2OCUA

Structure of the complex of c-terminal lobe of bovine lactoferrin with n-(4-hydroxyphenyl) acetamide at 2.38 a resolution
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structure of the complex of C-terminal lobe of bovine lactoferrin with N-(4-hydroxyphenyl) acetamide at 2.38 A resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
molecule tags Metal binding protein
total genus 106
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2006-12-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ocuA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ocuA02
5BWJA 1AIVA 1J1NA 1N0TA 3OOAA 1BTJA 5L9MA 3OO8A 1Y3QA 3VVEA 3V83A 2OK2A 1QW0A 1GTKA 3MZBA 4ZDMA 4ELQA 3IL1B 5DYHA 4ZE9A 5L9SA 1UTHB 3IO6A 3VV5A 3SDFA 3CSGA 3S9EA 3PPOA 4OYVA 1RYOA 3USDA 3GXAA 2I58A 1YTVA 4JWXA 5DT6A 3RT6B 4PFTA 3Q27A 2F97A 1Y9UA 2YPNA 4YAHX 3FVOA 4ZZEA 3TCGA 2F6GA 1NFTA 4X48A 2X7PA 2E0SA 4OZ9A 3SEUA 1QUKA 4BDNA 3LSLA 2I3WA 4TLMB 1B5IA 2XD2A 3M3LA 1MS7A 1MQDA 2Q8JA 4M1VA 3FATA 3W9VA 1URSA 4OFJA 4JSDA 4G8NA 2QMWA 4PQJA 1NH7A 3VXBA 2PX1A 3K6XA 1FTKA 4ZE8A 3GBAA 4EUOA 1MXWA 1P1QA 1A99A 5A5XB 2IA4A 2OWSA 3VLVA 1KWHA 1O64A 3FVGA 3Q25A 3QSLA 2CZLA 2RF1A 3A3UA 4ESXA 1TT1A 1T0KA 3QXMA 1MY3A 4LQ2A 4QSCA 4F3SA 3IAZA 1XT8A 4FJPA 1BLFA 2ZNUA 3RT8A 3TEPA 1ZIUA 3C4MA 3ILUB 4ZZAA 4LVQA 5L9OA 1Y4CA 2UYFA 2GFEA 4THIA 4RPNA 1MXXA 4HCYA 1B1XA 1IUDA 1IEJA 2XXHA 3IOUA 3QIMA 1ZU0A 3VLUA 4YB6A 5K2XA 2ONRA 3TPAA 3HN0A 3QK6A 2FA7A 4PFYA 1IXCA 1ZMGA 1LBCA 3PD8A 3R26A 3S2VA 4N6PA 1UTHA 1SW2A 5CBSA 4R6YA 1MPDA 3I6VA 4R2BA 1B1HA 1ANFA 3KEIA 4C1TA 3CSBA 1PB9A 1WDNA 1MH3A 1PBQA 3OO6A 3O66A 1ZJLA 4I8CA 3JZJA 1EU8A 2V3UA 4YMAA 4AQ4A 5H8SA 4OTEA 4MLQA 4I62A 1O7TA 2X7QA 1I69A 2O68A 2REJA 1SI0A 5AA2D 