4LZ8A

Crystal structures of glur2 ligand-binding-domain in complex with glutamate and positive allosteric modulators
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Discovery and Characterization of a Novel Dihydroisoxazole Class of alpha-Amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazolepropionic acid (AMPA) Receptor Potentiators.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 86
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-31
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4lz8A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4lz8A02
1N7WA 2ALUA 3N5LA 1PBPA 1LLSA 3HO7A 4LQ2A 1XHYA 4F1VA 3KJTA 1URGA 3IORA 1BIYA 3IOUA 3HV1A 3TTKA 3LUYA 4M4GA 3TTRA 5CRYA 2UVHA 1DSNA 2QL3A 3TCHA 2ONKE 3DLNA 3RTWB 3KSJA 3TCGA 5L9OA 2DQVA 2V25A 4GQOA 3D4CA 4F22A 5CBSA 4RXLA 3OO6A 5JK4A 3B7DA 4OETA 3MP8A 3SEXA 2GHBA 5DVIA 3EN3A 4OYVA 3VVDA 3K1NA 5HPQA 5F1QA 5KDTA 4KFQA 4Q8RA 4EXLA 1N3WA 2FA7A 2VP1A 4AQ4A 2HCAA 4NF6A 4BDOA 2CMOA 2W7YA 4IO3A 4OHNA 2F7BA 3RNNA 4ZZEA 1FQDA 1OQGA 2RC8A 1FTKA 4F2QA 1F9BA 4ELQA 2OWSA 2RKMA 1HSLA 5TP9A 3FVNA 2FNCA 2OBGA 2QSXA 4DCYA 1SQYA 4LA9A 2NWJA 3SDFA 3OEKA 3VLUA 3E13X 1CE2A 1JVXA 1PB7A 4MLVA 3QXMA 1BKAA 3QYTA 3K6WA 1DPEA 4R74A 1USYE 2XXRA 4G4PA 3MPKA 3RQTA 5AA2A 4YB6A 3IO6A 3U1OA 1LFGA 3V83A 5JEIA 2GFEA 4POWA 2R9JA 1UIUA 2H9BA 3PPRA 1B3HA 1IZ1A 2PVUA 3FASA 1UIVA 5CMCA 4P11A 3T96B 4GIZA 1IUDA 4LONB 2V3QA 2HAUA 2QS2A 2XHDA 4ZE8A 1MG1A 4BDRA 1IXIA 2F6PA 1P1NA 1BLFA 1MQIA 2HFBA 4RK2A 4KI0E 4ZEFA 4PFUA 2Q88A 4IO5A 4PQJA 5L8DA 4BDLA 1QVSA 3OXNA 2M8CA 2G29A 2DWAA 1MY4A 4O3BA 3DELB 4ZS9A 1EZPA 3G3FA 3TYHA 1IXHA 2O7IA 5K2YA 1KWHA 3KGCA 1N76A 1O63A 3K1MA 3ZKLA 4XKRA 2XD3A 5A5XA 1YAEA 3QIMA 2I49A 5H8NB 5DTBA 