1NKXA

Crystal structure of a proteolytically generated functional monoferric c-lobe of bovine lactoferrin at 1.9a resolution
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
344
structure length
340
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords LACTOTRANSFERRIN
publication title Crystal Structure of a Proteolytically Generated Functional Monoferric C-lobe of Bovine Lactoferrin at 1.9A Resolution
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
total genus 110
structure length 340
sequence length 344
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-01-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1nkxA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1nkxA02
4U22A 5DEXA 3H6UA 3RT6B 4YMAA 3W15C 1MXZA 2XD2A 1S50A 3O9PA 2AIXA 3CSGA 1EZPA 1BKAA 2DWJA 1SBPA 2F35A 1TXFA 4ZEKA 2Y84A 2WKYA 3VXCA 3S4UA 1Y4CA 5K2XA 4NWCA 1OLAA 1FQFA 2OBGA 3V8XB 2F6GA 5CI5A 1B3HA 3FVKA 1B51A 5A5XB 2B65A 4NF8B 4RY1A 1I6BA 1CB6A 1SD3A 3TZAA 4OTEA 3S9LC 2RC8A 1N0TA 4NEDA 3OOAA 1LFIA 3LBSA 4G77A 4XKPA 4ZZEA 2ZNSA 1A99A 1VFDA 4ZEIA 3OO8A 3SEWA 5H8NB 3F11A 3PPOA 3WAEA 2I48A 3MZBA 1N7XA 4QSDA 4R74A 1LGBC 1LAGE 3GBAA 2V3QA 4NF6B 1UTBA 3JV9A 4F1VA 1ATGA 1B58A 2XXWA 5FHOA 1DPPA 3ZSFA 3O28A 2G29A 1L5TA 4FATA 2NXOA 1Y4TA 4EXKA 2VD2A 4KYDA 4OFJA 5B7DA 1LFHA 3G3JA 3MUQA 1UIUA 3IO4A 1MY4A 4I1DA 3L6GA 3Q28A 1XT8A 2RCBA 3B7DA 4FE8A 2ONKE 2P0SA 1MY2A 3VVFA 1RYOA 5M2VA 3FD3A 4PP0A 1OVBA 1QW0A 3Q26A 3KN3A 1DTZA 3PU5A 1NKXA 1ZTYA 4EDPA 2V84A 3TTMA 1WDNA 3RY3A 3ILTB 3ZKKA 3N5LA 3BKIB 3LSFB 5H8HB 3EHSA 5JTYB 4P11A 5CMCA 3PMXA 4NF5A 3MPKA 4JSOA 2I6EA 2X26A 1SI0A 2Q88A 1ANFA 1MQHA 2F7CA 3JYRA 4YB6A 3T93B 4R75A 2DWAA 4U21A 4KR5A 3ZS6A 3IO6A 5I84A 1FW0A 2XX9A 1SQYA 3C33A 1N04A 4OWDA 1MQDA 