1DSNA

D60s n-terminal lobe human lactoferrin
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
315
structure length
315
Chain Sequence
RRRSVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRRVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLSGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords LACTOFERRIN
publication title Altered domain closure and iron binding in transferrins: the crystal structure of the Asp60Ser mutant of the amino-terminal half-molecule of human lactoferrin.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Iron transport protein
total genus 94
structure length 315
sequence length 315
ec nomenclature
pdb deposition date 1995-12-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1dsnA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1dsnA02
3TELA 5I58A 1NH7A 4JXIA 4OXVA 3V89B 5AA3A 2QS2A 1POTA 2DQVA 4BDLA 4F2OA 1SQYA 4NF4B 4XKNA 2VD2A 2F7AA 2Y84A 1B1XA 2FNCA 1MDP1 3ZKKA 4JB7A 3R7XA 3IO6A 3KOSA 4EQBA 2R9JA 4HW8A 4QFKA 3G3KA 2HAVA 3FXRA 1XS5A 4P0GA 3O2AA 1P99A 5DVJA 1PBQA 1DSNA 3RTWB 1CE2A 2WKYA 4G8MA 4OZ9A 2ANJA 4KPTA 1B5IA 3RT6B 1UIUA 1QULA 1AMFA 3T9UA 4KD5A 4R6HA 5FHMA 4YAHX 3LSXA 3VLWA 3HV1A 3PD8A 1QUIA 4LA9A 4GOTA 3H03A 5ELVA 1N3WA 4NF4A 2O51A 2QSXA 1R6ZA 1Y1ZA 3RN8A 4LZ7A 4F29A 4R75A 2CMOA 1RYXA 2Q9TA 3VV5A 3ECRA 2V25A 1MM6A 1SBPA 2F7BA 2P2AA 4MLQA 3EQ1A 4IO4A 4PFTA 2DXRA 3HSTA 4BLAA 4ZEFA 1Q1KA 4PE5B 3O28A 5B7DA 4R74A 2W7YA 1OVBA 2O68A 4YU0A 3MPLA 1OIBA 1QKAA 4ZEIA 3SEYA 1PBPA 1SD3A 1LLSA 3CFLA 4R2BA 4ZDMA 3T9HB 3IORA 4C1TA 2XXQA 4G8HA 1MQGA 3C36A 1HSLA 3TUSA 3L6HA 3THIA 3QUJA 4PFUA 1I69A 2AYSA 3PV0E 3VFJA 2FYIA 4WXJA 5L8DA 5EHSA 3I5OA 1DPEA 2PT1A 1JVYA 1O63A 1AL3A 2Z22A 4XTCQ 5ITOA 1VR5A 2ZNSA 1XT8A 1GTKA 1LBCA 4OENA 2I58A 1MS7A 3MVYA 