1DSNA

D60s n-terminal lobe human lactoferrin
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
315
structure length
315
Chain Sequence
RRRSVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRRVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLSGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Altered domain closure and iron binding in transferrins: the crystal structure of the Asp60Ser mutant of the amino-terminal half-molecule of human lactoferrin.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Iron transport protein
molecule keywords LACTOFERRIN
total genus 94
structure length 315
sequence length 315
ec nomenclature
pdb deposition date 1995-12-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1dsnA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1dsnA02
2IA4A 4JWXA 4JWOA 3ZKKA 2F36A 1NNFA 4O3AA 3MP6A 2I49A 4WKMA 3VLVA 1Z7NE 4H67A 2DE4A 3H7MA 4Q30B 5A5XA 3CSBA 1A99A 3FXUA 3K6UA 1DMBA 2XXYA 1II5A 2F6PA 4TQUQ 5BWJA 3KSJA 4OETA 1B7HA 4GFRA 5CBRA 1B6HA 3ILUB 4NEDA 3V5AA 1CB6A 4G2ZA 4BDNA 2XX9A 1ZJLA 3FJ7A 1MXWA 4GD5A 2QL3A 1SI0A 5ISUA 4H5FA 4IO2A 2NUVA 4KPTA 3TQLA 4LUBA 2Q2AA 2V3TA 3RTFB 4ELPA 3K02A 2LAOA 3JZJA 2W7YA 3KJ7A 3UP9A 4ZECA 1M5FA 1DPPA 4FEBA 3MP8A 1XHYA 4K3FA 1R1NA 2AYSA 5CMCA 5H8QA 5I84A 1LLSA 1EH3A 1B5HA 2QS4A 3CR9A 4R6KA 4U2RA 3OO9A 1A8EA 4ESXA 2R71A 5CMKA 1UTBA 4BDMA 5I57B 1B52A 1P99A 4EXLA 3RT6B 1EZPA 3N6TA 1IXCA 1B3LA 1FTOA 4FEDA 3CI8A 4I62A 4QSCA 1BKAA 2H98A 2DWIA 2RC8A 5AA3A 2PMSA 3U8QA 1URDA 2H4IA 1L5TA 3PUYE 2XXWA 2H9BA 4G68C 3C4MA 1BIYA 2DWJA 4OFLA 1YAEA 4QRZA 2X7PA 4DXCA 3K4UA 1OQHA 2GHBA 4GXAA 3PUZE 3K00A 4HCWA 1B05A 4THIA 5L8DA 4HCYA 3QXMA 4H5GA 4FE8A 3SKPA 3TUSA 4F3PA 4JB7A 5KCJA 2Y7WA 2H5YA 4XKQA 3SETA 2DSFA 4U21A 2XHDA 5FTHA 1SW4A 1LGBC 