1NKXA

Crystal structure of a proteolytically generated functional monoferric c-lobe of bovine lactoferrin at 1.9a resolution
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
344
structure length
340
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transport protein
molecule keywords LACTOTRANSFERRIN
publication title Crystal Structure of a Proteolytically Generated Functional Monoferric C-lobe of Bovine Lactoferrin at 1.9A Resolution
pubmed doi rcsb
total genus 110
structure length 340
sequence length 344
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-01-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1nkxA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1nkxA02
3I6VA 4RPNA 4Z7EA 1OMPA 5TP9A 4JXIA 3DLNA 5H8HA 4OXVA 1HSLA 1MY4A 1I69A 2O7UA 1XHYA 3N6UA 1GGGA 4LZ8A 4Z0IA 5AA3A 2W7YA 4R73A 3V89B 2XXYA 4FAJA 3UK4A 4OFLA 4NMYA 3EF7A 3GXAA 3R26A 2O68A 4ZEKA 1Y1ZA 2DOJA 3TEPA 3TTMA 2I4CA 4QRZA 4RJZA 4GRKA 3HHGA 5JK4A 2REGA 3BFTA 1IXCA 2GH9A 2I6EA 2UYEA 1A8EA 3VVDA 3PGFA 3PMVA 4O3AA 3O6HA 2DE4A 2ZNUA 3OMBA 5ICTA 1MY2A 3BFUA 3MZBA 1L5TA 4YB5A 2XXWA 1AL3A 1B40A 2XXUA 4EF2A 2DWHA 2H25A 2RINA 4FJPA 4DE8A 3VE1B 1IXGA 2ZYKA 3T66A 2Q88A 4R74A 4Q5TA 3ZS6A 3L6GA 3LSWA 3U92A 4OERA 3KOTA 3FXQA 4KQPA 5LOMA 2UVHA 3S9LC 5AA4B 3CFLA 4F2OA 4K3FA 3T9VA 4RA1A 4Q8RA 3UGWA 1MY0A 4LQ2A 2RF1A 3G3FA 3DELB 2AIXA 1DTZA 4ELRA 1GR2A 1NH7A 3C4MA 1S9TA 4H5FA 1UTHB 3OSRA 4FE8A 1XVYA 2H99A 4KD5A 3K1NA 4N07A 1DMBA 4BLAA 4GF8A 4G77A 4MLVA 1SBPA 1P1NA 4BDNA 1URDA 1PBPA 1D4NA 3FGSA 4XIGQ 5L8DA 3TTLA 4ZZEA 5H8NA 2D3IA 1JVYA 3IOWA 4HTGA 2ZYOA 3N6TA 4ZEIA 2XD3A 5FTHA 2B65A 3IOUA 2R71A 1R9LA 3I5OA 1MPDA 1II5A 5AE4A 3K6WA 3TCHA 4ZEFA 5F1QA 2P1SA 3S9EA 1DSNA 1B3FA 2DWJA 4ZS9A 1YAEA 1A40A 3QXMA 