2OCUA

Structure of the complex of c-terminal lobe of bovine lactoferrin with n-(4-hydroxyphenyl) acetamide at 2.38 a resolution
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords Lactotransferrin
publication title Structure of the complex of C-terminal lobe of bovine lactoferrin with N-(4-hydroxyphenyl) acetamide at 2.38 A resolution
rcsb
molecule tags Metal binding protein
total genus 106
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2006-12-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ocuA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ocuA02
4XKRA 3N94A 1OLAA 5L8DA 4YMBA 1SD3A 1NH8A 1A8FA 3BBRA 2O84X 2OJTA 2AYSA 2RKMA 4GXSB 4TOZA 3PD8A 4IB2A 4ONYA 3TKDA 3QUJA 3TTRA 1QKAA 3U92A 1NNPA 3BFUA 4PP0A 4U1ZA 1Y3NA 4BDNA 3K6UA 3TMGA 5IKBA 3C33A 1MXZA 1XOCA 2XX8A 1BP5A 1TXFA 4M1VA 5ICTA 3EQ1A 3BKIB 1MY2A 2XD3A 1QKBA 2QL3A 4EXKA 1NFTA 1FQDA 4QRZA 3U93A 5I56B 1MXXA 2DWJA 2PYYA 4GWOA 1MDP1 1N7WA 2DYXA 2PBWA 4G2ZA 1BLFA 1Z7NE 5A5XA 1M5CA 4ZEIA 1IUDA 2Y7KA 5F1QA 1B58A 1JW5A 4YB5A 1FTOA 1IXGA 4Q0CA 1LFIA 4DDDA 3EF7A 4H0WA 1QJMA 2GRVA 4EF2A 3ONMA 4OERA 4DCYA 4EUOA 4QFPA 3UP9A 4YB6A 3MW0A 1XS5A 3CFXA 4QSDA 4KHZE 1GVCA 2DVZA 4U22A 4PFWA 3HHFA 2DXYA 2ZYNA 4NF4A 2XXUA 2F78A 4G8NA 2DE4A 3QAXA 1I69A 4OTEA 4JSOA 1MQDA 3RPWA 1OQGA 1HSEA 5JTYA 1VSOA 3M8UA 4ND9A 4ZZEA 2XXVA 4PQJA 2I58A 1NNTA 4RYAA 1IEJA 4XKNA 3CG3A 3FXUA 1HSLA 2O68A 2QRYA 3K0VA 1VE4A 2CZLA 4GFRA 1ZKBA 5ICQA 3TODA 2DQVA 5BWJA 4NE4A 3I3VA 5I57A 3KJ7A 3FZVA 4NF6A 1UTBB 1URSA 5FHMA 3FVOA 3MP8A 4DIGA 1B46A 1LB8A 5TP9B 5TPAA 3B7DA 5I59B 1B2HA 5HM4B 1MDQA 1QVSA 4FE8A 4MH5A 5DT6A 3S9MC 2RC7A 4IY5A 3EN3A 4TLMB 1L5TA 3G3KA 3OOAA 3TEPA 1USYH 1Y4CA 4R73A 4R74A 5KDTA 3FVNA 1LBCA 3T9VA 1Y3QA 