2RINA

Abc-transporter choline binding protein in complex with acetylcholine
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
288
structure length
288
Chain Sequence
ESCGTVRFSDVGWTDITATTATATTILEALGYETDVKVLSVPVTYTSLKNKDIDVFLGNWMPTMEADIAPYREDKSVETVRENLAGAKYTLATNAKGAELGIKDFKDIAAHKDELDGKIYGIEPGNDGNRLIIDMVEKGTFDLKGFEVVESSEQGMLAQVARAEKSGDPIVFLGWEPHPMNANFKLTYLSGGDDVFGPNYGGATVHTNVRAGYTTECPNVDKLLQNLSFSLQMENEIMGKILNDGEDPEKAAAAWLKDNPQSIEPWLSGVATKDGGDGLAAVKAALGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords PUTATIVE GLYCINE BETAINE-BINDING ABC TRANSPORTER PROTEIN
publication title Crystal structures of the choline/acetylcholine substrate-binding protein ChoX from Sinorhizobium meliloti in the liganded and unliganded-closed states.
pubmed doi rcsb
source organism Rhizobium meliloti
molecule tags Protein binding
total genus 88
structure length 288
sequence length 288
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-10-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04069 OpuAC Substrate binding domain of ABC-type glycine betaine transport system
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2rinA01
3.40.190.100 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Glycine betaine-binding periplasmic protein; domain 2 2rinA02
5H8NA 3O29A 3KEIA 1B7UA 4F31B 2O1LA 1D9YA 5EYFA 1NKXA 4FE8A 2I48A 1MQIA 2F78A 3QSLA 3DELB 3M3LA 1JW5A 3MVYA 1P1WA 4O3BA 5ICQA 4FEBA 3R6UA 5H8QA 2DVZA 3MVXA 5H8HB 4DZ1A 3H3GA 1JEUA 3PUYE 4EQBA 4IGTA 5BWJA 2UVJA 3PPRA 3O6HA 2RCAA 1B2HA 4LQ2A 5DEXA 5JK4A 4EXKA 2QPQA 3K6XA 5LOMA 1MM6A 3MZBA 4ZEBA 3KJ7A 4YICA 3M8UA 4O3CA 1OLAA 1DPEA 1M5CA 4PP0A 3CRBA 2XD3A 5K2YA 4ESWA 5DT6A 1VR5A 4IY5A 5I58A 3FVKA 1BP5A 3O97A 3P7IA 1RKMA 1YAEA 1ANFA 1GTKA 3S2VA 4NWDA 3T9XB 2Z23A 1JW4A 2VD3A 3K6WA 1BTJA 4X9TA 3UORA 3PGFA 2ZYMA 1B0HA 3KGCA 3I6VA 4OFOA 3HHFA 3DM0A 3IX1A 4GXAA 4JWOA 4KCDA 4OQOA 3RLFE 4H5FA 4BLAA 2PMSA 4OTEA 4BDLA 4PFUA 1N7XA 4U2RA 1Z7NE 4JBZA 4MF3A 1S7YA 1YCJA 3W15C 1NMUA 4THIA 3TQWA 3TKDA 3BKIB 2REJA 3JV9A 3TTRA 4NF5A 1N84A 1NH8A 3RPWA 1TWYA 3CVGA 2F8DA 2Q9TA 