3C32A 3G3FA 3SEVA 3MW0A 2LAOA 1MPCA 2XXRA 2DOJA 2OBGA 4R9GA 1JEVA 3RY3A 3ODBA 5FHNA 5ICQA 2ZYMA 3OSQA 4KHZE 1QUKA 2RC8A 4HCWA 1B3FA 5EHMA 2Y7IA 3PUXE 1Y3NA 4YB6A 2BJJX 1MQHA 2IA4A 3O66A 3SEUA 3QIMA 1FQBA 2ABHA 2UXAA 3KSJA 1FTOA 2QL3A 1B4HA 4E0XA 1SI1A 3GXAA 3O6HA 4I62A 3MAMA 3K00A 3OOAA 1EZOA 1NL5A 3IOUA 3Q29A 1QJMA 2I4CA 4MBPA 5L9OA 4RY1A 5DVIA 1O64A 1LSTA 2XXPA 1WDNA 4I9DA 3RNNA 3HHGA 2OWSA 1H43A 3K6VA 4U22A 1POY1 1II5A 4BDQA 4ELQA 1A55A 4U1OA 1B3LA 2F8DA 3KZGA 2O6AA 3H6WA 1PC3A 4KYEA 1JEUA 2UYEA 4LZ8A 3ONMA 2GH9A 3FJMA 1IITA 4K3FA 4U4XA 3OELA 1GR2A 1N7XA 1QUJA 4KFQA 3EN3A 3QAXA 3C35A 3MWBA 3MP1A 2RC9A 3C4MA 1M5FA 2XXYA 2P1SA 1EU8A 1Z7ME 3D4CA 1B2HA 3U93A 1MH3A 2E1SA 3TQLA 4F1UA 2XD2A 4OESA 4POXA 3TZAA 1ATGA 3TQWA 2F35A 3K6UA 2DWHA 1IQ7A 4U23A 3HCQA 2V3UA 3S2VA 3PU5A 3C9HA 4F1YA 4ECFA 4KR5A 2F5XA 3SEWA 1NMUA 1D9VA 4RJZA 3PGFA 2G93A 2B65A 4IY6A 1LFGA 3MPKA 1IEJA 1JW1A 1IXGA 1AOVA 3VE1B 4X48A 2I49A 3G3GA 3FV1A 4IO5A 1MH4A 4EXLA 4WEPA 3R26A 4HTGA 2Q88A 1R9QA 3W15C 4ESXA 1SYIA 5LOMA 5HM4B 3N5LA 4BDOA 3OENA 3KEIA 4R2FA 4H5GA 4WEDA 5AA2B 4F2QA 1MXXA 1I6BA 2OJTA 3O97A 1B7UA 4OFLA 1A8EA 4XKPA 2PX1A 3S4UA 4ZE8A 1EH3A 3N26A 3PUZE 1BP5A 3U72A 2UVIA 1B7HA 1B0HA 3H4ZA 4KCDA 4JWOA 3H6UA 4ZE9A 3CFXA 1BLFA 4EDPA 2H25A 3RPWA 4POWA 4DXBA 3DLNA 1P1WA 1URSA 3OSRA 2RCBA 3KN7A 2XXHA 3IJXB 3EHTA 1WODA 2I0BA 1MXZA 4H8IA 2IEEA 4YZZA 2XXTA 1UTBA 3PPOA 3VVEA 2QMXA 5H8QB 5IKBA 4IGTA 2RC7A 5KCJB 1Y9UA 4H67A 2X7QA 3E13X 2V3TA 3E9XA 5TPAA 1B05A 4WKMA 2XXXA 3KOTA 1B1HA 1US4A 4ISUA 4GL8A 3N6TA 1P1NA 2XXIA 4OTEA 4BDNA 4IO3A 4H1XA 5BUUA 3OO6A 4G4PA 2H9BA 2OZZA 3QSLA 3QK6A 3QXMA 4TLMB 4AB5A 3U92A 4FIMA 5DEXB 3TPAA 3ZKLA 4GFRA 2ESNA 1LAXA 1JQFA 4RXLA 4MLVA 2F36A 4QRZA 3TEPA 2PT2A 1H76A 4Z0IA 3RUMA 3CG3A 1USYH 2GHAA 5KCJA 4XXUA 