4O3CA 4TLLB 1GV8A 3JZJA 4GFRA 2M8CA 4OZ9A 2D21A 3K6WA 2VP1A 3PPPA 2I0CA 2PT2A 1AMFA 4H8JA 5KCJB 3UGWA 2R6GE 5BWJA 1QULA 3G7WA 4GOTA 2UYEA 3H6VA 3M3FA 5JK4A 2OWTA 4H5GA 1B3FA 4PETA 3K02A 4PFWA 5L9MA 1H76A 4C1TA 1T0KA 3KSXA 4QF9A 5AA4B 1SW1A 1IUDA 5IAIA 2DYXA 3IB0A 4EXLA 2O69A 4WEPA 3K6XA 3QIMA 5I2KB 3FXQA 4IY5A 1POTA 2OZZA 2XX8A 3O66A 5FHNA 1IXGA 1US5A 4LVQA 3CG3A 4FAJA 5BUUA 3PUZE 4LUBA 3UK4A 2RC9A 4LONB 3GBBA 2ZYKA 4X48A 2Q2CA 1MXWA 4R6KA 5EHSA 3EPEA 4DCYA 3HSTA 3TTKA 3S9MC 4KCCA 4G68C 4ISUA 1YAEA 2AYSA 5I58A 3E4RA 4JWYA 3WAFA 1R9QA 4R9GA 3TTLA 1BIYA 2X7QA 1S9TA 4LA9A 1Y1MA 3A09A 3FVNA 2V93A 3CIJA 4JDFA 3SERA 4ELPA 1J1NA 3K1NA 1VE4A 2Y7WA 4I9DA 2I49A 3IOTA 3IR1A 1YCJA 1YPNA 1I69A 3FXRA 4TQUQ 1ZIUA 3OO7A 5AA1A 3QYTA 3LSXA 1OVTA 3KBRA 2Q89A 3KEIA 4R73A 3OSRA 3Q25A 4DLDA 4LZ7A 4F39A 3GXAA 1GGGA 1QKAA 3OEMA 5DEXB 2HZKA 3VVDA 1UTHA 1LBBA 2G93A 4G8MA 4POXA 4F3BA 1DMBA 1SVXB 3KN7A 3KSJA 3T66A 2Q2AA 3KGCA 2QRYA 5CMBA 1D4NA 4OEVA 2GHAA 3CR9A 4DXUA 1AL3A 4H65A 3CI8A 3LSLA 3PUXE 1XC1A 1LAFE 3DELB 2Y7IA 3T96B 3LSWA 1B7HA 4YMBA 3SEYA 3IOVA 4LZ8A 4U1OA 4MLQA 3UIFA 1MQJA 1M5FA 2O6AA 5ELVA 2HXWA 3ECRA 4ZECA 2GH9A 4GIZA 3U92A 4JXIA 1YTVA 1NNPA 1Y3PA 3C36A 2XXIA 4GRKA 3MP6A 4XKNA 3MZ1A 4ZEBA 4IGRA 1JW1A 1EU8A 1JW5A 1Y3NA 4OERA 4IO3A 5KDTB 3B6WA 3K1PA 2YJPA 4GWOA 1P1QA 3TCHA 1MQGA 4LQ2A 5HM4B 3T9XB 2XHDA 4QRZA 1A7LA 1O63A 2PMSA 3TTNA 3VLVA 3TKDA 4P0GA 1SI1A 1AOVA 2E1SA 1GVCA 3DLNA 3U8QA 2O68A 3VE1B 2DXYA 5ITPA 1NFTA 2F34A 2ZNUA 3SETA 3FATA 5ICQA 4ZE8A 4F29A 1II5A 3FJGA 3RPWA 2YPNA 4KD5A 1FTKA 4U4SA 1CE2A 4NF5B 3C32A 4OFLA 4G4PA 1VR5A 4WKMA 1MXVA 2E0SA 5DVJA 1LAXA 4N13A 2O7UA 4LZ5A 3IB1A 2XX7A 1D9YA 4LATA 4AQ4A 4THIA 4C1UA 1MXUA 3UP9A 5AE4A 4DXBA 4ZDMA 1DTGA 1A8EA 1Q35A 3H6TA 4AB6A 3SKPA 