5I2KB

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with 7-{[ethyl(4-fluorophenyl)amino]methyl}-n,2-dimethyl-5-oxo-5h-[1,3]thiazolo[3,2-a]pyrimidine-3-carboxamide (compound 19)
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
289
structure length
286
Chain Sequence
MSTRLKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVRYQEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
publication title Discovery of GluN2A-Selective NMDA Receptor Positive Allosteric Modulators (PAMs): Tuning Deactivation Kinetics via Structure-Based Design.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 286
sequence length 289
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i2kB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i2kB02
2OCUA 4MLVA 3C9HA 3L6HA 4MLQA 4TOZA 3FUZA 3V5AA 3ZSFA 1NNTA 1R9QA 3TDJA 3H03A 1QKBA 4TQUQ 1H76A 1JNFA 4UA8A 4IGRA 4N13A 1ZJLA 3PV0E 1TFAA 5DVIA 1N04A 1MRPA 1ELJA 1YAEA 5CBRA 4H1XA 3VVEA 3V83A 2QPQA 4ELQA 1B32A 4DXUA 2DOJA 4GF8A 3KGCA 1B5HA 4GD5A 2M8CA 4MF3A 3PPPA 3PPQA 1LSTA 3EHUA 2VD3A 4P11A 2OBGA 3H4ZA 3OMBA 4TLLB 5ICQA 5H8FA 2PBWA 5DEXB 2I58A 1H45A 4ZEIA 1TXFA 4IB2A 1NKXA 4THIA 3S9MC 2KLFA 1MDP1 5I57B 4GQOA 1LBCA 3MP6A 4NWDA 2NXOA 1MY3A 2XHDA 2E1SA 1P1QA 1LAHE 3KN8A 2Z22A 2I4BA 4ZECA 1GV8A 2XXIA 4XKQA 3IOUA 4YKPA 5DVFA 1SBPA 2IA4A 2A5TA 4QHQA 1LAXA 4ELOA 3MP8A 4RA1A 1UQWA 1GTKA 4QSDA 3IO6A 1FW0A 2NOOA 4ZE8A 4GL0A 2H4IA 2XXPA 4KYSA 3U94A 5KCJA 1I6QA 2OJTA 4Q30B 3TPAA 4U23A 3KOTA 2REGA 2HEUA 3H7MA 5CMMA 1JEUA 3G7WA 3B6TA 5DT6A 4GLIA 2ABHA 1B9JA 2Y7PA 5CMCA 3BKIB 3VLUA 3H6VA 4AB6A 1UTHB 4JB7A 2Z23A 1Y3NA 3DM0A 1RYXA 3RN8A 1B4ZA 4KR5A 3IL1B 4IO3A 3TMGA 3TTRA 1NNPA 5HM4B 2Y7RA 1QUJA 4BDQA 3GZGA 3H6UA 5AE4A 3O66A 1M5FA 1YPNA 4RPOA 3TODA 4HW8A 4RY1A 3VVFA 4PP0A 5CBSA 1B7UA 2Q89A 3UGWA 3QAXA 5KCJB 5FTIA 4AQ4A 1AH5A 2P1SA 4WEPA 1R9LA 3IB0A 2P2AA 2H5YA 1B3FA 3LSXA 3E3KA 1KWHA 4DXBA 1D3KA 1Y20A 4R9GA 1LGBC 1BLFA 1H43A 2F7BA 3EF7A 3T93B 3C33A 4NF8A 3HV1A 3MQ9A 