1LAXA

Crystal structure of male31, a defective folding mutant of maltose-binding protein
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
369
structure length
369
Chain Sequence
b'KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTDPKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRIT'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a defective folding protein
pubmed doi rcsb
molecule keywords MALTOSE-BINDING PROTEIN MUTANT MALE31
source organism Escherichia coli
molecule tags Sugar binding protein
total genus 126
structure length 369
sequence length 369
chains with identical sequence C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-03-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1laxA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1laxA01
4GF8A 4U21A 4DIGA 3KFMA 1B3HA 1MH4A 5I59B 3G3HA 5I56B 1OLCA 4Q0CA 1F9BA 4RYAA 3SEYA 3VXCA 2DVCA 3EQ1A 1A55A 3FXRA 5CBRA 2BJJX 4HW8A 4RPOA 4QFOA 3EHUA 1LAXA 2ZNSA 5A5XB 1RYOA 3G3FA 5DVFA 2XX7A 3T93B 4MH5A 2NOOA 4I62A 4ZECA 5H8HB 2DVZA 1SYHA 4U4XA 2OBGA 1S50A 3T9UA 3B6TA 2XXUA 1MXYA 3TAJA 2H98A 4YKKA 1NH7A 3TYHA 1Z7ME 3PUYE 4RA1A 5I2KB 1P99A 5HPQA 1LBCA 1MY4A 2RKMA 3R26A 5KCJA 1A99A 5TU0A 1BLFA 1D9VA 4Q5TA 2I3VA 4MLVA 1FQAA 2RC9A 3G3IA 4LATA 4ELRA 1NNPA 4XKRA 1EZPA 1T0KA 3IL1B 2QSXA 3LSLA 2DE2A 4TLMB 4LONB 2LAOA 4C1UA 1LCFA 4NWCA 1SW4A 3VLWA 2YJPA 3H4ZA 4X1BA 1JEUA 1R6ZA 1US5A 3RNNA 4IO6A 2H25A 4NF5B 3C4MA 4I1DA 4PFTA 5CMKA 2VHAA 1MQHA 2O69A 3OO7A 1OQHA 3MVYA 1RKMA 4KHZE 1IEJA 1MXUA 3K6VA 1GTKA 1OVBA 4HTGA 3ZKLA 2G93A 1AMFA 3KJTA 2Q2AA 2XX8A 4FAJA 4N6PA 1MY3A 1L5TA 3OSRA 4IO2A 3USDA 1OQGA 1B1HA 1H3DA 5ISUA 3V83A 4WEPA 3VFJA 3C32A 1N7WA 3EN3A 1P1UA 3TPAA 1IXHA 3TTRA 1JW1A 3UP9A 4H1XA 3PMXA 1MPCA 2P1SA 4Q8RA 2NUVA 2VOZA 4FEBA 2QRYA 5K2YA 3QK6A 4GWOA 3I3VA 1JNFA 3LSWA 4E0XA 3R6UA 1VE4A 3SESA 4QFLA 4H67A 3C36A 1MQJA 4IY6A 1POTA 4F1YA 1M5DA 4M1VA 1JVXA 2O7IA 3OO8A 4F3PA 1MPBA 1S9TA 4OTEA 2DWHA 1P1WA 1ZMGA 3M3LA 4MFIA 1SD3A 1DSNA 