2RINA

Abc-transporter choline binding protein in complex with acetylcholine
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
288
structure length
288
Chain Sequence
ESCGTVRFSDVGWTDITATTATATTILEALGYETDVKVLSVPVTYTSLKNKDIDVFLGNWMPTMEADIAPYREDKSVETVRENLAGAKYTLATNAKGAELGIKDFKDIAAHKDELDGKIYGIEPGNDGNRLIIDMVEKGTFDLKGFEVVESSEQGMLAQVARAEKSGDPIVFLGWEPHPMNANFKLTYLSGGDDVFGPNYGGATVHTNVRAGYTTECPNVDKLLQNLSFSLQMENEIMGKILNDGEDPEKAAAAWLKDNPQSIEPWLSGVATKDGGDGLAAVKAALGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Protein binding
molecule keywords PUTATIVE GLYCINE BETAINE-BINDING ABC TRANSPORTER PROTEIN
publication title Crystal structures of the choline/acetylcholine substrate-binding protein ChoX from Sinorhizobium meliloti in the liganded and unliganded-closed states.
pubmed doi rcsb
source organism Rhizobium meliloti
total genus 88
structure length 288
sequence length 288
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-10-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04069 OpuAC Substrate binding domain of ABC-type glycine betaine transport system
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2rinA01
3.40.190.100 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Glycine betaine-binding periplasmic protein; domain 2 2rinA02
4LA9A 2R9JA 5H8NA 1B40A 3H3GA 3RN8A 2P2AA 2OLBA 1MY1A 3LSFB 4P11A 2Z8FA 3VDFA 2I4CA 2P0SA 4NF5A 3HHGA 3PV0E 1MG1A 3IB2A 4JXIA 4GL8A 2Y7IA 2H99A 3PUXE 2YPNA 3MC2A 4L17A 2YJPA 4F3BA 4ZEFA 5TP9B 2ZYKA 3W9VA 1MXVA 2QL3A 3PU5A 1DPEA 1N7XA 4H1XA 4IO2A 3TTRA 1N3XA 4DXCA 3N6UA 1IITA 2H98A 4DXBA 3FJGA 3GBAA 1MXUA 2I4BA 3CI8A 4THIA 1B58A 1LBCA 2F35A 3ILTB 4NF6B 2OCUA 2PT2A 4OXVA 1M5FA 3O9PA 1D4NA 1VSOA 3QUFA 2UYEA 4TQUQ 2E0SA 2I0CA 4U4XA 1WVJA 4BDMA 2V93A 1B6HA 4I8CA 2F6PA 3VVFA 3T66A 3EN3A 3TPAA 1ATGA 3VVDA 4WEDA 2DWIA 1A8FA 4FEBA 1LAGE 2XD2A 1UTHB 3S9EA 4X48A 5I56A 3CFXA 4C1TA 2DXRA 3CG1A 1BP5A 4GFRA 1D3KA 4H67A 3HV1A 1FTKA 3K6UA 4OENA 3OO6A 3H6WA 1OQHA 1NNKA 1P1QA 1DPPA 3QIMA 2OBGA 1JQFA 1MRPA 3TTLA 3IOUA 2R71A 2DSFA 3MZ1A 3C34A 3OELA 3PUZE 1PC3A 4FJPA 1MQDA 