3MPLA 4DXCA 3RTFB 1B0LA 1EU8A 2ZYKA 3V89B 4DLDA 3SEWA 1Y4TA 2XX7A 3VXBA 4NF5B 3OXNA 5CC2A 2XX9A 3FXRA 1B7ZA 5FHOA 1GGGA 2Z22A 4Z0IA 3GXAA 1UQWA 1XVXA 3CIJA 2PMSA 3SEUA 4ESWA 2YPNA 3PMXA 1LFHA 4U1OA 3WAFA 2Q8JA 3K02A 4O3AA 4QSEA 4KI0E 5B7DA 4IO5A 3OO9A 2OCUA 2P2AA 4GOTA 3MPKA 3B6QA 4I9DA 3UGWA 1PBPA 4EQ7A 4BDQA 3MAMA 3OEMA 4IO4A 5I2KA 5EHMA 2I3WA 1MQGA 4PFYA 4F3SA 2XXYA 5DVIA 5H8NA 3OD7A 5H8FB 1UTHA 1KWHA 2ZMBA 5ELVA 4GIZA 1IXIA 3Q26A 2XXQA 3H6WA 2YLNA 1FCKA 2OZZA 3L6HA 3RUMA 1LBBA 4G68C 3RNNA 1AH5A 4Z7EA 3SESA 2KLFA 4H65A 3PUXE 1M5FA 5HPQA 1ATGA 3OMBA 3CRBA 2GH9A 1QULA 5H8QB 2NWJA 2G93A 1O63A 4JWOA 3PUYE 2DE3A 4GVOA 3S2VA 3E4RA 1UIUA 5FTIA 4PE5B 4OWDA 4ZDMA 2HFBA 4H67A 4WKMA 1LLSA 2F34A 2NOOA 3O6GA 4OEUA 1USYE 1F9BA 1DOTA 4GF8A 3AXFA 2F7AA 3T96B 4NF8B 1A40A 3TCGA 2I48A 2O6AA 3MWBA 1IZ1A 2O69A 2O7UA 4PETA 1IITA 4KQPA 3TZAA 3K1MA 3P7IA 3G3IA 3N6TA 4U21A 4RJZA 3K1NA 3MZBA 4BLAA 3PPOA 1CE2A 5I2NA 1MM7A 4DZ1A 3M3KA 1LCFA 1N3XA 3JYRA 3TTLA 3V83A 2H4IA 1MRPA 1US5A 5AA2B 4F2OA 4U4XA 5FTHA 3VE1B 3PPRA 1Y1ZA 3G3JA 4Q8RA 4R2BA 3N5LA 1P1NA 1NNFA 4TLLB 2PVUA 1OQHA 2Y7RA 3CFLA 3PD9A 2Z8FA 4LZ8A 5CMCA 3RTWB 4H5GA 4R6YA 1MXUA 4OHNA 1WVJA 3IOUA 4H8IA 3F11A 3FASA 4IGTA 4IO3A 4EXLA 1N76A 1LAGE 1JW1A 2B3BA 2GHAA 1DSNA 3EHSA 1MY1A 1JEVA 3SKPA 2F6PA 1YPNA 2DOJA 3FIRA 3MZ9A 4OESA 1LAFE 2QS2A 4F1YA 3EHTA 3HPIA 2X7QA 4NWCA 4QFLA 1Y20A 3QSLA 1R9QA 5A5XB 4DE8A 3VLWA 4BDMA 2I4CA 1MH3A 3U8QA 4Q30B 3M3FA 4DXBA 4KYSA 4G68A 2QMXA 1B0HA 1S9TA 3FVGA 2DXRA 2Q88A 3OO7A 1M5DA 3TDJA 3C4MA 1Z7ME 3MP1A 3TCHA 1MG1A 2ANJA 4K3FA 1H45A 3W15C 2P0SA 3HV1A 4G8HA 4N07A 4RPOA 1P1OA 3IO6A 2RC9A 4QFNA 2H25A 4OFJA 1RYXA 4NF4B 3E9XA 2F6GA 2YJPA 1ZIUA 2QS3A 4RK9A 2VD2A 4AB5A 5CM6A 1B5JA 4QSCA 5JTYB 