5CC2A 1PEBA 3A09A 4TLLB 4F39A 3FJMA 2ZNTA 1LAHE 1YCJA 1A8FA 4PP0A 1IXGA 4PFYA 5I2KA 1XOCA 3ILUB 4U1ZA 1VSOA 1NKXA 3PD8A 4ZE9A 4G68A 2PBWA 1MPCA 4OENA 1LBCA 4EF2A 3HCQA 2YPNA 3CR9A 3FIRA 4XKNA 2DWIA 4U4XA 5TPAB 4N07A 3UORA 3K1PA 4U4SA 4RJZA 1JW1A 5EHMA 5I57A 5K2XA 5FHMA 2WKYA 3K00A 2I48A 5DVJA 3T9VA 1FW0A 1GGGA 2QMWA 4NE4A 3TPAA 4NF5B 1SW5A 1HSEA 3KBRA 3PPPA 1MQDA 4I1DA 2DXRA 1VFEA 2I3VA 1Y4CA 4ISUA 3H6WA 5ELVA 2VD2A 2DVZA 1MH4A 4OEVA 3G3GA 1RYOA 5F7VA 2REGA 1A8EA 3DP8A 4LUBA 2ANJA 4F3GA 4AB5A 5AA1A 1YPNA 3C32A 3IO4A 2H25A 1ZU0A 3TQLA 2UVJA 2OK2A 3PUYE 3B6WA 2VGQA 3I5OA 5I59A 3S9LC 1Z7ME 2DSFA 3TMGA 1I6QA 1QW0A 5JTYA 5KCJB 2PMSA 1B2HA 3KOTA 2I0BA 4OFJA 2ZNSA 2PT2A 3RY3A 1GV8A 1B46A 1MM7A 1AOVA 3OSQA 1NMUA 4ZEKA 4KD5A 3H6TA 1MXXA 1QKBA 3SEYA 1B3FA 4C1UA 1DMBA 2F7CA 1MRPA 1B1HA 4ZEBA 4BDQA 3FUZA 3MQ9A 3EHUA 2THIA 2ONSA 2PT1A 2Q2CA 2I4CA 4U2RA 3S9NC 4XIGQ 4KYEA 3C9HA 3W9WA 1MXZA 2I6EA 5EHSA 2OJTA 2Z8DA 3H06B 3CVGA 5BWJA 1OVBA 4F3PA 2YJPA 4I8CA 4LZ8A 3MVYA 3O97A 2NXOA 2BJJX 1LGBC 4OVJA 2F35A 3N6TA 4JB7A 3T9UA 1IITA 2D5WA 2H98A 2X7QA 1FTJA 1A55A 1JEUA 3OSRA 3FVOA 3CG3A 3VDFA 1XT8A 1NL5A 1I6AA 5AA3A 3LSXA 4IO4A 3HSTA 4F1YA 4XTCQ 2QPQA 5ISUA 1SI0A 3KJ7A 1H43A 2XXHA 1IXCA 4GWOA 1Q35A 4U21A 3H3GA 2QS3A 3K2DA 2O69A 4QSEA 4IY6A 3CFLA 3GBAA 1AMFA 2AIXA 2H5YA 1B5IA 2A5TB 1LCFA 4C0RA 5KDTB 4ECFA 2RC9A 3R6UA 3CFZA 3C33A 4MF3A 5H8FA 4JSOA 4ZZAA 1A40A 4YMBA 1TWYA 1NFTA 4Z7EA 2X26A 1LAGE 4NTLA 1M5DA 4GXAA 1NNKA 1SYIA 4POXA 2QJEA 4HTGA 3MPLA 3QSLA 3VFJA 1ZIUA 1Y4TA 2PYYA 4FJPA 4NF4A 2Q8JA 2RCBA 4DXBA 1S50A 2AL5A 4YU0A 5TP9B 4TLMB 1MPDA 3OD7A 2I3WA 1UTHB 1II5A 2X7PA 4HCWA 3HHFA 3M3FA 3U72A 3S2VA 5B7DA 4WEPA 4YKIA 5B70A 3FZVA 2HXWA 3MAMA 2AYSA 4FATA 2G93A 5CMMA 1WODA 1MDP1 