2Y7RA 3C34A 3VVFA 1FTMA 3GBBA 3MQ9A 2A5TA 4ISUA 2DXYA 1ELJA 2OWSA 4ZEKA 3A09A 2ONSA 3IB2A 1JVYA 4DDDA 4C0RA 4H6DA 4YU0A 3E3KA 2XXXA 3DLNA 4X48A 3UGWA 1Q1KA 4ELPA 4JXIA 3VV5A 1B3FA 1IQ7A 1MH3A 4OEVA 4RY1A 2HAVA 1FTKA 2QL3A 2CZLA 2DQVA 3SEWA 2ANJA 3OXNA 4JB7A 4PE5B 2ZYNA 2REJA 3KZGA 4WXJA 2F36A 4KCCA 2Z23A 1O63A 2FNCA 2IA4A 4G8NA 1A54A 3K1NA 1B7ZA 4JSDA 4YB6A 2H99A 2I3WA 2NXOA 4H65A 4GD5A 1OMPA 3TCHA 3UIFA 5L8DA 2QMXA 3PUWE 2B3BA 3SEVA 1A7LA 3K2DA 4DXCA 3MUQA 3D4GA 1UTHA 2Q2CA 1SI1A 1QKBA 3VVDA 4BDQA 4GIZA 1LB9A 1Y4CA 4Z7EA 3T96B 2O7UA 5B70A 1P1OA 5AA4A 2HQ0A 3W9VA 4RK9A 1SVXB 3K1MA 3FZVA 2UYFA 1B9JA 2FA7A 4P11A 5H8NA 4QFNA 3S9NC 4KQPA 3S2VA 3BFUA 3U94A 1BIYA 1QUJA 4R72A 1PB7A 2DS9A 3GBAA 2F5XA 2OK2A 1KWHA 4X9TA 3IB0A 1O64A 4JWXA 1AL3A 1NL5A 4WKMA 4ZDMA 5ITOA 4C1TA 3FUZA 5K2XA 1MQGA 3MW0A 1UIVA 2IEEA 1FTOA 4LA9A 4O3BA 5DTBA 2QS4A 4R73A 1ZTYA 1M5CA 3FJGA 5AA1A 2AL4A 3FXQA 3T22A 3I5OA 2F7CA 2F97A 4YB7A 4DE8A 1EZOA 2H5YA 1B40A 1B5IA 4GLIA 2DSFA 1B32A 4E0WA 2DOJA 4BDRA 1H45A 5ELVA 2I48A 1M5EA 4G4PA 4BLAA 1ZLQA 1QULA 2KLFA 3TFLA 5JTYA 5DEXA 1JW4A 4KD5A 1B1XA 4F3SA 3MVWA 4JSOA 1CB6A 4KCDA 1FQCA 3LSFB 5DT6A 3U8QA 3S9LC 3MP6A 1MDP1 4KYEA 1A8EA 3KN7A 3K0VA 3MJNA 1QW0A 3H6TA 5AA4B 3T9VA 4GL0A 3DELB 2RCBA 4JWYA 4H5FA 3S9MC 3IB1A 4IO4A 4G68C 3FV2A 2CMOA 5H8NB 2H9BA 5CM6A 5CMCA 2QJEA 4NF5A 4DXBA 2Y7PA 4OESA 4HS7A 3P7IA 4R2BA 2D3IA 2OCUA 5BUUA 2XXVA 2P0SA 5EYFA 1LB8A 2XXIA 4G8MA 3HCQA 4NF4A 1LCTA 5ICQA 3RLFE 3FD3A 2V93A 3W9WA 2I58A 4JBZA 4YMAA 2QS3A 3U1OA 5I2NA 3U92A 1LAHE 3M3KA 1O7TA 1Y1MA 3K6UA 1A8FA 4QSDA 2W7YA 4UA8A 4M4GA 4XXUA 3RQTA 5I84A 1WDNA 4PETA 3KGCA 5F1QA 1B5JA 3T9XB 4YKPA 2A5SA 3K00A 1B2HA 3ILTB 3O29A 5FHMA 4MLQA 3FJ7A 1QJMA 3G3GA 1B3EA 1JETA 1FQFA 3EF7A 5JTYB 5DEXB 3VLVA 4ZEBA 4AB5A 3AXFA 4KYDA 4PQJA 2VD3A 1NNTA 2ZNUA 1XS5A 3B6QA 2Q8JA 2XX9A 1OLAA 4ZZAA 3PMVA 2O6AA 4EDPA 3OSQA 4Z0IA 1MS7A 1UIUA 3UORA 5CMBA 3H7MA 3QIMA 4F3BA 1M5BA 3TDJA 4BDNA 4XKQA 3K4UA 3MVXA 1Z7NE 3ZS6A 5J1DA 2RF1A 1ZJLA 2VGQA 