2RINA

Abc-transporter choline binding protein in complex with acetylcholine
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
288
structure length
288
Chain Sequence
ESCGTVRFSDVGWTDITATTATATTILEALGYETDVKVLSVPVTYTSLKNKDIDVFLGNWMPTMEADIAPYREDKSVETVRENLAGAKYTLATNAKGAELGIKDFKDIAAHKDELDGKIYGIEPGNDGNRLIIDMVEKGTFDLKGFEVVESSEQGMLAQVARAEKSGDPIVFLGWEPHPMNANFKLTYLSGGDDVFGPNYGGATVHTNVRAGYTTECPNVDKLLQNLSFSLQMENEIMGKILNDGEDPEKAAAAWLKDNPQSIEPWLSGVATKDGGDGLAAVKAALGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords PUTATIVE GLYCINE BETAINE-BINDING ABC TRANSPORTER PROTEIN
publication title Crystal structures of the choline/acetylcholine substrate-binding protein ChoX from Sinorhizobium meliloti in the liganded and unliganded-closed states.
pubmed doi rcsb
source organism Rhizobium meliloti
molecule tags Protein binding
total genus 88
structure length 288
sequence length 288
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-10-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04069 OpuAC Substrate binding domain of ABC-type glycine betaine transport system
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2rinA01
3.40.190.100 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Glycine betaine-binding periplasmic protein; domain 2 2rinA02
2RCAA 1JQFA 1P1QA 2O1MA 4QFPA 3JYRA 2F7AA 1B05A 4OMBA 1ZKBA 5CC2A 3ILTB 4HW8A 3UK4A 3FD3A 3N94A 4GVOA 3E13X 2XXXA 5ITOA 4QF9A 3BFUA 4FIMA 1SYIA 5EHMA 4C1TA 3R26A 4DXCA 2XD3A 3LC8A 5I2KB 4ZEKA 1UIUA 4QSEA 2OWSA 1SI1A 5F1QA 2Q89A 3K0VA 3Q26A 4F3GA 1B0LA 1LSTA 2VGQA 3M8UA 5BUUA 4H1XA 4X48A 3PUWE 2GFEA 3SEVA 2ABHA 1URDA 4F1VA 2O68A 5EYFA 3MPKA 2NOOA 2PX1A 2UVHA 4JWOA 1YPNA 4YU0A 2F78A 2P2AA 5KCJB 2RCBA 3A3CA 2I4BA 3H6UA 3RTWB 1Q1KA 5A5XB 2DXYA 2G93A 4I62A 4LVQA 5AA4B 2Y7WA 4NF6B 3T66A 3U94A 1CE2A 5DEXB 4G77A 2RKMA 3HPIA 3H4ZA 5ICQA 1P1NA 2BJJX 5DVJA 