3QK6A 4DDDA 2DYXA 2HQ0A 3R7XA 2O69A 3C31A 3C36A 1A7LA 2QS3A 1B2HA 3TCHA 1A55A 2QJEA 4U22A 3K6VA 1MPBA 2DQVA 3QUJA 2ALUA 3SEUA 5H8HA 5BUUA 1DPEA 3VFJA 1SW4A 2F34A 3FXUA 4ZDMA 1AOVA 4KD5A 3BFUA 5I2KB 3LSWA 3TTNA 3T9HB 3BBRA 1UIVA 3AXFA 3IO4A 5TP9B 5AA4A 1FCKA 2ONSA 3K1NA 4R6YA 1JW1A 2RCBA 1P99A 3FVNA 4OVJA 2H99A 4JWXA 4LZ8A 2GH9A 5ICTA 4AB5A 2VP1A 5AA3A 1SW2A 4NF8B 3PPOA 4POWA 3FZVA 4WXJA 1H3DA 3OO6A 1LFGA 1MQDA 4I9DA 4NF6B 4X48A 2NUVA 4ECFA 3M3LA 3D4GA 3PPNA 4G68C 1B1HA 1XVYA 3FV2A 5H8HB 5HPQA 1US5A 2F35A 4DLDA 2I0CA 3A3CA 4ISUA 4RK9A 5FTHA 1QVSA 2RKMA 1LAGE 1NFTA 2XX9A 3SETA 2BJJX 1N0TA 2AIXA 1D4NA 3H6TA 4LZ7A 1T0KA 2Q8JA 3PMWA 4JWYA 4K3FA 3EHTA 4FAJA 1O63A 1B3HA 1PC3A 4R2FA 4ZEDA 3TTMA 5CMBA 2Y7KA 3H3GA 3KFMA 4YZZA 1LFIA 3IOTA 4R74A 1EZOA 1B52A 2FA7A 2G29A 1H44A 5I2NA 1WVJA 5L9MA 3RNNA 2E0SA 2DVCA 1Q35A 4XIGQ 4DIGA 5DYHA 5I58B 1M5BA 1I6AA 3PMVA 4F3PA 1SW5A 4X9TA 4Q0CA 4FATA 3SEXA 1DSNA 4R2BA 1MQHA 4RYAA 4ONYA 4YKKA 3M3KA 4JBZA 1SD3A 4NE4A 1USYE 3T9VA 4NF5A 3C34A 1D9VA 3TCGA 2PVUA 2XXUA 3K6WA 3A3UA 5I56B 5K2XA 4POXA 3V89B 1PB7A 3OSRA 1MPCA 3S4UA 1LLSA 2I3VA 3MBPA 1B46A 4XTCQ 4U4SA 1N76A 2F5XA 3R6UA 4LQ5A 4QFOA 2DWIA 3PU5A 3OD7A 5I2NB 1IITA 4HCWA 2DWAA 4F31B 4ZZAA 1ZMGA 4GL8A 1B51A 1POTA 2P0SA 1SDXA 5I59A 4EQ9A 3PPRA 3MVZA 2XXWA 3KBRA 4BDNA 4KHZE 3FGSA 1JVXA 3UORA 3TKDA 4LUBA 1II5A 4QFLA 3PD8A 4R6HA 4BDRA 5CI5A 3SERA 2V93A 4I1DA 3MC2A 5CMKA 3UP9A 1GVCA 3G3IA 3U93A 2DVZA 2F6PA 3SESA 4OETA 2OZZA 4NMYA 5HBCA 3RTWB 5L9OA 1NNFA 1ZBMA 3G3GA 4NF5B 2DE4A 5I57A 1A40A 1MQJA 1IQ7A 2V3UA 4UACA 4BDMA 1SW1A 2UVIA 1UTBA 3TTLA 2Z8DA 2F7AA 1ZIUA 3V8XB 5I59B 5M2VA 3CIJA 2F8DA 1OQGA 3PUZE 3U92A 3A09A 4YICA 3FASA 1MQIA 2H9BA 3TTKA 2V3QA 3IOVA 3U8QA 3K0VA 1PBQA 4IO7A 1A8FA 4IO2A 1Y3QA 1US4A 1B0LA 4KPTA 3QXMA 3O6HA 4IO4A 1LB9A 1VFEA 5AA2D 2O1MA 3FVOA 3KEIA 1B3GA 4JSDA 3G3HA 2QS1A 2UYFA 3O6IA 3MZ9A 2RC9A 3N26A 3CSBA 1UTHA 3IB2A 4ESXA 3TCFA 3C32A 3JZJA 1UTBB 1DMBA 4EQ7A 1FQDA 3RTFB 1BIYA 4LATA 4PE5B 3LBSA 1OLAA 