2OCUA

Structure of the complex of c-terminal lobe of bovine lactoferrin with n-(4-hydroxyphenyl) acetamide at 2.38 a resolution
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of the complex of C-terminal lobe of bovine lactoferrin with N-(4-hydroxyphenyl) acetamide at 2.38 A resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
molecule tags Metal binding protein
total genus 106
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2006-12-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ocuA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ocuA02
1A8FA 1EZPA 1LBCA 1TFDA 1Y3NA 2PT2A 2VD3A 3OEMA 1BP5A 3IB1A 2HZKA 1SQYA 4NF8A 2Z22A 1OLCA 2DSFA 1ELJA 1B0LA 4YB7A 4ZEBA 2QRYA 1GTKA 1MRPA 3GBAA 4PFYA 4G77A 2V93A 4YICA 4IGTA 1JW5A 3FATA 1NNTA 3MW0A 4U4XA 1Y9UA 1LSTA 1S7YA 1HSLA 2B3FA 5H8NB 3MBPA 1UTHB 3M3LA 1B3FA 4E0XA 5JTYB 2ZNUA 3CR9A 1GV8A 2NXOA 3E3KA 4N13A 4FJPA 1S9TA 4KD5A 5EHSA 2F7AA 4IO2A 4N07A 1QUJA 4F3BA 3Q25A 3PUYE 2NVUB 2FNCA 3IOVA 2O7UA 3E4RA 3ZKKA 2H25A 3DELB 5B70A 3IR1A 2ZXTA 2Q9TA 3AXFA 3KN8A 3VVEA 1SDXA 3QSLA 1SBPA 3PPQA 3VV5A 4WXJA 2I48A 4DZ1A 1MXZA 4NF5B 4F3PA 5I59B 3FJ7A 4RPNA 1TT1A 4BDQA 1MY3A 1P99A 3S4UA 3MAMA 1YAEA 3VXCA 3N94A 3QUFA 1TFAA 2ONKE 4F31B 4YKPA 3UK4A 5ITOA 1H76A 4YB6A 1LAFE 4LVQA 4E0WA 4RY1A 2XXHA 4PQJA 4AB5A 2XX8A 2QS3A 3H4ZA 4GRKA 3CRBA 3OO9A 3MC2A 4OFLA 1B3HA 2XX9A 3TTRA 4X1BA 3FGSA 4NF6B 2I4CA 4ZE8A 2DWJA 3MPKA 4R2FA 1B9JA 4R9FA 2FA7A 3G3KA 1MQIA 5H8HB 1HSJA 4MH5A 5I2KB 3RGYA 3PPRA 1PBPA 3RTWB 5I2NA 3HO7A 4AB6A 4R9GA 4HCWA 1Z7ME 1A7LA 4OFOA 3PGFA 2YJPA 3N5LA 3RUMA 1B58A 2GFEA 1A8EA 4O3BA 4TLMB 5DVFA 3HHGA 3IB2A 1TXFA 4OETA 1AIVA 2X7QA 1Y1ZA 2V25A 4KHZE 2Y84A 4R6YA 1LLSA 2F6PA 4HW8A 4R2BA 2ZYKA 4IO4A 