2I3WA 5FHOA 3QSLA 1WVJA 2XX7A 1BIYA 5K2XA 4R75A 5I58A 1IZ1A 1UIVA 2QL3A 3OENA 3VDFA 3EN3A 5AE4A 1NNPA 1QW0A 3N5LA 3H6WA 3VVDA 2HQ0A 4R2BA 3UP9A 1Y4CA 1M5CA 5JEIA 3TDJA 1ZMGA 3TODA 2V25A 1B0HA 1Y1MA 4IO3A 1IITA 1IIWA 3OOAA 1UTBA 3ZSFA 4KFQA 2ZXTA 2YPNA 2X7QA 2R6GE 3B6QA 4R6HA 3OO9A 2O51A 2QS2A 4BDLA 3EF7A 2B65A 1QUJA 1O63A 1LBBA 1J1NA 3IAZA 3VLWA 3SERA 2Z8FA 3TZAA 2P1SA 5H8QB 3TTLA 5KDTB 1GGGA 2DS9A 3C4MA 4ESWA 1VSOA 3C35A 4PQJA 3O6GA 4GF8A 4R9GA 3TFLA 2H25A 4EQ9A 2RF1A 2Y7IA 1TWYA 5I57A 4KD5A 4PP0A 3T93B 2VD3A 4ND9A 1AIVA 4RXLA 1YTVA 1NL5A 2OWTA 1LB9A 4ZS9A 4BDQA 3KN8A 2RC9A 1LAGE 1B51A 1RKMA 2PT1A 3LBSA 3IR1A 3Q28A 4GLIA 1ANFA 4LONB 3MP8A 4Q0CA 4QSCA 3KZGA 5HBCA 3V89B 2G29A 1MS7A 1MM6A 1GV8A 5I56B 2Q2CA 1ZBMA 3PMVA 4QHQA 3OEKA 1SVXB 4FE8A 2F7BA 2PVUA 1NH8A 1MY2A 3T9VA 4GIZA 3FJ7A 2I48A 2F36A 2O7UA 4RYAA 3PPRA 1XS5A 4IB2A 1ELJA 5M2VA 1SD3A 2Z8EA 4DCYA 4ONYA 3KN7A 2PYYA 3M3LA 3U93A 3IO4A 3OEMA 3SESA 5DYHA 4XKNA 5L9SA 4P11A 3TAJA 1Q35A 1S9TA 2F8DA 4H0WA 2QS1A 2ZYNA 1FCKA 5TPAA 3Q25A 3I3VA 4OHNA 1MM7A 5H8HB 2NXOA 3FJGA 3U72A 4GWOA 2YJPA 1XOCA 5IAIA 2AL5A 1HSEA 1H44A 5I59A 3UIFA 4U1OA 2F97A 3U1OA 3ZKLA 4PE5B 4G68A 2XXVA 4IO4A 4G8MA 1QKAA 4XKPA 1MH4A 4NF8A 4G4PA 4YAHX 4JWXA 1M5EA 3O6IA 4QRZA 1I69A 1SW2A 3MP1A 1Y3QA 2NUVA 1UQWA 4XIGQ 4OXVA 1JEVA 3O9PA 2XXIA 1FQBA 3JZJA 4M4GA 3TTMA 4ISUA 1LAXA 1EH3A 2W7YA 1Y1ZA 3MAMA 1N04A 1B3GA 1SW1A 3KSJA 4MLQA 3RT6B 1IQ7A 3EQ1A 3K00A 2F35A 4QFLA 3IB2A 3LR1A 2ONSA 2Y7PA 1MXUA 1PBPA 3K6VA 5ICTA 5K2YA 2DE4A 3S2VA 1VFDA 2FA7A 2VHAA 3KOTA 3A09A 3R7XA 4YKKA 4TLMB 3R6UA 4FJPA 1A8EA 1WDNA 2H4IA 1MH3A 1MPBA 5J1DA 2DE2A 1N0TA 3BBRA 4LA9A 3ECRA 5ITPA 2FNCA 3IJOB 2XXWA 4LZ5A 4O3CA 4Q5TA 3TPAA 2I3VA 2VOZA 1SBPA 4P0GA 4DXBA 4DE8A 3VVFA 1EU8A 1H76A 3SKPA 3MVXA 2X26A 2OLBA 4U4SA 2NWJA 3N26A 5CRYA 2YLNA 3HHFA 3FXQA 4PFWA 3EHUA 1MXWA 4F22A 2Z22A 1D3KA 2WKYA 3MZ1A 1NFTA 