2B3FA 2HXWA 4LATA 4M4GA 2YPNA 5KCJA 3RGYA 5L9OA 1H3DA 3TDJA 2RC7A 3OD7A 4QRZA 3H6VA 4DXUA 2I58A 5DVJA 4YB5A 5TU0A 3KSXA 4DDDA 4ELOA 3I3VA 1LFGA 3HHGA 3MVZA 1S50A 2AL4A 5FTIA 2I4BA 4ZE8A 4R73A 4XKQA 2DOJA 1M5FA 1N7WA 2OJTA 3C36A 1Y3PA 3G3GA 4GL0A 1R1NA 2P1SA 1MY2A 1MXVA 5KZTA 4IO3A 2IA4A 2Y7PA 2PYYA 3CSBA 3CG3A 3TELA 3E13X 4LZ7A 3FASA 4Q0CA 4F2QA 5B70A 4G68B 3V83A 4KR5A 1FTKA 1YPNA 4QHQA 4GRKA 4C1TA 5A5XA 3DP4A 4POXA 1A8FA 2H9BA 3OO7A 4TLMB 3KOSA 1FTJA 5L9MA 3EN3A 4FATA 1POTA 5ITPA 3O6IA 3FV2A 4OFLA 4GOTA 1B3FA 2ZYNA 3HSTA 4JWYA 1LSTA 1Y3QA 4HCYA 1NNFA 2XXTA 3IOTA 2AYSA 2XXVA 4ONYA 1L5TA 1N04A 1WVJA 2QMWA 3PD9A 2OLBA 1MS7A 1IXCA 4P0GA 2D5WA 3EPEA 4DXBA 2LAOA 4BDRA 4R9GA 3HV1A 2QMXA 4KFQA 1LBBA 5H8HA 1H43A 3RQTA 4DCYA 4U22A 3PMXA 4I1DA 4OXVA 3G7WA 3PMVA 2VHAA 1O63A 1PBPA 3IAZA 1IIWA 3T9HB 1LFIA 1MXZA 3L6HA 4DCXA 1US5A 1UTHB 4ISUA 1B32A 2A5SA 2AL5A 3KN7A 3MZ9A 4BDQA 4G77A 3LUYA 4POWA 2QS3A 3VXCA 3FXUA 2OBGA 4YMBA 2XXQA 3TTNA 1DOTA 4OERA 5BUUA 5DVIA 1B6HA 2ONSA 4KPTA 4FIMA 2DWIA 2HZKA 2QS4A 1B3LA 1ELJA 3V89B 4OVJA 3MPLA 4Q30B 1KWHA 1LAGE 3KN3A 4XXUA 4G8MA 5DTBA 3VXBA 2UYEA 1QUJA 1NH7A 3TZAA 3S9MC 2XXPA 3QUJA 1QVSA 4FECA 5AE4A 3S4UA 3KSJA 3S9LC 3R7XA 3PPQA 3L6GA 2NXOA 3MC2A 4RPNA 1SQYA 4UACA 3VDFA 3QIMA 4QFOA 4WXJA 4R9FA 1FQBA 4PFYA 3OENA 3UN6A 1JVXA 1USYH 5M2VA 2XHDA 2H4IA 3FJ7A 4H1XA 3Q29A 3ODBA 1GGGA 2GFEA 4GL8A 5I56B 4G4PA 2NVUB 4IO4A 3A3CA 5F7VA 5FHOA 4JB7A 5HPQA 2FNCA 2F97A 2UXAA 2UVGA 2X7PA 4HW8A 3R26A 1TXFA 4JSOA 1LGBC 5TPAB 4XTCQ 2DE4A 1QUIA 3C34A 2O69A 3RY3A 4ZE9A 3EHTA 3CR9A 1J1NA 3LSFB 3FXRA 1DTZA 2F7BA 1LCTA 3QUFA 2DWHA 4LQ5A 1Y1MA 4R6KA 4R2BA 2PBWA 3BFTA 3OOAA 3S9EA 4G68A 3O66A 3FV1A 1LLSA 4IY6A 3O9PA 1M5EA 4Q5TA 3TMGA 3FZVA 1B9JA 4H6DA 2Q89A 1LAXA 5H8FB 3O2AA 1EH3A 3IOUA 1BLFA 2ONRA 5K2XA 4C0RA 4F1UA 4OFJA 1OQHA 3JYRA 1AIVA 3BBRA 3ZKKA 3ILUB 3K0VA 2VD2A 3IB0A 4BDOA 2XXXA 1B0LA 3H6UA 3H7MA 1MQJA 5FTHA 5CBSA 3GXAA 4X1BA 1OIBA 1EZOA 1ZMGA 3KBRA 4ZDMA 1VE4A 2F7AA 1US4A 4P0IA 3N94A 5TP9B 3VVDA 1P1QA 3OEKA 3C33A 4GFRA 4HCWA 1PB7A 4RK9A 1MY1A 2DXYA 5H8SA 3IOVA 2QS1A 5HBCA 4NE4A 