4LZ8A

Crystal structures of glur2 ligand-binding-domain in complex with glutamate and positive allosteric modulators
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Discovery and Characterization of a Novel Dihydroisoxazole Class of alpha-Amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazolepropionic acid (AMPA) Receptor Potentiators.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 86
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-31
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4lz8A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4lz8A02
5DT6A 4PFYA 3IO6A 3OO6A 4F1UA 3H4ZA 2ZYOA 1OQGA 1YAEA 3MJNA 3QUJA 5L9SA 2CMOA 3MAMA 2OK2A 4GL8A 2V84A 1AMFA 3H03A 3RN8A 4TLMB 1BKAA 5AA4B 1US5A 4MLQA 3MP8A 5L9MA 1O7TA 1NMUA 2DVCA 4GFRA 2E0SA 2THIA 2B3FA 3EHSA 1LAGE 1H3DA 2UVHA 2REJA 4MFIA 3I5OA 3TFLA 4EF2A 2I49A 2QL3A 4OERA 2RC7A 1QW0A 1A8FA 4LZ8A 4H6DA 4LQ2A 2HEUA 3CSGA 1ATGA 4DXBA 2HAVA 1MPDA 2O7UA 3TCHA 1B32A 2FNCA 4BDLA 3DM0A 3MUQA 4NF5B 1QUJA 1B58A 5I2KA 4DXUA 2XXTA 4H8JA 5CI5A 3UK4A 4GD5A 3HO7A 3FV1A 1I6AA 4ISUA 4DLDA 3TQWA 4OEVA 4QSEA 4Z0IA 5FTIA 5AA2D 1USYE 2PBWA 2YPNA 2REGA 3D4CA 3Q25A 3V83A 3O6HA 2ZXTA 1LAHE 2HZLA 4R6YA 3H6VA 2VP1A 2I3WA 2E1SA 3S9MC 2GRVA 3OSRA 4H67A 3HN0A 1BP5A 3K6VA 2UVJA 3Q28A 4HTGA 3QAXA 2ZYMA 3S9LC 4GQOA 1FQAA 4KPTA 1AIVA 1SYIA 5B70A 3M8UA 4OWDA 4X1DA 1Z7NE 1P1WA 3IOWA 1LBCA 1BLFA 1XC1A 1NNPA 3MWBA 2RC9A 3TTMA 1DMBA 3HSTA 1A40A 4G68A 1DPPA 2XD2A 2A5TB 5DVJA 5KDTA 1QKAA 3B6QA 2QJEA 1MQDA 5CMCA 1B4HA 3E4RA 1RKMA 4F31B 3SEXA 3LC8A 3GLBA 1UIVA 1Q1KA 3S9EA 2P0SA 4F19A 4I1DA 1EU8A 4PFWA 4E0XA 3S9NC 4NF8B 1MXWA 1N3XA 4JDFA 4C1UA 4ND9A 4JSDA 2PMSA 4EF1A 1LFHA 1LB8A 5EHMA 3QIMA 3PUXE 3R26A 3T9XB 2AIXA 5HPQA 2DWIA 2O84X 3IB0A 4MLVA 1TFAA 2HAUA 2UVGA 1XVXA 4RY1A 1IXIA 3IORA 3KN3A 4P11A 1JW5A 3V8XB 5I84A 4RXLA 1Y3NA 1B0HA 1N84A 1IUDA 3MZ1A 3U1OA 4OHNA 3O29A 1MXYA 3KFMA 1RYXA 1ZMGA 2R9JA 3U93A 3IOTA 2P2AA 1MPCA 