1DSNA

D60s n-terminal lobe human lactoferrin
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
315
structure length
315
Chain Sequence
RRRSVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRRVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLSGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Iron transport protein
molecule keywords LACTOFERRIN
publication title Altered domain closure and iron binding in transferrins: the crystal structure of the Asp60Ser mutant of the amino-terminal half-molecule of human lactoferrin.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 94
structure length 315
sequence length 315
ec nomenclature
pdb deposition date 1995-12-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1dsnA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1dsnA02
4RY1A 4NF8A 4HW8A 3EHSA 3TCFA 4KHZE 2V3QA 3CR9A 3C34A 5I56B 3O6IA 2DVCA 3C32A 3OO7A 5ISUA 1H76A 2PVUA 3CG1A 1FCKA 5FHMA 4M1VA 2ESNA 3OENA 1GTKA 3Q26A 3KJTA 3O6HA 2DE3A 5HM4B 2QSXA 2REGA 1MPCA 4YB7A 4Q5TA 5TP9A 1AIVA 4GLIA 1MXUA 3T93B 3ILUB 1IXHA 2O69A 1JETA 3C9HA 4MBPA 5DVJA 2X26A 3PPNA 5I56A 3FATA 1S50A 1FTJA 3KN7A 4YKPA 5K2YA 5KCJA 1PBPA 1M5DA 2VGQA 3FXQA 2F7BA 1SW2A 4R9GA 1FTLA 1QUIA 4PFUA 3IB2A 4MLQA 4R73A 4OHNA 2YLNA 4GFRA 3RQTA 3PMWA 2R71A 1UTHB 4LZ5A 3OEMA 1IIWA 1XVXA 4DXBA 4EQ7A 1D3KA 1B2HA 1MY2A 3TYHA 4YZZA 4RPNA 1LBCA 3CVGA 3VVFA 3PPOA 4ESWA 4DIGA 1P1UA 1R6ZA 4IY5A 1NNTA 4GOTA 2VOZA 3FD3A 5DTBA 3H6UA 4IGRA 4QFOA 4LA9A 4OQOA 3OOAA 1UTHA 2NWJA 4KYEA 3E13X 1HSJA 4DXUA 2Y84A 3LBSA 3Q27A 5CBRA 2B3FA 4YAHX 1B5JA 2CZLA 3IAZA 4R2FA 1NKXA 1OVTA 4JB7A 1FW0A 1NH7A 1CB6A 1JW1A 2DP8A 4FATA 5A5XA 1B05A 4XKQA 2V3UA 4GRKA 3KGCA 2XXYA 4TLLB 4H6DA 3H6VA 1LB9A 3A09A 2OLBA 3N94A 1A8EA 3MZ1A 1BKAA 4NE4A 1PB9A 3C31A 