3MW0A 1UTHA 3K02A 3N5LA 4DXCA 4ZZAA 1DMBA 1ZU0A 3PPOA 3C4MA 2PT2A 3TCHA 3M3FA 4OESA 3E3KA 1UIUA 2Y84A 3VE1B 4LZ8A 1MDP1 2I6EA 1O64A 4AB6A 3ZSFA 1QJMA 2HEUA 1FTOA 2DYXA 5L8DA 3LSLA 1SD3A 5I84A 4IGRA 3U72A 3RTFB 3SETA 1CB6A 2G29A 2HQ0A 3W9WA 4P11A 3VV5A 3H6TA 1MH3A 4HS7A 4LVQA 1XC1A 2HAVA 3OO8A 3TCFA 1MXYA 4ZEKA 4N6PA 4G2ZA 3TTLA 4NF6B 4H0WA 5I2NB 3MUQA 1GVCA 2OWTA 1WDNA 4WEPA 3IJOB 2I4CA 4H67A 1UIVA 3TEPA 4XIGQ 1IXGA 2KLFA 3MZ1A 5B7DA 3OSRA 4QFPA 4XKNA 4QFNA 5AA4B 3LBSA 3QK6A 1OLCA 1SW4A 4RYAA 1NL5A 4ELRA 1MPBA 1AOVA 3QAXA 3EF7A 3PUVE 3DLNA 3FJMA 2O7UA 2I3VA 5I56A 3QXMA 4ZS9A 4DIGA 4OEUA 2P2AA 3E9XA 3F11A 2I0CA 3C9HA 3G3IA 5I57B 4OYVA 1H45A 1DPPA 3MP8A 3TTMA 3H6WA 4NF8B 1ZTYA 4L17A 3Q25A 3LSWA 4YKIA 1AL3A 3T66A 5TPAA 1R9QA 4U1ZA 5KDTB 3K1PA 2O7IA 3U94A 4NEDA 1SYHA 4X48A 1ZJLA 1NNPA 2VP1A 1MH4A 4GVOA 1IXIA 1MQDA 3UP9A 1P1UA 4GQOA 1RYXA 3G3KA 4IO2A 4PETA 4YAHX 3C35A 3TCGA 4F39A 4NTLA 2QRYA 1M5DA 2Q2AA 5ELVA 3MPKA 1OVTA 1XOCA 1GR2A 2F5XA 5H8FA 1B5IA 1IXHA 2NUVA 1QKBA 3PPPA 2XX8A 2ZNSA 1JNFA 3U93A 1VFEA 2OCUA 3RNNA 4ZECA 3G3JA 2W7YA 4JWXA 4F3BA 1MRPA 2I3WA 5FHMA 1B05A 4R72A 3OEMA 2V84A 2F7CA 4OETA 1JVYA 4F3SA 1HSJA 3B6QA 4U1OA 2V3TA 3FJGA 4EUOA 5DVFA 2UVIA 3H4ZA 2QJEA 5TP9A 1XHYA 4RXLA 1Y4CA 4EQ9A 3T93B 3MJNA 1B3EA 3D4CA 3CIJA 3ZS6A 4E0XA 3RT8A 1LB8A 4MH5A 2XXRA 4GIZA 3PMWA 1ZLQA 2VGQA 2I0BA 3FVOA 2QS2A 4MBPA 4N13A 1B46A 5AA1A 1TFAA 3FVGA 2X26A 3A3UA 5CM6A 1I6BA 3LC8A 2Q2CA 3MP1A 1IITA 4U21A 3W9VA 5I2KB 1F9BA 1NFTA 3IOWA 3UGWA 3FVNA 5ISUA 2CZLA 3OXNA 4UA8A 3WAFA 2DQVA 1VFDA 4ZEIA 1ZKBA 5DYHA 1EU8A 4RY1A 3WAEA 1BKAA 1FTLA 2G93A 1USYE 1B4HA 5EHMA 2HCAA 1BIYA 4YB7A 4H5GA 4KYEA 3ECRA 2F36A 4F3GA 3DP6A 4NF6A 4XKPA 5ITOA 5I2NA 1URSA 4F22A 3TQLA 4KD5A 4O3AA 2PT1A 1XS5A 4N07A 1PDAA 3FD3A 4U4XA 3OSQA 4AB5A 1SYIA 1ATGA 5AA4A 1XVYA 4KQPA 5ICTA 4LP2B 5CMKA 1AH5A 1OVBA 4YMAA 4ESXA 3THIA 4I62A 1I6QA 4R6HA 3VLWA 4FAJA 4G8NA 3U1OA 2RINA 1LAFE 5F1QA 3DP8A 3MWBA 1P1OA 4M1VA 2Y7WA 4BDNA 2DE2A 3K6VA 5I57A 4YB6A 1Y3NA 3SKPA 2QSXA 4ND9A 4GWOA 1LFHA 3IL1B 5HM4B 3PU5A 4PFWA 2M8CA 5CMMA 2XXHA 4NF8A 2R71A 1RYOA 4OHNA 