2OZZA

Crystal structure of yhfz from shigella flexneri
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
231
structure length
230
Chain Sequence
SNAMDNKALLSHVDINNVVCAMPLPYTRLYEGLASGLKAQFDGIPFYYAHMRGADIRVECLLNGVYDMAVVSRLAAESYLSQNNLCIALELGPHTYVGEHQLICRKGESGNVKRVGLDSRSADQKIMTDVFFGDSDVERVDLSYHESLQRIVKGDVDAVIWNVAENELTMLGLEATPLTDDPRFLQATEAVVLTRVDDYPMQQLLRAVVDKHALLAHQQRVVSGEQEPSY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Structural genomics, unknown function
molecule keywords Hypothetical protein yhfZ
publication title Structure of YhfZ from Shigella flexneri
rcsb
source organism Shigella flexneri 2a
total genus 74
structure length 230
sequence length 231
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-02-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF14503 YhfZ_C YhfZ C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ozzA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ozzA02
3ZKLA 1MDQA 4DIGA 1QULA 3MWBA 1BIYA 2I3WA 2QRYA 4R75A 2I49A 5M2VA 5EYFA 1VFEA 4Z0IA 4PQJA 4XXUA 3O6HA 5IAIA 3K6UA 2I3VA 1IXIA 2WKYA 4YAHX 1O7TA 1Y3PA 1JVYA 1DPEA 2G93A 5HBCA 3MVWA 3K2DA 5CMBA 1Q35A 2CMOA 3MVXA 1Y20A 3K01A 2H4IA 1II5A 5CMMA 3Q28A 2DE3A 4RYAA 1F9BA 2NVUB 4YB5A 3WAEA 1N84A 3L6GA 3VXCA 4U21A 3N6TA 2X7PA 2KLFA 3TTNA 1FQEA 5AA2A 1USYH 3PUZE 1FTOA 2X26A 4P0IA 1JEVA 3TTRA 1Y4TA 4DXUA 3LBSA 3N6UA 5H8FB 2QMXA 3LR1A 3SERA 1B5HA 3RY3A 4DXCA 2ZYKA 3FV1A 2AL5A 1SYHA 3PMVA 4I62A 3HV1A 3IK6B 2UVHA 4ELOA 1AIVA 3OD7A 1GV8A 2QS3A 1O63A 2XXXA 4UA8A 4ND9A 1FTJA 2HXWA 3MC2A 4DE8A 4GXAA 3SEYA 3EF7A 2Q8JA 1H3DA 4N6PA 4G8MA 2Y7KA 1MXZA 1I6BA 4R2FA 3TMGA 2I48A 1B3FA 3JZJA 2W7YA 1MPBA 4H6DA 5DVIA 4R74A 3CFXA 1Y1MA 2I4CA 4GL8A 1FTMA 4Q0CA 1LSTA 2PT1A 4MH5A 4KCCA 3P7IA 1UTBB 4F29A 4ZEKA 4EQ9A 1R9QA 5DEXA 4XIGQ 3G3GA 3PD8A 