4YB7A 1PBQA 3M8UA 3OENA 2B3BA 1B5HA 1QUIA 1NH7A 4H8IA 5I59A 2V3TA 4JWXA 2GHBA 4R2FA 4NWDA 2I0BA 4OXVA 1PEBA 1B3GA 2I4CA 3IORA 3PV0E 3T9VA 3EF7A 1ZBMA 4OENA 1B05A 3HV1A 5H8QA 1LSTA 4HS7A 2GRVA 2V25A 3TELA 3MP1A 2F7AA 1XS5A 3K4UA 5HBCA 1PC3A 3T22A 3T9UA 4BDRA 2RCAA 4YZZA 1OMPA 2IEEA 1DOTA 5JEIA 4FECA 4ELRA 3V89B 4GVOA 3OSQA 4MLVA 3CG1A 4NMYA 2I3WA 4AB5A 1M5BA 3CRBA 3KOTA 3RQTA 3QXMA 2ABHA 2OLBA 3UORA 4Q5TA 5I58B 3IOUA 4ESWA 2THIA 3QK6A 4R72A 2B3FA 4R2BA 1MXXA 4R6YA 3GZGA 5ITOA 4EQ7A 2H5YA 4C0RA 4Z7EA 2HEUA 3CFXA 1MPBA 1SW2A 2P2AA 2LAOA 2F7BA 1FQAA 4OETA 5L9SA 3U93A 2O51A 3TODA 3TYHA 1HSLA 3C9HA 2QS1A 5I56A 4KHZE 4NF4A 3MVXA 3P7IA 2QMXA 4ZS9A 1B1HA 3MJNA 1UQWA 4KYEA 3OXNA 4OQOA 4YKIA 2OCUA 3PPRA 4M1VA 1N7WA 2Y7PA 5CMKA 3KG2A 2QS3A 4H0WA 3R26A 5CC2A 1MY0A 2ANJA 3MVZA 1MH4A 4F22A 1UTHB 2Y7KA 4Z0IA 4O3AA 3OO6A 1MDQA 3N26A 4XXUA 2PVUA 2HAUA 4LQ5A 5A5XA 2QSXA 4NF8A 3UA8A 1POY1 3FJMA 1IITA 2DVZA 3I6VA 3TCGA 1MG1A 4GQOA 3MVWA 3KFMA 4X1DA 2F97A 4ELQA 1MY1A 3AXFA 2Y7RA 5I2NB 2XXTA 4BDQA 4RK9A 4JB7A 1WODA 5I57B 1URDA 1DSNA 1QVSA 1Y9UA 5TP9B 5AA2B 4NF6A 1EZ9A 5DVFA 2RC7A 2H99A 3LC8A 4F18A 1EH3A 1H44A 3E13X 4JBZA 3SESA 3RTFB 1N76A 4H1XA 2Z8FA 4UACA 4KCDA 4MH5A 3QSLA 2Z8EA 1PDAA 3VDFA 4MBPA 1D3KA 2H4IA 4QFNA 4R6HA 2O1LA 1LB9A 5B70A 5DTBA 4IO7A 3KZGA 5K2YA 4YKJA 3PPNA 4DZ1A 3Q27A 2RKMA 3K6UA 2HZLA 3DP8A 3PMVA 4PQJA 1D9VA 3RUMA 4BDOA 2XXYA 4YICA 2AL4A 1JVXA 4IO5A 1IXIA 4K3FA 4FEDA 1XHYA 2REGA 5TPAA 4RPNA 4DXCA 1NH8A 4OHNA 1Y3QA 2REJA 3QAXA 5CBRA 5JTYA 4G8HA 1B52A 1JNFA 1JEVA 3R6UA 1MY3A 1JEUA 3MZ9A 3L6HA 1M5DA 1LLSA 3TEPA 4F19A 3TTRA 5AA3A 2DQVA 4HW8A 3DP6A 4POWA 4XKRA 4EF2A 1VSOA 4ZE9A 2ZYOA 3EHUA 3H06B 5J1DA 4ZEFA 3TUSA 4DCXA 3MBPA 1ZU0A 3K00A 1Z7ME 2Q9TA 1BTJA 2UXAA 2RF1A 4QFKA 3G3KA 1ZKBA 