3O66A 3KJ7A 4YB5A 3SERA 2H25A 3FIRA 1SYIA 4KCDA 4WEPA 2PYYA 4QRZA 3IR1A 2ZYNA 3HSTA 4C1TA 5FHOA 4MH5A 1J1NA 2R6GE 5IAIA 1URSA 1SBPA 1URGA 3FVNA 1LCFA 3EN3A 5CBSA 4EUOA 4ECFA 5KDTB 2UVGA 3G7WA 1FTOA 4LZ7A 3SEYA 4ZEFA 3N6UA 4POXA 4F29A 4ZZAA 2O51A 3VV5A 3TKDA 2I3VA 2O68A 3WAFA 5M2VA 1QJMA 3EF7A 2E0SA 4K3FA 1D4NA 4L17A 4IY6A 2H98A 4Z7EA 5AA2D 1PEBA 1MQHA 1DMBA 1IZ1A 3Q28A 5F1QA 5H8HB 2Q88A 3PUVE 1JNFA 3PMVA 3T96B 3K2DA 3PPRA 2NUVA 4OESA 4QSCA 3IOUA 5B70A 2DXRA 5ICTA 4ELRA 4ELQA 4ZS9A 4X1BA 1RKMA 4X1DA 3HN0A 3W9WA 3KOSA 4R6HA 1LAFE 3KFMA 3MP6A 4EDPA 1A99A 1DTZA 1EZPA 4N6PA 4ZEBA 3QXMA 4OMBA 1ZKBA 2FYIA 3L6GA 3B7DA 4G8HA 5DEXB 4P11A 3TZAA 3UP9A 4ONYA 3RTWB 1PC3A 5H8HA 3R7XA 1YPNA 1N3WA 3FVOA 5J1DA 5K2XA 4KQPA 4M4GA 4JWOA 4OFOA 2BJJX 3M3LA 1LFGA 1ZJLA 2LAOA 2GHAA 1LGBC 3HV1A 1HSLA 1B40A 1O7TA 4TOZA 1H3DA 2DWHA 3PV0E 1PB7A 3K6XA 5BWJA 2KLFA 1S7YA 4OWDA 1DPPA 1OMPA 1D9VA 3PUXE 4QFNA 4OYVA 5DEXA 4AB5A 4ZE9A 1EH3A 4YKIA 4DE8A 3IO6A 3QSLA 4G68B 4NF6B 3E3KA 1KWHA 1MQGA 4QFKA 3FVGA 4I62A 4O3AA 3MPKA 1NNFA 2RKMA 1IXIA 1MPDA 3OO9A 3T66A 3SKPA 3ZSFA 1MRPA 3U93A 4F19A 4YMBA 1L5TA 3IORA 3OXNA 2F6PA 4F1UA 3GBAA 1ZTYA 2AYSA 3IJOB 3RT8A 5ELVA 3O97A 1EZ9A 1B1XA 2D21A 1MH3A 4G4PA 3M8UA 1QKAA 2PX1A 2HFBA 5I57B 1B3FA 3CG3A 3VLUA 4LATA 1VSOA 4F3PA 3HCQA 4H8IA 5EHMA 1B32A 1N7WA 1AL3A 3H4ZA 3LC8A 1P1NA 4PETA 2F7CA 2XXVA 4YKJA 1IUDA 1MQDA 3ZKLA 4GF8A 4U22A 1MY4A 3PPPA 1XC1A 2QPQA 3TMGA 4BLAA 1B7HA 3V89B 4MF3A 3DP8A 3OO6A 1N04A 2Z23A 4YB6A 3QIMA 1ELJA 4KI0E 3GXAA 2XX7A 4XIGQ 1SI0A 3P7IA 5I57A 1VR5A 1SW5A 1TFAA 1FQAA 5TU0A 3K1PA 4F3SA 3SDFA 5HBCA 4IO4A 2QS2A 4R72A 5B7DA 4C1UA 3FV1A 4F1VA 1DSNA 4H8JA 1B3EA 1MDP1 1Y3QA 3MWBA 4R6KA 4U4XA 5I59A 2F7AA 4X48A 4F31B 3KOTA 2X7PA 1GV8A 4BDNA 1CE2A 1II5A 3TELA 1P1OA 4UA8A 3L6HA 4U2RA 