3FVKA 5DVFA 5HM4B 2ESNA 4YZZA 5BWJA 3E9XA 1A55A 2AL4A 1URGA 1DPEA 1B3LA 2DS9A 3DELB 3K6UA 2QS4A 3LUYA 1QJMA 4KHZE 4HW8A 1A7LA 4C1TA 4R72A 2A5TA 1WODA 3M3KA 3TQLA 4OXVA 4FECA 2DOJA 4EQBA 4AB5A 1WVJA 4LZ7A 1TFDA 4F29A 4ZECA 3MP1A 1A8EA 4XKQA 2Q2CA 1P1QA 3RUMA 3M3FA 4KI0E 3KJ7A 4QSCA 2WKYA 1S9TA 3MVWA 4PFUA 3OOAA 3S4UA 3PV0E 4POXA 3SDFA 2UXAA 3MC2A 4GWOA 5TP9A 4NF6B 4PE5B 3FVOA 1Y3QA 1D9YA 2F5XA 4ELOA 2ANJA 3TTLA 3JZJA 4N6PA 1VFDA 1ELJA 2Y7IA 3RTWB 1EH3A 3FIRA 1AL3A 2I58A 1MY2A 2GHBA 1P99A 4L17A 2XX9A 2XXXA 1EZPA 5H8HB 4R6HA 4ESWA 3ECRA 3ONMA 3W9WA 2XXIA 3N6TA 4OFLA 3TTKA 1A99A 4O3AA 1NNKA 3PU5A 1JETA 5ISUA 4H65A 3VVFA 1D9VA 2HFBA 4BDQA 2Z22A 3FGSA 4E0WA 1N0TA 4LVQA 5H8SA 4AQ4A 3MPKA 4BLAA 3TKDA 4PQJA 4IO7A 3IAZA 4JBZA 3ZKLA 3IL1B 4R9GA 3UORA 4GXSB 3D4GA 4H5FA 4FEDA 1XS5A 4I9DA 2ONRA 1B3FA 1B7HA 2F78A 3QK6A 5DTBA 1NH8A 1UTHB 4ZDMA 2OWSA 2XX8A 3VVEA 3E13X 3PPPA 3O28A 4NF6A 1US4A 4YB6A 4OTEA 2PX1A 1DOTA 3SEUA 5I59A 3OENA 4ZE9A 3T9VA 1FQCA 1B7UA 3L6GA 5FHNA 3TEPA 4R73A 5I2KB 4KR5A 3TCFA 1S7YA 3RPWA 4U4SA 3OELA 4QFLA 1JEUA 5F7VA 3FATA 1UTBB 4NE4A 3FUZA 5H8HA 3U94A 2GH9A 4BDRA 1MQIA 2HZKA 2NVUB 1GTKA 2BJJX 1EZ9A 3UIFA 3B7DA 3SETA 2H99A 2H25A 2NXOA 1OLCA 2DE2A 3EQ1A 1FW0A 1B52A 1Z7ME 1Y9UA 4GRKA 3PMXA 4LQ5A 3RTFB 1FQDA 3TZAA 3RQTA 1M5FA 4MBPA 1LSTA 5J1DA 3RT6B 3TUSA 1BTJA 2NOOA 1CB6A 1JQFA 4ESXA 5CC2A 1ZKBA 4LZ5A 4QF9A 2O1LA 2RKMA 3LR1A 1R1NA 2OZZA 3EHTA 5B7DA 4RYAA 3G7WA 1UTHA 4TQUQ 4QSDA 4YMAA 2Q89A 4G68B 3PPNA 2OWTA 3VVDA 4F1YA 3UN6A 1R9LA 3K0VA 4RK2A 1SW1A 5KDTB 3AXFA 4FORA 1KWHA 4OETA 2B65A 1OMPA 1MDP1 2KLFA 3VXCA 3A3CA 4M1VA 1O64A 2P1SA 2Z8FA 1M5DA 3FJGA 3R6UA 4U1OA 3FJMA 1MM7A 4GLIA 3Q27A 1UTBA 5ELVA 1DTGA 4QRZA 3IJOB 2A5SA 1WDNA 4ELRA 2RINA 3ODBA 1QULA 3SERA 4FEBA 3PUVE 5ICQA 2DP8A 2RCBA 4TOZA 1O63A 4P0IA 4IO3A 5FTHA 1GR2A 3CR9A 1USYH 3IB2A 4FATA 1MY3A 3CSBA 4IB2A 1IEJA 1IIWA 1VSOA 4KYEA 1ZLQA 3O9PA 3RGYA 1IXHA 2AL5A 2W7YA 3C35A 1N04A 1CE2A 1XOCA 3CIJA 