1B7ZA 3E9XA 4YZZA 2WKYA 4MH5A 3PUVE 1SDXA 2QPQA 2AIXA 5I2KA 3O6HA 4XKPA 4NTLA 3KZGA 2LAOA 3OEKA 1B0HA 4Q30B 2R9JA 3CFLA 3T96B 1EZPA 1R9QA 4MLVA 4POWA 1JW4A 1S9TA 2THIA 2R6GE 5AA1A 4ZEFA 2I0CA 3S4UA 5A5XA 4R72A 1H44A 4Q5TA 4EXLA 4H65A 5AA2B 3DM0A 4OFOA 5IKBA 4RJZA 4IB2A 5FHMA 1MM6A 3IOWA 1L5TA 3FVNA 3QUFA 3T66A 3OO9A 3K02A 4OESA 3FASA 5TU0A 3UGWA 3KN7A 3CIJA 3MUQA 1N84A 4HS7A 1B3FA 3FJ7A 2H99A 4WKMA 1MY4A 2OWTA 5HBCA 4DE8A 5I58A 1QKBA 3OEMA 2ABHA 3ZSFA 3C31A 4U4XA 2O51A 4XIGQ 1SW5A 1DPPA 1Z7ME 2F34A 5TPAB 5AE4A 3SESA 1LGBC 4F29A 3CRBA 2F7BA 5TP9B 2NXOA 4ELOA 3RGYA 3OMBA 4KQPA 3L6GA 2G29A 2ZYOA 3KSJA 3S9LC 4NF4B 1R1NA 4R73A 3MP8A 3UIFA 3V5AA 1MDP1 3IORA 2DE4A 5I2NB 3FV1A 4QSDA 2E1SA 4ZEIA 2HQ0A 3PPRA 2XXWA 3TYHA 2GHAA 2VP1A 4IO6A 2A5TB 1B5JA 1P1UA 4PFUA 1IITA 1OQHA 3THIA 3R7XA 4NWDA 4H5FA 2Q2CA 4YMBA 3TTLA 1P99A 4DXCA 1DMBA 4OENA 4JSOA 4ZS9A 3KSXA 2UXAA 1DTZA 3DELB 4DLDA 5EHMA 3R6UA 2PVUA 1B4ZA 5HPQA 2KLFA 1N3WA 5DTBA 4F19A 2HAUA 3PGFA 4FEDA 1VE4A 4GXAA 3EHTA 3MBPA 4KCCA 3FV2A 3KBRA 3KN8A 1Y20A 4BDLA 4KYEA 4IO4A 1QVSA 3BKIB 5AA2A 3MVYA 3FIRA 3MPKA 3C35A 5H8NB 5CBRA 3HHFA 3MQ9A 4KR5A 2ZXTA 3MW0A 1R9LA 5I57A 3OSRA 4O3CA 1ATGA 4G4PA 4U21A 3RN8A 3I3VA 1SW1A 2I0BA 4X1BA 5I59B 4YKJA 4G77A 4F3BA 1BKAA 1ZBMA 1SQYA 1POTA 2XXIA 4GRKA 2YJPA 4C0RA 3TAJA 1P1NA 3KJTA 5TPAA 2AL5A 2I48A 3KG2A 2H25A 2DWJA 1A7LA 5TP9A 3FJMA 3PMXA 1M5EA 1MRPA 2Z23A 1DOTA 1SYIA 2H9BA 2ZNSA 2H5YA 3K1MA 1D4NA 3DP6A 1N7WA 4NF4A 2XXQA 1YAEA 3HSTA 3H3GA 3C32A 2NOOA 5ELVA 5I2NA 1N76A 3T93B 4DXUA 4NF8B 2REGA 1TXFA 3M3KA 2V3QA 3B6WA 3MP6A 1B52A 3LSFB 2ONSA 4NWCA 2O7IA 2RC9A 4F1YA 3U8QA 2XXXA 2QS3A 1IQ7A 3TODA 1OMPA 4NMYA 2HEUA 3GLBA 1NNKA 3PUYE 1Y3NA 4DCYA 3F11A 4N07A 1N3XA 3T22A 1JQFA 3HV1A 