2DE2A 2UVJA 3MC2A 4YMBA 3K1PA 4RPOA 1Y4TA 3PUVE 1DPPA 4THIA 3G3IA 4ZZEA 3R6UA 1OQGA 3FV2A 3T93B 5HPQA 3RQTA 3PPNA 4O3CA 3RTFB 1GGGA 2ONRA 1N04A 4RA1A 2Q2AA 5DEXA 1F9BA 4PETA 1FTJA 3MZ9A 3MBPA 1MXUA 3TMGA 4GRKA 1FTMA 3VVDA 3M3FA 1B0LA 1US5A 1ZTYA 4ONYA 4O3BA 2Y7PA 3W9VA 3S9NC 2Z23A 1ZLQA 5JK4A 4M4GA 1N3XA 3D4GA 1B58A 4DXUA 3JV9A 3IAZA 4ESWA 4OQOA 4ND9A 3TTMA 3H06B 4Z7EA 3U1OA 3E3KA 3V8XB 4NF8B 3ILUB 4Q8RA 3TCFA 3V5AA 3TCGA 1Y20A 4LVQA 1MXWA 3UP9A 3U94A 2F97A 1MDQA 5F7VA 3U8QA 2THIA 3SDFA 1B6HA 5AA2D 1PDAA 3S9EA 2Y7RA 3S9LC 3CR9A 5BWJA 1Y3QA 4F1VA 3O6GA 1A40A 1FQFA 1XC1A 3PPRA 1BTJA 3Q25A 1MG1A 4YKKA 2GHBA 3GZGA 1Y1MA 3PPQA 3M3KA 1A99A 1ZJLA 3IR1A 4U1ZA 4X1BA 2Y7KA 4NMYA 3DM0A 4UA8A 2UVGA 4IO2A 1SW4A 1TFAA 4NF8A 2VD3A 3ILTB 4JBZA 2F6PA 3Q28A 3CSBA 4JWXA 1P1UA 1GV8A 1SW5A 2ALUA 2XHDA 4QFPA 3K6XA 4G77A 3MJNA 4EQ9A 1ZKBA 2I48A 2XX8A 3K0VA 1B3GA 2B3FA 3OO9A 3WAFA 2O1MA 2XXUA 4LUBA 4JSDA 4OEVA 3OEKA 3CRBA 2G29A 4F3PA 4PFWA 4U2RA 4Q5TA 4G8NA 5KDTB 1FQAA 4RNSA 2OWTA 1QW0A 3C33A 1MRPA 5CMMA 2O1LA 2P0SA 4HS7A 1SDXA 4GIZA 2V93A 1BIYA 4YB5A 1RKMA 3KFMA 5DT6A 4OFOA 4OHNA 1D3KA 4EXKA 4NF6B 1T0KA 1M5BA 3HHFA 1NNFA 3MVZA 3OEMA 3IO4A 2HCAA 3LC8A 4DXCA 4R9FA 1EZPA 4F22A 2DP8A 1DTZA 4QF9A 3QUFA 2E0SA 4P11A 3I3VA 4NWDA 3RGYA 3T9VA 4QSDA 1IIWA 2F7CA 1IUDA 5IAIA 1MQIA 2DSFA 1N0TA 5KDTA 1XVXA 4C1UA 3LSWA 5CBRA 4IB2A 1JW4A 3K1MA 2Z8FA 2F34A 5ITPA 3LSLA 2UVHA 5I57B 3M3LA 4GXAA 3H7MA 3B7DA 4F31B 4RPNA 2QS3A 4I8CA 4YKPA 3TKDA 1S50A 1Q35A 2PYYA 3UIFA 1MY3A 4F3GA 2NXOA 4NEDA 4YMAA 4NF6A 2V84A 4U4SA 2QS1A 3S9MC 4OVJA 3GBBA 2RF1A 1UTHB 3MVWA 2A5TB 5KZTA 4DDDA 3AXFA 1OQHA 3A3CA 4BDRA 3PUYE 2DVCA 4P0IA 1N76A 3KBRA 4PP0A 1B5JA 2GRVA 3F11A 1FQEA 2I4BA 3VXCA 3K02A 4F19A 3BFTA 4H5FA 2DS9A 4XIGQ 1SVXB 2UYFA 5DTBA 1XOCA 1PB8A 