1H44A 2PVUA 1B32A 2IA4A 4BDLA 3S9MC 1B4ZA 1CB6A 3O2AA 3ILTB 1RKMA 5I2KA 3AXFA 1SW4A 1ZTYA 3RGYA 2O6AA 2DXRA 1R6ZA 4NF6B 1FTLA 5CBSA 1Q1KA 3SEVA 5H8HB 1B1XA 3C33A 1SW1A 4YZZA 2XX7A 3OO6A 3EHUA 1I6QA 1JW1A 5I57A 1BKAA 4JWOA 5B70A 3IOUA 4EXKA 3SESA 2G29A 5I58A 4BDQA 4OEUA 5CI5A 5CM6A 2UYFA 3C4MA 2F36A 4YKKA 4X48A 2XXVA 4ECFA 4H8JA 3CSBA 2F34A 1MXXA 3U92A 1MS7A 5L9MA 3VV5A 3MW0A 1LAXA 4ESWA 1MQDA 3T9VA 4IGRA 3SEUA 3G7WA 4ZEDA 4R6HA 2VGQA 4M1VA 2RCBA 4O3BA 5H8QB 3T93B 4ZS9A 4OMBA 3G3KA 1SI1A 3M3FA 2FYIA 4BLAA 5CMKA 2F6GA 4ZEBA 5FHOA 1MRPA 4YB6A 3LSWA 1B7UA 5DVJA 2I0BA 3CI8A 5CC2A 3VFJA 1ELJA 1US5A 3IO6A 3F11A 2OK2A 3GBBA 4IO5A 3ZKKA 3ZSFA 2I4BA 1A7LA 3DELB 5J1DA 2PT2A 4F3GA 2IEEA 3RTFB 2Y7RA 4BDNA 3IO4A 2LAOA 3MPKA 1TWYA 4H5GA 1GGGA 1LAGE 4H8IA 1B3HA 2REGA 4TLMB 1JW4A 3V89B 3PPNA 3QUFA 5L9SA 3BKIB 1O64A 2XX8A 2XX9A 4NF8A 1A99A 3ODBA 1SDXA 3DP4A 4GWOA 2QS1A 4RPOA 4OWDA 5F1QA 4C0RA 1GR2A 2UVJA 1JVXA 3THIA 4OQOA 4QSDA 4YICA 1UTHA 5HM4B 1N3WA 4IY5A 1A54A 1I6AA 5KCJB 2HQ0A 4OVJA 2THIA 2F8DA 3ECRA 1NNFA 4FE8A 1GVCA 1XVYA 3VVEA 4C1TA 2ONSA 1A55A 3K4UA 3H4ZA 4OYVA 4OESA 3FVOA 4KFQA 2OWSA 3KBRA 3HN0A 3K1MA 2ALUA 4IY6A 3G3FA 4YKPA 4FJPA 1QUKA 1YAEA 1OQHA 1ZLQA 1FQFA 1SQYA 3C35A 2V84A 3PUVE 2Z8EA 3TCHA 4G68C 4NF5A 2Z8DA 1POTA 3QYTA 1USYE 1DOTA 2F35A 3BBRA 4HCYA 2A5SA 2XD3A 3ILUB 2H9BA 4OZ9A 5I59A 3IAZA 3PUWE 2AYSA 5AE4A 1MY2A 4XKNA 3M3KA 2Y7PA 3A3CA 4O3AA 1OLCA 4ZEIA 1LB8A 5KZTA 3MUQA 5IKBA 2XXWA 3OEMA 3PGFA 4P11A 3ZS6A 4QHQA 4ONYA 1NNTA 4JXIA 5AA2B 2M8CA 1MQJA 3MP6A 2XHDA 2UVIA 3VDFA 1QUIA 4FEDA 3E3KA 1FQBA 2ABHA 1XT8A 4F31B 1P99A 1H76A 1OMPA 3IB2A 3TKDA 3D4CA 1Z7NE 2HCAA 1R1NA 4KI0E 3VVDA 1MY3A 3CVGA 1NKXA 3DP6A 1RYXA 4DZ1A 3A09A 1VR5A 1BLFA 4OENA 4QRZA 5LOMA 3S9LC 2F7BA 3TDJA 2GH9A 2V25A 4G68A 5FHNA 3KOTA 1B52A 5L8DA 3H6UA 3KSJA 