2DSFA 5KCJA 2PX1A 4P0IA 1PB7A 1B5JA 3FZVA 4IO6A 2DVCA 4F2OA 3OO9A 1TT1A 1H45A 3K6VA 3BBRA 4Q0CA 4NE4A 3G3FA 2XXRA 1IEJA 4H67A 4HTGA 3O6GA 3C34A 3FASA 3I5OA 5I59B 1SYHA 2I58A 1ZMGA 4PFUA 2DOJA 1H3DA 2Z22A 3QUFA 1P99A 4PFYA 3TQWA 2X7PA 5I2KA 1SDXA 4L17A 4G68A 3H03A 2HAVA 3E3KA 1M5CA 3TQLA 1LFGA 3THIA 1B7UA 3V5AA 1H43A 3H6WA 3MAMA 2I4BA 1UTBB 2XD3A 1OQHA 4F3PA 4RXLA 2QS2A 1JVYA 3MP8A 3W9VA 1EZOA 5FTHA 3PD8A 4F1YA 3I3VA 5DVIA 1PB8A 5L9OA 2VD3A 3FV2A 3MVYA 4E0WA 3RGYA 3HN0A 1P1WA 4ESXA 2UYFA 5ISUA 5FHMA 3K1MA 2QMWA 1MXYA 1GTKA 1FQCA 1B4HA 3TPAA 1FCKA 4BLAA 2Q8JA 3G3IA 4WXJA 2I3VA 5ICTA 2XXXA 3S9EA 3M3KA 2OK2A 2VGQA 4LP2B 3U94A 4GL8A 4H5FA 3HO7A 3LUYA 1URGA 2UVHA 3S9NC 1QJMA 3TDJA 1URSA 5DT6A 3DM0A 1P1OA 4NF4B 3HHGA 1TFAA 1MS7A 3G3GA 1JQFA 4RA1A 3D4CA 1NL5A 1R6ZA 1IXHA 1TFDA 3BFTA 1B0LA 4YU0A 4FORA 2DE4A 4E0XA 4KI0E 4O3BA 3VXBA 3QUJA 3IOWA 1FTMA 1LCTA 1B7ZA 4IY6A 2DS9A 3N6UA 4GXAA 3RLFE 1N84A 2Z8DA 3FVGA 5H8SA 1B9JA 3KJTA 3VVEA 3TFLA 1B4ZA 4N07A 1OQGA 2F78A 2R71A 3KN8A 4ZEDA 3IB2A 1BLFA 1B0HA 3CSBA 2PYYA 3CVGA 4ECFA 1N3WA 1HSJA 5FTIA 1Y20A 1QUJA 3HCQA 3U1OA 4GXSB 2D3IA 3TCFA 1PB9A 2F5XA 3SEVA 4RNSA 1B1XA 4U23A 2VHAA 1MRPA 2UVGA 2F36A 1USYE 3H7MA 1FTJA 3BFUA 4F31B 3SEUA 3U72A 3ILUB 1MM6A 4JSDA 5CMMA 3SDFA 5KDTA 4OMBA 3SEXA 2RINA 3O6IA 5CBSA 3FXUA 4DE8A 2DWHA 2O1MA 4YKPA 1US4A 1B3EA 1WVJA 2UVIA 4YAHX 5H8FA 1MPCA 3PUVE 3D4GA 2F6PA 3MPLA 2NOOA 4RYAA 4OEUA 2A5TA 1NNKA 1OLCA 3A3CA 2ZXTA 1FTLA 2CMOA 2ALUA 4DDDA 3RNNA 2HQ0A 3PGFA 1B6HA 4BDNA 4OFOA 5KZTA 1NNTA 2A5SA 4QFOA 1M5EA 1KWHA 2Z23A 5EYFA 5IKBA 4F3GA 5TPAB 4EQBA 2ONSA 4OVJA 1B2HA 3CFLA 4GL0A 3KOSA 4U4XA 1JETA 3M3LA 3PUWE 3IL1B 4H6DA 1FTOA 2XXQA 2BJJX 3FGSA 5CRYA 3K01A 2V3UA 1QKBA 3RTWB 4FJPA 4PE5B 2H25A 4XKQA 1DPEA 4QSEA 1LCFA 