2UVGA 1DTGA 1R9QA 4R73A 3PU5A 2HFBA 4H8JA 1OIBA 5FTHA 1JW4A 1LCTA 3EF7A 1B7HA 3KSJA 4XIGQ 1B4ZA 2ALUA 3MP1A 1H3DA 1D4NA 1SYHA 4OEVA 3RQTA 2QJEA 2HAUA 5AA4A 3SEVA 2IEEA 3KOTA 3IB0A 1N7XA 1BKAA 4PFTA 4N6PA 3FIRA 5CBRA 4DE8A 3BFTA 3FXQA 4RK9A 3OEKA 4FATA 5KCJA 2AYSA 4EUOA 3Q26A 4LZ7A 1NNKA 1VE4A 2H99A 3PPNA 3TCHA 4H6DA 2ZNTA 3IOTA 5AA2D 2UVJA 5KDTB 3H03A 3ZSFA 1NMUA 3H6VA 1J1NA 1IIWA 3K02A 2AL5A 4ECFA 2I58A 4Q30B 3MPLA 4ZZEA 1FTLA 5EHMA 2DE2A 2OJTA 4F1UA 3TCGA 4F19A 2F35A 1H43A 2DE3A 3T93B 1FTJA 2F7BA 3MP6A 1B4HA 5HM4B 4POXA 4HCYA 3OELA 3U93A 2H5YA 4Z7EA 2F6GA 2ZYNA 2RINA 1MY1A 4GXAA 4ESWA 2QS1A 3PUZE 3IO4A 4G8NA 3BBRA 4C1UA 1M5CA 1R9LA 2F34A 3VE1B 3IX1A 1JQFA 2DWHA 4OVJA 1ZTYA 2Q88A 2XXVA 4GIZA 1ANFA 3DP6A 5J1DA 2A5TB 4F18A 1URDA 4FORA 2F78A 1FQBA 3K1PA 4H5GA 4XKNA 4QSCA 3PMWA 3H3GA 2H9BA 3K6VA 2E0SA 3QAXA 3B6TA 4ZEFA 5CC2A 3W9VA 3O28A 1A55A 1IXCA 1MDP1 3LSFB 2Y7IA 1Y3PA 1SVXB 3IL1B 3IK6B 3TMGA 3VVFA 5DEXA 1FTMA 4H5FA 4G68A 3K6UA 4FEBA 1YPNA 2HQ0A 3H7MA 3TZAA 4FECA 1MG1A 4ESXA 3OENA 4LZ8A 5L9OA 1MH3A 3QXMA 1I6BA 1MQJA 2THIA 3G3FA 1WVJA 3R26A 3E9XA 3PV0E 2HXWA 4QSEA 3K00A 3JZJA 4G8MA 4NF8B 1MXWA 1PBQA 2G29A 1A54A 3ODBA 2YPNA 3MVXA 1AH5A 1OQHA 2R71A 3EQ1A 3VFJA 3FVNA 2RF1A 2NUVA 1VSOA 4LP2B 4QFPA 3HHFA 2Y7KA 3FXRA 1JEVA 3MZBA 5FHOA 1D9VA 1BTJA 1MXYA 1SI1A 4YB5A 4Q0CA 1USYH 4ELOA 4JWYA 2F36A 1NH7A 5H8QB 2CZLA 3S9LC 3S9NC 3TTNA 4X1DA 3V5AA 2OK2A 4F1VA 3RT8A 3I6VA 1B6HA 3PMVA 3MVYA 4F2OA 5H8SA 3TUSA 1FQAA 4DXBA 3IJXB 3GZGA 1M5EA 1OMPA 2UXAA 3EHUA 4RPOA 1PDAA 5I56A 4JXIA 1Y4CA 2O1MA 4R6KA 3QYTA 4GL0A 5FHNA 4F29A 5CMBA 3C31A 2F7CA 3S2VA 1QVSA 5DVJA 5TP9A 3F11A 2ZNSA 3M3KA 1DOTA 2H4IA 5CM6A 3I3VA 4DXUA 2F8DA 4H67A 1ZKBA 1B7UA 3HV1A 2V3QA 1KWHA 3CIJA 2HEUA 