3LR1A 3VVFA 2ESNA 5JTYB 3SEYA 1PB8A 1WODA 3PPNA 2DWAA 2P0SA 4F1YA 5KDTA 3V5AA 1B3HA 4ELPA 4QSCA 1B58A 1UQWA 4F2OA 3IO4A 1HSEA 1MXXA 2O68A 3FXQA 2H98A 3SERA 4NWCA 5L9SA 1D3KA 1UTBB 4RNSA 3VVEA 3FIRA 1B7HA 1MPCA 1Y9UA 5CRYA 4QSDA 1FQAA 2FA7A 4KI0E 3S9NC 4JXIA 5AA2B 1XT8A 3Q27A 4AQ4A 3VLUA 3Q28A 2A5TB 2ZNUA 3C31A 2RKMA 2V25A 3TAJA 2ALUA 3IB2A 1URDA 2RC9A 2ZMBA 4DLDA 2DSFA 2BJJX 1SDXA 2B3BA 1GV8A 1IZ1A 2RCBA 2THIA 3K2DA 2D3IA 5CBRA 2OWSA 3RUMA 4QFKA 4F1VA 3VFJA 3TFLA 1URGA 1I69A 3CFLA 2O1MA 1B7ZA 4U23A 1FQCA 4HTGA 2H5YA 3CG1A 2I49A 1N0TA 2DVCA 5AA3A 2UVHA 1B40A 1A55A 2Y7IA 2ABHA 1B4ZA 3V8XB 1LB9A 4JDFA 1R6ZA 1B51A 2XXIA 2F34A 5FHNA 3K1MA 4NF4B 1SW2A 4TOZA 1A54A 1ZBMA 3O28A 3RN8A 5I2KA 4ELQA 2O6AA 2RC8A 5CMCA 1MG1A 5EHSA 1MQGA 4F3PA 1IUDA 1FTMA 3EQ1A 3GBBA 3KOTA 5I59B 1B5JA 1LAHE 2NWJA 3IB1A 2HFBA 4R75A 4LUBA 3PUXE 2XX7A 1B3GA 2V3QA 5CC2A 1SVXB 1B5HA 3FATA 4WEDA 5IAIA 5AA2D 3MVWA 1XVXA 1Y4TA 3RT6B 4KHZE 3KJTA 1NNKA 4G8HA 3OELA 1SI0A 2XXUA 2GH9A 2Z8FA 3OO9A 1HSLA 2X7QA 4EDPA 2YJPA 3CFXA 3JZJA 1MY3A 4R6YA 2DS9A 4BDMA 3EHSA 4Z7EA 4Z0IA 1Q35A 1PBQA 2H25A 4I8CA 3T96B 3TPAA 4NMYA 1FQEA 2ANJA 4KYSA 4X1DA 4JSDA 1OMPA 3CSGA 3B6WA 3CI8A 3OMBA 4OWDA 2IEEA 1P99A 4GD5A 4OEVA 4GLIA 2Z8DA 3U92A 5JTYA 1AMFA 2Y7RA 1MXWA 4YU0A 3B7DA 1JEVA 4EQ7A 1Y20A 1FQDA 1II5A 2FYIA 2E0SA 3MQ9A 2XXWA 2GHBA 1D4NA 3ILTB 3SEWA 3PUWE 4RA1A 2Z8EA 2Q8JA 1UTBA 4FJPA 1SBPA 3B6TA 1QW0A 4R74A 4MLQA 4EXLA 4YKKA 1IQ7A 2E1SA 4MFIA 3ZKLA 3D4GA 1QUKA 4XKRA 1EZ9A 3HO7A 3N6TA 1Z7ME 3LSXA 4MLVA 4QSEA 1EZPA 3TTKA 1N3XA 1TT1A 4Q8RA 5AA2A 3PUZE 3FUZA 2CMOA 3UA8A 2ONKE 5H8NB 2A5TA 2RF1A 1DTGA 3MP6A 4H65A 4PFTA 2R9JA 1B1XA 4IO7A 2Z22A 4YKPA 1H76A 1MPDA 2AIXA 3Q26A 4E0WA 2GHAA 4GF8A 3HPIA 3UIFA 2HAUA 1FQFA 3HN0A 4TQUQ 4RPOA 1MXUA 4G68C 1SW5A 4DE8A 1DSNA 5H8QB 1JQFA 1T0KA 4U4SA 3MBPA 1CE2A 4LZ5A 1FW0A 2OZZA 1I6AA 2DE3A 3KZGA 1N3WA 4LONB 3EHUA 3FGSA 4QF9A 4H8JA 3U8QA 3KN8A 1MQHA 5DEXB 3E4RA 4ZZEA 3RTWB 1SW1A 3K01A 3PV0E 1Y1ZA 2XXYA 1N76A 1LCFA 4EF2A 4KYDA 4I9DA 4PQJA 4OZ9A 3G3HA 3SEXA 5IKBA 2VOZA 1MY4A 3CFZA 4NF4A 2XX9A 4ECFA 4QFLA 3K1NA 3H06B 4RK2A 