4GOTA 4N13A 1D3KA 1RYXA 4YB6A 5DT6A 3SEYA 3T9XB 1TFDA 3K6WA 2ZYMA 1B51A 2XXXA 3KZGA 2PT2A 1A54A 2DS9A 3E13X 3KG2A 3MPLA 3QAXA 4OXVA 5K2XA 1POTA 4U1OA 3OO7A 4ND9A 2UVJA 3VVDA 3T22A 1MY3A 4JWYA 4LATA 1FQBA 2XXHA 3RNNA 4I9DA 4YZZA 4X1DA 3K6XA 1B32A 4LZ5A 1UTHA 1IIWA 3T93B 3MAMA 5KDTA 1HSLA 3BFUA 4GQOA 1PB7A 1H43A 2A5TA 3IL1B 1Y4CA 1QUKA 5I2NA 4BDLA 5ICTA 3FIRA 1N3XA 1NNTA 3VFJA 5AA2B 1POY1 1A55A 4KQPA 2OK2A 3O6HA 2I4BA 2R9JA 4PETA 3A3UA 1H3DA 2DQVA 2NXOA 2QMWA 4MH5A 1QVSA 3DP4A 3HN0A 3GBAA 3VLWA 4FJPA 5FTIA 4F1UA 1BLFA 1LFHA 2O51A 4EDPA 4YKIA 1ZKBA 4XKPA 1XVYA 3TZAA 1Y20A 2H25A 3GBBA 3M3KA 5I56B 5HM4B 2F78A 3T9HB 1ZLQA 2VHAA 2Q8JA 4YMBA 5JEIA 1UQWA 5JK4A 2ZNUA 4G8NA 1AL3A 1ANFA 2ONSA 3MVYA 1A8FA 1SW2A 4PFTA 1B7ZA 2O84X 1ZMGA 5DVFA 1B2HA 1J1NA 2DVZA 4IY5A 4MF3A 4EQ9A 1NNPA 2HEUA 4OQOA 4ZZEA 2GH9A 2Z8EA 4BLAA 2G29A 3ECRA 4IY6A 1N04A 3CFLA 4WEDA 2HQ0A 5FHOA 3S2VA 4F22A 2XXQA 1M5EA 1B3EA 5CI5A 1EZ9A 1D4NA 4QHQA 1MDQA 1P1UA 5DYHA 4TLMB 4ZZAA 4YMAA 4R74A 3D4GA 4LVQA 4NF4A 4E0XA 4GXSB 1NH7A 3I3VA 4NF6B 3IR1A 3ZKLA 2YLNA 3JV9A 1JEVA 1S50A 2HAUA 3LSXA 2DYXA 1FTJA 2R6GE 2XX8A 3QK6A 1RKMA 4F2OA 1LSTA 2XX7A 3MVWA 5CBSA 5I2KA 5FHNA 1F9BA 5AA4B 1UIUA 3QIMA 1ZTYA 3FXQA 1B3HA 1LAFE 5B7DA 4JBZA 3MJNA 4RNSA 4ZEKA 2FA7A 1WODA 4WEPA 3SEWA 1B58A 1Q1KA 3TCHA 3VXBA 1XVXA 1B5IA 4MLQA 3TMGA 5L9SA 4C0RA 2Y7PA 4IGTA 1Y3PA 4LQ2A 4R2FA 2RC7A 1SYHA 4X9TA 1SI1A 4N6PA 4ZE9A 4NF5B 1FQAA 3H6WA 4NMYA 2BJJX 3K2DA 3T9UA 4ZEDA 1MXYA 4OEUA 4NE4A 5K2YA 3U94A 3O6IA 1I6AA 3KFMA 2RKMA 2UVIA 4QF9A 1B3GA 4F29A 3MP1A 4LQ5A 1MXZA 1P1QA 2DVCA 3V83A 3G3FA 1AIVA 3IJXB 4PFYA 3RQTA 4F1VA 3RGYA 3FJMA 3M8UA 3T96B 1HSJA 4RYAA 5AA1A 4GRKA 1MQHA 2D5WA 1MDP1 3CG1A 4DZ1A 2AIXA 1DTZA 3UK4A 2V93A 3G3HA 3C9HA 1MXUA 2VP1A 3FVKA 3TCFA 1SW5A 2DP8A 4GWOA 