2OZZA

Crystal structure of yhfz from shigella flexneri
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
231
structure length
230
Chain Sequence
SNAMDNKALLSHVDINNVVCAMPLPYTRLYEGLASGLKAQFDGIPFYYAHMRGADIRVECLLNGVYDMAVVSRLAAESYLSQNNLCIALELGPHTYVGEHQLICRKGESGNVKRVGLDSRSADQKIMTDVFFGDSDVERVDLSYHESLQRIVKGDVDAVIWNVAENELTMLGLEATPLTDDPRFLQATEAVVLTRVDDYPMQQLLRAVVDKHALLAHQQRVVSGEQEPSY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Shigella flexneri 2a
publication title Structure of YhfZ from Shigella flexneri
rcsb
molecule keywords Hypothetical protein yhfZ
total genus 74
structure length 230
sequence length 231
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-02-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF14503 YhfZ_C YhfZ C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ozzA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ozzA02
4JWYA 1M5CA 3O66A 4G2ZA 1LGBC 1OVBA 4XKNA 3SKPA 1IUDA 4MH5A 3T9HB 4QFPA 2AL4A 4FORA 1ATGA 2YLNA 3HPIA 1I69A 3BKIB 2ZYMA 4IO7A 3RQTA 3TMGA 3FVKA 2QPQA 3MVWA 2FA7A 5H8QB 4FE8A 1SBPA 3LSLA 1URSA 2XD3A 1SW5A 3DELB 4QFKA 1P99A 3K6XA 1A8FA 3G3FA 2XXYA 2DXYA 3D4CA 3EF7A 5DVIA 2ABHA 3OOAA 1CE2A 4LQ2A 2OLBA 4KI0E 2PMSA 4X9TA 2F6GA 3H6TA 1FQDA 3DP4A 4BDQA 5JEIA 3FVNA 4G8MA 1B51A 5DVJA 1XVYA 1MRPA 1WVJA 3H6VA 3TFLA 4PFUA 3CG3A 4LVQA 3GLBA 1OMPA 2F36A 3CSGA 1NMUA 3KEIA 1MPCA 4F3GA 4YU0A 3U8QA 1ZJLA 5KDTB 3CFZA 1VR5A 2VD3A 4OMBA 1Y1ZA 1NH7A 2NOOA 2REGA 3O6GA 1H76A 5AA1A 1B7HA 3HSTA 5L8DA 3RNNA 1DPEA 1N7WA 3MW0A 3RY3A 4QFOA 2R9JA 3RLFE 2DSFA 3KBRA 5I56A 4HCYA 3H03A 1JVYA 2V93A 4GWOA 3IO6A 2REJA 5F7VA 4ISUA 3JV9A 4H65A 4R9FA 1B32A 3OSRA 3P7IA 1P1OA 4C1TA 4O3CA 1EZ9A 4ESXA 4M1VA 2I48A 3C33A 2ZNSA 1UTBB 2I0BA 3ZSFA 3VE1B 2H99A 1N7XA 5I59B 3KG2A 4WKMA 4NF4B 1LBBA 3IX1A 1JVXA 