2DVZA 4M4GA 3R6UA 1LFHA 4LVQA 2QS4A 1GTKA 4F39A 2D21A 1LCFA 2ESNA 1UIVA 1B6HA 1OQGA 4IO3A 2F78A 2XXPA 4H65A 3RNNA 4KCDA 3MVYA 2GRVA 5FTIA 2OLBA 4YKJA 3T9HB 1LFIA 4R72A 3H7MA 4EF2A 1XHYA 3H6VA 4POWA 5DEXB 1MY4A 5H8NA 4R6YA 3FD3A 3HHFA 3PMXA 5B7DA 5ITOA 3FGSA 4ZE8A 3H6WA 5CBRA 3M8UA 3UN6A 4AQ4A 4XKRA 3O66A 5I2KB 1B58A 2P2AA 2XXIA 1IXGA 4I1DA 3K1PA 2Y7IA 3JYRA 3TCGA 3OO9A 1N7WA 2AIXA 5K2XA 2QSXA 4JDFA 1NH8A 1OVBA 3MQ9A 4WKMA 3ONMA 3HPIA 4YMBA 3O28A 3TAJA 1A8EA 1B05A 3H06B 4ESXA 5I57B 1QKAA 3QSLA 1WVJA 4GL0A 1B51A 2YLNA 4OEVA 1BP5A 4TLLB 3WAFA 5I58B 1P1WA 1AH5A 4LONB 3SKPA 1FW0A 2F5XA 3QK6A 3E9XA 2Q9TA 4QFPA 3G3JA 1N0TA 4PFWA 3TQWA 5I56A 3K02A 4F1UA 3T9UA 2VP1A 3PPQA 2QS2A 4GF8A 2OJTA 4XKPA 1XOCA 2DS9A 3EHTA 1LLSA 2UXAA 1KWHA 3FVKA 1L5TA 1M5DA 5EHSA 1M5CA 3PPRA 1FTKA 4DDDA 3MZ9A 4JB7A 3Q27A 4KD5A 3UORA 3N94A 4MFIA 2E1SA 1P1OA 2H25A 2Q2AA 2O84X 1RYOA 1ZBMA 4LA9A 2I0CA 2Q89A 2B3FA 3O29A 4PP0A 1QJMA 3QXMA 5TP9A 3MP8A 1ZIUA 4X1BA 4NF4A 3FXRA 1P1UA 2YPNA 4EF1A 5I84A 4AB5A 3TQLA 2R9JA 4F3SA 3S2VA 3VLUA 3QIMA 3DM0A 3CFZA 3RN8A 3TEPA 4N07A 4AB6A 3KEIA 3HO7A 3E13X 4EXLA 4KQPA 1B7ZA 4EDPA 4RK2A 4NF8B 5CRYA 4F2QA 2QL3A 1Z7ME 1NH7A 4IO4A 4E0XA 4I8CA 3FV2A 3OXNA 4LUBA 1UTHB 3N5LA 1MY0A 3OENA 1Y1ZA 1D3KA 1H45A 3IJXB 4U22A 1DTGA 4WEPA 2XXUA 5KDTA 2DE4A 3K6WA 3IOTA 3KJ7A 5A5XA 3VE1B 2AL4A 1N04A 2O1MA 2XD2A 1IUDA 1JNFA 1M5EA 4LP2B 2FNCA 1DPPA 3EN3A 5FTHA 4QF9A 3SDFA 1ANFA 4IGTA 4ELRA 4OETA 3OMBA 2NXOA 3QUJA 4YKIA 4QFNA 4HCWA 3OOAA 4POXA 3V83A 3KN7A 3BFTA 5ISUA 3W9VA 3CG3A 4NF5B 1QUJA 3BFUA 1B7HA 2NUVA 4OHNA 4IB2A 3GZGA 1MXWA 1MQIA 1US4A 1TT1A 4MBPA 4FECA 3MP1A 4KHZE 5I59B 4RXLA 2V3UA 1XS5A 1I69A 2DE2A 4NTLA 3S9NC 3O97A 3KN8A 4EQ7A 4KPTA 2Q88A 1D4NA 3O9PA 1MG1A 3GXAA 3U8QA 3RQTA 2GHBA 4ISUA 2DQVA 4ZZEA 4DLDA 3Q29A 4DXBA 2XXYA 1LAHE 