA 3C33A 3PPNA 2ONRA 4OHNA 1XVXA 1H44A 3H6VA 3OENA 1JW4A 3O28A 4G8NA 2XXIA 4KR5A 1B9JA 2X7PA 1MQGA 2HFBA 1FTJA 2XXQA 1P99A 2F5XA 3FZVA 1MXYA 4XTCQ 1LAHE 3KN8A 1ZLQA 2V25A 4PFTA 3MZBA 3MP1A 4U1OA 4C0RA 1FQBA 4FAJA 2D21A 3PPPA 2XXPA 4UA8A 1ZKBA 1MY2A 4YKJA 2NWJA 3D4GA 3TTLA 3R26A 1AH5A 4PETA 1B2HA 1GR2A 4U23A 2VOZA 3PMWA 3PMXA 5HM4B 4EXLA 3PV0E 3UP9A 1TT1A 4IGRA 3SESA 4X1DA 2Z22A 1MY4A 3LBSA 3OO8A 3KN7A 1SQYA 3W9VA 1LSTA 1JQFA 4F19A 1D3KA 5JTYA 2NOOA 4WEDA 4AB5A 3O29A 1PB7A 2F97A 5H8FA 4IO5A 4HTGA 4HS7A 2DQVA 2R71A 3IOWA 4I1DA 1N0TA 1M5BA 3F11A 1B6HA 2ALUA 1BP5A 3LSXA 2RC7A 1H76A 3PUYE 3B6QA 2H99A 3IB0A 5I58A 1GGGA 4QSEA 3MVXA 1IXGA 4LA9A 3G3IA 3HSTA 3O66A 1QUJA 3FVNA 1IQ7A 1HSLA 2PX1A 2UVHA 4EXKA 3K1MA 3LSLA 3RY3A 2YLNA 1QVSA 1EU8A 2ABHA 3ONMA 4OFJA 1US4A 3SETA 3O9PA 4DE8A 4XIGQ 1ELJA 2I0BA 4IO7A 3OO6A 4POWA 2Q88A 3VXBA 4R73A 4Z0IA 4QFOA 1MQDA 3O6HA 2QRYA 4F22A 1UQWA 1MQIA 1SYIA 4GF8A 1R9LA 1B3LA 3HHFA 2Q2AA 1RYXA 2THIA 4X48A 2XHDA 4POXA 4KPTA 3HN0A 3DM0A 5JTYB 1I6QA 1LFIA 4IO3A 5EHMA 1SYHA 2F6GA 4RK2A 4ESXA 2ZNTA 1LFHA 3C4MA 4RYAA 2ZYKA 5H8SA 3ODBA 2BJJX 5L9OA 3IK6B 2GRVA 4RXLA 2XXHA 3H6UA 4EQ9A 3Q29A 3TTMA 2XX9A 5TP9A 1GTKA 2DWHA 4GQOA 3SEWA 4BDRA 1XOCA 1DOTA 2HQ0A 5KCJA 1MXUA 5B70A 4IY6A 1A40A 3U72A 2NUVA 4F3PA 2H4IA 3VFJA 3PMVA 3OO7A 4ELOA 1MXWA 5CMMA 2UYEA 2XD3A 1R6ZA 2ZYMA 3TQWA 3V8XB 4MLVA 3FVOA 3VDFA 2I48A 2I6EA 3FXQA 4NTLA 1IUDA 4JWOA 2P2AA 5BWJA 3PD8A 3QUFA 1JVYA 1O7TA 3CFLA 4NE4A 3S9NC 4FJPA 3OOAA 1D4NA 1AOVA 5FHNA 3OO9A 1B5IA 3BFTA 1NKXA 5HBCA 2I3WA 3Q25A 4GVOA 4GFRA 5CMCA 4OQOA 5KCJB 4F3SA 4F1UA 2XX8A 4PP0A 2X26A 2V3TA 4NWDA 4BDNA 2GH9A 3K02A 2F7AA 4OETA 4FATA 1Y4CA 4JWYA 2I3VA 4XXUA 1B3HA 4WEPA 2D3IA 4I9DA 1UIVA 2DVCA 1VE4A 3O6IA 3VLWA 