4HCYA 1JW5A 2DS9A 3H06B 3FUZA 4JSDA 3S9MC 4N13A 2DVZA 3MVWA 3K6UA 3CFLA 2Q9TA 3BFUA 5KZTA 3ZKKA 1FTKA 1Q35A 2QS3A 4F18A 2ZMBA 3G3JA 2RF1A 3LSWA 3RGYA 1I6AA 2H99A 1MDQA 4NMYA 2P2AA 1WODA 1LLSA 1MG1A 2RCBA 1LB8A 4ELOA 4FJPA 4P0IA 3O28A 4O3CA 3MC2A 4RK2A 4LUBA 3TCGA 1MM6A 4EXLA 5IKBA 3TTNA 1EU8A 1M5BA 2UXAA 1Y4TA 4ZECA 1ZMGA 2I49A 5I2NB 3SETA 1RYOA 1GVCA 3S9LC 3MVXA 3K1NA 1Y4CA 5FTHA 1AMFA 2Z22A 1USYE 3I6VA 2F5XA 4KCCA 1P99A 2VD2A 4GXSB 1SQYA 1DTGA 4WEDA 4KR5A 4GQOA 1ZIUA 2Z8FA 4XTCQ 3UN6A 1OLAA 1IEJA 2A5TB 2O1LA 1QUJA 4AQ4A 3KN8A 2VHAA 4LZ8A 5DVIA 4WKMA 1IXCA 4QF9A 1SVXB 2OZZA 1TFDA 4KYDA 5I2NA 3M3KA 2OBGA 3IOWA 1MPBA 2H4IA 2Q89A 1B5HA 4DCXA 1IITA 3DP6A 4MFIA 3MP1A 1PBQA 4OFLA 2B65A 4XXUA 5TPAB 2NVUB 2DQVA 4ESXA 1MXZA 2GFEA 4OZ9A 5DVFA 1POY1 4Q8RA 3N5LA 1R9LA 1UTBB 3TQWA 3CRBA 5HPQA 2F8DA 2AL5A 3S4UA 3T9UA 3N6TA 3A3CA 1QULA 3HPIA 2ANJA 1MY0A 2A5TA 4YMAA 1LAXA 3THIA 1OQHA 3BFTA 1US5A 2IA4A 2DXYA 1B0LA 4GWOA 4PFTA 4RK9A 1UIUA 3D4CA 1YAEA 4JBZA 3PUZE 5CI5A 3IB1A 1Y3PA 1ZU0A 2XD2A 3KG2A 4P0GA 2QRYA 3SEXA 2HZLA 1I6BA 5TPAA 1B3LA 2DWJA 3W15C 2ZYOA 2P1SA 4FEDA 4I8CA 1MY1A 3VE1B 1BTJA 3JV9A 4N07A 1US4A 3SEUA 4YU0A 1OVBA 3TTKA 2Y7RA 5AA1A 1ANFA 3TTLA 1OLCA 2I4BA 4F39A 1FQCA 3B6TA 1NMUA 3FVKA 2F35A 3CFZA 1SYHA 2HEUA 3LSLA 1URDA 2DWIA 3S9EA 4LQ5A 3G3KA 4IGTA 3FZVA 2ONRA 3Q25A 3RTFB 2HZKA 5KDTA 2A5SA 2I3WA 1OQGA 3ODBA 4R75A 3K6WA 2V84A 2I4CA 1BP5A 4JXIA 2DE4A 4H0WA 1XVYA 3VLWA 4PFWA 2I0BA 5ITOA 1B4ZA 3VXBA 2QL3A 2UVIA 3RN8A 4GIZA 4RNSA 3I3VA 4GXAA 3IK6B 1IQ7A 2DYXA 1MS7A 1FQBA 2OK2A 1UQWA 5AE4A 3T9HB 4ZZEA 3OO8A 3TTMA 3K0VA 3DLNA 4R2BA 1N7XA 3OMBA 4GVOA 5I2KB 3K00A 2F78A 3MJNA 1Z7NE 3PD9A 1B52A 2AIXA 1VE4A 1FTMA 3MW0A 4U23A 1VFDA 3CSGA 1O63A 1QW0A 2M8CA 4NF4B 4U4SA 2R9JA 5BUUA 1BIYA 3FJMA 3B6QA 4R74A 