1LFGA 2FYIA 2ONKE 5L8DA 5TP9A 4TOZA 3CFZA 3N6TA 3EHSA 3RTWB 4QFKA 4MFIA 3C9HA 4WEPA 5LOMA 1MS7A 1OLAA 3ECRA 4NTLA 3C4MA 3GZGA 5I57B 2ESNA 1MM7A 3RT6B 5KDTA 1GVCA 3PMWA 2XXTA 3DELB 3S9LC 3S9MC 1FQAA 3I6VA 1B3GA 3E4RA 4XKQA 2VHAA 3G3KA 4F3PA 3T9UA 1IXHA 4X9TA 1JEVA 3FV2A 4EF1A 4RNSA 3RTFB 1ZIUA 4U1OA 3FVGA 3M3LA 4KYSA 2AL4A 4P0IA 4I1DA 3MVWA 4HCWA 4F31B 2D21A 1RYOA 1MY4A 5EHSA 2WKYA 3UGWA 4X1DA 5CBRA 2QS1A 1NFTA 3Q25A 4G68B 5ISUA 2QPQA 2DE3A 3MP6A 3GBBA 2DWAA 3LBSA 3UIFA 5CMCA 4F3GA 4DIGA 2Q89A 2QS2A 2V3QA 5H8FA 3U1OA 4OVJA 3USDA 1DOTA 3SESA 4U2RA 1USYH 4QSEA 4EDPA 3ZS6A 4Z0IA 3V83A 2XX9A 2D5WA 1P1NA 5I59B 2H25A 3OEKA 1B51A 3RPWA 4YKJA 2OK2A 4F18A 1A99A 4IB2A 4QFOA 1LBBA 3KOSA 1ELJA 2G93A 5B7DA 5JK4A 4OFOA 4ZE9A 2DVCA 5TU0A 5M2VA 5DEXA 1GV8A 3S9NC 2RINA 4QFPA 4H8IA 3RQTA 1JVXA 3FVNA 3IAZA 2ABHA 5I84A 1SI0A 4H6DA 5ELVA 4NE4A 3SEVA 4F2OA 1BLFA 3H06B 3SKPA 3FASA 4RA1A 3OO7A 4IY5A 1OMPA 1QW0A 4YKPA 1R9LA 2B3FA 4G8HA 3V89B 4M1VA 3KN8A 2G29A 3KG2A 2FNCA 5I58A 2DE2A 3V5AA 1PBPA 2BJJX 3O66A 3FXRA 4U23A 2VGQA 4EF2A 3SEXA 4Q0CA 2A5TB 4GOTA 2HFBA 4OEUA 5L9OA 3IR1A 2OJTA 5I59A 3LC8A 2NWJA 4OYVA 4XXUA 3TTMA 1DSNA 1SBPA 5DVJA 2DVZA 4RPNA 4GXAA 4Q5TA 5H8NB 2NVUB 3O6HA 1MQGA 2Z23A 1AOVA 5BUUA 5AA3A 3W9WA 2DOJA 4R2FA 3KSXA 1Z7NE 1FQCA 2DE4A 4NF5B 2V25A 1LCTA 3K1PA 1XVYA 2UVHA 1P99A 4QF9A 3RT8A 4IO6A 3TCFA 3W15C 4F19A 3IO4A 1PDAA 1LFIA 4RXLA 3IX1A 4F1VA 4E0XA 1PB8A 4Q8RA 3G3HA 1QUJA 2H4IA 1BTJA 5A5XA 2XXYA 4EQ9A 5CBSA 4YMAA 1MXYA 1YCJA 4ELQA 2QJEA 1TT1A 1B0HA 2VD2A 3E3KA 3TFLA 2F7BA 4H0WA 4ELRA 1VFDA 2PVUA 1QVSA 1H45A 3MZBA 3VXCA 3UK4A 1B1XA 3VFJA 2PMSA 2Y7PA 1NNFA 1DTZA 4YAHX 4UA8A 4I9DA 5F1QA 5ITPA 2O1LA 1PEBA 4ISUA 4R6HA 2Y7RA 5BWJA 1OQGA 1NKXA 4XKPA 2LAOA 2AL5A 4BLAA 4EXLA 1JEUA 2FA7A 4KR5A 1AL3A 1B32A 4KYDA 4KI0E 5H8HB 3N94A 3G7WA 3B6QA 2I48A 2XXVA 2O1MA 2ZXTA 4OFJA 1NH7A 1TFAA 1US4A 1YPNA 3MP1A 1MDQA 2CMOA 4TLLB 2O68A 3QYTA 3K01A 4IO7A 2F34A 3D4CA 4DZ1A 3MVYA 4LP2B 3TQWA 3MPKA 1VFEA 4GQOA 3H7MA 4BDOA 3MVZA 4U4SA 3IJOB 3R7XA 4JBZA 1B7HA 2REGA 4R9FA 4HTGA 3FUZA 3CSGA 3OENA 3TTNA 1KWHA 2AIXA 5KDTB 4YB7A 