1DSNA

D60s n-terminal lobe human lactoferrin
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
315
structure length
315
Chain Sequence
RRRSVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRRVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLSGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Altered domain closure and iron binding in transferrins: the crystal structure of the Asp60Ser mutant of the amino-terminal half-molecule of human lactoferrin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LACTOFERRIN
molecule tags Iron transport protein
source organism Homo sapiens
total genus 94
structure length 315
sequence length 315
ec nomenclature
pdb deposition date 1995-12-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1dsnA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1dsnA02
3M3KA 3OSQA 2KLFA 1OQHA 3I3VA 3VVEA 2Q2CA 3Q26A 4OVJA 2H5YA 4MLVA 1B1HA 1A8FA 3GXAA 1SW4A 4OFOA 3FXRA 1MXYA 3CG3A 4DXCA 2XD2A 2Y84A 2QRYA 2IA4A 5TP9A 1GVCA 2PBWA 1M5FA 4KR5A 4ELRA 5I59A 3RTFB 4GRKA 1Y3QA 4PETA 1JNFA 3K0VA 3MP1A 3O28A 2REGA 1B9JA 4IO2A 3RT8A 3FXQA 3ILTB 4U2RA 1MXVA 4X1BA 5I84A 2Y7IA 3HV1A 2Q8JA 4YKIA 1B1XA 4GIZA 1II5A 2X7PA 4AQ4A 3KOTA 1JW4A 4XKNA 1MXUA 4QRZA 2XX8A 1LAXA 4OWDA 1USYE 4MFIA 1H76A 4H8JA 1AOVA 3RY3A 3OMBA 3U92A 3ECRA 1B3EA 4ELPA 5M2VA 4ISUA 3PPRA 1UTBB 3IAZA 2DWHA 1MQHA 3GBBA 4X9TA 4GQOA 3DP6A 2B65A 4KYEA 1ZMGA 2B3FA 4KCCA 2A5TB 4NWDA 2OWTA 3MJNA 3E9XA 3SEXA 3MVZA 5H8QA 5H8NB 2D21A 1OVBA 1B7UA 4JSDA 3O29A 1H3DA 4QF9A 3TFLA 4X1DA 3MPLA 3H06B 1Q1KA 2DVZA 2V84A 1P1WA 3RQTA 3IO4A 3DELB 1LB8A 3EHUA 4YB5A 5AA2D 1M5BA 4OXVA 3MP6A 2I4BA 2DS9A 1YTVA 3DP4A 2PT1A 1H44A 3H4ZA 4NF5B 3G3KA 1VSOA 3KEIA 2ONKE 3LSXA 3BBRA 4Q8RA 3C32A 2F97A 3N6UA 3IB2A 1Y1ZA 3G3FA 3K6UA 1M5CA 1Y20A 4ZS9A 5B70A 4QFKA 1LFHA 3PMVA 2XXVA 3LBSA 3H6UA 1UTHA 1ZIUA 2Z8FA 2F8DA 1EU8A 3IOWA 1UQWA 1NH7A 3TQWA 3K2DA 2GRVA 2UYEA 1B05A 3U8QA 4F1VA 4H5GA 3OOAA 1URDA 4OHNA 5L9SA 4L17A 1AL3A 1EZPA 4F1YA 5CBRA 1QULA 4KPTA 