1NKXA

Crystal structure of a proteolytically generated functional monoferric c-lobe of bovine lactoferrin at 1.9a resolution
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
344
structure length
340
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transport protein
publication title Crystal Structure of a Proteolytically Generated Functional Monoferric C-lobe of Bovine Lactoferrin at 1.9A Resolution
pubmed doi rcsb
molecule keywords LACTOTRANSFERRIN
total genus 110
structure length 340
sequence length 344
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-01-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1nkxA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1nkxA02
5JEIA 2NVUB 2XX7A 2XXYA 3MP1A 1P1UA 4U4XA 1M5BA 3PUXE 4K3FA 2ZNSA 3Q26A 4XKPA 3M3KA 4QF9A 3C31A 1II5A 3N5LA 3JV9A 1UIUA 3A09A 4PE5B 2XXXA 3PPRA 1UQWA 2VHAA 4IO3A 3D4CA 1YCJA 2PT2A 2AL4A 4NF5B 5H8FB 3FJGA 3E3KA 5H8QB 4NF5A 4GRKA 1MQJA 3PU5A 3O6GA 3O2AA 1MQIA 1SQYA 4QFOA 3FV2A 2I49A 3QAXA 3O66A 2PT1A 5AA2A 1LSTA 1KWHA 3VLUA 4WKMA 3ILUB 3PD8A 4O3AA 4KYDA 2FYIA 4O3CA 3TODA 4IY5A 2ZYMA 3EHTA 3SEXA 3IO4A 4DXCA 1ZKBA 4QFLA 4JB7A 1FTOA 4R73A 1B2HA 4R6YA 2QRYA 5CMBA 3SKPA 2UVHA 4F2QA 3M8UA 2VGQA 3G3HA 4YKKA 4G8MA 3K1NA 3OSQA 3SEUA 2Q89A 3MPLA 1M5FA 3HN0A 4PQJA 2I58A 3TYHA 2R71A 4R72A 3TTNA 2H99A 5CRYA 1B6HA 2QPQA 4GFRA 5CM6A 4OENA 1A8EA 5JK4A 4QSCA 1B4ZA 1SW1A 1ELJA 3FIRA 1USYH 2I3VA 4R75A 1B7UA 2YLNA 4R2FA 2XXVA 5J1DA 4BDNA 1YTVA 3RN8A 3TTLA 5I58B 3M3FA 3DM0A 1LB8A 1H45A 1PC3A 4G68B 3MVXA 5TP9A 1URGA 3T96B 3MUQA 3PV0E 2HZLA 3K4UA 4NF6A 2XD2A 2OJTA 4R74A 5ELVA 4ESXA 5CMKA 1B7ZA 1QUKA 3RTFB 3SEYA 1FTMA 1I6BA 1XOCA 3H6UA 1B9JA 5FTIA 1M5DA 2D21A 1B5JA 2XXUA 3K1MA 5ICTA 1MY4A 1FTJA 4POXA 1DTZA 4ZDMA 