2REJA 2E1SA 5TU0A 3TPAA 1B9JA 1PB9A 2XXRA 2F7BA 2H5YA 1FQBA 3K1PA 4ELOA 2I49A 2Q9TA 4NWDA 3GLBA 4RXLA 2D5WA 1J1NA 3FGSA 4BDLA 4R9GA 1BKAA 1FQFA 2I3VA 3H7MA 4F2QA 1MXWA 3T22A 5CRYA 4IY6A 4RNSA 1EH3A 1S7YA 2ESNA 5I57B 5LOMA 1MPCA 5I84A 3DLNA 2XXPA 4KR5A 1SI0A 4E0XA 4ZS9A 4NF6B 2XXHA 4P0GA 3C32A 5CI5A 4JDFA 3SERA 5H8SA 4HTGA 1IXCA 4YICA 5TPAB 2VGQA 3OO6A 3T9HB 2A5TA 3DELB 4G77A 4OQOA 2ABHA 3S9LC 3CVGA 3LC8A 2DP8A 3O9PA 1GTKA 2A5SA 3FJ7A 2W7YA 3C35A 3K6WA 4ZE9A 5CBRA 3PV0E 4OFLA 5I58A 5KDTB 3BFTA 1RYOA 4F39A 3O66A 3A09A 3PPQA 1POY1 1MPBA 2Z8DA 2H99A 1AMFA 1PB8A 1H3DA 3IOTA 5KZTA 3ILUB 1PB7A 1EZOA 3WAEA 2HZLA 4R6KA 2ONSA 2ONRA 5CBSA 4POWA 3G3HA 2THIA 4F3BA 4FIMA 4ZEKA 4R72A 1SW1A 3C9HA 1SQYA 3U72A 1VFDA 2XXTA 1XVYA 2HCAA 4R75A 4ECFA 3CG1A 2UYFA 4I8CA 2OWSA 3N6UA 2ZNUA 2B3FA 1XC1A 1B4ZA 1MXYA 1URDA 3O97A 4FAJA 4QFKA 5I2KB 3MVWA 3GBAA 5H8NB 1MS7A 2QSXA 1B3FA 3KGCA 3OSQA 3CSBA 3M3LA 1FTLA 1PEBA 3H03A 1B3LA 2DWAA 4ZECA 1N3WA 5DVJA 2BJJX 3D4CA 2DWHA 5CMBA 5J1DA 5ITPA 2Z8EA 3VVFA 4YKJA 3A3CA 3PPNA 1P1WA 4OFOA 4X48A 3I6VA 1I6QA 2UVJA 3TQLA 4NEDA 1AL3A 2M8CA 4F1UA 4L17A 2DE2A 2UVHA 2QMWA 2E0SA 3PUVE 3I5OA 3PPPA 4LVQA 3IB2A 4WXJA 4MFIA 1P1UA 3HSTA 4HW8A 3ZSFA 4GQOA 4R2FA 4OMBA 1B05A 4U23A 1B4HA 1MQIA 1YTVA 3A3UA 4AQ4A 4NTLA 3IK6B 5TP9A 4Q5TA 3VLUA 3SEVA 3UA8A 4KCCA 2V3QA 3KSXA 2XXIA 5L9MA 1OVTA 4JXIA 1BTJA 1ANFA 1DTGA 3KN7A 5JEIA 3QIMA 5L9OA 2OK2A 3W9VA 3RLFE 2AL5A 4RY1A 1FQCA 4YZZA 3UORA 3FJMA 4F18A 3H4ZA 4GL0A 3GZGA 5I2NB 1FQEA 1OMPA 2NUVA 4G4PA 4OETA 4F22A 1TWYA 4PFUA 5IAIA 3TFLA 3FV2A 2I6EA 1H76A 4GLIA 4MF3A 1SDXA 3G3FA 3T93B 4YKKA 4C1UA 4H5FA 4IGRA 3IORA 4O3BA 4H8JA 3O28A 4JWXA 1I6BA 4ZZAA 1QUIA 2HZKA 3USDA 1NH7A 3KOTA 3S9EA 4THIA 3L6GA 1B51A 1JNFA 4TQUQ 