3FV2A 3V83A 2VP1A 3I6VA 5H8HA 4ELPA 3HV1A 4DZ1A 3T22A 4XKPA 1Q1KA 1UTHB 4ZZAA 3FVGA 3K01A 3PPNA 3FXRA 4NMYA 3UIFA 1N0TA 2HXWA 3E9XA 2NWJA 1YTVA 2DWAA 2XXRA 4DXBA 3MQ9A 1H3DA 1MXZA 3OEMA 2F97A 4L17A 3SESA 5I57B 2DWHA 4F31B 3GBAA 2OBGA 3CI8A 4GLIA 5DEXB 4ZDMA 4LUBA 3UN6A 1JQFA 2OWSA 2UVIA 2O6AA 4ONYA 1NH8A 1NNTA 4EF2A 2ZYKA 4IO3A 5JTYA 4K3FA 4IGTA 3PUYE 1B1HA 2XXVA 2XXHA 5EHMA 3TDJA 4OXVA 3R6UA 3CG1A 3V5AA 3LSFB 3IK6B 4F39A 3O2AA 1SYHA 1PB9A 4RY1A 1EH3A 4ELOA 4H67A 2VGQA 5BUUA 4PFTA 4C1UA 4E0XA 3CFXA 1R9QA 3UK4A 4EXLA 3FD3A 4EQ9A 5IAIA 1F9BA 4ZECA 1T0KA 4YZZA 2ZYNA 3KN8A 3S2VA 4G68B 4POXA 1JW5A 3W15C 3LSXA 1PB8A 3N94A 1NNPA 3L6GA 3O29A 3U94A 1GV8A 1AOVA 4FAJA 2CMOA 2UVGA 1SW1A 2QS3A 2Y7KA 4X1BA 3FASA 4N13A 3M3KA 5KCJA 5I2KA 4QF9A 3K6VA 4OYVA 2DE4A 4YB5A 1B3HA 1POY1 1B58A 1Z7ME 1OIBA 4ESWA 2ONSA 2GH9A 4F1YA 2O68A 1ANFA 2F7BA 3MJNA 1US4A 4WEDA 4H6DA 1M5BA 4R6HA 5ICTA 1MG1A 3WAFA 1MM7A 4R6KA 4RK2A 2WKYA 4O3BA 4H5FA 2O7IA 4Q8RA 3BBRA 1A7LA 3EHTA 3TQLA 3K2DA 5AA2B 4IO5A 2RC9A 2X26A 3K1NA 3EHSA 3S9EA 4JBZA 2PT2A 1Z7NE 3LUYA 3QXMA 5A5XB 2X7PA 4IB2A 1MS7A 2QJEA 1XT8A 2H4IA 1FCKA 4QRZA 1MM6A 4QFNA 5H8NA 4F2QA 3EQ1A 3OMBA 2XX8A 1OVTA 4NWCA 1VSOA 3ECRA 4YKKA 3FGSA 4N6PA 1SW4A 3TTKA 3N5LA 4WXJA 2W7YA 4R6YA 3C32A 1VFEA 4DLDA 3A3CA 3QSLA 4PQJA 2QS1A 4XIGQ 4I62A 3HHGA 2Y7RA 3HHFA 1USYE 2QS2A 3FATA 2YPNA 1IQ7A 1B40A 3E4RA 4I8CA 2UYEA 3KSXA 3TTNA 4KYDA 3KN3A 2D3IA 1H45A 2XXXA 2UVHA 2RINA 1I6QA 3B7DA 1FTJA 2PBWA 3MP1A 4RJZA 5HBCA 5I84A 4F29A 2A5TA 2QL3A 1DOTA 3S9NC 3MUQA 4KD5A 4U22A 2F34A 1H44A 3S9LC 3THIA 3UA8A 4G77A 2Q2CA 2D5WA 4BDLA 5FTIA 3MZ1A 1M5DA 2H9BA 4QFLA 5AA3A 1R6ZA 2R6GE 1S9TA 4LP2B 1FQCA 3MBPA 4FIMA 4F3PA 4PETA 1LAXA 2FYIA 2Q9TA 2O7UA 3VFJA 1R1NA 2F5XA 3H7MA 1LSTA 2CZLA 4YMBA 3K1MA 5H8SA 4PFYA 3O9PA 5TP9A 