3CRBA 4DCYA 3K2DA 4G68C 4ECFA 1N7WA 4GXSB 1N0TA 3CG1A 3CG3A 4KR5A 4TLLB 4DLDA 3B6WA 1F9BA 3TAJA 1XVYA 4F3SA 1URSA 2QJEA 3LSWA 1H44A 3OO8A 3G3FA 2V3QA 1NL5A 4IO7A 4NEDA 1GV8A 4HS7A 4EXKA 4RXLA 4HCWA 3MZ1A 5KZTA 4JBZA 4G2ZA 4IB2A 1M5CA 3GXAA 2QMWA 3C36A 3IOTA 3QUFA 2DWJA 3BFTA 4F3GA 4X9TA 3CVGA 1ZIUA 2I0CA 3KN8A 4KFQA 4QSEA 1PEBA 2DYXA 2M8CA 5I57B 1A7LA 4ZEDA 4OYVA 3QIMA 1LAXA 1MY3A 1MY0A 3FVOA 3MWBA 3I3VA 2RCBA 2QS1A 4TLMB 4O3BA 3FZVA 3KEIA 1MM7A 2DOJA 2DS9A 3EF7A 1LCTA 2QMXA 4NWDA 5HM4B 4F29A 4JWOA 5I56A 2VD2A 1R6ZA 2OCUA 2DWAA 4GF8A 4XTCQ 1A99A 3IL1B 3MZ9A 2V25A 4GD5A 3ZKKA 3CFZA 3SETA 3SDFA 1R1NA 3RT6B 3FGSA 1SVXB 4NF4A 3F11A 3TUSA 3S9NC 4FE8A 1B3GA 5A5XA 1JQFA 2DWIA 3DP4A 5K2XA 2Z8FA 1CE2A 4QRZA 4F1VA 1OLCA 4ELRA 3H6WA 3PGFA 1EZOA 4C0RA 2ZNTA 3HPIA 1MQGA 4YB6A 5KCJB 4GL8A 5TPAA 1B4HA 2I48A 1URDA 3CI8A 1JVXA 4MH5A 4HTGA 2ZYNA 4BDQA 5L9OA 3T9VA 3UA8A 2F7BA 2H25A 4MFIA 1MQDA 2A5SA 2Q88A 5DEXA 1WVJA 4YB7A 2G29A 1LFHA 5I2KA 3MQ9A 2VP1A 3KOSA 1DPPA 4QSDA 3OO7A 2QS2A 2DVZA 2F35A 4GWOA 1DTGA 4R9FA 4IGRA 5CMCA 5L8DA 1MQHA 4F1UA 3MBPA 3K6UA 3O29A 2OWTA 3RPWA 4AB6A 4OHNA 1XS5A 1GTKA 4EF2A 3HSTA 1MY2A 3UP9A 3UORA 2UVGA 3LR1A 1JVYA 4HCYA 2E0SA 2ONRA 2H4IA 4YAHX 1FTKA 2ZNUA 2V93A 2GHAA 2ALUA 4LA9A 4HW8A 3SESA 3IAZA 1GR2A 2Y7PA 2O6AA 3KZGA 4ZE9A 3ODBA 3IOWA 1OLAA 5HPQA 2Y7KA 5ITPA 5BWJA 3MJNA 4GOTA 1SD3A 4ELQA 1VFDA 4H6DA 5KDTB 3LUYA 3I5OA 1B46A 3UIFA 2A5TB 4EXLA 5ITOA 1LAHE 1FQAA 3T9UA 3CSBA 1ZTYA 4KHZE 5AA3A 4H8JA 2DQVA 2HEUA 4ZEIA 3V5AA 4ELOA 4QHQA 4N13A 4OZ9A 4R6KA 4BDMA 3TELA 4OERA 5I2NA 1H43A 4GLIA 5BUUA 4LATA 4ZE8A 1TFAA 3HHFA 3G3GA 2AL5A 3QSLA 1MG1A 2ANJA 3H7MA 3VVDA 1B0LA 3MVZA 3EQ1A 3FVGA 5FHMA 1Y4TA 1Q1KA 2REJA 3KFMA 3IX1A 2RC7A 2QS3A 3O28A 3K01A 3U1OA 1FQEA 1RKMA 2X7PA 