4YAHX 1M5EA 3KBRA 5ICTA 3GZGA 4MH5A 3G3GA 3RY3A 2Y7RA 1YTVA 3I6VA 3SESA 4G4PA 5IKBA 4QFOA 3KGCA 4R6KA 1Y20A 4JWXA 2ZYNA 4BDNA 4LP2B 4YU0A 3ILUB 4O3CA 1HSEA 3V5AA 4C0RA 3RNNA 2V3TA 3BFTA 2F36A 3O6IA 2H4IA 3PD8A 1NL5A 1FCKA 1H76A 3PMVA 5CM6A 3MPLA 1B5JA 2D21A 4F2OA 4IO5A 5TP9B 4IY6A 1MY1A 1POTA 3RLFE 1URDA 1DTZA 3KOSA 3IO4A 2X7PA 3F11A 3IOVA 5CRYA 1I6BA 1NNFA 1ZBMA 1PBPA 3HCQA 1XHYA 1VFEA 4GF8A 1B5IA 1IXCA 4G8MA 2VD3A 3MBPA 3P7IA 3OO9A 3GXAA 4DE8A 5KCJA 3MW0A 1OQHA 4QHQA 4WXJA 1N76A 1TXFA 3O6GA 1LFGA 3CVGA 5JEIA 3HHFA 3VDFA 4JB7A 2QS2A 4DCYA 3LSWA 3T66A 3MQ9A 2VGQA 5AA1A 4JWYA 3Q26A 4Z7EA 3K6XA 3VE1B 1J1NA 5EHSA 3G3FA 2I0BA 4O3BA 2IEEA 3T9HB 4OVJA 1YCJA 1PB8A 2CZLA 3K2DA 4XKRA 4KYDA 1GGGA 3U72A 1QKBA 3TDJA 1NNTA 4GOTA 2O69A 4RK9A 1N7WA 1MY4A 1ZIUA 4OENA 3FVNA 3UA8A 3FVGA 3PD9A 1JEVA 4KCDA 5A5XB 3CI8A 1FTKA 2XXPA 3K4UA 4U2RA 4WEDA 3UGWA 3N6UA 2F8DA 3GBAA 3K00A 4YKPA 3VLVA 2DYXA 1D4NA 3MP6A 1B3HA 1SYHA 3OSQA 3QYTA 3OO7A 4P0GA 5DEXB 1TWYA 1MQJA 4G2ZA 1QVSA 1VE4A 5CMKA 4OMBA 3TODA 3L6HA 1MS7A 4LUBA 1A54A 3PGFA 4OZ9A 2H9BA 4QFNA 5I59B 1LCTA 1JW1A 3G3KA 2I3VA 3KSXA 4H8IA 3EN3A 4I8CA 1P1OA 4GXAA 1EZOA 1LGBC 2Z8DA 2XXQA 4G8NA 1AH5A 2UYFA 3KN7A 4NMYA 3SEWA 4ZZAA 3TPAA 1H43A 2OBGA 1FTOA 2DXRA 1SW5A 2PVUA 3TTRA 4R75A 2Y7PA 2HCAA 4OESA 4LONB 1IITA 4DZ1A 1AOVA 1LBBA 5H8QA 4DCXA 1ZJLA 2FA7A 4WEPA 3OO8A 3EF7A 3C9HA 2QS3A 3VFJA 1BIYA 5JK4A 1LAXA 2R71A 4M4GA 4THIA 2XXUA 2XD3A 2O68A 2Y7WA 4U1ZA 4GVOA 2QMWA 1L5TA 2R6GE 5EYFA 4YKKA 3WAFA 1OVTA 5CMMA 5A5XA 5FHMA 2HXWA 3CRBA 1H45A 3EPEA 1FTJA 3CFXA 3C34A 3C36A 2ALUA 3KZGA 3PUYE 5CMBA 3G3IA 4G77A 1I6QA 3SEVA 5DEXA 1PB9A 2ONSA 2V3UA 4IGRA 4ZEIA 3T9UA 5KZTA 3K1PA 4ELPA 1N3WA 3B6TA 1MH4A 3JV9A 4LA9A 3TCGA 5AA3A 1B1HA 3E3KA 4IO2A 2DWHA 3KSJA 3HV1A 1FQEA 2M8CA 1TT1A 2Q9TA 2QMXA 2XX7A 3MVYA 4TLLB 4OYVA 5I57B 1MQHA 1LCFA 2V93A 3IR1A 4NWCA 1MPBA 1SBPA 5CBSA 4X1BA 2QS1A 1B3EA 1LFIA 4KCCA 5FHOA 1H44A 3H7MA 3CFZA 1GVCA 4H5GA 3HPIA 2VHAA 3W15C 