2OBGA 3O97A 4BLAA 1FW0A 1SD3A 3PMWA 3TQWA 2BJJX 1NNFA 4R6KA 5DVFA 2O84X 4C1UA 4G8MA 4YB5A 1OLAA 3OELA 3H7MA 1TFAA 1XOCA 3ZKLA 1A40A 1N04A 4K3FA 4OQOA 3T9HB 3A09A 5H8QB 1ZLQA 5I56B 4RK9A 1YCJA 2HZLA 3FVKA 5AA4A 5HM4B 3CI8A 3FGSA 5B7DA 5H8NA 3RLFE 4KYSA 1US5A 5JTYB 2O69A 1JVYA 4H0WA 2D5WA 3W9WA 2OZZA 3Q26A 4G8HA 3FD3A 4E0WA 2VOZA 4GQOA 2VD3A 5KZTA 1DTGA 2G93A 1H3DA 3U1OA 5I59A 4PFWA 2XHDA 3M3FA 4LUBA 4Q8RA 4U2RA 4KCDA 1H45A 3TTKA 3TUSA 2Y7PA 1MQIA 3BFTA 2DWHA 1P1WA 4QFPA 3IB0A 4LZ7A 1D3KA 1QJMA 4PP0A 5FTIA 4F1UA 1LCFA 3M8UA 2HFBA 3W15C 3IJOB 4OWDA 1BIYA 4QRZA 4FATA 4ZECA 4RY1A 1HSEA 2NUVA 4G68C 2DYXA 1EZ9A 3N5LA 3PPNA 2XX9A 2UVHA 2ZNTA 5FHNA 1SI1A 4MFIA 3EN3A 2ONKE 4P11A 3RY3A 3IB2A 4U23A 1VR5A 2M8CA 1UIUA 4NEDA 1B46A 3H4ZA 3U72A 3IR1A 3ZS6A 4GOTA 1DPEA 4OERA 3U93A 3OENA 1TFDA 5B70A 1LAXA 1M5BA 3T9VA 4R6HA 3CVGA 2F35A 3K6VA 1FQDA 3I5OA 1Z7NE 1UTBB 3T9XB 3GZGA 1FTMA 3FJGA 3QAXA 1MXZA 3H6UA 1JEVA 1FTLA 1NL5A 1WVJA 2UVGA 4QFNA 2F36A 3G3JA 1VSOA 3KOSA 5CMMA 5CI5A 2GRVA 4R74A 1JNFA 2Q88A 4QF9A 2XXPA 4EQ9A 1FQAA 2O7UA 4AB5A 1OVBA 2AL4A 5JTYA 1IXIA 3RTWB 1UIVA 4ISUA 1SVXB 4LZ5A 1XHYA 1LLSA 2Y7WA 1NH8A 4M4GA 3EF7A 1GR2A 3KN3A 1IXGA 1IXHA 3RUMA 4FECA 5ICQA 1FQEA 1PEBA 4YB7A 3SEXA 5ISUA 4F18A 3PUXE 5KCJB 2DQVA 3IK6B 4DXBA 5J1DA 2FYIA 4H6DA 4UA8A 1B3HA 4IGTA 2ZYNA 1I6AA 3H06B 1B6HA 4NF5B 4H1XA 4KHZE 2PT1A 2Z8EA 4XXUA 1JEUA 1Y1MA 4WEPA 3UK4A 4YU0A 4LONB 3OO7A 4U4SA 2QJEA 3N6TA 3PUZE 3FZVA 4ND9A 5K2YA 3H03A 3CFXA 4R9FA 3SEVA 4RNSA 4RXLA 1M5DA 3HO7A 4NF6B 5DVJA 1EH3A 4GWOA 3B6TA 4FEBA 4LATA 5EHSA 1XC1A 2P0SA 3HCQA 3UP9A 2F8DA 5DEXB 2O1MA 1MXUA 1R6ZA 3PPPA 3O6GA 1HSLA 4DIGA 2W7YA 1MM7A 1XVYA 3ODBA 2F5XA 5JK4A 4BDQA 4IO7A 4EF2A 3BBRA 1LAFE 5H8HB 1JETA 4ELRA 1S50A 