3C35A 1SQYA 2I4CA 4E0XA 4OEUA 3GLBA 3KSXA 1OIBA 1N7XA 1OMPA 3O2AA 4LA9A 3THIA 3MPLA 1B4HA 2D3IA 1VE4A 3T66A 1MG1A 4FIMA 2I0BA 2QL3A 1VSOA 4RJZA 3I6VA 3S9NC 1MH4A 3ONMA 1CE2A 4EQBA 4RPNA 4NF4B 3OSQA 4F22A 3H06B 1ZKBA 2GFEA 3IAZA 3FD3A 1MXWA 4YKJA 1N7WA 1JEVA 4DE8A 3K01A 2Q2CA 3MUQA 3VDFA 3FJ7A 3ILTB 1FTOA 2HZKA 1HSLA 1JETA 4G8MA 1IXIA 3G3JA 4H0WA 1MY1A 1B5IA 2XXHA 4PFTA 4C1TA 4Z0IA 3O9PA 4QFPA 3PUXE 5ITPA 5F7VA 2VD2A 4O3CA 4C1UA 2REJA 3IR1A 3PUVE 4DXCA 1A99A 5F1QA 1PDAA 2RINA 5I2KA 3G3KA 1OQHA 2DSFA 5CRYA 4GVOA 5TP9A 2D5WA 4R6KA 1SYIA 2I3WA 2UVJA 3VV5A 1Z7ME 1B0HA 4WKMA 2ZYNA 1ZLQA 1MY2A 4G8NA 1OVTA 3G3FA 3TEPA 1NMUA 3N6TA 2O7UA 1M5DA 2A5SA 4XKNA 4OERA 3N94A 4NF6A 3B7DA 1I6BA 1DTZA 2RC8A 4DCXA 3K1PA 3R26A 4P0GA 3T96B 3Q29A 4FEBA 1JW5A 2RCAA 2ZYOA 3TELA 1B3LA 3U1OA 3Q25A 4OYVA 3KN7A 1S7YA 4U21A 4H5FA 3SEVA 2X7QA 5KZTA 4OESA 3SEYA 4GFRA 2WKYA 1S9TA 3DELB 4U2RA 2DXRA 4FECA 1QW0A 1IXHA 1P1NA 2B3BA 3UIFA 3FVKA 4EF2A 3I3VA 2G93A 1P1UA 2AYSA 3OO7A 1LCTA 2XXRA 4XKPA 2O84X 4F3SA 1Y4CA 4G8HA 3GBBA 5EHMA 3FXRA 4GOTA 1QUKA 5I58A 3O97A 1B6HA 3O6GA 1OLCA 4RXLA 3E4RA 1NNKA 4OENA 3CR9A 3TZAA 1URSA 1Z7NE 4KYEA 1XS5A 1POY1 1GR2A 3TAJA 3WAFA 3IK6B 2ZNUA 1TFDA 4FEDA 1M5EA 3UA8A 4JXIA 1PB9A 3OEMA 1EZ9A 1FQBA 5B7DA 5I56A 1RKMA 3PMXA 4FORA 4WEDA 2R9JA 2Y84A 3FATA 3RLFE 3FJMA 3ZKKA 4H67A 4ZEBA 2Z8FA 4OTEA 3B6WA 2YPNA 1Y1ZA 4OZ9A 5L9SA 2PT2A 1PEBA 3KJ7A 1N3XA 4YAHX 5TPAB 1Y3PA 1S50A 2YLNA 3O28A 3M3FA 4R73A 3MVYA 1EU8A 5ELVA 4H8JA 2HXWA 3RPWA 1VFDA 2VGQA 2HAUA 1XC1A 4QFKA 2R71A 4X1DA 3Q28A 4LVQA 2F6GA 3TYHA 3K1MA 5K2YA 2PMSA 3S2VA 1URDA 3HCQA 1MXZA 3OO8A 3Q26A 2YJPA 1R1NA 4ZZEA 3MJNA 3PUYE 3CG1A 3VVDA 4H65A 5EHSA 1Y4TA 3IOWA 2XD3A 4KYDA 1FQAA 3CRBA 4QFNA 4BDOA 2V84A 1O64A 2X26A 2O68A 5DTBA 3K6XA 2XX7A 4HCYA 1B7HA 4Q8RA 2ZXTA 2O51A 1F9BA 4ND9A 4KCCA 5ITOA 3QIMA 2B65A 3KOSA 4ZEKA 3CG3A 3H6WA 5JK4A 4HTGA 3RT8A 3T9UA 1I69A 4LONB 4GWOA 3ILUB 1WODA 3FIRA 4E0WA 4OHNA 1MXVA 4LQ2A 2W7YA 1QKAA 5I84A 3RUMA 1J1NA 3L6GA 