1DSNA

D60s n-terminal lobe human lactoferrin
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
315
structure length
315
Chain Sequence
RRRSVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRRVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLSGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Iron transport protein
source organism Homo sapiens
publication title Altered domain closure and iron binding in transferrins: the crystal structure of the Asp60Ser mutant of the amino-terminal half-molecule of human lactoferrin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LACTOFERRIN
total genus 94
structure length 315
sequence length 315
ec nomenclature
pdb deposition date 1995-12-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1dsnA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1dsnA02
4Q30B 3TPAA 4R9FA 2QS3A 1FTOA 3U94A 3SKPA 1JEUA 1N3WA 4P0IA 5AA2D 1MY3A 2O7UA 2XHDA 1MDQA 5TU0A 1EZ9A 1BTJA 1R1NA 5CMKA 3T22A 1DTGA 5I57B 1ZIUA 3Q28A 1AOVA 4LQ5A 4IO3A 5AA2A 1FTJA 4JWXA 1QUKA 3K02A 4G2ZA 4F3SA 3G3KA 3SETA 4FEDA 5L9MA 4RPOA 3O29A 5HM4B 2I3WA 2UXAA 1FQFA 1H44A 5ICQA 2P1SA 3A3CA 5DEXB 1SVXB 2HAUA 1GGGA 1LCTA 3KZGA 3ZS6A 1MXYA 5B7DA 1NNFA 1Y1ZA 4KCDA 2F35A 1XS5A 3IOUA 4KFQA 3WAFA 1SW5A 2XXIA 3FZVA 2OCUA 4YKKA 3SEXA 2ABHA 4PFTA 1J1NA 4R9GA 1B9JA 2F6GA 3IJXB 4JBZA 3R26A 4F22A 2GH9A 2Q8JA 4NF6A 2ZNSA 4QFPA 1JEVA 3TEPA 3RN8A 2A5TB 2QRYA 5TP9A 5DTBA 2AIXA 4P11A 5L9SA 3PPRA 3PMVA 2ZNUA 1Y3NA 3FJMA 1QKBA 2PYYA 4XKRA 4LZ8A 4GIZA 2GHAA 3LSWA 3JV9A 1JNFA 3D4CA 3K6XA 5CC2A 2D3IA 5J1DA 1IXIA 4PETA 4OWDA 5EYFA 1B46A 3M8UA 4RYAA 4OQOA 4F2OA 1ELJA 4WKMA 2H99A 4H1XA 5K2YA 1OVBA 3LBSA 3H06B 2LAOA 5H8HA 3W15C 3MPKA 1RKMA 4OFJA 3LR1A 3OMBA 1LBCA 3CFZA 4I8CA 2OLBA 4HCYA 2YJPA 3VV5A 3IB0A 1O64A 