2B3FA 3MJNA 3FXQA 2V3TA 3LUYA 3PD9A 3K1PA 4HCWA 5JEIA 4P0IA 2Y7KA 3C34A 1GGGA 5F7VA 2ZMBA 3S9NC 3H6TA 3K2DA 5CMKA 3DP8A 4QFKA 4IO3A 2XXYA 3HHGA 1B5HA 3C36A 4YKPA 1B3LA 3PPQA 1IIWA 3VDFA 2PBWA 5F1QA 3SEYA 1B9JA 3SERA 3G3KA 3IOVA 5L8DA 3WAFA 3TKDA 3KFMA 1D9YA 2D3IA 1P1OA 4H8IA 1H76A 3U94A 2Y7RA 4GD5A 3P7IA 3VVFA 3TMGA 2Q9TA 2F7CA 2I6EA 5CMBA 2DSFA 1B40A 4DDDA 3G7WA 1OVTA 4Q0CA 2B65A 1AMFA 3PV0E 2XXRA 4I1DA 2R71A 1MY1A 4IO2A 4OHNA 1B4HA 4ONYA 1H43A 4GIZA 4KI0E 3FXRA 3OD7A 2O1LA 1VFDA 4JBZA 3O6IA 1LBBA 3OXNA 1MQJA 4GXSB 2ZYKA 1NKXA 1QKAA 3MAMA 3TELA 4LQ5A 3G3GA 2GHBA 3K1NA 5DEXA 2DVZA 2DP8A 3TTMA 4AB6A 4GFRA 3PMVA 4YICA 2DE3A 5IAIA 1FTOA 2F6PA 1A8FA 2RC8A 3VE1B 4GF8A 2DWIA 3SETA 4LZ8A 2QS2A 4EXKA 2Z8DA 5AA3A 2A5TA 2Q2AA 4G2ZA 5H8HA 1MY2A 4ECFA 2HZKA 3K6UA 2DXYA 3H6VA 1B7UA 3CR9A 4QHQA 2HAVA 3WAEA 2IEEA 3VXCA 1PDAA 4PETA 1CE2A 3DLNA 4KYDA 1LAGE 1MPBA 4OETA 3TFLA 4OEVA 3QUJA 4ZEDA 2I3VA 4O3AA 3UN6A 1URGA 5CRYA 3SKPA 1MG1A 4U1ZA 3IJXB 4U1OA 1LB9A 4WXJA 1XVXA 2DVCA 4YKIA 2OCUA 1FQBA 4H67A 4I9DA 1USYH 1B32A 4F22A 1GV8A 3LSXA 3MZ9A 4L17A 3LSWA 1VFEA 3B7DA 2DWAA 5ITPA 2DXRA 2A5SA 1EZOA 2F78A 2I49A 5BUUA 5I2KB 4LP2B 2XXUA 3C33A 3IO4A 3K01A 3B6QA 1B58A 2H4IA 4EDPA 4F2OA 1RYXA 4F39A 3U92A 3D4GA 2NWJA 4G68B 3H6WA 3KJ7A 3RQTA 1FQFA 3EQ1A 1LFHA 4KFQA 4R9GA 1FCKA 3N94A 3EHUA 2P1SA 4EF1A 3TDJA 1B05A 2ALUA 3Q28A 3CG3A 5LOMA 1I6BA 3G3IA 1LFGA 4NF8A 4MF3A 1CB6A 1JW5A 3FXUA 3MZ1A 5I84A 1USYE 1QUJA 3S9MC 3ECRA 2CMOA 5I58B 5CM6A 2XX7A 3O2AA 4FE8A 3DP4A 3RTFB 1WODA 1MQHA 2XXVA 1MDQA 3N6UA 2UYEA 3QYTA 4E0XA 1MQGA 3MC2A 4DZ1A 4GL8A 1TWYA 4RYAA 3ONMA 4RA1A 4XTCQ 3ILTB 4X9TA 1OQGA 1Q1KA 1I6QA 2Y7IA 1B3GA 3LR1A 4IGRA 1S7YA 1N7XA 2RCAA 5H8QA 4OEUA 3EPEA 2P2AA 5I56A 2QS4A 2DOJA 