3U72A 1B05A 2XX8A 2QS4A 2ONRA 3CFZA 4OXVA 3IORA 4GXAA 1CB6A 4ZE9A 1MXYA 3HN0A 5LOMA 3KG2A 2O7IA 4H6DA 3TFLA 2V25A 4YB6A 1ATGA 2GHAA 2OWSA 3USDA 1B40A 4R75A 3FXQA 1JVYA 3OOAA 2QMXA 3DP4A 4GIZA 3LUYA 3SDFA 4EXKA 2HFBA 2RF1A 3LR1A 4PETA 4EXLA 2ZYKA 5AA2A 4OEVA 3JYRA 4IY6A 3MW0A 1MS7A 4H5GA 3EN3A 1MH3A 4XXUA 3KN3A 2Q9TA 3T9XB 4NF4A 3SKPA 4G77A 4I8CA 3ECRA 1B1XA 2F78A 5KDTB 1FTLA 4F18A 4I62A 1JQFA 2XXQA 4ELPA 5FHOA 4C0RA 4IY5A 4OFLA 1LFHA 1N3WA 3LSFB 2XD2A 2XXVA 3FVGA 1MM6A 1BKAA 2XXYA 4FJPA 3ZKLA 4IO5A 4G68A 2LAOA 4F3BA 1VR5A 4N07A 3C4MA 2QMWA 5FHNA 4YB5A 4YKIA 3OENA 3OELA 3K6UA 2DP8A 4M1VA 3PGFA 1BTJA 1QULA 4Z7EA 4PFWA 2QS2A 3W15C 1FTMA 5AA2B 2B3FA 2HCAA 1ZTYA 1EZPA 2AL4A 2H98A 1SYHA 2F36A 5A5XA 4JSOA 4YMBA 2OK2A 3CSGA 3BFTA 1MXUA 1DOTA 3RQTA 5BWJA 2F97A 5H8FB 3P7IA 3ODBA 1SI1A 3RY3A 3VLWA 2R6GE 1IIWA 2ANJA 1ZU0A 3EHSA 2AL5A 1YCJA 1FQCA 4IGTA 1GGGA 4ELRA 4G4PA 2RC7A 3PUWE 2OLBA 1MM7A 1NH7A 1P1OA 3GXAA 3OO9A 4G68B 4U1ZA 2XXXA 2XXTA 3CI8A 4ZS9A 2Q88A 3CFLA 3D4CA 5JEIA 3HHFA 5IKBA 1AIVA 4QSCA 3MWBA 1M5CA 1QJMA 5J1DA 2A5TB 1Q1KA 1EH3A 4GRKA 3VXBA 5A5XB 4F1UA 1B7ZA 2V3TA 1ANFA 1O7TA 5TU0A 4BDLA 3T22A 5IAIA 4YU0A 4IO6A 3DP6A 4U1OA 5AA1A 1IUDA 2O1LA 4OMBA 2ESNA 4ZEFA 1A54A 4RNSA 2Y7WA 3K00A 1TT1A 1NH8A 3KSJA 4ESWA 1N84A 1WDNA 2DE3A 3MZBA 4G2ZA 1IZ1A 2UYEA 5CC2A 2HZLA 1PBPA 1LB8A 1BP5A 2ZNSA 3K4UA 3LC8A 3VE1B 2GHBA 1L5TA 4OFOA 3E13X 2GRVA 1FQEA 4JWOA 3FJGA 4OQOA 4F1YA 2O6AA 4XKRA 4OWDA 3SEWA 2NWJA 4EDPA 2I49A 3M8UA 4F2QA 2UXAA 4L17A 1UIUA 4X1BA 4F29A 1MY0A 2CZLA 4DCYA 1MY4A 3B6QA 1TWYA 2DXYA 1P1WA 1XOCA 5TPAA 3N6UA 4Q5TA 3F11A 1HSJA 1USYH 1SI0A 3RT6B 2Q2AA 3PD9A 1DPPA 2VOZA 3MAMA 3QUFA 5ISUA 1IXCA 4H8IA 3W9VA 1LCFA 3I5OA 4QRZA 4P0IA 4JDFA 5H8NA 2UVGA 4NWCA 1MQGA 1PB8A 1FTKA 1Y9UA 3TUSA 3EPEA 2VHAA 1FQFA 1LBBA 3DLNA 1URGA 4NEDA 4PFYA 1HSEA 2IEEA 1IXGA 4LP2B 2NVUB 4GXSB 5JTYA 4LZ5A 5CM6A 3IB1A 2PX1A 1AMFA 3CFXA 5B70A 3K02A 3OXNA 2Y7IA 5AA4B 3MP1A 4R72A 1B3EA 3O29A 1R6ZA 3TQLA 5H8QA 3IX1A 2QRYA 3IJOB 