1MH4A 4RY1A 4FORA 1IEJA 3A09A 3F11A 3U1OA 3QK6A 3ILTB 4EQ9A 3SERA 3O6HA 4JXIA 2O68A 4KHZE 2FYIA 1N04A 4N07A 1B32A 4BDMA 1B1HA 4ZEBA 1UTBB 1Y20A 1OLAA 3VLUA 4UA8A 1B4ZA 2QJEA 2DWAA 3DP4A 4QRZA 3TTRA 1NNKA 4ESXA 1QULA 2DE3A 5DVJA 1B7UA 1B58A 3PUYE 2REGA 3K1NA 4RPNA 3MC2A 3VXCA 3Q26A 3CSGA 3SEUA 3T9VA 3KFMA 3H03A 3C31A 3CFLA 4R72A 3DM0A 1M5EA 1UQWA 4U21A 1PBQA 3VE1B 2XX8A 4POXA 3W9WA 2ALUA 1EU8A 4DDDA 3AXFA 1WVJA 5CM6A 1VE4A 4NF8B 2NUVA 3TCGA 3ILUB 1HSEA 4LUBA 1Q35A 3U8QA 5H8QA 3RY3A 1S9TA 4IO7A 2XXXA 3S4UA 3FXUA 1Y3PA 4EF1A 4E0XA 2VOZA 3ZKLA 3S9MC 2PMSA 1SDXA 3T66A 5ITPA 1QW0A 1LAHE 3BKIB 2Y7WA 2Y7PA 3PPOA 5A5XB 1B3FA 1URDA 4R6YA 4RJZA 5KCJA 4IO6A 3HSTA 4R2FA 3SESA 1LFGA 3PUWE 3OSRA 4H67A 2V25A 2NXOA 4PE5B 4MLVA 2NWJA 4F1UA 3PUZE 3TELA 4OYVA 1H76A 2O51A 1GR2A 2X7QA 1A8EA 3FXQA 3U72A 1IZ1A 2F78A 1FQAA 3TUSA 2QS4A 2DQVA 3DP6A 1FQEA 4M4GA 4TOZA 2KLFA 1MM6A 1OLCA 1QUJA 4RA1A 5JK4A 1Q1KA 3CIJA 4HCWA 5I2KA 1TXFA 4QFOA 4YKJA 5EHMA 4PFWA 3OO8A 3I6VA 3V83A 2AL5A 3O66A 3TZAA 3UK4A 1OMPA 4P0GA 3THIA 2XXYA 2Y7KA 1M5FA 3C36A 1N7XA 1LAFE 3CVGA 1NKXA 3KJ7A 2H25A 3R6UA 1B3HA 3GBBA 2DVZA 1FTMA 2XXTA 2DE4A 4NF4A 3IX1A 4NWCA 1EH3A 3MZBA 3QYTA 3DLNA 3H3GA 4X48A 2O84X 3KEIA 4NEDA 2R6GE 1I6QA 3RUMA 4FEBA 1VFDA 1MS7A 3GBAA 5I58B 3T96B 1DPPA 1TT1A 3DELB 4X9TA 3PPPA 1MQJA 1DMBA 4ZEDA 4U1OA 1Z7ME 3G3FA 3RTFB 3SEVA 4FIMA 3K01A 3WAEA 2ZMBA 4OXVA 4H5FA 3MP1A 2UVHA 4GOTA 1WODA 2VGQA 3GLBA 2DWHA 3O9PA 1H3DA 3G3JA 1MY0A 3TMGA 2XXQA 2Z8FA 4F19A 3TTMA 3E9XA 4N6PA 4F1VA 4OETA 3FGSA 4KI0E 3G3IA 2D5WA 5HBCA 5L9OA 4F3GA 1IXCA 3EPEA 3LSLA 3MVYA 1SW1A 5DVIA 4QFLA 4YAHX 4MBPA 3Q25A 3M3KA 1B3EA 1H45A 1B0LA 1D4NA 1ZU0A 5KDTA 1SBPA 1F9BA 4KYEA 2HCAA 3QXMA 4JWOA 5CMBA 1ZMGA 2HZKA 5FHNA 2ZYMA 3MPLA 4BLAA 1D9VA 1Y4TA 2PT1A 1ZJLA 3HHGA 2QS2A 2OWSA 