3CG1A 3KGCA 3O9PA 3O29A 2PT2A 2QS1A 2QSXA 2O6AA 1SBPA 3JYRA 4R2FA 5H8FB 4ELPA 2UVJA 2GH9A 1HSJA 4JWYA 4OVJA 1FTJA 3KOTA 4XKQA 1BP5A 3O28A 3TTRA 2VGQA 3N26A 1PB8A 3VFJA 2H98A 4BDOA 4WEDA 5FHOA 1PC3A 5EYFA 3A3CA 1OLCA 3IB1A 1POY1 1URDA 3TCFA 1II5A 2V93A 2HCAA 2FNCA 4G68A 4Z0IA 1LCTA 4XKNA 4IY5A 1Y3PA 3MP1A 2RCBA 1OIBA 2AYSA 3JV9A 1FQCA 4POXA 5CC2A 1LB8A 4IY6A 1IZ1A 1QUIA 2I4CA 3MVXA 4KD5A 3FUZA 4FIMA 4HTGA 1PBPA 3E13X 3LBSA 2OLBA 5I57B 2XXTA 1PB7A 1Q35A 1SW4A 1NMUA 3IOTA 1B2HA 1QULA 2YLNA 4JB7A 4H5GA 3MVWA 3K00A 1M5CA 1Y4TA 1XS5A 1ELJA 4KPTA 1MH4A 2I4BA 2V25A 3ZKKA 3VVDA 4BDMA 4TQUQ 1AH5A 1Y1ZA 2NVUB 4ZEBA 3TCHA 3V89B 3D4CA 3RPWA 3E3KA 1LSTA 2PYYA 4QSEA 5CMCA 4GLIA 3EHSA 3K0VA 4YKKA 3UORA 1MXVA 3MWBA 1JVXA 1YPNA 4OMBA 2RINA 3TQLA 4IO5A 2Z22A 1UTBA 2D21A 3BFUA 1JW1A 5KDTB 4F3GA 2RKMA 1B51A 2VHAA 4MBPA 1D9VA 2HXWA 4QFLA 4UACA 2Q89A 4N13A 4TOZA 1AOVA 5H8FA 1LAHE 1A54A 3MVZA 4TLLB 2V84A 3AXFA 1MXYA 3G3HA 1F9BA 1M5FA 3TTNA 4EQ7A 1AL3A 3T9UA 3UA8A 4JXIA 4OXVA 1O63A 4FAJA 3G3FA 2QL3A 5FTHA 4GVOA 3SEWA 2DE2A 1B3EA 3RNNA 3MPLA 2VD2A 4QFOA 4Z7EA 4JDFA 1DSNA 5KCJA 4F31B 1MY0A 4O3BA 2ANJA 1A55A 1ZTYA 4X1DA 2RC7A 3IX1A 2QMXA 1US4A 1A8EA 2UVIA 4RK2A 3K6WA 3K4UA 4NF5A 1NNTA 3LC8A 1MPCA 4P0GA 5AA4B 5ITOA 3PUWE 4NE4A 1B0LA 2ZYMA 5DVIA 1ZKBA 4GL0A 4R75A 5ICTA 2Y84A 3HPIA 4OFLA 3PU5A 4F1VA 3GBBA 3VLWA 2OJTA 2XD3A 4H8JA 4PE5B 2ESNA 3TZAA 2XX8A 3L6HA 3OSQA 4NF6A 2B3BA 1UQWA 4RPOA 2X26A 4EQBA 1RKMA 1NNPA 3V8XB 3CFZA 4FORA 3C9HA 2DS9A 3Q29A 4BDRA 1SYHA 4LA9A 4HW8A 2F7AA 2PMSA 1B7HA 4U22A 1GVCA 4DCXA 1LFIA 4F3PA 4ZEKA 5KDTA 4XKRA 2Z8FA 2QRYA 4ESWA 4JWOA 5M2VA 3E4RA 4F2QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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