4R74A 3T93B 3SEVA 1MM7A 2H9BA 3IL1B 5DYHA 3KZGA 4N07A 5I56B 1MY1A 5F1QA 2VOZA 3MPKA 5H8HA 1BIYA 5I57A 1AMFA 3IX1A 1OMPA 5JTYB 3UP9A 1FTMA 1MS7A 1Y9UA 3JYRA 4XKPA 3E13X 5DTBA 2FA7A 4NMYA 5CMCA 2I48A 3TCGA 3Q27A 4FAJA 4QSCA 4WEPA 4EXKA 3LSLA 5I2KB 3KN7A 3B6TA 2GH9A 5L9MA 1ZU0A 3SETA 3QYTA 3UGWA 1SW2A 1A54A 3T9XB 2G29A 4GLIA 2XXIA 2VHAA 3UN6A 3O6HA 4GXSB 2A5TA 2ALUA 2QS1A 4I62A 2I3WA 5I58B 2H4IA 5DT6A 4KQPA 2OZZA 3TPAA 1AH5A 2Z22A 1MY0A 1P99A 1Q35A 5CBSA 5DVJA 1N04A 1SBPA 1N7WA 2HAVA 2UXAA 1S9TA 4H0WA 4OTEA 3UA8A 3S2VA 3T96B 5B7DA 3CG1A 2NOOA 1GGGA 4OESA 2ZYMA 4BDLA 1SI1A 1JEVA 3OEMA 3S4UA 1IITA 1FQBA 3N6TA 3IJOB 3FVOA 2YLNA 5I2NB 4TQUQ 4JWYA 1B7HA 2ESNA 1MRPA 3JV9A 1HSLA 2DE2A 3ONMA 3LUYA 4EQ9A 3MVYA 1S7YA 4DLDA 3S9NC 3T9HB 1IXIA 4G68A 1FTLA 4JWOA 5CM6A 4IY5A 4P0IA 1GV8A 4FECA 4RNSA 3MQ9A 3TUSA 4ZE8A 3E3KA 2AIXA 4LONB 1PBPA 3M3LA 3U93A 2F78A 4ECFA 1L5TA 4I9DA 3C31A 2XXHA 1LAGE 4F3BA 5BWJA 1I6QA 2HEUA 1B32A 3PPOA 4YICA 3CFXA 1NKXA 5EHMA 5L8DA 2VD2A 3PPPA 3K4UA 1VFEA 2RC8A 2OK2A 3GLBA 1H45A 1WVJA 2F7AA 4H5FA 4MF3A 1A55A 3F11A 5TPAB 1R1NA 2HAUA 4LZ5A 3IJXB 5H8FA 4YKPA 3TTMA 1GR2A 5CMMA 2QPQA 3TCFA 5KDTA 1URSA 2HFBA 4BDQA 4DXBA 4FJPA 1FQFA 4NWCA 3RN8A 4MBPA 1MXXA 1N0TA 3TKDA 4P0GA 1NNTA 3MC2A 1NFTA 3S9MC 5A5XA 1R6ZA 2XXXA 3K1NA 3K00A 3IOUA 4NF8A 3OO9A 4IO7A 4EUOA 1R9QA 3CRBA 2H25A 2V3QA 4G68C 3IK6B 3SKPA 1N84A 2Y7PA 4IY6A 4R6YA 3OO8A 2Q88A 5I58A 2R9JA 3CFLA 4P11A 4ZECA 2ZYKA 3K1MA 1WODA 3MVWA 3OO7A 1XC1A 3LSFB 4HS7A 3FV1A 4AB5A 3R26A 4NTLA 2RCBA 1NMUA 2X26A 4RYAA 3K1PA 2V3UA 2F36A 3KOSA 1DSNA 1SI0A 1I6AA 1Y4CA 5I2NA 4H6DA 3MUQA 4XKQA 2ONRA 5TU0A 4YMAA 3BFTA 4PFUA 1DOTA 5KCJB 2A5SA 4ZE9A 1NNKA 4F2OA 1D9YA 5AA2A 1UIUA 2Y7WA 4KI0E 2D5WA 1MQIA 1XOCA 3G7WA 2F6GA 4OMBA 4ZZAA 3USDA 1PDAA 3VE1B 3FXUA 3T66A 3U72A 1B0LA 3G3JA 5AE4A 1F9BA 2D3IA 1JVXA 4Q30B 2UVIA 3Q28A 4G8NA 1Y1MA 4LA9A 3K01A 5EHSA 4LQ5A 4C1UA 2RC9A 3TODA 3D4GA 5TPAA 2O69A 3CR9A 1GTKA 4DZ1A 5KZTA 1ELJA 4U1ZA 4KCDA 3TMGA 4RY1A 2P0SA 3PUXE 2PT2A 4GOTA 