3H6UA 1D3KA 4RPNA 4JWOA 3QXMA 4YICA 3IK6B 1M5BA 1OLAA 4X9TA 3FXUA 5JTYA 1NKXA 3EHUA 3FASA 3S2VA 2ZNUA 3USDA 1T0KA 3T96B 2D5WA 1PB7A 4NTLA 4PETA 4F2QA 1HSLA 1MXUA 3PPOA 2X7QA 3VLUA 4ELQA 4IY5A 1MQGA 4R2BA 3MZ9A 4YMBA 5IAIA 3H06B 1SQYA 1R9QA 4DXCA 2DSFA 1MM6A 2Q8JA 3KG2A 3HHGA 5H8FB 2RC8A 2Z8EA 1B5HA 4FE8A 3ZSFA 5K2XA 2YJPA 3WAEA 4OEUA 2OJTA 2F6PA 4OQOA 1OVBA 2UYEA 4XIGQ 2HQ0A 4OFOA 2VD2A 3OXNA 2V3QA 5I57A 5CBRA 1VR5A 2ZMBA 4EUOA 5AE4A 5I2NA 1JW4A 3QSLA 4EXKA 3C32A 3O2AA 3OEMA 5DYHA 3N94A 3LSLA 5DVIA 4RPOA 3IOUA 3H6WA 4UACA 1ZTYA 3KOTA 3PUZE 1Y4CA 5TPAB 3CG3A 3KEIA 5TU0A 4X48A 4NF4A 5KCJB 2I4BA 4YB7A 1LB9A 3BBRA 3K1NA 2F35A 1MRPA 3I3VA 2Z23A 4U4XA 2IA4A 1PEBA 2Q2AA 2Q88A 1B40A 1F9BA 4F22A 3RT8A 4OFJA 2ABHA 2G93A 4KQPA 5AA4A 4ZZEA 3PPRA 1SVXB 2QPQA 2F7BA 3O66A 4RJZA 2DVZA 5H8FA 2O51A 2B3BA 1MXVA 3C4MA 3DLNA 4N07A 1LLSA 3B6WA 2PT2A 4R74A 5LOMA 4Q30B 4N13A 3GBBA 1B3GA 3VXBA 3C31A 2GFEA 3MZBA 1B9JA 3ILTB 2XXHA 3VLWA 1DSNA 4F3BA 3BFUA 2I48A 1Y3PA 1URSA 1UIUA 3TTNA 2XXWA 3N26A 4Q5TA 1R6ZA 3U92A 4NF5A 2Y84A 3SEYA 4DIGA 4BDOA 3G3HA 2DQVA 3DP6A 4NEDA 4EQ7A 3TMGA 2XHDA 1B0LA 5AA2B 1SI1A 5TPAA 4LATA 1MY0A 1M5CA 4QFKA 5M2VA 3H3GA 1IQ7A 3IJXB 4U22A 1PDAA 4U23A 1MH3A 2H98A 3H6TA 4PP0A 2RF1A 2DE4A 3KJTA 3M3LA 2LAOA 1B7ZA 1B4ZA 1NH7A 3R7XA 4YKJA 3Q29A 3C33A 1MG1A 3DP8A 3LBSA 4FJPA 4WKMA 3VV5A 4NWDA 4IGTA 4FIMA 3ZS6A 1YPNA 5H8QB 4AB6A 3K01A 1MDQA 4H0WA 4PFTA 2ONKE 2RCAA 1XVYA 1B6HA 4F3PA 1JVXA 1SW4A 4EDPA 3MVXA 2QRYA 1XT8A 3SKPA 2QSXA 4F39A 2PT1A 4MF3A 1SD3A 2X26A 4QFPA 3BKIB 1Y1MA 1Y4TA 3OEKA 3FD3A 5L9OA 4ZS9A 2DXYA 1GV8A 3O97A 2NWJA 5I56B 3IX1A 5F1QA 2ZNSA 4G8HA 5H8NB 2FYIA 3PUWE 4YB5A 2F34A 3A3UA 1POY1 3THIA 1B51A 1RYOA 5K2YA 4DDDA 5AA2A 4NF8A 5I58B 5BUUA 4IO4A 1FTMA 1SW2A 1B05A 2DWAA 4ECFA 4BDMA 4ZEKA 4GIZA 4XKNA 3CG1A 3FZVA 2F7AA 2XXYA 3FXQA 3TAJA 4F3SA 4FAJA 2F7CA 2ZYKA 4R2FA 1IXGA 3V89B 3IB1A 1PBQA 5L8DA 3OD7A 4XXUA 1P1NA 4ZEFA 4HCWA 4JXIA 1SI0A 3K02A 3FXRA 2I4CA 