3FVNA 1LB9A 1IITA 3R7XA 2H9BA 1B6HA 4NTLA 4TOZA 1B3GA 3MW0A 5IKBA 3H7MA 1Z7ME 4U23A 4F1YA 4NF4B 4IB2A 4FECA 1N84A 4C1UA 1M5CA 2HFBA 1ANFA 5H8SA 4YU0A 1URGA 3EHTA 3CG3A 1HSEA 4IGRA 3VDFA 1Y3QA 5AA2A 4H0WA 1MH3A 3IK6B 4DXUA 4WKMA 1IXIA 1M5DA 4F29A 3OO7A 1SW2A 3PD8A 2IA4A 4OTEA 1P1OA 4F19A 1N3WA 1A99A 4F18A 4YKKA 1EH3A 4L17A 3K0VA 3LBSA 3Q26A 2D5WA 1BKAA 4KR5A 4G4PA 1PB7A 4FEBA 3DP6A 3USDA 3OXNA 3QSLA 1LCTA 1CB6A 1US5A 3A3UA 3HSTA 4FORA 3D4GA 3C35A 1MXXA 4PETA 4XXUA 1LFHA 4I1DA 3ILTB 3WAEA 3SKPA 3IOTA 2DVZA 4LVQA 2CZLA 4U4SA 3FJMA 4HW8A 3MWBA 3KSXA 2HAUA 3FATA 1B5JA 3MBPA 5CRYA 3H6TA 4GD5A 4IY5A 4Q30B 3EHUA 4DDDA 1XVXA 1MXZA 1IEJA 1B9JA 2ZYNA 3CFZA 1AMFA 1BP5A 4X1DA 1POTA 4R9GA 1QW0A 3PPQA 1AH5A 3RN8A 1KWHA 1N04A 3Q27A 4F31B 5DYHA 4YKJA 2PT2A 1B51A 4KYEA 3B6TA 2RKMA 2XX7A 4R6HA 5I2NB 5EYFA 3FZVA 5IAIA 1GTKA 4I8CA 1NNKA 3PPRA 4C1TA 1LBCA 2I4BA 2CMOA 2NUVA 1NFTA 2G93A 4F22A 1B1HA 2Q2AA 5AA4A 2QMXA 3RGYA 3SESA 2ABHA 1NNPA 4OVJA 1URSA 3UIFA 3ZKLA 1VSOA 3HO7A 2F6PA 4BDMA 4PFWA 4OETA 3M3FA 2V3UA 4C0RA 1UTHA 2XX9A 4I9DA 1O7TA 3TUSA 5KDTA 4OEUA 1LGBC 4HCYA 4R72A 2O1LA 3Q25A 5K2XA 1B46A 2YPNA 1UQWA 1LAFE 2Y7WA 2V84A 3H3GA 5CBSA 2FA7A 3OENA 4WEDA 1B3HA 1MM6A 2XXQA 3LSFB 1TXFA 2P2AA 3LSLA 5KCJB 2FNCA 4DCYA 3H6UA 3TTKA 3K01A 5B7DA 1ELJA 3QIMA 2Y7PA 3V8XB 1B52A 4GFRA 4H8JA 4RYAA 1EZ9A 3FVGA 1FTOA 5J1DA 1QULA 3RNNA 2HCAA 1NNTA 3MZ1A 2XXTA 2ONRA 1FQFA 2QS1A 3ONMA 3E9XA 5B70A 5I57B 2NWJA 4BDQA 3UA8A 1JW5A 5DEXB 4IY6A 1LLSA 1H45A 3PD9A 4OWDA 2XXRA 2GRVA 3FVOA 3KGCA 3PMXA 2NOOA 3GBBA 2A5TB 1A54A 5M2VA 1B0LA 2Z8FA 1B0HA 2PYYA 1FQBA 1MH4A 3CFXA 2XXVA 4LONB 4QFKA 4G68B 3KSJA 4F3SA 4IO3A 3IX1A 2I0BA 3MC2A 3PUWE 4JWXA 1OLCA 3G3GA 3VFJA 4ESWA 5CMKA 4DZ1A 1Y4TA 3V5AA 4DCXA 3CSGA 1MRPA 4ZEDA 4P0IA 