4XXUA 4YAHX 3TTLA 5TU0A 5CM6A 3Q25A 3IOVA 5F7VA 1VR5A 1XT8A 1PC3A 3F11A 4ELRA 4GLIA 4ECFA 3UIFA 4OERA 2F97A 1NH8A 2O69A 1VSOA 4OYVA 4PQJA 1M5CA 4DIGA 1JW4A 3KJTA 1ATGA 3KN8A 3ZS6A 2F7AA 3OO8A 4JXIA 2ALUA 1ELJA 1WDNA 4FIMA 4NTLA 2WKYA 4NWDA 1SBPA 1XS5A 1ZIUA 4GIZA 3LUYA 4PFWA 3R6UA 3EHUA 3TELA 3CFXA 1T0KA 1MY1A 2DWHA 2DOJA 4KR5A 4RK9A 3S9LC 2XD2A 1B1HA 2PYYA 4H8JA 3H3GA 3PMWA 1R9LA 3HHGA 4ZEBA 5JTYB 4OTEA 1LB8A 2P2AA 3PGFA 1Y3NA 2QMXA 3K1PA 1JVXA 4HW8A 3L6HA 4HS7A 1MS7A 2A5SA 5ICQA 2RF1A 4XKRA 5KCJB 4MFIA 2Z23A 1XC1A 1YCJA 4X1BA 3V89B 4H6DA 2DE2A 2HZLA 3B6WA 4YKJA 1AH5A 3OEKA 4EF2A 3ODBA 1OLAA 3KN7A 1JNFA 2I0BA 3E4RA 3N5LA 4RA1A 3TKDA 4IO5A 4OFJA 3DP6A 3FUZA 3GZGA 4U1ZA 3VDFA 1AOVA 4JSDA 3E3KA 3R7XA 1S7YA 1ZU0A 5CRYA 3G3GA 1Y4TA 3HSTA 2RC9A 4I8CA 5IAIA 2I58A 4KYEA 4RPOA 1M5BA 1MPDA 5FHMA 4OFOA 2I3VA 4DCYA 2UVGA 3MBPA 3VLUA 3KEIA 3O97A 3C33A 4JDFA 1P1NA 3OOAA 4F3GA 3K0VA 3S9MC 3N94A 1B3FA 3I6VA 3RPWA 3U72A 4C1UA 1OIBA 1OMPA 3OSQA 5H8SA 4O3BA 5F1QA 4X48A 2I48A 3IO6A 1UIVA 4ELQA 2E0SA 4RPNA 1JW5A 1LBCA 5ITPA 5KZTA 2DXRA 1CE2A 2HFBA 4Q0CA 4F19A 3KSXA 3VVFA 3FXRA 5I56A 1P1WA 3H03A 1NFTA 1LAXA 4G68B 4R9FA 4F3BA 1LB9A 2O1LA 3USDA 3OO6A 4AB6A 1PDAA 5BUUA 4Q5TA 3RY3A 2B3BA 4R72A 4U4SA 5H8FA 1MH4A 3SEVA 3C32A 3VE1B 4FATA 3W9WA 3UN6A 3PPRA 3MUQA 1MQDA 1YTVA 4XIGQ 2V25A 4GF8A 2NVUB 1FCKA 1LCFA 2NWJA 4DCXA 1B0HA 1RYOA 1LFIA 1FW0A 4F3SA 1FQFA 3PPQA 3FVNA 3IX1A 2FYIA 1B40A 1N7WA 3IAZA 1N3WA 5AA2D 4KD5A 2QRYA 4EQBA 1QKAA 5H8NA 1JETA 3UGWA 2OWSA 1N7XA 1OVTA 4L17A 3CFZA 2XXVA 3QUFA 3SEUA 3OEMA 4YKKA 2RCAA 3IORA 3PUVE 1NMUA 3FD3A 3KGCA 2ZXTA 5AA4A 1JQFA 3HO7A 2PBWA 2XXIA 2VD2A 3FATA 3Q28A 1O63A 1MXVA 2XXRA 1LCTA 4G8HA 5AA2A 3TTKA 1S9TA 1SD3A 3MPKA 2PX1A 4LONB 4GVOA 4ELOA 4RY1A 3PPPA 1GTKA 1USYE 3Q27A 3RN8A 3IB0A 