5I58B 1O7TA 2UYFA 4K3FA 3GBAA 4YKJA 2PX1A 3MAMA 3H03A 3T9UA 2ZYKA 1TFDA 1H44A 3SDFA 3IR1A 3T22A 2V3UA 1PB9A 1A99A 1S9TA 4F19A 3IJXB 5I59A 3TODA 4LA9A 4IB2A 1OQGA 2ZYOA 2ZXTA 1R9LA 4F29A 3OO6A 1ZIUA 1A7LA 4R2FA 4EF1A 3TUSA 3ONMA 4IO6A 3SEVA 2B65A 4OENA 5CI5A 2DP8A 2D21A 5CMBA 1QKAA 2REGA 3BFUA 1A8EA 3O6GA 3GLBA 3IK6B 2O84X 3SEUA 4ZEDA 1JW1A 4WKMA 1NNTA 3IORA 4ZEFA 4FORA 4NF5B 4GXSB 4PE5B 2HZLA 2V93A 1D9VA 1QULA 3T9VA 1YTVA 1PC3A 1B1HA 1IEJA 2DXRA 4F18A 1B52A 3HCQA 3A09A 1P1NA 3KG2A 1A40A 4H8IA 5KCJB 3IO6A 1LBCA 4OMBA 1SI1A 1MM7A 2QL3A 2F6GA 4IO5A 2NOOA 3N6UA 2R6GE 1M5BA 2XD2A 1POY1 2PVUA 3PD8A 3VLVA 2DWJA 2WKYA 4RJZA 3N26A 2O51A 3C32A 3QYTA 2GRVA 2Q88A 3TYHA 3AXFA 4KCCA 3KFMA 3I5OA 1FCKA 4YZZA 3GZGA 1JETA 2Y7KA 1PEBA 2F35A 1VSOA 5A5XB 3M3KA 3G3FA 3UK4A 1MY0A 2ZNTA 2YLNA 4FEDA 3K4UA 4TLLB 2F6PA 3K00A 4C1UA 3SESA 1Q1KA 5JEIA 1MDQA 5J1DA 3K6UA 3USDA 2OK2A 2H99A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5H8NA 3O29A 3KEIA 1B7UA 4F31B 4PFBA 2O1LA 1D9YA 5EYFA 3EKIA 1NKXA 4FE8A 2I48A 1MQIA 2F78A 3QSLA 3DELB 3KC0A 3M3LA 1JW5A 3MVYA 4OVSA 1P1WA 4O3BA 5ICQA 1NV0A 4FEBA 3R6UA 5H8QA 2DVZA 3MVXA 5H8HB 4DZ1A 3U65A 3H3GA 1JEUA 2V4CA 3PUYE 4EQBA 4IGTA 2XWKA 5BWJA 2UVJA 3PPRA 3O6HA 2RCAA 1B2HA 4LQ2A 5DEXA 5JK4A 4EXKA 1SPIA 2QPQA 3K6XA 5LOMA 1MM6A 3MZBA 4ZEBA 3KJ7A 4YICA 3M8UA 4O3CA 2HPGA 1FPKA 1FBFA 1OLAA 1DPEA 1IMEA 1M5CA 4PP0A 1DCUA 3CRBA 2XD3A 5K2YA 4ESWA 5DT6A 1FJ6A 3PTYA 1VR5A 4IY5A 5I58A 3FVKA 1BP5A 3O97A 3P7IA 1RKMA 1YXIA 1YAEA 1ANFA 1GTKA 4N15A 4PBHA 3S2VA 4NWDA 3T9XB 2Z23A 1JW4A 2VD3A 3K6WA 4PAFA 1BTJA 4X9TA 3UORA 2XA5A 3PGFA 2ZYMA 1B0HA 3KGCA 3I6VA 4OFOA 3HHFA 3DM0A 3IX1A 4GXAA 4JWOA 4KCDA 4OQOA 4PTKA 3RLFE 4H5FA 4BLAA 2PMSA 4OTEA 4BDLA 3E78A 4PFUA 1N7XA 4U2RA 1Z7NE 4X8RA 4JBZA 4MF3A 1S7YA 1YCJA 1RDZA 4GBWA 3W15C 1NMUA 4THIA 3TQWA 3TKDA 3BKIB 2REJA 3JV9A 3TTRA 4NF5A 1N84A 1NH8A 3RPWA 4OVTA 1TWYA 3CVGA 2F8DA 2Q9TA 2B3FA 1LBVA 2HXWA 5A5LA 4LATA 4M4GA 2YPNA 5KCJA 3RGYA 5L9OA 1H3DA 3TDJA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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