1SVXB 1NL5A 1OVBA 3N5LA 3KZGA 4PFUA 3VLVA 4F39A 2FYIA 2F7CA 2OWTA 3TQWA 2THIA 2Z8EA 1FTJA 2FNCA 1MXXA 2I48A 4PQJA 5H8NB 1B5JA 4F1VA 2DE2A 4RK2A 5L8DA 4FE8A 3S9EA 2D21A 4TLMB 2PYYA 4F3GA 2X7PA 2UVHA 4KI0E 5EYFA 1XHYA 3IJXB 1Y1MA 4KQPA 4R9FA 1B58A 2HAVA 5JTYB 2I6EA 4YB7A 2PT1A 3QYTA 1A8EA 4U4XA 3HSTA 3MVXA 2CMOA 4MFIA 4HS7A 1MPDA 2QSXA 4KFQA 1YTVA 1QUIA 3CVGA 2ZYMA 4MH5A 5H8QB 3S9LC 4N6PA 3HPIA 3OEKA 1LAFE 3UK4A 3HHGA 1IEJA 3W9WA 1AL3A 1XVXA 5DVJA 4F19A 1MDQA 3HO7A 3MVWA 2H25A 4YMAA 2ONKE 4O3AA 3QSLA 4MBPA 4QSEA 5H8SA 4O3BA 1DTGA 3GBAA 5FHMA 4F2OA 3K2DA 2ZMBA 2ZNTA 3EQ1A 4NTLA 1XT8A 2DWHA 4KCDA 1RYOA 2DS9A 3VXCA 3E9XA 3JV9A 4EUOA 3MPKA 1JW4A 3KJTA 3RGYA 4BLAA 4M4GA 4DZ1A 3FV1A 3DP8A 3UN6A 4QF9A 2DWJA 4OFJA 4EF1A 5DEXA 1D9YA 3MZ1A 3LSLA 5KDTA 3Q27A 3WAEA 3ZS6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2OCUA 4MLVA 3C9HA 3L6HA 4MLQA 4TOZA 3FUZA 3V5AA 4N8GA 3ZSFA 1NNTA 1R9QA 3TDJA 4NN3A 3H03A 1QKBA 4JVIA 4TQUQ 1H76A 1JNFA 4UA8A 4IGRA 4N13A 1ZJLA 3PV0E 1TFAA 5DVIA 4JVCA 1N04A 1MRPA 1ELJA 1YAEA 5CBRA 4H1XA 3VVEA 3V83A 2QPQA 4ELQA 1B32A 4DXUA 2DOJA 4GF8A 2QVUA 3KGCA 1B5HA 4GD5A 2M8CA 4MF3A 3PPPA 4GX4A 3PPQA 1LSTA 3EHUA 2VD3A 4P11A 2OBGA 3H4ZA 3OMBA 4TLLB 5ICQA 5H8FA 2PBWA 2HHMA 5DEXB 2I58A 4XEQA 1H45A 4ZEIA 1TXFA 4O7IA 4IB2A 1NKXA 4THIA 3S9MC 1AWBA 1KA0A 2KLFA 1MDP1 5I57B 4GQOA 1LBCA 3MP6A 4NWDA 2NXOA 1MY3A 4HE2A 2XHDA 2E1SA 1P1QA 1FBDA 1LAHE 3KN8A 2Z22A 4I3YA 2I4BA 4ZECA 1GV8A 2XXIA 4XKQA 3IOUA 4YKPA 5DVFA 1SBPA 2IA4A 2A5TA 2WBBA 1RDZA 4QHQA 1LAXA 4ELOA 3MP8A 4RA1A 1UQWA 1GTKA 4QSDA 3IO6A 1FW0A 2NOOA 4ZE8A 4GL0A 2H4IA 2XXPA 4KYSA 3U94A 5KCJA 1I6QA 2OJTA 4Q30B 4MIJA 3TPAA 4U23A 3KOTA 1NV3A 2REGA 2HEUA 2WBDA 3H7MA 5CMMA 1JEUA 2ZZVA 3G7WA 3B6TA 5DT6A 4GLIA 1FPFA 1K9YA 2ABHA 4IR8A 1B9JA 2Y7PA 5CMCA 3BKIB 3VLUA 3H6VA 4AB6A 1UTHB 4JB7A 2Z23A 4MEVA 1Y3NA 3CHGA 3DM0A 1RYXA 3RN8A 1B4ZA 4KR5A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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