1BP5A 1N3WA 4ISUA 3S9LC 1VE4A 3A3CA 5H8NA 2XHDA 1FQCA 2O51A 2F6PA 4EF1A 1OIBA 1OQHA 4MBPA 3KSXA 2HAUA 1JEUA 4LUBA 1OVTA 2R9JA 4RY1A 3U72A 3KN7A 3O9PA 1VFEA 3MZBA 4GIZA 3T9HB 4H5FA 2IA4A 3WAFA 1LBCA 3FD3A 4YKPA 1MXZA 4DCXA 3VFJA 5AA2B 4C1TA 5FHOA 2ZYKA 1OQGA 2I4CA 4QFPA 4XXUA 3CFXA 4JWYA 5DVFA 2V84A 5CBSA 4NTLA 2H98A 1RYXA 1SW2A 1R9LA 2XXHA 1QW0A 1UTHA 3S9MC 3RUMA 3PD9A 3G7WA 1MXYA 4R6HA 4U1ZA 4ELPA 2RC9A 2X7QA 1FQBA 2O68A 3OXNA 1A40A 4LONB 4KD5A 4DZ1A 3IB2A 3N26A 1H76A 1AH5A 5L9SA 2UYEA 2P0SA 2F8DA 2Z8DA 3IK6B 3FUZA 2B3BA 2VOZA 3RGYA 3N94A 3FVKA 3T22A 1ZBMA 3VE1B 2F7CA 3UK4A 5FTHA 1LFIA 1SI0A 4NF8A 1NNPA 3TZAA 2REGA 3IJXB 4F19A 1EZPA 3E13X 3S4UA 3JZJA 4R9GA 4MLQA 4U23A 1Q35A 1UIVA 3S9EA 2DP8A 1Y20A 3T93B 2O84X 3H03A 4OTEA 1D4NA 1Y1ZA 3K6VA 5TP9B 2OZZA 4AB5A 4OWDA 3BFUA 2DE2A 3HV1A 1PDAA 2NWJA 5EYFA 4NF6B 3FATA 3PPQA 3FXRA 1VR5A 4EUOA 4F18A 4EQ7A 3H4ZA 2F5XA 2XXWA 1FQDA 1ANFA 1GGGA 1B5HA 4FEDA 4Z0IA 1OVBA 1XHYA 4YMAA 1UTBA 4X48A 1D3KA 1B3FA 2OWSA 4NWCA 1O63A 4LZ7A 4E0XA 4KCDA 3K0VA 1R9QA 1QUIA 3OMBA 4G4PA 1TT1A 3EPEA 3PPNA 1MRPA 1H3DA 4XKRA 4X1DA 4C1UA 1DSNA 1B40A 4ZEKA 1B1XA 3OSRA 3FXQA 3D4GA 5EHMA 1MXUA 3OD7A 3MPKA 2QL3A 3C33A 2PBWA 3TTRA 3R7XA 3G3JA 4MF3A 1N76A 5AE4A 1P1OA 3GBAA 2HCAA 3V8XB 4LVQA 4RA1A 3ILTB 3THIA 1AMFA 1TWYA 3IORA 1QULA 5HBCA 2RINA 4GQOA 2HXWA 1NH7A 3FV1A 3U92A 3TCFA 2FNCA 3PPOA 5I56B 1A8FA 1FCKA 4GL0A 4QFKA 1GVCA 1WODA 4IGTA 3O6HA 3OO6A 2O1LA 2Y7WA 4OETA 1AOVA 1USYE 5I59A 1Y9UA 3WAEA 3K02A 4LQ2A 5AA4A 4BDLA 1S9TA 4ZZEA 2V3UA 5B70A 2Q8JA 4NF4B 2F6GA 2UVJA 5H8HB 1CB6A 4FORA 1I69A 3DLNA 3OEMA 5A5XB 1ATGA 4IO5A 1LFGA 3FVNA 3VV5A 1PB9A 5H8HA 2RF1A 2Z8EA 2XXQA 3W9VA 4ESWA 3KN3A 4OVJA 2I4BA 1DMBA 3H06B 4G8HA 4U1OA 2NOOA 1IIWA 4F31B 1DOTA 3ZKLA 4PETA 3BKIB 