3T9HB 4GD5A 2FA7A 4Q8RA 4NTLA 1B46A 3MWBA 4Q30B 2R9JA 3FUZA 4DIGA 4MFIA 3TMGA 1MM7A 1TWYA 3FIRA 4BDMA 1O64A 3O29A 1RKMA 3GLBA 3MC2A 5H8NA 1R9LA 4IGTA 4UA8A 2W7YA 3PD9A 1QUKA 3ONMA 3RT8A 4G8NA 3IAZA 4ELOA 3FJ7A 1RYXA 2CZLA 4QFPA 2H9BA 4JWOA 3W9WA 3H4ZA 4G68B 3VLWA 2O7IA 1USYH 4IB2A 2FYIA 2KLFA 1GR2A 2XXUA 3EN3A 1A8FA 3C35A 4WEDA 5AA2D 4KPTA 4FEBA 4X1BA 1ZLQA 4G2ZA 4YKKA 2QL3A 3RN8A 4I8CA 1AH5A 2ZNTA 3O6HA 3UN6A 5LOMA 4M4GA 3EQ1A 2NVUB 3FVOA 4I62A 3PMWA 4QHQA 3N94A 2F8DA 2ONRA 2QPQA 3DP4A 3R7XA 3H3GA 5EHMA 4BDLA 4RPOA 4ZZAA 1F9BA 1SW5A 1SYIA 4U1ZA 1ELJA 2DE3A 2OWSA 2HFBA 3O2AA 3MQ9A 1Q1KA 1O7TA 5H8HA 2XXPA 1XVXA 4EQ9A 1LB8A 1NNFA 4ND9A 1B3LA 3VFJA 1I6AA 2H98A 4F2QA 1MDP1 1FQBA 4XTCQ 4FIMA 2AL5A 4EF1A 1A40A 3IX1A 1UIVA 3EHTA 2ESNA 4PFTA 1IXCA 1AIVA 3OMBA 1N3XA 2FNCA 2ZYNA 2XXVA 1MPDA 2PBWA 4QFLA 1JW4A 3B6TA 3Q29A 3USDA 4R9FA 3OEKA 5TU0A 4RJZA 4TLMB 2NUVA 2QJEA 1BP5A 2O84X 3CFZA 4HCYA 2ZMBA 1B40A 3PPQA 3V83A 2GFEA 4HCWA 5F1QA 1A55A 5AA4A 1PBPA 1XOCA 1IZ1A 4KQPA 1A54A 3S2VA 4MF3A 3G3HA 3A3UA 4KFQA 4F1UA 5H8QB 4EUOA 3ODBA 5I2NA 5I57A 3C4MA 4KYSA 1B5IA 1OIBA 3C31A 3B6QA 5L8DA 1MH3A 2ZYMA 4F3SA 3VV5A 5TP9A 2YLNA 5AA2A 3N6TA 4ONYA 3KJ7A 4X9TA 3HHFA 1P1NA 2DE2A 1MQIA 4OESA 1S7YA 4GLIA 4RK2A 2DXRA 2VOZA 4N6PA 2OJTA 3K0VA 2P1SA 1IIWA 1VFEA 1HSEA 1P1UA 2IA4A 3K2DA 2PT1A 3E9XA 3PUYE 2XXHA 3OD7A 1XVYA 5CM6A 1LBCA 3ZKLA 3HPIA 4YB5A 4U2RA 5F7VA 2NWJA 2DWIA 4TOZA 3VLUA 3FV1A 1B32A 1IQ7A 3IJOB 1SW4A 2UVJA 1I6QA 5H8FB 4IO4A 4IO2A 4QSCA 4GF8A 3OELA 3IK6B 5HPQA 2A5TB 3TAJA 1FQDA 2D5WA 1Y1ZA 4XIGQ 4OYVA 3IJXB 1FQEA 3LR1A 1Z7NE 1LAHE 2HCAA 3O97A 5I56B 2DP8A 5DYHA 1ZJLA 2QS4A 1R1NA 1NMUA 3MW0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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