1P1UA 2YPNA 2H98A 1NNTA 2O69A 5H8FB 1B6HA 4R75A 4G68B 2G29A 3UA8A 1B3GA 2Y7RA 1GTKA 4QHQA 1R9LA 4R6KA 4RK9A 3OOAA 1RYXA 1VFEA 2HEUA 3VLWA 1JQFA 2OJTA 1RYOA 2I6EA 3VVFA 4M1VA 4ZEFA 2ZYNA 1NL5A 1ZLQA 1D3KA 1MY1A 5CI5A 2XD2A 1URSA 5JEIA 4ELPA 5I84A 4ZS9A 1YPNA 4RNSA 4YKIA 2DS9A 3S9NC 5FHMA 1MPDA 2R71A 1AIVA 1LAXA 2ONRA 1NNPA 4EDPA 3PPNA 1XT8A 3VFJA 1IUDA 5F7VA 2GRVA 4G77A 4DCXA 4TLMB 3MZ1A 2IEEA 4GWOA 1OQHA 4ZE8A 3RGYA 1BLFA 1HSLA 4X1BA 3G3GA 3TAJA 2Y84A 4IO2A 2ZYKA 2I4BA 1UTHB 2X26A 5TPAB 5JTYB 4LONB 3FVOA 2VP1A 2DWJA 2RC7A 3IOVA 3B6QA 5I56B 3PUVE 1P99A 1VR5A 1DOTA 2FA7A 4LZ7A 4DCYA 4DXCA 3I3VA 4G8NA 3E13X 5I57A 3TCHA 3UN6A 2VD3A 3KN3A 4OVJA 4DE8A 4F18A 5CBSA 2DVCA 2I48A 2Z23A 1IIWA 3K6UA 5BUUA 3B6WA 1B2HA 4U23A 5AA1A 3G3HA 1TFAA 2O1LA 3FJ7A 4HTGA 2XXRA 4BDRA 2BJJX 4G8HA 3KN7A 4E0WA 4RK2A 2V3UA 3H4ZA 2AL4A 4KPTA 5DEXA 3PMXA 3Q27A 3TQLA 4F1YA 1DSNA 1UIVA 2H4IA 4GXAA 3OD7A 3IAZA 3VDFA 1LB8A 4I9DA 5KCJB 3O6IA 2DWIA 4JSOA 2E0SA 1BKAA 3PUXE 2Q88A 3IR1A 3B7DA 3VVEA 1JW1A 3BFUA 3OSQA 3MWBA 1XOCA 3S9EA 4ZDMA 4O3BA 1P1QA 2XXVA 1M5BA 2UVIA 2A5TA 2Q2AA 2RC9A 1MXVA 5LOMA 3FV1A 2ZXTA 2F7BA 3CSBA 3JZJA 3HCQA 3IK6B 1MY2A 3KBRA 5FTHA 3PD8A 5I59B 3IOWA 1USYH 3IORA 3UIFA 4IY6A 4TQUQ 1PBPA 3CR9A 3FD3A 3KG2A 4GL8A 3FV2A 1T0KA 4G4PA 4U22A 3DP8A 4THIA 1MDP1 1USYE 1DPEA 3KOSA 2I58A 4O3AA 1XHYA 4PFUA 3OEMA 1O63A 3T9UA 4FAJA 4EQBA 2PBWA 3CG1A 4XKPA 3U93A 1SI0A 2F8DA 4QF9A 3N26A 2REJA 3K00A 3MBPA 2P2AA 2QSXA 5AA4B 1XVYA 2VD2A 3N6TA 4NWDA 1UTBA 2PVUA 4Z0IA 3T9HB 2Q2CA 3IO4A 3V89B 4ZZEA 4IB2A 3HV1A 1P1WA 1B5JA 3FATA 1LCFA 2UVGA 4OMBA 2HQ0A 2DSFA 5H8NB 3ZKKA 4KYSA 3QAXA 4ELQA 5I2NB 3O6GA 3CRBA 1IITA 2XXHA 4IO4A 2DXRA 4AQ4A 2I4CA 1B3LA 3IO6A 5IAIA 4Q5TA 4ZECA 1NH7A 2I0CA 1L5TA 3USDA 1LBBA 3K6WA 1O7TA 1N84A 4YKPA 3MVZA 4U2RA 