1MY2A 1H76A 3IB1A 3PMVA 3MWBA 4N07A 4M4GA 5CMBA 3L6GA 1Y1MA 1N3WA 1PB7A 5TPAA 5K2YA 1Y3QA 1ZBMA 5EHMA 2D3IA 1AIVA 1N76A 3IJXB 1IUDA 2XXIA 1S9TA 1J1NA 1WDNA 3MW0A 5FHMA 3V8XB 2YLNA 3CFLA 4ZEKA 2B65A 1M5CA 1SI1A 2GRVA 1Y9UA 5FHOA 4OESA 4AB5A 4GF8A 5JTYB 4O3CA 2ZYMA 1N04A 5J1DA 3VLVA 3IOWA 5H8HA 1B46A 2F7AA 1QJMA 4G77A 1OVTA 1ZU0A 1TXFA 2PBWA 4YB5A 4P0GA 3LSLA 5H8FB 3CG3A 4F29A 3B6WA 4YMBA 4ZECA 1SD3A 2DXYA 2ONRA 3C35A 4QFLA 4YKKA 4KCCA 4ELPA 4NMYA 2QS3A 3MVXA 4F39A 1B3FA 5K2XA 4U21A 3B7DA 4IGRA 4NF8B 4HS7A 3T9HB 2VP1A 4OFLA 4RYAA 4QRZA 1Y3NA 4QSDA 4G2ZA 2H5YA 2ZMBA 5HPQA 1FTJA 2Y7KA 4QHQA 1JNFA 5DEXB 3C31A 2F5XA 3K0VA 1Q1KA 1N7WA 3OMBA 1B2HA 3TMGA 2V3TA 2F8DA 2E1SA 1NL5A 3OXNA 4XTCQ 4MBPA 5H8SA 4DCXA 1FTLA 5JEIA 4DCYA 3M3KA 4PETA 1LGBC 4IY6A 2GHAA 3EQ1A 5I2NA 4IO3A 3SERA 3D4GA 3C33A 2VD3A 5AE4A 1QKBA 1SVXB 5JTYA 1FCKA 2RC7A 4MH5A 3H6UA 4YICA 4IO5A 3IOTA 1URSA 2I3VA 3U93A 5I58B 1B5JA 3EPEA 4PFWA 2OWTA 2RCAA 1PB9A 3N26A 1R9QA 4FAJA 4RPOA 2OWSA 4ZZAA 3MQ9A 4NWCA 3MUQA 4LVQA 5IKBA 3PPRA 4FIMA 2HZLA 1Z7ME 3DP8A 2KLFA 1CB6A 4NF8A 2H9BA 3KN7A 3OEMA 3TTKA 2ANJA 1MPDA 4NF4A 3PGFA 4WXJA 3WAFA 1UIVA 3TCHA 3IORA 5DVFA 3OSQA 3OD7A 2Q8JA 2PX1A 3TKDA 4G8NA 3O28A 1GR2A 5L9MA 2VOZA 2XX7A 3JZJA 2W7YA 3C32A 3DP4A 3QXMA 1B5IA 1Y1ZA 3HHFA 3LSXA 4N13A 5F7VA 3K6WA 3T96B 3U8QA 3WAEA 3KJ7A 3G3GA 4DXUA 1B05A 4GXSB 1A55A 3PUWE 4JWYA 5DT6A 3Q27A 5A5XB 2Z22A 1LAFE 5ICQA 3TQLA 3UP9A 1B4ZA 3LR1A 3PPNA 4ZE8A 1MXZA 2UXAA 1IIWA 3MAMA 3VLUA 4JB7A 1GGGA 4Z7EA 1B0LA 2V3UA 2RC9A 4JSDA 3PUYE 4C1UA 1MQHA 4FE8A 4OHNA 2RF1A 2ZNSA 4POWA 1LFHA 2O6AA 2ZYOA 1A8EA 3TEPA 4I62A 3DM0A 2HZKA 4LQ5A 2QMXA 4X1BA 2DYXA 3SEWA 3KBRA 3FV1A 3O29A 4YU0A 4OETA 5CI5A 3KJTA 1IXGA 2Q2CA 3TDJA 1MPCA 1OVBA 3B6TA 2Y7WA 5ICTA 1IQ7A 4BDRA 5FTIA 5IAIA 2NOOA 3SETA 1LAXA 3M8UA 3TAJA 1H43A 1EU8A 2P1SA 3PMXA 3FIRA 1A7LA 1MH3A 4DE8A 2QS4A 3SEYA 1I6QA 3HSTA 3K00A 1RYXA 4NWDA 2X26A 3K6VA 4OERA 2F78A 4F1YA 1MQJA 1B5HA 2HEUA 4IO4A 3VV5A 3K2DA 1D9VA 3RNNA 4LUBA 1NNPA 1LLSA 1YTVA 3PUVE 3O6GA 2QRYA 3KGCA 2XXQA 3H6VA 1Y3PA 3FVOA 3ODBA 1B3EA 3K1NA 3RGYA 3OO8A 3SEUA 1BIYA 