4OENA 4JWXA 3V8XB 4E0XA 4RK9A 4TLMB 3PU5A 4BLAA 3H7MA 2AYSA 5ICQA 1H43A 2I4CA 3K02A 5IAIA 2XHDA 5AA4B 3KGCA 3MP8A 1BP5A 3THIA 4O3BA 3G3HA 3FVNA 1DTZA 2W7YA 4PFWA 2O6AA 3TCHA 1FTOA 1MY4A 1N3XA 1JW5A 3DLNA 4Z7EA 2DXRA 2Z23A 1J1NA 3PD9A 3PUWE 4UACA 3CI8A 4E0WA 3PMWA 1N76A 4BDMA 2F5XA 1PC3A 3MAMA 2E0SA 3KJ7A 4OERA 1MQGA 1QUIA 2YPNA 2DQVA 3OEKA 3VFJA 5FTIA 2M8CA 1LFIA 3M3FA 3K6WA 1B46A 1US5A 3P7IA 2H98A 4GVOA 2RINA 4RPOA 2NUVA 1IEJA 3R7XA 1QJMA 2UVHA 5DEXB 1MPDA 3RPWA 3SDFA 3QXMA 1B5HA 1PB8A 1POY1 3I6VA 2QS2A 3RNNA 3MZ1A 3TTNA 3HO7A 5FHOA 1Z7NE 2GHBA 2NXOA 1DPEA 1HSEA 3FGSA 2UVJA 1Y4TA 3MW0A 3IORA 2F7BA 1IIWA 1VE4A 2QSXA 2XXUA 1XVYA 4C1TA 2I58A 4HW8A 3CVGA 4U4XA 1IZ1A 4F29A 2E1SA 3V5AA 2RKMA 3LR1A 2IEEA 4JXIA 4M1VA 1T0KA 1B52A 1YAEA 3RUMA 4ZDMA 4OETA 4OYVA 5HM4B 1FQAA 1Y3NA 1QUJA 2VGQA 3EPEA 3QUJA 4YMBA 2OLBA 1LCFA 1D4NA 3M8UA 1NH8A 4KFQA 2ZNUA 4G2ZA 5DVIA 1SW5A 4R9GA 4F3GA 1UTBA 2F7CA 1D9VA 1Z7ME 3G3GA 4THIA 3FD3A 5AA4A 4ZEBA 1B2HA 4WEDA 4F39A 2DVCA 4JB7A 5H8NA 3FZVA 4RK2A 1ZBMA 4LATA 1OIBA 3HSTA 3PD8A 4NF4B 1B7ZA 3ODBA 3KFMA 2NVUB 1MQJA 2R71A 4YU0A 4GL8A 3TZAA 5BUUA 3VLWA 3QSLA 1XT8A 4O3AA 1P1UA 3B6WA 3GBAA 1TWYA 3PV0E 1NL5A 3OSRA 5CI5A 5H8SA 2XXWA 1LAFE 1TFAA 1MY2A 2DYXA 3OD7A 4ZEFA 2O7UA 1SYIA 1IXHA 4LQ2A 4NF5A 1SQYA 3W9VA 2LAOA 5AA3A 4QHQA 5DEXA 4RJZA 2DP8A 3QAXA 4U21A 1B3GA 3TYHA 2F35A 2PVUA 4JDFA 4F19A 3AXFA 3H03A 1POTA 3OXNA 1YCJA 2FNCA 2XXQA 2XXPA 1LLSA 2RCAA 2HQ0A 5TP9B 4KD5A 2ZYNA 3V83A 5I59B 4G77A 3C36A 3K6VA 1FW0A 1IUDA 3FJGA 3N94A 2I6EA 1VR5A 2OBGA 3MWBA 2F6PA 2OWSA 4QFLA 2HCAA 3OENA 2I0BA 2CZLA 1AIVA 3SEYA 2P2AA 4LP2B 4NE4A 4JSOA 5I56A 3W15C 2PYYA 2VD3A 1B40A 2DWJA 5ITPA 1MY3A 1SD3A 3CSGA 5JTYA 2ZNSA 2HXWA 3ZS6A 4OEVA 3DP8A 3T9VA 2UYFA 4HTGA 3RT6B 5CC2A 3EN3A 3S9LC 4FEDA 3IOTA 4OZ9A 3VXBA 2O68A 1B4HA 4EQ7A 1BLFA 3N26A 5I2KA 1N3WA 2VP1A 1MH4A 1B0HA 1BKAA 4Q5TA 1PBQA 3VVDA 1IXGA 4R9FA 5JK4A 3I5OA 3TEPA 2O7IA 4R73A 3QUFA 4R2BA 1FQDA 4M4GA 4EXLA 1JQFA 4F1UA 1MH3A 1ZTYA 4U22A 4ND9A 1URGA 1PB9A 