4EQ7A 4RXLA 4OVJA 5TU0A 2H5YA 1O63A 5TPAB 2HZLA 1IXIA 1S7YA 4JB7A 5I2NB 1N04A 3DLNA 5L9SA 4KQPA 3VVDA 2IEEA 3AXFA 2UXAA 2F6PA 2P0SA 3PPRA 2G29A 1B3EA 1QUIA 4NTLA 1A40A 4X1DA 4RYAA 1YPNA 2I58A 1ZU0A 4Q0CA 4NF5A 4NF8A 4YB7A 4P0IA 1Y9UA 2XXQA 1KWHA 1MY4A 1AL3A 1B9JA 2Y7WA 4AQ4A 3I3VA 1ZIUA 1LBCA 3MVXA 3KFMA 5AA4A 2V25A 4GF8A 3N6TA 1FTOA 2O1MA 4YKPA 2F78A 3C34A 1MH3A 1A54A 1MDQA 3O28A 4EUOA 2ZNTA 1Y20A 3MVZA 4U1OA 4FEDA 4LATA 2DVZA 4MBPA 5CBSA 4LQ5A 3ILTB 4ZEDA 1B6HA 3H6UA 1QKBA 2HCAA 4I1DA 3DM0A 3OENA 1VE4A 1OQGA 2ALUA 1WODA 5DT6A 1ELJA 4OTEA 3MVYA 3PPOA 4LZ7A 2DS9A 2Z8EA 4H1XA 1XVXA 4F22A 2UYFA 4R2FA 5CBRA 3KSJA 1DMBA 1GTKA 1DTZA 3IOUA 1HSJA 1TWYA 1TFAA 4IY6A 1SI0A 2I4BA 4GOTA 4DCYA 4OQOA 1OLCA 3H06B 4G8HA 3HN0A 4ZE9A 1A8EA 3ILUB 3IJOB 4M4GA 1MPDA 3FXUA 4IO2A 3IORA 1XC1A 3V8XB 2RC8A 2Z23A 1II5A 4JSDA 1HSEA 2NXOA 4FEBA 1PBQA 1B5JA 3GXAA 5I58A 4JWXA 3TCHA 3IB2A 1XS5A 4HTGA 2QSXA 3UP9A 3IAZA 2Y7PA 5HM4B 4GFRA 1JNFA 1NNFA 3G3HA 3U93A 1MQIA 1URGA 3W9WA 2RC7A 3N26A 1IIWA 3RT8A 1B4ZA 2V3TA 2YJPA 3EHUA 3G3JA 1QJMA 4BDOA 1QW0A 2ZNUA 3TZAA 1US5A 1WDNA 2H25A 1P1WA 2ONKE 4Z0IA 3T9UA 2QMXA 3F11A 4OFJA 2Q2AA 3TTLA 3KOSA 3S4UA 4GRKA 1OQHA 2V3QA 4EXKA 4KCDA 2O84X 3FVOA 3CRBA 5CMMA 2QRYA 3FJ7A 2X7QA 5HPQA 2R71A 4X48A 2ZMBA 3EN3A 4YICA 4MLQA 2XD2A 3H4ZA 3RPWA 1SW2A 4JWOA 5JK4A 3W9VA 4ND9A 3T66A 3KJTA 3RN8A 1NL5A 4R2BA 3TELA 4BDMA 4YAHX 3QIMA 4KR5A 4ZE8A 1EZPA 3U72A 3Q26A 2Z8FA 3RTFB 1CB6A 1IZ1A 5H8QA 4NF5B 2HZKA 4NF8B 1Q35A 2HEUA 1BTJA 1MXXA 4DE8A 1QUJA 1SYIA 4EF1A 1B5IA 3T9VA 4LONB 3C36A 2F35A 3OO9A 5KZTA 5DVFA 3K6UA 4OHNA 3PUVE 3G3KA 4FJPA 3CVGA 1N3WA 2F8DA 4H8IA 3LBSA 1B05A 5B7DA 2Q89A 4R9GA 4DCXA 1LCTA 5BWJA 4MFIA 3TQWA 4OFLA 4TLMB 5ICQA 5DTBA 4JDFA 4TOZA 5K2YA 3IJXB 3SERA 3ZS6A 4F2OA 3OO6A 2IA4A 5I56B 1NKXA 2DOJA 3TKDA 