3T22A 2DQVA 1H3DA 1JW1A 3EF7A 1B3HA 1GTKA 2HCAA 3TELA 1JETA 4ND9A 4OMBA 4H5GA 3UORA 4BDLA 2B3BA 2F6GA 4G68C 4EUOA 2ZNTA 3F11A 1O7TA 1MDP1 1B9JA 3IL1B 1XHYA 5TPAB 3R26A 2Y84A 3KFMA 1N0TA 3I5OA 2XXRA 4R6YA 1OIBA 4YZZA 3A3UA 4DLDA 4MLQA 3QUJA 2XXUA 3VE1B 3KSJA 2UVIA 3ILUB 1EZOA 5DYHA 1JW5A 3TCGA 2XXHA 1B52A 4XIGQ 3JYRA 4EQBA 1M5EA 1TWYA 2DP8A 1XOCA 1DTGA 3BBRA 5AA2A 3FGSA 3PPOA 2F97A 1PBQA 4KCDA 1OLCA 2XD3A 3IK6B 4GIZA 4G8MA 5AA4A 3QAXA 3CIJA 4GVOA 3HCQA 4KHZE 3TYHA 3FJ7A 1QUIA 3KEIA 3S2VA 1L5TA 5DTBA 3RY3A 2IA4A 3K4UA 2X7PA 4PE5B 3JV9A 5I2KA 3PD8A 2OZZA 2O51A 3FXQA 4R6KA 3O97A 3H4ZA 2THIA 5B70A 4R73A 4POXA 4JSOA 2I3WA 2Q2AA 4H65A 1O63A 4G4PA 4U22A 2HAUA 1P1WA 1Y4TA 4F2QA 3S4UA 1A40A 2Q88A 3RUMA 5FTHA 4ZEBA 3FXUA 2DWJA 3BFUA 4C0RA 3U94A 1ANFA 3O2AA 1ZMGA 3QSLA 2RC8A 1M5BA 3OSRA 1JVYA 4KYEA 3T9VA 5I2NB 1Y4CA 4BDQA 1ZLQA 3O6IA 3BKIB 3KZGA 3DP6A 5H8QB 3FVKA 5AA2D 1M5DA 3A09A 4RJZA 4ZS9A 3FD3A 1MY3A 3Q29A 1NH8A 4RY1A 3T93B 4FEDA 5HM4B 1R1NA 4PFTA 2XXPA 3CVGA 1S50A 1IZ1A 3A3CA 1POY1 4R74A 2RCBA 2Z8EA 5FHNA 1R6ZA 1IEJA 2O7IA 2I49A 2PYYA 1FQBA 3MJNA 4RK2A 3H03A 2V84A 3MBPA 3ZKLA 1ZTYA 3Q26A 4LATA 4TLMB 1P1OA 4R2BA 3U92A 1QKAA 4MF3A 3RLFE 4KD5A 4XKNA 4NF4B 4PP0A 1SW1A 1S7YA 3R6UA 4EQ7A 5ITOA 3HN0A 3M3FA 2O69A 2XXXA 2XX8A 2XXWA 2X7QA 1Y20A 2NUVA 1F9BA 1QUKA 3SDFA 1DMBA 4NF6A 1FQFA 1I69A 1VR5A 2ONSA 3IB0A 2NXOA 2DS9A 1MPBA 2ALUA 3QK6A 3CR9A 1EZPA 1MQIA 4H5FA 1SW5A 3T9XB 2CZLA 4YB6A 2GH9A 4O3AA 1UTHA 4LONB 2IEEA 5H8QA 4KQPA 3E9XA 1N84A 3THIA 3KN3A 2O84X 5CRYA 5L9SA 1MH4A 4OQOA 1CE2A 1NNTA 1WODA 4RK9A 1TFDA 3G3FA 2RKMA 3OO9A 3K6XA 3MP8A 3EHUA 1LAHE 2QMWA 1FQEA 1UTBB 4AQ4A 3DLNA 2M8CA 4HCYA 1II5A 3LUYA 4GL0A 3L6HA 4ESWA 1MM6A 5CC2A 3LSWA 3KOTA 2UVGA 3GXAA 3VXBA 1T0KA 2I58A 3TODA 4YKIA 3IO6A 4O3BA 4OWDA 1ZJLA 4JWXA 4PFYA 4KFQA 3ZSFA 5I57A 1UIUA 5AA1A 2F36A 4LZ8A 1VE4A 1XT8A 2QSXA 1XC1A 3GLBA 2ZYNA 1US5A 3BFTA 1NMUA 4GRKA 1B3LA 4LQ2A 4ZEIA 5CM6A 2DWHA 4OZ9A 4GD5A 5CMMA 5KCJB 3VVEA 4QSCA 1SYHA 1UQWA 4IGTA 1LB8A 1LSTA 1URGA 4GWOA 4NEDA 4KPTA 4ESXA 1HSJA 4LZ7A 3UN6A 3HO7A 2I6EA 1Q35A 4F3SA 4ZZEA 4R72A 