1VFEA 3QUFA 2V3TA 3MVYA 4DCYA 1N84A 2Z8EA 1LAHE 4H5GA 3H7MA 1LFIA 2RCAA 5H8QB 1JVXA 4F3BA 3FASA 5FTIA 1SI1A 4MLVA 4Q0CA 1WDNA 2UVHA 3O9PA 3PMXA 3MPLA 3G3GA 1XOCA 5L9MA 1JW4A 3TAJA 2UYFA 1DPEA 4HCWA 1Y1ZA 3EQ1A 4KYSA 5H8NB 2F34A 3PUWE 1GGGA 2Q2AA 4NF4A 2NXOA 2X7QA 5ITPA 1ATGA 3KSXA 4G68A 4NF6A 3ECRA 4H65A 3FXRA 4GL0A 1MH4A 3BBRA 3DM0A 1B7ZA 1LCTA 5CMCA 4OFJA 2O7UA 1AOVA 3LSFB 1O64A 3TEPA 5I84A 1TWYA 1EZOA 2F97A 5F7VA 4F22A 2XXWA 5AA2B 2G29A 4RYAA 1QUKA 2AL4A 2XXQA 2D3IA 3MP8A 2I58A 2ZNSA 3TFLA 3DELB 2DE2A 3MZ9A 2YJPA 4POWA 5CMKA 1NNKA 4H67A 2XXXA 4I9DA 3LSXA 1MXWA 1I6QA 2V25A 4ZE8A 1SW1A 1TT1A 4BDLA 2Q2CA 5ICQA 1S9TA 3UA8A 1Y20A 2ABHA 4TQUQ 3LR1A 1P1WA 3PGFA 1A55A 2O6AA 4FECA 3A3UA 1BLFA 3K1MA 2XXRA 2PT2A 3WAEA 3TUSA 4H5FA 4EF1A 4LONB 1B58A 3JZJA 4FAJA 4LQ2A 1AH5A 2GH9A 3S2VA 5DT6A 4GL8A 5AA2A 5KCJB 3FJGA 1MM7A 2H5YA 4I1DA 1B3GA 2PMSA 3FXUA 2VP1A 3IX1A 4IO2A 3RY3A 3UIFA 4FEBA 3OEKA 4RA1A 2O7IA 3TPAA 1MXXA 4PE5B 3CSBA 4H1XA 3OSRA 4BDQA 3O2AA 2QS4A 3C4MA 1JVYA 1OIBA 3C33A 1HSEA 2XD3A 3T9VA 4QSEA 2OWSA 4DXCA 2Q8JA 2HCAA 3CFXA 2XXUA 2IEEA 1LSTA 3GLBA 2OCUA 3MAMA 4EXKA 2UVJA 3QK6A 2PBWA 3QAXA 4F2QA 1MXVA 3KZGA 3JYRA 3IO4A 3H6TA 1Y1MA 3G3FA 3VVDA 1H44A 3K01A 4GD5A 2HAUA 4NEDA 3T22A 4U21A 4G77A 2RC7A 3RPWA 4FORA 1Q1KA 2REJA 3ILTB 5AA3A 3IJXB 1N0TA 3TQLA 2ZYMA 1B9JA 3U72A 3B6WA 4ELPA 5A5XB 4WXJA 3QUJA 4NWCA 1B0HA 3KN3A 1M5CA 1WVJA 3ONMA 4PP0A 4AB6A 4KFQA 1PB8A 3PU5A 3MVZA 3UORA 1N76A 2XHDA 3KEIA 4RXLA 4R6YA 1LAGE 3UGWA 3U92A 3SESA 4ZEDA 1DOTA 3C35A 1LFHA 2THIA 3CI8A 4E0XA 2ZYKA 4NTLA 1FQDA 2RINA 4IO5A 2XX9A 3TODA 2QS1A 2O84X 2O1MA 4U1ZA 2Y7IA 1JQFA 2NOOA 4E0WA 2I48A 1JEVA 4F3GA 1M5FA 3DP4A 2QMXA 3G3HA 3OD7A 3TCHA 4QSDA 4RJZA 4EF2A 4XKNA 2Z8DA 3H6WA 4QHQA 4BDOA 3PPQA 3VLVA 4FE8A 2Y7KA 2FA7A 3K4UA 4PFYA 