1H3DA 3PPNA 3KFMA 1MQHA 3LR1A 4KPTA 1MXUA 2YJPA 5JTYB 1NH8A 3MZ9A 5CMMA 3FIRA 1LCFA 1EZPA 4YICA 4NF6B 1TT1A 2F78A 3SEYA 1XS5A 3OOAA 3EQ1A 3S9NC 3WAFA 4H8IA 1DPPA 2GHBA 4YB6A 2B3FA 4GXAA 3TFLA 3LC8A 5DTBA 3FV1A 4TLLB 1OLAA 1UTBB 1JEUA 4GVOA 1B3LA 5AA2D 3TTNA 1JW1A 1NL5A 2E0SA 3K4UA 2RC7A 1Y20A 4YZZA 3N5LA 3N94A 1NNFA 2I3VA 1A7LA 5I58B 1USYE 1Y9UA 1Y3NA 3O66A 4ZE9A 2Z8EA 1B3EA 5I2KA 4MF3A 2F34A 4P0GA 4NF8A 2DSFA 2RCAA 1DTGA 1NKXA 2YLNA 4IO7A 4NE4A 3TODA 1MM7A 3U94A 1N7XA 4QFOA 1R1NA 4G68C 3K00A 3VXBA 5FTIA 2QRYA 1QVSA 1PB8A 1QUJA 3TELA 3VVEA 4JSDA 1YTVA 3VLWA 4XKQA 2UVIA 2O84X 1JNFA 2UVJA 1LB8A 4KYDA 3PPOA 2PT1A 4ELOA 3TKDA 1MS7A 4THIA 1XT8A 5I84A 5L9OA 3PU5A 1NMUA 3UN6A 1XC1A 2A5SA 1LFGA 3MJNA 3BBRA 5FHMA 1JETA 3H6WA 4JB7A 3MVYA 5H8FB 3CRBA 1B32A 2UXAA 1EZOA 2XXPA 2OBGA 5AA1A 4GOTA 4JBZA 2OJTA 2B3BA 4H65A 5KCJA 1Y4CA 3S9MC 3VV5A 2X26A 1MPBA 5DT6A 5FHOA 4P11A 1ZU0A 2RC8A 4U1ZA 5ELVA 3SDFA 1ZMGA 4I62A 3IJXB 1B5IA 3K2DA 2AYSA 1ZLQA 3EN3A 2V3QA 1B4HA 3U93A 3IORA 3OO6A 3JYRA 2HQ0A 4DIGA 5CMBA 1FQCA 3F11A 3PV0E 3RTWB 5I59B 2Q89A 4G8HA 5DEXA 5ICQA 3C34A 5I56B 1UIVA 3MP1A 3SEXA 2FYIA 1US4A 1BIYA 2PVUA 4LUBA 2A5TA 3KG2A 4EDPA 4AB6A 3B7DA 3ZKKA 5TPAA 4OMBA 4G68A 3ECRA 1LFIA 1MPCA 5DVIA 1TFAA 4G8MA 2Y84A 1MDQA 4LATA 1B7HA 1I6AA 4LA9A 4GIZA 3E13X 3CG1A 1B7ZA 1D9YA 3C31A 4ND9A 2OK2A 4X9TA 1SD3A 4EXKA 4KFQA 2Y7IA 3TMGA 5JTYA 3O6GA 3KN7A 4RY1A 3E3KA 2QJEA 5EHMA 5CMCA 3H4ZA 2DS9A 1FTMA 3KN8A 4IGTA 4HCWA 3MVXA 2IEEA 1SW4A 2ZNTA 3EHSA 2F6GA 4KHZE 2O6AA 4OEVA 4QSCA 3OELA 3IO6A 3THIA 4F39A 3LSXA 3OEMA 4F3PA 3RQTA 1DOTA 1UTBA 1MY3A 4Q0CA 2F36A 3CVGA 1FQEA 1LBBA 3GLBA 1Y1MA 1VFEA 3CSBA 1A8FA 3FV2A 3RTFB 4DLDA 4LZ5A 3TQWA 1MQJA 1OVBA 3ZSFA 4ZECA 3PMWA 4IO5A 1Q35A 4RK9A 4OFJA 2Q8JA 4EQ9A 5A5XB 