2W7YA 3IJOB 5TPAB 3SERA 3HCQA 4F39A 3FJ7A 4U22A 1B7HA 2NXOA 3IOVA 1B3HA 4FECA 3PMWA 1NNFA 5I84A 3QYTA 1M5EA 5DEXB 4JWXA 1SW4A 2I0BA 5I2KB 4U21A 4Z7EA 2O1MA 3CR9A 2Q2CA 3B6TA 2FA7A 3ZSFA 1NH8A 3LC8A 2YJPA 2D3IA 3TFLA 1LBBA 3FJMA 3GLBA 3OEKA 3SEWA 3OO9A 3BBRA 2CMOA 3B7DA 4X1BA 4YB5A 1Y1MA 1YPNA 5K2YA 1US4A 1LAFE 3CIJA 5AA1A 3U93A 5L9MA 3RT8A 1BIYA 4JSOA 3TEPA 2THIA 1SBPA 3SEVA 1PB8A 3KSJA 2AYSA 2DXYA 3UGWA 2CZLA 1P1NA 1Y3PA 2B3FA 1MS7A 1YAEA 1B5IA 3TCGA 3PUVE 1JW4A 2GFEA 2F7AA 1D9YA 4IO2A 4RJZA 2ZXTA 3U8QA 3LSXA 2E1SA 4H65A 1US5A 3I6VA 3HO7A 3H3GA 5DVIA 3ONMA 2UXAA 4LZ8A 3TKDA 3CFLA 2P1SA 3DP6A 1QJMA 1RYOA 4ZS9A 1P99A 2GH9A 1P1WA 1N84A 3VXBA 1LB9A 3K00A 1JW5A 4PFWA 4H67A 1MH3A 3RTWB 5F1QA 5I2NB 1Y3NA 3T9XB 1MXVA 5DT6A 1MDQA 4OXVA 2PVUA 1FQFA 1BTJA 1Y4CA 1O7TA 3KBRA 4JSDA 3IB0A 1FW0A 3H6TA 2UVIA 3T66A 4KI0E 4F1YA 4H8IA 2ONSA 3TQWA 3LBSA 2F34A 1TXFA 3PMXA 1O64A 1MXXA 4ZECA 3W9WA 3HHGA 4POWA 5H8NB 4IO4A 1NNKA 3MP6A 4OEUA 2F97A 5EHSA 4H0WA 5JTYA 1MPBA 3EN3A 3AXFA 4YZZA 1IZ1A 2O69A 2RC8A 1D9VA 1JETA 4H1XA 4KYEA 3Q27A 1BLFA 4U2RA 1N3XA 3LSFB 4YKJA 3RY3A 5CBRA 1XVXA 1B58A 1T0KA 4ND9A 2DE3A 4YU0A 3TMGA 3TTKA 2Q2AA 4U4SA 1JW1A 1UTHB 2ONKE 1SYHA 4GVOA 1AIVA 3OENA 2GHBA 4DIGA 3N6TA 5H8FA 4F3BA 3QK6A 4G77A 1NKXA 3N6UA 1MPCA 1MXWA 1LLSA 5H8QA 1FTLA 1ZU0A 1HSLA 3E9XA 3DP8A 4IY6A 4I62A 1I6AA 4PFYA 3K6WA 4F22A 3FXUA 4Q0CA 5TU0A 4NF8B 2XXPA 1TFDA 4I8CA 5ICQA 4YICA 2DXRA 4DE8A 1DPEA 2UYFA 2IEEA 4UA8A 4I9DA 1QKAA 2RKMA 1IXGA 4G8NA 3RQTA 3KJ7A 4N6PA 1B1HA 2O7IA 2H5YA 1Z7NE 4THIA 1B52A 3MVWA 4OFLA 3ZS6A 4BLAA 1EH3A 2I6EA 3RNNA 1N04A 1IXHA 3G3IA 1B05A 4JDFA 3H6VA 3C4MA 3V83A 1B32A 5CMMA 1XC1A 2ZYOA 3FASA 1SW5A 2Y7IA 1I6QA 1POTA 2D5WA 3M3LA 3L6GA 3VVFA 4PFTA 4KCCA 3LSLA 1UTBB 3DELB 4XKQA 5DYHA 