4U1OA 4X48A 4ONYA 4EF2A 1UIVA 5H8QB 4YKJA 1PB7A 4BDNA 4PFTA 3TDJA 1LBBA 2XD3A 3BKIB 5JEIA 4GL0A 4GXAA 3FASA 3H6WA 1B5IA 4ELOA 3VVFA 5HBCA 3H6VA 5FTHA 2XXTA 1B3HA 1XVXA 1CB6A 1SYHA 4QFPA 2YJPA 4IO6A 3IO6A 1DMBA 1VFDA 4GF8A 3HCQA 4PP0A 1HSJA 3VLVA 2FYIA 4KYSA 1MXWA 1B3LA 4ELQA 3KBRA 3MZ9A 2DWIA 2ZXTA 3TTLA 3K6XA 1EZOA 2AL5A 1MPCA 4TOZA 4F3PA 4DXUA 1YPNA 1UTHB 5J1DA 4BDRA 1MDQA 2QL3A 4POWA 4FORA 4Z0IA 3E4RA 4FE8A 1ZJLA 3KJTA 4F18A 4AB6A 4U4SA 1NNPA 3ZSFA 4FEBA 1P1QA 1ZKBA 3C34A 3PPNA 1FCKA 3L6GA 2ZNTA 4DE8A 3QK6A 5AA1A 2F34A 4GWOA 3CIJA 2OJTA 4YB6A 3TQLA 1MPBA 1LGBC 5DVFA 4OQOA 3EHTA 1QKBA 3KN3A 3RLFE 3WAEA 4H65A 2DOJA 4IO3A 3KSXA 2Y7KA 1SW1A 3LC8A 2Y7RA 4LZ7A 4PE5B 5H8HB 1RYOA 2P1SA 5I57B 1USYH 1P1OA 3FVGA 3O2AA 4DCXA 1OLAA 4MH5A 4R6HA 1A99A 3T9UA 1TT1A 2V93A 2CMOA 1MQDA 5ELVA 1LCTA 3W9WA 3EHSA 4G8MA 1QVSA 3R6UA 1ATGA 3Q29A 4HCWA 4R72A 2WKYA 4LUBA 4BDOA 1FQCA 4R75A 4PFYA 1OLCA 4DIGA 4QFNA 4XKRA 2O1MA 2ONSA 1ANFA 3JZJA 4C0RA 2AL4A 3PUVE 2NWJA 2REJA 3SEWA 2DSFA 1O63A 4YB7A 2Q2AA 1ZLQA 4U23A 1PEBA 3SESA 3O6IA 1JETA 4DDDA 4K3FA 4H1XA 4ZZEA 3ILUB 1FTKA 5L9OA 4DCYA 1QUKA 2Z8EA 4ESXA 4YAHX 4RA1A 3PPQA 3H3GA 4WKMA 2H99A 3FVKA 1OQGA 3IB0A 1I69A 2UVGA 1JW1A 3GZGA 3FATA 2DWAA 4IB2A 2PMSA 4EQBA 3OO6A 5KCJA 2XXRA 3IOVA 3O97A 1D3KA 4XXUA 2B3BA 2QMXA 3T22A 1P1NA 1MM6A 4RPNA 3O9PA 2Q89A 2V3TA 1FTJA 4G68B 1EZ9A 3UIFA 3H6TA 3C35A 3SERA 2BJJX 3A3UA 1OVTA 4F2QA 1O7TA 4ZEKA 2V25A 3TAJA 3FV2A 4H67A 2DE4A 4I1DA 2RF1A 4WXJA 3V89B 3LSWA 3CFZA 3EQ1A 5K2YA 3PUZE 1A40A 3A09A 1MXZA 5FHMA 4OEUA 4QSEA 3G3IA 3RTWB 4GFRA 3UORA 4JBZA 1M5DA 2I0CA 3WAFA 4N6PA 5H8FB 5HPQA 3KN8A 3MVXA 2OCUA 5KDTB 1B4ZA 1WDNA 1MDP1 3QIMA 4EDPA 3BFUA 2HZKA 3B7DA 3C4MA 4PQJA 3KG2A 4F22A 2ZYOA 1BTJA 5A5XB 2RC7A 3PMXA 4OFLA 2ANJA 5EYFA 1XHYA 4NF8B 3U1OA 2GHAA 3N5LA 2I3VA 3HHFA 3KSJA 3VXCA 2XX7A 2QS3A 4UA8A 5CMBA 3SEUA 1EH3A 5CMKA 2THIA 4NF6B 1LAHE 4QSDA 1B5JA 1A8EA 4IGTA 1B6HA 3PUYE 3IB1A 4ZEDA 2ZMBA 4O3CA 1JEUA 1SDXA 2XXYA 3D4CA 4G4PA 1KWHA 2DXYA 2XX9A 1QKAA 