1SVXB 3PUZE 2O51A 4LQ5A 3CI8A 4GQOA 3QK6A 1ZJLA 4BDOA 4LP2B 3RT6B 1QUIA 4QFPA 4TQUQ 3M3KA 5K2YA 1JW4A 1R6ZA 3PPPA 3D4CA 2ZXTA 3W9WA 2Z22A 4EQBA 4GL0A 4EUOA 3IB2A 1MXWA 4OQOA 2ZNSA 4R75A 1IIWA 4M4GA 1FQDA 4UA8A 2H98A 3TDJA 3K6UA 3SETA 3TYHA 1MDP1 5DVJA 3K6VA 5ISUA 4GL8A 4N13A 2I0CA 1D9VA 3KN3A 1B58A 1O63A 1GV8A 2QL3A 3HPIA 4IO4A 2OLBA 2QS3A 1B5HA 4NEDA 5H8NB 4R2BA 1Z7NE 4RK2A 2GFEA 5HM4B 1DPEA 2XHDA 4R2FA 1A55A 2X7PA 4EF1A 1BTJA 5H8FA 2Q9TA 4LZ7A 4FIMA 4RNSA 1PBQA 3IB0A 4OESA 1PC3A 4YKIA 3SEVA 5JEIA 4U2RA 2OZZA 4QSDA 2QS4A 3S2VA 3TPAA 1YPNA 3Q28A 1CE2A 4OZ9A 3IR1A 2NVUB 3W15C 2HAVA 1QUKA 2ONSA 1MXVA 4OFOA 4IO2A 2DXYA 2ZYMA 2Y7KA 1D3KA 3JV9A 4XKNA 2P0SA 3U72A 4E0XA 4ISUA 1Q1KA 3OEKA 2BJJX 3UORA 4ECFA 2REJA 4E0WA 1LSTA 3AXFA 5EHSA 2H4IA 3FXRA 1OIBA 1LAHE 2NXOA 4NF4A 3IOVA 1T0KA 4R6KA 1M5EA 1ZIUA 1QJMA 3M3LA 4N6PA 4PFTA 2VHAA 2THIA 4POXA 4JWYA 3HCQA 3G3IA 3T93B 4GXSB 4H5GA 3K1MA 3IL1B 4F2QA 3RLFE 3G3HA 4UACA 2OCUA 2F8DA 3TCGA 1IZ1A 2DWIA 2ZMBA 1H43A 5F7VA 4QFNA 3RUMA 3LUYA 2R6GE 4XTCQ 4G8NA 1HSJA 3O2AA 3IJOB 3N26A 1B4ZA 3E4RA 3O9PA 4F3BA 1VR5A 4KI0E 3RPWA 3FJGA 1SYIA 1S50A 2I3WA 1R9QA 4NF5B 4ELQA 3PUYE 3MPLA 2ONKE 4H6DA 4DXBA 3KBRA 3QUFA 5H8QB 3S4UA 3MPKA 3C33A 2VOZA 1JQFA 4YMBA 1FTKA 3V83A 4X48A 3TCFA 4AQ4A 1M5FA 2QSXA 1I6BA 2F7CA 3C36A 3MQ9A 4MH5A 5A5XA 5ITOA 2HZKA 2OWTA 4GLIA 4R9FA 5I2NA 3GBAA 1P1QA 2UVGA 1MY1A 2QPQA 3FJ7A 1SW1A 3FVKA 1TFDA 1FTLA 3SEUA 5FHNA 3DP8A 4PFYA 2RCBA 3OO8A 3SEWA 3FASA 4ZDMA 3UP9A 4YB7A 3O97A 2WKYA 4KCDA 1IQ7A 1IXHA 4HS7A 3KOSA 4OHNA 2QMWA 2Q2CA 3TAJA 3ILUB 3MP8A 3TZAA 5KDTB 3PUXE 3DP4A 3VXCA 1P1UA 4F3GA 1J1NA 1FQAA 4F1UA 1LAGE 1AIVA 1SI1A 3CR9A 1JEVA 2F7BA 2V25A 3KJTA 3OO9A 4PFUA 1N7WA 2E1SA 3TQLA 2RC9A 3G3KA 2VD2A 1RKMA 3H6VA 4EQ7A 1MXYA 1BLFA 