4QSEA 3FUZA 3PUYE 2ZNSA 4NWCA 4XKQA 3G3HA 3OSQA 1SD3A 3MZ1A 1PBQA 3B6TA 5JTYA 4U1OA 4GFRA 4L17A 3VVFA 3GBAA 2E0SA 5DVFA 2F6PA 4MLQA 1P1NA 3VXBA 1NNPA 1MM7A 4LZ8A 2UVGA 4O3CA 5AA4A 1FQAA 3O6IA 3MVZA 1SBPA 4RA1A 3PU5A 1LAFE 3T9XB 2ONKE 2RC9A 1B3EA 5HPQA 2ZYOA 4G68B 1WDNA 4E0WA 3TZAA 4ELPA 3JV9A 5TU0A 1HSLA 3EQ1A 4RPNA 1S7YA 2O51A 2DWJA 1B46A 3W15C 5H8NB 1PB8A 3Q26A 2H98A 5DYHA 4TOZA 1OLAA 2OWTA 3RTWB 3I5OA 1ATGA 4QFKA 1EU8A 1CE2A 5FHMA 2DVCA 4G77A 1Y9UA 3CG1A 4MF3A 4FATA 1IITA 4RY1A 2VOZA 4OTEA 4PFYA 3I6VA 1JQFA 2Y84A 2V3TA 4JSDA 4OXVA 1AOVA 2O68A 4LZ7A 3TTKA 4F18A 4TQUQ 5TPAA 3K1NA 1EZ9A 4G8HA 4KYSA 4PE5B 3T66A 2HEUA 1IEJA 5I56B 3FZVA 4U2RA 3Q25A 1IXCA 3R7XA 3LC8A 3SEWA 3MJNA 3CSGA 3UA8A 3IR1A 2B3BA 3H03A 1EH3A 4U1ZA 5I2NA 4YU0A 4PFUA 4X1DA 4ZDMA 1HSJA 2HZLA 1ZMGA 5ITPA 1MQHA 4JBZA 1FCKA 1IZ1A 3OO7A 1MXUA 1NMUA 2ZNUA 2VHAA 2NWJA 3IB0A 5JK4A 4IO2A 2DYXA 1Y3QA 1S9TA 3B6QA 4NWDA 1M5BA 1B5JA 3C36A 3H3GA 5TP9B 3PPPA 4NF4B 1PC3A 4RNSA 2ZXTA 3OELA 2ZNTA 3TCFA 2ANJA 4C1UA 4IO6A 1UIUA 4P0GA 5AA1A 1MPCA 3HCQA 4FIMA 4NE4A 4YB7A 2PX1A 4R73A 4DCXA 2OBGA 4GLIA 4HS7A 3H6TA 1N76A 2D5WA 3HSTA 2XXTA 4F2OA 4R2BA 4KYDA 4F22A 3RT8A 2D3IA 1SYIA 2HAUA 1B40A 2RKMA 1T0KA 1URSA 1D9YA 3FJGA 4ZE9A 2RINA 4F19A 4I9DA 2YJPA 3LSFB 2Z8FA 2OCUA 3PV0E 3U72A 3EPEA 3G3IA 3O6GA 5KDTB 1D9VA 2GHAA 2HFBA 1TFAA 2A5TA 1FQCA 3PPOA 1EZPA 3IB1A 5A5XB 3LSXA 3TELA 5EHMA 3DP8A 1PB7A 1XVXA 4F1YA 2O69A 2ZMBA 2V93A 3IJOB 1P1QA 1LFGA 4THIA 1M5FA 1MH4A 3KGCA 4ZZAA 1LGBC 2I6EA 4HTGA 4ELQA 4PETA 2DP8A 1QKBA 3A3UA 4GOTA 4DCYA 1H43A 3PD9A 3TODA 4GXSB 4NEDA 3B7DA 4Q8RA 4G2ZA 3IL1B 2UYEA 1URGA 5DTBA 1SW5A 5ELVA 1UQWA 3OEKA 1NL5A 4KR5A 1VFDA 4U4SA 3V8XB 3RLFE 2CZLA 3TPAA 3KN3A 2ZYNA 3FVNA 1EZOA 2H5YA 3OSRA 1ZJLA 1SVXB 4F3BA 2O1LA 2BJJX 3FXQA 3C32A 2VD2A 5H8FA 3IX1A 4LQ5A 2NOOA 