2PT1A 4G68A 3CRBA 3K1MA 1JW4A 4LZ5A 1D9YA 1HSEA 3PPQA 5CMKA 2ZNUA 1BKAA 4ZDMA 1UTBA 3ONMA 3FATA 4HW8A 1AH5A 1A54A 1O64A 5KZTA 2HXWA 4AB6A 4BDNA 4MLVA 3FJMA 4F22A 1EZ9A 4ELOA 4OTEA 3EHTA 5AA2B 2I0BA 3CSBA 2HAVA 2GHBA 3E13X 3PPPA 4UACA 1LB9A 3MPLA 5AA4B 2UVJA 3P7IA 4R9GA 3HPIA 2UYFA 4E0WA 2R6GE 3TZAA 2GFEA 1XVXA 1HSLA 2O7UA 3AXFA 4FATA 5DVIA 3H6TA 2A5SA 1FTOA 3MZ9A 4U1ZA 5EYFA 4ECFA 3G3JA 1MY0A 5I2KB 3N5LA 2Z8DA 4R75A 4OEVA 1B7UA 5HBCA 4PFUA 5KCJA 3TUSA 1XS5A 1I6AA 3ZKKA 4FORA 1H44A 4ZEDA 4DDDA 1P1UA 1MXXA 1B1HA 3I3VA 1YAEA 4PQJA 1SW2A 4FECA 1SW4A 1AMFA 1FTMA 3G3IA 3IOVA 4GLIA 2XHDA 1MXWA 3Q28A 3FZVA 4ONYA 2REJA 1FW0A 1B4HA 1IXCA 3PD9A 4F1UA 1POTA 1IXIA 1ZKBA 4JDFA 1SDXA 4H8JA 2HQ0A 4Q30B 3K02A 1LCFA 4XKRA 4WKMA 4JWOA 1RKMA 1B7ZA 2Q9TA 1SYIA 4EXKA 2F7CA 3OOAA 2A5TA 3U72A 1URDA 2AYSA 5I56B 1FQDA 1EH3A 3UA8A 4N6PA 4K3FA 1SQYA 1I6BA 1QULA 3VLWA 4QFNA 3C36A 1USYE
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4LA9A 2R9JA 1LBVA 5H8NA 4N15A 4N81A 1B40A 2ZZXA 3H3GA 3B50A 3RN8A 2P2AA 2OLBA 1NUZA 1MY1A 3LSFB 4P11A 2Z8FA 3VDFA 1FJ9A 1BK4A 2I4CA 2P0SA 4NF5A 3HHGA 3PV0E 1MG1A 3IB2A 4JXIA 5I5PA 4GL8A 2Y7IA 2H99A 3PUXE 2YPNA 3MC2A 4L17A 2YJPA 4F3BA 4ZEFA 5TP9B 1LBYA 2ZYKA 3W9VA 1MXVA 2QL3A 5I7IA 3PU5A 4OVRA 1DPEA 1N7XA 4H1XA 4IO2A 3TTRA 1N3XA 4DXCA 3N6UA 1IITA 2H98A 2KQZA 4DXBA 3FJGA 3GBAA 1SPIA 1MXUA 2I4BA 3CI8A 4THIA 1B58A 1LBCA 2F35A 3ILTB 4NF6B 2OCUA 2PT2A 4OXVA 1M5FA 3O9PA 1D4NA 1VSOA 3QUFA 2UYEA 4TQUQ 2E0SA 3T1BA 2I0CA 4U4XA 1WVJA 4BDMA 2V93A 1B6HA 2B4MA 4I8CA 5IZZA 2F6PA 3VVFA 3T66A 2FIXA 3EN3A 3TPAA 1ATGA 3VVDA 4WEDA 2DWIA 5EYGA 1A8FA 4FEBA 1LAGE 2XD2A 4JVDA 1UTHB 3S9EA 4X48A 5I56A 3CFXA 4C1TA 4P9KA 2DXRA 3CG1A 1BP5A 4GFRA 1D3KA 4GWWA 4H67A 3HV1A 4PBQA 1FTKA 3K6UA 4OENA 3OO6A 3H6WA 5F24A 1OQHA 3GYYA 1NNKA 4I3YA 1P1QA 3BIGA 1DPPA 3QIMA 2OBGA 1JQFA 1FPLA 1JP4A 1MRPA 3TTLA 3IOUA 2R71A 2DSFA 3MZ1A 3C34A 3OELA 1LBZA 3PUZE 1PC3A 4FJPA 1MQDA 1LFGA 2FYIA 2ONKE 5L8DA 5TP9A 4TOZA 3CFZA 3N6TA 3EHSA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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