3HHFA 4U21A 5CM6A 2ALUA 1AOVA 4ZE8A 1P1WA 2AL4A 3TTRA 3OSQA 1YCJA 1P99A 4KCCA 5I57A 1WVJA 1F9BA 5BUUA 1POY1 2VD3A 5DVFA 2DP8A 3IO4A 4AB5A 4JDFA 3B6WA 2M8CA 4OENA 3H03A 3U1OA 2R9JA 4MLQA 3MVZA 1SDXA 2PX1A 4ELPA 5L9SA 2QS2A 1H76A 3C9HA 4DXCA 1S7YA 5TP9B 2LAOA 1PEBA 3OD7A 4PE5B 5H8HB 5HPQA 1N0TA 3A09A 1LAXA 3KEIA 2HZLA 1USYH 1RYXA 1ZBMA 3B6QA 4NWDA 3T22A 1SYHA 3EPEA 4PP0A 4KYSA 2AL5A 2DXRA 4YAHX 3VVFA 1RYOA 4H67A 3QAXA 3MAMA 3PUVE 3W9VA 3K1PA 4O3BA 3L6HA 4OYVA 3O6IA 4YMAA 1VE4A 3G3JA 2GHAA 3IB1A 4XKRA 4MFIA 3HV1A 4ESXA 2XXXA 3P7IA 1OQHA 3QYTA 2I58A 4NF6A 3SERA 3FUZA 5CC2A 1MQGA 5CBRA 3A3CA 2O7IA 4XKPA 3T9UA 2F7AA 1MQDA 1I6QA 1B05A 2VGQA 3K02A 3ODBA 4POWA 3C32A 1SW5A 4F1VA 2PMSA 5ITPA 4NF5A 1FCKA 2XXIA 2F97A 4G2ZA 5H8QA 4WEPA 4X1BA 3G7WA 5I58A 3VLUA 3KJ7A 3MUQA 5I2KB 4BDLA 2Z23A 1WDNA 2V93A 4QHQA 3FD3A 1GVCA 2V3TA 2X7QA 2DE3A 2KLFA 4NF8B 1XOCA 3GZGA 4FATA 4WXJA 2DE2A 3T96B 4U1OA 1M5BA 3U8QA 5L9MA 2HEUA 1Y3PA 4QFLA 4ZEBA 5TU0A 3JZJA 2ESNA 2VP1A 4ZZAA 4MBPA 1SI0A 1B1XA 1EU8A 1WODA 4U22A 1PDAA 3H06B 4QSEA 1OVTA 1ATGA 5BWJA 1FTJA 1QKAA 1UIUA 2HXWA 3T9HB 4IO6A 1O64A 1N3XA 3QUJA 2DWAA 2PBWA 4RPOA 3FXUA 3RT8A 2F35A 3I3VA 5KZTA 1B2HA 3HN0A 3O28A 2ANJA 4GWOA 4RXLA 3M8UA 2I48A 4NWCA 1FW0A 1B7UA 4FEDA 4R6YA 2XD2A 4TLMB 1TWYA 2DVCA 3KZGA 3K6XA 4BDRA 3IAZA 2I49A 2O1MA 3T9XB 2OWSA 1IUDA 2D21A 4QF9A 1VFDA 4YKPA 4O3CA 1ZTYA 2O69A 1N76A 4PQJA 1SQYA 4H1XA 1QKBA 1PB9A 3O29A 4M1VA 2UYFA 1JVXA 3Q29A 1ZKBA 2XX8A 3CIJA 5CI5A 2F5XA 4JSOA 4U4XA 3RY3A 2Z8DA 4JWOA 1MQIA 2DQVA 2Y7RA 5I59A 3R6UA 3MVWA 1MG1A 3MP6A 3BKIB 3DM0A 2G29A 1OQGA 2XXHA 5I56A 5AA2B 3VLVA 2DYXA 4ONYA 2H5YA 1H44A 5HBCA 4EXLA 5TPAB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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