1FQAA 2LAOA 1MG1A 3VVFA 4TLMB 2XXRA 1B4ZA 3H6WA 2REJA 4R2BA 3KFMA 5AA2D 1US5A 3OEMA 4H65A 5I2KB 3S4UA 4DDDA 2E1SA 1MH4A 3SEYA 3KSJA 1IXHA 1LFGA 3VE1B 5DEXA 2AYSA 4ISUA 3A3UA 3DP8A 4N13A 3ILUB 1B7ZA 1Y3NA 4MFIA 2UVJA 3G3JA 3BBRA 4KYEA 1QKBA 3RT6B 1XC1A 3VVEA 3LR1A 2OZZA 1CE2A 2D5WA 3W15C 1YPNA 3CI8A 2FNCA 3B6TA 3O6GA 3EQ1A 3K6XA 4U2RA 3U8QA 2F7BA 1USYE 2DE3A 4G4PA 2RC9A 1AL3A 3JZJA 3ZKKA 4QSCA 1PB8A 1R1NA 1XS5A 4GXAA 2XXYA 4GXSB 2Z8EA 5DVIA 1LLSA 2XXTA 3LSFB 4OTEA 1URDA 1OVTA 1A54A 1JETA 2DE2A 3C34A 4ELRA 1OIBA 2XXWA 4IO4A 5AE4A 4GLIA 4OXVA 3WAFA 3TDJA 1ZMGA 1MQJA 5TPAB 3TEPA 5DEXB 3UGWA 1LAGE 1P1OA 3PPRA 2O7UA 2V3UA 1IZ1A 2AIXA 4GL0A 1A99A 2VD2A 1NH7A 1Y1ZA 3M3KA 3GBAA 1JW1A 3FXUA 3E13X 4Q0CA 4ND9A 2WKYA 1NFTA 3CIJA 3N6UA 1S50A 1Z7ME 3GZGA 1NL5A 1PDAA 2Z8FA 3M8UA 4EUOA 4N6PA 1Y9UA 3SDFA 1B51A 4OERA 4K3FA 3QAXA 1SW5A 4LQ5A 3R7XA 4OYVA 4ONYA 3IB2A 2G29A 3K6VA 2R6GE 1VR5A 4RJZA 3FUZA 4LZ5A 3E9XA 1H45A 1Y4TA 3A09A 4E0XA 3OEKA 1PB9A 3RPWA 4PE5B 3MVWA 3FV2A 1SBPA 3IAZA 1LAXA 4C1TA 3CSGA 4ELQA 4R9FA 4BDOA 4TLLB 4YKIA 2UVIA 4UACA 5K2YA 4PFUA 2QS4A 4R72A 3Q26A 5M2VA 3RGYA 1DMBA 4EDPA 3VVDA 1DTGA 4LUBA 4AB6A 2Y7KA 3TELA 4U21A 1UIUA 3VV5A 2B3BA 1B1HA 2XXUA 3DP6A 3KGCA 2Y7PA 1DSNA 1MPBA 3ZSFA 1A7LA 3N6TA 4OENA 1ATGA 1NNFA 2H98A 2ZNSA 5JEIA 5L9MA 5H8NB 3TMGA 5B7DA 3H4ZA 4YICA 4H8IA 4WKMA 3TTKA 3TCFA 1B46A 3OD7A 4AQ4A 3TPAA 2DYXA 4JSDA 3T9HB 1PBPA 5BUUA 3M3FA 2OJTA 4RA1A 1LBCA 4JXIA 5I84A 2RCAA 5I59A 3THIA 2DS9A 3E4RA 2AL5A 4YAHX 1B58A 1P1WA 4DLDA 3EHSA 4PQJA 3FXRA 4PFYA 2F35A 3SEXA 1CB6A 1MM7A 4C1UA 3FJ7A 1JEVA 2CZLA 4QFLA 3I3VA 1BTJA 4ESWA 3FGSA 3DELB 1OQHA 3TTNA 4QFKA 4BDLA 2HAUA 4JBZA 4IB2A 1H43A 5FTHA 4F18A 3B7DA 5HPQA 5ITPA 1T0KA 5ICTA 4OWDA 3W9WA 4BDQA 