4WEDA 3U72A 4QFNA 5I84A 4GD5A 4F2QA 2DXYA 2GHBA 1MY2A 4RNSA 4YAHX 3E13X 1N04A 3GLBA 1P1OA 4I1DA 4I9DA 3O9PA 3FJGA 4NF4A 4K3FA 2OZZA 4U1OA 2DVCA 4KQPA 3I5OA 3IORA 3BFUA 3HN0A 1FQDA 5B7DA 2GH9A 2QS4A 4RK2A 5TPAB 4OXVA 4P11A 4EXLA 2I3VA 1WDNA 2X26A 1N3XA 3TDJA 1Y20A 4JBZA 4M4GA 3KEIA 4ZS9A 2ABHA 3ZKLA 5L8DA 4MFIA 1BLFA 1JNFA 4THIA 4NEDA 3HPIA 1POY1 3O6IA 1QULA 3IO6A 4PFWA 4HTGA 5AA2A 4WKMA 1SI0A 2HZLA 2REGA 5H8NA 1B1HA 3O66A 3K1MA 1IXIA 1ZLQA 3RTFB 2A5SA 5JTYA 1EU8A 4F3GA 1B0HA 2P2AA 1LB8A 4O3CA 4ELRA 3SEYA 1A40A 5F7VA 3FJMA 4EDPA 3THIA 1IITA 4GVOA 4U21A 1MQHA 4YMBA 3WAEA 3SEUA 4RJZA 3TKDA 3V89B 4BDLA 3KJ7A 1LBBA 3ILUB 4YKKA 4HS7A 2PYYA 2OCUA 3VDFA 4FAJA 2RC7A 1P1UA 2ZYMA 5L9SA 1SYIA 4OENA 4MLQA 4R6HA 2O84X 1OVTA 4PE5B 5I59A 4BDNA 2ZMBA 4QRZA 2I0CA 3C34A 5KCJB 2I6EA 4Q8RA 1OQGA 2REJA 3PMXA 2ONRA 4U1ZA 3O29A 2P0SA 1MY0A 1XOCA 1TWYA 2B3BA 3K6WA 2I4BA 3N6TA 5DVIA 4AQ4A 1L5TA 2GHAA 3VLUA 1NFTA 4U2RA 3FVOA 5I57A 2XXTA 2OLBA 4GWOA 3UGWA 5KZTA 2XXQA 2PBWA 3CVGA 4NWDA 4KCDA 4F1YA 1FW0A 3TQLA 5H8HA 3H6TA 3TYHA 2DOJA 4DLDA 3FD3A 3VVDA 5I2KA 4MF3A 1B3GA 4WEPA 1RYXA 1IXGA 3TELA 1O64A 3ECRA 4UACA 4NWCA 1XC1A 4KYSA 2H98A 3OO6A 1B5JA 4OTEA 2RCBA 4GXSB 1GR2A 3R6UA 5DT6A 4KYDA 3EN3A 4G2ZA 1N0TA 4F39A 4JWXA 2RKMA 1B3EA 3TAJA 1MXUA 4H8IA 3FZVA 4QFKA 4ZEKA 3DP8A 4LA9A 4QFLA 3UA8A 5I58A 2Q8JA 1AMFA 2ONSA 3EPEA 1P1NA 1M5BA 2I0BA 1XVXA 2HAVA 3RNNA 3P7IA 5H8FA 2XXWA 4UA8A 4POWA 4IO5A 4ISUA 1RYOA 4M1VA 3CFXA 1Z7NE 3DLNA 4OESA 1JEUA 3JYRA 2E1SA 3U94A 1PC3A 5A5XA 3K6XA 3G7WA 3Q27A 5DEXB 1N84A 2DYXA 1WODA 1FQEA 3Q29A 3UORA 3TCFA 3U8QA 4TQUQ 2PVUA 3OMBA 4BDRA 4EQBA 5ELVA 5LOMA 3N6UA 3ZS6A 3KGCA 1I69A 3VLVA 4X9TA 4ZECA 3WAFA 2UYFA 4TOZA 1DSNA 4DCYA 2XX7A 1MM6A 3CFZA 2Y7WA 4YMAA 