1UTBB 4U21A 2QS4A 2XD3A 4UACA 5I57A 4H8JA 3LR1A 1OVTA 3VLVA 2Z8DA 2QJEA 3P7IA 4PFYA 3TCHA 5TPAB 3MQ9A 5FHOA 4X1DA 3CG1A 4FECA 3CI8A 3B6TA 3TTLA 1UTHA 5CRYA 4JWYA 2A5TA 2NVUB 5B70A 1SYHA 5JTYB 4FEDA 4XKRA 1VE4A 4AQ4A 3HN0A 1FQCA 2ONKE 5I2KA 1DMBA 5JEIA 1VFEA 3PMXA 5TU0A 5TP9B 1PB9A 1MY2A 3CVGA 5ISUA 2QMWA 3T9XB 4N13A 3QYTA 1Y4CA 1BKAA 1LGBC 4F39A 4YKJA 3KN3A 1EZ9A 1YAEA 4GF8A 3FJ7A 3K01A 3O6IA 3Q27A 3H3GA 4FEBA 1B51A 4LQ2A 5FTHA 1HSJA 3IOVA 2O69A 4TQUQ 3K4UA 3T22A 3UA8A 4GLIA 4GQOA 3IOWA 1B3EA 5J1DA 1B5HA 4KI0E 4NF5A 3MZ1A 4YB7A 5JTYA 1NNTA 1ELJA 2AL4A 3PD9A 3DP4A 4L17A 3FVNA 2HEUA 1B32A 1USYE 3KGCA 5TP9A 1URDA 2HZLA 4OETA 2I6EA 1P1OA 1TT1A 1TXFA 1NFTA 4G68B 3FXQA 4BDMA 4ZECA 2DE4A 4G2ZA 1ZMGA 1AH5A 1B4ZA 1NNKA 3BKIB 2OK2A 3K1NA 3IB0A 4TLLB 1LBBA 3FVKA 3O9PA 3VLUA 1MXYA 3IJOB 2DXYA 3O29A 3B6QA 1Y3PA 3MZBA 2I3VA 2F6GA 1QKBA 4AB6A 5CI5A 4GL0A 5CMBA 3N6UA 3BFUA 3H6TA 1SW1A 5H8HB 4FE8A 5F1QA 2O84X 3FVOA 3RLFE 2RINA 4Q0CA 3C31A 4RK2A 3TTNA 4EQ7A 3G7WA 4OERA 4OMBA 4DIGA 4G68A 5I2NB 4H6DA 3N94A 1MY4A 4DCYA 4IO7A 3IOTA 2Z8EA 2REGA 1H3DA 4QFOA 1M5CA 1LCTA 2F78A 2NOOA 3FUZA 4H0WA 4DCXA 2DVZA 3FD3A 3EHUA 4LP2B 3LBSA 4QFNA 1M5DA 2PBWA 3VXBA 3UN6A 3I6VA 1B9JA 1JVXA 2VGQA 1D9YA 3EHSA 2DE3A 3DP6A 2YPNA 5H8HA 3PPPA 3IB2A 1LB9A 1VFDA 3T96B 3GBAA 2XX9A 4GWOA 3SKPA 3KN8A 5DYHA 4I1DA 3VVFA 1N84A 1LAHE 4C0RA 2B3BA 2HFBA 4RYAA 2I3WA 2Q2CA 3TFLA 5CMKA 4LONB 4YICA 3V83A 3FATA 5CMCA 3OXNA 4GVOA 1ANFA 1LCFA 1MM7A 5FTIA 5ICTA 5I2NA 1OLCA 3A09A 4MFIA 1XVYA 3SETA 3DELB 1O7TA 4OEUA 3C34A 3MVXA 3TDJA 2HAUA 3VDFA 2DWAA 5AA4B 3B6WA 3JYRA 3TYHA 4LZ5A 5I84A 5DVFA 3MP6A 2V3QA 1PEBA 1FW0A 4QSCA 1S9TA 4FORA 2ZNTA 4MF3A 3M8UA 4QHQA 3KG2A 3ZS6A 4R73A 5M2VA 2XXVA 2VOZA 4IGRA 3HPIA 4JDFA 3T66A 2ZYKA 2RKMA 1IXIA 4EUOA 3FIRA 4N07A 3UGWA 