2I0BA 3HCQA 1GR2A 4I9DA 3VXBA 4TOZA 4RK2A 2Y7RA 4GRKA 1I6QA 2DWIA 3QYTA 1MG1A 3E9XA 4RJZA 3WAEA 3O28A 1NNFA 3DM0A 1EZOA 5I58B 5KZTA 1MPDA 5L9OA 2F34A 1M5BA 2D21A 1B52A 1XC1A 4EXLA 3K2DA 4RPNA 4EF2A 1I6AA 1B2HA 4GL0A 4G2ZA 3H6TA 3H6VA 2VP1A 2UVJA 1DTGA 5BWJA 4OERA 4QFNA 2XXYA 4U21A 2A5SA 3GXAA 1UTBB 1NNKA 3D4GA 5L8DA 4K3FA 5B7DA 3VLUA 3TMGA 1FW0A 1RYOA 3IJXB 4LQ2A 4F29A 4KCDA 2ZYKA 4FATA 3W9VA 3D4CA 2GHBA 4NF5A 1VFEA 3MJNA 4DZ1A 3KBRA 4N6PA 2DWHA 4MBPA 4U1ZA 1US4A 3T9UA 3OO7A 1IXGA 2QS4A 2V3UA 3FXRA 3CVGA 4GL8A 2RINA 3RGYA 4JWYA 3H3GA 2B3BA 4H5FA 4KQPA 1OVBA 2XD2A 3FGSA 5FHMA 4YB6A 1IXCA 4G8HA 3KFMA 4F2QA 4YMBA 4Z0IA 2DWJA 1D9YA 1FTKA 5JK4A 3IX1A 4F31B 1IEJA 2XX9A 4IO5A 2XXUA 1NKXA 1NMUA 5I57B 2RC8A 4PFYA 1H3DA 1B3LA 2HZKA 2DYXA 3PPOA 3O66A 3IOUA 3HN0A 4ZE9A 3CFXA 1B5IA 2DP8A 5L9MA 1DMBA 3BKIB 3T96B 4ZEBA 2NVUB 3UN6A 4KYSA 3UORA 5CMKA 3CFZA 3LSWA 1PB9A 3IB0A 1XHYA 1XVYA 2LAOA 2ONKE 3RT8A 2OK2A 3UA8A 3LSLA 4EXKA 4O3AA 3CIJA 4E0WA 3FATA 3KJTA 3A3UA 4H5GA 2Z8DA 1LGBC 5I84A 3C32A 4I8CA 4U23A 4Z7EA 3RNNA 3C31A 3G3KA 2E1SA 5TPAB 4R6KA 3KJ7A 5F7VA 1FQEA 5CBRA 4NWCA 2OBGA 2GRVA 4UACA 5I59B 1P99A 3DLNA 1PB7A 1QULA 2DSFA 2XXQA 1OLCA 4MF3A 3AXFA 1S7YA 4TLLB 1B5HA 4HS7A 2DWAA 3LSFB 1JVXA 4U2RA 3CSGA 4G68B 3QK6A 4OYVA 4DDDA 4KYEA 4ZECA 4NF8B 1FQFA 2QJEA 4MFIA 3G3GA 3K6XA 2DVZA 2GHAA 2QS3A 3ODBA 1JNFA 4BDRA 1A7LA 3I6VA 1MY4A 4YKPA 2O7IA 3ZS6A 2O6AA 3S9MC 3EHTA 4FEDA 3TEPA 2V93A 4OQOA 1ATGA 1JETA 4QFOA 2I4CA 1O7TA 4H67A 5CMCA 3K1NA 1MQJA 3TTNA 4I1DA 3TUSA 1GTKA 3OO6A 1B3FA 4R74A 5H8FA 3OO8A 2ONRA 4MH5A 2X7PA 1JVYA 4X1DA 4DXUA 2Y84A 4RY1A 4NMYA 3KGCA 1H43A 2QMXA 1ZJLA 3VV5A 1II5A 1B3EA 1A54A 2H98A 4NTLA 3TELA 1DPPA 3G3FA 4F3BA 2ZNSA 5AA1A 4LATA 2CZLA 1IUDA 5HPQA 5ISUA 4IY5A 3PD8A 3PV0E 1ZTYA 5EHSA 4QFKA 3TQWA 2UYFA 2F5XA 2ALUA 3KSXA 3MC2A 3B6TA 3DP8A 1VR5A 1ZU0A 3FUZA 1YCJA 4THIA 3O2AA 3RUMA 3CG3A 