4NF8A 1Y9UA 1A99A 3C32A 5CBRA 2Z8EA 3TTNA 2F97A 2Z22A 3IOTA 2I0BA 1PB9A 3B6TA 3MW0A 4ELOA 4MFIA 3V5AA 1AL3A 4JSDA 1CB6A 3HPIA 1PDAA 5CRYA 1FQCA 1FTLA 1OQGA 3P7IA 4YMBA 2X7PA 4EXLA 4Z7EA 3KN8A 2F7CA 1B51A 3RPWA 2G93A 1VSOA 4F3PA 2O6AA 3EHTA 4Q8RA 3IB1A 2ANJA 5K2XA 2F36A 5A5XA 3IJOB 5ISUA 3FVGA 4IY5A 1N3XA 4GF8A 2DOJA 3KJTA 1MQGA 2ONKE 1QJMA 5DVFA 1QVSA 3E3KA 1H43A 3ZSFA 2RC8A 4KR5A 1GVCA 4HW8A 5AA2B 1ANFA 4IGTA 4LA9A 3O28A 2THIA 4K3FA 4G68C 3TKDA 2XX9A 4BDLA 4H8IA 3I5OA 1AMFA 4LATA 1ZKBA 1YAEA 3MAMA 4BDOA 1SQYA 2HZLA 4OESA 3K2DA 4GFRA 5ELVA 1B40A 1MQDA 4OENA 3PU5A 3VLVA 4DLDA 1CE2A 1M5CA 3G7WA 5AE4A 1MQHA 2OWTA 2CZLA 1P1NA 1MRPA 3E4RA 4MH5A 3SEYA 3QUJA 5CMCA 4OHNA 2F7AA 2V93A 5L8DA 2WKYA 4UACA 4NF5A 4NF6B 4GVOA 2RKMA 5BWJA 5ITOA 4GRKA 4GQOA 5TP9B 4G8MA 4H5GA 1SI1A 2AYSA 3OELA 3GXAA 3KOTA 1A7LA 2XXUA 1QUIA 4O3CA 3H6VA 4KQPA 1OIBA 3R7XA 2Y7IA 2OK2A 3TQWA 4X1DA 4FJPA 1SYHA 3VXBA 3RLFE 2IA4A 3TTLA 4YB5A 3UP9A 5I58A 1MY4A 1WDNA 1UIUA 3M3LA 2QMWA 4OFOA 1B05A 3K1PA 5H8HB 2H9BA 2P0SA 2Z8DA 1EZPA 2FNCA 1MQIA 1US5A 3L6GA 1Y3QA 1Y1MA 4OEUA 2XX7A 4AB6A 3FASA 5DYHA 1A54A 4OTEA 4AB5A 2V3TA 3D4GA 1FQBA 1MM7A 2RCBA 3LSFB 3PPQA 1PB7A 1FW0A 4GLIA 2UYEA 3CFXA 4LP2B 4R6HA 5DT6A 3VVDA 3MQ9A 4YICA 1PB8A 3TDJA 2I49A 2RINA 4R74A 3RT8A 3TYHA 1R6ZA 3O2AA 2DYXA 4H8JA 2I3VA 4KYDA 4FECA 4LZ5A 1PEBA 1AH5A 1Y4CA 3EF7A 4KD5A 4NE4A 4ISUA 4GD5A 4OERA 3CI8A 5AA3A 2M8CA 1POTA 3LC8A 5F1QA 2QS1A 2NVUB 3QUFA 4EXKA 3OO7A 5IKBA 1LB9A 4BDQA 1FQDA 3Q29A 4C1UA 1TFDA 5H8FA 3L6HA 1LAGE 4G68A 1NMUA 4N13A 4WEDA 3FVNA 2R9JA 1SW4A 4FE8A 3C35A 4XKQA 3TFLA 5H8QB 2CMOA 1N0TA 4IGRA 4ELRA 4MLQA 3N6UA 2O1MA 4Q0CA 4L17A 1HSJA 1LLSA 3EHSA 4R73A 2HFBA 4F3BA 1IXHA 1QKAA 4ZEKA 1IXGA 3H6WA 1MPCA 3C34A 3EN3A 3H7MA 4YU0A 3LUYA 4TLLB 1I6AA 1YTVA 4LQ2A 4NMYA 