2VGQA 5ICQA 4LONB 4NE4A 4ZEIA 3TODA 1FQCA 2XXXA 5KDTA 1IUDA 4GF8A 3GBBA 3K0VA 1DPEA 2XXRA 3C33A 1RKMA 2O7IA 4OWDA 5CRYA 1M5FA 2NOOA 2Q2CA 1OLAA 2XD2A 3EHTA 3FVGA 4OYVA 2IA4A 3PUXE 1GGGA 4NTLA 4H0WA 5AA3A 1Y4TA 1B32A 4G4PA 4YKJA 3LSXA 5CI5A 1LFHA 3MZ1A 3M3FA 2YLNA 4ZZAA 4BDOA 1SW2A 2DVZA 1B51A 4IB2A 2O1LA 3L6GA 2D21A 2PX1A 1NH8A 1Y1MA 1B5IA 5L9MA 4OERA 3RLFE 4PP0A 3G3IA 4QHQA 5TU0A 1B1XA 3LSWA 1SW5A 3A09A 2FYIA 1D3KA 4XKRA 3KN7A 3MP8A 1DMBA 2XXUA 3T96B 1QKBA 2DQVA 5I56B 1QUIA 2CMOA 3TTKA 4GFRA 1MPDA 1FCKA 3LSLA 3OXNA 3RN8A 1US4A 1DPPA 3MQ9A 3UIFA 5K2XA 2WKYA 1P1WA 1A99A 1AL3A 3C9HA 1ZJLA 3CSBA 1YCJA 1I6AA 4IY5A 1NNPA 3T9XB 4QFOA 3SKPA 1IEJA 4BLAA 4ONYA 4O3AA 5BUUA 2Q2AA 2PT1A 1LCFA 3G3HA 5K2YA 4OHNA 1FQFA 3MVZA 1UIUA 4GL8A 1LAGE 3C36A 3FUZA 3ILTB 4F22A 2Y7RA 3KOSA 1XHYA 3D4GA 4DDDA 4P0IA 1OVBA 3IJOB 1UTBA 1NKXA 2P1SA 1IXHA 3IOUA 1VR5A 3SDFA 3V8XB 4EQ7A 1JVXA 3T9VA 1JW1A 4ELPA 4GOTA 1R1NA 1NL5A 2G93A 2LAOA 4DXCA 3S9MC 3C32A 3IAZA 3USDA 3Q28A 5HBCA 1B2HA 5AA2B 1I6QA 3PUWE 3ONMA 1LFGA 4EXKA 1ATGA 4JDFA 2NWJA 1FTKA 4GLIA 1SW4A 2HCAA 2AIXA 1MPCA 5HPQA 4H65A 5H8QA 3HSTA 3K01A 4L17A 4DIGA 3B7DA 3FASA 1B5HA 2D3IA 4C0RA 2QMWA 3RT6B 1Y3QA 4I62A 2QL3A 4IGRA 1MH4A 3EHSA 2F5XA 5I2NB 5ISUA 1N7WA 1Q35A 2F97A 3KFMA 2DXRA 4LQ2A 3OSQA 1N76A 3H6UA 4KYEA 2GRVA 1HSEA 3OSRA 4XKPA 2KLFA 3IOWA 4YKIA 1UTHA 4RYAA 4G8HA 5M2VA 5CMMA 3T66A 2DS9A 1ZIUA 4ZEDA 3TQWA 2I49A 4ELQA 1DTZA 2R6GE 4ZE9A 1T0KA 2RC9A 4OMBA 3W15C 1H44A 1VFDA 1XVYA 1O63A 1YTVA 2ZYOA 4PETA 5BWJA 5I57B 4R72A 2UVHA 3G3JA 3QK6A 4TLLB 2O69A 3K2DA 4RA1A 4KCCA 1XS5A 1SD3A 1JVYA 1MQDA 4OQOA 1LFIA 5TPAA 4QF9A 5AA4B 2PMSA 4MLVA 3CSGA 4IY6A 1URSA 3B6QA 3OOAA 2QS2A 4NF5A 4IO6A 2X7PA 2QSXA 3G3GA 3KG2A 5CBSA 4XKQA 