5AA2A 2F6GA 1AOVA 4LZ8A 1MY0A 2D5WA 3FV1A 4GXSB 3VE1B 1P1UA 4XTCQ 2E0SA 1B1XA 1A40A 2ZNTA 4ZEFA 4N13A 4F1YA 4OFOA 3PMXA 4NF4A 1B46A 1B40A 1F9BA 2D3IA 1SYHA 5FTHA 3Q29A 1B32A 3Q27A 1A55A 1M5FA 3CR9A 3VVEA 4U4XA 1T0KA 4LUBA 3MVYA 2HFBA 3K6UA 3G3IA 1HSJA 4KHZE 3FIRA 1BLFA 4ELQA 4WXJA 2P0SA 1OQGA 3CRBA 4GOTA 4R6YA 2CMOA 1FQCA 3I5OA 1MXVA 2UYEA 2GH9A 1A99A 1SDXA 1LBCA 4DCXA 3HHGA 4EUOA 2AIXA 2IA4A 4OETA 3OD7A 4TQUQ 1QVSA 1BP5A 1TFDA 4QSDA 4HCWA 4JBZA 3V8XB 3C33A 2V3QA 3MUQA 3TYHA 2XXRA 4FEBA 3PGFA 1L5TA 1R6ZA 3GLBA 2KLFA 3IL1B 3GBBA 4NF5B 3PU5A 2AL4A 2HZLA 1H45A 3PMWA 4KPTA 1LCFA 1D9VA 5JTYA 1MXXA 2REGA 3KEIA 2XHDA 1B58A 3HSTA 2Q8JA 4Q8RA 3IOVA 1OLAA 1QUKA 1TFAA 2XXTA 3HO7A 3PD9A 4ZZEA 1YAEA 4BDMA 4NWDA 3H03A 2DOJA 3SETA 1MXZA 2H99A 4F2OA 4EQ7A 4OESA 1MY1A 3IOTA 4F18A 2HAVA 4FAJA 4IY6A 2M8CA 3FVNA 4ZEIA 2PMSA 3O97A 3TCHA 4C0RA 1URSA 3G3HA 3FASA 3CI8A 3K6WA 3EHSA 1EZ9A 4MLVA 5TP9A 3ZKKA 4YKIA 3OMBA 1R9LA 1Y3NA 4R73A 2OZZA 2ZMBA 4XKRA 2UVGA 5I2NA 4Q30B 4RNSA 4OEVA 4YZZA 1FQDA 3EPEA 1WODA 3G7WA 4AB5A 1B5JA 1PEBA 1DSNA 1FTOA 1ZLQA 1KWHA 1UTHA 3N6UA 4IGTA 3FZVA 1USYE 4OWDA 4E0XA 4YB7A 2ZYMA 1FTMA 1MQGA 3OSRA 1JEUA 3VFJA 4F39A 4KYDA 3TCGA 4EDPA 3RPWA 2ZNUA 3SDFA 3SEWA 4AQ4A 3SEUA 4ZZAA 2H5YA 1GVCA 1M5DA 2I6EA 1MDQA 1LB8A 3RN8A 5IKBA 2OCUA 3IO6A 3MPLA 3O6HA 3CSBA 4F19A 1JW5A 5LOMA 4ZEDA 4OZ9A 5H8NA 4R9FA 3JV9A 1N3XA 1LFHA 3S9EA 4X9TA 5AA2D 1MQHA 4JDFA 4BDOA 1N7XA 4WKMA 4BDNA 2QRYA 1MY3A 1Z7ME 3K4UA 2THIA 5H8SA 2HEUA 2B3FA 3FV2A 3DP6A 1XVXA 3IK6B 2DXRA 3ILUB 4R72A 1FTLA 1O64A 3MP6A 3RQTA 3MVWA 2ZYOA 2DVCA 1LCTA 5I2KA 1MRPA 1BKAA 4YKJA 1N3WA 5DVFA 5TU0A 4GQOA 3QIMA 4H8JA 2A5TB 3IORA 3MWBA 4BLAA 5DTBA 3U92A 3WAFA 1P1OA 5DT6A 3S4UA 3HV1A 3T9HB 4F1UA 5H8FB 3DP4A 3QXMA 1N84A 1QJMA 1OVTA 4X1BA 2ESNA 2QPQA 4ELRA 4RPOA 1POTA 1URGA 4YICA 4G68C 1JW1A 1POY1 1SW5A 4JSOA 2ANJA 1OQHA 4OVJA 5FHNA 4OFJA 3GZGA 