2Y84A 3VLUA 3FVGA 2RC8A 5F1QA 1D9VA 4R74A 4YKPA 1Q1KA 1B7HA 2I4CA 4X9TA 1DPEA 1N84A 3MPLA 2VD3A 4QRZA 1ZTYA 3HHGA 4R6HA 3TKDA 3MC2A 2F7CA 1DTZA 4OZ9A 2DWIA 4DIGA 1VFEA 3K6UA 4ELPA 4P0IA 3C35A 3TFLA 1O63A 1ZJLA 1WVJA 4U22A 3PPQA 4F39A 4GOTA 5I59B 4QHQA 1OLCA 5H8HA 1SW1A 4YZZA 1I6AA 4ZE9A 1MY0A 2DXYA 2ESNA 2QS1A 3ILTB 2OBGA 4KFQA 4X1BA 4RK9A 1JW5A 4OVJA 3PUZE 5A5XA 4JDFA 5FHMA 3T22A 2I4BA 1NMUA 2O68A 1TFAA 1ZIUA 1NNKA 3HPIA 2ZYOA 2ANJA 4NF8B 1TWYA 3RT8A 3RNNA 3IOUA 3MVYA 4G68C 4LQ2A 4DXCA 2RKMA 3MWBA 4MBPA 2HEUA 1MM6A 3Q27A 4KD5A 4FEBA 4ZZEA 4FORA 4OEUA 3FVKA 2O84X 2ZYNA 5I2KA 2HAVA 3N5LA 1ZBMA 2R9JA 4DXUA 1XHYA 1B1XA 1PEBA 2E0SA 1MY1A 3RTFB 2DOJA 3S9LC 4IO2A 2DXRA 5I56B 3U1OA 4LONB 4G8HA 4G68B 3RTWB 2W7YA 1QKAA 2O1LA 3Q28A 1HSJA 2I0CA 3G3FA 5H8HB 1S7YA 4GRKA 4PFWA 1URGA 2RINA 1URSA 4QF9A 3FV1A 2OLBA 2PT2A 3OELA 3MP6A 2REGA 1QULA 4YKKA 3MPKA 5A5XB 4MH5A 2DVZA 4OESA 1MDP1 1RYOA 4ECFA 1FQDA 3BFUA 2XX7A 4H5FA 4FECA 1IIWA 3CG1A 1JVXA 5H8QA 1A8EA 3MW0A 4F31B 5ELVA 3TODA 4YU0A 1USYH 4I62A 3GBBA 4MLQA 5FHOA 4U4XA 2F78A 4H67A 4Q8RA 1Y3QA 1RKMA 1I69A 1N3XA 3CVGA 1IEJA 3BKIB 4R2FA 2PYYA 3CFXA 3SKPA 3M3LA 5TPAA 2DWAA 3USDA 2QS2A 3FJGA 1ZU0A 3T96B 3K00A 1O64A 5ISUA 3DLNA 4IGTA 4NF5B 1LAFE 1YTVA 4WXJA 5AA2A 2UXAA 4NF4B 3EHUA 4H0WA 4R6KA 1IITA 4M4GA 5CBRA 3K4UA 5AA4B 3IO6A 2H5YA 2HZLA 4HW8A 3IR1A 1N7WA 1NNPA 5I2NA 3OXNA 1LB9A 5K2XA 5AA3A 3I6VA 4DXBA 2F6PA 1BIYA 5H8QB 1UTBB 3EPEA 2V3QA 2QJEA 4HCWA 2O6AA 3P7IA 3TZAA 4QFPA 1A55A 4U1ZA 4M1VA 2G93A 2X7QA 5DYHA 2O1MA 3V89B 4HCYA 4P0GA 3RN8A 1NH8A 1EZ9A 3HCQA 4QSDA 5F7VA 3S9MC 4E0WA 2IA4A 1B5JA 3KBRA 1TXFA 4Q30B 3FASA 1FQEA 1POTA 3KN3A 1I6BA 2HXWA 3HV1A 3VXCA 4Z7EA 1Y1MA 5AA2B 2NXOA 3RLFE 2I58A 3C36A 1KWHA 3FATA 3WAEA 