4GL0A 5AA2B 5EYFA 4RYAA 1AL3A 1SDXA 2DWHA 4LVQA 3MUQA 1LFHA 2NOOA 3CSGA 1OVTA 4X9TA 1R9QA 1Y3QA 2Y7KA 2UVIA 1TFAA 3U92A 5H8SA 1I6BA 3MZBA 4OTEA 1Y1MA 5L9MA 1RYXA 4IO6A 3FATA 3K6XA 1XC1A 1OLCA 2ZXTA 5J1DA 4FECA 1EU8A 1LAXA 3SESA 3R26A 4MBPA 4EUOA 1FQEA 1P1UA 4ELRA 1UTBA 1PB8A 4R6KA 1A54A 3U93A 4LQ5A 4OWDA 3IB2A 4H5FA 1B5HA 3CIJA 2PX1A 1GTKA 1B7UA 4TQUQ 5AA2D 2Y7RA 1B05A 4G8NA 1LSTA 4NWCA 1SW2A 4KYDA 2VD3A 5A5XB 2DXYA 2P0SA 2V3TA 3TAJA 3RPWA 4IY5A 4X48A 2F78A 1H76A 3O2AA 1P1WA 4QFKA 1JNFA 1NNTA 4R73A 3PMVA 5H8QB 5I2KB 4HCYA 3IAZA 3RGYA 3FV2A 3S4UA 4JDFA 1S7YA 1TXFA 1B7HA 4NMYA 1MY1A 2P1SA 3SEUA 4U1OA 5I58A 1HSJA 1Q1KA 3UA8A 1WDNA 1Y3PA 4JWOA 2ZYKA 4F18A 2UYEA 3FVKA 1FTMA 1R1NA 3G3KA 3TODA 1JW4A 2ABHA 5I57B 1QULA 3H4ZA 4GF8A 1NNPA 4Q5TA 2XXPA 4E0WA 4HW8A 4R75A 1MDQA 3THIA 4EQ9A 2VOZA 1PB9A 2KLFA 4YZZA 1JETA 4H65A 1D9YA 2DYXA 2DE3A 4RY1A 4R2BA 3HPIA 1FQBA 2XXVA 3IK6B 3CG1A 1USYH 4IGRA 4YB5A 3T93B 4UA8A 4G8MA 5H8HB 4ND9A 4PFTA 4UACA 4LZ5A 2ONRA 1QUIA 4F3BA 3PV0E 1D3KA 2O84X 3FVGA 5ITOA 1AH5A 2ZYOA 3C4MA 3GXAA 3E9XA 5TU0A 4GOTA 4YKKA 3O6IA 1H3DA 1NH8A 1N3XA 2XXWA 3LSWA 3DP4A 4QFOA 1P1QA 3ILTB 1LB8A 1MH3A 1IQ7A 4RPOA 5AA4B 4N13A 3TUSA 3E4RA 2GRVA 1B3LA 4NEDA 1SI1A 3CFXA 3PPOA 2RC7A 1SVXB 1URDA 1JEVA 1GR2A 1M5CA 1UQWA 3ZSFA 1JVYA 3ONMA 4R9GA 3OO7A 3C35A 2RINA 2Y84A 3IB0A 3FGSA 3IL1B 3MVXA 2RF1A 4TOZA 4Q0CA 4JXIA 3RTFB 3VV5A 1Y3NA 4I9DA 4XXUA 1AIVA 2Z22A 1O64A 3OOAA 4P0GA 2ZNUA 3GLBA 2A5SA 5CMBA 2VHAA 3U94A 4ONYA 4F19A 3Q26A 4ELPA 2Z8EA 3V89B 4XKQA 3VE1B 1ZJLA 3N6UA 3TELA 1YTVA 1OIBA 3UGWA 2Z23A 1DTGA 1ZLQA 2Y7WA 5H8NA 2Q9TA 3QK6A 3KG2A 1XS5A 1IIWA 3RLFE 3L6GA 3FV1A 3RT6B 3IB1A 1US4A 3JZJA 3TTMA 1MQJA 5H8FB 1M5BA 3ZKKA 4QHQA 1MM6A 1R6ZA 3W15C 5I2NB 4DE8A 