4R6HA 1DPPA 4IO7A 1SW4A 3ODBA 1IQ7A 4OZ9A 2F8DA 3KN3A 2XD2A 3K6VA 4FORA 2V84A 3CI8A 1ZLQA 3W9WA 3H06B 1MQJA 2IA4A 3TCFA 1Q1KA 3PUZE 2F36A 3TYHA 1M5BA 2ZYOA 1ZBMA 3QUFA 3KFMA 4KCDA 1OIBA 4C0RA 1OVBA 1QUJA 4LA9A 2RF1A 1MQHA 2FNCA 1B1XA 3QK6A 3T9XB 4UA8A 5EHSA 1A8EA 4ZEDA 1DMBA 4NMYA 5DEXB 4KD5A 2ZXTA 3MJNA 3IB1A 3FATA 1NL5A 4XIGQ 1II5A 3PMVA 1SYIA 1LB9A 2VOZA 4OEVA 2Y7PA 3MZ1A 3IJOB 3ILTB 2D21A 4F3GA 3VFJA 5H8QA 1SVXB 2DS9A 1B7UA 3UIFA 5JK4A 1ZJLA 1N04A 4G68B 1MPDA 4XTCQ 3IOVA 2O1MA 1WDNA 4IO6A 1QUKA 5BUUA 3VXCA 3MQ9A 2V25A 4LQ2A 3IAZA 3G7WA 4OENA 3C36A 3T9UA 3KSJA 1SW2A 3LSWA 4LZ7A 3O6HA 3HHGA 2Z23A 4LQ5A 2PT1A 4KFQA 3PU5A 3RGYA 3H6TA 1JW4A 3ECRA 3TTNA 2V3TA 4RK2A 3LUYA 4MBPA 5DYHA 1D4NA 4LATA 3R7XA 1T0KA 1LCTA 2DVCA 4ESXA 3VDFA 2OWTA 3RN8A 3KBRA 4GRKA 1Q35A 1AIVA 1ZTYA 1ZMGA 4ISUA 1CB6A 3KEIA 4UACA 5CMMA 4EF1A 2HXWA 2O7IA 5KCJA 3OELA 1O7TA 2ZNTA 3TTKA 2F97A 1H44A 1GR2A 1S50A 2D3IA 3FJGA 2VP1A 1ELJA 3B6TA 3H3GA 1VR5A 4YKIA 1JQFA 2A5TB 5H8HA 5AA4A 2CMOA 1TFAA 1MM6A 1LFGA 3IOWA 2DSFA 4OVJA 3RQTA 1FQAA 4G8MA 3JZJA 2OBGA 3KN8A 1TFDA 3TQWA 5I58B 3KZGA 3IL1B 4QFOA 3UN6A 1RKMA 4C1TA 2DWIA 5FHNA 5AA1A 2Q2CA 3K01A 3OSRA 3MVYA 4QF9A 1MXVA 2VHAA 3LR1A 1ZU0A 2R71A 1B7HA 1DPEA 1D9YA 4R9FA 3C34A 1HSJA 1US4A 2VD3A 4IO2A 1MH4A 3H6VA 3U94A 1I6AA 4POXA 1H43A 2F35A 2FYIA 4EDPA 1FTMA 3TTMA 4BDRA 4U4SA 4YU0A 2UYEA 1A99A 3SDFA 2Y7IA 3QYTA 3OENA 4I62A 2H9BA 3Q28A 4U2RA 3TELA 2O51A 2REGA 3FD3A 3IB0A 1B1HA 3VVEA 2AL4A 1D9VA 4BDOA 2H98A 2X7PA 4RA1A 5AA3A 1N84A 4LONB 4YMAA 3LSXA 1YAEA 2WKYA 5M2VA 3D4GA 4ELRA 5I56A 5DVFA 5K2XA 1B52A 4GL8A 1LGBC 4ZEBA 4AB6A 4X1DA 2QJEA 3PGFA 3Q29A 1FW0A 3RT6B 4HS7A 3VVDA 5CMKA 1JETA 3K4UA 3OO8A 2I0BA 1P1QA 1B3GA 4JWYA 3K6XA 2F7CA 2ONKE 1FTJA 