3RTWB 3PGFA 3U1OA 1M5FA 3QUJA 3PD9A 1SD3A 3PMXA 3E3KA 3EPEA 3MWBA 3PV0E 3SEYA 4KFQA 3CR9A 4R72A 2XX9A 2RCAA 3IB1A 5KDTA 2F7CA 3IOWA 2DYXA 1P1QA 3IL1B 1PC3A 4XXUA 3MP8A 2QMWA 1GGGA 4UACA 4GQOA 1BP5A 4R73A 2ONRA 4GL0A 1Y3NA 1LB9A 1BLFA 5B70A 3G3GA 3PPPA 4GXAA 3I5OA 2VD2A 3CFLA 5AA2D 4U21A 5H8HB 2Q8JA 1QVSA 1JETA 3K6WA 1VFDA 3TCFA 3Q25A 3SEVA 5K2XA 4IY5A 5FHOA 4RPOA 3WAEA 3FV1A 1FTKA 1O7TA 4ELQA 2I3VA 2A5SA 3VVEA 1I6AA 1PB7A 2AIXA 2DVCA 2XXUA 4GL8A 1ZKBA 5DYHA 3SDFA 1XOCA 4GXSB 1UTBA 4FECA 1USYH 1MY1A 2XXWA 5I59A 3E13X 3MPKA 4NF4A 1FW0A 4ZS9A 1AH5A 3S9MC 2ZYOA 4NWDA 5JTYB 3V89B 5FHMA 3IOVA 2ANJA 3KOTA 4ECFA 3OSQA 1Y4CA 4U4SA 3JZJA 1M5EA 1UTHA 4R75A 2DE3A 4OEUA 1YAEA 2GRVA 1A55A 3TTMA 3A09A 4KYEA 4U2RA 1N3XA 3L6HA 4BLAA 1FQEA 2PYYA 4ELRA 2Z22A 1DPPA 1P1UA 3T96B 3D4GA 2AL5A 4Q30B 3QAXA 2THIA 1B1XA 5J1DA 2ESNA 3CIJA 1A99A 5I57A 3C35A 1FQAA 2OK2A 1D9YA 1SI1A 3ODBA 5DEXA 1B5HA 1MDP1 4NE4A 3KN7A 3IOTA 5ITOA 2DP8A 3LC8A 1N76A 4YB6A 4EDPA 4BDRA 3PPQA 4OESA 3R7XA 3MAMA 1ZMGA 1MXVA 4HW8A 2O1LA 3DP8A 2GHAA 3MZBA 5CMBA 2B3FA 1IXGA 3A3UA 4XKRA 5EHSA 4RA1A 1IEJA 4H0WA 3VXCA 4PFWA 4GVOA 5CMKA 5KCJB 1B3LA 5I2KB 3ONMA 1URDA 1P1NA 3O6HA 4ZZEA 1H43A 3N6UA 2NUVA 4F3SA 1RYXA 4YKIA 1SDXA 3HO7A 4MLVA 2Q88A 1RKMA 4G68C 2DWIA 1UIUA 4JSOA 4G68A 1ZLQA 4LZ5A 1HSLA 3FUZA 4JXIA 2Y7IA 4F1VA 1S50A 2UVJA 3O6IA 4XTCQ 4P0GA 1Y3PA 1SQYA 5H8FA 2E1SA 2GFEA 3GBBA 4F19A 3TEPA 4OENA 3GZGA 2OWTA 2XXIA 1B7UA 1LFHA 3IR1A 4IO4A 3SEWA 2OJTA 1GVCA 3K4UA 1PDAA 3K0VA 3PUWE 1MY2A 5H8NB 2D21A 3M3FA 1ZBMA 1LAFE 4GD5A 4FATA 1B0LA 4HCWA 3VLUA 2PT1A 4POWA 5IKBA 4OWDA 4HS7A 4OFOA 4C0RA 4QHQA 5F1QA 4ZEKA 3M3LA 5CC2A 1DTGA 4DDDA 3TAJA 1PBPA 3TUSA 4KCCA 5AA2A 3PUZE 2I0CA 1PEBA 4BDNA 1LFGA 3LSWA 2DQVA 3BFUA 4I9DA 5ISUA 1B2HA 2AYSA 2E0SA 1MXWA 3C31A 5L9OA 3OELA 2Z8DA 