5EHMA 2PBWA 4XKNA 3TCFA 1IXGA 2DWAA 4PP0A 4EQ7A 2OJTA 3CR9A 3H06B 5H8FA 2OLBA 1MRPA 2R6GE 2VD2A 3GZGA 4ZE9A 3HSTA 2V3TA 3PPQA 4DZ1A 2Q9TA 3TELA 2Z22A 3KEIA 4IGRA 3RY3A 1A40A 4F3GA 2XXRA 3MPKA 1UQWA 5L9SA 4NF4B 2I0CA 3BKIB 3CIJA 1GVCA 1DPEA 3DM0A 3PD9A 1MXZA 2H4IA 3U93A 4U4SA 3BBRA 3MP8A 5I2NB 1D4NA 3IOTA 2XXWA 1Y3NA 1AIVA 1POY1 4IO3A 1JW5A 3RGYA 3HPIA 3O6IA 1II5A 3TZAA 1URDA 2Y7WA 1Y20A 2R9JA 4POXA 3EPEA 5CMMA 4FE8A 4P0GA 3CFLA 3KSJA 3MZ9A 4KFQA 1DOTA 1N3WA 3ODBA 2I0BA 2XHDA 3SETA 1B51A 3FV1A 1BTJA 4PFUA 4ZEFA 2OZZA 1FCKA 5HBCA 4OYVA 4TOZA 3CG3A 2PYYA 5AA2B 4ZE8A 1HSEA 4EXLA 2F7AA 1LAFE 2PT1A 1Q35A 3Q26A 3FXUA 1QUIA 4PFYA 3S9EA 3MBPA 4O3AA 1R9QA 3MZ1A 3O2AA 2X26A 4U1ZA 3K6WA 2GRVA 1VR5A 3OENA 3N6TA 1FQEA 1LFGA 1ZIUA 4BDMA 2QS1A 3IX1A 2XD3A 2E0SA 5FHNA 4R2FA 3R7XA 3GXAA 1ZBMA 1PDAA 5H8FB 1SW2A 4QHQA 4XIGQ 4NEDA 2FYIA 1LGBC 3L6HA 3TTLA 4H8IA 1B7UA 3V89B 3S4UA 2HZLA 2F6PA 5DVJA 3CG1A 1RYXA 1EU8A 5FTIA 1NNKA 4OFJA 2Z8DA 2ZYMA 5EHSA 4GRKA 3QAXA 3PGFA 4TLLB 3HHGA 3IO4A 5AA2D 3UA8A 4YKJA 2GHAA 1US4A 3JZJA 1PB8A 4NTLA 1EH3A 3IJXB 3SKPA 4YZZA 4G8HA 3CFZA 3FASA 1SW5A 3PUZE 3IR1A 3MP1A 2REGA 4F19A 2ONRA 2ZXTA 3OEMA 3V5AA 1CE2A 3FATA 4RNSA 3PPRA 1SQYA 2HEUA 4N13A 1SBPA 4RK2A 2UXAA 4F31B 3G3KA 2O84X 3G3JA 4ONYA 1USYH 4FECA 4AQ4A 2HCAA 4XTCQ 1MG1A 4KR5A 5KZTA 3CI8A 4OERA 2AIXA 2Y7KA 2GFEA 1LBBA 4U1OA 2D5WA 1EZ9A 1B6HA 3C35A 3KJ7A 4RPNA 3O97A 1TFAA 2V3QA 3UK4A 1YAEA 5L9MA 1ANFA 3GLBA 4I9DA 4IO7A 5JEIA 4DCXA 1MXWA 2GH9A 1NH8A 3EHTA 1TWYA 2Q89A 1Y3QA 1ZU0A 1URGA 1PBQA 1N04A 3ECRA 1VFEA 3IORA 3C31A 3PU5A 3SDFA 1WODA 2ESNA 3ZSFA 4R9GA 1XHYA 4ZEIA 1FW0A 4OXVA 3IJOB 4LUBA 2I6EA 3TQWA 4NE4A 5AA3A 1S7YA 3H3GA 4LZ7A 1PB9A 3MPLA 1B0LA 1XVXA 5FTHA 5KDTA 3CRBA 2RC8A 4F1UA 3KSXA 3N94A 3VXBA 3OEKA 1HSLA 3TQLA 1VFDA 3KOSA 3H6VA 3IAZA 4L17A 4OEUA 4U2RA 1JEVA 1JQFA 1H44A 3HV1A 3M3FA 2ONKE 3LUYA 3OELA 2R71A 1MY0A 3RPWA 1MQDA 4UACA 4XKPA 1MY1A 5HM4B 3PD8A 1I69A 1TT1A 4FJPA 3K1PA 4OFLA 1N0TA 2M8CA 2PMSA 2G29A 1XOCA 4ESXA 1OVTA 