1LAFE 2F7CA 3TQLA 5KCJA 3IOWA 1ZIUA 3K1PA 4PFTA 3K02A 3H06B 1XT8A 3OXNA 1NNTA 1Y4TA 5A5XA 4LP2B 1LAHE 2HCAA 3M3KA 2HXWA 5AA4A 2Q88A 4YB5A 3TKDA 4OFLA 4NF6A 1DTZA 2Q2AA 2HAUA 3G3JA 2V3TA 5DEXA 1B7ZA 4GFRA 2Q9TA 4H6DA 2PT2A 2OJTA 3S9LC 2IEEA 3MQ9A 3O29A 1D4NA 3CFLA 4DIGA 1US5A 3RTFB 2DQVA 4XKQA 5AA2B 1B4HA 3MBPA 1LFGA 3L6GA 1N76A 3MZ9A 4POWA 4POXA 1I6BA 1Z7NE 1BTJA 1B1HA 1AL3A 4IO2A 1MDP1 4KI0E 5CMMA 4O3BA 2XXHA 2H9BA 2A5TA 5HM4B 1A8FA 4LZ7A 2QMWA 3FVGA 1QKBA 3B6WA 4EQBA 1OMPA 4NF4B 1B6HA 1IXHA 3FXUA 4AB6A 1TT1A 1EZPA 4RK9A 3PPPA 4NE4A 3IB1A 3USDA 3DELB 3V83A 4ESXA 1B4ZA 3GBAA 3PUXE 3OSQA 2VD2A 4FECA 3CG1A 4H8IA 3VXCA 4OENA 2REJA 3C9HA 3QAXA 1VE4A 3V5AA 4C1UA 3FVOA 3S9NC 2R9JA 3M3FA 1B9JA 3E3KA 2AYSA 1DOTA 3MZBA 4PFUA 2I58A 1PC3A 4M1VA 3C34A 5H8QA 1B7UA 5KDTA 3FVKA 4KCCA 4IGRA 5DVIA 3RY3A 1MQIA 1MXYA 5CBSA 1NH7A 3C36A 4UA8A 4P0IA 3PUZE 4ZDMA 4HTGA 4U22A 4N07A 4OTEA 3PPQA 4F3SA 1R1NA 3KOSA 1B3HA 3QUFA 2FYIA 2RC7A 3RLFE 5CM6A 1JW4A 5JTYB 3KG2A 2O84X 1PBQA 3TTKA 4LQ5A 3LUYA 2F6PA 1PB8A 3OELA 3SEYA 2UXAA 3K01A 4ELOA 5CI5A 5I56A 3QUJA 5CMBA 2UVIA 4NEDA 4ELPA 3H7MA 4JSDA 3B7DA 3T9XB 1CB6A 3ONMA 3T22A 1Y9UA 4IO7A 2V84A 1FQAA 1LFIA 5B70A 1B7HA 1SI0A 2Y7KA 3TCFA 2R71A 1R9QA 4ECFA 1QUIA 1AMFA 1P1WA 4R2FA 1SQYA 4WEPA 3TTRA 2XX8A 1Y20A 2Z23A 5TP9B 1RYXA 3F11A 1AH5A 1MQDA 2O1LA 3KN3A 1LLSA 4H65A 4KR5A 5I2NB 4GD5A 4WEDA 4HCYA 5H8HA 4YMAA 3W9WA 1N7WA 3BFTA 1IXIA 3U8QA 3LSXA 3PUYE 5ELVA 4IO6A 2O69A 1HSLA 3SEXA 3K1MA 1UTHB 2I49A 3P7IA 1FTJA 3VLVA 4RA1A 4FORA 2QSXA 4GXAA 3UGWA 4XXUA 4OEUA 4PETA 1PDAA 1Y3PA 2DE3A 4JXIA 3MVZA 3PPNA 2PBWA 1TXFA 3PUVE 1SW4A 4EF1A 1OIBA 4ZE8A 5AA3A 3N6TA 2XXPA 4DLDA 4G8NA 4L17A 1USYH 5H8NB 3FJMA 3E4RA 3THIA 1S50A 3MW0A 4JB7A 5FTIA 2I0CA 1MPCA 3L6HA 1DPEA 4F3PA 3W15C
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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