3RUMA 1R9QA 3ZS6A 3PD8A 4EQBA 5CRYA 1SD3A 2I6EA 4HS7A 3HHFA 4THIA 2ALUA 3RT6B 4G8NA 2HAVA 3O6GA 2VD3A 3GBBA 1LBBA 2ZNUA 3W9VA 1A7LA 4Q30B 1NL5A 2G93A 4ZEKA 1B46A 2P0SA 1XS5A 3TDJA 1UTBA 1F9BA 2H9BA 4IO3A 2XXPA 4KPTA 1B1HA 3RLFE 3U8QA 1B51A 1Y3NA 1SW4A 5EHSA 4OERA 3IB0A 3E9XA 3SEWA 1B5IA 4HTGA 1A54A 4F2OA 5AA4B 4ZEIA 5JTYB 1P1QA 3USDA 4JWYA 2WKYA 3UK4A 4DLDA 1ZLQA 3PUYE 4QFLA 4DDDA 3V8XB 3MZBA 3H03A 1GR2A 4OENA 3KSJA 1B3HA 4Z0IA 1YCJA 1XT8A 5H8FB 4XKPA 3KBRA 5H8SA 4DZ1A 5L9SA 4FIMA 3R26A 3QYTA 4OEUA 4U1OA 4IO6A 3VXCA 4OEVA 4X9TA 2D5WA 2OJTA 2ZXTA 3N26A 1A8FA 2OWTA 3IL1B 4ISUA 1M5EA 1QKBA 5AA4A 4LVQA 4OETA 5JTYA 3FV2A 4R9FA 4C0RA 5I58B 4NF5B 2RC8A 1POTA 4ZDMA 4O3BA 3HO7A 2UYEA 3OSQA 1SDXA 5CMBA 4F1YA 1H43A 2B3BA 2DWAA 1MY3A 1UIVA 2I0CA 2E1SA 1NNPA 1NFTA 3M3FA 2ZNTA 4XKRA 3EHTA 3H3GA 4JSOA 1D9YA 3F11A 5H8FA 2QMWA 1FQFA 5FHNA 3IOTA 4IB2A 3S9NC 2GRVA 3VVEA 3VFJA 3AXFA 3Q29A 2QJEA 3D4GA 4KD5A 3O29A 2Y7PA 2XX8A 3TTRA 1NH8A 2Y7WA 2YPNA 5I2KA 5L8DA 5JEIA 5DYHA 4NWDA 2V93A 4UACA 4YICA 5I58A 4NF5A 3RNNA 3EHUA 1Y9UA 4QFPA 3V5AA 1JEUA 3G3IA 3U1OA 2RC9A 3MUQA 3LUYA 3FGSA 3VDFA 3R6UA 4OXVA 4BDRA 4IO7A 1MQIA 3V83A 3E4RA 2CMOA 4G2ZA 3GZGA 3K6VA 1MXYA 3FJ7A 1TXFA 3IOVA 4JWXA 4LP2B 5CMMA 1N3XA 2ONKE 3C36A 1USYH 5H8QA 1Z7ME 3I5OA 4NF8B 3OELA 4PQJA 1T0KA 1H45A 2F36A 1A40A 5CC2A 3T9XB 4OVJA 2FNCA 2XXTA 1XHYA 1RYXA 1QVSA 4OTEA 3EPEA 3K02A 1B7UA 2GHBA 5EYFA 2W7YA 5LOMA 2DSFA 3HHGA 1I69A 2DOJA 3MBPA 4ND9A 1ZBMA 2ONSA 5CM6A 1B4HA 2XXIA 5JK4A 4G8MA 3MQ9A 3U94A 5H8NA 1YTVA 2XXHA 4TLMB 1PDAA 2HXWA 3BKIB 4YKKA 1FQEA 1B6HA 5I59B 1R1NA 2F6GA 3CIJA 4BDMA 5TP9B 2PT1A 4JDFA 1IXGA 4EQ9A 4RPOA 1MQJA 5L9OA 3SEVA 2HQ0A 4G68C
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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