4EXKA 3RUMA 5IKBA 1N84A 3RTFB 4GXSB 4ZEDA 4F22A 3DP8A 4F29A 3DP6A 4LVQA 5I58A 1DTZA 1LAGE 3E4RA 1R9LA 4QSCA 3OMBA 1BKAA 2XXPA 4KI0E 3LBSA 3Q29A 4OVJA 4ELQA 1XT8A 4U22A 3THIA 3VDFA 1FTLA 1QKAA 1PBPA 2RINA 3U72A 1Y4TA 4RXLA 4KPTA 4QSEA 3KBRA 4ECFA 4TQUQ 4BDLA 3LSXA 3TMGA 3MVZA 1UTBA 1MQIA 4FORA 3RN8A 4NF6A 3HO7A 5JK4A 3FVOA 5I57A 2XD2A 2OWTA 2Y7IA 3N6UA 4N07A 4X1DA 3VLUA 2UVGA 3B7DA 2ABHA 2HFBA 4EF1A 1MXXA 4HCWA 3L6GA 4EQBA 2V3UA 2YPNA 5TPAA 4R6KA 1B7HA 4ZS9A 5L9OA 3IOWA 2VP1A 3QUJA 3V8XB 2I4CA 3QYTA 2HZKA 3CFXA 2DE3A 2PX1A 4MBPA 1DPPA 5KDTB 4G68A 3G7WA 2ZMBA 5AA2A 3Q25A 3HN0A 3JYRA 4WEDA 4LZ5A 4NMYA 1B3GA 3K02A 2ALUA 5LOMA 3LC8A 3CVGA 3ZKKA 4F2QA 1B05A 4AB6A 1ZKBA 4JDFA 2HXWA 4IO5A 2QMWA 1MY2A 2F6GA 4OENA 3PUVE 3RTWB 1AH5A 3Q28A 3O9PA 3IOVA 4PFWA 2O1LA 4NWDA 3WAFA 3WAEA 1MPDA 3RT8A 3ILUB 1URSA 1N7XA 2AYSA 2ZYOA 2UVJA 3K6XA 5I58B 2Q88A 1M5FA 3H6UA 4DXUA 4DCYA 5M2VA 4GVOA 3QUFA 3UN6A 1B0HA 1USYE 4ESWA 3FVKA 3O28A 1UTBB 1XVYA 4NF6B 3O66A 4ELOA 3PPNA 5I57B 1IITA 1SI0A 4F39A 3C33A 3KN8A 4H0WA 1SYIA 3F11A 4GQOA 4LZ8A 1IUDA 3E13X 4GOTA 1DMBA 3QXMA 5TPAB 4QF9A 2UVIA 1DTGA 3BFTA 3TTKA 4OHNA 1Y9UA 3M8UA 2V25A 5FHOA 1IXIA 1H76A 3IK6B 2PT2A 1Y3PA 4FIMA 3T9HB 1YPNA 3FJMA 1FQBA 1LSTA 1NNFA 4ZZEA 3PUXE 3H6WA 4G68B 4THIA 2DWIA 3IO6A 4IGTA 4H5GA 4RJZA 2NWJA 2HAUA 3TCGA 1P1NA 4O3CA 3TEPA 3A3UA 3FGSA 1FTJA 3VE1B 3VVEA 4OQOA 3TODA 1D3KA 1NKXA 3I6VA 5BWJA 4ND9A 2B65A 5AE4A 2DXRA 1J1NA 4LP2B 1D9YA 4YMBA 5KCJB 3Q27A 3FVNA 2B3FA 1GV8A 1MM7A 1HSJA 1PC3A 5CI5A 4EF2A 2THIA 3TTMA 3QSLA 3MC2A 4OWDA 3OO9A 1B3LA 2F35A 4GL8A 3T66A 2I4BA 1VSOA 1LFIA 3W15C 2PVUA 3JV9A 4DLDA 4R6HA 2QS2A 4I8CA 2ZNTA 1WVJA 4H8JA 1IIWA 3TKDA 3MWBA 1BP5A 4NF8A 4YAHX 3N26A 3OO6A 3LR1A 2DE4A 4R9FA 3CSGA 3H03A 3K01A 3KG2A 3OOAA 3PMWA 2E1SA 5ITPA 3B6WA 2O51A 1B5HA 1I6BA 4FEDA 1MDQA 4MF3A 4QFPA 1ATGA 4FATA 4IY5A 2DYXA 1FQDA 3FVGA 2I49A 2D21A 3MAMA 5H8SA 2F7BA 1NFTA 3PPPA 5DVIA 2Y84A 2O68A 1I6AA 3RT6B 1H43A 3MZBA 4OZ9A 2XXQA 4YKIA 1OIBA 5CRYA 1IZ1A 5H8QA 