4LQ5A 1SI0A 5K2YA 2NUVA 1PB7A 1ZIUA 1YTVA 1TWYA 3IK6B 3PUWE 3TTRA 2XX7A 1QVSA 2AIXA 4E0WA 1I6QA 2VP1A 2X26A 5AA4A 3RT8A 3CIJA 1MQDA 2ZYOA 4N6PA 4EF1A 2O7IA 3TTKA 5A5XB 1IZ1A 1TFDA 3MP8A 4TOZA 1D4NA 4ZZAA 3W9WA 1AIVA 1NH8A 1R9LA 3BBRA 1NNPA 1DOTA 1A54A 4KCCA 1KWHA 1UIVA 1N7WA 3KSXA 4LATA 2O7UA 3IB1A 1LFHA 3A3UA 5CC2A 3IL1B 3SEXA 4Q30B 3H6VA 3USDA 1IXCA 4G68C 1ZU0A 3OO8A 2Y7WA 4FATA 3IX1A 3JZJA 1LAGE 4HCYA 1H44A 2D3IA 2OLBA 1R1NA 2M8CA 2PMSA 3ZSFA 3EPEA 1JETA 4M1VA 2ZNUA 3FGSA 5L9MA 3OMBA 5H8NB 2DYXA 5EYFA 3LSFB 2QPQA 3K6WA 1WVJA 5A5XA 4R72A 3G3HA 2DWJA 1FQDA 2NWJA 2H99A 3OO7A 2GFEA 1MXVA 2X7PA 2QRYA 5K2XA 2H4IA 5H8FB 1Z7NE 1B40A 2H98A 1VSOA 4ELOA 1NKXA 1MPDA 3TODA 4ELPA 3FVGA 5I2KB 4GXSB 2I0CA 4ELRA 5H8NA 1MY1A 4XKQA 2KLFA 4NTLA 3WAEA 4OYVA 4MH5A 4OFJA 3Q26A 4F3BA 3KJ7A 4QSEA 1MQJA 1FTLA 5I56B 1L5TA 2REJA 2HQ0A 1RYOA 4O3AA 1URGA 4FAJA 2D21A 3KJTA 5AE4A 1YPNA 3UK4A 1JW5A 5HBCA 5H8FA 4OWDA 1LB8A 1MY0A 2ZXTA 4ZEKA 4KQPA 3FJGA 3TAJA 4JSOA 3DP8A 1UQWA 4NF5B 3MUQA 3E4RA 3K2DA 4EF2A 4QFLA 4NWCA 2HZKA 1S7YA 4R6KA 2H5YA 1YCJA 4RK9A 4DZ1A 2RCAA 4F18A 1XHYA 2ZMBA 1LAFE 4ZEBA 4DE8A 2R6GE 4X9TA 4FJPA 1GVCA 2ONSA 3FXUA 4IY5A 2Q8JA 1OMPA 5I56A 4NE4A 1JNFA 2OCUA 1MPBA 1I6AA 3FASA 2XXWA 3OD7A 1FCKA 3GLBA 2HXWA 1FTKA 3SERA 3HO7A 1B46A 5AA2A 5I59B 3FZVA 4IO6A 4R6YA 3PMWA 1ZBMA 3LUYA 4YKIA 5I58B 3PMVA 5H8SA 4GD5A 2DWIA 4ZS9A 5AA1A 1HSEA 1SW2A 2PVUA 2A5SA 5CM6A 3CSGA 2FA7A 1CB6A 4KYSA 2ZYNA 3SESA 1M5EA 4DLDA 1OLAA 1J1NA 4H65A 1B52A 1H45A 3CFZA 2D5WA 1A7LA 2YJPA 2Q89A 1IXHA 4PQJA 4ZEDA 2AL5A 1B3HA 2YLNA 1DTGA 5L9SA 4F3SA 1A8FA 3UORA 5CBSA 2VHAA 3L6GA 5I59A 1B7ZA 5H8QA 2CZLA 2R71A 4KYDA 3EF7A 1P1QA 1LFIA 3G3JA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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