4N13A 1B51A 4ESWA 4GD5A 1FQEA 5ICTA 2O84X 4IO4A 3O66A 4R6KA 4EF1A 2Q9TA 3UK4A 1B3FA 4KHZE 4LZ8A 2R6GE 1M5EA 3HPIA 4YKKA 1Y3PA 2O1LA 1RKMA 3TTRA 5ITOA 2Z8DA 5F7VA 1US4A 3Q25A 3TELA 1O64A 5FHNA 4H8IA 2HZLA 1TXFA 4HCYA 4OFJA 3IR1A 3MZBA 2GFEA 3B6QA 4NEDA 1NNFA 3C33A 1I6BA 3EF7A 4XIGQ 4POXA 3PGFA 4RXLA 1CE2A 5AA2B 4YZZA 1N7XA 3MBPA 1S50A 3VV5A 5ISUA 1LBCA 4Q0CA 4KYDA 1R9LA 4LVQA 3C9HA 3U94A 1RYXA 1JVYA 2X7QA 3HHGA 4IGRA 1QW0A 3VDFA 1LSTA 4XTCQ 3TTKA 2PX1A 3OELA 4FATA 4G8HA 1IXCA 3A3CA 4FIMA 5CRYA 3VLUA 1TFDA 3FJMA 2QJEA 1LFGA 4QFOA 3CSBA 4TLLB 4F31B 1DTGA 5IKBA 2QS4A 5LOMA 1MG1A 1A7LA 2G93A 1XS5A 2ABHA 2DE3A 3FUZA 3ZKLA 2QMWA 3HN0A 4NF4A 4R2FA 3RGYA 5K2XA 1B58A 4ZEIA 4IO5A 3S9EA 1DPPA 3FJ7A 3ZKKA 3FIRA 4NF6A 1LB9A 2I49A 1SVXB 4F3SA 4MLQA 3DM0A 3L6HA 3O6GA 2O51A 1IQ7A 4I8CA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3M3KA 3OSQA 2KLFA 1OQHA 3I3VA 3VVEA 2Q2CA 4P1LA 3Q26A 4OVJA 4GBVA 2H5YA 4P56A 4MLVA 1B1HA 1A8FA 3GXAA 1SW4A 4OFOA 3FXRA 1MXYA 3CG3A 4DXCA 2XD2A 2Y84A 2QRYA 2IA4A 1FRPA 5TP9A 1GVCA 2PBWA 3U65A 1M5FA 4KR5A 4ELRA 5I59A 3RTFB 4GRKA 1Y3QA 3B50A 4PETA 1JNFA 3K0VA 3MP1A 3O28A 2REGA 3B8BA 1B9JA 4GBWA 4IO2A 3RT8A 3FXQA 3ILTB 4U2RA 1MXVA 4X1BA 5I84A 2Y7IA 2DDKA 3HV1A 2Q8JA 4YKIA 1B1XA 2OX3A 4GWUA 1FSAA 4GIZA 1II5A 2X7PA 4AQ4A 3KOTA 1JW4A 4XKNA 3RYDA 1MXUA 4QRZA 2XX8A 1LAXA 4OWDA 1USYE 4MFIA 1H76A 4H8JA 1AOVA 3RY3A 3OMBA 3U92A 1KZ8A 4N15A 3ECRA 1B3EA 4ELPA 4JVCA 5M2VA 4ISUA 3PPRA 1UTBB 3IAZA 2DWHA 4MJOA 1MQHA 3GBBA 4X9TA 5LDZA 5ET6A 4GQOA 3DP6A 2B65A 4KYEA 1ZMGA 2B3FA 4PGPA 4KCCA 2A5TB 4NWDA 2OWTA 3MJNA 3E9XA 3SEXA 3MVZA 5H8QA 5H8NB 2D21A 1OVBA 1B7UA 4JSDA 3O29A 1H3DA 4QF9A 3TFLA 4X1DA 3MPLA 3H06B 1Q1KA 2DVZA 2VPNA 4AS4A 2V84A 1RDXA 1P1WA 3RQTA 3IO4A 3DELB 1LB8A 3EHUA 4NG7A 3GYYA 4NAPA 4YB5A 2P3VA 5AA2D 1M5BA 4OXVA 2HHMA 3MP6A 2I4BA 2DS9A 1YTVA 3DP4A 4PFBA 2PT1A 1H44A 3H4ZA 4NF5B 3G3KA 1VSOA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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