2O6AA 3U93A 3FJGA 3Q26A 3FVOA 1MY0A 2ABHA 2RINA 3QYTA 4Z7EA 4ONYA 4OVJA 4U23A 1UTHB 4RJZA 2HCAA 4OESA 4QSEA 2DWAA 3WAEA 4OWDA 3PUWE 1PBPA 3B6TA 4NWCA 4OHNA 4TOZA 5CMBA 3UA8A 4LZ8A 1NKXA 1FTKA 1KWHA 3CVGA 3SERA 3T9VA 1B46A 1R6ZA 2I6EA 5L9OA 1EZOA 3JYRA 4KCCA 3K01A 3RT8A 5A5XB 4LP2B 2CZLA 5H8QB 1IUDA 4IO4A 4KYDA 5DVJA 3O9PA 2Q89A 1USYH 3IO4A 3TDJA 3W15C 1DOTA 2QJEA 2E1SA 3IOWA 1Y1ZA 3O66A 4NF4B 4EUOA 2ONKE 1MY4A 3MW0A 3OSRA 3H06B 3TAJA 2O68A 5KDTB 4R6HA 1N76A 3MWBA 1I69A 2D3IA 3O6GA 4R73A 5I2KB 4F39A 3H6TA 1O7TA 4ESWA 1N84A 3B7DA 3FV1A 4RXLA 5ITOA 3RLFE 2QS2A 2X7QA 3S4UA 4Z0IA 3S9NC 3EF7A 1DTGA 3G3KA 3DELB 1MRPA 3TODA 1VFDA 4G4PA 2UYEA 4IO7A 1A40A 1B7UA 3C35A 3MZBA 4N07A 3TTRA 3RUMA 5ELVA 1Y3QA 1Z7ME 4DXBA 3WAFA 3QSLA 4ZE8A 3PMXA 1QW0A 1SVXB 4BDOA 1TWYA 2M8CA 1AMFA 2DXYA 4LZ7A 4MBPA 2AL5A 4BDRA 2I0CA 1US5A 1M5DA 2B3FA 2VGQA 3Q29A 3TTNA 5I59A 3EHTA 3QUJA 2PT1A 3A3CA 4DDDA 1SDXA 3MZ1A 4O3CA 4XTCQ 5M2VA 3IOTA 4RK2A 3LSLA 3ZSFA 4NF5A 4PE5B 2V3UA 2YPNA 2XXPA 2ZMBA 4G68A 4R75A 2GFEA 1FTMA 3IB1A 3O29A 2F34A 2REJA 3FVGA 2ESNA 3OMBA 2OWTA 2OCUA 3VV5A 1JVYA 1IQ7A 1I6BA 3D4CA 3OELA 4QFKA 4XKNA 1MPCA 3IJOB 4OZ9A 3IB2A 4POWA 1B5JA 3IK6B 2HZKA 3S9EA 1US4A 2Q88A 3LR1A 3AXFA 1FTLA 4P0GA 1B4HA 1QKBA 1XOCA 4QFOA 5DEXA 5DTBA 5EHMA 3C34A 1IXGA 1PEBA 2G93A 4MLVA 3LBSA 4QSDA 1R9QA 1IXIA 3PPNA 1IZ1A 5H8HA 3TTMA 3TYHA 3CRBA 2B65A 3DP8A 1WVJA 3FASA 1GVCA 3UORA 3C31A 1URSA 1OQGA 1H44A 2Z8DA 3H6UA 2KLFA 2OBGA 3KN3A 3MVXA 4OENA 1PBQA 4OMBA 2GRVA 2UYFA 4P11A 3TCGA 4AB5A 1SQYA 1H76A 4ZS9A 3HCQA 2F8DA 2IEEA 3LC8A 3G3IA 4G8MA 1NL5A 4KFQA 3O28A 4YICA 1QULA 2NOOA 2Y7IA 1MM6A 2YJPA 4R2BA 4TLLB 2QS1A 3IOUA 4H65A 4QFPA 5L9MA 4F1YA 1MQIA 1MXXA 2Z8FA 4Q8RA 3KOSA 4G77A 3SESA 2F35A 2ZYOA 1LFGA 2Q2CA 3TQWA 2X26A 4NF8A 2P0SA 3DM0A 