3C35A 2HFBA 1S7YA 4P0IA 5I58A 5AA2D 1QKBA 3CSGA 4FJPA 1NNTA 1LAGE 1NFTA 4I1DA 2VD3A 4G68A 2PX1A 3IOUA 4WEDA 4YKIA 5CI5A 3RLFE 4DDDA 4FIMA 3O6IA 4L17A 4R2BA 3GZGA 3MVYA 3EHUA 2I3WA 5DTBA 1SI1A 4JXIA 2XXRA 3VVEA 2WKYA 4IO6A 1B51A 1ZLQA 4KQPA 4OQOA 4NE4A 1IXIA 4Q30B 4RK9A 3PUWE 1IEJA 1MPDA 4YMBA 3IR1A 3MAMA 2HQ0A 2OLBA 1QUJA 4NMYA 5F7VA 1SYIA 4EQBA 1IQ7A 1HSEA 1EU8A 2ESNA 1A55A 2F78A 1J1NA 4FAJA 4DXBA 1LCFA 4KYSA 2XD3A 2R6GE 2PMSA 3Q29A 1Z7ME 3Q28A 4P0GA 1MH4A 3KOTA 1SDXA 4Q8RA 5I59B 3VDFA 1JEVA 5DVJA 4MLVA 2Q9TA 4LZ5A 4GXAA 3C32A 1AL3A 5AA4B 4FEBA 5I57A 2XXTA 3OOAA 1PBQA 3TPAA 4OFJA 3UN6A 3EHSA 1IUDA 2RCAA 4ONYA 2XXIA 3PUYE 4BDRA 2Y84A 4E0WA 4BDOA 3QUJA 4LQ5A 2NUVA 3TQLA 2DWHA 3A3UA 2Z22A 3E4RA 2ABHA 2BJJX 3IB1A 1XT8A 1HSJA 1ZMGA 4AQ4A 2DE4A 3TTMA 4WEPA 4RPNA 3IO6A 4N07A 4WXJA 1MY1A 4TQUQ 1IITA 1POY1 2V3TA 3VLWA 2H9BA 4ZEBA 4Q5TA 4PP0A 4OESA 4FATA 3U94A 3MW0A 4F2OA 2OK2A 1PBPA 1L5TA 5FHNA 2KLFA 3ECRA 1MDP1 5LOMA 2OBGA 2Z23A 1JNFA 3L6HA 1PB7A 1B0HA 1B3EA 2F36A 1S50A 1LGBC 4DXUA 5KCJA 1MM6A 3G3KA 4ZEFA 1P1QA 1IXCA 1OMPA 4OFOA 2XX8A 3VLVA 3B6QA 4RYAA 2G93A 3Q25A 3KGCA 3C34A 4XIGQ 4RPOA 1B3LA 3OELA 3C9HA 1QVSA 3TDJA 3K6XA 1BKAA 2GRVA 5IAIA 2AIXA 4ZZAA 3V89B 2B65A 4RK2A 1N7XA 3R6UA 3R26A 4EDPA 4QFNA 4LP2B 5CC2A 3TCHA 2QSXA 1VSOA 5M2VA 2Y7RA 4M4GA 3K1PA 4M1VA 4UACA 3MC2A 2P2AA 4TOZA 2DSFA 3GBBA 3JYRA 2QS4A 3KJTA 4P11A 3MP8A 3PPPA 1A54A 4OEVA 4RNSA 1ZJLA 1EZ9A 4F3PA 4KPTA 2YPNA 2DVCA 4EQ9A 3W15C 3USDA 1NMUA 1Y3QA 2HAVA 2X26A 3P7IA 3PMVA 2PYYA 2XX9A 5H8SA 3O97A 3QXMA 5B7DA 3S2VA 3VXCA 2HZKA 4H5GA 5KDTA 5IKBA 5ISUA 4OMBA 2A5TA 2ZMBA 4XKNA 3PUZE 2LAOA 4PFUA 1WDNA 2O7UA 3KG2A 5JTYB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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