3FD3A 2KLFA 3HO7A 3MZ9A 4ZS9A 1YCJA 2GHAA 2XD2A 1B3GA 2GHBA 1P1NA 1N76A 4IY5A 5H8NA 3H6TA 4KCCA 4KYDA 1FQFA 4XKRA 5CMBA 5KZTA 1Z7NE 3JV9A 3OSRA 1N3WA 1IXIA 1XVYA 3S2VA 5DTBA 5I2NB 3OMBA 4H8JA 1QW0A 4ZEIA 2Y7RA 2DSFA 4H6DA 3O97A 5CM6A 2VP1A 4THIA 4BDMA 4ZECA 2P1SA 1VSOA 2ZXTA 3KJTA 3ZKLA 1II5A 4KYSA 4ZEFA 3IJXB 4R9GA 4RY1A 1B5HA 2O69A 5LOMA 3U93A 2GFEA 1PBQA 3H7MA 1M5DA 1VFDA 1MH3A 2PBWA 4NF6B 4F29A 4O3AA 5IKBA 3MVZA 3K1PA 2OK2A 2A5TA 5ITOA 3TCGA 3H06B 1LCFA 2ZMBA 2OCUA 3IORA 3MAMA 2PVUA 3JYRA 1UTHB 3UK4A 1BLFA 5JK4A 3EF7A 3O2AA 1FQCA 2RCBA 3MJNA 3G3HA 5CRYA 4MF3A 2H9BA 4IO6A 3C32A 5IAIA 1JNFA 1B05A 5DVJA 4R6YA 3TYHA 4GD5A 4F1YA 4ZEDA 4LATA 4R75A 3IO4A 3CFZA 3H3GA 1LCTA 4NWCA 4YB5A 3DP4A 3QXMA 3IOTA 4ZE8A 2V84A 3B6WA 5I57A 1SW2A 1HSEA 5CC2A 1OVBA 1SDXA 2F34A 5AA1A 2QMWA 2Q8JA 3K1NA 2M8CA 4ZDMA 1MRPA 3S9EA 1Q35A 3UN6A 4NEDA 1B0HA 3TCHA 3LSWA 1P1UA 3IJOB 4FIMA 1OMPA 3VLVA 4QFNA 3EHTA 2ONSA 1DPPA 5EYFA 2DE4A 5DT6A 3LC8A 4NF8A 3T9VA 2A5SA 3N94A 2Z8DA 1GV8A 3V5AA 4LZ8A 3PPOA 2A5TB 2OWTA 5L9SA 2PMSA 4YMAA 3E3KA 3MBPA 5ICQA 4FEDA 4I8CA 1M5CA 3IOVA 1JEUA 3FJMA 2V93A 4OFLA 3K6WA 4KI0E 1MXVA 3A3CA 3PD9A 3PGFA 2AL4A 2B3FA 5I56A 5CI5A 3I5OA 3SEVA 1YAEA 4G68A 3QYTA 3GXAA 4TQUQ 3TAJA 4F2OA 5H8FB 1B32A 1P1QA 4KCDA 5I57B 5CBSA 4G2ZA 4GWOA 2XXVA 4Q5TA 2OWSA 1N04A 5J1DA 3ZS6A 2VGQA 1WDNA 2YPNA 1SI1A 1D9YA 3CSBA 5I58B 1MY3A 5DVFA 2NVUB 1R9QA 2H25A 1MDQA 4JWXA 3C31A 1FTLA 4XKNA 3L6GA 1FTKA 2P0SA 4NMYA 2VHAA 3G3GA 3MP8A 1MXXA 4EF2A 4BLAA 3MQ9A 3T9XB 1ANFA 3TUSA 4RPNA 1OQGA 3T93B 3GLBA 2Q9TA 3QIMA 1SD3A 1H3DA 4ZEBA 4O3CA 4YMBA 3PUVE 2Y7IA 4YB7A 1FTMA 4GL8A 1OLAA 1EZPA 1N7XA 5KDTA 3T9UA 3ECRA 1SVXB 3U94A 2ZNUA 1B7UA 4H5GA 1QUKA 2I49A 2IEEA 3QK6A 3FIRA 3CR9A 4XKPA 5FTIA 3QSLA 