5IKBA 3PUWE 2O7UA 2ESNA 3D4GA 3T22A 3O28A 2F5XA 3USDA 4O3CA 4N6PA 4OZ9A 1ANFA 1B5JA 2DWJA 3EHTA 5AE4A 3EQ1A 3O66A 3T9HB 4NF4B 2QS1A 2GHAA 2E1SA 3OO9A 2DE2A 1CB6A 2XXUA 5CMKA 4GXSB 1MXYA 3TCFA 2XX9A 1MY2A 3IJOB 2RCAA 3HHGA 2F36A 4DDDA 4AB6A 2QS4A 3IOTA 3EPEA 3SEWA 1B51A 3K0VA 3IJXB 2DVCA 3FXQA 4I62A 3KSXA 3LR1A 5ICQA 3GZGA 4HS7A 2XXQA 3K4UA 5KZTA 1MXUA 3TEPA 2Y7PA 2HAVA 2R6GE 2XXYA 4RPNA 3RN8A 4KQPA 3JV9A 4LP2B 1EH3A 1UTBB 4GFRA 4NF8A 4U23A 4R6YA 2DP8A 3CRBA 2ZYNA 5FHOA 4NF6B 5KCJA 3OO8A 5I56A 2ZMBA 3MP1A 2NUVA 3K6VA 3V8XB 3VLWA 5I84A 4K3FA 4QFPA 1B0LA 2CZLA 4YICA 1J1NA 5DEXA 1EZ9A 2F34A 3I6VA 2B3FA 4EQ7A 1VFDA 4X1BA 3H7MA 2LAOA 4OFLA 3FJGA 5CBRA 4M1VA 1MXWA 4EXKA 3K02A 3T9XB 1MS7A 4YKJA 1EZOA 1POY1 4QF9A 4DXCA 3E3KA 3M3KA 3M3LA 2I58A 4KYSA 2F97A 3FXRA 1M5EA 2UYFA 3EHSA 1NNFA 3GBBA 2E0SA 3B6TA 4H1XA 3M8UA 3O9PA 1N0TA 2F7AA 1FTLA 3LSFB 1URSA 5I58B 5DVFA 2OCUA 3KOSA 4H8JA 2XXTA 3AXFA 1DTZA 3K01A 4RA1A 4ZDMA 4OQOA 4MFIA 3MBPA 4YKPA 3H6UA 3L6HA 1ZTYA 1JQFA 4IB2A 3LSLA 3SEVA 3BBRA 2DOJA 1FQCA 3MW0A 4G8HA 3Q27A 1LB9A 2A5TA 4Z0IA 4PE5B 3PD9A 5FTHA 2R71A 2OLBA 3IOWA 4GLIA 3ECRA 3PMWA 1N04A 4IGTA 3MWBA 1TFDA 3BFTA 3QAXA 2H99A 4F31B 4GD5A 3DP6A 5DYHA 1XVYA 2H4IA 1RKMA 4WKMA 4L17A 1H44A 2AL4A 3G3IA 1QKAA 3TQWA 3TTNA 1LFIA 4U22A 4ZECA 3WAFA 1UTHA 3OEMA 3VVEA 4PETA 1ZKBA 1B40A 1MQHA 2F6GA 4G77A 5LOMA 4R2FA 5M2VA 1B3GA 4G68B 5ITPA 3C34A 4BDMA 5IAIA 3N94A 2XXIA 3S9EA 2O6AA 1A99A 4JWXA 2IA4A 3JYRA 4KR5A 4DZ1A 5HBCA 1M5FA 1JW5A 5FHNA 3G7WA 2QMXA 2I4BA 2YLNA 4XKPA 1B4ZA 3U8QA 1B0HA 3PPQA 2B65A 1FCKA 5FTIA 4KCCA 4GVOA 3Q28A 3KFMA 3B6QA 4E0XA 3RUMA 3PUZE 4PFWA 1DPPA 2OWTA 3PUVE 1FQFA 3QUJA 3IOVA 4H8IA 3UP9A 3MVWA 4FE8A 5CI5A 2REJA 1N84A 4JSDA 4LATA 4R6HA 3VXCA 1B7ZA 