4HCYA 3W9VA 4Q0CA 4UA8A 3A09A 4Q8RA 3T22A 5ITOA 3U8QA 4XKPA 2O1MA 3T93B 4YKIA 4ZEDA 2Y7KA 2O7IA 3PMWA 1HSJA 1MXXA 5JTYB 2PYYA 4RA1A 4K3FA 1UQWA 4ONYA 2DE3A 3CFLA 1FQBA 4KD5A 3FV2A 4KYSA 1JVYA 2G29A 3K1MA 2UVIA 3FJ7A 1B46A 2VOZA 5I56A 4XTCQ 4G68C 3TELA 3N5LA 1ANFA 5H8NA 4I62A 4POWA 1FTLA 5ITPA 3ZKKA 5I58A 3QUFA 4GL0A 2I0CA 1N7XA 2YLNA 1FQFA 4U21A 1B1XA 1PC3A 1OIBA 4F1VA 2GHAA 3LSXA 4EQ9A 2F97A 1Y1ZA 4ZEBA 4EXLA 3MVZA 4JSOA 4R9FA 3OMBA 2F6GA 1ZU0A 2NUVA 2AYSA 4ZE8A 2XXVA 4RNSA 3LSFB 3TYHA 1QUIA 3G3JA 1P1UA 2DWJA 5I2NB 2V25A 1S50A 4IO6A 1B2HA 1IZ1A 2ZNTA 4F3GA 4KFQA 2O6AA 2I6EA 3JYRA 1JNFA 3DP4A 3UP9A 2D3IA 4HS7A 1I69A 4F18A 3KN8A 2H5YA 4NF4B 1LAFE 4H1XA 2XXRA 2OLBA 1Q35A 1QUKA 1SDXA 1NFTA 1MXZA 2OCUA 3PPQA 5HBCA 1II5A 3K6WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4GWZA 5ET5A 5DT6A 4PFYA 3IO6A 1RDYA 3OO6A 4F1UA 3H4ZA 2ZYOA 1OQGA 1YAEA 3MJNA 3QUJA 1QGXA 5L9SA 2F3DA 2CMOA 3GYYA 3MAMA 2OK2A 4GL8A 2V84A 1AMFA 3H03A 3RN8A 4TLMB 1BKAA 5AA4B 1US5A 4MLQA 3MP8A 5L9MA 1O7TA 1NMUA 2DVCA 4GFRA 2E0SA 4GBVA 2R8TA 2THIA 2B3FA 3EHSA 3FXBA 1LAGE 1H3DA 2UVHA 2REJA 4MFIA 3I5OA 1EYJA 3TFLA 4EF2A 2I49A 2QL3A 4OERA 2RC7A 5LTCA 1QW0A 1A8FA 4LZ8A 4H6DA 1CNQA 4LQ2A 4O7MA 1FJ9A 2HEUA 3CSGA 1ATGA 4DXBA 2HAVA 2HXRA 1MPDA 2O7UA 3TCHA 1B32A 2FNCA 4BDLA 3DM0A 3MUQA 4NF5B 1QUJA 1B58A 5I2KA 4DXUA 2XXTA 4H8JA 4P1EA 5CI5A 3UK4A 1NV7A 4GD5A 3HO7A 3FV1A 2XWVA 1I6AA 4PFIA 4ISUA 4DLDA 3TQWA 4OEVA 4QSEA 4Z0IA 5FTIA 5AA2D 1USYE 2PBWA 2YPNA 2Q74A 2REGA 3D4CA 2QVUA 2HPGA 2V4CA 3Q25A 3V83A 5IGAA 3O6HA 2ZXTA 1LAHE 2QVRA 2HZLA 4P47A 4R6YA 3H6VA 2VP1A 2I3WA 2E1SA 4FBPA 2XWIA 4MJOA 2CEYA 3S9MC 2GRVA 3OSRA 4H67A 3HN0A 1BP5A 3K6VA 2UVJA 3Q28A 4HTGA 3QAXA 2ZYMA 3S9LC 4GQOA 4OANA 5J16A 1FQAA 4KPTA 1AIVA 1SYIA 5B70A 4P1LA 3M8UA 4OWDA 4X1DA 1Z7NE 1P1WA 3IOWA 1LBCA 1BLFA 1XC1A 1NNPA 3MWBA 2RC9A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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