3T93B 1B0HA 5FHOA 1B52A 1URGA 4OEVA 4F39A 4EQ7A 2HXWA 3W9VA 1ATGA 4PQJA 3ONMA 2NOOA 4ZZAA 3TTKA 3H6TA 2VHAA 1S50A 4ECFA 4FATA 1UTHA 5TPAA 1NH8A 4DIGA 5JTYA 2XXWA 1LFIA 1FCKA 2QMXA 1ZBMA 3MZ9A 3CG3A 5I56A 3EHUA 1KWHA 2H5YA 4IO5A 4F2QA 1N76A 2B65A 5HPQA 1BIYA 4DZ1A 3UORA 3FVKA 3K6VA 5CMMA 1JETA 4GXSB 5I2KB 2ZYOA 3K4UA 5EHSA 4JDFA 3S9LC 4JWYA 4WXJA 4LVQA 3RQTA 2QL3A 4DXUA 2RF1A 1DTZA 1JVXA 3FIRA 1B1XA 1B7ZA 2GHBA 1MH3A 3MUQA 1JVYA 1LSTA 3KGCA 4YMAA 3OO6A 1I6BA 5H8SA 4EUOA 2UVJA 2GFEA 1SYIA 1JW4A 4POWA 2ZNTA 3TCFA 2HAVA 3GZGA 2F5XA 3V8XB 1B5IA 4EF2A 4XIGQ 3MP6A 3SDFA 1II5A 3FUZA 4NF4B 3C4MA 3S2VA 1MXUA 4QSCA 1LGBC 3M3FA 1FTKA 3T9XB 2XXPA 3HHFA 4QFNA 1OVTA 4PP0A 1EZOA 4RXLA 4U1ZA 3JYRA 3K0VA 2F6PA 3OENA 1M5DA 4ND9A 1B4HA 3C33A 2QPQA 3IB2A 2DE2A 3PV0E 4I62A 4PFYA 4XTCQ 4MF3A 3PD9A 2DXYA 4H65A 3A3UA 1A55A 4KCCA 1MG1A 3RT6B 1SD3A 2Q89A 3N94A 1GV8A 1IQ7A 2UYFA 1YCJA 4YB7A 2DP8A 3KSJA 4ZE9A 5I59A 5B70A 4U4SA 3HO7A 3ODBA 3OXNA 4R2BA 3U92A 3FXRA 1PC3A 3BFTA 2PX1A 4HS7A 1MPBA 2ESNA 1N7WA 1XVXA 2O7IA 1JW5A 4QFKA 1R9QA 4ONYA 1SW2A 2RCAA 3OEKA 2D21A 5KZTA 1MXZA 1A8FA 2ONSA 3OO9A 2B3BA 5M2VA 2E1SA 3H6UA 2PT2A 2OBGA 4NF5B 4ZEIA 4DXBA 4WEPA 1ZTYA 5KDTB 1TWYA 5ICTA 4C1TA 4H6DA 5FTIA 1P1OA 1XC1A 2B3FA 3C9HA 3HN0A 2W7YA 4NTLA 3MP8A 3ECRA 1Z7NE 1D9YA 5AA4A 4YZZA 3RTWB 4BDNA 1BP5A 3RNNA 4QSEA 1MXWA 1I69A 4C0RA 2XD3A 1B7HA 1LFHA 3KSXA 5H8NA 3K1MA 1POY1 1MXXA 4F31B 1A40A 3PGFA 5I2NA 2YLNA 3TODA 3O97A 3SEWA 4QSDA 4XKNA 3QIMA 3N5LA 4OZ9A 3UGWA 3EQ1A 2V84A 1US4A 3MJNA 4JB7A 3FJGA 3BBRA 3PMWA 4I1DA 2Q9TA 2V3QA 2OZZA 4U4XA 4H0WA 1S7YA 3LSXA 4GL0A 1NFTA 4ESWA 3QSLA 2F34A 3IL1B 4OFLA 4F29A 3MVWA 2A5SA 4XXUA 4YB6A 1B5HA 3MVXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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