2XD2A 4JBZA 3W9VA 3VXBA 4H6DA 5I59B 5HM4B 1LCTA 1OMPA 2HZKA 1GVCA 3VLVA 1ZBMA 4DXUA 5JTYB 4QSCA 2NVUB 3RT8A 3K6UA 1A7LA 1BP5A 3MVZA 3FXUA 3A3CA 4MH5A 2F8DA 2HQ0A 3EF7A 4ZEIA 3T66A 2ZYMA 4FAJA 1ATGA 2B3BA 4KHZE 4EQBA 5H8QA 4G68C 4WXJA 3IR1A 3Q29A 1LBBA 3QUFA 4FORA 1B1XA 1PC3A 3P7IA 3UIFA 1XVXA 4H67A 1B9JA 3O29A 3PMXA 3MJNA 4BLAA 4OERA 3IX1A 4ZEDA 4F29A 5L9SA 4OXVA 1I69A 4G2ZA 3F11A 3KN8A 1LAFE 2HZLA 5BUUA 4F3SA 3C31A 1B52A 3MP6A 4DIGA 2Q2AA 2FYIA 3ODBA 4Q30B 3I3VA 3MZ1A 4F2OA 3CI8A 1P1OA 4YMAA 2XX7A 4GL8A 1US5A 3SKPA 3KN3A 5H8HA 4IO2A 1OLAA 1PDAA 2O1MA 3UN6A 3PGFA 4LZ7A 1SBPA 3LBSA 3BKIB 1QJMA 3G3HA 1SD3A 1VR5A 4NF8B 1WVJA 4OEUA 1SW1A 4P0IA 4H0WA 5I56B 4ESXA 4RNSA 3O6HA 2DS9A 4GRKA 2D21A 4F1UA 3TTLA 4THIA 2UXAA 3VVFA 5DEXB 3N26A 3PUXE 2I0CA 4RK9A 1QUJA 5AA4A 2Z8FA 1SW4A 1O7TA 1Y1ZA 4FEDA 5TPAA 4DLDA 1N7XA 2V3UA 5DT6A 3V5AA 4YAHX 4OESA 3S9MC 2O1LA 4QFLA 4MLQA 3OENA 3TKDA 1H45A 4OMBA 4O3AA 3MC2A 2HEUA 2V84A 1T0KA 4R72A 4OFOA 3KN7A 4NF5A 4R9FA 2Y7IA 3KZGA 2O68A 3PPNA 2DE4A 1QUKA 3G3JA 3H6VA 2XX8A 2OZZA 1IEJA 1OQHA 4QFNA 1Z7NE 1Y20A 4NWDA 3Q25A 3CSBA 1POTA 3DM0A 1R9LA 1L5TA 1D9VA 4EF1A 2D3IA 3LC8A 1Y9UA 3ZS6A 3SETA 1TT1A 1FQAA 3TFLA 4DCXA 3A3UA 3O6GA 4YB7A 3FD3A 1MXVA 4X1DA 1B58A 1MY3A 2GH9A 4KPTA 3BFUA 1DOTA 1BTJA 2V93A 4QRZA 3SERA 2P2AA 4ELOA 2QRYA 2Q89A 1B6HA 4FEBA 4C1TA 1NH7A 3C36A 1P99A 5I2NA 2IEEA 1B3EA 1B4HA 1ELJA 4QSDA 5ICTA 1SYHA 1MY0A 2XXXA 3R7XA 2UVGA 3TDJA 2O51A 1FTOA 3UK4A 3KEIA 4KCDA 4ESWA 1MPBA 1MQGA 1D4NA 4IO7A 1VE4A 3H03A 4JWYA 1ZMGA 3TZAA 4H5GA 4FIMA 3WAEA 4EDPA 5CM6A 3OELA 3OMBA 3PU5A 4BDNA 3MZ9A 3FJ7A 1B32A 1PBQA 1S9TA 3HN0A 4WEDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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