1MXYA 1AL3A 2PMSA 3C31A 5AA3A 4UACA 4ZECA 3M3LA 2R71A 2F7CA 1LB9A 3KZGA 1PB9A 3FXUA 3EHSA 3TUSA 5JTYB 2QPQA 2DWIA 3K6XA 3CIJA 1J1NA 2XXQA 1B1HA 3TTMA 1S50A 4ZEFA 4QSCA 2RC7A 4R9FA 5BWJA 2DOJA 4Q5TA 2PYYA 5AA4B 1B5IA 4R6KA 4H1XA 2I58A 3USDA 2Z22A 3HHGA 1LCTA 2O7IA 4FORA 3UGWA 3KJTA 1XC1A 4PFTA 4GQOA 1LBBA 3KFMA 2X7QA 5DT6A 3N26A 1UTBA 3C9HA 3UK4A 5BUUA 4U4XA 2FA7A 2R6GE 4IO7A 2DWAA 2O7UA 4U23A 3KSXA 4XTCQ 4GVOA 4H5FA 5H8SA 2XXHA 1IXHA 1B2HA 4BDMA 4JWYA 3FASA 2GFEA 2XXRA 3U93A 1R9LA 4G8NA 3K6VA 1B0HA 2QMWA 3OO8A 4NF6A 4EUOA 5ICQA 4JSOA 3QAXA 2F97A 3FATA 5CMCA 1N3XA 4FAJA 3K00A 5H8HA 1BTJA 1FQDA 1N7XA 3B6WA 2QJEA 2P1SA 3RT6B 4EQBA 3FIRA 1YPNA 1MH3A 3RPWA 3C34A 1QVSA 2Y7WA 1IQ7A 2HZKA 2Z23A 3DLNA 3TTLA 3D4GA 3MBPA 1LBCA 4RK9A 4JWXA 5TPAB 4YMAA 2RF1A 4GD5A 2HAVA 5K2YA 3MAMA 1B0LA 4F1VA 1YCJA 3IOWA 1B3GA 3FVGA 4Z7EA 5H8QA 3UIFA 4HW8A 5AA2D 2REJA 4R9GA 1DSNA 4LQ2A 3R26A 1MM6A 1B3LA 3E4RA 4Q30B 2ONRA 1HSEA 3VLWA 4BDOA 1OVTA 3CFLA 4OFLA 3K0VA 1AMFA 1A40A 2RC8A 5I2NB 1MPDA 3PUXE 4H67A 4WXJA 1OIBA 1VE4A 3V5AA 2ZYMA 1JETA 4LZ5A 1ZKBA 2P0SA 2H99A 3LUYA 3S4UA 3MPLA 4N13A 1MY1A 3VLVA 2VD3A 4LATA 1NFTA 3CR9A 3IOVA 3IORA 1PBPA 3RUMA 4GIZA 3T96B 1PEBA 1ZU0A 2DWHA 4OERA 2OZZA 1DMBA 4FEBA 3T22A 1NNKA 4K3FA 1Y4CA 4BDRA 3FJMA 4X9TA 5ICTA 3KG2A 1TXFA 1IIWA 4G4PA 4QFLA 2V3QA 4WEDA 3U1OA 1Y3NA 4RJZA 2RCAA 3PMWA 1SW2A 1URDA 1MXVA 3L6HA 1VSOA 2F7AA 4QFOA 1JEUA 1PDAA 4GRKA 1MQGA 1A8FA 4H0WA 1B9JA 2Q2CA 4OFJA 4MLVA 4NMYA 1YTVA 3UP9A 3SEXA 3CRBA 2B65A 2PBWA 3GLBA 1JW5A 5F7VA 3LSLA 3W9WA 5KCJA 1DTZA 3KOSA 1QW0A 3TFLA 3MZBA 1B4HA 3U94A 3S9EA 1MDP1 2DSFA 3TYHA 4F3PA 4KYEA 5L9OA 2DXYA 1SI0A 3I3VA 1POY1 2A5TB 5JEIA 4OFOA 3FJ7A 1WODA 1TFDA 3SETA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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