3B6QA 3G3IA 3UGWA 5A5XA 2OCUA 3RUMA 2F7AA 3ZKKA 1B7ZA 5M2VA 2A5TB 2FNCA 3PUXE 1EZOA 4ZEFA 5CM6A 2XHDA 4NF6A 1B3FA 2HAUA 4DXCA 3FZVA 3JYRA 4H5GA 1B52A 3KJ7A 1MY0A 5AE4A 1L5TA 3MPLA 3B6WA 4KPTA 3VVFA 1OLAA 2GHBA 1Y4TA 4YKJA 1GR2A 4LZ8A 3FJMA 4OZ9A 1MQDA 3VLWA 3VDFA 2HQ0A 4QSCA 2DXRA 3TODA 1N84A 3CSBA 2I3WA 3SEUA 4RPNA 2QS4A 2O51A 1QULA 3BFTA 2O69A 3K02A 1BIYA 1MQHA 3O97A 4QSEA 2HFBA 1B3GA 4N07A 5TP9B 4AB5A 5LOMA 4RNSA 3SEXA 3QUFA 2VHAA 4Z7EA 3FXQA 2DE2A 1AMFA 1TFDA 4RK9A 3RGYA 4YMAA 1MH4A 3PMWA 1NFTA 3OO7A 4KYSA 3ZKLA 3TPAA 1RYOA 5CMCA 2M8CA 2HAVA 3OEKA 3VV5A 3C4MA 2RKMA 1JEVA 1UIVA 4MF3A 4DIGA 4ZEIA 3C9HA 3G7WA 1B0HA 4AB6A 4OEVA 4O3AA 3TCGA 4F3BA 4F18A 1Y3QA 1TXFA 2P2AA 5AA4B 4GIZA 2PX1A 2OZZA 1SVXB 5TPAA 1MQJA 5I2NA 3H6WA 4TLLB 3DP6A 1FTLA 5FTHA 3VLVA 4P11A 1B46A 5H8FB 2XX7A 3Q29A 3TYHA 1ZTYA 3K1PA 4IGRA 1B4HA 3UORA 2Y84A 1QKAA 3KGCA 1JW4A 1I6BA 2P1SA 3IO4A 4G4PA 2VOZA 3KZGA 2PVUA 1R9LA 5CI5A 4G8NA 4LA9A 1J1NA 4UA8A 1O64A 2LAOA 1MXUA 4PE5B 4OETA 2V3UA 5FHNA 1MPBA 1UQWA 3HCQA 2RCBA 5ITPA 4QSDA 2V84A 1MQGA 1FQFA 4XKQA 1XHYA 4U1ZA 3TTRA 1NNKA 3QK6A 1POTA 1BKAA 4DXUA 3LR1A 1EU8A 4IO6A 5EYFA 2B3BA 3PU5A 2BJJX 3T93B 2I6EA 4F1UA 4U4XA 4R74A 3B6TA 1FTMA 1LCFA 5L9MA 1AIVA 3M8UA 3MZ9A 4EQBA 2B65A 1FQBA 1DSNA 1MY3A 3SETA 1JW1A 4PP0A 3Q28A 3MP6A 5I58B 1QUKA 1IXHA 3IB0A 2KLFA 2H98A 3VXBA 2G93A 2XXPA 2RF1A 3PMVA 4WEPA 1JEUA 1LAGE 2DWJA 1D4NA 4NF6B 3K00A 5CRYA 4ZEBA 4KHZE 1MXYA 5ELVA 1LAHE 3FIRA 2XXTA 2I49A 4OERA 4Q5TA 3MC2A 1LFIA 2I4CA 1TT1A 3OO8A 1D3KA 3PD8A 4E0WA 3U92A 1LLSA 3RT6B 1IXCA 4U23A 3R26A 4NEDA 3FJGA 3T9XB 2ZXTA 3USDA 1IITA 3OD7A 2NVUB 1D9VA 3Q27A 4TQUQ 3QYTA 4THIA 1LB8A 3OXNA 1Y1MA 1YCJA 3H3GA 4H8JA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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