2QPQA 4NF5A 4TOZA 3UIFA 3R6UA 1FTOA 2XXXA 3PUXE 4ZZAA 1LGBC 2UVGA 1LB8A 4FE8A 1WODA 4NF4A 1TFDA 3RUMA 1FCKA 1MS7A 3QUJA 4LVQA 4EQ7A 4JSOA 5AA4A 4KQPA 3L6HA 5TP9B 4DCXA 1M5EA 3K2DA 4DZ1A 1PC3A 3CRBA 3CG3A 2DWJA 3IX1A 2Q89A 3N26A 4JB7A 3C9HA 3MZ1A 1UTBA 2RF1A 4N07A 1IXCA 3UORA 4RNSA 1MQHA 1QUIA 1SI0A 2O51A 3IL1B 4KHZE 1EZOA 1NNTA 3PUWE 1XT8A 4G8MA 4F3BA 3AXFA 3IB1A 1MPDA 2Z23A 1B4HA 5KDTB 1QJMA 4H1XA 2FA7A 4O3BA 5CMKA 3SERA 3UA8A 3KZGA 2HZKA 1POY1 1B0LA 1S9TA 5TU0A 1MPCA 2FYIA 1GVCA 2O7IA 2CMOA 1L5TA 4EQBA 3LUYA 1AIVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2VPOA 2B65A 5A5LA 5T3JA 1M5FA 2HCAA 4P11A 1Y20A 1MXZA 4F3GA 4YB6A 4XFEA 1LBBA 3U92A 2F8DA 2CEYA 3TQLA 5EHSA 3T66A 4U4SA 2QSXA 4P1LA 4DCYA 3G3KA 3K0VA 3TTRA 2QS3A 3KG2A 2Y7WA 3G7WA 3MUQA 5L8DA 4OFOA 4G77A 3E79A 2GQ1A 3PU5A 3OSQA 2QMXA 4I40A 5ET5A 3H03A 1RDYA 2DP8A 1NV1A 1B3FA 3RQTA 4L17A 1B40A 2OX3A 1B52A 1BKAA 2YJPA 3SEUA 3KOSA 1B3EA 4RPOA 3LUZA 4XKQA 1F9BA 4NF6A 3KJ7A 4EF1A 3KEIA 4LP2B 1NV5A 2Q2CA 4OMBA 2QL3A 1SW4A 3K01A 1FW0A 3KSXA 2PT1A 4G61A 4OEVA 4ZEKA 4F2QA 4LZ7A 2ONKE 3KOTA 4F1VA 1UTHA 2FIEA 4GIZA 1AMFA 3EN3A 1EH3A 2UYFA 3V83A 1Y3PA 4JVDA 5IZ3B 2F36A 1J1NA 3D4CA 1A8FA 2QFLA 3C33A 4H46A 3PPNA 2ONRA 4OHNA 1XVXA 2WX9A 5ESYA 1H44A 3H6VA 3OENA 2P3NA 1JW4A 3O28A 4G8NA 4N8YA 1LBXA 1DK4A 2XXIA 4KR5A 1B9JA 2X7PA 1MQGA 1RDXA 1FSAA 2HFBA 1FTJA 2XXQA 1P99A 2WEFA 2F5XA 3FZVA 1MXYA 4XTCQ 1LAHE 1NV0A 1FTAA 3KN8A 1ZLQA 2V25A 4PFTA 3MZBA 3MP1A 4U1OA 4C0RA 1FQBA 4FAJA 2D21A 3PPPA 2XXPA 4UA8A 1ZKBA 1MY2A 4YKJA 2NWJA 3D4GA 3TTLA 4GX6A 3R26A 1AH5A 4PETA 1B2HA 1GR2A 4U23A 2ZZVA 2VOZA 4PC9A 2PCRA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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