3GXAA 4H1XA 1B52A 1QW0A 4G68C 3PPOA 4KR5A 1AOVA 3PD8A 3L6HA 3PPPA 3QUJA 4EQ9A 4FIMA 4OEUA 1JETA 1MXXA 2O51A 4DCXA 1PB9A 3CI8A 4MBPA 5IAIA 5AE4A 3A3CA 3SERA 4JSOA 2Y7PA 5IKBA 4NF6A 5I58B 5EYFA 3CFLA 4I8CA 4NMYA 1QKAA 1LAHE 5H8FB 3T9HB 1EH3A 2QPQA 3BKIB 2Z23A 3TEPA 1CE2A 5A5XB 3TTLA 2VP1A 2I3WA 3MZ9A 2VD2A 2M8CA 4U4SA 3LUYA 2XXYA 2Z8FA 1URGA 4LATA 5AA1A 3R7XA 2XXPA 4LZ5A 2ESNA 5CMCA 4X48A 1IQ7A 4FEDA 2B65A 4JWOA 2DE4A 1MDQA 2RC8A 4KFQA 4ND9A 3B6WA 3SETA 3O2AA 2Q89A 1D9YA 1LGBC 4JSDA 1GVCA 1H45A 1PEBA 2DP8A 2Z8DA 3TFLA 3MWBA 4GQOA 1R6ZA 1B7ZA 3SEXA 1MXVA 3K1NA 3H06B 4U22A 4IO7A 3VLWA 1PB8A 4IO3A 1MPBA 3U92A 5CMKA 1B40A 2Z8EA 1LB9A 3O97A 4G68B 3JV9A 4Z0IA 3C4MA 2VHAA 3K4UA 3TTMA 3LR1A 3T9UA 2QMXA 4YU0A 1US5A 3O6HA 4LUBA 4YZZA 1SW1A 3LBSA 3D4CA 2OBGA 2ANJA 1QJMA 5JEIA 3OO7A 2XXIA 1PB7A 3MJNA 3A3UA 5DYHA 1MM7A 3MVWA 1MY4A 5F1QA 1IZ1A 2O6AA 3LC8A 1UIVA 5DTBA 5FHMA 1ZBMA 3C35A 1M5DA 1POTA 1B05A 4U23A 3PD9A 3V83A 1FTOA 1II5A 1F9BA 3VXBA 2W7YA 3QIMA 1MQGA 3M8UA 3RPWA 2DWAA 3TPAA 3H6WA 3PUVE 1MS7A 1N3WA 1XT8A 4FE8A 3KJTA 1P1QA 5ICTA 2V3TA 4QSDA 3FV1A 4XTCQ 3OO8A 3S9EA 3MUQA 2OWSA 1EZOA 5ITPA 1CB6A 3N26A 1O7TA 1ZMGA 3T22A 3UN6A 4P0GA 1ZU0A 5FTIA 4OZ9A 1UTBB 1B3LA 1EZ9A 2BJJX 4R75A 3CG3A 3FXUA 4Q5TA 1Q1KA 2XHDA 2V3UA 2OWTA 2A5TA 4ZDMA 3W9WA 2UYEA 1S50A 4EF1A 3U1OA 1UQWA 3DM0A 4KPTA 3SESA 4LQ5A 4BDMA 5TP9B 3HCQA 1B46A 3KBRA 1BIYA 3FVKA 4RXLA 1USYE 1VFEA 4R74A 2AL4A 3OD7A 4C1TA 2XD3A 2RCAA 2VOZA 4JB7A 3FV2A 2DWIA 1NNFA 3RY3A 3UP9A 3DP4A 2R9JA 3KN3A 3KSXA 3O6GA 4EF2A 1LAXA 4PFUA 2D5WA 3SEWA 4KI0E 4OFJA 2UVIA 3KZGA 2O68A 2V84A 3CG1A 4NF4B 1QUKA 4XXUA 4F3SA 5JK4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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