4M1VA 3TPAA 2GHAA 2Y84A 5J1DA 4IB2A 4F2QA 3PV0E 3K1NA 3DLNA 1LBBA 5I58B 1MM7A 5I58A 2RCBA 5IKBA 1I6QA 3R26A 1BP5A 2THIA 4GL0A 4HTGA 4QFNA 2O7UA 4H8IA 1P1OA 2OZZA 1B4ZA 4R9GA 1PB9A 2ZYNA 1VFEA 3RTWB 5LOMA 5H8HB 1H45A 1LAGE 1MQGA 4KYSA 2CMOA 5EHSA 4DXUA 1IXHA 4YU0A 3PD9A 1B9JA 3MZ9A 2ANJA 1MQJA 1IEJA 3A09A 3M3FA 4ISUA 1Y9UA 1Q35A 2Q9TA 3M3LA 4BDQA 4DLDA 2P1SA 2F7BA 3H6VA 1O64A 2VOZA 5CMMA 4I1DA 2OJTA 1YPNA 3CIJA 1SYIA 4IO3A 3OD7A 1IITA 1MH3A 3PU5A 2XXUA 1MPBA 2UVHA 3O2AA 3T66A 4H0WA 1ZBMA 5EYFA 3I5OA 5I2NB 4H1XA 4QFLA 4ZEIA 1EU8A 1OVBA 2UXAA 4LA9A 4PP0A 1FQDA 4U4XA 1D9VA 3N6UA 3GXAA 4IO6A 4YB5A 5TP9A 2F6GA 2V3QA 2ZYKA 1SW1A 4U22A 3SEXA 3KOTA 5TP9B 3HV1A 3VXCA 4ZDMA 4FECA 3C36A 5HBCA 3V8XB 4UACA 3SDFA 4JSOA 1PB8A 2H99A 3BFTA 2ZNTA 3B6QA 2XXTA 3MVZA 5TPAA 4WXJA 3U1OA 3CSGA 1URGA 2Z22A 3TFLA 2O1MA 4POXA 1D9YA 3LSFB 3THIA 2QS3A 3EHSA 4YKPA 2D21A 2Y7RA 3FV2A 3PUXE 5H8FB 1GV8A 3CG3A 4M4GA 4PFUA 3OENA 1B0LA 3G3JA 4E0WA 1QJMA 1TFAA 3FGSA 3H4ZA 3HPIA 4DE8A 1TXFA 3GLBA 3VVEA 4EXKA 1LAHE 4F31B 4KHZE 3W9VA 1JW1A 2REGA 2AL4A 2PVUA 5DEXB 5CC2A 2I3WA 2VD3A 3HHFA 2F7CA 3K1MA 4YB7A 3MQ9A 1N0TA 1A7LA 1HSEA 2FNCA 1NNKA 3BBRA 3E9XA 3EQ1A 3EPEA 3FZVA 2OLBA 4P0IA 4R6YA 2QPQA 3PD8A 4OEVA 4NF6A 3MC2A 1VE4A 4GL8A 4C1TA 3OXNA 4EF1A 5B70A 2I4CA 5HPQA 3ILTB 4IGRA 3P7IA 1TT1A 3PPOA 4FORA 2ZNSA 2QSXA 4UA8A 4F18A 2DE3A 1QUJA 1JEUA 1UTBB 1Y1MA 3K6VA 3PMVA 4NF8B 3BKIB 2Y7KA 3KBRA 3TEPA 1DSNA 1MG1A 5JTYA 3EN3A 4KCDA 5AE4A 5DVIA 1QUIA 1FQCA 2V84A 2ONRA 4KI0E 1BTJA 2HXWA 3G7WA 5TPAB 4FAJA 5H8NB 2XD3A 5I57A 4AQ4A 3U92A 5I59B 2A5TB 1FQEA 2O7IA 1GR2A 1B1XA 2HAVA 3L6GA 1DPEA 3N26A 1OLCA 3ONMA 3LSWA 1MY2A 4ZEFA 4EQ7A 1GGGA 2F5XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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