2NVUB 1A54A 2HQ0A 1Y1MA 5ITOA 3IJXB 3U1OA 3HN0A 2QS1A 2B65A 4F29A 4ZEFA 1R9LA 4O3CA 4ELPA 1Y3PA 3THIA 2XXXA 5ISUA 4X9TA 4KPTA 2P1SA 1B5HA 4ZE8A 1EZ9A 1UTHB 1B5IA 1PDAA 2O1LA 4I1DA 5B70A 2I4BA 3V5AA 2NXOA 4PFTA 4MLQA 3ZKKA 3O2AA 3LBSA 2ZNSA 4P0IA 4FEDA 3RY3A 3LSLA 4WEPA 1PC3A 2GHBA 3O29A 5F7VA 3Q25A 1B6HA 3OEKA 1LAHE 1Y9UA 3MVZA 2IEEA 4F1VA 1UIVA 4RPNA 4DCXA 1XT8A 1UTBA 2RCBA 3PUWE 3KG2A 2V93A 3H6UA 1LSTA 3CSGA 1A55A 2Q2AA 5I59A 2R6GE 5L9SA 4F3PA 1R6ZA 3HCQA 4X1BA 1N7XA 1O64A 2PX1A 2Y7WA 3KOSA 3C31A 3TAJA 2I0CA 1BIYA 1YCJA 3E13X 3MUQA 3MBPA 4N13A 1JEUA 2XXWA 1SBPA 5AE4A 3LSFB 3MC2A 2UVGA 4LP2B 3MP6A 3R6UA 4GD5A 1SW5A 2UXAA 4JBZA 1LAXA 3IR1A 2HEUA 2R9JA 4NF5A 4LZ5A 3R26A 3DP8A 3CR9A 4N6PA 3E3KA 4OYVA 3Q27A 1TT1A 4F19A 2ZYMA 1NKXA 4FATA 3IO4A 4H1XA 3GBBA 2XHDA 2QPQA 1XHYA 4FECA 3FXQA 3CFZA 1B40A 2HAUA 1PBQA 3QXMA 2V3UA 2GFEA 3O6IA 4E0WA 2OLBA 3VV5A 3DM0A 1B3HA 4EQBA 1GV8A 1D3KA 4MLVA 1WODA 3UK4A 4JB7A 3FV1A 4M4GA 2FA7A 1IIWA 4P11A 3JV9A 1POTA 3S4UA 3FVKA 1IXHA 3KJTA 1A7LA 1QW0A 1EZPA 1JVXA 4F31B 3B6WA 1M5EA 1SYHA 1VFEA 5DTBA 1P99A 5AA2D 3G3GA 2UVIA 3VLVA 5H8FA 4FJPA 1FTKA 4XKQA 1JVYA 3K2DA 1AOVA 1SI1A 1N0TA 2F5XA 2G29A 3DP6A 4XXUA 4KYEA 3PMWA 4H6DA 4HCWA 2X26A 4HCYA 5HBCA 4FEBA 2Q89A 2LAOA 3EPEA 4JSDA 3N26A 4XKPA 4EQ9A 3ZS6A 3SEXA 4YAHX 1R1NA 1B3EA 2AIXA 2QS4A 4WEDA 2RINA 3TUSA 3V8XB 1NMUA 3FUZA 2ALUA 5K2YA 2RCAA 2PT2A 5KCJB 4OXVA 4LUBA 1URGA 4NF8A 3HO7A 4YB7A 3T66A 3K00A 4KYDA 2Y84A 3IX1A 1OLCA 4GXAA 3RT8A 5H8HB 3DP4A 5AA4B 1MY4A 1DTZA 4ELQA 1B32A 2RC8A 3S9NC 2HAVA 1NNKA 4YKPA 5EYFA 3SETA 3ZKLA 3EHUA 4QHQA 4DXUA 3SEYA 1MY3A 1MY0A 5AA2A 3MVXA 5DEXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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