4EUOA 2X7QA 5IAIA 2ZYKA 1AOVA 4YB5A 1N76A 1NMUA 4GXAA 2Z8EA 4F2OA 4R74A 5TP9A 4R6YA 4HCYA 3FIRA 1TFDA 2AL5A 2DWJA 3D4CA 3SEUA 2RCAA 2X7PA 1B4ZA 3EHSA 4OFOA 2XXHA 3PV0E 4G2ZA 1B58A 2YLNA 1I6QA 4EQ9A 5I59A 1MM6A 4IB2A 5I56A 3O6HA 5CBSA 1YCJA 2Z8FA 3A3CA 3KN3A 2UYEA 2A5TB 3CSBA 1P1QA 3TTNA 4OETA 3KOTA 2GHBA 1QUKA 2P2AA 4QFKA 5CC2A 5A5XA 1GR2A 4NF8B 3IOUA 4OMBA 5H8HA 1SDXA 4QRZA 4KYSA 2UVHA 1N3XA 2XXYA 1LFHA 4YICA 5I2KA 4K3FA 2XXTA 4F1VA 2O1MA 4Q30B 4JWOA 4P0IA 1TXFA 3SERA 3O6GA 4GFRA 3C9HA 1QVSA 3TUSA 4LQ5A 1SW1A 5DYHA 4BDOA 1LLSA 1B4HA 2RC7A 2F78A 4R75A 3SEXA 4POWA 3HHFA 5B7DA 2V84A 5H8QB 1UTHB 4U23A 2F34A 3DP4A 1GGGA 1Y1ZA 2NVUB 5TP9B 1YTVA 1B46A 5ICTA 3E9XA 5F7VA 4F18A 2F8DA 3N5LA 3OD7A 3PPOA 1IXCA 2QPQA 4LQ2A 1R1NA 3ONMA 2DP8A 1B52A 1PEBA 1XC1A 4G77A 1MXVA 2WKYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4GF8A 4I3YA 4U21A 4DIGA 3KFMA 1B3HA 1MH4A 5I59B 1NI9A 3G3HA 2JJKA 5I56B 5ET5A 1OLCA 4Q0CA 1F9BA 4RYAA 3SEYA 3VXCA 2DVCA 3EQ1A 1A55A 3FXRA 5CBRA 2BJJX 4HW8A 4RPOA 4MNPA 4NGUA 4QFOA 3EHUA 1LAXA 2ZNSA 1FBHA 5A5XB 1RYOA 4QBAA 3G3FA 5DVFA 2XX7A 4GWYA 1EYIA 3T93B 4MH5A 3IFCA 2NOOA 4I62A 4ZECA 5H8HB 2DVZA 1SYHA 4U4XA 2OBGA 1S50A 3T9UA 3B6TA 2XXUA 1MXYA 3TAJA 2H98A 4YKKA 1NH7A 3TYHA 1Z7ME 4P9KA 3PUYE 4RA1A 5I2KB 1P99A 5HPQA 1LBCA 4GWXA 1MY4A 3U65A 1EYJA 4PTKA 3T0JA 2RKMA 3R26A 5KCJA 4OVSA 1A99A 5TU0A 1BLFA 2WYKA 2QFLA 4MAGA 1FPBA 1D9VA 4Q5TA 2I3VA 4MLVA 1FQAA 2FBPA 2RC9A 4NG7A 3G3IA 4LATA 4ELRA 1QGXA 1NNPA 4XKRA 1EZPA 1T0KA 1CNQA 3IL1B 2QSXA 3LSLA 2DE2A 4TLMB 3BIGA 4LONB 2LAOA 2B4LA 4C1UA 1LCFA 4NWCA 1SW4A 3VLWA 2YJPA 3H4ZA 1KZ8A 4X1BA 1JEUA 1R6ZA 1US5A 3RNNA 4IO6A 2H25A 4NF5B 3C4MA 2XWOA 4I1DA 4PFTA 5CMKA 2VHAA 4PGNA 2BJIA 1MQHA 2O69A 3OO7A 1OQHA 3MVYA 1RKMA 4KHZE 1IEJA 1MXUA 3K6VA 1GTKA 4HTGA 1OVBA 3ZKLA 2G93A 1AMFA 3KJTA 2Q2AA 4MX6A 2XX8A 2QVVA 4FAJA 4N6PA 1MY3A 1L5TA 2HHMA 4N6KA 3OSRA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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